Publications HAL de florent,lalys

2020

Journal articles

titre
Catheter navigation support for liver radioembolization guidance: feasibility of structure-driven intensity-based registration
auteur
Houda Hammami, Florent Lalys, Yan Rolland, Antoine Petit, Pascal Haigron
article
International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery, Springer Verlag, 2020, ⟨10.1007/s11548-020-02250-8⟩
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titre
Fusion imaging with a mobile C-arm for peripheral arterial disease
auteur
Alexandre Villena, Florent Lalys, Blandine Saudreau, Remy Pascot, Alexandre Barré, Antoine Lucas, Adrien Kaladji
article
Annals of Vascular Surgery, Elsevier Masson, 2020, ⟨10.1016/j.avsg.2020.07.059⟩
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titre
Similarity measures and attribute selection for case-based reasoning in transcatheter aortic valve implantation
auteur
Hélène Feuillâtre, Vincent Auffret, Miguel Castro, Florent Lalys, Herve Le Breton, Mireille Garreau, Pascal Haigron
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2020, 15 (9), pp.e0238463. ⟨10.1371/journal.pone.0238463⟩
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2019

Journal articles

titre
Use of Numerical Simulation to Predict Iliac Complications During Placement of an Aortic Stent Graft
auteur
Anne Daoudal, Juliette Gindre, Florent Lalys, Moundji Kafi, Claire Dupont, Antoine Lucas, Pascal Haigron, Adrien Kaladji
article
Annals of Vascular Surgery, Elsevier Masson, 2019, 61, pp.291-298. ⟨10.1016/j.avsg.2019.04.035⟩
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titre
Identification of Parameters Influencing the Vascular Structure Displacement in Fusion Imaging during Endovascular Aneurysm Repair
auteur
Florent Lalys, Alexandre Barré, Moundji Kafi, Mohamed Benziane, Blandine Saudreau, Claire Dupont, Adrien Kaladji
article
JVIR: Journal of Vascular and Interventional Radiology, Elsevier, 2019, 30 (9), pp.1386-1392. ⟨10.1016/j.jvir.2019.02.022⟩
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https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-02150190/file/Lalys-2019-Identification%20of%20Parameters%20Influencing%20the%20Vascular%20Structure%20Displacement-final.pdf BibTex
titre
Fusion imaging for EVAR with mobile c-arm
auteur
Adrien Kaladji, Alexandre Villena, Remy Pascot, Florent Lalys, Anne Daoudal, Elodie Clochard, Antoine Lucas, Alain Cardon
article
Annals of Vascular Surgery, Elsevier Masson, 2019, 55, pp.166-174. ⟨10.1016/j.avsg.2018.06.006⟩
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https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01862530/file/Kaladji_Fusion%20imaging%20for%20EVAR.pdf BibTex
titre
Automatic aortic root segmentation and anatomical landmarks detection for TAVI procedure planning
auteur
Florent Lalys, Simon Esneault, Miguel Castro, Lucas Royer, Pascal Haigron, Vincent Auffret, Jacques Tomasi
article
Minimally Invasive Therapy and Allied Technologies, Taylor & Francis, 2019, 28 (3), pp.157-164. ⟨10.1080/13645706.2018.1488734⟩
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https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01862531/file/Lalys_Automatic%20aortic%20root%20segmentation_MITAT_final.pdf BibTex

2018

Journal articles

titre
A hybrid image fusion system for endovascular interventions of peripheral artery disease
auteur
Florent Lalys, Ketty Favre, Alexandre Villena, Vincent Durrmann, Mathieu Colleaux, Antoine Lucas, Adrien Kaladji
article
International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery, Springer Verlag, 2018, 13 (7), pp.997-1007. ⟨10.1007/s11548-018-1731-9⟩
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https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01812215/file/Lalys%20-%20A%20hybrid%20image%20fusion%20system%20-%20IJCARS_2017_V8.pdf BibTex

2017

Journal articles

titre
Influencing factors of sac shrinkage after endovascular aneurysm repair
auteur
Florent Lalys, Anne Daoudal, Juliette Gindre, Cemil Goksu, Antoine Lucas, Adrien Kaladji
article
Journal of Vascular Surgery, Elsevier, 2017, 65 (6), pp.1830-1838. ⟨10.1016/j.jvs.2016.12.131⟩
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BibTex
titre
Predictive Models of Complications after Endovascular Aortic Aneurysm Repair
auteur
Adrien Kaladji, Anne Daoudal, Aurélien Dumenil, Cemil Goksu, Alain Cardon, Elodie Clochard, Antoine Lucas, Florent Lalys
article
Annals of Vascular Surgery, Elsevier Masson, 2017, 40, pp.19--27. ⟨10.1016/j.avsg.2016.08.020⟩
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BibTex
titre
Systematic Review and Meta-Analysis of Preoperative Risk Factors of Type II Endoleaks after Endovascular Aneurysm Repair
auteur
Florent Lalys, Vincent Durrmann, Aurélien Dumenil, Cemil Goksu, Alain Cardon, Elodie Clochard, Antoine Lucas, Adrien Kaladji
article
Annals of Vascular Surgery, Elsevier Masson, 2017, 41, pp.284-293. ⟨10.1016/j.avsg.2016.08.021⟩
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2015

Journal articles

titre
PyDBS: an automated image processing workflow for deep brain stimulation surgery.
auteur
Tiziano d'Albis, Claire Haegelen, Caroline Essert, Sara Fernández-Vidal, Florent Lalys, Pierre Jannin
article
International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery, Springer Verlag, 2015, 10 (2), pp.117-28. ⟨10.1007/s11548-014-1007-y⟩
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-01116063/file/pydbs_revised_topublish.pdf BibTex

2014

Journal articles

titre
Weight gain following subthalamic nucleus deep brain stimulation: a PET study.
auteur
Paul Sauleau, Florence Le Jeune, Sophie Drapier, Jean-François Houvenaghel, Thibaut Dondaine, Claire Haegelen, Florent Lalys, Gabriel Robert, Dominique Drapier, Marc Vérin
article
Movement Disorders, Wiley, 2014, 29 (14), pp.1781-7. ⟨10.1002/mds.26063⟩
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titre
Surgical process modelling: a review.
auteur
Florent Lalys, Pierre Jannin
article
International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery, Springer Verlag, 2014, 9 (3), pp.495-511. ⟨10.1007/s11548-013-0940-5⟩
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-00926470/file/Etat_art_V13.pdf BibTex
titre
Investigation of morphometric variability of subthalamic nucleus, red nucleus, and substantia nigra in advanced Parkinson's disease patients using automatic segmentation and PCA-based analysis.
auteur
Yiming Xiao, Pierre Jannin, Tiziano d'Albis, Nicolas Guizard, Claire Haegelen, Florent Lalys, Marc Vérin, Louis Collins
article
Human Brain Mapping, Wiley, 2014, 35 (9), pp.4330-44. ⟨10.1002/hbm.22478⟩
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-01012041/file/PCA_morphometric_variability_analysis_of_midbrain_nuclei.pdf BibTex
titre
Analysis of electrode deformations in deep brain stimulation surgery.
auteur
Florent Lalys, Claire Haegelen, Tiziano d'Albis, Pierre Jannin
article
International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery, Springer Verlag, 2014, 9 (1), pp.107-17. ⟨10.1007/s11548-013-0911-x⟩
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-00836932/file/Courbure-DBS-V9.pdf BibTex

2013

Journal articles

titre
Multi-site study of surgical practice in neurosurgery based on surgical process models.
auteur
Germain Forestier, Florent Lalys, Laurent Riffaud, D. Louis Collins, Jurgen Meixensberger, Shafik Wassef, Thomas Neumuth, Benoit Goulet, Pierre Jannin
article
Journal of Biomedical Informatics, Elsevier, 2013, 46 (5), pp.822-9. ⟨10.1016/j.jbi.2013.06.006⟩
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-00853846/file/jbi2013.pdf BibTex
titre
Anatomo-clinical atlases correlate clinical data and electrode contact coordinates: application to subthalamic deep brain stimulation.
auteur
Florent Lalys, Claire Haegelen, Mehri Maroua, Sophie Drapier, Marc Verin, Pierre Jannin
article
Journal of Neuroscience Methods, Elsevier, 2013, 212 (2), pp.297-307. ⟨10.1016/j.jneumeth.2012.11.002⟩
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-00750921/file/1-s2.0-S0165027012004499-main.pdf BibTex
titre
Automatic knowledge-based recognition of low-level tasks in ophthalmological procedures.
auteur
Florent Lalys, David Bouget, Laurent Riffaud, Pierre Jannin
article
International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery, Springer Verlag, 2013, 8 (1), pp.39-49. ⟨10.1007/s11548-012-0685-6⟩
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-00695646/file/Lalys2012-IJCARS.pdf BibTex

2012

Journal articles

titre
A framework for the recognition of high-level surgical tasks from video images for cataract surgeries.
auteur
Florent Lalys, Laurent Riffaud, David Bouget, Pierre Jannin
article
IEEE Transactions on Biomedical Engineering, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2012, 59 (4), pp.966-76. ⟨10.1109/TBME.2011.2181168⟩
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-00669682/file/TBE_2012_V7.pdf BibTex
titre
Classification of surgical processes using dynamic time warping
auteur
Germain Forestier, Florent Lalys, Laurent Riffaud, Brivael Trelhu, Pierre Jannin
article
Journal of Biomedical Informatics, Elsevier, 2012, 45 (2), pp.255-264. ⟨10.1016/j.jbi.2011.11.002⟩
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-00669624/file/jbi2012.pdf BibTex

Conference papers

titre
Surgical Tools Recognition and Pupil Segmentation for Cataract Surgical Process Modeling
auteur
David Bouget, Florent Lalys, Pierre Jannin
article
Medicine Meets Virtual Reality - NextMed, Feb 2012, Newport beach, CA, United States. pp.78-84
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-00669660/file/Bouget_D.pdf BibTex
titre
Analysis of electrodes' placement and deformation in deep brain stimulation from medical images
auteur
Maroua Mehri, Florent Lalys, Camille Maumet, Claire Haegelen, Pierre Jannin
article
SPIE Medical Imaging, Feb 2012, San diego, CA, United States. pp.8316-32, ⟨10.1117/12.912225⟩
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-00669674/file/MarouaMEHRI_MI_2012.pdf BibTex
titre
Clustering de séquences d'activités pour l'étude de procédures neurochirurgicales
auteur
Germain Forestier, Florent Lalys, Laurent Riffaud, Brivael Trelhu, Pierre Jannin
article
12e Conférence Internationale Francophone sur l'Extraction et la Gestion des Connaissances, Feb 2012, Bordeaux, France. pp.489-494
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-00670007/file/egc2012_final.pdf BibTex

Theses

titre
Automatic recognition of low-level and high-level surgical tasks in the Operating Room from video images
auteur
Florent Lalys
article
Medical Imaging. Université Rennes 1, 2012. English
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00695648/file/These-Lalys-Florent.pdf BibTex

2011

Journal articles

titre
Automatic computation of electrode trajectories for Deep Brain Stimulation: a hybrid symbolic and numerical approach
auteur
Caroline Essert, Claire Haegelen, Florent Lalys, Alexandre Abadie, Pierre Jannin
article
International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery, Springer Verlag, 2011, 7 (4), pp.517-532. ⟨10.1007/s11548-011-0651-8⟩
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Conference papers

titre
An application-dependent framework for the recognition of high-level surgical tasks in the OR
auteur
Florent Lalys, Laurent Riffaud, David Bouget, Pierre Jannin
article
14th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention, Sep 2011, Toronto, Canada. pp.331-338
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-00617015/file/paper_630_Lalys.pdf BibTex
titre
Assessment of surgical skills using Surgical Processes and Dynamic Time Warping
auteur
Germain Forestier, Florent Lalys, Laurent Riffaud, Brivael Trelhu, Pierre Jannin
article
M2CAI 2011 (MICCAI workshop) - Modelling and Monitoring of Computer-Assisted Intervention, Sep 2011, Toronto, Canada
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-00617017/file/paper7_DTW_revised.pdf BibTex
titre
Validation of basal ganglia segmentation on a 3T MRI template
auteur
Claire Haegelen, Nicolas Guizard, Pierrick Coupé, Florent Lalys, Pierre Jannin, Xavier Morandi, D. Louis Collins
article
Human Brain Mapping, Jun 2011, Quebec City, Canada
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-00632521/file/Abstract-HBM.pdf BibTex
titre
Correlating Clinical Scores with Anatomical Electrodes Locations for Assessing Deep Brain Stimulation
auteur
Florent Lalys, Claire Haegelen, Alexandre Abadie, Pierre Jannin
article
IPCAI 2011, Jun 2011, Berlin, Germany. pp.113-121, ⟨10.1007/978-3-642-21504-9_11⟩
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-00617006/file/IPCAI_2011_V2.pdf BibTex
titre
Analyse de vidéos de microscopes chirurgicaux pour la reconnaissance automatique d'étapes en combinant SVM et HMM
auteur
Florent Lalys, Laurent Riffaud, Xavier Morandi, Pierre Jannin
article
ORASIS - Congrès des jeunes chercheurs en vision par ordinateur, INRIA Grenoble Rhône-Alpes, Jun 2011, Praz-sur-Arly, France. epub ahead of print
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https://hal.inria.fr/inria-00595720/file/paper19.pdf BibTex

Poster communications

titre
Anatomo-Clinical Atlases in SubThalamic Deep Brain Stimulation : correlating clinical data and electrode contacts coordinates
auteur
Florent Lalys, Claire Haegelen, Maroua Mehri, Pierre Jannin
article
Troisième réunion annuelle de l’ITMO Technologies pour la Santé, Oct 2011, Tours, France. 2011
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2010

Journal articles

titre
Construction and assessment of a 3-T MRI brain template.
auteur
Florent Lalys, Claire Haegelen, Jean-Christophe Ferré, Omar El-Ganaoui, Pierre Jannin
article
NeuroImage, Elsevier, 2010, 49 (1), pp.345-54. ⟨10.1016/j.neuroimage.2009.08.007⟩
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-00546487/file/NeuroImage_2009-2b.pdf BibTex

Conference papers

titre
Validation de la Segmentation des Ganglions de la Base sur un Template IRM 3 Tesla
auteur
Claire Haegelen, Florent Lalys, Pierre Jannin, Alexandre Abadie, Louis Collins, Gilles Brassier, Xavier Morandi
article
Réunion de la Société de Neurochirurgie de Langue Française, Dec 2010, Marne-la-Vallée, France. pp.543-544
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BibTex
titre
Surgical Phases Detection from Microscope Videos by Combining SVM and HMM
auteur
Florent Lalys, Laurent Riffaud, Xavier Morandi, Pierre Jannin
article
International MICCAI Workshop, MCV 2010, Sep 2010, Beijing, China. pp.54-62
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-00616981/file/MICCAI_MCV_paper_8.pdf BibTex
titre
Automatic phases recognition in pituitary surgeries by microscope images classification
auteur
Florent Lalys, Laurent Riffaud, Xavier Morandi, Pierre Jannin
article
IPCAI'10, First international conference on Information processing in computer-assisted interventions, Jun 2010, Geneve, Switzerland. pp.34-44, ⟨10.1007/978-3-642-13711-2_4⟩
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-00616977/file/IPCAI_2010_V2.pdf BibTex
titre
Anatomo-clinical atlases in subthalamic Deep Brain Stimulation correlating clinical data and electrode contacts coordinates
auteur
Florent Lalys, Claire Haegelen, Muriel Baillieul, Alexandre Abadie, Pierre Jannin
article
7th Annual World Congress for Brain Mapping and Image Guided Therapy, IBMISPS'2010, Apr 2010, United States
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-00616979/file/IBMISPS_abstract.pdf BibTex

2009

Conference papers

titre
Post-operative assessment in Deep Brain Stimulation based on multimodal images: registration workflow and validation.
auteur
Florent Lalys, Claire Haegelen, Alexandre Abadie, Pierre Jannin
article
Medical Imaging 2009: Visualization, Image-Guided Procedures, and Modeling, Feb 2009, Lake Buena Vista, FL, United States. pp.72612M, ⟨10.1117/12.810475⟩
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-00616970/file/SPIE2009.pdf BibTex
titre
Analyse de données pour la construction de modèles de procédures neurochirurgicales
auteur
Brivael Trelhu, Florent Lalys, Laurent Riffaud, Xavier Morandi, Pierre Jannin
article
Extraction et gestion des connaissances (EGC 2009), Jan 2009, Strasbourg, France. pp.427-432
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-00616975/file/Trelhu09a.pdf BibTex
titre
Analyse post-opératoire en stimulation cérébrale profonde basée sur des images multimodales : mise en place et validation des chaînes de recalage
auteur
Florent Lalys, Claire Haegelen, Alexandre Abadie, Omar El Ganaoui, Pierre Jannin
article
ORASIS'09 - Congrès des jeunes chercheurs en vision par ordinateur, 2009, Trégastel, France, France
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https://hal.inria.fr/inria-00404643/file/39.pdf BibTex