Publications HAL du labo/EPI 40491;460002;459988;460033;460005;459993;460014

2021

titre
Vous avez dit paléogénomique ?
auteur
Céline Bon, Marie-Claude Marsolier-Kergoat
article
Revue d’ethnoécologie, Paris : Revue d’ethnoécologie, Museum national d’histoire naturelle, 2021, ⟨10.4000/ethnoecologie.6696⟩
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2020

titre
Polo-like kinase 1 (Plk1) is a positive regulator of DNA replication in the Xenopus in vitro system
auteur
Diletta Ciardo, Olivier Haccard, Hemalatha Narassimprakash, Virginie Chioldelli, Arach Goldar, Kathrin Marheineke
article
Cell Cycle, Taylor & Francis, 2020, ⟨10.1080/15384101.2020.1782589⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02879764/file/Ciardo_et_al_2020.pdf BibTex
titre
A mobile laboratory for ancient DNA analysis
auteur
José Utge, Noémie Sévêque, Anne-Sophie Lartigot-Campin, Agnès Testu, Anne-Marie Moigne, Régis Vézian, Frédéric Maksud, Robert Bégouën, Christine Verna, Sylvain Soriano, Jean-Marc Elalouf
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2020, 15 (3), pp.e0230496. ⟨10.1371/journal.pone.0230496⟩
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titre
Mediator Roles Going Beyond Transcription
auteur
Kévin M. André, Eliet H. Sipos, Julie Soutourina
article
Trends in genetics: TIG, 2020, ⟨10.1016/j.tig.2020.08.015⟩
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titre
The Importance Of Naturally Attenuated Sars-Cov-2 In The Fight Against Covid-19
auteur
J. Armengaud, Agnès Delaunay-Moisan, Jean-Yves Thuret, Eelco Van Anken, Diego Acosta-Alvear, Tomás Aragón, Carolina Arias, Marc Blondel, Ineke Braakman, Jean-François Collet, René Courcol, Antoine Danchin, Jean-François Deleuze, Jean-Philippe Lavigne, Sophie Lucas, Thomas Michiels, Edward R. B. Moore, Jonathon Nixon-Abell, Ramon Rossello-Mora, Zhengli Shi, Antonio G. Siccardi, Roberto Sitia, Daniel Tillett, Kenneth N. Timmis, Michel B. Toledano, Peter van Der Sluijs, Elisa Vicenzi
article
Environmental Microbiology, Society for Applied Microbiology and Wiley-Blackwell, 2020, n/a (n/a), ⟨10.1111/1462-2920.15039⟩
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titre
Structural basis of the interaction between cyclodipeptide synthases and aminoacylated tRNA substrates
auteur
Gabrielle Bourgeois, Jérôme Seguin, Morgan Babin, Muriel Gondry, Yves Mechulam, Emmanuelle Schmitt
article
RNA (New York, N.Y.), 2020, ⟨10.1261/rna.075184.120⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02907478/file/RNA-2020-Bourgeois-1589-602.pdf BibTex
titre
Cyclodipeptide synthases: a promising biotechnological tool for the synthesis of diverse 2,5-diketopiperazines
auteur
Nicolas Canu, Mireille Moutiez, Pascal Belin, Muriel Gondry
article
Natural Product Reports, Royal Society of Chemistry, 2020, ⟨10.1039/c9np00036d⟩
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titre
Flexizyme-aminoacylated shortened tRNAs demonstrate that only the aminoacylated acceptor arms of the two tRNA substrates are required for cyclodipeptide synthase activity
auteur
Nicolas Canu, Carine Tellier, Morgan Babin, Robert Thai, Inès Ajel, Jérôme Seguin, Olivier Cinquin, Robin Vinck, Mireille Moutiez, Pascal Belin, Jean-Christophe Cintrat, Muriel Gondry
article
Nucleic Acids Research, 2020, ⟨10.1093/nar/gkaa903⟩
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titre
A small targeting domain in Ty1 integrase is sufficient to direct retrotransposon integration upstream of tRNA genes
auteur
Camille Grison, Indranil Adhya, Rachid Menouni, Hélène Fayol, Noé Palmic, Joël Acker, Pascale Lesage, Amna Asif-Laidin, Christine Conesa, Amandine Bonnet
article
EMBO Journal, EMBO Press, 2020, pp.e104337. ⟨10.15252/embj.2019104337⟩
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titre
Histone Variant H2A.J Marks Persistent DNA Damage and Triggers the Secretory Phenotype in Radiation-Induced Senescence
auteur
Anna Isermann, Carl Mann, Claudia E. Rübe
article
International Journal of Molecular Sciences, MDPI, 2020, 21 (23), ⟨10.3390/ijms21239130⟩
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titre
In vivo characterization of the activities of novel cyclodipeptide oxidases: new tools for increasing chemical diversity of bioproduced 2,5-diketopiperazines in Escherichia coli
auteur
Fabien Le Chevalier, Isabelle Correia, Lucrèce Matheron, Morgan Babin, Mireille Moutiez, Nicolas Canu, Muriel Gondry, Olivier Lequin, Pascal Belin
article
Microbial Cell Factories, 2020, 19 (1), pp.178. ⟨10.1186/s12934-020-01432-y⟩
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2019

titre
Design on a Rational Basis of High-Affinity Peptides Inhibiting the Histone Chaperone ASF1
auteur
May Bakail, Albane Gaubert, Jessica Andreani, Gwenaëlle Moal, Guillaume Pinna, Ekaterina Boyarchuk, Marie-Cécile Gaillard, Régis Courbeyrette, Carl Mann, Jean-Yves Thuret, Berengère Guichard, Brice Murciano, Nicolas Richet, Adeline Poitou, Claire Frederic, Marie-Hélène Le Du, Morgane Agez, Caroline Roelants, Zachary Gurard-Levin, Geneviève Almouzni, Nadia Cherradi, Raphaël Guérois, Françoise Ochsenbein
article
Cell Chemical Biology, Cell Press, 2019, 26 (11), pp.1573-1585.e10. ⟨10.1016/j.chembiol.2019.09.002⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02385251/file/Bakail%20M.%20et%20al%202019.pdf BibTex
titre
Euclid preparation
auteur
R. Barnett, S. J. Warren, D. J. Mortlock, J.-G. Cuby, C. Conselice, P. C. Hewett, C. J. Willott, N. Auricchio, A. Balaguera-Antolínez, M. Baldi, S. Bardelli, F. Bellagamba, R. Bender, A. Biviano, D. Bonino, E. Bozzo, E. Branchini, M. Brescia, J. Brinchmann, C. Burigana, S. Camera, V. Capobianco, C. Carbone, J. Carretero, C. S. Carvalho, F. J. Castander, M. Castellano, S. Cavuoti, A. Cimatti, R. Clédassou, G. Congedo, L. Conversi, Y. Copin, L. Corcione, J. Coupon, H. M. Courtois, M. Cropper, A. da Silva, C. A. J. Duncan, S. Dusini, A. Ealet, S. Farrens, P. Fosalba, S. Fotopoulou, N. Fourmanoit, M. Frailis, M. Fumana, S. Galeotta, B. Garilli, W. Gillard, B. R. Gillis, J. Graciá-Carpio, F. Grupp, H. Hoekstra, F. Hormuth, H. Israel, K. Jahnke, S. Kermiche, M. Kilbinger, C. C. Kirkpatrick, T. Kitching, R. Kohley, B. Kubik, M. Kunz, H. Kurki-Suonio, R. Laureijs, S. Ligori, P. B. Lilje, I. Lloro, E. Maiorano, O. Mansutti, O. Marggraf, N. Martinet, F. Marulli, R. Massey, N. Mauri, E. Medinaceli, S. Mei, Y. Mellier, R. B. Metcalf, J. J. Metge, G. Meylan, M. Moresco, L. Moscardini, E. Munari, C. Neissner, S. M. Niemi, T. Nutma, C. Padilla, S. Paltani, F. Pasian, P. Paykari, W. J. Percival, V. Pettorino, G. Polenta, M. Poncet, L. Pozzetti, F. Raison, A. Renzi, J. Rhodes, H.-W. Rix, E. Romelli, M. Roncarelli, E. Rossetti, R. Saglia, D. Sapone, R. Scaramella, P. Schneider, V. Scottez, A. Secroun, S. Serrano, G. Sirri, L. Stanco, F. Sureau, P. Tallada-Crespí, D. Tavagnacco, A. N. Taylor, M. Tenti, I. Tereno, R. Toledo-Moreo, F. Torradeflot, L. Valenziano, T. Vassallo, Y. Wang, A. Zacchei, G. Zamorani, J. Zoubian, E. Zucca
article
Astronomy and Astrophysics - A&A, EDP Sciences, 2019, 631, pp.A85. ⟨10.1051/0004-6361/201936427⟩
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https://hal-cea.archives-ouvertes.fr/cea-02334278/file/aa36427-19.pdf BibTex
titre
Glucocorticoids delay RAF-induced senescence promoted by EGR1
auteur
Cyril Carvalho, Valentin l'Hôte, Régis Courbeyrette, Gueorgui Kratassiouk, Guillaume Pinna, Jean-Christophe Cintrat, Cyril Denby-Wilkes, Céline Derbois, Robert Olaso, Jean-François Deleuze, Carl Mann, Jean-Yves Thuret
article
Journal of Cell Science, Company of Biologists, 2019, 132 (16), pp.jcs230748. ⟨10.1242/jcs.230748⟩
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titre
A genome-wide RNAi screen reveals essential therapeutic targets of breast cancer stem cells
auteur
Abir Arfaoui, Claire Rioualen, Violette Azzoni, Guillaume Pinna, Pascal Finetti, Julien Wicinski, Emmanuelle Josselin, Manon Macario, Rémy Castellano, Candi Léonard-Stumpf, Anthony Bal, Abigaelle Gros, Sylvain Lossy, Maher Kharrat, Yves Collette, François Bertucci, Daniel Birnbaum, Hayet Douik, Ghislain Bidaut, Emmanuelle Charafe-Jauffret, Christophe Ginestier
article
EMBO Molecular Medicine, Wiley Open Access, 2019, 11 (10), pp.e9930. ⟨10.15252/emmm.201809930⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02539524/file/Arfaoui%20et%20al.%20%28RNAi%20screen%29.pdf BibTex
titre
On the Interplay of the DNA Replication Program and the Intra-S Phase Checkpoint Pathway
auteur
Diletta Ciardo, Arach Goldar, Kathrin Marheineke
article
Genes, MDPI, 2019, 10 (2), pp.94. ⟨10.3390/genes10020094⟩
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titre
Author Correction: Reprogramming Escherichia coli for the production of prenylated indole diketopiperazine alkaloids
auteur
Pavlina Dubois, Isabelle Correia, Fabien Le Chevalier, Steven Dubois, Isabelle Jacques, Nicolas Canu, Mireille Moutiez, Robert Thai, Muriel Gondry, Olivier Lequin, Pascal Belin
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2019, 9 (1), pp.15009. ⟨10.1038/s41598-019-51404-5⟩
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titre
Functional interplay between Mediator and RNA polymerase II in Rad2/XPG loading to the chromatin
auteur
Adrien Georges, Diyavarshini Gopaul, Cyril Denby Wilkes, Nathalie Giordanengo Aiach, Elizaveta Novikova, Marie-Bénédicte Barrault, Olivier Alibert, Julie Soutourina
article
Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2019, ⟨10.1093/nar/gkz598⟩
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titre
Urinary ketone body loss leads to degeneration of brain white matter in elderly SLC5A8-deficient mice
auteur
Laurent Suissa, Virginie Flachon, Jean-Marie Guigonis, Charles-Vivien Olivieri, Fanny Burel-Vandenbos, Julien Guglielmi, Damien Ambrosetti, Matthieu Gérard, Philippe Franken, Jacques Darcourt, Luc Pellerin, Thierry Pourcher, Sabine Lindenthal
article
Journal of Cerebral Blood Flow and Metabolism, Nature Publishing Group, 2019, pp.271678X19873662. ⟨10.1177/0271678X19873662⟩
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titre
Study of bicyclomycin biosynthesis in Streptomyces cinnamoneus by genetic and biochemical approaches
auteur
Jerzy Witwinowski, Mireille Moutiez, Matthieu Coupet, Isabelle Correia, Pascal Belin, Antonio Ruzzini, Corinne Saulnier, Laëtitia Caraty, Emmanuel Favry, Jérôme Seguin, Sylvie Lautru, Olivier Lequin, Muriel Gondry, Jean-Luc Pernodet, Emmanuelle Darbon
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2019, 9 (1), pp.20226. ⟨10.1038/s41598-019-56747-7⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02431235/file/2019_Study%20of%20bicyclomycin%20biosynthesis%20in%20Streptomyces%20cinnamoneusby%20genetic%20and%20biochemical%20approaches.pdf BibTex
titre
Human CCR6+Th17 lymphocytes are highly sensitive to radiation-induced senescence and are a potential target for prevention of radiation-induced toxicity
auteur
Patricia Zadigue, Alexandre La Taille, Paul-Henri Romeo, Sabine Le Gouvello, Hoang Quy Nguyen, Yazid Belkacemi, Carl Mann, Françoise Hoffschir, Stéphane Kerbrat, Mathieu Surénaud
article
International Journal of Radiation Oncology, Biology, Physics, 2019, ⟨10.1016/j.ijrobp.2019.10.045⟩
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2018

titre
The eukaryotic bell-shaped temporal rate of DNA replication origin firing emanates from a balance between origin activation and passivation
auteur
Jean-Michel Arbona, Arach Goldar, Olivier Hyrien, Alain Arneodo, Benjamin Audit
article
eLife, eLife Sciences Publication, 2018, 7, pp.e35192. ⟨10.7554/eLife.35192⟩
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titre
The striatal kinase DCLK3 produces neuroprotection against mutant huntingtin
auteur
Laurie Galvan, Laetitia Francelle, Marie-Claude Gaillard, Lucie de Longprez, Maria-Angeles Carrillo-de Sauvage, Géraldine Liot, Karine Cambon, Lev Stimmer, Sophie Luccantoni, Julien Flament, Julien Valette, Michel de Chaldée, Gwenaëlle Auregan, Martine Guillermier, Charlène Joséphine, Fanny Petit, Caroline Jan, Margot Jarrige, Noëlle Dufour, Gilles Bonvento, Sandrine Humbert, Frédéric Saudou, Philippe Hantraye, Karine Mérienne, Alexis-Pierre Bemelmans, Anselme Perrier, Nicole Déglon, Emmanuel Brouillet
article
Brain - A Journal of Neurology , Oxford University Press (OUP), 2018, 141 (5), pp.1434-1454. ⟨10.1093/brain/awy057⟩
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titre
Incorporation of Non-canonical Amino Acids into 2,5-Diketopiperazines by Cyclodipeptide Synthases
auteur
Nicolas Canu, Pascal Belin, Robert Thai, Isabelle Correia, Olivier Lequin, Jérôme Seguin, Mireille Moutiez, Muriel Gondry
article
Angewandte Chemie International Edition, Wiley-VCH Verlag, 2018, 57 (12), pp.3118-3122. ⟨10.1002/anie.201712536⟩
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titre
A mating-type mutagenesis screen identifies a zinc-finger protein required for specific DNA excision events in Paramecium
auteur
Simran Bhullar, Cyril Denby Wilkes, Olivier Arnaiz, Mariusz Nowacki, Linda Sperling, Eric Meyer
article
Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2018, 46 (18), pp.9550--9562. ⟨10.1093/nar/gky772⟩
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titre
Six domesticated PiggyBac transposases together carry out programmed DNA elimination in Paramecium
auteur
Julien Bischerour, Simran Bhullar, Cyril Denby Wilkes, Vinciane Régnier, Nathalie Mathy, Emeline Dubois, Aditi Singh, Estienne Swart, Olivier Arnaiz, Linda Sperling, Mariusz Nowacki, Mireille Bétermier
article
Elife, 2018, 7, pp.e37927. ⟨10.7554/eLife.37927⟩
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titre
A Comprehensive Overview of the Cyclodipeptide Synthase Family Enriched with the Characterization of 32 New Enzymes
auteur
Muriel Gondry, Isabelle Jacques, Robert Thai, Morgan Babin, Nicolas Canu, Jérôme Seguin, Pascal Belin, Jean-Luc Pernodet, Mireille Moutiez
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2018, 9, pp.46. ⟨10.3389/fmicb.2018.00046⟩
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https://hal-cea.archives-ouvertes.fr/cea-01988448/file/A%20Comprehensive%20Overview%20of%20the%20Cyclodipeptide%20Synthase%20Family%20Enriched%20with%20the%20Characterization%20of%2032%20New%20Enzymes.pdf BibTex
titre
Mediator, known as a coactivator, can act in transcription initiation in an activator-independent manner in vivo
auteur
Helene Jean-Jacques, Siew Lay Poh, Laurent Kuras
article
Biochimica et Biophysica Acta - Gene Regulatory Mechanisms , Elsevier, 2018, 1861 (8), pp.687--696. ⟨10.1016/j.bbagrm.2018.07.001⟩
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titre
Nrf2-activated expression of sulfiredoxin contributes to urethane-induced lung tumorigenesis
auteur
Murli Mishra, Hong Jiang, Hedy A. Chawsheen, Matthieu Gérard, Michel B. Toledano, Qiou Wei
article
Cancer Letters, Elsevier, 2018, 432, pp.216--226. ⟨10.1016/j.canlet.2018.06.011⟩
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2017

titre
Transcription regulation by the Mediator complex
auteur
Julie Soutourina
article
Nature Reviews Molecular Cell Biology, Nature Publishing Group, 2017, 19 (4), pp.262 - 274. ⟨10.1038/nrm.2017.115⟩
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titre
Genome data on the extinct $Bison\ schoetensacki$ establish it as a sister species of the extant European bison ($Bison\ bonasus$)
auteur
Pauline Palacio, Véronique Berthonaud, Claude Guérin, Josie Lambourdière, Frédéric Maksud, Michel Philippe, Delphine Plaire, Thomas Stafford, Marie-Claude Marsolier-Kergoat, Jean-Marc Elalouf
article
BMC Evolutionary Biology, BioMed Central, 2017, 17, pp.48. ⟨10.1186/s12862-017-0894-2⟩
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https://hal-cea.archives-ouvertes.fr/cea-03282660/file/palac1.pdf BibTex
titre
A scaffold protein that chaperones a cysteine-sulfenic acid in H2O2 signaling
auteur
Antoine Bersweiler, Benoît d'Autréaux, Hortense Mazon, Alexandre Kriznik, Gemma Belli, Agnès Delaunay-Moisan, Michel B Toledano, Sophie Rahuel-Clermont
article
Nature Chemical Biology, Nature Publishing Group, 2017, 13 (8), pp.909 - 915. ⟨10.1038/nCHeMBIO.2412⟩
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https://hal.univ-lorraine.fr/hal-01652643/file/17473_3_merged_1489503813%281%29.pdf BibTex
titre
Comparative analysis of the sensitivity of metagenomic sequencing and PCR to detect a biowarfare simulant ($Bacillus\ atrophaeus$) in soil samples
auteur
Delphine Plaire, Simon Puaud, Marie-Claude Marsolier-Kergoat, Jean-Marc Elalouf
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2017, 12 (5), pp.e0177112. ⟨10.1371/journal.pone.0177112⟩
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https://hal-cea.archives-ouvertes.fr/cea-03282656/file/pla1.pdf BibTex
titre
Histone Variant H2A.L.2 Guides Transition Protein-Dependent Protamine Assembly in Male Germ Cells
auteur
Sophie Barral, Yuichi Morozumi, Hiroki Tanaka, Emilie Montellier, Jérôme Govin, Maud de Dieuleveult, Guillaume Charbonnier, Yohann Coute, Denis Puthier, Thierry Buchou, Fayçal Boussouar, Takashi Urahama, François Fenaille, Sandrine Curtet, Patrick Héry, Nicolas Fernandez-Nunez, Hitoshi Shiota, Matthieu Gérard, Sophie Rousseaux, Hitoshi Kurumizaka, Saadi Khochbin
article
Molecular Cell, Elsevier, 2017, 66 (1), pp.89-101.e8. ⟨10.1016/j.molcel.2017.02.025⟩
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titre
Light-sensing via hydrogen peroxide and a peroxiredoxin
auteur
Kristofer Bodvard, Ken Peeters, Friederike Roger, Natalie Romanov, Aeid Igbaria, Niek Welkenhuysen, Gael Palais, Wolfgang Reiter, Michel B. Toledano, Mikael Käll, Mikael Molin
article
Nature Communications, Nature Publishing Group, 2017, 8, pp.14791. ⟨10.1038/ncomms14791⟩
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https://hal-cea.archives-ouvertes.fr/cea-02139188/file/bod.pdf BibTex
titre
Concerted action of the MutLβ heterodimer and Mer3 helicase regulates the global extent of meiotic gene conversion
auteur
Yann Duroc, Rajeev Kumar, Lepakshi Ranjha, Céline Adam, Raphaël Guérois, Khan Md Muntaz, Marie-Claude Marsolier-Kergoat, Florent Dingli, Raphaëlle Laureau, Damarys Loew, Bertrand Llorente, Jean-Baptiste Charbonnier, Petr Cejka, Valérie Borde
article
eLife, eLife Sciences Publication, 2017, 6, pp.e21900. ⟨10.7554/eLife.21900⟩
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https://hal-cea.archives-ouvertes.fr/cea-03282661/file/Dur1.pdf BibTex
titre
Absence of Gim proteins, but not GimC complex, alter stress-induced transcription
auteur
Ana Fátima Amorim, Dora Pinto, Laurent Kuras, Lisete Fernandes
article
BBA - Biochimica et Biophysica Acta, Elsevier, 2017, ⟨10.1016/j.bbagrm.2017.04.005⟩
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titre
Molecular genetics of the transcription factor GLIS3 identifies its dual function in beta cells and neurons
auteur
Sophie Calderari, Massimiliano Ria, Christelle Gérard, Tatiane C. Nogueira, Olatz Villate, Stephan C. Collins, Helen Neil, Nicolas Gervasi, Christophe Hue, Nicolas Suarez-Zamorano, Cécilia Prado, Miriam Cnop, Marie-Thérèse Bihoreau, Pamela J. Kaisaki, Jean-Baptiste Cazier, Cécile Julier, Mark Lathrop, Michel Werner, Decio L. Eizirik, Dominique Gauguier
article
Genomics, 2017, 110 (2), pp.98-111. ⟨10.1016/j.ygeno.2017.09.001⟩
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titre
Reexamining the function of glutathione in oxidative protein folding and secretion
auteur
Agnès Delaunay-Moisan, Alise Ponsero, Michel Toledano
article
Antioxidants & redox signaling, 2017, ⟨10.1089/ars.2017.7148⟩
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titre
Toward understanding of the mechanisms of Mediator function in vivo: Focus on the preinitiation complex assembly
auteur
Thomas Eychenne, Michel Werner, Julie Soutourina
article
Transcription, 2017, 8 (5), pp.328--342. ⟨10.1080/21541264.2017.1329000⟩
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titre
Nonlinear feedback drives homeostatic plasticity in H2O2 stress response
auteur
Youlian Goulev, Sandrine Morlot, Audrey Matifas, Bo Huang, Mikael Molin, Michel B. Toledano, Gilles Charvin
article
Elife, 2017, 6, ⟨10.7554/eLife.23971⟩
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titre
Publisher Correction: Membrane association of the bacterial riboregulator Hfq and functional perspectives
auteur
Antoine Malabirade, Javier Morgado-Brajones, Sylvain Trépout, Frank Wien, Ileana Marquez, Jérôme Seguin, Sergio Marco, Marisela Velez, Véronique Arluison
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2017, 7 (1), pp.15651. ⟨10.1038/s41598-017-15019-y⟩
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titre
Aminoacyl-tRNA-Utilizing Enzymes in Natural Product Biosynthesis
auteur
Mireille Moutiez, Pascal Belin, Muriel Gondry
article
Chemical Reviews, 2017, ⟨10.1021/acs.chemrev.6b00523⟩
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2016

titre
Functional interplay between Mediator and TFIIB in preinitiation complex assembly in relation to promoter architecture
auteur
Thomas Eychenne, Elizaveta Novikova, Marie-Bénédicte Barrault, Olivier Alibert, Claire Boschiero, Nuno Peixeiro, David Cornu, Virginie Redeker, Laurent Kuras, Pierre Nicolas, Michel Werner, Julie Soutourina
article
Genes and Development, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2016, 30 (18), pp.2119 - 2132. ⟨10.1101/gad.285775.116⟩
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titre
MSK1 triggers the expression of the INK4AB/ARF locus in oncogene-induced senescence
auteur
Raphaël Culerrier, Maëlle Carraz, Carl Mann, Malek Djabali
article
Molecular Biology of the Cell, American Society for Cell Biology, 2016, 27 (17), pp.2726 - 2734. ⟨10.1091/mbc.E15-11-0772⟩
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titre
Comparable Senescence Induction in Three-dimensional Human Cartilage Model by Exposure to Therapeutic Doses of X-rays or C-ions
auteur
Dounia Hamdi, François Chevalier, Jean-Emmanuel Groetz, Florent Durantel, Jean-Yves Thuret, Carl Mann, Yannick Saintigny
article
International Journal of Radiation Oncology - Biology - Physics, Elsevier, 2016, 95 (1), pp.139 - 146. ⟨10.1016/j.ijrobp.2016.02.014⟩
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https://hal-cea.archives-ouvertes.fr/cea-01938049/file/PIIS0360301616001280.pdf BibTex
titre
Deciphering DNA replication dynamics in eukaryotic cell populations in relation with their averaged chromatin conformations OPEN
auteur
Arach Goldar, A. Arneodo, B. Audit, Françoise Argoul, A. Rappailles, G. Guilbaud, Nataliya Petryk, Malik Kahli, Olivier Hyrien
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2016, 6 (22), pp.22469 (1-8). ⟨10.1038/srep22469⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01412574/file/GoldarSRep2016.pdf BibTex
titre
ParTIES: a toolbox for Paramecium interspersed DNA elimination studies
auteur
Cyril Denby Wilkes, Olivier Arnaiz, Linda Sperling
article
Bioinformatics, Oxford University Press (OUP), 2016, 32 (4), pp.599 - 601. ⟨10.1093/bioinformatics/btv691⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01412717/file/denbywilkes2015.pdf BibTex
titre
Post-transcriptional modulation of interleukin 8 by CNOT6L regulates skeletal muscle differentiation
auteur
Anna Polesskaya, Guillaume Pinna, Yassine Sassi, Marie Vandamme, Anne Bigot, Vincent Mouly, Nadya Morozova, Annick Harel-Bellan, Cindy Degerny
article
Biochimica et Biophysica Acta - Molecular Cell Research, Elsevier, 2016, 1863 (2), pp.263 - 270. ⟨10.1016/j.bbamcr.2015.11.018⟩
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titre
La Roque-Gageac, la grotte Maldidier
auteur
Myriam Boudadi-Maligne, Koren Abanozian, Jean-Christophe Castel, Solène Caux, David Cochard, Jean-Marc Elalouf, Nejma Goutas, François Lacrampe-Cuyaubère, Véronique Laroulandie, Arnaud Lenoble, Jean-Baptiste Mallye, Pauline Palacio, Solange Rigaud
article
Bilan Scientifique de la Région Aquitaine , Direction régionale des affaires culturelles Aquitaine, Service régional de l'archéologie, 2016, Bilan scientifique de la région Aquitaine 2014, pp.80-81
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titre
Isotopic exchange on the diurnal scale between near-surface snow and lower atmospheric water vapor at Kohnen station, East Antarctica
auteur
François Ritter, Hans Christian Steen-Larsen, Martin Werner, Valérie Masson-Delmotte, Anais Orsi, Melanie Behrens, Gerit Birnbaum, Johannes Freitag, Camille Risi, Sepp Kipfstuhl
article
The Cryosphere, Copernicus 2016, 10 (4), pp.1647 - 1663. ⟨10.5194/tc-10-1647-2016⟩
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titre
Protein folding activity of the ribosome: Key player in yeast prion propagation
auteur
Cecile P. Voisset, Marc Blondel, Flavie Soubigou, Justine Evrard, Phu Hai Nguyen, Naushaba Hassin, Stéphane Chédin, Reynald Gillet, Marie-Astrid Contesse, Gaëlle Friocourt, Guillaume Stahl, Gary Jones
article
Prion, Taylor & Francis, 2016, 10 (sup1), pp.S24--S25. ⟨10.1080/19336896.2016.1163103⟩
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2015

titre
Mediator independently orchestrates multiple steps of preinitiation complex assembly in vivo
auteur
Fanny Eyboulet, Sandra Wydau-Dematteis, Thomas Eychenne, Olivier Alibert, Helen Neil, Claire Boschiero, Marie-Claire Nevers, Hervé Volland, David Cornu, Virginie Redeker, Michel Werner, Julie Soutourina
article
Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2015, 43 (19), pp.9214 - 9231. ⟨10.1093/nar/gkv782⟩
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titre
Adaptive aneuploidy protects against thiol peroxidase deficiency by increasing respiration via key mitochondrial proteins.
auteur
Alaattin Kaya, Maxim V Gerashchenko, Inge Seim, Jean Labarre, Michel B Toledano, Vadim N Gladyshev
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America , National Academy of Sciences, 2015, 112 (34), pp.10685-90. ⟨10.1073/pnas.1505315112⟩
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titre
Analysis of 51 cyclodipeptide synthases reveals the basis for substrate specificity.
auteur
Isabelle B Jacques, Mireille Moutiez, Jerzy Witwinowski, Emmanuelle Darbon, Cécile Martel, Jérôme Seguin, Emmanuel Favry, Robert Thai, Alain Lecoq, Steven Dubois, Jean-Luc Pernodet, Muriel Gondry, Pascal Belin
article
Nature Chemical Biology, Nature Publishing Group, 2015, 11 (9), pp.721-7. ⟨10.1038/nchembio.1868⟩
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titre
Retrotransposons. An RNA polymerase III subunit determines sites of retrotransposon integration.
auteur
Antoine Bridier-Nahmias, Aurélie Tchalikian-Cosson, Joshua A Baller, Rachid Menouni, Hélène Fayol, Amando Flores, Ali Saïb, Michel Werner, Daniel F Voytas, Pascale Lesage
article
Science, American Association for the Advancement of Science, 2015, pp.585-8. ⟨10.1126/science.1259114⟩
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titre
Striatal long noncoding RNA Abhd11os is neuroprotective against an N-terminal fragment of mutant huntingtin in vivo.
auteur
Laetitia Francelle, Laurie Galvan, Marie-Claude Gaillard, Fanny Petit, Benoît Bernay, Martine Guillermier, Gilles Bonvento, Noëlle Dufour, Jean-Marc Elalouf, Philippe Hantraye, Nicole Déglon, Michel de Chaldée, Emmanuel Brouillet
article
Neurobiology of Aging, Elsevier, 2015, pp.1601.e7-16. ⟨10.1016/j.neurobiolaging.2014.11.014⟩
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titre
The striatal long noncoding RNA Abhd11os is neuroprotective against an N-terminal fragment of mutant huntingtin in vivo
auteur
Laetitia Francelle, Laurie Galvan, Marie-Claude Gaillard, Fanny Petit, Benoit Bernay, Martine Guillermier, Gilles Bonvento, Noëlle Dufour, Jean-Marc Elalouf, Philippe Hantraye, Nicole Déglon, Michel de Chaldée, Emmanuel Brouillet
article
Neurobiology of Aging, Elsevier, 2015, 36 (3), pp.1601.e7-1601.e16. ⟨10.1016/j.neurobiolaging.2014.11.014⟩
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titre
Global reorganization of the nuclear landscape in senescent cells.
auteur
Tamir Chandra, Philip Andrew Ewels, Stefan Schoenfelder, Mayra Furlan-Magaril, Steven William Wingett, Kristina Kirschner, Jean-Yves Thuret, Simon Andrews, Peter Fraser, Wolf Reik
article
Cell Reports, Elsevier Inc, 2015, pp.471-83. ⟨10.1016/j.celrep.2014.12.055⟩
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titre
Identification of proteins associated with RNA polymerase III using a modified tandem chromatin affinity purification.
auteur
Ngoc-Thuy-Trinh Nguyen, Cyril Saguez, Christine Conesa, Olivier Lefebvre, Joël Acker
article
Gene, Elsevier, 2015, 556 (1), pp.51-60. ⟨10.1016/j.gene.2014.07.070⟩
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titre
A vlincRNA participates in senescence maintenance by relieving H2AZ-mediated repression at the INK4 locus.
auteur
Sandra Lazorthes, Céline Vallot, Sébastien Briois, Marion Aguirrebengoa, Jean-Yves Thuret, Georges St Laurent, Claire Rougeulle, Philipp Kapranov, Carl Mann, Didier Trouche, Estelle Nicolas
article
Nature Communications, Nature Publishing Group, 2015, pp.5971. ⟨10.1038/ncomms6971⟩
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titre
Interferences of Silica Nanoparticles in Green Fluorescent Protein Folding Processes
auteur
Géraldine Klein, Stephanie Devineau, Jean-Christophe Aude, Yves Boulard, Hélène Pasquier, Jean Labarre, Serge Pin, Jean Philippe Renault
article
Langmuir, American Chemical Society, 2015, in press, ⟨10.1021/acs.langmuir.5b03890⟩
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titre
Erratum: A vlincRNA participates in senescence maintenance by relieving H2AZ-mediated repression at the INK4 locus
auteur
Sandra Lazorthes, Céline Vallot, Sébastien Briois, Marion Aguirrebengoa, Jean-Yves Thuret, Georges St Laurent, Claire Rougeulle, Philipp Kapranov, Carl Mann, Didier Trouche, Estelle Nicolas
article
Nature Communications, Nature Publishing Group, 2015, 6, pp.6918. ⟨10.1038/ncomms7918⟩
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2014

titre
Smart Detection of Toxic Metal Ions, Pb2+ and Cd2+, Using a 129Xe NMR-Based Sensor
auteur
Nawal Tassali, Naoko Kotera, Céline Boutin, Estelle Léonce, Yves Boulard, Bernard Rousseau, Emmanuelle Dubost, Frédéric Taran, Thierry Brotin, Jean-Pierre Dutasta, Patrick Berthault
article
Analytical and Bioanalytical Chemistry, Springer Verlag, 2014, 86 (3), pp.1783-1788. ⟨10.1021/ac403669p⟩
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2013

titre
Structural Determinants for Protein adsorption/non-adsorption to Silica Surface
auteur
Christelle Mathé, Stéphanie Devineau, Jean-Christophe Aude, Gilles Lagniel, Stéphane Chédin, Véronique Legros, Marie-Hélène Mathon, Jean-Philippe Renault, Serge Pin, Yves Boulard, Jean Labarre
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2013, 8 (11), pp.e81346. ⟨10.1371/JOURNAL.PONE.0081346⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02112602/file/journal.pone.0081346.PDF BibTex
titre
High throughput screening identifies disulfide isomerase DsbC as a very efficient partner for recombinant expression of small disulfide-rich proteins in E. coli
auteur
Hervé Nozach, Carole Fruchart-Gaillard, François Fenaille, Fabrice Beau, Oscar Pereira Ramos, Badreddine Douzi, Natalie Saez, Mireille Moutiez, Denis Servent, Muriel Gondry, Robert Thai, Philippe Cuniasse, Renaud Vincentelli, Vincent Dive
article
Microbial Cell Factories, BioMed Central, 2013, 12, ⟨10.1186/1475-2859-12-37⟩
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https://hal-cea.archives-ouvertes.fr/cea-02100032/file/Nozach-2013-High%20throughput%20scre.pdf BibTex
titre
Multiscale analysis of genome-wide replication timing profiles using a wavelet-based signal-processing algorithm
auteur
Benjamin Audit, Antoine Baker, Chun-Long Chen, Aurélien Rappailles, Guillaume Guilbaud, Hanna Julienne, Arach Goldar, Yves d'Aubenton-Carafa, Olivier Hyrien, Claude Thermes, Alain Arneodo
article
Nature Protocols, Nature Publishing Group, 2013, 8 (1), pp.98-110. ⟨10.1038/nprot.2012.145⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01557077/file/ABCRM.pdf BibTex
titre
From Simple Bacterial and Archaeal Replicons to Replication N/U-Domains
auteur
Olivier Hyrien, Aurélien Rappailles, Guillaume Guilbaud, Antoine Baker, Chun-Long Chen, Arach Goldar, Nataliya Petryk, Malik Kahli, Emilie Ma, Yves d'Aubenton-Carafa, Benjamin Audit, Claude Thermes, A. Arneodo
article
Journal of Molecular Biology, Elsevier, 2013, 425 (23), pp.4673-4689. ⟨10.1016/j.jmb.2013.09.021⟩
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2012

titre
Capucin does not modify the toxicity of a mutant Huntingtin fragment in vivo
auteur
Laurie Galvan, Nad'A Lepejová, Marie-Claude Gaillard, Carole Malgorn, Martine Guillermier, Diane Houitte, Gilles Bonvento, Fanny Petit, Noëlle Dufour, Patrick Héry, Matthieu Gérard, Jean-Marc Elalouf, Nicole Déglon, Emmanuel Brouillet, Michel de Chaldée
article
Neurobiology of Aging, Elsevier, 2012, 33 (8), pp.1845.e5-1845.e6. ⟨10.1016/j.neurobiolaging.2012.01.009⟩
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BibTex
titre
Oursalp programme: Contribution of the Baré d'Onnion Cave (Haute-Savoie, France) and first conclusions of the programme
auteur
Alain Argant, Jean-Marc Elalouf, Céline Bon
article
Braunschweiger Naturkundliche Schriften Band, 2012, 11, pp.3-11
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01778663/file/2012_Argant_BDO_ICBS17.pdf BibTex
titre
A transcriptional-switch model for Slr1738-controlled gene expression in the cyanobacterium Synechocystis.
auteur
Paul Garcin, Olivier Delalande, Ju-Yuan Zhang, Corinne Cassier-Chauvat, Franck Chauvat, Yves Boulard
article
BMC Structural Biology, BioMed Central, 2012, 12, pp.1. ⟨10.1186/1472-6807-12-1⟩
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-00713301/file/1472-6807-12-1.pdf BibTex

2011

titre
Cell uptake of a biosensor detected by hyperpolarized 129Xe NMR: The transferrin case
auteur
Céline Boutin, Antoine Stopin, Fatimazohra Lenda, Thierry Brotin, Jean-Pierre Dutasta, Nadège Jamin, Alain Sanson, Yves Boulard, François Leteurtre, Gaspard Huber, Aurore Bogaert-Buchmann, Nawal Tassali, Hervé Desvaux, Marie Carrière, Patrick Berthault
article
Bioorganic and Medicinal Chemistry, Elsevier, 2011, 19 (13), pp.4135-4143. ⟨10.1016/j.bmc.2011.05.002⟩
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BibTex
titre
A panoramic view of gene expression in the human kidney
auteur
Danielle Chabardes-Garonne, Arnaud Mejean, Jean-Christophe Aude, Lydie Cheval, Antonio Di Stefano, Marie-Claude Gaillard, Martine Imbert-Teboul, Monika Wittner, Chanth Balian, Véronique Anthouard, Catherine Robert, Beatrice Segurens, Patrick Wincker, Jean Weissenbach, Alain Doucet, Jean-Marc Elalouf
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America , National Academy of Sciences, 2011, 100 (23), pp.13710-13715. ⟨10.1073/pnas.2234604100⟩
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titre
Cyclodipeptide synthases, a family of class-I aminoacyl-tRNA synthetase-like enzymes involved in non-ribosomal peptide synthesis
auteur
Ludovic Sauguet, Mireille Moutiez, Yan Li, Pascal Belin, Jérôme Seguin, Marie-Hélène Le Du, Robert Thai, Cédric Masson, Matthieu Fonvielle, Jean-Luc Pernodet, Jean-Baptiste Charbonnier, Muriel Gondry
article
Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2011, 39 (10), pp.4475-4489. ⟨10.1093/nar/gkr027⟩
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titre
Direct Interaction of RNA Polymerase II and Mediator Required for Transcription in Vivo
auteur
Julie Soutourina, Sandra Wydau, Yves Ambroise, Claire Boschiero, Michel Werner
article
Science, American Association for the Advancement of Science, 2011, 331 (6023), pp.1451. ⟨10.1126/science.1200188⟩
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2010

titre
Cadmium-glutathione solution structures provide new insights into heavy metal detoxification.
auteur
Olivier Delalande, Hervé Desvaux, Emmanuel Godat, Alain Valleix, Christophe Junot, Jean Labarre, Yves Boulard
article
FEBS Journal, Wiley, 2010, 277 (24), pp.5086-96. ⟨10.1111/j.1742-4658.2010.07913.x⟩
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titre
Effect of pH and Counterions on the Encapsulation Properties of Xenon in Water-Soluble Cryptophanes
auteur
Patrick Berthault, Hervé Desvaux, Thierry Wendlinger, Marina Gyejacquot, Antoine Stopin, Thierry Brotin, Jean-Pierre Dutasta, Yves Boulard
article
Chemistry - A European Journal, Wiley-VCH Verlag, 2010, 16 (43), pp.12941-12946. ⟨10.1002/chem.201001170⟩
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titre
Endoplasmic reticulum is a major target of cadmium toxicity in yeast
auteur
Aurélie Gardarin, Stéphane Chédin, Gilles Lagniel, Jean-Christophe Aude, Emmanuel Godat, Patrice Catty, Jean Labarre
article
Molecular Microbiology, Wiley, 2010, 76 (4), pp.1034-1048. ⟨10.1111/j.1365-2958.2010.07166x⟩
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2009

titre
Cyclodipeptide synthases are a family of tRNA-dependent peptide bond–forming enzymes
auteur
Muriel Gondry, Ludovic Sauguet, Pascal Belin, Robert Thai, Rachel Amouroux, Carine Tellier, Karine Tuphile, Mickaël Jacquet, Sandrine Braud, Marie Courçon, Cédric Masson, Steven Dubois, Sylvie Lautru, Alain Lecoq, Shin-Ichi Hashimoto, Roger Genet, Jean-Luc Pernodet
article
Nature Chemical Biology, Nature Publishing Group, 2009, 5 (6), pp.414-420. ⟨10.1038/nchembio.175⟩
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titre
Direct and indirect CeO2 nanoparticles toxicity for Escherichia coli and Synechocystis
auteur
Ophélie Zeyons, Antoine Thill, Franck Chauvat, N. Menguy, Corinne Cassier-Chauvat, Cédric Oréar, Jean Daraspe, Melanie Auffan, Jérôme Rose, Olivier Spalla
article
Nanotoxicology, Taylor & Francis, 2009, 3 (4), pp.284-295
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2008

titre
Mutations of RNA polymerase II activate key genes of the nucleoside triphosphate biosynthetic pathways
auteur
Marta Kwapisz, Maxime Wery, Daphné Després, Yad Ghavi-Helm, Julie Soutourina, Pierre Thuriaux, François Lacroute
article
EMBO Journal, EMBO Press, 2008, 27 (18), pp.2411-2421. ⟨10.1038/emboj.2008.165⟩
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BibTex
titre
Mediator-Dependent Recruitment of TFIIH Modules in Preinitiation Complex
auteur
Cyril Esnault, Yad Ghavi-Helm, Sylvain Brun, Julie Soutourina, Nynke van Berkum, Claire Boschiero, Frank Holstege, Michel Werner
article
Molecular Cell, Elsevier, 2008, 31 (3), pp.337-346. ⟨10.1016/j.molcel.2008.06.021⟩
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BibTex
titre
Quantitative gene expression profiling of mouse brain regions reveals differential transcripts conserved in human and affected in disease models.
auteur
Camille Brochier, Marie-Claude Gaillard, Elsa Diguet, Nicolas Caudy, Carole Dossat, Béatrice Ségurens, Patrick Wincker, Emmanuel Roze, Jocelyne Caboche, Philippe Hantraye, Emmanuel Brouillet, Jean-Marc Elalouf, Michel de Chaldée
article
Physiological Genomics, American Physiological Society, 2008, 33 (2), pp.170-9. ⟨10.1152/physiolgenomics.00125.2007⟩
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titre
Two RNA polymerase I subunits control the binding and release of Rrn3 during transcription.
auteur
Frédéric Beckouet, Sylvie Labarre-Mariotte, Benjamin Albert, Yukiko Imazawa, Michel Werner, Olivier Gadal, Yasuhisa Nogi, Pierre Thuriaux
article
Molecular and Cellular Biology, American Society for Microbiology, 2008, 28 (5), pp.1596-605. ⟨10.1128/MCB.01464-07⟩
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titre
Protein Folding Activity of Ribosomal RNA Is a Selective Target of Two Unrelated Antiprion Drugs
auteur
Déborah Tribouillard-Tanvier, Suzana dos Reis, Fabienne Gug, Cécile Voisset, Vincent Beringue, Raimon Sabate, Ema Kikovska, Nicolas Talarek, Stéphane Bach, Chenhui Huang, Nathalie Desban, Sven Saupe, Surachai Supattapone, Jean-Yves Thuret, Stéphane Chédin, Didier Vilette, Hervé Galons, Suparna Sanyal, Marc Blondel
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2008, 3 (5), pp.e2174. ⟨10.1371/journal.pone.0002174⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02134950/file/Tribouillard%20et%20al%202008.pdf BibTex

2006

titre
Cytotoxicity of CeO2 Nanoparticles for Escherichia coli. Physico-Chemical Insight of the Cytotoxicity Mechanism
auteur
Antoine Thill, Ophélie Zeyons, Olivier Spalla, Franck Chauvat, Jérôme Rose, Melanie Auffan, Anne Marie Flank
article
Environmental Science and Technology, American Chemical Society, 2006, 40 (19), pp.6151 - 6156. ⟨10.1021/es060999b⟩
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2000

titre
Towards a human repertoire of monocytic lysosomal proteins
auteur
Agnès Journet, Agnès Chapel, Sylvie Kieffer, Mathilde Louwagie, Sylvie Luche, Jérôme Garin
article
Electrophoresis, Wiley-VCH Verlag, 2000, 21 (16), pp.3411-3419. ⟨10.1002/1522-2683(20001001)21:16<3411::AID-ELPS3411>3.0.CO;2-M⟩
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