Publications HAL du labo/EPI 1006225

2025

Journal articles

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Noémie Vingadassalon, Déborah Merda, Arnaud Felten, Virginie Chesnais, Christos Kourtis, et al.. Epidemiology of Staphylococcus aureus food isolates: Comparison of conventional methods with whole genome sequencing typing methods. Food Microbiology, 2025, 125, pp.104625. ⟨10.1016/j.fm.2024.104625⟩. ⟨anses-04694068⟩
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Géraldine Cazeau, Briac Virey, Carole Sala, Renaud Lailler, Adeline Huneau-Salaün, et al.. Is a syndromic approach well suited to foodborne disease surveillance? Implication for salmonellosis surveillance and prevention in France from a “One Health” perspective. Preventive Veterinary Medicine, 2025, 236, pp.106422. ⟨10.1016/j.prevetmed.2025.106422⟩. ⟨anses-04926121⟩
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Ásgeir Ástvaldsson, Gunnar Andersson, Linda Svensson, Karin Bruckner, Martine Denis, et al.. Evaluation of methods for detection of Campylobacter in raw milk: A multi-country study. International Journal of Food Microbiology, 2025, 427, pp.110938. ⟨10.1016/j.ijfoodmicro.2024.110938⟩. ⟨anses-04792848⟩
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2024

Journal articles

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Matthieu Martineau, Chloé Ambroset, Stéphanie Lefebvre, Eléna Kokabi, Albertine Léon, et al.. Unravelling the main genomic features of Mycoplasma equirhinis. BMC Genomics, 2024, 25 (1), pp.886. ⟨10.1186/s12864-024-10789-y⟩. ⟨hal-04712793⟩
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https://normandie-univ.hal.science/hal-04712793/file/12864_2024_Article_10789.pdf BibTex
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B H Hayes, J S Lim, M. Andraud, Timothée Vergne. Elucidating the influence of wild boar density on African swine fever spread in wild boar populations, Italy, 2022–2023. EFSA Supporting Publications, 2024, 21 (11), ⟨10.2903/sp.efsa.2024.en-9049⟩. ⟨hal-04912032⟩
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https://envt.hal.science/hal-04912032/file/EFSA%20Supporting%20Publications%20-%202024%20-%20Hayes%20-%20Elucidating%20the%20influence%20of%20wild%20boar%20density%20on%20African%20swine%20fever%20spread.pdf BibTex
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Véronique Boumtje, Hasanga D Manikpurage, Zhonglin Li, Nathalie Gaudreault, Victoria Saavedra Armero, et al.. Polygenic inheritance and its interplay with smoking history in predicting lung cancer diagnosis: a French-Canadian case-control cohort. EBioMedicine, 2024, 106, pp.105234. ⟨10.1016/j.ebiom.2024.105234⟩. ⟨anses-04678882⟩
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Frédérique Mocz, Marianne Berthelot, Virginie Michel, Alexandra Contreras-Jodar, Maryse Guinebretière. The assessment of litter quality in broiler chickens: validity, inter-assessor reliability, and intra-assessor repeatability of three visual scoring systems. British Poultry Science, In press, pp.1-8. ⟨10.1080/00071668.2024.2410361⟩. ⟨anses-04771576⟩
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Céline Deblanc, Stéphane Quéguiner, Stéphane Gorin, Gautier Richard, Angélique Moro, et al.. Pathogenicity and escape to pre-existing immunity of a new genotype of swine influenza H1N2 virus that emerged in France in 2020. Veterinary Research, 2024, 55 (1), pp.65. ⟨10.1186/s13567-024-01319-5⟩. ⟨hal-04588373⟩
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https://hal.science/hal-04588373/file/13567_2024_Article_1319.pdf https://hal.science/hal-04588373/file/13567_2024_1319_MOESM1_ESM.pdf BibTex
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Greta Bellinzona, Tiago Nardi, Michele Castelli, Gherard Batisti Biffignandi, Karim Adjou, et al.. Comparative genomics of Cryptosporidium parvum reveals the emergence of an outbreak-associated population in Europe and its spread to the United States. Genome Research, 2024, 34 (6), pp.877-887. ⟨10.1101/gr.278830.123⟩. ⟨hal-04643965⟩
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Manon Dechêne-Tempier, Claire de Boisséson, Pierrick Lucas, Stéphanie Bougeard, Virginie Libante, et al.. Virulence genes, resistome and mobilome of Streptococcus suis strains isolated in France. Microbial Genomics, 2024, 10 (3), pp.001224. ⟨10.1099/mgen.0.001224⟩. ⟨hal-04528772⟩
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Patricia Renson, Sophie Mahé, Mathieu Andraud, Mireille Le Dimna, Frédéric Paboeuf, et al.. Effect of vaccination route (intradermal vs. intramuscular) against porcine reproductive and respiratory syndrome using a modified live vaccine on systemic and mucosal immune response and virus transmission in pigs. BMC Veterinary Research, 2024, 20 (1), pp.5. ⟨10.1186/s12917-023-03853-4⟩. ⟨anses-04413214⟩
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Asma Mesdour, Sandra Ijoma, Muhammad-Bashir Bolajoko, Elena Arsevska, Mamadou Ciss, et al.. Assessing the impact of structural modifications in the construction of surveillance network for Peste des petits ruminants disease in Nigeria: The role of backbone and sentinel nodes. PLoS ONE, 2024, 19 (11), pp.e0303237. ⟨10.1371/journal.pone.0303237⟩. ⟨hal-04893378⟩
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Francisco Javier Moreno, Florencio Pazos, Manuel Garrido-Romero, Cyrielle Payen, Gonzalo Borrego-Yaniz, et al.. Roadmap for the integration of gastro‐intestinal (GI) tract microbiomes (human and domestic animal) in risk assessments under EFSA's remit. EFSA Supporting Publications, 2024, 21 (2), pp.EN-8597. ⟨10.2903/sp.efsa.2024.EN-8597⟩. ⟨hal-04474405⟩
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Alexandre Gaymard, Caroline Picard, Guilhem Vazzoler, Pascale Massin, Emilie Frobert, et al.. Impact of the H274Y Substitution on N1, N4, N5, and N8 Neuraminidase Enzymatic Properties and Expression in Reverse Genetic Influenza A Viruses. Viruses, 2024, 16 (3), pp.388. ⟨10.3390/v16030388⟩. ⟨anses-04549222⟩
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Pauline Pannetier, Bénédicte Morin, Joëlle Cabon, Morgane Danion, Thierry Morin, et al.. Water-accommodated fractions of heavy and light oils impact DNA integrity, embryonic development, and immune system of Japanese medaka at early life stages. Environmental Science and Pollution Research, 2024, 31 (38), pp.50916-50928. ⟨10.1007/s11356-024-34604-z⟩. ⟨anses-04913812⟩
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Peter Smith, Andrew Joseph, Craig Baker-Austin, Nisha Kang, Sandrine Baron, et al.. Epidemiological cut-off values for Vibrio parahaemolyticus calculated from minimal inhibitory concentration data generated at 35 and 28°C. Diseases of Aquatic Organisms, 2024, 160, pp.127-134. ⟨10.3354/dao03831⟩. ⟨anses-04862933⟩
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Rozenn Souillard, Virginie Allain, Anne Christine Dufay-Lefort, Nathalie Rousset, Arthi Amalraj, et al.. Biosecurity implementation on large-scale poultry farms in Europe: A qualitative interview study with farmers. Preventive Veterinary Medicine, 2024, 224, pp.106119. ⟨10.1016/j.prevetmed.2024.106119⟩. ⟨anses-04574507⟩
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Axelle Scoizec, Eric Niqueux, Audrey Schmitz, Béatrice Grasland, Loïc Palumbo, et al.. New Patterns for Highly Pathogenic Avian Influenza and Adjustment of Prevention, Control and Surveillance Strategies: The Example of France. Viruses, 2024, 16 (1), pp.101. ⟨10.3390/v16010101⟩. ⟨anses-04416341⟩
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Abbey Olsen, Silvia Bonardi, Lisa Barco, Marianne Sandberg, Nina Langkabel, et al.. A comparison of European surveillance programs for Campylobacter in broilers. Food Control, 2024, 155, pp.110059. ⟨10.1016/j.foodcont.2023.110059⟩. ⟨anses-04416244⟩
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Christian Baudry, Gaëlle Jadé, Paul Rayneau, Bertrand Lombard, Max Feinberg, et al.. S-score: a new score for binary qualitative proficiency testing schemes interpretable as the z-score. Accreditation and Quality Assurance, 2024, 29 (2), pp.103-113. ⟨10.1007/s00769-023-01561-y⟩. ⟨anses-04509384⟩
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Maryse Guinebretière, Laura Warin, Jean-Philippe Moysan, Bertrand Méda, Frédérique Mocz, et al.. Effects of strain and stocking density on leg health, activity, and use of enrichments in conventional broiler chicken production. Poultry Science, 2024, 103 (9), pp.103993. ⟨10.1016/j.psj.2024.103993⟩. ⟨hal-04631786⟩
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Kerli Mõtus, Dagni-Alice Viidu, Triin Rilanto, Tarmo Niine, Toomas Orro, et al.. Application of multiblock analysis to identify key areas and risk factors for dairy cow persistence. Preventive Veterinary Medicine, 2024, 222, pp.106081. ⟨10.1016/j.prevetmed.2023.106081⟩. ⟨anses-04416135⟩
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Alisia Chiado Rana, Géraldine Cazeau, Stéphanie Bougeard, Kevin Bethune, Vincent Chochois, et al.. A retrospective multivariate case-control approach to investigate factors influencing the sanitary quality of raw milk cheeses. Applied Food Research, 2024, 4 (2), pp.100617. ⟨10.1016/j.afres.2024.100617⟩. ⟨anses-04816878⟩
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https://anses.hal.science/anses-04816878/file/A%20Alisia%20Chiado%20Rana%202024%20retrospective%20multivariate%20case-control%20approach%20to%20investigate%20factors%20influencing%20the%20sanitary%20quality%20of%20raw%20milk%20cheeses.pdf BibTex
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Janaïna Grevelinger, Olivier Bourry, François Meurens, Aline Perrin, Caroline Hervet, et al.. Impact of swine influenza A virus on porcine reproductive and respiratory syndrome virus infection in alveolar macrophages. Frontiers in Veterinary Science, 2024, 11, pp.1454762. ⟨10.3389/fvets.2024.1454762⟩. ⟨hal-04696357⟩
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Karolina Ucieklak, Sylwia Wojtys-Tekiel, Garance Leroy, Laëtitia Le Devendec, Sandrine Baron, et al.. New Structure of Aeromonas salmonicida O-Polysaccharide Isolated from Ill Farmed Fish. Microorganisms, 2024, 12 (8), pp.1575. ⟨10.3390/microorganisms12081575⟩. ⟨anses-04693995⟩
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Manuel Garrido-Romero, Florencio Pazos, Elisa Sánchez-Martínez, Carlos Benito, José Ángel Gómez-Ruiz, et al.. Relevance of gut microbiome research in food safety assessment. Gut microbes, 2024, 16 (1), pp.2410476. ⟨10.1080/19490976.2024.2410476⟩. ⟨anses-04792666⟩
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Jean Lagarde, Carole Feurer, Martine Denis, Pierre-Emmanuel Douarre, Pascal Piveteau, et al.. Listeria monocytogenes prevalence and genomic diversity along the pig and pork production chain. Food Microbiology, 2024, 119, pp.104430. ⟨10.1016/j.fm.2023.104430⟩. ⟨hal-04526173⟩
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Pauline Pannetier, Christelle Clérandeau, Stéphane Le Floch, Jérôme Cachot, Bénédicte Morin. Toxicity evaluation of water-accommodated fraction of heavy and light oils on the rainbow trout fish cell line RTL-W1.. Environmental Science and Pollution Research, 2024, 31 (37), pp.49715-49726. ⟨10.1007/s11356-024-34458-5⟩. ⟨hal-04675367⟩
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Caroline Le Maréchal, Martine Denis, Louis Vanlemmens, Léa Jambou, Gauthier Delvallez, et al.. An outbreak of botulism on a pig farm due to the newly described Clostridium botulinum type C. Anaerobe, 2024, 89, pp.102885. ⟨10.1016/j.anaerobe.2024.102885⟩. ⟨anses-04922694⟩
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Patrick Munk, Dongsheng Yang, Timo Röder, Leonie Maier, Thomas Nordahl Petersen, et al.. The European livestock resistome. mSystems, 2024, 9 (4), ⟨10.1128/msystems.01328-23⟩. ⟨hal-04879771⟩
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Kathrin Schmies, Christin Hennig, Nicolas Rose, Christelle Fablet, Timm Harder, et al.. Dynamic of swine influenza virus infection in weaned piglets in five enzootically infected herds in Germany, a cohort study. Porcine health management, 2024, 10 (1), pp.36. ⟨10.1186/s40813-024-00390-w⟩. ⟨anses-04805846⟩
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Mathilde Gondard, Lydie Postic, Emmanuel Garin, Mathilde Turpaud, Fabien Vorimore, et al.. Exceptional Bluetongue virus (BTV) and Epizootic hemorrhagic disease virus (EHDV) circulation in France in 2023. Virus Research, 2024, 350, pp.199489. ⟨10.1016/j.virusres.2024.199489⟩. ⟨anses-04793042⟩
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Benedetta Cordioli, Alessia Rizzardi, Angela Guolo, Tiziana Ferro, Cosetta Bacchin, et al.. Antimicrobial susceptibility of Clostridium botulinum group III field strains isolated in Europe from animal outbreaks. Veterinary Microbiology, 2024, 298, pp.110281. ⟨10.1016/j.vetmic.2024.110281⟩. ⟨anses-04792932⟩
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Stéphane Gorin, Gautier Richard, Séverine Hervé, Eric Eveno, Yannick Blanchard, et al.. Characterization of Influenza D Virus Reassortant Strain in Swine from Mixed Pig and Beef Farm, France. Emerging Infectious Diseases, 2024, 30 (8), pp.1672-1676. ⟨10.3201/eid3008.240089⟩. ⟨anses-04790659⟩
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Alice Fusaro, Bianca Zecchin, Edoardo Giussani, Elisa Palumbo, Montserrat Agüero-García, et al.. High pathogenic avian influenza A(H5) viruses of clade 2.3.4.4b in Europe—Why trends of virus evolution are more difficult to predict. Virus Evolution, 2024, 10 (1), pp.veae027. ⟨10.1093/ve/veae027⟩. ⟨anses-04582927⟩
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Konstantinos Koutsoumanis, Ana Allende, Declan Bolton, Sara Bover-Cid, Marianne Chemaly, et al.. BSE risk posed by ruminant collagen and gelatine derived from bones. EFSA Journal, 2024, 22 (7), ⟨10.2903/j.efsa.2024.8883⟩. ⟨hal-04765992⟩
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Laetitia Montacq, Doriana Flores, Hélène Giummarra, Laurane Pallandre, Anaïs Angot, et al.. cds46, a highly variable carp edema virus gene. Journal of General Virology, 2024, 105 (11), 16 p. ⟨10.1099/jgv.0.002048⟩. ⟨hal-04794299⟩
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Vianney Sicard, Sébastien Picault, Mathieu Andraud. Pig herd management and infection transmission dynamics: a challenge for modellers. Peer Community Journal, 2024, 4, pp.e52. ⟨10.24072/pci.animsci.100198⟩. ⟨hal-04592902⟩
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Zahra Manoochehri, Mahmoud Etebari, Pauline Pannetier, Karim Ebrahimpour. In vitro toxicity of polyethylene terephthalate nanoplastics (PET-NPs) in human hepatocarcinoma (HepG2) cell line. Toxicology and Environmental Health Sciences, 2024, 16 (2), pp.203-215. ⟨10.1007/s13530-024-00213-z⟩. ⟨anses-04661173⟩
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Tereza Almeida, Ana M Lopes, Josep Estruch, Carlos Rouco, Patrizia Cavadini, et al.. A new HaCV-EBHSV recombinant lagovirus circulating in European brown hares (Lepus europaeus) from Catalonia, Spain. Scientific Reports, 2024, 14 (1), pp.2872. ⟨10.1038/s41598-024-53201-1⟩. ⟨anses-04456767⟩
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Marianne Berthelot, C. Aubert, N. Ehrhardt, C. Baudry, Carine Paraud. Dairy goat doe-kid rearing systems: Farmers' motivations and a description of practices, benefits and drawbacks. Journal of Dairy Science, 2024, 107 (10), pp.8100-8114. ⟨10.3168/jds.2023-24600⟩. ⟨anses-04661358⟩
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Aneta Pluta, Juan Pablo Jaworski, Casey Droscha, Sophie Vanderweele, Tasia M. Taxis, et al.. Inter-laboratory comparison of eleven quantitative or digital PCR assays for detection of proviral bovine leukemia virus in blood samples. BMC Veterinary Research, 2024, 20 (1), pp.381. ⟨10.1186/s12917-024-04228-z⟩. ⟨anses-04687241⟩
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Soumaya Sabri, Lamia Khannous, Séverine Ferré, Adel Souissi, Radhouane Gdoura, et al.. First molecular investigation to detect avian Mycoplasma species in clinical samples from laying-hen farms in Tunisia. BMC Veterinary Research, 2024, 20 (1), pp.459. ⟨10.1186/s12917-024-04311-5⟩. ⟨anses-04792715⟩
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Joana Abrantes, Stéphan Bertagnoli, Patriz Cavadini, Pedro J. Estev, Dolor Gavier-Widén, et al.. Comment on Shah et al. Genetic Characteristics and Phylogeographic Dynamics of Lagoviruses. Viruses, 2024, ⟨10.3390/v16060927⟩. ⟨hal-04604804⟩
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Konstantinos Koutsoumanis, Ana Allende, Avelino Alvarez-Ordóñez, Declan Bolton, Sara Bover-Cid, et al.. Update of the list of qualified presumption of safety (QPS) recommended microbiological agents intentionally added to food or feed as notified to EFSA 19: Suitability of taxonomic units notified to EFSA until September 2023. EFSA Journal, 2024, 22 (1), pp.e8517. ⟨10.2903/j.efsa.2024.8517⟩. ⟨anses-04879704⟩
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Marion Laurent, Stéphanie Bougeard, Lucile Caradec, Florence Ghestem, Matthias Albrecht, et al.. Novel indices reveal that pollinator exposure to pesticides varies across biological compartments and crop surroundings. Science of the Total Environment, 2024, 927, pp.172118. ⟨10.1016/j.scitotenv.2024.172118⟩. ⟨hal-04540908⟩
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Claire Chauvin, Elsa Coz, Eric Jouy, Marie-Laure Delignette-Muller, Agnès Perrin-Guyomard, et al.. 19. Colistin resistance in pigs – assessing the effectiveness of mitigation measures. Animal. Science proceedings, 2024, 15 (4), pp.268-269. ⟨10.1016/j.anscip.2024.06.183⟩. ⟨anses-04848948⟩
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Peter Smith, Elizabeth Buba, Andrew P Desbois, Alexandra Adams, David Verner-Jeffreys, et al.. Setting epidemiological cut-off values relevant to MIC and disc diffusion data for Aeromonas salmonicida generated by a standard method. Diseases of Aquatic Organisms, 2024, 159, pp.29 - 35. ⟨10.3354/dao03798⟩. ⟨anses-04676207⟩
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Manon Vastel, Corinne Pau-Roblot, Séverine Ferré, Véronique Tocqueville, Chloé Ambroset, et al.. Capsular Polysaccharide Production in Bacteria of the Mycoplasma Genus: A Huge Diversity of Pathways and Synthases for So‐Called Minimal Bacteria. Molecular Microbiology, 2024, 122 (6), pp.866-878. ⟨10.1111/mmi.15325⟩. ⟨hal-04762175⟩
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https://u-picardie.hal.science/hal-04762175/file/Vastel%202024%20Capsular%20Polysaccharide%20Production%20in%20Bacteria%20of%20the%20Mycoplasma%20Genus%20A%20Huge%20Diversity%20of%20Pathways%20and%20Synthases%20for%20So-Called%20Minimal%20Bacteria.pdf BibTex
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Aurélie Babin, Frank Schurr, Sabine Delannoy, Patrick Fach, Minh Huyen Ton Nu Nguyet, et al.. Distribution of infectious and parasitic agents among three sentinel bee species across European agricultural landscapes. Scientific Reports, 2024, 14 (1), pp.3524. ⟨10.1038/s41598-024-53357-w⟩. ⟨hal-04481521⟩
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https://hal.science/hal-04481521/file/Babin_2024_Distribution%20of%20infectious%20and%20parasitic%20agents%20among%20three%20sentinel%20bee%20species.pdf BibTex
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Nathalie Rousset, Azziza Ait Ahmed, Loïc Balaine, Antoine Battaglia, Benoît Berlizot, et al.. Utiliser mieux et moins les produits de désinfection en filières avicole et piscicole. Innovations Agronomiques, 2024, 94, pp.115-126. ⟨10.17180/ciag-2024-vol94-art08⟩. ⟨hal-04601631⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-04601631/file/2024_Rousset_IA%2094_VF.pdf BibTex
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Agnès Perrin-Guyomard, Pamela Houée, Pierrick Lucas, Arnaud Felten, Laetitia Le Devendec, et al.. 93. Colistin resistance in French poultry: Positive impact of control efforts. Animal. Science proceedings, 2024, 15 (3), pp.229. ⟨10.1016/j.anscip.2024.06.094⟩. ⟨anses-04700284⟩
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Lihong Liu, Mikhayil Hakhverdyan, Per Wallgren, Kevin Vanneste, Qiang Fu, et al.. An interlaboratory proficiency test using metagenomic sequencing as a diagnostic tool for the detection of RNA viruses in swine fecal material. Microbiology Spectrum, 2024, 12 (10), pp.e0420823. ⟨10.1128/spectrum.04208-23⟩. ⟨anses-04782223⟩
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https://anses.hal.science/anses-04782223/file/liu-et-al-2024-an-interlaboratory-proficiency-test-using-metagenomic-sequencing-as-a-diagnostic-tool-for-the-detection.pdf BibTex
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Juliette Dupré, Mireille Le Dimna, Evelyne Hutet, Pascal Dujardin, Aurore Fablet, et al.. Exploring type I interferon pathway: virulent vs. attenuated strain of African swine fever virus revealing a novel function carried by MGF505-4R. Frontiers in Immunology, 2024, 15, pp.1358219. ⟨10.3389/fimmu.2024.1358219⟩. ⟨anses-04504013⟩
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https://anses.hal.science/anses-04504013/file/Dupr%C3%A9_Front%20Immunol_2024.pdf BibTex
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Maxime Delsart, Jean-Michel Répérant, Chantal Benoit, Edouard Boudin, Jean-François Da-Costa, et al.. Bayesian estimation of the sensitivity and specificity of coprological and serological diagnostic tests for the detection of Ascaris suum infection on pig farms. International Journal for Parasitology, 2024, 54 (10), pp.523-533. ⟨10.1016/j.ijpara.2024.04.010⟩. ⟨hal-04568350⟩
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https://enva.hal.science/hal-04568350/file/1-s2.0-S0020751924000808-main.pdf BibTex
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Nathalie Rousset, Azziza Ait Ahmed, Loïc Balaine, Antoine Battaglia, Benoît Berlizot, et al.. Using disinfection products less and better in the poultry and fish sectors. Innovations Agronomiques, 2024, 94, pp.91-101. ⟨10.17180/ciag-2024-Vol94-art07-GB⟩. ⟨hal-04791437⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-04791437/file/2024_Rousset_Innovations%20Agronomiques_Vol%2094_GB.pdf BibTex
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Marc Aerts, Sandrine Baron, Valeria Bortolaia, Rene Hendriksen, Beatriz Guerra, et al.. Technical specifications for a EU‐wide baseline survey of antimicrobial resistance in bacteria from aquaculture animals. EFSA Journal, 2024, 22, pp.e8928. ⟨10.2903/j.efsa.2024.8928⟩. ⟨anses-04676259⟩
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Alice Fusaro, José Gonzales, Thijs Kuiken, Gražina Mirinavičiūtė, Éric Niqueux, et al.. Avian influenza overview December 2023–March 2024. EFSA Journal, 2024, 22 (3), pp.e8754. ⟨10.2903/j.efsa.2024.8754⟩. ⟨anses-04922878⟩
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Teresa Fagundes, Pauline Pannetier, Lisa Gölz, Laura Behnstedt, Jane Morthorst, et al.. The generation gap in endocrine disruption: Can the integrated fish endocrine disruptor test (iFEDT) bridge the gap by assessing intergenerational effects of thyroid hormone system disruption?. Aquatic Toxicology, 2024, 272, pp.106969. ⟨10.1016/j.aquatox.2024.106969⟩. ⟨anses-04922866⟩
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Stéphane Gorin, Gautier Richard, Stéphane Quéguiner, Amélie Chastagner, Nicolas Barbier, et al.. Pathogenesis, Transmission, and Within-Host Evolution of Bovine-Origin Influenza D Virus in Pigs. Transboundary and emerging diseases, 2024, 2024 (1), pp.9009051. ⟨10.1155/2024/9009051⟩. ⟨hal-04661286⟩
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João B Cota, Nina Langkabel, Lisa Barco, Abbey Olsen, Silvia Bonardi, et al.. Comparison of european surveillance and control programs for Salmonella in broiler and Turkey chains. Food Control, 2024, 165, pp.110656. ⟨10.1016/j.foodcont.2024.110656⟩. ⟨anses-04633373⟩
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Pedro J. Sánchez-Cordón, Fabian Z. X. Lean, Carrie Batten, Falko Steinbach, Aleksija Neimanis, et al.. Comparative evaluation of disease dynamics in wild boar and domestic pigs experimentally inoculated intranasally with the European highly virulent African swine fever virus genotype II strain “Armenia 2007”. Veterinary Research, 2024, 55 (1), pp.89. ⟨10.1186/s13567-024-01343-5⟩. ⟨hal-04655332⟩
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Claire Lescoat, Delphine Perrotte, Séverine Barry, Elise Oden, Valentin Herbet, et al.. Spatio-temporal distribution and international context of bovine viral diarrhoea virus genetic diversity in France. Veterinary Research, 2024, 55 (1), pp.129. ⟨10.1186/s13567-024-01377-9⟩. ⟨hal-04721177⟩
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Asma Mesdour, Sandra Ijioma, Muhammad-Bashir Bolajoko, Elena Arsevska, Mamadou Ciss, et al.. Towards the Building of a Surveillance Network for PPR-Like Diseases in Nigeria: Identifying Potential Sentinel Node in a Partially-Known Network. Studies in Computational Intelligence, 2024, Studies in Computational Intelligence, 1142, pp.325-337. ⟨10.1007/978-3-031-53499-7_26⟩. ⟨hal-04551625⟩
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François‐xavier Briand, Marielle Beltrame, Carole Guillemoto, Rachel Busson, Laetitia Pigeyre, et al.. Highly pathogenic avian influenza A (H5N1) clade 2.3.4.4b virus infection in captive bears (Ursus thibetanus) and in captive and wild birds, France, 2022. German Journal of Veterinary Research, 2024, 4 (1), pp.77-81. ⟨10.51585/gjvr.2024.1.0077⟩. ⟨anses-04577858⟩
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https://anses.hal.science/anses-04577858/file/Briand_Ger%20J%20Vet%20Res_2024.pdf BibTex
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Stéphanie Bougeard, Caroline Peltier, Benoit Jaillais, Jean-Claude Boulet, Mohamed Hanafi. Benchmarking multiblock methods with canonical factorization. Chemometrics and Intelligent Laboratory Systems, 2024, 254, pp.105240. ⟨10.1016/j.chemolab.2024.105240⟩. ⟨hal-04760093⟩
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Peter Smith, Laëtitia Le Devendec, Eric Jouy, Emeline Larvor, David Verner-Jeffreys, et al.. Epidemiological cut-off values for Yersina ruckeri disc diffusion data generated by a standardised method. Diseases of Aquatic Organisms, 2024, 158, pp.21-25. ⟨10.3354/dao03779⟩. ⟨anses-04574853⟩
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https://anses.hal.science/anses-04574853/file/d158p021.pdf BibTex
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Gauthier Delvallez, Christelle Mazuet, Caroline Le Maréchal. Botulisme humain et animal : regards croisés. Revue de biologie médicale, 2024, 379, pp.41-47. ⟨10.3917/rbm.379.0041⟩. ⟨anses-04811556⟩
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Conference papers

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Morgane Rémond, Eric Lewandowski, Vincent Muller, Célia Puyal-Rucine, Anne Lehébel, et al.. Etude descriptive du portage de Streptococcus suis et des sérotypes 2, 1/2 et 9 au sein de deux cheptels présentant des cas cliniques de streptococcie. 56. Journées de la Recherche Porcine, Ifip; Inrae, Feb 2024, Saint-Malo (FR), France. pp.71-76. ⟨hal-04449508⟩
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Rozenn Souillard, Jeanne Laurentie, Francis Repoila, Isabelle Kempf, Pascale Serror. Synthesis: Enterococcus cecorum, an opportunistic pathogen of poultry: Learning more about to better control it on the farms. Animal - science proceedings, Jul 2024, Tours, France. ⟨10.1016/j.anscip.2024.06.052⟩. ⟨hal-04862894⟩
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Rozenn Souillard, Virginie Allain, Anne-Christine Dufay-Lefort, Nathalie Rousset, Arthi Amalraj, et al.. Observance de la biosécurité : Etude menée auprès de 83 éleveurs de volailles de chair en Europe. 15. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2024, Tours, France. pp.432-436. ⟨hal-04547026⟩
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Marianne Berthelot, Nadège Aigueperse, Maylis Duminil, Aurélia Lecacheur, Flavien Delvaux, et al.. Revenir à l’allaitement maternel chez les caprins laitiers : un équilibre à trouver entre bénéfices et risques. Séminaire du métaprogramme SANBA, INRAE, Oct 2024, Paris La Villette, France. ⟨hal-04746418⟩
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Damien Costa, Loïc Favennec, Romy Razakandrainibe, A Chevillot, Étienne Carvin, et al.. Epidemiology of cryptosporidiosis in France and new insights on parasitic viruses - importance of one health approach. 14th European Multicolloquium of Parasitology, Aug 2024, Wroclaw, Poland. ⟨hal-04690313⟩
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Maryse Guinebretière, Ludovic Calandreau, Alexandra Scheubel, Frédérique Mocz, Jean-Philippe Moysan, et al.. Structurer et enrichir l’espace : quels impacts sur les comportements et la réactivité des poulets de chair. 15. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2024, Tours, France. pp.12-17. ⟨hal-04546517⟩
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Evelyne Boscher, Stéphanie Bougeard, M. Guy, Emmanuelle Houard, Arnaud Felten, et al.. Performance of infrared spectroscopy to predict serogroup and ability of adhesion of Listeria monocytogenes compared to genomic analysis. ISOPOL XXI, Matthew Gilmour, Sep 2024, Norwich, UK, United Kingdom. ⟨anses-04811451⟩
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Jean Lagarde, Pierre-Emmanuel Douarre, Benjamin Félix, Romero Karol, Evelyne Boscher, et al.. Soil fitness and genetic diversity of Listeria monocytogenes from pigs to land spreading. 21st International Symposium on Problems of Listeria and Listeriosis (ISOPOL), Matthew Gilmour, Sep 2024, Norwich, UK, United Kingdom. ⟨anses-04811501⟩
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Matthieu Martineau, Eléna Kokabi, Chloé Ambroset, Marine Jay, Florence Tardy, et al.. Mycoplasma equirhinis, a disregarded player in equine respiratory disorders?. 12th International Equine Infectious Diseases Conference, Sep 2024, Deauville, France. pp.24-25 (n°23), ⟨10.1111/evj.14215⟩. ⟨hal-04723332⟩
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Marianne Berthelot, Ludivine Derboule, Nadège Aigueperse, Deloupy-Dobin Blanche, Jérôme Boucherot, et al.. The effects of rearing kids with non-lactating goats on kids’ behavioral development. 9th International Conference on the Welfare Assessment of Animals at Farm Level, EAAP, Aug 2024, Florence, Italy. ⟨hal-04746945⟩
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Muriel Guyard-Nicodème, Philippe Velge. Sensibilité du poussin à Salmonella : rôle du microbiote et de Campylobacter. 15. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2024, Tours, France. pp.458-461. ⟨hal-04546693⟩
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Maureen Duflot, Françoise Pozet, Sophie Le Bouquin-Leneveu, Céline Richomme, Odile Bourgau, et al.. The range of Clinostomum complanatum within French freshwater habitats hosting European perch (Perca fluviatilis). European Multicolloquium of Parasitology 2024 (EMOP 2024), Polish Parasitological Society, Aug 2024, Wroclaw, University of Wroclaw, Poland. ⟨hal-04729595⟩
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François‐Xavier Briand, Pascale Massin, Claire Martenot, Martine Cherbonnel-Pansart, Katell Louboutin, et al.. Émergence et diffusion d’un génotype de virus d’influenza aviaire hautement pathogène A(H5N1) de clade 2.2.4.4.b adapté aux Laridae en France. XXVIes Journées francophones de virologie, Société Française de Virologie, Apr 2024, Liège, Belgique. ⟨anses-04694195⟩
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Adeline Huneau-Salaün, Setha Ketavong, Paula Chan, Rodolphe Thomas, Justine Dusseux, et al.. Why some farms are regularly affected by rabbit hemorrhagic disease? An epidemiological survey in france. 13th World Rabbit Congress, Oct 2024, Tarragona, Spain. ⟨anses-04788285⟩
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Lucie Collineau, Laurence Lacmago, Yohann Lacotte, Benoit Lange, Olivier Lemenand, et al.. Towards integrated surveillance of antibioic resistance in France. A first analysis of surveillance data in a One Health perspective. International One H Symposium (ONEH2024), Innôzh; Anses; Labocéa, Jun 2024, Saint Brieuc, France. ⟨anses-04619942⟩
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Stephen Valas. Contexte épidémiologique de la leucose bovine enzootique sur l’île de La Réunion. Comité d’experts scientifiques santé et bien-être animal, Jan 2024, Paris, France. ⟨hal-04862693⟩
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Axelle Scoizec, François‐Xavier Briand, Éric Niqueux, Audrey Schmitz, Guillaume Gerbier, et al.. Cluster de foyers IAHP en poules pondeuses, Bretagne 2023 : résultats des investigations épidémiologiques. 15. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2024, Tours, France. pp.226-230. ⟨hal-04546955⟩
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Béatrice Grasland, Jocelyn Marguerie. Premier bilan de la mise en œuvre de la stratégie vaccinale contre l'influenza aviaire hautement pathogène en France. 15. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2024, Tours, France. ⟨hal-04546452⟩
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Rozenn Souillard, Jeanne Laurentie, Francis Repoila, Isabelle Kempf, Pascale Serror. Enterococcus cecorum, un agent pathogène opportuniste des volailles : mieux le connaitre pour une meilleure maitrise en élevage. 15. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2024, Tours, France. pp.102-110. ⟨hal-04547075⟩
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Frédérique Mocz, Laura Warin, Jean-Philippe Moysan, Alassane Keita, Ewen Poulnais, et al.. Evaluation de l’impact de l’accès à un jardin d’hiver sur le bien-être du poulet de chair. 15. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2024, Tours, France. pp.18-22. ⟨hal-04546715⟩
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Claire Chauvin, Elsa Coz, Eric Jouy, Marie Laure Delignette-Muller, Agnes Perrin-Guyomard, et al.. Résistance à la colistine chez le porc - des mesures de maîtrise efficaces. 56. Journées de la Recherche Porcine, Ifip, Feb 2024, Saint-Malo, France. pp.81-82. ⟨hal-04449556⟩
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https://hal.science/hal-04449556/file/s08.pdf BibTex
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Marianne Berthelot, Marie-Madeleine Mialon, Ludivine Derboule, Nadège Aigueperse, Céline Parias, et al.. Elever des chevrettes en présence d’adultes non allaitantes est-il un avantage en termes de bien-être ?. Séminaire du métaprogramme SANBA, INRAE, Oct 2024, Paris La Villette, France. ⟨hal-04746542⟩
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Maryne Jaÿ, Nathalie Jarrige, Sandra Lacôte, Stephanie Lefebvre, François Poumarat, et al.. Recent updates for VIGIMYC, a settled 20-year old surveillance network dedicated to ruminant mycoplasmas. 25th International Organization for Mycoplasmology Congress (IOM 2024), International Organization for Mycoplasmology, Jul 2024, Las Palmas De Gran Canaria, Spain. ⟨hal-04660308⟩
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Sophie Le Bouquin-Leneveu, Jésabel Laithier, Rodolphe Thomas, Adeline Huneau-Salaün, Françoise Pozet, et al.. Investigations épidémiologiques dans quatre foyers de maladie du sommeil de la carpe dans le Nord en 2023. 8. Journées de la Recherche Filière Piscicole, ITAVI, Jul 2024, Rennes, France. ⟨hal-04698604⟩
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Maureen Duflot, Françoise Pozet, Sophie Le Bouquin-Leneveu, Céline Richomme, Odile Bourgau, et al.. Distribution de Clinostomum complanatum, parasite zoonotique, dans la perche (Perca fluviatilis) en France. 8. Journées de la Recherche Filière Piscicole, ITAVI, Jul 2024, Rennes, France. ⟨hal-04698554⟩
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Nicolas Viloux, Gauthier Delvallez, Corentin Bourgeois, Jean Sautereau, Christelle Mazuet, et al.. Entérite ulcéro-nécrotique chez la perdrix : résultats préliminaires de l’évaluation d’un outil PCR pour confirmer le diagnostic clinique. 15e Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, ITAVI, expert des filières avicole, cunicole et piscicole; INRAE; ANSES; CTCPA - Centre technique agroalimentaire, Mar 2024, Tours, France. pp.111-114. ⟨hal-04548477⟩
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https://hal.science/hal-04548477/file/Diapo_JRA_2024%20Clostridium%20ColinumCLM.pdf BibTex
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Agnes Perrin-Guyomard, Paméla Houée, Pierrick Lucas, Arnaud Felten, Laetitia Le Devendec, et al.. Résistance à la colistine chez la volaille française : impact positif des efforts de maîtrise. Quinzièmes Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, JRA, Mar 2024, Tours, France. pp.662-666. ⟨anses-04574719⟩
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https://anses.hal.science/anses-04574719/file/140_PERRIN_JRA_final.pdf BibTex
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Maxime Bruto, Albertine Léon, Matthieu Martineau, Florence Tardy, Fabien Labroussaa, et al.. Hotspot of recombination in Metamycoplasma equirhinis: evidence of multiple horizontal gene transfer events originating from bacteria sharing the same ecological niche. 25th Congress of the International Organization for Mycoplasmology (IOM 2024), International Organization for Mycoplasmology, Jul 2024, Gran Canaria, Spain. pp.Communication orale. ⟨anses-04856839⟩
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Sandrine Baron, Sophie Le Bouquin-Leneveu, Eric Jouy, Laëtitia Le Devendec, Florence Tardy, et al.. La filière piscicole en France et l’antibiorésistance – bilan de 10 années de recherche. 8. Journées de la Recherche Filière Piscicole, ITAVI, Jul 2024, Rennes, France. pp.1. ⟨hal-04696870⟩
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Elise Gourhannic, Leena Ledon, Pauline Grippon, Stephane Biacchesi, Lénaïg Louboutin, et al.. Impact de l’augmentation de la température des eaux sur les infections à Novirhabdovirus, pathogènes majeurs des salmonidés. 8. Journées de la Recherche Filière Piscicole, ITAVI, Jul 2024, Rennes, France. ⟨hal-04698570⟩
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Jean-Philippe Moysan, Angélique Moro, Jean-Michel Oizel, Joël Caro, Jean-François Robert, et al.. Étude des effets de l’éclosion à la ferme sur le bien-être et les performances de poulets à croissance rapide. 15. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2024, Tours, France. pp.393-397. ⟨hal-04546752⟩
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Claudio Trombani, Mélanie Ropars, Vianney Sicard, Sébastien Picault, Nicolas Rose, et al.. Gestion de la grippe récurrente H1avN1 à travers la vaccination des porcelets et le contrôle des agents de co-infection dans un élevage naisseur-engraisseur breton. 56èmes Journées de la Recherche Porcine, Ifip; INRAE, Feb 2024, Saint-Malo (FR), France. pp.59-64. ⟨hal-04449444⟩
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