Publications HAL du labo/EPI 1006225

2024

Journal articles

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Alice Fusaro, Bianca Zecchin, Edoardo Giussani, Elisa Palumbo, Montserrat Agüero-García, et al.. High pathogenic avian influenza A(H5) viruses of clade 2.3.4.4b in Europe—Why trends of virus evolution are more difficult to predict. Virus Evolution, 2024, 10 (1), pp.veae027. ⟨10.1093/ve/veae027⟩. ⟨anses-04582927⟩
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Vianney Sicard, Sébastien Picault, Mathieu Andraud. Pig herd management and infection transmission dynamics: a challenge for modellers. Peer Community Journal, 2024, 4, pp.e52. ⟨10.24072/pci.animsci.100198⟩. ⟨hal-04592902⟩
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Manon Dechêne-Tempier, Claire de Boisséson, Pierrick Lucas, Stéphanie Bougeard, Virginie Libante, et al.. Virulence genes, resistome and mobilome of Streptococcus suis strains isolated in France. Microbial Genomics, 2024, 10 (3), ⟨10.1099/mgen.0.001224⟩. ⟨hal-04528772⟩
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Céline Deblanc, Stéphane Quéguiner, Stéphane Gorin, Gautier Richard, Angélique Moro, et al.. Pathogenicity and escape to pre-existing immunity of a new genotype of swine influenza H1N2 virus that emerged in France in 2020. Veterinary Research, 2024, 55 (1), pp.65. ⟨10.1186/s13567-024-01319-5⟩. ⟨hal-04588373⟩
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Patricia Renson, Sophie Mahé, Mathieu Andraud, Mireille Le Dimna, Frédéric Paboeuf, et al.. Effect of vaccination route (intradermal vs. intramuscular) against porcine reproductive and respiratory syndrome using a modified live vaccine on systemic and mucosal immune response and virus transmission in pigs. BMC Veterinary Research, 2024, 20 (1), pp.5. ⟨10.1186/s12917-023-03853-4⟩. ⟨anses-04413214⟩
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Alexandre Gaymard, Caroline Picard, Guilhem Vazzoler, Pascale Massin, Emilie Frobert, et al.. Impact of the H274Y Substitution on N1, N4, N5, and N8 Neuraminidase Enzymatic Properties and Expression in Reverse Genetic Influenza A Viruses. Viruses, 2024, 16 (3), pp.388. ⟨10.3390/v16030388⟩. ⟨anses-04549222⟩
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Greta Bellinzona, Tiago Nardi, Michele Castelli, Gherard Batisti Biffignandi, Karim Adjou, et al.. Comparative genomics of Cryptosporidium parvum reveals the emergence of an outbreak-associated population in Europe and its spread to the United States. Genome Research, 2024, ⟨10.1101/gr.278830.123⟩. ⟨hal-04643965⟩
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Francisco Javier Moreno, Florencio Pazos, Manuel Garrido-Romero, Cyrielle Payen, Gonzalo Borrego-Yaniz, et al.. Roadmap for the integration of gastro‐intestinal (GI) tract microbiomes (human and domestic animal) in risk assessments under EFSA's remit. EFSA Supporting Publications, 2024, 21 (2), pp.EN-8597. ⟨10.2903/sp.efsa.2024.EN-8597⟩. ⟨hal-04474405⟩
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Jean Lagarde, Carole Feurer, Martine Denis, Pierre-Emmanuel Douarre, Pascal Piveteau, et al.. Listeria monocytogenes prevalence and genomic diversity along the pig and pork production chain. Food Microbiology, 2024, 119, pp.104430. ⟨10.1016/j.fm.2023.104430⟩. ⟨hal-04526173⟩
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Kerli Mõtus, Dagni-Alice Viidu, Triin Rilanto, Tarmo Niine, Toomas Orro, et al.. Application of multiblock analysis to identify key areas and risk factors for dairy cow persistence. Preventive Veterinary Medicine, 2024, 222, pp.106081. ⟨10.1016/j.prevetmed.2023.106081⟩. ⟨anses-04416135⟩
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Christian Baudry, Gaëlle Jadé, Paul Rayneau, Bertrand Lombard, Max Feinberg, et al.. S-score: a new score for binary qualitative proficiency testing schemes interpretable as the z-score. Accreditation and Quality Assurance, 2024, 29 (2), pp.103-113. ⟨10.1007/s00769-023-01561-y⟩. ⟨anses-04509384⟩
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Rozenn Souillard, Virginie Allain, Anne Christine Dufay-Lefort, Nathalie Rousset, Arthi Amalraj, et al.. Biosecurity implementation on large-scale poultry farms in Europe: A qualitative interview study with farmers. Preventive Veterinary Medicine, 2024, 224, pp.106119. ⟨10.1016/j.prevetmed.2024.106119⟩. ⟨anses-04574507⟩
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Abbey Olsen, Silvia Bonardi, Lisa Barco, Marianne Sandberg, Nina Langkabel, et al.. A comparison of European surveillance programs for Campylobacter in broilers. Food Control, 2024, 155, pp.110059. ⟨10.1016/j.foodcont.2023.110059⟩. ⟨anses-04416244⟩
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Axelle Scoizec, Eric Niqueux, Audrey Schmitz, Béatrice Grasland, Loïc Palumbo, et al.. New Patterns for Highly Pathogenic Avian Influenza and Adjustment of Prevention, Control and Surveillance Strategies: The Example of France. Viruses, 2024, 16 (1), pp.101. ⟨10.3390/v16010101⟩. ⟨anses-04416341⟩
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Maryse Guinebretière, Laura Warin, Jean-Philippe Moysan, Bertrand Méda, Frédérique Mocz, et al.. Effects of strain and stocking density on leg health, activity, and use of enrichments in conventional broiler chicken production. Poultry Science, In press, pp.103993. ⟨10.1016/j.psj.2024.103993⟩. ⟨hal-04631786⟩
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Aurélie Babin, Frank Schurr, Sabine Delannoy, Patrick Fach, Minh Huyen Ton Nu Nguyet, et al.. Distribution of infectious and parasitic agents among three sentinel bee species across European agricultural landscapes. Scientific Reports, 2024, 14 (1), pp.3524. ⟨10.1038/s41598-024-53357-w⟩. ⟨hal-04481521⟩
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Tereza Almeida, Ana M Lopes, Josep Estruch, Carlos Rouco, Patrizia Cavadini, et al.. A new HaCV-EBHSV recombinant lagovirus circulating in European brown hares (Lepus europaeus) from Catalonia, Spain. Scientific Reports, 2024, 14 (1), pp.2872. ⟨10.1038/s41598-024-53201-1⟩. ⟨anses-04456767⟩
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Marion Laurent, Stéphanie Bougeard, Lucile Caradec, Florence Ghestem, Matthias Albrecht, et al.. Novel indices reveal that pollinator exposure to pesticides varies across biological compartments and crop surroundings. Science of the Total Environment, 2024, 927, pp.172118. ⟨10.1016/j.scitotenv.2024.172118⟩. ⟨hal-04540908⟩
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Nathalie Rousset, Azziza Ait Ahmed, Loïc Balaine, Antoine Battaglia, Benoît Berlizot, et al.. Utiliser mieux et moins les produits de désinfection en filières avicole et piscicole. Innovations Agronomiques, 2024, 94, pp.115-126. ⟨10.17180/ciag-2024-vol94-art08⟩. ⟨hal-04601631⟩
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Juliette Dupré, Mireille Le Dimna, Evelyne Hutet, Pascal Dujardin, Aurore Fablet, et al.. Exploring type I interferon pathway: virulent vs. attenuated strain of African swine fever virus revealing a novel function carried by MGF505-4R. Frontiers in Immunology, 2024, 15, pp.1358219. ⟨10.3389/fimmu.2024.1358219⟩. ⟨anses-04504013⟩
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Maxime Delsart, Jean-Michel Répérant, Chantal Benoit, Edouard Boudin, Jean-François Da-Costa, et al.. Bayesian estimation of the sensitivity and specificity of coprological and serological diagnostic tests for the detection of Ascaris suum infection on pig farms. International Journal for Parasitology, In press, ⟨10.1016/j.ijpara.2024.04.010⟩. ⟨hal-04568350⟩
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João B Cota, Nina Langkabel, Lisa Barco, Abbey Olsen, Silvia Bonardi, et al.. Comparison of european surveillance and control programs for Salmonella in broiler and Turkey chains. Food Control, 2024, 165, pp.110656. ⟨10.1016/j.foodcont.2024.110656⟩. ⟨anses-04633373⟩
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François‐xavier Briand, Marielle Beltrame, Carole Guillemoto, Rachel Busson, Laetitia Pigeyre, et al.. Highly pathogenic avian influenza A (H5N1) clade 2.3.4.4b virus infection in captive bears (Ursus thibetanus) and in captive and wild birds, France, 2022. German Journal of Veterinary Research, 2024, 4 (1), pp.77-81. ⟨10.51585/gjvr.2024.1.0077⟩. ⟨anses-04577858⟩
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Peter Smith, Laëtitia Le Devendec, Eric Jouy, Emeline Larvor, David Verner-Jeffreys, et al.. Epidemiological cut-off values for Yersina ruckeri disc diffusion data generated by a standardised method. Diseases of Aquatic Organisms, 2024, 158, pp.21-25. ⟨10.3354/dao03779⟩. ⟨anses-04574853⟩
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Asma Mesdour, Sandra Ijioma, Muhammad-Bashir Bolajoko, Elena Arsevska, Mamadou Ciss, et al.. Towards the Building of a Surveillance Network for PPR-Like Diseases in Nigeria: Identifying Potential Sentinel Node in a Partially-Known Network. Studies in Computational Intelligence, 2024, Studies in Computational Intelligence, 1142, pp.325-337. ⟨10.1007/978-3-031-53499-7_26⟩. ⟨hal-04551625⟩
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Conference papers

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Nicolas Viloux, Gauthier Delvallez, Corentin Bourgeois, Jean Sautereau, Christelle Mazuet, et al.. Entérite ulcéro-nécrotique chez la perdrix : résultats préliminaires de l’évaluation d’un outil PCR pour confirmer le diagnostic clinique. 15. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, ITAVI, expert des filières avicole, cunicole et piscicole; INRAE; ANSES; CTCPA - Centre technique agroalimentaire, Mar 2024, Tours, France. pp.111-114. ⟨hal-04548477⟩
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Maryse Guinebretière, Ludovic Calandreau, Alexandra Scheubel, Frédérique Mocz, Jean-Philippe Moysan, et al.. Structurer et enrichir l’espace : quels impacts sur les comportements et la réactivité des poulets de chair. 15. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2024, Tours, France. pp.12-17. ⟨hal-04546517⟩
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Lucie Collineau, Laurence Lacmago, Yohann Lacotte, Benoit Lange, Olivier Lemenand, et al.. Towards integrated surveillance of antibioic resistance in France. A first analysis of surveillance data in a One Health perspective. International One H Symposium (ONEH2024), Innôzh; Anses; Labocéa, Jun 2024, Saint Brieuc, France. ⟨anses-04619942⟩
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Claire Chauvin, Elsa Coz, Eric Jouy, Marie Laure Delignette-Muller, Agnes Perrin-Guyomard, et al.. Résistance à la colistine chez le porc - des mesures de maîtrise efficaces. 56. Journées de la Recherche Porcine, Ifip; Inrae, Feb 2024, Saint-Malo (FR), France. pp.81-82. ⟨hal-04449556⟩
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Rozenn Souillard, Jeanne Laurentie, Francis Repoila, Isabelle Kempf, Pascale Serror. Enterococcus cecorum, un agent pathogène opportuniste des volailles : mieux le connaitre pour une meilleure maitrise en élevage. 15. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2024, Tours, France. pp.102-110. ⟨hal-04547075⟩
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Frédérique Mocz, Laura Warin, Jean-Philippe Moysan, Alassane Keita, Ewen Poulnais, et al.. Evaluation de l’impact de l’accès à un jardin d’hiver sur le bien-être du poulet de chair. 15. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2024, Tours, France. pp.18-22. ⟨hal-04546715⟩
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Béatrice Grasland, Jocelyn Marguerie. Premier bilan de la mise en œuvre de la stratégie vaccinale contre l'influenza aviaire hautement pathogène en France : Vaccination contre l’influenza aviaire hautement pathogène en France : où en est-on ?. 15. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2024, Tours, France. ⟨hal-04546452⟩
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Axelle Scoizec, François‐Xavier Briand, Éric Niqueux, Audrey Schmitz, Guillaume Gerbier, et al.. Cluster de foyers IAHP en poules pondeuses, Bretagne 2023 : résultats des investigations épidémiologiques. 15. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2024, Tours, France. pp.226-230. ⟨hal-04546955⟩
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Muriel Guyard-Nicodème, Philippe Velge. Sensibilité du poussin à Salmonella : rôle du microbiote et de Campylobacter. 15. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2024, Tours, France. pp.458-461. ⟨hal-04546693⟩
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Agnes Perrin-Guyomard, Paméla Houée, Pierrick Lucas, Arnaud Felten, Laetitia Le Devendec, et al.. Résistance à la colistine chez la volaille française : impact positif des efforts de maîtrise. Quinzièmes Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, JRA, Mar 2024, Tours, France. pp.662-666. ⟨anses-04574719⟩
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Claudio Trombani, Mélanie Ropars, Vianney Sicard, Sébastien Picault, Nicolas Rose, et al.. Gestion de la grippe récurrente H1avN1 à travers la vaccination des porcelets et le contrôle des agents de co-infection dans un élevage naisseur-engraisseur breton. 56. Journées de la Recherche Porcine, Ifip; Inrae, Feb 2024, Saint-Malo (FR), France. pp.59-64. ⟨hal-04449444⟩
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Jean-Philippe Moysan, Angélique Moro, Jean-Michel Oizel, Joël Caro, Jean-François Robert, et al.. Étude des effets de l’éclosion à la ferme sur le bien-être et les performances de poulets à croissance rapide. 15. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2024, Tours, France. pp.393-397. ⟨hal-04546752⟩
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Maxime Delsart, Nicolas Rose, Barbara Dufour, Jean-Michel Répérant, Radu Blaga, et al.. Quels sont les facteurs associés aux niveaux de parasitisme interne chez les porcs dans les systèmes d'élevage alternatifs ?. 56. Journées de la Recherche Porcine (JRP), Feb 2024, St Malo, France. pp.55. ⟨hal-04446370⟩
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Maryem Ben Salem, Mathieu Andraud, Stéphanie Bougeard, Sophie Le Bouquin, Virginie Allain, et al.. Epizootie d’Influenza Aviaire Hautement Pathogène en France en 2022-2023 : importance des facteurs environnementaux. 15. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2024, Tours, France. pp.236-240. ⟨hal-04539486⟩
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Laetitia Bonifait, Maria Pardos de la Gandara, Arnaud Felten, Amandine Thépault, Louise Baugé, et al.. La contamination humaine par Salmonella enterica subsp arizonae a-t-elle un lien avec son émergence dans la filière avicole ? : Salmonella arizonae dans la filière avicole. 15. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, ITAVI, expert des filières avicole, cunicole et piscicole; INRAE; ANSES; CTCPA - Centre technique agroalimentaire, Mar 2024, Tours, France. pp.462-467. ⟨hal-04539612⟩
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Léa Boudaud, Catherine Belloc, Thomas Delquigny, Jean-Charles Donval, Adeline Huneau-Salaün, et al.. Recueil d’opinion sur le formulaire d’enquête épidémiologique lors de foyer de Salmonella en élevage de poules pondeuses. 15. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras (JRA), ITAVI, expert des filières avicole, cunicole et piscicole; INRAE; ANSES; CTCPA - Centre technique agroalimentaire, Mar 2024, Tours, France. pp.468-472. ⟨hal-04547995⟩
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Mathilde Gondard, Lydie Postic, Mathilde Turpaud, Fabrice Touzain, Yannick Blanchard, et al.. Orbivirus : situation épidémiologique exceptionnelle en France en 2023, intérêt du séquençage de génomes viraux dans un contexte épizootique. XXVIes Journées francophones de virologie, Société Française de Virologie, Apr 2024, Bruxelles, Belgique. ⟨anses-04572804⟩
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Léa Ottmann, Victoria Brejon, Angélique Travel, Jean-Michel Répérant. Le parasitisme en volaille sur parcours, un problème sous-estimé. 15. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, ITAVI, expert des filières avicole, cunicole et piscicole; INRAE; ANSES; CTCPA - Centre technique agroalimentaire, Mar 2024, Tours, France. pp.92-96. ⟨hal-04548073⟩
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Armande Dupuis, Christelle Fablet, Florent Eono, Éric Eveno, Poulain Gilles, et al.. Combiner larmes brunes et lésions corporelles pour une appréciation du bien-être des porcs ?. 56. Journées de la Recherche Porcine, Ifip; Inrae, Feb 2024, Saint-Malo (FR), France. pp.253-258. ⟨hal-04449306⟩
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Morgane Rémond, Eric Lewandowski, Vincent Muller, Célia Puyal-Rucine, Anne Lehébel, et al.. Etude descriptive du portage de Streptococcus suis et des sérotypes 2, 1/2 et 9 au sein de deux cheptels présentant des cas cliniques de streptococcie. 56. Journées de la Recherche Porcine, Ifip; Inrae, Feb 2024, Saint-Malo (FR), France. pp.71-76. ⟨hal-04449508⟩
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Rozenn Souillard, Virginie Allain, Anne-Christine Dufay-Lefort, Nathalie Rousset, Arthi Amalraj, et al.. Observance de la biosécurité : Etude menée auprès de 83 éleveurs de volailles de chair en Europe. 15. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2024, Tours, France. pp.432-436. ⟨hal-04547026⟩
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Poster communications

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Martine Denis, Emmanuelle Houard, Adiel Ouedraogo, Léonie Le Berre, Carole Feurer, et al.. Survie au froid et pathogénicité des souches de Yersinia enterocolitica BT4 isolées chez le porc et génétiquement proches ou non de souches isolées chez l’homme. 56. Journées de la Recherche Porcine, Feb 2024, Saint-Malo (FR), France. Ifip, Journées de la Recherche Porcine, 56, pp.45-46, 2024, 53èmes Journées de la Recherche Porcine. ⟨hal-04449384⟩
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Jean-Michel Répérant, Rahma Attia El Hili, Martine Thomas-Hénaff, Chantal Benoit, Pierre Le Bihannic, et al.. Le curcuma pour lutter contre les coccidies : un candidat plutôt décevant. 15. Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2024, Tours (France), France. pp.623-627, 2024. ⟨anses-04548333⟩
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Nathalie Rousset, Rozenn Souillard, Virginie Allain, Sophie Le Bouquin, Jocelyn Marguerie, et al.. Observance de la biosécurité en aviculture en France : Où en est-on et quelles sont les attentes des éleveurs ?. 15. Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2024, Tours (France), France. pp.558-562, 2024. ⟨anses-04548343⟩
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Aude Kleiber, Maryse Guinebretière, Pauline Loiseau, Ivan Jego, Virginie Michel. Un projet européen de réseaux multi-acteurs pour améliorer les pratiques d’élevage des poulets de chair (BroilerNet). 15. Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2024, Tours (France), France. pp.534-538, 2024. ⟨anses-04547234⟩
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Delsart Maxime, Nicolas Rose, Dufour Barbara, Édouard Boudin, Virginie Dorenlor, et al.. What are the external biosecurity measures in French outdoor pig farms ?. 15th European symposium of porcine health management, Jun 2024, Leipzig, Germany. ⟨hal-04601327⟩
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Agnes Perrin-Guyomard, Paméla Houée, Pierrick Lucas, Arnaud Felten, Laetitia Le Devendec, et al.. Résistance à la colistine chez la volaille française : impact positif des efforts de maîtrise. 15. Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2024, Tours (France), France. pp.662-666, 2024. ⟨anses-04548197⟩
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Sandra Rouxel, Typhaine Poezevara, Martine Thomas-Hénaff, Michel Amelot, Amandine Avouac, et al.. Développement d’un modèle expérimental de botulisme aviaire : Optimisation des paramètres pour favoriser la colonisation caecale par Clostridium botulinum. 15. Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2024, Tours (France), France. pp.667-671, 2024. ⟨anses-04548363⟩
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Delsart Maxime, Parois Séverine, Dufour Barbara, Boudin Édouard, Virginie Dorenlor, et al.. Husbandry practices in suckling piglets on alternative farms and farmers' perception of the pigs' pain. 15th European symposium of porcine health management, Jun 2024, Leipzig, Germany. ⟨hal-04601329⟩
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https://enva.hal.science/hal-04601329/file/ESPHM%202024_Pain_Delsart%20et%20al_Poster_16-9.pdf BibTex
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Adeline Huneau-Salaün, Tapie Isabelle, Tribéhou Guillaume, Marie-Bénédicte Peyrat, Sophie Le Bouquin. Analyse rétrospective des enquêtes épidémiologiques en foyers de salmonelles dans les élevages de pondeuses en 2020. 15. Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2024, Tours (France), France. pp.657-661, 2024. ⟨anses-04547182⟩
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Pauline Creach, Pascal Galliot, Jérôme Hazart, Alassane Keita, Jean-Philippe Moysan. Evaluation des performances de capteurs commerciaux de concentrations en ammoniac en poulailler. 15. Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2024, Tours (France), France. pp.867-872, 2024. ⟨anses-04548566⟩
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Anne Gautier-Bouchardon, Séverine Ferré, Odile Balan, Florence Tardy. Actualités du Laboratoire National de Référence pour les mycoplasmoses aviaires. 15. Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2024, Tours (France), France. pp.646-650, 2024. ⟨anses-04539666⟩
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Rozenn Souillard, Sandra Rouxel, Virginie Dorenlor, Typhaine Poezevara, Loïc Balaine, et al.. Suivi de la détection de C. botulinum depuis l'élevage de volailles jusqu’à l’épandage du fumier dans les parcelles. 15. Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2024, Tours (France), France. pp.672-676, 2024. ⟨anses-04548414⟩
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Reports

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Catherine Belloc, Marie-Laure Begout, Alain Boissy, Alice de Boyer Des Roches, Marine Friant-Perrot, et al.. Lignes Directrices pour l’établissement de référentiels d’étiquetage du bien-être des animaux. Saisine n°2021-AUTO-0161, ANSES. 2024, 253 p. ⟨anses-04608581⟩
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Corinne Danan, Vincent Leclerc, Frédérique Moury, Viviane Morel, Claire Yvon, et al.. Note d’appui scientifique et technique de l’Anses relative aux «Modalités de surveillance et de lutte contre les variants de Salmonella Typhimurium : Bilan des résultats des confirmations réalisées sur les souches collectées depuis 2011». Saisine n°2023-AST-0070, 2024, 9 p. ⟨anses-04612031⟩
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Preprints, Working Papers, ...

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Vianney Sicard, Sébastien Picault, Mathieu Andraud. Pig herd management and infection transmission dynamics: a challenge for modellers. 2024. ⟨hal-04464917⟩
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2023

Journal articles

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Stephen Valas, David Ngwa-Mbot, Sophie Stourm, Sophie Mémeteau, Marc Tabouret. A retrospective evaluation of pooled serum ELISA testing in the frame of the French eradication program for infectious bovine rhinotracheitis. Preventive Veterinary Medicine, 2023, 214, pp.105890. ⟨10.1016/j.prevetmed.2023.105890⟩. ⟨anses-04188380⟩
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Mathieu Andraud, S Hervé, S Gorin, N Barbier, S Quéguiner, et al.. Evaluation of early single dose vaccination on swine influenza A virus transmission in piglets: From experimental data to mechanistic modelling. Vaccine, 2023, 41, pp.3119 - 3127. ⟨10.1016/j.vaccine.2023.04.018⟩. ⟨anses-04123704⟩
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https://anses.hal.science/anses-04123704/file/1-s2.0-S0264410X23004012-main.pdf BibTex
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Nathalie Rousset, Antoine Battaglia, Julie Puterflam, Rozenn Souillard, Virginie Allain, et al.. Observance de la biosécurité en aviculture en France - où en est-t-on et quelles sont les attentes des éleveurs ?. TeMa, 2023, 65, pp.12-18. ⟨anses-04470631⟩
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Martine Denis, Valérie Rose, Bérengère Nagard, Amandine Thépault, Pierrick Lucas, et al.. Comparative Analysis of Campylobacter jejuni and C. coli Isolated from Livestock Animals to C. jejuni and C. coli Isolated from Surface Water Using DNA Sequencing and MALDI-TOF. Pathogens, 2023, 12 (9), pp.1069. ⟨10.3390/pathogens12091069⟩. ⟨hal-04196825⟩
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Brandon H. Hayes, Timothée Vergne, Mathieu Andraud, Nicolas Rose. Mathematical modeling at the livestock-wildlife interface: scoping review of drivers of disease transmission between species. Frontiers in Veterinary Science, 2023, 10, pp.1225446. ⟨10.3389/fvets.2023.1225446⟩. ⟨hal-04223851⟩
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Anne-Marie Pourcher, Céline Druilhe, Caroline Le Maréchal, Elisabeth Repérant, Evelyne Boscher, et al.. Quantification of indicator and pathogenic bacteria in manures and digestates from three agricultural biogas plants over a one-year period. Waste Management, 2023, 169, pp.91-100. ⟨10.1016/j.wasman.2023.06.037⟩. ⟨anses-04170587⟩
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Jeanne Laurentie, Valentin Loux, Christelle Hennequet-Antier, Emilie Chambellon, Julien Deschamps, et al.. Comparative Genome Analysis of Enterococcus cecorum Reveals Intercontinental Spread of a Lineage of Clinical Poultry Isolates. MSphere, 2023, 8 (2), pp.e0049522. ⟨10.1128/msphere.00495-22⟩. ⟨hal-04004063⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-04004063/file/laurentie-et-al-2023-comparative-genome-analysis-of-enterococcus-cecorum-reveals-intercontinental-spread-of-a-lineage.pdf BibTex
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Elina Tast Lahti, Nadja Karamehmedovic, Hilde Riedel, Linnea Blom, Jeppe Boel, et al.. One Health surveillance—A cross-sectoral detection, characterization, and notification of foodborne pathogens. Frontiers in Public Health, 2023, 11, pp.91-100. ⟨10.3389/fpubh.2023.1129083⟩. ⟨hal-04258420⟩
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Andrea Laconi, Giuditta Tilli, Francesco Galuppo, Guido Grilli, Rozenn Souillard, et al.. Stakeholders’ Perceptions of Biosecurity Implementation in Italian Poultry Farms. Animals, 2023, 13 (20), pp.3246. ⟨10.3390/ani13203246⟩. ⟨anses-04395674⟩
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https://anses.hal.science/anses-04395674/file/animals-13-03246.pdf BibTex
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Héloïse Pageaut, Sonia Lacouture, Mélanie Lehoux, Corinne Marois-Créhan, Mariela Segura, et al.. Interactions of Mycoplasma hyopneumoniae and/or Mycoplasma hyorhinis with Streptococcus suis Serotype 2 Using In Vitro Co-Infection Models with Swine Cells. Pathogens, 2023, 12 (7), pp.866. ⟨10.3390/pathogens12070866⟩. ⟨anses-04188331⟩
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https://anses.hal.science/anses-04188331/file/pathogens-12-00866-v2.pdf BibTex
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Emma Meloni, Caroline Le Maréchal, Florian Millot, Ariane Payne, Clément Calenge, et al.. Exposure of waterfowl to Clostridium botulinum in France. Frontiers in Conservation Science, 2023, 4, pp.1011555. ⟨10.3389/fcosc.2023.1011555⟩. ⟨anses-04050397⟩
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Stéphanie Bougeard, Pasquale Dolce, Véronique Cariou, Mohamed Hanafi. Prediction model for multiblock data with or without intermediate blocks. Estimation by PLS Path Modeling. Chemometrics and Intelligent Laboratory Systems, 2023, 243, pp.105016. ⟨10.1016/j.chemolab.2023.105016⟩. ⟨anses-04350825⟩
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Noémie Gloanec, Muriel Guyard-Nicodème, Raphaël Brunetti, Ségolène Quesne, Alassane Keita, et al.. Plasmid DNA Prime/Protein Boost Vaccination against Campylobacter jejuni in Broilers: Impact of Vaccine Candidates on Immune Responses and Gut Microbiota. Pharmaceutics, 2023, 15 (5), pp.1397. ⟨10.3390/pharmaceutics15051397⟩. ⟨anses-04123731⟩
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Maud Contrant, Lionel Bigault, Mathieu Andraud, Marion Desdouits, Sophie Rocq, et al.. Porcine Epidemic Diarrhea Virus, Surrogate for Coronavirus Decay Measurement in French Coastal Waters and Contribution to Coronavirus Risk Evaluation. Microbiology Spectrum, 2023, 11 (4), pp.e0184423. ⟨10.1128/spectrum.01844-23⟩. ⟨anses-04191018⟩
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Céline Deblanc, Virginie Allain, Aurélie Oger, Olivier Bourry, Gaëlle Simon, et al.. Bilan de la surveillance de la maladie d'Aujeszky en élevages de suidés domestiques et sauvages en France continentale et sur l'île de la Réunion en 2021. Bulletin épidémiologique, 2023, 100 (article 2), pp.1-9. ⟨anses-04401089⟩
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https://anses.hal.science/anses-04401089/file/MRE-030_2023-12-13_Aujeszky-Deblanc_VF_0.pdf BibTex
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François Meurens, Frédéric Carlin, Michel Federighi, Maria-Eleni Filippitzi, Matthieu Fournier, et al.. Clostridium botulinum type C, D, C/D, and D/C: An update. Frontiers in Microbiology, 2023, 13, pp.1099184. ⟨10.3389/fmicb.2022.1099184⟩. ⟨hal-03963259⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03963259/file/Meurens_Front%20Microbiol_2023.pdf BibTex
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Jeanne Laurentie, Gwenaelle Mourand, Pauline Grippon, Sylviane Furlan, Claire Chauvin, et al.. Determination of Epidemiological Cutoff Values for Antimicrobial Resistance of Enterococcus cecorum. Journal of Clinical Microbiology, 2023, ⟨10.1128/jcm.01445-22⟩. ⟨hal-04004196⟩
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Muriel Guyard-Nicodème, Nagham Anis, Doaa Naguib, Eric Viscogliosi, Marianne Chemaly. Prevalence and Association of Campylobacter spp., Salmonella spp., and Blastocystis sp. in Poultry. Microorganisms, 2023, 11 (8), pp.1983. ⟨10.3390/microorganisms11081983⟩. ⟨hal-04289613⟩
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Solène Mousqué, Frédérique Mocz, Anja Riber. Validation of Methods for Assessment of Dust Levels in Layer Barns. Animals, 2023, 13 (5), pp.783. ⟨10.3390/ani13050783⟩. ⟨anses-04040543⟩
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Emmanuel Bréard, Lydie Postic, Mathilde Gondard, Cindy Bernelin-Cottet, Aurélie Le Roux, et al.. Circulation of Bluetongue Virus Serotypes 1, 4, 8, 10 and 16 and Epizootic Hemorrhagic Disease Virus in the Sultanate of Oman in 2020–2021. Viruses, 2023, 15 (6), pp.1259. ⟨10.3390/v15061259⟩. ⟨anses-04145201⟩
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Noémie Gloanec, Muriel Guyard-Nicodème, Raphaël Brunetti, Ségolène Quesne, Alassane Keita, et al.. Evaluation of Two Recombinant Protein-Based Vaccine Regimens against Campylobacter jejuni: Impact on Protection, Humoral Immune Responses and Gut Microbiota in Broilers. Animals, 2023, 13 (24), pp.3779. ⟨10.3390/ani13243779⟩. ⟨anses-04350409⟩
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Alexandra Rahmani, Leila Parizadeh, Marine Baud, Yoannah François, A. Bazire, et al.. Potential of Marine Strains of Pseudoalteromonas to Improve Resistance of Juvenile Sea Bass to Pathogens and Limit Biofilm Development. Probiotics and Antimicrobial Proteins, 2023, ⟨10.1007/s12602-023-10180-5⟩. ⟨hal-04343291⟩
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https://hal.science/hal-04343291/file/3ac345ba-2167-4cb3-926f-fa192cf27246.pdf BibTex
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Manon Dechêne-Tempier, Eric Jouy, Marie-Hélène Bayon-Auboyer, Stéphanie Bougeard, Claire Chauvin, et al.. Antimicrobial resistance profiles of Streptococcus suis isolated from pigs, wild boars, and humans in France between 1994 and 2020. Journal of Clinical Microbiology, 2023, 61 (9), pp.e0016423. ⟨10.1128/jcm.00164-23⟩. ⟨anses-04228454⟩
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https://anses.hal.science/anses-04228454/file/Dechene_Tempier_2023_JCM_postprint.pdf BibTex
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Jun-Sik Lim, Mathieu Andraud, Eutteum Kim, Timothée Vergne. Three Years of African Swine Fever in South Korea (2019–2021): A Scoping Review of Epidemiological Understanding. Transboundary and emerging diseases, 2023, 2023, pp.4686980. ⟨10.1155/2023/4686980⟩. ⟨hal-04055541⟩
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Peter Smith, Laëtitia Le Devendec, Eric Jouy, Emeline Larvor, Jean Lesne, et al.. Epidemiological cut-off values for non-O1/ non-O139 Vibrio cholerae disc diffusion data generated by standardised methods. Diseases of Aquatic Organisms, 2023, 156, pp.115 - 121. ⟨10.3354/dao03766⟩. ⟨anses-04395805⟩
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Cyrille Ngassam Tchamba, Fabrice Touzain, Marte Fergestad, Anneleen de Visscher, Trine l'Abee-Lund, et al.. Identification of staphylococcal cassette chromosome mec in Staphylococcus aureus and non-aureus staphylococci from dairy cattle in Belgium: Comparison of multiplex PCR and whole genome sequencing. Research in Veterinary Science, 2023, 155, pp.150-155. ⟨10.1016/j.rvsc.2023.01.011⟩. ⟨anses-04041119⟩
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Cyrielle Payen, Annaëlle Kerouanton, Jorge Novoa, Florencio Pazos, Carlos Benito, et al.. Effects of Major Families of Modulators on Performances and Gastrointestinal Microbiota of Poultry, Pigs and Ruminants: A Systematic Approach. Microorganisms, 2023, 11 (6), pp.1464. ⟨10.3390/microorganisms11061464⟩. ⟨anses-04170451⟩
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Morgan Sarry, Cindy Bernelin-Cottet, Caroline Michaud, Anthony Relmy, Aurore Romey, et al.. Development of a primary cell model derived from porcine dorsal soft palate for foot-and-mouth disease virus research and diagnosis. Frontiers in Microbiology, 2023, 14, pp.1215347. ⟨10.3389/fmicb.2023.1215347⟩. ⟨hal-04281738⟩
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Stéphanie Bougeard, Adeline Huneau-Salaun, Mikael Attia, Jean-Baptiste Richard, Caroline Demeret, et al.. Application of Machine Learning Prediction of Individual SARS-CoV-2 Vaccination and Infection Status to the French Serosurveillance Survey From March 2020 to 2022: Cross-Sectional Study. JMIR Public Health and Surveillance, 2023, 9, pp.e46898. ⟨10.2196/46898⟩. ⟨anses-04395611⟩
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Muriel Guyard-Nicodème, Nagham Anis, Doaa Naguib, Eric Viscogliosi, Marianne Chemaly. Prevalence and Association of Campylobacter spp., Salmonella spp., and Blastocystis sp. in Poultry. Microorganisms, 2023, 11 (8), pp.1983. ⟨10.3390/microorganisms11081983⟩. ⟨anses-04228489⟩
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Nagham Anis, Laetitia Bonifait, Ségolène Quesne, Louise Baugé, Marianne Chemaly, et al.. Simultaneous Detection of Salmonella spp. and Quantification of Campylobacter spp. in a Real-Time Duplex PCR: Myth or Reality?. Pathogens, 2023, 12, pp.338. ⟨10.3390/pathogens12020338⟩. ⟨anses-04018970⟩
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https://anses.hal.science/anses-04018970/file/pathogens-12-00338.pdf BibTex
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Caterina Lupini, Claudia Maria Tucciarone, Giulia Mescolini, Giulia Quaglia, Giulia Graziosi, et al.. Longitudinal Survey on aMPV Circulation in French Broiler Flocks following Different Vaccination Strategies. Animals, 2023, 13 (1), pp.57. ⟨10.3390/ani13010057⟩. ⟨anses-04328570⟩
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Maxime Delsart, Françoise Pol, Barbara Dufour, Nicolas Rose, Christelle Fablet. L’élevage porcin en systèmes alternatifs : atouts et défis en termes de bien-être animal, biosécurité, santé animale et sécurité sanitaire. INRAE Productions Animales, 2023, 36 (3), pp.7675. ⟨10.20870/productions-animales.2023.36.3.7675⟩. ⟨hal-04231528⟩
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Laurane Pallandre, Doriana Flores, Françoise Pozet, Laurent Bigarré. Nearly complete genome sequence of a Perhabdovirus isolated on European perch (Perca fluviatilis). Microbiology Resource Announcements, 2023, 12 (10), pp.e0044223. ⟨10.1128/MRA.00442-23⟩. ⟨anses-04311933⟩
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Cornelia Adlhoch, Alice Fusaro, José L Gonzales, Thijs Kuiken, Stefano Marangon, et al.. Avian influenza overview September – December 2022. EFSA Journal, 2023, 21 (1), pp.e07786. ⟨10.2903/j.efsa.2023.7786⟩. ⟨anses-04456900⟩
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Cornelia Adlhoch, Alice Fusaro, José L Gonzales, Thijs Kuiken, Stefano Marangon, et al.. Avian influenza overview December 2022 – March 2023. EFSA Journal, 2023, 21 (3), pp.e07917. ⟨10.2903/j.efsa.2023.7917⟩. ⟨anses-04456874⟩
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https://anses.hal.science/anses-04456874/file/EFSA%20Journal%20-%202023%20-%20%20-%20Avian%20influenza%20overview%20December%202022%20%20%20March%202023.pdf BibTex
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Minh Huyen Ton Nu Nguyet, Stéphanie Bougeard, Aurélie Babin, Eric Dubois, Christine Druesne, et al.. Building composite indices in the age of big data – Application to honey bee exposure to infectious and parasitic agents. Heliyon, 2023, 9 (4), pp.e15244. ⟨10.1016/j.heliyon.2023.e15244⟩. ⟨anses-04068240⟩
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Noémie Gloanec, Daniel Dory, Ségolène Quesne, Véronique Béven, Typhaine Poezevara, et al.. Research Note: Analysis of immune responses in broilers after vaccination against Campylobacter jejuni. Poultry Science, 2023, 102 (4), pp.102510. ⟨10.1016/j.psj.2023.102510⟩. ⟨anses-04040798⟩
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Jowita S. Niczyporuk, Wojciech Kozdruń, Agnieszka Czujkowska, Yannick Blanchard, Teheipuaura Mariteragi-Helle, et al.. West Nile Virus Lineage 2 in Free-Living Corvus cornix Birds in Poland. Tropical Medicine and Infectious Disease, 2023, 8 (8), pp.417. ⟨10.3390/tropicalmed8080417⟩. ⟨hal-04228234⟩
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https://hal.science/hal-04228234/file/tropicalmed-08-00417-v2.pdf BibTex