Journal articles

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Thibaut Lurier, Marie-Anne Arcangioli. Letter to the Editor: Comment on the recent article titled “Diagnostic and economic evaluation of matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry with machine learning for screening of Johne's disease from dairy cow serum”. Journal of Dairy Science, 2026, 109 (3), pp.2069. ⟨10.3168/jds.2025-27813⟩. ⟨hal-05525454⟩

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Ambrine Arrar, Nour Mesto, Roxane Descaillot, Muris Humo, Aude de Cesar, et al.. Insulin resistance induced by pesticides is overcome by pancreatic islet adaptation in a mouse model of Parkinson’s disease. Molecular metabolism, 2026, 109, pp.102388. ⟨10.1016/j.molmet.2026.102388⟩. ⟨hal-05645636v2⟩

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Elissa Khamisse, Xavier Bertrand, Damien Bouchard, Lucie Collineau, Olivier Fortineau, et al.. Residual antimicrobials in food can select for antimicrobial resistance. The Lancet Microbe, 2026, 7 (3), pp.101302. ⟨10.1016/j.lanmic.2025.101302⟩. ⟨anses-05485961⟩

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Nunzio Sarnino, Subhasish Basak, Lucie Collineau, Roswitha Merle. Quantitative microbial risk assessment of extended‐spectrum β‐lactamase-producing Escherichia coli transfer from broiler litter to fresh lettuce consumption. Science in One Health, 2026, pp.100152. ⟨10.1016/j.soh.2026.100152⟩. ⟨anses-05527339⟩

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Lucie Collineau, Mélanie Colomb-Cotinat. L’approche une seule santé pour une action coordonnée contre l’antibiorésistance. Médecine/Sciences, 2026, 42 (2), pp.175-183. ⟨10.1051/medsci/2026015⟩. ⟨anses-05535962⟩

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Tony Rochegüe, Sandrine Hughes, Estelle Saras, Benjamin Gillet, Antoine Drapeau, et al.. Integrative and conjugative elements carrying high-level gentamicin resistance genes in Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis from horses. Microbial Genomics, 2026, 12 (5), pp.001722. ⟨10.1099/mgen.0.001722⟩. ⟨anses-05641817⟩

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Morgane Moustaghfir, Bernadette Espana, Karine Hauray, Rémi Charretier, Abdessalem Hammed, et al.. Pharmacokinetics Study and Modelling of Amoxicillin After Intramuscular Administration in Veal Calves Suffering From Omphalitis. Journal of Veterinary Pharmacology and Therapeutics, 2026, 49 (1), pp.33-43. ⟨10.1111/jvp.70016⟩. ⟨hal-05218356⟩

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Nathan Soleau, Maxime Bruto, Sarah Ganet, Stéphane Bonacorsi, Aurélie Cointe, et al.. Pathogenic potential and phylogenomic analysis of stx2-carrying O26:H11 Shiga toxin-producing Escherichia coli isolated from dairy products in France (2014–2024). Microbial Genomics, 2026, 12 (2), ⟨10.1099/mgen.0.001647⟩. ⟨hal-05577919⟩

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Mattia Pirolo, Manal Abuoun, Nicholas Duggett, Marisa Haenni, Mikaela K Fritz, et al.. Cross-species and cross-border spread of aph(3′)-ia -mediated neomycin resistance in Escherichia coli from animals: a genomic perspective. Journal of Antimicrobial Chemotherapy, 2026, 81 (5), ⟨10.1093/jac/dkag143⟩. ⟨anses-05597076⟩

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Antonia Virginia Francisco Pedro, Lucía Manso-Silván, Thibaut Lurier, Maria Luisa Catombela, Armelle Peyraud, et al.. Seroprevalence and potential risk factors of contagious bovine pleuropneumonia in the Huambo province of Angola. Scientific Reports, 2026, 16, pp.17652. ⟨10.1038/s41598-026-46690-9⟩. ⟨hal-05590184v2⟩

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Mohammed Mahdi Mousa Al-Barrakee, Ahlem Mahjoub, Pauline François, Véronique Métayer, Antoine Drapeau, et al.. Pseudomonas aeruginosa isolates from diabetic foot ulcers in Al-Najaf, Iraq: Circulation of high-risk clones and carbapenem resistance. IJID Regions, 2026, 18, pp.100862. ⟨10.1016/j.ijregi.2026.100862⟩. ⟨anses-05561586⟩

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Ehsan Adnan Hashim, Meriem Souguir, Véronique Métayer, Antoine Drapeau, Sana Azaiez, et al.. Global threats in local wards: Dissemination of high-risk clones resistant to last-generation cephalosporins and carbapenems in Iraqi hospitals. IJID Regions, 2026, 18, pp.100852. ⟨10.1016/j.ijregi.2026.100852⟩. ⟨anses-05527970⟩

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Norman Daurelle, Sylvie Dallot, Virginie Ravigné, Olivier Cotto, Gaël Thébaud, et al.. Evaluation of a Plant Disease Surveillance System Using the Animal-Health OASIS Method: Application to Sharka in France. Plant Disease, 2026, 110 (1), pp.71-78. ⟨10.1094/PDIS-02-25-0238-SR⟩. ⟨anses-05512285⟩

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Aurélie Lotoux, Matthieu Bertrand, Pierre-Emmanuel Douarre, Mounia Kortebi, Hélène Riveiro, et al.. Large-scale phenotyping and comparative genomics reveal genetic features of Listeria persistence in epithelial cells. PLoS Pathogens, 2026, 22 (4), pp.e1013323. ⟨10.1371/journal.ppat.1013323⟩. ⟨hal-05605012⟩

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Journal articles

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Rachel Contarin, Séverine Murri, Antoine Drapeau, Tom Cayssials, Jean-Yves Madec, et al.. Comprehensive genomic analysis of antibiotic resistance plasmids in animal-associated Staphylococcus aureus in France. Microbiology Spectrum, 2025, 13 (10), ⟨10.1128/spectrum.00772-25⟩. ⟨anses-05316144⟩

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Subhasish Basak, Nunzio Sarnino, Roswitha Merle, Lucie Collineau. Quantification of the risk of Extended-Spectrum Beta-Lactamase producing Escherichia coli colonization in humans through occupational exposure in broiler production. Microbial Risk Analysis, 2025, 30, pp.100349. ⟨10.1016/j.mran.2025.100349⟩. ⟨anses-05219564⟩

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Marisa Haenni, Pierre Châtre, Racha Beyrouthy, Antoine Drapeau, Pauline François, et al.. No genetic link between E. coli isolates carrying mcr-1 in bovines and humans in France. Journal of Global Antimicrobial Resistance, 2025, 41, pp.111-116. ⟨10.1016/j.jgar.2024.12.021⟩. ⟨anses-04894989⟩

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Maxime Bruto, Maryne Jaÿ, Stéphanie Lefebvre, Florine Dieu, Marc Saulmont, et al.. Emergence and rapid propagation of ST4 Mycoplasma bovis subtype in France and Belgium. Veterinary Journal, 2025, 314, pp.106437. ⟨10.1016/j.tvjl.2025.106437⟩. ⟨anses-05523753⟩

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Sandra Martínez-Álvarez, Ursula Höfle, Pierre Châtre, Carla Andrea Alonso, María Ángeles Asencio-Egea, et al.. One Health bottom-up analysis of the dissemination pathways concerning critical priority carbapenemase- and ESBL-producing Enterobacterales from storks and beyond. Journal of Antimicrobial Chemotherapy, 2025, 80 (1), pp.68-78. ⟨10.1093/jac/dkae371⟩. ⟨anses-04869228⟩

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Sandra Martínez-Álvarez, Pierre Châtre, Pauline François, Myriam Zarazaga, Jean-Yves Madec, et al.. Comparative phylogenomics of extended-spectrum beta-lactamase-producing Escherichia coli revealed a wide diversity of clones and plasmids in Spanish chicken meat. International Journal of Food Microbiology, 2025, 426, pp.110900. ⟨10.1016/j.ijfoodmicro.2024.110900⟩. ⟨anses-04704434⟩

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Géraldine Cazeau, Briac Virey, Carole Sala, Renaud Lailler, Adeline Huneau-Salaün, et al.. Is a syndromic approach well suited to foodborne disease surveillance? Implication for salmonellosis surveillance and prevention in France from a “One Health” perspective. Preventive Veterinary Medicine, 2025, 236, pp.106422. ⟨10.1016/j.prevetmed.2025.106422⟩. ⟨anses-04926121⟩

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Lilian Bruyère-Ostells, Jérémy Verchère, Dominique Bétemps, Florian Almela, Thierry Baron, et al.. Subclinical detection of misfolded alpha-synuclein in the blood of M83 mice. Acta Neuropathologica, 2025, 150 (1), pp.2. ⟨10.1007/s00401-025-02909-z⟩. ⟨anses-05221652⟩

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Maïssane Chikh, David Ngwa-Mbot, Eric Morignat, Sophie Memeteau, Jean-Philippe Amat. OASIS evaluation of the French laboratory diagnostic surveillance system: right people, right techniques but imperfect use. Frontiers in Veterinary Science, 2025, 12, pp.1419034. ⟨10.3389/fvets.2025.1419034⟩. ⟨anses-05265149⟩

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Nadia Jaidane, Wejdene Mansour, Lamia Tilouche, Pierre Châtre, Pauline François, et al.. OXA-204 Carbapenemase in Clinical Isolate of Pseudomonas guariconensis, Tunisia. Emerging Infectious Diseases, 2025, 31 (6), ⟨10.3201/eid3106.250131⟩. ⟨anses-05094097⟩

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Mélanie Colomb-Cotinat, Lucie Collineau. Surveillance de l’antibiorésistance à l’ère One Health : systèmes et synergies entre santé humaine, santé animale et environnement. La Lettre de l'Infectiologue, 2025, 6 (XL), pp.214-242. ⟨anses-05528327⟩

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Giffona Loysell Justinia Hanitravelo, Guillaume Lhermie, Diego Manriquez, Viviane Hénaux, Benoit Durand, et al.. Cost-effectiveness assessment of alternative surveillance measures for bovine tuberculosis using stochastic modeling simulation. Preventive Veterinary Medicine, 2025, 237, pp.106443. ⟨10.1016/j.prevetmed.2025.106443⟩. ⟨anses-04938845⟩

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Kristýna Brodíková, Thibault Destanque, Marisa Haenni, Renáta Karpíšková. Clonal Complex 398 Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus Producing Panton-Valentine Leukocidin, Czech Republic, 2023. Emerging Infectious Diseases, 2025, 31 (1), pp.174-177. ⟨10.3201/eid3101.241323⟩. ⟨anses-04859059⟩

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Anna Bencsik, Emmanuelle Chiffoleau. Laboratoire durable : plastique responsable, saurons-nous relever le défi. Revue Française d'Histotechnologie, 2025, 37 (1), pp.205-219. ⟨10.25830/afh.rfh.2025.37.1.205⟩. ⟨anses-05129641⟩

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Nicolas Desneux, Andrea Battisti, Anne-Sophie Brinquin, Rudy Caparros-Megido, Gilbert Gault, et al.. Opinion and report of the French Agency for Food, Environmental and Occupational Health and Safety (ANSES) relating to an analysis of the health risks associated with exposure to caterpillars with stinging hairs and the development of management recommendations. Food Risk Assess Europe, 2025, 3, pp.0060E. ⟨10.2903/fr.efsa.2025.FR-0060⟩. ⟨hal-05429126⟩

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Séverine Fontaine-Laboureur. Eclairage sur les travaux de l'Anses et de l'ITB concernant la résistance de la cercosporiose. Betteravier Français, 2025, 1202, pp.22-23. ⟨anses-05128027⟩

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Maryne Jaÿ, Sara Klose, Marco Bottinelli, Tiina Autio, Claire A.M. Becker, et al.. Advancing standardization of diagnostics and antimicrobial susceptibility testing for pathogenic mycoplasmas of livestock origin: insights from the MyMIC network. BMC Veterinary Research, 2025, 21 (1), pp.712. ⟨10.1186/s12917-025-05154-4⟩. ⟨anses-05465628⟩

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Jean-Baptiste Maison, Fleur Boulet, Claire A.M. Becker, Mathieu Magnin. Thrombose aortique et thromboembolie chez les bovins. Le Point vétérinaire, 2025, 56 (470), pp.84-88. ⟨hal-05305305⟩

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Kinga M. Sulyok, Zsuzsa Kreizinger, Dorottya Földi, Áron Botond Kovács, Dénes Grózner, et al.. Molecular detection of antimicrobial resistance in livestock mycoplasmas: Current status and future prospects. Frontiers in Veterinary Science, 2025, 12, pp.1699077. ⟨10.3389/fvets.2025.1699077⟩. ⟨hal-05470804⟩

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Nunzio Sarnino, Subhasish Basak, Lucie Collineau, Roswitha Merle. Recreational Water Risk from Extended-Spectrum Beta-Lactamase-Producing Escherichia coli of Broiler Origin: A Quantitative Microbial Risk Assessment. Environments, 2025, 12 (12), pp.403. ⟨10.3390/environments12110403⟩. ⟨anses-05354045⟩

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Johann Vulin, Fabien Chauveau, Chloé Duret, Muris Humo, Marco Valdebenito, et al.. Behavioural, biochemical and functional phenotyping of subchronic exposure to chlordecone in mice. NeuroToxicology, 2025, 111, pp.103334. ⟨10.1016/j.neuro.2025.103334⟩. ⟨anses-05327793⟩

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Nadia Jaidane, Thierry Naas, Sameh Boughattas, Laetitia Du Fraysseix, Lamia Tilouche, et al.. Occurrence of mcr-1.1-producing Escherichia coli in clinical settings in Tunisia. Journal of Global Antimicrobial Resistance, 2025, 44, pp.149 - 151. ⟨10.1016/j.jgar.2025.06.011⟩. ⟨anses-05166544⟩

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Jana Inäbnit, Thomas Démoulins, Paraskevi Pramateftaki, Marilou Bourgeon, Fabien Labroussaa, et al.. A versatile plug and play bacterial chassis based on a fast-growing Mycoplasma species. Nucleic Acids Research, 2025, 53 (20), pp.gkaf1134. ⟨10.1093/nar/gkaf1134⟩. ⟨anses-05528321⟩

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Lucie Collineau, Soukaina Ait Ali, Servane Bareille, Claire Chauvin, Marisa Haenni, et al.. Evaluating the impact of a 10 year reduction in critically important antibiotic use on the occurrence of antibiotic resistance in E. coli from cattle, dogs and cats in France. JAC-Antimicrobial Resistance, 2025, 7 (6), pp.1-8. ⟨10.1093/jacamr/dlaf207⟩. ⟨anses-05387624⟩

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Imen Hmidi, Meriem Souguir, Véronique Métayer, Antoine Drapeau, Pauline François, et al.. Characterization of Enterobacterales Resistant to Extended-Spectrum Cephalosporins Isolated from Meat in Tunisia. Journal of Food Protection, 2025, 88 (11), pp.100610. ⟨10.1016/j.jfp.2025.100610⟩. ⟨anses-05288013⟩

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Leila Hamze, Estelle Saras, Sana Azaiez, Wejdene Mansour, Jean-Yves Madec, et al.. Susceptibility of Acinetobacter baumannii isolates from different sources to biocides: a matter of biofilm. Antimicrobial Resistance and Infection Control, 2025, 14 (1), pp.147. ⟨10.1186/s13756-025-01658-8⟩. ⟨anses-05391172⟩

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Tristan Berger, Sonja Boland, Emmanuel Flahaut, Corinne Chanéac, Anna Bencsik. Towards a nuanced application of the established hierarchy integrating specific adaptations to nanomaterial risk management: comment on the article by Omari Shekaftik et al. (J Nanopart Res (2023) 25, 245) regarding an analysis of “hierarchy of controls” in workplaces and laboratories involving nanomaterials. Journal of Nanoparticle Research, 2025, 27 (11), pp.279. ⟨10.1007/S11051-025-06473-1⟩. ⟨hal-05329038⟩

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Marisa Haenni, Pierre Châtre, Antoine Drapeau, Géraldine Cazeau, Jonathan Troncy, et al.. Distinct molecular epidemiology of resistances to extended-spectrum cephalosporins and carbapenems in Enterobacter hormaechei in cats and dogs versus horses in France. Journal of Antimicrobial Chemotherapy, 2025, 80 (2), pp.567-575. ⟨10.1093/jac/dkae448⟩. ⟨anses-04926358⟩

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Philippe Gourlay, Caroline Lefrère, Julie Botman, Dianjara Rakotoharisoa, Nadine Brisseau, et al.. Epidemiological and Clinical Profile of Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus (MRSA) Infections in European Hedgehogs (Erinaceus europaeus) Treated at a Wildlife Health Center in Northwestern France. Journal of wildlife diseases, 2025, 61 (2), pp.308-319. ⟨10.7589/JWD-D-24-00128⟩. ⟨anses-05074345⟩

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Manon Vastel, Patrice Gaurivaud, Florence Tardy, Anne V. Gautier-Bouchardon. Standardized analysis of nuclease activities in Mycoplasma species colonizing swine, poultry, and small ruminants. FEMS Microbiology Letters, 2025, 372, pp.fnaf057. ⟨10.1093/femsle/fnaf057⟩. ⟨anses-05129486⟩

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A. Bencsik, Nathalie Accart. L’histologie se met au parfum de l’olfaction ou comment les odeurs nous font parfois tourner la tête. Revue Française d'Histotechnologie, 2025, 37 (1), pp.13-31. ⟨anses-05129599⟩

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Sergio Gabriel Olvera-Vazquez, Xilong Chen, Aurélie Mesnil, Camille Meslin, Fabricio Almeida-Silva, et al.. Comprehensive annotation of olfactory and gustatory receptor genes and transposable elements revealed their evolutionary dynamics in aphids. Molecular Biology and Evolution, 2025, 42 (12), pp.msaf238. ⟨10.1093/molbev/msaf238⟩. ⟨anses-05299488⟩

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Julie Teresa Shapiro, Géraldine Cazeau, Romane Dibiagio, Céline Dupuy, Eric Morignat, et al.. Current practice and future directions in syndromic surveillance for animal health: A scoping review and analysis. Preventive Veterinary Medicine, 2025, 241, pp.106532. ⟨10.1016/j.prevetmed.2025.106532⟩. ⟨anses-05061802⟩

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Antonella Migliaccio, Thibault Destanque, Marisa Haenni, Jean-Yves Madec, Keith A Jolley, et al.. Genomic and phenotypic analysis of ST25 A. baumannii identifies virulence-associated clades and capsular/outer core locus types. MSphere, 2025, 11 (1), ⟨10.1128/msphere.00717-25⟩. ⟨anses-05494622⟩

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Léna Sleiman, Christelle Elias, Pierre Cassier, Jean-Yves Madec, Marisa Haenni, et al.. Carbapenemase-producing Enterobacterales in the hospital water environment: a narrative review. Clinical Microbiology and Infection, 2025, ⟨10.1016/j.cmi.2025.12.008⟩. ⟨anses-05471637⟩

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Morgane Moustaghfir, Thibault Destanque, Pauline François, Pierre Châtre, Vanessa Louzier, et al.. Changes in fecal microbiota after therapeutic exposure to amoxicillin-clavulanic acid in veal calves receiving multiple antibiotics. Microbiology Spectrum, 2025, 13 (12), pp.e0131625. ⟨10.1128/spectrum.01316-25⟩. ⟨anses-05422125⟩

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Elissa Khamisse, Xavier Bertrand, Damien Bouchard, Lucie Collineau, Olivier Fortineau, et al.. Rethinking the role of animals in antimicrobial resistance. The Lancet Microbe, 2025, 29 (1), pp.101248. ⟨10.1016/j.lanmic.2025.101248⟩. ⟨anses-05298875⟩

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Domenic Burger, Marianna Kashyrina, Lukas van den Heuvel, Hortense de la Seiglière, Amanda J Lewis, et al.. Synthetic α-synuclein fibrils replicate in mice causing MSA-like pathology. Nature, 2025, ⟨10.1038/s41586-025-09698-1⟩. ⟨hal-05356048⟩

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Sofia Mlala, Sébastien Picault, Carole Sala, Pierre Villard, Jean-Luc Vinard, et al.. Assessing the efficiency of the bovine brucellosis surveillance-control system in a disease-free context through agent-based modelling. Veterinary Research, 2025, 56 (1), pp.120. ⟨10.1186/s13567-025-01549-1⟩. ⟨hal-05118048⟩

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Corentin Blanchais, Carine Pages, Manuel Campos, Kenza Boubekeur, Rachel Contarin, et al.. Interplay between the Xer recombination system and the dissemination of antibioresistance in Acinetobacter baumannii. Nucleic Acids Research, 2025, 53 (1), ⟨10.1093/nar/gkae1255⟩. ⟨hal-04888847⟩

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Marisa Haenni, Séverine Murri, Antoine Drapeau, Iarimino Rafidinarivo, Stéphanie Gilles, et al.. Emergence of MRSA ST612 in horses and of MSSA CC398 in cats in France. Journal of Antimicrobial Chemotherapy, 2025, ⟨10.1093/jac/dkaf027⟩. ⟨hal-04974631⟩

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Viviane Hénaux, Laurent Cloastre, Barbara Dufour, Benoit Durand, Luca Freddi, et al.. La France métropolitaine a conservé son statut indemne de brucellose des petits ruminants en 2023 et 2024. Bulletin Epidémiologique, 2025, 106 (7), pp.1-9. ⟨anses-05535898⟩

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Marlène Roy, Sandra Lacôte, Sophie Desloire, Adrien Thiesson, Coralie Pulido, et al.. Two strains of Toscana virus show different virulence and replication capacity in mice and cell culture models. Virulence, 2025, 16 (1), pp.2535470. ⟨10.1080/21505594.2025.2535470⟩. ⟨hal-05177310⟩

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Claire Chauvin, Eric Jouy, Anne Chevance, Corinne Jaureguy, Xavier Sauzea, et al.. Decrease in colistin resistance among young bovine and pig productions in France: relationship with colistin usage and stewardship measures. Journal of Antimicrobial Chemotherapy, 2025, 80 (12), pp.3227-3235. ⟨10.1093/jac/dkaf322⟩. ⟨anses-05333428⟩

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Sandra Martínez-Álvarez, Susana Sanz, Pierre Châtre, María de Toro, Carmen Olarte, et al.. Interplay between bacterial clones and plasmids in the spread of blaSHV-12- and blaCTX-M-14-carrying Escherichia coli from the livestock environment. One Health, 2025, 20, pp.101058. ⟨10.1016/j.onehlt.2025.101058⟩. ⟨anses-05130362⟩

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Jean-Baptiste Maison, Fleur Boulet, Claire A.M. Becker, Mathieu Magnin. Thrombose et thromboembolie aortiques chez deux veaux. Le Point vétérinaire, 2025, 56 (470), pp.74-79. ⟨hal-05305182⟩

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Lucie Collineau. Épidémiologie de la résistance aux antibiotiques chez l’animal. Bulletin de l'Académie Vétérinaire de France, 2025, 178, ⟨10.3406/bavf.2025.71142⟩. ⟨anses-05302287⟩

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Nunzio Sarnino, Subhasish Basak, Lucie Collineau, Roswitha Merle. Pathways of Escherichia coli transfer from animal manure: risks and mitigation in agriculture. Frontiers in Public Health, 2025, 13, ⟨10.3389/fpubh.2025.1568621⟩. ⟨anses-05107415⟩

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Géraldine Cazeau, Benjamin Matt, Sophia Denorre, Thierry Baron, Jean-Philippe Amat. Bilan 2024 de la surveillance des encéphalopathies spongiformes des petits ruminants en France : aucun cas de tremblante classique détecté et quatre cas de tremblante atypique. Bulletin Epidémiologique, 2025, 106 (1), pp.1-6. ⟨anses-05535850⟩

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Fabienne Archer, Alexandra Erny, Cyrielle Nanquette, Sandra Lacôte, Patrice Gaurivaud, et al.. Modeling mycoplasma infections: insights from Air-Liquid Interface cultures of primary bronchial epithelial cells. Microbial Pathogenesis, 2025, 209, pp.108081. ⟨10.1016/j.micpath.2025.108081⟩. ⟨hal-05320279⟩

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