Publications HAL du labo/EPI 122678

2024

Journal articles

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Sandra Martínez-Álvarez, Pierre Châtre, Pauline François, Idris Nasir Abdullahi, Carmen Simón, et al.. Unexpected role of pig nostrils in the clonal and plasmidic dissemination of extended-spectrum beta-lactamase-producing Escherichia coli at farm level. Ecotoxicology and Environmental Safety, 2024, 273, pp.116145. ⟨10.1016/j.ecoenv.2024.116145⟩. ⟨anses-04496957⟩
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Sana Ncir, Marisa Haenni, Pierre Châtre, Antoine Drapeau, Pauline François, et al.. Occurrence and persistence of multidrug-resistant Enterobacterales isolated from urban, industrial and surface water in Monastir, Tunisia. Science of the Total Environment, 2024, 926, pp.171562. ⟨10.1016/j.scitotenv.2024.171562⟩. ⟨anses-04531709⟩
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Roland Nankam Chimi, Sami Zidane, Thibaut Lurier, Marie-Anne Arcangioli. Hyperthermie et diarrhée intermittentes avec amaigrissement progressif chez une vache charolaise. Le Nouveau Praticien Vétérinaire. Elevages et Santé, 2024, 15 (53), pp.46-50. ⟨10.1051/npvelsa/2024006⟩. ⟨hal-04549590⟩
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Pauline Lavainne, Charlotte Rüger, Jean-Philippe Amat, Viviane Hénaux, Eric Morignat, et al.. Estimation de la date présumée d’une mortalité massive aigue d’abeilles à partir de la masse d’un échantillon de cadavres d’abeilles adultes : étude pilote. Bulletin épidémiologique, 2024, 101 (4), pp.1-9. ⟨anses-04598740⟩
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https://anses.hal.science/anses-04598740/file/Lavainne%20Pauline%202024%20Estimation%20de%20la%20date%20pr%C3%A9sum%C3%A9e%20d%E2%80%99une%20mortalit%C3%A9%20massive%20aigue%20d%E2%80%99abeilles.pdf BibTex
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Sébastien Duperron, Sébastien Halary, Jean-Pierre Bouly, Théotime Roussel, Mylène Hugoni, et al.. Transcriptomic insights into the dominance of two phototrophs throughout the water column of a tropical hypersaline-alkaline crater lake (Dziani Dzaha, Mayotte). Frontiers in Microbiology, 2024, 15, ⟨10.3389/fmicb.2024.1368523⟩. ⟨mnhn-04570592⟩
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Marwan Osman, Iman Yassine, Monzer Hamze, Hiba Al Mir, Anahita Ghorbani Tajani, et al.. Emergence of Extended-Spectrum Cephalosporin- and Colistin-Resistant Enterobacterales in Otherwise Healthy University Students. Microbial Drug Resistance, 2024, 30 (2), pp.101-107. ⟨10.1089/mdr.2023.0213⟩. ⟨anses-04456447⟩
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Sébastien Duperron, Sébastien Halary, Jean-Pierre Bouly, Théotime Roussel, Myléne Hugoni, et al.. Transcriptomic insights into the dominance of two phototrophs throughout the water column of a tropical hypersaline-alkaline crater lake (Dziani Dzaha, Mayotte). Frontiers in Microbiology, 2024, 15, pp.1368523. ⟨10.3389/fmicb.2024.1368523⟩. ⟨hal-04582518⟩
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Lucie Collineau, Léo Rousset, Mélanie Colomb-Cotinat, Marion Bordier, Clémence Bourely. Moving towards One Health surveillance of antibiotic resistance in France: a semi-quantitative evaluation of the level of collaboration within the national surveillance system. JAC-Antimicrobial Resistance, 2024, 6 (1), pp.dlae008. ⟨10.1093/jacamr/dlae008⟩. ⟨anses-04473385⟩
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Lucien J M van Keulen, Corry H Dolstra, Ruth Bossers‐de Vries, Alex Bossers, Jorg G Jacobs, et al.. Change in the molecular properties of CH1641 prions after transmission to wild‐type mice: Evidence for a single strain. Neuropathology and Applied Neurobiology, 2024, 50 (1), ⟨10.1111/nan.12963⟩. ⟨anses-04459932⟩
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Henok Ayalew Tegegne, Frederick T A Freeth, Carlijn Bogaardt, Emma Taylor, Johana Reinhardt, et al.. Implementation of One Health surveillance systems: Opportunities and challenges - lessons learned from the OH-EpiCap application. One Health, 2024, 18, pp.100704. ⟨10.1016/j.onehlt.2024.100704⟩. ⟨anses-04526720⟩
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https://anses.hal.science/anses-04526720/file/Tegegne%20%20Henok%202024%20Implementation%20of%20One%20Health%20surveillance%20systems%20Opportunities%20and%20challenges%20-%20lessons%20learned%20from%20the%20OH-EpiCap%20application.pdf BibTex
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Mlala Sofia, François Dedieu, Viviane Hénaux, Didier Calavas. Comment l’organisation des acteurs locaux influence-t-elle la surveillance sanitaire ? Modèle pro-curatif vs. modèle pro-préventif. Bulletin épidémiologique, 2024, 101, pp.Article 3. ⟨anses-04598671⟩
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Demetris Taliadoros, Alice Feurtey, Nathan Wyatt, Benoit Barrès, Pierre Gladieux, et al.. Emergence and spread of the barley net blotch pathogen coincided with crop domestication and cultivation history. PLoS Genetics, 2024, 20 (1), pp.e1010884. ⟨10.1371/journal.pgen.1010884⟩. ⟨hal-04532805⟩
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Roxana Zamudio, Patrick Boerlin, Michael R Mulvey, Marisa Haenni, Racha Beyrouthy, et al.. Global transmission of extended-spectrum cephalosporin resistance in Escherichia coli driven by epidemic plasmids. EBioMedicine, 2024, 103, pp.105097. ⟨10.1016/j.ebiom.2024.105097⟩. ⟨anses-04543102⟩
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Conference papers

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Eric Morignat, Chikh Maïssane, David Ngwa-Mbot, Jean-Philippe Amat. Réactosurveillance : premiers pas vers une analyse en temps réel des données Sigal – IBR. Journée nationale de la référence professionnelle, Feb 2024, Maisons-Alfort, France, France. ⟨anses-04477567⟩
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T. Lurier, Elodie Rousset, Patrick Gasqui, Carole Sala, Eric Morignat, et al.. Evaluation using latent class models of the diagnostic performances of three ELISA tests commercialized for the serological diagnosis of Coxiella burnetii infection in domestic ruminants.. SBED Conference 2024: Insights in Action, SBED: Society for Bayesian Methods in Epidemiology and Diagnostics, Jan 2024, Bruxelles, Belgium. ⟨hal-04513134⟩
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Séverine Fontaine. Etats des lieux des résistances chez Cercospora beticola vis-à-vis des Strobilurines et des Triazoles. JER - Journées d’Echanges sur les Résistances aux produits de protection des plantes, JER, Feb 2024, Villeurbanne, Rhône, France. ⟨anses-04459663⟩
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Christophe Plantamp. Méthodologie : Détection, suivi et quantification de la résistance aux PPP. JER - Journées d’Échanges sur les Résistances aux Produits de Protection des Plantes, R4P, Feb 2024, Villeurbanne - Rhône, France. ⟨anses-04513162⟩
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Sandra Martínez-Álvarez, Ursula Höfle, Pierre Châtre, Carla Andrea Alonso, Pauline François, et al.. Surveillance of ESBL-producing and carbapenem-resistant Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae from white storks. 34th European Congress of Clinical Microbiology & Infectious Diseases, ESCMID, Apr 2024, Barcelona, Spain. ⟨anses-04564976⟩
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Moura Pedro, Lucie Collineau, Marianne Sandberg, Laura Tomassone, Daniele de Meneghi, et al.. Users’ perception of the OH-EpiCap evaluation tool based on its application to nine national antimicrobial resistance and antimicrobial usage surveillance systems. International One H Symposium (ONEH2024), Jun 2024, Saint Brieuc, France. ⟨anses-04609637⟩
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T. Lurier, María-Laura Boschiroli, Kristel Gache, Carole Forfait-Dubuc, Sophie Carles, et al.. Estimation of the variability of the specificity of gamma interferon tests used for bovine tuberculosis surveillance in France. SBED Conference 2024: Insights in Action, SBED: Society for Bayesian Methods in Epidemiology and Diagnostics, Jan 2024, Bruxelles, Belgium. ⟨hal-04513113⟩
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Lucie Collineau, Laurence Lacmago, Yohann Lacotte, Benoit Lange, Olivier Lemenand, et al.. Towards integrated surveillance of antibioic resistance in France. A first analysis of surveillance data in a One Health perspective. International One H Symposium (ONEH2024), Innôzh; Anses; Labocéa, Jun 2024, Saint Brieuc, France. ⟨anses-04619942⟩
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Christophe Plantamp. Résistance aux insecticides chez les pucerons ravageurs des cultures. JER - Journées d’Échanges sur les Résistances aux Produits de Protection des Plantes, R4P, Feb 2024, Villeurbanne - Rhône, France. ⟨anses-04513152⟩
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Lucie Collineau, Léo Rousset, Mélanie Colomb-Cotinat, Marion Bordier, Clémence Bourély. Moving towards One Health surveillance of antimicrobial resistance in France - A mixed approach to evaluate cross-sectoral collaboration and associated drivers and barriers. International One H Symposium (ONEH2024), Innôzh; Anses; Labocéa, Jun 2024, Saint Brieuc, France. ⟨anses-04608665⟩
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Poster communications

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Meriem Mtibaa, Ahlem Mahjoub, Maha Dardouri, Sana Azaiez, Jean Yves Madec, et al.. Therapeutic alternative to the use of antibiotics in chicken farming: What about detection of ESBL Escherichia coli. 34th European Congress of Clinical Microbiology & Infectious Diseases, Apr 2024, Barcelona, Spain. 2024. ⟨anses-04564974⟩
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Marisa Haenni, Séverine Murri, Iarimino Rafiinarivo, Pauline François, Jean Yves Madec. MRSA and MSSA ST398 in French companion animals : a One Health concern. 34th European Congress of Clinical Microbiology & Infectious Diseases, Apr 2024, Barcelona, Spain. 2024. ⟨anses-04564967⟩
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Sandra A Martínez-Álvarez, Pierre Châtre, Pauline François, Idris Nasir Abdullahi, Carmen Simón, et al.. Analysis of plasmid-mediated ESBL production and colistin resistance in Escherichia coli from pig nostrils: a new reservoir of concern?. 34th European Congress of Clinical Microbiology & Infectious Diseases, Apr 2024, Barcelana, Spain. 2024, ⟨10.13039/501100011033⟩. ⟨anses-04564965⟩
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Lucie Collineau, Charlotte Valat, Anouk Rioual, Anne Margrete Urdahl, Camilla Sekse. SOA8 – WGS surveillance of animal pathogens and AMR (SPAMR-VET) –ST2.1, ST2.2. European Partnership on Animal Health and Welfare Scientific Workshop (EUPAHW), Jun 2024, Thessalonique, Greece. Poster. ⟨anses-04600896⟩
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Sana Ncir, Marisa Haenni, Pierre Châtre, Antoine Drapeau, Pauline François, et al.. Occurrence and persistence of multi-drug resistant Enterobacterales isolated from urban, industrial and surface water in Monastir. 34th European Congress of Clinical Microbiology & Infectious Diseases, Apr 2024, Barcelona, Spain. 2024. ⟨anses-04564971⟩
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Matthieu Martineau, Eléna Kokabi, Anis Taiebi, Stephanie Lefebvre, Sophie Pradier, et al.. Etude épidémiologique des mycoplasmes dans les affections respiratoires équines. Journées sciences et innovations équines, May 2024, Saumur, France. ⟨hal-04607289⟩
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Collineau Lucie, Colomb-Cotinat Mélanie, Amat Jean-Philippe, Elodie Brelot, Arnaud Friggeri, et al.. A One Health Observatory of antimicrobial resistance in metropolitan Lyon. Journée annuelle du réseau Shape-Med@Lyon, May 2024, Villeurbanne, France. pp.Poster. ⟨anses-04587106⟩
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Reports

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Laurent Gentzbittel, Marie-Laure Desprez-Loustau, Florence Fontaine, Ivan Sache, Didier Tharreau, et al.. Stratégies de lutte vis-à-vis du chancre coloré du platane (Ceratocystis platani). Saisine n°2020-SA-0073, 2024, 124 p. ⟨anses-04616853⟩
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Preprints, Working Papers, ...

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Mehdi Chabert, Sandra Lacôte, Philippe Marianneau, Marie-Pierre Confort, Noémie Aurine, et al.. Comparative study of two Rift Valley fever virus field strains circulating in Mauritania in 2010 and 2013 reveals the high virulence of the MRU25010-30 strain isolated from camel. 2024. ⟨hal-04569435⟩
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2023

Journal articles

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Amy K Hahs, Bertrand Fournier, Myla F J Aronson, Charles H Nilon, Adriana Herrera-Montes, et al.. Urbanisation generates multiple trait syndromes for terrestrial animal taxa worldwide. Nature Communications, 2023, 14 (1), pp.4751. ⟨10.1038/s41467-023-39746-1⟩. ⟨anses-04404901⟩
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Jacques Devos, Claire A.M. Becker, Hadjila Yanes, Jocelyn Turpin, Francois Schelcher, et al.. La tumeur nasale enzootique des caprins : une maladie méconnue. Bulletin des G.T.V., 2023, 110, pp.71-75. ⟨hal-04146227⟩
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https://vetagro-sup.hal.science/hal-04146227/file/BULL_GTV_2023_TUMEUR_NASALE_ENTV-preprint.pdf BibTex
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Julie Teresa Shapiro, Alvah Zorea, Aya Brown Kav, Vicente J Ontiveros, Itzhak Mizrahi, et al.. Multilayer networks of plasmid genetic similarity reveal potential pathways of gene transmission. The International Society of Microbiologial Ecology Journal, 2023, 17 (5), pp.649 - 659. ⟨10.1038/s41396-023-01373-5⟩. ⟨anses-04404809⟩
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Nada Elgriw, Véronique Métayer, Antoine Drapeau, Pauline François, Sana Azaiez, et al.. Clonal, Plasmidic and Genetic Diversity of Multi-Drug-Resistant Enterobacterales from Hospitalized Patients in Tripoli, Libya. Antibiotics, 2023, 12 (9), pp.1430. ⟨10.3390/antibiotics12091430⟩. ⟨anses-04218141⟩
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https://anses.hal.science/anses-04218141/file/Elgriw_KpCarbaLibya_Antibiotics2023.pdf BibTex
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Meriem Souguir, Pierre Châtre, Antoine Drapeau, Pauline François, Sana Azaiez, et al.. Molecular characterization of highly prevalent Escherichia coli and Escherichia marmotae resistant to extended-spectrum cephalosporins in European starlings ( Sturnus vulgaris ) in Tunisia. Microbiology Spectrum, 2023, 11 (5), pp.e0222023. ⟨10.1128/spectrum.02220-23⟩. ⟨anses-04261113⟩
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Meriem Souguir, Pierre Châtre, Antoine Drapeau, Sana Azaiez, Imen Hmidi, et al.. CTX-M-15/27-positive Escherichia coli and VIM-2-producing Pseudomonas putida in free-living pigeons (Columba livia) in Tunisia. Journal of Global Antimicrobial Resistance, 2023, 36, pp.70-75. ⟨10.1016/j.jgar.2023.12.013⟩. ⟨anses-04387345⟩
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Clémence Bourély, Léo Rousset, Mélanie Colomb-Cotinat, Lucie Collineau. How to move towards One Health surveillance? A qualitative study exploring the factors influencing collaborations between antimicrobial resistance surveillance programmes in France. Frontiers in Public Health, 2023, 11, pp.1123189. ⟨10.3389/fpubh.2023.1123189⟩. ⟨hal-04205938⟩
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Laura Amato, Guido Benedetti, Paola Di Giuseppe, Viviane Hénaux, Renaud Lailler, et al.. Mapping food surveillance chains through different sectors. Frontiers in Public Health, 2023, 11, pp.1129851. ⟨10.3389/fpubh.2023.1129851⟩. ⟨anses-04215424⟩
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A. Bencsik, Accart Nathalie. Anatomie des plantes et innovations technologiques en microscopie. Revue Française d'Histotechnologie, A paraître, 35 (1), pp.1-7. ⟨10.25830/afh.rfh.2023.35.1.15⟩. ⟨anses-04405172⟩
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Maxime Bruto, Philippe Oger, Patrice Got, Cécile Bernard, Delphine Melayah, et al.. Phytoplanktonic species in the haloalkaline Lake Dziani Dzaha select their archaeal microbiome. Molecular Ecology, 2023, 32 (24), pp.6824-6838. ⟨10.1111/mec.17179⟩. ⟨hal-04277813⟩
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Henok Ayalew Tegegne, Carlijn Bogaardt, Lucie Collineau, Géraldine Cazeau, Renaud Lailler, et al.. OH-EpiCap: a semi-quantitative tool for the evaluation of One Health epidemiological surveillance capacities and capabilities. Frontiers in Public Health, 2023, 11, ⟨10.3389/fpubh.2023.1053986⟩. ⟨hal-04128458⟩
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Matthieu Martineau, Elena Kokabi, Anis Taiebi, Stéphanie Lefebvre, Sophie Pradier, et al.. Epidemiology and pathogenicity of M. equirhinis in equine respiratory disorders. Veterinary Microbiology, 2023, 287, pp.109926. ⟨10.1016/j.vetmic.2023.109926⟩. ⟨hal-04314716⟩
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Sandy Duperier, Marie Grosdidier, Jean-Baptiste Louvet, Isabelle Pieretti, Anne Quillévéré-Hamard. Un pipeline de traitement d’informations issues du web pour anticiper les dangers en santé des plantes. Méthodologie développée par la Plateforme ESV dans le cadre de la " Veille Sanitaire Internationale".. NOV'AE, 2023, 11, pp.1-15. ⟨10.17180/novae-2023-NO-art11⟩. ⟨anses-04444448⟩
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Vincent Baby, Chloé Ambroset, Patrice Gaurivaud, Laurent Falquet, Christophe Boury, et al.. Comparative genomics of Mycoplasma feriruminatoris, a fast-growing pathogen of wild Caprinae. Microbial Genomics, 2023, 9 (10), ⟨10.1099/mgen.0.001112⟩. ⟨hal-04323203⟩
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Sana Azaiez, Marisa Haenni, Asma Ben Cheikh, Mohamed Sahbi Chalbi, Aziza Messaoudi, et al.. Healthcare Equipment and Personnel Reservoirs of Carbapenem-Resistant Acinetobacter baumannii Epidemic Clones in Intensive Care Units in a Tunisian Hospital. Microorganisms, 2023, 11 (11), pp.2637. ⟨10.3390/microorganisms11112637⟩. ⟨anses-04375836⟩
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Jean-Yves Madec. L’antibiorésistance, un enjeu transversal (One Health). La revue de l'infirmière, 2023, 72 (294), pp.24-26. ⟨10.1016/j.revinf.2023.08.006⟩. ⟨anses-04425637⟩
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Dominique Bétemps, Jean-Noël Arsac, Simon Nicot, Dominique Canal, Habiba Tlili, et al.. Protease-Sensitive and -Resistant Forms of Human and Murine Alpha-Synucleins in Distinct Brain Regions of Transgenic Mice (M83) Expressing the Human Mutated A53T Protein. Biomolecules, 2023, 13 (12), pp.1788. ⟨10.3390/biom13121788⟩. ⟨anses-04344903⟩
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Maud Belliard, Mannaïg de Kersauson, Emilie Delmar, Céline Dupuy, Caroline Lantuejoul, et al.. Bilan des déclarations de troubles de santé à l’Observatoire des Mortalités et des Affaiblissements de l’Abeille mellifère (2017-2021) et perspectives 2023. La Santé de l'Abeille, 2023, 318, pp.69-80. ⟨hal-04414353⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-04414353/file/Article%202_OMAA-Septembre%202023-Version%20finale-20230920%20version%20sant%C3%A9%20de%20l%27abeille.pdf BibTex
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Carole Forfait, María-Laura Boschiroli, Sophie Carles, Chaigneau Pauline, Barbara Dufour, et al.. Surveillance de la tuberculose due à Mycobacterium bovis en France métropolitaine pour la campagne 2019-2020 : résultats et indicateurs de fonctionnement. Bulletin épidémiologique, 2023, 97, pp.9. ⟨anses-04291131⟩
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Jean-Yves Madec. Développement de résistances chez les animaux alors que l’antibiotique ne leur a pas été administré. Comptes Rendus. Biologies, 2023, 346 (S1), pp.1 - 4. ⟨10.5802/crbiol.116⟩. ⟨anses-04425652⟩
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https://anses.hal.science/anses-04425652/file/CRBIOL_2023__346_S1_A6_0.pdf BibTex
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Marisa Haenni, Laetitia Du Fraysseix, Pauline François, Antoine Drapeau, Tristan Bralet, et al.. Occurrence of ESBL- and AmpC-Producing E. coli in French Griffon Vultures Feeding on Extensive Livestock Carcasses. Antibiotics, 2023, 12 (7), pp.1160. ⟨10.3390/antibiotics12071160⟩. ⟨anses-04161005⟩
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Mohamed Rhouma, Jean-Yves Madec, Ramanan Laxminarayan. Colistin: from the shadows to a One Health approach for addressing antimicrobial resistance. International Journal of Antimicrobial Agents, 2023, 61 (2), pp.106713. ⟨10.1016/j.ijantimicag.2023.106713⟩. ⟨anses-04142706⟩
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Michaël Treilles, Pierre Châtre, Antoine Drapeau, Jean-Yves Madec, Marisa Haenni. Spread of the mcr-1 colistin-resistance gene in Escherichia coli through plasmid transmission and chromosomal transposition in French goats. Frontiers in Microbiology, 2023, 13, pp.1023403. ⟨10.3389/fmicb.2022.1023403⟩. ⟨anses-03954125⟩
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Zoubida Dendani Chadi, Marie-Anne Arcangioli. Pulsed-Field Gel Electrophoresis Analysis of Bovine Associated Staphylococcus aureus: A Review. Pathogens, 2023, 12 (7), pp.966. ⟨10.3390/pathogens12070966⟩. ⟨hal-04171368⟩
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https://vetagro-sup.hal.science/hal-04171368/file/Review%20pathogens-12-00966.pdf BibTex
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Pedro Moura, Lucie Collineau, Marianne Sandberg, Laura Tomassone, Daniele de Meneghi, et al.. Users’ perception of the OH-EpiCap evaluation tool based on its application to nine national antimicrobial resistance surveillance systems. Frontiers in Public Health, 2023, 11, ⟨10.3389/fpubh.2023.1138645⟩. ⟨hal-04132736⟩
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Timothee Dub, Henna Mäkelä, Esther van Kleef, Agnès Leblond, Alizé Mercier, et al.. Epidemic intelligence activities among national public and animal health agencies: a European cross-sectional study. BMC Public Health, 2023, 23 (1), pp.1488. ⟨10.1186/s12889-023-16396-y⟩. ⟨hal-04181754⟩
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Lucie Collineau. One health : la France dispose d’un système de surveillance riche mais complexe et fragmenté. La Dépêche vétérinaire, 2023, 1663, pp.7. ⟨hal-04206166⟩
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Ingvild Loubet, Lucie Meyer, Séverine Michel, Fanny Pernin, Sébastien Carrere, et al.. A high diversity of non-target site resistance mechanisms to acetolactate-synthase (ALS) inhibiting herbicides has evolved within and among field populations of common ragweed (Ambrosia artemisiifolia L.). BMC Plant Biology, 2023, 23 (1), pp.art. 510. ⟨10.1186/s12870-023-04524-0⟩. ⟨hal-04288942⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-04288942/file/2023-276.pdf BibTex
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Séverine Fontaine, Laëtitia Caddoux, Benoit Barrès. First report of the kdr pyrethroid resistance mutation in a French population of the English grain aphid, Sitobion avenae. Crop Protection, 2023, 165, pp.106153. ⟨10.1016/j.cropro.2022.106153⟩. ⟨hal-03948515⟩
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Matthieu Chourrout, Christophe Sandt, Timm Weitkamp, Tanja Dučić, David Meyronet, et al.. Virtual histology of Alzheimer’s Disease: Biometal entrapment within amyloid-β plaques allows for detection via X-ray phase-contrast imaging. Acta Biomaterialia, 2023, 170, pp.260-272. ⟨10.1016/j.actbio.2023.07.046⟩. ⟨hal-04046962v2⟩
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Elsa Coz, Eric Jouy, Géraldine Cazeau, Nathalie Jarrige, Claire Chauvin, et al.. Evolution of the proportion of colistin-resistant isolates in animal clinical Escherichia coli over time - A hierarchical mixture model approach. Preventive Veterinary Medicine, 2023, 213, pp.105881. ⟨10.1016/j.prevetmed.2023.105881⟩. ⟨anses-04040740⟩
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Sabine Delannoy, Corine Hoffer, Maï-Lan Tran, Jean-Yves Madec, Anne Brisabois, et al.. High throughput qPCR analyses suggest that Enterobacterales of French sheep and cow cheese rarely carry genes conferring resistances to critically important antibiotics for human medicine. International Journal of Food Microbiology, 2023, 403, pp.110303. ⟨10.1016/j.ijfoodmicro.2023.110303⟩. ⟨anses-04143864⟩
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Eric Morignat, Amat Jean-Phillippe, Thomas Maignien, Anne-Gaëlle Morignat, Méry, Laurent. Bilan de la surveillance de l’ESB en France en 2022. Bulletin épidémiologique, 2023, 100 SPÉCIAL MALADIES ANIMALES RÉGLEMENTÉES ET EMERGENTES (MRE) (Article 1), pp.1-5. ⟨anses-04402063⟩
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James Devillers, Jean-Philippe David, Benoit Barrès, Haoues Alout, Bruno Lapied, et al.. Integrated Plan of Insecticide Resistance Surveillance in Mosquito Vectors in France. Insects, 2023, 14 (5), pp.457. ⟨10.3390/insects14050457⟩. ⟨hal-04122120⟩
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Géraldine Cazeau, Méry, Laurent, Anne-Gaëlle Morignat, Jean-Philippe Amat. Bilan 2022 de la surveillance des encéphalopathies spongiformes des petits ruminants en France. Bulletin épidémiologique, 2023, 100 (3), pp.1-10. ⟨anses-04405480⟩
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https://anses.hal.science/anses-04405480/file/Cazeau%20G%C3%A9raldine%20MRE-042_2023-12-21_Tremblante__VF.pdf BibTex
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Ugoline Godeau, Maryline Pioz, Olivier Martin, Charlotte Rüger, Didier Crauser, et al.. Brood thermoregulation effectiveness is positively linked to the amount of brood but not to the number of bees in honeybee colonies. Peer Community Journal, 2023, Volume 3 (2023), article e42, ⟨10.24072/pci.zool.100134⟩. ⟨hal-04133101⟩
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Maud Belliard, Mannaïg de Kersauson, Emilie Delmar, Céline Dupuy, Caroline Lantuejoul, et al.. Bilan des déclarations de troubles de santé à l’Observatoire des Mortalités et des Affaiblissements de l’Abeille mellifère (2017-2021) et perspectives 2023. Abeilles et Fleurs, 2023, 863, pp.30-35. ⟨hal-04414414⟩
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Lucie Collineau, Yohann Lacotte, Madec Jean-Yves. Vers une approche "One health" de la surveillance de l'antibiorésistance en france - Bilan 2016-2022 de la synthèse annuelle produite par Santé publique France. Bulletin Epidémiologique Hebdomadaire - BEH, 2023, 22-23, pp.488-493. ⟨anses-04405515⟩
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Sandra Martínez-Álvarez, Pierre Châtre, Teresa Cardona-Cabrera, Pauline François, Alberto Sánchez-Cano, et al.. Detection and genetic characterization of blaESBL-carrying plasmids of cloacal Escherichia coli isolates from white stork nestlings (Ciconia ciconia) in Spain. Journal of Global Antimicrobial Resistance, 2023, 34, pp.186 - 194. ⟨10.1016/j.jgar.2023.07.011⟩. ⟨anses-04222165⟩
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https://anses.hal.science/anses-04222165/file/MartinezAlvarez_ESBLstorksNestlings_JGAR2023.pdf BibTex
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Benoit Durand, Barbara Dufour, Claire Ponsart, Viviane Hénaux, Charlotte Rüger. Bilan de la surveillance de la brucellose des petits-ruminants en France métropolitaine entre 2020 et 2022. Bulletin épidémiologique, 2023, 100, pp.Article 4. ⟨anses-04370688⟩
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https://anses.hal.science/anses-04370688/file/Durand%20Benoit%202023%20Bilan%20de%20la%20surveillance%20de%20la%20brucellose%20des%20petits%20ruminants%20en%20France%20m%C3%A9tropolitaine%20entre%202020%20et%202022.pdf BibTex
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Justine Lagrange, Jean-Philippe Amat, Cristina Ballesteros, Peter Damborg, Thomas Grönthal, et al.. Pilot testing the EARS-Vet surveillance network for antibiotic resistance in bacterial pathogens from animals in the EU/EEA. Frontiers in Microbiology, 2023, 14, pp.1188423. ⟨10.3389/fmicb.2023.1188423⟩. ⟨anses-04188220⟩
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Alban Lis, Marion Bordier, Barbara Häsler, Lucie Collineau, Laura Tomassone, et al.. Capturing systematically users' experience of evaluation tools for integrated AMU and AMR surveillance. Frontiers in Veterinary Science, 2023, 10, pp.1107122. ⟨10.3389/fvets.2023.1107122⟩. ⟨hal-04106060⟩
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Lucie Collineau, Clémence Bourély, Léo Rousset, Anne Berger-Carbonne, Marie-Cécile Ploy, et al.. Towards One Health surveillance of antibiotic resistance: characterisation and mapping of existing programmes in humans, animals, food and the environment in France, 2021. Eurosurveillance, 2023, 28 (22), pp.2200804. ⟨10.2807/1560-7917.es.2023.28.22.2200804⟩. ⟨hal-04128634⟩
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Paarthiphan Elankumuran, Glenn F Browning, Marc S Marenda, Amanda Kidsley, Marwan Osman, et al.. Identification of genes influencing the evolution of Escherichia coli ST372 in dogs and humans. Microbial Genomics, 2023, 9 (2), ⟨10.1099/mgen.0.000930⟩. ⟨anses-03998324⟩
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Mathilda Idier, Myriam Siegwart, Benoit Barrès, Sandrine Maugin, Jérôme Olivares, et al.. Genetic characterization of multiple insecticide resistances in Cydia pomonella (L.) using RNAseq. Entomologia Generalis, 2023, 43 (3), pp.545-554. ⟨10.1127/entomologia/2023/2029⟩. ⟨hal-04224151⟩
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Agnese Lupo, Benoît Valot, Estelle Saras, Antoine Drapeau, Marine Robert, et al.. Multiple host colonization and differential expansion of multidrug-resistant ST25-Acinetobacter baumannii clades. Scientific Reports, 2023, 13 (1), pp.21854. ⟨10.1038/s41598-023-49268-x⟩. ⟨anses-04375645⟩
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Julien Thézé, Chloé Ambroset, Séverine Barry, Sébastien Masseglia, Adélie Colin, et al.. Genome-wide phylodynamic approach reveals the epidemic dynamics of the main Mycoplasma bovis subtype circulating in France. Microbial Genomics, 2023, 9 (7), pp.mgen001067. ⟨10.1099/mgen.0.001067⟩. ⟨hal-04181802⟩
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Nithya Babu Rajendran, Fabiana Arieti, Carla Alejandra Mena-Benítez, Liliana Galia, Maela Tebon, et al.. EPI-Net One Health reporting guideline for antimicrobial consumption and resistance surveillance data: a Delphi approach. The Lancet Regional Health - Europe, 2023, 26, pp.100563. ⟨10.1016/j.lanepe.2022.100563⟩. ⟨hal-04206273⟩
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Conference papers

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A. Bencsik, Pietri, M., Hector Ardila-Osorio, A. Baudry, François Boudet-Devaud, et al.. Effet pro-Alzheimer d’une exposition des neurones aux nanoparticules de TiO2 ou de noir de carbone. 1er Colloque GdR NaMasTE, Digiteo CEA, Nov 2023, Saclay (92), France. ⟨10.1186/s12989-022-00490-x⟩. ⟨anses-04416703⟩
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Maryne Jaÿ, Florence Tardy, Claire Becker. Évolution des souches de Mycoplasma bovis circulant en France. Journées Nationales des GTV, GTV, May 2023, Poitiers, France. pp.149-155. ⟨hal-04350489⟩
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https://hal.science/hal-04350489/file/Becker%2024%20mai%20Atelier%20Respiv2.pdf BibTex
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Lucie Collineau, Mélanie Colomb-Cotinat, Léo Rousset, Clémence Bourély. Moving towards one health surveillance of antimicrobial resistance in France: key findings of the surv1health project. Society for Veterinary Epidemiology and Preventive Medicine (SVEPM), Mar 2023, Toulouse, France. ⟨anses-04513279⟩
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Marisa Haenni, Séverine Murri, Antoine Drapeau, Madec Jean-Yves. Caractérisation génomique de Staphylococcus epidermidis résistants à la méticilline d’origine animale. Colloque Staphosium, Nov 2023, Lyon, France. ⟨anses-04506190⟩
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Melanie Save, Claire A.M. Becker, Anaïs Bompard, Bertrand Guin, Séverine Barry, et al.. Influence of birth mode and pre- and post-biotic supplementation on the fecal microbiota: a randomized controlled trial in Charolais calves. European Buiatrics Congress and ECBHM Jubilee Symposium 2023, Aug 2023, Berlin, Germany. pp.34-?. ⟨hal-04202057⟩
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Pauline de Jerphanion, Anne Quillévéré-Hamard, Marine Marjou, Marie Agnes Jacques, Valérie Olivier, et al.. Delimiting survey of Xylella fastidosa subsp. multiplex : bringing together multidisciplinary expertise to support risk management. 4th European Conference on Xylella fastidisiosa – satellite events of International Congress of Plant Pathology, Aug 2023, Lyon, France. ⟨anses-04513339⟩
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Jean-Noël Arsac, Jérémy Verchère, Habiba Tlili, Claire Aufauvre, Dominique Bétemps, et al.. Proposition d’un modèle transgénique murin (APPxM83) développant une pathologie associée à la co-expression des protéines alpha-synucléine et β-amyloïde humaines ». 8ème Journée d’actualité sur les maladies à prions et autres protéinopathies, Jun 2023, Paris, France. pp.Communication orale. ⟨anses-04492259⟩
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Anna Bencsik. Effets sur la santé humaine d’une exposition orale chronique aux nanoparticules de dioxyde de silice utilisées dans l’alimentation (additif E551): ce que suggèrent les études sur la souris exposée durant 18 mois. Journées Francophones de Nutrition, Dec 2023, Marseille, France. ⟨anses-04504462⟩
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Lucie Collineau, Mélanie Colomb-Cotinat, Léo Rousset, Clémence Bourély. Vers une surveillance intégrée de l'antibiorésistance en France - Bilan du projet Surv1Health. Journée du Résapath, Mar 2023, Villeurbanne - Rhône, France. ⟨anses-04513247⟩
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Géraldine Cazeau. Des chiffres et des cartes. Journée du Résapath, RESAPATH, Mar 2023, Lyon, France. ⟨anses-04504743⟩
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Anna Bencsik. Nanoparticules et Maladies neurodégénératives - Apports d’une étude mécanistique sur des neurones exposés à des nanoparticules de dioxyde de titane et de noir de carbone. Comité de Dialogue "Nanomatériaux & Santé", Apr 2023, Maisons Alfort, France. ⟨anses-04504379⟩
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Viviane Hénaux, Henok Ayalew Tegegne, Carlijn Bogaardt, Géraldine Cazeau, Lucie Collineau, et al.. Défis et opportunités dans la mise en œuvre de la surveillance One Health : leçons tirées de l'application de l’outil d’évaluation OH-EpiCap. Journées scientifiques de l'AEEMA, Jun 2023, Maisons Alfort, France. ⟨anses-04417492⟩
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Oucheriah Yasmine, Tricot Agnès, Colin Adélie, Nouzha Heleili, Florence Tardy, et al.. Etude de la résistance aux antibiotiques de clones de Mycoplasma bovis en Algérie. 3e Webinaire International Sécurité Alimentaire et Santé Animale, École Nationale Supérieure Vétérinaire d’Alger, Jul 2023, Alger, Algérie. ⟨hal-04265705⟩
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Séverine Murri, Lefrère, Caroline, Drapeau Pauline, Antoine Gourlay, Philippe Gourlay, et al.. Caractérisation génomique des Staphylococcus aureus (SASM et SARM) chez le hérisson en France. Colloque Staphosium, Nov 2023, Lyon, France. ⟨anses-04506288⟩
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Lucie Collineau, Géraldine Cazeau, Marisa Haenni, Nathalie Jarrige, Eric Jouy, et al.. Le résapath dans le contexte européen : actualités du réseau Ears-Vet. Journée du Résapath, Mar 2023, Visioconférence, France. ⟨anses-04506479⟩
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Matthieu Martineau, Éléna Kokabi, Maryne Jaÿ, Florence Tardy, Albertine Léon. Association of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus and Mycoplasma spp. in equine respiratory infections. Workshop Havemeyer, Ashley Boyle, May 2023, Mendenhall, United States. ⟨hal-04095078⟩
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Rachel Contarin, Marisa Haenni, Emilie Dordet-Frisoni. Les éléments génétiques mobiles chez Staphylococcus aureus : vecteurs de l’antibiorésistance. Colloque Staphosium, Nov 2023, Lyon, France. ⟨anses-04504869⟩
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Wejdène Mansour, Lucie Collineau, Mindaugas Malakauskas, Marta Kuźmińska-Bajor, Kabelitz Tina, et al.. Interventions to control the dynamics of antimicrobial resistance from chickens through the environment: ENVIRE. 9th symposium on antimicrobial resistance in animals and the environment (ARAE 2023), Jul 2023, Tours, France. ⟨anses-04509793⟩
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Thibaut Lurier, Bernard Jankowiak, Claire A.M. Becker, Marie Anne Arcangioli. Gestion d'un pyothorax par mise en place d'un drain thoracique chez une génisse Holstein. Journées Nationales des GTV, GTV, May 2023, Poitiers, France. pp.317. ⟨hal-04350530⟩
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Christophe Plantamp, Laetitia Caddoux, Benoit Barrès, Séverine Fontaine. QUANTification haut débit d’ALLèles liés à la résistance des bioagresseurs aux produits de protection des plantes - Groupe de Travail Vegephyl sur la Résistance des Ravageurs. Groupe de Travail Vegephyl sur la Résistance des Ravageurs, Nov 2023, VISIOCONFERENCE, France. ⟨anses-04506364⟩
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