Publications HAL du labo/EPI 122685

2022

Journal articles

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Géraldine Carne, David D. Makowski, Sandrine Carrillo, Thierry Guérin, Petru Jitaru, et al.. Probabilistic determination of a maximum acceptable level of contaminant to reduce the risk of overexposure for a novel or emerging food: the case of cadmium in edible seaweed in the French population. Food additives & contaminants. Part A. Chemistry, analysis, control, exposure & risk assessment, Taylor & Francis, 2022, 39 (8), pp.1439-1452. ⟨10.1080/19440049.2022.2087921⟩. ⟨hal-03700362⟩
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Alassane Keita, Laetitia Le Devendec, Michel Amelot, Julie Puterflam, Camille Lucas, et al.. Efficacy of passive immunization in broiler chicks via an inactivated Escherichia coli autogenous vaccine administered to broiler breeder hens. Avian Pathology, Taylor & Francis, In press, 25 p. ⟨10.1080/03079457.2022.2084362⟩. ⟨hal-03700012⟩
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Charlotte Valat, Marisa Haenni, Youssef Arnaout, Antoine Drapeau, Edouard Hirchaud, et al.. F74 plasmids are major vectors of virulence genes in bovine NTEC2. Letters in Applied Microbiology, Wiley, In press, ⟨10.1111/lam.13733⟩. ⟨anses-03715577⟩
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Benjamin Félix, Yann Sevellec, Federica Palma, Pierre Emmanuel Douarre, Arnaud Felten, et al.. A European-wide dataset to uncover adaptive traits of Listeria monocytogenes to diverse ecological niches. Scientific Data , Nature Publishing Group, 2022, 9 (1), pp.190. ⟨10.1038/s41597-022-01278-6⟩. ⟨anses-03665051⟩
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Sandra Jaudou, Mai-Lan Tran, Fabien Vorimore, Patrick Fach, Sabine Delannoy. Evaluation of high molecular weight DNA extraction methods for long-read sequencing of Shiga toxin-producing Escherichia coli. PLoS ONE, Public Library of Science, 2022, 17 (7), pp.e0270751. ⟨10.1371/journal.pone.0270751⟩. ⟨anses-03735612⟩
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Gabriel Pasquier, Périne Doyen, Maria Kazour, Alexandre Dehaut, Mamadou Diop, et al.. Manta net: The golden method for sampling surface water microplastics in aquatic environments. Frontiers in Environmental Science, Frontiers, 2022, 10, ⟨10.3389/fenvs.2022.811112⟩. ⟨anses-03630809⟩
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Sabine Delannoy, Maï-Lan Tran, Patrick Fach. Insights into the assessment of highly pathogenic Shiga toxin-producing Escherichia coli in raw milk and raw milk cheeses by High Throughput Real-time PCR. International Journal of Food Microbiology, Elsevier, 2022, 366, pp.109564. ⟨10.1016/j.ijfoodmicro.2022.109564⟩. ⟨anses-03715565⟩
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Sabine Delannoy, Corine Hoffer, Raphaëlle Youf, Emilie Dauvergne, Hattie E Webb, et al.. High Throughput Screening of Antimicrobial Resistance Genes in Gram-Negative Seafood Bacteria. Microorganisms, MDPI, 2022, 10 (6), pp.1225. ⟨10.3390/microorganisms10061225⟩. ⟨anses-03707197⟩
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Yassine Makni, Thierno Diallo, Thierry Guérin, Julien Parinet. Improving the monitoring of multi-class pesticides in baby foods using QuEChERS-UHPLC-Q-TOF with automated identification based on MS/MS similarity algorithms. Food Chemistry, Elsevier, 2022, pp.133573. ⟨10.1016/j.foodchem.2022.133573⟩. ⟨anses-03706205⟩
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Thierno Diallo, Yassine Makni, Adélaïde Lerebours, Hélène Thomas, Thierry Guérin, et al.. Development and validation according to the SANTE guidelines of a QuECh-ERS-UHPLC-QTOF-MS method for the screening of 204 pesticides in bivalves. Food Chemistry, Elsevier, 2022, 386, pp.132871. ⟨10.1016/j.foodchem.2022.132871⟩. ⟨hal-03628271⟩
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Marie Vagner, Gaëlle G. Boudry, Lucie Courcot, Dorothée Vincent, Alexandre Dehaut, et al.. Experimental evidence that polystyrene nanoplastics cross the intestinal barrier of European seabass. Environment International, Elsevier, In press, pp.107340. ⟨10.1016/j.envint.2022.107340⟩. ⟨anses-03695684⟩
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Julie Puterflam, Rozenn Souillard, Loïc Balaine, Pascal Galliot, Catarina Lucas, et al.. Colisée - Controlling colibacillosis in chicken. Innovations Agronomiques, INRAE, 2022, 85, pp.83-92. ⟨hal-03739936⟩
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Gaëlle Gonzalez, Laure Bournez, Rayane Amaral Moraes, Dumarest Marine, Clémence Galon, et al.. A One-Health Approach to Investigating an Outbreak of Alimentary Tick-Borne Encephalitis in a Non-endemic Area in France (Ain, Eastern France): A Longitudinal Serological Study in Livestock, Detection in Ticks, and the First Tick-Borne Encephalitis Virus Isolation and Molecular Characterisation. Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2022, 13, pp.863725. ⟨10.3389/fmicb.2022.863725⟩. ⟨anses-03648941⟩
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Yann Sévellec, Eliette Ascencio, Pierre-Emmanuel Douarre, Benjamin Félix, Laurent Gal, et al.. Listeria monocytogenes: Investigation of Fitness in Soil Does Not Support the Relevance of Ecotypes. Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2022, 13, pp.917588. ⟨10.3389/fmicb.2022.917588⟩. ⟨hal-03712850⟩
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Nick Beijer, Alexandre Dehaut, Maxim Carlier, Helen Wolter, Ron Versteegen, et al.. Relationship Between Particle Properties and Immunotoxicological Effects of Environmentally-Sourced Microplastics. Frontiers in Water, Frontiers, 2022, 4, pp.866732. ⟨10.3389/frwa.2022.866732⟩. ⟨anses-03682345⟩
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Pierre Emmanuel Douarre, Yann Sévellec, Patricia Le Grandois, Christophe Soumet, Arnaud Bridier, et al.. FepR as a Central Genetic Target in the Adaptation to Quaternary Ammonium Compounds and Cross-Resistance to Ciprofloxacin in Listeria monocytogenes. Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2022, 13, pp.864576. ⟨10.3389/fmicb.2022.864576⟩. ⟨anses-03707762⟩
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Madjid Djouina, Cécile Vignal, Alexandre Dehaut, Ségolène Caboche, Nell Hirt, et al.. Oral exposure to polyethylene microplastics alters gut morphology, immune response, and microbiota composition in mice. Environmental Research, Elsevier, 2022, 212 (Part B), pp.113230. ⟨10.1016/j.envres.2022.113230⟩. ⟨hal-03649433⟩
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Claudia Gerard, Maxime R. Hervé, Héloïse Hamel, Mélanie Gay, Michel Barbier, et al.. Metazoan parasite community as a potential biological indicator in juveniles of the starry smooth-hound Mustelus asterias Cloquet, 1819 (Carcharhiniformes Triakidae). Aquatic Living Resources, EDP Sciences, 2022, 35, pp.3. ⟨10.1051/alr/2022002⟩. ⟨hal-03674718⟩
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Maëline Ribeiro, N. Zephyr, J.A.L. Silva, Morgane Danion, Thierry Guérin, et al.. Assessment of the mercury-selenium antagonism in rainbow trout fish. Chemosphere, Elsevier, 2022, 286 (Pt 2), pp.131749. ⟨10.1016/j.chemosphere.2021.131749⟩. ⟨anses-03651307⟩
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Federica Palma, Nicolas Radomski, Alizée Guérin, Yann Sévellec, Benjamin Félix, et al.. Genomic elements located in the accessory repertoire drive the adaptation to biocides in Listeria monocytogenes strains from different ecological niches. Food Microbiology, Elsevier, 2022, pp.103757. ⟨10.1016/j.fm.2021.103757⟩. ⟨anses-03150893⟩
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Camille Lucas, Sabine Delannoy, Catherine Schouler, Rozenn Souillard, Laetitia Le Devendec, et al.. Description and validation of a new set of PCR markers predictive of avian pathogenic Escherichia coli virulence. Veterinary Microbiology, Elsevier, 2022, 273, 7 p. ⟨10.1016/j.vetmic.2022.109530⟩. ⟨hal-03768115⟩
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Catherine Hennechart-Collette, Océane Dehan, Michel Laurentie, Audrey Fraisse, Sandra Martin-Latil, et al.. Method for detecting norovirus, hepatitis A and hepatitis E viruses in tap and bottled drinking water. International Journal of Food Microbiology, Elsevier, 2022, 377, pp.109757. ⟨10.1016/j.ijfoodmicro.2022.109757⟩. ⟨anses-03702517⟩
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Marine Uguen, Katy R Nicastro, Gerardo I Zardi, Sylvie M Gaudron, Nicolas Spilmont, et al.. Microplastic leachates disrupt the chemotactic and chemokinetic behaviours of an ecosystem engineer (Mytilus edulis). Chemosphere, Elsevier, 2022, 306, pp.135425. ⟨10.1016/j.chemosphere.2022.135425⟩. ⟨hal-03721287⟩
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Devon Kavanaugh, Benjamin Glasset, Rozenn Dervyn, Cyprien Guérin, Sandra Plancade, et al.. New genetic biomarkers to differentiate non-pathogenic from clinically relevant Bacillus cereus strains. Clinical Microbiology and Infection, Elsevier for the European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, 2022, 28 (1), pp.137.e1-137.e8. ⟨10.1016/j.cmi.2021.05.035⟩. ⟨hal-03356344⟩
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Conference papers

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Fleurine Akoueson, Ika Paul-Pont, Chaza Chbib, Périne Doyen, Sébastien Monchy, et al.. Les additifs plastiques dans les barquettes alimentaires : caractérisation en Py-GC-HRMS et impacts sur les stades de développement de l'huitre creuse (Crassostrea gigas). GDR Polymères et Océans 2022, GDR Polymères et Océans, Jun 2022, Brest, France. ⟨anses-03711133⟩
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Alexandre Dehaut, Charlotte Himber, Guillaume Duflos. Microplastiques et témoins positifs : proposition d’une méthode simple de dopage d’échantillons. GDR Polymères et Océans 2022, GDR Polymères et Océans, Jun 2022, Brest, France. ⟨anses-03710989⟩
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Fleurine Akoueson, Chaza Chbib, Ika Paul-Pont, Périne Doyen, Sébastien Monchy, et al.. Pyrolysis-GC-HRMS: an application for the identification and quantification of organic plastic additives.. SETAC Europe 32nd Annual Meeting, SETAC, May 2022, Copenhague, Denmark. ⟨anses-03711154⟩
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Poster communications

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Sophie Roussel, Sabrina Cadel-Six, Benjamin Félix, Pierre Emmanuel Douarre, Arnaud A. Bridier, et al.. Joint Technological Unit ACTIA “FASTYPERS”: Fast detection of food-borne bacterial pathogens. Food Micro, Aug 2022, Athènes, Greece. ⟨hal-03714890⟩
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Julie Puterflam, Pascal Galliot, Loïc Balaine, Isabelle Kempf, Laetitia Le Devendec, et al.. Les facteurs déclenchants de la colibacillose du poulet de chair : étude épidémiologique dans 80 élevages en France. 14. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras (JRA), Mar 2022, Tours, France. ⟨hal-03775530⟩
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2021

Journal articles

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Mathilde Bonis, Arnaud Felten, Sylvie Pairaud, Angélie Dijoux, Véronique Maladen, et al.. Comparative phenotypic, genotypic and genomic analyses of Bacillus thuringiensis associated with foodborne outbreaks in France. PLoS ONE, Public Library of Science, 2021, 16 (2), pp.e0246885. ⟨10.1371/journal.pone.0246885⟩. ⟨hal-03306246⟩
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Catherine Hennechart-Collette, Océane Dehan, Michel Laurentie, Audrey Fraisse, Sandra Martin-Latil, et al.. Detection of norovirus, hepatitis A and hepatitis E viruses in multicomponent foodstuffs. International Journal of Food Microbiology, Elsevier, 2021, 337, pp.108931. ⟨10.1016/j.ijfoodmicro.2020.108931⟩. ⟨anses-03015846⟩
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Florence Postollec, Sabine Herbin, Alexandra Séverac Cauquil, Sébastien Louarn, Marie-Hélène Guinebretière, et al.. BtID -Outils pour identifier, tracer et contrôler les contaminants de Bacillus thuringiensis de la fourche à la fourchette. Innovations Agronomiques, INRAE, 2021, 82, pp.53-65. ⟨10.15454/5kqe-4413⟩. ⟨hal-03159089⟩
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Lucas Givelet, Delphine Truffier-Boutry, Laurent Noël, Jean-François Damlencourt, Petru Jitaru, et al.. Optimisation and application of an analytical approach for the characterisation of TiO2 nanoparticles in food additives and pharmaceuticals by single particle inductively coupled plasma-mass spectrometry. Talanta, Elsevier, 2021, 224, pp.121873 -. ⟨10.1016/j.talanta.2020.121873⟩. ⟨hal-03492886⟩
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Thomas Brauge, Sylvain Trigueros, Arnaud Briet, Sabine Debuiche, Guylaine Leleu, et al.. MALDI-TOF Mass Spectrometry Fingerprinting Performance Versus 16S rDNA Sequencing to Identify Bacterial Microflora From Seafood Products and Sea Water Samples. Frontiers in Marine Science, Frontiers Media, 2021, 8, ⟨10.3389/fmars.2021.650116⟩. ⟨anses-03524181⟩
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Pauline Bosman, Audrey Combès, Marine Lambert, Gwenaëlle Lavison-Bompard, Valérie Pichon. Development and Application of Molecularly Imprinted Polymers for the Selective Extraction of Chlordecone from Bovine Serum. Separations, MDPI, 2021, 8 (12), pp.237. ⟨10.3390/separations8120237⟩. ⟨hal-03475021⟩
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Fleurine Akoueson, Chaza Chbib, Sébastien Monchy, Ika Paul-Pont, Périne Doyen, et al.. Identification and quantification of plastic additives using Pyrolysis-GC/MS: a review. Science of the Total Environment, Elsevier, 2021, 773, pp.145073. ⟨10.1016/j.scitotenv.2021.145073⟩. ⟨anses-03137716⟩
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Julien Parinet. Predicting reversed-phase liquid chromatographic retention times of pesticides by deep neural networks. Heliyon, Elsevier 2021, 7 (12), pp.e08563. ⟨10.1016/j.heliyon.2021.e08563⟩. ⟨anses-03509974⟩
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Livia Schwendimann, D. Merda, T. Berger, S. Denayer, C. Feraudet-Tarisse, et al.. Staphylococcal Enterotoxin Gene Cluster: Prediction of Enterotoxin (SEG and SEI) Production and of the Source of Food Poisoning on the Basis of v Saβ Typing. Applied and Environmental Microbiology, American Society for Microbiology, 2021, 87 (5), ⟨10.1128/AEM.02662-20⟩. ⟨hal-03365988⟩
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Marina Saraiva, Rachida Chekri, Axelle Leufroy, Thierry Guérin, Jens J. Sloth, et al.. Development and validation of a single run method based on species specific isotope dilution and HPLC-ICP-MS for simultaneous species interconversion correction and speciation analysis of Cr(III)/Cr(VI) in meat and dairy products. Talanta, Elsevier, 2021, 222, pp.121538 -. ⟨10.1016/j.talanta.2020.121538⟩. ⟨hal-03492453⟩
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Alexandra Chiaverini, Fabrizia Guidi, Marina Torresi, Vicdalia Aniela Acciari, Gabriella Centorotola, et al.. Phylogenetic Analysis and Genome-Wide Association Study Applied to an Italian Listeria monocytogenes Outbreak. Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2021, 12, pp.750065. ⟨10.3389/fmicb.2021.750065⟩. ⟨anses-03703995⟩
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Nathalie Arnich, Eric Abadie, Zouher Amzil, Marie-Yasmine Dechraoui Bottein, Katia Comte, et al.. Guidance Level for Brevetoxins in French Shellfish. Marine drugs, MDPI, 2021, 19 (9), pp.520. ⟨10.3390/md19090520⟩. ⟨anses-03350437⟩
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Maïlie Saint-Hilaire, Aurore Fourcot, Alain Bousquet-Mélou, Guido Rychen, Jean-Pierre Thomé, et al.. Characterization and quantification of chlordecone elimination in ewes. Environmental Toxicology and Pharmacology, Elsevier, 2021, 87, pp.103698. ⟨10.1016/j.etap.2021.103698⟩. ⟨hal-03515239⟩
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Marion Bordier, Flavie Luce Goutard, Nicolas Antoine-Moussiaux, Phuc Pham-Duc, Renaud Lailler, et al.. Engaging Stakeholders in the Design of One Health Surveillance Systems: A Participatory Approach. Frontiers in Veterinary Science, Frontiers Media, 2021, 8, pp.646458. ⟨10.3389/fvets.2021.646458⟩. ⟨hal-03304671⟩
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Vincent Plassard, Philippe Gisbert, Sophie A Granier, Yves Millemann. Surveillance of Extended-Spectrum β-Lactamase-, Cephalosporinase- and Carbapenemase-Producing Gram-Negative Bacteria in Raw Milk Filters and Healthy Dairy Cattle in Three Farms in Île-de-France, France. Frontiers in Veterinary Science, Frontiers Media, 2021, 8, pp.633598. ⟨10.3389/fvets.2021.633598⟩. ⟨anses-03266287⟩
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Aurélie Cointe, Etienne Bizot, Sabine Delannoy, Patrick Fach, Philippe Bidet, et al.. Emergence of New ST301 Shiga Toxin-Producing Escherichia coli Clones Harboring Extra-Intestinal Virulence Traits in Europe. Toxins, MDPI, 2021, 13 (10), pp.686. ⟨10.3390/toxins13100686⟩. ⟨anses-03704015⟩
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Julien Parinet. Prediction of pesticide retention time in reversed-phase liquid chromatography using quantitative-structure retention relationship models: a comparative study of seven molecular descriptors datasets. Chemosphere, Elsevier, 2021, pp.130036. ⟨10.1016/j.chemosphere.2021.130036⟩. ⟨hal-03158280⟩
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Marina Saraiva, Petru Jitaru, Jens Sloth. Speciation analysis of Cr(III) and Cr(VI) in bread and breakfast cereals using species-specific isotope dilution and HPLC-ICP-MS. Journal of Food Composition and Analysis, Elsevier, 2021, 102, pp.103991. ⟨10.1016/j.jfca.2021.103991⟩. ⟨hal-03657291⟩
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Fiona Zoz, Stéphane Guyot, Cosette Grandvalet, Mélanie Ragon, Eric Lesniewska, et al.. Management of Listeria monocytogenes on Surfaces via Relative Air Humidity: Key Role of Cell Envelope. Foods, MDPI, 2021, 10 (9), pp.1-15. ⟨10.3390/foods10092002⟩. ⟨hal-03327279⟩
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Shuai Zhi, Brendon Parsons, Jonas Szelewicki, Yue Yuen, Patrick Fach, et al.. Identification of Shiga-Toxin-Producing Shigella Infections in Travel and Non-Travel Related Cases in Alberta, Canada. Toxins, MDPI, 2021, 13 (11), pp.755. ⟨10.3390/toxins13110755⟩. ⟨anses-03715596⟩
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Gwenaëlle Lavison-Bompard, Julien Parinet, Karelle Huby, Thierry Guérin, Chanthadary Inthavong, et al.. Correlation between endemic chlordecone concentrations in three bovine tissues determined by isotopic dilution liquid chromatography–tandem mass spectrometry. Science of the Total Environment, Elsevier, 2021, 788, pp.147833. ⟨10.1016/j.scitotenv.2021.147833⟩. ⟨anses-03722009⟩
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Vincent Hort, Eric Abadie, Nathalie Arnich, Marie-Yasmine Dechraoui Bottein, Zouher Amzil. Chemodiversity of Brevetoxins and Other Potentially Toxic Metabolites Produced by Karenia spp. and Their Metabolic Products in Marine Organisms. Marine drugs, MDPI, 2021, 19 (12), pp.656. ⟨10.3390/md19120656⟩. ⟨anses-03549777⟩
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Sabine Delannoy, Catherine Schouler, Rozenn Souillard, Léna Yousfi, Laetitia Le Devendec, et al.. Diversity of Escherichia coli strains isolated from day-old broiler chicks, their environment and colibacillosis lesions in 80 flocks in France. Veterinary Microbiology, Elsevier, 2021, 252, 8 p. ⟨10.1016/j.vetmic.2020.108923⟩. ⟨hal-03107169⟩
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Jon W. Wong, Jian Wang, James S. Chang, Willis Chow, Roland Carlson, et al.. Multilaboratory Collaborative Study of a Nontarget Data Acquisition for Target Analysis (nDATA) Workflow Using Liquid Chromatography-High-Resolution Accurate Mass Spectrometry for Pesticide Screening in Fruits and Vegetables. Journal of Agricultural and Food Chemistry, American Chemical Society, 2021, 69 (44), pp.13200-13216. ⟨10.1021/acs.jafc.1c04437⟩. ⟨anses-03722038⟩
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Sabrina Cadel-Six, Emeline Cherchame, Pierre-Emmanuel Douarre, Yue Tang, Arnaud Felten, et al.. The Spatiotemporal Dynamics and Microevolution Events That Favored the Success of the Highly Clonal Multidrug-Resistant Monophasic Salmonella Typhimurium Circulating in Europe. Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2021, 12, pp.651124. ⟨10.3389/fmicb.2021.651124⟩. ⟨anses-03703971⟩
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Conference papers

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Fleurine Akoueson, Chaza Chbib, Armance Brémard, Sébastien Monchy, Ika Paul-Pont, et al.. Pyrolyse-GC-MS-Orbitrap: une application pour l’identification et la quantification d’additifs plastiques organiques. Marco 2021, CPER Marco, Oct 2021, Boulogne-sur-Mer, France. ⟨anses-03711182⟩
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Fleurine Akoueson, Chaza Chbib, Ika Paul-Pont, Périne Doyen, Sébastien Monchy, et al.. GC/MS-Orbitrap: une application pour la caractérisation d’additifs plastiques. GDR Polymères et Océans 2020, GDR Polymères et Océans, Feb 2021, En ligne, France. ⟨anses-03711312⟩
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Alexandre Dehaut, Périne Doyen, Fleurine Akoueson, Maria Kazour, Jéremy Thery, et al.. Mise en place de la plateforme 3PAC : analyse et caractérisation des particules de plastiques dans l’environnement et les produits marins. Marco 2021, CPER Marco, Oct 2021, Boulogne-sur-Mer, France. ⟨anses-03711255⟩
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Guillaume Duflos, Fleurine Akoueson, Alexandre Dehaut. Microplastics in food : characterization of plastic additives using Pyrolysis-GC-MS-Orbitrap. AOAC Virtual Food Science Symposium, AOAC, Aug 2021, On-line conference, United States. ⟨anses-03711276⟩
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Alexandre Dehaut. Microplastics and now nanoplastics, new challenges in food and human health. AOAC Virtual Food Science Symposium, AOAC, Jul 2021, On-line conference, Switzerland. ⟨anses-03711292⟩
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Guillaume Duflos, Alexandra ter Halle, Christelle Anquetil, Laurence Asia, Nadia Bouzid, et al.. Avancement sur la mise au point d’une méthode de dosage des microplastiques par pyrolyse couplée à la spectrométrie de masse. GDR Polymères et Océans 2020, GDR Polymères et Océans, Feb 2021, En ligne, France. ⟨anses-03711342⟩
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Book sections

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Arnaud Bridier, Christophe Soumet, Isabelle Attig, Thomas Brauge, Graziella Midelet, et al.. Biocides désinfectants en agroalimentaire. Lavoisier. Agents antimicrobiens et sécurité sanitaire des aliments, Lavoisier, pp.87-104, 2021, 978-2-7430-2597-7. ⟨anses-03624375⟩
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Pascale Fabre, Fabienne Lagarde, Stephane Bruzaud, Guillaume Duflos, François Galgani, et al.. Les dangers de l'invasion plastique. Livre vert 2022, Edition Le Pommier, pp.23-26, 2021, 9782746523609. ⟨hal-03761649⟩
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Poster communications

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Martial Mengelers, Yvonne Staal, Margriet Park, Wim Mennes, Alexandre Dehaut, et al.. The in vitro effects of microplastics on the cytokine response of macrophages. EFSA’s Scientific Colloquium 25, May 2021, On-line conference, Italy. ⟨anses-03711599⟩
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Alexandre Dehaut, Périne Doyen, Thierry Grard, Sami Souissi, Sébastien Monchy, et al.. Analyser et caractériser les particules de plastique : introduction de la plateforme 3PAC. GDR Polymères et Océans 2020, Feb 2021, En ligne, France. ⟨anses-03711645⟩
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Fleurine Akoueson, Chaza Chbib, Sébastien Monchy, Ika Paul-Pont, Périne Doyen, et al.. La pyrolyse GC/MS-Orbitrap une application pour la caractérisation d'additifs plastiques. Colloque SEFA 2021, Jun 2021, En ligne, France. ⟨anses-03711564⟩
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Alexandre Dehaut, Ludovic Hermabessiere, Guillaume Duflos. How to analyse microplastics in (sea)food : proposition of the MIMS concept (minimal information for the microplastics studies). EFSA’s Scientific Colloquium 25, May 2021, On-line conference, Italy. ⟨anses-03711611⟩
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Reports

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Raphaële Le Garrec, Eric Abadie, Zouher Amzil, Marie-Yasmine Bottein, Katia Comte, et al.. Les brévétoxines dans les coquillages, données de toxicité, d’occurrence et microalgues productrices : Avis de l'Anses. Rapport d'expertise collective. [Autre] (saisine n° 2020-SA-0020), 2021, pp.180. ⟨anses-03338904⟩
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Theses

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Livia Schwendimann. Evaluation and prediction of staphylococcal enterotoxins. Human health and pathology. Université Paris-Est, 2021. English. ⟨NNT : 2021PESC0002⟩. ⟨tel-03666896⟩
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2020

Journal articles

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Pauline Kooh, Anne Thébault, Vasco Cadavez, Ursula Gonzales-Barron, Isabelle Villena. Risk factors for sporadic cryptosporidiosis: A systematic review and meta-analysis. Microbial Risk Analysis, 2020, pp.100116. ⟨10.1016/j.mran.2020.100116⟩. ⟨hal-03068259⟩
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Alexandre Nougadère, Véronique Sirot, Jean Pierre J. P. Cravedi, Paule Vasseur, Cyril Feidt, et al.. Dietary exposure to pesticide residues and associated health risks in infants and young children -Results of the French infant total diet study. Environment International, Elsevier, 2020, 137, ⟨10.1016/j.envint.2020.105529⟩. ⟨hal-02556953⟩
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Deborah Martin, Fiona Lobo, Gwenaëlle Lavison-Bompard, Thierry Guérin, Julien Parinet. Effect of home cooking processes on chlordecone content in beef and investigation of its by-products and metabolites by HPLC-HRMS/MS. Environment International, Elsevier, 2020, 144, pp.106077. ⟨10.1016/j.envint.2020.106077⟩. ⟨hal-03158198⟩
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Rodney J. Feliciano, Geraldine Boue, Jeanne-Marie Membré. Overview of the Potential Impacts of Climate Change on the Microbial Safety of the Dairy Industry. Foods, 2020, 9 (12), pp.1-20. ⟨10.3390/foods9121794⟩. ⟨hal-03219600⟩
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Win Cowger, Andy Booth, Bonnie Hamilton, Clara Thaysen, Sebastian Primpke, et al.. Reporting Guidelines to Increase the Reproducibility and Comparability of Research on Microplastics. Applied Spectroscopy, Society for Applied Spectroscopy, 2020, 74 (9), pp.1066-1077. ⟨10.1177/0003702820930292⟩. ⟨anses-02915486⟩
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Vincent Hort, Nathalie Arnich, Thierry Guérin, Gwenaëlle Lavison-Bompard, Marina Nicolas. First Detection of Tetrodotoxin in Bivalves and Gastropods from the French Mainland Coasts. Toxins, MDPI, 2020, 12 (9), pp.599. ⟨10.3390/toxins12090599⟩. ⟨anses-02965280⟩
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Ronel Biré, Thomas Bertin, Inès Dom, Vincent Hort, Corinne Schmitt, et al.. First Evidence of the Presence of Anatoxin-A in Sea Figs Associated with Human Food Poisonings in France. Marine drugs, MDPI, 2020, 18 (6), pp.285. ⟨10.3390/md18060285⟩. ⟨anses-02965306⟩
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Mathilde Gondard, Sabine Delannoy, Valérie Pinarello, Rosalie Aprelon, Elodie Devillers, et al.. Upscaling the Surveillance of Tick-borne Pathogens in the French Caribbean Islands.. Pathogens, MDPI, 2020, 9 (3), ⟨10.3390/pathogens9030176⟩. ⟨hal-02555967⟩
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Vincent Hort, Marina Nicolas, Angélique Travel, Catherine Jondreville, Corentin Maleix, et al.. Carry-over assessment of fumonisins and zearalenone to poultry tissues after exposure of chickens to a contaminated diet – A study implementing stable-isotope dilution assay and UHPLC-MS/MS. Food Control, Elsevier, 2020, 107, pp.106789. ⟨10.1016/j.foodcont.2019.106789⟩. ⟨hal-02624954⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02624954/file/S0956713519303780.pdf BibTex
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Thomas Brauge, Lena Barre, Guylaine Leleu, Stéphane André, Catherine C. Denis, et al.. European survey and evaluation of sampling methods recommended by the standard EN ISO 18593 for the detection of Listeria monocytogenes and Pseudomonas fluorescens on industrial surfaces. FEMS Microbiology Letters, Wiley-Blackwell, 2020, 367 (7), pp.fnaa057. ⟨10.1093/femsle/fnaa057⟩. ⟨hal-02620313⟩
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Victor R Merino, Viviane Nakano, Sabine Delannoy, Patrick Fach, Gabriela G F Alberca, et al.. Prevalence of Enteropathogens and Virulence Traits in Brazilian Children With and Without Diarrhea. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, Frontiers, 2020, 10, ⟨10.3389/fcimb.2020.549919⟩. ⟨anses-03715607⟩
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https://hal-anses.archives-ouvertes.fr/anses-03715607/file/fcimb-10-549919.pdf BibTex
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Luc Ingenbleek, Philippe Verger, Marie-Madeleine Gimou, Abimbola Adegboye, Samson Adebayo, et al.. Human dietary exposure to chemicals in sub-Saharan Africa: safety assessment through a total diet study. Lancet Planetary Health , Elsevier, 2020, 4 (7), pp.e292-e300. ⟨10.1016/S2542-5196(20)30104-2⟩. ⟨hal-03192464⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03192464/file/1-s2.0-S2542519620301042-main.pdf BibTex
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J. Dupouy-Camet, M. Gay, R. Houin. New eating habits, new parasitic risks: The example of fish. Bulletin de l'Académie Nationale de Médecine, Elsevier Masson, 2020, 204, pp.1010 - 1016. ⟨10.1016/j.banm.2020.10.003⟩. ⟨hal-03493357⟩
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Yann Sévellec, Sophie Granier, Simon Le Hello, François-Xavier Weill, Laurent Guillier, et al.. Source Attribution Study of Sporadic Salmonella Derby Cases in France. Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2020, 11, pp.889. ⟨10.3389/fmicb.2020.00889⟩. ⟨anses-02799393⟩
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Marie Noel Mansour, Joseph Yaghi, André El Khoury, Arnaud Felten, Michel-Yves Mistou, et al.. Prediction of Salmonella serovars isolated from clinical and food matrices in Lebanon and genomic-based investigation focusing on Enteritidis serovar. International Journal of Food Microbiology, Elsevier, 2020, 333, pp.108831. ⟨10.1016/j.ijfoodmicro.2020.108831⟩. ⟨hal-03491405⟩
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Catherine Hennechart-Collette, Sandra Martin-Latil, Audrey Fraisse, Florian Niveau, Sylvie Perelle. Virological analyses in collective catering outbreaks in France between 2012 and 2017. Food Microbiology, Elsevier, 2020, 91, pp.103546. ⟨10.1016/j.fm.2020.103546⟩. ⟨anses-03479112⟩
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Laurent Guillier, Sandra Martin-Latil, Estelle Chaix, Anne Thébault, Nicole Pavio, et al.. Modelling the inactivation of viruses from the Coronaviridae family in response to temperature and relative humidity in suspensions or surfaces.. Applied and Environmental Microbiology, American Society for Microbiology, 2020, ⟨10.1128/AEM.01244-20⟩. ⟨pasteur-02908234⟩
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https://hal-pasteur.archives-ouvertes.fr/pasteur-02908234/file/2020-Guillier-AEM.01244-20.full.pdf BibTex
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Maria Kazour, Sharif Jemaa, Maria El Rakwe, Guillaume Duflos, Ludovic Hermabassiere, et al.. Juvenile fish caging as a tool for assessing microplastics contamination in estuarine fish nursery grounds. Environmental Science and Pollution Research, Springer Verlag, 2020, 27 (4), pp.3548-3559. ⟨10.1007/s11356-018-3345-8⟩. ⟨hal-02568667⟩
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Ludovic Hermabessiere, Justine Receveur, Charlotte Himber, David Mazurais, Arnaud Huvet, et al.. An Irgafos® 168 story: when the ubiquity of an additive prevents studying its leaching from plastics. Science of the Total Environment, Elsevier, 2020, 749, pp.141651. ⟨10.1016/j.scitotenv.2020.141651⟩. ⟨anses-02915461⟩
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https://hal-anses.archives-ouvertes.fr/anses-02915461/file/Hermabessiere%20et%20al%202020.pdf BibTex
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Catherine Hennechart-Collette, Océane Dehan, Audrey Fraisse, Sandra Martin-Latil, Sylvie Perelle. Evaluation of three different filters and two methods for recovering viruses from drinking water. Journal of Virological Methods, Elsevier, 2020, 284, pp.113939. ⟨10.1016/j.jviromet.2020.113939⟩. ⟨anses-03479091⟩
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Federica Palma, Thomas Brauge, Nicolas Radomski, Ludovic Mallet, Arnaud Felten, et al.. Dynamics of mobile genetic elements of Listeria monocytogenes persisting in ready-to-eat seafood processing plants in France. BMC Genomics, BioMed Central, 2020, 21 (1), ⟨10.1186/s12864-020-6544-x⟩. ⟨hal-02913857⟩
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Nathalie Arnich, Eric Abadie, Nicolas Delcourt, Valérie Fessard, Jean-Marc Fremy, et al.. Health risk assessment related to pinnatoxins in French shellfish. Toxicon, Elsevier, 2020, 180, pp.1-10. ⟨10.1016/j.toxicon.2020.03.007⟩. ⟨anses-02861821⟩
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https://hal-anses.archives-ouvertes.fr/anses-02861821/file/S0041010120300982.pdf BibTex
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Luen-Luen Li, Rachid Amara, Sami Souissi, Alexandre Dehaut, Guillaume Duflos, et al.. Impacts of microplastics exposure on mussel (Mytilus edulis) gut microbiota. Science of the Total Environment, Elsevier, 2020, 745, pp.141018. ⟨10.1016/j.scitotenv.2020.141018⟩. ⟨anses-03137792⟩
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Book sections

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Alexandre Dehaut, Ludovic Hermabessiere, Guillaume Duflos. Microplastics Detection Using Pyrolysis-GC/MS-Based Methods. Rocha-Santos T., Costa M., Mouneyrac C. Handbook of Microplastics in the Environment, Springer International Publishing, pp.1-35, 2020, 978-3-030-39040-2. ⟨10.1007/978-3-030-10618-8_27-1⟩. ⟨anses-03137833⟩
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Poster communications

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Renaud Lailler, Choreh C. Farrokh, Sophie Carles, Céline Dupuy, Hélène Amar. A new French organization based on multi-partner platforms for a more efficient and integrated surveillance on the food chain: a two year's experience on Salmonella. 6th World One Health Congress, Oct 2020, Edinburgh, United Kingdom. The 6th World One Health Congress, virtual edition (30 October -3 November 2020), 2020. ⟨anses-03007544⟩
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Reports

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Bruno Le Bizec, Fabrice Nesslany, Karine Tack, Claude Atgie, Pierre Marie Badot, et al.. Avis de l'Anses relatif à la teneur maximale en cadmium pour les algues destinées à l'alimentation humaine. [Autre] Saisine n° 2017-SA-0070, 2020, pp.61. ⟨anses-03345144⟩
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2019

Journal articles

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Nicolas Radomski, Sabrina Cadel-Six, Emeline Cherchame, Arnaud Felten, Pauline Barbet, et al.. A Simple and Robust Statistical Method to Define Genetic Relatedness of Samples Related to Outbreaks at the Genomic Scale – Application to Retrospective Salmonella Foodborne Outbreak Investigations. Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2019, 10, pp.2413. ⟨10.3389/fmicb.2019.02413⟩. ⟨pasteur-02481757⟩
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https://hal-pasteur.archives-ouvertes.fr/pasteur-02481757/file/A%20simple%20and%20robust%20statistical%20method%20to%20define%20genetic%20relatedness%20of%20samples%20related%20to%20outbreaks%20at%20the%20genomic%20scale%20-%20Application%20to%20retrospective%20Salmonella%20foodborne%20outbreak%20investigations..pdf BibTex
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K. Laroucau, F. Vorimore, R. Aaziz, L. Solmonson, R.C. Hsia, et al.. Chlamydia buteonis, a new Chlamydia species isolated from a red-shouldered hawk. Systematic and Applied Microbiology, Elsevier, 2019, 42, pp.125997 -. ⟨10.1016/j.syapm.2019.06.002⟩. ⟨hal-03487805⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03487805/file/S0723202019300438.pdf BibTex
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Méryl Vila Nova, Kévin Durimel, Kévin La, Arnaud Felten, Philippe Bessieres, et al.. Genetic and metabolic signatures of Salmonella enterica subsp. enterica associated with animal sources at the pangenomic scale. BMC Genomics, BioMed Central, 2019, 20 (1), ⟨10.1186/s12864-019-6188-x⟩. ⟨hal-02392205⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02392205/file/2019_VilaNova_BMC%20GENOMICS.pdf BibTex
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Julia Mougin, Stéphanie Copin, Daline Bojolly, Virginie Raguenet, Annick Robert-Pillot, et al.. Adhesion to stainless steel surfaces and detection of viable but non cultivable cells of Vibrio parahaemolyticus and Vibrio cholerae isolated from shrimps in seafood processing environments: Stayin' alive?. Food Control, Elsevier, 2019, 102, pp.122-130. ⟨10.1016/j.foodcont.2019.03.024⟩. ⟨hal-02620700⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02620700/file/S0956713519301239.pdf BibTex
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Bo-Hyung Lee, Dominique Garmyn, Laurent Gal, Cyprien Guerin Guérin, Laurent Guillier, et al.. Exploring Listeria monocytogenes transcriptomes in correlation with divergence of lineages and virulence as measured in Galleria mellonella. Applied and Environmental Microbiology, American Society for Microbiology, 2019, 85 (21), ⟨10.1128/AEM.01370-19⟩. ⟨hal-02296269⟩
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Catherine Hennechart-Collette, Florian Niveau, Sandra Martin-Latil, A. Fraisse, Sylvie Perelle. Development of an extraction method to detect enteric viruses in dressed vegetables. International Journal of Food Microbiology, Elsevier, 2019, 311, pp.108349 -. ⟨10.1016/j.ijfoodmicro.2019.108349⟩. ⟨hal-03488623⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03488623/file/S016816051930279X.pdf BibTex