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Polly G Hill, Isabelle Mary, Da Purdie, Mv Zubkov. Similarity in microbial amino acid uptake in surface waters of the North and South Atlantic (sub-)tropical gyres. Progress in Oceanography, Elsevier, 2011, 91 (4), pp.437-446. 〈hal-00841497〉
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Cyril Vidau, Hicham El Alaoui, David Georges Biron, Frédéric Delbac. Mais où sont passées les abeilles ?. Biofutur, Elsevier - Cachan : Lavoisier, 2011, 327, pp.56-59. 〈hal-00825319〉
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Olga Savichtcheva, Didier Debroas, Rainer Kurmayer, Clement Villar, Jean-Philippe Jenny, et al.. Quantitative PCR enumeration of total/toxic Planktothrix rubescens and total cyanobacteria in preserved DNA isolated from lake sediments.. Applied and Environmental Microbiology, American Society for Microbiology, 2011, 77 (24), pp.8744-53. 〈10.1128/AEM.06106-11〉. 〈hal-00840945〉
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Simon Roux, François Enault, Gisèle Bronner, Didier Debroas. Comparison of 16S rRNA and protein-coding genes as molecular markers for assessing microbial diversity (Bacteria and Archaea) in ecosystems.. FEMS Microbiology Ecology, Wiley-Blackwell, 2011, 78 (3), pp.617-28. 〈10.1111/j.1574-6941.2011.01190.x〉. 〈hal-00840983〉
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Maarten Bekaert, Jean-Francois Timsit, Stijn Vansteelandt, Pieter Depuydt, Aurélien Vésin, et al.. Attributable mortality of ventilator-associated pneumonia: a reappraisal using causal analysis.. American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine, American Thoracic Society, 2011, 184 (10), pp.1133-9. 〈10.1164/rccm.201105-0867OC〉. 〈hal-00841199〉
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Simon Roux, Michaël Faubladier, Antoine Mahul, Nils Paulhe, Aurélien Bernard, et al.. Metavir: a web server dedicated to virome analysis.. Bioinformatics, Oxford University Press (OUP), 2011, 27 (21), pp.3074-5. 〈10.1093/bioinformatics/btr519〉. 〈hal-00841495〉
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Delphine Boucher, Jean Baptiste Laffaire, Faouzi Jaziri, Christine David, Corinne Biderre-Petit, et al.. Bacterial community composition of biological degreasing systems and health risk assessment for workers.. Microbial Ecology, Springer Verlag, 2011, 62 (4), pp.868-81. 〈10.1007/s00248-011-9887-7〉. 〈hal-00842850〉
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Guillaume Borrel, Didier Jézéquel, Corinne Biderre-Petit, Nicole Morel-Desrosiers, Jean-Pierre Morel, et al.. Production and consumption of methane in freshwater lake ecosystems.. Research in Microbiology, Elsevier, 2011, 162 (9), pp.832-47. 〈10.1016/j.resmic.2011.06.004〉. 〈hal-00823217〉
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Regis Cereghino, Celine Leroy, Jean-François Carrias, Laurent Pelozuelo, Caroline Segura, et al.. Ant-plant mutualisms promote functional diversity in phytotelm communities. Functional Ecology, Wiley, 2011, 25 (5), pp.954-963. 〈hal-00817509〉
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Benjamin Misson, Marion Sabart, Christian Amblard, Delphine Latour. Benthic survival of Microcystis: Long-term viability and ability to transcribe microcystin genes. Harmful Algae, Elsevier, 2011, 13, pp.20-25. 〈hal-00848693〉
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Sandrine Demanèche, Jean-Michel Monier, Eric Dugat-Bony, Pascal Simonet. Exploration of horizontal gene transfer between transplastomic tobacco and plant-associated bacteria. FEMS Microbiology Ecology, Wiley-Blackwell, 2011, 78 (1), pp.129-136. 〈10.1111/j.1574-6941.2011.01126.x〉. 〈hal-00630134〉
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Corinne Biderre-Petit, Didier Jézéquel, Eric Dugat-Bony, Filipa Lopes, Jan Kuever, et al.. Identification of microbial communities involved in the methane cycle of a freshwater meromictic lake.. FEMS Microbiology Ecology, Wiley-Blackwell, 2011, 77 (3), pp.533-45. 〈10.1111/j.1574-6941.2011.01134.x〉. 〈hal-00842871〉
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Bushra Parveen, Jean-Philippe Reveilliez, Isabelle Mary, Viviane Ravet, Gisèle Bronner, et al.. Diversity and dynamics of free-living and particle-associated Betaproteobacteria and Actinobacteria in relation to phytoplankton and zooplankton communities.. FEMS Microbiology Ecology, Wiley-Blackwell, 2011, 77 (3), pp.461-76. 〈10.1111/j.1574-6941.2011.01130.x〉. 〈hal-00841014〉
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Dionigia Meloni, Giovanna Sanciu, Philippe Poirier, Hicham El Alaoui, Magali Chabé, et al.. Molecular subtyping of Blastocystis sp. isolates from symptomatic patients in Italy.. Parasitology Research, Springer Verlag (Germany), 2011, 109 (3), pp.613-9. 〈10.1007/s00436-011-2294-7〉. 〈hal-00825442〉
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Alexandre Lautrette, Carole Schwebel, Didier Gruson, R. W. Talbot, Jean-François Timsit, et al.. Transfer of take-home messages in graduate ICU education.. Intensive Care Med, 2011, 37 (8), pp.1323-30. 〈10.1007/s00134-011-2256-7〉. 〈hal-00842126〉
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Nicolas Blot, Daniella Mella-Flores, Christophe Six, Gildas Le Corguillé, Christophe Boutte, et al.. Light history influences the response of the marine cyanobacterium Synechococcus sp. WH7803 to oxidative stress.. Plant Physiology, American Society of Plant Biologists, 2011, 156 (4), pp.1934-54. 〈10.1104/pp.111.174714〉. 〈hal-00825364〉
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Jean-Ralph Zahar, Jean-Francois Timsit, Maïté Garrouste-Orgeas, Adrien Français, Aurélien Vesin, et al.. Outcomes in severe sepsis and patients with septic shock: pathogen species and infection sites are not associated with mortality.. Critical Care Medicine, Lippincott, Williams & Wilkins, 2011, 39 (8), pp.1886-95. 〈10.1097/CCM.0b013e31821b827c〉. 〈hal-00841190〉
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Valerie Polonais, Michael Shea, Dominique Soldati-Favre. Toxoplasma gondii aspartic protease 1 is not essential in tachyzoites.. Experimental Parasitology, Elsevier, 2011, 128 (4), pp.454-9. 〈10.1016/j.exppara.2011.05.003〉. 〈hal-00820561〉
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M. Bouvy, Y. Bettarel, C. Bouvier, I. Domaizon, S. Jacquet, et al.. Trophic interactions between viruses, bacteria and nanoflagellates under various nutrient conditions and simulated climate change.. Environmental Microbiology, Wiley-Blackwell, 2011, 13 (7), pp.1842-57. 〈10.1111/j.1462-2920.2011.02498.x〉. 〈hal-00819823〉
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Angia Sriram Pradeep Ram, S. Rasconi, M. Jobard, S. Palesse, J. Colombet, et al.. High Lytic Infection Rates but Low Abundances of Prokaryote Viruses in a Humic Lake (Vassivie're, Massif Central, France). Applied and Environmental Microbiology, American Society for Microbiology, 2011, 77 (16), pp.5610-5618. 〈hal-00787191〉
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Natacha Mrozek, Alexandre Lautrette, Claire Aumeran, Henri Laurichesse, Christiane Forestier, et al.. Bloodstream infection after positive catheter cultures: what are the risks in the intensive care unit when catheters are routinely cultured on removal?. Critical Care Medicine, Lippincott, Williams & Wilkins, 2011, 39 (6), pp.1301-5. 〈10.1097/CCM.0b013e3182120190〉. 〈hal-00842131〉
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Cécile Lepère, Mikihide Demura, Masanobu Kawachi, Sarah Romac, Ian Probert, et al.. Whole-genome amplification (WGA) of marine photosynthetic eukaryote populations.. FEMS Microbiology Ecology, Wiley-Blackwell, 2011, 76 (3), pp.513-23. 〈10.1111/j.1574-6941.2011.01072.x〉. 〈hal-00848702〉
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A.-E. Heng, M. H. Abdelkader, M. Diaconita, A. Nony, A. Guerraoui, et al.. Impact of short term use of interdialytic 60% ethanol lock solution on tunneled silicone catheter dysfunction.. Clinical Nephrology, Dustri-Verlag, 2011, 75 (6), pp.534-41. 〈hal-00841494〉
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Hélène Masclaux, Alexandre Bec, Maiko Kagami, Marie-Elodie Perga, Télesphore Sime-Ngando, et al.. Food quality of anemophilous plant pollen for zooplankton. Limnology and Oceanography, Association for the Sciences of Limnology and Oceanography, 2011, 56 (3), pp.939-946. 〈hal-00820085〉
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Stéphan Jacquet, Isabelle Domaizon, Sylvie Masquelier, Cécile Lepère, Laure Guillou, et al.. Virus, bactéries et protistes pathogènes du phytoplancton, le rôle insoupçonné des parasites dans le fonctionnement des écosystèmes aquatiques. Le Courrier de l'environnement de l'INRA, Paris : Institut national de la recherche agronomique Délégation permanente à l'environnement, 2011, 60 (60), pp.37-50. 〈hal-01196814〉
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Yvan Bettarel, Thierry Bouvier, Corinne Bouvier, Claire Carré, Anne Desnues, et al.. Ecological traits of planktonic viruses and prokaryotes along a full-salinity gradient.. FEMS Microbiology Ecology, Wiley-Blackwell, 2011, 76 (2), pp.360-72. 〈10.1111/j.1574-6941.2011.01054.x〉. 〈hal-00820091〉
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Delphine Gourcilleau, Catherine Lenne, Claudia Armenise, Bruno Moulia, Jean-Louis Julien, et al.. Phylogenetic study of plant Q-type C2H2 zinc finger proteins and expression analysis of poplar genes in response to osmotic, cold and mechanical stresses.. DNA Research, Oxford University Press (OUP), 2011, 18 (2), pp.77-92. 〈10.1093/dnares/dsr001〉. 〈hal-00842840〉
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France Denoeud, Michaël Roussel, Benjamin Noel, Ivan Wawrzyniak, Corinne Da Silva, et al.. Genome sequence of the stramenopile Blastocystis, a human anaerobic parasite.. Genome Biology, BioMed Central, 2011, 12 (3), pp.R29. 〈10.1186/gb-2011-12-3-r29〉. 〈inserm-00617212〉
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Julien Pisson, Nicole Morel-Desrosiers, Jean-Pierre Morel, André De Roy, Fabrice Leroux, et al.. Tracking the Structural Dynamics of Hybrid Layered Double Hydroxides. Chemistry of Materials, American Chemical Society, 2011, 23 (6), pp.1482-1490. 〈hal-00823208〉
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Eric Dugat-Bony, Mohieddine Missaoui, Eric Peyretaillade, Corinne Biderre-Petit, Ourdia Bouzid, et al.. HiSpOD: probe design for functional DNA microarrays.. Bioinformatics, Oxford University Press (OUP), 2011, 27 (5), pp.641-8. 〈10.1093/bioinformatics/btq712〉. 〈hal-00842882〉
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Rozenn Thomas, Lyria Berdjeb, Télesphore Sime-Ngando, Stéphan Jacquet. Viral abundance, production, decay rates and life strategies (lysogeny versus lysis) in Lake Bourget (France).. Environmental Microbiology, Wiley-Blackwell, 2011, 13 (3), pp.616-30. 〈10.1111/j.1462-2920.2010.02364.x〉. 〈hal-00820093〉
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Gauthier Dobigny, Philippe Poirier, Karmadine Hima, Odile Cabaret, Philippe Gauthier, et al.. Molecular survey of rodent-borne Trypanosoma in Niger with special emphasis on T. lewisi imported by invasive black rats. Acta Tropica, Elsevier, 2011, 117 (3), pp.21126503. 〈10.1016/j.actatropica.2010.11.004〉. 〈hal-01113935〉
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Valérie Polonais, Bernardo Javier Foth, Krishna Chinthalapudi, Jean-Baptiste Marq, Dietmar J Manstein, et al.. Unusual anchor of a motor complex (MyoD-MLC2) to the plasma membrane of Toxoplasma gondii.. Traffic, Wiley, 2011, 12 (3), pp.287-300. 〈10.1111/j.1600-0854.2010.01148.x〉. 〈hal-00820570〉
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Philippe Poirier, Ivan Wawrzyniak, Aurélie Albert, Hicham El Alaoui, Frédéric Delbac, et al.. Development and evaluation of a real-time PCR assay for detection and quantification of blastocystis parasites in human stool samples: prospective study of patients with hematological malignancies.. Journal of Clinical Microbiology, American Society for Microbiology, 2011, 49 (3), pp.975-83. 〈10.1128/JCM.01392-10〉. 〈hal-00825471〉
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Tsuneo Tanaka, T. F. Thingstad, Urania Christaki, J. Colombet, Véronique Cornet-Barthaux, et al.. Lack-of P-limitation of phytoplankton and heterotrophic prokaryotes in surface waters of three anticyclonic eddies in the stratified Mediterranean Sea. Biogeosciences, European Geosciences Union, 2011, 8, pp.525-538. 〈10.5194/bg-8-525-2011〉. 〈hal-00573163〉
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E. Feschet-Chassot, V. Raspal, Y. Sibaud, Ok Awitor, Frédérique Bonnemoy, et al.. Tunable functionality and toxicity studies of titanium dioxide nanotube layers. Thin Solid Films, Elsevier, 2011, 519 (8), pp.2564-2568. 〈hal-00830577〉
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Corinne Biderre-Petit, Delphine Boucher, Jan Kuever, Patrick Albéric, Didier Jézéquel, et al.. Identification of sulfur-cycle prokaryotes in a low-sulfate lake (Lake Pavin) using aprA and 16S rRNA gene markers.. Microbial Ecology, Springer Verlag, 2011, 61 (2), pp.313-27. 〈10.1007/s00248-010-9769-4〉. 〈hal-00842948〉
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Benjamin Misson, Marion Sabart, Christian Amblard, Delphine Latour. INVOLVEMENT OF MICROCYSTINS AND COLONY SIZE IN THE BENTHIC RECRUITMENT OF THE CYANOBACTERIUM MICROCYSTIS (CYANOPHYCEAE)1. European Journal of Phycology, Taylor & Francis, 2011, 47 (1), pp.42 - 51. 〈10.1111/j.1529-8817.2010.00943.x〉. 〈hal-01826049〉
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Urania Christaki, F. Van Wambeke, D. Lefevre, A. Lagaria, L. Prieur, et al.. Impact of anticyclonic mesoscale features on the Mediterranean Sea's microbial food web.. Biogeosciences Discussions, European Geosciences Union, 2011, 8, pp.185-220. 〈10.5194/bgd-8-185-2011〉. 〈hal-00757865〉
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Jaroslaw Wiszniowski, Alexandra Ter Halle, Claire Richard, Frédérique Bonnemoy, Jacques Bohatier. TOXICITY OF SULCOTRIONE PHOTOPRODUCTS MIXTURE TOWARDS VIBRIO FISCHERI IN THE AQUATIC ENVIRONMENT. Archives of Environmental Protection, 2011, 37 (4), pp.15-23. 〈hal-00830581〉
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S. Fleutot, Hervé Martinez, Jean-Charles Dupin, Isabelle Baraille, C. Forano, et al.. Experimental (X-Ray Photoelectron Spectroscopy) and theoretical studies of benzene based organics intercalated into layered double hydroxide. Solid State Sci., 2011, 13 (9), pp.1676--1686. 〈10.1016/j.solidstatesciences.2011.05.007〉. 〈hal-01503978〉
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Benjamin Misson, Marion Sabart, Christian Amblard, Delphine Latour. Involvement of microcystins and colony size in the benthic recruitment of the cyanobacterium Microcystis (Cyanophyceae).. Journal of Phycology, Wiley, 2011, 47 (1), pp.42-51. 〈hal-00820324〉
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Télesphore Sime-Ngando, Nathalie Niquil. Editorial: 'Disregarded' microbial diversity and ecological potentials in aquatic systems: a new paradigm shift ahead. Hydrobiologia, Springer, 2011, 659, pp.1-4. 〈hal-00825304〉
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Télesphore Sime-Ngando, Nathalie Niquil. Editorial: 'Disregarded' microbial diversity and ecological potentials in aquatic systems: a new paradigm shift ahead. Hydrobiologia, Springer, 2011, 659 (1), pp.1-4. 〈hal-00820220〉
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P.G. Hill, Isabelle Mary, D.A. Purdie, M.V. Zubkov. Similarity in microbial amino acid uptake in surface waters of the North and South Atlantic (sub-)tropical gyres.. Progress in Oceanography, Elsevier, 2011, 91 (4), pp.437-446. 〈hal-00842135〉
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Eric Peyretaillade, Hicham El Alaoui, Marie Diogon, Valérie Polonais, Nicolas Parisot, et al.. Extreme reduction and compaction of microsporidian genomes.. Research in Microbiology, Elsevier, 2011, 162 (6), pp.598-606. 〈10.1016/j.resmic.2011.03.004〉. 〈hal-00814808〉
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Cyril Vidau, Marie Diogon, Julie Aufauvre, Régis Fontbonne, Bernard Viguès, et al.. Déclin des colonies d'abeilles et origine multifactorielle : cas de Nosema ceranae et des insecticides. La santé de l'abeille, 2011, 245 (9-10), pp.417-426. 〈hal-01115873v2〉
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Fleur Ponton, Fernando Otálora-Luna, Thierry Lefèvre, Patrick M Guerin, Camille Lebarbenchon, et al.. Water-seeking behavior in worm-infected crickets and reversibility of parasitic manipulation.. Behavioral Ecology, Oxford University Press (OUP), 2011, 22 (2), pp.392-400. 〈10.1093/beheco/arq215〉. 〈hal-00814753〉
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Julien Pisson, Nicole Morel-Desrosiers, Jean-Pierre Morel, André De Roy, Fabrice Leroux, et al.. Toward a better understanding of hybrid LDH interlayer structure and dynamics. Chemistry of Materials, American Chemical Society, 2011, 23, pp.1482-1490. 〈hal-00477687〉
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Emmanuel Canet, David Osman, Jérome Lambert, Christophe Guitton, Anne-Elisabeth Heng, et al.. Acute respiratory failure in kidney transplant recipients: a multicenter study.. Critical Care, BioMed Central, 2011, 15 (2), pp.R91. 〈10.1186/cc10091〉. 〈hal-00841211〉
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Boutheina Grami, Serena Rasconi, Nathalie Niquil, Marlène Jobard, Blanche Saint-Béat, et al.. Functional effects of parasites on food web properties during the spring diatom bloom in Lake Pavin: a linear inverse modeling analysis.. PLoS ONE, Public Library of Science, 2011, 6 (8), pp.e23273. 〈10.1371/journal.pone.0023273〉. 〈hal-00819808〉
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Xiao Li Shi, Cécile Lepère, David J Scanlan, Daniel Vaulot. Plastid 16S rRNA gene diversity among eukaryotic picophytoplankton sorted by flow cytometry from the South Pacific Ocean.. PLoS ONE, Public Library of Science, 2011, 6 (4), pp.e18979. 〈10.1371/journal.pone.0018979〉. 〈hal-00848706〉
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Cyril Vidau, Marie Diogon, Julie Aufauvre, Régis Fontbonne, Bernard Viguès, et al.. Exposure to sublethal doses of fipronil and thiacloprid highly increases mortality of honeybees previously infected by Nosema ceranae.. PLoS ONE, Public Library of Science, 2011, 6 (6), pp.e21550. 〈10.1371/journal.pone.0021550〉. 〈hal-00814778〉
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Bertrand Evrard, Sophie Coudeyras, Annie Dosgilbert, Nicolas Charbonnel, Josette Alamé, et al.. Dose-dependent immunomodulation of human dendritic cells by the probiotic Lactobacillus rhamnosus Lcr35. PLoS ONE, Public Library of Science, 2011, 6 (4), pp.e18735. 〈10.1371/journal.pone.0018735〉. 〈hal-00841317〉
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00841317/file/Evrard2011_Dose.pdf BibTex
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Kevin B Laupland, Benoit Misset, Bertrand Souweine, Alexis Tabah, Elie Azoulay, et al.. Mortality associated with timing of admission to and discharge from ICU: a retrospective cohort study.. BMC Health Services Research, BioMed Central, 2011, 11, pp.321. 〈10.1186/1472-6963-11-321〉. 〈hal-00842124〉
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Alain Dejean, Bruno Corbara, Céline Leroy, Jacques H C Delabie, Vivien Rossi, et al.. Inherited biotic protection in a neotropical pioneer plant.. PLoS ONE, Public Library of Science, 2011, 6 (3), pp.e18071. 〈10.1371/journal.pone.0018071〉. 〈hal-00825845〉
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00825845/file/Dejean2011_Inherited.pdf BibTex
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Olivier Brouard, Anne-Hélène Le Jeune, Céline Leroy, Régis Cereghino, Olivier Roux, et al.. Are algae relevant to the detritus-based food web in tank-bromeliads?. PLoS ONE, Public Library of Science, 2011, 6 (5), pp.e20129. 〈10.1371/journal.pone.0020129〉. 〈hal-00819161〉
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Céline Leroy, Nathalie Séjalon-Delmas, Alain Jauneau, Mario-Xavier Ruiz-Gonzalez, Hervé Gryta, et al.. Trophic mediation by a fungus in an ant-plant mutualism. Journal of Ecology, Wiley, 2011, 99, pp.583-590. 〈hal-00818792〉
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Jean-François Carrias, Céline Leroy, Régis Céréghino, Anne-Catherine Lehours, Laurent Pélozuelo, et al.. Des plantes tropicales qui forment des mares : les broméliacées-citerne Un écosystème aquatique miniature capital pour la biodiversité. Le Courrier de la Nature, Société nationale de protection de la nature (France), 2011, 261, pp.20-27. 〈hal-00849049〉
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Christian Jeanthon, Dominique Boeuf, Océane Dahan, Florence Le Gall, Laurence Garczarek, et al.. Diversity of cultivated and metabolically active aerobic anoxygenic phototrophic bacteria along an oligotrophic gradient in the Mediterranean Sea. Biogeosciences, European Geosciences Union, 2011, 8 (7), pp.1955-1970. 〈10.5194/bg-8-1955-2011〉. 〈hal-01218510〉
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01218510/file/bg-8-1955-2011.pdf BibTex
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Alain Dejean, Régis Céréghino, James M Carpenter, Bruno Corbara, Bruno Hérault, et al.. Climate change impact on neotropical social wasps.. PLoS ONE, Public Library of Science, 2011, 6 (11), pp.e27004. 〈10.1371/journal.pone.0027004〉. 〈hal-00825825〉
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00825825/file/Dejean2011_Climate.pdf BibTex
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F. Lopes, Eric Viollier, A. Thiam, Gil Michard, G. Abril, et al.. Biogeochemical modelling of anaerobic vs. aerobic methane oxidation in a meromictic crater lake (Lake Pavin, France). Applied Geochemistry, Elsevier, 2011, 26, pp.1919-1932. 〈10.1016/j.apgeochem.2011.06.021〉. 〈insu-00651276〉
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https://hal-insu.archives-ouvertes.fr/insu-00651276/file/Lopes-AppliedGeochemistry-2011.pdf BibTex
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Frank H Gleason, Frithjof C Kuepper, James P Amon, Kathryn Picard, Claire M M Gachon, et al.. Zoosporic true fungi in marine ecosystems: a review. Marine and Freshwater Research, CSIRO Publishing, 2011, 62 (4), pp.383-393. 〈hal-00820103〉
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C. Leroy, N. Séjalon-Delmas, A. Jauneau, M.X. Ruiz-Gonzalez, H. Gryta, et al.. Trophic mediation by a fungus in an ant-plant mutualism. Journal of Ecology, Wiley, 2011, 99, pp.583-590. 〈hal-00598276〉
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Communication dans un congrès

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Faouzi Jaziri, Sébastien Cipière, Mohieddine Missaoui, Denonfoux Jérémie, Eric Dugat-Bony, et al.. Détermination de sondes oligonucléotidiques pour biopuces phylogénétiques en environnement grille de calcul. Rencontres Scientifiques France Grilles 2011, Sep 2011, Lyon, France. 〈hal-00658712〉
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00658712/file/Determination_de_sondes_oligonucleotidiques_pour_biopuces_phylogenetiques_en_environnement_grille_de_calcul.pdf BibTex
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Trung-Tung Doan, Hong Quang Nguyen, Najwa Taib, Jean-Christophe Charvy, Gisèle Bronner, et al.. Portage de ePANAM sur la grille de calcul. Rencontres Scientifiques France Grilles 2011, Sep 2011, Lyon, France. 〈hal-00660147〉
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00660147/file/rencontre_sciFG_epanam_final.pdf BibTex

Chapitre d'ouvrage

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D. Debroas, F. Enault, Isabelle Jouan-Dufournel, G. Bronner, Jean-François Humbert. Metagenomic approach studying the taxonomic and functional diversity of the bacterial community in lakes. Frans J. de Bruijn. Handbook of Molecular Microbial Ecology II: Metagenomics in Different Habitats, Jon Wiley and Sons Publishers, pp.287-293, 2011. 〈bioemco-00640523〉
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Dg Biron, D Nedelkov, D Missée, P Holzmuller. Proteomics and Host Pathogen Interactions: A Bright Future?. Genetics and Evolution of Infectious Diseases, 2011. 〈hal-01115245〉
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Philippe Cuny, Cristiana Cravo-Laureau, Vincent Grossi, Franck Gilbert, Cécile Militon. Biodegradation of Hydrocarbons in Bioturbated Marine Sediments. Koukkou, Anna-Irini. MICROBIAL BIOREMEDIATION OF NON-METALS: CURRENT RESEARCH, Caister Academic Press, pp.55-92, 2011. 〈hal-00657077〉
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Thèse

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Guillaume Borrel. Diversité des archées et implication de la composante procaryote dans le cycle biogéochimique du méthane en milieu aquatique continental : études taxonomiques et fonctionnelles dans la colonne d'eau et les sédiments anoxiques du lac Pavin. Sciences agricoles. Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand II, 2011. Français. 〈NNT : 2011CLF22176〉. 〈tel-00932300〉
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00932300/file/BORREL_2011CLF22176.pdf BibTex
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Eric Dugat-Bony. Caractérisation des capacités métaboliques des populations microbiennes impliquées dans les processus de bioremédiation des chloroéthènes par des approches moléculaires haut débit : les biopuces ADN fonctionnelles. Sciences agricoles. Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand II, 2011. Français. 〈NNT : 2011CLF22175〉. 〈tel-00719578〉
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00719578/file/DugatBony-2011CLF22175.pdf BibTex
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Benjamin Olivier Misson. Potentiel toxique et structure génétique de populations de Microcystis en lien avec les différentes phases de son cycle de vie. Sciences agricoles. Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand II, 2011. Français. 〈NNT : 2011CLF22168〉. 〈tel-00678587〉
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00678587/file/2011CLF22168-Misson.pdf BibTex
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Michaël Roussel. Séquençage du génome du parasite intestinal Blastocystis sp. (ST7) : vers une meilleure compréhension des capacités métaboliques d'organites apparentés aux mitochondries chez ce microorganisme anaérobie. Sciences agricoles. Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand II, 2011. Français. 〈NNT : 2011CLF22164〉. 〈tel-00678598〉
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00678598/file/2011CLF22164-_-_Roussel-reedite.pdf BibTex
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Hélène Masclaux. Diversité des interactions trophiques à l'interface microorganismes - microcrustacés dans une zone littorale à macrophytes : conséquences sur le transfert des acides gras essentiels. Sciences agricoles. Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand II, 2011. Français. 〈NNT : 2011CLF22137〉. 〈tel-00673430〉
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00673430/file/2011CLF22137Masclaux.pdf BibTex
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Alexandre Michelet. Recherche de nouveaux actifs d'origine microalgale d'intérêt en dermocosmétique : antiacnéens et conservateurs potentiels. Sciences agricoles. Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand II, 2011. Français. 〈NNT : 2011CLF22119〉. 〈tel-01308513〉
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01308513/file/2011CLF22119_-_MICHELET_-_diff.pdf BibTex