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Jean-Luc Faillie, Samy Babai, Sabrina Crépin, Virginie Bres, Marie-Laure Laroche, et al.. Pancreatitis associated with the use of GLP-1 analogs and DPP-4 inhibitors: a case/non-case study from the French Pharmacovigilance Database.. Acta Diabetologica, Springer Verlag, 2013, epub ahead of print. 〈10.1007/s00592-013-0544-0〉. 〈hal-00922480〉
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Dupuy Christine, Clarisse Mallet, Katell Guizien, Hélène Montanié, Martine Bréret, et al.. Sequential resuspension of biofilm components (viruses, prokaryotesand protists) as measured by erodimetry experiments in the Brouagemudflat (French Atlantic coast). Journal of Sea Research, Elsevier, 2013, 〈10.1016/j.seares.2013.12.002〉. 〈hal-01214993〉
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P. Poirier, C. Nourrisson, L. Gibold, E. Chalus, D. Guelon, et al.. Three cases of cutaneous mucormycosis with Lichtheimia spp. (ex Absidia/Mycocladus) in ICU. Possible cross-transmission in an intensive care unit between 2 cases. Journal de Mycologie Médicale / Journal of Medical Mycology, 2013, 23 (4), pp.24139734. 〈10.1016/j.mycmed.2013.09.002〉. 〈hal-01112590〉
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Geneviève Bricheux, Jean-Louis Bonnet, Jacques Bohatier, Jean-Pierre Morel, Nicole Morel-Desrosiers. Microcalorimetry: a powerful and original tool for tracking the toxicity of a xenobiotic on Tetrahymena pyriformis.. Ecotoxicology and Environmental Safety, Elsevier, 2013, 98, pp.88-94. 〈10.1016/j.ecoenv.2013.09.019〉. 〈hal-01053791〉
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Guillaume Borrel, Paul O 'Toole, Hugh Harris, Pierre Peyret, Jean-François Brugere, et al.. Phylogenomic Data Support a Seventh Order of Methylotrophic Methanogens and Provide Insights into the Evolution of Methanogenesis. Genome Biology and Evolution, Society for Molecular Biology and Evolution, 2013, 5 (10), pp.1769 - 1780. 〈10.1093/gbe/evt128〉. 〈hal-01612746〉
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01612746/file/2013_GenomeBiolEvol_Borrel-gbe_evt128.pdf BibTex
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Ivan Wawrzyniak, Philippe Poirier, Eric Viscogliosi, Meloni Dionigia, Catherine Texier, et al.. Blastocystis, an unrecognized parasite: an overview of pathogenesis and diagnosis.. Ther Adv Infect Dis, 2013, 1 (5), pp.167-78. 〈10.1177/2049936113504754〉. 〈hal-01071806〉
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Aurore Villay, Céline Laroche, Diane Roriz, Hicham El Alaoui, Frédéric Delbac, et al.. Optimisation of culture parameters for exopolysaccharides production by the microalga Rhodella violacea.. Bioresource Technology, Elsevier, 2013, 146, pp.732-5. 〈10.1016/j.biortech.2013.07.030〉. 〈hal-01071051〉
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Yoann Millerioux, Charles Ebikeme, Marc Biran, Pauline Morand, Guillaume Bouyssou, et al.. The threonine degradation pathway of the Trypanosoma brucei procyclic form: the main carbon source for lipid biosynthesis is under metabolic control.. Molecular Microbiology, Wiley, 2013, 90(1), pp.114-29. 〈hal-01101378〉
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Valérie Polonais, Abdel Belkorchia, Michaël Roussel, Eric Peyretaillade, Pierre Peyret, et al.. Identification of two new polar tube proteins related to polar tube protein 2 in the microsporidian Antonospora locustae.. FEMS Microbiology Letters, Wiley-Blackwell, 2013, 346 (1), pp.36-44. 〈10.1111/1574-6968.12198〉. 〈hal-01071815〉
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Piotr Medrzycki, Hervé Giffard, Pierrick Aupinel, Luc P Belzunces, Marie-Pierre Chauzat, et al.. Standard methods for toxicology research in Apis mellifera. Journal of Apicultural Research, 2013, 52 (4), pp.52(4): (2013). 〈10.3896/IBRA.1.52.4.14〉. 〈hal-01115275〉
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Mathieu Roudel, Julie Aufauvre, Bruno Corbara, Frédéric Delbac, Nicolas Blot. New insights on the genetic diversity of the honeybee parasite Nosema ceranae based on multilocus sequence analysis.. Parasitology, Cambridge University Press (CUP), 2013, 140 (11), pp.1346-56. 〈10.1017/S0031182013001133〉. 〈hal-01071812〉
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Olivier Dézerald, Céline Leroy, Bruno Corbara, Jean-François Carrias, Laurent Pelozuelo, et al.. Food-web structure in relation to environmental gradients and predator-prey ratios in tank-bromeliad ecosystems. PLoS ONE, Public Library of Science, 2013, vol. 8, pp. 1-8. 〈10.1371/journal.pone.0071735〉. 〈hal-00913931〉
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00913931/file/Dezerald_10204.pdf BibTex
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Nicolas Olivier Rode, Julie Landes, Eva J P Lievens, Elodie Flaven, Adeline Segard, et al.. Cytological, molecular and life cycle characterization of Anostracospora rigaudi n. g., n. sp. and Enterocytospora artemiae n. g., n. sp., two new microsporidian parasites infecting gut tissues of the brine shrimp Artemia.. Parasitology, Cambridge University Press (CUP), 2013, 140 (9), pp.1168-85. 〈10.1017/S0031182013000668〉. 〈hal-01071897〉
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Céline Leroy, Jean-François Carrias, Bruno Corbara, Laurent Pélozuelo, Olivier Dézerald, et al.. Mutualistic ants contribute to tank-bromeliad nutrition.. Annals of Botany, Oxford University Press (OUP), 2013, epub ahead of print. 〈10.1093/aob/mct147〉. 〈hal-00849045〉
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Manuela Hartmann, Michael V. Zubkov, Dave J. Scanlan, Cécile Lepère. In situ interactions between photosynthetic picoeukaryotes and bacterioplankton in the Atlantic Ocean: evidence for mixotrophy. Environmental Microbiology Reports, Wiley, 2013, pp.doi:10.1111/1758-2229.12084. 〈hal-00848704〉
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Mélanie Gerphagnon, Delphine Latour, Jonathan Colombet, Télesphore Sime-Ngando. A Double Staining Method Using SYTOX Green and Calcofluor White for Studying Fungal Parasites of Phytoplankton.. Applied and Environmental Microbiology, American Society for Microbiology, 2013, 79 (13), pp.3943-51. 〈10.1128/AEM.00696-13〉. 〈hal-00846159〉
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Régis Fontbonne, Lionel Garnery, Cyril Vidau, Julie Aufauvre, Catherine Texier, et al.. Comparative susceptibility of three Western honeybee taxa to the microsporidian parasite Nosema ceranae.. Infection, Genetics and Evolution, Elsevier, 2013, 17, pp.188-94. 〈10.1016/j.meegid.2013.04.016〉. 〈hal-01071818〉
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A. Lautrette, M. Fejjal, A. Aithssain, T. N. Phan, N. Caillot, et al.. Comparison of three methods of diagnosis of plasma unmeasured anions in critically ill patients.. Minerva Anestesiologica, Edizione Minerva Medica, 2013, epub ahead of print. 〈hal-00834505〉
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Fabrice Thiolliere, Anne Françoise Serre-Sapin, Jean Reignier, Marcel Benedit, Jean Michel Constantin, et al.. Epidemiology and outcome of thrombocytopenic patients in the intensive care unit: results of a prospective multicenter study.. Intensive Care Med, 2013, epub ahead of print. 〈10.1007/s00134-013-2963-3〉. 〈hal-00834510〉
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Dima El Safadi, Dionigia Meloni, Philippe Poirier, Marwan Osman, Amandine Cian, et al.. Molecular epidemiology of Blastocystis in Lebanon and correlation between subtype 1 and gastrointestinal symptoms.. American Journal of Tropical Medicine and Hygiene, American Society of Tropical Medicine and Hygiene, 2013, 88 (6), pp.1203-6. 〈10.4269/ajtmh.12-0777〉. 〈hal-01071889〉
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Bushra Parveen, Viviane Ravet, Chakib Djediat, Isabelle Mary, Catherine Quiblier, et al.. Bacterial communities associated with Microcystis colonies differ from free-living communities living in the same ecosystem. Environmental Microbiology Reports, Wiley, 2013, pp.doi:10.1111/1758-2229.12071. 〈hal-00845941〉
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Djillali Annane, Jean-François Timsit, Bruno Megarbane, Claude Martin, Benoit Misset, et al.. Recombinant human activated protein C for adults with septic shock.. American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine, American Thoracic Society, 2013, 187 (10), pp.1091-7. 〈10.1164/rccm.201211-2020OC〉. 〈hal-00837619〉
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Julien Thevenon, Abderrahmane Bourredjem, Laurence Faivre, Catherine Cardot-Bauters, Alain Calender, et al.. Higher risk of death among MEN1 patients with mutations in the JunD interacting domain: a Groupe d'etude des Tumeurs Endocrines (GTE) cohort study.. Human Molecular Genetics, Oxford University Press (OUP), 2013, 22 (10), pp.1940-8. 〈10.1093/hmg/ddt039〉. 〈hal-00935869〉
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Tiffanie Lescure, Alice Carpentier, Fabienne Battaglia-Brunet, Nicole Morel-Desrosiers. Oxidation of As(III) by the bacterial community of a marine sediment monitored by microcalorimetry. Geomicrobiology Journal, Taylor & Francis, 2013, 30, pp.540-548. 〈10.1080/01490451.2012.737088〉. 〈hal-00746918〉
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Benjamin Planquette, Jean-Francois Timsit, Benoit Misset, Carole Schwebel, Elie Azoulay, et al.. Pseudomonas Aeruginosa Ventilator-Associated Pneumonia: Predictive Factors of Treatment Failure.. American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine, American Thoracic Society, 2013, epub ahead of print. 〈10.1164/rccm.201210-1897OC〉. 〈hal-00834514〉
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Amy R Kirkham, Cécile Lepère, Ludwig E Jardillier, Fabrice Not, Heather Bouman, et al.. A global perspective on marine photosynthetic picoeukaryote community structure.. ISME Journal, Nature Publishing Group, 2013, 7 (5), pp.922-36. 〈10.1038/ismej.2012.166〉. 〈hal-00848701〉
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Bertrand Pons, Alexandre Lautrette, Johanna Oziel, Jean Dellamonica, Régine Vermesch, et al.. Diagnostic accuracy of early urinary index changes in differentiating transient from persistent acute kidney injury in critically ill patients: multicenter cohort study.. Critical Care, BioMed Central, 2013, 17 (2), pp.R56. 〈10.1186/cc12582〉. 〈hal-00834516〉
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Geneviève Bricheux, Loïc Morin, Gwenaël Le Moal, Gérard Coffe, Damien Balestrino, et al.. Pyrosequencing assessment of prokaryotic and eukaryotic diversity in biofilm communities from a French river.. MicrobiologyOpen, Wiley, 2013, epub ahead of print. 〈10.1002/mbo3.80〉. 〈hal-00812657〉
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Najwa Taib, Jean-François Mangot, Isabelle Domaizon, Gisèle Bronner, Didier Debroas. Phylogenetic Affiliation of SSU rRNA Genes Generated by Massively Parallel Sequencing: New Insights into the Freshwater Protist Diversity. PLoS ONE, Public Library of Science, 2013, 8 (3), pp.e58950. 〈hal-00840867〉
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00840867/file/Taib2013_Phylogenetic.pdf BibTex
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Olivier Dézerald, Stanislas Talaga, Céline Leroy, Jean-François Carrias, Bruno Corbara, et al.. Environmental determinants of macroinvertebrate diversity in small water bodies: insights from tank-bromeliads. Hydrobiologia, Kluwer Academic Publishers, 2013, pp.DOI 10.1007/s10750-013-1464-2. 〈hal-00845572〉
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Fifa Bothon, Eric Debiton, Felicien Avlessi, Christiane Forestier, Jean-Claude Teulade, et al.. In vitro biological effects of two anti-diabetic medicinal plants used in Benin as folk medicine.. BMC Complementary and Alternative Medicine, BioMed Central, 2013, 13 (1), pp.51. 〈10.1186/1472-6882-13-51〉. 〈inserm-00798331〉
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Cécile Lepère, Isabelle Domaizon, Najwa Taïb, Jean-François Mangot, Gisèle Bronner, et al.. Geographic distance and ecosystem size determine the distribution of smallest protists in lacustrine ecosystems.. FEMS Microbiology Ecology, Wiley-Blackwell, 2013, epub ahead of print. 〈10.1111/1574-6941.12100〉. 〈hal-00806709〉
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Mylène Hugoni, Sandrine Etien, Antoine Bourges, Cécile Lepère, Isabelle Domaizon, et al.. Dynamics of ammonia-oxidizing Archaea and Bacteria in contrasted freshwater ecosystems.. Research in Microbiology, Elsevier, 2013, a compléter. 〈10.1016/j.resmic.2013.01.004〉. 〈hal-00813624〉
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Lamjed Mansour, Oum Kalthoum Ben Hassine, Christian Vivarès, Emmanuel Cornillot. Spraguea lophii (Microsporidia) parasite of the teleost fish, Lophius piscatorius from Tunisian coasts: evidence for an extensive chromosome length polymorphism.. Parasitology International, Elsevier, 2013, 62 (1), pp.66-74. 〈10.1016/j.parint.2012.09.007〉. 〈hal-01071899〉
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Florent Valour, Hervé Dutronc, Aurélien Dinh, Céline Cazorla, Patricia Pavèse, et al.. Difficult-to-treat Gram-negative bone and joint infections: efficacy and safety of prolonged intravenous colistin.. International Journal of Antimicrobial Agents, Elsevier, 2013, 41 (2), pp.197-9. 〈10.1016/j.ijantimicag.2012.09.016〉. 〈hal-00821043〉
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Jérôme Franchel, Mohamed-Fouad Bouzidi, Gisèle Bronner, Felicity Vear, Paul Nicolas, et al.. Positional cloning of a candidate gene for resistance to the sunflower downy mildew, Plasmopara halstedii race 300.. TAG Theoretical and Applied Genetics, Springer Verlag, 2013, 126 (2), pp.359-67. 〈10.1007/s00122-012-1984-6〉. 〈hal-00822169〉
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Geneviève Bricheux, Gwenaël Le Moal, Claire Hennequin, Gérard Coffe, Florence Donnadieu, et al.. Characterization and evolution of natural aquatic biofilm communities exposed in vitro to herbicides.. Ecotoxicology and Environmental Safety, Elsevier, 2013, 88, pp.126-34. 〈10.1016/j.ecoenv.2012.11.003〉. 〈hal-00783594〉
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Claire Aumeran, P. Guyot, M. Boisnoir, C. Robin-Hennequin, M. Vidal, et al.. Activity of ethanol and daptomycin lock on biofilm generated by an in vitro dynamic model using real subcutaneous injection ports.. European Journal of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Springer Verlag, 2013, 32 (2), pp.199-206. 〈10.1007/s10096-012-1732-5〉. 〈hal-00815229〉
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Jérémie Denonfoux, Nicolas Parisot, Eric Dugat-Bony, Corinne Petit, Delphine Boucher, et al.. Gene Capture Coupled to High-Throughput Sequencing as a Strategy for Targeted Metagenome Exploration. DNA Research, Oxford University Press (OUP), 2013, pp. 1-12. 〈10.1093/dnares/dst001〉. 〈hal-00783545〉
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David Georges Biron, Hugh D Loxdale. Host-parasite molecular cross-talk during the manipulative process of a host by its parasite.. Journal of Experimental Biology, Cambridge University Press, 2013, 216 (Pt 1), pp.148-60. 〈10.1242/jeb.073825〉. 〈hal-00834511〉
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Bushra Parveen, Isabelle Mary, Agnès Vellet, Viviane Ravet, Didier Debroas. Temporal dynamics and phylogenetic diversity of free-living and particle-associated Verrucomicrobia communities in relation to environmental variables in a mesotrophic lake.. FEMS Microbiology Ecology, Wiley-Blackwell, 2013, 83 (1), pp.189-201. 〈10.1111/j.1574-6941.2012.01469.x〉. 〈hal-00821799〉
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Olivier Crouzet, Jarosław Wiszniowski, Florence Donnadieu, Frédérique Bonnemoy, Jacques Bohatier, et al.. Dose-dependent effects of the herbicide mesotrione on soil cyanobacterial communities.. Archives of Environmental Contamination and Toxicology, Springer Verlag, 2013, 64 (1), pp.23-31. 〈10.1007/s00244-012-9809-9〉. 〈hal-00815290〉
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C. Philipponnet, C. Guérin, E. Canet, R. Robert, C. Mariat, et al.. Kidney biopsy in the critically ill patient, results of a multicentre retrospective case series.. Minerva Anestesiologica, Edizione Minerva Medica, 2013, 79 (1), pp.53-61. 〈hal-00830518〉
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A. Tamsa Arfao, M. Lontsi Djimeli, Rv Nandjou Nguéfack, Moïse Nola, Me Nougang, et al.. Comparison of the inhibition of commensally and enteropathogenic E. coli strains in the presence of Eucalyptus microcorys leaves extract in aquatic microcosm. International Journal of Current Microbiology and Applied Sciences, Krishna Institute of Science, 2013, 2 (6), pp.80-96. 〈hal-00840183〉
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Emeline Valton, Christian Amblard, Ivan Wawrzyniak, Frederique Penault-Llorca, Mahchid Bamdad. P-gp expression in brown trout erythrocytes: evidence of a detoxification mechanism in fish erythrocytes.. Sci Rep, 2013, 3, pp.3422. 〈10.1038/srep03422〉. 〈hal-01071814〉
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Zéphyrin Fokam, Paul Alain Nana, Pierre Ngassam, Geneviève Bricheux, Philippe Bouchard, et al.. Description of two new species of Sicuophoridae and Nyctotheridae (Heterotrichina), endocommensal in the rectal ampulla of Bufo regularis (Amphibia: Anura) from the Northwest of Cameroon. Protistology, 2013, 8 (1), pp.16 - 21. 〈hal-01114647v2〉
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Simon Roux, Mart Krupovic, Didier Debroas, Patrick Forterre, François Enault. Assessment of viral community functional potential from viral metagenomes may be hampered by contamination with cellular sequences.. Biology Open, Royal Society, 2013, 3 (12), pp.130160. 〈10.1098/rsob.130160〉. 〈hal-00932219〉
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Vincent Maire, Gaël Alvarez, J Colombet, Aurélie Comby, Romain Despinasse, et al.. An unknown oxidative metabolism substantially contributes to soil CO2 emissions. Biogeosciences, European Geosciences Union, 2013, 10, pp.1155-1167. 〈hal-01190438〉
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Anne Aubusson Fleury, Geneviève Bricheux, Raghida Damaj, Michel Lemullois, Gérard Coffe, et al.. Epiplasmins and Epiplasm in Paramecium: The Building of a Submembraneous Cytoskeleton. Protist, Elsevier, 2013, 164 (4), pp.451-469. 〈10.1016/j.protis.2013.04.003〉. 〈hal-01071900v2〉
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01071900/file/Epiplasmins_revised_version.pdf BibTex
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Mylène Hugoni, Najwa Taib, Didier Debroas, Isabelle Domaizon, Isabelle Jouan-Dufournel, et al.. Structure of the rare archaeal biosphere and seasonal dynamics of active ecotypes in surface coastal waters. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America , National Academy of Sciences, 2013, 110 (15), pp.6004-6009. 〈10.1073/pnas.1216863110〉. 〈hal-01354640〉
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01354640/file/PNAS-2013-Hugoni-HAL.pdf BibTex
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Mélanie Gerphagnon, Delphine Latour, Jonathan Colombet, Télesphore Sime-Ngando. Fungal parasitism: life cycle, dynamics and impact on cyanobacterial blooms. PLoS ONE, Public Library of Science, 2013, 8 (4), pp.e60894. 〈10.1371/journal.pone.0060894〉. 〈hal-00843243〉
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00843243/file/Gerphagnon2013_Fungal.pdf BibTex
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Olivier Lambert, Mélanie Piroux, Sophie Puyo, Chantal Thorin, Monique L'Hostis, et al.. Widespread occurrence of chemical residues in beehive matrices from apiaries located in different landscapes of Western France.. PLoS ONE, Public Library of Science, 2013, 8 (6), pp.e67007. 〈10.1371/journal.pone.0067007〉. 〈hal-01071820〉
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William Tottey, Jeremie Denonfoux, Faouzi Jaziri, Nicolas Parisot, Mohiedine Missaoui, et al.. The Human Gut Chip ‘‘HuGChip’’, an Explorative Phylogenetic Microarray for Determining Gut Microbiome Diversity at Family Level. PLoS ONE, Public Library of Science, 2013, 449, pp.804 - 804. 〈10.1371/journal.pone.0062544.s004〉. 〈hal-01612757〉
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01612757/file/2013_PlosONE_HuGChip.pdf BibTex
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Aurore Dubuffet, Judith E. Smith, Leellen Solter, M. Alejandra Perotti, Henk R. Braig, et al.. Specific Detection and Localization of Microsporidian Parasites in Invertebrate Hosts by Using In Situ Hybridization. Applied and Environmental Microbiology, American Society for Microbiology, 2013, 79 (1), pp.385-388. 〈10.1128/AEM.02699-12〉. 〈hal-01609937〉
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Marc Saudreau, Sylvain Pincebourde, Mathieu Dassot, A. Adam, Hugh D Loxdale, et al.. On the canopy structure manipulation to buffer climate change effects on insect herbivore development. Trees - Structure and Function, Springer Verlag, 2013, 27, pp.239-248. 〈10.1007/s00468-012-0791-7〉. 〈hal-00866158〉
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Isabelle Domaizon, Olga Savichtcheva, Didier Debroas, Fabien Arnaud, Clement Villar, et al.. DNA from lake sediments reveals the long-term dynamics and diversity of Synechococcus assemblages. Biogeosciences, European Geosciences Union, 2013, p. 3817-3838. 〈10.5194/bg-10-3817-2013〉. 〈halsde-00866805〉
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Stéphan Jacquet, Xu Zhong, Parvathi Ammini, Angia Sriram Pradeep Ram. First description of a cyanophage infecting the cyanobacterium Arthrospira platensis (Spirulina). Journal of Applied Phycology, Springer Verlag, 2013, 25, pp.195-203. 〈hal-00813900〉
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00813900/file/Jacquet2013_First_Description.pdf BibTex
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Frédéric Plewniak, Sandrine Koechler, Benjamin Navet, Eric Dugat-Bony, Olivier Bouchez, et al.. Metagenomic insights into microbial metabolism affecting arsenic dispersion in Mediterranean marine sediments. Molecular Ecology, Wiley, 2013, 22 (19), pp.4870-4883. 〈10.1111/mec.12432〉. 〈hal-01026453〉
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Simon Roux, François Enault, Gisèle Bronner, Daniel Vaulot, Patrick Forterre, et al.. Chimeric viruses blur the borders between the major groups of eukaryotic single-stranded DNA viruses.. Nature Communications, Nature Publishing Group, 2013, 4, pp.2700. 〈10.1038/ncomms3700〉. 〈hal-00881062〉
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Emilie Dordet-Frisoni, Eric Baranowski, Aurélien Barré, Alain Blanchard, Marc Breton, et al.. Draft Genome Sequences of Mycoplasma auris and Mycoplasma yeatsii, Two Species of the Ear Canal of Caprinae. Genome Announcements, American Society for Microbiology, 2013, 1 (3), epub ahead of print. 〈10.1128/genomeA.00280-13〉. 〈hal-00907449〉
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Lucía Manso-Silván, Florence Tardy, Eric Baranowski, Aurélien Barré, Alain Blanchard, et al.. Draft Genome Sequences of Mycoplasma alkalescens, Mycoplasma arginini, and Mycoplasma bovigenitalium, Three Species with Equivocal Pathogenic Status for Cattle. Genome Announcements, American Society for Microbiology, 2013, 1 (3), pp.e00348-13. 〈10.1128/genomeA.00348-13〉. 〈hal-00907454〉
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Virginie Dupuy, Pascal Sirand-Pugnet, Eric Baranowski, Aurélien Barré, Marc Breton, et al.. Complete Genome Sequence of Mycoplasma putrefaciens Strain 9231, One of the Agents of Contagious Agalactia in Goats. Genome Announcements, American Society for Microbiology, 2013, 1 (3), pp.e00354-13. 〈10.1128/genomeA.00354-13〉. 〈hal-00907450〉
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Communication dans un congrès

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Flore Ballaud, Alexis Dufresne, Andre-Jean Francez, Jonathan Colombet, Télesphore Sime-Ngando, et al.. Patterns of viral and microbial diversity in Sphagnum-dominated peatland using meta genomics. VIème Colloque AFEM “Microbiologie environnementale : du gène à l’écosystème”, Oct 2013, Clermont-Ferrand, France. 〈hal-01156599〉
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Clarisse Mallet, Isabelle Batisson, Pierre Joly, Frédérique Bonnemoy, Pascale Besse-Hoggan, et al.. Devenir et impacts d’un « cocktail » d’herbicides sur des groupes fonctionnels microbiens: élaboration de bioindicateurs de perturbations. Colloque de Prospective SIC, 2013, Paris, France. 2013. 〈hal-01606155〉
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Nabaz Mohammed, Hélène Celle-Jeanton, Isabelle Batisson, Corinne Bardot, Jonathan Colombet, et al.. Integrated characterization of groundwater contamination in an alluvial system. Case study of Allier alluvial aquifer (Massif Central, France).. EGU General Assembly 2013, 2013, Vienna, Austria. 〈hal-00803038〉
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Chapitre d'ouvrage

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Philippe Poirier, Jean-Marc Ferry. Référentiel identitaire et justification publique. Face à la disjonction de l’Universel et du Commun, le défi de la sécularisation religieuse. Editions Parole et Silence. Démocratie(s) Liberté(s) et Religion(s), 2013, 978-2-88918-234-3. 〈hal-01742841〉
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Eric De Moulins-Beaufort, Philippe Poirier, Jean-Marc Ferry. De l’“ex-communication” des religions à l’insertion du dialogue interreligieux dans un espace postséculier. Lethielleux Editions. Gouvernance mondiale et éthique au XXIe siècle, pp177-207, 2013, 978-2249622502. 〈hal-01742837〉
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Brevet

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P Michaud, Céline Laroche, A Villay, M Roussel, M Diogon, et al.. Utilisation de polysaccharides sulfatés pour le traitement de la nosémose des abeilles. France, Patent n° : WO2014076261 A1. 2013. 〈hal-01115866〉
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Poster

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Flore Ballaud, Alexis Dufresne, Andre-Jean Francez, Jonathan Colombet, Télesphore Sime-Ngando, et al.. Viral and microbial diversity in a Sphagnum-dominated peatland using metagenomics. Colloque Génomique Environnementale ‘Diversité, évolution et fonctionnement du vivant à l’ère des nouvelles technologies de séquençage’, Aug 2013, Rennes, France. 〈hal-01159031〉
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Thèse

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Julie Aufauvre. Impact de la microsporidie Nosema ceranae et d'insecticides neurotoxiques sur la santé de l'abeille domestique (Apis mellifera). Sciences agricoles. Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand II, 2013. Français. 〈NNT : 2013CLF22427〉. 〈tel-00973858〉
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00973858/file/AUFAUVRE_2013CLF22427.pdf BibTex
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Mathieu Roudel. Diversité génétique et recherche de facteurs de virulence de Nosema ceranae, parasite de l'abeille mellifère. Sciences agricoles. Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand II, 2013. Français. 〈NNT : 2013CLF22414〉. 〈tel-00959521〉
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00959521/file/ROUDEL_2013CLF22414.pdf BibTex
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Mylène Hugoni. Structure et activité des Archaea planctoniques dans les écosystèmes aquatiques. Sciences agricoles. Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand II, 2013. Français. 〈NNT : 2013CLF22388〉. 〈tel-01136205〉
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01136205/file/HUGONI_2013CLF22388.pdf BibTex
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Mélanie Gerphagnon. Ecologie des chytrides parasites de la cyanobactérie Anabaena macrospora. Sciences agricoles. Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand II, 2013. Français. 〈NNT : 2013CLF22385〉. 〈tel-01379598〉
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01379598/file/GERPHAGNON_2013CLF22385.pdf BibTex
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Simon Roux. Diversité, évolution et écologie virale : des communautés aux génotypes. Analyse bioinformatique de métagénomes viraux. Sciences agricoles. Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand II, 2013. Français. 〈NNT : 2013CLF22380〉. 〈tel-00908344〉
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Najwa Taïb. Analyse de la diversité microbienne par séquençage massif : méthodes et applications. Sciences agricoles. Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand II, 2013. Français. 〈NNT : 2013CLF22374〉. 〈tel-00926896〉
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00926896/file/TAIB_2013CLF22374.pdf BibTex
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Mathieu Floury. Analyse des tendances d'évolution de peuplements de macroinvertébrés benthiques dans un contexte de réchauffement des eaux. Sciences agricoles. Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand II, 2013. Français. 〈NNT : 2013CLF22344〉. 〈tel-00844377〉
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https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00844377/file/Floury-2013CLF22344.pdf BibTex
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Jérémie Denonfoux. Détermination de sondes oligonucléotidiques pour outils moléculaires à haut débit : application pour le développement d'une nouvelle approche de capture de gènes pour l'écologie microbienne. Sciences agricoles. Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand II, 2013. Français. 〈NNT : 2013CLF22331〉. 〈tel-01077860〉
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