Publications HAL de la collection (IBS-VIC;IBS-EPIGEN)

2022

titre
Structural basis of DNA methylation-dependent site selectivity of the Epstein–Barr virus lytic switch protein ZEBRA/Zta/BZLF1
auteur
Florent Bernaudat, Montse Gustems, Johannes Günther, Mizar Oliva, Alexander Buschle, Christine Göbel, Priscilla Pagniez, Julien Lupo, Luca Signor, Christoph Müller, Patrice Morand, Michael Sattler, Wolfgang Hammerschmidt, Carlo Petosa
article
Nucleic Acids Research, 2022, ⟨10.1093/nar/gkab1183⟩
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titre
Structural analysis of Red1 as a conserved scaffold of the RNA-targeting MTREC/PAXT complex
auteur
Anne-Emmanuelle Foucher, Leila Touat-Todeschini, Ariadna Juarez-Martinez, Auriane Rakitch, Hamida Laroussi, Claire Karczewski, Samira Acajjaoui, Montserrat Soler-López, Stephen Cusack, Cameron Mackereth, André Verdel, Jan Kadlec
article
Nature Communications, 2022, 13, pp.4969. ⟨10.1038/s41467-022-32542-3⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03867746/file/Foucher%20%26%20Toddeschini%2CNature%20Comm%2C2022.pdf BibTex
titre
Drug resistance dependent on allostery: A P-loop rigor Eg5 mutant exhibits resistance to allosteric inhibition by STLC
auteur
Rose-Laure Indorato, Salvatore Debonis, Isabel Garcia-Saez, Dimitrios A Skoufias
article
Frontiers in Oncology, 2022, 12, pp.965455. ⟨10.3389/fonc.2022.965455⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03811918/file/FO_2022.pdf BibTex
titre
Riboflavin-binding proteins for singlet oxygen production
auteur
Céline Lafaye, Sylvain Aumonier, Joaquim Torra, Luca Signor, David von Stetten, Marjolaine Noirclerc-Savoye, Xiaokun Shu, Rubén Ruiz-González, Guillaume Gotthard, Antoine Royant, Santi Nonell
article
Photochemical & Photobiological Sciences , 2022, 21, pp.1545-1555. ⟨10.1007/s43630-021-00156-1⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03715086/file/Lafaye%20et%20al.%20PhotochemPhotobiolSci.pdf BibTex
titre
Enantioselective approach for expanding the three‐dimensional space of tetrahydroquinoline to develop bet bromodomain inhibitors
auteur
Marie‐ange Lespinasse, Kaiyao Wei, Justine Perrin, Matthias Winkler, Sieme Hamaidia, Alexis Leroy, Zuzana Macek Jilkova, Christian Philouze, Patrice Marche, Carlo Petosa, Jérôme Govin, Anouk Emadali, Yung‐sing Wong
article
Chemistry - A European Journal, 2022, 2022, pp.e202202293. ⟨10.1002/chem.202202293⟩
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titre
Binding stoichiometry and structural model of the HIV-1 Rev/Importin β complex
auteur
Didier Spittler, Rose-Laure Indorato, Elisabetta Boeri Erba, Elise Delaforge, Luca Signor, Simon Harris, Isabel Garcia-Saez, Andrés Palencia, Frank Gabel, Martin Blackledge, Marjolaine Noirclerc-Savoye, Carlo Petosa
article
Life Science Alliance, 2022, ⟨10.26508/lsa.202201431⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03453423/file/2022_LifeSciAlliance_Spittler.pdf BibTex
titre
De novo determination of mosquitocidal Cry11Aa and Cry11Ba structures from naturally-occurring nanocrystals
auteur
Guillaume Tetreau, Michael R. Sawaya, Elke De Zitter, Elena A. Andreeva, Anne-Sophie Banneville, Natalie A. Schibrowsky, Nicolas Coquelle, Aaron S. Brewster, Marie Luise Grünbein, Gabriela Nass Kovacs, Mark S. Hunter, Marco Kloos, Raymond G. Sierra, Giorgio Schiro, Pei Qiao, Myriam Stricker, Iris D. Young, Ninon Zala, Sylvain Engilberge, Alexander Gorel, Luca Signor, Jean-Marie Teulon, Mario Hilpert, Lutz Foucar, Johan Bielecki, Richard Bean, Raphael De Wijn, Tokushi Sato, Dennis Bideshi, Romain Letrun, Alexander Batyuk, Irina Snigireva, Daphna Fenel, Robin Schubert, Ethan J. Canfield, Mario M. Alba, Frédéric Laporte, Henry Kirkwood, Laurence Després, Maria Bacia, Amandine Roux, Christian Chapelle, François Riobé, Olivier Maury, Wai-Li Ling, Sébastien Boutet, Adrian Mancuso, Irina Gutsche, Eric Girard, Thomas R. M. Barends, Jean-Luc Pellequer, Hyun-Woo Park, Arthur D. Laganowsky, Jose Rodriguez, Manfred Burghammer, Robert L. Shoeman, R. Bruce Doak, Martin Weik, Nicholas K. Sauter, Brian Federici, Duilio Cascio, Ilme Schlichting, Jacques-Philippe Colletier
article
Nature Communications, 2022, 13, ⟨10.1038/s41467-022-31746-x⟩
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titre
De novo determination of mosquitocidal Cry11Aa and Cry11Ba structures from naturally-occurring nanocrystals
auteur
Guillaume Tetreau, Michael Sawaya, Elke de Zitter, Elena Andreeva, Anne-Sophie Banneville, Natalie Schibrowsky, Nicolas Coquelle, Aaron Brewster, Marie Luise Grünbein, Gabriela Nass Kovacs, Mark Hunter, Marco Kloos, Raymond Sierra, Giorgio Schiro, Pei Qiao, Myriam Stricker, Dennis Bideshi, Iris Young, Ninon Zala, Sylvain Engilberge, Alexander Gorel, Luca Signor, Jean-Marie Teulon, Mario Hilpert, Lutz Foucar, Johan Bielecki, Richard Bean, Raphael de Wijn, Tokushi Sato, Henry Kirkwood, Romain Letrun, Alexander Batyuk, Irina Snigireva, Daphna Fenel, Robin Schubert, Ethan Canfield, Mario Alba, Frédéric Laporte, Laurence Després, Maria Bacia, Amandine Roux, Christian Chapelle, François Riobé, Olivier Maury, Wai Li Ling, Sébastien Boutet, Adrian Mancuso, Irina Gutsche, Eric Girard, Thomas Barends, Jean-Luc Pellequer, Hyun-Woo Park, Arthur Laganowsky, Jose Rodriguez, Manfred Burghammer, Robert Shoeman, R. Bruce Doak, Martin Weik, Nicholas Sauter, Brian Federici, Duilio Cascio, Ilme Schlichting, Jacques-Philippe Colletier
article
Nature Communications, 2022, 13 (1), pp.4376. ⟨10.1038/s41467-022-31746-x⟩
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https://hal-cnrs.archives-ouvertes.fr/hal-03847393/file/Tetreau%20et%20al.%20Nature%20communications.pdf BibTex
titre
Toward more potent imidazopyridine inhibitors of Candida albicans Bdf1: Modeling the role of structural waters in selective ligand binding
auteur
Yingsheng Zhou, Justin Overhulse, Nathan Dupper, Yanchun Guo, Boris Kashemirov, Kaiyao Wei, Jérôme Govin, Carlo Petosa, Charles Mckenna
article
Journal of Computational Chemistry, 2022, ⟨10.1002/jcc.26997⟩
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2021

titre
Hybrid Amyloid-Based Redox Hydrogel for Bioelectrocatalytic H2 Oxidation
auteur
Nicolas Duraffourg, Maxime Leprince, Serge Crouzy, Olivier Hamelin, Yves Usson, Luca Signor, Christine Cavazza, Vincent Forge, Luca Albertin
article
Angewandte Chemie International Edition, 2021, 60 (26), pp.14488-14497. ⟨10.1002/anie.202101700⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03241503/file/2021_ACIE_BMV-HET_NiFeSeHyDB_Preprint_v1.pdf BibTex
titre
The Plastid-Encoded RNA Polymerase-Associated Protein PAP9 Is a Superoxide Dismutase With Unusual Structural Features
auteur
Adrien Favier, Pierre Gans, Elisabetta Boeri Erba, Luca Signor, Soumiya Sankari Muthukumar, Thomas Pfannschmidt, Robert Blanvillain, David Cobessi
article
Frontiers in Plant Science, 2021, 12, pp.668897. ⟨10.3389/fpls.2021.668897⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03313484/file/fpls-12-668897.pdf BibTex
titre
Eg5 targeting agents: From new anti-mitotic based inhibitor discovery to cancer therapy and resistance
auteur
Isabel Garcia-Saez, Dimitrios A Skoufias
article
Biochemical Pharmacology, 2021, 184, pp.114364. ⟨10.1016/j.bcp.2020.114364⟩
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https://hal-cnrs.archives-ouvertes.fr/hal-03454834/file/BP-S-20-02841-manuscript-draft.pdf BibTex
titre
Structural insights into protein folding, stability and activity using in vivo perdeuteration of hen egg-white lysozyme
auteur
Joao Ramos, Valerie Laux, Michael Haertlein, Elisabetta Boeri Erba, Katherine Mcauley, V Trevor Forsyth, Estelle Mossou, Sine Larsen, Annette Langkilde
article
International Union of Crystallography journal, 2021, 8 (3), pp.372-386. ⟨10.1107/S2052252521001299⟩
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titre
Divalent cations influence the dimerization mode of murine S100A9 protein by modulating its disulfide bond pattern
auteur
Luca Signor, Theo Paris, Caroline Mas, Adrien Picard, Georges Lutfalla, Elisabetta Boeri Erba, Laure Yatime
article
Journal of Structural Biology, 2021, 213 (1), pp.107689. ⟨10.1016/j.jsb.2020.107689⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03120644/file/Signor-et-al_JSB-2021_HAL-manuscript-version.pdf BibTex
titre
ATAD2 controls chromatin-bound HIRA turnover
auteur
Tao Wang, Daniel Perazza, Fayçal Boussouar, Matteo Cattaneo, Alexandre Bougdour, Florent Chuffart, Sophie Barral, Alexandra Vargas, Ariadni Liakopoulou, Denis Puthier, Lisa Bargier, Yuichi Morozumi, Mahya Jamshidikia, Isabel Garcia-Saez, Carlo Petosa, Sophie Rousseaux, A Verdel, Saadi Khochbin
article
Life Science Alliance, 2021, ⟨10.26508/lsa.202101151⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03359419/file/Wang_Tao_LSA_2021.pdf BibTex

2020

titre
Exploring the structure and dynamics of macromolecular complexes by native mass spectrometry
auteur
Elisabetta Boeri Erba, Luca Signor, Carlo Petosa
article
Journal of Proteomics, 2020, 222, pp.103799. ⟨10.1016/j.jprot.2020.103799⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-02864550/file/S1874391920301676.pdf BibTex
titre
Phase-plate cryo-EM structure of the Widom 601 CENP-A nucleosome core particle reveals differential flexibility of the DNA ends
auteur
Ramachandran Boopathi, Radostin Danev, Maryam Khoshouei, Seyit Kale, Sunil Nahata, Lorrie Ramos, Dimitar Angelov, Stefan Dimitrov, Ali Hamiche, Carlo Petosa, Jan Bednar
article
Nucleic Acids Research, 2020, 48 (10), pp.5735-5748. ⟨10.1093/nar/gkaa246⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03007422/file/Boopathi2020.pdf BibTex
titre
Phase-plate cryo-EM structure of the Widom 601 CENP-A nucleosome core particle reveals differential flexibility of the DNA ends
auteur
Ramachandran Boopathi, Radostin Danev, Maryam Khoshouei, Seyit Kale, Sunil Nahata, Lorrie Ramos, Dimitar Angelov, Stefan Dimitrov, Ali Hamiche, Carlo Petosa, Jan Bednar
article
Nucleic Acids Research, 2020, 48 (10), pp.5735-5748. ⟨10.1093/nar/gkaa246⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03102278/file/gkaa246.pdf BibTex
titre
Cryo-electron microscopy of the chromatin fiber
auteur
Ramachandran Boopathi, Stefan Dimitrov, Ali Hamiche, Carlo Petosa, Jan Bednar
article
Current Opinion in Structural Biology, 2020, 64, pp.97-103. ⟨10.1016/j.sbi.2020.06.016⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-02947617/file/Boopathi%20et%20al.%20COSB.pdf BibTex
titre
Nanoscale surface structures of DNA bound to Deinococcus radiodurans HU unveiled by atomic force microscopy.
auteur
Shu-Wen W. Chen, Anne-Sophie Banneville, Jean-Marie Teulon, Joanna Timmins, Jean-Luc Pellequer
article
Nanoscale, 2020, 12 (44), pp.22628-22638. ⟨10.1039/d0nr05320a⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03018678/file/Chen%20et%20al.%20Nanoscale.pdf BibTex
titre
Headless C1q: a new molecular tool to decipher its collagen‐like functions
auteur
Guillaume Fouët, Isabelle Bally, Luca Signor, Katharina Häussermann, Nicole M. Thielens, Véronique Rossi, Christine Gaboriaud
article
FEBS Journal, 2020, ⟨10.1111/febs.15543⟩
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BibTex
titre
Assembly of The Mitochondrial Complex I Assembly Complex Suggests a Regulatory Role for Deflavination
auteur
Gabriele Giachin, Matthew Jessop, Romain Bouverot, Samira Acajjaoui, Melissa Saïdi, Anaïs Chretien, Maria Bacia-Verloop, Luca Signor, Philippe Mas, Adrien Favier, Eve Borel Meneroud, Michael Hons, Darren Hart, Eaazhisai Kandiah, Elisabetta Boeri Erba, Alain Buisson, Gordon Leonard, Irina Gutsche, Montserrat Soler-Lopez
article
Angewandte Chemie International Edition, 2020, ⟨10.1002/anie.202011548⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-03119718/file/Giachin%20et%20al.%20-%202021%20-%20Assembly%20of%20The%20Mitochondrial%20Complex%20I%20Assembly%20C.pdf BibTex
titre
Focus on DNA Glycosylases—A Set of Tightly Regulated Enzymes with a High Potential as Anticancer Drug Targets
auteur
Fabienne Hans, Muge Senarisoy, Chandini Bhaskar Naidu, Joanna Timmins
article
International Journal of Molecular Sciences, 2020, 21 (23), pp.9226. ⟨10.3390/ijms21239226⟩
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BibTex
titre
Nucleo‐plastidic PAP 8/ pTAC 6 couples chloroplast formation with photomorphogenesis
auteur
Monique Liebers, François-Xavier Gillet, Abir Israel, Kevin Pounot, Louise Chambon, Maha Chieb, Fabien Chevalier, Rémi Ruedas, Adrien Favier, Pierre Gans, Elisabetta Boeri Erba, David Cobessi, Thomas Pfannschmidt, Robert Blanvillain
article
EMBO Journal, 2020, 39 (22), pp.e104941. ⟨10.15252/embj.2020104941⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-02972660/file/Liebers%20preprint.pdf BibTex
titre
Phase and fluorescence imaging with a surprisingly simple microscope based on chromatic aberration
auteur
Ondřej Mandula, Jean-Philippe Kleman, Françoise Lacroix, Cédric Allier, Daniel Fiole, Lionel Hervé, Pierre Blandin, Dorothee Kraemer, Sophie Morales
article
Optics Express, 2020, 28 (2), pp.2079. ⟨10.1364/OE.28.002079⟩
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BibTex
titre
A Guide to Native Mass Spectrometry to determine complex interactomes of molecular machines
auteur
Rita Puglisi, Elisabetta Boeri Erba, Annalisa Pastore
article
FEBS Journal, 2020, ⟨10.1111/febs.15281⟩
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BibTex
titre
Revealing the mechanism of repressor inactivation during switching of a temperate bacteriophage
auteur
Kim Krighaar Rasmussen, Andrés Palencia, Anders Varming, Habiba El-Wali, Elisabetta Boeri Erba, Martin Blackledge, Karin Hammer, Torsten Herrmann, Mogens Kilstrup, Leila Lo Leggio, Malene Ringkjøbing Jensen
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2020, 117 (34), pp.20576-20585. ⟨10.1073/pnas.2005218117⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-02972710/file/Rasmussen%20et%20al.%20PNAS.pdf BibTex
titre
Förster Resonance Energy Transfer Based Biosensor for Targeting the hNTH1–YB1 Interface as a Potential Anticancer Drug Target
auteur
Muge Senarisoy, Caroline Barette, Françoise Lacroix, Salvatore Debonis, Meike Stelter, Fabienne Hans, Jean-Philippe Kleman, Marie-Odile Fauvarque, Joanna Timmins
article
ACS Chemical Biology, 2020, 15 (4), pp.990-1003. ⟨10.1021/acschembio.9b01023⟩
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https://hal-cea.archives-ouvertes.fr/cea-02517754/file/Preprint_Senarisoy_etal.pdf BibTex
titre
Serial femtosecond crystallography on in vivo-grown crystals drives elucidation of mosquitocidal Cyt1Aa bioactivation cascade
auteur
Guillaume Tetreau, Anne-Sophie Banneville, Elena Andreeva, Aaron Brewster, Mark Hunter, Raymond Sierra, Jean-Marie Teulon, Iris Young, Niamh Burke, Tilman A. Grünewald, Joël Beaudouin, Irina Snigireva, Maria Teresa Fernandez-Luna, Alister Burt, Hyun-Woo Park, Luca Signor, Jayesh Bafna, Rabia Sadir, Daphna Fenel, Elisabetta Boeri-Erba, Maria Bacia-Verloop, Ninon Zala, Frédéric Laporte, Laurence Després, Martin Weik, Sébastien Boutet, Martin Rosenthal, Nicolas Coquelle, Manfred Burghammer, Duilio Cascio, Michael Sawaya, Mathias Winterhalter, Enrico Gratton, Irina Gutsche, Brian Federici, Jean-Luc Pellequer, Nicholas Sauter, Jacques-Philippe Colletier
article
Nature Communications, 2020, 11 (1), ⟨10.1038/s41467-020-14894-w⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02506591/file/tetreau2020.pdf BibTex
titre
Surviving salt fluctuations: stress and recovery in Halobacterium salinarum, an extreme halophilic Archaeon
auteur
Pierre Vauclare, F. Natali, Jean-Philippe Kleman, Giuseppe Zaccai, Bruno Franzetti
article
Scientific Reports, 2020, 10 (1), pp.3298. ⟨10.1038/s41598-020-59681-1⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02519472/file/Vauclare%20et%20al.%20Scientific%20Reports.pdf BibTex

2019

titre
A solvent-exposed cysteine forms a peculiar Ni(II)-binding site in the metallochaperone CooT from Rhodospirillum rubrum.
auteur
Marila Alfano, Giulia Veronesi, Francesco Musiani, Barbara Zambelli, Luca Signor, Olivier Proux, Mauro Rovezzi, Stefano Ciurli, Christine Cavazza
article
Chemistry - A European Journal, 2019, 25 (67), pp.15351-15360. ⟨10.1002/chem.201903492⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02289379/file/Alfanoetal-FINAL.pdf BibTex
titre
Phosphomimetic mutations modulate the ability of HIV-1 Rev to bind human Importin β in vitro
auteur
Nadia Ben Fadhel, Luca Signor, Carlo Petosa, Marjolaine Noirclerc-Savoye
article
Matters, 2019, ⟨10.19185/matters.201903000032⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02270755/file/BenFadhel%20et%20al.%20Matters_2019.pdf BibTex
titre
Cell morphology and nucleoid dynamics in dividing Deinococcus radiodurans
auteur
Kevin Floc’h, Françoise Lacroix, Pascale Servant, Yung-Sing Wong, Jean-Philippe Kleman, Dominique Bourgeois, Joanna Timmins
article
Nature Communications, 2019, 10 (1), ⟨10.1038/s41467-019-11725-5⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02273077/file/Floc%27h%20et%20al.%20Nat%20Commun.pdf BibTex
titre
Molecular Basis of DNA Packaging in Bacteria Revealed by All-Atoms Molecular Dynamic Simulations: The case of histone like proteins in Borrelia burgdoferi.
auteur
Cécilia Hognon, Simon Garaude, Joanna Timmins, Christophe Chipot, Francois Dehez, Antonio Monari
article
Journal of Physical Chemistry Letters, 2019, ⟨10.1021/acs.jpclett.9b02978⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02352618/file/Hognon%20et%20al.%20J%20Phys%20Chem%20Lett.pdf BibTex
titre
Is the fate of clinical candidate Arry-520 already sealed? Predicting resistance in Eg5-inhibitor complexes
auteur
Rose-Laure Indorato, Sandeep Talapatra, Fangzhu Lin, Shozeb Haider, Simon Mackay, Frank Kozielski, Dimitrios Skoufias
article
Molecular Cancer Therapeutics, 2019, pp.molcanther.0154.2019. ⟨10.1158/1535-7163.MCT-19-0154⟩
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BibTex
titre
Structural and Functional Characterization of the Type Three Secretion System (T3SS) Needle of Pseudomonas aeruginosa
auteur
Charlotte Lombardi, James Tolchard, Stéphanie Bouillot, Luca Signor, Caroline Gébus, David Liebl, Daphna Fenel, Jean-Marie Teulon, Juliane Brock, Birgit Habenstein, Jean-Luc Pellequer, Eric Faudry, Antoine Loquet, Ina Attree, Andréa Dessen, Viviana Job
article
Frontiers in Microbiology, 2019, 10 (573), ⟨10.3389/fmicb.2019.00573⟩
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BibTex
titre
Towards a molecular understanding of the water purification properties of Moringa seed proteins
auteur
M. Moulin, E. Mossou, Luca Signor, S. Kieffer-Jaquinod, H. M. Kwaambwa, F. Nermark, P. Gutfreund, E. P. Mitchell, M. Haertlein, V. T. Forsyth, A. R. Rennie
article
Journal of Colloid and Interface Science, 2019, 554, pp.296-304. ⟨10.1016/j.jcis.2019.06.071⟩
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BibTex
titre
The three Endonuclease III variants of Deinococcus radiodurans possess distinct and complementary DNA repair activities
auteur
Aili Sarre, Meike Stelter, Filipe Rollo, Salvatore Debonis, Anna Seck, Cécilia Hognon, Jean-Luc Ravanat, Antonio Monari, François Dehez, Elin Moe, Joanna Timmins
article
DNA Repair, 2019, 78, pp.45-59. ⟨10.1016/j.dnarep.2019.03.014⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02092591/file/S1568786418303215.pdf BibTex
titre
Tailing miniSOG: structural bases of the complex photophysics of a flavin-binding singlet oxygen photosensitizing protein
auteur
Joaquim Torra, Céline Lafaye, Luca Signor, Sylvain Aumonier, Cristina Flors, Xiaokun Shu, Santi Nonell, Guillaume Gotthard, Antoine Royant
article
Scientific Reports, 2019, 9 (1), pp.2428-1-2428-10. ⟨10.1038/s41598-019-38955-3⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02306813/file/Scientific_Reports_9_2428.pdf BibTex
titre
The conformational changes coupling ATP hydrolysis and translocation in a bacterial DnaB helicase
auteur
Thomas Wiegand, Riccardo Cadalbert, Denis Lacabanne, Joanna Timmins, Laurent L. Terradot, Anja Böckmann, Beat Meier
article
Nature Communications, 2019, 10 (1), pp.31. ⟨10.1038/s41467-018-07968-3⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02322585/file/2E9EFFFD-4E7A-4C55-90D3-4766D50B8764.pdf BibTex
titre
A molecular mechanism for transthyretin amyloidogenesis
auteur
Ai Woon Yee, Matteo Aldeghi, Matthew Blakeley, Andreas Ostermann, Philippe Mas, Martine Moulin, Daniele de Sanctis, Matthew Bowler, Christoph Mueller-Dieckmann, Edward P. Mitchell, Michael Haertlein, Bert de Groot, Elisabetta Boeri Erba, V. Trevor Forsyth
article
Nature Communications, 2019, 10 (1), pp.925-1-925-10. ⟨10.1038/s41467-019-08609-z⟩
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2018

titre
Chaperonin CCT checkpoint function in basal transcription factor TFIID assembly
auteur
Simona Antonova, Matthias Haffke, Eleonora Corradini, Mykolas Mikuciunas, Teck Low, Luca Signor, Robert van Es, Kapil Gupta, Elisabeth Scheer, Harmjan Vos, Làszlò Tora, Albert Heck, H. Timmers, Imre Berger
article
Nature Structural and Molecular Biology, 2018, 25 (12), pp.1119-1127
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BibTex
titre
Characterizing Intact Macromolecular Complexes Using Native Mass Spectrometry.
auteur
Elisabetta Boeri Erba, Luca Signor, Mizar Francesca Oliva, Fabienne Hans, Carlo Petosa
article
Methods in Molecular Biology, 2018, 1764, pp.133-151. ⟨10.1007/978-1-4939-7759-8_9⟩
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BibTex
titre
Bacterial cell wall nanoimaging by autoblinking microscopy
auteur
Kevin Floc’h, Françoise Lacroix, Liliana Barbieri, Pascale Servant, Rémi Galland, Corey Butler, Jean-Baptiste Sibarita, Dominique Bourgeois, Joanna Timmins
article
Scientific Reports, 2018, 8 (1), ⟨10.1038/s41598-018-32335-z⟩
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BibTex
titre
Structure of an H1-Bound 6-Nucleosome Array Reveals an Untwisted Two-Start Chromatin Fiber Conformation
auteur
Isabel Garcia-Saez, Hervé Menoni, Ramachandran Boopathi, Manu Shukla, Lama Soueidan, Marjolaine Noirclerc-Savoye, Aline Le Roy, Dimitrios Skoufias, Jan Bednar, Ali Hamiche, Dimitar Angelov, Carlo Petosa, Stefan Dimitrov
article
Molecular Cell, 2018, 72 (5), pp.902-915.e7. ⟨10.1016/j.molcel.2018.09.027⟩
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titre
Mouse REC114 is essential for meiotic DNA double-strand break formation and forms a complex with MEI4
auteur
Rajeev Kumar, Cecilia Oliver, Christine Brun, Ariadna Juarez-Martinez, Yara Tarabay, Jan Kadlec, Bernard de Massy
article
Life Science Alliance, 2018, 1 (6), pp.e201800259. ⟨10.26508/lsa.201800259⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01974944/file/2018_Kumar_Life%20Science%20Alliance_1.pdf BibTex
titre
RIP2 filament formation is required for NOD2 dependent NF-κB signalling
auteur
Erika Pellegrini, Ambroise Desfosses, Arndt Wallmann, Wiebke Manuela Schulze, Kristina Rehbein, Philippe Mas, Luca Signor, Stephanie Gaudon, Grasilda Zenkeviciute, Michael Hons, Hélène Malet, Irina Gutsche, Carsten Sachse, Guy Schoehn, Hartmut Oschkinat, Stephen Cusack
article
Nature Communications, 2018, 9 (1), ⟨10.1038/s41467-018-06451-3⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-01889011/file/Pellegrini%20et%20al.%20Nat%20Comm.pdf BibTex
titre
A new hope to fight invasive fungal infection
auteur
Carlo Petosa, Jérôme Govin, Flore Mietton
article
médecine/sciences, 2018, 34 (2), pp.123 - 125. ⟨10.1051/medsci/20183402007⟩
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2017

titre
Synaptic Interactome Mining Reveals p140Cap as a New Hub for PSD Proteins Involved in Psychiatric and Neurological Disorders.
auteur
Annalisa Alfieri, Oksana Sorokina, Annie Adrait, Costanza Angelini, Isabella Russo, Alessandro Morellato, Michela Matteoli, Elisabetta Menna, Elisabetta Boeri Erba, Colin Mclean, J Douglas Armstrong, Ugo Ala, Joseph D Buxbaum, Alfredo Brusco, Yohann Couté, Silvia de Rubeis, Emilia Turco, Paola Defilippi
article
Frontiers in Molecular Neuroscience, 2017, 10, pp.212. ⟨10.3389/fnmol.2017.00212⟩
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titre
Structural intermediates in the fusion-associated transition of vesiculovirus glycoprotein.
auteur
Eduard Baquero, Aurélie A Albertini, Hélène Raux, Abbas Abou‐hamdan, Elisabetta Boeri Erba, Malika Ouldali, Linda Buonocore, John K Rose, Jean Lepault, Stéphane Bressanelli, Yves Gaudin
article
EMBO Journal, 2017, 36 (5), pp.679-692. ⟨10.15252/embj.201694565⟩
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titre
Structure and Dynamics of a 197 bp Nucleosome in Complex with Linker Histone H1.
auteur
Jan Bednar, Isabel Garcia-Saez, Ramachandran Boopathi, Amber R Cutter, Gabor Papai, Anna Reymer, Sajad H Syed, Imtiaz Nisar Lone, Ognyan Tonchev, Corinne Crucifix, Hervé Menoni, Christophe Papin, Dimitrios Skoufias, Hitoshi Kurumizaka, Richard Lavery, Ali Hamiche, Jeffrey J Hayes, Patrick Schultz, Dimitar Angelov, Carlo Petosa, Stefan Dimitrov
article
Molecular Cell, 2017, 66 (5), pp.729. ⟨10.1016/j.molcel.2017.05.018⟩
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titre
Chromophore Isomer Stabilization Is Critical to the Efficient Fluorescence of Cyan Fluorescent Proteins
auteur
Guillaume Gotthard, David von Stetten, Damien Clavel, Marjolaine Noirclerc-Savoye, Antoine Royant
article
Biochemistry, 2017, 56 (49), pp.6418 - 6422. ⟨10.1021/acs.biochem.7b01088⟩
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titre
Efficient conversion of alkenes to chlorohydrins by a Ru-based artificial enzyme.
auteur
Sarah Lopez, Laurianne Rondot, Christine Cavazza, Marina Iannello, Elisabetta Boeri Erba, Nicolai Burzlaff, Frank Strinitz, Adeline Jorge-Robin, Caroline Marchi-Delapierre, Stéphane Ménage
article
Chemical Communications, 2017, 53 (25), pp.3579-3582. ⟨10.1039/C6CC08873B⟩
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titre
Unraveling self-assembly pathways of the 468-kDa proteolytic machine TET2.
auteur
Pavel Macek, Rime Kerfah, Elisabetta Boeri Erba, Elodie Crublet, Christine Moriscot, Guy Schoehn, Carlos Amero, Jérôme Boisbouvier
article
Science Advances , 2017, 3 (4), pp.e1601601. ⟨10.1126/sciadv.1601601⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-01561616/file/Macek%20et%20al.%20ScienceAdvances%202017.pdf BibTex
titre
Selective BET bromodomain inhibition as an antifungal therapeutic strategy.
auteur
Flore Mietton, Elena Ferri, Morgane Champleboux, Ninon Zala, Danièle Maubon, Yingsheng Zhou, Mike Harbut, Didier Spittler, Cécile Garnaud, Marie Courçon, Muriel Chauvel, Christophe d'Enfert, Boris A Kashemirov, Mitchell Hull, Muriel Cornet, Charles E Mckenna, Jérôme Govin, Carlo Petosa
article
Nature Communications, 2017, 8, pp.15482. ⟨10.1038/ncomms15482⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-01537809/file/Selective%20BET%20bromodomain%20inhibition%20as%20an%20antifungal%20therapeutic%20strategy.pdf BibTex
titre
Structures of the inactive and active states of RIP2 kinase inform on the mechanism of activation.
auteur
Erika Pellegrini, Luca Signor, Saurabh Singh, Elisabetta Boeri Erba, Stephen Cusack
article
PLoS ONE, 2017, 12 (5), pp.e0177161. ⟨10.1371/journal.pone.0177161⟩
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titre
Insights into the molecular architecture and histone H3-H4 deposition mechanism of yeast Chromatin assembly factor 1
auteur
Paul Victor Sauer, Jennifer Timm, Danni Liu, David Sitbon, Elisabetta Boeri Erba, Christophe Velours, Norbert Mücke, Jörg Langowski, Françoise Ochsenbein, Geneviève Almouzni, Daniel Panne
article
eLife, 2017, 6, pp.e23474. ⟨10.7554/eLife.23474⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-01522557/file/e23474-download.pdf BibTex

2016

titre
The CAL(AI)2DOSCOPE: a microspectrophotometer for accurate recording of correlated absorbance and fluorescence emission spectra
auteur
Martin Byrdin, Dominique Bourgeois
article
Spectroscopy Europe, 2016, 28 (6), pp.14-17
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titre
Barriers and levers to HIV post-exposure prophylaxis
auteur
Nicolas Charpentier, Guillemette Quatremere, Xavier Mabire, Sabrina Roduit, Vanessa Laguette, Didier Spittler, Elodie Guillois, Cyril Martin, Daniela Rojas Castro, Marie Preau
article
Santé Publique, 2016, 28 (6), pp.791-799. ⟨10.3917/spub.166.0791⟩
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titre
Fusion to a homo-oligomeric scaffold allows cryo-EM analysis of a small protein
auteur
Francesca Coscia, Leandro F Estrozi, Fabienne Hans, Hélène Malet, Marjolaine Noirclerc-Savoye, Guy Schoehn, Carlo Petosa
article
Scientific Reports, 2016, 6, pp.30909. ⟨10.1038/srep30909⟩
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titre
Bromodomains: Structure, function and pharmacology of inhibition.
auteur
Elena Ferri, Carlo Petosa, Charles E Mckenna
article
Biochemical Pharmacology, 2016, 106, pp.1-18
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titre
Dynamic Competing Histone H4 K5K8 Acetylation and Butyrylation Are Hallmarks of Highly Active Gene Promoters.
auteur
Afsaneh Goudarzi, Di Zhang, He Huang, Sophie Barral, Oh Kwang Kwon, Shankang Qi, Zhanyun Tang, Thierry Buchou, Anne-Laure Vitte, Tieming He, Zhongyi Cheng, Emilie Montellier, Jonathan Gaucher, Sandrine Curtet, Alexandra Debernardi, Guillaume Charbonnier, Denis Puthier, Carlo Petosa, Daniel Panne, Sophie Rousseaux, Robert G Roeder, Yingming Zhao, Saadi Khochbin
article
Molecular Cell, 2016, 62 (2), pp.169-80. ⟨10.1016/j.molcel.2016.03.014⟩
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titre
H1–nucleosome interactions and their functional implications
auteur
Ali Hamiche, Jan Bednar, Stefan Dimitrov
article
Biochimica et Biophysica Acta - Gene Regulatory Mechanisms , 2016, 1859 (3), pp.436-443. ⟨10.1016/j.bbagrm.2015.10.012⟩
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titre
Data publication with the structural biology data grid supports live analysis
auteur
Peter A. Meyer, Stephanie Socias, Jason Key, Elizabeth Ransey, Emily C. Tjon, Alejandro Buschiazzo, Ming Lei, Chris Botka, James Withrow, David Neau, Kanagalaghatta Rajashankar, Karen S. Anderson, Richard H. Baxter, Stephen C. Blacklow, Titus J. Boggon, Alexandre M. J. J. Bonvin, Dominika Borek, Tom J. Brett, Amedeo Caflisch, Chung-I Chang, Walter J. Chazin, Kevin D. Corbett, Michael S. Cosgrove, Sean Crosson, Sirano Dhe-Paganon, Enrico Di Cera, Catherine L. Drennan, Michael J. Eck, Brandt F. Eichman, Qing R. Fan, Adrian R. Ferré-d'Amaré, J. Christopher Fromme, K. Christopher Garcia, Rachelle Gaudet, Peng Gong, Stephen C. Harrison, Ekaterina E. Heldwein, Zongchao Jia, Robert J. Keenan, Andrew C. Kruse, Marc Kvansakul, Jason S. Mclellan, Yorgo Modis, Yunsun Nam, Zbyszek Otwinowski, Emil F. Pai, Pedro José Barbosa Pereira, Carlo Petosa, C. S. Raman, Tom A. Rapoport, Antonina Roll-Mecak, Michael K. Rosen, Gabby Rudenko, Joseph Schlessinger, Thomas U. Schwartz, Yousif Shamoo, Holger Sondermann, Niraj H. Tolia, Oleg V. Tsodikov, Kenneth D. Westover, Hao Wu, Ian Foster, James S. Fraser, Filipe R. N C. Maia, Tamir Gonen, Tom Kirchhausen, Kay Diederichs, Mercè Crosas, Piotr Sliz
article
Nature Communications, 2016, 7, ⟨10.1038/ncomms10882⟩
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titre
Quaternary Structure of Fur Proteins, a New Subfamily of Tetrameric Proteins
auteur
Julien Pérard, Jacques Covès, Mathieu Castellan, Serge Solard, Myriam Savard, Roger Miras, Sandra Galop, Luca Signor, Serge Crouzy, Isabelle Michaud-Soret, Eve de Rosny
article
Biochemistry, 2016, 55 (10), pp.1503-1515. ⟨10.1021/acs.biochem.5b01061⟩
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titre
Structural and dynamics studies of a truncated variant of CI repressor from bacteriophage TP901-1
auteur
Kim Krighaar Rasmussen, Kristian E. H. Frandsen, Elisabetta Boeri Erba, Margit Pedersen, Anders K. Varming, Karin Hammer, Mogens Kilstrup, Peter W. Thulstrup, Martin Blackledge, Malene Ringkjøbing Jensen, Leila Lo Leggio
article
Scientific Reports, 2016, 6, pp.29574. ⟨10.1038/srep29574⟩
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titre
Reaction of PerR with Molecular Oxygen May Assist H2O2 Sensing in Anaerobes.
auteur
Ramakrishan Sethu, Eric Gouré, Luca Signor, Christelle Caux-Thang, Martin Clémancey, Victor Duarte, Jean-Marc Latour
article
ACS Chemical Biology, 2016, 11 (5), pp.1438-1444. ⟨10.1021/acschembio.5b01054⟩
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titre
A Decade of Biochemical and Structural Studies of the DNA Repair Machinery of Deinococcus radiodurans: Major Findings, Functional and Mechanistic Insight and Challenges
auteur
Joanna Timmins, Elin Moe
article
Computational and Structural Biotechnology Journal, 2016, 14, pp.168 - 176. ⟨10.1016/j.csbj.2016.04.001⟩
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titre
Monitoring ssDNA Binding to the DnaB Helicase from Helicobacter pylori by Solid-State NMR Spectroscopy
auteur
Thomas Wiegand, Riccardo Cadalbert, Carole Gardiennet, Joanna Timmins, Laurent Terradot, Anja Böckmann, Beat H. Meier
article
Angewandte Chemie International Edition, 2016, 55 (45), pp.14164 - 14168. ⟨10.1002/anie.201607295⟩
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titre
Impact of Deuteration on the Assembly Kinetics of Transthyretin Monitored by Native Mass Spectrometry and Implications for Amyloidoses.
auteur
Ai Woon Yee, Martine Moulin, Nina Breteau, Michael Haertlein, Edward P Mitchell, Jonathan B Cooper, Elisabetta Boeri Erba, V Trevor Forsyth
article
Angewandte Chemie International Edition, 2016, ⟨10.1002/anie.201602747⟩
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titre
Rational design of a monomeric and photostable far-red fluorescent protein for fluorescence imaging in vivo
auteur
Dan Yu, Zhiqiang Dong, William Clay Gustafson, Rubén Ruiz-González, Luca Signor, Fanny Marzocca, Franck Borel, Matthew P. Klassen, Kalpana Makhijani, Antoine Royant, Yuh-Nung Jan, William A. Weiss, Su Guo, Xiaokun Shu
article
Protein Science, 2016, 25 (2), pp.308-315. ⟨10.1002/pro.2843⟩
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2015

titre
Structure and primase-mediated activation of a bacterial dodecameric replicative helicase
auteur
Alexandre Bazin, Mickael V Cherrier, Irina Gutsche, Joanna Timmins, Laurent Terradot
article
Nucleic Acids Research, 2015, 13 p. ⟨10.1093/nar/gkv792⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-01184227/file/Bazin_etal_NAR_2015.pdf BibTex
titre
Combining a NHS ester and glutaraldehyde improves crosslinking prior to MALDI MS analysis of intact protein complexes.
auteur
Elisabetta Boeri Erba, Pierre Andre Klein, Luca Signor
article
Biological Mass Spectrometry, 2015, 50 (10), pp.1114-9
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BibTex
titre
The emerging role of native mass spectrometry in characterizing the structure and dynamics of macromolecular complexes
auteur
Elisabetta Boeri Erba, Carlo Petosa
article
Protein Science, 2015, 10.1002, pro.2661. ⟨10.1002/pro.2661⟩
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BibTex
titre
Asymmetric ring structure of Vps4 required for ESCRT-III disassembly.
auteur
Christophe Caillat, Pauline Macheboeuf, Yuanfei Wu, Andrew A Mccarthy, Elisabetta Boeri Erba, Grégory Effantin, Heinrich G Göttlinger, Winfried Weissenhorn, Patricia Renesto
article
Nature Communications, 2015, 6 (1), pp.8781. ⟨10.1038/ncomms9781⟩
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titre
Self protein-protein interactions are involved in TPPP/p25 mediated microtubule bundling.
auteur
Salvatore Debonis, Emmanuelle Neumann, Dimitrios Skoufias
article
Scientific Reports, 2015, 5, pp.13242
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BibTex
titre
Rapid automated detergent screening for the solubilization and purification of membrane proteins and complexes.
auteur
Violaine Lantez, Ioulia Nikolaidis, M. Rechenmann, Thierry Vernet, Marjolaine Noirclerc-Savoye
article
Engineering in Life Sciences, 2015, 15 (1), p.39-50
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BibTex
titre
Novel insights into nickel import in Staphylococcus aureus: the positive role of free histidine and structural characterization of a new thiazolidine-type nickel chelator.
auteur
Hugo Lebrette, E. Borezée-Durant, Lydie Martin, P. Richaud, Elisabetta Boeri Erba, C. Cavazza
article
Metallomics : integrated biometal science, 2015, 7 (4), pp.613-21. ⟨10.1039/c4mt00295d⟩
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titre
IPP51, a chalcone acting as a microtubule inhibitor with in vivo antitumor activity against bladder carcinoma.
auteur
Véronique Martel-Frachet, Michelle Keramidas, Alessandra Nurisso, Salvatore Debonis, Claire Rome, Jean-Luc Coll, Ahcène Boumendjel, Dimitrios Skoufias, Xavier Ronot
article
Oncotarget, 2015, 6 (16), pp.14669-86
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titre
Tail proteins of phage T5: investigation of the effect of the His6-tag position, from expression to crystallisation.
auteur
Marjolaine Noirclerc-Savoye, Ali Flayhan, Cindy Pereira, Benoit Gallet, Pierre Gans, Christine Ebel, Cécile Breyton
article
Protein Expression and Purification, 2015, 109, pp.70-8
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titre
Structural and functional characterization of two unusual endonuclease III enzymes from Deinococcus radiodurans
auteur
Aili Sarre, Mats Ökvist, Tobias Klar, David R Hall, Arne O. Smalås, Sean Mcsweeney, Joanna Timmins, Elin Moe
article
Journal of Structural Biology, 2015, 191 (2), pp.87-99. ⟨10.1016/j.jsb.2015.05.009⟩
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2014

titre
Investigating macromolecular complexes using top-down mass spectrometry.
auteur
Elisabetta Boeri Erba
article
Proteomics, 2014, 14 (10), pp.1259-70
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titre
A cost-effective protocol for the parallel production of libraries of 13CH3-specifically labeled mutants for NMR studies of high molecular weight proteins.
auteur
Elodie Crublet, Rime Kerfah, Guillaume Mas, Marjolaine Noirclerc-Savoye, Violaine Lantez, Thierry Vernet, Jérôme Boisbouvier
article
Methods in Molecular Biology, 2014, pp.229-44
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01093893/file/Crublet%20et%20al.%20MethodsInMolecularBiology%202014.pdf BibTex
titre
Expression, purification and crystallization of two endonuclease III enzymes from Deinococcus radiodurans.
auteur
Aili Sarre, Mats Okvist, Tobias Klar, Elin Moe, Joanna Timmins
article
Acta Crystallographica Section F: Structural Biology and Crystallization Communications, 2014, 70 (Pt 12), pp.1688-92
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-01093359/file/Sarre_etal_EndoIII_ActaF_2014.pdf BibTex
titre
Centromeric histone variant CENP-A represses acetylation-dependent chromatin transcription that is relieved by histone chaperone NPM1.
auteur
Jayasha Shandilya, Parijat Senapati, Fabienne Hans, Hervé Menoni, Philippe Bouvet, Stefan Dimitrov, Dimitar Angelov, Tapas K Kundu
article
Journal of Biochemistry, 2014, 156 (4), pp.221-7
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titre
A complement to the modern crystallographer's toolbox : caged gadolinium complexes with versatile binding modes.
auteur
Meike Stelter, Rafael Molina, Sandra Jeudy, Richard Kahn, Chantal Abergel, Juan A. Hermoso
article
Acta crystallographica Section D : Structural biology [1993-..], 2014, 70 (6), pp.1506-16. ⟨10.1107/S1399004714005483⟩
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titre
RNA Clamping by Vasa Assembles a piRNA Amplifier Complex on Transposon Transcripts
auteur
Jordi Xiol, Pietro Spinelli, Maike a. Laussmann, David Homolka, Zhaolin Yang, Elisa Cora, Yohann Couté, Simon J. Conn, Jan Kadlec, Ravi Sachidanandam, Marko Kaksonen, Stephen Cusack, Anne Ephrussi, Ramesh s. Pillai
article
Cell, 2014, 157 (7), pp.1698-1711. ⟨10.1016/j.cell.2014.05.018⟩
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titre
An improved monomeric infrared fluorescent protein for neuronal and tumour brain imaging.
auteur
Dan Yu, William Clay Gustafson, Chun Han, Céline Lafaye, Marjolaine Noirclerc-Savoye, Woo-Ping Ge, Desiree A Thayer, Hai Huang, Thomas B Kornberg, Antoine Royant, Lily Yeh Jan, Yuh Nung Jan, William A Weiss, Xiaokun Shu
article
Nature Communications, 2014, 5, pp.3626
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