Publications HAL du labo/EPI 576;1043235 de la collection IBS-PBA

2024

titre
Monitoring Drug-Protein Interactions in the Bacterial Periplasm by Solution Nuclear Magnetic Resonance Spectroscopy
auteur
Alicja Razew, Quentin Herail, Mayara Miyachiro, Constantin Anoyatis-Pelé, Catherine Bougault, Andrea Dessen, Michel Arthur, Jean-Pierre Simorre
article
Journal of the American Chemical Society, In press, ⟨10.1021/jacs.4c00604⟩
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https://cnrs.hal.science/hal-04510786/file/KPC2_manuscript_ACS_v9.pdf BibTex

2023

titre
Architecture and genomic arrangement of the MurE–MurF bacterial cell wall biosynthesis complex
auteur
Karina Shirakawa, Fernanda Angélica Sala, Mayara Miyachiro, Viviana Job, Daniel Maragno Trindade, Andréa Dessen
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2023, 120 (21), pp.e2219540120. ⟨10.1073/pnas.2219540120⟩
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https://hal.science/hal-04162887/file/Shirakawa%20et%20al.%20pnas.pdf BibTex
titre
Architecture of a PKS-NRPS hybrid megaenzyme involved in the biosynthesis of the genotoxin colibactin
auteur
Sarah Bonhomme, Carlos Contreras-Martel, Andréa Dessen, Pauline Macheboeuf
article
Structure, 2023, 31 (6), pp.700-721.e4. ⟨10.1016/j.str.2023.03.012⟩
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https://hal.science/hal-04071035/file/Final-Bonhomme-Figures.pdf BibTex
titre
Penicillin-binding protein (PBP) inhibitor development: A 10-year chemical perspective
auteur
Ariane Bertonha, Caio Silva, Karina Shirakawa, Daniel Trindade, Andréa Dessen
article
Experimental Biology and Medicine, 2023, 248 (19), pp.1657-1670. ⟨10.1177/15353702231208407⟩
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2022

titre
Combined Structural Analysis and Molecular Dynamics Reveal Penicillin-Binding Protein Inhibition Mode with β-Lactones
auteur
Parker Flanders, Carlos Contreras-Martel, Nathaniel Brown, Joshua Shirley, Alexandre Martins, Kelsie Nauta, Andréa Dessen, Erin Carlson, Elizabeth Ambrose
article
ACS Chemical Biology, 2022, 17 (11), pp.3110-3120. ⟨10.1021/acschembio.2c00503⟩
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https://hal.science/hal-03969300/file/Flanders%20et%20al.%20ACS%20chemical%20biology.pdf BibTex
titre
Draft genome sequence of Psychrobacter nivimaris LAMA 639 and its biotechnological potential
auteur
Brendon Egon Kormann Staloch, Henrique Niero, Robert Cardoso De Freitas, Patricia Ballone, Fernanda Rodrigues-Costa, Daniela Barretto Barbosa Trivella, Andréa Dessen, Marcus Adonai Castro Da Silva, André Oliveira de Souza Lima
article
Data in Brief, 2022, 41, pp.107927. ⟨10.1016/j.dib.2022.107927⟩
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titre
Structural insights into ring-building motif domains involved in bacterial sporulation
auteur
Bowen Liu, Helena Chan, Elda Bauda, Carlos Contreras-Martel, Laure Bellard, Anne-Marie Villard, Caroline Mas, Emmanuelle Neumann, Daphna Fenel, Adrien Favier, Monica Serrano, Adriano Henriques, Christopher Rodrigues, Cecile Morlot
article
Journal of Structural Biology, 2022, 214 (1), pp.107813. ⟨10.1016/j.jsb.2021.107813⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-03621065/file/Liu%20et%20al.%20J%20of%20structural%20biology.pdf BibTex

2021

titre
Chemical Elicitors Induce Rare Bioactive Secondary Metabolites in Deep-Sea Bacteria under Laboratory Conditions
auteur
Rafael de Felício, Patricia Ballone, Cristina Freitas Bazzano, Luiz Alves, Renata Sigrist, Gina Polo Infante, Henrique Niero, Fernanda Rodrigues-Costa, Arthur Zanetti Nunes Fernandes, Luciane Tonon, Luciana Paradela, Renna Karoline Eloi Costa, Sandra Martha Gomes Dias, Andréa Dessen, Guilherme Telles, Marcus Adonai Castro da Silva, Andre Oliveira de Souza Lima, Daniela Barretto Barbosa Trivella
article
Metabolites, 2021, 11 (2), pp.107. ⟨10.3390/metabo11020107⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-03193692/file/deFelicio%20et%20al.%20Met%C3%A9bolites.pdf BibTex
titre
MagC is a NplC/P60‐like member of the $\alpha$‐2‐macroglobulin Mag complex of $Pseudomonas\ aeruginosa$ that interacts with peptidoglycan
auteur
Samira Zouhir, Carlos Contreras‐martel, Daniel Maragno Trindade, Ina Attrée, Andréa Dessen, Pauline Macheboeuf
article
FEBS Letters, 2021, ⟨10.1002/1873-3468.14148⟩
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titre
Self-association of MreC as a regulatory signal in bacterial cell wall elongation
auteur
Alexandre Martins, Carlos Contreras-Martel, Manon Janet-Maitre, Mayara Miyachiro, Leandro Estrozi, Daniel Maragno Trindade, Caíque Malospirito, Fernanda Rodrigues-Costa, Lionel Imbert, Viviana Job, Guy Schoehn, Ina Attrée, Andréa Dessen
article
Nature Communications, 2021, 12 (1), pp.2987. ⟨10.1038/s41467-021-22957-9⟩
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https://hal.science/hal-03369436/file/2021Martins.pdf BibTex
titre
The inherent flexibility of type I non-ribosomal peptide synthetase multienzymes drives their catalytic activities
auteur
Sarah Bonhomme, Andréa Dessen, Pauline Macheboeuf
article
Open Biology, 2021, 11 (5), pp.200386. ⟨10.1098/rsob.200386⟩
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https://hal.science/hal-03328643/file/Bonhomme%20et%20al.%20Open%20biology.pdf BibTex

2020

titre
Bacterial secretins: Mechanisms of assembly and membrane targeting
auteur
Yuri Rafael de Oliveira Silva, Carlos Contreras-Martel, Pauline Macheboeuf, Andréa Dessen
article
Protein Science, 2020, 29 (4), pp.893-904. ⟨10.1002/pro.3835⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-02864317/file/Oliveira%20de%20Silva%20et%20al.%20Protein%20Sci.pdf BibTex
titre
Exolysin (ExlA) from Pseudomonas aeruginosa Punctures Holes into Target Membranes Using a Molten Globule Domain
auteur
Quentin Bertrand, Viviana Job, Antoine Maillard, Lionel Imbert, Jean-Marie Teulon, Adrien Favier, Jean-Luc Pellequer, Philippe Huber, Ina Attree, Andréa Dessen
article
Journal of Molecular Biology, 2020, 432 (16), pp.4466-4480. ⟨10.1016/j.jmb.2020.05.025⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-02909708/file/Bertrand%20et%20al.%20JMB.pdf BibTex
titre
Merulinic acid C overcomes gentamicin resistance in Enterococcus faecium
auteur
Fernanda Rodrigues-Costa, Juliano Slivinski, Laura Ióca, Ariane Bertonha, Rafael de Felício, Marcos Guilherme Da Cunha, Paulo Vinicius da Mata Madeira, Ana Cauz, Daniel Maragno Trindade, Vítor Freire, Cristina Dislich Ropke, Ana Gales, Marcelo Brocchi, António Ferreira, Frederico Gueiros-Filho, Daniela Barretto Barbosa Trivella, Roberto Berlinck, Andréa Dessen
article
Bioorganic Chemistry, 2020, 100, pp.103921. ⟨10.1016/j.bioorg.2020.103921⟩
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titre
Photoswitching mechanism of a fluorescent protein revealed by time-resolved crystallography and transient absorption spectroscopy.
auteur
Joyce Woodhouse, Gabriela Nass Kovacs, Nicolas Coquelle, Lucas M. Uriarte, Virgile Adam, Thomas R. M. Barends, Martin Byrdin, Eugenio de La Mora, R. Bruce Doak, Mikolaj Feliks, Martin J Field, Franck Fieschi, Virginia Guillon, Stefan Jakobs, Yasumasa Joti, Pauline Macheboeuf, Koji Motomura, Karol Nass, Shigeki Owada, Christopher M. Roome, Cyril Ruckebusch, Giorgio Schirò, Robert L. Shoeman, Michel Thépaut, Tadashi Togashi, Kensuke Tono, Makina Yabashi, Marco Cammarata, Lutz Foucar, Dominique Bourgeois, Michel Sliwa, Jacques-Philippe Colletier, Ilme Schlichting, Martin Weik
article
Nature Communications, 2020, 11 (1), pp.741. ⟨10.1038/s41467-020-14537-0⟩
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https://hal.science/hal-02498645/file/s41467-020-14537-0.pdf BibTex

2019

titre
An RNA-Binding Protein Secreted by a Bacterial Pathogen Modulates RIG-I Signaling
auteur
Alessandro Pagliuso, To Nam Tham, Eric Allemand, Stevens Robertin, Bruno Dupuy, Quentin Bertrand, Christophe Becavin, Mikael Koutero, Valérie Najburg, Marie-Anne Nahori, Frédéric Tangy, Fabrizia Stavru, Sergey Bessonov, Andréa Dessen, Christian Muchardt, Alice Lebreton, Anastassia Komarova, Pascale Cossart
article
Cell Host and Microbe, 2019, 26 (6), pp.823-835.e11. ⟨10.1016/j.chom.2019.10.004⟩
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https://pasteur.hal.science/pasteur-02390001/file/Pagliuso_CHM19.pdf BibTex
titre
Baseplate Component TssK and Spatio-Temporal Assembly of T6SS in Pseudomonas aeruginosa
auteur
David Liebl, Mylène Robert-Genthon, Viviana Job, Valentina Cogoni, Ina Attree
article
Frontiers in Microbiology, 2019, 10, ⟨10.3389/fmicb.2019.01615⟩
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titre
Complex Formation between Mur Enzymes from Streptococcus pneumoniae
auteur
Mayara Miyachiro, Daniela Granato, Daniel Maragno Trindade, Christine Ebel, Adriana Franco Paes Leme, Andréa Dessen
article
Biochemistry, 2019, 58 (30), pp.3314-3324. ⟨10.1021/acs.biochem.9b00277⟩
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titre
Penicillin-Binding Proteins (PBPs) and Bacterial Cell Wall Elongation Complexes
auteur
Mayara Miyachiro, Carlos Contreras-Martel, Andréa Dessen
article
Subcellular Biochemistry: Macromolecular Protein Complexes II, 93, Robin Harris, pp.273-289, 2019, ⟨10.1007/978-3-030-28151-9_8⟩
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titre
Structural and Functional Characterization of the Type Three Secretion System (T3SS) Needle of Pseudomonas aeruginosa
auteur
Charlotte Lombardi, James Tolchard, Stéphanie Bouillot, Luca Signor, Caroline Gébus, David Liebl, Daphna Fenel, Jean-Marie Teulon, Juliane Brock, Birgit Habenstein, Jean-Luc Pellequer, Eric Faudry, Antoine Loquet, Ina Attree, Andréa Dessen, Viviana Job
article
Frontiers in Microbiology, 2019, 10 (573), ⟨10.3389/fmicb.2019.00573⟩
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titre
Structure and assembly of pilotin-dependent and -independent secretins of the type II secretion system
auteur
S Peter Howard, Leandro F Estrozi, Quentin Bertrand, Carlos Contreras-Martel, Timothy Strozen, Viviana Job, Alexandre Martins, Daphna Fenel, Guy Schoehn, Andréa Dessen
article
PLoS Pathogens, 2019, 15 (5), pp.e1007731. ⟨10.1371/journal.ppat.1007731⟩
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titre
The MurG glycosyltransferase provides an oligomeric scaffold for the cytoplasmic steps of peptidoglycan biosynthesis in the human pathogen Bordetella pertussis
auteur
Federica Laddomada, Mayara Miyachiro, Matthew Jessop, Delphine Patin, Viviana Job, Dominique Mengin-Lecreulx, Aline Le Roy, Christine Ebel, Cécile Breyton, Irina Gutsche, Andréa Dessen
article
Scientific Reports, 2019, 9 (1), pp.4656. ⟨10.1038/s41598-019-40966-z⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-02097640/file/Laddomada_ScientificReports_2019.pdf BibTex

2018

titre
Assembly of an atypical α-macroglobulin complex from Pseudomonas aeruginosa
auteur
Samira Zouhir, Mylène Robert-Genthon, Daniel Maragno Trindade, Viviana Job, Marko Nedeljković, Cécile Breyton, Christine Ebel, Ina Attree, Andréa Dessen
article
Scientific Reports, 2018, 8 (1), pp.527. ⟨10.1038/s41598-017-18083-6⟩
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titre
Pore-forming activity of the $Pseudomonas\ aeruginosa$ type III secretion system translocon alters the host epigenome
auteur
Laurent Dortet, Charlotte Lombardi, François Cretin, Andréa Dessen, Alain Filloux
article
Nature Microbiology, 2018, 3, pp.378 - 386. ⟨10.1038/s41564-018-0109-7⟩
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titre
Structural characterization of the sporulation protein GerM from Bacillus subtilis
auteur
Jennyfer Trouve, Ahmed Mohamed, Francisco Leisico, Carlos Contreras-Martel, Bowen Liu, Caroline Mas, David Rudner, Christopher D.A. Rodrigues, Cécile Morlot
article
Journal of Structural Biology, 2018, ⟨10.1016/j.jsb.2018.09.010⟩
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BibTex
titre
Structure of the essential peptidoglycan amidotransferase MurT/GatD complex from Streptococcus pneumoniae
auteur
Cécile Morlot, Daniel Straume, Katharina Peters, Olav A Hegnar, Nolwenn Simon, Anne-Marie Villard, Carlos Contreras-Martel, Francisco Leisico, Eefjan Breukink, Christine Gravier-Pelletier, Laurent Le Corre, Waldemar Vollmer, Nicolas Pietrancosta, Leiv Sigve Håvarstein, André Zapun
article
Nature Communications, 2018, 9, pp.3180. ⟨10.1038/s41467-018-05602-w⟩
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https://hal.science/hal-01861372/file/2018Morlot.pdf BibTex

2017

titre
Autocatalytic association of proteins by covalent bond formation: a Bio Molecular Welding toolbox derived from a bacterial adhesin.
auteur
Julie Bonnet, J. Cartannaz, G. Tourcier, Carlos Contreras-Martel, Jean-Philippe Kleman, Cécile Morlot, Thierry Vernet, Anne-Marie Di Guilmi
article
Scientific Reports, 2017, 7, pp.43564. ⟨10.1038/srep43564⟩
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titre
Molecular architecture of the PBP2–MreC core bacterial cell wall synthesis complex
auteur
Carlos Contreras-Martel, Alexandre Martins, Chantal Ecobichon, Daniel Maragno Trindade, Pierre-Jean Matteï, Samia Hicham, Pierre Hardouin, Meriem El Ghachi, Ivo G. Boneca, Andréa Dessen
article
Nature Communications, 2017, 8 (1), pp.776. ⟨10.1038/s41467-017-00783-2⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-01618613/file/s41467-017-00783-2.pdf BibTex
titre
New strategies for targeting and treatment of multi-drug resistant Staphylococcus aureus
auteur
L. Mayrink Assis, Marko Nedeljković, Andréa Dessen
article
Drug Resistance Updates, 2017, 31, pp.1 - 14. ⟨10.1016/j.drup.2017.03.001⟩
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BibTex
titre
Substitutions in PBP2b from β-Lactam-resistant Streptococcus pneumoniae Have Different Effects on Enzymatic Activity and Drug Reactivity.
auteur
Philippe Calvez, Eefjan Breukink, David I Roper, Mélanie Dib, Carlos Contreras-Martel, André Zapun
article
Journal of Biological Chemistry, 2017, 292 (7), pp.2854-2865. ⟨10.1074/jbc.M116.764696⟩
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2016

titre
Arginine 66 Controls Dark-State Formation in Green-to-Red Photoconvertible Fluorescent Proteins
auteur
Romain Berardozzi, Virgile Adam, Alexandre Martins, Dominique Bourgeois
article
Journal of the American Chemical Society, 2016, 138 (2), pp.558-565. ⟨10.1021/jacs.5b09923⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-01266594/file/Berardozi%20et%20al.%20JACS.pdf BibTex
titre
Rational design of ultrastable and reversibly photoswitchable fluorescent proteins for super-resolution imaging of the bacterial periplasm
auteur
Mariam El Khatib, Alexandre Martins, Dominique Bourgeois, Jacques-Philippe Colletier, Virgile Adam
article
Scientific Reports, 2016, 6, ⟨10.1038/srep18459⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-01280266/file/srep18459.pdf BibTex
titre
Structural Basis of Lipid Targeting and Destruction by the Type V Secretion System of Pseudomonas aeruginosa.
auteur
Paulo Vinicius da Mata Madeira, Samira Zouhir, Pauline Basso, David Neves, Aurélie Laubier, Richard Salacha, Sophie Bleves, Eric Faudry, Carlos Contreras-Martel, Andréa Dessen
article
Journal of Molecular Biology, 2016, 428 (9 Pt A), pp.1790-803. ⟨10.1016/j.jmb.2016.03.012⟩
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BibTex
titre
Structural Insights into Protein-Protein Interactions Involved in Bacterial Cell Wall Biogenesis.
auteur
Federica Laddomada, Mayara M Miyachiro, Andréa Dessen
article
Antibiotics, 2016, 5 (2), ⟨10.3390/antibiotics5020014⟩
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2015

titre
A Structural Snapshot of Type II Pilus Formation in Streptococcus pneumoniae.
auteur
Md Munan Shaik, Charlotte Lombardi, Daniel Maragno Trindade, Daphna Fenel, Guy Schoehn, Anne-Marie Di Guilmi, Andréa Dessen
article
Journal of Biological Chemistry, 2015, 290 (37), pp.22581-92
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titre
Asymmetric ring structure of Vps4 required for ESCRT-III disassembly.
auteur
Christophe Caillat, Pauline Macheboeuf, Yuanfei Wu, Andrew A Mccarthy, Elisabetta Boeri Erba, Grégory Effantin, Heinrich G Göttlinger, Winfried Weissenhorn, Patricia Renesto
article
Nature Communications, 2015, 6 (1), pp.8781. ⟨10.1038/ncomms9781⟩
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titre
Crystallographic Study of Peptidoglycan Biosynthesis Enzyme MurD: Domain Movement Revisited.
auteur
Roman Šink, Miha Kotnik, Anamarija Zega, Hélène Barreteau, Stanislav Gobec, Didier Blanot, Andréa Dessen, Carlos Contreras-Martel
article
PLoS ONE, 2015, 11 (3), pp.e0152075. ⟨10.1371/journal.pone.0152075⟩
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titre
FtsZ filament capping by MciZ, a developmental regulator of bacterial division.
auteur
Alexandre W Bisson-Filho, Karen F Discola, Patrícia Castellen, Valdir Blasios, Alexandre Martins, Maurício L Sforça, Wanius Garcia, Ana Carolina M Zeri, Harold P Erickson, Andréa Dessen, Frederico J Gueiros-Filho
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2015, 112 (17), pp.E2130-8
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titre
Rapid automated detergent screening for the solubilization and purification of membrane proteins and complexes.
auteur
Violaine Lantez, Ioulia Nikolaidis, M. Rechenmann, Thierry Vernet, Marjolaine Noirclerc-Savoye
article
Engineering in Life Sciences, 2015, 15 (1), p.39-50
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2014

titre
Crystal structure of pb9, the distal tail protein of bacteriophage T5: a conserved structural motif among all siphophages.
auteur
Ali Flayhan, Frédéric M D Vellieux, Rudi Lurz, Olivier Maury, Carlos Contreras-Martel, Eric Girard, Pascale Boulanger, Cécile Breyton
article
Journal of Virology, 2014, 88 (2), pp.820-8. ⟨10.1128/jvi.02135-13⟩
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titre
Membrane and chaperone recognition by the major translocator protein PopB of the type III secretion system of Pseudomonas aeruginosa.
auteur
Karen F Discola, Andreas Förster, François Boulay, Jean-Pierre Simorre, Ina Attree, Andréa Dessen, Viviana Job
article
Journal of Biological Chemistry, 2014, 289 (6), pp.3591-601
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titre
Penicillin-binding proteins and beta-lactam resistance
auteur
André Zapun, Pauline Macheboeuf, Thierry Vernet
article
Mayers D., Sobel J., Ouelette M., Lerner S. Antimicrobial Drug Resistance : Principles for the Clinic and Bench, 1 (13), Humana Press, p. 145-170, 2014
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titre
Resistance to antibiotics targeted to the bacterial cell wall.
auteur
I Nikolaidis, S Favini-Stabile, Andréa Dessen
article
Protein Science, 2014, 23 (3), pp.243-59
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titre
Structural basis for the inhibition of the chromatin repressor BAHD1 by the bacterial nucleomodulin LntA.
auteur
Alice Lebreton, Viviana Job, Marie Ragon, Alban Le Monnier, Andréa Dessen, Pascale Cossart, Hélène Bierne
article
mBio, 2014, 5 (1), pp.e00775-13. ⟨10.1128/mBio.00775-13⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-01109386/file/Lebreton2014cu.pdf BibTex
titre
Structural basis of pilus anchoring by the ancillary pilin RrgC of Streptococcus pneumoniae.
auteur
Md Munan Shaik, Amandine Maccagni, Guillaume Tourcier, Anne-Marie Di Guilmi, Andréa Dessen
article
Journal of Biological Chemistry, 2014, 289 (24), pp.16988-97
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BibTex
titre
Structural similarity of secretins from type II and type III secretion systems.
auteur
Tommaso Tosi, Leandro F Estrozi, Viviana Job, Ingrid Guilvout, Anthony P Pugsley, Guy Schoehn, Andréa Dessen
article
Structure, 2014, 22 (9), pp.1348-1355. ⟨10.1016/j.str.2014.07.005⟩
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BibTex
titre
Structure of a bacterial α2-macroglobulin reveals mimicry of eukaryotic innate immunity.
auteur
Steve G Wong, Andréa Dessen
article
Nature Communications, 2014, 22, pp.4917
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