Publications HAL du labo/EPI 576;1043235 de la collection IBS-RMN

2024

titre
Molecular recognition of Escherichia coli R1-type core lipooligosaccharide by DC-SIGN
auteur
Ferran Nieto-Fabregat, Angela Marseglia, Michel Thépaut, Jean-Philippe Kleman, Massilia Abbas, Aline Le Roy, Christine Ebel, Meriem Maalej, Jean-Pierre Simorre, Cedric Laguri, Antonio Molinaro, Alba Silipo, Franck Fieschi, Roberta Marchetti
article
iScience, 2024, 27 (2), pp.108792. ⟨10.1016/j.isci.2024.108792⟩
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https://hal.science/hal-04467850/file/Nieto-Fabregat%20et%20al.%20iScience.pdf BibTex
titre
Monitoring Drug-Protein Interactions in the Bacterial Periplasm by Solution Nuclear Magnetic Resonance Spectroscopy
auteur
Alicja Razew, Quentin Herail, Mayara Miyachiro, Constantin Anoyatis-Pelé, Catherine Bougault, Andrea Dessen, Michel Arthur, Jean-Pierre Simorre
article
Journal of the American Chemical Society, In press, ⟨10.1021/jacs.4c00604⟩
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https://cnrs.hal.science/hal-04510786/file/KPC2_manuscript_ACS_v9.pdf BibTex
titre
The Plasma Membrane-Associated Cation-Binding Protein Pcap1 of Arabidopsis Thaliana is a Uranyl-Binding Protein
auteur
Alicia Vallet, Jacqueline Martin-Laffon, Adrien Favier, Benoît Revel, Titouan Bonnot, Claude Vidaud, Jean Armengaud, Jean-Charles Gaillard, Pascale Delangle, Fabienne Devime, Sylvie Figuet, Nelson B.C. Serre, Elisabetta Boeri Erba, Bernhard Brutscher, Stéphane Ravanel, Jacques Bourguignon, Claude Alban
article
2024
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2023

titre
Aromatic ring flips in differently packed ubiquitin protein crystals from MAS NMR and MD
auteur
Diego Gauto, Olga Lebedenko, Lea Marie Becker, Isabel Ayala, Roman Lichtenecker, Nikolai Skrynnikov, Paul Schanda
article
Journal of Structural Biology: X, 2023, 7, pp.100079. ⟨10.1101/2022.07.07.499110⟩
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https://hal.science/hal-03863723/file/1-s2.0-S2590152422000204-main.pdf BibTex
titre
Infranalytics : une plateforme nationale pour accéder aux spectromètres les plus puissants
auteur
Jean-Pierre Simorre, Carine van Heijenoort
article
L'Actualité Chimique, 2023, 483
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https://hal.science/hal-04311873/file/Infranalytics_Actuchimique_2023.pdf BibTex
titre
Multivalent interactions of the disordered regions of XLF and XRCC4 foster robust cellular NHEJ and drive the formation of ligation-boosting condensates in vitro
auteur
Duc-Duy Vu, Alessio Bonucci, Manon Brenière, Metztli Cisneros-Aguirre, Philippe Pelupessy, Ziqing Wang, Ludovic Carlier, Guillaume Bouvignies, Patricia Cortes, Aneel Aggarwal, Martin Blackledge, Zoher Gueroui, Valérie Belle, Jeremy Stark, Mauro Modesti, Fabien Ferrage
article
BioRxiv, 2023, ⟨10.1101/2023.07.12.548668⟩
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titre
Phase separation and molecular ordering of the prion-like domain of the Arabidopsis thermosensory protein EARLY FLOWERING 3
auteur
Stephanie Hutin, Janet R Kumita, Vivien I Strotmann, Anika Dolata, Wai Li Ling, Nessim Louafi, Anton Popov, Pierre-Emmanuel Milhiet, Martin Blackledge, Max H Nanao, Philip A Wigge, Yvonne Stahl, Luca Costa, Mark D Tully, Chloe Zubieta
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2023, 120 (28), pp.e2304714120. ⟨10.1073/pnas.2304714120⟩
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https://hal.science/hal-04212491/file/2023.03.12.532276v1.full%20%281%29.pdf BibTex
titre
Site-specific introduction of alanines for the nuclear magnetic resonance investigation of low-complexity regions and large biomolecular assemblies
auteur
Carlos A Elena-Real, Annika Urbanek, Lionel Imbert, Anna Morató, Aurélie Fournet, Frédéric Allemand, Nathalie Sibille, Jérôme Boisbouvier, Pau Bernadó
article
ACS Chemical Biology, 2023, 18 (9), pp.2039-2049. ⟨10.1021/acschembio.3c00288⟩
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https://hal.science/hal-04225812/file/Elena-Real%20et%20al.%20acschembio.pdf BibTex
titre
Staphylococcus aureus sacculus mediates activities of M23 hydrolases
auteur
Alicja Razew, Cedric Laguri, Alicia Vallet, Catherine Bougault, Magdalena Kaus-Drobek, Izabela Sabala, Jean-Pierre Simorre
article
Nature Communications, 2023, 14 (1), pp.6706. ⟨10.1038/s41467-023-42506-w⟩
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https://hal.science/hal-04259415/file/Razew%20et%20al.%20Nature%20communications.pdf BibTex
titre
Structural heterogeneity in a phototransformable fluorescent protein impacts its photochemical properties
auteur
Arijit Maity, Jip Wulffelé, Isabel Ayala, Adrien Favier, Virgile Adam, Dominique Bourgeois, Bernhard Brutscher
article
Advanced Science, 2023, pp.e2306272. ⟨10.1002/advs.202306272⟩
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https://hal.science/hal-04426227/file/Advanced%20Science%20-%202023%20-%20Maity%20et%20al.%20Advanced%20sciences.pdf BibTex
titre
The plasma membrane-associated cation-binding protein PCaP1 of Arabidopsis thaliana is a uranyl-binding protein
auteur
Alicia Vallet, Jacqueline Martin-Laffon, Adrien Favier, Benoît Revel, Titouan Bonnot, Claude Vidaud, Jean Armengaud, Jean-Charles Gaillard, Pascale Delangle, Fabienne Devime, Sylvie Figuet, Nelson B.C. Serre, Elisabetta Boeri Erba, Bernhard Brutscher, Stéphane Ravanel, Jacques Bourguignon, Claude Alban
article
Journal of Hazardous Materials, 2023, 446, pp.art. 130668. ⟨10.1016/j.jhazmat.2022.130668⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03924852/file/Vallet%20et%20al%202023%20J%20Hazard%20Mater.pdf BibTex
titre
The rigid core and flexible surface of amyloid fibrils probed by Magic‐Angle Spinning NMR of aromatic residues
auteur
Lea Marie Becker, Mélanie Berbon, Alicia Vallet, Axelle Grelard, Estelle Morvan, Benjamin Bardiaux, Roman Lichtenecker, Matthias Ernst, Antoine Loquet, Paul Schanda
article
Angewandte Chemie International Edition, 2023, ⟨10.1002/anie.202219314⟩
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https://pasteur.hal.science/pasteur-04034318/file/HETS_HELLF_aromatics_AngewChem.pdf BibTex
titre
The structure of the high-affinity nickel-binding site in the Ni,Zn-HypA•UreE2 complex
auteur
Barbara Zambelli, Priyanka Basak, Heidi Hu, Mario Piccioli, Francesco Musiani, Valquiria Broll, Lionel Imbert, Jerome Boisbouvier, Michael Maroney, Stefano Ciurli
article
Metallomics, 2023, 15 (3), ⟨10.1093/mtomcs/mfad003⟩
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2022

titre
Antibacterial potency of type VI amidase effector toxins is dependent on substrate topology and cellular context
auteur
Atanas Radkov, Anne L Sapiro, Sebastian Flores, Corey Henderson, Hayden Saunders, Rachel Kim, Steven Massa, Samuel Thompson, Chase Mateusiak, Jacob Biboy, Ziyi Zhao, Lea M Starita, William L Hatleberg, Waldemar Vollmer, Alistair B Russell, Jean-Pierre Simorre, Spencer Anthony-Cahill, Peter Brzovic, Beth Hayes, Seemay Chou
article
eLife, 2022, 11, pp.e79796. ⟨10.7554/elife.79796⟩
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https://hal.science/hal-03801334/file/elife-79796.pdf BibTex
titre
Biomolecular and Biological Applications of Solid-State NMR with Dynamic Nuclear Polarization Enhancement
auteur
Wing Ying Chow, Gaël de Paëpe, Sabine Hediger
article
Chemical Reviews, 2022, 122 (10), pp.9795-9847. ⟨10.1021/acs.chemrev.1c01043⟩
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https://hal.science/hal-03658826/file/bioDNP_ChemRev2022_revised.pdf BibTex
titre
DltC acts as an interaction hub for AcpS, DltA and DltB in the teichoic acid d-alanylation pathway of Lactiplantibacillus plantarum
auteur
Nikos Nikolopoulos, Renata C Matos, Pascal Courtin, Isabel Ayala, Houssam Akherraz, Jean-Pierre Simorre, Marie-Pierre Chapot-Chartier, François Leulier, Stéphanie Ravaud, Christophe Grangeasse
article
Scientific Reports, 2022, 12 (1), pp.13133. ⟨10.1038/s41598-022-17434-2⟩
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https://hal.science/hal-03758310/file/s41598-022-17434-2.pdf BibTex
titre
Functional control of a 0.5 MDa TET aminopeptidase by a flexible loop revealed by MAS NMR
auteur
Diego Gauto, Pavel Macek, Duccio Malinverni, Hugo Fraga, Matteo Paloni, Iva Sučec, Audrey Hessel, Juan Pablo Bustamante, Alessandro Barducci, Paul Schanda
article
Nature Communications, 2022, 13, pp.1927. ⟨10.1038/s41467-022-29423-0⟩
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https://hal.science/hal-03866731/file/s41467-022-29423-0-1.pdf BibTex
titre
NMR assignment of human HSP90 N-terminal domain bound to a long residence time resorcinol ligand
auteur
Faustine Henot, Elodie Crublet, Matthias Frech, Jerome Boisbouvier
article
Biomolecular NMR Assignments, 2022, 16 (2), pp.257-266. ⟨10.1007/s12104-022-10089-0⟩
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titre
Nucleus-translocated mitochondrial cytochrome c liberates nucleophosmin-sequestered ARF tumor suppressor by changing nucleolar liquid–liquid phase separation
auteur
Katiuska González-Arzola, Antonio Díaz-Quintana, Noelia Bernardo-García, Jonathan Martínez-Fábregas, Francisco Rivero-Rodríguez, Miguel Á Casado-Combreras, Carlos Elena-Real, Alejandro Velázquez-Cruz, Sergio Gil-Caballero, Adrián Velázquez-Campoy, Elzbieta Szulc, María Gavilán, Isabel Ayala, Rocío Arranz, Rosa Ríos, Xavier Salvatella, José Valpuesta, Juan Hermoso, Miguel de la Rosa, Irene Díaz-Moreno
article
Nature Structural and Molecular Biology, 2022, 29 (10), pp.1024-1036. ⟨10.1038/s41594-022-00842-3⟩
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titre
Preparation and Characterization of Heparan Sulfate-Derived Oligosaccharides to Investigate Protein–GAG Interaction and HS Biosynthesis Enzyme Activity
auteur
Cédric Laguri, Rabia Sadir, Evelyne Gout, Romain Vivès, Hugues Lortat-Jacob
article
Glycosaminoglycans, 2303, Springer US, pp.121-137, 2022, Methods in Molecular Biology, ⟨10.1007/978-1-0716-1398-6_11⟩
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titre
Preparation and Characterization of Heparan Sulfate-Derived Oligosaccharides to Investigate Protein–GAG Interaction and HS Biosynthesis Enzyme Activity
auteur
Cédric Laguri, Rabia Sadir, Evelyne Gout, Romain Vivès, Hugues Lortat-Jacob
article
Glycosaminoglycans, 2303, Springer US, pp.121-137, 2022, Methods in Molecular Biology, ⟨10.1007/978-1-0716-1398-6_11⟩
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titre
Preparation and Characterization of Heparan Sulfate-Derived to Investigate Protein–GAG Interaction and HS Enzyme Activity
auteur
Cédric Laguri, Rabia Sadir, Evelyne Gout, Romain Vivès, Hugues Lortat-Jacob
article
Glycosaminoglycans, 2303, Springer US, pp.121-137, 2022, Methods in Molecular Biology, ⟨10.1007/978-1-0716-1398-6_11⟩
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titre
Publisher Correction: Functional control of a 0.5 MDa TET aminopeptidase by a flexible loop revealed by MAS NMR
auteur
Diego Gauto, Pavel Macek, Duccio Malinverni, Hugo Fraga, Matteo Paloni, Iva Sučec, Audrey Hessel, Juan Pablo Bustamante, Alessandro Barducci, Paul Schanda
article
Nature Communications, 2022, 13 (1), pp.3593. ⟨10.1038/s41467-022-31243-1⟩
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titre
Structural basis for the inhibition of IAPP fibril formation by the co-chaperonin prefoldin
auteur
Ricarda Törner, Tatsiana Kupreichyk, Lothar Gremer, Elisa Colas Debled, Daphna Fenel, Sarah Schemmert, Pierre Gans, Dieter Willbold, Guy Schoehn, Wolfgang Hoyer, Jerome Boisbouvier
article
Nature Communications, 2022, 13, pp.2363. ⟨10.1038/s41467-022-30042-y⟩
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https://hal.science/hal-03829614/file/Torner%20et%20al.%20Nature%20Communications.pdf BibTex
titre
Structural insights into ring-building motif domains involved in bacterial sporulation
auteur
Bowen Liu, Helena Chan, Elda Bauda, Carlos Contreras-Martel, Laure Bellard, Anne-Marie Villard, Caroline Mas, Emmanuelle Neumann, Daphna Fenel, Adrien Favier, Monica Serrano, Adriano Henriques, Christopher Rodrigues, Cecile Morlot
article
Journal of Structural Biology, 2022, 214 (1), pp.107813. ⟨10.1016/j.jsb.2021.107813⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-03621065/file/Liu%20et%20al.%20J%20of%20structural%20biology.pdf BibTex
titre
Suppressor Mutations in LptF Bypass Essentiality of LptC by Forming a Six-Protein Transenvelope Bridge That Efficiently Transports Lipopolysaccharide
auteur
Federica Falchi, Rebecca Taylor, Sebastian Rowe, Elisabete Moura, Tiago Baeta, Cedric Laguri, Jean-Pierre Simorre, Daniel Kahne, Alessandra Polissi, Paola Sperandeo
article
mBio, 2022, pp.e0220222. ⟨10.1128/mbio.02202-22⟩
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titre
Targeting a G-quadruplex from let-7e pre-miRNA with small molecules and nucleolin
auteur
Tiago Santos, André Miranda, Lionel Imbert, David Monchaud, Gilmar Salgado, Eurico Cabrita, Carla Cruz
article
Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis, 2022, 215, pp.114757. ⟨10.1016/j.jpba.2022.114757⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-03655794/file/Santos%20et%20al.pdf BibTex
titre
The role of heat shock proteins in preventing amyloid toxicity
auteur
Ricarda Törner, Tatsiana Kupreichyk, Wolfgang Hoyer, Jerome Boisbouvier
article
Frontiers in Molecular Biosciences, 2022, 9, pp.1045616. ⟨10.3389/fmolb.2022.1045616⟩
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BibTex
titre
Visualizing the transiently populated closed-state of human HSP90 ATP binding domain
auteur
Faustine Henot, Elisa Rioual, Adrien Favier, Pavel Macek, Elodie Crublet, Pierre Josso, Bernhard Brutscher, Matthias Frech, Pierre Gans, Claire Loison, Jerome Boisbouvier
article
2022
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https://hal.science/hal-03819347/file/2022.03.16.484593v1.full.pdf BibTex
titre
Visualizing the transiently populated closed-state of human HSP90 ATP binding domain
auteur
Faustine Henot, Elisa Rioual, Adrien Favier, Pavel Macek, Elodie Crublet, Pierre Josso, Bernhard Brutscher, Matthias Frech, Pierre Gans, Claire Loison, Jerome Boisbouvier
article
Nature Communications, 2022, 13 (1), pp.7601. ⟨10.1038/s41467-022-35399-8⟩
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https://hal.science/hal-04025433/file/s41467-022-35399-8.pdf BibTex

2021

titre
Architecture and assembly dynamics of the essential mitochondrial chaperone complex TIM9·10·12
auteur
Katharina Weinhäupl, Yong Wang, Audrey Hessel, Martha Brennich, Kresten Lindorff-Larsen, Paul Schanda
article
Structure, 2021, 29 (9), pp.1065-1073.e4. ⟨10.1016/j.str.2021.04.009⟩
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https://hal.science/hal-03875247/file/S0969212621001258.pdf BibTex
titre
Assessment of prediction methods for protein structures determined by NMR in CASP14 : impact of AlphaFold2
auteur
Yuanpeng Janet Huang, Ning Zhang, Beate Bersch, Krzysztof Fidelis, Masayori Inouye, Yojiro Ishida, Andriy Kryshtafovych, Naohiro Kobayashi, Yutaka Kuroda, Gaohua Liu, Andy Liwang, G. Swapna, Nan Wu, Toshio Yamazaki, Gaetano Montelione
article
Proteins - Structure, Function and Bioinformatics, 2021, 89 (12), pp.1959-1976. ⟨10.1002/prot.26246⟩
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https://hal.science/hal-03357450/file/prot.26246.pdf BibTex
titre
Backbone and methyl resonances assignment of the 87 kDa prefoldin from Pyrococcus horikoshii
auteur
Ricarda Törner, Faustine Henot, Rida Awad, Pavel Macek, Pierre Gans, Jérôme Boisbouvier
article
Biomolecular NMR Assignments, 2021, ⟨10.1007/s12104-021-10029-4⟩
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https://hal.science/hal-03262426/file/Torner%20et%20al.%20Biomol.pdf BibTex
titre
Deciphering the structural attributes of protein–heparan sulfate interactions using chemo-enzymatic approaches and NMR spectroscopy
auteur
Aurélie Préchoux, Jean-Pierre Simorre, Hugues Lortat-Jacob, Cédric Laguri
article
Glycobiology, 2021, ⟨10.1093/glycob/cwab012⟩
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https://hal.science/hal-03184396/file/Pr%C3%A9choux%20et%20al.%20-%202021%20-%20Deciphering%20the%20structural%20attributes%20of%20protein%E2%80%93heparan%20sulfate%20interactions%20using%20chemo-enzymatic%20approach.pdf BibTex
titre
Determination of the two-component systems regulatory network reveals core and accessory regulations across Pseudomonas aeruginosa lineages
auteur
Julian Trouillon, Lionel Imbert, Anne-Marie Villard, Thierry Vernet, Ina Attrée, Sylvie Elsen
article
Nucleic Acids Research, 2021, 49 (20), pp.11476-11490. ⟨10.1093/nar/gkab928⟩
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https://hal.science/hal-03463808/file/Trouillon%20et%20al.%20NAR.pdf BibTex
titre
Disentangling Chromophore States in a Reversibly Switchable Green Fluorescent Protein: Mechanistic Insights from NMR Spectroscopy
auteur
Nina Eleni Christou, Karine Giandoreggio-Barranco, Isabel Ayala, Oleksandr Glushonkov, Virgile Adam, Dominique Bourgeois, Bernhard Brutscher
article
Journal of the American Chemical Society, 2021, 143 (19), pp.7521-7530. ⟨10.1021/jacs.1c02442⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-03328569/file/Christou%20et%20al.%20JACS.pdf BibTex
titre
How do Chaperones Bind (Partly) Unfolded Client Proteins?
auteur
Iva Sučec, Beate Bersch, Paul Schanda
article
Frontiers in Molecular Biosciences, 2021, 8, pp.762005. ⟨10.3389/fmolb.2021.762005⟩
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https://hal.science/hal-03408836/file/su1.pdf BibTex
titre
In Vitro Production of Perdeuterated Proteins in H2O for Biomolecular NMR Studies
auteur
Lionel Imbert, Rachel Lenoir-Capello, Elodie Crublet, Alicia Vallet, Rida Awad, Isabel Ayala, Celine Juillan-Binard, Hubert Mayerhofer, Rime Kerfah, Pierre Gans, Emeric Miclet, Jerome Boisbouvier
article
Methods in Molecular Biology, 2021, 2199, pp.127-149. ⟨10.1007/978-1-0716-0892-0_8⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-03015847/file/Imbert%20et%20al.%20Structure%20Genomics.pdf BibTex
titre
LptB 2 FG is an ABC transporter with Adenylate Kinase activity regulated by LptC/A recruitment
auteur
Tiago Baeta, Karine Giandoreggio-Barranco, Isabel Ayala, Elisabete Moura, Paola Sperandeo, Alessandra Polissi, Jean-Pierre Simorre, Cedric Laguri
article
2021
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BibTex
titre
Optimized precursor to simplify assignment transfer between backbone resonances and stereospecifically labelled valine and leucine methyl groups: application to human Hsp90 N-terminal domain
auteur
Faustine Henot, Rime Kerfah, Ricarda Törner, Pavel Macek, Elodie Crublet, Pierre Gans, Matthias Frech, Olivier Hamelin, Jérôme Boisbouvier
article
Journal of Biomolecular NMR, 2021, 75 (6-7), pp.221-232. ⟨10.1007/s10858-021-00370-0⟩
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https://hal.science/hal-03262389/file/henot%20et%20al.%20Jbiomol.pdf BibTex
titre
Peptidoglycan binding by a pocket on the accessory NTF2-domain of Pgp2 directs helical cell shape of Campylobacter jejuni
auteur
Chang Sheng-Huei Lin, Anson Chan, Jenny Vermeulen, Jacob Brockerman, Arvind Soni, Martin Tanner, Erin Gaynor, Lawrence Mcintosh, Jean-Pierre Simorre, Michael Murphy
article
Journal of Biological Chemistry, 2021, 296, pp.100528. ⟨10.1016/j.jbc.2021.100528⟩
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BibTex
titre
Pre-miRNA-149 G-quadruplex as a molecular agent to capture nucleolin
auteur
Tiago Santos, André Miranda, Lionel Imbert, Andreia Jardim, Catarina Caneira, Virgínia Chu, João Conde, Maria Paula Cabral Campello, António Paulo, Gilmar Salgado, Eurico Cabrita, Carla Cruz
article
European Journal of Pharmaceutical Sciences, 2021, 169, pp.106093. ⟨10.1016/j.ejps.2021.106093⟩
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BibTex
titre
Self-association of MreC as a regulatory signal in bacterial cell wall elongation
auteur
Alexandre Martins, Carlos Contreras-Martel, Manon Janet-Maitre, Mayara Miyachiro, Leandro Estrozi, Daniel Maragno Trindade, Caíque Malospirito, Fernanda Rodrigues-Costa, Lionel Imbert, Viviana Job, Guy Schoehn, Ina Attrée, Andréa Dessen
article
Nature Communications, 2021, 12 (1), pp.2987. ⟨10.1038/s41467-021-22957-9⟩
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https://hal.science/hal-03369436/file/2021Martins.pdf BibTex
titre
Solution Structure of the C-terminal Domain of A20, the Missing Brick for the Characterization of the Interface between Vaccinia Virus DNA Polymerase and its Processivity Factor
auteur
Beate Bersch, Nicolas Tarbouriech, Wim Burmeister, Frédéric Iseni
article
Journal of Molecular Biology, 2021, 433 (13), pp.167009. ⟨10.1016/j.jmb.2021.167009⟩
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https://hal.science/hal-03243142/file/1-s2.0-S0022283621002102-main.pdf BibTex
titre
Structural Basis for the Inhibition of IAPP Fibril Formation by the Hsp60 Co-Chaperonin Prefoldin
auteur
Ricarda Toerner, Tatsiana Kupreichyk, Lothar Gremer, Elisa Colas Debled, Daphna Fenel, Pierre Gans, Dieter Willbold, Guy Schoehn, Wolfgang Hoyer, Jerome Boisbouvier
article
2021
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BibTex
titre
The lipopolysaccharide transporter complex LptB2FG also displays adenylate kinase activity in vitro dependent on binding partners LptC/LptA
auteur
Tiago Baeta, Karine Giandoreggio-Barranco, Isabel Ayala, Elisabete C.C. M. Moura, Paola Sperandeo, Alessandra Polissi, Jean-Pierre Simorre, Cédric Laguri
article
Journal of Biological Chemistry, 2021, pp.101313. ⟨10.1016/j.jbc.2021.101313⟩
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https://hal.science/hal-03394830/file/Tiago-et-al_preproof.pdf BibTex
titre
The Plastid-Encoded RNA Polymerase-Associated Protein PAP9 Is a Superoxide Dismutase With Unusual Structural Features
auteur
Adrien Favier, Pierre Gans, Elisabetta Boeri Erba, Luca Signor, Soumiya Sankari Muthukumar, Thomas Pfannschmidt, Robert Blanvillain, David Cobessi
article
Frontiers in Plant Science, 2021, 12, pp.668897. ⟨10.3389/fpls.2021.668897⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-03313484/file/fpls-12-668897.pdf BibTex

2020

titre
Assembly of The Mitochondrial Complex I Assembly Complex Suggests a Regulatory Role for Deflavination
auteur
Gabriele Giachin, Matthew Jessop, Romain Bouverot, Samira Acajjaoui, Melissa Saïdi, Anaïs Chretien, Maria Bacia-Verloop, Luca Signor, Philippe Mas, Adrien Favier, Eve Borel Meneroud, Michael Hons, Darren Hart, Eaazhisai Kandiah, Elisabetta Boeri Erba, Alain Buisson, Gordon Leonard, Irina Gutsche, Montserrat Soler-Lopez
article
Angewandte Chemie International Edition, 2020, ⟨10.1002/anie.202011548⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-03119718/file/Giachin%20et%20al.%20-%202021%20-%20Assembly%20of%20The%20Mitochondrial%20Complex%20I%20Assembly%20C.pdf BibTex
titre
Asymmetric Synthesis of Methyl Specifically Labelled L ‐Threonine and Application to the NMR Studies of High Molecular Weight Proteins
auteur
Isabel Ayala, Lucile Chiari, Rime Kerfah, Jérôme Boisbouvier, Pierre Gans, Olivier Hamelin
article
ChemistrySelect, 2020, 5 (17), pp.5092-5098. ⟨10.1002/slct.202000827⟩
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https://hal.science/hal-02867781/file/Ayala%20et%20al.%20Biol%20Chem%20%26%20chem%20Biol%202020.pdf BibTex
titre
Boronic acid and diol-containing polymers: how to choose the correct couple to form “strong” hydrogels at physiological pH
auteur
Tamiris Figueiredo, Vanina Cosenza, Yu Ogawa, Isabelle Jeacomine, Alicia Vallet, Sonia Ortega, Raphaël Michel, Johan D M Olsson, Thibaud Gerfaud, Jean-Guy Boiteau, Jing Jing, Craig Harris, Rachel Auzély-Velty
article
Soft Matter, 2020, 16 (15), pp.3628-3641. ⟨10.1039/D0SM00178C⟩
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https://hal.science/hal-03815499/file/Ms_SoftMatter_revised_VF%20RA.pdf BibTex
titre
Crystallographic analysis of Staphylococcus aureus LcpA, the primary wall teichoic acid ligase
auteur
Franco Li, Federico Rosell, Robert Gale, Jean-Pierre Simorre, Eric Brown, Natalie Strynadka
article
Journal of Biological Chemistry, 2020, 295 (9), pp.2629-2639. ⟨10.1074/jbc.RA119.011469⟩
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BibTex
titre
Defining the function of OmpA in the Rcs stress response
auteur
Kilian Dekoninck, Juliette Létoquart, Cédric Laguri, Pascal Jean-Pierre Demange, Robin Bevernaegie, Jean-Pierre Simorre, Olivia Dehu, Bogdan Iorga, Benjamin Elias, Seung-Hyun Cho, Jean-Francois Collet
article
eLife, 2020, 9, pp.e60861. ⟨10.7554/eLife.60861⟩
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https://hal.science/hal-02998523/file/elife-60861-v2-light.pdf BibTex
titre
Exolysin (ExlA) from Pseudomonas aeruginosa Punctures Holes into Target Membranes Using a Molten Globule Domain
auteur
Quentin Bertrand, Viviana Job, Antoine Maillard, Lionel Imbert, Jean-Marie Teulon, Adrien Favier, Jean-Luc Pellequer, Philippe Huber, Ina Attree, Andréa Dessen
article
Journal of Molecular Biology, 2020, 432 (16), pp.4466-4480. ⟨10.1016/j.jmb.2020.05.025⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-02909708/file/Bertrand%20et%20al.%20JMB.pdf BibTex
titre
Nucleo‐plastidic PAP 8/ pTAC 6 couples chloroplast formation with photomorphogenesis
auteur
Monique Liebers, François-Xavier Gillet, Abir Israel, Kevin Pounot, Louise Chambon, Maha Chieb, Fabien Chevalier, Rémi Ruedas, Adrien Favier, Pierre Gans, Elisabetta Boeri Erba, David Cobessi, Thomas Pfannschmidt, Robert Blanvillain
article
EMBO Journal, 2020, 39 (22), pp.e104941. ⟨10.15252/embj.2020104941⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-02972660/file/Liebers%20preprint.pdf BibTex
titre
Spectral editing of intra- and inter-chain methyl–methyl NOEs in protein complexes
auteur
Ricarda Törner, Rida Awad, Pierre Gans, Bernhard Brutscher, Jérôme Boisbouvier
article
Journal of Biomolecular NMR, 2020, 74 (1), pp.83-94. ⟨10.1007/s10858-019-00293-x⟩
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https://hal.science/hal-02504779/file/Torner%20et%20al.%20JBiomol%202019.pdf BibTex
titre
SPOR Proteins Are Required for Functionality of Class A Penicillin-Binding Proteins in Escherichia coli
auteur
Manuel Pazos, Katharina Peters, Adrien Boes, Yalda Safaei, Calem Kenward, Nathanael Caveney, Cédric Laguri, Eefjan Breukink, Natalie Strynadka, Jean-Pierre Simorre, Mohammed Terrak, Waldemar Vollmer
article
mBio, 2020, 11 (6), ⟨10.1128/mBio.02796-20⟩
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BibTex
titre
Structural basis of client specificity in mitochondrial membrane-protein chaperones
auteur
Iva Sučec, Yong Wang, Ons Dakhlaoui, Katharina Weinhäupl, Tobias Jores, Doriane Costa, Audrey Hessel, Martha Brennich, Doron Rapaport, Kresten Lindorff-Larsen, Beate Bersch, Paul Schanda
article
2020
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BibTex
titre
Structural basis of client specificity in mitochondrial membrane-protein chaperones
auteur
Iva Sučec, Yong Wang, Ons Dakhlaoui, Katharina Weinhäupl, Tobias Jores, Doriane Costa, Audrey Hessel, Martha Brennich, Doron Rapaport, Kresten Lindorff-Larsen, Beate Bersch, Paul Schanda
article
Science Advances , 2020, 6 (51), pp.eabd0263. ⟨10.1126/sciadv.abd0263⟩
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https://hal.science/hal-03184293/file/sciadv.abd0263.pdf BibTex
titre
Structural features of the interaction of MapZ with FtsZ and membranes in Streptococcus pneumoniae
auteur
Tomáš Hošek, Catherine M Bougault, Jean-Pierre Lavergne, Denis Martinez, Isabel Ayala, Daphna Fenel, Marine Restelli, Cécile Morlot, Birgit Habenstein, Christophe C. Grangeasse, Jean-Pierre Simorre
article
Scientific Reports, 2020, 10 (1), pp.4051. ⟨10.1038/s41598-020-61036-9⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-01119769/file/Hosek%20et%20al.%20Sci%20Rep.pdf BibTex
titre
Structure of the Peptidoglycan Synthase Activator LpoP in Pseudomonas aeruginosa
auteur
Nathanael Caveney, Alexander Egan, Isabel Ayala, Cédric Laguri, Craig Robb, Eefjan Breukink, Waldemar Vollmer, Natalie Strynadka, Jean-Pierre Simorre
article
Structure, 2020, 28 (6), pp.643-650.e5. ⟨10.1016/j.str.2020.03.012⟩
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BibTex
titre
Thanatin Impairs Lipopolysaccharide Transport Complex Assembly by Targeting LptC–LptA Interaction and Decreasing LptA Stability
auteur
Elisabete Moura, Tiago Baeta, Alessandra Romanelli, Cédric Laguri, Alessandra Martorana, Emanuela Erba, Jean-Pierre Simorre, Paola Sperandeo, Alessandra Polissi
article
Frontiers in Microbiology, 2020, 11, pp.909. ⟨10.3389/fmicb.2020.00909⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-03002248/file/fmicb-11-00909.pdf BibTex
titre
The mitochondrial carrier pathway transports non-canonical substrates with an odd number of transmembrane segments
auteur
Heike Rampelt, Iva Sucec, Beate Bersch, Patrick Horten, Inge Perschil, Jean-Claude Martinou, Martin van Der Laan, Nils Wiedemann, Paul Schanda, Nikolaus Pfanner
article
BMC Biology, 2020, 18 (1), ⟨10.1186/s12915-019-0733-6⟩
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https://hal.science/hal-02440892/file/s12915-019-0733-6.pdf BibTex

2019

titre
Aromatic ring dynamics, thermal activation and transient conformations of a 468 kDa enzyme by specific labeling and fast-MAS NMR
auteur
Diego Gauto, Pavel Macek, Alessandro Barducci, Hugo Fraga, Audrey Hessel, Tsutomu Terauchi, David Gajan, Yohei Miyanoiri, Jérôme Boisbouvier, Roman Josef Lichtenecker, Masatsune Kainosho, Paul Schanda
article
Journal of the American Chemical Society, 2019, ⟨10.1021/jacs.9b04219⟩
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BibTex
titre
Aromatic SOFAST-HMBC for proteins at natural $^{13}$C abundance
auteur
Alicia Vallet, Adrien Favier, Bernhard Brutscher
article
Journal of Magnetic Resonance, 2019, 300, pp.95-102. ⟨10.1016/j.jmr.2019.01.009⟩
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https://hal.science/hal-02085964/file/S1090780719300096.pdf BibTex
titre
Conformational Dynamics in the Core of Human Y145Stop Prion Protein Amyloid Probed by Relaxation Dispersion NMR
auteur
Matthew Shannon, Theint Theint, Dwaipayan Mukhopadhyay, Krystyna Surewicz, Witold Surewicz, Dominique Marion, Paul Schanda, Christopher Jaroniec
article
ChemPhysChem, 2019, BioNMR Spectroscopy, 20 (2), pp.311-317. ⟨10.1002/cphc.201800779⟩
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https://hal.science/hal-01885648/file/PrPdynamics-ChemPhysChem.pdf BibTex
titre
Integrated NMR and cryo-EM atomic-resolution structure determination of a half-megadalton enzyme complex
auteur
Diego Gauto, Leandro F Estrozi, Charles Schwieters, Grégory Effantin, Pavel Macek, Rémy Sounier, Astrid C. Sivertsen, Elena Schmidt, Rime Kerfah, Guillaume Mas, Jacques-Philippe Colletier, Peter Güntert, Adrien Favier, Guy Schoehn, Paul Schanda, Jérôme Boisbouvier
article
Nature Communications, 2019, 10 (1), pp.2697. ⟨10.1038/s41467-019-10490-9⟩
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https://hal.science/hal-02166767/file/gauto2019.pdf BibTex
titre
Mechanism of the allosteric activation of the ClpP protease machinery by substrates and active-site inhibitors
auteur
Jan Felix, Katharina Weinhäupl, Christophe Chipot, François Dehez, Audrey Hessel, Diego Gauto, Cécile Morlot, Olga Abian, Irina Gutsche, Adrian Velazquez-Campoy, Paul Schanda, Hugo Fraga
article
Science Advances , 2019, 5 (9), pp.eaaw3818. ⟨10.1126/sciadv.aaw3818⟩
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https://hal.science/hal-02279022/file/Felix%20et%20al.%20-%20Sci.%20Adv.%20-%202019.pdf BibTex
titre
Mechanistic Insights into Microsecond Time-Scale Motion of Solid Proteins Using Complementary 15 N and 1 H Relaxation Dispersion Techniques
auteur
Petra Rovó, Colin Smith, Diego Gauto, Bert de Groot, Paul Schanda, Rasmus Linser
article
Journal of the American Chemical Society, 2019, 141 (2), pp.858-869. ⟨10.1021/jacs.8b09258⟩
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BibTex
titre
Negative impact of carbapenem methylation on the reactivity of β-lactams for cysteine acylation revealed by quantum calculations and kinetic analyses
auteur
Nicholus Bhattacharjee, Sébastien Triboulet, Vincent Dubée, Matthieu Fonvielle, Zainab Edoo, Jean-Emmanuel Hugonnet, Mélanie Etheve-Quelquejeu, Jean-Pierre Simorre, Martin J. Field, Michel Arthur, Catherine M Bougault
article
Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 2019, 63 (4), pp.e02039-18. ⟨10.1128/AAC.02039-18⟩
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https://hal.science/hal-02057268/file/AAC.02039-18.pdf BibTex
titre
Recognition of Peptidoglycan Fragments by the Transpeptidase PBP4 From Staphylococcus aureus
auteur
Roberto Maya-Martinez, J Andrew N Alexander, Christian Otten, Isabel Ayala, Daniela Vollmer, Joe Gray, Catherine M Bougault, Alister Burt, Cédric Laguri, Matthieu Fonvielle, Michel Arthur, Natalie Strynadka, Waldemar Vollmer, Jean-Pierre Simorre
article
Frontiers in Microbiology, 2019, 9, pp.3223. ⟨10.3389/fmicb.2018.03223⟩
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BibTex
titre
Relaxing with liquids and solids – A perspective on biomolecular dynamics
auteur
Paul Schanda
article
Journal of Magnetic Resonance, 2019, 306, pp.180-186. ⟨10.1016/j.jmr.2019.07.025⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-02269125/file/S109078071930151X.pdf BibTex
titre
Studying intact bacterial peptidoglycan by proton-detected NMR spectroscopy at 100 kHz MAS frequency
auteur
Catherine M Bougault, Isabel Ayala, Waldemar Vollmer, Jean-Pierre Simorre, Paul Schanda
article
Journal of Structural Biology, 2019, 206 (1), pp.66-72. ⟨10.1016/j.jsb.2018.07.009⟩
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https://hal.science/hal-01857707/file/revision-proton-detected-final.pdf BibTex

2018

titre
Advanced isotopic labeling for the NMR investigation of challenging proteins and nucleic acids
auteur
Jérôme Boisbouvier, Lewis E Kay
article
Journal of Biomolecular NMR, 2018, 71 (3), pp.115-117. ⟨10.1007/s10858-018-0199-9⟩
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https://hal.science/hal-01991758/file/Boisbouvier%20et%20al.%20JBNMR2018.pdf BibTex
titre
BEST and SOFAST experiments for resonance assignment of histidine and tyrosine side chains in 13C/15N labeled proteins
auteur
Nina Eleni Christou, Bernhard Brutscher
article
Journal of Biomolecular NMR, 2018, 72 (3-4), pp.115-124. ⟨10.1007/s10858-018-0216-z⟩
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BibTex
titre
Coupling of polymerase and carrier lipid phosphatase prevents product inhibition in peptidoglycan synthesis
auteur
Víctor Hernández-Rocamora, Christian Otten, Atanas Radkov, Jean-Pierre Simorre, Eefjan Breukink, Michael Vannieuwenhze, Waldemar Vollmer
article
The Cell Surface, 2018, 2, pp.1 - 13. ⟨10.1016/j.tcsw.2018.04.002⟩
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BibTex
titre
Dynamics and interactions of AAC3 in DPC are not functionally relevant
auteur
Vilius Kurauskas, Audrey Hessel, Francois Dehez, Christophe Chipot, Beate Bersch, Paul Schanda
article
Nature Structural and Molecular Biology, 2018, 25 (9), pp.745-747. ⟨10.1038/s41594-018-0127-4⟩
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BibTex
titre
How Detergent Impacts Membrane Proteins: Atomic-Level Views of Mitochondrial Carriers in Dodecylphosphocholine
auteur
Vilius Kurauskas, Audrey Hessel, Peixiang Ma, Paola Lunetti, Katharina Weinhäupl, Lionel Imbert, Bernhard Brutscher, Martin King, Rémy Sounier, Vincenza Dolce, Edmund Kunji, Loredana Capobianco, Christophe Chipot, Francois Dehez, Beate Bersch, Paul Schanda
article
Journal of Physical Chemistry Letters, 2018, 9 (5), pp.933-938. ⟨10.1021/acs.jpclett.8b00269⟩
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BibTex
titre
Induced conformational changes activate the peptidoglycan synthase PBP1B
auteur
Alexander Egan, Roberto Maya-Martinez, Isabel Ayala, Catherine M Bougault, Manuel Banzhaf, Eefjan Breukink, Waldemar Vollmer, Jean-Pierre Simorre
article
Molecular Microbiology, 2018, 110 (3), pp.335 - 356. ⟨10.1111/mmi.14082⟩
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BibTex
titre
microRNA-122 amplifies hepatitis C virus translation by shaping the structure of the internal ribosomal entry site
auteur
Philipp Schult, Hanna Roth, Rebecca Adams, Caroline Mas, Lionel Imbert, Christian Orlik, Alessia Ruggieri, Anna Pyle, Volker Lohmann
article
Nature Communications, 2018, 9, pp.2613. ⟨10.1038/s41467-018-05053-3⟩
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BibTex
titre
Microsecond motions probed by near-rotary-resonance R1ρ 15N MAS NMR experiments: the model case of protein overall-rocking in crystals
auteur
Alexey Krushelnitsky, Diego Gauto, Diana Rodriguez Camargo, Paul Schanda, Kay Saalwächter
article
Journal of Biomolecular NMR, 2018, 71 (1), pp.53-67. ⟨10.1007/s10858-018-0191-4⟩
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https://hal.science/hal-01857740/file/Krushelnitsky%20et%20al.%20-%20Journal%20of%20Biomolecular%20NMR%20-%202018.pdf BibTex
titre
Microsecond Protein Dynamics from Combined Bloch-McConnell and Near-Rotary-Resonance R1rho Relaxation-Dispersion MAS NMR
auteur
Dominique Marion, Diego Gauto, Isabel Ayala, Karine Giandoreggio-Barranco, Paul Schanda
article
ChemPhysChem, 2018, ⟨10.1002/cphc.201800935⟩
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BibTex
titre
NMR for Biological Systems
auteur
Paul Schanda, Eduard Chekmenev
article
ChemPhysChem, 2018
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BibTex
titre
Perturbations of Native Membrane Protein Structure in Alkyl Phosphocholine Detergents: A Critical Assessment of NMR and Biophysical Studies
auteur
Christophe Chipot, François Dehez, Jason Schnell, Nicole Zitzmann, Eva Pebay-Peyroula, Laurent Catoire, Bruno Miroux, Edmund Kunji, Gianluigi Veglia, Timothy Cross, Paul Schanda
article
Chemical Reviews, 2018, 118 (7), pp.3559-3607. ⟨10.1021/acs.chemrev.7b00570⟩
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BibTex
titre
Solid State NMR Studies of Intact Lipopolysaccharide Endotoxin
auteur
Cédric Laguri, Alba Silipo, Alessandra M Martorana, Paul Schanda, Roberta Marchetti, Alessandra Polissi, Antonio Molinaro, Jean-Pierre Simorre
article
ACS Chemical Biology, 2018, 13 (8), pp.2106 - 2113. ⟨10.1021/acschembio.8b00271⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-01875923/file/Laguri_main_FINAL.pdf BibTex
titre
Structural Basis of Membrane Protein Chaperoning through the Mitochondrial Intermembrane Space
auteur
Katharina Weinhäupl, Caroline Lindau, Audrey Hessel, Yong Wang, Conny Schütze, Tobias Jores, Laura Melchionda, Birgit Schönfisch, Hubert Kalbacher, Beate Bersch, Doron Rapaport, Martha Brennich, Kresten Lindorff-Larsen, Nils Wiedemann, Paul Schanda
article
Cell, 2018, 175 (5), pp.1365 - 1379.e25. ⟨10.1016/j.cell.2018.10.039⟩
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https://hal.science/hal-01925763/file/Weinha%CC%88upl%20et%20al.%20-%20Cell%20-%202018.pdf BibTex
titre
Structural investigation of a chaperonin in action reveals how nucleotide binding regulates the functional cycle
auteur
Guillaume Mas, Jia-Ying Guan, Elodie Crublet, Elisa Colas Debled, Christine Moriscot, Pierre Gans, Guy Schoehn, Pavel Macek, Paul Schanda, Jérôme Boisbouvier
article
Science Advances , 2018, 4 (9), pp.eaau4196. ⟨10.1126/sciadv.aau4196⟩
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https://hal.science/hal-01912129/file/Mas%20et%20al.%20Chaperonin%202018.pdf BibTex
titre
The antibiotic cyclomarin blocks arginine-phosphate–induced millisecond dynamics in the N-terminal domain of ClpC1 from Mycobacterium tuberculosis
auteur
Katharina Weinhäupl, Martha Brennich, Uli Kazmaier, Joël Lelièvre, Lluis Ballell, Alfred Goldberg, Paul Schanda, Hugo Fraga
article
Journal of Biological Chemistry, 2018, ⟨10.1074/jbc.RA118.002251⟩
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https://hal.science/hal-01768184/file/J.%20Biol.%20Chem.-2018-Weinha%CC%88upl-jbc.RA118.002251.pdf BibTex

2017

titre
Fragment-Based NMR Study of the Conformational Dynamics in the bHLH Transcription Factor Ascl1.
auteur
Lorenzo Baronti, Tomáš Hošek, Sergio Gil-Caballero, Hadas Raveh-Amit, Eduardo O Calçada, Isabel Ayala, András Dinnyés, Isabella C Felli, Roberta Pierattelli, Bernhard Brutscher
article
Biophysical Journal, 2017, 112 (7), pp.1366-1373. ⟨10.1016/j.bpj.2017.02.025⟩
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BibTex
titre
Functional reconstitution of cell-free synthesized purified K v channels
auteur
Stéphane Renauld, Sandra Cortès, Beate Bersch, Xavier Henry, Michel de Waard, Béatrice Schaack
article
Biochimica et Biophysica Acta:Biomembranes, 2017, 1859 (12), pp.2373 - 2380. ⟨10.1016/j.bbamem.2017.09.002⟩
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BibTex
titre
Interaction of lipopolysaccharides at intermolecular sites of the periplasmic Lpt transport assembly
auteur
Cédric Laguri, Paola Sperandeo, Kevin Pounot, Isabel Ayala, Alba Silipo, Catherine M Bougault, Antonio Molinaro, Alessandra Polissi, Jean-Pierre Simorre
article
Scientific Reports, 2017, 7 (1), pp.9715. ⟨10.1038/s41598-017-10136-0⟩
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BibTex
titre
Methyl-Specific Isotope Labeling Strategies for NMR Studies of Membrane Proteins
auteur
Vilius Kurauskas, Paul Schanda, Rémy Sounier
article
Methods in Molecular Biology, 2017, ⟨10.1007/978-1-4939-7151-0_6⟩
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https://hal.science/hal-01571189/file/ms-MiMB-2015-sounier-190116.pdf BibTex
titre
Mitochondrial ADP/ATP Carrier in Dodecylphosphocholine Binds Cardiolipins with Non-native Affinity
auteur
François Dehez, Paul Schanda, Martin S King, Edmund R S Kunji, Christophe Chipot
article
Biophysical Journal, 2017, S0006-3495 (17), pp.31031-31037. ⟨10.1016/j.bpj.2017.09.019⟩
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BibTex
titre
Observation of CH⋅⋅⋅π Interactions between Methyl and Carbonyl Groups in Proteins.
auteur
Frédéric A Perras, Dominique Marion, Jérôme Boisbouvier, David L Bryce, Michael J Plevin
article
Angewandte Chemie International Edition, 2017, 56 (26), pp.7564-7567. ⟨10.1002/anie.201702626⟩
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https://hal.science/hal-01538752/file/Perras%20et%20al.%20Angawandte%202017.pdf BibTex
titre
Optimized fast mixing device for real-time NMR applications.
auteur
Rémi Franco, Adrien Favier, Paul Schanda, Bernhard Brutscher
article
Journal of Magnetic Resonance, 2017, 281, pp.125-129. ⟨10.1016/j.jmr.2017.05.016⟩
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BibTex
titre
Probing Conformational Exchange Dynamics in a Short-Lived Protein Folding Intermediate by Real-Time Relaxation-Dispersion NMR.
auteur
Rémi Franco, Sergio Gil-Caballero, Isabel Ayala, Adrien Favier, Bernhard Brutscher
article
Journal of the American Chemical Society, 2017, 139 (3), pp.1065-1068. ⟨10.1021/jacs.6b12089⟩
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BibTex
titre
Protein conformational dynamics studied by (15)N and (1)H R1ρ relaxation dispersion: Application to wild-type and G53A ubiquitin crystals.
auteur
Diego Gauto, Audrey Hessel, Petra Rovó, Vilius Kurauskas, Rasmus Linser, Paul Schanda
article
Solid State Nuclear Magnetic Resonance, 2017, pp.S0926-2040(17)30006-1. ⟨10.1016/j.ssnmr.2017.04.002⟩
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BibTex
titre
Proton-detected solid-state NMR spectroscopy of a zinc diffusion facilitator protein in native nanodiscs
auteur
Beate Bersch, Jonas M Dörr, Audrey Hessel, J. Antoinette Killian, Paul Schanda
article
Angewandte Chemie International Edition, 2017, 56 (9), pp.2508-2512. ⟨10.1002/anie.201610441⟩
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https://hal.science/hal-01433745/file/CzcD_120117.pdf BibTex
titre
RNA binding and chaperone activity of the E. coli cold-shock protein CspA.
auteur
Enrico Rennella, Tomáš Sára, Michael Juen, Christoph Wunderlich, Lionel Imbert, Zsófia Sólyom, Adrien Favier, Isabel Ayala, Katharina Weinhäupl, Paul Schanda, Robert Konrat, Christoph Kreutz, Bernhard Brutscher
article
Nucleic Acids Research, 2017, 45 (7), pp.4255-4268. ⟨10.1093/nar/gkx044⟩
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BibTex
titre
Slow conformational exchange and overall rocking motion in ubiquitin protein crystals
auteur
Vilius Kurauskas, Sergei N Izmailov, Olga N Rogacheva, Audrey Hessel, Isabel Ayala, Joyce Woodhouse, Anastasya A Shilova, Yi N Xue, Tairan N Yuwen, Nicolas Coquelle, Jacques-Philippe N Colletier, Nikolai N Skrynnikov, Paul Schanda
article
Nature Communications, 2017, ⟨10.1038/s41467-017-00165-8⟩
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https://hal.science/hal-01571175/file/Kurauskas%20et%20al.%20-%202017%20-%20Nat.%20Commun%282%29.pdf BibTex
titre
Slow conformational exchange and overall rocking motion in ubiquitin protein crystals
auteur
Vilius Kurauskas, Izmailov Sergei A., Rogacheva Olga N., Audrey Hessel, Isabel Ayala, Woodhouse Joyce, Anastasya Shilova, Yi Xue, Tairan Yuwen, Nicolas Coquelle, Jacques-Philippe Colletier, Nikolai R. Skrynnikov, Paul Schanda
article
Nature Communications, 2017, ⟨10.1101/126813⟩
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titre
Solid‐state NMR H‐N‐(C)‐H and H‐N‐C‐C 3D/4D correlation experiments for resonance assignment of large proteins
auteur
Hugo Fraga, Charles-Adrien Arnaud, Diego Gauto, Maxime Audin, Vilius Kurauskas, Pavel Macek, Carsten Krichel, Jia-Ying Guan, Jérôme Boisbouvier, Remco Sprangers, Cécile Breyton, Paul Schanda
article
ChemPhysChem, 2017, ⟨10.1002/cphc.201700572⟩
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https://hal.science/hal-01583214/file/Author%20pre.pdf BibTex
titre
Structural insights into the substrate recognition and reaction specificity of the PLP-dependent fold-type I isoleucine 2-epimerase from Lactobacillus buchneri.
auteur
Rida Awad, Pierre Gans, Jean-Baptiste Reiser
article
Biochimie, 2017, 137, pp.165 - 173. ⟨10.1016/j.biochi.2017.03.015⟩
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titre
Unraveling self-assembly pathways of the 468-kDa proteolytic machine TET2.
auteur
Pavel Macek, Rime Kerfah, Elisabetta Boeri Erba, Elodie Crublet, Christine Moriscot, Guy Schoehn, Carlos Amero, Jérôme Boisbouvier
article
Science Advances , 2017, 3 (4), pp.e1601601. ⟨10.1126/sciadv.1601601⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-01561616/file/Macek%20et%20al.%20ScienceAdvances%202017.pdf BibTex

2016

titre
A ring-shaped conduit connects the mother cell and forespore during sporulation in Bacillus subtilis
auteur
Christopher D. A. Rodrigues, Xavier Henry, Emmanuelle Neumann, Vilius Kurauskas, Laure Bellard, Yann Fichou, Paul Schanda, Guy Schoehn, David Z. Rudner, Cécile Morlot
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2016, 113 (41), pp.11585-11590. ⟨10.1073/pnas.1609604113⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-01378398/file/PNAS-2016-Rodrigues_1.pdf BibTex
titre
Carbon-sulfur bond-forming reaction catalysed by the radical SAM enzyme HydE.
auteur
Roman Rohac, Patricia Amara, Alhosna Benjdia, Lydie Martin, Pauline Ruffié, Adrien Favier, Olivier Berteau, Jean-Marie Mouesca, Juan-Carlos Fontecilla-Camps, Yvain Nicolet
article
Nature Chemistry, 2016, 8 (5), pp.491-500. ⟨10.1038/NCHEM.2490⟩
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titre
Cross-Correlated Relaxation of Dipolar Coupling and Chemical-Shift Anisotropy in Magic-Angle Spinning R 1ρ NMR Measurements: Application to Protein Backbone Dynamics Measurements
auteur
Vilius Kurauskas, Emmanuelle Weber, Audrey Hessel, Isabel Ayala, Dominique Marion, Paul Schanda
article
Journal of Physical Chemistry B, 2016, 120 (34), pp.8905-8913. ⟨10.1021/acs.jpcb.6b06129⟩
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https://hal.science/hal-01382208/file/draft_CCR_rev1.pdf BibTex
titre
Hybrid Potential Simulation of the Acylation of Enterococcus faecium l,d-Transpeptidase by Carbapenems.
auteur
Nicholus Bhattacharjee, Martin J Field, Jean-Pierre Simorre, Michel Arthur, Catherine M Bougault
article
Journal of Physical Chemistry B, 2016, 120 (21), pp.4767-81. ⟨10.1021/acs.jpcb.6b02836⟩
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titre
Recombinant expression of the precursor of the hemorrhagic metalloproteinase HF3 and its non-catalytic domains using a cell-free synthesis system.
auteur
Milene C Menezes, Lionel Imbert, Eduardo S Kitano, Thierry Vernet, Solange M T Serrano
article
Amino Acids, 2016, ⟨10.1007/s00726-016-2255-7⟩
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titre
Sensitive proton-detected solid-state NMR spectroscopy of large proteins with selective CH3 labelling: application to the 50S ribosome subunit
auteur
Vilius Kurauskas, Elodie Crublet, Pavel Macek, Rime Kerfah, Diego Gauto, Jérôme Boisbouvier, Paul Schanda
article
Chemical Communications, 2016, 52, pp.9558-9561. ⟨10.1039/C6CC04484K⟩
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https://hal.science/hal-01353309/file/draft_simplelayout.pdf BibTex
titre
Structural and Functional Investigation of the Ag(+)/Cu(+) Binding Domains of the Periplasmic Adaptor Protein SilB from Cupriavidus metallidurans CH34.
auteur
Patricia Urbina, Beate Bersch, Fabien de Angelis, Kheiro-Mouna Derfoufi, Martine Prévost, Erik Goormaghtigh, Guy Vandenbussche
article
Biochemistry, 2016, 55 (20), pp.2883-97. ⟨10.1021/acs.biochem.6b00022⟩
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titre
Structure–function analysis of the extracellular domain of the pneumococcal cell division site positioning protein MapZ
auteur
Sylvie Manuse, Nicolas L Jean, Mégane Guinot, Jean-Pierre Lavergne, Cédric Laguri, Catherine M Bougault, Michael Vannieuwenhze, Christophe C. Grangeasse, Jean-Pierre Simorre
article
Nature Communications, 2016, 7 (1), pp.12071. ⟨10.1038/ncomms12071⟩
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titre
Studying Dynamics by Magic-Angle Spinning Solid-State NMR Spectroscopy: Principles and Applications to Biomolecules
auteur
Paul Schanda, Matthias Ernst
article
Progress in Nuclear Magnetic Resonance Spectroscopy, 2016, ⟨10.1016/j.pnmrs.2016.02.001⟩
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https://hal.science/hal-01280094/file/PNMRS_dynamics.pdf BibTex
titre
Synthesis and Structural Studies of Gallium(III) and Iron(III) Hemicryptophane Complexes
auteur
Isabelle Gosse, Koen Robeyns, Catherine M Bougault, Alexandre Martinez, Bernard Tinant, Jean-Pierre Dutasta
article
Inorganic Chemistry, 2016, 55 (3), pp.1011-1013. ⟨10.1021/acs.inorgchem.5b02750⟩
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2015

titre
Acyl acceptor recognition by Enterococcus faecium l,d-transpeptidase Ldtfm.
auteur
Sébastien Triboulet, Catherine M Bougault, Cédric Laguri, Jean-Emmanuel Hugonnet, Michel Arthur, Jean-Pierre Simorre
article
Molecular Microbiology, 2015, pp.10.1111
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titre
Backbone and side-chain (1)H, (13)C, and (15)N NMR assignments of the N-terminal domain of Escherichia coli LpoA.
auteur
Nicolas L Jean, Catherine M Bougault, Adeline Derouaux, Gilles Callens, Waldemar Vollmer, Jean-Pierre Simorre
article
Biomolecular NMR Assignments, 2015, pp.11
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titre
C5-epimerase and 2-O-sulfotransferase associate in vitro to generate contiguous epimerized and 2-O-sulfated heparan sulfate domains
auteur
Aurelie Prechoux, Celia Halimi, Jean-Pierre Simorre, Hugues Lortat-Jacob, Cédric Laguri
article
ACS Chemical Biology, 2015, 10 (4), pp.1064-1071
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titre
CH3-specific NMR assignment of alanine, isoleucine, leucine and valine methyl groups in high molecular weight proteins using a single sample
auteur
Rime Kerfah, Olivier Hamelin, Jérôme Boisbouvier, Dominique Marion
article
Journal of Biomolecular NMR, 2015, 63 (4), pp.389-402. ⟨10.1007/s10858-015-9998-4⟩
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https://hal.science/hal-01274085/file/Kerfah%20et%20al.%20JBiomolNMR%202015.pdf BibTex
titre
Conformational Exchange Processes in Biological Systems: Detection by Solid-State NMR
auteur
Peixiang Ma, Paul Schanda
article
eMagRes, 2015, ⟨10.1002/9780470034590.emrstm1418⟩
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https://hal.science/hal-01234460/file/draft_emagres_050515%20%281%29.pdf BibTex
titre
Coordination of peptidoglycan synthesis and outer membrane constriction during Escherichia coli cell division.
auteur
Andrew N Gray, Alexander J F Egan, Inge L Van'T Veer, Jolanda Verheul, Alexandre Colavin, Alexandra Koumoutsi, Jacob Biboy, a F Maarten Altelaar, Mirjam J Damen, Kerwyn Casey Huang, Jean-Pierre Simorre, Eefjan Breukink, Tanneke den Blaauwen, Athanasios Typas, Carol A Gross, Waldemar Vollmer
article
eLife, 2015, 4, pp.10.7554
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titre
Hydration water mobility is enhanced around tau amyloid fibers.
auteur
Yann Fichou, Giorgio Schirò, François-Xavier Gallat, Cédric Laguri, Martine Moulin, Jérôme Combet, Michaela Zamponi, Michael Härtlein, Catherine Picart, Estelle Mossou, Hugues Lortat-Jacob, Jacques-Philippe Colletier, Douglas J Tobias, Martin Weik
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2015, 112 (20), pp.6365-70
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titre
Induced folding in RNA recognition by Arabidopsis thaliana DCL1.
auteur
Irina P Suarez, Paula Burdisso, Matthieu Benoit, Jérôme Boisbouvier, Rodolfo M Rasia
article
Nucleic Acids Research, 2015, 43 (13), pp.6607-6619. ⟨10.1093/nar/gkv627⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-01199213/file/SUAREZ%20et%20al.%20NAR2015.PDF BibTex
titre
Longitudinal relaxation properties of (1)H(N) and (1)H(α) determined by direct-detected (13)C NMR experiments to study intrinsically disordered proteins (IDPs).
auteur
Tomáš Hošek, Sergi Gil-Caballero, Roberta Pierattelli, Bernhard Brutscher, Isabella C Felli
article
Journal of Magnetic Resonance, 2015, 254, pp.19-26
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BibTex
titre
Methyl-specific isotopic labeling: a molecular tool box for solution NMR studies of large proteins.
auteur
Rime Kerfah, Michael J Plevin, Rémy Sounier, Pierre Gans, Jérôme Boisbouvier
article
Current Opinion in Structural Biology, 2015, 32, pp.113-122. ⟨10.1016/j.sbi.2015.03.009⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-01162354/file/Kerfah%20et%20al%3B%20COSBI%202015.pdf BibTex
titre
NMR Methods for the Study of Instrinsically Disordered Proteins Structure, Dynamics, and Interactions: General Overview and Practical Guidelines.
auteur
Bernhard Brutscher, Isabella C Felli, Sergio Gil-Caballero, Tomáš Hošek, Rainer Kümmerle, Alessandro Piai, Roberta Pierattelli, Zsófia Sólyom
article
Advances in Experimental Medicine and Biology, 2015, 870, pp.49-122
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titre
Observing the overall rocking motion of a protein in a crystal
auteur
Peixiang Ma, Yi Xue, Nicolas Coquelle, Jens D. Haller, Tairan Yuwen, Isabel Ayala, Oleg Mikhailovskii, Dieter Willbold, Jacques-Philippe Colletier, Nikolai R. Skrynnikov, Paul Schanda
article
Nature Communications, 2015, ⟨10.1038/ncomms9361⟩
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https://hal.science/hal-01233308/file/ncomms9361.pdf BibTex
titre
Profiling sulfation/epimerization pattern of full-length heparan sulfate by NMR following cell culture 13C-glucose metabolic labeling.
auteur
Mathieu Pegeot, Rabia Sadir, I Eriksson, L Kjellen, Jean-Pierre Simorre, Pierre Gans, Hugues Lortat-Jacob
article
Glycobiology, 2015, 25 (2), pp.151-156. ⟨10.1093/glycob/cwu114⟩
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titre
Scrambling free combinatorial labeling of alanine-β, isoleucine-δ1, leucine-proS and valine-proS methyl groups for the detection of long range NOEs.
auteur
Rime Kerfah, Michael J. Plevin, Ombeline Pessey, Olivier Hamelin, Pierre Gans, Jérôme Boisbouvier
article
Journal of Biomolecular NMR, 2015, 61 (1), pp.73-82. ⟨10.1007/s10858-014-9887-2⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-01119770/file/Kerfah%20et%20al.%20JBiomolNMR2015.pdf BibTex
titre
Solution NMR assignment of LpoB, an outer-membrane anchored Penicillin-Binding Protein activator from Escherichia coli.
auteur
Nicolas L Jean, Catherine M Bougault, Alexander J F Egan, Waldemar Vollmer, Jean-Pierre Simorre
article
Biomolecular NMR Assignments, 2015, 9 (1), pp.123-7
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titre
Tail proteins of phage T5: investigation of the effect of the His6-tag position, from expression to crystallisation.
auteur
Marjolaine Noirclerc-Savoye, Ali Flayhan, Cindy Pereira, Benoit Gallet, Pierre Gans, Christine Ebel, Cécile Breyton
article
Protein Expression and Purification, 2015, 109, pp.70-8
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titre
The Disordered Region of the HCV Protein NS5A: Conformational Dynamics, SH3 Binding, and Phosphorylation.
auteur
Zsófia Sólyom, Peixiang Ma, Melanie Schwarten, Michaël Bosco, Ange Polidori, Grégory Durand, Dieter Willbold, Bernhard Brutscher
article
Biophysical Journal, 2015, 109 (7), pp.1483-96. ⟨10.1016/j.bpj.2015.06.040⟩
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titre
The SH3 regulatory domain of the hematopoietic cell kinase Hck binds ELMO via its polyproline motif.
auteur
Rida Awad, Marion Sevajol, Isabel Ayala, Anne Chouquet, Philippe Frachet, Pierre Gans, Jean-Baptiste Reiser, Jean-Philippe Kleman
article
FEBS Open Bio, 2015, 5, pp.99-106
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titre
Wss1 metalloprotease partners with Cdc48/Doa1 in processing genotoxic SUMO conjugates
auteur
Maxim Balakirev, James E Mullally, Adrien Favier, Nicole Assard, Eric Sulpice, David F Lindsey, Anastasia V Rulina, Xavier Gidrol, Keith D Wilkinson
article
eLife, 2015, 4, ⟨10.7554/eLife.06763⟩
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2014

titre
A cost-effective protocol for the parallel production of libraries of 13CH3-specifically labeled mutants for NMR studies of high molecular weight proteins.
auteur
Elodie Crublet, Rime Kerfah, Guillaume Mas, Marjolaine Noirclerc-Savoye, Violaine Lantez, Thierry Vernet, Jérôme Boisbouvier
article
Methods in Molecular Biology, 2014, pp.229-44
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https://hal.science/hal-01093893/file/Crublet%20et%20al.%20MethodsInMolecularBiology%202014.pdf BibTex
titre
Atomic model of a cell-wall cross-linking enzyme in complex with an intact bacterial peptidoglycan
auteur
Paul Schanda, Sébastien Triboulet, Cédric Laguri, Catherine M Bougault, Isabel Ayala, Morgane Callon, Michel Arthur, Jean-Pierre Simorre
article
Journal of the American Chemical Society, 2014, 136 (51), pp.10. ⟨10.1021/ja5105987⟩
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https://hal.science/hal-01093364/file/manuscript_finaldraft.pdf BibTex
titre
Electronic structure and hydration of tetramine cobalt hydride complexes.
auteur
Anirban Bhattacharjee, Alexander K. H. Weiss, Vincent Artero, Martin J Field, Thomas S. Hofer
article
Journal of Physical Chemistry B, 2014, 118 (20), pp.5551-5561. ⟨10.1021/jp502651s⟩
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https://hal.science/hal-01069163/file/manuscript.pdf BibTex
titre
Elongated structure of the outer-membrane activator of peptidoglycan synthesis LpoA: implications for PBP1A stimulation.
auteur
Nicolas L Jean, Catherine M Bougault, Adam Lodge, Adeline Derouaux, Gilles Callens, Alexander J F Egan, Isabel Ayala, Richard J Lewis, Waldemar Vollmer, Jean-Pierre Simorre
article
Structure, 2014, pp.1047-54
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titre
HNCA+, HNCO+, and HNCACB+ experiments: improved performance by simultaneous detection of orthogonal coherence transfer pathways
auteur
Sergio Gil-Caballero, Adrien Favier, Bernhard Brutscher
article
Journal of Biomolecular NMR, 2014, 60 (1), pp.1-9. ⟨10.1007/s10858-014-9847-x⟩
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titre
Measuring hydrogen exchange in proteins by selective water saturation in 1H–15N SOFAST/BEST-type experiments: advantages and limitations
auteur
Enrico Rennella, Zsófia Sólyom, Bernhard Brutscher
article
Journal of Biomolecular NMR, 2014, 60 (2-3), pp.99-107. ⟨10.1007/s10858-014-9857-8⟩
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titre
Membrane and chaperone recognition by the major translocator protein PopB of the type III secretion system of Pseudomonas aeruginosa.
auteur
Karen F Discola, Andreas Förster, François Boulay, Jean-Pierre Simorre, Ina Attree, Andréa Dessen, Viviana Job
article
Journal of Biological Chemistry, 2014, 289 (6), pp.3591-601
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titre
N-acetylglucosamine deacetylases modulate the anchoring of the gamma-glutamyl capsule to the cell wall of Bacillus anthracis.
auteur
Thomas Candela, Stavroula Balomenou, Willy Aucher, Vassilis Bouriotis, Jean-Pierre Simorre, Agnes Fouet, Ivo G Boneca
article
Microbial Drug Resistance, 2014, 20 (3), pp.222-30. ⟨10.1089/mdr.2014.0063⟩
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titre
Outer-membrane lipoprotein LpoB spans the periplasm to stimulate the peptidoglycan synthase PBP1B.
auteur
Alexander J F Egan, Nicolas L Jean, Alexandra Koumoutsi, Catherine M Bougault, Jacob Biboy, Jad Sassine, Alexandra S Solovyova, Eefjan Breukink, Athanasios Typas, Waldemar Vollmer, Jean-Pierre Simorre
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2014, 111 (22), pp.8197-202
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titre
Probing Transient Conformational States of Proteins by Solid-State R 11 Relaxation-Dispersion NMR Spec- troscopy
auteur
Peixiang Ma, Jens D. Haller, Jérémy Zajakala, Pavel Macek, Astrid C. Sivertsen, Dieter Willbold, Jérôme Boisbouvier, Paul Schanda
article
Angewandte Chemie International Edition, 2014, 53, pp.4312 - 4317. ⟨10.1002/anie.201311275⟩
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https://hal.science/hal-01093682/file/Ma_Angewandte%20Chemie%20%28International%20ed%20in%20English%292014.pdf BibTex
titre
relax: the analysis of biomolecular kinetics and thermodynamics using NMR relaxation dispersion data
auteur
Sébastien Morin, Troels E. Linnet, Mathilde Lescanne, Paul Schanda, Gary S. Thompson, Martin Tollinger, Kaare Teilum, Stephane Gagné, Dominique Marion, Christian Griesinger, Martin Blackledge, Edward J. d'Auvergne
article
Applied Bioinformatics, 2014, 30 (15), pp.2219 - 2220. ⟨10.1093/bioinformatics/btu166⟩
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https://hal.science/hal-01093687/file/Morin%20et%20al._Bioinformatics_2014.pdf BibTex
titre
Theoretical modeling of low-energy electronic absorption bands in reduced cobaloximes.
auteur
Anirban Bhattacharjee, Murielle Chavarot-Kerlidou, Jillian L. Dempsey, Harry B. Gray, Etsuko Fujita, James T. Muckerman, Marc Fontecave, Vincent Artero, Guilherme M. Arantes, Martin J Field
article
ChemPhysChem, 2014, 15 (14), pp.2951-8. ⟨10.1002/cphc.201402398⟩
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BibTex