Publications HAL du labo/EPI 576;1043235 de la collection IBS-VRM

2024

titre
ATP-dependent conformational dynamics in a photoactivated adenylate cyclase revealed by fluorescence spectroscopy and small-angle X-ray scattering
auteur
K. Ujfalusi-Pozsonyi, E. Bódis, M. Nyitrai, A. Kengyel, E. Telek, I. Pécsi, Z. Fekete, N. Varnyuné Kis-Bicskei, Caroline Mas, D. Moussaoui, P. Pernot, M. Tully, Martin Weik, Giorgio Schirò, S. Kapetanaki, A. Lukács
article
Communications Biology, 2024, 7 (1), pp.147. ⟨10.1038/s42003-024-05842-1⟩
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titre
Poxvirus-encoded DNA replication proteins: potential targets for antivirals
auteur
Nicolas Tarbouriech, Wim Burmeister, Beate Bersch, Frédéric Iseni
article
Virologie, 2024, 28 (1), pp.23-35. ⟨10.1684/vir.2024.1033⟩
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titre
Structural Impact of the Interaction of the Influenza A Virus Nucleoprotein with Genomic RNA Segments
auteur
Erwan Quignon, Damien Ferhadian, Antoine Hache, Valerie Vivet-Boudou, Catherine Isel, Anne Printz-Schweigert, Amélie Donchet, Thibaut Crépin, Roland Marquet
article
Viruses, 2024, 16 (3), pp.421. ⟨10.3390/v16030421⟩
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https://hal.science/hal-04644279/file/islandora_171373.pdf BibTex
titre
Structure and flexibility of the DNA polymerase holoenzyme of vaccinia virus
auteur
Wim Burmeister, Laetitia Boutin, Aurelia Balestra, Henri Gröger, Allison Ballandras-Colas, Stephanie Hutin, Christian Kraft, Clemens Grimm, Bettina Böttcher, Utz Fischer, Nicolas Tarbouriech, Frédéric Iseni
article
PLoS Pathogens, 2024, 20 (5), pp.e1011652. ⟨10.1371/journal.ppat.1011652⟩
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2023

titre
Orthoparamyxovirinae C Proteins Have a Common Origin and a Common Structural Organization
auteur
Ada Roy, Emeric Chan Mine, Lorenzo Gaifas, Cedric Leyrat, Valentina Volchkova, Florence Baudin, Luis Martinez-Gil, Viktor Volchkov, David Karlin, Jean-Marie Bourhis, Marc Jamin
article
2023
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titre
Antiviral activity of intracellular nanobodies targeting the influenza virus RNA-polymerase core
auteur
Mélissa Bessonne, Jessica Morel, Quentin Nevers, Allison Ballandras-Colas, Magali Grange, Alain Roussel, Thibaut Crépin, Bernard Delmas
article
2023
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titre
Cryo-EM structure of influenza helical nucleocapsid reveals NP-NP and NP-RNA interactions as a model for the genome encapsidation
auteur
Florian Chenavier, Leandro Estrozi, Jean-Marie Teulon, Eleftherios Zarkadas, Lily-Lorette Freslon, Jean-Luc Pellequer, Rob W. H. Ruigrok, Guy Schoehn, Allison Ballandras-Colas, Thibaut Crépin
article
Science Advances , 2023, 9 (50), pp.eadj9974. ⟨10.1126/sciadv.adj9974⟩
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https://hal.science/hal-04352762/file/sciadv.adj9974.pdf BibTex
titre
Multivalent Dynamic Colocalization of Avian Influenza Polymerase and Nucleoprotein by Intrinsically Disordered ANP32A Reveals the Molecular Basis of Human Adaptation
auteur
Aldo Camacho-Zarco, Lefan Yu, Tim Krischuns, Selin Dedeoglu, Damien Maurin, Guillaume Bouvignies, Thibaut Crépin, Rob Ruigrok, Stephan Cusack, Nadia Naffakh, Martin Blackledge
article
Journal of the American Chemical Society, 2023, 145 (38), pp.20985-21001. ⟨10.1021/jacs.3c06965⟩
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https://pasteur.hal.science/pasteur-04269631/file/camacho-zarco-et-al-2023-multivalent-dynamic-colocalization-of-avian-influenza-polymerase-and-nucleoprotein-by.pdf BibTex
titre
Orthoparamyxovirinae C Proteins Have a Common Origin and a Common Structural Organization
auteur
Ada Roy, Emeric Chan Mine, Lorenzo Gaifas, Cédric Leyrat, Valentina A. Volchkova, Florence Baudin, Luis Martinez-Gil, Viktor Volchkov, David G Karlin, Jean-Marie Bourhis, Marc Jamin
article
Biomolecules, 2023, 13 (3), pp.455. ⟨10.3390/biom13030455⟩
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https://hal.science/hal-04711026/file/biomolecules-13-00455.pdf BibTex

2022

titre
Borna Disease Virus 1 Phosphoprotein Forms a Tetramer and Interacts with Host Factors Involved in DNA Double-Strand Break Repair and mRNA Processing
auteur
Nicolas Tarbouriech, Florian Chenavier, Junna Kawasaki, Kamel Bachiri, Jean-Marie Bourhis, Pierre Legrand, Lily Freslon, Estelle Laurent, Elsa Suberbielle, Rob Ruigrok, Keizo Tomonaga, Daniel Gonzalez-Dunia, Masayuki Horie, Etienne Coyaud, Thibaut Crépin
article
Viruses, 2022, 14 (11), pp.2358. ⟨10.3390/v14112358⟩
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https://hal.science/hal-03834032/file/tarbouriech%20zr%20al.%20viruses.pdf BibTex
titre
Host succinate inhibits influenza virus infection through succinylation and nuclear retention of the viral nucleoprotein
auteur
Antoine Guillon, Deborah Bréa-Diakite, Adeline Cezard, Alan Wacquiez, Thomas Baranek, Jérôme Bourgeais, Frédéric Picou, Virginie Vasseur, Léa Meyer, Christophe Chevalier, Adrien Auvet, José Carballido, Lydie Desbarats, Florent Dingli, Andrei Turtoi, Audrey Le Gouellec, Florence Fauvelle, Amélie Donchet, Thibaut Crepin, Pieter Hiemstra, Christophe Paget, Damarys Loew, Olivier Herault, Nadia Naffakh, Ronan Le Goffic, Mustapha Si-Tahar
article
EMBO Journal, 2022, 41 (12), pp.e108306. ⟨10.15252/embj.2021108306⟩
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https://univ-tours.hal.science/hal-03687124/file/EMBJ-41-e108306%5B1%5D.pdf BibTex
titre
Human viruses, ancient, recent and zoonosis: a never ending story?
auteur
Rob Ruigrok, Emmanuel Drouet, Patrice Morand, Nicolas Tarbouriech, Rob W.H. Ruigrok
article
Virologie, 2022, 26 (3), pp.240-252. ⟨10.1684/vir.2022.0957⟩
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titre
Protein conformational space at the edge of allostery: turning a nonallosteric malate dehydrogenase into an “allosterized” enzyme using evolution-guided punctual mutations
auteur
Antonio Iorio, Céline Brochier-Armanet, Caroline Mas, Fabio Sterpone, Dominique Madern
article
Molecular Biology and Evolution, 2022, 39 (9), pp.msac186. ⟨10.1093/molbev/msac186⟩
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https://hal.science/hal-03781769/file/iorio%20et%20al.%2C%202022.pdf BibTex
titre
Selection of Primer–Template Sequences That Bind with Enhanced Affinity to Vaccinia Virus E9 DNA Polymerase
auteur
Jeffrey Destefano, Frédéric Iseni, Nicolas Tarbouriech
article
Viruses, 2022, 14 (2), pp.369. ⟨10.3390/v14020369⟩
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https://hal.science/hal-03807985/file/De%20Stefano%20et%20al.%20viruses.pdf BibTex
titre
Structural and biochemical characterisation of the Providencia stuartii arginine decarboxylase shows distinct polymerisation and regulation
auteur
Matthew Jessop, Karine Huard, Ambroise Desfosses, Guillaume Tetreau, Diego Carriel, Maria Bacia-Verloop, Caroline Mas, Philippe Mas, Angélique Fraudeau, Jacques-Philippe Colletier, Irina Gutsche
article
Communications Biology, 2022, 5 (1), pp.317. ⟨10.1038/s42003-022-03276-1⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-03650076/file/Jessop%20et%20al.%20communications%20biology.pdf BibTex
titre
Structural dynamics of the C-terminal X domain of Nipah and Hendra viruses controls the attachment to the C-terminal tail of the nucleocapsid protein
auteur
Jean-Marie Bourhis, Filip Yabukarski, Guillaume Communie, Robert Schneider, Valentina Volchkova, Mickaël Frénéat, Francine Gérard, Corinne Ducournau, Caroline Mas, Nicolas Tarbouriech, Malene Ringkjøbing Jensen, Viktor Volchkov, Martin Blackledge, Marc Jamin
article
Journal of Molecular Biology, 2022, 434 (10), pp.167551. ⟨10.1016/j.jmb.2022.167551⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-03651805/file/S0022283622001255.pdf BibTex
titre
Structural insights into ring-building motif domains involved in bacterial sporulation
auteur
Bowen Liu, Helena Chan, Elda Bauda, Carlos Contreras-Martel, Laure Bellard, Anne-Marie Villard, Caroline Mas, Emmanuelle Neumann, Daphna Fenel, Adrien Favier, Monica Serrano, Adriano Henriques, Christopher Rodrigues, Cecile Morlot
article
Journal of Structural Biology, 2022, 214 (1), pp.107813. ⟨10.1016/j.jsb.2021.107813⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-03621065/file/Liu%20et%20al.%20J%20of%20structural%20biology.pdf BibTex
titre
Structure and dynamics of the unassembled nucleoprotein of rabies virus in complex with its phosphoprotein chaperone module
auteur
Francine Gérard, Jean-Marie Bourhis, Caroline Mas, Anaïs Branchard, Duc Duy Vu, Sylvia Varhoshkova, Cedric Leyrat, Marc Jamin
article
Viruses, 2022, 14 (12), pp.2813. ⟨10.3390/v14122813⟩
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https://hal.science/hal-03959561/file/viruses-14-02813.pdf BibTex
titre
The intrinsically disordered SARS-CoV-2 nucleoprotein in dynamic complex with its viral partner nsp3a
auteur
Luiza Mamigonian Bessa, Serafima Guseva, Aldo Camacho-Zarco, Nicola Salvi, Damien Maurin, Laura Mariño Perez, Maiia Botova, Anas Malki, Max Nanao, Malene Ringkjøbing Jensen, Rob Ruigrok, Martin Blackledge
article
Science Advances , 2022, 8 (3), pp.eabm4034-1-eabm4034-12. ⟨10.1126/sciadv.abm4034⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-03621049/file/Sci_Adv_8_eabm4034.pdf BibTex
titre
The Vaccinia Virus DNA Helicase Structure from Combined Single-Particle Cryo-Electron Microscopy and AlphaFold2 Prediction
auteur
Stephanie Hutin, Wai Li Ling, Nicolas Tarbouriech, Guy Schoehn, Clemens Grimm, Utz Fischer, Wim Burmeister
article
Viruses, 2022, 14 (10), pp.2206. ⟨10.3390/v14102206⟩
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2021

titre
$^1$H, $^{13}$C and $^{15}$N Backbone chemical shift assignments of the n-terminal and central intrinsically disordered domains of SARS-CoV-2 nucleoprotein
auteur
Serafima Guseva, Laura Mariño Perez, Aldo Camacho-Zarco, Luiza Mamigonian Bessa, Nicola Salvi, Anas Malki, Damien Maurin, Martin Blackledge
article
Biomolecular NMR Assignments, 2021, pp.1-6. ⟨10.1007/s12104-021-10014-x⟩
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titre
Analysis of SEC-SAXS data via EFA deconvolution and Scatter
auteur
Mark Tully, Nicolas Tarbouriech, Robert Rambo, Stephanie Hutin
article
Journal of visualized experiments : JoVE, 2021, 167, ⟨10.3791/61578⟩
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https://hal.science/hal-03187951/file/jove-protocol-61578-analysis-of-sec-saxs-data-via-efa-deconvolution-and-scatter.pdf BibTex
titre
Influenza viruses and coronaviruses: Knowns, unknowns, and common research challenges
auteur
Olivier Terrier, Mustapha Si-Tahar, Mariette Ducatez, Christophe Chevalier, Andrés Pizzorno, Ronan Le Goffic, Thibaut Crepin, Gaëlle Simon, Nadia Naffakh
article
PLoS Pathogens, 2021, 17 (12), pp.e1010106. ⟨10.1371/journal.ppat.1010106⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-03518306/file/Terrier%20et%20al.%20Plos%20Pathogens.pdf BibTex
titre
Sendai Virus and a Unified Model of Mononegavirus RNA Synthesis
auteur
Daniel Kolakofsky, Philippe Le Mercier, Machiko Nishio, Martin Blackledge, Thibaut Crepin, Rob Ruigrok
article
Viruses, 2021, 13 (12), pp.2466. ⟨10.3390/v13122466⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-03518294/file/Kolakovsky%20et%20al.%20viruses.pdf BibTex
titre
Solution Structure of the C-terminal Domain of A20, the Missing Brick for the Characterization of the Interface between Vaccinia Virus DNA Polymerase and its Processivity Factor
auteur
Beate Bersch, Nicolas Tarbouriech, Wim Burmeister, Frédéric Iseni
article
Journal of Molecular Biology, 2021, 433 (13), pp.167009. ⟨10.1016/j.jmb.2021.167009⟩
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https://hal.science/hal-03243142/file/1-s2.0-S0022283621002102-main.pdf BibTex
titre
Structural and functional analysis of the Francisella lysine decarboxylase as a key actor in oxidative stress resistance
auteur
Jan Felix, Claire Siebert, Juila Novion Ducassou, Jérôme Nigou, Pierre Simon Garcia, Angélique Fraudeau, Karine Huard, Caroline Mas, Celine Brochier-Armanet, Yohann Couté, Irina Gutsche, Patricia Renesto
article
Scientific Reports, 2021, 11 (1), pp.972. ⟨10.1038/s41598-020-79611-5⟩
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https://hal.science/hal-03118173/file/Felix%20et%20al.%20Nature.pdf BibTex
titre
The LEAFY floral regulator displays pioneer transcription factor properties
auteur
Xuelei Lai, Romain Blanc-Mathieu, Loïc Grandvuillemin, Ying Huang, Arnaud Stigliani, Jérémy Lucas, Emmanuel Thévenon, Jeanne Loue-Manifel, Laura Turchi, Hussein Daher, Eugenia Brun-Hernandez, Gilles Vachon, David Latrasse, Moussa Benhamed, Renaud Dumas, Chloe Zubieta, François Parcy
article
Molecular Plant, 2021, 14 (5), pp.829-837. ⟨10.1016/j.molp.2021.03.004⟩
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https://hal.science/hal-03180115/file/Lai_2021_HAL.pdf BibTex

2020

titre
Assembly of The Mitochondrial Complex I Assembly Complex Suggests a Regulatory Role for Deflavination
auteur
Gabriele Giachin, Matthew Jessop, Romain Bouverot, Samira Acajjaoui, Melissa Saïdi, Anaïs Chretien, Maria Bacia-Verloop, Luca Signor, Philippe Mas, Adrien Favier, Eve Borel Meneroud, Michael Hons, Darren Hart, Eaazhisai Kandiah, Elisabetta Boeri Erba, Alain Buisson, Gordon Leonard, Irina Gutsche, Montserrat Soler-Lopez
article
Angewandte Chemie International Edition, 2020, ⟨10.1002/anie.202011548⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-03119718/file/Giachin%20et%20al.%20-%202021%20-%20Assembly%20of%20The%20Mitochondrial%20Complex%20I%20Assembly%20C.pdf BibTex
titre
Binding Mechanism Elucidation of the Acute Respiratory Disease Causing Agent Adenovirus of Serotype 7 to Desmoglein-2
auteur
Marc-André Hograindleur, Gregory Effantin, Daphna Fenel, Caroline Mas, André Lieber, Guy Schoehn, Pascal Fender, Emilie Vassal-Stermann
article
Viruses, 2020, 12 (10), pp.1075. ⟨10.3390/v12101075⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-02972725/file/Hograindleur%20et%20al.%20Viruses.pdf BibTex
titre
Differential Behaviours and Preferential Bindings of Influenza Nucleoproteins on Importins-α
auteur
Amélie Donchet, Emilie Vassal-Stermann, Francine Gérard, Rob W H Ruigrok, Thibaut Crépin
article
Viruses, 2020, 12 (8), pp.834. ⟨10.3390/v12080834⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-02912888/file/Donchet%20et%20al.%20Viruses.pdf BibTex
titre
Measles virus nucleo- and phosphoproteins form liquid-like phase-separated compartments that promote nucleocapsid assembly
auteur
Serafima Guseva, Sigrid Milles, Malene Ringkjøbing Jensen, Nicola Salvi, Jean-Philippe Kleman, Damien Maurin, Rob W H Ruigrok, Martin Blackledge
article
Science Advances , 2020, 6 (14), pp.eaaz7095. ⟨10.1126/sciadv.aaz7095⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-02529008/file/Guseva%20et%20al.%20Sci%20Adv.pdf BibTex
titre
Molecular basis of host-adaptation interactions between influenza virus polymerase PB2 subunit and ANP32A
auteur
Aldo Camacho-Zarco, Sissy Kalayil, Damien Maurin, Nicola Salvi, Elise Delaforge, Sigrid Milles, Malene Ringkjøbing Jensen, Darren Hart, Stephen Cusack, Martin Blackledge
article
Nature Communications, 2020, 11 (1), pp.3656. ⟨10.1038/s41467-020-17407-x⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-02947694/file/Camacho-Zarco%20et%20al.%20Nature%20Com.pdf BibTex
titre
Structural Description of the Nipah Virus Phosphoprotein and Its Interaction with STAT1
auteur
Malene Ringkjøbing Jensen, Filip Yabukarski, Guillaume Communie, Eric Condamine, Caroline Mas, Valentina Volchkova, Nicolas Tarbouriech, Jean-Marie Bourhis, Viktor Volchkov, Martin Blackledge, Marc Jamin
article
Biophysical Journal, 2020, 118 (10), pp.2470-2488. ⟨10.1016/j.bpj.2020.04.010⟩
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https://hal.science/hal-02867772/file/S0006349520303283.pdf BibTex
titre
Structure, dynamics and phase separation of measles virus RNA replication machinery
auteur
Serafima Guseva, Sigrid Milles, Malene Ringkjøbing Jensen, Guy Schoehn, Rob W H Ruigrok, Martin Blackledge
article
Current Opinion in Virology, 2020, 41, pp.59-67. ⟨10.1016/j.coviro.2020.05.006⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-03016129/file/Guseva%20et%20al.%20Curr%20Opin%20Virol.pdf BibTex
titre
X-ray Structure of the Human Karyopherin RanBP5, an Essential Factor for Influenza Polymerase Nuclear Trafficking
auteur
Christopher Swale, Bruno da Costa, Laura Sedano, Frederic Garzoni, Andrew Mccarthy, Imre Berger, Christoph Bieniossek, Rob W H Ruigrok, Bernard Delmas, Thibaut Crépin
article
Journal of Molecular Biology, 2020, 432 (10), pp.3353-3359. ⟨10.1016/j.jmb.2020.03.021⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-02555361/file/Swale%20et%20al.%20JMB.pdf BibTex

2019

titre
A molecular mechanism for transthyretin amyloidogenesis
auteur
Ai Woon Yee, Matteo Aldeghi, Matthew Blakeley, Andreas Ostermann, Philippe Mas, Martine Moulin, Daniele de Sanctis, Matthew Bowler, Christoph Mueller-Dieckmann, Edward P. Mitchell, Michael Haertlein, Bert de Groot, Elisabetta Boeri Erba, V. Trevor Forsyth
article
Nature Communications, 2019, 10 (1), pp.925-1-925-10. ⟨10.1038/s41467-019-08609-z⟩
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https://hal.science/hal-02085946/file/Nature_Communications_10_925.pdf BibTex
titre
Activation of the ILT7 receptor and plasmacytoid dendritic cell responses are governed by structurally-distinct BST2 determinants
auteur
Mariana Bego, Nolwenn Miguet, Alexandre Laliberté, Nick Aschman, Francine Gérard, Angelique Merakos, Winfried Weissenhorn, Éric Cohen
article
Journal of Biological Chemistry, 2019, pp.jbc.RA119.008481. ⟨10.1074/jbc.RA119.008481⟩
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BibTex
titre
Assembly and cryo-EM structures of RNA-specific measles virus nucleocapsids provide mechanistic insight into paramyxoviral replication
auteur
Ambroise Desfosses, Sigrid Milles, Malene Ringkjøbing Jensen, Serafima Guseva, Jacques-Philippe Colletier, Damien Maurin, Guy Schoehn, Irina Gutsche, Rob W H Ruigrok, Martin Blackledge
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2019, 116 (10), pp.4256-4264. ⟨10.1073/pnas.1816417116⟩
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https://hal.science/hal-02070475/file/desfosses2019.pdf BibTex
titre
CryoEM structure of adenovirus type 3 fibre with desmoglein 2 shows an unusual mode of receptor engagement
auteur
Emilie Vassal-Stermann, Grégory Effantin, Chloe Zubieta, Wim P Burmeister, Frédéric Iseni, Hongjie Wang, André Lieber, Guy Schoehn, Pascal Fender
article
Nature Communications, 2019, 10 (1), pp.1181. ⟨10.1038/s41467-019-09220-y⟩
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https://hal.science/hal-02085944/file/Vassal%20sterman.pdf BibTex
titre
Destabilization of the human RED–SMU1 splicing complex as a basis for host-directed antiinfluenza strategy
auteur
Usama Ashraf, Laura Tengo, Laurent Le Corre, Guillaume Fournier, Patricia Busca, Andrew Mccarthy, Marie-Anne Rameix-Welti, Christine Gravier-Pelletier, Rob W H Ruigrok, Yves Jacob, Pierre-Olivier Vidalain, Nicolas Pietrancosta, Thibaut Crépin, Nadia Naffakh
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2019, 116 (22), pp.10968-10977. ⟨10.1073/pnas.1901214116⟩
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https://hal.science/hal-02160991/file/PNAS_01214_Revised_Text.pdf BibTex
titre
Functional Metagenomic Technologies for the Discovery of Novel Enzymes for Biomass Degradation and Biofuel Production
auteur
Wang Hongling, Darren J Hart, Yingfeng An
article
BIOENERGY RESEARCH, 2019, 12 (3), pp.457-470
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BibTex
titre
Identification of the novel role of butyrate as AhR ligand in human intestinal epithelial cells
auteur
Ludovica Marinelli, Camille Martin-Gallausiaux, Jean-Marie Bourhis, Fabienne Beguet-Crespel, Herve Blottiere, Nicolas Lapaque
article
Scientific Reports, 2019, 9 (1), pp.643. ⟨10.1038/s41598-018-37019-2⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-01996381/file/s41598-018-37019-2.pdf BibTex
titre
Intermediate-resolution crystal structure of the human adenovirus B serotype 3 fibre knob in complex with the EC2-EC3 fragment of desmoglein 2
auteur
Emilie Vassal-Stermann, Stephanie Hutin, Pascal Fender, Wim P Burmeister
article
Acta crystallographica Section F : Structural biology communications [2014-..], 2019, 75 (12), pp.750-757. ⟨10.1107/S2053230X19015784⟩
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titre
The archaeal LDH-like malate dehydrogenase from Ignicoccus islandicus displays dual substrate recognition, hidden allostery and a non-canonical tetrameric oligomeric organization
auteur
Jennifer Roche, Eric Girard, Caroline Mas, Dominique Madern
article
Journal of Structural Biology, 2019, ⟨10.1016/j.jsb.2019.07.006⟩
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https://hal.science/hal-02273509/file/S1047847719301534.pdf BibTex
titre
The K296-D320 region of recombinant levansucrase BA-SacB can affect the sensitivity of Escherichia coli host to sucrose
auteur
Song Gao, Bo Jiang, Song Zhu, Darren J Hart, Xia Liu, Hongling Wang, Yingfeng An
article
Annals of Microbiology, 2019, ⟨10.1007/s13213-019-01496-1⟩
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https://hal.science/hal-03018995/file/Gao%20et%20al.%20-%202019%20-%20The%20K296-D320%20region%20of%20recombinant%20levansucrase%20B.pdf BibTex
titre
The LC8-RavP ensemble Structure Evinces A Role for LC8 in Regulating Lyssavirus Polymerase Functionality
auteur
Nathan Jespersen, Cedric Leyrat, Francine Gérard, Jean-Marie Bourhis, Danielle Blondel, Marc Jamin, Elisar Barbar
article
Journal of Molecular Biology, 2019, 431 (24), pp.4959-4977. ⟨10.1016/j.jmb.2019.10.011⟩
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BibTex
titre
The Nucleoprotein and Phosphoprotein of Measles Virus
auteur
Serafima Guseva, Sigrid Milles, Martin Blackledge, Rob W H Ruigrok
article
Frontiers in Microbiology, 2019, 10 (1832), pp.1-10. ⟨10.3389/fmicb.2019.01832⟩
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titre
The structure of the nucleoprotein of Influenza D shows that all Orthomyxoviridae nucleoproteins have a similar NPCORE, with or without a NPTAIL for nuclear transport
auteur
Amélie Donchet, Justine Oliva, Alice Labaronne, Laura Tengo, Myriam Miloudi, Francine Gérard, Caroline Mas, Guy Schoehn, Rob W H Ruigrok, Mariette Ducatez, Thibaut Crépin
article
Scientific Reports, 2019, 9, pp.600. ⟨10.1038/s41598-018-37306-y⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-01997471/file/SciReports_01_2019.pdf BibTex
titre
Vesicular stomatitis virus phosphoprotein dimerization domain is dispensable for virus growth
auteur
Francine Gérard, Marc Jamin, Martin Blackledge, Danielle Blondel, Jean-Marie Bourhis
article
Journal of Virology, 2019, ⟨10.1128/JVI.01789-19⟩
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2018

titre
A universal mini-vector and an annealing of PCR products (APP)-based cloning strategy for convenient molecular biological manipulations
auteur
Xia Liu, Tuoping Li, Darren J Hart, Song Gao, Hongling Wang, Herui Gao, Shumin Xu, Yifeng Zhang, Yifei Liu, Yingfeng An
article
Biochemical and Biophysical Research Communications, 2018, 497 (4), pp.978 - 982. ⟨10.1016/j.bbrc.2018.02.099⟩
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titre
Auxin sensing is a property of an unstructured domain in the Auxin Response Factor ETTIN of Arabidopsis thaliana
auteur
Sara Simonini, Philippe Mas, Caroline Mas, Lars Ostergaard, Darren J Hart
article
Scientific Reports, 2018, 8 (1), pp.13563. ⟨10.1038/s41598-018-31634-9⟩
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titre
Crystal Structures of Fungal Tectonin in Complex with O-Methylated Glycans Suggest Key Role in Innate Immune Defense
auteur
Roman Sommer, Olga N Makshakova, Therese Wohlschlager, Stephanie Hutin, May Marsh, Alexander Titz, Markus Künzler, Annabelle Varrot
article
Structure, 2018, 26 (3), pp.391 - 402. ⟨10.1016/j.str.2018.01.003⟩
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titre
microRNA-122 amplifies hepatitis C virus translation by shaping the structure of the internal ribosomal entry site
auteur
Philipp Schult, Hanna Roth, Rebecca Adams, Caroline Mas, Lionel Imbert, Christian Orlik, Alessia Ruggieri, Anna Pyle, Volker Lohmann
article
Nature Communications, 2018, 9, pp.2613. ⟨10.1038/s41467-018-05053-3⟩
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titre
RIP2 filament formation is required for NOD2 dependent NF-κB signalling
auteur
Erika Pellegrini, Ambroise Desfosses, Arndt Wallmann, Wiebke Manuela Schulze, Kristina Rehbein, Philippe Mas, Luca Signor, Stephanie Gaudon, Grasilda Zenkeviciute, Michael Hons, Hélène Malet, Irina Gutsche, Carsten Sachse, Guy Schoehn, Hartmut Oschkinat, Stephen Cusack
article
Nature Communications, 2018, 9 (1), ⟨10.1038/s41467-018-06451-3⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-01889011/file/Pellegrini%20et%20al.%20Nat%20Comm.pdf BibTex
titre
Structural characterization of the sporulation protein GerM from Bacillus subtilis
auteur
Jennyfer Trouve, Ahmed Mohamed, Francisco Leisico, Carlos Contreras-Martel, Bowen Liu, Caroline Mas, David Rudner, Christopher D.A. Rodrigues, Cécile Morlot
article
Journal of Structural Biology, 2018, ⟨10.1016/j.jsb.2018.09.010⟩
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titre
Three Novel Escherichia coli Vectors for Convenient and Efficient Molecular Biological Manipulations
auteur
Herui Gao, Xia Qi, Darren J Hart, Song Gao, Hongling Wang, Shumin Xu, Yifeng Zhang, Xia Liu, Yifei Liu, Yingfeng An
article
Journal of Agricultural and Food Chemistry, 2018, 66 (24), pp.6123 - 6131. ⟨10.1021/acs.jafc.8b01960⟩
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2017

titre
A Structural Organization for Disrupted in Schizophrenia 1, Identified by High-Throughput Screening, Reveals Distinctly Folded Regions Which Are Bisected by Mental Illness-Related Mutations.
auteur
Antony S K Yerabham, Philippe J Mas, Christina Decker, Dinesh C Soares, Oliver H Weiergräber, Luitgard Nagel-Steger, Dieter Willbold, Darren J Hart, Nicholas J Bradshaw, Carsten Korth
article
Journal of Biological Chemistry, 2017, ⟨10.1074/jbc.M116.773903⟩
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titre
Decrease of blood anti-alpha 1,3 Galactose Abs levels in multiple sclerosis (MS) and clinically isolated syndrome (CIS) patients
auteur
L. Le Berre, J. Roussé, P-A Gourraud, B-M Imbert-Marcille, A. Salama, G. Evanno, G. Semana, A. Nicot, E. Dugast, P. Guerif, C. Adjaoud, T. Freour, S. Brouard, F. Agbalika, R. Marignier, D. Brassat, D-A Laplaud, Emmanuel Drouet, V. van Pesch, J-P Soulillou
article
Clinical Immunology, 2017, 180, pp.128-135. ⟨10.1016/j.clim.2017.05.006⟩
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https://univ-rennes.hal.science/hal-01560209/file/1-s2.0-S1521661616306362-main.pdf BibTex
titre
ESPRIT: A Method for Defining Soluble Expression Constructs in Poorly Understood Gene Sequences.
auteur
Philippe J Mas, Darren J Hart
article
Methods in Molecular Biology, 2017, 1586, pp.45-63. ⟨10.1007/978-1-4939-6887-9_4⟩
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titre
Expression and Characterization of Levansucrase from Clostridium acetobutylicum.
auteur
Song Gao, Xianghui Qi, Darren J Hart, Herui Gao, Yingfeng An
article
Journal of Agricultural and Food Chemistry, 2017, 65 (4), pp.867-871. ⟨10.1021/acs.jafc.6b05165⟩
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titre
Mouse Rif1 is a regulatory subunit of protein phosphatase 1 (PP1).
auteur
Rasa Sukackaite, Daniela Cornacchia, Malene Ringkjøbing Jensen, Philippe J Mas, Martin Blackledge, Elin Enervald, Guangyou Duan, Tania Auchynnikava, Maja Köhn, Darren J Hart, Sara B C Buonomo
article
Scientific Reports, 2017, 7 (1), pp.2119. ⟨10.1038/s41598-017-01910-1⟩
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titre
Nonsegmented Negative-Sense RNA Viruses-Structural Data Bring New Insights Into Nucleocapsid Assembly.
auteur
Marc Jamin, Filip Yabukarski
article
Advances in Virus Research, 2017, 97, pp.143-185. ⟨10.1016/bs.aivir.2016.09.001⟩
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titre
Online Size-exclusion and Ion-exchange Chromatography on a SAXS Beamline
auteur
Martha Brennich, Adam Round, Stephanie Hutin
article
Journal of visualized experiments : JoVE, 2017, 119, ⟨10.3791/54861⟩
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titre
Signal peptide-dependent protein translocation pathway is crucial for the sucrose sensitivity of SacB-expressing Escherichia coli
auteur
Song Gao, Shuo Yao, Darren J Hart, Yingfeng An
article
Biochemical Engineering Journal, 2017, 122, pp.71 - 74. ⟨10.1016/j.bej.2017.03.002⟩
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titre
Structural analysis of the complex between influenza B nucleoprotein and human importin-α
auteur
Alice Labaronne, Sigrid Milles, Amélie Donchet, Malene Ringkjøbing Jensen, Martin Blackledge, Jean-Marie Bourhis, Rob W H Ruigrok, Thibaut Crépin
article
Scientific Reports, 2017, 7 (1), pp.17164. ⟨10.1038/s41598-017-17458-z⟩
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titre
Structural Characterization of the SMRT Corepressor Interacting with Histone Deacetylase 7.
auteur
Danielle C Desravines, Martin Serna Martin, Robert Schneider, Philippe J Mas, Nataliia Aleksandrova, Malene Ringkjøbing Jensen, Martin Blackledge, Darren J Hart
article
Scientific Reports, 2017, 7 (1), pp.3678. ⟨10.1038/s41598-017-03718-5⟩
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titre
Structural insights into the architecture of the Shigella flexneri virulence factor IcsA/VirG and motifs involved in polar distribution and secretion.
auteur
Stefan Leupold, Petra Büsing, Philippe J Mas, Darren J Hart, Andrea Scrima
article
Journal of Structural Biology, 2017, 198 (1), pp.19-27. ⟨10.1016/j.jsb.2017.03.003⟩
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titre
The vaccinia virus DNA polymerase structure provides insights into the mode of processivity factor binding
auteur
Nicolas Tarbouriech, Corinne N Ducournau, Stephanie Hutin, Philippe J. Mas, Petr Man, Eric Forest, Darren J Hart, Christophe N. Peyrefitte, Wim P Burmeister, Frédéric Iseni
article
Nature Communications, 2017, 8 (1), pp.1455. ⟨10.1038/s41467-017-01542-z⟩
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2016

titre
A SAM oligomerization domain shapes the genomic binding landscape of the LEAFY transcription factor.
auteur
Camille Sayou, Max H Nanao, Marc Jamin, David Posé, Emmanuel Thévenon, Laura Grégoire, Gabrielle Tichtinsky, Grégoire Denay, Felix Ott, Marta Peirats Llobet, Markus Schmid, Renaud Dumas, François Parcy
article
Nature Communications, 2016, 7, pp.11222. ⟨10.1038/ncomms11222⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-01310696/file/2016_Sayou_Nature%20Communications_1.pdf BibTex
titre
Amplification and pyrosequencing of near-full-length hepatitis C virus for typing and Monitoring antiviral Resistant Strains
auteur
Pauline Trémeaux, Alban Caporossi, Christophe Ramière, Elodie Santoni, Nicolas Tarbouriech, Marie-Ange Thélu, Katia Fusillier, Laure Geneletti, Olivier François, Vincent Leroy, Wim P Burmeister, Patrice André, Patrice Morand, Sylvie Larrat
article
Clinical Microbiology and Infection, 2016, ⟨10.1016/j.cmi.2016.01.015⟩
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titre
Binding of RNA by the Nucleoproteins of Influenza Viruses A and B
auteur
Alice Labaronne, Christopher Swale, Alexandre Monod, Guy Schoehn, Thibaut Crépin, Rob W H Ruigrok
article
Viruses, 2016, 8 (9), pp.247. ⟨10.3390/v8090247⟩
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titre
Death-Associated Protein Kinase Activity Is Regulated by Coupled Calcium/Calmodulin Binding to Two Distinct Sites.
auteur
Bertrand Simon, Anne-Sophie Huart, Koen Temmerman, Juha Vahokoski, Haydyn D T Mertens, Dana Komadina, Jan-Erik Hoffmann, Hayretin Yumerefendi, Dmitri I Svergun, Petri Kursula, Carsten Schultz, Andrew A Mccarthy, Darren J Hart, Matthias Wilmanns
article
Structure (London, England : 1993), 2016, 24 (6), pp.851-61. ⟨10.1016/j.str.2016.03.020⟩
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titre
Domain organization of vaccinia virus helicase-primase D5.
auteur
Stephanie Hutin, Wai-Li Ling, Adam Round, Grégory Effantin, Stefan Reich, Frédéric Iseni, Nicolas Tarbouriech, Guy Schoehn, Wim P Burmeister
article
Journal of Virology, 2016
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titre
Ensemble Structure of the Highly Flexible Complex Formed between Vesicular Stomatitis Virus Unassembled Nucleoprotein and its Phosphoprotein Chaperone.
auteur
Filip Yabukarski, Cedric Leyrat, Nicolas Martinez, Guillaume Communie, Ivan Ivanov, Euripedes A Ribeiro, Marlyse Buisson, Francine Gérard, Jean-Marie Bourhis, Malene Ringkjøbing Jensen, Pau Bernadó, Martin Blackledge, Marc Jamin
article
Journal of Molecular Biology, 2016, 428 (13), pp.2671-94. ⟨10.1016/j.jmb.2016.04.010⟩
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titre
Identification of Dynamic Modes in an Intrinsically Disordered Protein Using Temperature-Dependent NMR Relaxation.
auteur
Anton Abyzov, Nicola Salvi, Robert Schneider, Damien Maurin, Rob W H Ruigrok, Malene Ringkjøbing Jensen, Martin Blackledge
article
Journal of the American Chemical Society, 2016, 138 (19), pp.6240-51. ⟨10.1021/jacs.6b02424⟩
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titre
In Vitro/In Vivo Production of tRNA for X-Ray Studies
auteur
Clément Dégut, Alexandre Monod, Franck Brachet, Thibaut Crépin, Carine Tisné
article
Methods in Molecular Biology, 2016, 1320, pp.37-57. ⟨10.1007/978-1-4939-2763-0_4⟩
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titre
Influenza Polymerase Can Adopt an Alternative Configuration Involving a Radical Repacking of PB2 Domains.
auteur
Eric Thierry, Delphine Guilligay, Jan Kosinski, Thomas Bock, Stephanie Gaudon, Adam Round, Alexander Pflug, Narin Hengrung, Kamel El Omari, Florence Baudin, Darren J Hart, Martin Beck, Stephen Cusack
article
Molecular Cell, 2016, 61 (1), pp.125-37. ⟨10.1016/j.molcel.2015.11.016⟩
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titre
Investigating the Role of Large-Scale Domain Dynamics in Protein-Protein Interactions
auteur
Elise Delaforge, Sigrid Milles, Jie-Rong Huang, Denis Bouvier, Malene Ringkjøbing Jensen, Michael Sattler, Darren J Hart, Martin Blackledge
article
Frontiers in Molecular Biosciences, 2016, 3, pp.54. ⟨10.3389/fmolb.2016.00054⟩
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titre
New insights into HCV replication in original cells from Aedes mosquitoes
auteur
Catherine Fallecker, Alban Caporossi, Yassine Rechoum, Frederic Garzoni, Sylvie Larrat, Olivier François, Pascal Fender, Patrice Morand, Imre Berger, Marie-Anne Petit, Emmanuel Drouet
article
Virology Journal, 2016, 14 (1), pp.161. ⟨10.1186/s12985-017-0828-z⟩
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https://inserm.hal.science/inserm-01577634/file/12985_2017_Article_828.pdf BibTex
titre
Online ion-exchange chromatography for small-angle X-ray scattering
auteur
Stephanie Hutin, Martha Brennich, Benoit Maillot, Adam Round
article
Acta crystallographica Section D : Structural biology [1993-..], 2016, 72 (10), pp.1090 - 1099. ⟨10.1107/S2059798316012833⟩
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titre
Recent advances in universal TA cloning methods for use in function studies.
auteur
Shuo Yao, Darren J Hart, Yingfeng An
article
Protein Engineering, Design and Selection, 2016, 29 (11), pp.551 - 556. ⟨10.1093/protein/gzw047⟩
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titre
Secondary Structure Prediction of Protein Constructs Using Random Incremental Truncation and Vacuum-Ultraviolet CD Spectroscopy.
auteur
Mária Pukáncsik, Ágnes Orbán, Kinga Nagy, Koichi Matsuo, Kunihiko Gekko, Damien Maurin, Darren J Hart, István Kézsmárki, Beata G Vertessy, Petri Kursula
article
PLoS ONE, 2016, 11 (6), pp.e0156238. ⟨10.1371/journal.pone.0156238⟩
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BibTex
titre
Self-Assembly of Measles Virus Nucleocapsid-like Particles: Kinetics and RNA Sequence-Dependence.
auteur
Sigrid Milles, Malene Ringkjøbing Jensen, Guillaume Communie, Damien Maurin, Guy Schoehn, Rob W H Ruigrok, Martin Blackledge
article
Angewandte Chemie International Edition, 2016, ⟨10.1002/anie.201602619⟩
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titre
Structural analysis of point mutations at the Vaccinia virus A20/D4 interface
auteur
Céline Contesto-Richefeu, Nicolas Tarbouriech, Xavier Brazzolotto, Wim P Burmeister, Christophe N Peyrefitte, Frédéric Iseni
article
Acta crystallographica Section F : Structural biology communications [2014-..], 2016, 72 (9), pp.687-691. ⟨10.1107/S2053230X16011778⟩
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BibTex
titre
Structural characterization of recombinant IAV polymerase reveals a stable complex between viral PA-PB1 heterodimer and host RanBP5.
auteur
Christopher Swale, Alexandre Monod, Laura Tengo, Alice Labaronne, Frédéric Garzoni, Jean-Marie Bourhis, Stephen Cusack, Guy Schoehn, Imre Berger, Rob W H Ruigrok, Thibaut Crépin
article
Scientific Reports, 2016, 6, pp.24727. ⟨10.1038/srep24727⟩
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2014

titre
A cost-effective protocol for the parallel production of libraries of 13CH3-specifically labeled mutants for NMR studies of high molecular weight proteins.
auteur
Elodie Crublet, Rime Kerfah, Guillaume Mas, Marjolaine Noirclerc-Savoye, Violaine Lantez, Thierry Vernet, Jérôme Boisbouvier
article
Methods in Molecular Biology, 2014, pp.229-44
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https://hal.science/hal-01093893/file/Crublet%20et%20al.%20MethodsInMolecularBiology%202014.pdf BibTex