Publications HAL du labo/EPI 576;1043235 de la collection IBS-DYC

2022

titre
De novo determination of mosquitocidal Cry11Aa and Cry11Ba structures from naturally-occurring nanocrystals
auteur
Guillaume Tetreau, Michael R. Sawaya, Elke De Zitter, Elena A. Andreeva, Anne-Sophie Banneville, Natalie A. Schibrowsky, Nicolas Coquelle, Aaron S. Brewster, Marie Luise Grünbein, Gabriela Nass Kovacs, Mark S. Hunter, Marco Kloos, Raymond G. Sierra, Giorgio Schiro, Pei Qiao, Myriam Stricker, Iris D. Young, Ninon Zala, Sylvain Engilberge, Alexander Gorel, Luca Signor, Jean-Marie Teulon, Mario Hilpert, Lutz Foucar, Johan Bielecki, Richard Bean, Raphael De Wijn, Tokushi Sato, Dennis Bideshi, Romain Letrun, Alexander Batyuk, Irina Snigireva, Daphna Fenel, Robin Schubert, Ethan J. Canfield, Mario M. Alba, Frédéric Laporte, Henry Kirkwood, Laurence Després, Maria Bacia, Amandine Roux, Christian Chapelle, François Riobé, Olivier Maury, Wai-Li Ling, Sébastien Boutet, Adrian Mancuso, Irina Gutsche, Eric Girard, Thomas R. M. Barends, Jean-Luc Pellequer, Hyun-Woo Park, Arthur D. Laganowsky, Jose Rodriguez, Manfred Burghammer, Robert L. Shoeman, R. Bruce Doak, Martin Weik, Nicholas K. Sauter, Brian Federici, Duilio Cascio, Ilme Schlichting, Jacques-Philippe Colletier
article
Nature Communications, 2022, 13, ⟨10.1038/s41467-022-31746-x⟩
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titre
High-resolution Neutron Spectroscopy to Study Picosecond-nanosecond Dynamics of Proteins and Hydration Water
auteur
Kevin Pounot, Markus Appel, Christian Beck, Martin Weik, Giorgio Schirò, Yann Fichou, Tilo Seydel, Frank Schreiber
article
Journal of visualized experiments : JoVE, 2022, 182, ⟨10.3791/63664⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03769971/file/20211209_neutron_scattering_methods_forHAL.pdf BibTex
titre
Is orange carotenoid protein photoactivation a single-photon process?
auteur
Stanisław Niziński, Ilme Schlichting, Jacques-Philippe Colletier, Diana Kirilovsky, Gotard Burdzinski, Michel Sliwa
article
Biophysical Reports, 2022, 2 (3), pp.100072. ⟨10.1016/j.bpr.2022.100072⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03869280/file/Nizinski%20et%20al.%20BiophysRep.pdf BibTex
titre
Oligomerization processes limit photoactivation and recovery of the orange carotenoid protein
auteur
Elena Andreeva, Stanisław Niziński, Adjélé Wilson, Matteo Levantino, Elke de Zitter, Rory Munro, Fernando Muzzopappa, Aurélien Thureau, Ninon Zala, Gotard Burdzinski, Michel Sliwa, Diana Kirilovsky, Giorgio Schirò, Jacques-Philippe Colletier
article
Biophysical Journal, 2022, 121 (15), pp.2849-2872. ⟨10.1016/j.bpj.2022.07.004⟩
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https://hal-cnrs.archives-ouvertes.fr/hal-03847417/file/Andreeva%20et%20al.%20Biophusical%20journal.pdf BibTex
titre
Photophysical studies at cryogenic temperature reveal a novel photoswitching mechanism of rsEGFP2
auteur
Angela Mantovanelli, Oleksandr Glushonkov, Virgile Adam, Jip Wulffele, Daniel Thédié, Martin Byrdin, Ingo Gregor, Oleksii Nevskyi, Jörg Enderlein, Dominique Bourgeois
article
2022
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03810073/file/Mantovanelli%20preprint.pdf BibTex
titre
Rational control of off‐state heterogeneity in a photoswitchable fluorescent protein provides switching contrast enhancement
auteur
Virgile Adam, Kyprianos Hadjidemetriou, Nickels Jensen, Robert L. Shoeman, Joyce Woodhouse, Andrew Aquila, Anne-Sophie Banneville, Thomas Barends, Victor Bezchastnov, Sébastien Boutet, Martin Byrdin, Marco Cammarata, Sergio Carbajo, Nina Eleni Christou, Nicolas Coquelle, Eugenio de la Mora, Mariam El Khatib, Tadeo Moreno Chicano, R. Bruce Doak, Franck Fieschi, Lutz Foucar, Oleksandr Glushonkov, Alexander Gorel, Marie Luise Grünbein, Mario Hilpert, Mark Hunter, Marco Kloos, Jason Koglin, Thomas J. Lane, Mengning Liang, Angela Mantovanelli, Karol Nass, Gabriela Nass Kovacs, Shigeki Owada, Christopher M. Roome, Giorgio Schirò, Matthew Seaberg, Miriam Stricker, Michel Thépaut, Kensuke Tono, Kiyoshi Ueda, Lucas M. Uriarte, Daehyun You, Ninon Zala, Tatiana Domratcheva, Stefan Jakobs, Michel Sliwa, Ilme Schlichting, Jacques-Philippe Colletier, Dominique Bourgeois, Martin Weik
article
ChemPhysChem, 2022, 23 (19), pp.e202200192. ⟨10.1002/cphc.202200192⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03758975/file/Adam%20et%20al.%20ChemPhysChem.pdf BibTex
titre
Socialization of Providencia stuartii Enables Resistance to Environmental Insults
auteur
Julie Lopes, Guillaume Tetreau, Kevin Pounot, Mariam El Khatib, Jacques-Philippe Colletier
article
Microorganisms, 2022, 10 (5), pp.901. ⟨10.3390/microorganisms10050901⟩
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https://hal-cnrs.archives-ouvertes.fr/hal-03847651/file/microorganisms-10-00901-v3.pdf BibTex
titre
Structural and biochemical characterisation of the Providencia stuartii arginine decarboxylase shows distinct polymerisation and regulation
auteur
Matthew Jessop, Karine Huard, Ambroise Desfosses, Guillaume Tetreau, Diego Carriel, Maria Bacia-Verloop, Caroline Mas, Philippe Mas, Angélique Fraudeau, Jacques-Philippe Colletier, Irina Gutsche
article
Communications Biology, 2022, 5 (1), pp.317. ⟨10.1038/s42003-022-03276-1⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-03650076/file/Jessop%20et%20al.%20communications%20biology.pdf BibTex
titre
Structural and functional characterization of DdrC, a novel DNA damage-induced nucleoid associated protein involved in DNA compaction
auteur
Anne-Sophie Banneville, Claire Bouthier de La Tour, Cécilia Hognon, Jacques-Philippe Colletier, Jean-Marie Teulon, Aline Le Roy, Jean-Luc Pellequer, Antonio Monari, François Dehez, Fabrice Confalonieri, Pascale Servant, Joanna Timmins
article
Nucleic Acids Research, 2022, 50 (13), pp.7680-7696. ⟨10.1093/nar/gkac563⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-03420989/file/Banneville%20et%20al.%20NAR.pdf BibTex
titre
Structural information about the $trans-to-cis$ isomerization mechanism of the photoswitchable fluorescent protein rsEGFP2 revealed by multiscale infrared transient absorption
auteur
Lucas M. Uriarte, Raffaele Vitale, Stanisław Niziński, Kyprianos Hadjidemetriou, Ninon Zala, Andras Lukacs, Gregory Greetham, Igor Sazanovich, Martin Weik, Cyril Ruckebusch, Stephen Meech, Michel Sliwa
article
Journal of Physical Chemistry Letters, 2022, 13 (5), pp.1194-1202. ⟨10.1021/acs.jpclett.1c02920⟩
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titre
Structure-function-dynamics relationships in the peculiar Planktothrix PCC7805 OCP1: Impact of his-tagging and carotenoid type
auteur
Adjélé Wilson, Elena Andreeva, Stanisław Niziński, Léa Talbot, Elisabeth Hartmann, Ilme Schlichting, Gotard Burdzinski, Michel Sliwa, Diana Kirilovsky, Jacques-Philippe Colletier
article
Biochimica biophysica acta (BBA) - Bioenergetics, 2022, 1863 (7), pp.148584. ⟨10.1016/j.bbabio.2022.148584⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-03788031/file/Wilson%20et%20al.%20BBA.pdf BibTex
titre
Time-resolved serial femtosecond crystallography on fatty-acid photodecarboxylase: lessons learned
auteur
Kyprianos Hadjidemetriou, Nicolas Coquelle, Thomas Barends, Elke de Zitter, Ilme Schlichting, Jacques Philippe Colletier, Martin Weik
article
Acta crystallographica Section D : Structural biology [1993-..], 2022, 78 (9), pp.1131-1142. ⟨10.1107/S2059798322007525⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-03788055/file/Hadjidemetriou%20et%20al.%20Structural%20biology.pdf BibTex
titre
Unifying Perspective of the Ultrafast Photodynamics of Orange Carotenoid Proteins from Synechocystis : Peril of High-Power Excitation, Existence of Different S* States, and Influence of Tagging
auteur
Stanisław Niziński, Adjéle Wilson, Lucas Uriarte, Cyril Ruckebusch, Elena Andreeva, Ilme Schlichting, Diana Kirilovsky, Gotard Burdzinski, Michel Sliwa
article
JACS Au, 2022, 2 (5), pp.1084-1095. ⟨10.1021/jacsau.1c00472⟩
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titre
Xtrapol8 enables automatic elucidation of low-occupancy intermediate-states in crystallographic studies
auteur
Elke de Zitter, Nicolas Coquelle, Paula Oeser, Thomas Barends, Jacques-Philippe Colletier
article
Communications Biology, 2022, 5 (1), pp.640. ⟨10.1038/s42003-022-03575-7⟩
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https://hal-cnrs.archives-ouvertes.fr/hal-03847426/file/DeZitter%20et%20al.%20communications%20biology.pdf BibTex

2021

titre
A guide to time‐resolved structural analysis of light‐activated proteins
auteur
Harshwardhan Poddar, Derren Heyes, Giorgio Schirò, Martin Weik, David Leys, Nigel Scrutton
article
FEBS Journal, 2021, ⟨10.1111/febs.15880⟩
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titre
Can (We Make) Bacillus thuringiensis Crystallize More Than Its Toxins?
auteur
Guillaume Tetreau, Elena Andreeva, Anne-Sophie Banneville, Elke de Zitter, Jacques-Philippe Colletier
article
Toxins, 2021, 13 (7), pp.441. ⟨10.3390/toxins13070441⟩
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titre
Diffusivelike Motions in a Solvent-Free Protein-Polymer Hybrid
auteur
Giorgio Schirò, Yann Fichou, Alex Brogan, Richard Sessions, Wiebke Lohstroh, Michaela Zamponi, Gerald Schneider, Francois-Xavier Gallat, Alessandro Paciaroni, Douglas Tobias, Adam Perriman, Martin Weik
article
Physical Review Letters, 2021, 126 (8), pp.088102. ⟨10.1103/PhysRevLett.126.088102⟩
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titre
How does $Bacillus\ thuringiensis$ crystallize such a large diversity of toxins?
auteur
Guillaume Tetreau, Elena Andreeva, Anne-Sophie Banneville, Elke de Zitter, Jacques-Philippe Colletier
article
Toxins, 2021, 13 (7), pp.443. ⟨10.3390/toxins13070443⟩
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titre
Mechanism and dynamics of fatty acid photodecarboxylase
auteur
Damien Sorigué, Kyprianos Hadjidemetriou, S. Blangy, G. Gotthard, A. Bonvalet, Nicolas Coquelle, P. Samire, Alexey Aleksandrov, L. Antonucci, A. Benachir, S. Boutet, Martin Byrdin, Marco Cammarata, S. Carbajo, Stephan Cuine, R. Doak, L. Foucar, A. Gorel, M. Grünbein, E. Hartmann, Rainer Hienerwadel, M. Hilpert, M. Kloos, T. Lane, B. Légeret, P. Legrand, Y. Li-Beisson, S. Moulin, D. Nurizzo, G. Peltier, Giorgio Schirò, R. Shoeman, M. Sliwa, X. Solinas, B. Zhuang, T. Barends, Jacques-Philippe Colletier, M. Joffre, Antoine Royant, C. Berthomieu, Martin Weik, T. Domratcheva, K. Brettel, Marten H. Vos, I. Schlichting, Pascal Arnoux, P. Müller, F. Beisson
article
Science, 2021, 372 (6538), pp.eabd5687. ⟨10.1126/science.abd5687⟩
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titre
Porphyrin Binding and Irradiation Promote G-Quadruplex DNA Dimeric Structure
auteur
Valeria Libera, Elena Andreeva, Anne Martel, Aurelien Thureau, Marialucia Longo, Caterina Petrillo, Alessandro Paciaroni, Giorgio Schirò, Lucia Comez
article
Journal of Physical Chemistry Letters, 2021, 12 (33), pp.8096-8102. ⟨10.1021/acs.jpclett.1c01840⟩
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titre
Structure–function dataset reveals environment effects within a fluorescent protein model system
auteur
Elke de Zitter, Siewert Hugelier, Sam Duwé, Wim Vandenberg, Alison Tebo, Luc van Meervelt, Peter Dedecker
article
Angewandte Chemie, 2021, 133 (18), pp.10161-10169. ⟨10.1002/anie.202015201⟩
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BibTex
titre
Zinc Determines Dynamical Properties and Aggregation Kinetics of Human Insulin
auteur
Kevin Pounot, Geoffrey W Grime, Alessandro Longo, Michaela Zamponi, Daria Noferini, Viviana Cristiglio, T. Seydel, Elspeth F Garman, Martin Weik, Vito Foderà, G. Schirò
article
Biophysical Journal, 2021, 120 (5), pp.886-898. ⟨10.1101/2020.07.02.184903⟩
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2020

titre
Chiral Separation, X-ray Structure, and Biological Evaluation of a Potent and Reversible Dual Binding Site AChE Inhibitor
auteur
Marco Catto, Leonardo Pisani, Eugenio de La Mora, Benny Danilo Belviso, Giuseppe Felice Mangiatordi, Andrea Pinto, Annalisa De Palma, Nunzio Denora, Rocco Caliandro, Jacques-Philippe Colletier, Israel Silman, Cosimo Damiano Altomare, Orazio Nicolotti
article
ACS Medicinal Chemistry Letters, 2020, 11 (5), pp.869-876. ⟨10.1021/acsmedchemlett.9b00656⟩
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titre
Development of potent reversible selective inhibitors of butyrylcholinesterase as fluorescent probes
auteur
Stane Pajk, Damijan Knez, Urban Košak, Maja Zorović, Xavier Brazzolotto, Nicolas Coquelle, Florian Nachon, Jacques-Philippe Colletier, Marko Živin, Jure Stojan, Stanislav Gobec
article
Journal of Enzyme Inhibition and Medicinal Chemistry, 2020, 35 (1), pp.498-505. ⟨10.1080/14756366.2019.1710502⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03014299/file/Pajk2020.pdf BibTex
titre
Discovery of a Potent Dual Inhibitor of Acetylcholinesterase and Butyrylcholinesterase with Antioxidant Activity that Alleviates Alzheimer-like Pathology in Old APP/PS1 Mice
auteur
Elisabet Viayna, Nicolas Coquelle, Monika Cieslikiewicz-Bouet, Pedro Cisternas, Carolina Oliva, Elena Sánchez-López, Miren Ettcheto, Manuela Bartolini, Angela de Simone, Mattia Ricchini, Marisa Rendina, Mégane Pons, Omidreza Firuzi, Belén Pérez, Luciano Saso, Vincenza Andrisano, Florian Nachon, Xavier Brazzolotto, Maria Luisa García, Antoni Camins, Israel Silman, Ludovic Jean, Nibaldo Inestrosa, Jacques-Philippe Colletier, Pierre-Yves Renard, Diego Muñoz-Torrero
article
Journal of Medicinal Chemistry, 2020, ⟨10.1021/acs.jmedchem.0c01775⟩
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titre
Environmental and socioeconomic effects of mosquito control in Europe using the biocide Bacillus thuringiensis subsp. israelensis (Bti)
auteur
Carsten Brühl, Laurence Despres, Oliver Frör, Chandrashekhar Patil, Brigitte Poulin, Guillaume Tetreau, Stefanie Allgeier
article
Science of the Total Environment, 2020, 724, pp.137800. ⟨10.1016/j.scitotenv.2020.137800⟩
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BibTex
titre
Mechanistic Investigations of Green mEos4b Reveal a Dynamic Long-Lived Dark State
auteur
Elke de Zitter, Jacqueline Ridard, Daniel Thédié, Virgile Adam, Bernard C. Levy, Martin Byrdin, Guillaume Gotthard, Luc van Meervelt, Peter Dedecker, Isabelle Demachy, Dominique Bourgeois
article
Journal of the American Chemical Society, 2020, 142 (25), pp.10978-10988. ⟨10.1021/jacs.0c01880⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-02895781/file/DeZitter_JACS_2020.pdf BibTex
titre
Photoswitching mechanism of a fluorescent protein revealed by time-resolved crystallography and transient absorption spectroscopy.
auteur
Joyce Woodhouse, Gabriela Nass Kovacs, Nicolas Coquelle, Lucas M. Uriarte, Virgile Adam, Thomas R. M. Barends, Martin Byrdin, Eugenio de La Mora, R. Bruce Doak, Mikolaj Feliks, Martin J Field, Franck Fieschi, Virginia Guillon, Stefan Jakobs, Yasumasa Joti, Pauline Macheboeuf, Koji Motomura, Karol Nass, Shigeki Owada, Christopher M. Roome, Cyril Ruckebusch, Giorgio Schirò, Robert L. Shoeman, Michel Thépaut, Tadashi Togashi, Kensuke Tono, Makina Yabashi, Marco Cammarata, Lutz Foucar, Dominique Bourgeois, Michel Sliwa, Jacques-Philippe Colletier, Ilme Schlichting, Martin Weik
article
Nature Communications, 2020, 11 (1), pp.741. ⟨10.1038/s41467-020-14537-0⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02498645/file/s41467-020-14537-0.pdf BibTex
titre
Probing the dynamics of biological matter by elastic, quasi-elastic, and inelastic neutron scattering
auteur
Giorgio Schirò
article
EPJ Web of Conferences, 2020, 236, pp.05001. ⟨10.1051/epjconf/202023605001⟩
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BibTex
titre
Radiation damage and dose limits in serial synchrotron crystallography at cryo- and room temperatures
auteur
Eugenio de La Mora, Nicolas Coquelle, Charles Bury, Martin Rosenthal, James Holton, Ian Carmichael, Elspeth Garman, Manfred Burghammer, Jacques-Philippe Colletier, Martin Weik
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2020, 117 (8), pp.4142-4151. ⟨10.1073/pnas.1821522117⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03014308/file/delamora.pdf BibTex
titre
Remote oxidative modifications induced by oxygen free radicals modify T/R allosteric equilibrium of a hyperthermophilic lactate dehydrogenase
auteur
Frédéric Halgand, Chantal Houée-Lévin, Martin Weik, Dominique Madern
article
Journal of Structural Biology, 2020, 210 (2), pp.107478. ⟨10.1016/j.jsb.2020.107478⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03011827/file/1-s2.0-S1047847720300411-main.pdf BibTex
titre
Serial femtosecond crystallography on in vivo-grown crystals drives elucidation of mosquitocidal Cyt1Aa bioactivation cascade
auteur
Guillaume Tetreau, Anne-Sophie Banneville, Elena Andreeva, Aaron Brewster, Mark Hunter, Raymond Sierra, Jean-Marie Teulon, Iris Young, Niamh Burke, Tilman A. Grünewald, Joël Beaudouin, Irina Snigireva, Maria Teresa Fernandez-Luna, Alister Burt, Hyun-Woo Park, Luca Signor, Jayesh Bafna, Rabia Sadir, Daphna Fenel, Elisabetta Boeri-Erba, Maria Bacia-Verloop, Ninon Zala, Frédéric Laporte, Laurence Després, Martin Weik, Sébastien Boutet, Martin Rosenthal, Nicolas Coquelle, Manfred Burghammer, Duilio Cascio, Michael Sawaya, Mathias Winterhalter, Enrico Gratton, Irina Gutsche, Brian Federici, Jean-Luc Pellequer, Nicholas Sauter, Jacques-Philippe Colletier
article
Nature Communications, 2020, 11 (1), ⟨10.1038/s41467-020-14894-w⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02506591/file/tetreau2020.pdf BibTex
titre
Shock Damage Analysis in Serial Femtosecond Crystallography Data Collected at MHz X-ray Free-Electron Lasers
auteur
Alexander Gorel, Marie Luise Grünbein, Richard Bean, Johan Bielecki, Mario Hilpert, Michele Cascella, Jacques-Philippe Colletier, Hans Fangohr, Lutz Foucar, Elisabeth Hartmann, Mark Hunter, Henry Kirkwood, Marco Kloos, Romain Letrun, Thomas Michelat, Robert Shoeman, Jolanta Sztuk-Dambietz, Guillaume Tetreau, Herbert Zimmermann, Adrian Mancuso, Thomas R.M. Barends, R. Bruce Doak, Claudiu Andrei Stan, Ilme Schlichting
article
Crystals, 2020, 10 (12), pp.1145. ⟨10.3390/cryst10121145⟩
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BibTex
titre
The C. elegans GATA transcription factor elt-2 mediates distinct transcriptional responses and opposite infection outcomes towards different Bacillus thuringiensis strains
auteur
Alejandra Zárate-Potes, Wentao Yang, Barbara Pees, Rebecca Schalkowski, Philipp Segler, Bentje Andresen, Daniela Haase, Rania Nakad, Philip Rosenstiel, Guillaume Tetreau, Jacques-Philippe Colletier, Hinrich Schulenburg, Katja Dierking
article
PLoS Pathogens, 2020, 16 (9), pp.e1008826. ⟨10.1371/journal.ppat.1008826⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03014289/file/zaratepotes2020.pdf BibTex
titre
Tracking Internal and Global Diffusive Dynamics During Protein Aggregation by High-Resolution Neutron Spectroscopy
auteur
Kevin Pounot, Hussein Chaaban, Vito Foderà, Giorgio Schirò, Martin Weik, Tilo Seydel
article
Journal of Physical Chemistry Letters, 2020, 11 (15), pp.6299-6304. ⟨10.1021/acs.jpclett.0c01530⟩
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2019

titre
‘Drc’, a structurally novel ssDNA-binding transcription regulator of N4-related bacterial viruses
auteur
Maarten Boon, Elke de Zitter, Jeroen De smet, Jeroen Wagemans, Marleen Voet, Friederike Pennemann, Thomas Schalck, Konstantin Kuznedelov, Konstantin Severinov, Luc Van meervelt, Marc De maeyer, Rob Lavigne
article
Nucleic Acids Research, 2019, 48 (1), pp.445-459. ⟨10.1093/nar/gkz1048⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03513209/file/boo1.pdf BibTex
titre
Assembly and cryo-EM structures of RNA-specific measles virus nucleocapsids provide mechanistic insight into paramyxoviral replication
auteur
Ambroise Desfosses, Sigrid Milles, Malene Ringkjøbing Jensen, Serafima Guseva, Jacques-Philippe Colletier, Damien Maurin, Guy Schoehn, Irina Gutsche, Rob W H Ruigrok, Martin Blackledge
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2019, 116 (10), pp.4256-4264. ⟨10.1073/pnas.1816417116⟩
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https://hal.science/hal-02070475/file/desfosses2019.pdf BibTex
titre
Cell morphology and nucleoid dynamics in dividing Deinococcus radiodurans
auteur
Kevin Floc’h, Françoise Lacroix, Pascale Servant, Yung-Sing Wong, Jean-Philippe Kleman, Dominique Bourgeois, Joanna Timmins
article
Nature Communications, 2019, 10 (1), ⟨10.1038/s41467-019-11725-5⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02273077/file/Floc%27h%20et%20al.%20Nat%20Commun.pdf BibTex
titre
Design, biological evaluation and X-ray crystallography of nanomolar multifunctional ligands targeting simultaneously acetylcholinesterase and glycogen synthase kinase-3
auteur
Killian Oukoloff, Nicolas Coquelle, Manuela Bartolini, Marina Naldi, Rémy Le Guével, Stéphane Bach, Béatrice Josselin, Sandrine Ruchaud, Marco Catto, Leonardo Pisani, Nunzio Denora, Rosa Maria Iacobazzi, Israel Silman, Joel L Sussman, Frédéric Buron, Jacques-Philippe Colletier, Ludovic Jean, Sylvain Routier, Pierre-Yves Renard
article
European Journal of Medicinal Chemistry, 2019, 168, pp.58-77. ⟨10.1016/j.ejmech.2018.12.063⟩
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https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-02055769/file/Oukoloff_et_al-2019-Design%2C_biological_evaluation_and_X-ray_crystallography_of_nanomolar.pdf BibTex
titre
Integrated NMR and cryo-EM atomic-resolution structure determination of a half-megadalton enzyme complex
auteur
Diego Gauto, Leandro F Estrozi, Charles Schwieters, Grégory Effantin, Pavel Macek, Rémy Sounier, Astrid C. Sivertsen, Elena Schmidt, Rime Kerfah, Guillaume Mas, Jacques-Philippe Colletier, Peter Güntert, Adrien Favier, Guy Schoehn, Paul Schanda, Jérôme Boisbouvier
article
Nature Communications, 2019, 10 (1), pp.2697. ⟨10.1038/s41467-019-10490-9⟩
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https://hal.science/hal-02166767/file/gauto2019.pdf BibTex
titre
Ligand pathways in neuroglobin revealed by low-temperature photodissociation and docking experiments
auteur
Chiara Ardiccioni, Alessandro Arcovito, Stefano Della Longa, Peter van der Linden, Dominique Bourgeois, Martin Weik, Linda Celeste Montemiglio, Carmelinda Savino, Giovanna Avella, Cécile Exertier, Philippe Carpentier, Thierry Prangé, Maurizio Brunori, Nathalie Colloc'H, Beatrice Vallone
article
International Union of Crystallography journal, 2019, 6, pp.832-842. ⟨10.1107/S2052252519008157⟩
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BibTex
titre
Light-induced structural changes in a full-length cyanobacterial phytochrome probed by time- resolved X-ray scattering
auteur
Derren J. Heyes, Samantha J. O. Hardman, Martin N. Pedersen, Joyce Woodhouse, Eugenio de La Mora, Michael Wulff, Martin Weik, Marco Cammarata, Nigel S. Scrutton, Giorgio Schirò
article
Communications Biology, 2019, 2 (1), pp.1. ⟨10.1038/s42003-018-0242-0⟩
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https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-02086213/file/Heyes-Light-induced%20structural%20changes%20in%20a%20full-length%20cyanobacterial.pdf BibTex
titre
Mechanistic investigation of mEos4b reveals a strategy to reduce track interruptions in sptPALM
auteur
Elke de Zitter, Daniel Thédié, Viola Mönkemöller, Siewert Hugelier, Joël Beaudouin, Virgile Adam, Martin Byrdin, Luc van Meervelt, Peter Dedecker, Dominique Bourgeois
article
Nature Methods, 2019, 16 (8), pp.707-710. ⟨10.1038/s41592-019-0462-3⟩
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titre
MHz data collection of a microcrystalline mixture of different jack bean proteins
auteur
Marie Luise Grünbein, Johan Bielecki, Alexander Gorel, Miriam Stricker, Richard Bean, Marco Cammarata, Katerina Dörner, Lars Fröhlich, Elisabeth Hartmann, Steffen Hauf, Mario Hilpert, Yoonhee Kim, Marco Kloos, Romain Letrun, Marc Messerschmidt, Grant Mills, Gabriela Nass Kovacs, Marco Ramilli, Christopher M Roome, Tokushi Sato, Matthias Scholz, Michel Sliwa, Jolanta Sztuk-Dambietz, Martin Weik, Britta Weinhausen, Nasser Al-Qudami, Djelloul Boukhelef, Sandor Brockhauser, Wajid Ehsan, Moritz Emons, Sergey Esenov, Hans Fangohr, Alexander Kaukher, Thomas Kluyver, Max Lederer, Luis Maia, Maurizio Manetti, Thomas Michelat, Astrid Münnich, Florent Pallas, Guido Palmer, Gianpietro Previtali, Natascha Raab, Alessandro Silenzi, Janusz Szuba, Sandhya Venkatesan, Krzysztof Wrona, Jun Zhu, R. Bruce Doak, Robert Shoeman, Lutz Foucar, Jacques-Philippe Colletier, Adrian Mancuso, Thomas Barends, Claudiu Stan, Ilme Schlichting
article
Scientific Data , 2019, 6 (1), ⟨10.1038/s41597-019-0010-0⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02412659/file/s41597-019-0010-0.pdf BibTex
titre
NMR Reveals Light-Induced Changes in the Dynamics of a Photoswitchable Fluorescent Protein
auteur
Nina Eleni Christou, Isabel Ayala, Karine Giandoreggio-Barranco, Martin Byrdin, Virgile Adam, Dominique Bourgeois, Bernhard Brutscher
article
Biophysical Journal, 2019, 117 (11), pp.2087-2100. ⟨10.1016/j.bpj.2019.10.035⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02389522/file/32348_0_merged_1561984080.pdf BibTex
titre
Novel multitarget-directed ligands targeting acetylcholinesterase and σ1 receptors as lead compounds for treatment of Alzheimer's disease: Synthesis, evaluation, and structural characterization of their complexes with acetylcholinesterase
auteur
Julien Lalut, Gianluca Santoni, Delphine Karila, Cédric Lecoutey, Audrey Davis, Florian Nachon, Israel Silman, Joel Sussman, Martin Weik, Tangui Maurice, Patrick Dallemagne, Cédric Lecoutey
article
European Journal of Medicinal Chemistry, 2019, 162, pp.234-248. ⟨10.1016/j.ejmech.2018.10.064⟩
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titre
Role of hydration water in the onset of protein structural dynamics
auteur
Giorgio Schirò, Martin Weik
article
Journal of Physics: Condensed Matter, 2019, 31 (46), pp.463002. ⟨10.1088/1361-648X/ab388a⟩
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titre
Structural stability of human butyrylcholinesterase under high hydrostatic pressure
auteur
Liina Kangur, Kõu Timpmann, Dominik Zeller, Patrick Masson, Judith Peters, Arvi Freiberg
article
Biochimica et Biophysica Acta Proteins and Proteomics, 2019, 1867 (2), pp.107-113
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titre
Three-dimensional view of ultrafast dynamics in photoexcited bacteriorhodopsin
auteur
Gabriela Nass Kovacs, Jacques-Philippe Colletier, Marie Luise Grünbein, Yang Yang, Till Stensitzki, Alexander Batyuk, Sergio Carbajo, R. Bruce Doak, David Ehrenberg, Lutz Foucar, Raphael Gasper, Alexander Gorel, Mario Hilpert, Marco Kloos, Jason Koglin, Jochen Reinstein, Christopher Roome, Ramona Schlesinger, Matthew Seaberg, Robert Shoeman, Miriam Stricker, Sébastien Boutet, Stefan Haacke, Joachim Heberle, Karsten Heyne, Tatiana Domratcheva, Thomas Barends, Ilme Schlichting
article
Nature Communications, 2019, 10 (1), ⟨10.1038/s41467-019-10758-0⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03014303/file/nasskovacs2019.pdf BibTex
titre
Three-dimensional view of ultrafast dynamics in photoexcited bacteriorhodopsin
auteur
Gabriela Nass Kovacs, Jacques-Philippe Colletier, Marie Luise Grünbein, Yang Yang, Till Stensitzki, Alexander Batyuk, Sergio Carbajo, R Bruce Doak, David Ehrenberg, Lutz Foucar, Raphael Gasper, Alexander Gorel, Mario Hilpert, Marco Kloos, Jason E Koglin, Jochen Reinstein, Christopher M Roome, Ramona Schlesinger, Matthew Seaberg, Robert Shoeman, Miriam Stricker, Sébastien Boutet, Stefan Haacke, Joachim Heberle, Karsten Heyne, Tatiana Domratcheva, Thomas Barends, Ilme Schlichting
article
2019
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2018

titre
A Long-Lived Triplet State Is the Entrance Gateway to Oxidative Photochemistry in Green Fluorescent Proteins
auteur
Martin Byrdin, Chenxi Duan, Dominique Bourgeois, Klaus Brettel
article
Journal of the American Chemical Society, 2018, 140 (8), pp.2897 - 2905. ⟨10.1021/jacs.7b12755⟩
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titre
Bacterial cell wall nanoimaging by autoblinking microscopy
auteur
Kevin Floc’h, Françoise Lacroix, Liliana Barbieri, Pascale Servant, Rémi Galland, Corey Butler, Jean-Baptiste Sibarita, Dominique Bourgeois, Joanna Timmins
article
Scientific Reports, 2018, 8 (1), ⟨10.1038/s41598-018-32335-z⟩
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titre
Chromophore twisting in the excited state of a photoswitchable fluorescent protein captured by time-resolved serial femtosecond crystallography
auteur
Nicolas Coquelle, Michel Sliwa, Joyce Woodhouse, Giorgio Schirò, Virgile Adam, Andrew Aquila, Thomas R. M. Barends, Sébastien Boutet, Martin Byrdin, Sergio Carbajo, Eugenio de La Mora, R. Bruce Doak, Mikolaj Feliks, Franck Fieschi, Lutz Foucar, Virginia Guillon, Mario Hilpert, Mark S. Hunter, Stefan Jakobs, Jason E. Koglin, Gabriela Kovacsova, Thomas J. Lane, Bernard C. Levy, Mengning Liang, Karol Nass, Jacqueline Ridard, Joseph S. Robinson, Christopher M. Roome, Cyril Ruckebusch, Matthew Seaberg, Michel Thépaut, Marco Cammarata, Isabelle Demachy, Martin J Field, Robert L. Shoeman, Dominique Bourgeois, Jacques-Philippe Colletier, Ilme Schlichting, Martin Weik
article
Nature Chemistry, 2018, 10 (1), pp.31-37. ⟨10.1038/nchem.2853⟩
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titre
Design of tryptophan-containing mutants of the symmetrical Pizza protein for biophysical studies
auteur
Hiroki Noguchi, Bram Mylemans, Elke de Zitter, Luc van Meervelt, Jeremy R.H. Tame, Arnout Voet
article
Biochemical and Biophysical Research Communications, 2018, 497 (4), pp.1038-1042. ⟨10.1016/j.bbrc.2018.02.168⟩
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titre
Extreme amyloid polymorphism in Staphylococcus aureus virulent PSMα peptides
auteur
Nir Salinas, Jacques-Philippe Colletier, Asher Moshe, Meytal Landau
article
Nature Communications, 2018, 9 (1), pp.3512. ⟨10.1038/s41467-018-05490-0⟩
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titre
Global spectroscopic analysis to study the regulation of the photosynthetic proton motive force: A critical reappraisal
auteur
Guillaume Allorent, Martin Byrdin, Luca Carraretto, Tomas Morosinotto, Ildikó Szabó, Giovanni Finazzi
article
Biochimica biophysica acta (BBA) - Bioenergetics, 2018, 1859 (9), pp.676-683. ⟨10.1016/j.bbabio.2018.07.001⟩
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titre
Increasing Polarity in Tacrine and Huprine Derivatives: Potent Anticholinesterase Agents for the Treatment of Myasthenia Gravis
auteur
Carles Galdeano, Nicolas Coquelle, Monika Cieslikiewicz-Bouet, Manuela Bartolini, Belén Pérez, M Victòria Clos, Israel Silman, Ludovic Jean, Jacques-Philippe Colletier, Pierre-Yves Renard, Diego Muñoz-Torrero
article
Molecules, 2018, 23 (3), pp.634. ⟨10.3390/molecules23030634⟩
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titre
Interaction between Insects, Toxins, and Bacteria: Have We Been Wrong So Far?
auteur
Guillaume Tetreau
article
Toxins, 2018, 10 (7), pp.281. ⟨10.3390/toxins10070281⟩
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titre
Larval Exposure to the Bacterial Insecticide Bti Enhances Dengue Virus Susceptibility of Adult Aedes aegypti Mosquitoes
auteur
Isabelle Moltini-Conclois, Renaud Stalinski, Guillaume Tetreau, Laurence Després, Louis Lambrechts
article
Insects, 2018, 9 (4), pp.193. ⟨10.3390/insects9040193⟩
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https://hal-pasteur.archives-ouvertes.fr/pasteur-01969194/file/insects-09-00193.pdf BibTex
titre
Megahertz data collection from protein microcrystals at an X-ray free-electron laser
auteur
Luis Grünbein, Johan Bielecki, Alexander Gorel, Miriam Stricker, Richard Bean, Marco Cammarata, Katerina Dörner, Lars Fröhlich, Elisabeth Hartmann, Steffen Hauf, Mario Hilpert, Yoonhee Kim, Marco Kloos, Romain Letrun, Marc Messerschmidt, Grant Mills, Gabriela Nass Kovacs, Marco Ramilli, Christopher Roome, Tokushi Sato, Matthias Scholz, Michel Sliwa, Jolanta Sztuk-Dambietz, Martin Weik, Britta Weinhausen, Nasser Al-Qudami, Djelloul Boukhelef, Sandor Brockhauser, Wajid Ehsan, Moritz Emons, Sergey Esenov, Hans Fangohr, Alexander Kaukher, Thomas Kluyver, Max Lederer, Luis Maia, Maurizio Manetti, Thomas Michelat, Astrid Münnich, Florent Pallas, Guido Palmer, Gianpietro Previtali, Natascha Raab, Alessandro Silenzi, Janusz Szuba, Sandhya Venkatesan, Krzysztof Wrona, Jun Zhu, R Bruce Doak, Robert Shoeman, Lutz Foucar, Jacques-Philippe Colletier, Adrian Mancuso, Thomas Barends, Claudiu Stan, Ilme Schlichting
article
Nature Communications, 2018, 9 (1), pp.3487. ⟨10.1038/s41467-018-05953-4⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01912078/file/s41467-018-05953-4.pdf BibTex
titre
Multi-target-directed ligands for treating Alzheimer's disease: Butyrylcholinesterase inhibitors displaying antioxidant and neuroprotective activities
auteur
Damijan Knez, Nicolas Coquelle, Anja Pišlar, Simon Žakelj, Marko Jukič, Matej Sova, Janez Mravljak, Florian Nachon, Xavier Brazzolotto, Janko Kos, Jacques-Philippe Colletier, Stanislav Gobec
article
European Journal of Medicinal Chemistry, 2018, 156, pp.598 - 617. ⟨10.1016/j.ejmech.2018.07.033⟩
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BibTex
titre
Photochemical Mechanism of an Atypical Algal Phytochrome
auteur
Uzma Choudry, Derren Heyes, Samantha Hardman, Michiyo Sakuma, Igor Sazanovich, Joyce Woodhouse, Eugenio de La Mora, Martin S. Pedersen, Michael Wulff, Martin Weik, Giorgio Schirò, Nigel Scrutton
article
ChemBioChem, 2018, 19 (10), pp.1036 - 1043. ⟨10.1002/cbic.201800016⟩
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BibTex
titre
Porin self-association enables cell-to-cell contact in Providencia stuartii floating communities
auteur
Mariam El Khatib, Chady Nasrallah, Julie Lopes, Que-Tien Tran, Guillaume Tetreau, Hind Basbous, Daphna Fenel, Benoit Gallet, Mathilde Lethier, Jean-Michel Bolla, Jean-Marie Pagès, Michel Vivaudou, Martin Weik, Mathias Winterhalter, Jacques-Philippe Colletier
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2018, 115 (10), pp.E2220-E2228. ⟨10.1073/pnas.1714582115⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01894519/file/BOLLA%203.pdf BibTex
titre
Potent 3‐Hydroxy‐2‐Pyridine Aldoxime Reactivators of Organophosphate‐Inhibited Cholinesterases with Predicted Blood–Brain Barrier Penetration
auteur
Tamara Zorbaz, Anissa Braïki, Nikola Marakovic, Julien Renou, Eugenio de La Mora, Nikolina Macek Hrvat, Maja Katalinic, I. Silman, J.L. Sussman, Guillaume Mercey, Catherine Gomez, Romain Mougeot, Belén Pérez, Rachid Baati, Florian Nachon, Martin Weik, Ludovic Jean, Zrinka Kovarik, Pierre-Yves Renard
article
Chemistry - A European Journal, 2018, 24 (38), pp.9675-9691. ⟨10.1002/chem.201801394⟩
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titre
Probing the Structure and Dynamics of Cells, Cell Components and Endogenous Nanoparticles Under Extreme Conditions with Neutrons
auteur
Judith Peters, Ruth Prassl, P. Oger
article
Biological, Physical and Technical Basics of Cell Engineering, Springer Singapore, pp.401-420, 2018
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titre
Protein-assisted formation and stabilization of catalytically active polyoxometalate species
auteur
Laurens Vandebroek, Elke de Zitter, Elke De zitter, Hong Giang Thi Ly, Dragan Conić, Tzvetan Mihaylov, Annelies Sap, Paul Proost, Kristine Pierloot, Luc Van meervelt, Tatjana Parac-Vogt
article
Chemistry - A European Journal, 2018, 24 (40), pp.10099-10108. ⟨10.1002/chem.201802052⟩
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BibTex
titre
Structure-Based Optimization of Nonquaternary Reactivators of Acetylcholinesterase Inhibited by Organophosphorus Nerve Agents
auteur
Gianluca Santoni, J. de Sousa, Eugenio de La Mora, J. Dias, Ludovic Jean, J.L. Sussman, I. Silman, Pierre-Yves Renard, R.C.D. Brown, Martin Weik, R. Baati, F. Nachon
article
Journal of Medicinal Chemistry, 2018, 61 (17), pp.7630-7639. ⟨10.1021/acs.jmedchem.8b00592⟩
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titre
The Magic of Crystal Structure-Based Inhibitor Optimization: Development of a Butyrylcholinesterase Inhibitor with Picomolar Affinity and in Vivo Activity
auteur
Urban Košak, Boris Brus, Damijan Knez, Simon Žakelj, Jurij Trontelj, Anja Pišlar, Roman Šink, Marko Jukič, Marko Živin, Adrian Podkowa, Florian Nachon, Xavier Brazzolotto, Jure Stojan, Janko Kos, Nicolas Coquelle, Kinga Sałat, Jacques-Philippe Colletier, Stanislav Gobec
article
Journal of Medicinal Chemistry, 2018, 61 (1), pp.119-139. ⟨10.1021/acs.jmedchem.7b01086⟩
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BibTex
titre
Time-Resolved Serial Femtosecond Crystallography, Towards Molecular Movies of Biomolecules in Action
auteur
Jacques-Philippe Colletier, Giorgio Schirò, Martin Weik
article
Petra Fromme; Sebastien Boutet; Mark Hunter. X-ray Free Electron Lasers, Springer International Publishing, pp.331-356, 2018, ⟨10.1007/978-3-030-00551-1_11⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-01993625/file/TRSFX_Review_2018_02_23_final_JPC.pdf BibTex

2017

titre
A General Mechanism of Photoconversion of Green-to-Red Fluorescent Proteins Based on Blue and Infrared Light Reduces Phototoxicity in Live-Cell Single-Molecule Imaging
auteur
Bartosz Turkowyd, Alexander Balinovic, David Virant, Haruko G. Gölz Carnero, Fabienne Caldana, Marc Endesfelder, Dominique Bourgeois, Ulrike Endesfelder
article
Angewandte Chemie International Edition, 2017, 56 (38), pp.11634 - 11639. ⟨10.1002/anie.201702870⟩
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BibTex
titre
Changes in dynamics of $\alpha$-chymotrypsin due to covalent inhibitors investigated by elastic incoherent neutron scattering
auteur
C. D. Andersson, Nicolas Martinez, Dominik Zeller, Stina Holmgren Rondahl, Michael M. Koza, Bernhard Frick, Fredrik Ekström, Judith Peters, Anna Linusson
article
Physical Chemistry Chemical Physics, 2017, 19, pp.25369-25379. ⟨10.1039/c7cp04041e⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01647114/file/Andersson2017.pdf BibTex
titre
Crystallophore: a versatile lanthanide complex for protein crystallography combining nucleating effects, phasing properties, and luminescence
auteur
Sylvain Engilberge, François Riobé, Sebastiano Di Pietro, Louise Lassalle, Nicolas Coquelle, Charles-Adrien Arnaud, Delphine Pitrat, Jean-Christophe Mulatier, Dominique Madern, Cécile Breyton, Olivier Maury, Eric Girard
article
Chemical Science, 2017, 8 (9), pp.5909 - 5917. ⟨10.1039/C7SC00758B⟩
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titre
Deciphering Structural Photophysics of Fluorescent Proteins by Kinetic Crystallography.
auteur
Dominique Bourgeois
article
International Journal of Molecular Sciences, 2017, 18 (6), pp.E1187. ⟨10.3390/ijms18061187⟩
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BibTex
titre
Efficient switching of mCherry fluorescence using chemical caging
auteur
Bas M. C. Cloin, Elke de Zitter, Desiree Salas, Vincent Gielen, Gert E. Folkers, Marina Mikhaylova, Maike Bergeler, Bartosz Krajnik, Jeremy Harvey, Casper C. Hoogenraad, Luc van Meervelt, Peter Dedecker, Lukas C. Kapitein
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2017, 114 (27), pp.7013-7018. ⟨10.1073/pnas.1617280114⟩
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titre
High hydrostatic pressure specifically affects molecular dynamics and shape of low-density lipoprotein particles
auteur
M. Golub, B. Lehofer, Nicolas Martinez, J. Ollivier, J. Kohlbrecher, R. Prassl, Judith Peters
article
Scientific Reports, 2017, 7, pp.46034. ⟨10.1038/srep46034⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01582543/file/SREP46034.pdf BibTex
titre
Interaction of lipopolysaccharides at intermolecular sites of the periplasmic Lpt transport assembly
auteur
Cédric Laguri, Paola Sperandeo, Kevin Pounot, Isabel Ayala, Alba Silipo, Catherine M Bougault, Antonio Molinaro, Alessandra Polissi, Jean-Pierre Simorre
article
Scientific Reports, 2017, 7 (1), pp.9715. ⟨10.1038/s41598-017-10136-0⟩
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BibTex
titre
Low-density lipoproteins investigated under high hydrostatic pressure by elastic incoherent neutron scattering
auteur
Judith Peters, Nicolas Martinez, B. Lehofer, R. Prassl
article
European Physical Journal E: Soft matter and biological physics, 2017, 40 (7), pp.341-341. ⟨10.1140/epje/i2017-11558-8⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01582512/file/Paper-published.pdf BibTex
titre
Mobility of a Mononucleotide within a Lipid Matrix: A Neutron Scattering Study
auteur
Loreto Misuraca, Francesca Natali, Laura da Silva, Judith Peters, Bruno Demé, Jacques Ollivier, Tilo Seydel, Valerie Laux-Lesourd, Michael Haertlein, Giuseppe Zaccai, David Deamer, Marie Christine Maurel
article
Life, 2017, Origin of Cellular Life, 7 (1), pp.2. ⟨10.3390/life7010002⟩
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https://hal.science/hal-01582551/file/life-07-00002.pdf BibTex
titre
N-Propargylpiperidines with naphthalene-2-carboxamide or naphthalene-2-sulfonamide moieties: Potential multifunctional anti-Alzheimer's agents.
auteur
Urban Košak, Damijan Knez, Nicolas Coquelle, Boris Brus, Anja Pišlar, Florian Nachon, Xavier Brazzolotto, Janko Kos, Jacques-Philippe Colletier, Stanislav Gobec
article
Bioorganic and Medicinal Chemistry, 2017, 25 (2), pp.633-645. ⟨10.1016/j.bmc.2016.11.032⟩
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BibTex
titre
Neutrons describe ectoine effects on water H-bonding and hydration around a soluble protein and a cell membrane
auteur
Giuseppe Zaccai, Irina Bagyan, Jérôme Combet, Gabriel J. Cuello, Bruno Demé, Yann Fichou, François-Xavier Gallat, Victor M. Galvan Josa, Susanne von Gronau, Michael Haertlein, Anne Martel, Martin Moulin, Markus Neumann, Martin Weik, Dieter Oesterhelt
article
Scientific Reports, 2017, 6 (31434), ⟨10.1038/srep31434⟩
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BibTex
titre
Photoswitching of Green mEos2 by Intense 561 nm Light Perturbs Efficient Green-to-Red Photoconversion in Localization Microscopy
auteur
Daniel Thédié, Romain Berardozzi, Virgile Adam, Dominique Bourgeois
article
Journal of Physical Chemistry Letters, 2017, 8 (18), pp.4424 - 4430. ⟨10.1021/acs.jpclett.7b01701⟩
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titre
Proton reduction reaction catalyzed by homoleptic nickel bis-1,2-dithiolate complexes: Experimental and theoretical mechanistic investigations.
auteur
Athanasios Zarkadoulas, Martin J Field, Vincent Artero, Christiana A. Mitsopoulou
article
ChemCatChem, 2017, 9 (12), pp.2308-2317. ⟨10.1002/cctc.201601399⟩
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BibTex
titre
Providencia stuartii form biofilms and floating communities of cells that display high resistance to environmental insults.
auteur
Mariam El Khatib, Que-Tien Tran, Chady Nasrallah, Julie Lopes, Michel Bolla, Michel Vivaudou, Jean-Marie Pagès, Jacques-Philippe Colletier
article
PLoS ONE, 2017, 12 (3), pp.e0174213. ⟨10.1371/journal.pone.0174213⟩
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BibTex
titre
Simple and efficient system for photoconverting light-sensitive proteins in serial crystallography experiments
auteur
Giorgio Schirò, Joyce Woodhouse, Martin Weik, Ilme Schlichting, Robert L. Shoeman
article
Journal of Applied Crystallography, 2017, 50 (3), pp.932 - 939. ⟨10.1107/S1600576717006264⟩
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BibTex
titre
Slow conformational exchange and overall rocking motion in ubiquitin protein crystals
auteur
Vilius Kurauskas, Sergei N Izmailov, Olga N Rogacheva, Audrey Hessel, Isabel Ayala, Joyce Woodhouse, Anastasya A Shilova, Yi N Xue, Tairan N Yuwen, Nicolas Coquelle, Jacques-Philippe N Colletier, Nikolai N Skrynnikov, Paul Schanda
article
Nature Communications, 2017, ⟨10.1038/s41467-017-00165-8⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01571175/file/Kurauskas%20et%20al.%20-%202017%20-%20Nat.%20Commun%282%29.pdf BibTex
titre
Slow conformational exchange and overall rocking motion in ubiquitin protein crystals
auteur
Vilius Kurauskas, Izmailov Sergei A., Rogacheva Olga N., Audrey Hessel, Isabel Ayala, Woodhouse Joyce, Anastasya Shilova, Yi Xue, Tairan Yuwen, Nicolas Coquelle, Jacques-Philippe Colletier, Nikolai R. Skrynnikov, Paul Schanda
article
Nature Communications, 2017, ⟨10.1101/126813⟩
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BibTex
titre
The cytotoxic $Staphylococcus\ aureus$ PSM$\alpha$3 reveals a cross-$\alpha$ amyloid-like fibril
auteur
Einav Tayeb-Fligelman, Orly Tabachnikov, Asher Moshe, Orit Goldshmidt-Tran, Michael R Sawaya, Nicolas Coquelle, Jacques-Philippe Colletier, Meytal Landau
article
Science, 2017, 355 (6327), pp.831-833. ⟨10.1126/science.aaf4901⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-01487773/file/nihms.pdf BibTex

2016

titre
Aminoacetylation Reaction Catalyzed by Leucyl-tRNA Synthetase Operates via a Self-Assisted Mechanism Using a Conserved Residue and the Aminoacyl Substrate
auteur
Alexey Aleksandrov, Andrés Palencia, Stephen Cusack, Martin J Field
article
Journal of Physical Chemistry B, 2016, 120 (19), pp.4388-4398. ⟨10.1021/acs.jpcb.6b02387⟩
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BibTex
titre
Anharmonic activations in proteins and peptide model systems and their connection with supercooled water thermodynamics
auteur
Giorgio Schirò, A. Cupane
article
Il Nuovo Cimento C, 2016, 39 (3), pp.305-316. ⟨10.1393/ncc/i2016-16305-y⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-01648722/file/ncc11200%281%29.pdf BibTex
titre
Arginine 66 Controls Dark-State Formation in Green-to-Red Photoconvertible Fluorescent Proteins
auteur
Romain Berardozzi, Virgile Adam, Alexandre Martins, Dominique Bourgeois
article
Journal of the American Chemical Society, 2016, 138 (2), pp.558-565. ⟨10.1021/jacs.5b09923⟩
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BibTex
titre
Artificial Hydrogenases Based on Cobaloximes and Heme Oxygenase
auteur
Marine Bacchi, Elias Veinberg, Martin J Field, Jens Niklas, Toshitaka Matsui, David M. Tiede, Oleg G. Poluektov, Masao Ikeda-Saito, Marc Fontecave, Vincent Artero
article
ChemPlusChem, 2016, 81 (10 Spécial issue), pp.1083-1089. ⟨10.1002/cplu.201600218⟩
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titre
De novo phasing with X-ray laser reveals mosquito larvicide BinAB structure.
auteur
Jacques-Philippe Colletier, Michael R Sawaya, Mari Gingery, Jose A Rodriguez, Duilio Cascio, Aaron S Brewster, Tara Michels-Clark, Robert H Hice, Nicolas Coquelle, S Boutet, Gj William, M Messerschmidt, Dp Deponte, Rg Sierra, H Laksmono, Je Koglin, Ms Hunter, Hyun-Woo Park, Monarin Uervirojnangkoorn, Dennis K Bideshi, Axel T Brunger, Brian A Federici, Nicholas K Sauter, David S Eisenberg
article
Nature, 2016, 539 (7627), pp.43-47. ⟨10.1038/nature19825⟩
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titre
Development of an in-vivo active reversible butyrylcholinesterase inhibitor.
auteur
Urban Košak, Boris Brus, Damijan Knez, Roman Šink, Simon Žakelj, Jurij Trontelj, Anja Pišlar, Jasna Šlenc, Martina Gobec, Marko Živin, Larisa Tratnjek, Martina Perše, Kinga Sałat, Adrian Podkowa, Barbara Filipek, Florian Nachon, Xavier Brazzolotto, Anna Więckowska, Barbara Malawska, Jure Stojan, Irena Mlinarič Raščan, Janko Kos, Nicolas Coquelle, Jacques-Philippe Colletier, Stanislav Gobec
article
Scientific Reports, 2016, 6, pp.39495. ⟨10.1038/srep39495⟩
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Dynamics of human acetylcholinesterase bound to non-covalent and covalent inhibitors shedding light on changes to the water network structure
auteur
Judith Peters, Nicolas Martinez, Marie Trovaslet, Kévin Scannapieco, Michael Marek Koza, Patrick Masson, Florian Nachon
article
Physical Chemistry Chemical Physics, 2016, 18 (18), pp.12992-13001
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Experimental and Theoretical Insight into Electrocatalytic Hydrogen Evolution with Nickel Bis(aryldithiolene) Complexes as Catalysts.
auteur
Athanasios Zarkadoulas, Martin J Field, Constantina Papatriantafyllopoulou, Jennifer Fize, Vincent Artero, Christina A. Mitsopoulou
article
Inorganic Chemistry, 2016, 55 (2), pp.432-444. ⟨10.1021/acs.inorgchem.5b02000⟩
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High protein flexibility and reduced hydration water dynamics are key pressure adaptive strategies in prokaryotes
auteur
Nicolas Martinez, G. Michoud, A. Cario, J. Ollivier, Bruno Franzetti, M. Jebbar, P. Oger, Judith Peters
article
Scientific Reports, 2016, 6, ⟨10.1038/srep32816⟩
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https://hal.science/hal-01427793/file/srep32816.pdf BibTex
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Hybrid Potential Simulation of the Acylation of Enterococcus faecium l,d-Transpeptidase by Carbapenems.
auteur
Nicholus Bhattacharjee, Martin J Field, Jean-Pierre Simorre, Michel Arthur, Catherine M Bougault
article
Journal of Physical Chemistry B, 2016, 120 (21), pp.4767-81. ⟨10.1021/acs.jpcb.6b02836⟩
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Rational design of ultrastable and reversibly photoswitchable fluorescent proteins for super-resolution imaging of the bacterial periplasm
auteur
Mariam El Khatib, Alexandre Martins, Dominique Bourgeois, Jacques-Philippe Colletier, Virgile Adam
article
Scientific Reports, 2016, 6, ⟨10.1038/srep18459⟩
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titre
Serial femtosecond crystallography and ultrafast absorption spectroscopy of the photoswitchable fluorescent protein IrisFP
auteur
Jacques-Philippe Colletier, M. Sliwa, François-Xavier Gallat, M. Sugahara, Virginia Guillon, Giorgio Schirò, Nicolas Coquelle, Joyce Woodhouse, Laure Roux, Guillaume Gotthard, Antoine Royant, L. Martinez Uriarte, C. Ruckebusch, Y. Joti, Martin Byrdin, E. Mizohata, E. Nango, T. Tanaka, K. Tono, M. Yabashi, Virgile Adam, Marco Cammarata, I. Schlichting, Dominique Bourgeois, Martin Weik
article
Journal of Physical Chemistry Letters, 2016, 7 (5), pp.882 - 887. ⟨10.1021/acs.jpclett.5b02789⟩
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titre
Structural Determinants of Improved Fluorescence in a Family of Bacteriophytochrome-Based Infrared Fluorescent Proteins: Insights from Continuum Electrostatic Calculations and Molecular Dynamics Simulations
auteur
Mikolaj Feliks, Céline Lafaye, Xiaokun Shu, Antoine Royant, Martin J Field
article
Biochemistry, 2016, 55 (31), pp.4263 - 4274. ⟨10.1021/acs.biochem.6b00295⟩
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titre
Ultrafast Light-Induced Processes in DNA Photolyase and Its Substrate-Bound Complex
auteur
Klaus Brettel, Martin Byrdin, Marten H. Vos
article
Ultrafast Dynamics at the Nanoscale: Biomolecules and Supramolecular Assemblies, 2016, 9789814745338
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2015

titre
A novel expression cassette delivers efficient production of exclusively tetrameric human butyrylcholinesterase with improved pharmacokinetics for protection against organophosphate poisoning.
auteur
Stanislav Terekhov, Ivan Smirnov, Tatiana Bobik, Olga Shamborant, Marina Zenkova, Elena Chernolovskaya, Danil Gladkikh, Arkadii Murashev, Igor Dyachenko, Viktor Palikov, Yulia Palikova, Vera Knorre, Alexey Belogurov, Natalie Ponomarenko, G Michael Blackburn, Patrick Masson, Alexander Gabibov
article
Biochimie, 2015, 118, pp.51-9
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titre
Bacteriorhodopsin: Would the real structural intermediates please stand up?
auteur
Cecilia Wickstrand, Robert Dods, Antoine Royant, Richard Neutze
article
BBA - Biochimica et Biophysica Acta, 2015, 1850 (3), pp.536-553
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titre
Biomarkers of Exposure to Organophosphorus Poisons: A New Motif for Covalent Binding to Tyrosine in Proteins That Have No Active Site Serine
auteur
Patrick Masson, Oksana Lockridge, Lawrence M Schopfer
article
Handbook of Toxicology of Chemical Warfare Agents, Academic Press, pp.953-965, 2015
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titre
Catalytic Bioscavengers: The New Generation of Bioscavenger-Based Medical Countermeasures
auteur
Patrick Masson
article
Handbook of Toxicology of Chemical Warfare Agents, Academic Press, pp.1107-1123, 2015
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titre
Decoding vibrational states of Concanavalin A amyloid fibrils.
auteur
Federica Piccirilli, Giorgio Schirò, Valeria Vetri, Stefano Lupi, Andrea Perucchi, Valeria Militello
article
Biophysical Chemistry, 2015, 199, pp.17-24
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titre
Defective Guanine Nucleotide Exchange in the Elongation Factor-like 1 (EFL1) GTPase by Mutations in the Shwachman-Diamond Syndrome Protein.
auteur
Adrián García-Márquez, Abril Gijsbers, Eugenio de La Mora, Nuria Sánchez-Puig
article
Journal of Biological Chemistry, 2015, 290 (29), pp.17669-78
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titre
Dye-sensitized PS-b-P2VP-templated nickel oxide films for photoelectrochemical applications.
auteur
Julien Massin, Maximilian Bräutigam, Nicolas Kaeffer, Nicolas Queyriaux, Martin J Field, Félix H. Schacher, Jürgen Popp, Murielle Chavarot-Kerlidou, Benjamin Dietzek, Vincent Artero
article
Interface Focus, 2015, 5 (3), pp.article number 20140083. ⟨10.1098/rsfs.2014.0083⟩
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titre
Enzymatic Minimum Free Energy Path Calculations Using Swarms of Trajectories
auteur
Melchor Sanchez-Martinez, Martin J Field, Ramon Crehuet
article
Journal of Physical Chemistry B, 2015, 119 (3), ⟨10.1021/jp506593t⟩
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titre
Expression-enhanced fluorescent proteins based on enhanced green fluorescent protein for super-resolution microscopy
auteur
Sam Duwé, Elke de Zitter, Vincent Gielen, Benjamien Moeyaert, Wim Vandenberg, Tim Grotjohann, Koen Clays, Stefan Jakobs, Luc van Meervelt, Peter Dedecker
article
ACS Nano, 2015, 9 (10), pp.9528-9541. ⟨10.1021/acsnano.5b04129⟩
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titre
Force-induced chemical reactions on the metal centre in a single metalloprotein molecule.
auteur
Peng Zheng, Guilherme M Arantes, Martin J Field, Hongbin Li
article
Nature Communications, 2015, 6, pp.7569
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titre
Hydration water mobility is enhanced around tau amyloid fibers.
auteur
Yann Fichou, Giorgio Schirò, François-Xavier Gallat, Cédric Laguri, Martine Moulin, Jérôme Combet, Michaela Zamponi, Michael Härtlein, Catherine Picart, Estelle Mossou, Hugues Lortat-Jacob, Jacques-Philippe Colletier, Douglas J Tobias, Martin Weik
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2015, 112 (20), pp.6365-70
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titre
In crystallo optical spectroscopy (icOS) as a complementary tool on the macromolecular crystallography beamlines of the ESRF.
auteur
David von Stetten, Thierry Giraud, Philippe Carpentier, Franc Sever, Maxime Terrien, Fabien Dobias, Douglas H Juers, David Flot, Christoph Mueller-Dieckmann, Gordon A Leonard, Daniele de Sanctis, Antoine Royant
article
Acta crystallographica Section D : Structural biology [1993-..], 2015, 71 (Pt 1), pp.15-26
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titre
Influence of pressure and crowding on the sub-nanosecond dynamics of globular proteins.
auteur
M Erlkamp, Jérémie Marion, Nicolas Martinez, C Czeslik, Judith Peters, R Winter
article
Journal of Physical Chemistry B, 2015, 119 (14), pp.4842-8
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titre
La microscopie de fluorescence à super-résolution : un outil révolutionnaire pour imager le vivant à l'échelle nanométrique.
auteur
Virgile Adam, Dominique Bourgeois
article
Photoniques, 2015, 74, pp.34-39
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titre
Molecular adaptation and salt stress response of Halobacterium salinarum cells revealed by neutron spectroscopy.
auteur
Pierre Vauclare, Vincent Marty, Elisa Fabiani, Nicolas Martinez, Marion Jasnin, Frank Gabel, Judith Peters, Giuseppe Zaccai, Bruno Franzetti
article
Extremophiles, 2015, 19 (6), pp.1099-107
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titre
Molecular Dynamics Simulations of a Powder Model of the Intrinsically Disordered Protein Tau.
auteur
Yann Fichou, Matthias Heyden, Giuseppe Zaccai, Martin Weik, Douglas J Tobias
article
Journal of Physical Chemistry B, 2015, 119 (39), pp.12580-9
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titre
Multi-target directed ligands: Electrophysiological characterization of an anticholinesterase inhibitor coupled to an agonist of α7 nicotinic acetylcholine receptor
auteur
Rómulo Aráoz, Monika Bouet, Manuela Bartolini, Nicolas Coquelle, Jacques-Philippe Colletier, Denis Servent, Jordi Molgó, Ludovic Jean, Pierre-Yves Renard
article
Biochemical Pharmacology, 2015, 97 (4), pp.621. ⟨10.1016/j.bcp.2015.08.006⟩
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titre
Multiple proton relay routes in the reaction mechanism of RNAP II: assessing the effect of structural model.
auteur
Rui Zhang, Anirban Bhattacharjee, Martin J Field, Dennis R Salahub
article
Proteins - Structure, Function and Bioinformatics, 2015, 83 (2), pp.268-81
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titre
Observing heme doming in myoglobin with femtosecond X-ray absorption spectroscopya)
auteur
M. Levantino, H. T. Lemke, Giorgio Schirò, M. Glownia, A. Cupane, Marco Cammarata
article
Structural Dynamics, 2015, 2 (4), pp.041713. ⟨10.1063/1.4921907⟩
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https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01168333/file/Observing%20heme%20doming%20in%20myoglobin.pdf BibTex
titre
Observing the overall rocking motion of a protein in a crystal
auteur
Peixiang Ma, Yi Xue, Nicolas Coquelle, Jens D. Haller, Tairan Yuwen, Isabel Ayala, Oleg Mikhailovskii, Dieter Willbold, Jacques-Philippe Colletier, Nikolai R. Skrynnikov, Paul Schanda
article
Nature Communications, 2015, ⟨10.1038/ncomms9361⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01233308/file/ncomms9361.pdf BibTex
titre
Pressure-induced molten globule state of human acetylcholinesterase: structural and dynamical changes monitored by neutron scattering.
auteur
Jérémie Marion, Marie Trovaslet, Nicolas Martinez, Patrick Masson, R Schweins, Florian Nachon, M Trapp, Judith Peters
article
Physical Chemistry Chemical Physics, 2015, 17 (5), pp.3157-63
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titre
Radiation damage to macromolecules: kill or cure?
auteur
Elspeth F Garman, Martin Weik
article
Journal of Synchrotron Radiation, 2015, 22 (Pt 2), pp.195-200
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titre
Raster-scanning serial protein crystallography using micro- and nano-focused synchrotron beams
auteur
Nicolas Coquelle, Aaron S. Brewster, Ulrike Kapp, Anastasya Shilova, Britta Weinhausen, Manfred Burghammer, Jacques-Philippe Colletier
article
Acta crystallographica Section D : Structural biology [1993-..], 2015, 71, pp.1184-1196. ⟨10.1107/S1399004715004514⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01572740/file/Acta_Crystallographica_D_Vol_71_pp_1184.pdf BibTex
titre
Rational design of enhanced photoresistance in a photoswitchable fluorescent protein
auteur
Chenxi Duan, Martin Byrdin, Mariam El Kathib, Xavier Henry, Virgile Adam, Dominique Bourgeois
article
Methods and Applications in Fluorescence, 2015, 3 (1), pp.XXX. ⟨10.1088/2050-6120/3/1/014004⟩
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titre
Remodeling of the Z-Ring Nanostructure during the Streptococcus pneumoniae Cell Cycle Revealed by Photoactivated Localization Microscopy.
auteur
Maxime Jacq, Virgile Adam, Dominique Bourgeois, Christine Moriscot, Anne-Marie Di Guilmi, Thierry Vernet, Cécile Morlot
article
mBio, 2015, 6 (4), pp.e01108-15
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titre
SdsA polymorph isolation and improvement of their crystal quality using nonconventional crystallization techniques
auteur
Eugenio de La Mora, Edith Flores-Hernández, Jean Jakoncic, Vivian Stojanoff, Dritan Siliqi, Nuria Sánchez-Puig, Abel Moreno
article
Journal of Applied Crystallography, 2015, 48 (5), ⟨10.1107/S1600576715016556⟩
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titre
Structural characterization of the complex between hen egg-white lysozyme and Zr$^{IV}$ -Substituted Keggin polyoxometalate as artificial protease
auteur
Annelies Sap, Elke de Zitter, Luc Van meervelt, Tatjana N. Parac-Vogt
article
Chemistry - A European Journal, 2015, 21 (33), pp.11692-11695. ⟨10.1002/chem.201501998⟩
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titre
Structure-based development of nitroxoline derivatives as potential multifunctional anti-Alzheimer agents.
auteur
Damijan Knez, Boris Brus, Nicolas Coquelle, Izidor Sosič, Roman Šink, Xavier Brazzolotto, Janez Mravljak, Jacques-Philippe Colletier, Stanislav Gobec
article
Bioorganic and Medicinal Chemistry, 2015, 23 (15), pp.4442-52
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titre
Technical advances in molecular simulation since the 1980s
auteur
Martin J Field
article
Archives of Biochemistry and Biophysics, 2015, 582, ⟨10.1016/j.abb.2015.03.005⟩
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BibTex
titre
Toxicity of eosinophil MBP is repressed by intracellular crystallization and promoted by extracellular aggregation.
auteur
Alice Soragni, Shida Yousefi, Christina Stoeckle, Angela B Soriaga, Michael R Sawaya, Evelyne Kozlowski, Inès Schmid, Susanne Radonjic-Hoesli, Sebastien Boutet, Garth J Williams, Marc Messerschmidt, M Marvin Seibert, Duilio Cascio, Nadia A Zatsepin, Manfred Burghammer, Christian Riekel, Jacques-Philippe Colletier, Roland Riek, David S Eisenberg, Hans-Uwe Simon
article
Molecular Cell, 2015, 57 (6), pp.1011-21
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BibTex
titre
Translational diffusion of hydration water correlates with functional motions in folded and intrinsically disordered proteins.
auteur
Giorgio Schirò, Yann Fichou, Francois-Xavier Gallat, Kathleen Wood, Frank Gabel, Martine Moulin, Michael Härtlein, Matthias Heyden, Jacques-Philippe Colletier, Andrea Orecchini, Alessandro Paciaroni, Joachim Wuttke, Douglas J Tobias, Martin Weik
article
Nature Communications, 2015, 6, pp.6490
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BibTex
titre
Ultrafast myoglobin structural dynamics observed with an X-ray free-electron laser.
auteur
Matteo Levantino, Giorgio Schirò, Henrik Till Lemke, Grazia Cottone, James Michael Glownia, Diling Zhu, Mathieu Chollet, Hyotcherl Ihee, Antonio Cupane, Marco Cammarata
article
Nature Communications, 2015, 6 (1), pp.6772. ⟨10.1038/ncomms7772⟩
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https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01139805/file/ncomms7772.pdf BibTex
titre
Understanding Voltage Gating of Providencia stuartii Porins at Atomic Level.
auteur
Wanling Song, Harsha Bajaj, Chady Nasrallah, Hualiang Jiang, Mathias Winterhalter, Jacques-Philippe Colletier, Yechun Xu
article
PLoS Computational Biology, 2015, 11 (5), pp.e1004255
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titre
Varied Probability of Staying Collapsed/Extended at the Conformational Equilibrium of Monomeric Aβ40 and Aβ42.
auteur
Wanling Song, Yuanyuan Wang, Jacques-Philippe Colletier, Huaiyu Yang, Yechun Xu
article
Scientific Reports, 2015, 5, pp.11024
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2014

titre
300-Fold increase in production of the Zn2+-dependent dechlorinase TrzN in soluble form via apoenzyme stabilization.
auteur
Colin J Jackson, Christopher W Coppin, Paul D Carr, Alexey Aleksandrov, Matthew Wilding, Elena Sugrue, Joanna Ubels, Michael Paks, Janet Newman, Thomas S Peat, Robyn J Russell, Martin J Field, Martin Weik, John G Oakeshott, Colin Scott
article
Applied and Environmental Microbiology, 2014, 80 (13), pp.4003-11
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titre
An improved monomeric infrared fluorescent protein for neuronal and tumour brain imaging.
auteur
Dan Yu, William Clay Gustafson, Chun Han, Céline Lafaye, Marjolaine Noirclerc-Savoye, Woo-Ping Ge, Desiree A Thayer, Hai Huang, Thomas B Kornberg, Antoine Royant, Lily Yeh Jan, Yuh Nung Jan, William A Weiss, Xiaokun Shu
article
Nature Communications, 2014, 5, pp.3626
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titre
Characterization of the divalent metal binding site of bacterial polysaccharide deacetylase using crystallography and quantum chemical calculations
auteur
Md Munan Shaik, Nicholus Bhattacharjee, Anirban Bhattacharjee, Martin J Field, Giuseppe Zanotti
article
Proteins - Structure, Function and Bioinformatics, 2014, 82 (7), pp.1311 - 1318. ⟨10.1002/prot.24497⟩
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titre
Cobaloxime-based artificial hydrogenases.
auteur
Marine Bacchi, Gustav Berggren, Jens Niklas, Elias Veinberg, Michael W. Mara, Megan L. Shelby, Oleg G. Poluektov, Lin X. Chen, David M Tiede, Christine Cavazza, Martin J Field, Marc Fontecave, Vincent Artero
article
Inorganic Chemistry, 2014, 53 (15), pp.8071-8082. ⟨10.1021/ic501014c⟩
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https://hal.science/hal-01069152/file/Article%20Marine%2004072014.pdf BibTex
titre
Correlation of the dynamics of native human acetylcholinesterase and its inhibited huperzine A counterpart from sub-picoseconds to nanoseconds.
auteur
M Trapp, M Tehei, Marie Trovaslet, Florian Nachon, Nicolas Martinez, M M Koza, Martin Weik, Patrick Masson, Judith Peters
article
Journal of the Royal Society Interface, 2014, 11 (97), pp.20140372
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BibTex
titre
Deep sea microbes probed by incoherent neutron scattering under high hydrostatic pressure.
auteur
Judith Peters, Nicolas Martinez, Grégoire Michoud, Anaïs Cario, Bruno Franzetti, Philippe Oger, Mohamed Jebbar
article
Zeitschrift für Physikalische Chemie, 2014, 228, 10-12, pp.1121-1133. ⟨10.1515/zpch-2014-0547⟩
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titre
Design, synthesis and biological evaluation of novel tetrahydroacridine pyridine- aldoxime and -amidoxime hybrids as efficient uncharged reactivators of nerve agent-inhibited human acetylcholinesterase
auteur
Maria Kliachyna, Gianluca Santoni, Valentin Nussbaum, Julien Renou, Benoît Sanson, Jacques-Philippe Colletier, Mélanie Arboléas, Mélanie Loiodice, Martin Weik, Ludovic Jean, Pierre-Yves Renard, Florian Nachon, Rachid Baati
article
European Journal of Medicinal Chemistry, 2014, 78, pp.455-467. ⟨10.1016/j.ejmech.2014.03.044⟩
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BibTex
titre
Direct Evidence for a Peroxide Intermediate and a Reactive Enzyme-Substrate-Dioxygen Configuration in a Cofactor-free Oxidase
auteur
Soi Bui, David von Stetten, Pablo G. Jambrina, Thierry Prange, Nathalie Colloc'H, Daniele de Sanctis, Antoine Royant, Edina Rosta, Roberto A. Steiner
article
Angewandte Chemie International Edition, 2014, 53 (50), pp.13710-13714. ⟨10.1002/anie.201405485⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01572959/file/Angewandte_Chemie_Vol_53_pp_13710.pdf BibTex
titre
Discovery, biological evaluation, and crystal structure of a novel nanomolar selective butyrylcholinesterase inhibitor.
auteur
Boris Brus, Urban Košak, Samo Turk, Anja Pišlar, Nicolas Coquelle, Janko Kos, Jure Stojan, Jacques-Philippe Colletier, Stanislav Gobec
article
Journal of Medicinal Chemistry, 2014, 57 (19), pp.8167-79
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BibTex
titre
Electronic structure and hydration of tetramine cobalt hydride complexes.
auteur
Anirban Bhattacharjee, Alexander K. H. Weiss, Vincent Artero, Martin J Field, Thomas S. Hofer
article
Journal of Physical Chemistry B, 2014, 118 (20), pp.5551-5561. ⟨10.1021/jp502651s⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01069163/file/manuscript.pdf BibTex
titre
Excited state dynamics of the photoconvertible fluorescent protein Kaede revealed by ultrafast spectroscopy
auteur
E. Fron, M. Sliwa, Virgile Adam, J. Michiels, Susana Rocha, P. Dedecker, J. Hofkens, H. Mizuno
article
Photochemical & Photobiological Sciences , 2014, 13, pp.867 - 874. ⟨10.1039/c3pp50335f⟩
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BibTex
titre
Experimental Evidence for a Liquid-Liquid Crossover in Deeply Cooled Confined Water
auteur
Antonio Cupane, Margarita Fomina, Irina Piazza, Judith Peters, Giorgio Schirò
article
Physical Review Letters, 2014, 113 (21), pp.215701. ⟨10.1103/PhysRevLett.113.215701⟩
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https://hal.science/hal-01582604/file/PhysRevLett.113.215701.pdf BibTex
titre
Green-to-red photoconvertible Dronpa mutant for multimodal super-resolution fluorescence microscopy
auteur
Benjamien Moeyaert, Ngan Nguyen Bich, Elke de Zitter, Susana Rocha, Koen Clays, Hideaki Mizuno, Luc van Meervelt, Johan Hofkens, Peter Dedecker
article
ACS Nano, 2014, 8 (2), pp.1664-1673. ⟨10.1021/nn4060144⟩
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BibTex
titre
Hydrolysis of DFP and the nerve agent (S)-sarin by DFPase proceeds along two different reaction pathways: implications for engineering bioscavengers.
auteur
Troy Wymore, Martin J Field, Paul Langan, Jeremy C Smith, Jerry M Parks
article
Journal of Physical Chemistry B, 2014, 118 (17), pp.4479-89
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BibTex
titre
In cellulo Evaluation of Phototransformation Quantum Yields in Fluorescent Proteins Used As Markers for Single-Molecule Localization Microscopy
auteur
Sergiy Avilov, Romain Berardozzi, Mudalige S. Gunewardene, Virgile Adam, Samuel T. Hess, Dominique Bourgeois
article
PLoS ONE, 2014, 9 (6), pp.Volume 9 | Issue 6 | e98362. ⟨10.1371/journal.pone.0098362⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-01093348/file/Avilov_et_al_2014.pdf BibTex
titre
Influence of myelin proteins on the structure and dynamics of a model membrane with emphasis on the low temperature regime
auteur
W Knoll, Judith Peters, P Kursula, Y Gerelli, F Natali
article
Journal of Chemical Physics, 2014, 141 (20), pp. 205101. ⟨10.1063/1.4901738⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01582610/file/Knoll_JCP_2014.pdf BibTex
titre
Low-dose X-ray radiation induces structural alterations in proteins.
auteur
Valentin Borshchevskiy, Ekaterina Round, Ivan Erofeev, Martin Weik, Andrii Ishchenko, Ivan Yu. Gushchin, Alexey Mishin, Dieter Willbold, Georg Büldt, Valentin I. Gordeliy
article
Acta crystallographica Section D : Structural biology [1993-..], 2014, 70 (Pt 10), pp.2675-85
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BibTex
titre
Molecular mobility in Medicago truncatula seed during early stage of germination : Neutron Scattering and NMR investigations.
auteur
Xavier Falourd, Francesca Natali, Judith Peters, Loic Foucat
article
Chemical Physics, 2014, 428, pp.181-185
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BibTex
titre
mQfit, a new program for analyzing quasi-elastic neutron scattering data
auteur
Nicolas Martinez, Francesca Natali, Judith Peters
article
11th International Conference on Quasielastic Neutron Scattering, May 2014, Autrans, France. pp.3010, ⟨10.1051/epjconf/20158303010⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01582591/file/Martinez_epjconf-Qens-Wins2014_03010.pdf BibTex
titre
Nanoparticle surface-enhanced Raman scattering of bacteriorhodopsin stabilized by amphipol A8-35.
auteur
V Polovinkin, T Balandin, O Volkov, Ekaterina Round, V Borshchevskiy, P Utrobin, D von Stetten, Antoine Royant, D Willbold, G Arzumanyan, V Chupin, J-L Popot, Valentin I. Gordeliy
article
Journal of Membrane Biology, 2014, 247 (9-10), pp.971-80
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Phototransformable fluorescent proteins: Future challenges.
auteur
Virgile Adam, Romain Berardozzi, Martin Byrdin, Dominique Bourgeois
article
Current Opinion in Chemical Biology, 2014, 20, pp.92-102
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-01093360/file/COCHBI-D-14-00028R1_Paper.pdf BibTex
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Phototransformable fluorescent proteins: which one for which application?
auteur
Virgile Adam
article
Histochemistry and Cell Biology, 2014, 142 (1), pp.19-41
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Protein crystal structure obtained at 2.9 Å resolution from injecting bacterial cells into an X-ray free-electron laser beam.
auteur
Michael R Sawaya, Duilio Cascio, Mari Gingery, Jose Rodriguez, Lukasz Goldschmidt, Jacques-Philippe Colletier, Marc M Messerschmidt, Sébastien Boutet, Jason E Koglin, Garth J Williams, Aaron S Brewster, Karol Nass, Johan Hattne, Sabine Botha, R Bruce Doak, Robert L Shoeman, Daniel P Deponte, Hyun-Woo Park, Brian A Federici, Nicholas K Sauter, Ilme Schlichting, David S Eisenberg
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2014, 111 (35), pp.12769-74
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Proton dynamics in bacterial spores, a neutron scattering investigation
auteur
Alexandre Colas de La Noue, Judith Peters, Patrick Gervais, Nicolas Martinez, Jean-Marie Perrier-Cornet, Francesca Natali
article
11th International Conference on Quasielastic Neutron Scattering, May 2014, Autrans, France. pp.02003, ⟨10.1051/epjconf/20158302003⟩
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QM/MM through the 1990s: The First Twenty Years of Method Development and Applications
auteur
Meiyi Liu, Ying-Jie Wang, Yakun Chen, Martin J Field, Jiali Gao
article
Israel Journal of Chemistry, 2014, 54 (8-9), pp.1250-1263. ⟨10.1002/ijch.201400036⟩
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Reaction site-driven regioselective synthesis of AChE inhibitors
auteur
Emilia Oueis, Gianluca Santoni, Cyril Ronco, Olga A. Syzgantseva, Vincent Tognetti, Laurent Joubert, Anthony Romieu, Martin Weik, Ludovic Jean, Cyrille Sabot, Florian Nachon, Pierre-Yves Renard
article
Organic & Biomolecular Chemistry, 2014, 12 (1), pp.156-161. ⟨10.1039/C3OB42109K⟩
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Simple Link Atom Saccharide Hybrid (SLASH) Treatment for Glycosidic Bonds at the QM/MM Boundary
auteur
Crous Werner, Martin J Field, Kevin J Naidoo
article
Journal of Chemical Theory and Computation, 2014, 10 (4), pp.1727-1738
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Structural and dynamical properties of reconstituted myelin sheaths in the presence of myelin proteins MBP and P2 studied by neutron scattering.
auteur
Wiebke Knoll, Judith Peters, Petri Kursula, Yuri Gerelli, Jacques Ollivier, Bruno Demé, Mark Telling, Ewout Kemner, Francesca Natali
article
Soft Matter, 2014, 10 (3), pp.519-29
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Structural and electronic snapshots during the transition from a Cu(II) to Cu(I) metal center of a lytic polysaccharide monooxygenase by X-ray photoreduction.
auteur
Mikael Gudmundsson, Seonah Kim, Miao Wu, Takuya Ishida, Majid Hadadd Momeni, Gustav Vaaje-Kolstad, Daniel Lundberg, Antoine Royant, Jerry Ståhlberg, Vincent G H Eijsink, Gregg T Beckham, Mats Sandgren
article
Journal of Biological Chemistry, 2014, 289 (27), pp.18782-92
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Structural basis of photoswitching in fluorescent proteins.
auteur
Chenxi Duan, Virgile Adam, Martin Byrdin, Dominique Bourgeois
article
Methods in Molecular Biology, 2014, 1148, pp.177-202
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Structure-guided simulations illuminate the mechanism of ATP transport through VDAC1.
auteur
Om P Choudhary, Aviv Paz, Joshua L Adelman, Jacques-Philippe Colletier, Jeff Abramson, Michael Grabe
article
Nature Structural and Molecular Biology, 2014, 21 (7), pp.626-32
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Structures of a human blood group glycosyltransferase in complex with a photo-activatable UDP-Gal derivative reveal two different binding conformations.
auteur
René Jørgensen, Gaëlle Batot, Karin Mannerstedt, Anne Imberty, Christelle Breton, Ole Hindsgaul, Antoine Royant, Monica M Palcic
article
Acta crystallographica Section F : Structural biology communications [2014-..], 2014, 70 (Pt 8), pp.1015-21
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The boson peak of deeply cooled confined water reveals the existence of a low-temperature liquid-liquid crossover.
auteur
Antonio Cupane, Margarita Fomina, Giorgio Schirò
article
Journal of Chemical Physics, 2014, 141 (18), pp.18C510
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The Mechanism of Citryl-Coenzyme A Formation Catalyzed by Citrate Synthase
auteur
Alexey Aleksandrov, Elena Zvereva, Martin J Field
article
Journal of Physical Chemistry B, 2014, 118 (17), pp.4505-4513. ⟨10.1021/jp412346g⟩
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Theoretical modeling of low-energy electronic absorption bands in reduced cobaloximes.
auteur
Anirban Bhattacharjee, Murielle Chavarot-Kerlidou, Jillian L. Dempsey, Harry B. Gray, Etsuko Fujita, James T. Muckerman, Marc Fontecave, Vincent Artero, Guilherme M. Arantes, Martin J Field
article
ChemPhysChem, 2014, 15 (14), pp.2951-8. ⟨10.1002/cphc.201402398⟩
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Virus particle assembly into crystalline domains enabled by the coffee ring effect
auteur
Ronald Gebhardt, Jean-Marie Teulon, Jean-Luc Pellequer, Manfred Burghammer, Jacques-Philippe Colletier, Christian Riekel
article
Soft Matter, 2014, 10 (30), pp.5458-5462. ⟨10.1039/c4sm00414k⟩
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https://hal.science/hal-01572715/file/Soft_Matt_10_5458.pdf BibTex