Publications HAL du labo/EPI 576;1043235 de la collection IBS-EAM

2023

titre
DNA Polymerization in Icy Moon Abyssal Pressure Conditions
auteur
Lorenzo Carré, Ghislaine Henneke, Etienne Henry, Didier Flament, Éric Girard, Franzetti Bruno
article
Astrobiology, 2023, ⟨10.1089/ast.2021.0201⟩
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2022

titre
Behavior of B- and Z-DNA Crystals under High Hydrostatic Pressure
auteur
Thierry Prangé, Nathalie Colloc’h, Anne-Claire Dhaussy, Marc Lecouvey, Evelyne Migianu-Griffoni, Eric Girard
article
Crystals, 2022, 12, ⟨10.3390/cryst12060871⟩
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https://hal-normandie-univ.archives-ouvertes.fr/hal-03781069/file/2022_Prang%C3%A9_Crystals.pdf BibTex
titre
Binding stoichiometry and structural model of the HIV-1 Rev/Importin β complex
auteur
Didier Spittler, Rose-Laure Indorato, Elisabetta Boeri Erba, Elise Delaforge, Luca Signor, Simon Harris, Isabel Garcia-Saez, Andrés Palencia, Frank Gabel, Martin Blackledge, Marjolaine Noirclerc-Savoye, Carlo Petosa
article
Life Science Alliance, 2022, ⟨10.26508/lsa.202201431⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03453423/file/2022_LifeSciAlliance_Spittler.pdf BibTex
titre
Characterization of a small tRNA ‐binding protein that interacts with the archaeal proteasome complex
auteur
Gaëlle Hogrel, Laura Marino-Puertas, Sébastien Laurent, Ziad Ibrahim, Jacques Covès, Eric Girard, Frank Gabel, Daphna Fenel, Marie‐claire Daugeron, Béatrice Clouet-d'Orval, Tamara Basta, Didier Flament, Bruno Franzetti
article
Molecular Microbiology, 2022, Bacterial macromolecular machineries, 118 (1-2), pp.16-29. ⟨10.1111/mmi.14948⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-03701716/file/Hogrel%20et%20al.%20Mol%20Microbiol.pdf BibTex
titre
Comparative study of the effects of high hydrostatic pressure per se and high argon pressure on urate oxidase ligand stabilization
auteur
Thierry Prangé, Philippe Carpentier, Anne-Claire Dhaussy, Peter van Der Linden, Eric Girard, Nathalie Colloc’h
article
Acta crystallographica Section D : Structural biology [1993-..], 2022, 78 (2), pp.162-173. ⟨10.1107/S2059798321012134⟩
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https://hal-normandie-univ.archives-ouvertes.fr/hal-03542387/file/2022_Pangre_Acta_Cristallographica_D.pdf BibTex
titre
De novo determination of mosquitocidal Cry11Aa and Cry11Ba structures from naturally-occurring nanocrystals
auteur
Guillaume Tetreau, Michael R. Sawaya, Elke De Zitter, Elena A. Andreeva, Anne-Sophie Banneville, Natalie A. Schibrowsky, Nicolas Coquelle, Aaron S. Brewster, Marie Luise Grünbein, Gabriela Nass Kovacs, Mark S. Hunter, Marco Kloos, Raymond G. Sierra, Giorgio Schiro, Pei Qiao, Myriam Stricker, Iris D. Young, Ninon Zala, Sylvain Engilberge, Alexander Gorel, Luca Signor, Jean-Marie Teulon, Mario Hilpert, Lutz Foucar, Johan Bielecki, Richard Bean, Raphael De Wijn, Tokushi Sato, Dennis Bideshi, Romain Letrun, Alexander Batyuk, Irina Snigireva, Daphna Fenel, Robin Schubert, Ethan J. Canfield, Mario M. Alba, Frédéric Laporte, Henry Kirkwood, Laurence Després, Maria Bacia, Amandine Roux, Christian Chapelle, François Riobé, Olivier Maury, Wai-Li Ling, Sébastien Boutet, Adrian Mancuso, Irina Gutsche, Eric Girard, Thomas R. M. Barends, Jean-Luc Pellequer, Hyun-Woo Park, Arthur D. Laganowsky, Jose Rodriguez, Manfred Burghammer, Robert L. Shoeman, R. Bruce Doak, Martin Weik, Nicholas K. Sauter, Brian Federici, Duilio Cascio, Ilme Schlichting, Jacques-Philippe Colletier
article
Nature Communications, 2022, 13, ⟨10.1038/s41467-022-31746-x⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03805376/file/NatureComm-2022.pdf BibTex
titre
Equilibria between conformational states of the Ras oncogene protein revealed by high pressure crystallography
auteur
Eric Girard, Rui P Lopes, Michael Spoerner, Anne-Claire Dhaussy, Thierry Prangé, Hans Robert Kalbitzer, Nathalie Colloc’h
article
Chemical Science, 2022, 13 (7), pp.2001-2010. ⟨10.1039/D1SC05488K⟩
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https://hal-normandie-univ.archives-ouvertes.fr/hal-03542352/file/2022_Girard-Chem-Sci.pdf BibTex
titre
Medical contrast agents as promising tools for biomacromolecular SAXS experiments
auteur
Frank Gabel, Sylvain Engilberge, Emmanuelle Schmitt, Aurélien Thureau, Yves Mechulam, Javier Pérez, Eric Girard
article
Acta crystallographica Section D : Structural biology [1993-..], 2022, 78 (9), pp.1120-1130. ⟨10.1107/S2059798322007392⟩
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https://hal-polytechnique.archives-ouvertes.fr/hal-03789538/file/jc5050.pdf BibTex
titre
Protein conformational space at the edge of allostery: turning a nonallosteric malate dehydrogenase into an “allosterized” enzyme using evolution-guided punctual mutations
auteur
Antonio Iorio, Céline Brochier-Armanet, Caroline Mas, Fabio Sterpone, Dominique Madern
article
Molecular Biology and Evolution, 2022, 39 (9), pp.msac186. ⟨10.1093/molbev/msac186⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03781769/file/iorio%20et%20al.%2C%202022.pdf BibTex
titre
Relevance of Earth-Bound Extremophiles in the Search for Extraterrestrial Life.
auteur
Lorenzo Carré, Giuseppe Zaccai, Xavier Delfosse, Eric Girard, Bruno Franzetti
article
Astrobiology, 2022, 22 (3), pp.322-367. ⟨10.1089/ast.2021.0033⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03819312/file/Carr%C3%A9%20et%20al.%20Astrobiology.pdf BibTex

2021

titre
Biochemical, structural and dynamical studies reveal strong differences in the thermal-dependent allosteric behavior of two extremophilic lactate dehydrogenases
auteur
Antonio Iorio, Jennifer Roche, Sylvain Engilberge, Nicolas Coquelle, Eric Girard, Fabio Sterpone, Dominique Madern
article
Journal of Structural Biology, 2021, 213 (3), pp.107769. ⟨10.1016/j.jsb.2021.107769⟩
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titre
Experimental study of proteome halophilicity using nanoDSF: a proof of concept
auteur
Lorenzo Carre, Éric Girard, Bruno Franzetti
article
Extremophiles, In press
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03400447/file/EXT-21-Jun-0068.R1_Proof_hi.pdf BibTex
titre
Influence of divalent cations in the protein crystallization process assisted by lanthanide-based additives
auteur
Amandine Roux, Romain Talon, Zaynab Alsalman, Sylvain Engilberge, Anthony d' Aléo, Sebastiano Di Pietro, Adeline Robin, Alessio Bartocci, Guillaume Pilet, Elise Dumont, Tristan Wagner, Seigo Shima, François Riobé, Eric Girard, Olivier Maury
article
Inorganic Chemistry, 2021, 60 (20), pp.15208-15214. ⟨10.1021/acs.inorgchem.1c01635⟩
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https://hal.science/hal-03407486/file/Manuscript%20%281%29.pdf BibTex
titre
Phylogenetics and biochemistry elucidate the evolutionary link between l-malate and l-lactate dehydrogenases and disclose an intermediate group of sequences with mix functional properties
auteur
Céline Brochier-Armanet, Dominique Madern
article
Biochimie, 2021, 191, pp.140-153. ⟨10.1016/j.biochi.2021.08.004⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-03358405/file/Armanet%20et%20al.%20Biochimie.pdf BibTex
titre
Relevance of earth-bound extremophiles in the search for extra-terrestrial life
auteur
Lorenzo Carré, Giuseppe Zaccai, Xavier Delfosse, Éric Girard, Bruno Franzetti
article
Astrobiology, In press
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03400442/file/AST-2021-0033_Proof_hi.pdf BibTex
titre
Resurrection of Ancestral Malate Dehydrogenases Reveals the Evolutionary History of Halobacterial Proteins : Deciphering Gene Trajectories and Changes in Biochemical Properties
auteur
Samuel Blanquart, Mathieu Groussin, Aline Le Roy, Gergely J Szöllosi, Eric Girard, Bruno Franzetti, Manolo Gouy, Dominique Madern
article
Molecular Biology and Evolution, 2021, pp.1-44. ⟨10.1093/molbev/msab146⟩
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https://hal-cnrs.archives-ouvertes.fr/hal-03231689/file/msab146.pdf BibTex
titre
Structure and dynamics of the quaternary hunchback mRNA translation repression complex
auteur
Jakub Macošek, Bernd Simon, Johanna-Barbara Linse, Pravin Kumar Ankush Jagtap, Sophie L. Winter, Jaelle Foot, Karine Lapouge, Kathryn Perez, Mandy Rettel, Miloš T. Ivanović, Pawel Masiewicz, Brice Murciano, Mikhail Savitski, Inga Loedige, Jochen S. Hub, Frank Gabel, Janosch Hennig
article
Nucleic Acids Research, 2021, 49 (15), pp.8866-8885. ⟨10.1093/nar/gkab635⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03335234/file/mac1.pdf BibTex

2020

titre
Current approaches for integrating solution NMR spectroscopy and small-angle scattering to study the structure and dynamics of biomolecular complexes
auteur
Florent Delhommel, Frank Gabel, Michael Sattler
article
Journal of Molecular Biology, 2020, 432 (9), pp.2890-2912. ⟨10.1016/j.jmb.2020.03.014⟩
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titre
Krypton-derivatization highlights O 2 -channeling in a four-electron reducing oxidase
auteur
Sylvain Engilberge, Tristan Wagner, Philippe Carpentier, Eric Girard, Seigo Shima
article
Chemical Communications, 2020, 56 (74), pp.10863-10866. ⟨10.1039/d0cc04557h⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-02947404/file/Engilberge%20et%20al.%20Chem%20Comm.pdf BibTex
titre
Molecular dynamics in cells: A neutron view
auteur
Giuseppe Zaccai
article
Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects, 2020, 1864, pp.129475 -. ⟨10.1016/j.bbagen.2019.129475⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03488738/file/S0304416519302612.pdf BibTex
titre
Monitoring the Production of High Diffraction-Quality Crystals of Two Enzymes in Real Time Using In Situ Dynamic Light Scattering
auteur
Raphaël de Wijn, Kévin Rollet, Sylvain Engilberge, Alastair G Mcewen, Oliver Hennig, Heike Betat, Mario Mörl, François Riobé, Olivier Maury, Eric Girard, Philippe Bénas, Bernard Lorber, Claude Sauter
article
Crystals, 2020, 10 (2), pp.65. ⟨10.3390/cryst10020065⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-02464277/file/crystals-10-00065-v3.pdf BibTex
titre
Observing protein degradation by the PAN-20S proteasome by time-resolved neutron scattering
auteur
Emilie Mahieu, Jacques Covès, Georg Krüger, Anne Martel, Martine Moulin, Nico Carl, Michael Härtlein, Teresa Carlomagno, Bruno Franzetti, Frank Gabel
article
Biophysical Journal, 2020, 119 (2), pp.375-388. ⟨10.1016/j.bpj.2020.06.015⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-03456352/file/S0006349520304896.pdf BibTex
titre
Protein thermal stability
auteur
Fabio Sterpone, Dominique Madern, Stepan Timr
article
Progress in Molecular Biology and Translational Science, 2020
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BibTex
titre
Remote oxidative modifications induced by oxygen free radicals modify T/R allosteric equilibrium of a hyperthermophilic lactate dehydrogenase
auteur
Frédéric Halgand, Chantal Houée-Lévin, Martin Weik, Dominique Madern
article
Journal of Structural Biology, 2020, 210 (2), pp.107478. ⟨10.1016/j.jsb.2020.107478⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03011827/file/1-s2.0-S1047847720300411-main.pdf BibTex
titre
Small-Angle Neutron Scattering of RNA–Protein Complexes
auteur
Audrone Lapinaite, Teresa Carlomagno, Frank Gabel
article
Methods in Molecular Biology, 2020, 2113, pp.165-188. ⟨10.1007/978-1-0716-0278-2_13⟩
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titre
Surviving salt fluctuations: stress and recovery in Halobacterium salinarum, an extreme halophilic Archaeon
auteur
Pierre Vauclare, F. Natali, Jean-Philippe Kleman, Giuseppe Zaccai, Bruno Franzetti
article
Scientific Reports, 2020, 10 (1), pp.3298. ⟨10.1038/s41598-020-59681-1⟩
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https://hal.science/hal-02519472/file/Vauclare%20et%20al.%20Scientific%20Reports.pdf BibTex
titre
Temperature Unmasks Allosteric Propensity in a Thermophilic Malate Dehydrogenase via Dewetting and Collapse
auteur
Marina Katava, Massimo Marchi, Dominique D Madern, Michael Sztucki, Marco Maccarini, Fabio Sterpone
article
Journal of Physical Chemistry B, 2020, 124 (6), pp.1001-1008. ⟨10.1021/acs.jpcb.9b10776⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03008190/file/paper_sub.pdf BibTex
titre
The C‐terminal domain of Corynebacterium glutamicum mycoloyltransferase A is composed of five repeated motifs involved in cell wall binding and stability
auteur
Christiane Dietrich, Inès Li de La Sierra-Gallay, Muriel Masi, Eric Girard, Nathalie Dautin, Florence Constantinesco-Becker, Maryelle Tropis, Mamadou Daffé, Herman van Tilbeurgh, Nicolas Bayan
article
Molecular Microbiology, 2020, 114 (1), ⟨10.1111/mmi.14492⟩
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titre
The guide sRNA sequence determines the activity level of box C/D RNPs
auteur
Andrea Graziadei, Frank Gabel, John Kirkpatrick, Teresa Carlomagno
article
eLife, 2020, 9, ⟨10.7554/eLife.50027⟩
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BibTex
titre
Tracking Crystallophore Nucleating Properties: Setting Up a Database for Statistical Analysis
auteur
Tao Jiang, Amandine Roux, Sylvain Engilberge, Zaynab Alsalman, Sebastiano Di Pietro, Bruno Franzetti, François Riobé, Olivier Maury, Eric Girard
article
Crystal Growth & Design, 2020, 20 (8), pp.5322-5329. ⟨10.1021/acs.cgd.0c00556⟩
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2019

titre
A simple and versatile microfluidic device for efficient biomacromolecule crystallization and structural analysis by serial crystallography
auteur
Raphaël de Wijn, Oliver Hennig, Jennifer Roche, Sylvain Engilberge, Kevin Rollet, Pablo Fernandez-Millan, Karl Brillet, Heike Betat, Mario Mörl, Alain Roussel, Eric Girard, Christoph Mueller-Dieckmann, Gavin Fox, Vincent Olieric, José Gavira, Bernard Lorber, Claude Sauter
article
International Union of Crystallography journal, 2019, 6 (3), pp.454-464. ⟨10.1107/S2052252519003622⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02117153/file/lz5024.pdf BibTex
titre
Histone chaperone exploits intrinsic disorder to switch acetylation specificity
auteur
Nataliya Danilenko, Lukas Lercher, John Kirkpatrick, Frank Gabel, Luca Codutti, Teresa Carlomagno
article
Nature Communications, 2019, 10 (1), pp.3435. ⟨10.1038/s41467-019-11410-7⟩
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titre
Medical contrast media as possible tools for SAXS contrast variation
auteur
Frank Gabel, Sylvain Engilberge, Javier Pérez, Eric Girard
article
International Union of Crystallography journal, 2019, 6 (4), ⟨10.1107/S2052252519005943⟩
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titre
Molecular recognition of ubiquitin and Lys63-linked diubiquitin by STAM2 UIM-SH3 dual domain: the effect of its linker length and flexibility
auteur
Minh-Ha Nguyen, Marie Martin, Henry Kim, Frank Gabel, Olivier Walker, Maggy Hologne
article
Scientific Reports, 2019, 9 (1), ⟨10.1038/s41598-019-51182-0⟩
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titre
Pressure-induced activation of latent Dihydroorotase from Aquifex aeolicus as revealed by high pressure protein crystallography
auteur
Thierry Prangé, Eric Girard, Roger Fourme, Anne-Claire Dhaussy, Brian Edwards, Asmita Vaishnav, Chandni Patel, Guy Evans, Guy Hervé, David Evans
article
FEBS Journal, 2019, 286 (6), pp.1204-1213. ⟨10.1111/febs.14758⟩
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BibTex
titre
Protein crystal structure determination with the crystallophore, a nucleating and phasing agent
auteur
Sylvain Engilberge, Tristan Wagner, Gianluca Santoni, Cécile Breyton, Seigo Shima, Bruno Franzetti, François Riobé, Olivier Maury, Eric Girard
article
Journal of Applied Crystallography, 2019, 52 (4), ⟨10.1107/S1600576719006381⟩
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BibTex
titre
RNA Back and Forth: Looking through Ribozyme and Viroid Motifs
auteur
Marie-Christine Maurel, Fabrice Leclerc, Jacques Vergne, Giuseppe Zaccai
article
Viruses, 2019, 11 (3), pp.283. ⟨10.3390/v11030283⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02104510/file/viruses-11-00283.pdf BibTex
titre
The archaeal LDH-like malate dehydrogenase from Ignicoccus islandicus displays dual substrate recognition, hidden allostery and a non-canonical tetrameric oligomeric organization
auteur
Jennifer Roche, Eric Girard, Caroline Mas, Dominique Madern
article
Journal of Structural Biology, 2019, ⟨10.1016/j.jsb.2019.07.006⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02273509/file/S1047847719301534.pdf BibTex

2018

titre
Archaeal acetoacetyl-CoA thiolase/HMG-CoA synthase complex channels the intermediate via a fused CoA-binding site
auteur
Bastian Vögeli, Sylvain Engilberge, Eric Girard, François Riobé, Olivier Maury, Tobias Erb, Seigo Shima, Tristan Wagner
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2018, 115 (13), pp.3380-3385. ⟨10.1073/pnas.1718649115⟩
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BibTex
titre
Biological small-angle neutron scattering: recent results and development
auteur
Emilie Mahieu, Frank Gabel
article
Acta crystallographica Section D : Structural biology [1993-..], 2018, 74 (8), pp.715-726. ⟨10.1107/S2059798318005016⟩
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BibTex
titre
Characterization of a Glycyl-Specific TET Aminopeptidase Complex from Pyrococcus horikoshii
auteur
Hind Basbous, Alexandre Appolaire, Eric Girard, Bruno Franzetti
article
Journal of Bacteriology, 2018, 200 (17), ⟨10.1128/JB.00059-18⟩
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BibTex
titre
Merging In-Solution X-ray and Neutron Scattering Data Allows Fine Structural Analysis of Membrane–Protein Detergent Complexes
auteur
Gaëtan Dias Mirandela, Giulia Tamburrino, Miloš Ivanović, Felix Strnad, Olwyn Byron, Tim Rasmussen, Paul Hoskisson, Jochen Hub, Ulrich Zachariae, Frank Gabel, Arnaud Javelle
article
Journal of Physical Chemistry Letters, 2018, 9 (14), pp.3910-3914. ⟨10.1021/acs.jpclett.8b01598⟩
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BibTex
titre
Neutron scattering in the biological sciences: progress and prospects
auteur
Rana Ashkar, Hassina Bilheux, Heliosa Bordallo, Robert Briber, David Callaway, Xiaolin Cheng, Xiang Qiang Chu, Joseph Curtis, Mark Dadmun, Paul Fenimore, David Fushman, Frank Gabel, Kushol Gupta, Frederick Herberle, Frank Heinrich, Liang Hong, John Katsaras, Zvi Kelman, Eugenia Kharlampieva, Flora Kneller, Andrey Kovalevsky, Susan Krueger, Paul Langan, Raquel Lieberman, Yun Liu, Mathias Losche, Edward Lyman, Yimin Mao, John Marino, Carla Mattos, Flora Meilleur, Peter Moody, Jonathan Nickels, William O'Dell, Hugh O'Neill, Ursula Perez-Salas, Judith Peters, Loukas Petridis, Alexei Sokolov, Christopher Stanley, Norman Wagner, Michael Weinrich, Kevin Weiss, Troy Wymore, Yang Zhang, Jeremy Smith, Xiang-Qiang Chu, Gérald Kneller, Peter Peters
article
Acta crystallographica Section D : Structural biology [1993-..], 2018, 74 (12), pp.1129-1168. ⟨10.1107/S2059798318017503⟩
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BibTex
titre
Solution scattering approaches to dynamical ordering in biomolecular systems
auteur
Pau Bernadó, Nobutaka Shimizu, Giuseppe Zaccai, Hironari Kamikubo, Masaaki Sugiyama
article
Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects, 2018, 1862 (2), pp.253 - 274. ⟨10.1016/j.bbagen.2017.10.015⟩
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BibTex
titre
Structural and functional studies of the metalloregulator Fur identify a promoter-binding mechanism and its role in Francisella tularensis virulence
auteur
J. Pérard, S. Nader, M. Levert, L Arnaud, P. Carpentier, C. Siebert, F. Blanquet, C. Cavazza, P. Renesto, D. Schneider, M. Maurin, Jacques Covès, S. Crouzy, Isabelle Michaud-Soret
article
Communications Biology, 2018, 1 (1), ⟨10.1038/s42003-018-0095-6⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02975690/file/Michaud-SoretIsabelle_Perard_2018.pdf BibTex
titre
Structural basis for terminal loop recognition and stimulation of pri-miRNA-18a processing by hnRNP A1
auteur
Hamed Kooshapur, Nila Roy Choudhury, Bernd Simon, Max Mühlbauer, Alexander Jussupow, Noemi Fernandez, Alisha Jones, Andre Dallmann, Frank Gabel, Carlo Camilloni, Gracjan Michlewski, Javier Caceres, Michael Sattler
article
Nature Communications, 2018, 9, pp.2479. ⟨10.1038/s41467-018-04871-9⟩
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BibTex
titre
The multicatalytic compartment of propionyl-CoA synthase sequesters a toxic metabolite
auteur
Iria Bernhardsgrütter, Bastian Vögeli, Tristan Wagner, Dominik Peter, Niña Socorro Cortina, Jörg Kahnt, Gert Bange, Sylvain Engilberge, Eric Girard, François Riobé, Olivier Maury, Seigo Shima, Jan Zarzycki, Tobias Erb
article
Nature Chemical Biology, 2018, 14, pp.1127-1132. ⟨10.1038/s41589-018-0153-x⟩
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titre
The Rhubarb Connection and Other Revelations: The Everyday World of Metal Ions
auteur
Lars Öhrström, Jacques Covès
article
Royal Society of Chemistry, In press
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BibTex
titre
Unveiling the Binding Modes of the Crystallophore, a Terbium-based Nucleating and Phasing Molecular Agent for Protein Crystallography
auteur
Sylvain Engilberge, François Riobé, Tristan Wagner, Sebastiano Di Pietro, Cécile Breyton, Bruno Franzetti, Seigo Shima, Eric Girard, Elise Dumont, Olivier Maury
article
Chemistry - A European Journal, 2018, 24 (39), pp.9739-9746. ⟨10.1002/chem.201802172⟩
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2017

titre
2017 publication guidelines for structural modelling of small-angle scattering data from biomolecules in solution: an update
auteur
Jill Trewhella, Anthony P. Duff, Dominique D. Durand, Frank Gabel, J. Mitchell Guss, Wayne A. Hendrickson, Greg L. Hura, David A. Jacques, Nigel M. Kirby, Ann H. Kwan, Javier Perez, Lois Pollack, Timothy M. Ryan, Andrej Sali, Dina Schneidman-Duhovny, Torsten Schwede, Dmitri I. Svergun, Masaaki Sugiyama, John Tainer, Patrice Vachette, John Westbrook, Andrew E. Whitten
article
Acta crystallographica Section D : Structural biology [1993-..], 2017, 73 (9), pp.710 - 728. ⟨10.1107/S2059798317011597⟩
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titre
A central cavity within the holo-translocon suggests a mechanism for membrane protein insertion
auteur
Mathieu Botte, Nathan R. Zaccai, Jelger Lycklama À. Nijeholt, Rémy Martin, Kèvin Knoops, Gabor Papai, Juan Zou, Aurélien Deniaud, Manikandan Karuppasamy, Qiyang Jiang, Abhishek Singha Roy, Klaus Schulten, Patrick Schultz, Juri Rappsilber, Giuseppe Zaccai, Imre Berger, Ian Collinson, Christiane Schaffitzel
article
Scientific Reports, 2017, 6 (38399), 13 p. ⟨10.1038/srep38399⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01597707/file/Scientific_Reports_6_p38399.pdf BibTex
titre
Bacteriophage T5 tail tube structure suggests a trigger mechanism for Siphoviridae DNA ejection
auteur
Charles-Adrien Arnaud, Grégory Effantin, Corinne Vivès, Sylvain Engilberge, Maria Bacia-Verloop, Pascale Boulanger, Eric Girard, Guy Schoehn, Cécile Breyton
article
Nature Communications, 2017, 8 (1), pp.1953. ⟨10.1038/s41467-017-02049-3⟩
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titre
Cross-Talk Between Nickel and Other Metals in Microbial Systems
auteur
Dietrich H. Nies, Jacques Covès, R. Gary Sawers
article
Deborah Zamble; Magdalena Rowińska-Żyrek; Henryk Kozlowski. Biological Chemistry of Nickel, Chapter 15, Royal Society of Chemistry, pp.306-338, 2017, 978-1-78262-498-1. ⟨10.1039/9781788010580-00306⟩
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titre
Crystallophore: a versatile lanthanide complex for protein crystallography combining nucleating effects, phasing properties, and luminescence
auteur
Sylvain Engilberge, François Riobé, Sebastiano Di Pietro, Louise Lassalle, Nicolas Coquelle, Charles-Adrien Arnaud, Delphine Pitrat, Jean-Christophe Mulatier, Dominique Madern, Cécile Breyton, Olivier Maury, Eric Girard
article
Chemical Science, 2017, 8 (9), pp.5909 - 5917. ⟨10.1039/C7SC00758B⟩
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titre
Determinants of neuroglobin plasticity highlighted by joint coarse-grained simulations and high pressure crystallography.
auteur
Nathalie Colloc’h, Sophie Sacquin-Mora, Giovanna Avella, Anne-Claire Dhaussy, Thierry Prangé, Beatrice Vallone, Eric Girard
article
Scientific Reports, 2017, 7 (1), pp.1858. ⟨10.1038/s41598-017-02097-1⟩
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titre
Fluctuating RNA
auteur
Giuseppe Zaccai, Marie Christine Maurel, Ada Yonath
article
Sciences de la vie, sciences de l’information, ISTE Editions, pp.15-20, 2017, 978-1-78405-287-4
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titre
Methods in Molecular Biophysics : Structure, Dynamics, Function for Biology and Medicine - Second Edition
auteur
Zaccai Nathan R., Serdyuk Igor N., Giuseppe Zaccai
article
Cambridge University Pres, 2017, 9781107056374
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titre
Methods in Molecular Biophysics: Structure, Dynamics, Function for Biology and Medicine - 2nd Edition
auteur
Zaccai Nathan R., Serdyuk Igor N., Giuseppe Zaccai
article
Cambridge University Press, pp.702, 2017, 978-1107056374
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titre
Mobility of a Mononucleotide within a Lipid Matrix: A Neutron Scattering Study
auteur
Loreto Misuraca, Francesca Natali, Laura da Silva, Judith Peters, Bruno Demé, Jacques Ollivier, Tilo Seydel, Valerie Laux-Lesourd, Michael Haertlein, Giuseppe Zaccai, David Deamer, Marie Christine Maurel
article
Life, 2017, Origin of Cellular Life, 7 (1), pp.2. ⟨10.3390/life7010002⟩
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https://hal.science/hal-01582551/file/life-07-00002.pdf BibTex
titre
Molecular forces and motion in the transmission of information in biology
auteur
Giuseppe Zaccai
article
ISTE Editions. Sciences de la vie, sciences de l’information, , pp.34-40, 2017, 978-1-78405-287-4
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titre
Neutrons describe ectoine effects on water H-bonding and hydration around a soluble protein and a cell membrane
auteur
Giuseppe Zaccai, Irina Bagyan, Jérôme Combet, Gabriel J. Cuello, Bruno Demé, Yann Fichou, François-Xavier Gallat, Victor M. Galvan Josa, Susanne von Gronau, Michael Haertlein, Anne Martel, Martin Moulin, Markus Neumann, Martin Weik, Dieter Oesterhelt
article
Scientific Reports, 2017, 6 (31434), ⟨10.1038/srep31434⟩
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titre
On the quest for the elusive mechanism of action of daptomycin: Binding, fusion, and oligomerization
auteur
Jin Zhang, Walter R.P. Scott, Frank Gabel, Miao Wu, Ruqaiba Desmond, Junghwan Bae, Giuseppe Zaccai, W. Russ Algar, Suzana K. Straus
article
Biochimica et Biophysica Acta Proteins and Proteomics, 2017, ⟨10.1016/j.bbapap.2017.07.020⟩
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titre
Salt Survivors
auteur
Giuseppe Zaccai
article
The biologist, 2017
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titre
Segmental, domain-selective perdeuteration and small angle neutron scattering for structural analysis of multi-domain proteins.
auteur
Miriam Sonntag, Pravin Jagtap, Bernd Simon, Marie-Sousai Appavou, Arie Geerlof, Ralf Stehle, Frank Gabel, Janosch Hennig, Michael Sattler
article
Angewandte Chemie International Edition, 2017, ⟨10.1002/anie.201702904⟩
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titre
Structural Insight into Ubiquitin-Like Protein Recognition and Oligomeric States of JAMM/MPN(+) Proteases.
auteur
Shiyun Cao, Sylvain Engilberge, Eric Girard, Frank Gabel, Bruno Franzetti, Julie A Maupin-Furlow
article
Structure (London, England : 1993), 2017, ⟨10.1016/j.str.2017.04.002⟩
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titre
The Summer of 1954 and Paths to the Institut Laue-Langevin
auteur
David L Worcester, Antonio Faraone, Giuseppe Zaccai
article
Neutron News, 2017, 28 (3), pp.15-19. ⟨10.1080/10448632.2017.1342480⟩
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titre
Thermal activation of 'allosteric- like' large-scale motions in a eukaryotic Lactate Dehydrogenase
auteur
Marina Katava, Marco Maccarini, Guillaume Villain, Alessandro Paciaroni, Michael Sztucki, Oxana Ivanova, Dominique Madern, Fabio Sterpone
article
Scientific Reports, 2017, 7, pp.41092. ⟨10.1038/srep41092⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01473622/file/srep41092%20%283%29.pdf BibTex
titre
Time-resolved neutron scattering provides new insight into protein substrate processing by a AAA+ unfoldase.
auteur
Ziad Ibrahim, Anne Martel, Martine Moulin, Henry S Kim, Michael Härtlein, Bruno Franzetti, Frank Gabel
article
Scientific Reports, 2017, 7, pp.40948. ⟨10.1038/srep40948⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-01465686/file/Scientific_Reports_7_p40948.pdf BibTex

2016

titre
ARHGEF17 is an essential spindle assembly checkpoint factor that targets Mps1 to kinetochores.
auteur
Mayumi Isokane, Thomas Walter, Robert Mahen, Bianca Nijmeijer, Jean-Karim Hériché, Kota Miura, Stefano Maffini, Miroslav Penchev Ivanov, Tomoya S Kitajima, Jan Peters, Jan Ellenberg
article
Journal of Cell Biology, 2016, 212 (6), pp.647-59. ⟨10.1083/jcb.201408089⟩
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titre
Erratum: New insights into the mechanism of substrates trafficking in Glyoxylate/Hydroxypyruvate reductases
auteur
Louise Lassalle, Sylvain Engilberge, Dominique Madern, Pierre Vauclare, Bruno Franzetti, Eric Girard
article
Scientific Reports, 2016, 6 (1), ⟨10.1038/srep23879⟩
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titre
From Peptide Aptamers to Inhibitors of FUR, Bacterial Transcriptional Regulator of Iron Homeostasis and Virulence
auteur
Sophie Mathieu, Cheickna Cissé, Sylvie Vitale, Aynur Ahmadova, Mélissa Degardin, Julien Pérard, Pierre Colas, Roger Miras, Didier Boturyn, Jacques Covès, Serge Crouzy, Isabelle Michaud-Soret
article
ACS Chemical Biology, 2016, 11 (9), pp.2519-2528. ⟨10.1021/acschembio.6b00360⟩
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titre
H2O : première molécule de la Vie
auteur
Giuseppe Zaccai
article
Gilbert Belaubre; Ernesto Di Mauro; Victor Mastrangelo; Pierre Nabet; Jean Schmets. FORMATION DES SYSTÈMES STELLAIRES ET PLANÉTAIRES CONDITIONS D'APPARITION DE LA VIE, EDP-Sciences, pp.237-247, 2016, 978-2-7598-1965-2
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titre
High protein flexibility and reduced hydration water dynamics are key pressure adaptive strategies in prokaryotes
auteur
Nicolas Martinez, G. Michoud, A. Cario, J. Ollivier, Bruno Franzetti, M. Jebbar, P. Oger, Judith Peters
article
Scientific Reports, 2016, 6, ⟨10.1038/srep32816⟩
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https://hal.science/hal-01427793/file/srep32816.pdf BibTex
titre
ILL Pays Tribute to Bernard Jacrot, the First French Director of the Institute
auteur
Giuseppe Zaccai
article
Neutron News, 2016, 27 (3), pp.11-13
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titre
New insights into the mechanism of substrates trafficking in Glyoxylate/Hydroxypyruvate reductases
auteur
Louise Lassalle, Sylvain Engilberge, Dominique Madern, Pierre Vauclare, Bruno Franzetti, Eric Girard
article
Scientific Reports, 2016, 6, ⟨10.1038/srep20629⟩
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titre
SAXS/SANS on Supercharged Proteins Reveals Residue-Specific Modifications of the Hydration Shell.
auteur
Henry S Kim, Anne Martel, Eric Girard, Martine Moulin, Michael Härtlein, Dominique Madern, Martin Blackledge, Bruno Franzetti, Frank Gabel
article
Biophysical Journal, 2016, 110 (10), pp.2185-94. ⟨10.1016/j.bpj.2016.04.013⟩
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titre
Self-assembly Controls Self-cleavage of HHR from ASBVd (−): a Combined SANS and Modeling Study
auteur
Fabrice Leclerc, Giuseppe Zaccai, Jacques Vergne, Martina Řìhovà, Anne Martel, Marie-Christine Maurel
article
Scientific Reports, 2016, 6 (30287), ⟨10.1038/srep30287⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-01357443/file/srep30287.pdf BibTex
titre
TET peptidases: A family of tetrahedral complexes conserved in prokaryotes
auteur
Alexandre Appolaire, Matteo Colombo, Hind Basbous, Frank Gabel, Eric Girard, Bruno Franzetti
article
Biochimie, 2016, 122, pp.188-196. ⟨10.1016/j.biochi.2015.11.001⟩
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titre
The fluctuating ribosome: thermal molecular dynamics characterized by neutron scattering
auteur
Giuseppe Zaccai, Francesca Natali, Judith Peters, Martina Řihová, Ella Zimmerman, J. Ollivier, J. Combet, Marie-Christine Maurel, Anat Bashan, Ada Yonath
article
Scientific Reports, 2016, 6, pp.37138 ⟨10.1038/srep37138⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-01417992/file/srep37138.pdf BibTex
titre
Tuned by metals: the TET peptidase activity is controlled by 3 metal binding sites
auteur
Matteo Colombo, Eric Girard, Bruno Franzetti
article
Scientific Reports, 2016, 6, ⟨10.1038/srep20876⟩
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titre
Xanthan Exopolysaccharide: Cu(2+) Complexes Affected from the pH-Dependent Conformational State; Implications for Environmentally Relevant Biopolymers.
auteur
Benjamin Causse, Lorenzo Spadini, Géraldine Sarret, Adeline Faure, Christophe Travelet, Dominique Madern, Cécile Delolme
article
Environmental Science and Technology, 2016, 50 (7), pp.3477-85. ⟨10.1021/acs.est.5b03141⟩
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2015

titre
Crystallography under high pressure using synchrotron radiation
auteur
Jean-Paul Itié, Eric Girard, Nicolas Guignot, Y. Le Godec, Mohamed Mezouar
article
Journal of Physics D: Applied Physics, 2015, 48 (50), pp.504007 ⟨10.1088/0022-3727/48/50/504007⟩
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titre
Dynamic footprint of sequestration in the molecular fluctuations of osteopontin
auteur
S. Lenton, T. Seydel, T. Nylander, C. Holt, M. Härtlein, S. Teixeira, Giuseppe Zaccai
article
Journal of the Royal Society Interface, 2015, 12 (110), pp.20150506
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titre
Functional Sub-states by High-pressure Macromolecular Crystallography
auteur
Anne-Claire Dhaussy, Eric Girard
article
Sub-cellular biochemistry, 2015, 72, pp.215-35. ⟨10.1007/978-94-017-9918-8_11⟩
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titre
Microbial diversity and adaptation to high hydrostatic pressure in deep-sea hydrothermal vents prokaryotes.
auteur
Mohamed Jebbar, Bruno Franzetti, Eric Girard, Philippe Oger
article
Extremophiles, 2015, 19 (4), pp.721-40
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titre
Molecular adaptation and salt stress response of Halobacterium salinarum cells revealed by neutron spectroscopy.
auteur
Pierre Vauclare, Vincent Marty, Elisa Fabiani, Nicolas Martinez, Marion Jasnin, Frank Gabel, Judith Peters, Giuseppe Zaccai, Bruno Franzetti
article
Extremophiles, 2015, 19 (6), pp.1099-107
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titre
Molecular Dynamics Simulations of a Powder Model of the Intrinsically Disordered Protein Tau.
auteur
Yann Fichou, Matthias Heyden, Giuseppe Zaccai, Martin Weik, Douglas J Tobias
article
Journal of Physical Chemistry B, 2015, 119 (39), pp.12580-9
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titre
Small-Angle Neutron Scattering for Structural Biology of Protein-RNA Complexes.
auteur
Frank Gabel
article
Methods in Enzymology, 2015, 558, pp.391-415
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BibTex
titre
Special section on Molecular biology of Archaea.
auteur
David Prangishvili, Simonetta Gribaldo, Bruno Franzetti, Patrick Forterre
article
Biochimie, 2015, 118, pp.253. ⟨10.1016/j.biochi.2015.09.020⟩
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titre
Translational diffusion of hydration water correlates with functional motions in folded and intrinsically disordered proteins.
auteur
Giorgio Schirò, Yann Fichou, Francois-Xavier Gallat, Kathleen Wood, Frank Gabel, Martine Moulin, Michael Härtlein, Matthias Heyden, Jacques-Philippe Colletier, Andrea Orecchini, Alessandro Paciaroni, Joachim Wuttke, Douglas J Tobias, Martin Weik
article
Nature Communications, 2015, 6, pp.6490
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titre
Uniqueness of models from small-angle scattering data: the impact of a hydration shell and complementary NMR restraints.
auteur
Henry S Kim, Frank Gabel
article
Acta crystallographica Section D : Structural biology [1993-..], 2015, 71 (Pt 1), pp.57-66
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2014

titre
An experimental point of view on hydration/solvation in halophilic proteins.
auteur
Romain Talon, Nicolas Coquelle, Dominique Madern, Eric Girard
article
Frontiers in Microbiology, 2014, 5 (12), pp.66
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titre
Conserved structure and domain organization among bacterial Slc26 transporters.
auteur
Emma L R Compton, Kimberly Page, Heather E Findlay, Michael Haertlein, Martine Moulin, Ulrich Zachariae, David G Norman, Frank Gabel, Arnaud Javelle
article
Biochemical Journal, 2014, 463 (2), pp.297-307
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titre
Crystal structure of pb9, the distal tail protein of bacteriophage T5: a conserved structural motif among all siphophages.
auteur
Ali Flayhan, Frédéric M D Vellieux, Rudi Lurz, Olivier Maury, Carlos Contreras-Martel, Eric Girard, Pascale Boulanger, Cécile Breyton
article
Journal of Virology, 2014, 88 (2), pp.820-8. ⟨10.1128/jvi.02135-13⟩
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titre
Deep sea microbes probed by incoherent neutron scattering under high hydrostatic pressure.
auteur
Judith Peters, Nicolas Martinez, Grégoire Michoud, Anaïs Cario, Bruno Franzetti, Philippe Oger, Mohamed Jebbar
article
Zeitschrift für Physikalische Chemie, 2014, 228, 10-12, pp.1121-1133. ⟨10.1515/zpch-2014-0547⟩
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titre
Interface matters: the stiffness route to stability of a thermophilic tetrameric malate dehydrogenase.
auteur
Maria Kalimeri, Eric Girard, Dominique Madern, Fabio Sterpone
article
PLoS ONE, 2014, 9 (12), pp.e113895
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titre
Metal sensing and signal transduction by CnrX from Cupriavidus metallidurans CH34: role of the only methionine assessed by a functional, spectroscopic, and theoretical study.
auteur
Juliette Trepreau, Cornelia Grosse, Jean-Marie Mouesca, Géraldine Sarret, Eric Girard, Isabelle Petit-Härtlein, Sandra Kuennemann, Céline Desbourdes, Eve de Rosny, Antoine P Maillard, Dietrich H Nies, Jacques Covès
article
Metallomics, 2014, 6 (2), pp.263-273. ⟨10.1039/C3MT00248A⟩
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titre
New insights into microbial adaptation to extreme saline environments
auteur
Pierre Vauclare, Dominique Madern, Eric Girard, Frank Gabel, Giuseppe Zaccai, Bruno Franzetti
article
BIO Web of Conferences, 2014, 2, pp.XXX
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titre
Picosecond dynamics in haemoglobin from different species: A quasielastic neutron scattering study
auteur
Andreas Stadler, Christopher Garvey, Jan Peter Embs, Michael Marek Koza, Tobias Unruh, Gerhard Artmann, Giuseppe Zaccai
article
Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects, 2014, 1840 (10), pp.2989-2999
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titre
Probing the conformation of FhaC with small-angle neutron scattering and molecular modeling.
auteur
Frank Gabel, Marc F Lensink, Bernard Clantin, Françoise Jacob-Dubuisson, Vincent Villeret, Christine Ebel
article
Biophysical Journal, 2014, 107 (1), pp.185-196. ⟨10.1016/j.bpj.2014.05.025⟩
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titre
Small-angle neutron scattering reveals the assembly mode and oligomeric architecture of TET, a large, dodecameric aminopeptidase.
auteur
Alexandre Appolaire, Eric Girard, Matteo Colombo, M Asunción Durá, Martine Moulin, Michael Härtlein, Bruno Franzetti, Frank Gabel
article
Acta crystallographica Section D : Structural biology [1993-..], 2014, 70 (Pt 11), pp.2983-93
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titre
Structural basis for the assembly of the Sxl-Unr translation regulatory complex.
auteur
Janosch Hennig, Cristina Militti, Grzegorz M Popowicz, Iren Wang, Miriam Sonntag, Arie Geerlof, Frank Gabel, Fátima Gebauer, Michael Sattler
article
Nature, 2014, 515 (7526), pp.287-90
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titre
The crystal structure of the anti-σ factor CnrY in complex with the σ factor CnrH shows a new structural class of anti-σ factors targeting extracytoplasmic function σ factors
auteur
Antoine P Maillard, Eric Girard, Widade Ziani, Isabelle Petit-Härtlein, Richard Kahn, Jacques Covès
article
Journal of Molecular Biology, 2014, 426 (12), pp.2313-27. ⟨10.1016/j.jmb.2014.04.003⟩
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titre
The TET2 and TET3 aminopeptidases from Pyrococcus horikoshii form a hetero-subunit peptidasome with enhanced peptide destruction properties.
auteur
Alexandre Appolaire, M Asunción Durá, Mylène Ferruit, Jean-Pierre Andrieu, Anne Godfroy, Simonetta Gribaldo, Bruno Franzetti
article
Molecular Microbiology, 2014, 94 (4), pp.803-814. ⟨10.1111/mmi.12775⟩
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titre
The X-ray structure of NccX from Cupriavidus metallidurans 31A illustrates potential dangers of detergent solubilization when generating and interpreting crystal structures of membrane proteins.
auteur
Widade Ziani, Antoine P. Maillard, Isabelle Petit-Härtlein, Norbert Garnier, Serge Crouzy, Eric Girard, Jacques Covès
article
Journal of Biological Chemistry, 2014, 289 (45), pp.31160-31172. ⟨10.1074/jbc.M114.586537⟩
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titre
Thermal Fluctuations in Amphipol A8-35 Particles: A Neutron Scattering and Molecular Dynamics Study
auteur
Moeava Tehei, Jason Perlmutter, Fabrice Giusti, Jonathan Sachs, Giuseppe Zaccai, Jean-Luc Popot
article
Journal of Membrane Biology, 2014, 247 (9-10), pp.897-908. ⟨10.1007/s00232-014-9725-1⟩
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titre
Thermodynamics (a reminder)
auteur
Giuseppe Zaccai
article
Eva Pebay-Peyroula; Hugues Nury; François Parcy; Rob W H Ruigrok; Christine Ziegler; Leticia F Cugliandolo. From Molecules to Living Organisms: An Interplay Between Biology and Physics, 102 (2), Oxford University Press, 2014, 9780198752950
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titre
Transient electrostatic interactions dominate the conformational equilibrium sampled by multidomain splicing factor U2AF65: a combined NMR and SAXS study.
auteur
Jie-Rong Huang, Lisa R Warner, Carolina Sanchez, Frank Gabel, Tobias Madl, Cameron D Mackereth, Michael Sattler, Martin Blackledge
article
Journal of the American Chemical Society, 2014, 136 (19), pp.7068-76
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