Publications HAL du labo/EPI 576;1043235 de la collection IBS-I2SR

2022

titre
Biophysical ordering transitions underlie genome 3D re-organization during cricket spermiogenesis
auteur
Guillermo Orsi, Maxime M.C. Tortora, Béatrice Horard, Dominique Baas, Jean-Philippe Kleman, Jonas Bucevičius, Gražvydas Lukinavičius, Daniel Jost, Benjamin Loppin
article
2022
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https://hal-cnrs.archives-ouvertes.fr/hal-03797978/file/Orsi_bioRxiv_2022.pdf BibTex
titre
Crystallography in France, a selective instant view
auteur
Pierre Bordet, Arie van Der Lee, Joanna Timmins, Etienne Balan, Delphine Cabaret, René Guinebretière, Matias Velázquez, Philippe Guionneau
article
IUCr Newsletter, 2022, 30 (1), pp.1-29
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https://hal.science/hal-03624626/file/%28IUCr%29%20articles%20Cryst%20in%20France%202022.pdf BibTex
titre
Extra kinetic dimensions for label discrimination
auteur
Raja Chouket, Agnès Pellissier-Tanon, Aliénor Lahlou, Ruikang Zhang, Diana Kim, Marie-Aude Plamont, Mingshu Zhang, Xi Zhang, Pingyong Xu, Nicolas Desprat, Dominique Bourgeois, Agathe Espagne, Annie Lemarchand, Thomas Le Saux, Ludovic Jullien
article
Nature Communications, 2022, 13 (1), pp.1482. ⟨10.1038/s41467-022-29172-0⟩
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titre
Extra kinetic dimensions for label discrimination
auteur
Raja Chouket, Agnès Pellissier-Tanon, Aliénor Lahlou, Ruikang Zhang, Diana Kim, Marie-Aude Plamont, Mingshu Zhang, Xi Zhang, Pingyong Xu, Nicolas Desprat, Dominique Bourgeois, Agathe Espagne, Annie Lemarchand, Thomas Le Saux, Ludovic Jullien
article
Nature Communications, 2022, 13, pp.1482. ⟨10.1038/s41467-022-29172-0⟩
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https://hal.science/hal-03844297/file/ChoNatCommun2022.pdf BibTex
titre
Human endonuclease III/NTH1: focusing on the [4Fe–4S] cluster and the N-terminal domain
auteur
Elin Moe, Célia Silveira, Lidia Zuccarello, Filipe Rollo, Meike Stelter, Salvatore de Bonis, Catharina Kulka-Peschke, Sagie Katz, Peter Hildebrandt, Ingo Zebger, Joanna Timmins, Smilja Todorovic
article
Chemical Communications, 2022, ⟨10.1039/d2cc03643f⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03845005/file/Moe%20et%20al.%20Chem%20Comm.pdf BibTex
titre
In vitro reconstitution of an efficient nucleotide excision repair system using mesophilic enzymes from Deinococcus radiodurans
auteur
Anna Seck, Salvatore de Bonis, Christine Saint-Pierre, Didier Gasparutto, Jean-Luc Ravanat, Joanna Timmins
article
Communications Biology, 2022, 5 (1), pp.127. ⟨10.1038/s42003-022-03064-x⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-03650082/file/Seck%20et%20al.%20Comms%20Bio%202022.pdf BibTex
titre
mEos4b Photoconversion Efficiency Depends on Laser Illumination Conditions Used in PALM
auteur
Jip Wulffele, Daniel Thédié, Oleksandr Glushonkov, Dominique Bourgeois
article
Journal of Physical Chemistry Letters, 2022, 13 (22), pp.5075-5080. ⟨10.1021/acs.jpclett.2c00933⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03810036/file/Wulffele%20et%20al.%20jpclett.pdf BibTex
titre
Photophysical studies at cryogenic temperature reveal a novel photoswitching mechanism of rsEGFP2
auteur
Angela Mantovanelli, Oleksandr Glushonkov, Virgile Adam, Jip Wulffele, Daniel Thédié, Martin Byrdin, Ingo Gregor, Oleksii Nevskyi, Jörg Enderlein, Dominique Bourgeois
article
2022
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03810073/file/Mantovanelli%20preprint.pdf BibTex
titre
Rational control of off‐state heterogeneity in a photoswitchable fluorescent protein provides switching contrast enhancement
auteur
Virgile Adam, Kyprianos Hadjidemetriou, Nickels Jensen, Robert L. Shoeman, Joyce Woodhouse, Andrew Aquila, Anne-Sophie Banneville, Thomas Barends, Victor Bezchastnov, Sébastien Boutet, Martin Byrdin, Marco Cammarata, Sergio Carbajo, Nina Eleni Christou, Nicolas Coquelle, Eugenio de la Mora, Mariam El Khatib, Tadeo Moreno Chicano, R. Bruce Doak, Franck Fieschi, Lutz Foucar, Oleksandr Glushonkov, Alexander Gorel, Marie Luise Grünbein, Mario Hilpert, Mark Hunter, Marco Kloos, Jason Koglin, Thomas J. Lane, Mengning Liang, Angela Mantovanelli, Karol Nass, Gabriela Nass Kovacs, Shigeki Owada, Christopher M. Roome, Giorgio Schirò, Matthew Seaberg, Miriam Stricker, Michel Thépaut, Kensuke Tono, Kiyoshi Ueda, Lucas M. Uriarte, Daehyun You, Ninon Zala, Tatiana Domratcheva, Stefan Jakobs, Michel Sliwa, Ilme Schlichting, Jacques-Philippe Colletier, Dominique Bourgeois, Martin Weik
article
ChemPhysChem, 2022, 23 (19), pp.e202200192. ⟨10.1002/cphc.202200192⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03758975/file/Adam%20et%20al.%20ChemPhysChem.pdf BibTex
titre
Single molecule imaging simulations with full fluorophore photophysics
auteur
Dominique Bourgeois
article
2022
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03810049/file/Bourgeois%20preprint.pdf BibTex
titre
Structural and functional characterization of DdrC, a novel DNA damage-induced nucleoid associated protein involved in DNA compaction
auteur
Anne-Sophie Banneville, Claire Bouthier de La Tour, Cécilia Hognon, Jacques-Philippe Colletier, Jean-Marie Teulon, Aline Le Roy, Jean-Luc Pellequer, Antonio Monari, François Dehez, Fabrice Confalonieri, Pascale Servant, Joanna Timmins
article
Nucleic Acids Research, 2022, 50 (13), pp.7680-7696. ⟨10.1093/nar/gkac563⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-03420989/file/Banneville%20et%20al.%20NAR.pdf BibTex

2021

titre
Disentangling Chromophore States in a Reversibly Switchable Green Fluorescent Protein: Mechanistic Insights from NMR Spectroscopy
auteur
Nina Eleni Christou, Karine Giandoreggio-Barranco, Isabel Ayala, Oleksandr Glushonkov, Virgile Adam, Dominique Bourgeois, Bernhard Brutscher
article
Journal of the American Chemical Society, 2021, 143 (19), pp.7521-7530. ⟨10.1021/jacs.1c02442⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-03328569/file/Christou%20et%20al.%20JACS.pdf BibTex
titre
Insights into the ligand binding specificity of SREC‐II (scavenger receptor expressed by endothelial cells)
auteur
Catherine Wicker‐planquart, Pascale Tacnet‐delorme, Laurence Preisser, Samy Dufour, Yves Delneste, Dominique Housset, Philippe Frachet, Nicole M. Thielens
article
FEBS Open Bio, 2021, Online ahead of print. ⟨10.1002/2211-5463.13260⟩
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-03315913/file/2021DelnesteEq07.pdf BibTex
titre
Metabolic biorthogonal labeling and dSTORM imaging of peptidoglycan synthesis in Streptococcus pneumoniae
auteur
Jennyfer Trouve, Oleksandr Glushonkov, Cecile Morlot
article
STAR Protocols, 2021, 2 (4), pp.101006. ⟨10.1016/j.xpro.2021.101006⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03510706/file/TrouveGlushonkovMorlot2021%20STAR%20Protocol.pdf BibTex
titre
Nanoscale dynamics of peptidoglycan assembly during the cell cycle of Streptococcus pneumoniae
auteur
Jennyfer Trouve, André Zapun, Christopher Arthaud, Claire Durmort, Anne Marie Di Guilmi, Bill Söderström, Anais Pelletier, Christophe Grangeasse, Dominique Bourgeois, Yung-Sing Wong, Cecile Morlot
article
Current Biology - CB, 2021, ⟨10.1016/j.cub.2021.04.041⟩
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titre
Supramolecular assembly of the Escherichia coli LdcI upon acid stress
auteur
Matthew Jessop, Clarissa Liesche, Jan Felix, Ambroise Desfosses, Megghane Baulard, Virgile Adam, Angélique Fraudeau, Karine Huard, Grégory Effantin, Jean-Philippe Kleman, Maria Bacia-Verloop, Dominique Bourgeois, Irina Gutsche
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2021, 118 (2), pp.e2014383118. ⟨10.1073/pnas.2014383118⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-03112998/file/Jessop%20et%20al.%20PNAS.pdf BibTex

2020

titre
Complement C1q Interacts With LRP1 Clusters II and IV Through a Site Close but Different From the Binding Site of Its C1r and C1s-Associated Proteases
auteur
Guillaume Fouët, Evelyne Gout, Catherine Wicker-Planquart, Isabelle Bally, Camilla de Nardis, Stéphane Dedieu, Anne Chouquet, Christine Gaboriaud, Nicole M. Thielens, Jean-Philippe Kleman, Véronique Rossi
article
Frontiers in Immunology, 2020, 11, pp.583754. ⟨10.3389/fimmu.2020.583754⟩
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titre
Focus on DNA Glycosylases—A Set of Tightly Regulated Enzymes with a High Potential as Anticancer Drug Targets
auteur
Fabienne Hans, Muge Senarisoy, Chandini Bhaskar Naidu, Joanna Timmins
article
International Journal of Molecular Sciences, 2020, 21 (23), pp.9226. ⟨10.3390/ijms21239226⟩
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titre
Förster Resonance Energy Transfer Based Biosensor for Targeting the hNTH1–YB1 Interface as a Potential Anticancer Drug Target
auteur
Muge Senarisoy, Caroline Barette, Françoise Lacroix, Salvatore Debonis, Meike Stelter, Fabienne Hans, Jean-Philippe Kleman, Marie-Odile Fauvarque, Joanna Timmins
article
ACS Chemical Biology, 2020, 15 (4), pp.990-1003. ⟨10.1021/acschembio.9b01023⟩
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https://hal-cea.archives-ouvertes.fr/cea-02517754/file/Preprint_Senarisoy_etal.pdf BibTex
titre
Measles virus nucleo- and phosphoproteins form liquid-like phase-separated compartments that promote nucleocapsid assembly
auteur
Serafima Guseva, Sigrid Milles, Malene Ringkjøbing Jensen, Nicola Salvi, Jean-Philippe Kleman, Damien Maurin, Rob W H Ruigrok, Martin Blackledge
article
Science Advances , 2020, 6 (14), pp.eaaz7095. ⟨10.1126/sciadv.aaz7095⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-02529008/file/Guseva%20et%20al.%20Sci%20Adv.pdf BibTex
titre
Mechanistic Investigations of Green mEos4b Reveal a Dynamic Long-Lived Dark State
auteur
Elke de Zitter, Jacqueline Ridard, Daniel Thédié, Virgile Adam, Bernard C. Levy, Martin Byrdin, Guillaume Gotthard, Luc van Meervelt, Peter Dedecker, Isabelle Demachy, Dominique Bourgeois
article
Journal of the American Chemical Society, 2020, 142 (25), pp.10978-10988. ⟨10.1021/jacs.0c01880⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-02895781/file/DeZitter_JACS_2020.pdf BibTex
titre
Molecular and Cellular Interactions of Scavenger Receptor SR-F1 With Complement C1q Provide Insights Into Its Role in the Clearance of Apoptotic Cells
auteur
Catherine Wicker-Planquart, Samy Dufour, Pascale Tacnet-Delorme, Isabelle Bally, Yves Delneste, Philippe Frachet, Dominique Housset, Nicole M. Thielens
article
Frontiers in Immunology, 2020, 11, ⟨10.3389/fimmu.2020.00544⟩
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BibTex
titre
Nanoscale surface structures of DNA bound to Deinococcus radiodurans HU unveiled by atomic force microscopy.
auteur
Shu-Wen W. Chen, Anne-Sophie Banneville, Jean-Marie Teulon, Joanna Timmins, Jean-Luc Pellequer
article
Nanoscale, 2020, 12 (44), pp.22628-22638. ⟨10.1039/d0nr05320a⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03018678/file/Chen%20et%20al.%20Nanoscale.pdf BibTex
titre
Phase and fluorescence imaging with a surprisingly simple microscope based on chromatic aberration
auteur
Ondřej Mandula, Jean-Philippe Kleman, Françoise Lacroix, Cédric Allier, Daniel Fiole, Lionel Hervé, Pierre Blandin, Dorothee Kraemer, Sophie Morales
article
Optics Express, 2020, 28 (2), pp.2079. ⟨10.1364/OE.28.002079⟩
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BibTex
titre
Photoswitching mechanism of a fluorescent protein revealed by time-resolved crystallography and transient absorption spectroscopy.
auteur
Joyce Woodhouse, Gabriela Nass Kovacs, Nicolas Coquelle, Lucas M. Uriarte, Virgile Adam, Thomas R. M. Barends, Martin Byrdin, Eugenio de La Mora, R. Bruce Doak, Mikolaj Feliks, Martin J Field, Franck Fieschi, Virginia Guillon, Stefan Jakobs, Yasumasa Joti, Pauline Macheboeuf, Koji Motomura, Karol Nass, Shigeki Owada, Christopher M. Roome, Cyril Ruckebusch, Giorgio Schirò, Robert L. Shoeman, Michel Thépaut, Tadashi Togashi, Kensuke Tono, Makina Yabashi, Marco Cammarata, Lutz Foucar, Dominique Bourgeois, Michel Sliwa, Jacques-Philippe Colletier, Ilme Schlichting, Martin Weik
article
Nature Communications, 2020, 11 (1), pp.741. ⟨10.1038/s41467-020-14537-0⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02498645/file/s41467-020-14537-0.pdf BibTex
titre
Surviving salt fluctuations: stress and recovery in Halobacterium salinarum, an extreme halophilic Archaeon
auteur
Pierre Vauclare, F. Natali, Jean-Philippe Kleman, Giuseppe Zaccai, Bruno Franzetti
article
Scientific Reports, 2020, 10 (1), pp.3298. ⟨10.1038/s41598-020-59681-1⟩
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https://hal.science/hal-02519472/file/Vauclare%20et%20al.%20Scientific%20Reports.pdf BibTex

2019

titre
Cell morphology and nucleoid dynamics in dividing Deinococcus radiodurans
auteur
Kevin Floc’h, Françoise Lacroix, Pascale Servant, Yung-Sing Wong, Jean-Philippe Kleman, Dominique Bourgeois, Joanna Timmins
article
Nature Communications, 2019, 10 (1), ⟨10.1038/s41467-019-11725-5⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02273077/file/Floc%27h%20et%20al.%20Nat%20Commun.pdf BibTex
titre
Cytosolic PCNA interacts with p47phox and controls NADPH oxidase NOX2 activation in neutrophils
auteur
Delphine Ohayon, Alessia de Chiara, Pham My-Chan Dang, Nathalie Thieblemont, Simon Chatfield, Viviana Marzaioli, Sabrina Sofia Burgener, Julie Mocek, Céline Candalh, Coralie Pintard, Pascale Tacnet-Delorme, Gilles Renault, Isabelle Lagoutte, Maryline Favier, Francine Walker, Margarita Hurtado-Nedelec, Dominique Desplancq, Etienne Weiss, Charaf Benarafa, Dominique Housset, Jean-Claude Marie, Philippe Frachet, Jamel El-Benna, Véronique Witko-Sarsat
article
Journal of Experimental Medicine, 2019, 216 (11), pp.2669-2687. ⟨10.1084/jem.20180371⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02355202/file/islandora_97577.pdf BibTex
titre
Cytosolic PCNA interacts with p47phox and controls NADPH oxidase NOX2 activation in neutrophils
auteur
Delphine Ohayon, Alessia de Chiara, Pham My-Chan Dang, Nathalie Thieblemont, Simon Chatfield, Viviana Marzaioli, Sabrina Sofia Burgener, Julie Mocek, Céline Candalh, Coralie Pintard, Pascale Tacnet-Delorme, Gilles Renault, Isabelle Lagoutte, Maryline Favier, Francine Walker, Margarita Hurtado-Nedelec, Dominique Desplancq, Etienne Weiss, Charaf Benarafa, Dominique Housset, Jean-Claude Marie, Philippe Frachet, Jamel El-Benna, Véronique Witko-Sarsat
article
Journal of Experimental Medicine, 2019, 216 (11), pp.2669-2687. ⟨10.1084/jem.20180371⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03014849/file/Ohayon-Witko-Sarsat-PCNA-NOX2-JEM-2019%20opened.pdf BibTex
titre
Ligand pathways in neuroglobin revealed by low-temperature photodissociation and docking experiments
auteur
Chiara Ardiccioni, Alessandro Arcovito, Stefano Della Longa, Peter van der Linden, Dominique Bourgeois, Martin Weik, Linda Celeste Montemiglio, Carmelinda Savino, Giovanna Avella, Cécile Exertier, Philippe Carpentier, Thierry Prangé, Maurizio Brunori, Nathalie Colloc'H, Beatrice Vallone
article
International Union of Crystallography journal, 2019, 6, pp.832-842. ⟨10.1107/S2052252519008157⟩
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titre
Mechanistic investigation of mEos4b reveals a strategy to reduce track interruptions in sptPALM
auteur
Elke de Zitter, Daniel Thédié, Viola Mönkemöller, Siewert Hugelier, Joël Beaudouin, Virgile Adam, Martin Byrdin, Luc van Meervelt, Peter Dedecker, Dominique Bourgeois
article
Nature Methods, 2019, 16 (8), pp.707-710. ⟨10.1038/s41592-019-0462-3⟩
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titre
Molecular Basis of DNA Packaging in Bacteria Revealed by All-Atoms Molecular Dynamic Simulations: The case of histone like proteins in Borrelia burgdoferi.
auteur
Cécilia Hognon, Simon Garaude, Joanna Timmins, Christophe Chipot, Francois Dehez, Antonio Monari
article
Journal of Physical Chemistry Letters, 2019, ⟨10.1021/acs.jpclett.9b02978⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02352618/file/Hognon%20et%20al.%20J%20Phys%20Chem%20Lett.pdf BibTex
titre
NMR Reveals Light-Induced Changes in the Dynamics of a Photoswitchable Fluorescent Protein
auteur
Nina Eleni Christou, Isabel Ayala, Karine Giandoreggio-Barranco, Martin Byrdin, Virgile Adam, Dominique Bourgeois, Bernhard Brutscher
article
Biophysical Journal, 2019, 117 (11), pp.2087-2100. ⟨10.1016/j.bpj.2019.10.035⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02389522/file/32348_0_merged_1561984080.pdf BibTex
titre
Proteomic analysis of neutrophils in ANCA-associated vasculitis reveals a dysregulation in proteinase 3-associated proteins such as annexin-A1 involved in apoptotic cell clearance
auteur
Judith Everts-Graber, Katherine Martin, Nathalie Thieblemont, Julie Mocek, Arnaud Roccabianca, Philippe Chafey, Morgane Le Gall, Pascale Tacnet-Delorme, Chris Reutelingsperger, Jean-Marc Naccache, Bernard Bonnotte, Alexandre Karras, Xavier Puéchal, Loïc Guillevin, Benjamin Terrier, Philippe Frachet, Mauro Perretti, Luc Mouthon, Véronique Witko-Sarsat
article
Kidney International, 2019, 19, pp.30269-8. ⟨10.1016/j.kint.2019.02.017⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-02166651/file/S0085253819302698.pdf BibTex
titre
Recognition protein C1q of innate immunity agglutinates nanodiamonds without activating complement
auteur
Agathe Bélime, Nicole M. Thielens, Edmond Gravel, Philippe Frachet, Sarah Ancelet, Pascale Tacnet-Delorme, Charlotte Caneiro, Jane Chuprin, Christine Gaboriaud, Guy Schoehn, Eric Doris, Wai-Li Ling
article
Nanomedicine: Nanotechnology, Biology and Medicine, 2019, 18, pp.292-302. ⟨10.1016/j.nano.2018.09.009⟩
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https://hal-cea.archives-ouvertes.fr/cea-02126984/file/S1549963418305288.pdf BibTex
titre
The conformational changes coupling ATP hydrolysis and translocation in a bacterial DnaB helicase
auteur
Thomas Wiegand, Riccardo Cadalbert, Denis Lacabanne, Joanna Timmins, Laurent L. Terradot, Anja Böckmann, Beat Meier
article
Nature Communications, 2019, 10 (1), pp.31. ⟨10.1038/s41467-018-07968-3⟩
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https://hal.science/hal-02322585/file/2E9EFFFD-4E7A-4C55-90D3-4766D50B8764.pdf BibTex
titre
The three Endonuclease III variants of Deinococcus radiodurans possess distinct and complementary DNA repair activities
auteur
Aili Sarre, Meike Stelter, Filipe Rollo, Salvatore Debonis, Anna Seck, Cécilia Hognon, Jean-Luc Ravanat, Antonio Monari, François Dehez, Elin Moe, Joanna Timmins
article
DNA Repair, 2019, 78, pp.45-59. ⟨10.1016/j.dnarep.2019.03.014⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02092591/file/S1568786418303215.pdf BibTex

2018

titre
A Long-Lived Triplet State Is the Entrance Gateway to Oxidative Photochemistry in Green Fluorescent Proteins
auteur
Martin Byrdin, Chenxi Duan, Dominique Bourgeois, Klaus Brettel
article
Journal of the American Chemical Society, 2018, 140 (8), pp.2897 - 2905. ⟨10.1021/jacs.7b12755⟩
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titre
Bacterial cell wall nanoimaging by autoblinking microscopy
auteur
Kevin Floc’h, Françoise Lacroix, Liliana Barbieri, Pascale Servant, Rémi Galland, Corey Butler, Jean-Baptiste Sibarita, Dominique Bourgeois, Joanna Timmins
article
Scientific Reports, 2018, 8 (1), ⟨10.1038/s41598-018-32335-z⟩
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titre
Chromophore twisting in the excited state of a photoswitchable fluorescent protein captured by time-resolved serial femtosecond crystallography
auteur
Nicolas Coquelle, Michel Sliwa, Joyce Woodhouse, Giorgio Schirò, Virgile Adam, Andrew Aquila, Thomas R. M. Barends, Sébastien Boutet, Martin Byrdin, Sergio Carbajo, Eugenio de La Mora, R. Bruce Doak, Mikolaj Feliks, Franck Fieschi, Lutz Foucar, Virginia Guillon, Mario Hilpert, Mark S. Hunter, Stefan Jakobs, Jason E. Koglin, Gabriela Kovacsova, Thomas J. Lane, Bernard C. Levy, Mengning Liang, Karol Nass, Jacqueline Ridard, Joseph S. Robinson, Christopher M. Roome, Cyril Ruckebusch, Matthew Seaberg, Michel Thépaut, Marco Cammarata, Isabelle Demachy, Martin J Field, Robert L. Shoeman, Dominique Bourgeois, Jacques-Philippe Colletier, Ilme Schlichting, Martin Weik
article
Nature Chemistry, 2018, 10 (1), pp.31-37. ⟨10.1038/nchem.2853⟩
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titre
Proteinase 3 Interferes With C1q-Mediated Clearance of Apoptotic Cells
auteur
Pascale Tacnet-Delorme, Julie Gabillet, Simon Chatfield, Nathalie Thieblemont, Philippe Frachet, Véronique Witko-Sarsat
article
Frontiers in Immunology, 2018, 9, ⟨10.3389/fimmu.2018.00818⟩
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2017

titre
A General Mechanism of Photoconversion of Green-to-Red Fluorescent Proteins Based on Blue and Infrared Light Reduces Phototoxicity in Live-Cell Single-Molecule Imaging
auteur
Bartosz Turkowyd, Alexander Balinovic, David Virant, Haruko G. Gölz Carnero, Fabienne Caldana, Marc Endesfelder, Dominique Bourgeois, Ulrike Endesfelder
article
Angewandte Chemie International Edition, 2017, 56 (38), pp.11634 - 11639. ⟨10.1002/anie.201702870⟩
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titre
Autocatalytic association of proteins by covalent bond formation: a Bio Molecular Welding toolbox derived from a bacterial adhesin.
auteur
Julie Bonnet, J. Cartannaz, G. Tourcier, Carlos Contreras-Martel, Jean-Philippe Kleman, Cécile Morlot, Thierry Vernet, Anne-Marie Di Guilmi
article
Scientific Reports, 2017, 7, pp.43564. ⟨10.1038/srep43564⟩
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titre
Calreticulin Release at an Early Stage of Death Modulates the Clearance by Macrophages of Apoptotic Cells
auteur
Rim Osman, Pascale Tacnet-Delorme, Jean-Philippe Kleman, Arnaud Millet, Philippe Frachet
article
Frontiers in Immunology, 2017, 8, pp.1034. ⟨10.3389/fimmu.2017.01034⟩
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BibTex
titre
Deciphering Structural Photophysics of Fluorescent Proteins by Kinetic Crystallography.
auteur
Dominique Bourgeois
article
International Journal of Molecular Sciences, 2017, 18 (6), pp.E1187. ⟨10.3390/ijms18061187⟩
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BibTex
titre
Photoswitching of Green mEos2 by Intense 561 nm Light Perturbs Efficient Green-to-Red Photoconversion in Localization Microscopy
auteur
Daniel Thédié, Romain Berardozzi, Virgile Adam, Dominique Bourgeois
article
Journal of Physical Chemistry Letters, 2017, 8 (18), pp.4424 - 4430. ⟨10.1021/acs.jpclett.7b01701⟩
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2016

titre
A Decade of Biochemical and Structural Studies of the DNA Repair Machinery of Deinococcus radiodurans: Major Findings, Functional and Mechanistic Insight and Challenges
auteur
Joanna Timmins, Elin Moe
article
Computational and Structural Biotechnology Journal, 2016, 14, pp.168 - 176. ⟨10.1016/j.csbj.2016.04.001⟩
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A simple acoustofluidic chip for microscale manipulation using evanescent Scholte waves.
auteur
Vivian Aubert, Régis Wunenburger, Tony Valier-Brasier, David Rabaud, Jean-Philippe Kleman, Cédric Poulain
article
Lab on a Chip, 2016, 16 (13), pp.2532-9. ⟨10.1039/c6lc00534a⟩
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Arginine 66 Controls Dark-State Formation in Green-to-Red Photoconvertible Fluorescent Proteins
auteur
Romain Berardozzi, Virgile Adam, Alexandre Martins, Dominique Bourgeois
article
Journal of the American Chemical Society, 2016, 138 (2), pp.558-565. ⟨10.1021/jacs.5b09923⟩
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Cytoplasmic proliferating cell nuclear antigen connects glycolysis and cell survival in acute myeloid leukemia
auteur
Delphine Ohayon, Alessia de Chiara, Nicolas Chapuis, Céline Candalh, Julie Mocek, Jean-Antoine Ribeil, Lamya Haddaoui, Norbert Ifrah, Olivier Hermine, Frédéric Bouillaud, Philippe Frachet, Didier Bouscary, Véronique Witko-Sarsat
article
Scientific Reports, 2016, 6, pp.35561. ⟨10.1038/srep35561⟩
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Heparan Sulfate differently controls CXCL12α and CXCL12γ mediated cell migration through differential presentation to CXCR4
auteur
Bridgette Janine Connell, Rabia Sadir, Françoise Baleux, Cédric Laguri, Jean-Philippe Kleman, Lingjie Luo, Fernando Arenzana-Seisdedos, Hugues Lortat-Jacob
article
Science Signaling, 2016, 9 (452), pp.ra107. ⟨10.1126/scisignal.aaf1839⟩
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Monitoring ssDNA Binding to the DnaB Helicase from Helicobacter pylori by Solid-State NMR Spectroscopy
auteur
Thomas Wiegand, Riccardo Cadalbert, Carole Gardiennet, Joanna Timmins, Laurent Terradot, Anja Böckmann, Beat H. Meier
article
Angewandte Chemie International Edition, 2016, 55 (45), pp.14164 - 14168. ⟨10.1002/anie.201607295⟩
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Proteinase 3 Is a Phosphatidylserine-binding Protein That Affects the Production and Function of Microvesicles.
auteur
Katherine R Martin, Chahrazade Kantari-Mimoun, Min Yin, Magali Pederzoli-Ribeil, Fanny Angelot-Delettre, Adam Ceroi, Cédric Grauffel, Marc Benhamou, Nathalie Reuter, Philippe Saas, Philippe Frachet, Chantal M Boulanger, Véronique Witko-Sarsat
article
Journal of Biological Chemistry, 2016, 291 (20), pp.10476-89. ⟨10.1074/jbc.M115.698639⟩
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Rational design of ultrastable and reversibly photoswitchable fluorescent proteins for super-resolution imaging of the bacterial periplasm
auteur
Mariam El Khatib, Alexandre Martins, Dominique Bourgeois, Jacques-Philippe Colletier, Virgile Adam
article
Scientific Reports, 2016, 6, ⟨10.1038/srep18459⟩
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Serial femtosecond crystallography and ultrafast absorption spectroscopy of the photoswitchable fluorescent protein IrisFP
auteur
Jacques-Philippe Colletier, M. Sliwa, François-Xavier Gallat, M. Sugahara, Virginia Guillon, Giorgio Schirò, Nicolas Coquelle, Joyce Woodhouse, Laure Roux, Guillaume Gotthard, Antoine Royant, L. Martinez Uriarte, C. Ruckebusch, Y. Joti, Martin Byrdin, E. Mizohata, E. Nango, T. Tanaka, K. Tono, M. Yabashi, Virgile Adam, Marco Cammarata, I. Schlichting, Dominique Bourgeois, Martin Weik
article
Journal of Physical Chemistry Letters, 2016, 7 (5), pp.882 - 887. ⟨10.1021/acs.jpclett.5b02789⟩
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The CAL(AI)2DOSCOPE: a microspectrophotometer for accurate recording of correlated absorbance and fluorescence emission spectra
auteur
Martin Byrdin, Dominique Bourgeois
article
Spectroscopy Europe, 2016, 28 (6), pp.14-17
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2015

titre
La microscopie de fluorescence à super-résolution : un outil révolutionnaire pour imager le vivant à l'échelle nanométrique.
auteur
Virgile Adam, Dominique Bourgeois
article
Photoniques, 2015, 74, pp.34-39
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titre
Rational design of enhanced photoresistance in a photoswitchable fluorescent protein
auteur
Chenxi Duan, Martin Byrdin, Mariam El Kathib, Xavier Henry, Virgile Adam, Dominique Bourgeois
article
Methods and Applications in Fluorescence, 2015, 3 (1), pp.XXX. ⟨10.1088/2050-6120/3/1/014004⟩
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titre
Remodeling of the Z-Ring Nanostructure during the Streptococcus pneumoniae Cell Cycle Revealed by Photoactivated Localization Microscopy.
auteur
Maxime Jacq, Virgile Adam, Dominique Bourgeois, Christine Moriscot, Anne-Marie Di Guilmi, Thierry Vernet, Cécile Morlot
article
mBio, 2015, 6 (4), pp.e01108-15
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Role of C1q in Efferocytosis and Self-Tolerance — Links With Autoimmunity
auteur
Philippe Frachet, Pascale Tacnet-Delorme, Christine Gaboriaud, Nicole M. Thielens
article
Autoimmunity - Pathogenesis, Clinical Aspects and Therapy of Specific Autoimmune Diseases, Katerina Chatzidionysiou, pp.21-51, 2015, 2, 978-953-51-2134-3. ⟨10.5772/60519⟩
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titre
Structural and functional characterization of two unusual endonuclease III enzymes from Deinococcus radiodurans
auteur
Aili Sarre, Mats Ökvist, Tobias Klar, David R Hall, Arne O. Smalås, Sean Mcsweeney, Joanna Timmins, Elin Moe
article
Journal of Structural Biology, 2015, 191 (2), pp.87-99. ⟨10.1016/j.jsb.2015.05.009⟩
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Structure and primase-mediated activation of a bacterial dodecameric replicative helicase
auteur
Alexandre Bazin, Mickael V Cherrier, Irina Gutsche, Joanna Timmins, Laurent Terradot
article
Nucleic Acids Research, 2015, 13 p. ⟨10.1093/nar/gkv792⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-01184227/file/Bazin_etal_NAR_2015.pdf BibTex
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The SH3 regulatory domain of the hematopoietic cell kinase Hck binds ELMO via its polyproline motif.
auteur
Rida Awad, Marion Sevajol, Isabel Ayala, Anne Chouquet, Philippe Frachet, Pierre Gans, Jean-Baptiste Reiser, Jean-Philippe Kleman
article
FEBS Open Bio, 2015, 5, pp.99-106
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2014

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A complement to the modern crystallographer's toolbox : caged gadolinium complexes with versatile binding modes.
auteur
Meike Stelter, Rafael Molina, Sandra Jeudy, Richard Kahn, Chantal Abergel, Juan A. Hermoso
article
Acta crystallographica Section D : Structural biology [1993-..], 2014, 70 (6), pp.1506-16. ⟨10.1107/S1399004714005483⟩
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Centromeric histone variant CENP-A represses acetylation-dependent chromatin transcription that is relieved by histone chaperone NPM1.
auteur
Jayasha Shandilya, Parijat Senapati, Fabienne Hans, Hervé Menoni, Philippe Bouvet, Stefan Dimitrov, Dimitar Angelov, Tapas K Kundu
article
Journal of Biochemistry, 2014, 156 (4), pp.221-7
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Expression, purification and crystallization of two endonuclease III enzymes from Deinococcus radiodurans.
auteur
Aili Sarre, Mats Okvist, Tobias Klar, Elin Moe, Joanna Timmins
article
Acta Crystallographica Section F: Structural Biology and Crystallization Communications, 2014, 70 (Pt 12), pp.1688-92
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-01093359/file/Sarre_etal_EndoIII_ActaF_2014.pdf BibTex
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In cellulo Evaluation of Phototransformation Quantum Yields in Fluorescent Proteins Used As Markers for Single-Molecule Localization Microscopy
auteur
Sergiy Avilov, Romain Berardozzi, Mudalige S. Gunewardene, Virgile Adam, Samuel T. Hess, Dominique Bourgeois
article
PLoS ONE, 2014, 9 (6), pp.Volume 9 | Issue 6 | e98362. ⟨10.1371/journal.pone.0098362⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-01093348/file/Avilov_et_al_2014.pdf BibTex
titre
Phototransformable fluorescent proteins: Future challenges.
auteur
Virgile Adam, Romain Berardozzi, Martin Byrdin, Dominique Bourgeois
article
Current Opinion in Chemical Biology, 2014, 20, pp.92-102
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-01093360/file/COCHBI-D-14-00028R1_Paper.pdf BibTex
titre
Phototransformable fluorescent proteins: which one for which application?
auteur
Virgile Adam
article
Histochemistry and Cell Biology, 2014, 142 (1), pp.19-41
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Relative contribution of c1q and apoptotic cell-surface calreticulin to macrophage phagocytosis.
auteur
Mélanie Verneret, Pascale Tacnet-Delorme, Rim Osman, Rida Awad, Alexei Grichine, Jean-Philippe Kleman, Philippe Frachet
article
Journal of Innate Immunity, 2014, 6 (4), pp.426-34
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titre
Structural basis of photoswitching in fluorescent proteins.
auteur
Chenxi Duan, Virgile Adam, Martin Byrdin, Dominique Bourgeois
article
Methods in Molecular Biology, 2014, 1148, pp.177-202
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