Publications HAL du labo/EPI 576;1043235 de la collection IBS-SYN

2022

titre
Bistable Photoswitch Allows in Vivo Control of Hematopoiesis
auteur
Lea Albert, Jatin Nagpal, Wieland Steinchen, Lei Zhang, Laura Werel, Nemanja Djokovic, Dusan Ruzic, Malte Hoffarth, Jing Xu, Johanna Kaspareit, Frank Abendroth, Antoine Royant, Gert Bange, Katarina Nikolic, Soojin Ryu, Yali Dou, Lars-Oliver Essen, Olalla Vázquez
article
ACS Central Science, 2022, 8 (1), pp.57-66. ⟨10.1021/acscentsci.1c00434⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-03621281/file/ACS_Cent_Sc_8_57.pdf BibTex
titre
Cyan fluorescent proteins derived from mNeonGreen
auteur
Landon Zarowny, Damien Clavel, Ryan Johannson, Kévin Duarte, Hadrien Depernet, Jérôme Dupuy, Heather Baker, Alex Brown, Antoine Royant, Robert Campbell
article
Protein Engineering, Design and Selection, 2022, 35, pp.1-13. ⟨10.1093/protein/gzac004⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03750484/file/Zarowny%20et%20al.%20PEDS.pdf BibTex
titre
De novo determination of mosquitocidal Cry11Aa and Cry11Ba structures from naturally-occurring nanocrystals
auteur
Guillaume Tetreau, Michael R. Sawaya, Elke De Zitter, Elena A. Andreeva, Anne-Sophie Banneville, Natalie A. Schibrowsky, Nicolas Coquelle, Aaron S. Brewster, Marie Luise Grünbein, Gabriela Nass Kovacs, Mark S. Hunter, Marco Kloos, Raymond G. Sierra, Giorgio Schiro, Pei Qiao, Myriam Stricker, Iris D. Young, Ninon Zala, Sylvain Engilberge, Alexander Gorel, Luca Signor, Jean-Marie Teulon, Mario Hilpert, Lutz Foucar, Johan Bielecki, Richard Bean, Raphael De Wijn, Tokushi Sato, Dennis Bideshi, Romain Letrun, Alexander Batyuk, Irina Snigireva, Daphna Fenel, Robin Schubert, Ethan J. Canfield, Mario M. Alba, Frédéric Laporte, Henry Kirkwood, Laurence Després, Maria Bacia, Amandine Roux, Christian Chapelle, François Riobé, Olivier Maury, Wai-Li Ling, Sébastien Boutet, Adrian Mancuso, Irina Gutsche, Eric Girard, Thomas R. M. Barends, Jean-Luc Pellequer, Hyun-Woo Park, Arthur D. Laganowsky, Jose Rodriguez, Manfred Burghammer, Robert L. Shoeman, R. Bruce Doak, Martin Weik, Nicholas K. Sauter, Brian Federici, Duilio Cascio, Ilme Schlichting, Jacques-Philippe Colletier
article
Nature Communications, 2022, 13, ⟨10.1038/s41467-022-31746-x⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03805376/file/NatureComm-2022.pdf BibTex
titre
Irreversible inhibition of IspG, a target for the development of new antimicrobials, by a 2‐vinyl analogue of its MEcPP substrate
auteur
Vivien Herrscher, Clea Witjaksono, Marie Buchotte, Claire Ferret, Fabien Massicot, Jean-Luc Vasse, Franck Borel, Jean-Bernard Behr, Myriam Seemann
article
Chemistry - A European Journal, 2022, ⟨10.1002/chem.202200241⟩
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BibTex
titre
PAP8/pTAC6 Is Part of a Nuclear Protein Complex and Displays RNA Recognition Motifs of Viral Origin
auteur
Louise Chambon, François-Xavier Gillet, Maha Chieb, David Cobessi, Thomas Pfannschmidt, Robert Blanvillain
article
International Journal of Molecular Sciences, 2022, 23 (6), pp.3059. ⟨10.3390/ijms23063059⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03610759/file/ijms-23-03059-v2.pdf BibTex
titre
Rational control of off‐state heterogeneity in a photoswitchable fluorescent protein provides switching contrast enhancement
auteur
Virgile Adam, Kyprianos Hadjidemetriou, Nickels Jensen, Robert L. Shoeman, Joyce Woodhouse, Andrew Aquila, Anne-Sophie Banneville, Thomas Barends, Victor Bezchastnov, Sébastien Boutet, Martin Byrdin, Marco Cammarata, Sergio Carbajo, Nina Eleni Christou, Nicolas Coquelle, Eugenio de la Mora, Mariam El Khatib, Tadeo Moreno Chicano, R. Bruce Doak, Franck Fieschi, Lutz Foucar, Oleksandr Glushonkov, Alexander Gorel, Marie Luise Grünbein, Mario Hilpert, Mark Hunter, Marco Kloos, Jason Koglin, Thomas J. Lane, Mengning Liang, Angela Mantovanelli, Karol Nass, Gabriela Nass Kovacs, Shigeki Owada, Christopher M. Roome, Giorgio Schirò, Matthew Seaberg, Miriam Stricker, Michel Thépaut, Kensuke Tono, Kiyoshi Ueda, Lucas M. Uriarte, Daehyun You, Ninon Zala, Tatiana Domratcheva, Stefan Jakobs, Michel Sliwa, Ilme Schlichting, Jacques-Philippe Colletier, Dominique Bourgeois, Martin Weik
article
ChemPhysChem, 2022, 23 (19), pp.e202200192. ⟨10.1002/cphc.202200192⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03758975/file/Adam%20et%20al.%20ChemPhysChem.pdf BibTex
titre
Riboflavin-binding proteins for singlet oxygen production
auteur
Céline Lafaye, Sylvain Aumonier, Joaquim Torra, Luca Signor, David von Stetten, Marjolaine Noirclerc-Savoye, Xiaokun Shu, Rubén Ruiz-González, Guillaume Gotthard, Antoine Royant, Santi Nonell
article
Photochemical & Photobiological Sciences , 2022, 21, pp.1545-1555. ⟨10.1007/s43630-021-00156-1⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03715086/file/Lafaye%20et%20al.%20PhotochemPhotobiolSci.pdf BibTex
titre
Serial crystallography captures dynamic control of sequential electron and proton transfer events in a flavoenzyme
auteur
Manuel Maestre-Reyna, Cheng-Han Yang, Eriko Nango, Wei-Cheng Huang, Eka Putra Gusti Ngurah Putu, Wen-Jin Wu, Po-Hsun Wang, Sophie Franz-Badur, Martin Saft, Hans-Joachim Emmerich, Hsiang-Yi Wu, Cheng-Chung Lee, Kai-Fa Huang, Yao-Kai Chang, Jiahn-Haur Liao, Jui-Hung Weng, Wael Gad, Chiung-Wen Chang, Allan Pang, Michihiro Sugahara, Shigeki Owada, Yuhei Hosokawa, Yasumasa Joti, Ayumi Yamashita, Rie Tanaka, Tomoyuki Tanaka, Fangjia Luo, Kensuke Tono, Kai-Cheng Hsu, Stephan Kiontke, Igor Schapiro, Roberta Spadaccini, Antoine Royant, Junpei Yamamoto, So Iwata, Lars-Oliver Essen, Yoshitaka Bessho, Ming-Daw Tsai
article
Nature Chemistry, 2022, 14 (6), pp.677-685. ⟨10.1038/s41557-022-00922-3⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03716098/file/Maestre-Reyna%20et%20al.%20NatChem.pdf BibTex
titre
Slow protein dynamics probed by time-resolved oscillation crystallography at room temperature
auteur
Sylvain Aumonier, Sylvain Engilberge, Nicolas Caramello, David von Stetten, Guillaume Gotthard, Gordon Leonard, Christoph Mueller-Dieckmann, Antoine Royant
article
International Union of Crystallography journal, 2022, 9 (6), pp.756-767. ⟨10.1107/S2052252522009150⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03827095/file/Aumonier%20et%20al.%20IUCrJ.pdf BibTex
titre
Structural insights into light-driven anion pumping in cyanobacteria
auteur
R. Astashkin, K. Kovalev, S. Bukhdruker, S. Vaganova, A. Kuzmin, A. Alekseev, T. Balandin, D. Zabelskii, I. Gushchin, A. Royant, D. Volkov, G. Bourenkov, E. Koonin, M. Engelhard, E. Bamberg, V. Gordeliy
article
Nature Communications, 2022, 13 (1), pp.6460. ⟨10.1038/s41467-022-34019-9⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03844174/file/Astashkin%20et%20al.%20Nat%20Commun.pdf BibTex
titre
The AAA+ ATPase RavA and its binding partner ViaA modulate E. coli aminoglycoside sensitivity through interaction with the inner membrane
auteur
Jan Felix, Ladislav Bumba, Clarissa Liesche, Angélique Fraudeau, Fabrice Rébeillé, Jessica El Khoury, Karine Huard, Benoit Gallet, Christine Moriscot, Jean-Philippe Kleman, Yoan Duhoo, Matthew Jessop, Eaazhisai Kandiah, Frédéric Barras, Juliette Jouhet, Irina Gutsche
article
Nature Communications, 2022, 13 (1), pp.5502. ⟨10.1038/s41467-022-32992-9⟩
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https://hal.science/hal-03787887/file/Felix%20et%20al.%20Nature%20comm.pdf BibTex
titre
The Reductive Dehydroxylation Catalyzed by IspH, a Source of Inspiration for the Development of Novel Anti-Infectives
auteur
Hannah Jobelius, Gabriella Bianchino, Franck Borel, Philippe Chaignon, Myriam Seemann
article
Molecules, 2022, 27 (3), pp.708. ⟨10.3390/molecules27030708⟩
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titre
The Reductive Dehydroxylation Catalyzed by IspH, a Source of Inspiration for the Development of Novel Anti-Infectives
auteur
Hannah Jobelius, Gabriella Ines Bianchino, Franck Borel, Philippe Chaignon, Myriam Seemann
article
Molecules, 2022, 27 (3), pp.708. ⟨10.3390/molecules27030708⟩
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BibTex
titre
Three-Dimensional Envelope and Subunit Interactions of the Plastid-Encoded RNA Polymerase from Sinapis alba
auteur
Rémi Ruedas, Soumiya Sankari Muthukumar, Sylvie Kieffer-Jaquinod, François-Xavier Gillet, Daphna Fenel, Grégory Effantin, Thomas Pfannschmidt, Yohann Couté, Robert Blanvillain, David Cobessi
article
International Journal of Molecular Sciences, 2022, 23 (17), pp.9922. ⟨10.3390/ijms23179922⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03774879/file/Ruedas%20et%20al.%20ijms.pdf BibTex
titre
Trapping and structural characterisation of a covalent intermediate in vitamin B 6 biosynthesis catalysed by the Pdx1 PLP synthase
auteur
Matthew J Rodrigues, Nitai Giri, Antoine Royant, Yang Zhang, Rachel Bolton, Gwyndaf Evans, Steve E Ealick, Tadhg Begley, Ivo Tews
article
RSC Chemical Biology, 2022, 3 (2), pp.227-230. ⟨10.1039/D1CB00160D⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03411231/file/Rodrigues_RSCChemBiol_2021_Pdx1.3_I333_formatted-online.pdf BibTex

2021

titre
An enzymatic activation of formaldehyde for nucleotide methylation
auteur
Charles Bou-Nader, Frederick W Stull, Ludovic Pecqueur, Philippe Simon, Vincent Guérineau, Antoine Royant, Marc Fontecave, Murielle Lombard, Bruce A Palfey, Djemel Hamdane
article
Nature Communications, 2021, 12, pp.4542. ⟨10.1038/s41467-021-24756-8⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-03343627/file/s41467-021-24756-8.pdf BibTex
titre
Crystallization of Proteins on Chip by Microdialysis for In Situ X-ray Diffraction Studies
auteur
Sofia Jaho, Niels Junius, Franck Borel, Yoann Sallaz-Damaz, Jean-Baptiste Salmon, Monika Budayova-Spano
article
Journal of visualized experiments : JoVE, 2021, 170, ⟨10.3791/61660⟩
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titre
LEAFY protein crystals with a honeycomb structure as a platform for selective preparation of outstanding stable bio-hybrid materials
auteur
Lucile Chiari, Philippe Carpentier, Sylvie Kieffer-Jaquinod, Alice Gogny, Julien Pérard, Stéphane Ravanel, David Cobessi, Stéphane Ménage, Renaud Dumas, Olivier Hamelin
article
Nanoscale, 2021, 13 (19), pp.8901-8908. ⟨10.1039/d1nr00268f⟩
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titre
Mechanism and dynamics of fatty acid photodecarboxylase
auteur
Damien Sorigué, Kyprianos Hadjidemetriou, S. Blangy, G. Gotthard, A. Bonvalet, Nicolas Coquelle, P. Samire, Alexey Aleksandrov, L. Antonucci, A. Benachir, S. Boutet, Martin Byrdin, Marco Cammarata, S. Carbajo, Stephan Cuine, R. Doak, L. Foucar, A. Gorel, M. Grünbein, E. Hartmann, Rainer Hienerwadel, M. Hilpert, M. Kloos, T. Lane, B. Légeret, P. Legrand, Y. Li-Beisson, S. Moulin, D. Nurizzo, G. Peltier, Giorgio Schirò, R. Shoeman, M. Sliwa, X. Solinas, B. Zhuang, T. Barends, Jacques-Philippe Colletier, M. Joffre, Antoine Royant, C. Berthomieu, Martin Weik, T. Domratcheva, K. Brettel, Marten H. Vos, I. Schlichting, Pascal Arnoux, P. Müller, F. Beisson
article
Science, 2021, 372 (6538), pp.eabd5687. ⟨10.1126/science.abd5687⟩
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titre
Optimization of Crystal Growth for Neutron Macromolecular Crystallography
auteur
Elham Vahdatahar, Niels Junius, Monika Budayova-Spano
article
Journal of visualized experiments : JoVE, 2021, 169, ⟨10.3791/61685⟩
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titre
The Plastid-Encoded RNA Polymerase-Associated Protein PAP9 Is a Superoxide Dismutase With Unusual Structural Features
auteur
Adrien Favier, Pierre Gans, Elisabetta Boeri Erba, Luca Signor, Soumiya Sankari Muthukumar, Thomas Pfannschmidt, Robert Blanvillain, David Cobessi
article
Frontiers in Plant Science, 2021, 12, pp.668897. ⟨10.3389/fpls.2021.668897⟩
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titre
Ultrafast structural changes within a photosynthetic reaction centre
auteur
Robert Dods, Petra Båth, Dmitry Morozov, Viktor Ahlberg Gagnér, David Arnlund, Hoi Ling Luk, Joachim Kübel, Michał Maj, Adams Vallejos, Cecilia Wickstrand, Robert Bosman, Kenneth R Beyerlein, Garrett Nelson, Mengning Liang, Despina Milathianaki, Joseph Robinson, Rajiv Harimoorthy, Peter Berntsen, Erik Malmerberg, Linda Johansson, Rebecka Andersson, Sergio Carbajo, Elin Claesson, Chelsie E Conrad, Peter Dahl, Greger Hammarin, Mark S Hunter, Chufeng Li, Stella Lisova, Antoine Royant, Cecilia Safari, Amit Sharma, Garth J Williams, Oleksandr Yefanov, Sebastian Westenhoff, Jan Davidsson, Daniel P Deponte, Sébastien Boutet, Anton Barty, Gergely Katona, Gerrit Groenhof, Gisela Brändén, Richard Neutze
article
Nature, 2021, 589, pp.310-314
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2020

titre
A microfluidic device for both on-chip dialysis protein crystallization and in situ X-ray diffraction
auteur
Niels Junius, Sofia Jaho, Yoann Sallaz-Damaz, Franck Borel, Jean-Baptiste Salmon, Monika Budayova-Spano
article
Lab on a Chip, 2020, 20 (2), pp.296-310. ⟨10.1039/C9LC00651F⟩
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titre
Aequorea's secrets revealed: New fluorescent proteins with unique properties for bioimaging and biosensing
auteur
Gerard G. Lambert, Hadrien Depernet, Guillaume Gotthard, Darrin T. Schultz, Isabelle Navizet, Talley Lambert, Stephen R. Adams, Albertina Torreblanca-Zanca, Meihua Chu, Daphne S. Bindels, Vincent Levesque, Jennifer Nero Moffat, Anya Salih, Antoine Royant, Nathan C. Shaner
article
PLoS Biology, 2020, 18 (11), pp.e3000936. ⟨10.1371/journal.pbio.3000936⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03015356/file/journal.pbio.3000936.pdf BibTex
titre
Characterization of a bacterial copper‐dependent lytic polysaccharide monooxygenase with an unusual second coordination sphere
auteur
Alessia Munzone, Bilal El Kerdi, Mathieu Fanuel, Hélène Rogniaux, David Ropartz, Marius Réglier, Antoine Royant, A. Jalila Simaan, Christophe Decroos
article
FEBS Journal, 2020, 287 (15), pp.3298-3314. ⟨10.1111/febs.15203⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02467531/file/HAL_PlAA10_FEBS_Journal.pdf BibTex
titre
ID30A-3 (MASSIF-3) – a beamline for macromolecular crystallography at the ESRF with a small intense beam
auteur
David von Stetten, Philippe Carpentier, David Flot, Antonia Beteva, Hugo Caserotto, Fabien Dobias, Matias Guijarro, Thierry Giraud, Mario Lentini, Sean Mcsweeney, Antoine Royant, Sébastien Petitdemange, Jeremy Sinoir, John Surr, Olof Svensson, Pascal Théveneau, Gordon Leonard, Christoph Mueller-Dieckmann
article
Journal of Synchrotron Radiation, 2020, 27 (3), pp.844-851. ⟨10.1107/S1600577520004002⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-02864606/file/ig5090.pdf BibTex
titre
Large crystal growth for neutron protein crystallography
auteur
Monika Budayova-Spano, Katarina Koruza, Zoë Fisher
article
Methods in Enzymology, 2020, 634, pp.21-46. ⟨10.1016/bs.mie.2019.11.015⟩
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BibTex
titre
Millisecond time-resolved serial oscillation crystallography of a blue-light photoreceptor at a synchrotron
auteur
Sylvain Aumonier, Gianluca Santoni, Guillaume Gotthard, David von Stetten, Gordon A. Leonard, Antoine Royant
article
International Union of Crystallography journal, 2020, 7 (4), pp.728-736. ⟨10.1107/S2052252520007411⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03014981/file/mf5042.pdf BibTex
titre
Mixing Salts and Poly(ethylene glycol) into Protein Solutions: The Effects of Diffusion across Semipermeable Membranes and of Convection
auteur
Virginia Apostolopoulou, Niels Junius, Richard Sear, Monika Budayova-Spano
article
Crystal Growth & Design, 2020, 20 (6), pp.3927-3936. ⟨10.1021/acs.cgd.0c00246⟩
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BibTex
titre
Molecular mechanism of light-driven sodium pumping
auteur
Kirill Kovalev, Roman Astashkin, Ivan Gushchin, Philipp Orekhov, Dmytro Volkov, Egor Zinovev, Egor Marin, Maksim Rulev, Alexey Alekseev, Antoine Royant, Philippe Carpentier, Dmitrii Zabelskii, Christian Baeken, Ilya Sergeev, Taras Balandin, Gleb Bourenkov, Xavier Carpena, Roeland Boer, Nina Maliar, Valentin Borshchevskiy, Georg Büldt, Ernst Bamberg, Valentin I. Gordeliy
article
Nature Communications, 2020, 11 (1), pp.2137. ⟨10.1038/s41467-020-16032-y⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-02864661/file/Kovalev%20et%20al.%20Nature%20Comm.pdf BibTex
titre
Nucleo‐plastidic PAP 8/ pTAC 6 couples chloroplast formation with photomorphogenesis
auteur
Monique Liebers, François-Xavier Gillet, Abir Israel, Kevin Pounot, Louise Chambon, Maha Chieb, Fabien Chevalier, Rémi Ruedas, Adrien Favier, Pierre Gans, Elisabetta Boeri Erba, David Cobessi, Thomas Pfannschmidt, Robert Blanvillain
article
EMBO Journal, 2020, 39 (22), pp.e104941. ⟨10.15252/embj.2020104941⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-02972660/file/Liebers%20preprint.pdf BibTex
titre
Observing protein degradation by the PAN-20S proteasome by time-resolved neutron scattering
auteur
Emilie Mahieu, Jacques Covès, Georg Krüger, Anne Martel, Martine Moulin, Nico Carl, Michael Härtlein, Teresa Carlomagno, Bruno Franzetti, Frank Gabel
article
Biophysical Journal, 2020, 119 (2), pp.375-388. ⟨10.1016/j.bpj.2020.06.015⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-03456352/file/S0006349520304896.pdf BibTex
titre
Optimization of crystallization of biological macromolecules using dialysis combined with temperature control
auteur
Niels Junius, Elham Vahdatahar, Esko Oksanen, Jean-Luc Ferrer, Monika Budayova-Spano
article
Journal of Applied Crystallography, 2020, 53 (3), pp.686-698. ⟨10.1107/S1600576720003209⟩
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2019

titre
Dynamics of a family of cyan fluorescent proteins probed by incoherent neutron scattering
auteur
Maksym Golub, Virginia Guillon, Guillaume Gotthard, Dominik Zeller, Nicolas Martinez, Tilo Seydel, Michael M Koza, Céline Lafaye, Damien Clavel, David von Stetten, Antoine Royant, Judith Peters
article
Journal of the Royal Society Interface, 2019, 16 (152), pp.20180848. ⟨10.1098/rsif.2018.0848⟩
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BibTex
titre
Dynamics of a family of cyan fluorescent proteins probed by incoherent neutron scattering
auteur
Maksym Golub, Virginia Guillon, Guillaume Gotthard, Dominik Zeller, Nicolas Martinez, Tilo Seydel, Michael Koza, Céline Lafaye, Damien Clavel, David von Stetten, Antoine Royant, Judith Peters
article
Journal of the Royal Society Interface, 2019, 16 (152), pp.20180848. ⟨10.1098/rsif.2018.0848⟩
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BibTex
titre
Specific radiation damage is a lesser concern at room temperature
auteur
Guillaume Gotthard, Sylvain Aumonier, Daniele de Sanctis, Gordon Leonard, David von Stetten, Antoine Royant
article
International Union of Crystallography journal, 2019, 6 (4), pp.665-680. ⟨10.1107/S205225251900616X⟩
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BibTex
titre
Structure Solution of the Fluorescent Protein Cerulean Using MeshAndCollect
auteur
Stephanie Hutin, Gianluca Santoni, Ulrich Zander, Nicolas Foos, Sylvain Aumonier, Guillaume Gotthard, Antoine Royant, Christoph Mueller-Dieckmann, Gordon Leonard
article
Journal of visualized experiments : JoVE, 2019, 145, ⟨10.3791/58594⟩
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BibTex
titre
Tailing miniSOG: structural bases of the complex photophysics of a flavin-binding singlet oxygen photosensitizing protein
auteur
Joaquim Torra, Céline Lafaye, Luca Signor, Sylvain Aumonier, Cristina Flors, Xiaokun Shu, Santi Nonell, Guillaume Gotthard, Antoine Royant
article
Scientific Reports, 2019, 9 (1), pp.2428-1-2428-10. ⟨10.1038/s41598-019-38955-3⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02306813/file/Scientific_Reports_9_2428.pdf BibTex
titre
Tyrosine metabolism: identification of a key residue in the acquisition of prephenate aminotransferase activity by 1β aspartate aminotransferase
auteur
Cécile Giustini, Matthieu Graindorge, David Cobessi, Serge Crouzy, Adeline Robin, Gilles Curien, Michel Matringe
article
FEBS Journal, 2019, 286 (11), pp.2118-2134. ⟨10.1111/febs.14789⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02093098/file/Giustini%20et%20all%20corrected%20_.pdf BibTex

2018

titre
Global spectroscopic analysis to study the regulation of the photosynthetic proton motive force: A critical reappraisal
auteur
Guillaume Allorent, Martin Byrdin, Luca Carraretto, Tomas Morosinotto, Ildikó Szabó, Giovanni Finazzi
article
Biochimica biophysica acta (BBA) - Bioenergetics, 2018, 1859 (9), pp.676-683. ⟨10.1016/j.bbabio.2018.07.001⟩
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BibTex
titre
Synthesis and Kinetic evaluation of an azido analogue of methylerythritol phosphate: a Novel Inhibitor of E. coli YgbP/IspD
auteur
Zoljargal Baatarkhuu, Philippe Chaignon, Franck Borel, Jean-Luc Ferrer, Alain Wagner, Myriam Seemann
article
Scientific Reports, 2018, 8 (1), pp.17892. ⟨10.1038/s41598-018-35586-y⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02007734/file/islandora_78270.pdf BibTex

2017

titre
Chromophore Isomer Stabilization Is Critical to the Efficient Fluorescence of Cyan Fluorescent Proteins
auteur
Guillaume Gotthard, David von Stetten, Damien Clavel, Marjolaine Noirclerc-Savoye, Antoine Royant
article
Biochemistry, 2017, 56 (49), pp.6418 - 6422. ⟨10.1021/acs.biochem.7b01088⟩
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BibTex
titre
Crystal Structure of the Chloroplastic Oxoene Reductase ceQORH from Arabidopsis thaliana
auteur
Sarah Mas y Mas, Gilles Curien, Cécile Giustini, Norbert Rolland, Jean-Luc Ferrer, David Cobessi
article
Frontiers in Plant Science, 2017, 8, pp.329. ⟨10.3389/fpls.2017.00329⟩
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BibTex
titre
Further Insight into Crystal Structures of Escherichia coli IspH/LytB in Complex with Two Potent Inhibitors of the MEP Pathway: A Starting Point for Rational Design of New Antimicrobials
auteur
Franck Borel, Elodie Barbier, Sergiy Krasutsky, Karnjapan Janthawornpong, Philippe Chaignon, C. Dale Poulter, Jean-Luc Ferrer, Myriam Seemann
article
ChemBioChem, 2017, 18 (21), pp.2137 - 2144. ⟨10.1002/cbic.201700363⟩
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Lysine relay mechanism coordinates intermediate transfer in vitamin B6 biosynthesis.
auteur
Matthew J Rodrigues, Volker Windeisen, Yang Zhang, Gabriela Guédez, Stefan Weber, Marco Strohmeier, Jeremiah W Hanes, Antoine Royant, Gwyndaf Evans, Irmgard Sinning, Steven E Ealick, Tadhg P Begley, Ivo Tews
article
Nature Chemical Biology, 2017, 13 (3), pp.290-294. ⟨10.1038/nchembio.2273⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-01487798/file/Rodr.pdf BibTex
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Molecular characterization of Netrin-1 and APP receptor binding: New leads to block the progression of senile plaques in Alzheimer's disease.
auteur
Franck Borel, Fanny Marzocca, Jean-Guy Delcros, Nicolas Rama, Patrick Mehlen, Jean-Luc Ferrer
article
Biochemical and Biophysical Research Communications, 2017, 488 (3), pp.466-470. ⟨10.1016/j.bbrc.2017.05.056⟩
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mScarlet: a bright monomeric red fluorescent protein for cellular imaging.
auteur
Daphne S Bindels, Lindsay Haarbosch, Laura van Weeren, Marten Postma, Katrin E Wiese, Marieke Mastop, Sylvain Aumonier, Guillaume Gotthard, Antoine Royant, Mark A Hink, Theodorus W J Gadella
article
Nature Methods, 2017, 14 (1), pp.53-56. ⟨10.1038/nmeth.4074⟩
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Online Raman spectroscopy for structural biology on beamline ID29 of the ESRF
auteur
David von Stetten, Thierry Giraud, Soi Bui, Roberto Steiner, François Fihman, Daniele de Sanctis, Antoine Royant
article
Journal of Structural Biology, 2017, 200 (2), pp.124 - 127. ⟨10.1016/j.jsb.2017.10.004⟩
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Precision Optogenetic Tool for Selective Single- and Multiple-Cell Ablation in a Live Animal Model System.
auteur
Kalpana Makhijani, Tsz-Leung To, Rubén Ruiz-González, Céline Lafaye, Antoine Royant, Xiaokun Shu
article
Cell Chemical Biology, 2017, 24 (1), pp.110-119. ⟨10.1016/j.chembiol.2016.12.010⟩
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titre
WIFIP : a web-based user interface for automated synchrotron beamlines
auteur
Yoann Sallaz-Damaz, Jean-Luc Ferrer
article
Journal of Synchrotron Radiation, 2017, 24 (5), pp.1105 - 1111. ⟨10.1107/S1600577517009080⟩
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2016

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A crystallization apparatus for temperature-controlled flow-cell dialysis with real-time visualization.
auteur
Niels Junius, Esko Oksanen, Maxime Terrien, Christophe Berzin, Jean-Luc Ferrer, Monika Budayova-Spano
article
Journal of Applied Crystallography, 2016, 49 (3), pp.806-813. ⟨10.1107/S1600576716004635⟩
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A three-dimensional movie of structural changes in bacteriorhodopsin.
auteur
Eriko Nango, Antoine Royant, Minoru Kubo, Takanori Nakane, Cecilia Wickstrand, Tetsunari Kimura, Tomoyuki Tanaka, Kensuke Tono, So Song, Rie Tanaka, Toshi Arima, Ayumi Yamashita, Jun Kobayashi, Toshiaki Hosaka, Eiichi Mizohata, Przemyslaw Nogly, Michihiro Sugahara, Daewoong Nam, Takashi Nomura, Tatsuro Shimamura, Dohyun Im, Takaaki Fujiwara, Yasuaki Yamanaka, Byeonghyun Jeon, Tomohiro Nishizawa, Kazumasa Oda, Masahiro Fukuda, Rebecka Andersson, Petra Båth, Robert Dods, Jan Davidsson, Shigeru Matsuoka, Satoshi Kawatake, Michio Murata, Osamu Nureki, Shigeki Owada, Takashi Kameshima, Takaki Hatsui, Yasumasa Joti, Gebhard Schertler, Makina Yabashi, Ana-Nicoleta Bondar, Jörg Standfuss, Richard Neutze, So Iwata
article
Science, 2016, 354 (6319), pp.1552-1557. ⟨10.1126/science.aah3497⟩
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De novo phasing with X-ray laser reveals mosquito larvicide BinAB structure.
auteur
Jacques-Philippe Colletier, Michael R Sawaya, Mari Gingery, Jose A Rodriguez, Duilio Cascio, Aaron S Brewster, Tara Michels-Clark, Robert H Hice, Nicolas Coquelle, S Boutet, Gj William, M Messerschmidt, Dp Deponte, Rg Sierra, H Laksmono, Je Koglin, Ms Hunter, Hyun-Woo Park, Monarin Uervirojnangkoorn, Dennis K Bideshi, Axel T Brunger, Brian A Federici, Nicholas K Sauter, David S Eisenberg
article
Nature, 2016, 539 (7627), pp.43-47. ⟨10.1038/nature19825⟩
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Gas-sensitive biological crystals processed in pressurized oxygen and krypton atmospheres: deciphering gas channels in proteins using a novel `soak-and-freeze' methodology
auteur
Bénédicte Lafumat, Christoph Mueller-Dieckmann, Gordon Leonard, Nathalie Colloc'H, Thierry Prangé, Thierry Giraud, Fabien Dobias, Antoine Royant, Peter van Der Linden, Philippe Carpentier
article
Journal of Applied Crystallography, 2016, 49 (5), pp.1478 - 1487. ⟨10.1107/S1600576716010992⟩
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Rational design of a monomeric and photostable far-red fluorescent protein for fluorescence imaging in vivo
auteur
Dan Yu, Zhiqiang Dong, William Clay Gustafson, Rubén Ruiz-González, Luca Signor, Fanny Marzocca, Franck Borel, Matthew P. Klassen, Kalpana Makhijani, Antoine Royant, Yuh-Nung Jan, William A. Weiss, Su Guo, Xiaokun Shu
article
Protein Science, 2016, 25 (2), pp.308-315. ⟨10.1002/pro.2843⟩
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Serial femtosecond crystallography and ultrafast absorption spectroscopy of the photoswitchable fluorescent protein IrisFP
auteur
Jacques-Philippe Colletier, M. Sliwa, François-Xavier Gallat, M. Sugahara, Virginia Guillon, Giorgio Schirò, Nicolas Coquelle, Joyce Woodhouse, Laure Roux, Guillaume Gotthard, Antoine Royant, L. Martinez Uriarte, C. Ruckebusch, Y. Joti, Martin Byrdin, E. Mizohata, E. Nango, T. Tanaka, K. Tono, M. Yabashi, Virgile Adam, Marco Cammarata, I. Schlichting, Dominique Bourgeois, Martin Weik
article
Journal of Physical Chemistry Letters, 2016, 7 (5), pp.882 - 887. ⟨10.1021/acs.jpclett.5b02789⟩
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Structural analysis of the bright monomeric yellow-green fluorescent protein mNeonGreen obtained by directed evolution.
auteur
Damien Clavel, Guillaume Gotthard, David von Stetten, Daniele de Sanctis, Hélène Pasquier, Gerard G Lambert, Nathan C Shaner, Antoine Royant
article
Acta crystallographica Section D : Structural biology [1993-..], 2016, 72 (12), pp.1298-1307. ⟨10.1107/S2059798316018623⟩
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Structural Determinants of Improved Fluorescence in a Family of Bacteriophytochrome-Based Infrared Fluorescent Proteins: Insights from Continuum Electrostatic Calculations and Molecular Dynamics Simulations
auteur
Mikolaj Feliks, Céline Lafaye, Xiaokun Shu, Antoine Royant, Martin J Field
article
Biochemistry, 2016, 55 (31), pp.4263 - 4274. ⟨10.1021/acs.biochem.6b00295⟩
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The chloroplast membrane associated ceQORH putative quinone oxidoreductase reduces long-chain, stress-related oxidized lipids.
auteur
Gilles Curien, Cécile Giustini, Jean-Luc Montillet, Sarah Mas y Mas, David Cobessi, Jean-Luc Ferrer, Michel Matringe, Alexander Grechkin, Norbert Rolland
article
Phytochemistry, 2016, 122, pp.45-55. ⟨10.1016/j.phytochem.2015.11.015⟩
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2015

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Analytical ultracentrifugation and preliminary X-ray studies of the chloroplast envelope quinone oxidoreductase homologue from Arabidopsis thaliana.
auteur
Sarah Mas y Mas, Cécile Giustini, Jean-Luc Ferrer, Norbert Rolland, Gilles Curien, David Cobessi
article
Acta crystallographica Section F : Structural biology communications [2014-..], 2015, 71 (Pt 4), pp.455-458. ⟨10.1107/S2053230X1500480X⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01143277/file/Mas%20y%20Mas%20S.%20-%20Acta%20Crystallographica%20F%202015.pdf BibTex
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Combining 'dry' co-crystallization and in situ diffraction to facilitate ligand screening by X-ray crystallography.
auteur
Muriel Gelin, Vanessa Delfosse, Frédéric Allemand, François Hoh, Yoann Sallaz-Damaz, Michel Pirocchi, William Bourguet, Jean-Luc Ferrer, Gilles Labesse, Jean François Guichou
article
Acta crystallographica Section D : Structural biology [1993-..], 2015, 71 (Pt 8), pp.1777-87. ⟨10.1107/S1399004715010342⟩
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In crystallo optical spectroscopy (icOS) as a complementary tool on the macromolecular crystallography beamlines of the ESRF.
auteur
David von Stetten, Thierry Giraud, Philippe Carpentier, Franc Sever, Maxime Terrien, Fabien Dobias, Douglas H Juers, David Flot, Christoph Mueller-Dieckmann, Gordon A Leonard, Daniele de Sanctis, Antoine Royant
article
Acta crystallographica Section D : Structural biology [1993-..], 2015, 71 (Pt 1), pp.15-26
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Structural analysis of a feline norovirus protruding domain.
auteur
Bishal K Singh, Sebastian Glatt, Jean-Luc Ferrer, Anna D Koromyslova, Mila M Leuthold, Jessica Dunder, Grant S Hansman
article
Virology, 2015, 474, pp.181-5
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Structural Basis of Why Nelfinavir-Resistant D30N Mutant of HIV-1 Protease Remains Susceptible to Saquinavir.
auteur
Vishal Prashar, Subhash C Bihani, Jean-Luc Ferrer, Madhusoodan V Hosur
article
Chemical Biology and Drug Design, 2015, pp.doi: 10.1111
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The status of the macromolecular crystallography beamlines at the European Synchrotron Radiation Facility
auteur
Christoph Mueller-Dieckmann, Matthew W. Bowler, Philippe Carpentier, David Flot, Andrew A. Mccarthy, Max H. Nanao, Didier Nurizzo, Petra Pernot, Alexander Popov, Adam Round, Antoine Royant, Daniele de Sanctis, David von Stetten, Gordon A. Leonard
article
The European Physical Journal Plus, 2015, 130 (70), ⟨10.1140/epjp/i2015-15070-0⟩
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2014

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Biochemical and biophysical characterization of the selenium-binding and reducing site in Arabidopsis thaliana homologue to mammals selenium-binding protein 1.
auteur
Florie Schild, Sylvie Kieffer-Jacquinot, Andrés Palencia, David Cobessi, Géraldine Sarret, Chloé Zubieta, Agnés Jourdain, Renaud Dumas, Vincent Forge, Denis Testemale, Jacques Bourguignon, Véronique Hugouvieux
article
Journal of Biological Chemistry, 2014, 289 (46), pp.31765-31776. ⟨10.1074/jbc.M114.571208⟩
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https://hal.science/hal-01108713/file/2014_Schild_Journal%20of%20Biological%20Chemistry_1.pdf BibTex
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Crystal structure of mouse mu-crystallin complexed with NADPH and the T3 thyroid hormone.
auteur
Franck Borel, Isma Hachi, Andres Palencia, Marie-Claude Gaillard, Jean-Luc Ferrer
article
FEBS Journal, 2014, 281 (6), pp.1598-612
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titre
The neutron structure of urate oxidase resolves a long-standing mechanistic conundrum and reveals unexpected changes in protonation.
auteur
Esko Oksanen, Matthew P Blakeley, Mohamed El-Hajji, Ulf Ryde, Monika Budayova-Spano
article
PLoS ONE, 2014, 9 (1), pp.e86651
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