Publications HAL de la structure 1057997;1043261;552920

2022

titre
Genome-wide screen in human plasma identifies multifaceted complement evasion of Pseudomonas aeruginosa
auteur
Manon Janet-Maitre, Stéphane Pont, Frerich Masson, Serena Sleiman, Julian Trouillon, Mylène Robert-Genthon, Benoît Gallet, Chantal Dumestre-Perard, Sylvie Elsen, Christine Moriscot, Bart Bardoel, Suzan Rooijakkers, François Cretin, Ina Attrée
article
PLoS Pathogens, 2022, 1386 (1), pp.325-345. ⟨10.1371/journal.ppat.1011023⟩
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titre
Genomic erosion and horizontal gene transfer shape functional differences of the ExlA toxin in Pseudomonas spp.
auteur
Viviana Job, Laura Gomez-Valero, Adèle Renier, Christophe Rusniok, Stephanie Bouillot, Viviane Chenal-Francisque, Erwan Gueguen, Annie Adrait, Mylène Robert-Genthon, Katy Jeannot, Peter Panchev, Sylvie Elsen, Marie-Odile Fauvarque, Yohann Couté, Carmen Buchrieser, Ina Attrée
article
iScience, 2022, 25 (7), pp.104596. ⟨10.1016/j.isci.2022.104596⟩
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https://hal.science/hal-03725826/file/1-s2.0-S2589004222008689-main.pdf BibTex
titre
The core and accessory Hfq interactomes across Pseudomonas aeruginosa lineages
auteur
Julian Trouillon, Kook Han, Ina Attrée, Stephen Lory
article
Nature Communications, 2022, 13 (1), pp.1258. ⟨10.1038/s41467-022-28849-w⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03813894/file/Trouillon%20et%20al.%2C%202022%2C%20Nat%20Comm.pdf BibTex

2021

titre
Determination of the two-component systems regulatory network reveals core and accessory regulations across Pseudomonas aeruginosa lineages
auteur
Julian Trouillon, Lionel Imbert, Anne-Marie Villard, Thierry Vernet, Ina Attrée, Sylvie Elsen
article
Nucleic Acids Research, 2021, 49 (20), pp.11476-11490. ⟨10.1093/nar/gkab928⟩
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https://hal.science/hal-03463808/file/Trouillon%20et%20al.%20NAR.pdf BibTex
titre
Electrochemical detection of redox molecules secreted by Pseudomonas aeruginosa – Part 1: Electrochemical signatures of different strains
auteur
Julie Oziat, Thibaut Cohu, Sylvie Elsen, Maxime Gougis, George Malliaras, Pascal Mailley
article
Bioelectrochemistry, 2021, 140, pp.107747. ⟨10.1016/j.bioelechem.2021.107747⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-03518178/file/Oziat%20et%20al%20Bioelectrochem.pdf BibTex
titre
ExlA pore-forming toxin: localization at the bacterial membrane, regulation of secretion by cyclic-Di-GMP, and detection in vivo
auteur
Vincent Deruelle, Alice Berry, Stéphanie Bouillot, Viviana Job, Antoine Maillard, Sylvie Elsen, Philippe Huber
article
Toxins, 2021, 13 (9), pp.645. ⟨10.3390/toxins13090645⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03356365/file/deru1.pdf BibTex
titre
Host phospholipid peroxidation fuels ExoU-dependent cell necrosis and supports $Pseudomonas\ aeruginosa$-driven pathology
auteur
Salimata Bagayoko, Stephen Adonai Leon-Icaza, Miriam Pinilla, Audrey Hessel, Karin Santoni, David Péricat, Pierre-Jean Bordignon, Flavie Moreau, Elif Eren, Aurélien Boyancé, Emmanuelle Naser, Lise Lefèvre, Céline Berrone, Nino Iakobachvili, Arnaud Metais, Yoann Rombouts, Geanncarlo Lugo-Villarino, Agnès Coste, Ina Attrée, Dara W. Frank, Hans Clevers, Peter J. Peters, Céline Cougoule, Rémi Planès, Etienne Meunier
article
PLoS Pathogens, 2021, 17 (9), pp.e1009927. ⟨10.1371/journal.ppat.1009927⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03355818/file/bagay1.pdf BibTex
titre
MagC is a NplC/P60‐like member of the $\alpha$‐2‐macroglobulin Mag complex of $Pseudomonas\ aeruginosa$ that interacts with peptidoglycan
auteur
Samira Zouhir, Carlos Contreras‐martel, Daniel Maragno Trindade, Ina Attrée, Andréa Dessen, Pauline Macheboeuf
article
FEBS Letters, 2021, ⟨10.1002/1873-3468.14148⟩
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titre
Metabotypes of Pseudomonas aeruginosa Correlate with Antibiotic Resistance, Virulence and Clinical Outcome in Cystic Fibrosis Chronic Infections
auteur
Oriane Moyne, Florence Castelli, Dominique Bicout, Julien Boccard, Boubou Camara, Benoit Cournoyer, Eric Faudry, Samuel Terrier, Dalil Hannani, Sarah Huot-Marchand, Claire Léger, Max Maurin, Tuan-Dung Ngo, Caroline Plazy, Robert Quinn, Ina Attrée, François Fenaille, Bertrand Toussaint, Audrey Le Gouëllec
article
Metabolites, 2021, 11 (2), ⟨10.3390/metabo11020063⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03146820/file/Moyne%20et%20al.%20v2%202021.pdf BibTex
titre
Self-association of MreC as a regulatory signal in bacterial cell wall elongation
auteur
Alexandre Martins, Carlos Contreras-Martel, Manon Janet-Maitre, Mayara Miyachiro, Leandro Estrozi, Daniel Maragno Trindade, Caíque Malospirito, Fernanda Rodrigues-Costa, Lionel Imbert, Viviana Job, Guy Schoehn, Ina Attrée, Andréa Dessen
article
Nature Communications, 2021, 12 (1), pp.2987. ⟨10.1038/s41467-021-22957-9⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03369436/file/2021Martins.pdf BibTex
titre
The bacterial toxin ExoU requires a host trafficking chaperone for transportation and to induce necrosis
auteur
Vincent Deruelle, Stéphanie Bouillot, Viviana Job, Emmanuel Taillebourg, Marie-Odile Fauvarque, Ina Attrée, Philippe Huber
article
Nature Communications, 2021, 12 (1), ⟨10.1038/s41467-021-24337-9⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03280070/file/Deruelle_et_al-2021-Nature_Communications.pdf BibTex
titre
The biosynthetic pathway of ubiquinone contributes to pathogenicity of Francisella Running title: Ubiquinone and Francisella pathogenicity
auteur
Katayoun Kazemzadeh, Mahmoud Hajj Chehade, Gautier Hourdoir, Camille Dorothée Brunet, Yvan Caspar, Laurent Loiseau, Frederic Barras, Fabien Pierrel, Ludovic Pelosi
article
Journal of Bacteriology, 2021, ⟨10.1128/JB.00400-21⟩
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https://hal.science/hal-03357541/file/JB00400-21R1-Merged_PDF.pdf BibTex
titre
Transcription Inhibitors with XRE DNA-Binding and Cupin Signal-Sensing Domains Drive Metabolic Diversification in Pseudomonas
auteur
Julian Trouillon, Michel Ragno, Victor Simon, Ina Attrée, Sylvie Elsen
article
mSystems, 2021, 6 (1), ⟨10.1128/mSystems.00753-20⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03112373/file/mSystems-2021-Trouillon-.full.pdf BibTex
titre
Vfr or CyaB promote the expression of the pore-forming toxin exlBA operon in Pseudomonas aeruginosa ATCC 9027 without increasing its virulence in mice
auteur
Selene García-Reyes, Dina Moustafa, Ina Attrée, Joanna Goldberg, Sara Quiroz-Morales, Gloria Soberón-Chávez
article
Microbiology, 2021, 167 (8), ⟨10.1099/mic.0.001083⟩
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2020

titre
Bacterial behavior in human blood reveals complement evaders with some persister-like features
auteur
Stéphane Pont, Nathan Fraikin, Yvan Caspar, Laurence van Melderen, Ina Attrée, François Cretin
article
PLoS Pathogens, 2020, 16 (12), pp.e1008893. ⟨10.1371/journal.ppat.1008893⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03112360/file/journal.ppat.1008893%20%281%29.pdf BibTex
titre
Species-specific recruitment of transcription factors dictates toxin expression
auteur
Julian Trouillon, Erwin Sentausa, Michel Ragno, Mylène Robert-Genthon, Stephen Lory, Ina Attree, Sylvie Elsen
article
Nucleic Acids Research, 2020, 48 (5), pp.2388-2400. ⟨10.1093/nar/gkz1232⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02497500/file/2020%20Transcription%20factors_%20JT%26SE_NAR.pdf BibTex
titre
The O2-independent pathway of ubiquinone biosynthesis is essential for denitrification in Pseudomonas aeruginosa
auteur
Chau-Duy-Tam Vo, Julie Michaud, Sylvie Elsen, Bruno Faivre, Emmanuelle Bouveret, Frédéric Barras, Marc Fontecave, Fabien Pierrel, Murielle Lombard, Ludovic Pelosi
article
Journal of Biological Chemistry, 2020, 295 (27), pp.9021-9032. ⟨10.1074/jbc.RA120.013748⟩
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https://hal-pasteur.archives-ouvertes.fr/pasteur-02746713/file/Manuscript%20JBC%20Pseudo%20final.pdf BibTex
titre
The PopN gate-keeper complex acts on the ATPase PscN to regulate the T3SS secretion switch from early to middle substrates in Pseudomonas aeruginosa
auteur
Tuan Dung Ngo, Caroline Perdu, Bakhos Jneid, Michel Ragno, Julia Novion Ducassou, Alexandra Kraut, Yohann Couté, Charles Stopford, Ina Attrée, Arne Rietsch, Eric Faudry
article
Journal of Molecular Biology, 2020, ⟨10.1016/j.jmb.2020.10.024⟩
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titre
Trophic cooperation promotes bacterial survival of Staphylococcus aureus and Pseudomonas aeruginosa.
auteur
Laura Camus, Paul Briaud, Sylvère Bastien, Sylvie Elsen, Anne Doléans-Jordheim, François Vandenesch, Karen Moreau
article
ISME Journal, In press
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02964539/file/2020%20Camus%20et%20al..pdf BibTex

2019

titre
An unusual community-acquired invasive and multi systemic infection due to ExoU-harboring Pseudomonas aeruginosa strain: Clinical disease and microbiological characteristics
auteur
Alexandre Elabbadi, Stéphane Pont, Charlotte Verdet, Patrick Plésiat, François Cretin, Guillaume Voiriot, Muriel Fartoukh, Michel Djibré
article
Journal of Microbiology, Immunology and Infection, In press, ⟨10.1016/j.jmii.2019.06.008⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02345592/file/Elabbadi%20A%2C%20et%20al%2C%202019.pdf BibTex
titre
Baseplate Component TssK and Spatio-Temporal Assembly of T6SS in Pseudomonas aeruginosa
auteur
David Liebl, Mylène Robert-Genthon, Viviana Job, Valentina Cogoni, Ina Attree
article
Frontiers in Microbiology, 2019, 10, ⟨10.3389/fmicb.2019.01615⟩
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titre
Chimeric Protein–Protein Interface Inhibitors Allow Efficient Inhibition of Type III Secretion Machinery and Pseudomonas aeruginosa Virulence
auteur
Tuan-Dung Ngo, Sophie Plé, Aline Thomas, Caroline Barette, Antoine Fortuné, Younes Bouzidi, Marie-Odile Fauvarque, Rossimiriam Pereira de Freitas, Flaviane Francisco Hilário, Ina Attree, Yung-Sing Wong, Eric Faudry
article
ACS Infectious Diseases, 2019, 5 (11), pp.1843-1854. ⟨10.1021/acsinfecdis.9b00154⟩
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https://hal.science/hal-02318760/file/NgoACSInfectDisease2019-HALversion%20%281%29.pdf BibTex
titre
Insertion sequences drive the emergence of a highly adapted human pathogen
auteur
Erwin Sentausa, Pauline Basso, Alice Berry, Annie Adrait, Gwendoline Bellement, Stephen Lory, Sylvie Elsen, Yohann Coute, Ina Attree
article
Microbial Genomics, In press, ⟨10.1099/mgen.0.000265⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02301533/file/2019%20Sentausa%20et%20al.pdf BibTex
titre
Structural and Functional Characterization of the Type Three Secretion System (T3SS) Needle of Pseudomonas aeruginosa
auteur
Charlotte Lombardi, James Tolchard, Stéphanie Bouillot, Luca Signor, Caroline Gébus, David Liebl, Daphna Fenel, Jean-Marie Teulon, Juliane Brock, Birgit Habenstein, Jean-Luc Pellequer, Eric Faudry, Antoine Loquet, Ina Attree, Andréa Dessen, Viviana Job
article
Frontiers in Microbiology, 2019, 10 (573), ⟨10.3389/fmicb.2019.00573⟩
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titre
Structure, Function, and Evolution of the Pseudomonas aeruginosa Lysine Decarboxylase LdcA
auteur
Eaazhisai Kandiah, Diego Carriel, Pierre Simon Garcia, Jan Felix, Manuel Banzhaf, George Kritikos, Maria Bacia-Verloop, Céline Brochier-Armanet, Sylvie Elsen, Irina Gutsche
article
Structure, 2019, ⟨10.1016/j.str.2019.10.003⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02345384/file/Kandiah%20et%20al.%20Structure.pdf BibTex

2018

titre
A novel subfamily of bacterial AAT-fold basic amino acid decarboxylases and functional characterization of its first representative: Pseudomonas aeruginosa LdcA
auteur
Diego Carriel, Pierre Simon Garcia, Florence Castelli, Patricia Lamourette, François Fenaille, Céline Brochier-Armanet, Sylvie Elsen, Irina Gutsche
article
Genome Biology and Evolution, 2018, 10 (11), pp.3058-3075. ⟨10.1093/gbe/evy228⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01987296/file/2018_Cariel_Genome%20Biology%20and%20Evolution_1.pdf BibTex
titre
cAMP and Vfr Control Exolysin Expression and Cytotoxicity of Pseudomonas aeruginosa Taxonomic Outliers
auteur
Alice Berry, Kook Han, Julian Trouillon, Mylène Robert-Genthon, Michel Ragno, Stephen Lory, Ina Attree, Sylvie Elsen
article
Journal of Bacteriology, 2018, 200 (12), ⟨10.1128/jb.00135-18⟩
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titre
CLIQ-BID: A method to quantify bacteria-induced damage to eukaryotic cells by automated live-imaging of bright nuclei
auteur
Yann Wallez, Stéphanie Bouillot, Emmanuelle Soleilhac, Philippe Huber, Ina Attree, Eric Faudry
article
Scientific Reports, 2018, 8 (1), ⟨10.1038/s41598-017-18501-9⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01666808/file/2018%20Wallez%20et%20al.pdf BibTex
titre
Corrigendum: Pseudomonas aeruginosa Takes a Multi-Target Approach to Achieve Junction Breach
auteur
Guillaume Golovkine, Emeline Reboud, Philippe Huber
article
Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 2018, 8, ⟨10.3389/fcimb.2018.00052⟩
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titre
Functional Consequences of Calcium Influx Promoted by Bacterial Pore-Forming Toxins
auteur
Stéphanie Bouillot, Emeline Reboud, Philippe Huber
article
Toxins, 2018, 10 (10), pp.387. ⟨10.3390/toxins10100387⟩
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titre
Pore-forming activity of the $Pseudomonas\ aeruginosa$ type III secretion system translocon alters the host epigenome
auteur
Laurent Dortet, Charlotte Lombardi, François Cretin, Andréa Dessen, Alain Filloux
article
Nature Microbiology, 2018, 3, pp.378 - 386. ⟨10.1038/s41564-018-0109-7⟩
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titre
Pseudomonas aeruginosa Takes a Multi-Target Approach to Achieve Junction Breach
auteur
Guillaume Golovkine, Emeline Reboud, Philippe Huber
article
Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 2018, 7, ⟨10.3389/fcimb.2017.00532⟩
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2017

titre
Exolysin Shapes the Virulence of Pseudomonas aeruginosa Clonal Outliers
auteur
Emeline Reboud, Pauline Basso, Antoine Maillard, Philippe Huber, Ina Attree
article
Toxins, 2017, 9 (11), pp.364. ⟨10.3390/toxins9110364⟩
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titre
IFN-γ extends the immune functions of Guanylate Binding Proteins to inflammasome-independent antibacterial activities during Francisella novicida infection
auteur
Pierre Wallet, Sacha Benaoudia, Amandine Mosnier, Brice Lagrange, Amandine Martin, Helena Lindgren, Igor Golovliov, Fanny Michal, Pauline Basso, Sophia Djebali, Angelina Provost, Omran Allatif, Etienne Meunier, Petr Broz, Masahiro Yamamoto, Bénédicte F. Py, Eric Faudry, Anders Sjöstedt, Thomas Henry
article
PLoS Pathogens, 2017, 13 (10), pp.e1006630. ⟨10.1371/journal.ppat.1006630⟩
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titre
Multiple Pseudomonas species secrete exolysin-like toxins and provoke Caspase-1-dependent macrophage death.
auteur
Pauline Basso, Pierre Wallet, Sylvie Elsen, Emmanuelle Soleilhac, Thomas Henry, Eric Faudry, Ina Attrée
article
Environmental Microbiology, 2017, 10, pp.4045-4064. ⟨10.1111/1462-2920.13841⟩
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titre
Pseudomonas aeruginosa ExlA and Serratia marcescens ShlA trigger cadherin cleavage by promoting calcium influx and ADAM10 activation
auteur
Emeline Reboud, Stéphanie Bouillot, Sabine Patot, Benoit Béganton, Ina Attrée, Philippe Huber
article
PLoS Pathogens, 2017, 13 (8), pp.e1006579. ⟨10.1371/journal.ppat.1006579⟩
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BibTex
titre
Pseudomonas aeruginosa Exolysin promotes bacterial growth in lungs, alveolar damage and bacterial dissemination
auteur
Stéphanie Bouillot, Patrick Munro, Benoit Gallet, Emeline Reboud, Guillaume Golovkine, Guy Schoehn, Ina Attrée, Emmanuel Lemichez, Philippe Huber
article
Scientific Reports, 2017, 7 (1), pp.2120. ⟨10.1038/s41598-017-02349-0⟩
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-01525980/file/SciReportsBouillotetal2017.pdf BibTex
titre
Pseudomonas aeruginosa Pore-Forming Exolysin and Type IV Pili Cooperate To Induce Host Cell Lysis
auteur
Pauline Basso, Michel Ragno, Sylvie Elsen, Emeline Reboud, Guillaume Golovkine, Stéphanie Bouillot, Philippe Huber, Stephen Lory, Eric Faudry, Ina Attree
article
mBio, 2017, 8 (1), ⟨10.1128/mBio.02250-16⟩
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titre
The human NAIP-NLRC4-inflammasome senses the Pseudomonas aeruginosa T3SS inner-rod protein
auteur
Teddy Grandjean, Anne Boucher, Marion Thepaut, Laura Monlezun, Benoit Guery, Eric Faudry, Eric Kipnis, Rodrigue Dessein
article
International Immunology, 2017, 29 (8), pp.377-384. ⟨10.1093/intimm/dxx047⟩
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2016

titre
Host cell surfaces induce a Type IV pili-dependent alteration of bacterial swimming
auteur
Guillaume Golovkine, Laurence Lemelle, Claire Burny, Cédric Vaillant, Jean-François Palierne, Christophe Place, Philippe Huber
article
Scientific Reports, 2016, 6 (1), ⟨10.1038/srep38950⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02318932/file/srep38950.pdf BibTex
titre
Phenotype and toxicity of the recently discovered exlA -positive Pseudomonas aeruginosa strains collected worldwide
auteur
Emeline Reboud, Sylvie Elsen, Stéphanie Bouillot, Guillaume Golovkine, Katy Jeannot, Ina Attree, Philippe Huber
article
Environmental Microbiology, 2016, 18 (10), pp.3425 - 3439. ⟨10.1111/1462-2920.13262⟩
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titre
Pseudomonas aeruginosa renews its virulence factors
auteur
Philippe Huber, Pauline Basso, Emeline Reboud, Ina Attree
article
Environmental Microbiology Reports, 2016, 8 (5), pp.564-571. ⟨10.1111/1758-2229.12443⟩
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titre
Pseudomonas aeruginosa Transmigrates at Epithelial Cell-Cell Junctions, Exploiting Sites of Cell Division and Senescent Cell Extrusion
auteur
Guillaume Golovkine, Eric Faudry, Stéphanie Bouillot, Sylvie Elsen, Ina Attree, Philippe Huber
article
PLoS Pathogens, 2016, 12 (1), pp.e1005377. ⟨10.1371/journal.ppat.1005377⟩
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titre
Structural Basis of Lipid Targeting and Destruction by the Type V Secretion System of Pseudomonas aeruginosa.
auteur
Paulo Vinicius da Mata Madeira, Samira Zouhir, Pauline Basso, David Neves, Aurélie Laubier, Richard Salacha, Sophie Bleves, Eric Faudry, Carlos Contreras-Martel, Andréa Dessen
article
Journal of Molecular Biology, 2016, 428 (9 Pt A), pp.1790-803. ⟨10.1016/j.jmb.2016.03.012⟩
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titre
Structural insights into the Escherichia coli lysine decarboxylases and molecular determinants of interaction with the AAA+ ATPase RavA.
auteur
Eaazhisai Kandiah, Diego Carriel, Julien Pérard, Hélène Malet, Maria Bacia-Verloop, Kaiyin Liu, Sze W S Chan, Walid A Houry, Sandrine Ollagnier de Choudens, Sylvie Elsen, Irina Gutsche
article
Scientific Reports, 2016, 6, pp.24601. ⟨10.1038/srep24601⟩
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2015

titre
ExsB Is Required for Correct Assembly of the Pseudomonas aeruginosa Type III Secretion Apparatus in the Bacterial Membrane and Full Virulence In Vivo
auteur
Caroline Perdu, Philippe Huber, Stéphanie Bouillot, Ariel Blocker, Sylvie Elsen, Ina Attree, Eric Faudry
article
Infection and Immunity, 2015, 83 (5), pp.1789-1798. ⟨10.1128/IAI.00048-15⟩
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titre
Pharmacological Activation of Rap1 Antagonizes the Endothelial Barrier Disruption Induced by Exotoxins ExoS and ExoT of Pseudomonas aeruginosa
auteur
Stéphanie Bouillot, Ina Attree, Philippe Huber
article
Infection and Immunity, 2015, 83 (5), pp.1820-1829. ⟨10.1128/IAI.00010-15⟩
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BibTex
titre
PscI is a type III secretion needle anchoring protein with in vitro polymerization capacities.
auteur
Laura Monlezun, David Liebl, Daphna Fenel, Teddy Grandjean, Alice Berry, Guy Schoehn, Rodrigue Dessein, Eric Faudry, Ina Attree
article
Molecular Microbiology, 2015, 96 (2), pp.419-36
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2014

titre
Sequential inactivation of Rho GTPases and Lim kinase by Pseudomonas aeruginosa toxins ExoS and ExoT leads to endothelial monolayer breakdown
auteur
Philippe Huber, S. Bouillot, S. Elsen, I. Attree
article
Cellular and Molecular Life Sciences, 2014, 71 (10), pp.1927-1941. ⟨10.1007/s00018-013-1451-9⟩
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titre
VE-cadherin cleavage by LasB protease from Pseudomonas aeruginosa facilitates type III secretion system toxicity in endothelial cells
auteur
Guillaume Golovkine, Eric Faudry, Stéphanie Bouillot, Romé Voulhoux, Ina Attrée, Philippe Huber
article
PLoS Pathogens, 2014, 10 (3), pp.e1003939. ⟨10.1371/journal.ppat.1003939⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01458199/file/journal.ppat.1003939.PDF BibTex