2022
- titre
- The Candida glabrata glycogen branching enzyme structure reveals unique features of branching enzymes of the Saccharomycetaceae phylum
- auteur
- Léa Conchou, Juliette Martin, Isabelle R. Gonçalves, Frédéric Galisson, Sébastien Violot, Florence Guillière, Nushin Aghajari, Lionel Ballut
- article
- Glycobiology, Oxford University Press (OUP), 2022, ⟨10.1093/glycob/cwab110⟩
- DOI
- DOI : 10.1093/glycob/cwab110
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-
- titre
- Are Methionine Sulfoxide-Containing Proteins Related to Seed Longevity? A Case Study of Arabidopsis thaliana Dry Mature Seeds Using Cyanogen Bromide Attack and Two-Dimensional-Diagonal Electrophoresis
- auteur
- Ewa Marzena Kalemba, Benoît Valot, Dominique Job, Christophe Bailly, Patrice Meimoun
- article
- Plants, MDPI, 2022, 11 (4), pp.569. ⟨10.3390/plants11040569⟩
- DOI
- DOI : 10.3390/plants11040569
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-
- titre
- PAP8/pTAC6 Is Part of a Nuclear Protein Complex and Displays RNA Recognition Motifs of Viral Origin
- auteur
- Louise Chambon, François-Xavier Gillet, Maha Chieb, David Cobessi, Thomas Pfannschmidt, Robert Blanvillain
- article
- International Journal of Molecular Sciences, MDPI, 2022, 23 (6), pp.3059. ⟨10.3390/ijms23063059⟩
- DOI
- DOI : 10.3390/ijms23063059
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-
- titre
- Synthesis of phospholipids under plausible prebiotic conditions and analogies with phospholipid biochemistry or origin of life studies
- auteur
- Michele Fiore, Carolina Chieffo, Augustin Lopez, Dimitri Fayolle, Johal Ruiz, Laurent Soulère, P. Oger, Emiliano Altamura, Florence Popowycz, René Buchet
- article
- Astrobiology, Mary Ann Liebert, In press, ⟨10.1089/ast.2021.0059⟩
- DOI
- DOI : 10.1089/ast.2021.0059
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-
- titre
- Membrane adaptation in the hyperthermophilic archaeon Pyrococcus furiosus relies upon a novel strategy involving glycerol monoalkyl glycerol tetraether lipids
- auteur
- Maxime Tourte, Philippe Schaeffer, Vincent Grossi, Philippe Oger
- article
- Environmental Microbiology, Society for Applied Microbiology and Wiley-Blackwell, 2022, ⟨10.1111/1462-2920.15923⟩
- DOI
- DOI : 10.1111/1462-2920.15923
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-
- titre
- Carbon catabolite repression in pectin digestion by the phytopathogen Dickeya dadantii
- auteur
- Shiny Martis B, Michel Droux, William Nasser, Sylvie Reverchon, Sam Meyer
- article
- Journal of Biological Chemistry, American Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2022, 298 (1), pp.101446. ⟨10.1016/j.jbc.2021.101446⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.jbc.2021.101446
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-
- titre
- Snf1 Kinase Differentially Regulates Botrytis cinerea Pathogenicity according to the Plant Host
- auteur
- Szabina Lengyel, Christine Rascle, Nathalie Poussereau, Christophe Bruel, Luca Sella, Mathias Choquer, Francesco Favaron
- article
- Microorganisms, MDPI, 2022, 10 (2), pp.444. ⟨10.3390/microorganisms10020444⟩
- DOI
- DOI : 10.3390/microorganisms10020444
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-
- titre
- Relationship between the Chromosome Structural Dynamics and Gene Expression-A Chicken and Egg Dilemma?
- auteur
- Diana Le Berre, Georgi Muskhelishvili, William Nasser, Sylvie Reverchon
- article
- Microorganisms, MDPI, 2022, 10 (5), pp.846. ⟨10.3390/microorganisms10050846⟩
- DOI
- DOI : 10.3390/microorganisms10050846
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-
- titre
- Identification of new Dickeya dadantii virulence factors secreted by the type 2 secretion system
- auteur
- Guy Condemine, Bastien Le Derout
- article
- PLoS ONE, Public Library of Science, 2022, 17 (4), pp.e0265075. ⟨10.1371/journal.pone.0265075⟩
- DOI
- DOI : 10.1371/journal.pone.0265075
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-
- titre
- Influence of aphotic haloclines and euxinia on organic biomarkers and microbial communities in a thalassohaline and alkaline volcanic crater lake
- auteur
- David Sala, Vincent Grossi, Hélène Agogué, Christophe Leboulanger, Didier Jézéquel, Gérard Sarazin, Ingrid Antheaume, Cécile Bernard, Magali Ader, Mylène Hugoni
- article
- Geobiology, Wiley, 2022, 20 (2), pp.292-309. ⟨10.1111/gbi.12477⟩
- DOI
- DOI : 10.1111/gbi.12477
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-
- titre
- Specificity and genetic polymorphism in the Vfm quorum sensing system of plant pathogenic bacteria of the genus Dickeya
- auteur
- Nicole Hugouvieux‐cotte‐pattat, Monique Royer, Erwan Gueguen, Paul Le Guen, Roderich Süssmuth, Sylvie Reverchon, Stéphane Cociancich
- article
- Environmental Microbiology, Society for Applied Microbiology and Wiley-Blackwell, 2022, pp.1467-1483. ⟨10.1111/1462-2920.15889⟩
- DOI
- DOI : 10.1111/1462-2920.15889
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-
2021
- titre
- Diversity within the Dickeya zeae complex, identification of Dickeya zeae and Dickeya oryzae members, proposal of the novel species Dickeya parazeae sp. nov.
- auteur
- Nicole Hugouvieux-Cotte-Pattat, Frédérique van Gijsegem
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2021, 71 (11), ⟨10.1099/ijsem.0.005059⟩
- DOI
- DOI : 10.1099/ijsem.0.005059
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-
- titre
- Straightforward Synthesis of Chiral Terpenoid Building Blocks by Ru-Catalyzed Enantioselective Hydrogenation
- auteur
- Johal Ruiz, Philippe Oger, Laurent Soulère, Florence Popowycz
- article
- Journal of Organic Chemistry, American Chemical Society, 2021, ⟨10.1021/acs.joc.1c00677⟩
- DOI
- DOI : 10.1021/acs.joc.1c00677
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-
- titre
- Separation and quantification of 2-Keto-3-deoxy-gluconate (KDG) a major metabolite in pectin and alginate degradation pathways
- auteur
- Shiny Martis B., Michel Droux, Florelle Deboudard, William Nasser, Sam Meyer, Sylvie Reverchon
- article
- Analytical Biochemistry, Elsevier Masson, 2021, 619, pp.114061. ⟨10.1016/j.ab.2020.114061⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.ab.2020.114061
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-
- titre
- Non-Polar Lipids as Regulators of Membrane Properties in Archaeal Lipid Bilayer Mimics
- auteur
- Marta Salvador-Castell, Nicholas Brooks, Roland Winter, Judith Peters, Philippe Oger
- article
- International Journal of Molecular Sciences, MDPI, 2021, 22 (11), ⟨10.3390/ijms22116087⟩
- DOI
- DOI : 10.3390/ijms22116087
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-
- titre
- Design and comparative characterization of RecA variants
- auteur
- Elsa del Val, William Nasser, Hafid Abaibou, Sylvie Reverchon
- article
- Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2021, 11 (1), ⟨10.1038/s41598-021-00589-9⟩
- DOI
- DOI : 10.1038/s41598-021-00589-9
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-
- titre
- Role of the Discriminator Sequence in the Supercoiling Sensitivity of Bacterial Promoters
- auteur
- Raphaël Forquet, Maïwenn Pineau, William Nasser, Sylvie Reverchon, Sam Meyer
- article
- mSystems, 2021, ⟨10.1128/mSystems.00978-21⟩
- DOI
- DOI : 10.1128/mSystems.00978-21
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-
- titre
- RNA Chaperones Hfq and ProQ Play a Key Role in the Virulence of the Plant Pathogenic Bacterium Dickeya dadantii
- auteur
- Simon Leonard, Camille Villard, William Nasser, Sylvie Reverchon, Florence Hommais
- article
- Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2021, 12, pp.687484. ⟨10.3389/fmicb.2021.687484⟩
- DOI
- DOI : 10.3389/fmicb.2021.687484
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-
- titre
- Structure–function analysis of pectate lyase Pel3 reveals essential facets of protein recognition by the bacterial type 2 secretion system.
- auteur
- Camille Pineau, Natalia Guschinskaya, Isabelle R. Gonçalves, Florence Ruaudel, Xavier Robert, Patrice Gouet, Lionel Ballut, Vladimir Shevchik
- article
- Journal of Biological Chemistry, American Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2021, pp.100305. ⟨10.1016/j.jbc.2021.100305⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.jbc.2021.100305
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-
- titre
- The Piezo-Hyperthermophilic Archaeon Thermococcus piezophilus Regulates Its Energy Efficiency System to Cope With Large Hydrostatic Pressure Variations
- auteur
- Yann Moalic, Jordan Hartunians, Cécile Dalmasso, Damien Courtine, Myriam Georges, Philippe Oger, Zongze Shao, Mohamed Jebbar, Karine Alain
- article
- Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2021, 12, pp.730231. ⟨10.3389/fmicb.2021.730231⟩
- DOI
- DOI : 10.3389/fmicb.2021.730231
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-
- titre
- The infection cushion of Botrytis cinerea : a fungal ‘weapon’ of plant‐biomass destruction
- auteur
- Mathias Choquer, Christine Rascle, Isabelle R. Gonçalves, Amélie de Vallée, Cécile Ribot, Elise Loisel, Pavlé Smilevski, Jordan Ferria, Mahamadi Savadogo, Eytham Souibgui, Marie‐josèphe Gagey, Jean‐william Dupuy, Jeffrey Rollins, Riccardo Marcato, Camille Noûs, Christophe Bruel, Nathalie Poussereau
- article
- Environmental Microbiology, Society for Applied Microbiology and Wiley-Blackwell, 2021, 23, pp.2293-2314. ⟨10.1111/1462-2920.15416⟩
- DOI
- DOI : 10.1111/1462-2920.15416
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-
- titre
- Reappraisal of archaeal C20-C25 diether lipid (extended archaeol) origin and use as a biomarker of hypersalinity
- auteur
- Flore Vandier, Maxime Tourte, Cara Doumbe-Kingue, Julien Plancq, Philippe Schaeffer, Phil Oger, Vincent Grossi
- article
- Organic Geochemistry, Elsevier, In press, ⟨10.1016/j.orggeochem.2021.104276⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.orggeochem.2021.104276
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-
- titre
- Targeted-antibacterial-plasmids (TAPs) combining conjugation and CRISPR/Cas systems achieve strain-specific antibacterial activity
- auteur
- Audrey Reuter, Cécile Hilpert, Annick Dedieu-Berne, Sophie Lematre, Erwan Gueguen, Guillaume Launay, Sarah Bigot, Christian Lesterlin
- article
- Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2021, 49 (6), pp.3584-3598. ⟨10.1093/nar/gkab126⟩
- DOI
- DOI : 10.1093/nar/gkab126
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-
- titre
- Alkanes increase the stability of early life membrane models under extreme pressure and temperature conditions
- auteur
- Loreto Misuraca, Bruno Demé, Philippe Oger, Judith Peters
- article
- Communications Chemistry, Nature Research 2021, ⟨10.1038/s42004-021-00467-5⟩
- DOI
- DOI : 10.1038/s42004-021-00467-5
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-
- titre
- DNA sequence-directed cooperation between nucleoid-associated proteins
- auteur
- Aleksandre Japaridze, Wayne Yang, Cees Dekker, William Nasser, Georgi Muskhelishvili
- article
- iScience, Elsevier, 2021, 24 (5), pp.102408. ⟨10.1016/j.isci.2021.102408⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.isci.2021.102408
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-
- titre
- Candida albicans Hexokinase 2 Challenges the Saccharomyces cerevisiae Moonlight Protein Model
- auteur
- Romain Laurian, Jade Ravent, Karine Dementhon, Marc Lemaire, Alexandre Soulard, Pascale Cotton
- article
- Microorganisms, MDPI, 2021, 9 (4), pp.848. ⟨10.3390/microorganisms9040848⟩
- DOI
- DOI : 10.3390/microorganisms9040848
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-
- titre
- Characterisation of a synthetic Archeal membrane reveals a possible new adaptation route to extreme conditions
- auteur
- Marta Salvador-Castell, Maksym Golub, Nelli Erwin, Bruno Demé, Nicholas Brooks, Roland Winter, Judith Peters, Philippe Oger
- article
- Communications Biology, Nature Publishing Group, 2021, 4, ⟨10.1038/s42003-021-02178-y⟩
- DOI
- DOI : 10.1038/s42003-021-02178-y
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-
- titre
- Identification and characterization of a new soybean promoter induced by Phakopsora pachyrhizi, the causal agent of Asian soybean rust
- auteur
- L. Cabre, S. Peyrard, C. Sirven, L. Gilles, B. Pelissier, S. Ducerf, N. Poussereau
- article
- BMC Biotechnology, BioMed Central, 2021, 21, pp.27. ⟨10.1186/s12896-021-00684-9⟩
- DOI
- DOI : 10.1186/s12896-021-00684-9
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-
- titre
- Clathrin Is Important for Virulence Factors Delivery in the Necrotrophic Fungus Botrytis cinerea
- auteur
- Eytham Souibgui, Christophe Bruel, Mathias Choquer, Amélie de Vallée, Cindy Dieryckx, Jean William Dupuy, Marie-Pascale Latorse, Christine Rascle, Nathalie Poussereau
- article
- Frontiers in Plant Science, Frontiers, 2021, 12, pp.668937. ⟨10.3389/fpls.2021.668937⟩
- DOI
- DOI : 10.3389/fpls.2021.668937
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-
- titre
- Biochemical characterization and mutational studies of a novel 3-methlyadenine DNA glycosylase II from the hyperthermophilic Thermococcus gammatolerans
- auteur
- Donghao Jiang, Likui Zhang, Kunming Dong, Yong Gong, Philippe Oger
- article
- DNA Repair, Elsevier, 2021
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-
- titre
- Identification of a novel bifunctional uracil DNA glycosylase from Thermococcus barophilus Ch5
- auteur
- Likui Zhang, Donghao Jiang, Qi Gan, Haoqiang Shi, Li Miao, Yong Gong, Philippe Oger
- article
- Applied Microbiology and Biotechnology, Springer Verlag, In press, ⟨10.1007/s00253-021-11422-8⟩
- DOI
- DOI : 10.1007/s00253-021-11422-8
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-
- titre
- Characterization of a novel type III alcohol dehydrogenase from Thermococcus barophilus Ch5
- auteur
- Likui Zhang, Donghao Jiang, Yuting Li, Leilei Wu, Qing Liu, Kunming Dong, Philippe Oger
- article
- International Journal of Biological Macromolecules, Elsevier, 2021
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-
- titre
- The mineral weathering ability of Collimonas pratensis PMB3(1) involves a Malleobactin-mediated iron acquisition system
- auteur
- Laura Picard, Cédric Paris, Tiphaine Dhalleine, Emmanuelle Morin, Philippe Oger, Marie-Pierre Turpault, Stéphane Uroz
- article
- Environmental Microbiology, Society for Applied Microbiology and Wiley-Blackwell, In press, ⟨10.1111/1462-2920.15508⟩
- DOI
- DOI : 10.1111/1462-2920.15508
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-
- titre
- Acid Hydrolysis for the Extraction of Archaeal Core Lipids and HPLC-MS Analysis
- auteur
- Maxime Tourte, Philippe Schaeffer, Vincent Grossi, Phil Oger
- article
- Bio-protocol , Bio-protocol LCC, 2021, 11 (16), ⟨10.21769/bioprotoc.4118⟩
- DOI
- DOI : 10.21769/bioprotoc.4118
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-
- titre
- Reappraisal of archaeal C20-C25 diether lipid (extended archaeol) origin and use as a biomarker of hypersalinity
- auteur
- Flore Vandier, Maxime Tourte, Cara Doumbe-Kingue, Julien Plancq, Philippe Schaeffer, Phil Oger, Vincent Grossi
- article
- Organic Geochemistry, Elsevier, In press, ⟨10.1016/j.orggeochem.2021.104276⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.orggeochem.2021.104276
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-
- titre
- Pattern and causes of the establishment of the invasive bacterial potato pathogen Dickeya solani and of the maintenance of the resident pathogen D. dianthicola
- auteur
- Pauline Blin, Kévin Robic, Slimane Khayi, Jérémy Cigna, Euphrasie Munier, Pauline Dewaegeneire, Angélique Laurent, Yan Jaszczyszyn, Kar-Wai Hong, Kok‐gan Chan, Amélie Beury, Sylvie Reverchon, Tatiana Giraud, Valérie Hélias, Denis Faure
- article
- Molecular Ecology, Wiley, 2021, 30 (2), pp.608-624. ⟨10.1111/mec.15751⟩
- DOI
- DOI : 10.1111/mec.15751
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-
- titre
- Quorum Sensing Regulation in Phytopathogenic Bacteria
- auteur
- Julie Baltenneck, Sylvie Reverchon, Florence Hommais
- article
- Microorganisms, MDPI, 2021, 9 (2), pp.239. ⟨10.3390/microorganisms9020239⟩
- DOI
- DOI : 10.3390/microorganisms9020239
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-
- titre
- In vitro exploration of the Xanthomonas hortorum pv. vitians genome using transposon insertion sequencing and comparative genomics to discriminate between core and contextual essential genes
- auteur
- Lucas Morinière, Solène Lecomte, Erwan Gueguen, Franck Bertolla
- article
- Microbial Genomics, Society for General Microbiology, 2021, ⟨10.1099/mgen.0.000546⟩
- DOI
- DOI : 10.1099/mgen.0.000546
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-
- titre
- Datamining and functional environmental genomics reassess the phylogenetics and functional diversity of fungal monosaccharide transporters
- auteur
- Florian Barbi, Laurent Vallon, Carmen Guerrero-Galán, Sabine D. Zimmermann, Delphine Melayah, Danis Abrouk, Jeanne Dore, Lemaire Marc, Laurence Fraissinet-Tachet, Patricia Luis, Roland Marmeisse
- article
- Applied Microbiology and Biotechnology, Springer Verlag, In press, 105 (2), pp.647-660. ⟨10.1007/s00253-020-11076-y⟩
- DOI
- DOI : 10.1007/s00253-020-11076-y
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-
- titre
- Complete genome of Bradyrhizobium sp. strain BDV5419, representative of Australian genospecies L
- auteur
- Christine Oger-Desfeux, Jerome Briolay, P. Oger, Bénédicte Lafay
- article
- Microbiology Resource Announcements, American Society for Microbiology, 2021, 10 (8), pp.e00042-21. ⟨10.1128/MRA.00042-21⟩
- DOI
- DOI : 10.1128/MRA.00042-21
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-
- titre
- Complete Genome Sequence of Bradyrhizobium sp. Strain BDV5040, Representative of Widespread Genospecies B in Australia
- auteur
- Christine Oger-Desfeux, Jérôme Briolay, Philippe Oger, Bénédicte Lafay
- article
- Microbiology Resource Announcements, American Society for Microbiology, 2021, 10 (3), pp.e01326-20. ⟨10.1128/MRA.01326-20⟩
- DOI
- DOI : 10.1128/MRA.01326-20
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-
- titre
- Implications of carbon catabolite repression for plant–microbe interactions
- auteur
- Theophile Franzino, Hasna Boubakri, Tomislav Cernava, Danis Abrouk, Wafa Achouak, Sylvie Reverchon, William Nasser, Feth El Zahar Haichar
- article
- Plant Communications, Cell Press, 2021, 3, pp.100272. ⟨10.1016/j.xplc.2021.100272⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.xplc.2021.100272
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-
- titre
- Agrobacterium fabrum C58 involved nitrate reductase NapA and antisense RNA NorR to denitrify
- auteur
- Solène Lecomte, Xavier Nesme, Théophile Franzino, Camille Villard, Mariane Pivard, Ludovic Vial, Jeanne Doré, Florence Hommais, Feth El Zahar Haichar
- article
- FEMS Microbiology Ecology, Wiley-Blackwell, 2021, 97 (1), ⟨10.1093/femsec/fiaa233⟩
- DOI
- DOI : 10.1093/femsec/fiaa233
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-
- titre
- Design and synthesis of 3, 5- hetero diesters of 4-deoxy quinic acid and their aphicidal activity against Acyrthosiphon pisum
- auteur
- Xiubin Li, Catherine Sivignon, Pedro da Silva, Yvan Rahbé, Yves Queneau, Sylvie Moebs-Sanchez
- article
- Tetrahedron, Elsevier, 2021, pp.131982. ⟨10.1016/j.tet.2021.131982⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.tet.2021.131982
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-
- titre
- ScreenSeed as a novel high throughput seed germination phenotyping method
- auteur
- Nicolas Merieux, Pierre Cordier, Marie-Hélène Wagner, Sylvie Ducournau, Sophie Aligon, Dominique Job, Philippe Grappin, Edwin Grappin
- article
- Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2021, 11 (1), ⟨10.1038/s41598-020-79115-2⟩
- DOI
- DOI : 10.1038/s41598-020-79115-2
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-
- titre
- Effects of the denitrification inhibitor “procyanidins” on the diversity, interactions, and potential functions of rhizosphere-associated microbiome
- auteur
- Mylène Hugoni, William Galland, Solène Lecomte, Maxime Bruto, mohamed Barakat, Florence Piola, Wafa Achouak, Feth El Zahar Haichar
- article
- Microorganisms, MDPI, 2021, 9 (7), pp.1406. ⟨10.3390/microorganisms9071406⟩
- DOI
- DOI : 10.3390/microorganisms9071406
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-
- titre
- Biological inhibition of denitrification (BDI) in the field: Effect on plant growth in two different soils
- auteur
- William Galland, Feth El Zahar Haichar, Sonia Czarnes, Celine Mathieu, Jean-Louis Demorge, Simon Laurent, Sara Puijalon, Florence Piola
- article
- Applied Soil Ecology, 2021, 159, pp.103857. ⟨10.1016/j.apsoil.2020.103857⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.apsoil.2020.103857
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-
2020
- titre
- Induction of non-lamellar phases in archaeal lipids at high temperature and high hydrostatic pressure by apolar polyisoprenoids
- auteur
- Marta Salvador-Castell, Nicholas Brooks, Judith Peters, P. Oger
- article
- Biochimica et Biophysica Acta:Biomembranes, Elsevier, 2020, 1862 (2), pp.183130. ⟨10.1016/j.bbamem.2019.183130⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.bbamem.2019.183130
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-
- titre
- Structural Characterization of an Archaeal Lipid Bilayer as a Function of Hydration and Temperature
- auteur
- Marta Salvador-Castell, Bruno Demé, Philippe Oger, Judith Peters
- article
- International Journal of Molecular Sciences, MDPI, 2020, 21 (5), pp.1816. ⟨10.3390/ijms21051816⟩
- DOI
- DOI : 10.3390/ijms21051816
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-
- titre
- Lipid phase separation induced by the apolar polyisoprenoid squalane demonstrates its role in membrane domain formation in archaeal membranes
- auteur
- Marta Salvador-Castell, Bruno Demé, Phil Oger, Judith Peters
- article
- Langmuir, American Chemical Society, In press, ⟨10.1021/acs.langmuir.0c00901⟩
- DOI
- DOI : 10.1021/acs.langmuir.0c00901
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-
- titre
- Apolar Polyisoprenoids Located in the Midplane of the Bilayer Regulate the Response of an Archaeal-like Membrane to High Temperature and Pressure
- auteur
- Josephine Loricco, Marta Salvador-Castell, Bruno Demé, Judith Peters, Philippe Oger
- article
- Frontiers in Chemistry, Frontiers Media, 2020
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Apolar Polyisoprenoids Located in the Midplane of the Bilayer Regulate the Response of an Archaeal-Like Membrane to High Temperature and Pressure
- auteur
- Josephine Loricco, Marta Salvador-Castell, Bruno Demé, Judith Peters, Philippe Oger
- article
- Frontiers in Chemistry, Frontiers Media, 2020, 8, ⟨10.3389/fchem.2020.594039⟩
- DOI
- DOI : 10.3389/fchem.2020.594039
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- titre
- Carbon metabolism snapshot by ddPCR during the early step of Candida albicans phagocytosis by macrophages
- auteur
- Romain Laurian, Cécile Jacot-Des-Combes, Fabiola Bastian, Karine Dementhon, Pascale Cotton
- article
- Pathogens and Disease, Oxford University Press, 2020, 78 (1), pp.ftaa014. ⟨10.1093/femspd/ftaa014⟩
- DOI
- DOI : 10.1093/femspd/ftaa014
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-
- titre
- Pattern and causes of the establishment of the invasive bacterial potato pathogen Dickeya solani and of the maintenance of the resident pathogen D. dianthicola
- auteur
- Pauline Blin, Kévin Robic, Slimane Khayi, Jeremy Cigna, Euphrasie Munier, Pauline Dewaegeneire, Angélique Laurent, Yan Jaszczyszyn, Kar‐wai Hong, Kok‐gan Chan, Amélie Beury, Sylvie Reverchon, Tatiana Giraud, Valérie Hélias, Denis Faure
- article
- Molecular Ecology, Wiley, 2020, ⟨10.1111/mec.15751⟩
- DOI
- DOI : 10.1111/mec.15751
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-
- titre
- The Multiple Facets of Plant–Fungal Interactions Revealed Through Plant and Fungal Secretomics
- auteur
- Delphine Vincent, Maryam Rafiqi, Dominique Job
- article
- Frontiers in Plant Science, Frontiers, 2020, 10, pp.1626. ⟨10.3389/fpls.2019.01626⟩
- DOI
- DOI : 10.3389/fpls.2019.01626
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-
- titre
- New Insights Into DNA Repair Revealed by NucS Endonucleases From Hyperthermophilic Archaea
- auteur
- Likui Zhang, Donghao Jiang, Mai Wu, Zhihui Yang, Philippe Oger
- article
- Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2020, 11, ⟨10.3389/fmicb.2020.01263⟩
- DOI
- DOI : 10.3389/fmicb.2020.01263
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-
- titre
- An alternative pathway for repair of deaminated bases in DNA triggered by archaeal NucS endonuclease
- auteur
- Likui Zhang, Haoqiang Shi, Qi Gan, Yuxiao Wang, Mai Wu, Zhihui Yang, Philippe Oger, Jianting Zheng
- article
- DNA Repair, Elsevier, 2020, pp.102734. ⟨10.1016/j.dnarep.2019.102734⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.dnarep.2019.102734
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-
- titre
- Characterization of a Family IV uracil DNA glycosylase from the hyperthermophilic euryarchaeon Thermococcus barophilus Ch5
- auteur
- Qi Gan, Mengfan He, Haoqiang Shi, Phil Oger, Zhihui Yang, Liping Ran, Likui Zhang
- article
- International Journal of Biological Macromolecules, Elsevier, 2020, 146, pp.475-481. ⟨10.1016/j.ijbiomac.2019.12.202⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.ijbiomac.2019.12.202
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-
- titre
- Characterization and application of a family B DNA polymerase from the hyperthermophilic and radioresistant euryarchaeon Thermococcus gammatolerans
- auteur
- Likui Zhang, Donghao Jiang, Haoqiang Shi, Mai Wu, Qi Gan, Zhihui Yang, Philippe Oger
- article
- International Journal of Biological Macromolecules, Elsevier, 2020, 156, pp.217-224. ⟨10.1016/j.ijbiomac.2020.03.204⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.ijbiomac.2020.03.204
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-
- titre
- Insect mouthpart transcriptome unveils extension of cuticular protein repertoire and complex organization
- auteur
- Natalia Guschinskaya, Denis Ressnikoff, Karim Arafah, Sebastien Voisin, Philippe Bulet, Marilyne Uzest, Yvan Rahbé
- article
- iScience, Elsevier, 2020, 23 (2), pp.100828. ⟨10.1016/j.isci.2020.100828⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.isci.2020.100828
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-
- titre
- Cuticular Structure Proteomics in the Pea Aphid Acyrthosiphon pisum Reveals New Plant Virus Receptor Candidates at the Tip of Maxillary Stylets
- auteur
- Maelle Deshoux, Victor Masson, Karim Arafah, Sebastien Voisin, Natalia Guschinskaya, Manuella van Munster, Bastien Cayrol, Craig Webster, Yvan Rahbé, Stéphane Blanc, Philippe Bulet, Marilyne Uzest
- article
- Journal of Proteome Research, American Chemical Society, 2020, 19 (3), pp.1319-1337. ⟨10.1021/acs.jproteome.9b00851⟩
- DOI
- DOI : 10.1021/acs.jproteome.9b00851
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-
- titre
- TwisTranscripT: stochastic simulation of the transcription-supercoiling coupling
- auteur
- Bilal El Houdaigui, Sam Meyer
- article
- Bioinformatics, Oxford University Press (OUP), 2020, 36 (12), pp.3899-3901. ⟨10.1093/bioinformatics/btaa221⟩
- DOI
- DOI : 10.1093/bioinformatics/btaa221
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-
- titre
- Dickeya poaceiphila sp. nov., a plant-pathogenic bacterium isolated from sugar cane (Saccharum officinarum)
- auteur
- Nicole Hugouvieux‐cotte‐pattat, Celine Brochier-Armanet, Jean-Pierre Flandrois, Sylvie Reverchon
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2020, 70 (8), pp.4508-4514. ⟨10.1099/ijsem.0.004306⟩
- DOI
- DOI : 10.1099/ijsem.0.004306
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-
- titre
- Plasmid‐chromosome crosstalks
- auteur
- Ludovic Vial, Florence Hommais
- article
- Environmental Microbiology, Society for Applied Microbiology and Wiley-Blackwell, 2020, 22 (2), pp.540-556. ⟨10.1111/1462-2920.14880⟩
- DOI
- DOI : 10.1111/1462-2920.14880
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- titre
- Plant nitrogen supply affects the Botrytis cinerea infection process and modulates known and novel virulence factors
- auteur
- Marie‐christine Soulie, Shamsuddin Mia Koka, Kévin Floch, Baptiste Vancostenoble, Deborah Barbe, Antoine Daviere, Ludivine Soubigou‐taconnat, Veronique Brunaud, Nathalie Poussereau, Elise Loisel, Amelie Devallee, Dominique Expert, Mathilde Fagard
- article
- Molecular Plant Pathology, Wiley, 2020, 21, pp.1436-1450. ⟨10.1111/mpp.12984⟩
- DOI
- DOI : 10.1111/mpp.12984
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-
- titre
- Identification of a novel type of glucose dehydrogenase involved in the mineral weathering ability of Collimonas pratensis strain PMB3(1)
- auteur
- Laura Picard, Marie-Pierre Turpault, P. Oger, Stephane Uroz
- article
- FEMS Microbiology Ecology, Wiley-Blackwell, 2020, ⟨10.1093/femsec/fiaa232⟩
- DOI
- DOI : 10.1093/femsec/fiaa232
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- titre
- Draft Genome Sequence of Collimonas pratensis Strain PMB3(1), an Effective Mineral-Weathering and Chitin-Hydrolyzing Bacterial Strain
- auteur
- Laura Picard, Philippe Oger, Marie-Pierre Turpault, Stephane Uroz
- article
- Microbiology Resource Announcements, American Society for Microbiology, 2020, 9 (37), ⟨10.1128/MRA.00601-20⟩
- DOI
- DOI : 10.1128/MRA.00601-20
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-
- titre
- Dual transcriptomics and proteomics analyses of the early stage of interaction between Caballeronia mineralivorans PML1(12) and mineral
- auteur
- Stephane Uroz, Laura Picard, Marie-Pierre Turpault, Lucas Auer, J. Armengaud, P. Oger
- article
- Environmental Microbiology, Society for Applied Microbiology and Wiley-Blackwell, In press, 22 (9), pp.3838-3862. ⟨10.1111/1462-2920.15159⟩
- DOI
- DOI : 10.1111/1462-2920.15159
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- titre
- High-Temperature Behavior of Early Life Membrane Models
- auteur
- Loreto Misuraca, Antonino Caliò, Isabelle Grillo, Axelle Grélard, Philippe Marie Oger, Judith Peters, Bruno Demé
- article
- Langmuir, American Chemical Society, 2020, ⟨10.1021/acs.langmuir.0c02258⟩
- DOI
- DOI : 10.1021/acs.langmuir.0c02258
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-
- titre
- Advances on Antiviral Activity of Morus spp. Plant Extracts: Human Coronavirus and Virus-Related Respiratory Tract Infections in the Spotlight
- auteur
- Inès Thabti, Quentin Albert, Stéphanie Philippot, François Dupire, Brenda Westerhuis, Stéphane Fontanay, Arnaud Risler, Thomas Kassab, Walid Elfalleh, Ali Aferchichi, Mihayl Varbanov
- article
- Molecules, MDPI, 2020, 25 (8), pp.1876. ⟨10.3390/molecules25081876⟩
- DOI
- DOI : 10.3390/molecules25081876
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-
- titre
- Functionalized Membrane Domains: An Ancestral Feature of Archaea?
- auteur
- Maxime Tourte, Philippe Schaeffer, Vincent Grossi, Phil Oger
- article
- Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2020, 11, pp.526. ⟨10.3389/fmicb.2020.00526⟩
- DOI
- DOI : 10.3389/fmicb.2020.00526
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-
- titre
- Novel intact polar and core lipid compositions in the Pyrococcus model species, P. furiosus and P. yayanosii, reveal the largest lipid diversity amongst Thermococcales
- auteur
- Maxime Tourte, Vanessa Kuentz, Philippe Schaeffer, Vincent Grossi, Anaïs Cario, Philippe Oger
- article
- Biomolecules, MDPI, 2020, 10 (6), pp.830. ⟨10.3390/biom10060830⟩
- DOI
- DOI : 10.3390/biom10060830
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-
- titre
- The nucleoid-associated protein IHF acts as a ‘transcriptional domainin’ protein coordinating the bacterial virulence traits with global transcription
- auteur
- Sylvie Reverchon, Sam Meyer, Raphaël Forquet, Florence Hommais, Georgi Muskhelishvili, William Nasser
- article
- Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2020, ⟨10.1093/nar/gkaa1227⟩
- DOI
- DOI : 10.1093/nar/gkaa1227
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-
- titre
- Antioxidative Enzyme Responses to Antimony Stress of Serratia marcescens – an Endophytic Bacteria of Hedysarum pallidum Roots
- auteur
- Mounia Kassa-Laouar, Aicha Mechakra, Agnès Rodrigue, Ouissem Meghnous, Alima Bentellis, Oualida Rached
- article
- Polish Journal of Environmental studies, HARD Pub. Co., 2020, 29 (1), pp.141-152. ⟨10.15244/pjoes/100494⟩
- DOI
- DOI : 10.15244/pjoes/100494
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-
- titre
- The genome sequence of the grape phylloxera provides insights into the evolution, adaptation, and invasion routes of an iconic pest
- auteur
- Claude Rispe, Fabrice Legeai, Paul Nabity, Rosa Fernández, Arinder Arora, Patrice Baa-Puyoulet, Celeste Banfill, Leticia Bao, Miquel Barberà, Maryem Bouallegue, Anthony Bretaudeau, Jennifer Brisson, Federica Calevro, Pierre Capy, Olivier Catrice, Thomas Chertemps, Carole Couture, Laurent Deliere, Angela Douglas, Keith Dufault-Thompson, Paula Escuer, Honglin Feng, Astrid Forneck, Toni Gabaldón, Roderic Guigó, Frédérique Hilliou, Silvia Hinojosa-Alvarez, Yi-Min Hsiao, Sylvie Hudaverdian, Emmanuelle Jacquin-Joly, Edward James, Spencer Johnston, Benjamin Joubard, Gaëlle Le Goff, Gaël Le Trionnaire, Pablo Librado, Shanlin Liu, Eric Lombaert, Hsiao-Ling Lu, Martine Maïbèche, Mohamed Makni, Marina Marcet-Houben, David Martinez-Torres, Camille Meslin, Nicolas Montagné, Nancy Moran, Daciana Papura, Nicolas Parisot, Yvan Rahbé, Mélanie Ribeiro Lopes, Aida Ripoll-Cladellas, Stéphanie Robin, Céline Roques, Celine Lopez-Roques, Pascale Roux, Julio Rozas, Alejandro Sanchez-Gracia, Jose Sánchez-Herrero, Didac Santesmasses, Iris Scatoni, Rémy-Félix Serre, Ming Tang, Wenhua Tian, Paul Umina, Manuella van Munster, Carole Vincent-Monégat, Joshua Wemmer, Alex Wilson, Ying Zhang, Chaoyang Zhao, Jing Zhao, Serena Zhao, Xin Zhou, François Delmotte, Denis Tagu
- article
- BMC Biology, BioMed Central, 2020, 18 (1), pp.90. ⟨10.1186/s12915-020-00820-5⟩
- DOI
- DOI : 10.1186/s12915-020-00820-5
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-
- titre
- Systems-Based Approaches to Unravel Networks and Individual Elements Involved in Apple Superficial Scald
- auteur
- Evangelos Karagiannis, Georgia Tanou, Federico Scossa, Martina Samiotaki, Michail Michailidis, Maria Manioudaki, François Laurens, Dominique Job, Alisdair Fernie, Mathilde Orsel, Athanassios Molassiotis
- article
- Frontiers in Plant Science, Frontiers, 2020, 11, ⟨10.3389/fpls.2020.00008⟩
- DOI
- DOI : 10.3389/fpls.2020.00008
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-
- titre
- Original sequence divergence among Pseudomonas putida CadRs drive specificity
- auteur
- Julien Cayron, Géraldine Effantin, Elsa Prudent, Agnès Rodrigue
- article
- Research in Microbiology, Elsevier, In press, 171, pp.21-27. ⟨10.1016/j.resmic.2019.11.001⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.resmic.2019.11.001
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-
- titre
- Does Biological Denitrification Inhibition (BDI) in the Field Induce an Increase in Plant Growth and Nutrition in Apium graveolens L. Grown for a Long Period?
- auteur
- William Galland, Florence Piola, Céline Mathieu, Lyna Bouladra, Laurent Simon, Feth Haichar
- article
- Microorganisms, MDPI, 2020, 8 (8), pp.1-13. ⟨10.3390/microorganisms8081204⟩
- DOI
- DOI : 10.3390/microorganisms8081204
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-
2019
- titre
- A Similar Secretome Disturbance as a Hallmark of Non-pathogenic Botrytis cinerea ATMT-Mutants?
- auteur
- Amélie de Vallée, Pascal Bally, Christophe Bruel, Lucie Chandat, Mathias Choquer, Cindy Dieryckx, Jean William Dupuy, Sophie Kaiser, Marie-Pascale Latorse, Elise Loisel, Géraldine Mey, Guillaume Morgant, Christine Rascle, Julia Schumacher, Adeline Simon, Eytham Souibgui, Muriel Viaud, François Villalba, Nathalie Poussereau
- article
- Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2019, 10 (2829), 13 p. ⟨10.3389/fmicb.2019.02829⟩
- DOI
- DOI : 10.3389/fmicb.2019.02829
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-
- titre
- The first study on the impact of osmolytes in whole cells of high temperature-adapted microorganisms
- auteur
- Marta Salvador-Castell, Maksym Golub, Nicolas Martinez, Jacques Ollivier, Judith Peters, Philippe Oger
- article
- Soft Matter, Royal Society of Chemistry, 2019, 15 (41), pp.8381-8391. ⟨10.1039/c9sm01196j⟩
- DOI
- DOI : 10.1039/c9sm01196j
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-
- titre
- Protomembranes at the origin of life
- auteur
- Loreto Misuraca, Bruno Demé, Judith Peters, Phil M. Oger, P. Oger
- article
- European Biophysics Journal, Springer Verlag (Germany), 2019
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-
- titre
- Dickeya lacustris sp. nov., a water-living pectinolytic bacterium isolated from lakes in France
- auteur
- Nicole Hugouvieux-Cotte-Pattat, Cécile Jacot-Des-Combes, Jérôme Briolay
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2019, 69, pp.721-726. ⟨10.1099/ijsem.0.003208⟩
- DOI
- DOI : 10.1099/ijsem.0.003208
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-
- titre
- The hypoxic expression of the glucose transporter RAG1 reveals the role of the bHLH transcription factor Sck1 as a novel hypoxic modulator in Kluyveromyces lactis
- auteur
- Rosa Santomartino, Daniela Ottaviano, Ilaria Camponeschi, Tracy Ann Alcarpio Landicho, Luca Falato, Andrea Visca, Alexandre Soulard, Marc Lemaire, Michele Maria Bianchi
- article
- FEMS Yeast Research, Oxford University Press (OUP), 2019, 19 (4), pp.foz041. ⟨10.1093/femsyr/foz041⟩
- DOI
- DOI : 10.1093/femsyr/foz041
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-
- titre
- Biochemical characterization and mutational studies of the thermostable uracil DNA glycosylase from the hyperthermophilic euryarchaeon Thermococcus barophilus Ch5
- auteur
- Haoqiang Shi, Qi Gan, Donghao Jiang, Yuqi Wu, Youcheng Yin, Haiyue Hou, Hongxun Chen, Li Miao, Zhihui Yang, Phil M. Oger, Likui Zhang
- article
- International Journal of Biological Macromolecules, Elsevier, 2019, ⟨10.1016/j.ijbiomac.2019.05.073⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.ijbiomac.2019.05.073
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-
- titre
- In Search for the Membrane Regulators of Archaea
- auteur
- Marta Salvador-Castell, Maxime Tourte, Philippe Oger
- article
- International Journal of Molecular Sciences, MDPI, 2019, 20 (18), pp.4434. ⟨10.3390/ijms20184434⟩
- DOI
- DOI : 10.3390/ijms20184434
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-
- titre
- Biochemical characterization of a thermostable DNA ligase from the hyperthermophilic euryarchaeon Thermococcus barophilus Ch5
- auteur
- Haoqiang Shi, Yanchao Huang, Qi Gan, Mianwen Rui, Hongxun Chen, Chuandeng Tu, Zhihui Yang, Likui Zhang, P. Oger
- article
- Applied Microbiology and Biotechnology, Springer Verlag, 2019, ⟨10.1007/s00253-019-09736-9⟩
- DOI
- DOI : 10.1007/s00253-019-09736-9
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-
- titre
- Biochemical characterization and mutational studies of the 8-oxoguanine DNA glycosylase from the hyperthermophilic and radioresistant archaeon Thermococcus gammatolerans
- auteur
- Likui Zhang, Yuting Li, Haoqiang Shi, Dai Zhang, Zhihui Yang, P. Oger, Jianting Zheng
- article
- Applied Microbiology and Biotechnology, Springer Verlag, 2019, ⟨10.1007/s00253-019-10031-w⟩
- DOI
- DOI : 10.1007/s00253-019-10031-w
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-
- titre
- Analysis of Environmental Conditions Affecting Acids Production in Lactic Acid Bacteria Involved in Ivorian Cocoa Fermentation
- auteur
- Djeneba Ouattara., Honore Ouattara, Michel Droux, Sebastien Niamke
- article
- Scholars Academic Journal of Biosciences, AS Publishers, India 2019, 7 (4), pp.158-165. ⟨10.21276/sajb.2019.7.4.1⟩
- DOI
- DOI : 10.21276/sajb.2019.7.4.1
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-
- titre
- Modeling the bioconversion of polysaccharides in a continuous reactor: A case study of the production of oligogalacturonates by Dickeya dadantii
- auteur
- Jacques-Alexandre Sepulchre, Sylvie Reverchon, Jean-Luc Gouzé, William Nasser
- article
- Journal of Biological Chemistry, American Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2019, 294 (5), pp.1753-1762. ⟨10.1074/jbc.RA118.004615⟩
- DOI
- DOI : 10.1074/jbc.RA118.004615
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-
- titre
- A novel plasmid‐transcribed regulatory sRNA, QfsR, controls chromosomal polycistronic gene expression in Agrobacterium fabrum
- auteur
- Benjamin Diel, Magali Dequivre, Florence Wisniewski-Dyé, Ludovic Vial, Florence Hommais
- article
- Environmental Microbiology, Society for Applied Microbiology and Wiley-Blackwell, 2019, 21 (8), pp.3063-3075. ⟨10.1111/1462-2920.14704⟩
- DOI
- DOI : 10.1111/1462-2920.14704
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-
- titre
- The phytopathogenic nature of Dickeya aquatica 174/2 and the dynamic early evolution of Dickeya pathogenicity
- auteur
- Alexandre Duprey, Najwa Taïb, Simon Leonard, Tiffany Garin, Jean-Pierre Flandrois, William Nasser, Céline Brochier-Armanet, Sylvie Reverchon
- article
- Environmental Microbiology, Society for Applied Microbiology and Wiley-Blackwell, 2019, 21 (8), pp.2809-2835. ⟨10.1111/1462-2920.14627⟩
- DOI
- DOI : 10.1111/1462-2920.14627
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-
- titre
- Corrigendum to “Caballeronia mineralivorans sp. nov., isolated from oak-Scleroderma citrinum mycorrhizosphere” [Syst. Appl. Microbiol. 40 (2017) 345–351]
- auteur
- S. Uroz, Phil M. Oger
- article
- Systematic and Applied Microbiology, Elsevier, 2019, 42 (3), pp.423-424. ⟨10.1016/j.syapm.2019.03.001⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.syapm.2019.03.001
- Accès au bibtex
-
- titre
- Plant Symbionts Are Engineers of the Plant-Associated Microbiome
- auteur
- Stéphane Uroz, Pierre-Emmanuel Courty, P. Oger
- article
- Trends in Plant Science, Elsevier, 2019, 24 (10), pp.905-916. ⟨10.1016/j.tplants.2019.06.008⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.tplants.2019.06.008
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-
- titre
- Monitoring of abiotic degradation of photocrosslinked silicone acrylate coatings: the fate of the photoinitiator
- auteur
- Salma Ouali, Patrick Germain, Rémy Gourdon, Valérie Desjardin, Yoann Louis
- article
- Environmental Science and Pollution Research, Springer Verlag, 2019, 26 (15), pp.15324-15332. ⟨10.1007/s11356-019-04937-1⟩
- DOI
- DOI : 10.1007/s11356-019-04937-1
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-
- titre
- Dual 0.02% chlorhexidine digluconate - 0.1% disodium EDTA loaded thermosensitive ocular gel for Acanthamoeba keratitis treatment
- auteur
- A. Cucina, S. Filali, A. Risler, C. Febvay, D. Salmon, C. Pivot, M. Pelandakis, F. Pirot
- article
- International Journal of Pharmaceutics, Elsevier, 2019, 556, pp.330-337. ⟨10.1016/j.ijpharm.2018.12.016⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.ijpharm.2018.12.016
- Accès au bibtex
-
- titre
- Hexokinase and Glucokinases Are Essential for Fitness and Virulence in the Pathogenic Yeast Candida albicans
- auteur
- Romain Laurian, Karine Dementhon, Bastien Doumèche, Alexandre Soulard, Thierry Noël, Marc Lemaire, Pascale Cotton
- article
- Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2019, 10
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-
- titre
- Bacterial genome architecture shapes global transcriptional regulation by DNA supercoiling
- auteur
- Bilal El houdaigui, Raphaël Forquet, Thomas Hindré, Dominique Schneider, William Nasser, Sylvie Reverchon, Sam Meyer
- article
- Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2019, 47 (11), pp.5648-5657. ⟨10.1093/nar/gkz300⟩
- DOI
- DOI : 10.1093/nar/gkz300
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-
- titre
- Coherent Domains of Transcription Coordinate Gene Expression During Bacterial Growth and Adaptation
- auteur
- Georgi Muskhelishvili, Raphaël Forquet, Sylvie Reverchon, Sam Meyer, William Nasser
- article
- Microorganisms, MDPI, 2019, 7 (12), pp.694. ⟨10.3390/microorganisms7120694⟩
- DOI
- DOI : 10.3390/microorganisms7120694
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-
- titre
- APERO: a genome-wide approach for identifying bacterial small RNAs from RNA-Seq data
- auteur
- Simon Leonard, Sam Meyer, Stéphan Lacour, William Nasser, Florence Hommais, Sylvie Reverchon
- article
- Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2019, 47 (15), pp.1-12. ⟨10.1093/nar/gkz485⟩
- DOI
- DOI : 10.1093/nar/gkz485
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-
- titre
- Acetic acid bacteria (AAB) involved in cocoa fermentation from Ivory Coast: species diversity and performance in acetic acid production
- auteur
- Souleymane Soumahoro, Honoré Ouattara, Michel Droux, William Nasser, Sébastien Niamke, Sylvie Reverchon
- article
- Journal of Food Science and Technology, Springer Link, 2019, 57, pp.1904-1916. ⟨10.1007/s13197-019-04226-2⟩
- DOI
- DOI : 10.1007/s13197-019-04226-2
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-
- titre
- RecA and DNA recombination: a review of molecular mechanisms
- auteur
- Elsa del Val, William Nasser, Hafid Abaibou, Sylvie Reverchon
- article
- Biochemical Society Transactions, Portland Press, 2019, ⟨10.1042/BST20190558⟩
- DOI
- DOI : 10.1042/BST20190558
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-
- titre
- DNA Supercoiling: an Ancestral Regulator of Gene Expression in Pathogenic Bacteria?
- auteur
- Shiny Martis B., Raphaël Forquet, Sylvie Reverchon, William Nasser, Sam Meyer
- article
- Computational and Structural Biotechnology Journal, Elsevier, 2019, 17, pp.1047-1055. ⟨10.1016/j.csbj.2019.07.013⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.csbj.2019.07.013
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-
- titre
- Modeling the bioconversion of polysaccharides in a continuous reactor: A case study of the production of oligo-galacturonates by Dickeya dadantii
- auteur
- Jacques-Alexandre Sepulchre, Sylvie Reverchon, Jean-Luc Gouzé, William Nasser
- article
- Journal of Biological Chemistry, American Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2019, 294 (5), pp.1753-1762. ⟨10.1074/jbc.RA118.004615⟩
- DOI
- DOI : 10.1074/jbc.RA118.004615
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- titre
- A secreted metal-binding protein protects necrotrophic phytopathogens from reactive oxygen species
- auteur
- Lulu Liu, Virginie Gueguen-Chaignon, Isabelle R. Gonçalves, Christine Rascle, Martine Rigault, Alia Dellagi, Elise Loisel, Nathalie Poussereau, Agnès Rodrigue, Laurent Terradot, Guy Condemine
- article
- Nature Communications, Nature Publishing Group, 2019, 10 (1), pp.4853. ⟨10.1038/s41467-019-12826-x⟩
- DOI
- DOI : 10.1038/s41467-019-12826-x
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-
- titre
- Identification by Tn-seq of Dickeya dadantii genes required for survival in chicory plants
- auteur
- Kévin Royet, Nicolas Parisot, Agnès Rodrigue, Erwan Gueguen, Guy Condemine
- article
- Molecular Plant Pathology, Wiley, 2019, 20 (2), pp.287-306. ⟨10.1111/mpp.12754⟩
- DOI
- DOI : 10.1111/mpp.12754
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-
- titre
- Amborella – Bearing witness to the past ?
- auteur
- Valerie Poncet, Philippe Birnbaum, Valérie Burtet-Sarramegna, Alexandre de Kochko, Bruno Fogliani, Gildas Gateble, Sandrine Isnard, Tanguy Jaffré, Dominique Job, François Munoz, Jérôme Munzinger, C.P. Scutt, Rémi Tournebize, Santiago Trueba, Yohan Pillon
- article
- Annual Plant Reviews Online, Wiley, 2019, 3, pp.1 - 41. ⟨10.1002/9781119312994.apr0689⟩
- DOI
- DOI : 10.1002/9781119312994.apr0689
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-
- titre
- Les insectes comme modèles dans l'imaginaire des artistes: symboles et anti-symboles
- auteur
- Yvan Rahbé, Sibylle Orlandi
- article
- Comptes Rendus Biologies, Elsevier, 2019, 342 (7-8), pp.249-250. ⟨10.1016/j.crvi.2019.09.004⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.crvi.2019.09.004
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-
2018
- titre
- Gene stacking of multiple traits for high yield of fermentable sugars in plant biomass
- auteur
- A. Aznar, C. Chalvin, P. M. Shih, M. Maimann, B. Ebert, D. S. Birdseye, D. Loque, H. V. Scheller
- article
- Biotechnology for Biofuels, BioMed Central, 2018, 11, pp.2. ⟨10.1186/s13068-017-1007-6⟩
- DOI
- DOI : 10.1186/s13068-017-1007-6
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-
- titre
- Production of muconic acid in plants
- auteur
- A. Eudes, R. Berthomieu, Z. Hao, N. Zhao, V. T. Benites, E. E. K. Baidoo, D. Loque
- article
- Metabolic Engineering, Elsevier, 2018, 46, pp.13-19. ⟨10.1016/j.ymben.2018.02.002⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.ymben.2018.02.002
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-
- titre
- Interplay of classic Exp and specific Vfm quorum sensing systems on the phenotypic features of Dickeya solani strains exhibiting different virulence levels
- auteur
- M. Potrykus, N. Hugouvieux-Cotte-Pattat, E. Lojkowska
- article
- Molecular Plant Pathology, Wiley, 2018, 19 (5), pp.1238-1251. ⟨10.1111/mpp.12614⟩
- DOI
- DOI : 10.1111/mpp.12614
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-
- titre
- Comparison of Highly and Weakly Virulent Dickeya solani Strains, With a View on the Pangenome and Panregulon of This Species
- auteur
- M. Golanowska, M. Potrykus, A. Motyka-Pomagruk, M. Kabza, G. Bacci, M. Galardini, M. Bazzicalupo, I. Makalowska, K. Smalla, A. Mengoni, N. Hugouvieux-Cotte-Pattat, E. Lojkowska
- article
- Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2018, 9, pp.1940. ⟨10.3389/fmicb.2018.01940⟩
- DOI
- DOI : 10.3389/fmicb.2018.01940
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-
- titre
- The pH regulator PacC: a host-dependent virulence factor in Botrytis cinerea
- auteur
- Christine Rascle, Cindy Dieryckx, Jean William Dupuy, Laetitia Muszkieta, Eytham Souibgui, Michel Droux, Christophe Bruel, Vincent Girard, Nathalie Poussereau
- article
- Environmental Microbiology Reports, Wiley, 2018, 10 (5), pp.555-568. ⟨10.1111/1758-2229.12663⟩
- DOI
- DOI : 10.1111/1758-2229.12663
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-
- titre
- Patterns of protein carbonylation during Medicago truncatula seed maturation
- auteur
- Pascale Satour, Chvan Youssef, Benoit Ly Vu, Béatrice Teulat, Emilie Chatelain, Claudette Job, Dominique Job, Françoise Montrichard
- article
- Plant, Cell and Environment, Wiley, 2018, 41 (9), pp.2183-2194. ⟨10.1111/pce.13194⟩
- DOI
- DOI : 10.1111/pce.13194
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-
- titre
- The Effect of Crowding on Protein Stability, Rigidity, and High Pressure Sensitivity in Whole Cells
- auteur
- M. Golub, N. Martinez, G. Michoud, J. Ollivier, M. Jebbar, P. Oger, J. Peters
- article
- Langmuir, American Chemical Society, 2018, 34 (35), pp.10419-10425. ⟨10.1021/acs.langmuir.8b01240⟩
- DOI
- DOI : 10.1021/acs.langmuir.8b01240
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-
- titre
- Dickeya dadantii pectic enzymes necessary for virulence are also responsible for activation of the Arabidopsis thaliana innate immune system
- auteur
- D. Expert, O. Patrit, V. E. Shevchik, C. Perino, V. Boucher, C. Creze, E. Wenes, M. Fagard
- article
- Molecular Plant Pathology, Wiley, 2018, 19 (2), pp.313-327. ⟨10.1111/mpp.12522⟩
- DOI
- DOI : 10.1111/mpp.12522
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-
- titre
- Dynamic root exudate chemistry and microbial substrate preferences drive patterns in rhizosphere microbial community assembly
- auteur
- K. Zhalnina, K. B. Louie, Z. Hao, N. Mansoori, U. N. Rocha, S. Shi, H. Cho, U. Karaoz, D. Loque, B. P. Bowen, M. K. Firestone, T. R. Northen, E. L. Brodie
- article
- Nature Microbiology, Nature Publishing Group, 2018, 3 (4), pp.470-480. ⟨10.1038/s41564-018-0129-3⟩
- DOI
- DOI : 10.1038/s41564-018-0129-3
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-
- titre
- The Two-Component System ZraPSR Is a Novel ESR that Contributes to Intrinsic Antibiotic Tolerance in Escherichia coli
- auteur
- Kevin Rome, Céline Borde, Raleb Taher, Julien Cayron, Christian Lesterlin, Erwan Gueguen, Eve de Rosny, Agnès Rodrigue
- article
- Journal of Molecular Biology, Elsevier, 2018, 430 (24), pp.4971-4985. ⟨10.1016/j.jmb.2018.10.021⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.jmb.2018.10.021
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-
- titre
- ThreaDNA: predicting DNA mechanics’ contribution to sequence selectivity of proteins along whole genomes
- auteur
- Jasmin Cevost, Cédric Vaillant, Sam Meyer
- article
- Bioinformatics, Oxford University Press (OUP), 2018, 34 (4), pp.609-616. ⟨10.1093/bioinformatics/btx634⟩
- DOI
- DOI : 10.1093/bioinformatics/btx634
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-
- titre
- Leaching and Biodegradation of Darocur 1173 used as a Photo-Initiator in the Production of Photocrosslinked Silicone Acrylates
- auteur
- Salma Ouali, Yoann Louis, Patrick Germain, Rémy Gourdon, Valérie Desjardin
- article
- Journal of Polymers and the Environment, Springer Verlag, 2018, 26 (1), pp.244-253. ⟨10.1007/s10924-017-0939-z⟩
- DOI
- DOI : 10.1007/s10924-017-0939-z
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-
- titre
- Complete Genome Sequences of 11 Type Species from the Thermococcus Genus of Hyperthermophilic and Piezophilic Archaea
- auteur
- P. M. Oger
- article
- Genome Announcements, American Society for Microbiology, 2018, 6 (8)
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-
- titre
- Biochemical characterization of a thermostable endonuclease V from the hyperthermophilic euryarchaeon Thermococcus barophilus Ch5
- auteur
- Y. Wang, L. Zhang, X. Zhu, Y. Li, H. Shi, P. Oger, Z. Yang
- article
- International Journal of Biological Macromolecules, Elsevier, 2018, 117, pp.17-24. ⟨10.1016/j.ijbiomac.2018.05.155⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.ijbiomac.2018.05.155
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-
- titre
- Chromosomal organization of transcription: in a nutshell
- auteur
- Sam Meyer, S. Reverchon, W. Nasser, G. Muskhelishvili
- article
- Current Genetics, Springer Verlag, 2018, 64 (3), pp.555-565
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-
- titre
- Bacteriocyte Reprogramming to Cope With Nutritional Stress in a Phloem Sap Feeding Hemipteran, the Pea Aphid Acyrthosiphon pisum
- auteur
- Stefano Colella, Nicolas Parisot, Pierre Simonet, Karen Gaget, Gabrielle Duport, Patrice Baa-Puyoulet, Yvan Rahbé, Hubert Charles, Gérard Febvay, Patrick Callaerts, Federica Calevro
- article
- Frontiers in Physiology, Frontiers, 2018, 9, pp.1498. ⟨10.3389/fphys.2018.01498⟩
- DOI
- DOI : 10.3389/fphys.2018.01498
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-
2017
- titre
- Comprehensive proteome profiling in Aedes albopictus to decipher Wolbachia-arbovirus interference phenomenon
- auteur
- Yoann Saucereau, Claire Valiente Moro, Cindy Dieryckx, Jean-William Dupuy, Florence-Hélène Tran, Vincent Girard, Patrick Potier, Patrick Mavingui
- article
- BMC Genomics, BioMed Central, 2017, 18 (1), pp.635. ⟨10.1186/s12864-017-3985-y⟩
- DOI
- DOI : 10.1186/s12864-017-3985-y
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-
- titre
- The uniform structure of O-polysaccharides isolated from Dickeya solani strains of different origin
- auteur
- Karolina Ossowska, Małgorzata Czerwicka, Wojciech Sledz, Sabina Zoledowska, Agata Motyka, Małgorzata Golanowska, Guy Condemine, Ewa Lojkowska, Zbigniew Kaczyński
- article
- Carbohydrate Research, Elsevier, 2017, 445, pp.40 - 43. ⟨10.1016/j.carres.2017.04.001⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.carres.2017.04.001
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-
- titre
- 700 MPa sample stick for studying liquid samples or solid-gas reactions down to 1.8 K and up to 550 K
- auteur
- E. Lelièvre-Berna, B. Demé, J. Gonthier, J-P. Gonzales, J. Maurice, Y. Memphis, C. Payre, P. Oger, J. Peters, S. Vial
- article
- Journal of Neutron Research, IOS Press, 2017, 19 (1/2), pp.77-84
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-
- titre
- The role of intrinsic disorder and dynamics in the assembly and function of the type II secretion system
- auteur
- S. Gu, V. E. Shevchik, R. Shaw, R. W. Pickersgill, J. A. Garnett
- article
- Biochim Biophys Acta Proteins Proteom, 2017, 1865 (10), pp.1255-1266. ⟨10.1016/j.bbapap.2017.07.006⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.bbapap.2017.07.006
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-
- titre
- Spatial organization of DNA sequences directs the assembly of bacterial chromatin by a nucleoid-associated protein
- auteur
- Aleksandre Japaridze, Sylvain Renevey, Patrick Sobetzko, Liubov Stoliar, William Nasser, Giovanni Dietler, Georgi Muskhelishvili
- article
- Journal of Biological Chemistry, American Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2017, 292 (18), pp.7607-7618. ⟨10.1074/jbc.M117.780239⟩
- DOI
- DOI : 10.1074/jbc.M117.780239
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-
- titre
- Coping with the pressure: Microbial adaptation to high hydrostatic pressure in deep sea hydrothermal vents
- auteur
- Phil M. Oger
- article
- Journal of Physics: Conference Series, IOP Publishing, 2017, 950, pp.032016. ⟨10.1088/1742-6596/950/3/032016⟩
- DOI
- DOI : 10.1088/1742-6596/950/3/032016
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-
- titre
- Diversity of free-living amoebae in soils and their associated human opportunistic bacteria
- auteur
- Elodie Denet, Bénédicte Coupat-Goutaland, Sylvie Nazaret, Michel Pélandakis, Sabine Favre-Bonté
- article
- Parasitology Research, Springer Verlag (Germany), 2017, 116 (11), pp.3151-3162. ⟨10.1007/s00436-017-5632-6⟩
- DOI
- DOI : 10.1007/s00436-017-5632-6
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-
- titre
- Caballeronia mineralivorans sp. nov., isolated from oak-Scleroderma citrinum mycorrhizosphere.
- auteur
- Stéphane Uroz, P. Oger
- article
- Systematic and Applied Microbiology, Elsevier, 2017, 40 (6), pp.345-351. ⟨10.1016/j.syapm.2017.05.005⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.syapm.2017.05.005
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-
- titre
- Complete Genome Sequence of the Hyperthermophilic Piezophilic Archaeon Pyrococcus kukulkanii NCB100 Isolated from the Rebecca's Roost Hydrothermal Vent in the Guaymas Basin
- auteur
- P. M. Oger, N. Callac, C. Oger-Desfeux, S. Hughes, B. Gillet, M. Jebbar, A. Godfroy
- article
- Genome Announcements, American Society for Microbiology, 2017, 5 (7)
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-
- titre
- Erratum to: Multiple controls affect arsenite oxidase gene expression in Herminiimonas arsenicoxydans
- auteur
- S. Koechler, J. Cleiss-Arnold, C. Proux, O. Sismeiro, M. A. Dillies, F. Goulhen-Chollet, F. Hommais, D. Lièvremont, F. Arsène-Ploetze, J. Y. Coppe, P. N. Bertin
- article
- BMC Microbiology, BioMed Central, 2017, 17 (1), pp.74
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-
- titre
- Bacterial host and reporter gene optimization for genetically encoded whole cell biosensors
- auteur
- Catherine Brutesco, Sandra Preveral, Camille Escoffier, Elodie C. T. Descamps, Elsa Prudent, Julien Cayron, Louis Dumas, Manon Ricquebourg, Géraldine Adryanczyk-Perrier, Arjan de Groot, Daniel Garcia, Agnès Rodrigue, David Pignol, Nicolas Ginet
- article
- Environmental Science and Pollution Research, Springer Verlag, 2017, 24 (1), pp.52--65. ⟨10.1007/s11356-016-6952-2⟩
- DOI
- DOI : 10.1007/s11356-016-6952-2
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-
- titre
- Semi-autonomous inline water analyzer: design of a common light detector for bacterial, phage, and immunological biosensors
- auteur
- Elodie C. T. Descamps, Damien Meunier, Catherine Brutesco, Sandra Prévéral, Nathalie Franche, Ingrid Bazin, Bertrand Miclot, Philippe Larosa, Camille Escoffier, Jean-Raphaël Fantino, Daniel Garcia, Mireille Ansaldi, Agnès Rodrigue, David Pignol, Pierre Cholat, Nicolas Ginet
- article
- Environmental Science and Pollution Research, Springer Verlag, 2017, 24 (1), pp.66--72. ⟨10.1007/s11356-016-8010-5⟩
- DOI
- DOI : 10.1007/s11356-016-8010-5
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-
- titre
- 2-Substituted Aniline as a Simple Scaffold for LuxR-Regulated QS Modulation
- auteur
- S. Li, J. Wawrzyniak, Y. Queneau, L. Soulère
- article
- Molecules, MDPI, 2017, 22 (12), pp.E2090. ⟨10.3390/molecules22122090⟩
- DOI
- DOI : 10.3390/molecules22122090
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-
- titre
- Endoribonuclease-Based Two-Component Repressor Systems for Tight Gene Expression Control in Plants
- auteur
- Y. Liang, S. Richardson, V. T. Benites, C. Cheng-Yue, T. Tran, J. Mortimer, A. Mukhopadhyay, J. D. Keasling, H. V. Scheller, D. Loque
- article
- ACS Synthetic Biology, American Chemical Society, 2017, 6 (5), pp.806-816. ⟨10.1021/acssynbio.6b00295⟩
- DOI
- DOI : 10.1021/acssynbio.6b00295
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-
- titre
- Epsilonproteobacteria dominate bacterial diversity at a natural tar seep
- auteur
- F. Lormieres, P. M. Oger
- article
- Comptes Rendus Biologies, Elsevier, 2017, 340 (4), pp.238-243. ⟨10.1016/j.crvi.2016.10.001⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.crvi.2016.10.001
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-
- titre
- SbCOMT (Bmr12) is involved in the biosynthesis of tricin-lignin in sorghum
- auteur
- A. Eudes, T. Dutta, K. Deng, N. Jacquet, A. Sinha, V. T. Benites, E. E. K. Baidoo, A. Richel, S. E. Sattler, T. R. Northen, S. Singh, B. A. Simmons, D. Loque
- article
- PLoS ONE, Public Library of Science, 2017, 12 (6), pp.e0178160. ⟨10.1371/journal.pone.0178160⟩
- DOI
- DOI : 10.1371/journal.pone.0178160
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-
- titre
- Copper transporters are responsible for copper isotopic fractionation in eukaryotic cells
- auteur
- Jean-Loup Cadiou, Sylvain Pichat, Victor P. Bondanese, Alexandre Soulard, Toshiyuki Fujii, Francis Albarède, Philippe Oger
- article
- Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2017, 7, ⟨10.1038/srep44533⟩
- DOI
- DOI : 10.1038/srep44533
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-
- titre
- Pushing the limits of nickel detection to nanomolar range using a set of engineered bioluminescent Escherichia coli
- auteur
- Julien Cayron, Elsa Prudent, Camille Escoffier, Erwan Gueguen, Marie-Andrée Mandrand-Berthelot, David Pignol, Daniel Garcia, Agnès Rodrigue
- article
- Environmental Science and Pollution Research, Springer Verlag, 2017, 24 (1), pp.4 - 14. ⟨10.1007/s11356-015-5580-6⟩
- DOI
- DOI : 10.1007/s11356-015-5580-6
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-
- titre
- Regulation of the synthesis of pulp degrading enzymes in Bacillus isolated from cocoa fermentation
- auteur
- H. G. Ouattara, S. Reverchon, S. L. Niamke, W. Nasser
- article
- Food Microbiology, Elsevier, 2017, 63, pp.255-262
- Accès au bibtex
-
- titre
- Lactic acid bacteria involved in cocoa beans fermentation from Ivory Coast: Species diversity and citrate lyase production
- auteur
- Hadja Ouattara, Honoré Ouattara, Michel Droux, Sylvie Reverchon, William Nasser, Sébastien Niamke
- article
- International Journal of Food Microbiology, Elsevier, 2017, 256, pp.11-19. ⟨10.1016/j.ijfoodmicro.2017.05.008⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.ijfoodmicro.2017.05.008
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-
- titre
- Plant-phytopathogen interactions: bacterial responses to environmental and plant stimuli
- auteur
- Simon Leonard, Florence Hommais, William Nasser, Sylvie Reverchon
- article
- Environmental Microbiology, Society for Applied Microbiology and Wiley-Blackwell, 2017, 19 (5), pp.1689 - 1716. ⟨10.1111/1462-2920.13611⟩
- DOI
- DOI : 10.1111/1462-2920.13611
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-
- titre
- New nucleic acid testing devices to diagnose infectious diseases in resource-limited settings
- auteur
- P. Maffert, S. Reverchon, W. Nasser, C. Rozand, H. Abaibou
- article
- European Journal of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Springer Verlag, 2017, 36 (10), pp.1717-1731
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-
- titre
- Toward inline multiplex biodetection of metals, bacteria, and toxins in water networks: the COMBITOX project
- auteur
- Mireille Ansaldi, Ingrid Bazin, Pierre Cholat, Agnès Rodrigue, David Pignol
- article
- Environmental Science and Pollution Research, Springer Verlag, 2017, 24 (1), pp.1-3. ⟨10.1007/s11356-015-5582-4⟩
- DOI
- DOI : 10.1007/s11356-015-5582-4
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-
- titre
- A Combination of Histological, Physiological, and Proteomic Approaches Shed Light on Seed Desiccation Tolerance of the Basal Angiosperm Amborella trichopoda.
- auteur
- Matthieu Villegente, Philippe Marmey, Claudette Job, Marc Galland, Gwendal Cueff, Beatrice Godin, Loïc Rajjou, Thierry Balliau, Michel Zivy, Bruno Fogliani, Valérie Burtet-Sarramegna, Dominique Job
- article
- Proteomes, MDPI, 2017, 5 (3), pp.19. ⟨10.3390/proteomes5030019⟩
- DOI
- DOI : 10.3390/proteomes5030019
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-
- titre
- The interaction of the bioinsecticide PA1b (Pea Albumin 1 subunit b) with the insect V-ATPase triggers apoptosis
- auteur
- Vanessa Eyraud, Severine Balmand, Lamis Karaki, Isabelle Rahioui, Catherine Sivignon, Agnès F. Delmas, Corinne Royer, Yvan Rahbé, Pedro da Silva, Frédéric Gressent
- article
- Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2017, 7 (1), pp.4902. ⟨10.1038/s41598-017-05315-y⟩
- DOI
- DOI : 10.1038/s41598-017-05315-y
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-
2016
- titre
- Expression of S-adenosylmethionine Hydrolase in Tissues Synthesizing Secondary Cell Walls Alters Specific Methylated Cell Wall Fractions and Improves Biomass Digestibility
- auteur
- A. Eudes, N. Zhao, N. Sathitsuksanoh, E. E. Baidoo, J. Lao, Gang Wang, S. Yogiswara, T. S. Lee, S. Singh, J. C. Mortimer, J. D. Keasling, B. A. Simmons, D. Loque
- article
- Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, Frontiers, 2016, 4, pp.58
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- titre
- Relationship between digital information and thermodynamic stability in bacterial genomes
- auteur
- D. Nigatu, W. Henkel, P. Sobetzko, G. Muskhelishvili
- article
- EURASIP Journal on Bioinformatics and Systems Biology, SpringerOpen, 2016, 2016 (1), pp.4
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- titre
- Pichia kudrazevii and Candida nitrativorans are the most well-adapted and relevant yeast species fermenting cocoa in Agneby-Tiassa, a local Ivorian cocoa producing region
- auteur
- L. Samagaci, H. Ouattara, S. Niamke, M. Lemaire
- article
- Food Research International, Elsevier, 2016, 89 (Part 1), pp.773-780
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- titre
- Genome-wide analyses of chitin synthases identify horizontal gene transfers towards bacteria and allow a robust and unifying classification into fungi
- auteur
- Isabelle R. Gonçalves, Sophie Brouillet, Marie-Christine Soulié, Simonetta Gribaldo, Catherine Sirven, Noémie Charron, Martine Boccara, Mathias Choquer
- article
- BMC Evolutionary Biology, BioMed Central, 2016, 16, pp.252. ⟨10.1186/s12862-016-0815-9⟩
- DOI
- DOI : 10.1186/s12862-016-0815-9
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- titre
- Metabolism and Virulence Strategies in Dickeya–Host Interactions
- auteur
- N. Hugouvieux-Cotte-Pattat
- article
- Progress in Molecular Biology and Translational Science, Zafar U. Khan and E. Chris Muly, 2016, 142, pp.93-129. ⟨10.1016/bs.pmbts.2016.05.006⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/bs.pmbts.2016.05.006
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-
- titre
- Detection of the free living amoeba Naegleria fowleri by using conventional and real-time PCR based on a single copy DNA sequence
- auteur
- E. Regoudis, M. Pelandakis
- article
- Experimental Parasitology, Elsevier, 2016, 161, pp.35-9
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-
- titre
- Citrus Plants: A Model System for Unlocking the Secrets of NO and ROS-Inspired Priming Against Salinity and Drought
- auteur
- Athanassios Molassiotis, Dominique Job, Vasileios Ziogas, Georgia Tanou
- article
- Frontiers in Plant Science, Frontiers, 2016, 7, pp.229. ⟨10.3389/fpls.2016.00229⟩
- DOI
- DOI : 10.3389/fpls.2016.00229
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-
- titre
- Antimicrobial Peptide Resistance Genes in the Plant Pathogen Dickeya dadantii
- auteur
- Caroline Pandin, Martine Caroff, Guy Condemine
- article
- Applied and Environmental Microbiology, American Society for Microbiology, 2016, 82 (21), pp.6423-6430. ⟨10.1128/AEM.01757-16⟩
- DOI
- DOI : 10.1128/AEM.01757-16
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-
- titre
- Outbreak of diarrhoeal illness in participants in an obstacle adventure race, Alpes-Maritimes, France, June 2015
- auteur
- C. Six, S. Aboukais, S. Giron, J. C. d'Oliveira, F. Peloux-Petiot, F. Franke, H. Terrien, F. Dassonville, J. Deniau, K. Ambert-Balay, T. Chesnot, R. Ruimy, M. Pelandakis, P. Basset, M. Munoz Rivero, P. Malfait
- article
- Eurosurveillance, European Centre for Disease Prevention and Control, 2016, 21 (23), ⟨10.2807/1560-7917.ES.2016.21.23.30253⟩
- DOI
- DOI : 10.2807/1560-7917.ES.2016.21.23.30253
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-
- titre
- Population Structure in Naegleria fowleri as Revealed by Microsatellite Markers
- auteur
- B. Coupat-Goutaland, E. Regoudis, M. Besseyrias, A. Mularoni, M. Binet, P. Herbelin, M. Pelandakis
- article
- PLoS ONE, Public Library of Science, 2016, 11 (4), pp.e0152434
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-
- titre
- Synthesis of new dicinnamoyl 4-deoxy quinic acid and methyl ester derivatives and evaluation of the toxicity against the pea aphid Acyrthosiphon pisum.
- auteur
- Xiubin Li, Lucie Grand, Thomas Pouleriguen, Yves Queneau, Pedro da Silva, Yvan Rahbé, Jean-Luc Poëssel, Sylvie Moebs-Sanchez
- article
- Organic and Biomolecular Chemistry, Royal Society of Chemistry, 2016, 14 (8), pp.2487-2497. ⟨10.1039/c5ob02483h⟩
- DOI
- DOI : 10.1039/c5ob02483h
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- titre
- Transcriptional start site turnover in the evolution of bacterial paralogous genes - the pelE-pelD virulence genes in Dickeya
- auteur
- Alexandre Duprey, William Nasser, Simon Leonard, Céline Brochier-Armanet, S. Reverchon
- article
- FEBS Journal, Wiley, 2016, 283 (22), pp.4192-4207
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-
- titre
- Silencing of natural transformation by an RNA chaperone and a multitarget small RNA
- auteur
- Laetitia Attaiech, Aïda Boughammoura, Céline Brochier-Armanet, Omran Allatif, Flora Peillard-Fiorente, Ross A. Edwards, Ayat R. Omar, Andrew M. Macmillan, Mark Glover, Xavier Charpentier
- article
- Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America , National Academy of Sciences, 2016, 113 (31), pp.8813-8818. ⟨10.1073/pnas.1601626113⟩
- DOI
- DOI : 10.1073/pnas.1601626113
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-
- titre
- Effect of a static magnetic field on Escherichia coli adhesion and orientation
- auteur
- Lotfi Mhamdi, Nejib Mhamdi, Naceur Mhamdi, Philippe Lejeune, Nicole Jaffrezic-Renault, Noël Burais, Riccardo Scorretti, Jiry Pokorny, Laurence Ponsonnet
- article
- Canadian Journal of Microbiology, NRC Research Press, 2016, 62 (11), pp.944-952. ⟨10.1139/cjm-2015-0839⟩
- DOI
- DOI : 10.1139/cjm-2015-0839
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-
- titre
- Coordinated Regulation of Species-Specific Hydroxycinnamic Acid Degradation and Siderophore Biosynthesis Pathways in Agrobacterium fabrum
- auteur
- Jessica Baude, Ludovic Vial, Camille Villard, Tony Campillo, Céline Lavire, Xavier Nesme, Florence Hommais
- article
- Applied and Environmental Microbiology, American Society for Microbiology, 2016, 82 (12), pp.3515-3524. ⟨10.1128/aem.00419-16⟩
- DOI
- DOI : 10.1128/aem.00419-16
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- titre
- Exploiting members of the BAHD acyltransferase family to synthesize multiple hydroxycinnamate and benzoate conjugates in yeast
- auteur
- A. Eudes, M. Mouille, D. S. Robinson, V. T. Benites, Gang Wang, L. Roux, Y. L. Tsai, E. E. Baidoo, T. Y. Chiu, J. L. Heazlewood, H. V. Scheller, A. Mukhopadhyay, J. D. Keasling, S. Deutsch, D. Loque
- article
- Microbial Cell Factories, BioMed Central, 2016, 15 (1), pp.198. ⟨10.1186/s12934-016-0593-5⟩
- DOI
- DOI : 10.1186/s12934-016-0593-5
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- titre
- Pyrococcus kukulkanii sp. nov., a hyperthermophilic, piezophilic archaeon isolated from a deep-sea hydrothermal vent
- auteur
- N. Callac, P. Oger, F. Lesongeur, J. E. Rattray, P. Vannier, G. Michoud, M. Beauverger, N. Gayet, O. Rouxel, M. Jebbar, A. Godfroy
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2016, 66 (8), pp.3142-9. ⟨10.1099/ijsem.0.001160⟩
- DOI
- DOI : 10.1099/ijsem.0.001160
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- titre
- Molecular chaperone accumulation as a function of stress evidences adaptation to high hydrostatic pressure in the piezophilic archaeon Thermococcus barophilus
- auteur
- A. Cario, M. Jebbar, A. Thiel, N. Kervarec, P. M. Oger
- article
- Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2016, 6, pp.29483. ⟨10.1038/srep29483⟩
- DOI
- DOI : 10.1038/srep29483
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- titre
- Medical applications of Cu, Zn, and S isotope effects
- auteur
- F. Albarede, P. Telouk, V. Balter, V. P. Bondanese, E. Albalat, P. Oger, P. Bonaventura, P. Miossec, T. Fujii
- article
- Metallomics, Royal Society of Chemistry, 2016, 8 (10), pp.1056-1070. ⟨10.1039/c5mt00316d⟩
- DOI
- DOI : 10.1039/c5mt00316d
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- titre
- How Can Secretomics Help Unravel the Secrets of Plant-Microbe Interactions?
- auteur
- Delphine Vincent, Kim M. Plummer, Peter S. Solomon, Marc-Henri Lebrun, Dominique Job, Maryam Rafiqi
- article
- Frontiers in Plant Science, Frontiers, 2016, 1 p. ⟨10.3389/fpls.2016.01777⟩
- DOI
- DOI : 10.3389/fpls.2016.01777
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- titre
- Data set for transcriptome analysis of Escherichia coli exposed to nickel
- auteur
- Manon Gault, Agnès Rodrigue
- article
- Data in Brief, Elsevier, 2016, 9, pp.314 - 317. ⟨10.1016/j.dib.2016.08.069⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.dib.2016.08.069
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- titre
- Castles fall from inside: Evidence for dominant internal photo-catalytic mechanisms during treatment of Saccharomyces cerevisiae by photo-Fenton at neutral pH
- auteur
- S. Giannakis, C. Ruales-Lonfat, S. Rtimi, S. Thabet, P. Cotton, C. Pulgarín
- article
- Applied Catalysis B: Environmental, Elsevier, 2016, 185, pp.150-162
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-
- titre
- Erratum to: Temperature-induced variation in gene expression burst size in metazoan cells
- auteur
- O. Arnaud, Sam Meyer, E. Vallin, G. Beslon, O. Gandrillon
- article
- BMC Molecular Biology, BioMed Central, 2016, 17, pp.2
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-
- titre
- Complete Genome Sequence of the Hyperthermophilic and Piezophilic Archaeon Thermococcus barophilus Ch5, Capable of Growth at the Expense of Hydrogenogenesis from Carbon Monoxide and Formate
- auteur
- P. Oger, T. G. Sokolova, D. A. Kozhevnikova, E. A. Taranov, P. Vannier, H. S. Lee, K. K. Kwon, S. G. Kang, J. H. Lee, E. A. Bonch-Osmolovskaya, A. V. Lebedinsky
- article
- Genome Announcements, American Society for Microbiology, 2016, 4 (1), ⟨10.1128/genomeA.01534-15⟩
- DOI
- DOI : 10.1128/genomeA.01534-15
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- titre
- Erratum for Dalmasso et al., Complete Genome Sequence of the Hyperthermophilic and Piezophilic Archaeon Thermococcus piezophilus CDGST, Able To Grow under Extreme Hydrostatic Pressures
- auteur
- C. Dalmasso, P. Oger, D. Courtine, M. Georges, K. Takai, L. Maignien, K. Alain
- article
- Genome Announcements, American Society for Microbiology, 2016, 4 (5)
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- titre
- Random mutagenesis of the hyperthermophilic archaeon Pyrococcus furiosus using in vitro mariner transposition and natural transformation
- auteur
- Natalia Guschinskaya, Romain Brunel, Maxime Tourte, Gina L. Lipscomb, Michael W. W. Adams, Philippe Oger, Xavier Charpentier
- article
- Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2016, 6, pp.36711. ⟨10.1038/srep36711⟩
- DOI
- DOI : 10.1038/srep36711
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- titre
- Global transcriptional response of Dickeya dadantii to environmental stimuli relevant to the plant infection
- auteur
- X. Jiang, O. Zghidi-Abouzid, C. Oger-Desfeux, F. Hommais, N. Greliche, G. Muskhelishvili, W. Nasser, S. Reverchon
- article
- Environmental Microbiology, Society for Applied Microbiology and Wiley-Blackwell, 2016, 18 (11), pp.3651-3672
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- titre
- From multiple pathogenicity islands to a unique organized pathogenicity archipelago
- auteur
- C. Bouyioukos, S. Reverchon, F. Kepes
- article
- Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2016, 6, pp.27978. ⟨10.1038/srep27978⟩
- DOI
- DOI : 10.1038/srep27978
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- titre
- Regulation of pel genes, major virulence factors in the plant pathogen bacterium Dickeya dadantii, is mediated by cooperative binding of the nucleoid-associated protein H-NS
- auteur
- O. Zghidi-Abouzid, E. Herault, S. Rimsky, S. Reverchon, W. Nasser, M. Buckle
- article
- Research in Microbiology, Elsevier, 2016, 167 (4), pp.247-253
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-
- titre
- Temporal control of Dickeya dadantii main virulence gene expression by growth phase-dependent alteration of regulatory nucleoprotein complexes
- auteur
- A. Duprey, G. Muskhelishvili, S. Reverchon, W. Nasser
- article
- Biochimica et Biophysica Acta - Gene Regulatory Mechanisms , Elsevier, 2016, 1859 (11), pp.1470-1480
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-
- titre
- A robust gene-stacking method utilizing yeast assembly for plant synthetic biology
- auteur
- P. M. Shih, K. Vuu, N. Mansoori, L. Ayad, K. B. Louie, B. P. Bowen, T. R. Northen, D. Loque
- article
- Nature Communications, Nature Publishing Group, 2016, 7, pp.13215. ⟨10.1038/ncomms13215⟩
- DOI
- DOI : 10.1038/ncomms13215
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- titre
- Biotechnology and synthetic biology approaches for metabolic engineering of bioenergy crops
- auteur
- P. M. Shih, Y. Liang, D. Loque
- article
- Plant Journal, Wiley, 2016, 87 (1), pp.103-17. ⟨10.1111/tpj.13176⟩
- DOI
- DOI : 10.1111/tpj.13176
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- titre
- Meningoencephalitis due to the amoeboflagellate Naegleria fowleri in ruminants in Algeria
- auteur
- M. S. Benterki, A. Ayachi, O. Bennoune, E. Regoudis, M. Pelandakis
- article
- Parasite, EDP Sciences, 2016, 23, pp.11. ⟨10.1051/parasite/2016011⟩
- DOI
- DOI : 10.1051/parasite/2016011
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- titre
- Ni exposure impacts the pool of free Fe and modifies DNA supercoiling via metal-induced oxidative stress in Escherichia coli K-12
- auteur
- Manon Gault, Géraldine Effantin, Agnès Rodrigue
- article
- Free Radical Biology and Medicine, Elsevier, 2016, 97, pp.351 - 361. ⟨10.1016/j.freeradbiomed.2016.06.030⟩
- DOI
- DOI : 10.1016/j.freeradbiomed.2016.06.030
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- titre
- Genome-wide analysis identifies gain and loss/change of function within the small multigenic insecticidal Albumin 1 family of Medicago truncatula
- auteur
- L Karaki, P da Silva, F Rizk, C Chouabe, N Chantret, V Eyraud, F Gressent, C Sivignon, I Rahioui, D Kahn, Céline Brochier-Armanet, Yvan Rahbé, C Royer
- article
- BMC Plant Biology, BioMed Central, 2016, 16 (1), pp.63. ⟨10.1186/s12870-016-0745-0⟩
- DOI
- DOI : 10.1186/s12870-016-0745-0
- Accès au texte intégral et bibtex
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