Publications HAL de la structure 82660

2019

Article dans une revue

titre
SpiCee: A Genetic Tool for Subcellular and Cell-Specific Calcium Manipulation
auteur
Oriol Ros, Yvrick Zagar, Sandrine Couvet, Alain Aghaie, Fiona Roche, Sarah Baudet, Alice Louail, Christine Petit, Yves Mechulam, Xavier Nicol
article
SSRN Electronic Journal, 2019, ⟨10.2139/ssrn.3470393⟩
DOI
DOI : 10.2139/ssrn.3470393
Accès au bibtex
BibTex
titre
Recognition of different base tetrads by RHAU: X-ray crystal structure of the G4 recognition motif bound to the 3’-end tetrad of a DNA G-quadruplex
auteur
Brahim Heddi, Vee Vee Cheong, Emmanuelle Schmitt, Yves Mechulam, Anh Tuân Phan
article
Journal of Structural Biology, Elsevier, 2019, pp.S1047-8477(19)30210-2. ⟨10.1016/j.jsb.2019.10.001⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.jsb.2019.10.001
pubmedId
Pubmed icone : 31586599
Accès au bibtex
BibTex
titre
The human 18S rRNA m6A methyltransferase METTL5 is stabilized by TRMT112
auteur
Nhan Van tran, Felix G m Ernst, Ben Hawley, Christiane Zorbas, Nathalie Ulryck, Philipp Hackert, Katherine Bohnsack, Markus Bohnsack, Samie Jaffrey, Marc Graille, Denis L j Lafontaine
article
Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2019, 47 (15), pp.7719-7733. ⟨10.1093/nar/gkz619⟩
DOI
DOI : 10.1093/nar/gkz619
Accès au bibtex
BibTex
titre
SponGee: A Genetic Tool for Subcellular and Cell-Specific cGMP Manipulation
auteur
Oriol Ros, Yvrick Zagar, Solène Ribes, Sarah Baudet, Karine Loulier, Sandrine Couvet, Delphine Ladarre, Alain Aghaie, Alice Louail, Christine Petit, Yves Mechulam, Zsolt Lenkei, Xavier Nicol
article
Cell Reports , Elsevier Inc, 2019, 27 (13), pp.4003-4012.e6. ⟨10.1016/j.celrep.2019.05.102⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.celrep.2019.05.102
pubmedId
Pubmed icone : 31242429
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02165731/file/Ros%20et%20al%20-%20Cell%20Rep%202019.pdf BibTex
titre
NMR solution and X-ray crystal structures of a DNA molecule containing both right- and left-handed parallel-stranded G-quadruplexes
auteur
Fernaldo Richtia Winnerdy, Blaž Bakalar, Arijit Maity, J Jeya Vandana, Yves Mechulam, Emmanuelle Schmitt, Anh Tuân Phan
article
Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2019, pp.gkz349. ⟨10.1093/nar/gkz349⟩
DOI
DOI : 10.1093/nar/gkz349
pubmedId
Pubmed icone : 31216034
Accès au bibtex
BibTex
titre
The DEAH-box RNA helicase Dhr1 contains a remarkable carboxyl terminal domain essential for small ribosomal subunit biogenesis
auteur
Amlan Roychowdhury, Clément Joret, Gabrielle Bourgeois, Valérie Heurgué-Hamard, Denis Lafontaine, Marc Graille
article
Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2019, pp.gkz529. ⟨10.1093/nar/gkz529⟩
DOI
DOI : 10.1093/nar/gkz529
pubmedId
Pubmed icone : 31188444
Accès au bibtex
BibTex
titre
Cortical branched actin determines cell cycle progression
auteur
Nicolas Molinie, Svetlana Rubtsova, Artem Fokin, Sai Visweshwaran, Nathalie Rocques, Anna Polesskaya, Anne Schnitzler, Sophie Vacher, Evgeny Denisov, Lubov Tashireva, Vladimir Perelmuter, Nadezhda Cherdyntseva, Ivan Bièche, Alexis Gautreau
article
Cell Research, Nature Publishing Group, 2019, 29 (6), pp.432-445. ⟨10.1038/s41422-019-0160-9⟩
DOI
DOI : 10.1038/s41422-019-0160-9
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02266355/file/Molinie%20Cell%20Res%202019.pdf BibTex
titre
Barhl2 maintains T cell factors as repressors and thereby switches off the Wnt/β-Catenin response driving Spemann organizer formation
auteur
Elena Sena, Nathalie Rocques, Caroline Borday, Harem Sabr Muhamad Amin, Karine Parain, David Sitbon, Albert Chesneau, Beatrice Durand
article
Development (Cambridge, England), Company of Biologists, 2019, 146 (10), pp.dev173112. ⟨10.1242/dev.173112⟩
DOI
DOI : 10.1242/dev.173112
pubmedId
Pubmed icone : 31036545
Accès au bibtex
BibTex
titre
Purification of tubulin with controlled posttranslational modifications by polymerization-depolymerization cycles
auteur
Judith Souphron, Satish Bodakuntla, Jijumon A.S., Goran Lakisic, Alexis Gautreau, Carsten Janke, Maria Magiera
article
Nature Protocols, Nature Publishing Group, 2019, ⟨10.1038/s41596-019-0153-7⟩
DOI
DOI : 10.1038/s41596-019-0153-7
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02391936/file/Souphron%202019%20author%20file.pdf BibTex
titre
Start Codon Recognition in Eukaryotic and Archaeal Translation Initiation: A Common Structural Core
auteur
Emmanuelle Schmitt, Pierre-Damien Coureux, Auriane Monestier, Etienne Dubiez, Yves Mechulam
article
International Journal of Molecular Sciences, MDPI, 2019, 20 (4), pp.939. ⟨10.3390/ijms20040939⟩
DOI
DOI : 10.3390/ijms20040939
pubmedId
Pubmed icone : 30795538
Accès au bibtex
BibTex
titre
A Minimal Sequence for Left-Handed G-Quadruplex Formation
auteur
Blaž Bakalar, Brahim Heddi, Emmanuelle Schmitt, Yves Mechulam, Anh Tuân Phan
article
Angewandte Chemie International Edition, Wiley-VCH Verlag, 2019, 58 (8), pp.2331-2335. ⟨10.1002/anie.201812628⟩
DOI
DOI : 10.1002/anie.201812628
pubmedId
Pubmed icone : 30481397
Accès au bibtex
BibTex
titre
m6A mRNA Destiny: Chained to the rhYTHm by the YTH-Containing Proteins
auteur
Ditipriya Hazra, Clément Chapat, Marc Graille
article
Genes, MDPI, 2019, 10 (1), pp.49. ⟨10.3390/genes10010049⟩
DOI
DOI : 10.3390/genes10010049
pubmedId
Pubmed icone : 30650668
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal-polytechnique.archives-ouvertes.fr/hal-01996108/file/genes-10-00049-v2.pdf BibTex
titre
Phosphorylation of Merlin by Aurora A kinase appears necessary for mitotic progression
auteur
Vinay Mandati, Laurence Maestro, Florent Dingli, Berangère Lombard, Damarys Loew, Nicolas Molinie, Stephane Romero, Daniel Bouvard, Daniel Louvard, Alexis Gautreau, Eric Pasmant, Dominique Lallemand
article
Journal of Biological Chemistry, American Society for Biochemistry and Molecular Biology, In press, pp.jbc.RA118.006937. ⟨10.1074/jbc.RA118.006937⟩
DOI
DOI : 10.1074/jbc.RA118.006937
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02266353/file/Mandati%20JBC%202019%20In%20press.pdf BibTex

2018

Article dans une revue

titre
mRNA decapping: finding the right structures
auteur
Clément Charenton, Marc Graille
article
Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, Royal Society, The, 2018, 373 (1762), pp.20180164. ⟨10.1098/rstb.2018.0164⟩
DOI
DOI : 10.1098/rstb.2018.0164
pubmedId
Pubmed icone : 30397101
Accès au bibtex
BibTex
titre
Cyclization Reaction Catalyzed by Cyclodipeptide Synthases Relies on a Conserved Tyrosine Residue
auteur
Emmanuelle Schmitt, Gabrielle Bourgeois, Muriel Gondry, Alexey Aleksandrov
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2018, 8 (1), pp.7031. ⟨10.1038/s41598-018-25479-5⟩
DOI
DOI : 10.1038/s41598-018-25479-5
pubmedId
Pubmed icone : 29728603
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal-polytechnique.archives-ouvertes.fr/hal-01974171/file/41598_2018_Article_25479.pdf BibTex
titre
Variable Neighborhood Search with Cost Function Networks To Solve Large Computational Protein Design Problems
auteur
Antoine Charpentier, David Mignon, Sophie Barbe, Juan Cortés, Thomas Schiex, Thomas Simonson, David Allouche
article
Journal of Chemical Information and Modeling, American Chemical Society, 2018, ⟨10.1021/acs.jcim.8b00510⟩
DOI
DOI : 10.1021/acs.jcim.8b00510
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.laas.fr/hal-01943616/file/VNS-CPD_Charpentier_2018.pdf BibTex
titre
Multifaceted Study on a Cytochalasin Scaffold: Lessons on Reactivity, Multidentate Catalysis, and Anticancer Properties
auteur
Mehdi Zaghouani, Oscar Gayraud, Vincent Jactel, Sébastien Prevost, Ambre Dezaire, Michèle Sabbah, Alexandre Escargueil, Thanh-Lan Lai, Christophe Le clainche, Nathalie Rocques, Stéphane Romero, Alexis Gautreau, Florent Blanchard, Gilles Frison, Bastien Nay
article
Chemistry - A European Journal, Wiley-VCH Verlag, 2018, 24 (62), pp.16686-16691. ⟨10.1002/chem.201804023⟩
DOI
DOI : 10.1002/chem.201804023
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02135339/file/CEJ2018_version%20r%C3%A9vis%C3%A9e.pdf BibTex
titre
Evolutionary insights into Trm112-methyltransferase holoenzymes involved in translation between archaea and eukaryotes
auteur
Nhan Van tran, Leslie Muller, Robert Ross, Roxane Lestini, Juliette Létoquart, Nathalie Ulryck, Patrick Limbach, Valérie De crécy-Lagard, Sarah Cianférani, Marc Graille
article
Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2018, 46 (16), pp.8483 - 8499. ⟨10.1093/nar/gky638⟩
DOI
DOI : 10.1093/nar/gky638
Accès au bibtex
BibTex
titre
Adaptive landscape flattening in amino acid sequence space for the computational design of protein:peptide binding
auteur
Francesco Villa, Nicolas Panel, Xingyu Chen, Thomas Simonson
article
Journal of Chemical Physics, American Institute of Physics, 2018, 149 (7), pp.072302. ⟨10.1063/1.5022249⟩
DOI
DOI : 10.1063/1.5022249
pubmedId
Pubmed icone : 30134674
Accès au bibtex
BibTex
titre
How does binding of agonist ligands control intrinsic molecular dynamics in human NMDA receptors?
auteur
Zoltan Palmai, Kimberley Houenoussi, Sylvia Cohen-Kaminsky, Luba Tchertanov
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2018, 13 (8), pp.e0201234. ⟨10.1371/journal.pone.0201234⟩
DOI
DOI : 10.1371/journal.pone.0201234
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02411581/file/journal.pone.0201234.pdf BibTex
titre
Classical Drude Polarizable Force Field Model for Methyl Phosphate and Its Interactions with Mg 2+
auteur
Francesco Villa, Alexander Mackerell, Benoît Roux, Thomas Simonson
article
Journal of Physical Chemistry A, American Chemical Society, 2018, 122 (29), pp.6147-6155. ⟨10.1021/acs.jpca.8b04418⟩
DOI
DOI : 10.1021/acs.jpca.8b04418
pubmedId
Pubmed icone : 29966419
Accès au bibtex
BibTex
titre
The trimeric coiled‐coil HSBP1 protein promotes WASH complex assembly at centrosomes
auteur
Sai Visweshwaran, Peter Thomason, Raphaël Guérois, Sophie Vacher, Evgeny Denisov, Lubov Tashireva, Maria Lomakina, Christine Lazennec‐schurdevin, Goran Lakisic, Sergio Lilla, Nicolas Molinie, Véronique Henriot, Yves Mechulam, Antonina Alexandrova, Nadezhda Cherdyntseva, Ivan Bièche, Emmanuelle Schmitt, Robert Insall, Alexis Gautreau
article
EMBO Journal, EMBO Press, 2018, 37 (13), pp.e97706. ⟨10.15252/embj.201797706⟩
DOI
DOI : 10.15252/embj.201797706
pubmedId
Pubmed icone : 29844016
Accès au bibtex
BibTex
titre
Structural basis for partition of the cyclodipeptide synthases into two subfamilies
auteur
Gabrielle Bourgeois, Jérôme Seguin, Morgan Babin, Pascal Belin, Mireille Moutiez, Yves Mechulam, Muriel Gondry, Emmanuelle Schmitt
article
Journal of Structural Biology, Elsevier, 2018, 203 (1), pp.17-26. ⟨10.1016/j.jsb.2018.03.001⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.jsb.2018.03.001
pubmedId
Pubmed icone : 29505829
Accès au bibtex
BibTex
titre
Accurate PDZ/Peptide Binding Specificity with Additive and Polarizable Free Energy Simulations
auteur
Nicolas Panel, Francesco Villa, Ernesto Fuentes, Thomas Simonson
article
Biophysical Journal, Biophysical Society, 2018, 114 (5), pp.1091-1102. ⟨10.1016/j.bpj.2018.01.008⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.bpj.2018.01.008
pubmedId
Pubmed icone : 29539396
Accès au bibtex
BibTex
titre
NRL and CRX Define Photoreceptor Identity and Reveal Subgroup-Specific Dependencies in Medulloblastoma
auteur
Alexandra Garancher, Charles Lin, Morgane Morabito, Wilfrid Richer, Nathalie Rocques, Magalie Larcher, Laure Bihannic, Kyle Smith, Catherine Miquel, Sophie Leboucher, Nirmitha Herath, Fanny Dupuy, Pascale Varlet, Christine Haberler, Christine Walczak, Nadine El Tayara, Andreas Volk, Stéphanie Puget, François Doz, Olivier Delattre, Sabine Druillennec, Olivier Ayrault, Robert Wechsler-Reya, Alain Eychène, Franck Bourdeaut, Paul Northcott, Celio Pouponnot
article
Cancer Cell, Elsevier, 2018, 33 (3), pp.435-449.e6. ⟨10.1016/j.ccell.2018.02.006⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.ccell.2018.02.006
Accès au bibtex
BibTex
titre
The Arp2/3 Regulatory System and Its Deregulation in Cancer
auteur
Nicolas Molinie, Alexis Gautreau
article
Physiological Reviews, American Physiological Society, 2018, 98 (1), pp.215-238. ⟨10.1152/physrev.00006.2017⟩
DOI
DOI : 10.1152/physrev.00006.2017
pubmedId
Pubmed icone : 29212790
Accès au bibtex
BibTex
titre
The Arp2/3 Regulatory System and Its Deregulation in Cancer
auteur
Nicolas Molinie, Alexis Gautreau
article
Physiological Reviews, American Physiological Society, 2018, 98 (1), pp.215-238. ⟨10.1152/physrev.00006.2017⟩
DOI
DOI : 10.1152/physrev.00006.2017
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02266360/file/Molinie%20Physiol%20Rev%202018%20%281%29.pdf BibTex
titre
Role of aIF1 in Pyrococcus abyssi translation initiation
auteur
Auriane Monestier, Christine Lazennec-Schurdevin, Pierre-Damien Coureux, Yves Mechulam, Emmanuelle Schmitt
article
Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2018, 46 (20), pp.11061-11074. ⟨10.1093/nar/gky850⟩
DOI
DOI : 10.1093/nar/gky850
pubmedId
Pubmed icone : 30239976
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal-polytechnique.archives-ouvertes.fr/hal-01974980/file/gky850.pdf BibTex
titre
The trimeric coiled‐coil HSBP 1 protein promotes WASH complex assembly at centrosomes
auteur
Sai Visweshwaran, Peter Thomason, Raphaël Guérois, Sophie Vacher, Evgeny Denisov, Lubov Tashireva, Maria Lomakina, Christine Lazennec‐schurdevin, Goran Lakisic, Sergio Lilla, Nicolas Molinie, Veronique Henriot, Yves Mechulam, Antonina Alexandrova, Nadezhda Cherdyntseva, Ivan Bièche, Emmanuelle Schmitt, Robert Insall, Alexis Gautreau
article
EMBO Journal, EMBO Press, 2018, 37 (13), pp.e97706. ⟨10.15252/embj.201797706⟩
DOI
DOI : 10.15252/embj.201797706
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02266358/file/Sai%20EMBO%20J%202018.pdf BibTex
titre
GBF1 and Arf1 interact with Miro and regulate mitochondrial positioning within cells
auteur
Laurence Walch, Emilie Pellier, Weihua Leng, Goran Lakisic, Alexis Gautreau, Vincent Contremoulins, Jean-Marc Verbavatz, Catherine Jackson
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2018, 8, pp.17121. ⟨10.1038/s41598-018-35190-0⟩
DOI
DOI : 10.1038/s41598-018-35190-0
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02266357/file/Walch%20Sci%20Rep%202018.pdf BibTex

Chapitre d'ouvrage

titre
Contribution of the Yeast Saccharomyces cerevisiae Model to Understand the Mechanisms of Selenium Toxicity
auteur
Myriam Lazard, Marc Dauplais, Pierre Plateau
article
Molecular and Integrative Toxicology, 16, Springer International Publishing, pp.71-87, 2018, Selenium, 978-3-319-95389-2. ⟨10.1007/978-3-319-95390-8_4⟩
DOI
DOI : 10.1007/978-3-319-95390-8_4
Accès au bibtex
BibTex
titre
Random Migration Assays of Mammalian Cells and Quantitative Analyses of Single Cell Trajectories
auteur
Irene Dang, Alexis Gautreau
article
Methods in Molecular Biology, 1749, Humana Press, pp.1-9, 2018, Cell Migration, 978-1-4939-7700-0. ⟨10.1007/978-1-4939-7701-7_1⟩
DOI
DOI : 10.1007/978-1-4939-7701-7_1
pubmedId
Pubmed icone : 29525985
Accès au bibtex
BibTex
titre
Directional Collective Migration in Wound Healing Assays
auteur
Nicolas Molinie, Alexis Gautreau
article
Humana Press. Methods in Molecular Biology, 1749, Springer Science+Business Media, pp.11-19, 2018, Cell Migration, 978-1-4939-7700-0. ⟨10.1007/978-1-4939-7701-7_2⟩
DOI
DOI : 10.1007/978-1-4939-7701-7_2
pubmedId
Pubmed icone : 29525986
Accès au bibtex
BibTex

2017

Article dans une revue

titre
Computational design of fully overlapping coding schemes for protein pairs and triplets
auteur
Vaitea Opuu, Martin Silvert, Thomas Simonson
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2017, 7 (1), ⟨10.1038/s41598-017-16221-8⟩
DOI
DOI : 10.1038/s41598-017-16221-8
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal-polytechnique.archives-ouvertes.fr/hal-01961705/file/s41598-017-16221-8.pdf BibTex
titre
Trm112, a Protein Activator of Methyltransferases Modifying Actors of the Eukaryotic Translational Apparatus
auteur
Gabrielle Bourgeois, Juliette Létoquart, Nhan van Tran, Marc Graille
article
Biomolecules, MDPI, 2017, 7 (4), pp.7. ⟨10.3390/biom7010007⟩
DOI
DOI : 10.3390/biom7010007
pubmedId
Pubmed icone : 28134793
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal-polytechnique.archives-ouvertes.fr/hal-01948152/file/biomolecules-07-00007.pdf BibTex
titre
A unique surface on Pat1 C-terminal domain directly interacts with Dcp2 decapping enzyme and Xrn1 5′–3′ mRNA exonuclease in yeast
auteur
Clément Charenton, Claudine Gaudon-Plesse, Zaineb Fourati, Valério Taverniti, Régis Back, Olga Kolesnikova, Bertrand Séraphin, Marc Graille
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America , National Academy of Sciences, 2017, 114 (45), pp.E9493-E9501. ⟨10.1073/pnas.1711680114⟩
DOI
DOI : 10.1073/pnas.1711680114
pubmedId
Pubmed icone : 29078363
Accès au bibtex
BibTex
titre
Simple models for nonpolar solvation: Parameterization and testing
auteur
Eleni Michael, Savvas Polydorides, Thomas Simonson, Georgios Archontis
article
Journal of Computational Chemistry, Wiley, 2017, 38 (29), pp.2509-2519. ⟨10.1002/jcc.24910⟩
DOI
DOI : 10.1002/jcc.24910
Accès au bibtex
BibTex
titre
On the Relation between Chemical Oscillations and Self-Replication
auteur
Erwan Bigan, Pierre Plateau
article
Artificial Life, Massachusetts Institute of Technology Press (MIT Press), 2017, 23 (4), pp.453-480. ⟨10.1162/ARTL_a_00241⟩
DOI
DOI : 10.1162/ARTL_a_00241
pubmedId
Pubmed icone : 28985117
Accès au bibtex
BibTex
titre
Comparing pairwise-additive and many-body generalized Born models for acid/base calculations and protein design
auteur
Francesco Villa, David Mignon, Savvas Polydorides, Thomas Simonson
article
Journal of Computational Chemistry, Wiley, 2017, 38 (28), pp.2396-2410. ⟨10.1002/jcc.24898⟩
DOI
DOI : 10.1002/jcc.24898
pubmedId
Pubmed icone : 28749575
Accès au bibtex
BibTex
titre
Full Protein Sequence Redesign with an MMGBSA Energy Function
auteur
Thomas Gaillard, Thomas Simonson
article
Journal of Chemical Theory and Computation, American Chemical Society, 2017, 13 (10), pp.4932-4943. ⟨10.1021/acs.jctc.7b00202⟩
DOI
DOI : 10.1021/acs.jctc.7b00202
pubmedId
Pubmed icone : 28886244
Accès au bibtex
BibTex
titre
A Simple PB/LIE Free Energy Function Accurately Predicts the Peptide Binding Specificity of the Tiam1 PDZ Domain
auteur
Nicolas Panel, Young Sun, Ernesto Fuentes, Thomas Simonson
article
Frontiers in Molecular Biosciences, Frontiers Media, 2017, 4, ⟨10.3389/fmolb.2017.00065⟩
DOI
DOI : 10.3389/fmolb.2017.00065
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal-polytechnique.archives-ouvertes.fr/hal-01961715/file/fmolb-04-00065.pdf BibTex
titre
Recent advances in the mechanism of selenoamino acids toxicity in eukaryotic cells
auteur
Myriam Lazard, Marc Dauplais, Sylvain Blanquet, Pierre Plateau
article
Biomolecular concepts, 2017, 8 (2), pp.93-104. ⟨10.1515/bmc-2017-0007⟩
DOI
DOI : 10.1515/bmc-2017-0007
pubmedId
Pubmed icone : 28574376
Accès au bibtex
BibTex
titre
The structure of an E. coli tRNA f Met A 1-U 72 variant shows an unusual conformation of the A 1-U 72 base pair
auteur
Auriane Monestier, Alexey Aleksandrov, Pierre-Damien Coureux, Michel Panvert, Yves Mechulam, Emmanuelle Schmitt
article
RNA, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2017, 23 (5), pp.673-682. ⟨10.1261/rna.057877.116⟩
DOI
DOI : 10.1261/rna.057877.116
pubmedId
Pubmed icone : 28143889
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal-polytechnique.archives-ouvertes.fr/hal-01961641/file/673.pdf BibTex
titre
Computational Design of the Tiam1 PDZ Domain and Its Ligand Binding
auteur
David Mignon, Nicolas Panel, Xingyu Chen, Ernesto Fuentes, Thomas Simonson
article
Journal of Chemical Theory and Computation, American Chemical Society, 2017, 13 (5), pp.2271-2289. ⟨10.1021/acs.jctc.6b01255⟩
DOI
DOI : 10.1021/acs.jctc.6b01255
pubmedId
Pubmed icone : 28394603
Accès au bibtex
BibTex
titre
The Arp2/3 inhibitory protein Arpin is dispensable for chemotaxis
auteur
Irene Dang, Joern Linkner, Jun Yan, Daniel Irimia, Jan Faix, Alexis Gautreau
article
Biology of the Cell, Wiley, 2017, 109 (4), pp.162-166. ⟨10.1111/boc.201600064⟩
DOI
DOI : 10.1111/boc.201600064
pubmedId
Pubmed icone : 28186323
Accès au bibtex
BibTex
titre
Exposure to selenomethionine causes selenocysteine misincorporation and protein aggregation in Saccharomyces cerevisiae.
auteur
Pierre Plateau, Cosmin Saveanu, Roxane Lestini, Marc Dauplais, Laurence Decourty, Alain Jacquier, Sylvain Blanquet, Myriam Lazard
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2017, 7, pp.44761. ⟨10.1038/srep44761⟩
DOI
DOI : 10.1038/srep44761
pubmedId
Pubmed icone : 28303947
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal-pasteur.archives-ouvertes.fr/pasteur-01496769/file/2017_Plateau_et_al_Scientific_Reports.pdf BibTex
titre
DNA binding specificities of Escherichia coli Cas1–Cas2 integrase drive its recruitment at the CRISPR locus
auteur
Clara Moch, Michel Fromant, Sylvain Blanquet, Pierre Plateau
article
Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2017, 45 (5), pp.2714-2723. ⟨10.1093/nar/gkw1309⟩
DOI
DOI : 10.1093/nar/gkw1309
pubmedId
Pubmed icone : 28034956
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal-polytechnique.archives-ouvertes.fr/hal-01961608/file/gkw1309.pdf BibTex
titre
Equivalence of M- and P-Summation in Calculations of Ionic Solvation Free Energies
auteur
Thomas Simonson, Gerhard Hummer, Benoît Roux
article
Journal of Physical Chemistry A, American Chemical Society, 2017, 121 (7), pp.1525-1530. ⟨10.1021/acs.jpca.6b12691⟩
DOI
DOI : 10.1021/acs.jpca.6b12691
Accès au bibtex
BibTex
titre
Structural Basis of Arp2/3 Complex Inhibition by GMF, Coronin, and Arpin
auteur
Olga Sokolova, Angelina Chemeris, Siyang Guo, Salvatore Alioto, Meghal Gandhi, Shae Padrick, Evgeniya Pechnikova, Violaine David, Alexis Gautreau, Bruce Goode
article
Journal of Molecular Biology, Elsevier, 2017, 429 (2), pp.237-248. ⟨10.1016/j.jmb.2016.11.030⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.jmb.2016.11.030
pubmedId
Pubmed icone : 27939292
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal-polytechnique.archives-ouvertes.fr/hal-01964479/file/nihms850600.pdf BibTex
titre
Probing the stereospecificity of tyrosyl- and glutaminyl-tRNA synthetase with molecular dynamics
auteur
Karen Druart, Maeva Le Guennec, Zoltan Palmai, Thomas Simonson
article
Journal of Molecular Graphics and Modelling, Elsevier, 2017, 71, pp.192-199. ⟨10.1016/j.jmgm.2016.11.007⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.jmgm.2016.11.007
pubmedId
Pubmed icone : 27939931
Accès au bibtex
BibTex
titre
Gradients of Rac1 Nanoclusters Support Spatial Patterns of Rac1 Signaling
auteur
Amanda Remorino, Simon de Beco, Fanny Cayrac, Fahima Di Federico, Gaetan Cornilleau, Alexis Gautreau, Maria Carla Parrini, Jean-Baptiste Masson, Maxime Dahan, Mathieu Coppey
article
Cell Reports , Elsevier Inc, 2017, 21 (7), pp.1922-1935. ⟨10.1016/j.celrep.2017.10.069⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.celrep.2017.10.069
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-01637091/file/1-s2.0-S2211124717315322-main.pdf BibTex
titre
β1 integrin dependent Rac/group I PAK signaling mediates YAP activation of Yes associated protein 1 (YAP1) via NF2/merlin.
auteur
Hiba Sabra, Molly Brunner, Vinay Mandati, Bernhard Wehrle-Haller, Dominique Lallemand, Anne-Sophie Ribba, Genevieve Chevalier, Philippe Guardiola, Marc Block, Daniel Bouvard
article
Journal of Biological Chemistry, American Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2017, ⟨10.1074/jbc.M117.808063⟩
DOI
DOI : 10.1074/jbc.M117.808063
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01612087/file/Sabra%20et%20al_REV%20mss%20hig%20resolution.pdf BibTex
titre
Activation mode of the eukaryotic m2G10 tRNA methyltransferase Trm11 by its partner protein Trm112
auteur
Gabrielle Bourgeois, Julien Marcoux, Jean-Michel Saliou, Sarah Cianférani, Marc Graille
article
Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2017, 45 (4), pp.1971-1982. ⟨10.1093/nar/gkw1271⟩
DOI
DOI : 10.1093/nar/gkw1271
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal-polytechnique.archives-ouvertes.fr/hal-01953006/file/gkw1271.pdf BibTex