2019
Journal articles
- titre
- Human Proteome Project Mass Spectrometry Data Interpretation Guidelines 3.0
- auteur
- Eric W Deutsch, Lydie Lane, Christopher M Overall, Nuno Bandeira, Mark D. Baker, Charles Pineau, Robert L Moritz, Fernando Corrales, Sandra Orchard, Jennifer E van Eyk, Young-Ki Paik, Susan T Weintraub, Yves Vandenbrouck, Gilbert S Omenn
- article
- Journal of Proteome Research, 2019, 18 (12), pp.4108-4116. ⟨10.1021/acs.jproteome.9b00542⟩
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- titre
- Physical and functional interaction between SET1/COMPASS complex component CFP-1 and a Sin3S HDAC complex in C. elegans
- auteur
- Flore Beurton, Przemyslaw Stempor, Matthieu Caron, Alex Appert, Yan Dong, Ron A-J Chen, David Cluet, Yohann Couté, Marion Herbette, Ni Huang, Hélène Polvèche, Martin Spichty, Cécile Bedet, Julie Ahringer, Francesca Palladino
- article
- Nucleic Acids Research, 2019, 47 (21), pp.11164-11180. ⟨10.1093/nar/gkz880⟩
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- titre
- Comprehensive and comparative exploration of the Atp7b(-/-) mouse plasma proteome
- auteur
- Maud Lacombe, Michel Jaquinod, Lucid Belmudes, Yohann Couté, Claire Ramus, Florence Combes, Thomas Burger, Elisabeth Mintz, Justine Barthelon, Vincent Leroy, Aurélia Poujois, Alain Lachaux, France Woimant, Virginie Brun
- article
- Metallomics, 2019, 12 (2), pp.249-258. ⟨10.1039/c9mt00225a⟩
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- titre
- Physical and functional interaction between SET1/COMPASS complex component CFP-1 and a Sin3S HDAC complex in C. elegans
- auteur
- Flore Beurton, Przemyslaw Stempor, Matthieu Caron, Alex Appert, Yan Dong, Ron A-J Chen, David Cluet, Yohann Couté, Marion Herbette, Ni Huang, Hélène Polveche, Martin Spichty, Cécile Bedet, Julie Ahringer, Francesca Palladino
- article
- Nucleic Acids Research, 2019, 47 (21), pp.11164-11180. ⟨10.1093/nar/gkz880⟩
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- titre
- Polarization Induced Electro-Functionalization of Pore Walls: A Contactless Technology
- auteur
- Aurelie Bouchet-Spinelli, Emeline Descamps, Jie Liu, Abdulghani Ismail, Pascale Pham, François Chatelain, Thierry Leichle, Loic Leroy, Patrice Noël Marche, Camille Raillon, André Roget, Yoann Roupioz, Neso Sojic, Arnaud Buhot, Vincent Haguet, Thierry Livache, Pascal Mailley
- article
- Biosensors, 2019, 9 (4), pp.E121. ⟨10.3390/bios9040121⟩
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- titre
- Dissecting the Shared and Context-Dependent Pathways Mediated by the p140Cap Adaptor Protein in Cancer and in Neurons
- auteur
- Jennifer Chapelle, Oksana Sorokina, Colin Mclean, Vincenzo Salemme, Annalisa Alfieri, Costanza Angelini, Alessandro Morellato, Annie Adrait, Elisabetta Menna, Michela Matteoli, Yohann Couté, Ugo Ala, Emilia Turco, Paola Defilippi, J. Douglas Armstrong
- article
- Frontiers in Cell and Developmental Biology, 2019, 7, ⟨10.3389/fcell.2019.00222⟩
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- titre
- Rotator Cuff Tenocytes Differentiate into Hypertrophic Chondrocyte-Like Cells to Produce Calcium Deposits in an Alkaline Phosphatase-Dependent Manner
- auteur
- Christelle Darrieutort-Laffite, Paul Arnolfo, Thomas Garraud, Annie Adrait, Yohann Couté, Guy Louarn, Valérie Trichet, Pierre Layrolle, Benoit Le Goff, Fréderic Blanchard
- article
- Journal of Clinical Medicine, 2019, 8 (10), pp.1544. ⟨10.3390/jcm8101544⟩
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- titre
- Chimeric Protein–Protein Interface Inhibitors Allow Efficient Inhibition of Type III Secretion Machinery and Pseudomonas aeruginosa Virulence
- auteur
- Tuan-Dung Ngo, Sophie Plé, Aline Thomas, Caroline Barette, Antoine Fortuné, Younes Bouzidi, Marie-Odile Fauvarque, Rossimiriam Pereira de Freitas, Flaviane Francisco Hilário, Ina Attree, Yung-Sing Wong, Eric Faudry
- article
- ACS Infectious Diseases, 2019, 5 (11), pp.1843-1854. ⟨10.1021/acsinfecdis.9b00154⟩
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- titre
- Identification of the Arabidopsis calmodulin-dependent NAD+ kinase that sustains the elicitor-induced oxidative burst
- auteur
- Elisa Dell'Aglio, Cécile Giustini, Alexandra Kraut, Yohann Couté, Alex Costa, Guillaume Decros, Yves Gibon, Christian Mazars, Michel Matringe, Giovanni Finazzi, Gilles Curien
- article
- Plant Physiology, 2019, 181 (4), pp.1449-1458. ⟨10.1104/pp.19.00912⟩
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- titre
- Signaling Pathways, Chemical and Biological Modulators of Nucleotide Excision Repair: The Faithful Shield against UV Genotoxicity
- auteur
- F. Kobaisi, N. Fayyad, H. Rezvani, M. Fayyad-Kazan, E. Sulpice, B. Badran, H. Fayyad-Kazan, X. Gidrol, Walid Rachidi
- article
- Oxidative Medicine and Cellular Longevity, 2019, 2019, pp.1-18. ⟨10.1155/2019/4654206⟩
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- titre
- High-Content Screening Identifies New Inhibitors of Connexin 43 Gap Junctions
- auteur
- Christèle Picoli, Emmanuelle Soleilhac, Agnès Journet, Caroline Barette, Marjorie Comte, Christian Giaume, Franck Mouthon, Marie-Odile Fauvarque, Mathieu Charvériat
- article
- ASSAY and Drug Development Technologies, 2019, 17 (5), pp.240-248. ⟨10.1089/adt.2019.927⟩
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- titre
- Androgen receptor-modulatory microRNAs provide insight into therapy resistance and therapeutic targets in advanced prostate cancer
- auteur
- Claire Fletcher, Eric Sulpice, Stéphanie Combe, Akifumi Shibakawa, Damien Leach, Mark Hamilton, Stelios Chrysostomou, Adam Sharp, Jon Welti, Wei Yuan, Dafydd. Dart, Eleanor Knight, Jian Ning, Jeffrey Francis, Evangelia Kounatidou, Luke Gaughan, Amanda Swain, Shawn Lupold, Johann de Bono, Sean Mcguire, Xavier Gidrol, Charlotte Bevan
- article
- Oncogene, 2019, 38 (28), pp.5700-5724. ⟨10.1038/s41388-019-0823-5⟩
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- titre
- Interactome of the yeast RNA polymerase III transcription machinery constitutes several chromatin modifiers and regulators of the genes transcribed by RNA polymerase II
- auteur
- Pratibha Bhalla, Dipti Vinayak Vernekar, Benoit Gilquin, Yohann Couté, Purnima Bhargava
- article
- Gene, 2019, 702, pp.205-214. ⟨10.1016/j.gene.2018.12.037⟩
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- titre
- USP1 links platinum resistance to cancer cell dissemination by regulating Snail stability
- auteur
- Maura Sonego, Ilenia Pellarin, Alice Costa, Gian Luca Rampioni Vinciguerra, Michela Coan, Alexandra Kraut, Sara D’andrea, Alessandra Dall’acqua, Dan Cacsire Castillo-Tong, Daniela Califano, Simona Losito, Riccardo Spizzo, Yohann Couté, Andrea Vecchione, Barbara Belletti, Monica Schiappacassi, Gustavo Baldassarre
- article
- Science Advances , 2019, 5 (5), pp.eaav3235. ⟨10.1126/sciadv.aav3235⟩
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- titre
- Cyclins B1, T1, and H differ in their molecular mode of interaction with cytomegalovirus protein kinase pUL97
- auteur
- Mirjam Steingruber, Lena Keller, Eileen Socher, Sabrina Ferré, Anne-Marie Hesse, Yohann Couté, Friedrich Hahn, Nicole Büscher, Bodo Plachter, Heinrich Sticht, Manfred Marschall
- article
- Journal of Biological Chemistry, 2019, 294 (15), pp.6188-6203. ⟨10.1074/jbc.RA118.007049⟩
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- titre
- BMP9 is a paracrine factor controlling liver sinusoidal endothelial cell fenestration and protecting from hepatic fibrosis
- auteur
- Agnès Desroches-Castan, Emmanuelle Tillet, Nicolas Ricard, Marie Ouarné, Christine Mallet, Lucid Belmudes, Yohann Couté, Olivier Boillot, Jean-Yves Scoazec, Sabine Bailly, Jean-Jacques Feige
- article
- Hepatology, 2019, ⟨10.1002/hep.30655⟩
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- titre
- UAP56 associates with DRM2 and is localized to chromatin in Arabidopsis
- auteur
- Jacinthe Azevedo, Claire Picart, Laurent Dureau, Dominique Pontier, Sylvie Jaquinod-Kieffer, Mohamed-Ali Hakimi, Thierry Lagrange
- article
- FEBS Open Bio, 2019, 9 (5), pp.973-985. ⟨10.1002/2211-5463.12627⟩
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- titre
- Unravelling hidden components of the chloroplast envelope proteome: opportunities and limits of better MS sensitivity
- auteur
- Imen Bouchnak, Sabine Brugière, Lucas Moyet, Sophie Le Gall, Daniel Salvi, Marcel Kuntz, Marianne Tardif, Norbert Rolland
- article
- Molecular and Cellular Proteomics, 2019, 18 (7), mcp.RA118.000988. ⟨10.1074/mcp.RA118.000988⟩
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- titre
- Insertion sequences drive the emergence of a highly adapted human pathogen
- auteur
- Erwin Sentausa, Pauline Basso, Alice Berry, Annie Adrait, Gwendoline Bellement, Stephen Lory, Sylvie Elsen, Yohann Coute, Ina Attree
- article
- Microbial Genomics, 2019, 6 (9), ⟨10.1099/mgen.0.000265⟩
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- titre
- Ribosomal Proteins Regulate MHC Class I Peptide Generation for Immunosurveillance
- auteur
- Jiajie Wei, Rigel Kishton, Matthew Angel, Crystal Conn, Nicole Dalla Venezia, Virginie Marcel, Anne Vincent, Frédéric Catez, Sabrina Ferré, Lilia Ayadi, Virginie Marchand, Devin Dersh, Louis M. Staudt, James Gibbs, Ivaylo Ivanov, Nathan Fridlyand, Yohann Coute, Jean-Jacques Diaz, Shu-Bing Qian, Nicholas P Restifo, Jonathan Yewdell
- article
- Molecular Cell, 2019, ⟨10.1016/j.molcel.2018.12.020⟩
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- titre
- Five simple yet essential steps to correctly estimate the rate of false differentially abundant proteins in mass spectrometry analyses
- auteur
- Samuel Wieczorek, Quentin Giai Gianetto, Thomas Burger
- article
- Journal of Proteomics, 2019, 207, pp.103441. ⟨10.1016/j.jprot.2019.103441⟩
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- titre
- Building blocks for a European Organ-on-Chip roadmap
- auteur
- Christine L. Mummery, Peter Loskill, Dries Braeken, Wolfgang Eberle, Madalena Cipriano, Luis Fernandez, Mart Graef, Xavier X. Gidrol, Nathalie Picollet-d'Hahan, Berend van Meer, Ignacio Ochoa, Mieke Schutte, Massimo Mastrangeli, Sylvie Millet, The Orchid Partners, Janny van den Eijnden-van Raaij
- article
- Altex -Heidelberg-, 2019, 36 (4), pp.481-492. ⟨10.14573/altex.1905221⟩
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- titre
- Distinguishing between Spectral Clustering and Cluster Analysis of Mass Spectra
- auteur
- Hélène Borges, Romain Guibert, Olga Permiakova, Thomas Burger
- article
- Journal of Proteome Research, 2019, 18 (1), pp.571-573. ⟨10.1021/acs.jproteome.8b00516⟩
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- titre
- Pandoravirus Celtis Illustrates the Microevolution Processes at Work in the Giant Pandoraviridae Genomes
- auteur
- Matthieu Legendre, Jean-Marie Alempic, Nadège Philippe, Audrey Lartigue, Sandra Jeudy, Olivier Poirot, Ngan Thi Ta, Sébastien Nin, Yohann Couté, Chantal Abergel, Jean-Michel Claverie
- article
- Frontiers in Microbiology, 2019, 10, pp.430. ⟨10.3389/fmicb.2019.00430⟩
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- titre
- A Soluble Metabolon Synthesizes the Isoprenoid Lipid Ubiquinone
- auteur
- Mahmoud Hajj Chehade, Ludovic Pelosi, Cameron David Fyfe, Laurent Loiseau, Bérengère Rascalou, Sabine Brugière, Katayoun Kazemzadeh, Chau-Duy-Tam Vo, Lidia Ciccone, Laurent Aussel, Yohann Couté, Marc Fontecave, Frédéric Barras, Murielle Lombard, Fabien Pierrel
- article
- Cell Chemical Biology, 2019, 26 (4), pp.482-492.e7. ⟨10.1016/j.chembiol.2018.12.001⟩
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- titre
- Bioinformatics tools and workflow to select blood biomarkers for early cancer diagnosis: an application to pancreatic cancer
- auteur
- Yves Vandenbrouck, David Christiany, Florence Combes, Valentin Loux, Virginie Brun
- article
- Proteomics, 2019, 19 (21-22), pp.e1800489. ⟨10.1002/pmic.201800489⟩
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- titre
- The architecture of lipid droplets in the diatom Phaeodactylum tricornutum
- auteur
- Josselin Lupette, Antoine Jaussaud, Khawla Seddiki, Christian Morabito, Sabine Brugière, Hubert Schaller, Marcel Kuntz, Jean-Luc Putaux, Pierre-Henri Jouneau, Fabrice Rébeillé, Denis Falconet, Yohann Coute, Juliette Jouhet, Marianne Tardif, Juliette Salvaing, Eric Marechal
- article
- Algal Research - Biomass, Biofuels and Bioproducts, 2019, 38, pp.101415. ⟨10.1016/j.algal.2019.101415⟩
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- titre
- Ruminococcin C, a promising antibiotic produced by a human gut symbiont
- auteur
- Steve Chiumento, Clarisse Roblin, Sylvie Kieffer-Jaquinod, Sybille Tachon, Chloé Leprêtre, Christian Basset, Dwi Aditiyarini, Hamza Olleik, Cendrine Nicoletti, Olivier Bornet, Olga Iranzo, Marc Maresca, Renaud Hardré, Michel Fons, Thierry Giardina, Estelle Devillard, Françoise Guerlesquin, Yohann Couté, Mohamed Atta, Josette Perrier, Mickael Lafond, Victor Duarte
- article
- Science Advances , 2019, 5 (9), pp.eaaw9969. ⟨10.1126/sciadv.aaw9969⟩
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Book sections
- titre
- Ultrasensitive Quantification of Recombinant Proteins Using AAA-MS
- auteur
- Mathilde Louwagie, Sylvie Kieffer-Jaquinod, Virginie Brun
- article
- Ultrasensitive Quantification of Recombinant Proteins Using AAA-MS, pp.1-10, 2019
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- titre
- Designing an in silico strategy to select tissue-leakage biomarkers using the galaxy framework
- auteur
- Lien Nguyen, Virginie Brun, Florence Combes, Valentin Loux, Yves Vandenbrouck
- article
- Proteomics for biomarker discovery: Methods and protocols, 1959, pp.275-289, 2019, Methods in Molecular Biology book series (MIMB), ISBN: 978-1-4939-9164-8. ⟨10.1007/978-1-4939-9164-8_18⟩
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- titre
- Protein Biomarker Discovery in Non-depleted Serum by Spectral Library-Based Data-Independent Acquisition Mass Spectrometry
- auteur
- Alexandra Kraut, Mathilde Louwagie, Christophe Bruley, Christophe D. Masselon, Yohann Couté, Virginie Brun, Anne-Marie Hesse
- article
- Methods in Molecular Biology, 1959, pp.129-150, 2019
- Accès au bibtex
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- titre
- Protein-Level Statistical Analysis of Quantitative Label-Free Proteomics Data with ProStaR
- auteur
- Samuel Wieczorek, Florence Combes, Hélène Borges, Thomas Burger
- article
- Proteomics for Biomarker Discovery, pp.225-246, 2019, Methods in Molecular Biology, ⟨10.1007/978-1-4939-9164-8_15⟩
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