Publications HAL de la structure 552718;1043111

2024

Journal articles

titre
The Arabidopsis leaf quantitative atlas: a cellular and subcellular mapping through unified data integration
auteur
Dimitri Tolleter, Edward N Smith, Clémence Dupont-Thibert, Clarisse Uwizeye, Denis Vile, Pauline Gloaguen, Denis Falconet, Giovanni Finazzi, Yves Vandenbrouck, Gilles Curien
article
Quantitative Plant Biology, 2024, 5, pp.e2. ⟨10.1017/qpb.2024.1⟩
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https://hal.science/hal-04504920/file/Tolleter_2024.pdf BibTex

2023

Journal articles

titre
Light-independent regulation of algal photoprotection by CO2 availability
auteur
M. Águila Ruiz-Sola, Serena Flori, Yizhong Yuan, Gaelle Villain, Emanuel Sanz-Luque, Petra Redekop, Ryutaro Tokutsu, Anika Küken, Angeliki Tsichla, Georgios Kepesidis, Guillaume Allorent, Marius Arend, Fabrizio Iacono, Giovanni Finazzi, Michael Hippler, Zoran Nikoloski, Jun Minagawa, Arthur R Grossman, Dimitris Petroutsos
article
Nature Communications, 2023, 14 (1), pp.1977. ⟨10.1038/s41467-023-37800-6⟩
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https://hal.science/hal-04075888/file/Aguila%20Ruiz-Sola-2023-Light-independent%20re.pdf BibTex
titre
Adaptive traits of cysts of the snow alga Sanguina nivaloides unveiled by 3D subcellular imaging
auteur
Jade Ezzedine, Clarisse Uwizeye, Grégory Si Larbi, Gaelle Villain, Mathilde Louwagie, Marion Schilling, Pascal Hagenmuller, Benoît Gallet, Adeline Stewart, Dimitris Petroutsos, Fabienne Devime, Pascal Salze, Lucie Liger, Juliette Jouhet, Marie Dumont, Stéphane Ravanel, Alberto Amato, Jean-Gabriel Valay, Pierre-Henri Jouneau, Denis Falconet, Eric Maréchal
article
Nature Communications, 2023, 14 (1), pp.7500. ⟨10.1038/s41467-023-43030-7⟩
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https://hal.science/hal-04294008/file/s41467-023-43030-7.pdf BibTex
titre
Improving photosynthetic efficiency toward food security: Strategies, advances, and perspectives
auteur
Edward N Smith, Marvin van Aalst, Tiina Tosens, Ülo Niinemets, Benjamin Stich, Tomas Morosinotto, Alessandro Alboresi, Tobias Erb, Paul A Gómez-Coronado, Dimitri Tolleter, Giovanni Finazzi, Gilles Curien, Matthias Heinemann, Oliver Ebenhöh, Julian M Hibberd, Urte Schlüter, Tianshu Sun, Andreas P.M. Weber
article
Molecular Plant, 2023, 16 (10), pp.1547-1563. ⟨10.1016/j.molp.2023.08.017⟩
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https://hal.science/hal-04212442/file/Smith%20et%20al.pdf BibTex
titre
Tailoring confocal microscopy for real-time analysis of photosynthesis at single-cell resolution
auteur
Mattia Storti, Haythem Hsine, Clarisse Uwizeye, Olivier Bastien, Daniel P Yee, Fabien Chevalier, Johan Decelle, Cécile Giustini, Daniel Béal, Gilles Curien, Giovanni Finazzi, Dimitri Tolleter
article
Cell Reports Methods, 2023, 3 (9), pp.100568. ⟨10.1016/j.crmeth.2023.100568⟩
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https://hal.science/hal-04302239/file/Storti_2023_PMID_37751690.pdf BibTex
titre
Loss of CpFTSY Reduces Photosynthetic Performance and Affects Insertion of PsaC of PSI in Diatoms
auteur
Marianne Nymark, Giovanni Finazzi, Charlotte Volpe, Manuel Serif, Davi de Miranda Fonseca, Animesh Sharma, Nicolas Sanchez, Amit Kumar Sharma, Felicity Ashcroft, Ralph Kissen, Per Winge, Atle Magnar Bones
article
Plant and Cell Physiology, 2023, 64 (6), pp.583-603. ⟨10.1093/pcp/pcad014⟩
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https://hal.science/hal-04090163/file/Nymark%20et%20al%20-%20Plant%20Cell%20Physiol%202023.pdf BibTex
titre
3D‐reconstructions of zygospores in Zygnema vaginatum (Charophyta) reveal details of cell wall formation, suggesting adaptations to extreme habitats
auteur
Charlotte Permann, Martina Pichrtová, Tereza Šoljaková, Klaus Herburger, Pierre‐henri Jouneau, Clarisse Uwizeye, Denis Falconet, Eric Marechal, Andreas Holzinger
article
Physiologia Plantarum, 2023, 175 (4), pp.e13988. ⟨10.1111/ppl.13988⟩
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https://hal.science/hal-04189778/file/Physiologia%20Plantarum%20-%202023%20-%20Permann.pdf BibTex
titre
Limiting etioplast gene‐expression induces apical hook twisting during skoto‐morphogenesis of Arabidopsis seedlings
auteur
Salek Ahmed Sajib, Björn Grübler, Cylia Oukacine, Etienne Delannoy, Florence Courtois, Caroline Mauve, Claire Lurin, Bertrand Gakière, Thomas Pfannschmidt, Livia Merendino
article
Plant Journal, 2023, 114 (2), pp.293-309. ⟨10.1111/tpj.16134⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-04003971/file/The%20Plant%20Journal%20-%202023%20-%20Sajib%20-%20Limiting%20et.pdf BibTex

2022

Journal articles

titre
E. coli chromosomal-driven expression of NADK2 from A. thaliana: A preferable alternative to plasmid-driven expression for challenging proteins
auteur
Matthieu Goussé, Elisa Dell’aglio, Gilles Curien, Stéphanie Borland, Sébastien Renoud, Caroline Ranquet, Alexia Chandor-Proust
article
Protein Expression and Purification, 2022, 195-196, pp.106090. ⟨10.1016/j.pep.2022.106090⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03651303/file/Gouss%C3%A9_et_al_2022_submitted.pdf BibTex
titre
Photosynthetic light harvesting and thylakoid organization in a CRISPR/Cas9 Arabidopsis thaliana LHCB1 knockout mutant
auteur
Hamed Sattari Vayghan, Wojciech Nawrocki, Christo Schiphorst, Dimitri Tolleter, Chen Hu, Véronique Douet, Gaëtan Glauser, Giovanni Finazzi, Roberta Croce, Emilie Wientjes, Fiamma Longoni
article
Frontiers in Plant Science, 2022, 13, pp.833032. ⟨10.3389/fpls.2022.833032⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03651281/file/satt1.pdf BibTex
titre
Trade-off between sex and growth in diatoms: Molecular mechanisms and demographic implications
auteur
Rossella Annunziata, Bruno Hay Mele, Pina Marotta, Massimiliano Volpe, Laura Entrambasaguas, Svenja Mager, Krzysztof Stec, Maurizio Ribera d'Alcalà, Remo Sanges, Giovanni Finazzi, Daniele Iudicone, Marina Montresor, Maria Immacolata Ferrante
article
Science Advances , 2022, 8 (3), pp.eabj9466. ⟨10.1126/sciadv.abj9466⟩
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https://hal.science/hal-03544630/file/sciadv.abj9466.pdf BibTex
titre
A metabolic, phylogenomic and environmental atlas of diatom plastid transporters from the model species Phaeodactylum
auteur
Shun Liu, Mattia Storti, Giovanni Finazzi, Chris Bowler, Richard G Dorrell
article
Frontiers in Plant Science, 2022, 13, pp.950467. ⟨10.3389/fpls.2022.950467⟩
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https://hal.science/hal-03828869/file/Liu%20et%20al%20-%20Frontiers%20in%20Plant%20Science%202022.pdf BibTex
titre
Protection of photosystem I during sudden light stress depends on ferredoxin:NADP(H) reductase abundance and interactions
auteur
Melvin Rodriguez-Heredia, Francesco Saccon, Sam Wilson, Giovanni Finazzi, Alexander V Ruban, Guy T Hanke
article
Plant Physiology, 2022, 188 (2), pp.1028-1042. ⟨10.1093/plphys/kiab550⟩
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https://hal.science/hal-03544690/file/Rodriguez-Heredia-2022-Protection%20of%20photos.pdf BibTex
titre
Impaired photoprotection in $Phaeodactylum\ tricornutum$ KEA3 mutants reveals the proton regulatory circuit of diatoms light acclimation
auteur
Claire Seydoux, Mattia Storti, Vasco Giovagnetti, Anna Matuszyńska, Erika Guglielmino, Xue Zhao, Cécile Giustini, Yufang Pan, Lander Blommaert, Jhoanell Angulo, Alexander Ruban, Hanhua Hu, Benjamin Bailleul, Florence Verniquet Courtois, Guillaume Allorent, Giovanni Finazzi
article
New Phytologist, 2022, 234 (2), pp.578-591. ⟨10.1111/nph.18003⟩
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https://hal.science/hal-03612330/file/Seydoux-2022-Impaired%20photoprotec.pdf BibTex

Book sections

titre
Cell Biology of Organelles
auteur
Uwe Maier, Daniel Moog, Serena Flori, Pierre-Henri Jouneau, Denis Falconet, Thomas Heimerl, Peter Kroth, Giovanni Finazzi
article
The Molecular Life of Diatoms, Springer International Publishing, pp.265-286, 2022, ⟨10.1007/978-3-030-92499-7_10⟩
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https://hal.science/hal-03666831/file/Book%20chapter-life%20of%20diatoms-Maier.pdf BibTex

2021

Journal articles

titre
Morphological bases of phytoplankton energy management and physiological responses unveiled by 3D subcellular imaging
auteur
Clarisse Uwizeye, Johan Decelle, Pierre-Henri Jouneau, Serena Flori, Benoit Gallet, Jean-Baptiste Keck, Davide Dal Bo, Christine Moriscot, Claire Seydoux, Fabien Chevalier, Nicole L Schieber, Rachel Templin, Guillaume Allorent, Florence Courtois, Gilles Curien, Yannick Schwab, Guy Schoehn, Samuel C Zeeman, Denis Falconet, Giovanni Finazzi
article
Nature Communications, 2021, 12 (1), pp.1049. ⟨10.1038/s41467-021-21314-0⟩
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https://hal.science/hal-03157982/file/Uwizeye-2021-Morphological%20bases.pdf BibTex
titre
Subcellular architecture and metabolic connection in the planktonic photosymbiosis between Collodaria (radiolarians) and their microalgae
auteur
Johan Decelle, Giulia Veronesi, Lekieffre Charlotte, Benoit Gallet, Fabien Chevalier, Hryhoriy Stryhanyuk, Sophie Marro, Stéphane Ravanel, Rémi Tucoulou, Schieber Nicole, Giovanni Finazzi, Yannick Schwab, Niculina Musat
article
Environmental Microbiology, 2021, 23 (11), pp.6569-6586. ⟨10.1111/1462-2920.15766⟩
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https://hal.science/hal-03373848/file/Decelle-2021-Subcellular%20architec.pdf BibTex
titre
Cytoklepty in the plankton: A host strategy to optimize the bioenergetic machinery of endosymbiotic algae
auteur
Clarisse Uwizeye, Margaret Mars Brisbin, Benoit Gallet, Fabien Chevalier, Charlotte Lekieffre, Nicole Schieber, Denis Falconet, Daniel Wangpraseurt, Lukas Schertel, Hryhoriy Stryhanyuk, Niculina Musat, Satoshi Mitarai, Yannick Schwab, Giovanni Finazzi, Johan Decelle
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2021, 118 (27), pp.e2025252118. ⟨10.1073/pnas.2025252118⟩
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https://hal.science/hal-03281020/file/Uwizeye%20et%20al_merged_1619052681_small.pdf BibTex
titre
Consequences of Mixotrophy on Cell Energetic Metabolism in Microchloropsis gaditana Revealed by Genetic Engineering and Metabolic Approaches
auteur
Davide Dal Bo, Leonardo Magneschi, Mariette Bedhomme, Elodie Billey, Etienne Deragon, Mattia Storti, Mathilde Menneteau, Christelle Richard, Camille Rak, Morgane Lapeyre, Mehdi Lembrouk, Melissa Conte, Valérie Gros, Guillaume Tourcier, Cécile Giustini, Denis Falconet, Gilles Curien, Guillaume Allorent, Dimitris Petroutsos, Frédéric Laeuffer, Laurent Fourage, Juliette Jouhet, Eric Maréchal, Giovanni Finazzi, Séverine Collin
article
Frontiers in Plant Science, 2021, 12, ⟨10.3389/fpls.2021.628684⟩
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https://hal.science/hal-03237438/file/dal%20Bo%20et%20al%202021%20mixo%20nanno.pdf BibTex
titre
Boosting Biomass Quantity and Quality by Improved Mixotrophic Culture of the Diatom Phaeodactylum tricornutum
auteur
Valeria Villanova, Dipali Singh, Julien Pagliardini, David Fell, Adeline Le Monnier, Giovanni Finazzi, Mark Poolman
article
Frontiers in Plant Science, 2021, 12, ⟨10.3389/fpls.2021.642199⟩
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https://hal.science/hal-03202742/file/Villanova-2021-Boosting%20Biomass%20Qua.pdf BibTex
titre
Functional studies of CpSRP54 in diatoms show that the mechanism of thylakoid protein insertion differs from plants and green algae
auteur
Marianne Nymark, Marthe Caroline Grønbech Hafskjold, Charlotte Volpe, Davi de Miranda Fonseca, Animesh Sharma, Eirini Tsirvouli, Manuel Serif, Per Winge, Giovanni Finazzi, Atle Magnar Bones
article
Plant Journal, 2021, 106 (1), pp.113-132. ⟨10.1111/tpj.15149⟩
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https://hal.science/hal-03098197/file/CpSRP54%20manuscript.pdf BibTex
titre
Mixotrophic growth of the extremophile galdieria sulphuraria reveals the flexibility of its carbon assimilation metabolism
auteur
Gilles Curien, Dagmar Lyska, Erika Guglielmino, Phillip Westhoff, Janina Janetzko, Marianne Tardif, Clément Hallopeau, Sabine Brugière, Davide Dal Bo, Johan Decelle, Benoit Gallet, Denis Falconet, Michele Carone, Claire Remacle, Myriam Ferro, Andreas Weber, Giovanni Finazzi
article
New Phytologist, 2021, ⟨10.1111/nph.17359⟩
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https://hal.science/hal-03193983/file/Curien_et_al_2021_New_Phytologist_plus_Supporting_information.pdf BibTex
titre
Regulation of photosynthetic electron flow on dark to light transition by ferredoxin:NADP(H) oxidoreductase interactions
auteur
Manuela Kramer, Melvin Rodriguez-Heredia, Francesco Saccon, Laura Mosebach, Manuel Twachtmann, Anja Krieger-Liszkay, Chris Duffy, Robert J Knell, Giovanni Finazzi, Guy Thomas Hanke
article
eLife, 2021, 10, ⟨10.7554/eLife.56088⟩
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https://hal.science/hal-03214040/file/Kramer%20-.pdf BibTex
titre
A multifaceted analysis reveals two distinct phases of chloroplast biogenesis during de-etiolation in Arabidopsis
auteur
Rosa Pipitone, Simona Eicke, Barbara Pfister, Gaetan Glauser, Denis Falconet, Clarisse Uwizeye, Thibaut Pralon, Samuel C Zeeman, Felix Kessler, Emilie Demarsy
article
eLife, 2021, 10, ⟨10.7554/eLife.62709⟩
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https://hal.science/hal-03158173/file/Pipitone%20-%20Elife%202021.pdf BibTex
titre
Catalytic Reactions and Energy Conservation in the Cytochrome bc 1 and b 6 f Complexes of Energy-Transducing Membranes
auteur
Marcin Sarewicz, Sebastian Pintscher, Rafał Pietras, Arkadiusz Borek, Łukasz Bujnowicz, Guy Hanke, William Cramer, Giovanni Finazzi, Artur Osyczka
article
Chemical Reviews, 2021, 121 (4), pp.2020-2108. ⟨10.1021/acs.chemrev.0c00712⟩
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https://hal.science/hal-03122713/file/Sarewicz%20et%20al%20-%20Final_version.pdf BibTex
titre
ChloroKB, a cell metabolism reconstruction of the model plant Arabidopsis thaliana
auteur
Pauline Gloaguen, Yves Vandenbrouck, Jacques Joyard, Gilles Curien
article
Comptes Rendus Biologies, 2021, 344 (2), pp.157-163. ⟨10.5802/crbiol.49⟩
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https://hal.science/hal-03282179/file/Gloaguen_et_al_ChloroKB_CRAS_2021.pdf BibTex
titre
Characterization of the Bubblegum acyl-CoA synthetase of Microchloropsis gaditana
auteur
Elodie Billey, Leonardo Magneschi, Sébastien Leterme, Mariette Bedhomme, Amélie Andres-Robin, Laurent Poulet, Morgane Michaud, Giovanni Finazzi, Renaud Dumas, Serge Crouzy, Frédéric Laueffer, Laurent Fourage, Fabrice Rébeillé, Alberto Amato, Séverine Collin, Juliette Jouhet, Eric Marechal
article
Plant Physiology, 2021, 185 (3), pp.815-835. ⟨10.1093/plphys/kiaa110⟩
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https://hal.science/hal-03185953/file/Billey%20et%20al%20-%20Plant%20Physiol%202021.pdf BibTex

2020

Journal articles

titre
Mutation of the atypical kinase ABC1K3 partially rescues the PROTON GRADIENT REGULATION 6 phenotype in $Arabidopsis\ thaliana$
auteur
Thibaut Pralon, Joy Collombat, Rosa Pipitone, Brigitte Ksas, Venkatasalam Shanmugabalaji, Michel Havaux, Giovanni Finazzi, Paolo Longoni, Felix Kessler
article
Frontiers in Plant Science, 2020, 11, pp.337. ⟨10.3389/fpls.2020.00337⟩
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https://hal.science/hal-03078461/file/Pralon-2020-Mutation%20of%20the%20Atyp.pdf BibTex
titre
Subcellular Chemical Imaging: New Avenues in Cell Biology.
auteur
Johan Decelle, Giulia Veronesi, Benoit Gallet, Hryhoriy Stryhanyuk, Pietro Benettoni, Matthias Schmidt, Rémi Tucoulou, Melissa Passarelli, Sylvain Bohic, Peta Clode, Niculina Musat
article
Trends in Cell Biology, 2020, 30 (3), pp.173-188. ⟨10.1016/j.tcb.2019.12.007⟩
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https://hal.science/hal-02492213/file/Revised_Manuscript_Decelle%20Trends%20in%20Cell%20Biology_HAL%20%282%29.pdf BibTex
titre
Embryonic photosynthesis affects post-germination plant growth
auteur
Ayala Sela, Urszula Piskurewicz, Christian Megies, Laurent Mène-Saffrané, Giovanni Finazzi, Luis Lopez-Molina
article
Plant Physiology, 2020, 182 (4), pp.2166-2181. ⟨10.1104/pp.20.00043⟩
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https://hal.science/hal-02526415/file/Sela%20-%20PLant%20Physiol%20-%202020.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
Cytoklepty in the plankton: a host strategy to optimize the bioenergetic machinery of endosymbiotic algae
auteur
Uwizeye Clarisse, Mars Brisbin Margaret, Gallet Benoit, Chevalier Fabien, Lekieffre Charlotte, Schieber Nicole, Falconet Denis, Wangpraseurt Daniel, Schertel Lukas, Stryhanyuk Hryhoriy, Musat Niculina, Mitarai Satoshi, Schwab Yannick, Finazzi Giovanni, Decelle Johan
article
2020
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BibTex
titre
In-cell quantitative structural imaging of phytoplankton using 3D electron microscopy
auteur
Clarisse Uwizeye, Johan Decelle, Pierre-Henri Jouneau, Benoit Gallet, Jean-Baptiste Keck, Christine Moriscot, Fabien Chevalier, Nicole Schieber, Rachel Templin, Gilles Curien, Yannick Schwab, Guy Schoehn, Samuel Zeeman, Denis Falconet, Giovanni Finazzi
article
2020
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https://hal.science/hal-03028180/file/Uwizeye.full.pdf BibTex

2019

Journal articles

titre
Plastoquinone homoeostasis by Arabidopsis proton gradient regulation 6 is essential for photosynthetic efficiency
auteur
Thibaut Pralon, Venkatasalam Shanmugabalaji, Paolo Longoni, Gaétan Glauser, Brigitte Ksas, Joy Collombat, Saskia Desmeules, Michel Havaux, Giovanni Finazzi, Felix Kessler
article
Communications Biology, 2019, 2, pp.220. ⟨10.1038/s42003-019-0477-4⟩
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https://cea.hal.science/cea-02178683/file/2019-Pralon-SAVE-s42003-019-0477-4.pdf BibTex
titre
Identification of the Arabidopsis calmodulin-dependent NAD+ kinase that sustains the elicitor-induced oxidative burst
auteur
Elisa Dell'Aglio, Cécile Giustini, Alexandra Kraut, Yohann Couté, Alex Costa, Guillaume Decros, Yves Gibon, Christian Mazars, Michel Matringe, Giovanni Finazzi, Gilles Curien
article
Plant Physiology, 2019, 181 (4), pp.1449-1458. ⟨10.1104/pp.19.00912⟩
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https://hal.science/hal-02361156/file/Dell%27aglio_2019_Plant_Physiology.pdf BibTex
titre
Algal Remodeling in a Ubiquitous Planktonic Photosymbiosis
auteur
Johan Decelle, Hryhoriy Stryhanyuk, Benoit Gallet, Giulia Veronesi, Matthias Schmidt, Sergio Balzano, Sophie Marro, Clarisse Uwizeye, Pierre-Henri Jouneau, Josselin Lupette, Juliette Jouhet, Eric Maréchal, Yannick Schwab, Nicole Schieber, Rémi Tucoulou, Hans Richnow, Giovanni Finazzi, Niculina Musat
article
Current Biology - CB, 2019, 29 (6), pp.968-978.e4. ⟨10.1016/j.cub.2019.01.073⟩
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https://hal.science/hal-02083159/file/Algal%20remodeling_CurrentBiology_HAL.pdf BibTex
titre
Role of cyclic and pseudo-cyclic electron transport in response to dynamic light changes in Physcomitrella patens
auteur
Mattia Storti, Alessandro Alboresi, Caterina Gerotto, Eva-Mari Aro, Giovanni Finazzi, Tomas Morosinotto
article
Plant, Cell and Environment, 2019, 42 (5), pp.1590-1602. ⟨10.1111/pce.13493⟩
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https://hal.science/hal-02088295/file/Storti%20et%20al.pdf BibTex
titre
Optical optimization of semi-transparent a-Si:H solar cells for photobioreactor application
auteur
A. Brodu, C. Seydoux, G. Finazzi, C. Dublanche-Tixier, C. Ducros
article
Thin Solid Films, 2019, 689, pp.137492. ⟨10.1016/j.tsf.2019.137492⟩
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https://hal.science/hal-02332917/file/brodu%20et%20al.pdf BibTex