Publications HAL de la structure 552719;1043112

2025

Book sections

titre
dCas-Based Tools to Visualize Chromatin or Modify Epigenetic Marks at Specific Plant Genomic Loci
auteur
Kateryna Fal, Cristel C Carles
article
Methods for Plant Nucleus and Chromatin Studies. Methods and Protocols, 2873, Springer US, pp.305-332, 2025, Methods in Molecular Biology, 978-1-0716-4227-6. ⟨10.1007/978-1-0716-4228-3_17⟩
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https://hal.science/hal-04933171/file/Fal%20%26%20Carles%2C%20MiMB%202024.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
The dual trxG/PcG protein ULTRAPETALA1 modulates H3K27me3 and directly enhances POLYCOMB REPRESSIVE COMPLEX 2 activity for fine-tuned reproductive transitions
auteur
Vangeli Geshkovski, Julia Engelhorn, Jean-Baptiste Izquierdo, Hamida Laroussi, Caroline Thouly, Laura Turchi, Marie Le Masson, Emmanuel Thévenon, Ambre Petitalot, Lauriane Simon, Sophie Desset, Philipp Michl-Holzinger, Hugues Parrinello, Klaus D Grasser, Aline Probst, Raphaël Margueron, Gilles Vachon, Jan Kadlec, Cristel C Carles
article
2025
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https://hal.science/hal-04932715/file/2024.10.21.619451v1.full-4.pdf BibTex

2024

Conference papers

titre
Annual PLANT-Int Symposium IV
auteur
Cristel Carles, Alice Poggi
article
Annual PLANT-Int Symposium IV, Sep 2024, Villar d'Arene, France
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titre
Mechanism of ULTRAPETALA1 protein interaction with a lncRNA during flower development
auteur
Alice Poggi, Cristel Carles
article
Annual PLANT-Int Symposium IV, Sep 2024, Jardin du Lautaret, Villar-d'Arène, France
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titre
Chromatin switches for specific developmental transitions : Zoom on the function of ULTRAPETALA as a PRC2 cofactor.
auteur
Cristel Carles
article
European Workshop in Plant Chromatin VIII, May 2024, Barcelona (ES), Spain
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titre
Molecular mechanisms of ULTRAPETALA1 in chromatin switches
auteur
Vangeli Geshkovski
article
Epiplant 2024, 2024, Clermont ferrand, France
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Book sections

titre
Quantitative Profiling of Histone Variants and Posttranslational Modifications by Tandem Mass Spectrometry in Arabidopsis
auteur
Vangeli Geshkovski, Hassan Hijazi, Julie Manessier, Sabine Brugière, Marie Courçon, Gilles Vachon, Delphine Pflieger, Cristel C Carles
article
Methods for Plant Nucleus and Chromatin Studies, 2873, Springer US, pp.19-38, 2024, Methods in Molecular Biology, ⟨10.1007/978-1-0716-4228-3_2⟩
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https://hal.science/hal-04828595/file/Geshkovski%20et%20al%2C%20MiMB%202024.pdf BibTex

Theses

titre
Chromatin switches in plants: Molecular mechanisms of the ULTRAPETALA1 protein
auteur
Vangeli Geshkovski
article
Vegetal Biology. Université Grenoble - Alpes, 2024. English. ⟨NNT : ⟩
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Preprints, Working Papers, ...

titre
The plastid-encoded RNA polymerase structures a logistic chain for light-induced photosynthesis
auteur
François-Xavier Gillet, Gregory Effantin, Gian Luca Freiherr von Scholley, Sabine Brugière, Maud Turquand, Noor Pasha, Daphna Fenel, Alicia Vallet, Yohann Couté, David Cobessi, Robert Blanvillain
article
2024
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titre
Manipulating plant development by editing histone methylation with the dCas9 tool: the CUC3 boundary gene as a case study
auteur
Kateryna Fal, Marie Le Masson, Alexandre Berr, Cristel C. Carles
article
2024
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2023

Journal articles

titre
Mutations in tau protein promote aggregation by favoring extended conformations
auteur
Kevin Pounot, Clara Piersson, Andrew Goring, Frédéric Rosu, Valérie Gabelica, Martin Weik, Songi Han, Yann Fichou
article
JACS Au, 2023, 4, pp.92-100. ⟨10.1021/jacsau.3c00550⟩
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https://hal.science/hal-04510750/file/Pounot%20et%20al.%20-%202024%20-%20Mutations%20in%20Tau%20Protein%20Promote%20Aggregation%20by%20Fa%20%281%29.pdf BibTex
titre
Editorial: Plant epigenetics and chromatin dynamics - EPIPLANT 2021-2022
auteur
Guillaume Moissiard, Marie Mirouze, Cristel Carles, Clémentine Vitte
article
Frontiers in Plant Science, 2023, 14, ⟨10.3389/fpls.2023.1260391⟩
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https://hal.science/hal-04305976/file/Moissiard%20et%20al%20-%20Frontiers%20in%20Plant%20Science%202023.pdf BibTex
titre
Lysine 27 of histone H3.3 is a fine modulator of developmental gene expression and stands as an epigenetic checkpoint for lignin biosynthesis in Arabidopsis
auteur
Kateryna Fal, Alexandre Berr, Marie Le Masson, Adi Faigenboim, Emeline Pano, Nickolay Ishkhneli, Netta‐lee Moyal, Claire Villette, Denisa Tomkova, Marie‐edith Chabouté, Leor Eshed Williams, Cristel C Carles
article
New Phytologist, 2023, 238, pp.1085-1100. ⟨10.1111/nph.18666⟩
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https://hal.science/hal-04031763/file/New%20Phytologist%20-%202023%20-%20Fal%20-%20Lysine%2027%20of%20histone%20H3%203%20is%20a%20fine%20modulator%20of%20developmental%20gene%20expression%20and%20stands%20as.pdf BibTex

Conference papers

titre
Molecular mechanisms of ULTRAPETALA1
auteur
Vangeli Geshkovski, Cristel Carles
article
Annual PLANT-Int Symposium III, Sep 2023, Jardin du Lautaret, Villar-d'Arène, France
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BibTex
titre
Annual PLANT-Int Symposium III
auteur
Cristel Carles
article
Annual PLANT-Int Symposium III, Sep 2023, Villar d'Arene, France
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titre
Organizing Committee of the Summer School "The many uses of plants
auteur
Cristel Carles
article
The many uses of plants - Summer School, EUR CBH, Jun 2023, Grenoble, France
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BibTex
titre
WHY ARE PLANTS FASCINATING? Overview on their biology and multiple usages
auteur
Cristel Carles
article
Summer School “The many uses of plants”, Graduate School Chemistry Biology health of Université Grenoble Alpes, Jun 2023, Grenobe, France
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BibTex
titre
Chromatin switches in plants: Molecular mechanisms of the ULTRAPETALA1 protein
auteur
Vangeli Geshkovski
article
Signaling through Chromatin, 2023, Grenoble, France
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BibTex

Theses

titre
Biochemical and structural study of the plant PRC2 complex and ULTRAPETALA1, two antagonistic regulators of chromatin in Arabidopsis thaliana
auteur
Jean-Baptiste Izquierdo
article
Sciences du Vivant [q-bio]. Université Grenoble Alpes (UGA), 2023. Français. ⟨NNT : 2023GRALV069⟩
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https://hal.science/tel-04837705/file/Manuscrit_de_th%C3%A8se_JBI.pdf BibTex

2022

Journal articles

titre
Biogenic signals from plastids and their role in chloroplast development
auteur
Monique Liebers, Carolina Cozzi, Finia Uecker, Louise Chambon, Robert Blanvillain, Thomas Pfannschmidt
article
Journal of Experimental Botany, 2022, 73, pp.7105-7125. ⟨10.1093/jxb/erac344⟩
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https://hal.science/hal-03819575/file/JEXBOT-2022-307425v2-Pfannschmidt.pdf BibTex
titre
PAP8/pTAC6 Is Part of a Nuclear Protein Complex and Displays RNA Recognition Motifs of Viral Origin
auteur
Louise Chambon, François-Xavier Gillet, Maha Chieb, David Cobessi, Thomas Pfannschmidt, Robert Blanvillain
article
International Journal of Molecular Sciences, 2022, 23 (6), pp.3059. ⟨10.3390/ijms23063059⟩
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https://hal.science/hal-03610759/file/ijms-23-03059-v2.pdf BibTex
titre
Three-Dimensional Envelope and Subunit Interactions of the Plastid-Encoded RNA Polymerase from Sinapis alba
auteur
Rémi Ruedas, Soumiya Sankari Muthukumar, Sylvie Kieffer-Jaquinod, François-Xavier Gillet, Daphna Fenel, Grégory Effantin, Thomas Pfannschmidt, Yohann Couté, Robert Blanvillain, David Cobessi
article
International Journal of Molecular Sciences, 2022, 23 (17), pp.9922. ⟨10.3390/ijms23179922⟩
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https://hal.science/hal-03774879/file/Ruedas%20et%20al.%20ijms.pdf BibTex

Conference papers

titre
Annual PLANT-Int Symposium II
auteur
Cristel Carles
article
Annual PLANT-Int Symposium, Sep 2022, Villar d'Arene, France
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BibTex
titre
Molecular mechanisms of ULTRAPETALA1 chromatin switch
auteur
Vangeli Geshkovski, Cristel Carles
article
Annual PLANT-Int Symposium II, Sep 2022, Jardin du Lautaret, Villar-d'Arène, France
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BibTex
titre
Study of the plant-specific Polycomb antagonist ULTRAPETALA1: a structural and biochemical approach
auteur
Jean-Baptiste Izquierdo
article
Epiplant 2022, Jun 2022, Banyuls - sur - Mer, France
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titre
Manipulating Histone methylation in Arabidopsis with the dCas9 tool: de-repression of the CUC3 boundary gene as a study case.
auteur
Kateryna Fal, Cristel C Carles
article
7th European Workshop on Plant Chromatin, May 2022, Pruhonice - Prague, Czech Republic
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BibTex

Theses

titre
ULTRAPETALA1 interactions with chromatin modifiers and remodelers : Roles in Arabidopsis thaliana development
auteur
Caroline Thouly
article
Biologie cellulaire. Université Grenoble Alpes [2020-..], 2022. Français. ⟨NNT : 2022GRALV048⟩
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https://theses.hal.science/tel-04861113/file/THOULY_2022_archivage.pdf BibTex
titre
Nuclear control of chloroplast biogenesis through proteins of the plastidial transcription machinery
auteur
Louise Chambon
article
Biologie végétale. Université Grenoble Alpes [2020-..], 2022. Français. ⟨NNT : 2022GRALV057⟩
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https://theses.hal.science/tel-03859468/file/CHAMBON_2022_archivage.pdf BibTex

2021

Journal articles

titre
Tissue folding at the organ–meristem boundary results in nuclear compression and chromatin compaction
auteur
Kateryna Fal, Niklas Korsbo, Juan Alonso-Serra, Jose Teles, Mengying Liu, Yassin Refahi, Marie-Edith Chaboute, Henrik Jönsson, Olivier Hamant
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2021, 118 (8), pp.e2017859118. ⟨10.1073/pnas.2017859118⟩
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https://hal.science/hal-03164462/file/islandora_115128.pdf BibTex
titre
Chromatin Manipulation and Editing: Challenges, New Technologies and Their Use in Plants
auteur
Kateryna Fal, Denisa Tomkova, Gilles Vachon, Marie-Edith Chaboute, Alexandre Berr, Cristel C Carles
article
International Journal of Molecular Sciences, 2021, 22 (2), pp.512. ⟨10.3390/ijms22020512⟩
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https://hal.science/hal-03111657/file/Fal-2021-Chromatin%20Manipulati.pdf BibTex
titre
Cauliflower fractal forms arise from perturbations of floral gene networks
auteur
Eugenio Azpeitia, Gabrielle Tichtinsky, Marie Le Masson, Antonio Serrano-Mislata, Jérémy Lucas, Veronica Gregis, Carlos Gimenez, Nathanaël Prunet, Etienne Farcot, Martin Kater, Desmond Bradley, Francisco Madueño, Christophe Godin, Francois Parcy
article
Science, 2021, 373 (6551), pp.192-197. ⟨10.1126/science.abg5999⟩
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https://hal.science/hal-03291136/file/Azpeitia%20et%20al_main_final.pdf BibTex
titre
The Plastid-Encoded RNA Polymerase-Associated Protein PAP9 Is a Superoxide Dismutase With Unusual Structural Features
auteur
Adrien Favier, Pierre Gans, Elisabetta Boeri Erba, Luca Signor, Soumiya Sankari Muthukumar, Thomas Pfannschmidt, Robert Blanvillain, David Cobessi
article
Frontiers in Plant Science, 2021, 12, pp.668897. ⟨10.3389/fpls.2021.668897⟩
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https://hal.science/hal-03313484/file/fpls-12-668897.pdf BibTex

Conference papers

titre
Annual PLANT-Int Symposium I
auteur
Cristel Carles, Vangeli Geshkovski
article
Annual PLANT-Int Symposium I, Sep 2021, Villar d'Arene, France
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BibTex
titre
ULT1, a plant specific epigenetic switch
auteur
Vangeli Geshkovski, Cristel Carles
article
Annual PLANT-Int Symposium I, Sep 2021, Jardin du Lautaret, Villar-d'Arène, France
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titre
Nuclear control of plastid transcription during chloroplast biogenesis: PAPs and beyond
auteur
Robert Blanvillain
article
SEB conference 2021, Jun 2021, Virtuel, France
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titre
Lysine 27 of histone H3.3 is a fine modulator of gene expression and developmental fates in Arabidopsis
auteur
Cristel Carles
article
EPIPLANT Meeting on Plant Epigenetics, Virtual, Feb 2021, Perpignan, France
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2020

Journal articles

titre
Nucleo‐plastidic PAP 8/ pTAC 6 couples chloroplast formation with photomorphogenesis
auteur
Monique Liebers, François-Xavier Gillet, Abir Israel, Kevin Pounot, Louise Chambon, Maha Chieb, Fabien Chevalier, Rémi Ruedas, Adrien Favier, Pierre Gans, Elisabetta Boeri Erba, David Cobessi, Thomas Pfannschmidt, Robert Blanvillain
article
EMBO Journal, 2020, 39 (22), pp.e104941. ⟨10.15252/embj.2020104941⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-02972660/file/Liebers%20preprint.pdf BibTex
titre
Unwinding BRAHMA Functions in Plants
auteur
Caroline Thouly, Marie Le Masson, Xuelei Lai, Cristel Carles, Gilles Vachon
article
Genes, 2020, 11 (1), pp.90. ⟨10.3390/genes11010090⟩
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https://hal.science/hal-02454776/file/Thouly.pdf BibTex

2019

Journal articles

titre
Dynamic control of enhancer activity drives stage-specific gene expression during flower morphogenesis
auteur
Wenhao Yan, Dijun Chen, Julia Schumacher, Diego Durantini, Julia Engelhorn, Ming Chen, Cristel Carles, Kerstin Kaufmann
article
Nature Communications, 2019, 10 (1), pp.1705. ⟨10.1038/s41467-019-09513-2⟩
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https://hal.science/hal-02130228/file/2019_Yan_Nature%20Communications_1.pdf BibTex
titre
Building Transcription Factor Binding Site Models to Understand Gene Regulation in Plants
auteur
Xuelei Lai, Arnaud Stigliani, Gilles Vachon, Cristel Carles, Cezary Smaczniak, Chloe Zubieta, Kerstin Kaufmann, François Parcy
article
Molecular Plant, 2019, 12 (6), pp.743-763. ⟨10.1016/j.molp.2018.10.010⟩
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https://hal.science/hal-02088235/file/Lai_et_al_final.pdf BibTex

Conference papers

titre
ULTRAPETALA: At the crossroads of chromatin regulators.
auteur
Cristel Carles
article
European Workshop in Plant Chromatin VI, Jun 2019, Cologne, Germany
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titre
Regulation of chromatin mark changes for organogenesis in Arabidopsis
auteur
Cristel Carles
article
EPIPLANT Meeting on Plant Epigenetics, Feb 2019, Strasbourg, France
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BibTex