Publications HAL de la structure 552724;1043105

2024

Journal articles

titre
Cell layer-specific expression of the homeotic MADS-box transcription factor PhDEF contributes to modular petal morphogenesis in petunia
auteur
Mathilde Chopy, Quentin Cavallini-Speisser, Pierre Chambrier, Patrice Morel, Jérémy Just, Véronique Hugouvieux, Suzanne Rodrigues Bento, Chloe Zubieta, Michiel Vandenbussche, Marie Monniaux
article
The Plant cell, 2024, 36, pp.324-345. ⟨10.1093/plcell/koad258⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-04232663/file/koad258.pdf BibTex

2023

Journal articles

titre
The F-box protein UFO controls flower development by redirecting the master transcription factor LEAFY to new cis-elements
auteur
Philippe Rieu, Laura Turchi, Emmanuel Thévenon, Eleftherios Zarkadas, Max Nanao, Hicham Chahtane, Gabrielle Tichtinsky, Jérémy Lucas, Romain Blanc-Mathieu, Chloe Zubieta, Guy Schoehn, François Parcy
article
Nature Plants, 2023, 9 (2), pp.315-329. ⟨10.1038/s41477-022-01336-2⟩
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https://cnrs.hal.science/hal-03993820/file/NP_manuscript.pdf BibTex
titre
BioSAXS at European Synchrotron Radiation Facility – Extremely Brilliant Source: BM29 with an upgraded source, detector, robot, sample environment, data collection and analysis software
auteur
Mark D Tully, Jerome Kieffer, Martha E Brennich, Raphael Cohen Aberdam, Jean Baptiste Florial, Stephanie Hutin, Markus Oscarsson, Antonia Beteva, Anton Popov, Dihia Moussaoui, Pascal Theveneau, Gergely Papp, Jonathan Gigmes, Florent Cipriani, Andrew Mccarthy, Chloe Zubieta, Christoph Mueller-Dieckmann, Gordon Leonard, Petra Pernot
article
Journal of Synchrotron Radiation, 2023, 30 (1), pp.258-266. ⟨10.1107/S1600577522011286⟩
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https://hal.science/hal-03942822/file/s-30-00258.pdf BibTex
titre
Phase separation and molecular ordering of the prion-like domain of the Arabidopsis thermosensory protein EARLY FLOWERING 3
auteur
Stephanie Hutin, Janet R Kumita, Vivien I Strotmann, Anika Dolata, Wai Li Ling, Nessim Louafi, Anton Popov, Pierre-Emmanuel Milhiet, Martin Blackledge, Max H Nanao, Philip A Wigge, Yvonne Stahl, Luca Costa, Mark D Tully, Chloe Zubieta
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2023, 120 (28), pp.e2304714120. ⟨10.1073/pnas.2304714120⟩
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https://hal.science/hal-04212491/file/2023.03.12.532276v1.full%20%281%29.pdf BibTex

Book sections

titre
Structural characterization of protein–DNA complexes using small angle X-ray scattering (SAXS) with contrast variation
auteur
Stephanie Hutin, Audrey Guillotin, Chloe Zubieta, Mark A. Tully
article
Methods in Enzymology, 680, Elsevier, pp.163-194, 2023, 0076-6879. ⟨10.1016/bs.mie.2022.1008.1021⟩
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https://hal.science/hal-03813271/file/HAL_SAXS-merged.pdf BibTex
titre
Identification of Plant Transcription Factor DNA-Binding Sites Using seq-DAP-seq
auteur
Stephanie Hutin, Romain Blanc-Mathieu, Philippe Rieu, François Parcy, Xuelei Lai, Chloe Zubieta
article
Kerstin Kaufmann; Bernd Mueller-Roeber. Plant Gene Regulatory Networks Methods and Protocols. Series: Methods in Molecular Biology, 2698, Humana Press/Springer, pp.119-145, 2023, 978-1-4939-7124-4. ⟨10.1007/978-1-0716-3354-0_9⟩
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https://hal.science/hal-04225070/file/combinepdf%20%281%29.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
Structure and flexibility of the DNA polymerase holoenzyme of vaccinia virus
auteur
Wim Burmeister, Laetitia Boutin, Aurelia Balestra, Henri Gröger, Allison Ballandras-Colas, Stephanie Hutin, Christian Kraft, Clemens Grimm, Bettina Böttcher, Utz Fischer, Nicolas Tarbouriech, Frédéric Iseni
article
2023
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BibTex

2022

Journal articles

titre
Getting in phase- DNA damage repair mechanisms and liquid-liquid phase separation of the plant-specific histone methyltransferase MtSUVR2
auteur
Stephanie Hutin, Chloe Zubieta
article
Molecular Plant, 2022, 15 (8), pp.1266-1267. ⟨10.1016/j.molp.2022.07.006⟩
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https://hal.science/hal-03727702/file/Hutin%20Zubieta.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
The F-box cofactor UFO redirects the LEAFY floral regulator to novel cis -elements
auteur
Philippe Rieu, Laura Turchi, Emmanuel Thévenon, Eleftherios Zarkadas, Max Nanao, Hicham Chahtane, Gabrielle Tichtinsky, Jérémy Lucas, Romain Blanc-Mathieu, Chloe Zubieta, Guy Schoehn, François Parcy
article
2022
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https://hal.science/hal-03808419/file/Rieu%20et%20al.pdf BibTex

2021

Journal articles

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Unraveling the role of MADS transcription factor complexes in apple tree dormancy
auteur
Vítor da Silveira Falavigna, Edouard Severing, Xuelei Lai, Joan Estevan, Isabelle Farrera, Véronique Hugouvieux, Luís Fernando Revers, Chloe Zubieta, George Coupland, Evelyne Costes, Fernando Andrés
article
New Phytologist, 2021, 232 (5), pp.2071-2088. ⟨10.1111/nph.17710⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03338801/file/da%20Silveira%20Falavigna-2021-Unraveling%20the%20role.pdf BibTex
titre
Analysis of SEC-SAXS data via EFA deconvolution and Scatter
auteur
Mark Tully, Nicolas Tarbouriech, Robert Rambo, Stephanie Hutin
article
Journal of visualized experiments : JoVE, 2021, 167, ⟨10.3791/61578⟩
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https://hal.science/hal-03187951/file/jove-protocol-61578-analysis-of-sec-saxs-data-via-efa-deconvolution-and-scatter.pdf BibTex

2020

Journal articles

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Genome-wide binding of SEPALLATA3 and AGAMOUS complexes determined by sequential DNA-affinity purification sequencing
auteur
Xuelei Lai, Arnaud Stigliani, Jérémy Lucas, Véronique Hugouvieux, François Parcy, Chloe Zubieta
article
Nucleic Acids Research, 2020, 48 (17), pp.9637-9648. ⟨10.1093/nar/gkaa729⟩
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https://hal.science/hal-02954090/file/Lai%20-%20Stigliani.pdf BibTex
titre
A prion-like domain in ELF3 functions as a thermosensor in Arabidopsis
auteur
Jae-Hoon Jung, Antonio Barbosa, Stephanie Hutin, Janet Kumita, Mingjun Gao, Dorothee Derwort, Catarina Silva, Xuelei Lai, Elodie Pierre, Feng Geng, Sol-Bi Kim, Sujeong Baek, Chloe Zubieta, Katja Jaeger, Philip Wigge
article
Nature, 2020, 585 (7824), pp.256-260. ⟨10.1038/s41586-020-2644-7⟩
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https://hal.science/hal-02954052/file/Jung_et_al_2020_draft.pdf BibTex
titre
Molecular mechanisms of Evening Complex activity in Arabidopsis
auteur
Catarina Silva, Aditya Nayak, Xuelei Lai, Stephanie Hutin, Véronique Hugouvieux, Jae-Hoon Jung, Irene Lopez-Vidriero, Jose Franco-Zorrilla, Kishore Panigrahi, Max Nanao, Philip Wigge, Chloe Zubieta
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2020, 117 (12), pp.6901-6909. ⟨10.1073/pnas.1920972117⟩
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https://hal.science/hal-02527582/file/pnas201920972_final.pdf BibTex
titre
Unwinding BRAHMA Functions in Plants
auteur
Caroline Thouly, Marie Le Masson, Xuelei Lai, Cristel Carles, Gilles Vachon
article
Genes, 2020, 11 (1), pp.90. ⟨10.3390/genes11010090⟩
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https://hal.science/hal-02454776/file/Thouly.pdf BibTex
titre
Contrasted evolutionary trajectories of plant transcription factors
auteur
Xuelei Lai, Hicham Chahtane, Raquel Martin-Arevalillo, Chloe Zubieta, François Parcy
article
Current Opinion in Plant Biology, 2020, 54, pp.101-107. ⟨10.1016/j.pbi.2020.03.002⟩
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https://hal.science/hal-02614102/file/COPLBI.pdf BibTex

2019

Journal articles

titre
Structural Basis for Plant MADS Transcription Factor Oligomerization
auteur
Xuelei Lai, Hussein Daher, Antonin Galien, Véronique Hugouvieux, Chloe Zubieta
article
Computational and Structural Biotechnology Journal, 2019, 17, pp.946-953. ⟨10.1016/j.csbj.2019.06.014⟩
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https://hal.science/hal-02265976/file/Lai-2019-Structural%20Basis%20for%20Plant%20MADS%20Trans.pdf BibTex
titre
Building Transcription Factor Binding Site Models to Understand Gene Regulation in Plants
auteur
Xuelei Lai, Arnaud Stigliani, Gilles Vachon, Cristel Carles, Cezary Smaczniak, Chloe Zubieta, Kerstin Kaufmann, François Parcy
article
Molecular Plant, 2019, 12 (6), pp.743-763. ⟨10.1016/j.molp.2018.10.010⟩
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https://hal.science/hal-02088235/file/Lai_et_al_final.pdf BibTex
titre
Brassicaceae-specific Gretchen Hagen 3 acyl acid amido synthetases conjugate amino acids to chorismate, a precursor of aromatic amino acids and salicylic acid
auteur
Cynthia Holland, Corey Westfall, Jason Schaffer, Alejandro de Santiago, Chloe Zubieta, Sophie Alvarez, Joseph Jez
article
Journal of Biological Chemistry, 2019, 294 (45), pp.16855-16864. ⟨10.1074/jbc.RA119.009949⟩
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https://hal.science/hal-02382535/file/J.%20Biol.%20Chem.-2019-Holland-jbc.RA119.009949.pdf BibTex
titre
CryoEM structure of adenovirus type 3 fibre with desmoglein 2 shows an unusual mode of receptor engagement
auteur
Emilie Vassal-Stermann, Grégory Effantin, Chloe Zubieta, Wim P Burmeister, Frédéric Iseni, Hongjie Wang, André Lieber, Guy Schoehn, Pascal Fender
article
Nature Communications, 2019, 10 (1), pp.1181. ⟨10.1038/s41467-019-09220-y⟩
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https://hal.science/hal-02085944/file/Vassal%20sterman.pdf BibTex