Publications HAL de la structure 552728;1043106

2021

Journal articles

titre
The LEAFY floral regulator displays pioneer transcription factor properties
auteur
Xuelei Lai, Romain Blanc-Mathieu, Loïc Grandvuillemin, Ying Huang, Arnaud Stigliani, Jérémy Lucas, Emmanuel Thévenon, Jeanne Loue-Manifel, Laura Turchi, Hussein Daher, Eugenia Brun-Hernandez, Gilles Vachon, David Latrasse, Moussa Benhamed, Renaud Dumas, Chloe Zubieta, François Parcy
article
Molecular Plant, Cell Press/Oxford UP, 2021, ⟨10.1016/j.molp.2021.03.004⟩
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titre
OsFD4 promotes the rice floral transition via florigen activation complex formation in the shoot apical meristem
auteur
Martina Cerise, Francesca Giaume, Mary Galli, Bahman Khahani, Jérémy Lucas, Federico Podico, Elahe Tavakol, François Parcy, Andrea Gallavotti, Vittoria Brambilla, Fabio Fornara
article
New Phytologist, Wiley, In press, 229, pp.429-443. ⟨10.1111/nph.16834⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02953028/file/Cerise_accepted.pdf BibTex
titre
A network of transcriptional repressors modulates auxin responses.
auteur
Jekaterina Truskina, Jingyi Han, Elina Chrysanthou, Carlos Galvan-Ampudia, Stéphanie Lainé, Geraldine Brunoud, Julien Macé, Simon Bellows, Jonathan Legrand, Anne-Maarit Bågman, Margot Smit, Ondrej Smetana, Arnaud Stigniani, Silvana Porco, Malcom J. Bennett, Ari Pekka Mähönen, Francois Parcy, Etienne Farcot, Francois Roudier, Siobhan M Brady, Anthony Bishopp, Teva Vernoux
article
Nature, Nature Publishing Group, 2021, 589 (7840), pp.116-119. ⟨10.1038/s41586-020-2940-2⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03021204/file/Truskina_%20main_text_all-rev6_CorrLegendFig3_withallFig.pdf BibTex
titre
Characterization of the Bubblegum acyl-CoA synthetase of Microchloropsis gaditana
auteur
Elodie Billey, Leonardo Magneschi, Sébastien Leterme, Mariette Bedhomme, Amélie Andres-Robin, Laurent Poulet, Morgane Michaud, Giovanni Finazzi, Renaud Dumas, Serge Crouzy, Frédéric Laueffer, Laurent Fourage, Fabrice Rébeillé, Alberto Amato, Séverine Collin, Juliette Jouhet, Eric Marechal
article
Plant Physiology, American Society of Plant Biologists, In press, ⟨10.1093/plphys/kiaa110⟩
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2020

Journal articles

titre
Eukaryotic virus composition can predict the efficiency of carbon export in the global ocean
auteur
Hiroto Kaneko, Romain Blanc-Mathieu, Hisashi Endo, Samuel Chaffron, Tom Delmont, Morgan Gaia, Nicolas Henry, Rodrigo Hernández-Velázquez, Canh Hao Nguyen, Hiroshi Mamitsuka, Patrick Forterre, Olivier Jaillon, Colomban de Vargas, Matthew Sullivan, Curtis Suttle, Lionel Guidi, Hiroyuki Ogata
article
iScience, Elsevier, 2020, pp.102002. ⟨10.1016/j.isci.2020.102002⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03097258/file/1-s2.0-S2589004220311998-main.pdf BibTex
titre
Genome-wide binding of SEPALLATA3 and AGAMOUS complexes determined by sequential DNA-affinity purification sequencing
auteur
Xuelei Lai, Arnaud Stigliani, Jérémy Lucas, Véronique Hugouvieux, François Parcy, Chloe Zubieta
article
Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2020, 48 (17), pp.9637-9648. ⟨10.1093/nar/gkaa729⟩
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titre
An Optimized Metabarcoding Method for Mimiviridae
auteur
Florian Prodinger, Hisashi Endo, Yasuhiro Gotoh, Yanze Li, Daichi Morimoto, Kimiho Omae, Kento Tominaga, Romain Blanc-Mathieu, Yoshihito Takano, Tetsuya Hayashi, Keizo Nagasaki, Takashi Yoshida, Hiroyuki Ogata
article
Microorganisms, MDPI, 2020, 8 (4), pp.506. ⟨10.3390/microorganisms8040506⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03111305/file/Prodinger%20et%20al%20-%20microorganisms-08-00506.pdf BibTex
titre
Contrasted evolutionary trajectories of plant transcription factors
auteur
Xuelei Lai, Hicham Chahtane, Raquel Martin-Arevalillo, Chloe Zubieta, François Parcy
article
Current Opinion in Plant Biology, Elsevier, 2020, 54, pp.101-107. ⟨10.1016/j.pbi.2020.03.002⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02614102/file/COPLBI.pdf BibTex
titre
JASPAR 2020: update of the open-access database of transcription factor binding profiles.
auteur
Oriol Fornés, Jaime Castro-Mondragon, Aziz Khan, Robin van der Lee, Xi Zhang, Phillip Richmond, Bhavi Modi, Solenne Correard, Marius Gheorghe, Damir Baranašić, Walter Santana-Garcia, Ge Tan, Jeanne Chèneby, Benoit Ballester, François Parcy, Albin Sandelin, Boris Lenhard, Wyeth Wasserman, Anthony Mathelier
article
Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2020, 48 (D1), pp.D87-D92. ⟨10.1093/nar/gkz1001⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02365013/file/gkz1001.pdf BibTex

2019

Journal articles

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Evolution of the Auxin Response Factors from charophyte ancestors
auteur
Raquel Martin-Arevalillo, Emmanuel Thevenon, Fanny Jégu, Thomas Vinos-Poyo, Teva Vernoux, François Parcy, Renaud Dumas
article
PLoS Genetics, Public Library of Science, 2019, 15 (9), pp.e1008400. ⟨10.1371/journal.pgen.1008400⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02329218/file/2019_Martin_Plos_Gen_1.pdf BibTex
titre
Origin of Gibberellin-Dependent Transcriptional Regulation by Molecular Exploitation of a Transactivation Domain in DELLA Proteins
auteur
Jorge Hernández-García, Asier Briones-Moreno, Renaud Dumas, Miguel Blázquez
article
Molecular Biology and Evolution, Oxford University Press (OUP), 2019, 36 (5), pp.908-918. ⟨10.1093/molbev/msz009⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02132420/file/Hern%C3%A1ndez-Garc%C3%ADa%3BBriones-Moreno%3BDumas%20-%20Origin%20of%20gibberellin-dependent%20transcriptional%20regulatio....pdf BibTex
titre
Crystal structure of the transcriptional repressor DdrO: insight into the metalloprotease/repressor-controlled radiation response in Deinococcus
auteur
Arjan de Groot, Marina Siponen, Romaric Magerand, Nicolas Eugenie, Raquel Martin-Arevalillo, Jade Doloy, David Lemaire, Géraldine Brandelet, François Parcy, Renaud Dumas, Philippe Roche, Pascale Servant, Fabrice Confalonieri, Pascal Arnoux, David Pignol, Laurence Blanchard
article
Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2019, 47 (21), pp.11403-11417. ⟨10.1093/nar/gkz883⟩
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https://hal-cea.archives-ouvertes.fr/cea-02315882/file/DeGroot-2019-NAR-gkz883.pdf BibTex
titre
Capturing Auxin Response Factors Syntax Using DNA Binding Models
auteur
Arnaud Stigliani, Raquel Martin-Arevalillo, Jérémy Lucas, Adrien Bessy, Thomas Vinos-Poyo, Victoria Mironova, Teva Vernoux, Renaud Dumas, François Parcy
article
Molecular Plant, Cell Press/Oxford UP, 2019, 12 (6), pp.822-832. ⟨10.1016/j.molp.2018.09.010⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02088272/file/Stigliani_total.pdf BibTex
titre
Building Transcription Factor Binding Site Models to Understand Gene Regulation in Plants
auteur
Xuelei Lai, Arnaud Stigliani, Gilles Vachon, Cristel Carles, Cezary Smaczniak, Chloe Zubieta, Kerstin Kaufmann, François Parcy
article
Molecular Plant, Cell Press/Oxford UP, 2019, 12 (6), pp.743-763. ⟨10.1016/j.molp.2018.10.010⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02088235/file/Lai_et_al_final.pdf BibTex

Books

titre
L’histoire secrète des fleurs. Collection « Comment a-t-on-su? »
auteur
Francois Parcy
article
Etienne Klein. Humensciences Editions, pp.230, 2019, 9782379310270
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