Journal articles

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Plant-TFClass: a structural classification for plant transcription factors

auteur

Romain Blanc-Mathieu, Renaud Dumas, Laura Turchi, Jérémy Lucas, François Parcy

article

Trends in Plant Science, 2024, 29 (1), pp.40-51. ⟨10.1016/j.tplants.2023.06.023⟩

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JASPAR 2024: 20th anniversary of the open-access database of transcription factor binding profiles

auteur

Ieva Rauluseviciute, Rafaël Riudavets-Puig, Romain Blanc-Mathieu, Jaime A. Castro-Mondragon, Katalin Ferenc, Vipin Kumar, Roza Berhanu Lemma, Jérémy Lucas, Jeanne Chèneby, Damir Baranasic, Aziz Khan, Oriol Fornes, Sveinung Gundersen, Morten Johansen, Eivind Hovig, Boris Lenhard, Albin Sandelin, Wyeth W. Wasserman, François Parcy, Anthony Mathelier

article

Nucleic Acids Research, 2024, 52 (D1), pp.D174-D182. ⟨10.1093/nar/gkad1059⟩

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Journal articles

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Thinking outside the F‐box: how UFO controls angiosperm development

auteur

Philippe Rieu, Moïra Arnoux-Courseaux, Gabrielle Tichtinsky, François Parcy

article

New Phytologist, 2023, 240 (3), pp.945-959. ⟨10.1111/nph.19234⟩

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The F-box protein UFO controls flower development by redirecting the master transcription factor LEAFY to new cis-elements

auteur

Philippe Rieu, Laura Turchi, Emmanuel Thévenon, Eleftherios Zarkadas, Max Nanao, Hicham Chahtane, Gabrielle Tichtinsky, Jérémy Lucas, Romain Blanc-Mathieu, Chloe Zubieta, Guy Schoehn, François Parcy

article

Nature Plants, 2023, 9 (2), pp.315-329. ⟨10.1038/s41477-022-01336-2⟩

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Cauliflowers or how the perseverance of a plant to make flowers produces an amazing fractal structure

auteur

Eugenio Azpeitia, François Parcy, Christophe Godin

article

Comptes Rendus. Biologies, 2023, 346 (G1), pp.75-83. ⟨10.5802/crbiol.120⟩

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Journal articles

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Transcriptional reprogramming during floral fate acquisition

auteur

Antoine Larrieu, Géraldine Brunoud, Aurore Guérault, Stéphanie Lainé, Lauriane Hennet, Arnaud Stigliani, Iris Gildea, Jeremy Just, Ludivine Soubigou-Taconnat, Sandrine Balzergue, Brendan Davies, Enrico Scarpella, Ykä Helariutta, François Parcy, Teva Vernoux

article

iScience, 2022, 25 (7), pp.104683. ⟨10.1016/j.isci.2022.104683⟩

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Auxin response factors are keys to the many auxin doors

auteur

Coralie Cancé, Raquel Martin-Arevalillo, Kenza Boubekeur, Renaud Dumas

article

New Phytologist, 2022, 235, pp.402-419. ⟨10.1111/nph.18159⟩

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Adaptive evolution of viruses infecting marine microalgae (haptophytes), from acute infections to stable coexistence

auteur

Ruth‐anne Sandaa, Marius R Saltvedt, Håkon Dahle, Haina Wang, Selina Våge, Romain Blanc‐mathieu, Ida H Steen, Nigel Grimsley, Bente Edvardsen, Hiroyuki Ogata, Janice Lawrence

article

Biological Reviews, 2022, 97, pp.179-194. ⟨10.1111/brv.12795⟩

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Journal articles

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Lipid-mediated regulation of flowering time

auteur

Yvon Jaillais, François Parcy

article

Science, 2021, 373 (6559), pp.1086-1087. ⟨10.1126/science.abl4883⟩

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LEAFY protein crystals with a honeycomb structure as a platform for selective preparation of outstanding stable bio-hybrid materials

auteur

Lucile Chiari, Philippe Carpentier, Sylvie Kieffer-Jaquinod, Alice Gogny, Julien Pérard, Stéphane Ravanel, David Cobessi, Stéphane Ménage, Renaud Dumas, Olivier Hamelin

article

Nanoscale, 2021, 13 (19), pp.8901-8908. ⟨10.1039/d1nr00268f⟩

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OsFD4 promotes the rice floral transition via florigen activation complex formation in the shoot apical meristem

auteur

Martina Cerise, Francesca Giaume, Mary Galli, Bahman Khahani, Jérémy Lucas, Federico Podico, Elahe Tavakol, François Parcy, Andrea Gallavotti, Vittoria Brambilla, Fabio Fornara

article

New Phytologist, 2021, 229 (1), pp.429-443. ⟨10.1111/nph.16834⟩

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Cauliflower fractal forms arise from perturbations of floral gene networks

auteur

Eugenio Azpeitia, Gabrielle Tichtinsky, Marie Le Masson, Antonio Serrano-Mislata, Jérémy Lucas, Veronica Gregis, Carlos Gimenez, Nathanaël Prunet, Etienne Farcot, Martin Kater, Desmond Bradley, Francisco Madueño, Christophe Godin, Francois Parcy

article

Science, 2021, 373 (6551), pp.192-197. ⟨10.1126/science.abg5999⟩

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Characterization of the Bubblegum acyl-CoA synthetase of Microchloropsis gaditana

auteur

Elodie Billey, Leonardo Magneschi, Sébastien Leterme, Mariette Bedhomme, Amélie Andres-Robin, Laurent Poulet, Morgane Michaud, Giovanni Finazzi, Renaud Dumas, Serge Crouzy, Frédéric Laueffer, Laurent Fourage, Fabrice Rébeillé, Alberto Amato, Séverine Collin, Juliette Jouhet, Eric Marechal

article

Plant Physiology, 2021, 185 (3), pp.815-835. ⟨10.1093/plphys/kiaa110⟩

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Self-Assembly of a Ginkgo Oligomerization Domain Creates a Sub-10-nm Honeycomb Architecture on Carbon and Silicon Surfaces with Customizable Pores: Implications for Nanoelectronics, Biosensing, and Biocatalysis

auteur

Elise Jacquier, Pierre-Henri Jouneau, Denis Falconet, Denis Mariolle, Emmanuel Thévenon, Grégory Si Larbi, Raluca Tiron, François Parcy, Pierre-Henri Elchinger, Renaud Dumas

article

ACS Applied Nano Materials, 2021, 4, pp.9518-9526. ⟨10.1021/acsanm.1c01944⟩

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A network of transcriptional repressors modulates auxin responses.

auteur

Jekaterina Truskina, Jingyi Han, Elina Chrysanthou, Carlos Galvan-Ampudia, Stéphanie Lainé, Geraldine Brunoud, Julien Macé, Simon Bellows, Jonathan Legrand, Anne-Maarit Bågman, Margot Smit, Ondrej Smetana, Arnaud Stigniani, Silvana Porco, Malcom J. Bennett, Ari Pekka Mähönen, Francois Parcy, Etienne Farcot, François Roudier, Siobhan M Brady, Anthony Bishopp, Teva Vernoux

article

Nature, 2021, 589 (7840), pp.116-119. ⟨10.1038/s41586-020-2940-2⟩

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The LEAFY floral regulator displays pioneer transcription factor properties

auteur

Xuelei Lai, Romain Blanc-Mathieu, Loïc Grandvuillemin, Ying Huang, Arnaud Stigliani, Jérémy Lucas, Emmanuel Thévenon, Jeanne Loue-Manifel, Laura Turchi, Hussein Daher, Eugenia Brun-Hernandez, Gilles Vachon, David Latrasse, Moussa Benhamed, Renaud Dumas, Chloe Zubieta, François Parcy

article

Molecular Plant, 2021, 14 (5), pp.829-837. ⟨10.1016/j.molp.2021.03.004⟩

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Genome-wide binding of SEPALLATA3 and AGAMOUS complexes determined by sequential DNA-affinity purification sequencing

auteur

Xuelei Lai, Arnaud Stigliani, Jérémy Lucas, Véronique Hugouvieux, François Parcy, Chloe Zubieta

article

Nucleic Acids Research, 2020, 48 (17), pp.9637-9648. ⟨10.1093/nar/gkaa729⟩

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JASPAR 2020: update of the open-access database of transcription factor binding profiles.

auteur

Oriol Fornés, Jaime Castro-Mondragon, Aziz Khan, Robin van Der Lee, Xi Zhang, Phillip Richmond, Bhavi Modi, Solenne Correard, Marius Gheorghe, Damir Baranašić, Walter Santana-Garcia, Ge Tan, Jeanne Chèneby, Benoit Ballester, François Parcy, Albin Sandelin, Boris Lenhard, Wyeth W. Wasserman, Anthony Mathelier

article

Nucleic Acids Research, 2020, 48 (D1), pp.D87-D92. ⟨10.1093/nar/gkz1001⟩

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Contrasted evolutionary trajectories of plant transcription factors

auteur

Xuelei Lai, Hicham Chahtane, Raquel Martin-Arevalillo, Chloe Zubieta, François Parcy

article

Current Opinion in Plant Biology, 2020, 54, pp.101-107. ⟨10.1016/j.pbi.2020.03.002⟩

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Journal articles

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Evolution of the Auxin Response Factors from charophyte ancestors

auteur

Raquel Martin-Arevalillo, Emmanuel Thevenon, Fanny Jégu, Thomas Vinos-Poyo, Teva Vernoux, François Parcy, Renaud Dumas

article

PLoS Genetics, 2019, 15 (9), pp.e1008400. ⟨10.1371/journal.pgen.1008400⟩

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Origin of Gibberellin-Dependent Transcriptional Regulation by Molecular Exploitation of a Transactivation Domain in DELLA Proteins

auteur

Jorge Hernández-García, Asier Briones-Moreno, Renaud Dumas, Miguel Blázquez

article

Molecular Biology and Evolution, 2019, 36 (5), pp.908-918. ⟨10.1093/molbev/msz009⟩

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Building Transcription Factor Binding Site Models to Understand Gene Regulation in Plants

auteur

Xuelei Lai, Arnaud Stigliani, Gilles Vachon, Cristel Carles, Cezary Smaczniak, Chloe Zubieta, Kerstin Kaufmann, François Parcy

article

Molecular Plant, 2019, 12 (6), pp.743-763. ⟨10.1016/j.molp.2018.10.010⟩

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Capturing Auxin Response Factors Syntax Using DNA Binding Models

auteur

Arnaud Stigliani, Raquel Martin-Arevalillo, Jérémy Lucas, Adrien Bessy, Thomas Vinos-Poyo, Victoria Mironova, Teva Vernoux, Renaud Dumas, François Parcy

article

Molecular Plant, 2019, 12 (6), pp.822-832. ⟨10.1016/j.molp.2018.09.010⟩

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Crystal structure of the transcriptional repressor DdrO: insight into the metalloprotease/repressor-controlled radiation response in Deinococcus

auteur

Arjan de Groot, Marina I. Siponen, Romaric Magerand, Nicolas Eugenie, Raquel Martin-Arevalillo, Jade Doloy, David Lemaire, Géraldine Brandelet, François Parcy, Renaud Dumas, Philippe Roche, Pascale Servant, Fabrice Confalonieri, Pascal Arnoux, David Pignol, Laurence Blanchard

article

Nucleic Acids Research, 2019, 47 (21), pp.11403-11417. ⟨10.1093/nar/gkz883⟩

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