Publications HAL de la structure 40494

Journal articles

titre
Prevention of Allergy to a Major Cow's Milk Allergen by Breastfeeding in Mice Depends on Maternal Immune Status and Oral Exposure During Lactation
auteur
Karine Adel-Patient, Hervé Bernard, François Fenaille, Stéphane Hazebrouck, Christophe Junot, Valérie Verhasselt
article
Frontiers in Immunology, 2020, 11, ⟨10.3389/fimmu.2020.01545⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03321788/file/2020_Adel-Patient_fimmu.pdf BibTex
titre
Correction: Alexandre-Gouabau et al. “Comprehensive Preterm Breast Milk Metabotype Associated with Optimal Infant Early Growth Pattern”, Nutrients, 2019, 11, 528
auteur
Marie Cécile Alexandre-Gouabau, Thomas Moyon, Agnès David-Sochard, François Fenaille, Sophie Cholet, Anne-Lise Royer, Yann Guitton, Hélène Billard, Hélène Billard, Dominique Darmaun, Jean-Christophe Rozé, Clair-Yves Boquien
article
Nutrients, 2020, 12 (1), pp.162. ⟨10.3390/nu12010162⟩
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https://hal.science/hal-04208485/file/nutrients-12-00162-v2.pdf BibTex
titre
BMP-1 disrupts cell adhesion and enhances TGF-β activation through cleavage of the matricellular protein thrombospondin-1
auteur
Cyril Anastasi, Patricia Rousselle, Maya Talantikite, Agnès Tessier, Caroline Cluzel, Alice Bachmann, Natacha Mariano, Mélissa Dussoyer, Lindsay Alcaraz, Laëtitia Fortin, Alexandre Aubert, Frédéric Delolme, Naïma El Kholti, J. Armengaud, Pierre Fournié, Céline Auxenfans, Ulrich Valcourt, Sandrine Vadon - Le Goff, Catherine Moali
article
Science Signaling, 2020, 13 (639), pp.eaba3880. ⟨10.1126/scisignal.aba3880⟩
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https://hal.science/hal-02991455/file/Version_HAL.pdf BibTex
titre
The proteomics contribution to the counter-bioterrorism toolbox in the post-COVID-19 era
auteur
Jean Armengaud
article
Expert Review of Proteomics, 2020, 17 (7-8), pp.507 - 511. ⟨10.1080/14789450.2020.1822745⟩
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https://hal.science/hal-04460366/file/Armengaud%20J%202020_Expert%20Review%20Proteomics_The%20proteomics%20contribution%20to%20the%20counter%20bioterrorism%20toolbox%20in%20the%20post%20COVID%2019%20era_Reprint.pdf BibTex
titre
The importance of naturally attenuated SARS‐CoV ‐2 in the fight against COVID ‐19
auteur
Jean Armengaud, Agnès Delaunay-Moisan, Jean‐yves Thuret, Eelco van Anken, Diego Acosta-Alvear, Tomás Aragón, Carolina Arias, Marc Blondel, Ineke Braakman, Jean‐françois Collet, René Courcol, Antoine Danchin, Jean‐françois Deleuze, Jean‐philippe Lavigne, Sophie Lucas, Thomas Michiels, Edward Moore, Jonathon Nixon-Abell, Ramon Rossello-Mora, Zheng‐li Shi, Antonio Siccardi, Roberto Sitia, Daniel Tillett, Kenneth Timmis, Michel Toledano, Peter van der Sluijs, Elisa Vicenzi
article
Environmental Microbiology, 2020, 22 (6), pp.1997-2000. ⟨10.1111/1462-2920.15039⟩
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titre
Health risk assessment related to pinnatoxins in French shellfish
auteur
Nathalie Arnich, Eric Abadie, Nicolas Delcourt, Valérie Fessard, Jean-Marc Fremy, Vincent Hort, Emmeline Lagrange, Thomas Maignien, Jordi Molgó, Marie-Bénédicte Peyrat, Jean-Paul Vernoux, César Mattei
article
Toxicon, 2020, 180, pp.1-10. ⟨10.1016/j.toxicon.2020.03.007⟩
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titre
Comparative Evaluation of Data Dependent and Data Independent Acquisition Workflows Implemented on an Orbitrap Fusion for Untargeted Metabolomics
auteur
Pierre Barbier Saint Hilaire, Kathleen Rousseau, Alexandre Seyer, Sylvain Dechaumet, Annelaure Damont, Christophe Junot, François Fenaille
article
Metabolites, 2020, 10 (4), pp.158. ⟨10.3390/metabo10040158⟩
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titre
Dihydropyrimidinase protects from DNA replication stress caused by cytotoxic metabolites
auteur
J. Basbous, Antoine Aze, Laurent Chaloin, Rana Lebdy, Dana Hodroj, Cyril Ribeyre, Marion Larroque, Caitlin Shepard, Baek Kim, Alain Pruvost, Jérôme Moreaux, Domenico Maiorano, Marcel Méchali, Angelos Constantinou
article
Nucleic Acids Research, 2020, 48 (4), pp.1886-1904. ⟨10.1093/nar/gkz1162⟩
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https://hal.science/hal-02556387/file/Dihydropyrimidinase%20protects%20from%20DNA%20replicationstress%20caused%20by%20cytotoxic%20metabolites.pdf BibTex
titre
A Lateral Flow Immunoassay for the Rapid Identification of CTX-M-Producing Enterobacterales from Culture Plates and Positive Blood Cultures
auteur
Sandrine Bernabeu, Kayaththiry Caroline Ratnam, Hervé Boutal, Camille Gonzalez, Anaïs Vogel, Karine Devilliers, Marc Plaisance, Saoussen Oueslati, Surbhi Malhotra-Kumar, Laurent Dortet, Nicolas Fortineau, Stéphanie Simon, Hervé Volland, Thierry Naas
article
Diagnostics, 2020, 10 (10), ⟨10.3390/diagnostics10100764⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03349199/file/diagnostics-10-00764-v2.pdf BibTex
titre
A Lateral Flow Immunoassay for the Rapid Identification of CTX-M-Producing Enterobacterales from Culture Plates and Positive Blood Cultures
auteur
Sandrine Bernabeu, Kayaththiry Caroline Ratnam, Hervé Boutal, Camille Gonzalez, Anaïs Vogel, Karine Devilliers, Marc Plaisance, Saoussen Oueslati, Surbhi Malhotra-Kumar, Laurent Dortet, Nicolas Fortineau, Stéphanie Simon, Hervé Volland, Thierry Naas
article
Diagnostics, 2020, 10 (10), pp.764. ⟨10.3390/diagnostics10100764⟩
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titre
Titanium Dioxide Nanoparticles Alter the Cellular Phosphoproteome in A549 Cells
auteur
Mathilde Biola-Clier, Jean-Charles Gaillard, Thierry Rabilloud, J. Armengaud, Marie Carrière
article
Nanomaterials, 2020, 10 (2), ⟨10.3390/nano10020185⟩
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https://hal.science/hal-02456149/file/nanomaterials-10-00185.pdf BibTex
titre
Development of a mass spectrometry imaging method for detecting and mapping graphene oxide nanoparticles in rodent tissues
auteur
Helene Cazier, Carole Malgorn, Nathalie Fresneau, Dominique Georgin, Antoine Sallustrau, Céline Chollet, Jean-Claude Tabet, Stéphane Campidelli, Mathieu Pinault, Martine Mayne-L’hermite, Frédéric Taran, Vincent Dive, Christophe Junot, François Fenaille, Benoit Colsch
article
Journal of The American Society for Mass Spectrometry, 2020, 31 (5), pp.1025-1036. ⟨10.1021/jasms.9b00070⟩
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titre
Effect of gut microbiota on depressive-like behaviors in mice is mediated by the endocannabinoid system
auteur
Grégoire Chevalier, Eleni Siopi, Laure Guenin-Macé, Maud Pascal, Thomas Laval, Aline Rifflet, Ivo Gomperts Boneca, Caroline Demangel, Benoit Colsch, Alain Pruvost, Emeline Chu-Van, Aurélie Messager, François Leulier, Gabriel Lepousez, Gérard Eberl, Pierre-Marie Lledo
article
Nature Communications, 2020, 11 (1), ⟨10.1038/s41467-020-19931-2⟩
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https://hal.science/hal-03231388/file/s41467-020-19931-2.pdf BibTex
titre
Proteogenomics‐Guided Evaluation of RNA‐Seq Assembly and Protein Database Construction for Emergent Model Organisms
auteur
Yannick Cogne, Duarte Gouveia, Arnaud Chaumot, Davide Degli Esposti, Olivier Geffard, Olivier Pible, Christine Almunia, J. Armengaud
article
Proteomics, 2020, 20 (10), pp.1-11. ⟨10.1002/pmic.201900261⟩
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titre
Multi-omic analysis of gametogenesis reveals a novel signature at the promoters and distal enhancers of active genes
auteur
Marion Crespo, Annelaure Damont, Melina Blanco, Emmanuelle Lastrucci, Sara El Kennani, Côme Ialy-Radio, Laila El Khattabi, Samuel Terrier, Mathilde Louwagie, Sylvie Kieffer-Jaquinod, Anne-Marie Hesse, Christophe Bruley, Sophie Chantalat, Jérôme Govin, François Fenaille, Christophe Battail, Julie Cocquet, Delphine Pflieger
article
Nucleic Acids Research, 2020, 48 (8), pp.4115-4138. ⟨10.1093/nar/gkaa163⟩
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https://hal.science/hal-02945580/file/CrespoM_et_al_NAR_2020_gkaa163.pdf BibTex
titre
Breastfeeding initiation or duration and longitudinal patterns of infections up to 2 years and skin rash and respiratory symptoms up to 8 years in the EDEN mother–child cohort
auteur
Camille Davisse-Paturet, Karine Adel-Patient, Anne Forhan, Sandrine Lioret, Isabella Annesi‐maesano, Barbara Heude, Marie-Aline Charles, Blandine Lauzon‐guillain
article
Maternal and Child Nutrition, 2020, 16 (3), ⟨10.1111/mcn.12935⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02904859/file/Davisse-Paturet_EDEN_MCN_Main%20Document_HAL_Juillet%202020.pdf BibTex
titre
Altered age‐linked regulation of plasma DYRK1A in elderly cognitive complainers (INSIGHT‐preAD study) with high brain amyloid load
auteur
Jean M Delabar, Marion Ortner, Stephanie Simon, Anne Wijkhuisen, Cecile Féraudet-Tarisse, Jonathan Pegon, Emma Vidal, Yael Hirschberg, Bruno Dubois, Marie-Claude Potier
article
Alzheimer's & Dementia: Translational Research & Clinical Interventions, 2020, 6 (1), pp.e12046. ⟨10.1002/trc2.12046⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-02899401/file/trc2.12046.pdf BibTex
titre
An emerging powerful technique for distinguishing isomers: Trapped ion mobility spectrometry time‐of‐flight mass spectrometry for rapid characterization of estrogen isomers
auteur
Aurélie Delvaux, Estelle Rathahao-Paris, Sandra Alves
article
Rapid Communications in Mass Spectrometry, 2020, 34 (24), pp.e8928. ⟨10.1002/rcm.8928⟩
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titre
Bioactive Potential of Extracts of Labrenzia aggregata Strain USBA 371, a Halophilic Bacterium Isolated from a Terrestrial Source
auteur
Carolina Díaz-Cárdenas, Laura Yinneth Rojas, Susana Fiorentino, Monica Cala, Jorge Díaz, Freddy Ramos, Jean Armengaud, Silvia Restrepo, Sandra Baena
article
Molecules, 2020, 25 (11), pp.2546. ⟨10.3390/molecules25112546⟩
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titre
A snake toxin as a theranostic agent for the type 2 vasopressin receptor
auteur
Laura Droctové, Manon Lancien, Vu Long Tran, Michaël Susset, Benoit Jego, Frederic Theodoro, Pascal Kessler, Gilles Mourier, Philippe Robin, Sékou Siramakan Diarra, Stefano Palea, Adrien Flahault, Amélia Chorfa, Maithé Corbani, Catherine Llorens-Cortes, Bernard Mouillac, Christiane Mendre, Alain Pruvost, Denis Servent, Charles Truillet, Nicolas Gilles
article
Theranostics, 2020, 10 (25), pp.11580-11594. ⟨10.7150/thno.47485⟩
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titre
Resilient and Sensitive Key Points of the Photosynthetic Machinery of Coffea spp. to the Single and Superimposed Exposure to Severe Drought and Heat Stresses
auteur
Danielly Dubberstein, Fernando Lidon, Ana Rodrigues, José Semedo, Isabel Marques, Weverton Rodrigues, Duarte Gouveia, Jean Armengaud, Magda Semedo, Sónia Martins, Maria Simões-Costa, I. Moura, Isabel Pais, Paula Scotti-Campos, Fábio Partelli, Eliemar Campostrini, Ana Ribeiro-Barros, Fábio Damatta, José Ramalho
article
Frontiers in Plant Science, 2020, 11, ⟨10.3389/fpls.2020.01049⟩
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titre
Resilient and Sensitive Key Points of the Photosynthetic Machinery of Coffea spp. to the Single and Superimposed Exposure to Severe Drought and Heat Stresses
auteur
Danielly Dubberstein, Fernando Lidon, Ana Rodrigues, José Semedo, Isabel Marques, Weverton Rodrigues, Duarte Gouveia, Jean Armengaud, Magda Semedo, Sónia Martins, Maria Simões-Costa, I. Moura, Isabel Pais, Paula Scotti-Campos, Fábio Partelli, Eliemar Campostrini, Ana Ribeiro-Barros, Fábio Damatta, José Ramalho
article
Frontiers in Plant Science, 2020, 11, ⟨10.3389/fpls.2020.01049⟩
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titre
Top-Down and Bottom-Up Proteomics of Circulating S100A8/S100A9 in Plasma of Septic Shock Patients
auteur
Christelle Dubois, Didier Payen, Stéphanie Simon, Christophe Junot, François Fenaille, Nathalie Morel, François Becher
article
Journal of Proteome Research, 2020, 19 (2), pp.914-925. ⟨10.1021/acs.jproteome.9b00690⟩
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titre
Top-Down and Bottom-Up Proteomics of Circulating S100A8/S100A9 in Plasma of Septic Shock Patients
auteur
Christelle Dubois, Didier Payen, Stéphanie Simon, Christophe Junot, François Fenaille, Nathalie Morel, François Becher
article
Journal of Proteome Research, 2020, 19 (2), pp.914-925. ⟨10.1021/acs.jproteome.9b00690⟩
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titre
Bacillus cereus Decreases NHE and CLO Exotoxin Synthesis to Maintain Appropriate Proteome Dynamics During Growth at Low Temperature
auteur
Catherine Duport, Ludivine Rousset, Béatrice Alpha-Bazin, J. Armengaud
article
Toxins, 2020, 12 (10), pp.645. ⟨10.3390/toxins12100645⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03101746/file/2020%20-%20Publi%2040%20-%20Duport%20-%20Toxins.pdf BibTex
titre
High-multiplexed monitoring of protein biomarkers in the sentinel Gammarus fossarum by targeted scout-MRM assay, a new vision for ecotoxicoproteomics
auteur
Julien Faugère, Duarte Gouveia, Sophie Ayciriex, Arnaud Chaumot, Christine Almunia, Adeline François, Jean Armengaud, Jérôme Lemoine, Olivier Geffard, Davide Degli Esposti, Arnaud Salvador
article
Journal of Proteomics, 2020, 226, pp.103901. ⟨10.1016/j.jprot.2020.103901⟩
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https://hal.science/hal-02903090/file/S1874391920302694.pdf BibTex
titre
Backbone Cyclization Turns a Venom Peptide into a Stable and Equipotent Ligand at Both Muscle and Neuronal Nicotinic Receptors
auteur
Julien Giribaldi, Yves Haufe, Edward Evans, Muriel Amar, Anna Durner, Casey Schmidt, Adèle Faucherre, Hamid Moha Ou Maati, Christine Enjalbal, Jordi Molgó, Denis Servent, David T. Wilson, Norelle Daly, Annette Nicke, Sébastien Dutertre
article
Journal of Medicinal Chemistry, 2020, 63 (21), pp.12682-12692. ⟨10.1021/acs.jmedchem.0c00957⟩
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https://hal.science/hal-02995265/file/Giribaldi%20et%20al.pdf BibTex
titre
Development of Conformational Antibodies to Detect Bcl-xL's Amyloid Aggregates in Metal-Induced Apoptotic Neuroblastoma Cells
auteur
Alexis Gonneaud, Fatima-Zohra Fakhir, Emeline Landas, Enora Le Tallec, Elisabeth Chartier-Garcia, Christine Almunia, Alexandre Chenal, Vincent Forge, Marquette Christel
article
International Journal of Molecular Sciences, 2020, 21 (20), pp.7625. ⟨10.3390/ijms21207625⟩
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https://hal.science/hal-03031819/file/ijms-21-07625-v2.pdf BibTex
titre
Proteotyping SARS-CoV-2 Virus from Nasopharyngeal Swabs: A Proof-of-Concept Focused on a 3 Min Mass Spectrometry Window
auteur
Duarte Gouveia, Guylaine Miotello, Fabrice Gallais, Jean-Charles Gaillard, Stéphanie Debroas, Laurent Bellanger, Jean-Philippe Lavigne, Albert Sotto, Lucia Grenga, Olivier Pible, J. Armengaud
article
Journal of Proteome Research, 2020, 19 (11), pp.4407-4416. ⟨10.1021/acs.jproteome.0c00535⟩
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BibTex
titre
Quick microbial molecular phenotyping by differential shotgun proteomics
auteur
Duarte Gouveia, Lucia Grenga, Olivier Pible, Jean Armengaud
article
Environmental Microbiology, 2020, 22 (8), pp.2996-3004. ⟨10.1111/1462-2920.14975⟩
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BibTex
titre
Shortlisting SARS‐CoV‐2 peptides for targeted studies from experimental data‐dependent acquisition tandem mass spectrometry data
auteur
Duarte Gouveia, Lucia Grenga, Jean‐charles Gaillard, Fabrice Gallais, Laurent Bellanger, Olivier Pible, J. Armengaud
article
Proteomics, 2020, 20 (14), pp.2000107. ⟨10.1002/pmic.202000107⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03349684/file/PMIC-20-0.pdf BibTex
titre
Combining proteogenomics and metaproteomics for deep taxonomic and functional characterization of microbiomes from a non-sequenced host
auteur
Duarte Gouveia, Olivier Pible, Karen Culotta, Virginie Jouffret, Olivier Geffard, Arnaud Chaumot, Davide Degli-Esposti, Jean Armengaud
article
npj Biofilms and Microbiomes, 2020, 6 (1), pp.23. ⟨10.1038/s41522-020-0133-2⟩
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titre
Proteomics in the COVID‐19 Battlefield: First Semester Check‐Up
auteur
Lucia Grenga, Jean Armengaud
article
Proteomics, 2020, 21 (1), ⟨10.1002/pmic.202000198⟩
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BibTex
titre
Control of mRNA translation by dynamic ribosome modification
auteur
Lucia Grenga, Richard Howard Little, Govind Chandra, Stuart Daniel Woodcock, Gerhard Saalbach, Richard James Morris, Jacob George Malone
article
PLoS Genetics, 2020, 16 (6), ⟨10.1371/journal.pgen.1008837⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03350114/file/a8a81491ac63f690296d24ec11768ea4.pdf BibTex
titre
Shotgun proteomics analysis of SARS-CoV-2-infected cells and how it can optimize whole viral particle antigen production for vaccines
auteur
Lucia Grenga, Fabrice Gallais, Olivier Pible, Jean-Charles Gaillard, Duarte Gouveia, Hélène Batina, Niza Bazaline, Sylvie Ruat, Karen Culotta, Guylaine Miotello, Stéphanie Debroas, Marie-Anne Roncato, Gérard Steinmetz, Charlotte Foissard, Anne Desplan, Béatrice Alpha-Bazin, Christine Almunia, Fabienne Gas, Laurent Bellanger, Jean Armengaud
article
Emerging microbes & infections, 2020, 9 (1), pp.1712-1721. ⟨10.1080/22221751.2020.1791737⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03350449/file/2020.04.17.046193.full.pdf BibTex
titre
A Small Compound Targeting Prohibitin with Potential Interest for Cognitive Deficit Rescue in Aging mice and Tau Pathology Treatment
auteur
Anne-Cécile Guyot, Charlotte Leuxe, Clémence Disdier, Nassima Oumata, Narciso Costa, Gwenaëlle Le Roux, Paloma Fernandez-Varela, Arnaud Duchon, Jean Baptiste Charbonnier, Yann Herault, Serena Pavoni, Hervé Galons, Emile Andriambeloson, Stéphanie Wagner, Laurent Meijer, Amie K. Lund, Aloïse Mabondzo
article
Scientific Reports, 2020, 10 (1), pp.1143. ⟨10.1038/s41598-020-57560-3⟩
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titre
Silencing miR-202-3p increases MMP-1 and promotes a brain invasive phenotype in metastatic breast cancer cells
auteur
Rania Harati, Shirin Hafezi, Abdelaziz Tlili, Aloïse M. Mabondzo
article
PLoS ONE, 2020, 15 (10), pp.e0239292. ⟨10.1371/journal.pone.0239292⟩
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https://hal.science/hal-04476267/file/Rania%20H%20et%20al%20%282%29.pdf BibTex
titre
P084 Quick full-range determination of the composition of the cystic fibrosis lung microbiome from sputum by phylopeptidomics
auteur
P. Hardouin, O. Pible, H. Marchandin, R. Chiron, J. Armengaud, L. Grenga
article
Journal of Cystic Fibrosis, 2020, 19, pp.S79. ⟨10.1016/S1569-1993(20)30419-7⟩
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titre
Dichloromethane Degradation Pathway from Unsequenced Hyphomicrobium sp. MC8b Rapidly Explored by Pan-Proteomics
auteur
Karim Hayoun, Emilie Geersens, Cédric C Laczny, Rashi Halder, Carmen Lázaro Sánchez, Abhijit Manna, Françoise Bringel, Michaël Ryckelynck, Paul Wilmes, Emilie Muller, Béatrice Alpha-Bazin, J. Armengaud, Stéphane Vuilleumier
article
Microorganisms, 2020, 8 (12), ⟨10.3390/microorganisms8121876⟩
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https://hal.science/hal-03107382/file/microorganisms-08-01876.pdf BibTex
titre
Proteotyping Environmental Microorganisms by Phylopeptidomics: Case Study Screening Water from a Radioactive Material Storage Pool
auteur
Karim Hayoun, Olivier Pible, Pauline Petit, François Allain, Virginie Jouffret, Karen Culotta, Corinne Rivasseau, Jean Armengaud, Béatrice Alpha-Bazin
article
Microorganisms, 2020, 8 (10), pp.1525. ⟨10.3390/microorganisms8101525⟩
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BibTex
titre
High-throughput proteotyping of bacterial isolates by double barrel chromatography-tandem mass spectrometry based on microplate paramagnetic beads and phylopeptidomics
auteur
Karim Hayoun, Jean-Charles Gaillard, Olivier Pible, Béatrice Alpha-Bazin, Jean Armengaud
article
Journal of Proteomics, 2020, 226, pp.103887. ⟨10.1016/j.jprot.2020.103887⟩
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titre
Proteotyping Environmental Microorganisms by Phylopeptidomics: Case Study Screening Water from a Radioactive Material Storage Pool
auteur
Karim Hayoun, Olivier Pible, Pauline Petit, François Allain, Virginie Jouffret, Karen Culotta, Corinne Rivasseau, J. Armengaud, Béatrice Alpha-Bazin
article
Microorganisms, 2020, 8 (10), ⟨10.3390/microorganisms8101525⟩
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https://hal.science/hal-02968385/file/Hayoun%20-%20Microorganisms.pdf BibTex
titre
Evaluation of the Biotoxis qPCR Detection Kit for Francisella tularensis Detection in Clinical and Environmental Samples
auteur
Aurélie Hennebique, Fabienne Gas, Hélène Batina, Cécilia de Araujo, Karine Bizet, Max Maurin
article
Journal of Clinical Microbiology, 2020, 59 (1), pp.e01434-20. ⟨10.1128/JCM.01434-20⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-04460069/file/hennebique-et-al-2020-evaluation-of-the-biotoxis-qpcr-detection-kit-for-francisella-tularensis-detection-in-clinical.pdf BibTex
titre
Investigation of space charge effects and ion trapping capacity on direct introduction ultra‐high‐resolution mass spectrometry workflows for metabolomics
auteur
Ulli Hohenester, Pierre Barbier Saint-Hilaire, François Fenaille, Richard Cole
article
Journal of Mass Spectrometry, 2020, 55 (10), pp.e4613. ⟨10.1002/jms.4613⟩
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BibTex
titre
SipD and IpaD induce a cross-protection against Shigella and Salmonella infections
auteur
Bakhos Jneid, Audrey Rouaix, Cécile Féraudet-Tarisse, Stéphanie Simon
article
PLoS Neglected Tropical Diseases, 2020, 14 (5), ⟨10.1371/journal.pntd.0008326⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03350195/file/1d6abdce184952bc740d65817688908a.pdf BibTex
titre
Proposed BoNT/A and /B Peptide Substrates Cannot Detect Multiple Subtypes in the Endopep-MS Assay
auteur
Suzanne Kalb, Jakub Baudys, Kaitlyn Kiernan, Dongxia Wang, François Becher, John Barr
article
Journal of Analytical Toxicology, 2020, 44 (2), pp.173-179. ⟨10.1093/jat/bkz044⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03350416/file/main.pdf BibTex
titre
Post-production modifications of murine mesenchymal stem cell (mMSC) derived extracellular vesicles (EVs) and impact on their cellular interaction
auteur
Sarah Le Saux, Hanna Aarrass, Joséphine Lai-Kee-Him, Patrick Bron, Jean Armengaud, Guylaine Miotello, Justine Bertrand-Michel, Emeric Dubois, Simon George, Orestis Faklaris, Jean-Marie Devoisselle, Philippe Legrand, Joël Chopineau, Marie Morille
article
Biomaterials, 2020, 231 (17), pp.119675. ⟨10.1016/j.biomaterials.2019.119675⟩
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BibTex
titre
Post-production modifications of murine mesenchymal stem cell (mMSC) derived extracellular vesicles (EVs) and impact on their cellular interaction
auteur
Sarah Le Saux, Hanna Aarrass, Josephine Lai-Kee-Him, Patrick Bron, J. Armengaud, Guylaine Miotello, Justine Bertrand-Michel, Emeric Dubois, Simon George, Orestis Faklaris, Jean-Marie Devoisselle, Philippe Legrand, Joel Chopineau, Marie Morille
article
Biomaterials, 2020, 231, pp.119675. ⟨10.1016/j.biomaterials.2019.119675⟩
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https://hal.science/hal-02414428/file/S0142961219307744.pdf BibTex
titre
From shotgun to targeted proteomics: rapid Scout-MRM assay development for monitoring potential immunomarkers in Dreissena polymorpha
auteur
Maxime Leprêtre, Mélissa Palos-Ladeiro, Julien Faugere, Christine Almunia, Jérôme Lemoine, Jean Armengaud, Alain Geffard, Arnaud Salvador
article
Analytical and Bioanalytical Chemistry, 2020, 412 (26), pp.7333-7347. ⟨10.1007/s00216-020-02868-2⟩
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titre
Identification of immune-related proteins of Dreissena polymorpha hemocytes and plasma involved in host-microbe interactions by differential proteomics
auteur
Maxime Leprêtre, Christine Almunia, J. Armengaud, Antoine Le Guernic, Arnaud Salvador, Alain Geffard, Mélissa Palos-Ladeiro
article
Scientific Reports, 2020, 10 (1), pp.6226. ⟨10.1038/s41598-020-63321-z⟩
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https://hal.univ-reims.fr/hal-02608535/file/Lepr%C3%AAtre2020.pdf BibTex
titre
Protein Corona Composition of Silica Nanoparticles in Complex Media: Nanoparticle Size does not Matter
auteur
Laurent Marichal, Géraldine Klein, J. Armengaud, Yves Boulard, Stéphane Chédin, Jean Labarre, Serge Pin, Jean-Philippe Renault, Jean-Christophe Aude
article
Nanomaterials, 2020, 10 (2), ⟨10.3390/nano10020240⟩
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https://cea.hal.science/cea-02467087/file/nanomaterials-10-00240.pdf BibTex
titre
Blood metabolomics uncovers inflammation-associated mitochondrial dysfunction as a potential mechanism underlying ACLF
auteur
Richard Moreau, Joan Clària, Ferran Aguilar, François Fenaille, Juan José Lozano, Christophe Junot, Benoit Colsch, Paolo Caraceni, Jonel Trebicka, Marco Pavesi, Carlo Alessandria, Frederik Nevens, Faouzi Saliba, Tania Welzel, Agustin Albillos, Thierry Gustot, Javier Fernández, Christophe Moreno, Maurizio Baldassarre, Giacomo Zaccherini, Salvatore Piano, Sara Montagnese, Victor Vargas, Joan Genescà, Elsa Solà, William Bernal, Noémie Butin, Thaïs Hautbergue, Sophie Cholet, Florence Castelli, Christian Jansen, Christian Steib, Daniela Campion, Raj Mookerjee, Miguel Rodríguez-Gandía, German Soriano, François Durand, Daniel Benten, Rafael Bañares, Rudolf Stauber, Henning Gronbaek, Minneke Coenraad, Pere Ginès, Alexander Gerbes, Rajiv Jalan, Mauro Bernardi, Vicente Arroyo, Paolo Angeli
article
Journal of Hepatology, 2020, 72 (4), pp.688-701. ⟨10.1016/j.jhep.2019.11.009⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03350315/file/S0168827819306968.pdf BibTex
titre
A European proposal for quality control and quality assurance of tandem mass spectral libraries
auteur
Herbert Oberacher, Michael Sasse, Jean-Philippe Antignac, Yann Guitton, Laurent Debrauwer, Emilien L. Jamin, Tobias Schulze, Martin Krauss, Adrian Covaci, Noelia Caballero-Casero, Kathleen Rousseau, Annelaure Damont, François Fenaille, Marja Lamoree, Emma L Schymanski
article
Environmental sciences : an international journal of environmental physiology and toxicology, 2020, 32 (1), pp.43. ⟨10.1186/s12302-020-00314-9⟩
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https://hal.science/hal-01410982/file/2020_Oberacher_Environ-Sci.pdf BibTex
titre
Direct Meta-Analyses Reveal Unexpected Microbial Life in the Highly Radioactive Water of an Operating Nuclear Reactor Core
auteur
Pauline Petit, Olivier Pible, Valérie Van Eesbeeck, Claude Alban, Gérard Steinmetz, Mohamed Mysara, Pieter Monsieurs, J. Armengaud, Corinne Rivasseau
article
Microorganisms, 2020, 8 (12), pp.1857. ⟨10.3390/microorganisms8121857⟩
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https://hal.science/hal-03025146/file/Petit%20et%20al%202020%20microorganisms-08-01857.pdf BibTex
titre
Direct Meta-Analyses Reveal Unexpected Microbial Life in the Highly Radioactive Water of an Operating Nuclear Reactor Core
auteur
Pauline Petit, Olivier Pible, Valérie Van Eesbeeck, Claude Alban, Gérard Steinmetz, Mohamed Mysara, Pieter Monsieurs, Jean Armengaud, Corinne Rivasseau
article
Microorganisms, 2020, 8 (12), pp.1857. ⟨10.3390/microorganisms8121857⟩
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titre
Estimating relative biomasses of organisms in microbiota using “phylopeptidomics”
auteur
Olivier Pible, François Allain, Virginie Jouffret, Karen Culotta, Guylaine Miotello, Jean Armengaud
article
Microbiome, 2020, 8 (1), pp.30. ⟨10.1186/s40168-020-00797-x⟩
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titre
Estimating relative biomasses of organisms in microbiota using “phylopeptidomics”
auteur
Olivier Pible, François Allain, Virginie Jouffret, Karen Culotta, Guylaine Miotello, J. Armengaud
article
Microbiome, 2020, 8 (1), pp.30. ⟨10.1186/s40168-020-00797-x⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03350387/file/s40168-020-00797-x.pdf BibTex
titre
Critical review on proteotypic peptide marker tracing for six allergenic ingredients in incurred foods by mass spectrometry
auteur
Rosa Pilolli, Chiara Nitride, Nathalie Gillard, Anne-Catherine Huet, Christof van Poucke, Marc de Loose, Olivier Tranquet, Colette Larre, Karine Adel-Patient, Hervé Bernard, E.N. Clare Mills, Linda Monaci
article
Food Research International, 2020, 128, pp.108747. ⟨10.1016/j.foodres.2019.108747⟩
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https://hal.science/hal-02410519/file/Manuscript_R2_ACCEPTED.pdf BibTex
titre
Improving lipid mapping in Genome Scale Metabolic Networks using ontologies
auteur
Nathalie Poupin, Florence Vinson, Arthur Moreau, Aurélie Batut, Maxime Chazalviel, Benoit Colsch, Laetitia Fouillen, Sarah Guez, Spiro Khoury, Jessica Dalloux-Chioccioli, Anthony Tournadre, Pauline Le Faouder, Corinne Pouyet, Pierre van Delft, Fanny Viars, Justine Bertrand-Michel, Fabien Jourdan
article
Metabolomics, 2020, 16 (4), ⟨10.1007/s11306-020-01663-5⟩
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https://hal.science/hal-02935172/file/s11306-020-01663-5.pdf BibTex
titre
Suspect and non-targeted screening of chemicals of emerging concern for human biomonitoring, environmental health studies and support to risk assessment: From promises to challenges and harmonisation issues
auteur
Mariane Pourchet, Laurent Debrauwer, Jana Klánová, Elliott J Price, Adrian Covaci, Noelia Caballero-Casero, Herbert Oberacher, Marja Lamoree, Annelaure Damont, Francois Fenaille, Jelle Vlaanderen, Jeroen Meijer, Martin Krauss, Denis Sarigiannis, Robert Barouki, Bruno Le Bizec, Jean-Philippe Antignac
article
Environment International, 2020, 139, ⟨10.1016/j.envint.2020.105545⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02735318/file/2020_environmentinternational_pourchet.pdf BibTex
titre
The Effect of the Food Matrix on the In Vitro Bio‐Accessibility and IgE Reactivity of Peanut Allergens
auteur
Huan Rao, Ivona Baricevic, Hervé Bernard, Frances Smith, Rebekah Sayers, Anuhradha Balasundaram, Carol Ann Costello, Philip Padfield, Aida Semic‐jusufagic, Angela Simpson, Karine Adel-Patient, Wentong Xue, E. N. Clare Mills
article
Molecular Nutrition and Food Research, 2020, 64 (14), pp.1-9. ⟨10.1002/mnfr.201901093⟩
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titre
Gout and pseudo-gout-related crystals promote GLUT1-mediated glycolysis that governs NLRP3 and interleukin-1β activation on macrophages
auteur
Felix Renaudin, Lucie Orliaguet, Florence Castelli, François Fenaille, Aurelie Prignon, Fawaz Alzaid, Christèle Combes, Aurélie Delvaux, Yasmina Adimy, Martine Cohen-Solal, Pascal Richette, Thomas Bardin, Jean-Pierre Riveline, Nicolas Venteclef, Frédéric Lioté, Laure Campillo-Gimenez, Hang-Korng Ea
article
Annals of the Rheumatic Diseases, 2020, 79 (11), pp.1506-1514. ⟨10.1136/annrheumdis-2020-217342⟩
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https://hal.science/hal-03203907/file/Renaudin_27609.pdf BibTex
titre
Fluorogenic iminosydnones: bioorthogonal tools for double turn-on click-and-release reactions
auteur
Margaux Riomet, Karine Porte, Anne Wijkhuisen, Davide Audisio, Frédéric Taran
article
Chemical Communications, 2020, 56 (52), pp.7183-7186. ⟨10.1039/d0cc03067h⟩
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titre
Very Early Blood Diffusion of the Active Lethal and Edema Factors of Bacillus anthracis After Intranasal Infection
auteur
Clémence Rougeaux, François Becher, Pierre L. Goossens, Jean-Nicolas Tournier
article
Journal of Infectious Diseases, 2020, 221 (4), pp.660-667. ⟨10.1093/infdis/jiz497⟩
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https://pasteur.hal.science/pasteur-03293185/file/jiz497.pdf BibTex
titre
Groundwater promotes emergence of asporogenic mutants of emetic Bacillus cereus
auteur
Ludivine Rousset, Béatrice Alpha-Bazin, Alice Chateau, J. Armengaud, Thierry Clavel, Odile Berge, Catherine Duport
article
Environmental Microbiology, 2020, 22, pp.5248-5264. ⟨10.1111/1462-2920.15203⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02921272/file/2020_Rousset_EnvironmMicrobiol_postprint.pdf BibTex
titre
Differential effects of post-weaning diet and maternal obesity on mouse liver and brain metabolomes
auteur
Sofiane Safi-Stibler, Mélanie Jouin, Etienne A Thévenot, Luc Jouneau, Alexandre Seyer, Anne Gabory, Hélène Jammes, Delphine Rousseau-Ralliard, Christine Baly
article
Nutrients, 2020, 12 (6), pp.1572. ⟨10.3390/nu12061572⟩
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https://hal.science/hal-02867469/file/nutrients-12-01572-v2.pdf BibTex
titre
The COVID-19 MS Coalition—accelerating diagnostics, prognostics, and treatment
auteur
Weston Struwe, Edward Emmott, Melanie Bailey, Michal Sharon, Andrea Sinz, Fernando Corrales, Kostas Thalassinos, Julian Braybrook, Clare Mills, Perdita Barran, Covid Ms Coalition, J. Armengaud
article
The Lancet, 2020, 395 (10239), pp.1761-1762. ⟨10.1016/S0140-6736(20)31211-3⟩
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BibTex
titre
Three distinct glycosylation pathways are involved in the decoration of $Lactococcus\ lactis$ cell wall glycopolymers
auteur
Ilias Theodorou, Pascal Courtin, Irina Sadovskaya, Simon Palussière, François Fenaille, Jennifer Mahony, Marie-Pierre Chapot-Chartier, Douwe van Sinderen
article
Journal of Biological Chemistry, 2020, 295 (16), pp.5519-5532. ⟨10.1074/jbc.RA119.010844⟩
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https://hal.science/hal-02565128/file/1-s2.0-S002192581748567X-main.pdf BibTex
titre
Assessment of a Loop-Mediated Isothermal Amplification (LAMP) Assay for the Rapid Detection of Pathogenic Bacteria from Respiratory Samples in Patients with Hospital-Acquired Pneumonia
auteur
Andrea Vergara, Hervé Boutal, Adrián Ceccato, Míriam López, Adrià Cruells, Leticia Bueno-Freire, Javier Moreno-Morales, Jorge Puig de La Bellacasa, Pedro Castro, Antoni Torres, Francesc Marco, Climent Casals-Pascual, Jordi Vila
article
Microorganisms, 2020, 8 (1), pp.103. ⟨10.3390/microorganisms8010103⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02964202/file/Microorganism_Vergara_2020.pdf BibTex

Conference papers

titre
Understanding complex microbiomes with metaproteomics
auteur
Jean Armengaud
article
PROTEOVIEDO, Oviedo, Spain, SEProt - Sociedad Española de Proteomica, Nov 2020, Oviedo, Spain
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https://hal.inrae.fr/hal-04476657/file/Proteoviedo%202020_Keynote%20speaker_Jean%20ARMENGAUD.pdf BibTex
titre
Mass Spectrometry: new diagnostic tools for the near future
auteur
Jean Armengaud
article
ESCMID Postgraduate Technical Workshop "Applications of MALDITOF Mass-Spectrometry in Clinical Microbiology", Belen Rodriguez-Sanchez - ESCMID Study Group for Molecular Diagnostics (ESGMD), Mar 2020, Madrid, Spain
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BibTex
titre
Les avancées en métaprotéomique et protéotypage pour l'identification des microorganismes
auteur
Jean Armengaud
article
Journées SEBIO Mobidic, SEBIO, Mar 2020, Reims, France
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Book sections

titre
Mass spectrometry-based metabolomics for an in-depth questioning of human health
auteur
Sandra Alves, Alain Paris, Estelle Rathahao-Paris
article
ADVANCES IN CLINICAL CHEMISTRY, pp.147-191, 2020, ⟨10.1016/bs.acc.2020.02.009⟩
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Special issue

titre
Toxins special issue "Antibodies for Toxins: From Detection to Therapeutics
auteur
Stéphanie Simon, E Ezan
article
Toxins, 2020
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Patents

titre
COMPLEXE IMMUNOMODULATEUR ET SES APPLICATIONS POUR LA THÉRAPIE
auteur
Slobodan Culina, Céline Cousin, Alexandra Savatier, Michel Léonetti
article
France, N° de brevet: FR2005663. 2020
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BibTex
titre
ANTI-LILRB ANTIBODIES AND USES THEREOF
auteur
Benoit Favier, Sixtine Coindre, Anne Wijkhuisen, Stéphanie Simon, Roger Le Grand, Olivier Lambotte
article
France, Patent n° : EP20306197. 2020
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Poster communications

titre
Glutathione conjugates as biomarkers of the systemic diffusion of vesicating agents
auteur
Thierry Douki, Marie Gilardoni, Clara-Lou Kang, Christophe Pierard, Fanny Caffin, Fanny Gros-Désormeaux, Daniel Leonco, Francois Fenaille, Christophe Junot
article
CBRNE Research and Innovation 5th International Conference, May 2020, Lille, France. 2020
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titre
Proteomic analysis of bystander effects in chondrosarcoma cells
auteur
Antoine Gilbert, Mihaela Tudor, Charlotte Lepleux, V. Rofidal, Sonia Hem, Christine Almunia, J. Armengaud, Emilie Brotin, Siamak Haghdoost, Diana Savu, François Chevalier
article
45th Annual Meeting of the European Radiation Research Society, Sep 2020, Lund, Sweden. , pp.123
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https://hal.science/hal-03144446/file/Poster%20F%20Chevalier.pdf BibTex
titre
INPUT OF DEEP PHENOTYPING IN THE METABOLIC SYNDROME STRATIFICATION
auteur
Stéphanie Monnerie, Mélanie Pétéra, Cécile Canlet, Florence Castelli, Benoit Colsch, Francois Fenaille, Charlotte Joly, Fabien Jourdan, Natacha Lenuzza, Bernard Lyan, Jean-Francois Martin, Carole Migné, José A Morais, Nathalie Poupin, Florence Vinson, Etienne Thevenot, Christophe Junot, Pierrette Gaudreau, Blandine Comte, Estelle Pujos-Guillot
article
European RFMF Metabomeeting 2020, Jan 2020, Toulouse, France. , 262 p., 2020, Oral and Poster Abstracts European RMF Metabomeeting 2020
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https://hal.science/hal-02505908/file/2020_BookOfAbstract_Metabomeeting_Toulouse_1.pdf BibTex

Theses

titre
Protéotypage de micro-organismes par spectrométrie de masse en tandem
auteur
Karim Hayoun
article
Sciences du Vivant [q-bio]. UNIVERSITE MONTPELLIER, 2020. Français. ⟨NNT : 2020MONTT078⟩
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BibTex
titre
Développement de nouveaux outils pour l’analyse métabolomique par spectrométrie de masse haute résolution : de l’acquisition de spectres MS/MS pour l’identification large-spectre de métabolites au marquage isotopique pour la quantification
auteur
Kathleen Rousseau
article
Chimie analytique. Université Paris-Saclay, 2020. Français. ⟨NNT : 2020UPASF006⟩
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https://theses.hal.science/tel-03793794/file/95367_ROUSSEAU_2020_archivage.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
The H2A.J histone variant contributes to Interferon-Stimulated Gene expression in senescence by its weak interaction with H1 and the derepression of repeated DNA sequences
auteur
Adele Mangelinck, Clement Coudereau, Regis Courbeyrette, Khalid Ouararhni, Ali Hamiche, Christophe Redon, William Bonner, Erwin van Dijk, Celine Derbois, Robert Olaso, Jean-Francois Deleuze, Francois Fenaille, Claudia Ruebe, Jean-Yves Thuret, Carl Mann
article
2020
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BibTex
titre
Combinatory therapy targeting mitochondrial oxidative phosphorylation improves efficacy of IDH mutant inhibitors in acute myeloid leukemia
auteur
Lucille Stuani, Marie Sabatier, Feng Wang, Nathalie Poupin, Claudie Bosc, Estelle Saland, Florence Castelli, Lara Gales, Camille Montersino, Emeline Boet, Evgenia Turtoi, Tony Kaoma, Thomas Farge, Nicolas Broin, Clément Larrue, Natalia Baran, Marc Conti, Sylvain Loric, Pierre-Luc Mouchel, Mathilde Gotanègre, Cédric Cassan, Laurent Fernando, Guillaume Cognet, Aliki Zavoriti, Mohsen Hosseini, Héléna Boutzen, Kiyomi Morita, Andrew Futreal, Emeline Chu-Van, Laurent Le Cam, Martin Carroll, Mary Selak, Norbert Vey, Claire Calmettes, Arnaud Pigneux, Audrey Bidet, Rémy Castellano, Francois Fenaille, Andrei Turtoi, Guillaume Cazals, Pierre Bories, Yves Gibon, Brandon Nicolay, Sébastien Ronseaux, Joe Marszalek, Courtney Dinardo, Marina Konopleva, Yves Collette, Laetitia Linares, Floriant Bellvert, Fabien Jourdan, Koichi Takahashi, Christian Récher, Jean-Charles Portais, Jean-Emmanuel Sarry
article
2020
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