Publications HAL de la collection AMAP

2023

Article dans une revue

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Yélognissè Agbohessou, Claire Delon, Eric Mougin, Manuela Grippa, Torbern Tagesson, et al.. To what extent are greenhouse-gas emissions offset by trees in a Sahelian silvopastoral system?. Agricultural and Forest Meteorology, 2023, 343, pp.109780. ⟨10.1016/j.agrformet.2023.109780⟩. ⟨hal-04264171⟩
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Alexandre de Haldat Du Lys, Mathieu Millan, Jean-François Barczi, Yves Caraglio, Guy Midgley, et al.. If self‐shading is so bad, why is there so much? Short shoots reconcile costs and benefits. New Phytologist, 2023, 237 (5), pp.1684-1695. ⟨10.1111/nph.18636⟩. ⟨hal-03889601⟩
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Laëtitia Lemière, Marc Jaeger, Marie Gosme, Gérard Subsol. Combinatorial maps, a new framework to model agroforestry systems. Plant Phenomics, 2023, 5, pp.0120. ⟨10.34133/plantphenomics.0120⟩. ⟨hal-04344009⟩
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Houssem E M Triki, Fabienne Ribeyre, Fabrice Pinard, Marc Jaeger. Coupling Plant Growth Models and Pest and Disease Models: An Interaction Structure Proposal, MIMIC. Plant Phenomics, 2023, 5, pp.0077. ⟨10.34133/plantphenomics.0077⟩. ⟨hal-04218531⟩
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A van Rooij, Eric Badel, Jean-François Barczi, Yves Caraglio, Tancrede Almeras, et al.. Modelling the growth stress in tree branches: eccentric growth vs. reaction wood. Peer Community Journal, 2023, 3, pp.e78. ⟨10.24072/pcjournal.308/⟩. ⟨hal-03748026v6⟩
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Rémi Vezy. PlantSimEngine: A Simulation Engine For The Soil-Plant-Atmosphere System. Journal of Open Source Software, 2023, 8, ⟨10.21105/joss.05371⟩. ⟨hal-04166660⟩
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Rémi Vezy, Sebastian Munz, Noémie Gaudio, Marie Launay, Patrice Lecharpentier, et al.. Modeling soil-plant functioning of intercrops using comprehensive and generic formalisms implemented in the STICS model. Agronomy for Sustainable Development, 2023, 43 (5), pp.61. ⟨10.1007/s13593-023-00917-5⟩. ⟨hal-04189857⟩
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2022

Article dans une revue

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Abel Louis Masson, Yves Caraglio, Eric-André Nicolini, Philippe Borianne, Jean-François Barczi. Modelling the functional dependency between root and shoot compartments to predict the impact of the environment on the architecture of the whole plant. Methodology for model fitting on simulated data using Deep Learning techniques. in silico Plants, 2022, 4 (1), ⟨10.1093/insilicoplants/diab036⟩. ⟨hal-03456803⟩
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Raphael P. A. Perez, Rémi Vezy, Loïc Brancheriau, Frédéric Boudon, François Grand, et al.. When architectural plasticity fails to counter the light competition imposed by planting design: an in silico approach using a functional–structural model of oil palm. in silico Plants, 2022, 4 (1), ⟨10.1093/insilicoplants/diac009⟩. ⟨hal-03736274⟩
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Haoyu Wang, Jing Hua, Mengzhen Kang, Xiujuan Wang, Xing-Rong Fan, et al.. Stronger wind, smaller tree: Testing tree growth plasticity through a modeling approach. Frontiers in Plant Science, 2022, 13, ⟨10.3389/fpls.2022.971690⟩. ⟨hal-03888028⟩
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2021

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Beda Innocent Adji, Doffou Sélastique Akaffou, Kouadio Henri Kouassi, Yao Patrice Houphouet, Philippe de Reffye, et al.. Allometric models for non-destructive estimation of dry biomass and leaf area in Khaya senegalensis (Desr.) A. Juss (Meliaceae), Pterocarpus erinaceus Pear. (Fabaceae) and Parkia biglobosa, Jack, R. Br. (Fabaceae). Trees - Structure and Function, 2021, 35, pp.1905-1920. ⟨10.1007/s00468-021-02159-y⟩. ⟨hal-03272359⟩
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Roberta Dainese, Alessandro Tarantino. Measurement of plant xylem water pressure using the high-capacity tensiometer and implications for the modelling of soil–atmosphere interaction. Geotechnique, 2021, 71 (5), pp.441-454. ⟨10.1680/jgeot.19.P.153⟩. ⟨hal-03222923⟩
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Philippe de Reffye, Baogang Hu, Mengzhen Kang, Véronique Letort, Marc Jaeger. Two decades of research with the GreenLab model in Agronomy. Annals of Botany, 2021, 127 (3), pp.281-295. ⟨10.1093/aob/mcaa172⟩. ⟨hal-02950606⟩
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Mengzhen Kang, Xiujuan Wang, Rui Qi, Zhi-Qi Jia, Philippe de Reffye, et al.. Analyzing and optimizing yield formation of tomato introgression lines using plant model. Euphytica, 2021, 217 (6), pp.100. ⟨10.1007/s10681-021-02834-8⟩. ⟨hal-03708831⟩
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Grégoire Leclerc, Pierre Bommel, Natacha Motisi, Rémi Vezy, Edwin Treminio, et al.. Coffee leaf rust (Hemeleia vastatrix) risk management in Central America: contribution of remote interactive simulations. Agronomie, Environnement & Sociétés, 2021, 11 (2), ⟨10.54800/roc535⟩. ⟨hal-03531784⟩
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Soualihou Soualiou, Zhiwei Wang, Weiwei Sun, Philippe de Reffye, Brian Collins, et al.. Functional–structural plant models mission in advancing crop science: opportunities and prospects. Frontiers in Plant Science, 2021, 12, pp.1-12. ⟨10.3389/fpls.2021.747142⟩. ⟨hal-03744298⟩
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2020

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Véronique Letort, Sylvie Sabatier, Michelle Pamelas Okoma, Marc Jaeger, Philippe de Reffye. Internal trophic pressure, a regulator of plant development? Insights from a stochastic functional–structural plant growth model applied to Coffea trees. Annals of Botany, 2020, 126 (4), pp.687-699. ⟨10.1093/aob/mcaa023⟩. ⟨hal-02945618⟩
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Virginie Moreaux, Simon Martel, Alexandre Bosc, Delphine Picart, David Achat, et al.. Energy, water and carbon exchanges in managed forest ecosystems: description, sensitivity analysis and evaluation of the INRAE GO+ model, version 3.0. Geoscientific Model Development Discussions, 2020, 13 (12), pp.5973-6009. ⟨10.5194/gmd-13-5973-2020⟩. ⟨hal-03051411⟩
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Rémi Vezy, Guerric Le Maire, Mathias Christina, Selena Georgiou, Pablo Imbach, et al.. DynACof: A process-based model to study growth, yield and ecosystem services of coffee agroforestry systems. Environmental Modelling and Software, 2020, 124, pp.104609. ⟨10.1016/j.envsoft.2019.104609⟩. ⟨hal-02488996⟩
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