Publications HAL de la structure 1061087

2021

Journal articles

titre
Loss of SET1/COMPASS methyltransferase activity reduces lifespan and fertility in Caenorhabditis elegans
auteur
Matthieu Caron, Loïc Gely, Steven Garvis, Annie Adrait, Yohann Couté, Francesca Palladino, Paola Fabrizio
article
Life Science Alliance, 2021, 5 (3), pp.e202101140. ⟨10.26508/lsa.202101140⟩
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https://hal.science/hal-03751327/file/e202101140.full.pdf BibTex
titre
Constrained G4 structures unveil topology specificity of known and new G4 binding proteins
auteur
A. Pipier, A. Devaux, T. Lavergne, A. Adrait, Y. Couté, S. Britton, P. Calsou, J. Riou, E. Defrancq, D. Gomez
article
Scientific Reports, 2021, 11 (1), ⟨10.1038/s41598-021-92806-8⟩
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https://hal.science/hal-03369749/file/41598_2021_Article_92806.pdf BibTex
titre
A new ultradian rhythm in mammalian cell dry mass observed by holography
auteur
Lamya Ghenim, Cédric Allier, Patricia Obeid, Lionel Hervé, Jean-Yves Fortin, Maxim Balakirev, Xavier Gidrol
article
Scientific Reports, 2021, 11 (1), ⟨10.1038/s41598-020-79661-9⟩
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https://hal.science/hal-03450438/file/s41598-020-79661-9%20%287%29_SR_Ultradianrhythm_2021%20%281%29.pdf BibTex
titre
Vitamin D deficiency during late pregnancy mediates placenta-associated complications
auteur
Tiphaine Raia-Barjat, Camille Sarkis, Florence Rancon, Lise Thibaudin, Jean-Christophe Gris, Nadia Alfaidy, Céline Chauleur
article
Scientific Reports, 2021, 11 (1), pp.20708. ⟨10.1038/s41598-021-00250-5⟩
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https://hal.science/hal-03504054/file/s41598-021-00250-5.pdf BibTex
titre
Significance of the placental barrier in antenatal viral infections
auteur
Hannah E.J. Yong, Shiao-Yng Chan, Amlan Chakraborty, Gayathri Rajaraman, Sharon Ricardo, Mohamed Benharouga, Nadia Alfaidy, Frantisek Staud, Padma Murthi
article
Biochimica et Biophysica Acta - Molecular Basis of Disease, 2021, 1867 (12), pp.166244. ⟨10.1016/j.bbadis.2021.166244⟩
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titre
ProMetIS, deep phenotyping of mouse models by combined proteomics and metabolomics analysis
auteur
Alyssa Imbert, Magali Rompais, Mohammed Selloum, Florence Castelli, Emmanuelle Mouton-Barbosa, Marion Brandolini-Bunlon, Emeline Chu-Van, Charlotte Joly, Aurélie Hirschler, Pierrick Roger-Mele, Thomas Burger, Sophie Leblanc, Tania Sorg, Sadia Ouzia, Yves Vandenbrouck, Claudine Médigue, Christophe Junot, Myriam Ferro, Estel Pujos-Guillot, Anne Gonzalez de Peredo, François Fenaille, Christine Carapito, Yann Herault, Etienne A. Thévenot
article
Scientific Data , 2021, 8 (1), pp.311. ⟨10.1038/s41597-021-01095-3⟩
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https://hal.science/pasteur-03453736/file/ProMetIS-NatCom-proof_Author.pdf BibTex
titre
Multiomics Study of Bacterial Growth Arrest in a Synthetic Biology Application
auteur
Delphine Ropers, Yohann Couté, Laëtitia Faure, Sabrina Ferré, Delphine Labourdette, Arieta Shabani, Lidwine Trouilh, Perrine Vasseur, Gwénaëlle Corre, Myriam Ferro, Marie-Ange Teste, Johannes Geiselmann, Hidde de Jong
article
ACS Synthetic Biology, 2021, 10 (11), pp.2910-2926. ⟨10.1021/acssynbio.1c00115⟩
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titre
Profiling of ob/ob mice skeletal muscle exosome-like vesicles demonstrates combined action of miRNAs, proteins and lipids to modulate lipid homeostasis in recipient cells
auteur
Audrey Jalabert, Laura Reininger, Emmanuelle Berger, Yohann Coute, Emmanuelle Meugnier, Alexis Forterre, Elizabeth Errazuriz-Cerda, Alain Geloen, Myriam Aouadi, Karim Bouzakri, Jennifer Rieusset, Sophie Rome
article
Scientific Reports, 2021, 11 (1), ⟨10.1038/s41598-021-00983-3⟩
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https://hal.science/hal-03420029/file/islandora_125717.pdf BibTex
titre
Transcriptomic Characterization of Postmolar Gestational Choriocarcinoma
auteur
Constance Collet, Jonathan Lopez, Christophe Battail, Fabienne Allias, Mojgan Devouassoux-Shisheboran, Sophie Patrier, Nicolas Lemaitre, Touria Hajri, Jérôme Massardier, Benoit You, François Mallet, François Golfier, Nadia Alfaidy, Pierre-Adrien Bolze
article
Biomedicines, 2021, 9 (10), pp.1474. ⟨10.3390/biomedicines9101474⟩
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titre
VE-Cadherin cleavage in sleep apnoea: new insights into intermittent hypoxia-related endothelial permeability
auteur
Olfa Harki, Renaud Tamisier, Jean-Louis Pépin, Sébastien Bailly, Anissa Mahmani, Brigitte Gonthier, Aude Salomon, Isabelle Vilgrain, Gilles Faury, Anne Briançon-Marjollet
article
European Respiratory Journal, 2021, 58 ((4)), pp.2004518. ⟨10.1183/13993003.04518-2020⟩
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titre
Transcriptomic Characterization of Postmolar Gestational Choriocarcinoma
auteur
Constance Collet, Jonathan Lopez, Christophe Battail, Fabienne Allias, Mojgan Devouassoux-Shisheboran, Sophie Patrier, Nicolas Lemaitre, Touria Hajri, Jérôme Massardier, Benoit You, François Mallet, François Golfier, Nadia Alfaidy, Pierre-Adrien Bolze
article
Biomedicines, 2021, 9 (10), pp.1474. ⟨10.3390/biomedicines9101474⟩
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titre
Mass Spectrometry-Based Proteomics Reveal Alcohol Dehydrogenase 1B as a Blood Biomarker Candidate to Monitor Acetaminophen-Induced Liver Injury
auteur
Floriane Pailleux, Pauline Maes, Michel Jaquinod, Justine Barthelon, Marion Darnaud, Claire Lacoste, Yves Vandenbrouck, Benoît Gilquin, Mathilde Louwagie, Anne-Marie Hesse, Alexandra Kraut, Jérôme Garin, Vincent Leroy, Jean-Pierre Zarski, Christophe Bruley, Yohann Couté, Didier Samuel, Philippe Ichai, Jamila Faivre, Virginie Brun
article
International Journal of Molecular Sciences, 2021, 22 (20), pp.11071. ⟨10.3390/ijms222011071⟩
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titre
Developing Rhodobacter sphaeroides for cathodic biopolymer production
auteur
Ferdinand Schmid, Julia Novion Ducassou, Yohann Couté, Johannes Gescher
article
Bioresource Technology, 2021, 336 (1), pp.125340. ⟨10.1016/j.biortech.2021.125340⟩
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titre
Sketched Stochastic Dictionary Learning for large‐scale data and application to high‐throughput mass spectrometry
auteur
Olga Permiakova, Thomas Burger
article
Statistical Analysis and Data Mining: The ASA Data Science Journal, 2021, ⟨10.1002/sam.11542⟩
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https://hal.science/hal-03324568/file/Sketched_Stochastic_Dictionary_Learning-preprintVersion.pdf BibTex
titre
Isoconazole and Clemizole Hydrochloride Partially Reverse the Xeroderma Pigmentosum C Phenotype
auteur
Farah Kobaisi, Eric Sulpice, Caroline Barette, Nour Fayyad, Marie-Odile Fauvarque, Bassam Badran, Mohammad Fayyad-Kazan, Hussein Fayyad-Kazan, Xavier Gidrol, Walid Rachidi
article
International Journal of Molecular Sciences, 2021, 22 (15), pp.8156. ⟨10.3390/ijms22158156⟩
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titre
Expanding the occurrence of polysaccharides to the viral world: the case of Mimivirus
auteur
Anna Notaro, Yohann Couté, Lucid Belmudes, Maria Elena Laugieri, Annalisa Salis, Gianluca Damonte, Antonio Molinaro, Michela Tonetti, Chantal Abergel, Cristina de Castro
article
Angewandte Chemie International Edition, 2021, 60 (36), pp.19897-19904. ⟨10.1002/anie.202106671⟩
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https://amu.hal.science/hal-03294946/file/anie.202106671.pdf BibTex
titre
BMP9 and BMP10 : Two close vascular quiescence partners that stand out
auteur
Agnès Desroches‐castan, Emmanuelle Tillet, Claire Bouvard, Sabine Bailly
article
Developmental Dynamics, 2021, ⟨10.1002/dvdy.395⟩
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https://hal.science/hal-03291998/file/Desroches-Castan%20et%20al.revised%20form.pdf BibTex
titre
Proteo3Dnet: a web server for the integration of structural information with interactomics data
auteur
Guillaume Postic, Jessica Andreani, Julien Marcoux, Victor Reys, Raphaël Guerois, Julien Rey, Emmanuelle Mouton-Barbosa, Yves Vandenbrouck, Sarah Cianferani, Odile Burlet-Schiltz, Gilles Labesse, Pierre Tufféry
article
Nucleic Acids Research, 2021, 49 (W1), pp.W567-W572. ⟨10.1093/nar/gkab332⟩
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https://hal.science/hal-03374264/file/Postic%20et%20al%20NAR%202021.pdf BibTex
titre
The bacterial toxin ExoU requires a host trafficking chaperone for transportation and to induce necrosis
auteur
Vincent Deruelle, Stéphanie Bouillot, Viviana Job, Emmanuel Taillebourg, Marie-Odile Fauvarque, Ina Attrée, Philippe Huber
article
Nature Communications, 2021, 12 (1), ⟨10.1038/s41467-021-24337-9⟩
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https://hal.science/hal-03280070/file/Deruelle_et_al-2021-Nature_Communications.pdf BibTex
titre
Different cardiovascular and pulmonary phenotypes for single- and double-knock-out mice deficient in BMP9 and BMP10
auteur
Claire Bouvard, Ly Tu, Martina Rossi, Agnès Desroches-Castan, Nihel Berrebeh, Elise Helfer, Caroline Roelants, Hequn Liu, Marie Ouarne, Nicolas Chaumontel, Christine Mallet, Christophe Battail, Andreas Bikfalvi, Marc Humbert, Laurent Savale, Thomas Daubon, Pascale Perret, Emmanuelle Tillet, Christophe Guignabert, Sabine Bailly
article
Cardiovascular Research, 2021, 118 (7), pp.1805-1820. ⟨10.1093/cvr/cvab187⟩
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https://hal.science/hal-03264032/file/Bouvard%20C%20et%20al_Cardiovasc%20Res%202021%20%28BMP9%2610%29.pdf BibTex
titre
Different cardiovascular and pulmonary phenotypes for single- and double-knock-out mice deficient in BMP9 and BMP10
auteur
Claire Bouvard, Ly Tu, Martina Rossi, Agnès Desroches-Castan, Nihel Berrebeh, Elise Helfer, Caroline Roelants, Hequn Liu, Marie Ouarné, Nicolas Chaumontel, Christine Mallet, Christophe Battail, Andreas Bikfalvi, Marc Humbert, Laurent Savale, Thomas Daubon, Pascale Perret, Emmanuelle Tillet, Christophe Guignabert, Sabine Bailly
article
Cardiovascular Research, 2021, pp.cvab187. ⟨10.1093/cvr/cvab187⟩
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titre
3D-printed scaffold combined to 2D osteoinductive coatings to repair a critical-size mandibular bone defect
auteur
M. Bouyer, C. Garot, P. Machillot, J. Vollaire, V. Fitzpatrick, S. Morand, J. Boutonnat, V. Josserand, G. Bettega, C. Picart
article
Materials Today Bio, 2021, 11, pp.100113. ⟨10.1016/j.mtbio.2021.100113⟩
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https://hal.science/hal-03247374/file/bouyer.pdf BibTex
titre
Production of acetoin from renewable resources under heterotrophic and mixotrophic conditions
auteur
Daniel Härrer, Carina Windhorst, Nicola Böhner, Julia Novion Ducassou, Yohann Couté, Johannes Gescher
article
Bioresource Technology, 2021, 329 (17), pp.124866. ⟨10.1111/pce.14013⟩
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titre
Production of acetoin from renewable resources under heterotrophic and mixotrophic conditions
auteur
Daniel Härrer, Carina Windhorst, Nicola Böhner, Julia Novion Ducassou, Yohann Couté, Johannes Gescher
article
Bioresource Technology, 2021, 329, pp.124866. ⟨10.1016/j.biortech.2021.124866⟩
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titre
NLRP7 Promotes Choriocarcinoma Growth and Progression through the Establishment of an Immunosuppressive Microenvironment
auteur
Deborah Reynaud, Roland Abi Nahed, Nicolas Lemaitre, Pierre-Adrien Bolze, Wael Traboulsi, Frederic Sergent, Christophe Battail, Odile Filhol, Vincent Sapin, Houssine Boufettal, Pascale Hoffmann, Touria Aboussaouira, Padma Murthi, Rima Slim, Mohamed Benharouga, Nadia Alfaidy
article
Cancers, 2021, 13 (12), pp.2999. ⟨10.3390/cancers13122999⟩
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titre
LEAFY protein crystals with a honeycomb structure as a platform for selective preparation of outstanding stable bio-hybrid materials
auteur
Lucile Chiari, Philippe Carpentier, Sylvie Kieffer-Jaquinod, Alice Gogny, Julien Pérard, Stéphane Ravanel, David Cobessi, Stéphane Ménage, Renaud Dumas, Olivier Hamelin
article
Nanoscale, 2021, 13 (19), pp.8901-8908. ⟨10.1039/d1nr00268f⟩
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https://hal.science/hal-03225550/file/Chiari%20et%20al.%20Nanoscale.pdf BibTex
titre
Copper-Associated Oxidative Stress Contributes to Cellular Inflammatory Responses in Cystic Fibrosis
auteur
Amal Kouadri, Johanna Cormenier, Kevin Gemy, Laurence Macari, Peggy Charbonnier, Pierre Richaud, Isabelle Michaud-Soret, Nadia Alfaidy, Mohamed Benharouga
article
Biomedicines, 2021, 9 (4), pp.329. ⟨10.3390/biomedicines9040329⟩
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https://hal.science/hal-03215775/file/Kouadri%20biomedicines-09-00329.pdf BibTex
titre
Mixotrophic growth of the extremophile galdieria sulphuraria reveals the flexibility of its carbon assimilation metabolism
auteur
Gilles Curien, Dagmar Lyska, Erika Guglielmino, Phillip Westhoff, Janina Janetzko, Marianne Tardif, Clément Hallopeau, Sabine Brugière, Davide Dal Bo, Johan Decelle, Benoit Gallet, Denis Falconet, Michele Carone, Claire Remacle, Myriam Ferro, Andreas Weber, Giovanni Finazzi
article
New Phytologist, 2021, ⟨10.1111/nph.17359⟩
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https://hal.science/hal-03193983/file/Curien_et_al_2021_New_Phytologist_plus_Supporting_information.pdf BibTex
titre
Nanoindentation of Mesenchymal Stem Cells using Atomic Force Microscopy: Effect of Adhesive Cell-Substrate Structures
auteur
Elisa Migliorini, Elisabetta Ada Cavalcanti-Adam, Antonio Emmanuele Uva, Michele Fiorentino, Michele Gattullo, Vito Modesto Manghisi, Lorenzo Vaiani, Antonio Boccaccio
article
Nanotechnology, 2021, 32 (21), pp.215706. ⟨10.1088/1361-6528/abe748⟩
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https://hal.science/hal-03152740/file/Migliorini%2Bet%2Bal_2021_Nanotechnology_10.1088_1361-6528_abe748.pdf BibTex
titre
Phylogenetic and functional diversity of aldehyde-alcohol dehydrogenases in microalgae
auteur
Robert van Lis, Yohann Couté, Sabine Brugière, Nicolas Tourasse, Benoist Laurent, Wolfgang Nitschke, Olivier Vallon, Ariane Atteia
article
Plant Molecular Biology, 2021, 105 (4-5), pp.497-511. ⟨10.1007/s11103-020-01105-9⟩
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https://hal.science/hal-03404235/file/van%20Lis%20et%20al_PMB2021_accepted%20manuscript.pdf BibTex
titre
Evidence-Based View of Safety and Effectiveness of Prokineticin Receptors Antagonists during Pregnancy
auteur
Deborah Reynaud, Frederic Sergent, Roland Abi Nahed, Wael Traboulsi, Constance Collet, Christel Marquette, Gianfranco Balboni, Qun-Yong Zhou, Nadia Alfaidy, Sophie Brouillet, Gayathri Rajaraman, Bill Kalionis, Pascale Hoffmann, Tiphaine Barjat, Mohamed Benharouga, Padma Murthi
article
Biomedicines, 2021, 9 (3), pp.309. ⟨10.3390/biomedicines9030309⟩
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https://hal.science/hal-03220172/file/biomedicines-09-00309-v2.pdf BibTex
titre
The quiescent endothelium: signalling pathways regulating organ-specific endothelial normalcy
auteur
Nicolas Ricard, Sabine Bailly, Christophe Guignabert, Michael Simons
article
Nature Reviews Cardiology, 2021, 18, pp.565-580. ⟨10.1038/s41569-021-00517-4⟩
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https://inserm.hal.science/inserm-03153011/file/%3D%3DNat%20Rev%20Cardio.pdf BibTex
titre
CHICKN: extraction of peptide chromatographic elution profiles from large scale mass spectrometry data by means of Wasserstein compressive hierarchical cluster analysis
auteur
Olga Permiakova, Romain Guibert, Alexandra Kraut, Thomas Fortin, Anne-Marie Hesse, Thomas Burger
article
BMC Bioinformatics, 2021, 22 (1), ⟨10.1186/s12859-021-03969-0⟩
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https://hal.science/hal-03145601/file/CHICKN-preprint.pdf BibTex
titre
Well Plate Maker: A user-friendly randomized block design application to limit batch effects in largescale biomedical studies
auteur
Hélène Borges, Anne-Marie Hesse, Alexandra Kraut, Yohann Couté, Virginie Brun, Thomas Burger
article
Bioinformatics, 2021, ⟨10.1093/bioinformatics/btab065⟩
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https://hal.science/hal-03135100/file/WPM_final_no_template.pdf BibTex
titre
Coarse-grained elastic network modelling: A fast and stable numerical tool to characterize mesenchymal stem cells subjected to AFM nanoindentation measurements
auteur
L. Vaiani, E. Migliorini, E.A. A Cavalcanti-Adam, A.E. E Uva, M. Fiorentino, M. Gattullo, V.M. M Manghisi, A. Boccaccio
article
Materials Science and Engineering: C, 2021, 121, pp.111860. ⟨10.1016/j.msec.2020.111860⟩
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https://hal.science/hal-03149866/file/Viviani%20et%20al_MSEC.pdf BibTex
titre
PepS: An Innovative Microfluidic Device for Bedside Whole Blood Processing before Plasma Proteomics Analyses
auteur
Benoit Gilquin, Myriam Cubizolles, Remco den Dulk, Frédéric Revol-Cavalier, Manuel Alessio, Charles-Elie Goujon, Camille Echampard, Gorka Arrizabalaga, Annie Adrait, Mathilde Louwagie, Patricia Laurent, Fabrice Navarro, Yohann Couté, Marie-Line Cosnier, Virginie Brun
article
Analytical Chemistry, 2021, 93 (2), pp.683-690. ⟨10.1021/acs.analchem.0c02270⟩
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titre
Additive Manufacturing of Material Scaffolds for Bone Regeneration: Toward Application in the Clinics
auteur
Charlotte Garot, Georges Bettega, Catherine Picart
article
Advanced Functional Materials, 2021, 31 (5), pp.2006967. ⟨10.1002/adfm.202006967⟩
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titre
Microglia modulate gliotransmission through the regulation of VAMP2 proteins in astrocytes
auteur
Fuyuko Takata‐tsuji, Naura Chounlamountri, Le‐duy Do, Camille Philippot, Julia Novion Ducassou, Yohann Couté, Sarrah Ben Achour, Jérôme Honnorat, Christophe Place, Olivier Pascual
article
Glia, 2021, 69 (1), pp.61-72. ⟨10.1002/glia.23884⟩
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titre
CYCLON and NPM1 Cooperate within an Oncogenic Network Predictive of R-CHOP Response in DLBCL
auteur
Antonin Bouroumeau, Lucile Bussot, Sieme Hamaidia, Andrea Garcia-Sandoval, Anna Bergan-Dahl, Patricia Betton-Fraisse, Samuel Duley, Cyril Fournier, Romain Aucagne, Annie Adrait, Yohann Couté, Anne Mcleer, Edwige Col, Laurence David-Boudet, Tatiana Raskovalova, Marie-Christine Jacob, Claire Vettier, Simon Chevalier, Sylvain Carras, Christine Lefebvre, Caroline Algrin, Rémy Gressin, Mary B. Callanan, Hervé Sartelet, Thierry Bonnefoix, Anouk Emadali
article
Cancers, 2021, 13 (23), pp.5900. ⟨10.3390/cancers13235900⟩
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titre
The Complex Regulatory Role of Cytomegalovirus Nuclear Egress Protein pUL50 in the Production of Infectious Virus
auteur
Sigrun Häge, Nicole Büscher, Victoria Pakulska, Friedrich Hahn, Annie Adrait, Steffi Krauter, Eva Maria Borst, Ursula Schlötzer-Schrehardt, Yohann Couté, Bodo Plachter, Manfred Marschall
article
Cells, 2021, 10 (11), pp.3119. ⟨10.3390/cells10113119⟩
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titre
Structural and functional analysis of the Francisella lysine decarboxylase as a key actor in oxidative stress resistance
auteur
Jan Felix, Claire Siebert, Juila Novion Ducassou, Jérôme Nigou, Pierre Simon Garcia, Angélique Fraudeau, Karine Huard, Caroline Mas, Celine Brochier-Armanet, Yohann Couté, Irina Gutsche, Patricia Renesto
article
Scientific Reports, 2021, 11 (1), pp.972. ⟨10.1038/s41598-020-79611-5⟩
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https://hal.science/hal-03118173/file/Felix%20et%20al.%20Nature.pdf BibTex
titre
Mass Spectrometry-Based Proteomics Reveal Alcohol Dehydrogenase 1B as a Blood Biomarker Candidate to Monitor Acetaminophen-Induced Liver Injury
auteur
Floriane Pailleux, Pauline Maes, Michel Jaquinod, Justine Barthelon, Marion Darnaud, Claire Lacoste, Yves Vandenbrouck, Benoit Gilquin, Mathilde Louwagie, Anne-Marie Hesse, Alexandra Kraut, Jérôme Garin, Vincent Leroy, Jean-Pierre Zarski, Christophe Bruley, Yohann Couté, Didier Samuel, Philippe Ichai, Jamila Faivre, Virginie Brun
article
International Journal of Molecular Sciences, 2021, 22 (20), pp.11071. ⟨10.3390/ijms222011071⟩
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BibTex
titre
An Innovative Standard for LC-MS-based HCP-profiling and Accurate Quantity Assessment: Application to Batch Consistency in Viral Vaccine Samples
auteur
Mathieu Trauchessec, Anne Marie Hesse, Alexandra Kraut, Yves Berard, Laura Herment, Tanguy Fortin, Christophe Bruley, Myriam Ferro, Catherine Manin
article
Proteomics, 2021, pp.e2000152. ⟨10.1002/pmic.202000152⟩
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BibTex
titre
Control of SRC Molecular Dynamics Encodes Distinct Cytoskeletal Responses by Specifying Signaling Pathway Usage
auteur
Adèle Kerjouan, Cyril Boyault, Christiane Oddou, Edwige Hiriart-Bryant, Alexei Grichine, Alexandra Kraut, Mylène Pezet, Martial Balland, Eva Faurobert, Isabelle Bonnet, Yohann Couté, Bertrand Fourcade, Corinne Albiges-Rizo, Olivier Destaing
article
Journal of Cell Science, 2021, 134 (2), ⟨10.1242/jcs.254599⟩
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BibTex
titre
P.171: Long-term Study of Vascularized Pancreas-on-chip
auteur
Fabrice Navarro, Marie Line Cosnier, Remco Den Dulk, Camille Laporte, Estelle André, Amandine Pitaval, Emily Tubbs, Sandrine Lablanche, Pierre Yves Benhamou, Yves Fouillet, Xavier Gidrol
article
Transplantation, 2021, 105 (12S1), pp.S72-S73. ⟨10.1097/01.tp.0000804728.22916.26⟩
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BibTex
titre
A plant-like mechanism coupling m6A reading to polyadenylation safeguards transcriptome integrity and developmental gene partitioning in Toxoplasma
auteur
Dayana C Farhat, Matthew W Bowler, Guillaume Communie, Dominique Pontier, Lucid Belmudes, Caroline Mas, Charlotte Corrao, Yohann Couté, Alexandre Bougdour, Thierry Lagrange, Mohamed-Ali Hakimi, Christopher Swale
article
eLife, 2021, 10, pp.e68312. ⟨10.7554/elife.68312⟩
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https://univ-perp.hal.science/hal-03313548/file/elife-68312-v2.pdf BibTex
titre
High-throughput measurements of bone morphogenetic protein/bone morphogenetic protein receptor interactions using biolayer interferometry
auteur
Valia Khodr, Paul Machillot, Elisa Migliorini, Jean-Baptiste Reiser, Catherine Picart
article
Biointerphases, 2021, 16, pp.031001. ⟨10.1116/6.0000926⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-03266642/file/Khodr%20et%20al.%20Biointerphases%202021.pdf BibTex
titre
Plastidial and cytosolic thiol reductases participate in the control of stomatal functioning
auteur
Jean‐luc Montillet, Damien Rondet, Sabine Brugière, Patricia Henri, Dominique Rumeau, Jean‐philippe Reichheld, Yohann Couté, Nathalie Leonhardt, Pascal Rey
article
Plant, Cell and Environment, 2021, 44 (5), pp.1417-1435. ⟨10.1111/pce.14013⟩
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https://hal.science/hal-03186495/file/Montillet%20et%20al%20PCE%2009-12-20-1.pdf BibTex
titre
Cooperative Blockade of CK2 and ATM Kinases Drives Apoptosis in VHL-Deficient Renal Carcinoma Cells through ROS Overproduction
auteur
Sofia Giacosa, Catherine Pillet, Irinka Séraudie, Laurent Guyon, Yann Wallez, Caroline Roelants, Christophe Battail, Bertrand Evrard, Frédéric Chalmel, Caroline Barette, Emmanuelle Soleilhac, Marie-Odile Fauvarque, Quentin Franquet, Gaëlle Fiard, Jean-Alexandre Long, Jean-Luc Descotes, Claude Cochet, Odile Filhol, Clément Sarrazin
article
Cancers, 2021, 13 (3), pp.576. ⟨10.3390/cancers13030576⟩
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https://hal.science/hal-03134709/file/cancers-13-00576-v2.pdf BibTex
titre
Advances and Utility of the Human Plasma Proteome
auteur
Eric W. Deutsch, Gilbert S. Omenn, Zhi Sun, Michal Maes, Maria Pernemalm, Krishnan K. Palaniappan, Natasha Letunica, Yves Vandenbrouck, Virginie Brun, Sheng-Ce Tao, Xiaobo Yu, Philipp E. Geyer, Vera Ignjatovic, Robert L. Moritz, Jochen M. Schwenk
article
Journal of Proteome Research, 2021, ⟨10.1021/acs.jproteome.1c00657⟩
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titre
CRMP4-mediated Fornix Development Involves Semaphorin-3E Signaling Pathway
auteur
Benoit Boulan, Charlotte Ravanello, Amandine Peyrel, Christophe Bosc, Christian Delphin, Florence Appaix, Eric Denarier, Alexandra Kraut, Muriel Jaquier-Sarlin, Alyson Fournier, Annie Andrieux, Sylvie Gory-Fauré, Jean-Christophe Deloulme
article
eLife, 2021, 10, pp.e70361. ⟨10.7554/eLife.70361⟩
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titre
Small Mass but Strong Information: Diagnostic Ions Provide Crucial Clues to Correctly Identify Histone Lysine Modifications
auteur
Alaa Hseiky, Marion Crespo, Sylvie Kieffer-Jaquinod, François Fenaille, Delphine Pflieger
article
Proteomes, 2021, 9 (2), ⟨10.3390/proteomes9020018⟩
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https://hal.science/hal-03389071/file/Proteomes-AlaaHseiky_2021.pdf BibTex
titre
Requirements and Attributes of Nano-Resonator Mass Spectrometry for the Analysis of Intact Viral Particles
auteur
Kavya Clément, Adrien Reynaud, Martial Defoort, Bogdan Vysotskyi, Thomas Fortin, Szu-Hsueh Lai, Vaitson Çumaku, Sergio Dominguez-Medina, Sébastien Hentz, Christophe D. Masselon
article
Analytical and Bioanalytical Chemistry, 2021, ⟨10.1007/s00216-021-03511-4⟩
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Conference papers

titre
Surface chemistry-mediated metal nanoclusters for in vivo shortwave infrared imaging
auteur
Xavier Le Guével, Benjamin Musnier, Karl Wegner, Maxime Henry, Agnes Desroches-Castan, Ute Resch-Genger, Sabine Bailly, Yves Usson, Véronique Josserand, Jean-Luc Coll
article
Colloidal Nanoparticles for Biomedical Applications XVI, Mar 2021, Online Only, France. pp.14, ⟨10.1117/12.2577451⟩
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https://hal.science/hal-03373560/file/SPIE-2021-xavier%20le%20guevel.pdf BibTex

Book sections

titre
GO enrichment analysis for differential proteomics using ProteoRE
auteur
Florence Combes, Valentin Loux, Yves Vandenbrouck
article
Proteomics Data Analysis, 2361, pp.179-196, 2021, Methods in Molecular Biology book series (MIMB), ⟨10.1007/978-1-0716-1641-3_11⟩
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Theses

titre
Méthodes statistiques pour le traitement des données de protéomique quantitative longitudinale
auteur
Hélène Borges
article
Bio-informatique [q-bio.QM]. Université Grenoble Alpes [2020-..], 2021. Français. ⟨NNT : 2021GRALS024⟩
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https://theses.hal.science/tel-03586760/file/BORGES_2021_archivage.pdf BibTex
titre
Multi-level characterization of bacteriophage T5 capsids and capsid-like particles using mass spectrometry.
auteur
Kavya Clément
article
Structural Biology [q-bio.BM]. Université Grenoble Alpes [2020-..], 2021. English. ⟨NNT : 2021GRALV042⟩
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https://theses.hal.science/tel-03558944/file/CLEMENT_2021_archivage.pdf BibTex
titre
Scalable machine learning approaches for chromatographic pattern extraction in large-scale mass spectrometry data
auteur
Olga Permiakova
article
Quantitative Methods [q-bio.QM]. Université Grenoble Alpes [2020-..], 2021. English. ⟨NNT : 2021GRALS008⟩
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https://theses.hal.science/tel-03337202/file/PERMIAKOVA_2021_archivage.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
Linear correlation between active and resistive stresses informs on force generation and stress transmission in adherent cells
auteur
Hélène Delanoë-Ayari, Nicolas Bouchonville, Marie Courçon, Alice Nicolas
article
2021
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https://arxiv.org/pdf/2105.05792 BibTex
titre
A drug repurposing screen identifies altiratinib as a selective inhibitor of a key regulatory splicing kinase and a potential therapeutic for toxoplasmosis and malaria
auteur
Christopher Swale, Valeria Bellini, Matthew Bowler, Flore Nardella, Marie-Pierre Brenier-Pinchart, Dominique Cannella, Lucid Belmudes, Caroline Mas, Yohann Couté, Fabrice Laurent, Artur Scherf, Alexandre Bougdour, Mohamed-Ali Hakimi
article
2021
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BibTex
titre
A peptide-level multiple imputation strategy accounting for the different natures of missing values in proteomics data
auteur
Q. Giai Gianetto, S. Wieczorek, Y. Couté, T. Burger
article
2021
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https://pasteur.hal.science/pasteur-03243577/file/2020.05.29.122770v1.full.pdf BibTex