Publications HAL de la structure 40494

Journal articles

titre
Sensitization Potency of Sunflower Seed Protein in a Mouse Model: Identification of 2S‐Albumins More Allergenic Than SFA‐8
auteur
Jihana Achour, Marine Guinot, Blanche Guillon, Romain Kapel, Olivier Galet, Karine Adel-Patient, Stéphane Hazebrouck, Hervé Bernard
article
Molecular Nutrition and Food Research, 2021, 65 (18), ⟨10.1002/mnfr.202100369⟩
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https://hal.univ-lorraine.fr/hal-03322664/file/mnfr.202100369.pdf BibTex
titre
A Comprehensive Analysis of Immune Constituents in Blood and Bronchoalveolar Lavage Allows Identification of an Immune Signature of Severe Asthma in Children
auteur
Karine Adel-Patient, Marta Grauso, Rola Abou-Taam, Blanche Guillon, Céline Dietrich, François Machavoine, Mélanie Briard, Nicolas Garcelon, Hassan Faour, Antoine Neuraz, Christophe Delacourt, Thierry Jo Molina, Maria Leite-De-Moraes, Guillaume Lezmi
article
Frontiers in Immunology, 2021, 12 (12), pp.1071-1077. ⟨10.3389/fimmu.2021.700521⟩
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titre
Enrichment of infant formula with long-chain polyunsaturated fatty acids and risk of infection and allergy in the nationwide ELFE birth cohort
auteur
Moufidath Adjibade, Camille Davisse-Paturet, Jonathan Y Bernard, Karine Adel-Patient, Amandine Divaret-Chauveau, Sandrine Lioret, Marie-Aline Charles, Blandine de Lauzon-Guillain
article
Allergy, 2021, 77 (5), pp.1522-1533. ⟨10.1111/all.15137⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03693984/file/Manuscript_IF_PUFA_Unmarked2.pdf BibTex
titre
Lysine-specific acetylated proteome from the archaeon Thermococcus gammatolerans reveals the presence of acetylated histones
auteur
Béatrice Alpha-Bazin, Aurore Gorlas, Arnaud Lagorce, Damien Joulié, Jean-Baptiste Boyer, Murielle Dutertre, Jean-Charles Gaillard, Anne Lopes, Yvan Zivanovic, Alain Dedieu, Fabrice Confalonieri, J. Armengaud
article
Journal of Proteomics, 2021, pp.104044. ⟨10.1016/j.jprot.2020.104044⟩
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https://hal.science/hal-03010126/file/Alpha-2021-JProteo-Lysine-MANUSCRIT.pdf BibTex
titre
Unleashing immuno-mass spectrometry superpowers to detect SARS-CoV-2
auteur
Jean Armengaud
article
EBioMedicine, 2021, 69, pp.103480. ⟨10.1016/j.ebiom.2021.103480⟩
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https://hal.science/hal-04460562/file/Armengaud%20J%202021_eBiomedicine_immunoMS%20SARS-CoV-2.pdf BibTex
titre
Pharmacokinetic neuroimaging to study the dose-related brain kinetics and target engagement of buprenorphine in vivo
auteur
Sylvain Auvity, Sébastien Goutal, Fabien Caillé, Dominique Vodovar, Alain Pruvost, Catriona Wimberley, Claire Leroy, Matteo Tonietto, Michel Bottlaender, Nicolas Tournier
article
Neuropsychopharmacology, 2021, 46 (6), pp.1220-1228. ⟨10.1038/s41386-021-00976-w⟩
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https://cea.hal.science/cea-03215261/file/ACCEPTED%20ARTICLE.pdf BibTex
titre
Allergen risk assessment for specific allergy to small ruminant's milk: development of sensitive immunoassays to detect goat's and sheep's milk contaminations in dairy food matrices
auteur
Hervé Bernard, Stéphane Hazebrouck, Nicolas Gaiani, Karine Adel-Patient
article
Frontiers in Allergy, 2021, 2 (733875), ⟨10.3389/falgy.2021.733875⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03889673/file/falgy-02-733875.pdf BibTex
titre
Increased protein S-nitrosylation in mitochondria: a key mechanism of exercise-induced cardioprotection
auteur
Doria Boulghobra, Mathilde Dubois, Béatrice Alpha-Bazin, Florence Coste, Maxime Olmos, Sandrine Gayrard, Isabelle Bornard, Gregory Meyer, Jean-Charles Gaillard, Jean Armengaud, Cyril Reboul
article
Basic Research in Cardiology, 2021, 116 (1), pp.66. ⟨10.1007/s00395-021-00906-3⟩
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titre
Characterization of a highly neutralizing single monoclonal antibody to botulinum neurotoxin type A
auteur
Sébastien Brier, Christine Rasetti-Escargueil, Anne Wijkhuisen, Stéphanie Simon, Maud Marechal, Emmanuel Lemichez, Michel Popoff
article
FASEB Journal, 2021, 35 (5), ⟨10.1096/fj.202002492R⟩
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https://pasteur.hal.science/pasteur-03254500/file/20210224_PapierTA12_FASEB_Revised%20final.pdf BibTex
titre
Evaluation of erythropoietin biosimilars Epotin™, Hemax® and Jimaixin™ by electrophoretic methods used for doping control analysis and specific N-glycan analysis revealed structural differences from original epoetin alfa drug Eprex®
auteur
Perrine Capdeville, Laurent Martin, Sophie Cholet, Annelaure Damont, Michel Audran, Magnus Ericsson, François Fenaille, Alexandre Marchand
article
Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis, 2021, 194, pp.113750. ⟨10.1016/j.jpba.2020.113750⟩
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titre
Metabolomics for personalized medicine: the input of analytical chemistry from biomarker discovery to point-of-care tests
auteur
Florence Anne Castelli, Giulio Rosati, Christian Moguet, Celia Fuentes, Jose Marrugo-Ramírez, Thibaud Lefebvre, Hervé Volland, Arben Merkoçi, Stéphanie Simon, François Fenaille, Christophe Junot
article
Analytical and Bioanalytical Chemistry, 2021, 414 (2), pp.759-789. ⟨10.1007/s00216-021-03586-z⟩
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titre
Untargeted lipidomics uncovers lipid signatures that distinguish severe from moderate forms of acutely decompensated cirrhosis
auteur
Joan Clària, Anna Curto, Richard Moreau, Benoit Colsch, Cristina López-Vicario, Juan José Lozano, Ferran Aguilar, Florence Castelli, François Fenaille, Christophe Junot, Ingrid Zhang, Maria Vinaixa, Oscar Yanes, Paolo Caraceni, Jonel Trebicka, Javier Fernández, Paolo Angeli, Rajiv Jalan, Vicente Arroyo
article
Journal of Hepatology, 2021, 75 (5), pp.1116-1127. ⟨10.1016/j.jhep.2021.06.043⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-04008385/file/2021_Claria_J_Hepatol.pdf BibTex
titre
Multiplatform metabolomics for an integrative exploration of metabolic syndrome in older men
auteur
Blandine Comte, Stéphanie Monnerie, Marion Brandolini-Bunlon, Cécile Canlet, Florence Castelli, Emeline Chu-Van, Benoit Colsch, François Fenaille, Charlotte Joly, Fabien Jourdan, Natacha Lenuzza, Bernard Lyan, Jean-François Martin, Carole Migné, José Morais, Mélanie Pétéra, Nathalie Poupin, Florence Vinson, Etienne Thevenot, Christophe Junot, Pierrette Gaudreau, Estelle Pujos-Guillot
article
EBioMedicine, 2021, 69, ⟨10.1016/j.ebiom.2021.103440⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03283772/file/1-s2.0-S2352396421002334-main.pdf BibTex
titre
H2B Type 1-K Accumulates in Senescent Fibroblasts with Persistent DNA Damage along with Methylated and Phosphorylated Forms of HMGA1
auteur
Kévin Contrepois, Carl Mann, François Fenaille
article
Proteomes, 2021, 9 (2), pp.30. ⟨10.3390/proteomes9020030⟩
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titre
Subcellular Distribution of Dietary Methyl-Mercury in Gammarus fossarum and Its Impact on the Amphipod Proteome
auteur
Claudia Cosio, Davide Degli-Esposti, Christine Almunia, Véronique Gaillet, Hervé Sartelet, Jean Armengaud, Arnaud Chaumot, Olivier Geffard, Alain Geffard
article
Environmental Science and Technology, 2021, 55 (15), pp.10514 - 10523. ⟨10.1021/acs.est.1c02385⟩
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https://hal.science/hal-03376460/file/final-Gammarus%20proteo_revised2.pdf BibTex
titre
First direct evidence of inter-partner hydride/deuteride exchanges for stored sodiated arginine/fructose-6-phosphate complex anions within salt-solvated structures
auteur
Ekaterina Darii, Yves Gimbert, Sandra Alves, Annelaure Damont, Alain Perret, Amina S Woods, François Fenaille, Jean-Claude Tabet
article
Journal of The American Society for Mass Spectrometry, 2021, 32 (6), pp.1424-1440. ⟨10.1021/jasms.1c00040⟩
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https://hal.science/hal-03242854/file/Revised%20manuscript.pdf BibTex
titre
The Adipose Microenvironment Dysregulates the Mammary Myoepithelial Cells and Could Participate to the Progression of Breast Cancer
auteur
Laetitia Delort, Juliette Cholet, Caroline Decombat, Marion Vermerie, Charles Dumontet, Florence Castelli, François Fenaille, Céline Auxenfans, Adrien Rossary, Florence Caldefie-Chezet
article
Frontiers in Cell and Developmental Biology, 2021, 8, pp.571948. ⟨10.3389/fcell.2020.571948⟩
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https://hal.science/hal-03176039/file/2021_Delort_Front_Cell_Dev_Biol%20-%20Copie.pdf BibTex
titre
Trapped ion mobility spectrometry time-of-flight mass spectrometry for high throughput and high resolution characterization of human milk oligosaccharide isomers
auteur
Aurélie Delvaux, Estelle Rathahao-Paris, Blanche Guillon, Sophie Cholet, Karine Adel-Patient, François Fenaille, Christophe Junot, Sandra Alves
article
Analytica Chimica Acta, 2021, 1180, pp.338878. ⟨10.1016/j.aca.2021.338878⟩
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https://hal.science/hal-03533998/file/S0003267021007042.pdf BibTex
titre
Detection of Borrelia burgdorferi antigens in tissues and plasma during early infection in a mouse model
auteur
Victoria Dolange, Stéphanie Simon, Nathalie Morel
article
Scientific Reports, 2021, 11, pp.17368. ⟨10.1038/s41598-021-96861-z⟩
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https://cea.hal.science/cea-04451572/file/s41598-021-96861-z.pdf BibTex
titre
Methionine Sulfoxide Reductases Contribute to Anaerobic Fermentative Metabolism in Bacillus cereus
auteur
Catherine Duport, Jean-Paul Madeira, Mahsa Farjad, Béatrice Alpha-Bazin, Jean Armengaud
article
Antioxidants , 2021, 10, ⟨10.3390/antiox10050819⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03250304/file/2021%20-%20Publi%2025%20-%20Duport%20-%20Antioxidants.pdf BibTex
titre
The Microbiome Meets Nanotechnology: Opportunities and Challenges in Developing New Diagnostic Devices
auteur
Celia Fuentes-Chust, Claudio Parolo, Giulio Rosati, Lourdes Rivas, Karla Perez-Toralla, Stéphanie Simon, Itziar de Lecuona, Christophe Junot, Jonel Trebicka, Arben Merkoçi
article
Advanced Materials, 2021, 33 (18), ⟨10.1002/adma.202006104⟩
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titre
The Microbiome Meets Nanotechnology: Opportunities and Challenges in Developing New Diagnostic Devices
auteur
Celia Fuentes‐chust, Claudio Parolo, Giulio Rosati, Lourdes Rivas, Karla Perez‐toralla, Stéphanie Simon, Itziar Lecuona, Christophe Junot, Jonel Trebicka, Arben Merkoçi
article
Advanced Materials, 2021, 33 (18), ⟨10.1002/adma.202006104⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03351431/file/AdvMat_a2021v33n18p2006104iENG.pdf BibTex
titre
Heterogeneity of SARS-CoV-2 virus produced in cell culture revealed by shotgun proteomics and supported by genome sequencing
auteur
Fabrice Gallais, Olivier Pible, Jean-Charles Gaillard, Stéphanie Debroas, Hélène Batina, Sylvie Ruat, Florian Sandron, Damien Delafoy, Zuzana Gerber, Robert Olaso, Fabienne Gas, Laurent Bellanger, Jean-François Deleuze, Lucia Grenga, Jean Armengaud
article
Analytical and Bioanalytical Chemistry, 2021, 413 (29), pp.7265-7275. ⟨10.1007/s00216-021-03401-9⟩
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https://cea.hal.science/cea-04359978/file/s00216-021-03401-9.pdf BibTex
titre
Interactions of viral proteins from pathogenic and low or non-Pathogenic orthohantaviruses with human Type I interferon signaling
auteur
Giulia Gallo, Grégory Caignard, Karine Badonnel, Guillaume Chevreux, Samuel Terrier, Agnieszka M Szemiel, Gleyder Roman-Sosa, Florian Binder, Quan Gu, Ana da Silva Filipe, Rainer G Ulrich, Alain Kohl, Damien Vitour, Noël Tordo, Myriam Ermonval
article
Viruses, 2021, 13 (1), pp.140. ⟨10.3390/v13010140⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-03131075/file/viruses-13-00140-v4.pdf BibTex
titre
Evidence for the systemic diffusion of (2-chloroethyl)-ethyl-sulfide, a sulfur mustard analog, and its deleterious effects in brain
auteur
Marie Gilardoni, Daniel Léonço, Fanny Caffin, Fanny Gros-Désormeaux, Camille Eldin, David Béal, Sadia Ouzia, Christophe Junot, François Fenaille, Christophe Piérard, Thierry Douki
article
Toxicology, 2021, 462, ⟨10.1016/j.tox.2021.152950⟩
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https://hal.science/hal-03345961/file/2020%20GILARDONI%20Toxicology%20Brain%20CEES%20for%20HAL.pdf BibTex
titre
Metabolomics of exhaled breath in critically ill COVID-19 patients: A pilot study
auteur
Stanislas Grassin-Delyle, Camille Roquencourt, Pierre Moine, Gabriel Saffroy, Stanislas Carn, Nicholas Heming, Jérôme Fleuriet, Hélène Salvator, Emmanuel Naline, Louis-Jean Couderc, Philippe Devillier, Etienne Thévenot, Djillali Annane
article
EBioMedicine, 2021, 63, pp.103154. ⟨10.1016/j.ebiom.2020.103154⟩
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https://cea.hal.science/cea-03086093/file/OpenAccess_StanislasGrassinDelyle.pdf BibTex
titre
Effect of actinorhizal root exudates on the proteomes of $Frankia\ soli$ NRRL B-16219, a strain colonizing the root tissues of its actinorhizal host via intercellular pathway
auteur
Abdellatif Gueddou, Indrani Sarker, Arnab Sen, Faten Ghodhbane-Gtari, David R Benson, Jean Armengaud, Maher Gtari
article
Research in Microbiology, 2021, 173 (1-2), pp.103900. ⟨10.1016/j.resmic.2021.103900⟩
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https://hal.science/hal-04460303/file/Gueddou%20A%202022_Res%20Microbiol_root%20exudates%20and%20Frankia%20soli%20proteomes_reprint.pdf BibTex
titre
Redox proteomic study of Bacillus cereus thiol proteome during fermentative anaerobic growth
auteur
Fella Hamitouche, Jean-Charles Gaillard, Philippe Schmitt, J. Armengaud, Catherine Duport, Luc Dedieu
article
BMC Genomics, 2021, 22 (1), pp.648. ⟨10.1186/s12864-021-07962-y⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03499925/file/2021%20-%20Publi%2043%20-%20Hamitouche%20-%20BMCGenom.pdf BibTex
titre
Cysteine Proteome Reveals Response to Endogenous Oxidative Stress in Bacillus cereus
auteur
Fella Hamitouche, J. Armengaud, Luc Dedieu, Catherine Duport
article
International Journal of Molecular Sciences, 2021, 22 (14), pp.7550. ⟨10.3390/ijms22147550⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03316028/file/2021%20-%20Publi%2034%20-%20Hamitouche%20-%20IntJMolSci.pdf BibTex
titre
Combinatorial targeting of microRNA-26b and microRNA-101 exerts a synergistic inhibition on cyclooxygenase-2 in brain metastatic triple-negative breast cancer cells
auteur
Rania Harati, Aloïse Mabondzo, Abdelaziz Tlili, Ghalia Khoder, Mona Mahfood, Rifat Hamoudi
article
Breast Cancer Research and Treatment, 2021, 187 (3), pp.695-713. ⟨10.1007/s10549-021-06255-y⟩
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https://hal.science/hal-04476286/file/Rifat%20et%20al.pdf BibTex
titre
Combinatorial targeting of microRNA-26b and microRNA-101 exerts a synergistic inhibition on cyclooxygenase-2 in brain metastatic triple-negative breast cancer cells
auteur
Rania Harati, Aloïse Mabondzo, Abdelaziz Tlili, Ghalia Khoder, Mona Mahfood, Rifat Hamoudi
article
Breast Cancer Research and Treatment, 2021, 187 (3), pp.695-713. ⟨10.1007/s10549-021-06255-y⟩
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https://hal.science/hal-04478060/file/s10549-021-06255-y%20%282%29.pdf BibTex
titre
Metaproteomics to decipher CF host-microbiota interactions: overview, challenges and future perspectives
auteur
Pauline Hardouin, Raphael Chiron, H. Marchandin, Jean Armengaud, Lucia Grenga
article
Genes, 2021, 12 (6), pp.892. ⟨10.3390/genes12060892⟩
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https://hal.science/hal-03633669/file/genes-12-00892-v2.pdf BibTex
titre
Right Ventricle Remodeling Metabolic Signature in Experimental Pulmonary Hypertension Models of Chronic Hypoxia and Monocrotaline Exposure
auteur
Thaïs Hautbergue, Fabrice Antigny, Angèle Boët, François Haddad, Bastien Masson, Mélanie Lambert, Amélie Delaporte, Jean-Baptiste Menager, Laurent Savale, Jérôme Le Pavec, Elie Fadel, Marc Humbert, Christophe Junot, François Fenaille, Benoit Colsch, Olaf Mercier
article
Cells, 2021, 10 (6), pp.1559. ⟨10.3390/cells10061559⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-04008302/file/2021_Hautbergue_Cells.pdf BibTex
titre
Small Mass but Strong Information: Diagnostic Ions Provide Crucial Clues to Correctly Identify Histone Lysine Modifications
auteur
Alaa Hseiky, Marion Crespo, Sylvie Kieffer-Jaquinod, François Fenaille, Delphine Pflieger
article
Proteomes, 2021, 9 (2), ⟨10.3390/proteomes9020018⟩
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https://hal.science/hal-03389071/file/Proteomes-AlaaHseiky_2021.pdf BibTex
titre
ProMetIS, deep phenotyping of mouse models by combined proteomics and metabolomics analysis
auteur
Alyssa Imbert, Magali Rompais, Mohammed Selloum, Florence Castelli, Emmanuelle Mouton-Barbosa, Marion Brandolini-Bunlon, Emeline Chu-Van, Charlotte Joly, Aurélie Hirschler, Pierrick Roger-Mele, Thomas Burger, Sophie Leblanc, Tania Sorg, Sadia Ouzia, Yves Vandenbrouck, Claudine Médigue, Christophe Junot, Myriam Ferro, Estel Pujos-Guillot, Anne Gonzalez de Peredo, François Fenaille, Christine Carapito, Yann Herault, Etienne A. Thévenot
article
Scientific Data , 2021, 8 (1), pp.311. ⟨10.1038/s41597-021-01095-3⟩
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https://hal.science/pasteur-03453736/file/ProMetIS-NatCom-proof_Author.pdf BibTex
titre
Increasing the power of interpretation for soil metaproteomics data
auteur
Virginie Jouffret, Guylaine Miotello, Karen Culotta, Sophie Ayrault, Olivier Pible, Jean Armengaud
article
Microbiome, 2021, 9 (1), ⟨10.1186/s40168-021-01139-1⟩
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https://hal.science/hal-03359730/file/Jouffret2021_Article_IncreasingThePowerOfInterpreta.pdf BibTex
titre
Co-expression network analysis identifies novel molecular pathways associated with cadmium and pyriproxyfen testicular toxicity in Gammarus fossarum
auteur
Natacha Koenig, Christine Almunia, Aurore Bonnal-Conduzorgues, Jean Armengaud, Arnaud Chaumot, Olivier Geffard, Davide Degli Esposti
article
Aquatic Toxicology, 2021, 235, pp.105816. ⟨10.1016/j.aquatox.2021.105816⟩
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titre
Top-Down Mass Spectrometry for Trace Level Quantification of Staphylococcal Enterotoxin A Variants
auteur
Donatien Lefebvre, François Fenaille, Déborah Merda, Kevin Blanco-Valle, Cécile Feraudet-Tarisse, Stéphanie Simon, Jacques-Antoine Hennekinne, Yacine Nia, François Becher
article
Journal of Proteome Research, 2021, 21 (2), pp.547-556. ⟨10.1021/acs.jproteome.1c00886⟩
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titre
Top-Down Mass Spectrometry for Trace Level Quantification of Staphylococcal Enterotoxin A Variants
auteur
Donatien Lefebvre, François Fenaille, Déborah Merda, Kevin Blanco-Valle, Cécile Feraudet-Tarisse, Stéphanie Simon, Jacques-Antoine Hennekinne, Yacine Nia, François Becher
article
Journal of Proteome Research, 2021, 21 (2), pp.547-556. ⟨10.1021/acs.jproteome.1c00886⟩
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titre
Quantitative Determination of Staphylococcus aureus Enterotoxins Types A to I and Variants in Dairy Food Products by Multiplex Immuno-LC-MS/MS
auteur
Donatien Lefebvre, Kevin Blanco-Valle, Cécile Feraudet-Tarisse, Déborah Merda, Stéphanie Simon, François Fenaille, Jacques-Antoine Hennekinne, Yacine Nia, François Becher
article
Journal of Agricultural and Food Chemistry, 2021, 69 (8), pp.2603-2610. ⟨10.1021/acs.jafc.0c07545⟩
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titre
Colloidal gel as an efficient process to treat CBR and prion contaminated solid surfaces
auteur
Celia Lepeytre, Fabien Frances, Marie-Sophie Charvolin, Amélie Ludwig, Esther Le Toquin, Emmanuel Comoy, Agnes Grandjean, Alban Gossard
article
Chemical Engineering Science, 2021, 246, https://doi.org/10.1016/j.ces.2021.116957. ⟨10.1016/j.ces.2021.116957⟩
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https://cea.hal.science/cea-03327940/file/BiochemGel-v20210226%20%281%29.pdf BibTex
titre
Comparative Proteomics of Ostreid Herpesvirus 1 and Pacific Oyster Interactions With Two Families Exhibiting Contrasted Susceptibility to Viral Infection
auteur
Maxime Leprêtre, Nicole Faury, Amélie Segarra, Stéphane Claverol, Lionel Degremont, Mélissa Palos-Ladeiro, Jean Armengaud, Tristan Renault, Benjamin Morga
article
Frontiers in Immunology, 2021, 11, ⟨10.3389/fimmu.2020.621994⟩
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titre
Arginine-selective modulation of the lysosomal transporter PQLC2 through a gate-tuning mechanism
auteur
Xavier Leray, Rossella Conti, Yan Li, Cécile Debacker, Florence Castelli, François Fenaille, Anselm A Zdebik, Michael Pusch, Bruno Gasnier
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2021, 118 (32), pp.e2025315118. ⟨10.1073/pnas.2025315118⟩
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https://hal.science/hal-03320088/file/PQLC2_Main_final-Ms%2BFigs.pdf BibTex
titre
Development and evaluation of an immuno-MALDI-TOF mass spectrometry approach for quantification of the abrin toxin in complex food matrices
auteur
Sandrine Livet, Sylvia Worbs, Hervé Volland, Stéphanie Simon, Martin Dorner, François Fenaille, Brigitte Dorner, François Becher
article
Toxins, 2021, 13, pp.52. ⟨10.3390/toxins13010052⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03352977/file/Liv1.pdf BibTex
titre
Detection of expanded‐spectrum cephalosporin hydrolysis by lateral flow immunoassay
auteur
Christian Moguet, Camille Gonzalez, Antoine Sallustrau, Stéphanie Gelhaye, Thierry Naas, Stéphanie Simon, Hervé Volland
article
Microbial Biotechnology, 2021, 15 (2), pp.603-612. ⟨10.1111/1751-7915.13892⟩
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BibTex
titre
Luminescent lanthanide nanoparticle-based imaging enables ultra-sensitive, quantitative and multiplexed in vitro lateral flow immunoassays
auteur
F. Mousseau, C. Féraudet Tarisse, S. Simon, T. Gacoin, A. Alexandrou, C I Bouzigues
article
Nanoscale, 2021, 13 (35), pp.14814 - 14824. ⟨10.1039/d1nr03358a⟩
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https://hal.science/hal-03878185/file/Mousseau%20et%20al.%20-%20Nanoscale%20Main%20text%20%2B%20SI%20-%20vf.pdf BibTex
titre
Metabotypes of Pseudomonas aeruginosa Correlate with Antibiotic Resistance, Virulence and Clinical Outcome in Cystic Fibrosis Chronic Infections
auteur
Oriane Moyne, Florence Castelli, Dominique J. Bicout, Julien Boccard, Boubou Camara, Benoit Cournoyer, Eric Faudry, Samuel Terrier, Dalil Hannani, Sarah Huot-Marchand, Claire Léger, Max Maurin, Tuan-Dung Ngo, Caroline Plazy, Robert Quinn, Ina Attrée, François Fenaille, Bertrand Toussaint, Audrey Le Gouëllec
article
Metabolites, 2021, 11 (2), ⟨10.3390/metabo11020063⟩
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https://hal.science/hal-03146820/file/Moyne%20et%20al.%20v2%202021.pdf BibTex
titre
Rapid Detection of VanA/B-Producing Vancomycin-Resistant Enterococci Using Lateral Flow Immunoassay
auteur
Saoussen Oueslati, Camille Gonzalez, Hervé Volland, Vincent Cattoir, Sandrine Bernabeu, Delphine Girlich, Duncan Dulac, Marc Plaisance, Laure Boutigny, Laurent Dortet, Stéphanie Simon, Thierry Naas
article
Diagnostics, 2021, 11 (10), pp.1805. ⟨10.3390/diagnostics11101805⟩
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titre
Rapid detection of vana/b-producing vancomycin-resistant enterococci using lateral flow immunoassay
auteur
S. Oueslati, C. Gonzalez, H. Volland, V. Cattoir, S. Bernabeu, D. Girlich, D. Dulac, M. Plaisance, L. Boutigny, L. Dortet, S. Simon, T. Naas
article
Diagnostics, 2021, 11 (10), pp.1805. ⟨10.3390/diagnostics11101805⟩
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https://hal.science/hal-03420643/file/diagnostics-11-01805-v2.pdf BibTex
titre
Development and validation of a lateral flow immunoassay for rapid detection of VanA-producing enterococci
auteur
Saoussen Oueslati, Hervé Volland, Vincent Cattoir, Sandrine Bernabeu, Delphine Girlich, Ducan Dulac, Marc Plaisance, Maxime Laroche, Laurent Dortet, Stéphanie Simon, Thierry Naas
article
Journal of Antimicrobial Chemotherapy, 2021, 76 (1), pp.146-151. ⟨10.1093/jac/dkaa413⟩
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titre
Pan-genome analysis identifies intersecting roles for Pseudomonas specialized metabolites in potato pathogen inhibition
auteur
Alba Pacheco-Moreno, Francesca Stefanato, Jonathan Ford, Christine Trippel, Simon Uszkoreit, Laura Ferrafiat, Lucia Grenga, Ruth Dickens, Nathan Kelly, Alexander Dh Kingdon, Liana Ambrosetti, Sergey Nepogodiev, Kim Findlay, Jitender Cheema, Martin Trick, Govind Chandra, Graham Tomalin, Jacob Malone, Andrew Truman
article
eLife, 2021, 10, ⟨10.7554/eLife.71900⟩
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titre
Metabolomics in the understanding and management of hepatic encephalopathy
auteur
Juliette Pelle, Florence A Castelli, Marika Rudler, Imen Alioua, Benoit Colsch, François Fenaille, Christophe Junot, Dominique Thabut, Nicolas Weiss
article
Analytical Biochemistry, 2021, 636, ⟨10.1016/j.ab.2021.114477⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-03981510/file/S000326972100378X.pdf BibTex
titre
In the mouse, prostaglandin D2 signalling protects the endometrium against adenomyosis
auteur
Pascal Philibert, Stéphanie Déjardin, Nelly Pirot, Alain Pruvost, Anvi Laetitia Nguyen, Florence Bernex, Francis Poulat, Brigitte Boizet-Bonhoure
article
Molecular Human Reproduction, 2021, 27 (5), ⟨10.1093/molehr/gaab029⟩
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titre
Discovery based high resolution MS/MS analysis for selection of allergen markers in chocolate and broth powder matrices
auteur
Rosa Pilolli, Christof van Poucke, Elisabetta de Angelis, Chiara Nitride, Marc de Loose, Nathalie Gillard, Anne-Catherine Huet, Olivier Tranquet, Colette Larré, Karine Adel-Patient, Hervé Bernard, E.N. Clare Mills, Linda Monaci
article
Food Chemistry, 2021, 343, pp.128533. ⟨10.1016/j.foodchem.2020.128533⟩
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titre
Delineation of cellular stages and identification of key proteins for reduction and biotransformation of Se(IV) by Stenotrophomonas bentonitica BII-R7
auteur
M. Pinel-Cabello, Virginie Chapon, M.A. Ruiz-Fresneda, B. Alpha-Bazin, C. Berthomieu, J. Armengaud, M.L. Merroun
article
Journal of Hazardous Materials, 2021, 418, pp.126150. ⟨10.1016/j.jhazmat.2021.126150⟩
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https://hal.science/hal-03337476/file/1-s2.0-S0304389421011146-main.pdf BibTex
titre
An adamantamine derivative as a drug candidate for the treatment of visceral leishmaniasis
auteur
Sébastien Pomel, Sandrine Cojean, Valérie Pons, Jean-Christophe Cintrat, Anvi Laetitia Nguyen, Joël Vacus, Alain Pruvost, Julien Barbier, Daniel Gillet, Philippe Loiseau
article
Journal of Antimicrobial Chemotherapy, 2021, 76 (10), pp.2640-2650. ⟨10.1093/jac/dkab226⟩
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titre
SLC37A4-CDG: New biochemical insights for an emerging congenital disorder of glycosylation with major coagulopathy
auteur
Alexandre Raynor, Walid Haouari, Bobby Ng, Sophie Cholet, Annie Harroche, Celia Raulet-Bussian, Samra Lounis-Ouaras, Sandrine Vuillaumier-Barrot, Tiffany Pascreau, Delphine Borgel, Hudson Freeze, François Fenaille, Arnaud Bruneel
article
Clinica Chimica Acta, 2021, 521, pp.104-106. ⟨10.1016/j.cca.2021.07.005⟩
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titre
SLC37A4-CDG: New biochemical insights for an emerging congenital disorder of glycosylation with major coagulopathy
auteur
Alexandre Raynor, Walid Haouari, Bobby Ng, Sophie Cholet, Annie Harroche, Celia Raulet-Bussian, Samra Lounis-Ouaras, Sandrine Vuillaumier-Barrot, Tiffany Pascreau, Delphine Borgel, Hudson Freeze, François Fenaille, Arnaud Bruneel
article
Clinica Chimica Acta, 2021, 521, pp.104-106. ⟨10.1016/j.cca.2021.07.005⟩
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titre
Azetidinimines as a novel series of non-covalent broad-spectrum inhibitors of β-lactamases with submicromolar activities against carbapenemases KPC-2 (class A), NDM-1 (class B) and OXA-48 (class D)
auteur
Eugénie Romero, Saoussen Oueslati, Mohamed Benchekroun, Agathe C.A. D’hollander, Sandrine Ventre, Kamsana Vijayakumar, Corinne Minard, Cynthia Exilie, Linda Tlili, Pascal Retailleau, Agustin Zavala, Eddy Elisée, Edithe Selwa, Laetitia Nguyen, Alain Pruvost, Thierry Naas, Bogdan Iorga, Robert Dodd, Kevin Cariou
article
European Journal of Medicinal Chemistry, 2021, 219, pp.113418. ⟨10.1016/j.ejmech.2021.113418⟩
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titre
Glutathione conjugates of the mercapturic acid pathway and guanine adduct as biomarkers of exposure to CEES, a sulfur mustard analog
auteur
Marie Roser, David Béal, Camille Eldin, Leslie Gudimard, Fanny Caffin, Fanny Gros-Désormeaux, Daniel Léonço, François Fenaille, Christophe Junot, Christophe Piérard, Thierry Douki
article
Analytical and Bioanalytical Chemistry, 2021, 413, pp.1337-1351. ⟨10.1007/s00216-020-03096-4⟩
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https://hal.science/hal-03103848/file/2020%20Roser%20et%20Anal%20Bioanal%20Chem%20final.pdf BibTex
titre
Stem cells of aquatic invertebrates as an advanced tool for assessing ecotoxicological impacts
auteur
Amalia Rosner, Jean Armengaud, Loriano Ballarin, Stéphanie Barnay-Verdier, Francesca Cima, Ana Varela Coelho, Isabelle Domart-Coulon, Damjana Drobne, Anne-Marie Genevière, Anita Jemec Kokalj, Ewa Kotlarska, Daniel Mark Lyons, Tali Mass, Guy Paz, Ksenia Pazdro, Lorena Perić, Andreja Ramšak, Sebastian Rakers, Baruch Rinkevich, Antonietta Spagnuolo, Michela Sugni, Sébastien Cambier
article
Science of the Total Environment, 2021, 771, pp.144565. ⟨10.1016/j.scitotenv.2020.144565⟩
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titre
Quantitative Assessment of SARS-CoV-2 Virus in Nasopharyngeal Swabs Stored in Transport Medium by a Straightforward LC-MS/MS Assay Targeting Nucleocapsid, Membrane, and Spike Proteins
auteur
Justyna Saadi, Saoussen Oueslati, Laurent Bellanger, Fabrice Gallais, Laurent Dortet, Anne-Marie Roque-Afonso, Christophe Junot, Thierry Naas, François Fenaille, François Becher
article
Journal of Proteome Research, 2021, 20 (2), pp.1434-1443. ⟨10.1021/acs.jproteome.0c00887⟩
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titre
Quantitative Assessment of SARS-CoV-2 Virus in Nasopharyngeal Swabs Stored in Transport Medium by a Straightforward LC-MS/MS Assay Targeting Nucleocapsid, Membrane, and Spike Proteins
auteur
Justyna Saadi, Saoussen Oueslati, Laurent Bellanger, Fabrice Gallais, Laurent Dortet, Anne-Marie Roque-Afonso, Christophe Junot, Thierry Naas, François Fenaille, François Becher
article
Journal of Proteome Research, 2021, 20 (2), pp.1434-1443. ⟨10.1021/acs.jproteome.0c00887⟩
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titre
Activation of Vitamin D Receptor Pathway Enhances Differentiating Capacity in Acute Myeloid Leukemia with Isocitrate Dehydrogenase Mutations
auteur
Marie Sabatier, Emeline Boet, Sonia Zaghdoudi, Nathan Guiraud, Alexis Hucteau, Nathaniel Polley, Guillaume Cognet, Estelle Saland, Laura Lauture, Thomas Farge, Ambrine Sahal, Vera Pancaldi, Emeline Chu-Van, Florence Castelli, Sarah Bertoli, Pierre Bories, Christian Récher, Héléna Boutzen, Véronique Mansat-de Mas, Lucille Stuani, Jean-Emmanuel Sarry
article
Cancers, 2021, 13 (20), pp.5243. ⟨10.3390/cancers13205243⟩
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titre
MAN1B1-CDG: Three new individuals and associated biochemical profiles
auteur
Soraya Sakhi, Sophie Cholet, Samer Wehbi, Bertrand Isidor, Benjamin Cogne, Sandrine Vuillaumier-Barrot, Thierry Dupré, Trost Detleft, Emmanuelle Schmitt, Bruno Leheup, Céline Bonnet, François Feillet, Christine Muti, François Fenaille, Arnaud Bruneel
article
Molecular Genetics and Metabolism Reports, 2021, 28, pp.100775. ⟨10.1016/j.ymgmr.2021.100775⟩
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titre
An antibody targeting type III secretion system induces broad protection against Salmonella and Shigella infections
auteur
Raphaël Sierocki, Bakhos Jneid, Maria Lucia Orsini Delgado, Marc Plaisance, Bernard Maillère, Hervé Nozach, Stéphanie Simon
article
PLoS Neglected Tropical Diseases, 2021, 15 (3), ⟨10.1371/journal.pntd.0009231⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03321777/file/2021_Sierocki_pntd.pdf BibTex
titre
An antibody targeting type III secretion system induces broad protection against Salmonella and Shigella infections
auteur
Raphaël Sierocki, Bakhos Jneid, Maria Lucia Orsini Delgado, Marc Plaisance, Bernard Maillère, Hervé Nozach, Stéphanie Simon
article
PLoS Neglected Tropical Diseases, 2021, 15 (3), pp.e0009231. ⟨10.1371/journal.pntd.0009231⟩
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titre
Recombinant myelin oligodendrocyte glycoprotein quality modifies evolution of experimental autoimmune encephalitis in macaques
auteur
Lev Stimmer, Joachim Confais, Anke'T Jong, Jennifer Veth, Claire-Maëlle Fovet, Philippe Horellou, Julie Massonneau, Audrey Perrin, Guylaine Miotello, Emilie Avazeri, Bert'T Hart, Kumaran Deiva, Roger Le Grand, Jean Armengaud, Jeffrey J Bajramovic, Hugues Contamin, Ché Serguera
article
Laboratory Investigation, 2021, 101 (11), pp.1513 - 1522. ⟨10.1038/s41374-021-00646-x⟩
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titre
Mitochondrial metabolism supports resistance to IDH mutant inhibitors in acute myeloid leukemia
auteur
Lucille Stuani, Marie Sabatier, Estelle Saland, Guillaume Cognet, Nathalie Poupin, Claudie Bosc, Florence A Castelli, Lara Gales, Evgenia Turtoi, Camille Montersino, Thomas Farge, Emeline Boet, Nicolas Broin, Clément Larrue, Natalia Baran, Madi y Cissé, Marc Conti, Sylvain Loric, Tony Kaoma, Alexis Hucteau, Aliki Zavoriti, Ambrine Sahal, Pierre-Luc Mouchel, Mathilde Gotanègre, Cédric Cassan, Laurent Fernando, Feng Wang, Mohsen Hosseini, Emeline Chu-Van, Laurent Le Cam, Martin Carroll, Mary A Selak, Norbert Vey, Rémy Castellano, François Fenaille, Andrei Turtoi, Guillaume Cazals, Pierre Bories, Yves Gibon, Brandon Nicolay, Sébastien Ronseaux, Joseph R Marszalek, Koichi Takahashi, Courtney D Dinardo, Marina Konopleva, Véra Pancaldi, Yves Collette, Floriant Bellvert, Fabien Jourdan, Laetitia K Linares, Christian Récher, Jean-Charles Portais, Jean-Emmanuel Sarry
article
Journal of Experimental Medicine, 2021, 218 (5), pp.e20200924. ⟨10.1084/jem.20200924⟩
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https://amu.hal.science/hal-03563454/file/jStuani_em_20200924.pdf BibTex
titre
Combining chemical knowledge and quantum calculation for interpreting low-energy product ion spectra of metabolite adduct ions: Sodiated diterpene diester species as a case study
auteur
Jean-Claude Tabet, Yves Gimbert, Annelaure Damont, David Touboul, François Fenaille, Amina S Woods
article
Journal of The American Society for Mass Spectrometry, 2021, 32 (10), pp.2499-2504. ⟨10.1021/jasms.1c00154⟩
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https://hal.science/hal-03328447/file/Tabet%20et%20al%20JASMS%202921.pdf BibTex
titre
The effect of acute moderate-intensity exercise on the serum and fecal metabolomes and the gut microbiota of cross-country endurance athletes
auteur
Mariangela Tabone, Carlo Bressa, Jose Angel García-Merino, Diego Moreno-Pérez, Emeline Chu Van, Florence Castelli, François Fenaille, Mar Larrosa
article
Scientific Reports, 2021, 11 (1), pp.3558. ⟨10.1038/s41598-021-82947-1⟩
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BibTex
titre
A Proteomic Study Suggests Stress Granules as New Potential Actors in Radiation-Induced Bystander Effects
auteur
Mihaela Tudor, Antoine Gilbert, Charlotte Lepleux, Mihaela Temelie, Sonia Hem, Jean Armengaud, Emilie Brotin, Siamak Haghdoost, Diana Savu, François Chevalier
article
International Journal of Molecular Sciences, 2021, 22 (15), pp.7957. ⟨10.3390/ijms22157957⟩
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https://hal.science/hal-03301338/file/2021%20Tudor%20et%20al%20IJMS.pdf BibTex
titre
The Metaproteomics Initiative: a coordinated approach for propelling the functional characterization of microbiomes
auteur
Tim van den Bossche, Magnus Ø. Arntzen, Dörte Becher, Dirk Benndorf, Vincent G H Eijsink, Céline Henry, Pratik D Jagtap, Nico Jehmlich, Catherine Juste, Benoit J Kunath, Bart Mesuere, Thilo Muth, Phillip B Pope, Jana Seifert, Alessandro Tanca, Sergio Uzzau, Paul Wilmes, Robert L Hettich, Jean Armengaud
article
Microbiome, 2021, 9 (1), pp.243. ⟨10.1186/s40168-021-01176-w⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-04127775/file/2021_Den%20Bossche_Microbiome.pdf BibTex
titre
Critical Assessment of MetaProteome Investigation (CAMPI): a multi-laboratory comparison of established workflows
auteur
Tim van den Bossche, Benoit Kunath, Kay Schallert, Stephanie Schäpe, Paul Abraham, Jean Armengaud, Magnus Ø. Arntzen, Ariane Bassignani, Dirk Benndorf, Stephan Fuchs, Richard Giannone, Timothy Griffin, Live Hagen, Rashi Halder, Céline Henry, Robert Hettich, Robert Heyer, Pratik Jagtap, Nico Jehmlich, Marlene Jensen, Catherine Juste, Manuel Kleiner, Olivier Langella, Theresa Lehmann, Emma Leith, Patrick May, Bart Mesuere, Guylaine Miotello, Samantha Peters, Olivier Pible, Pedro Queiros, Udo Reichl, Bernhard Renard, Henning Schiebenhoefer, Alexander Sczyrba, Alessandro Tanca, Kathrin Trappe, Jean-Pierre Trezzi, Sergio Uzzau, Pieter Verschaffelt, Martin von Bergen, Paul Wilmes, Maximilian Wolf, Lennart Martens, Thilo Muth
article
Nature Communications, 2021, 12 (1), pp. 7305. ⟨10.1038/s41467-021-27542-8⟩
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titre
Cyclical Patterns Affect Microbial Dynamics in the Water Basin of a Nuclear Research Reactor
auteur
Valérie van Eesbeeck, Ruben Props, Mohamed Mysara, Pauline C M Petit, Corinne Rivasseau, Jean Armengaud, Pieter Monsieurs, Jacques Mahillon, Natalie Leys
article
Frontiers in Microbiology, 2021, 12, pp.744115. ⟨10.3389/fmicb.2021.744115⟩
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https://hal.science/hal-04460344/file/Van%20Eesbeeck%20V%202021_Frontiers%20Microbiol_Cyclical%20patterns%20in%20the%20water%20basin%20of%20a%20nuclear%20research%20reactor_fmicb-12-744115.pdf BibTex
titre
Antibiotic tolerance and degradation capacity of the organic pollutant-degrading bacterium Rhodococcus biphenylivorans TG9T
auteur
Chungui Yu, Jean Armengaud, Ryan Andrew Blaustein, Kezhen Chen, Zhe Ye, Fengjun Xu, Jean-Charles Gaillard, Zhihui Qin, Yulong Fu, Erica Marie Hartmann, Chaofeng Shen
article
Journal of Hazardous Materials, 2021, 424, pp.127712. ⟨10.1016/j.jhazmat.2021.127712⟩
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https://hal.science/hal-04460321/file/Yu%20C%202021_Journal%20of%20Hazardous%20Materials_Rhodococcus%20biphenylivorans%20TG9.pdf BibTex

Conference papers

titre
Dynamique du microbiome d'un organisme sentinelle aquatique en réponse à la contamination chimique
auteur
Jean Armengaud, Arnaud Chaumot
article
Journées scientifiques du GDR écotoxicologie aquatique, INRAE, Nov 2021, Rennes, France
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titre
Mass spectrometry: new diagnostic tools for the near future
auteur
Jean Armengaud
article
Applications of MALDI-TOF Mass-Spectrometry in Clinical Microbiology - Postgraduate Education Course, ESCMID, Oct 2021, Madrid, Spain
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titre
Analyse taxonomique et fonctionnelle par spectrométrie de masse en tandem : de l'isolat aux microbiotes complexes
auteur
Jean Armengaud
article
MICROBES 2021 - 16 ième Congrès National de la SFM, Société Française de Microbiologie, Sep 2021, Nantes, France
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https://hal.inrae.fr/hal-04476585/file/SFM%202021_Jean%20Armengaud%20r%C3%A9sum%C3%A9_invited%20keynote%20abstract.pdf BibTex
titre
Proteogenomics, the alliance of genomics, transcriptomics, proteomics and informatics, for deciphering reliable molecular markers from environmental species
auteur
Jean Armengaud
article
COST MARISTEM meeting on Omics, Ana Coelho Varela - ITQB, Sep 2021, Peniche, Portugal
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titre
Accelerate diagnostics with mass spectrometry
auteur
Jean Armengaud
article
Overcoming future pandemics: tools to control viral threats - Post-graduate Education Course, Gulsen Özkaya Sahin - ESCMID, Sep 2021, Lund, Sweden
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BibTex
titre
Introduction to metaproteomics
auteur
Jean Armengaud
article
HUPO ReConnect 2021 - precongress webinar on Metaproteomics, The Human Proteome Organization (HUPO), Aug 2021, New Mexico, United States
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https://hal.inrae.fr/hal-04476615/file/HUPOreconnect%202021%20-%20Metaproteomics%20webinar.pdf BibTex
titre
Novel perspectives for mass spectrometry in microbiology: from proteotyping pathogens and their resistomes to extended characterization of microbiota
auteur
Jean Armengaud
article
31st ECCMID Meet-the-Expert, European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ECCMID), Jul 2021, Paris, France
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titre
Ecotoxicoprotéomique d'animaux sentinelles et leurs microbiotes: marqueurs moléculaires pour évaluer la qualité de l'environnement
auteur
Jean Armengaud
article
FIRE FR3020 webinar 25 mai 2021, Christian Mougin - Fédération Ile-de-France de Recherche sur l'Environnement (FIRE), May 2021, Paris, France
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https://hal.inrae.fr/hal-04476627/file/Webinar%20FIRE%2025%20mai%202021_Keynote%20Jean%20Armengaud.pdf BibTex
titre
Animaux sentinelles pour évaluer la qualité de l’environnement : marqueurs moléculaires & microbiotes
auteur
Jean Armengaud
article
Journées SFSM-SFP 2021, Société Française de Spectrométrie de Masse & Société Française de Protéomique, Apr 2021, Paris, France
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BibTex
titre
Contribution de la spectrométrie de masse dans la lutte contre la COVID-19
auteur
Jean Armengaud
article
Réunion plénière du GT12 CETAMA - Métrologie et Analyses Chimiques, CETAMA - Commission d'Etablissement des Méthodes d'Analyse, Mar 2021, Paris, France
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BibTex
titre
Effets d’expositions uniques ou en mélange à la carbamazépine et au méthyl-mercure sur le système anti-oxydant, le protéome et le métabolome de la moule zébrée (Dreissena polymorpha)
auteur
Clément Baratange, Hugo Baali, Isabelle Bonnard, Laurence Delahaut, Jean-Charles Gaillard, Dominique Grandjean, Stéphanie Sayen, Gallorini Andrea, David Renault, Florian Breider, Jean-Luc Loizeau, Jean Armengaud, Claudia Cosio
article
Journées scientifiques 2021 - GDR Ecotoxicologie aquatique, INRAE, Nov 2021, Rennes, France
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titre
YAP protects the eye from uveitic glaucoma by preserving retinal and anterior chamber homeostases
auteur
Juliette Bitard, Elodie-Kim Grellier, Sophie Lourdel, Helena Filipe, Annaïg Hamon, François Fenaille, Florence Castelli, Emeline Chu-Van, Jérôme E. Roger, Morgane Locker, Muriel Perron
article
ARVO Annual Meeting, May 2021, Virtual meeting, United States. pp.2356
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titre
Evaluation of early markers for the direct diagnosis of Lyme disease
auteur
Victoria Dolange, Stéphanie Simon, Nathalie Morel
article
ECCMID 2021, ESCMID, Jul 2021, On line Conference, France
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titre
An integrated metabolomics and proteogenomics approach reveals molecular alterations following carbamazepine exposure in the mussel Mytilus galloprovincialis
auteur
Thibaut Dumas, Frédérique Courant, Christine Almunia, Julien Boccard, David Rosain, Geoffroy Duporte, Jean Armengaud, Hélène Fenet, Elena Gomez
article
Journées du Groupement De Recherche Ecotoxicologie Aquatique (GDR EA), Nov 2021, Rennes, France
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titre
An integrated metabolomics and proteogenomics approach reveals metabolic alterations following carbamazepine exposure in the mussel Mytilus galloprovincialis
auteur
Thibaut Dumas, Elena Gomez, Christine Almunia, Julien Boccard, Geoffroy Duporte, Hélène Fenet, Frédérique Courant
article
SETAC Europe 31th Annual Meeting, May 2021, Seville (en ligne), Spain
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https://hal.science/hal-03228665/file/Extended%20abstract%20SETAC%202021.pdf BibTex
titre
Mass spectrometry for virus detection and characterisation
auteur
Lucia Grenga
article
ESCMID Postgraduate Technical Workshop, Oct 2021, on line, France
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titre
Preliminary functional insights into the gut microbiota of COVID-19 patients probed by metaproteomics
auteur
Lucia Grenga
article
4th International Metaproteomics Symposium, Sep 2021, Luxembourg, Luxembourg
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titre
Proteomics in the COVID-19 Battlefield
auteur
Lucia Grenga
article
MSACL 2021 EU 7th European Congress, Sep 2021, On Line, France
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titre
Metaproteomics profiling of the dynamic of the whole microbial components of the cystic fibrosis lung microbiota during CFTR modulator therapy.
auteur
Pauline Hardouin, Karen Cullota, Olivier Pible, Hélène Marchandin, Raphael Chiron, Jean Armengaud, Lucia Grenga
article
44rd European Cystic Fibrosis Conference (ECFS), Jun 2021, Milan (Italie), Italy
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titre
Challenges and solutions for exploring taxonomical and functional changes of microbiota along a soil core
auteur
Virginie Jouffret, Olivier Pible, Jean Armengaud
article
4th International Metaproteomics Symposium, Luxembourg Centre for Systems Biomedicine, Sep 2021, Luxemburg, Luxembourg
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BibTex
titre
Multiplex lateral flow immunoassay for detections of β-lactamase activity on cephalosporin and 5 CTX-M groups
auteur
Christian Moguet,, Stéphanie Gelhaye, Camille Gonzalez, Antoine Sallustreau, Thierry Naas, Stéphanie Simon, Hervé Volland
article
European congress of clinical microbiology & infectious diseases, Jul 2021, online, France
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BibTex
titre
Proposal of a decoy-free FDR approach suitable for metaproteomics.
auteur
Olivier Pible, Virginie Jouffret, Karen Culotta, Jean Armengaud
article
4th International Metaproteomics Symposium, Luxembourg Centre for Systems Biomedicine, Sep 2021, Luxemburg, Luxembourg
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Book sections

titre
Microbiote et allergies
auteur
Stéphane Hazebrouck
article
Allergologie de L'enfant et de L'adolescent, Elsevier, pp.224-228, 2021, ⟨10.1016/B978-2-294-76475-2.00015-4⟩
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Special issue

titre
Highly sensitive and specific detection of staphylococcal enterotoxins SEA, SEG, SEH, and SEI by immunoassay
auteur
Cécile Féraudet Tarisse, Céline Goulard-Huet, Yacine Nia, Karine Devilliers, Dominique Marcé, Chloé Dambrune, Donatien Lefebvre, Jacques-Antoine Hennekinne, Stéphanie Simon
article
Toxins, 13, pp 130, 2021, ⟨10.3390/toxins13020130⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03352819/file/Detection%20of%20SEA%2C%20SEG%2C%20SEH%2C%20and%20SEI%20-%20Feraudet%202021.pdf BibTex
titre
Innovative and Highly Sensitive Detection of Clostridium perfringens Enterotoxin Based on Receptor Interaction and Monoclonal Antibodies
auteur
Thea Neumann, Maren Krüger, Jasmin Weisemann, Stefan Mahrhold, Daniel Stern, Martin Dorner, Cécile Feraudet-Tarisse, Christopher Pöhlmann, Katharina Schulz, Ute Messelhäusser, Dagmar Rimek, Frank Gessler, Thomas Elssner, Stéphanie Simon, Andreas Rummel, Brigitte Dorner
article
Toxins, 13 (4), 2021, ⟨10.3390/toxins13040266⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03351424/file/toxins-13-00266.pdf BibTex
titre
Ricin Antibodies’ Neutralizing Capacity against Different Ricin Isoforms and Cultivars
auteur
Maria Lucia Orsini Delgado, Arnaud Avril, Julie Prigent, Julie Dano, Audrey Rouaix, Sylvia Worbs, Brigitte G Dorner, Clémence Rougeaux, François Becher, François Fenaille, Sandrine Livet, Hervé Volland, Jean-Nicolas Tournier, Stéphanie Simon
article
Toxins, 13 (2), 2021, ⟨10.3390/toxins13020100⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inrae.fr/hal-03351910/file/toxins-13-00100-v3.pdf BibTex
titre
Differentiation, Quantification and Identification of Abrin and Abrus precatorius Agglutinin
auteur
Sylvia Worbs, Bettina Kampa, Martin Skiba, Eva-Maria Hansbauer, Daniel Stern, Hervé Volland, François Becher, Stéphanie Simon, Martin Dorner, Brigitte Dorner
article
Toxins, 13 (4), pp.284, 2021, ⟨10.3390/toxins13040284⟩
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BibTex
titre
Differentiation, Quantification and Identification of Abrin and Abrus precatorius Agglutinin
auteur
Sylvia Worbs, Bettina Kampa, Martin Skiba, Eva-Maria Hansbauer, Daniel Stern, Hervé Volland, François Becher, Stéphanie Simon, Martin Dorner, Brigitte Dorner
article
Toxins, 13 (4), 2021, ⟨10.3390/toxins13040284⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inrae.fr/hal-03351408/file/toxins-13-00284-v3.pdf BibTex

Lectures

titre
Mass spectrometry for virus detection and characterisation
auteur
Lucia Grenga
article
Doctoral. ESCMID Postgraduate Technical Workshop, Espagne (on line), Spain. 2021
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https://hal.science/hal-04474098/file/ESGMD_MALDI_Online_2021.pdf BibTex

Patents

titre
ANTIBODIES, FRAGMENTS OR DERIVATIVES SPECIFICALLY BINDING TO A PROTEIN ANTIGEN CAPABLE OF BINDING TO NUCLEIC ACIDS, AND USES OF SAME
auteur
Oscar Henrique Pereira Ramos, Michel Leonetti, Stéphanie Simon, Gwenaëlle Le Roux, Nathalie Morel
article
France, Patent n° : WO2022180342A1. 2021
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BibTex
titre
Detecting beta-lactamase enzyme activity
auteur
Hervé Volland
article
France, Patent n° : WO2022162303 A1. 2021
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Poster communications

titre
Integrated Multi-omics of early breast milk constituents
auteur
Camilo Broc, Karine Adel-Patient, François Fenaille, Mikaïl Berdi, Eric Venot, Blanche Guillon, Florence Castelli, Benoit Colsch, Blandine de Lauzon-Guillain, Etienne Thévenot
article
Intelligent Systems for Molecular Biology/European Conference on computaional biology, Jul 2021, Virtuel, France
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titre
An integrated metabolomics and proteogenomics approach reveals molecular alterations following carbamazepine exposure in the mussel Mytilus galloprovincialis
auteur
Thibaut Dumas, Frédérique Courant, Christine Almunia, Julien Boccard, David Rosain, Geoffroy Duporte, Jean Armengaud, Hélène Fenet, Elena Gomez
article
14ème Journées Scientifiques du Réseau Francophone de Métabolomique et Fluxomique (RFMF), Nov 2021, Aussois (France), France
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titre
Development and characterization of electronic noses for the rapid detection of COVID-19 in exhaled breath
auteur
Christelle Ghazaly, Krystyna Biletska, Etienne A Thévenot, Philippe Devillier, Emmanuel Naline, Stanislas Grassin-Delyle, Emmanuel Scorsone
article
10th Franco-Spanish Workshop CMC2-IBERNAM, Nov 2021, Arcachon, France.
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https://cea.hal.science/cea-03713273/file/poster_ChristelleGhazaly_2021.pdf BibTex
titre
Development of an automated bioinformatic workflow to assess oligosaccharide composition of early breast milk samples from LC-HRMS data
auteur
Eric Venot, Sylvain Dechaumet, Blanche Guillon, Mikaïl Berdi, Ghita Tajeddine, Sophie Cholet, Blandine De Lauzon-Guillain, Etienne Thevenot, François Fenaille, And Karine Adel-Patient
article
Journées scientifiques du Réseau Francophone de Fluxomique et de Métabolomique, Nov 2021, AUSSOIS, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-04351512/file/PosterRFMF2021_VENOT.pdf BibTex