2024

Article dans une revue

titre

A novel mutation in the NR3C1 gene associated with reversible glucocorticoid resistance

auteur

Margaux Laulhé, Emmanuelle Kuhn, Jérôme Bouligand, Larbi Amazit, Julie Perrot, Elise Lebigot, Peter Kamenickỷ, Marc Lombès, Jérôme Fagart, Say Viengchareun, Laetitia Martinerie

article

European Journal of Endocrinology, 2024, 190 (4), pp.284-295. ⟨10.1093/ejendo/lvae031⟩

DOI

DOI : 10.1093/ejendo/lvae031

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titre

Visualization of translation reorganization upon persistent ribosome collision stress in mammalian cells

auteur

Juliette Fedry, Joana Silva, Mihajlo Vanevic, Stanley Fronik, Yves Mechulam, Emmanuelle Schmitt, Amédée Des Georges, William James Faller, Friedrich Förster

article

Molecular Cell, 2024, 84 (6), pp.1078-1089.e4. ⟨10.1016/j.molcel.2024.01.015⟩

DOI

DOI : 10.1016/j.molcel.2024.01.015

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titre

Visualization of translation reorganization upon persistent ribosome collision stress in mammalian cells

auteur

Juliette Fedry, Joana Silva, Mihajlo Vanevic, Stanley Fronik, Yves Mechulam, Emmanuelle Schmitt, Amédée Des Georges, William James Faller, Friedrich Förster

article

Molecular Cell, 2024, 84 (6), pp.1078-1089.e4. ⟨10.1016/j.molcel.2024.01.015⟩

DOI

DOI : 10.1016/j.molcel.2024.01.015

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titre

Inactivating negative regulators of cortical branched actin enhances persistence of single cell migration

auteur

Artem I Fokin, Arthur Boutillon, John James, Laura Courtois, Sophie Vacher, Gleb Simanov, Yanan Wang, Anna Polesskaya, Ivan Bièche, Nicolas B David, Alexis M Gautreau

article

Journal of Cell Science, 2024, 137 (1), pp.jcs261332. ⟨10.1242/jcs.261332⟩

DOI

DOI : 10.1242/jcs.261332

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2023

Article dans une revue

titre

Codependencies of mTORC1 signaling and endolysosomal actin structures

auteur

Amulya Priya, Sandra Antoine-Bally, Anne-Sophie Macé, Pedro Monteiro, Valentin Sabatet, David Remy, Florent Dingli, Damarys Loew, Constantinos Demetriades, Alexis Gautreau, Philippe Chavrier

article

Science Advances , 2023, 9 (37), pp.eadd9084. ⟨10.1126/sciadv.add9084⟩

DOI

DOI : 10.1126/sciadv.add9084

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titre

PLP-Dependent Enzyme Methionine γ-Lyase: Insights into the Michaelis Complex from Molecular Dynamics and Free Energy Simulations

auteur

Xingyu Chen, Nathan Ferchaud, Pierre Briozzo, David Machover, Thomas Simonson

article

Biochemistry, 2023, 62 (18), pp.2791-2801. ⟨10.1021/acs.biochem.3c00355⟩

DOI

DOI : 10.1021/acs.biochem.3c00355

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titre

Redesigning methionyl‐tRNA synthetase for β‐methionine activity with adaptive landscape flattening and experiments

auteur

Vaitea Opuu, Giuliano Nigro, Christine Lazennec-Schurdevin, Yves Mechulam, Emmanuelle Schmitt, Thomas Simonson

article

Protein Science, 2023, 32 (9), ⟨10.1002/pro.4738⟩

DOI

DOI : 10.1002/pro.4738

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titre

Binding of human Cdc123 to eIF2γ

auteur

Cristina Cardenal Peralta, Paul Vandroux, Lea Neumann-Arnold, Michel Panvert, Jérôme Fagart, Wolfgang Seufert, Yves Mechulam, Emmanuelle Schmitt

article

Journal of Structural Biology, 2023, 215 (3), pp.108006. ⟨10.1016/j.jsb.2023.108006⟩

DOI

DOI : 10.1016/j.jsb.2023.108006

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titre

Nanopore-based RNA sequencing deciphers the formation, processing, and modification steps of rRNA intermediates in archaea

auteur

Felix Grünberger, Michael Jüttner, Robert Knüppel, Sébastien Ferreira-Cerca, Dina Grohmann

article

RNA, 2023, 29 (8), pp.1255-1273. ⟨10.1261/rna.079636.123⟩

DOI

DOI : 10.1261/rna.079636.123

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titre

ERH : a plug‐and‐play protein important for gene silencing and cell cycle progression

auteur

Marc Graille

article

FEBS Journal, 2023, 290 (3), pp.688-691. ⟨10.1111/febs.16669⟩

DOI

DOI : 10.1111/febs.16669

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titre

Best Practices of Using AI-Based Models in Crystallography and Their Impact in Structural Biology

auteur

Marc Graille, Sophie Sacquin-Mora, Antoine Taly

article

Journal of Chemical Information and Modeling, In press, ⟨10.1021/acs.jcim.3c00381⟩

DOI

DOI : 10.1021/acs.jcim.3c00381

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titre

Structural insights into the evolution of late steps of translation initiation in the three domains of life

auteur

Ramy Kazan, Gabrielle Bourgeois, Christine Lazennec-Schurdevin, Pierre-Damien Coureux, Yves Mechulam, Emmanuelle Schmitt

article

Biochimie, In press, pp.S0300-9084(23)00030-5. ⟨10.1016/j.biochi.2023.02.002⟩

DOI

DOI : 10.1016/j.biochi.2023.02.002

pubmedId

: 36773835

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titre

Transcriptional and translational dynamics underlying heat shock response in the thermophilic crenarchaeon Sulfolobus acidocaldarius

auteur

Rani Baes, Felix Grünberger, Sébastien Pyr Dit Ruys, Mohea Couturier, Sarah de Keulenaer, Sonja Skevin, Filip van Nieuwerburgh, Didier Vertommen, Dina Grohmann, Sébastien Ferreira-Cerca, Eveline Peeters

article

mBio, In press, ⟨10.1128/mbio.03593-22⟩

DOI

DOI : 10.1128/mbio.03593-22

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titre

Computational protein design repurposed to explore enzyme vitality and help predict antibiotic resistance

auteur

Eleni Michael, Rémy Saint-Jalme, David Mignon, Thomas Simonson

article

Frontiers in Molecular Biosciences, 2023, 9, pp.905588. ⟨10.3389/fmolb.2022.905588⟩

DOI

DOI : 10.3389/fmolb.2022.905588

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titre

N 2-methylguanosine modifications on human tRNAs and snRNA U6 are important for cell proliferation, protein translation and pre-mRNA splicing

auteur

Can Wang, Nathalie Ulryck, Lydia Herzel, Nicolas Pythoud, Nicole Kleiber, Vincent Guerineau, Vincent Jactel, Chloé Moritz, Markus T Bohnsack, Christine Carapito, David Touboul, Katherine E Bohnsack, Marc Graille

article

Nucleic Acids Research, 2023, 51 (14), pp.7496-7519. ⟨10.1093/nar/gkad487⟩

DOI

DOI : 10.1093/nar/gkad487

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titre

PPP2R1A regulates migration persistence through the NHSL1-containing WAVE Shell Complex

auteur

Yanan Wang, Giovanni Chiappetta, Raphaël Guérois, Yijun Liu, Stéphane Romero, Daniel Boesch, Matthias Krause, Claire Dessalles, Avin Babataheri, Abdul Barakat, Baoyu Chen, Joelle Vinh, Anna Polesskaya, Alexis Gautreau

article

Nature Communications, 2023, 14 (1), pp.3541. ⟨10.1038/s41467-023-39276-w⟩

DOI

DOI : 10.1038/s41467-023-39276-w

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2022

Article dans une revue

titre

Molecular mechanism of Arp2/3 complex inhibition by Arpin

auteur

Fred Fregoso, Trevor van Eeuwen, Gleb Simanov, Grzegorz Rebowski, Malgorzata Boczkowska, Austin Zimmet, Alexis Gautreau, Roberto Dominguez

article

Nature Communications, 2022, 13 (1), pp.628. ⟨10.1038/s41467-022-28112-2⟩

DOI

DOI : 10.1038/s41467-022-28112-2

pubmedId

: 35110533

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titre

Medical contrast agents as promising tools for biomacromolecular SAXS experiments

auteur

Frank Gabel, Sylvain Engilberge, Emmanuelle Schmitt, Aurélien Thureau, Yves Mechulam, Javier Pérez, Eric Girard

article

Acta crystallographica Section D : Structural biology [1993-..], 2022, 78 (9), pp.1120-1130. ⟨10.1107/S2059798322007392⟩

DOI

DOI : 10.1107/S2059798322007392

pubmedId

: 36048152

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titre

The SARS-CoV-2 protein NSP2 impairs the silencing capacity of the human 4EHP-GIGYF2 complex

auteur

Limei Zou, Clara Moch, Marc Graille, Clément Chapat

article

iScience, 2022, 25, ⟨10.1016/j.isci.2022.104646⟩

DOI

DOI : 10.1016/j.isci.2022.104646

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titre

The SARS-CoV-2 protein NSP2 impairs the silencing capacity of the human 4EHP-GIGYF2 complex

auteur

Limei Zou, Clara Moch, Marc Graille, Clément Chapat

article

iScience, 2022, 25 (7), pp.104646. ⟨10.1016/j.isci.2022.104646⟩

DOI

DOI : 10.1016/j.isci.2022.104646

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titre

Role of aIF5B in archaeal translation initiation

auteur

Ramy Kazan, Gabrielle Bourgeois, Christine Lazennec-Schurdevin, Eric Larquet, Yves Mechulam, Pierre-Damien Coureux, Emmanuelle Schmitt

article

Nucleic Acids Research, 2022, ⟨10.1093/nar/gkac490⟩

DOI

DOI : 10.1093/nar/gkac490

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titre

Nucleation, stabilization, and disassembly of branched actin networks

auteur

Alexis Gautreau, Fred Fregoso, Gleb Simanov, Roberto Dominguez

article

Trends in Cell Biology, 2022, 32 (5), pp.421-432. ⟨10.1016/j.tcb.2021.10.006⟩

DOI

DOI : 10.1016/j.tcb.2021.10.006

pubmedId

: 34836783

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titre

Cg1246, a new player in mycolic acid biosynthesis in Corynebacterium glutamicum

auteur

Célia de Sousa-d'Auria, Florence Constantinesco, Nicolas Bayan, Patricia Constant, Maryelle Tropis, Mamadou Daffé, Marc Graille, Christine Houssin

article

Microbiology, 2022, 168, ⟨10.1099/mic.0.001171⟩

DOI

DOI : 10.1099/mic.0.001171

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titre

The X-ray crystallography phase problem solved thanks to AlphaFold and RoseTTAFold models: a case-study report

auteur

Irène Barbarin-Bocahu, Marc Graille

article

Acta crystallographica Section D : Structural biology [1993-..], 2022, 78 (4), ⟨10.1107/S2059798322002157⟩

DOI

DOI : 10.1107/S2059798322002157

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titre

How much can physics do for protein design?

auteur

Eleni Michael, Thomas Simonson

article

Current Opinion in Structural Biology, 2022, 72, pp.46-54. ⟨10.1016/j.sbi.2021.07.011⟩

DOI

DOI : 10.1016/j.sbi.2021.07.011

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titre

Grid batch-dependent tuning of glow discharge parameters

auteur

Ramy Kazan, Gabrielle Bourgeois, Dominique Carisetti, Ileana Florea, Eric Larquet, Jean-Luc Maurice, Yves Mechulam, François Ozanam, Emmanuelle Schmitt, Pierre-Damien Coureux

article

Frontiers in Molecular Biosciences, 2022, 9, pp.910218. ⟨10.3389/fmolb.2022.910218⟩

DOI

DOI : 10.3389/fmolb.2022.910218

pubmedId

: 36060254

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titre

Structural and molecular determinants for the interaction of ExbB from Serratia marcescens and HasB, a TonB paralog

auteur

Valérie Biou, Ricardo Jorge Diogo Adaixo, Mohamed Chami, Pierre-Damien Coureux, Benoist Laurent, Véronique Yvette Ntsogo Enguéné, Gisele Cardoso de Amorim, Nadia Izadi-Pruneyre, Christian Malosse, Julia Chamot-Rooke, Henning Stahlberg, Philippe Delepelaire

article

Communications Biology, 2022, 5 (1), pp.355. ⟨10.1038/s42003-022-03306-y⟩

DOI

DOI : 10.1038/s42003-022-03306-y

pubmedId

: 35418619

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titre

A Computational Model for the PLP-Dependent Enzyme Methionine γ-Lyase

auteur

Xingyu Chen, Pierre Briozzo, David Machover, Thomas Simonson

article

Frontiers in Molecular Biosciences, 2022, 9, pp.886358. ⟨10.3389/fmolb.2022.886358⟩

DOI

DOI : 10.3389/fmolb.2022.886358

pubmedId

: 35558556

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Ouvrages

titre

Computational Peptide Science

auteur

Thomas Simonson

article

Springer US, 2405, 2022, Methods in Molecular Biology, 978-1-0716-1854-7. ⟨10.1007/978-1-0716-1855-4⟩

DOI

DOI : 10.1007/978-1-0716-1855-4

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2021

Article dans une revue

titre

Forces generated by lamellipodial actin filament elongation regulate the WAVE complex during cell migration

auteur

Amine Mehidi, Frieda Kage, Zeynep Karatas, Maureen Cercy, Matthias Schaks, Anna Polesskaya, Matthieu Sainlos, Alexis Gautreau, Olivier Rossier, Klemens Rottner, Grégory Giannone

article

Nature Cell Biology, 2021, 23 (11), pp.1148-1162. ⟨10.1038/s41556-021-00786-8⟩

DOI

DOI : 10.1038/s41556-021-00786-8

pubmedId

: 34737443

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titre

A millisecond passive micromixer with low flow rate, low sample consumption and easy fabrication

auteur

Yuanyuan Liao, Yves Mechulam, Benedikt Lassalle-Kaiser

article

Scientific Reports, 2021, 11, ⟨10.1038/s41598-021-99471-x⟩

DOI

DOI : 10.1038/s41598-021-99471-x

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titre

Selenium metabolism and toxicity in the yeast Saccharomyces cerevisiae

auteur

Myriam Lazard

article

Medical Research Archives, 2021, 9 (9), ⟨10.18103/mra.v9i9.2550⟩

DOI

DOI : 10.18103/mra.v9i9.2550

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titre

Nuclear Magnetic Resonance Spectroscopy: A Multifaceted Toolbox to Probe Structure, Dynamics, Interactions, and Real-Time In Situ Release Kinetics in Peptide-Liposome Formulations

auteur

Camille Doyen, Eric Larquet, Pierre-Damien Coureux, Oriane Frances, Frédéric Herman, Serge Sablé, Jean-Pierre Burnouf, Christina Sizun, Ewen Lescop

article

Molecular Pharmaceutics, 2021, 18 (7), pp.2521-2539. ⟨10.1021/acs.molpharmaceut.1c00037⟩

DOI

DOI : 10.1021/acs.molpharmaceut.1c00037

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titre

Exposure to the Methylselenol Precursor Dimethyldiselenide Induces a Reductive Endoplasmic Reticulum Stress in Saccharomyces cerevisiae

auteur

Marc Dauplais, Pierre Mahou, Pierre Plateau, Myriam Lazard

article

International Journal of Molecular Sciences, 2021, 22 (11), pp.5467. ⟨10.3390/ijms22115467⟩

DOI

DOI : 10.3390/ijms22115467

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titre

Division of labor in epitranscriptomics: What have we learnt from the structures of eukaryotic and viral multimeric RNA methyltransferases?

auteur

Marc Graille

article

Wiley Interdisciplinary Reviews-RNA, 2021, ⟨10.1002/wrna.1673⟩

DOI

DOI : 10.1002/wrna.1673

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titre

Arpin Regulates Migration Persistence by Interacting with Both Tankyrases and the Arp2/3 Complex

auteur

Gleb Simanov, Irene Dang, Artem I Fokin, Ksenia Oguievetskaia, Valérie Campanacci, Jacqueline Cherfils, Alexis Gautreau

article

International Journal of Molecular Sciences, 2021, 22 (8), ⟨10.3390/ijms22084115⟩

DOI

DOI : 10.3390/ijms22084115

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titre

Assembly and Activity of the WASH Molecular Machine: Distinctive Features at the Crossroads of the Actin and Microtubule Cytoskeletons

auteur

Artem I Fokin, Alexis Gautreau

article

Frontiers in Cell and Developmental Biology, 2021, 9, pp.658865. ⟨10.3389/fcell.2021.658865⟩

DOI

DOI : 10.3389/fcell.2021.658865

pubmedId

: 33869225

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titre

A scaffold lncRNA shapes the mitosis to meiosis switch

auteur

Vedrana Andric, Alicia Nevers, Ditipriya Hazra, Sylvie Auxilien, Alexandra Menant, Marc Graille, Benoit Palancade, Mathieu Rougemaille

article

Nature Communications, 2021, 12 (1), pp.770. ⟨10.1038/s41467-021-21032-7⟩

DOI

DOI : 10.1038/s41467-021-21032-7

pubmedId

: 33536434

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titre

The Arp1/11 minifilament of dynactin primes the endosomal Arp2/3 complex

auteur

Artem I. Fokin, Violaine David, Ksenia Oguievetskaia, Emmanuel Derivery, Caroline E. Stone, Luyan Cao, Nathalie Rocques, Nicolas Molinie, Véronique Henriot, Magali Aumont-Nicaise, Maria-Victoria Hinckelmann, Frédéric Saudou, Christophe Le Clainche, Andrew P. Carter, Guillaume Romet ‐ Lemonne, Alexis M. Gautreau

article

Science Advances , 2021, ⟨10.1126/sciadv.abd5956⟩

DOI

DOI : 10.1126/sciadv.abd5956

pubmedId

: 33523880

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titre

Bulges in left-handed G-quadruplexes

auteur

Poulomi Das, Khac Huy Ngo, Fernaldo richtia Winnerdy, Arijit Maity, Blaž Bakalar, Yves Mechulam, Emmanuelle Schmitt, Anh Tuân Phan

article

Nucleic Acids Research, 2021, 49 (3), pp.1724-1736. ⟨10.1093/nar/gkaa1259⟩

DOI

DOI : 10.1093/nar/gkaa1259

pubmedId

: 33503265

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titre

Methylselenol Produced In Vivo from Methylseleninic Acid or Dimethyl Diselenide Induces Toxic Protein Aggregation in Saccharomyces cerevisiae

auteur

Marc Dauplais, Katarzyna Bierla, Coralie Maizeray, Roxane Lestini, Ryszard Lobinski, Pierre Plateau, Joanna Szpunar, Myriam Lazard

article

International Journal of Molecular Sciences, 2021, 22 (5), pp.2241. ⟨10.3390/ijms22052241⟩

DOI

DOI : 10.3390/ijms22052241

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titre

A novel minimal motif for left-handed G-quadruplex formation

auteur

Poulomi Das, Fernaldo Richtia Winnerdy, Arijit Maity, Yves Mechulam, Anh Tuân Phan

article

Chemical Communications, 2021, 57 (20), pp.2527-2530. ⟨10.1039/d0cc08146a⟩

DOI

DOI : 10.1039/d0cc08146a

pubmedId

: 33690751

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titre

The Arp2/3 Inhibitory Protein Arpin Is Required for Intestinal Epithelial Barrier Integrity

auteur

Sandra Chánez-Paredes, Armando Montoya-García, Karla F Castro-Ochoa, Julio García-Cordero, Leticia Cedillo-Barrón, Mineko Shibayama, Porfirio Nava, Sven Flemming, Nicolas Schlegel, Alexis Gautreau, Hilda Vargas-Robles, Ricardo Mondragón-Flores, Michael Schnoor

article

Frontiers in Cell and Developmental Biology, 2021, 9, pp.625719. ⟨10.3389/fcell.2021.625719⟩

DOI

DOI : 10.3389/fcell.2021.625719

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