Publications HAL de la structure ;553450;1043280;1061099;553451;1043278;1061100;553452;1043279;1061098;1153147;1153146;1153148

2023

Journal articles

titre
Histological features of liver disease development in the Atp7b −/− mouse: a model of Wilson’s disease
auteur
Pierre-Marie Lavrut, Olivier Guillaud, Jérôme Dumortier, Elisabeth Mintz, Virginie Brun, Sophie Heissat, Eduardo Couchonnal Bedoya, Alain Lachaux, Muriel Bost, Valerie Hervieu
article
Journal of Clinical Pathology, 2023, jcp-2023-209190. ⟨10.1136/jcp-2023-209190⟩
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SIN-3 acts in distinct complexes to regulate the germline transcriptional program in Caenorhabditis elegans
auteur
Valerie Robert, Matthieu Caron, Loic Gely, Annie Adrait, Victoria Pakulska, Yohann Couté, Manon Chevalier, Christian Riedel, Cecile Bedet, Francesca Palladino
article
Development (Cambridge, England), 2023, 150 (21), ⟨10.1242/dev.201755⟩
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Cell-type-specific control of secondary cell wall formation by Musashi-type translational regulators in Arabidopsis
auteur
Alicia Kairouani, Dominique Pontier, Claire Picart, Fabien Mounet, Yves Martinez, Lucie Le-Bot, Mathieu Fanuel, Philippe Hammann, Lucid Belmudes, Remy Merret, Jacinthe Azevedo, Marie-Christine Carpentier, Dominique Gagliardi, Yohann Couté, Richard Sibout, Natacha Bies-Etheve, Thierry Lagrange
article
eLife, 2023, 12, ⟨10.7554/eLife.88207⟩
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https://hal.science/hal-04230426/file/islandora_167735.pdf BibTex
titre
Compact and modular system architecture for a nano-resonator-mass spectrometer
auteur
Adrien Reynaud, Wioletta Trzpil, Louis Dartiguelongue, Vaitson Çumaku, Thomas Fortin, Marc Sansa, Sebastien Hentz, Christophe Masselon
article
Frontiers in Chemistry, 2023, 11, ⟨10.3389/fchem.2023.1238674⟩
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Pulse-SILAC and interactomics reveal distinct DDB1-CUL4 associated factors (DCAFs), cellular functions, and protein substrates
auteur
Jennifer Raisch, Marie-Line Dubois, Marika Groleau, Dominique Lévesque, Thomas Burger, Carla-Marie Jurkovic, Romain Brailly, Gwendoline Marbach, Alyson Mckenna, Catherine Barrette, Pierre-Étienne Jacques, François-Michel Boisvert
article
Molecular and Cellular Proteomics, 2023, pp.100644. ⟨10.1016/j.mcpro.2023.100644⟩
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https://hal.science/hal-04203140/file/Dubois%20et%20al.Manuscrit_Re_v5.pdf BibTex
titre
Fetal Muse-based therapy prevents lethal radio-induced gastrointestinal syndrome by intestinal regeneration
auteur
Honorine Dushime, Stéphanie Moreno, Christine Linard, Annie Adrait, Yohann Couté, Juliette Peltzer, Sébastien Messiaen, Claire Torres, Lydia Bensemmane, Daniel Lewandowski, Paul Henri Romeo, Vanessa Petit, Nathalie Gault
article
Stem Cell Research and Therapy, 2023, 14 (201), pp.1-22. ⟨10.1186/s13287-023-03425-1⟩
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https://irsn.hal.science/irsn-04249687/file/Stem%20cell%20Res%20Ther%202023.pdf BibTex
titre
Neuronal Store-Operated Calcium Channels
auteur
Alexandre Bouron
article
Molecular Neurobiology, 2023, 60, pp.4517-4546. ⟨10.1007/s12035-023-03352-5⟩
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titre
Controlling for false discoveries subsequently to large scale one‐way ANOVA testing in proteomics: Practical considerations
auteur
Thomas Burger
article
Proteomics, 2023, 2022, pp.00406. ⟨10.1002/pmic.202200406⟩
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https://hal.science/hal-04140803/file/PHTFDR-revised2-v2-final.pdf BibTex
titre
Neuronal Store-Operated Calcium Channels
auteur
Alexandre Bouron
article
Molecular Neurobiology, 2023, ⟨10.1007/s12035-023-03352-5⟩
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titre
Role of the deubiquitinating enzyme UCH-L1 in mitochondrial function
auteur
Alexandre Bouron, Laurence Aubry, Desirée Loreth, Marie-Odile Fauvarque, Catherine Meyer-Schwesinger
article
Frontiers in Cellular Neuroscience, 2023, 17, ⟨10.3389/fncel.2023.1149954⟩
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Detection of genes with differential expression dispersion unravels the role of autophagy in cancer progression
auteur
Christophe Le Priol, Chloé-Agathe Azencott, Xavier Gidrol
article
PLoS Computational Biology, 2023, 19 (3), pp.e1010342. ⟨10.1371/journal.pcbi.1010342⟩
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Inflammasome-independent NLRP3 function enforces ATM activity in response to genotoxic stress
auteur
Mélanie Bodnar-Wachtel, Anne-Laure Huber, Julie Gorry, Sabine Hacot, Delphine Burlet, Laetitia Gérossier, Baptiste Guey, Nadège Goutagny, Birke Bartosch, Elise Ballot, Julie Lecuelle, Caroline Truntzer, François Ghiringhelli, Bénédicte F Py, Yohann Couté, Annabelle Ballesta, Sylvie Lantuejoul, Janet Hall, Agnès Tissier, Virginie Petrilli
article
Life Science Alliance, 2023, 6 (4), pp.e202201494. ⟨10.26508/lsa.202201494⟩
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https://hal.science/hal-04052301/file/Bodnar-Wachtel2023.pdf BibTex
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Membrane vesicles released by Lacticaseibacillus casei BL23 inhibit the biofilm formation of Salmonella Enteritidis
auteur
David da Silva Barreira, Julie Laurent, Jessica Lourenço, Julia Novion Ducassou, Yohann Couté, Jean Guzzo, Aurélie Rieu
article
Scientific Reports, 2023, 13 (1), pp.1163. ⟨10.1038/s41598-023-27959-9⟩
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titre
Immune-Mediated Rippling Muscle Disease Associated With Thymoma and Anti-MURC/Cavin-4 Autoantibodies
auteur
Juliette Svahn, Laurent Coudert, Nathalie Streichenberger, Alexandra Kraut, Alice Gravier-Dumonceau-Mazelier, Ludivine Rotard, Laurence Calemard-Michel, Rita Menassa, Elisabeth Errazuriz-Cerda, Lara Chalabreysse, Alexis Osseni, Christophe Vial, Laurentiu Jomir, François Tronc, Do Le Duy, Emilien Bernard, Vincent Gache, Yohann Couté, Vincent Jacquemond, Laurent Schaeffer, Pascal Leblanc
article
Neurology Neuroimmunology & Neuroinflammation, 2023, 10 (1), pp.e200068. ⟨10.1212/NXI.0000000000200068⟩
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https://cnrs.hal.science/hal-04293370/file/e200068.full.pdf BibTex
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Investigation of chemical composition and biological activities of $Ajuga\ pyramidalis$—isolation of iridoids and phenylethanoid glycosides
auteur
Anthonin Gori, Benjamin Boucherle, Aurélien Rey, Maxime Rome, Caroline Barette, Emmanuelle Soleilhac, Christian Philouze, Marie-Odile Fauvarque, Nicola Fuzzati, Marine Peuchmaur
article
Metabolites, 2023, 13, pp.128. ⟨10.3390/metabo13010128⟩
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https://hal.science/hal-04014499/file/Gori-metabolites-2023.pdf BibTex
titre
RSL24D1 sustains steady-state ribosome biogenesis and pluripotency translational programs in embryonic stem cells
auteur
Sébastien Durand, Marion Bruelle, Fleur Bourdelais, Bigitha Bennychen, Juliana Blin-Gonthier, Caroline Isaac, Aurélia Huyghe, Sylvie Martel, Antoine Seyve, Christophe Vanbelle, Annie Adrait, Yohann Couté, David Meyronet, Frédéric Catez, Jean-Jacques Diaz, Fabrice Lavial, Emiliano Ricci, François Ducray, Mathieu Gabut
article
Nature Communications, 2023, 14 (1), pp.356. ⟨10.1038/s41467-023-36037-7⟩
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https://cnrs.hal.science/hal-04010880/file/41467_2023_Article_36037.pdf BibTex
titre
A Proteomics-Based Approach Identifies the NEDD4 Adaptor NDFIP2 as an Important Regulator of Ifitm3 Levels
auteur
Federico Marziali, Yuxin Song, Xuan-Nhi Nguyen, Lucid Belmudes, Julien Burlaud-Gaillard, Philippe Roingeard, Yohann Couté, Andrea Cimarelli
article
Viruses, 2023, 15 (10), pp.1993. ⟨10.3390/v15101993⟩
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Conference papers

titre
Chloroplast biogenesis: towards the role of localized translation in Arabidopsis
auteur
Norbert Rolland, Laura Dimnet, Sara Pullara, Lucas Moyet, Chloé Genevey, Samantha Moulin, Sabine Brugière, Alexandra Launay-Avon, Yohann Couté, Etienne Delannoy, Rémy Merret, Marcel Kuntz
article
59th Congress of the Argentine Society for Research in Biochemistry and Molecular Biology (SAIB), SAIB, Nov 2023, Rosario, Argentina
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Chloroplast biogenesis: towards the role of localized translation in Arabidopsis
auteur
Sara Pullara, Laura Dimnet, Lucas Moyet, Chloé Genevey, Samantha Moulin, Sabine Brugière, Alexandra Launay-Avon, Yohann Couté, Etienne Delannoy, Marcel Kuntz, Norbert Rolland
article
Journées du "Protéome Vert" 2023, Réseau Protéome Vert, Jun 2023, Gif-Sur-Yvette, France
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Book sections

titre
Statistical Analysis of Quantitative Peptidomics and Peptide-Level Proteomics Data with Prostar
auteur
Marianne Tardif, Enora Fremy, Anne-Marie Hesse, Thomas Burger, Yohann Couté, Samuel Wieczorek
article
Statistical Analysis of Proteomic Data, 2426, Springer US, pp.163-196, 2023, Methods in Molecular Biology, ⟨10.1007/978-1-0716-1967-4_9⟩
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titre
Validation of MS/MS identifications and label-free quantification using Proline
auteur
Véronique Dupierris, Anne-Marie Hesse, Jean-Philippe Menetrey, David Bouyssié, Thomas Burger, Yohann Couté, Christophe Bruley
article
Statistical Analysis of Proteomic Data, 2426, Springer US, pp.67-89, 2023, Methods in Molecular Biology, ⟨10.1007/978-1-0716-1967-4_4⟩
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https://hal.science/hal-03244240/file/ProlineBH-preprint-version.pdf BibTex
titre
Validation of MS/MS Identifications and Label-Free Quantification Using Proline
auteur
Véronique Dupierris, Anne-Marie Hesse, Jean-Philippe Menetrey, David Bouyssié, Thomas Burger, Yohann Couté, Christophe Bruley
article
Statistical Analysis of Proteomic Data, 2426, Springer US, pp.67-89, 2023, Methods in Molecular Biology, ⟨10.1007/978-1-0716-1967-4_4⟩
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titre
Statistical analysis of quantitative peptidomics and peptide-level proteomics data with Prostar
auteur
Marianne Tardif, Enora Fremy, Anne-Marie Hesse, Thomas Burger, Yohann Couté, Samuel Wieczorek
article
Statistical Analysis of Proteomic Data, 2426, Springer US, pp.163-196, 2023, Methods in Molecular Biology, ⟨10.1007/978-1-0716-1967-4_9⟩
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https://hal.science/hal-03242797/file/Prostar-peptidelevel-preprint.pdf BibTex
titre
Unveiling the links between peptide identification and differential analysis FDR controls by means of a practical introduction to knockoff filters
auteur
Lucas Etourneau, Nelle Varoquaux, Thomas Burger
article
Statistical Analysis of Proteomic Data, 2426, Springer US, pp.1-24, 2023, Methods in Molecular Biology, ⟨10.1101/2021.08.20.454134⟩
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Books

titre
Statistical Analysis of Proteomic Data
auteur
Thomas Burger
article
Springer US, 2426, pp.225-246, 2023, Methods in Molecular Biology, ⟨10.1007/978-1-0716-1967-4⟩
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Preprints, Working Papers, ...

titre
Detecting abnormal cell behaviors from dry mass time series
auteur
Romain Bailly, Marielle Malfante, Cédric Allier, Chiara Paviolo, Lamya Ghenim, Kiran Padmanabhan, Sabine Bardin, Jerome Mars
article
2023
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https://cnrs.hal.science/hal-04275745/file/Scientifc_Reports_lamyaghenim_soumis.pdf BibTex