2025

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Paul Bois, Le Anh Pham, Cédric Gaucherel. May a highly touristic tropical island sustain water resources? Navigating troubled waters to berth on a safe shore. AMBIO: A Journal of Environment and Society, 2025, 54, pp.364-378. ⟨10.1007/s13280-024-02079-4⟩. ⟨hal-04793626⟩

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Dereje T Demie, Daniel Wallach, Thomas F Döring, Frank Ewert, Thomas Gaiser, et al.. Evaluating a new intercrop model for capturing mixture effects with an extensive intercrop dataset. Agriculture, Ecosystems & Environment, 2025, 378, pp.109302. ⟨10.1016/j.agee.2024.109302⟩. ⟨hal-04747808⟩

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Thibault Durieux, Anne-Laure Decombeix, Carla J Harper, Merlin Ramel, Chris Mays, et al.. Callixylon seamrogia sp. nov., a new species from the uppermost Famennian (Upper Devonian) of Ireland. Review of Palaeobotany and Palynology, 2025, 334, pp.105256. ⟨10.1016/j.revpalbo.2024.105256⟩. ⟨hal-04822295⟩

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Léa Genty, Aurélie Metay, Elena Kazakou, Mathilde Baude, Antoine Gardarin, et al.. Agricultural practices in olive groves modify weeds floral traits and resources throughout the year. Agriculture, Ecosystems & Environment, 2025, 377, pp.109280. ⟨10.1016/j.agee.2024.109280⟩. ⟨hal-04696500⟩

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Andrés González-Melo, Juan Manuel Posada, Jacques Beauchêne, Romain Lehnebach, Bruno Clair. Tropical tree species with high wood specific gravity have higher concentrations of wood phosphorus, and are more efficient at resorbing it. AoB Plants, In press, ⟨10.1093/aobpla/plaf001⟩. ⟨hal-04883791⟩

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Xiaobin Hua, C.H. Lusk, I.A. Dickie, S. Adu-Bredu, K.J. Allen, et al.. Site-specific nutrient data reveal the importance of soils in driving the Mycorrhizal make-up of woody vegetation worldwide. Global Ecology and Biogeography, 2025, 34 (1), e13936 [13 p.]. ⟨10.1111/geb.13936⟩. ⟨hal-04839912⟩

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Sabrina Kumschick, Lysandre Journiac, Océane Boulesnane-Genguant, Christophe Botella, Robin Pouteau, et al.. Mapping potential environmental impacts of alien species in the face of climate change. Biological Invasions, 2025, 27 (1), pp.43. ⟨10.1007/s10530-024-03490-4⟩. ⟨hal-04866133⟩

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Xavier Morin, Maude Toigo, Lorenz Fahse, Joannès Guillemot, Maxime Cailleret, et al.. More species, more trees: The role of tree packing in promoting forest productivity. Journal of Ecology, 2025, ⟨10.1111/1365-2745.14460⟩. ⟨hal-04873942⟩

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Jérôme Munzinger, Chrissen Gemmill. Molecular insights into species delimitations of Cryptocarya, Endiandra, and Beilschmiedia (Lauraceae) in New Caledonia and neighbouring islands. Phytotaxa, 2025, 681 (3), pp.233-264. ⟨10.11646/phytotaxa.681.3.1⟩. ⟨hal-04890630⟩

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Nick P Rowe. Inverting the lady’s slipper orchid: development and active–passive mechanisms in a ‘living machine’. Journal of Experimental Botany, 2025, 76 (2), pp.191 - 194. ⟨10.1093/jxb/erae444⟩. ⟨hal-04903218⟩

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Pablo Sanchez‐martinez, Kyle G Dexter, Freddie C Draper, Chris Baraloto, Iêda Leão Do Amaral, et al.. Phylogenetic conservatism in the relationship between functional and demographic characteristics in Amazon tree taxa. Functional Ecology, 2025, 39 (1), pp.181-198. ⟨10.1111/1365-2435.14700⟩. ⟨hal-04832636⟩

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Marie Séguigne, Céline Leroy, Jean-François Carrias, Bruno Corbara, Thibaut Rota, et al.. Influence of isolation on the resilience of tank bromeliad ecosystems to drought in a Neotropical rainforest. Hydrobiologia, 2025, 852, pp.249-264. ⟨10.1007/s10750-024-05704-1⟩. ⟨hal-04767635⟩

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Pierre‐louis Stenger, Audrey Léopold, Kelly Dinh, Pierre Mournet, Nadia Robert, et al.. Advancing biomonitoring of eDNA studies with the Anaconda R package: Integrating soil and One Health perspectives in the face of evolving traditional agriculture practices. PLoS ONE, 2025, 20 (1), pp.e0311986. ⟨10.1371/journal.pone.0311986⟩. ⟨hal-04904826⟩

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Joseph Zailaa, Santiago Trueba, Marvin Browne, Leila R. Fletcher, Thomas Buckley, et al.. Sensitive Hydraulic and Stomatal Decline in Extreme Drought Tolerant Species of California Ceanothus. Plant, Cell and Environment, 2025, 48 (2), pp.1555-1573. ⟨10.1111/pce.15208⟩. ⟨hal-04807441⟩

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Pré-publication, Document de travail

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Vincyane Badouard, Sylvain Schmitt, Guillaume Salzet, Thomas Gaquiere, Margaux Rojat, et al.. LoggingLab: an R package to simulate reduced-impact selective logging in tropical forests using forest inventory data. 2025. ⟨hal-04862574⟩

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2024

Article dans une revue

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Beda Innocent Adji, Xiujuan Wang, Véronique Letort, Doffou Sélastique Akaffou, Sylvie-Annabel Sabatier, et al.. Stochastic modelling of development and biomass allocation: Computation applied to architecture of young mahogany trees (Khaya senegalensis Desr. A. Juss), a native African savannah emblematic agroforestry species. Computers and Electronics in Agriculture, 2024, 220, pp.108864. ⟨10.1016/j.compag.2024.108864⟩. ⟨hal-04560276⟩

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Franklin Platini Agouanet, Ivric Valaire Yatat–djeumen, Israël Tankam-Chedjou, Jean Jules Tewa. Control Model of Banana Black Sigatoka Disease with Seasonality. Differential Equations and Dynamical Systems, 2024, ⟨10.1007/s12591-024-00692-z⟩. ⟨hal-04577778⟩

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Amen Al-Yaari, Thomas Condom, Fabien Anthelme, Sophie Cauvy-Fraunié, Olivier Dangles, et al.. Warming-induced cryosphere changes predict drier Andean eco-regions. Environmental Research Letters, 2024, 19 (10), pp.104030. ⟨10.1088/1748-9326/ad6ea6⟩. ⟨hal-04686152⟩

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Artémis Anest, Yanis Bouchenak-Khelladi, Tristan Charles-Dominique, Félix Forest, Yves Caraglio, et al.. Author Correction: Blocking then stinging as a case of two-step evolution of defensive cage architectures in herbivore-driven ecosystems. Nature Plants, 2024, 10 (4), pp.689-689. ⟨10.1038/s41477-024-01675-2⟩. ⟨hal-04560316⟩

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Artémis Anest, Yanis Bouchenak-Khelladi, Tristan Charles-Dominique, Félix Forest, Yves Caraglio, et al.. Blocking then stinging as a case of two-step evolution of defensive cage architectures in herbivore-driven ecosystems. Nature Plants, 2024, 10, pp.587-597. ⟨10.1038/s41477-024-01649-4⟩. ⟨hal-04513209⟩

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Clément Aubert, Gilles Le Moguédec, Alvaro Velasco, Xander Combrink, Jeffrey W Lang, et al.. Estimating Total Length of Partially Submerged Crocodylians from Drone Imagery. Drones, 2024, 8, ⟨10.3390/drones8030115⟩. ⟨hal-04524511⟩

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Vincyane Badouard, Sylvain Schmitt, Guillaume Salzet, Thomas Gaquiere, Margaux Rojat, et al.. LoggingLab: An R package to simulate reduced-impact selective logging in tropical forests using forest inventory data. Ecological Modelling, 2024, 487, pp.110539. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2023.110539⟩. ⟨hal-04286637⟩

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Mattia Balestra, Suzanne Marselis, Temuulen Tsagaan Sankey, Carlos Cabo, Xinlian Liang, et al.. LiDAR Data Fusion to Improve Forest Attribute Estimates: A Review. Current Forestry Reports, 2024, 10, pp.281 - 297. ⟨10.1007/s40725-024-00223-7⟩. ⟨hal-04638109⟩

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Julien Barrere, Gauthier Ligot, Vincent Boulanger, Catherine C. Collet, Benoît Courbaud, et al.. Oak regeneration facing deer browsing: Can competition between saplings offset the diversion effect? A simulation experiment. Ecological Modelling, 2024, 489, pp.110608. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2023.110608⟩. ⟨hal-04443596⟩

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Solène Fabre Barroso, Olivier Flores, Pauline Palmas, Robin Pouteau, Jean-Yves Meyer. A Comparative Study of the Floristic Diversity and Structure of Relictual Littoral and Swamp Forests in the Island of Tahiti (French Polynesia, South Pacific). Pacific Science, 2024, 77 (2-3), ⟨10.2984/77.2.7⟩. ⟨hal-04521915⟩

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Ralph Bathelemy, Pierre Brigode, Vazken Andréassian, Charles Perrin, Vincent Moron, et al.. Simbi: historical hydro-meteorological time series and signatures for 24 catchments in Haiti. Earth System Science Data, 2024, 16 (4), pp.2073-2098. ⟨10.5194/essd-16-2073-2024⟩. ⟨hal-04564899⟩

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Claire Baudoux, Achille Biwolé, Olivier Hardy, Bruce Webber, Patrick Heuret. Can the competition dynamics of non-native invaders be reconstructed to reveal historical impact? The case of Cecropia peltata and Musanga cecropioides (Urticaceae) in Cameroon. Biological Invasions, 2024, 26 (1), pp.315-335. ⟨10.1007/s10530-023-03175-4⟩. ⟨hal-04271993⟩

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Simon Beurel, Julien B Bachelier, Jérôme Munzinger, Fuchen Shao, Jörg U. Hammel, et al.. First flower inclusion and fossil evidence of Cryptocarya (Laurales, Lauraceae) from Miocene amber of Zhangpu (China). Fossil Record, 2024, 27 (1), pp.1 - 11. ⟨10.3897/fr.27.109621⟩. ⟨hal-04379772⟩

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Rickarlos Bezandry, Mathilde Dupeyron, Laura Natalia Gonzalez-Garcia, Artemis Anest, Perla Hamon, et al.. The evolutionary history of three Baracoffea species from western Madagascar revealed by chloroplast and nuclear genomes. PLoS ONE, 2024, 19, ⟨10.1371/journal.pone.0296362⟩. ⟨hal-04448243⟩

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Pierre-Alexandre Bliman, Daiver Cardona-Salgado, Yves Dumont, Olga Vasilieva. Optimal Control Approach for Implementation of Sterile Insect Techniques. Journal of Mathematical Sciences, 2024, 279 (5), pp.607-622. ⟨hal-02418508⟩

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Marion Boisseaux, Daniela Nemetschek, Christopher Baraloto, Benoit Burban, Angela Casado-Garcia, et al.. Shifting trait coordination along a soil‐moisture‐nutrient gradient in tropical forests. Functional Ecology, In press, ⟨10.1111/1365-2435.14679⟩. ⟨hal-04750210⟩

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Elise Bouchard, Eric B Searle, Pierre Drapeau, Jingjing Liang, Javier G P Gamarra, et al.. Global patterns and environmental drivers of forest functional composition. Global Ecology and Biogeography, 2024, 33 (2), pp.303 - 324. ⟨10.1111/geb.13790⟩. ⟨hal-04593987⟩

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Clément Bourgoin, Guido Ceccherini, Marco Girardello, Christelle Vancutsem, Valerio Avitabile, et al.. Human degradation of tropical moist forests is greater than previously estimated. Nature 43, 2024, 631, pp.570-576. ⟨10.1038/s41586-024-07629-0⟩. ⟨hal-04636543⟩

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Isabel Cantera, Alexis Carteron, Alessia Guerrieri, Silvio Marta, Aurélie Bonin, et al.. The importance of species addition ‘versus’ replacement varies over succession in plant communities after glacier retreat. Nature Plants, 2024, 10, pp.256-267. ⟨10.1038/s41477-023-01609-4⟩. ⟨hal-04411640⟩

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Gerónimo A Cardozo, Florence Volaire, Pascal Chapon, Charlène Barotin, Karim Barkaoui. Can we identify tipping points of resilience loss in Mediterranean rangelands under increased summer drought?. Ecology, 2024, 108 (9), pp.e4383. ⟨10.1002/ecy.4383⟩. ⟨hal-04675506⟩

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Sarah B Carey, Laramie Aközbek, John T Lovell, Jerry Jenkins, Adam L Healey, et al.. ZW sex chromosome structure in Amborella trichopoda. Nature Plants, 2024, 10, pp.1944-1954. ⟨10.1038/s41477-024-01858-x⟩. ⟨hal-04768060⟩

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Jean-François Carrias, Céline Leroy, Jean-Pierre Aguer, Xuân-Thi Nguyen, Joséphine Leflaive, et al.. Response of anoxygenic and oxygenic phototrophs to an environmental gradient reveals unusual structure of freshwater microbial communities in the bromeliad ecosystem. Hydrobiologia, 2024, ⟨10.1007/s10750-024-05758-1⟩. ⟨hal-04823450⟩

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Alexis Carteron, Isabel Cantera, Alessia Guerrieri, Silvio Marta, Aurélie Bonin, et al.. Dynamics and drivers of mycorrhizal fungi after glacier retreat. New Phytologist, 2024, 242 (4), pp.1739-1752. ⟨10.1111/nph.19682⟩. ⟨hal-04538457⟩

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Abel Yu Hao Chai, Sue Han Lee, Fei Siang Tay, Pierre Bonnet, Alexis Joly. Beyond supervision: Harnessing self-supervised learning in unseen plant disease recognition. Neurocomputing, 2024, 610, pp.128608. ⟨10.1016/j.neucom.2024.128608⟩. ⟨hal-04815172⟩

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Wirong Chanthorn, Thorsten Wiegand, Anuttara Nathalang, Rajapandian Kanagaraj, Stuart Davies, et al.. Species assemblages and their drivers differ between trees and lianas in a seasonal evergreen forest in Thailand. Ecosphere, 2024, 15 (8), ⟨10.1002/ecs2.4942⟩. ⟨hal-04688402⟩

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Marcin Churski, Dries Kuijper, Katharina Semmelmayer, William J. Bond, Joris Cromsigt, et al.. Tree growth‐forms reveal dominant browsers shaping the vegetation. Functional Ecology, 2024, 38 (9), pp.2027-2040. ⟨10.1111/1365-2435.14623⟩. ⟨hal-04727802⟩

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Declan L M Cooper, Simon L Lewis, Martin J P Sullivan, Paulo I Prado, Hans ter Steege, et al.. Consistent patterns of common species across tropical tree communities. Nature, 2024, 625, pp.728-734. ⟨10.1038/s41586-023-06820-z⟩. ⟨hal-04414779⟩

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Rocio Cortés-B., Diego Zapata-Correa, Claes Persson, Piero G Delprete. Alibertia mahechae (Gardenieae, Rubiaceae), a new species from the Eastern Colombian Andes. Phytotaxa, 2024, 675 (2), pp.158-166. ⟨10.11646/phytotaxa.675.2.6⟩. ⟨hal-04830754⟩

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Maximilien Cosme, Arouna Koné, Franck Pommereau, Cédric Gaucherel. Improving livelihood through crop-livestock integration: Insights from a farm trajectory model. Agricultural Systems, 2024, 219, pp.103949. ⟨10.1016/j.agsy.2024.103949⟩. ⟨hal-04653797⟩

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Daniela Cusack, Bradley Christoffersen, Chris Smith-Martin, Kelly Andersen, Amanda Cordeiro, et al.. Toward a coordinated understanding of hydro‐biogeochemical root functions in tropical forests for application in vegetation models. New Phytologist, 2024, 242 (2), pp.351-371. ⟨10.1111/nph.19561⟩. ⟨hal-04536254⟩

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Polyanna da Conceição Bispo, Michelle Picoli, Beatriz Schwantes Marimon, Ben Hur Marimon Junior, Carlos Peres, et al.. Overlooking vegetation loss outside forests imperils the Brazilian Cerrado and other non-forest biomes. Nature Ecology & Evolution, 2024, 8, pp.12-13. ⟨10.1038/s41559-023-02256-w⟩. ⟨hal-04345249⟩

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Alain Danet, Susana Bautista, Alexandre Génin, Andrew P Beckerman, Fabien Anthelme, et al.. Species diversity promotes facilitation under stressful conditions. Oikos, 2024, 2024 (9), pp.e10303. ⟨10.1111/oik.10303⟩. ⟨hal-04574527⟩

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Renato de Lima, Gilles Dauby, André de Gasper, Eduardo Fernandez, Alexander Vibrans, et al.. Comprehensive conservation assessments reveal high extinction risks across Atlantic Forest trees. Science, 2024, 383 (6679), pp.219-225. ⟨10.1126/science.abq5099⟩. ⟨hal-04390223⟩

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Thibaud Decaëns, Marie Luise Carolina Bartz, Alexander Feijoo Martinez, Arnaud Goulpeau, Emmanuel Lapied, et al.. Earthworms (Oligochaeta, Clitellata) of the Mitaraka range (French Guiana): commented checklist with description of one genus and eighteen species new to science. Zoosystema, 2024, 46 (9), ⟨10.5252/zoosystema2024v46a9⟩. ⟨hal-04574470⟩

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Anne-Laure Decombeix, Philipp Hiller, Benjamin Bomfleur. A dwarf conifer tree from the Triassic of Antarctica: the first fossil evidence of suppressed growth in a favorable climate?. Annals of Botany, In press, ⟨10.1093/aob/mcae106⟩. ⟨hal-04647642⟩

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Alain Dejean, Celine Leroy, Bruno Corbara, Frédéric Azemar, Jérôme Orivel. Biological interactions involving the myrmecophyte Hirtella physophora and its associates. Biological Journal of the Linnean Society, 2024, 141 (1), pp.1-16. ⟨10.1093/biolinnean/blad061⟩. ⟨hal-04769529⟩

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Emanuela del Dottore, Alessio Mondini, Nick Rowe, Barbara Mazzolai. A growing soft robot with climbing plant–inspired adaptive behaviors for navigation in unstructured environments. Science Robotics, 2024, 9 (86), ⟨10.1126/scirobotics.adi5908⟩. ⟨hal-04409233⟩

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Baptiste Delaporte, Thomas Arsouze, Gunnar Keppel, Swen Jullien, Christophe Menkes, et al.. StormR: An R package to quantify and map the tropical storms and cyclones’ winds characteristics. Journal of Open Source Software, 2024, 9, pp.5766. ⟨10.21105/joss.05766⟩. ⟨hal-04397086⟩

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Hugo Deléglise, Dimitri Justeau-Allaire, Mark Mulligan, Jhan-Carlo Espinoza, Emiliana Isasi-Catalá, et al.. Integrating multi-objective optimization and ecological connectivity to strengthen Peru's protected area system towards the 30*2030 target. Biological Conservation, 2024, 299, pp.110799. ⟨10.1016/j.biocon.2024.110799⟩. ⟨hal-04747714⟩

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Guillaume Delhaye, Sietse van der Linde, David Bauman, C. David L Orme, Laura M Suz, et al.. Ectomycorrhizal fungi are influenced by ecoregion boundaries across Europe. Global Ecology and Biogeography, 2024, 33 (6), pp.e13837. ⟨10.1111/geb.13837⟩. ⟨hal-04555514⟩

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Piero G Delprete. Supplement to the Rubiaceae in the Flora dos Estados de Goiás e Tocantins, Brazil: Nomenclatural revision, typifications, new records, new identifications, and new combinations. Webbia : Journal of Plant Taxonomy and Geography, 2024, 79 (1), pp.53-182. ⟨10.36253/jopt-15948WEBBIA⟩. ⟨hal-04548724⟩

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Bi‐cheng Dong, Qiang Yang, Nicole Kinlock, Robin Pouteau, Petr Pyšek, et al.. Naturalization of introduced plants is driven by life‐form‐dependent cultivation biases. Diversity and Distributions, 2024, ⟨10.1111/ddi.13788⟩. ⟨hal-04288714⟩

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Jean‐yves Dubuisson, Adèle Nivart, Ehoarn Bidault, Vincent Droissart, Vincent Deblauwe, et al.. Diversity, taxonomy, and history of the tropical fern genus Didymoglossum Desv. (Hymenophyllaceae, Polypodiidae) in Africa. Journal of Systematics and Evolution, 2024, 62 (1), pp.84-101. ⟨10.1111/jse.12951⟩. ⟨mnhn-04082532⟩

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Yves Dumont, Ivric Valaire Yatat–djeumen. About contamination by sterile females and residual male fertility on the effectiveness of the sterile insect technique. Impact on disease vector control and disease control. Mathematical Biosciences, 2024, 370, pp.109165. ⟨10.1016/j.mbs.2024.109165⟩. ⟨hal-04474606⟩

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Yves Dumont, Michel Duprez. Modeling the impact of rainfall and temperature on sterile insect control strategies in a Tropical environment. Journal of Biological Systems, 2024, 32 (1), pp.311-347. ⟨10.1142/S0218339024500128⟩. ⟨hal-03811327v3⟩

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Yves Dumont, Clélia Oliva. On the impact of re-mating and residual fertility on the Sterile Insect Technique efficacy: case study with the medfly, Ceratitis capitata. PLoS Computational Biology, 2024, 20 (5), pp.e1012052. ⟨10.1371/journal.pcbi.1012052⟩. ⟨hal-04190843⟩

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Maxime Dumont, Guilhem Brunel, Paul Tresson, Jérôme Nespoulous, Hassan Boukcim, et al.. Operational sampling designs for poorly accessible areas based on a multi-objective optimization method. Geoderma, 2024, 445, pp.116888. ⟨10.1016/j.geoderma.2024.116888⟩. ⟨hal-04566087⟩

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Amaël Dupaix, Matthieu Lengaigne, Marco Andrello, Nicolas Barrier, Laurent Dagorn, et al.. Floating objects in the open ocean: Unveiling modifications of the pelagic habitat induced by forest cover change and climate variations. Global Environmental Change, 2024, 88, pp.102917. ⟨10.1016/j.gloenvcha.2024.102917⟩. ⟨hal-04727754⟩

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Thibault Durieux, Anne-Laure Decombeix, Carla J Harper, Jean Galtier. Reinvestigation of Stauroxylon beckii , a Possible Aneurophytalean Progymnosperm from the Mississippian of France. International Journal of Plant Sciences, 2024, 185, pp.270-290. ⟨10.1086/729412⟩. ⟨hal-04554406⟩

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Neija Elvekjaer, Laura Martínez-Sanchez, Pierre Bonnet, Alexis Joly, Maria Luisa Paracchini, et al.. Detecting flowers on imagery with computer vision to improve continental scale grassland biodiversity surveying. Ecological Solutions and Evidence, 2024, 5, ⟨10.1002/2688-8319.12324⟩. ⟨hal-04593804⟩

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Joaquim Estopinan, Maximilien Servajean, Pierre Bonnet, Alexis Joly, François Munoz. Mapping global orchid assemblages with deep learning provides novel conservation insights. Ecological Informatics, 2024, 81, pp.102627. ⟨10.1016/j.ecoinf.2024.102627⟩. ⟨hal-04581266⟩

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Shuai Fang, Jing Ren, Marc William Cadotte, Zuoqiang Yuan, Zhanqing Hao, et al.. Disturbance history, neighborhood crowding and soil conditions jointly shape tree growth in temperate forests. Oecologia, 2024, 205, pp.295-306. ⟨10.1007/s00442-024-05570-7⟩. ⟨hal-04640028⟩

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Florent Rumiano, Eve Miguel, Victor Dufleit, Pascal Degenne, Cédric Gaucherel, et al.. Corrigendum to “Spatial mechanistic modelling to simulate movements and contacts between wildlife and livestock in Southern Africa” [ecological modelling 498 (2024) /110863]. Ecological Modelling, 2024, 498, pp.110902. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2024.110902⟩. ⟨hal-04764710⟩

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Yibiao Zou, Constantin Zohner, Colin Averill, Haozhi Ma, Julian Merder, et al.. Positive feedbacks and alternative stable states in forest leaf types. Nature Communications, 2024, 15 (1), pp.4658. ⟨10.1038/s41467-024-48676-5⟩. ⟨hal-04725224⟩

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Article de blog scientifique

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Lydie Messado. Pourquoi certaines fleurs sentent bon et d’autres non ?. 2024. ⟨hal-04461700⟩

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Communication dans un congrès

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Yuchen BAI, Jean-Baptiste Durand, Florence Forbes, Grégoire Vincent. Estimation of leaf area index using simulated UAV laser Scanning. TRIDIFOR 2024 – Méthodes innovantes d’analyse de données 3D en forêt, GIP ECOFOR, Nov 2024, en ligne, France. ⟨hal-04837384⟩

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Yuchen BAI, Jean-Baptiste Durand, Grégoire Vincent, Florence Forbes. Semantic segmentation of forest point clouds using neural network. JDS 2024 - 55èmes Journées de Statistique de la SFdS, May 2024, Bordeaux, France. pp.1-10. ⟨hal-04653198⟩

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Anais A Boura, Brigitte Meyer-Berthaud, Anne-Laure Decombeix. Exploration de la diversité anatomique du bois au travers des temps géologiques : ce que nous révèlent les plantes fossiles. Journée Xylogénèse 2024, Jun 2024, Orléans, France. ⟨insu-04621763⟩

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Benoît Courbaud, François de Coligny, Laurent Larrieu, Matthieu Fortin, Gauthier Ligot, et al.. Simulating forest dynamics during field marteloscope exercises to analyze the effects of silviculture on ecosystem services and biodiversity. 26. IUFRO World Congress 2024, Jun 2024, Stockholm, Sweden. ⟨hal-04679137⟩

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Manon de la Tousche, Pierre-Alexandre Bliman, Yves Dumont. Modeling population dynamics and control strategies for a unique species evolving in heterogenous landscape. 15 th Conference on Dynamical Systems Applied to Biology and Natural Sciences (DSABNS 2024), Feb 2024, Lisbonne, Portugal. pp.194. ⟨hal-04495187⟩

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Anne-Laure Decombeix, Thibault Durieux, Carla J Harper, Brigitte Meyer-Berthaud, Jean Galtier. Permineralized plants from the Lydiennes Formation (France): a unique record of early Carboniferous plant diversity and biology. IBC 2024 - XX International Botanical Congress, Jul 2024, Madrid, Spain. ⟨hal-04708829⟩

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Anne-Laure Decombeix. Down by the water-Aerenchyma in Devonian and early Carboniferous plants. XI International Organisation Palaeobotany Conference (IOPC), The International Organisation of Palaeobotany, May 2024, Prague (CZ), Czech Republic. ⟨hal-04611104⟩

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Yves Dumont. On some mathematical issues about the Sterile Insect Technique against fruit fly. KSMB - SMB, Jul 2024, Seoul (Korea), South Korea. ⟨hal-04652120⟩

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Yves Dumont. The Sterile Insect Technique against fruit flies. Some new mathematical results. BIOMATH 2024: Annual International Conference on Mathematical Methods and Models in Biosciences, Jun 2024, Scottburgh, South Africa. ⟨hal-04652115⟩

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Thibault Durieux, Anne-Laure Decombeix, Carla J Harper. The diversity of architectural models in cladoxylopsids: insights from anatomically preserved Cladoxylon taeniatum specimens from France. XI International Organisation Palaeobotany Conference, May 2024, Prague (CZ), Czech Republic. ⟨hal-04611137⟩

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Bayle Florian, Clair Bruno, Robert Le Roy, Patrick Heuret, Xavier Morin, et al.. CONstruire en BOis avec les forêts de demain (CONBO): relations entre trajectoires de croissance et comportement mécanique des feuillus secondaires. 13èmes journées du GDR 3544 « Sciences du bois », Nov 2024, Nantes, France. pp.200-201. ⟨hal-04828104⟩

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Hervé Goëau, Vincent Espitalier, Pierre Bonnet, Alexis Joly. Overview of PlantCLEF 2024: multi-species plant identification in vegetation plot images. CLEF 2024 Working Notes - 25th Conference and Labs of the Evaluation Forum, Guglielmo Faggioli; Nicola Ferro; Petra Galuščáková; Alba García Seco de Herrera, Sep 2024, Grenoble, France. pp.1978-1988. ⟨hal-04806900⟩

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Marie Gosme, Kristoffer Ronn-Anderson, Birk Skyum, Clément Rigal, Raphaël Paut, et al.. AgroforesTreeAdvice: an advice aggregator for tree species selection for agroforestry systems. 7th European Agroforestry Conference, Mendel University, May 2024, Brno, Czech Republic. pp.300-301, ⟨10.11118/978-80-7509-982-2⟩. ⟨hal-04653766⟩

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Alexis Joly, Lukáš Picek, Stefan Kahl, Hervé Goëau, Vincent Espitalier, et al.. LifeCLEF 2024 Teaser: Challenges on Species Distribution Prediction and Identification. ECIR 2024 - 46th European Conference on Information Retrieval, Mar 2024, Glasgow, United Kingdom. pp.19-27, ⟨10.1007/978-3-031-56072-9_3⟩. ⟨hal-04667635⟩

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Alexis Joly, Lukáš Picek, Stefan Kahl, Hervé Goëau, Vincent Espitalier, et al.. Overview of LifeCLEF 2024: Challenges on Species Distribution Prediction and Identification. CLEF 2024 - 15th International Conference of the Cross-Language Evaluation Forum for European Languages, Sep 2024, Grenoble, France. pp.183-207, ⟨10.1007/978-3-031-71908-0_9⟩. ⟨hal-04830385⟩

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Stefan Kahl, Tom Denton, Holger Klinck, Vijay Ramesh, Viral Joshi, et al.. Overview of BirdCLEF 2024: Acoustic Identification of Under-studied Bird Species in the Western Ghats. CLEF 2024 Working Notes - 25th Conference and Labs of the Evaluation Forum, Sep 2024, Grenoble, France. pp.1948-1957. ⟨hal-04719578⟩

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Mathilde Le Pallec, Anne-Laure Decombeix. The Asselian flora of the Lodève Basin, France: diversity and significance of a classical early Permian assemblage. XI International Organisation Palaeobotany Conference, May 2024, Prague (CZ), Czech Republic. ⟨hal-04611211⟩

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Tanguy Lefort, Antoine Affouard, Pierre Bonnet, Benjamin Charlier, Alexis Joly, et al.. Cooperative learning of Pl@ntNet’s Artificial Intelligence algorithm using label aggregation. JDS 2024 - 55es Journées de Statistique, Société Française de Statistique, May 2024, Bordeaux, France. pp.35-44. ⟨hal-04574223⟩

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Jerad Zherui Liaw, Abel Yu Hao Chai, Sue Han Lee, Pierre Bonnet, Alexis Joly. Can Language Improve Visual Features For Distinguishing Unseen Plant Diseases?. ICPR 2024 - 27th International Conference on Pattern Recognition, Dec 2024, Kolkata, India. pp.296-311, ⟨10.1007/978-3-031-78113-1_20⟩. ⟨hal-04851648⟩

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Manoela Machado, Wesley da Cruz, M.A. Carniello, E. Sturdivant, F. Navarro-Rosales, et al.. Fire impacts in the Cerrado: Integrating LiDAR and field data to monitor vegetation structure and post-fire recovery. EGU General Assembly, Apr 2024, Vienne, Austria. en ligne [2 p.], ⟨10.5194/egusphere-egu24-19716⟩. ⟨hal-04888238⟩

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Brigitte Meyer-Berthaud, Antoine Champreux, Anne-Laure Decombeix. Adding to the diversity of a latest Devonian gondwanan plant assemblage : a new anatomically preserved axis from Barraba, Australia. XI International Organisation Palaeobotany Conference, May 2024, Prague (CZ), Czech Republic. ⟨hal-04612426⟩

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Lukáš Picek, Christophe Botella, Maximilien Servajean, César Leblanc, Remi Palard, et al.. Overview of GeoLifeCLEF 2024: Species Composition Prediction with High Spatial Resolution at Continental Scale using Remote Sensing. CLEF 2024 Working Notes - 25th Conference and Labs of the Evaluation Forum, Sep 2024, Grenoble, France. pp.1966-1977. ⟨hal-04720817⟩

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Lukáš Picek, Christophe Botella, Maximilien Servajean, César Leblanc, Rémi Palard, et al.. GeoPlant: Spatial Plant Species Prediction Dataset. NeurIPS 2024 - 38th Conference on Neural Information Processing Systems, Dec 2024, Vancouver, Canada. ⟨hal-04852083⟩

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Franck Pommereau, Cédric Gaucherel. A Multivalued, Spatialized, and Timed Modelling Language for Social-Ecological Systems. International Workshop on Petri Nets and Software Engineering (PNSE 2024), Jun 2024, Genève, Switzerland. pp.13--32. ⟨hal-04667502⟩

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Nick P Rowe, Patricia Soffiatti, Patrick Heuret, Tom Hattermann. Plants move : diversity of movements and strategies of climbing plants in tropical forests. ROBOSOFT 2024 - 7th IEEE-RAS International Conference on Soft Robotics, Apr 2024, San Diego, CA, United States. ⟨hal-04794003⟩

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C. Segura-Garcia, David Bauman, Vera L. S. Arruda, A. Alencar, Imma Oliveras Menor. Human land occupation regulates the effect of the climate on the burned area of the Cerrado biome. EGU General Assembly, Apr 2024, Vienne, Austria. en ligne [2 p.], ⟨10.5194/egusphere-egu24-10377⟩. ⟨hal-04888271⟩

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Clément Stahl, Ghislain Vieilledent. Mechanistic traits to predict shifts in tree species abundance and distribution with climate change in the Amazonian forest. Report of the strategic project 2020-2023. Labex CEBA annual meeting 2024, Oct 2024, Cayenne (Guyane), France. ⟨hal-04673147⟩

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Adrien Staquet, Christophe Proisy, Ludovic Granjon, Tanguy Maury, Paul-Emile Augusseau, et al.. Establishment of mangroves on a new mud bank by a combination of UAS SfM photogrammetry and LiDAR monitoring. ISPRS TC III Mid-term Symposium “Beyond the canopy: technologies and applications of remote sensing”, Polidori, Laurent; Gomes, Alessandra; Faure, Jean-François, Nov 2024, Belem, Brazil. pp.527 - 532, ⟨10.5194/isprs-archives-xlviii-3-2024-527-2024⟩. ⟨hal-04788874⟩

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Chapitre d'ouvrage

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Sandrine Isnard, Tanguy Jaffré. What Makes New Caledonia’s Flora So Outstanding?. Matthias Kowasch; Simon P. J. Batterbury. Geographies of New Caledonia-Kanaky : Environments, politics and cultures, Springer Nature, pp.21 - 32, 2024, 978-3-031-49139-9. ⟨10.1007/978-3-031-49140-5_3⟩. ⟨hal-04562811⟩

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Stéphan Marette, Caroline Lejars, Diane Briard, Christophe Chassard, Véronique Decroocq, et al.. Vers des recherches dé-coïncidentes dans un contexte de fragilité des écosystèmes et des systèmes agroalimentaires. Une recherche dé-coïncidente pour se préparer aux crises environnementales et alimentaires, Editions Quae, pp.11-19, 2024, Hors collection, 978-2-7592-3895-8. ⟨hal-04693521⟩

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François Munoz, Pierre Bonnet. New Automatic Identification Tools: An Aid for Botanists and Nature Managers ?. Emilie Kohlmann. Linking with Nature in the Digital Age: Volume 1 - Communication, Environment, Science and Society SET, 1, ISTE; Wiley, pp.161-175, 2024, 9781786308580. ⟨10.1002/9781394297580.ch9⟩. ⟨hal-04643105⟩

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HDR

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Nicolas Barbier. From leaf to satellite, dynamics and functioning of tropical vegetation. Environmental Sciences. Université de Montpellier (UM), FRA, 2024. ⟨tel-04653724⟩

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Autre publication scientifique

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Jean Luc Maeght, Merlin Ramel, Ammar Shihan, Quentin Le Blaye, Stéphane Fourtier, et al.. Practice Abstract - How to measure tree root growth in a forest. Practice Abstract, 2024. ⟨hal-04426569⟩

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Ouvrages

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Evanne Camps, Marion Schwartz, Thomas Le Bourgeois. AdvenRun II - Principales adventices de La Réunion. CIRAD, pp.239, 2024. ⟨hal-04785494⟩

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Stéphan Marette, Caroline Lejars, Diane Briard, Christophe Chassard, Véronique Decroocq, et al.. Une recherche dé-coïncidente pour se préparer aux crises environnementales et alimentaires. éditions Quae, 161 p., 2024, Hors collection, 978-2-7592-3895-8. ⟨10.35690/978-2-7592-3895-8⟩. ⟨hal-04630167⟩

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Poster de conférence

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David Bauman, S.M. Mcmahon, Yadvinder Malhi, Oliver L. Philips, William Farfan-Rios, et al.. Climate change effects on tree growth are mediated by local average climate in tropical moist forests [poster]. British Ecological Society Annual Meeting 2024, Dec 2024, Liverpool, United Kingdom. 1 p. multigr., 2024. ⟨hal-04840497⟩

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Evanne Camps, Marion Schwartz, Thomas Le Bourgeois. AdvenRun II : guide des principales adventices de La Réunion. Comité scientifique et technique du DPP CAPTerre 2024, Sep 2024, Saint-Gilles (Ile de la Réunion), France. ⟨hal-04785422⟩

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Alexandre de Haldat Du Lys, Lecoq Mathis, Yves Caraglio, Claire Atger, Eric-André Nicolini. Morphological Indicators of Young Tree Health and Recovery in Agroforestry Systems. 18e congrès de la Société Européenne d'Agronomie, Aug 2024, Rennes (FRA), France. ⟨hal-04808412⟩

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Anne-Laure Decombeix, Verlingue Killian. Foss-AI, an exploratory project using deep learning to extract paleobiological and paleoenvironmental data from fossil woods. IBC 2024 - XX International Botanical Congress, Jul 2024, Madrid, Spain. ⟨hal-04695310⟩

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Basile Hélie, Patrick Techer, Sandrine Auzoux, Rose-My Payet, Emmanuel Hoarau, et al.. Les plantes de service au bénéfice des agrosystèmes tropicaux : de la collection à Wiktrop. Comité scientifique et technique du DPP CAPTerre 2024, 2024, Saint-Denis, La Réunion, France. ⟨hal-04806517⟩

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Sarah Lewis, Constant Yves Adou Yao, Karim Barkaoui, Stéphanie M. Carrière, Marc Jaeger, et al.. Contribution of in-plot exchanges between farmers and scientists to knowledge hybridization: a case study in cocoa agroforestry systems in Côte d'Ivoire. 18th Congress of the European Society for Agronomy “Synergies for a resilient future: from knowledge to action”, Aug 2024, Rennes, France, France. ⟨hal-04687608⟩

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Christophe Proisy. Poster de présentation du living lab Magellan - Réseau de living labs Solu-Biod. Lancement officiel du Programme national de recherche sur les Solutions fondées sur la Nature, Apr 2024, Lyon, France. ⟨hal-04595875⟩

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Christophe Proisy, Antoine Gardel. Poster de présentation du living lab Magellan - Réseau de living labs SOLU-BIOD. Lancement officiel du Programme national de recherche sur les Solutions fondées sur la Nature, Apr 2024, Lyon, France. ⟨hal-04828622⟩

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Proceedings/Recueil des communications

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Elodie Blanchard, Thibault Catry, Quentin Marsal, Eric Delaître, Christophe Proisy, et al.. Monitoring mangroves with multi-sensor Earth Observation data sets: from one-shot historical cartography to online and near-real-time monitoring tools. ISPRS TC III Mid-term Symposium “Beyond the canopy: technologies and applications of remote sensing”, ISPRS International Archives of the Photogrammetry, Remote Sensing and Spatial Information Sciences, XLVIII-3-2024, Copernicus, pp.35-41, 2024, ⟨10.5194/isprs-archives-XLVIII-3-2024-35-2024⟩. ⟨hal-04776708⟩

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Siham Wakib, Ahmed El Bakkali, Hayat Zaher, Abdelillah Meddich, A. Aouabe, et al.. A comparative study of phenotypic traits linked to drought tolerance in 83 olive tree varieties grown in Moroccan and French collections. All Africa Horticultural Congress, Acta Horticulturae, International Society for Horticultural Science, 2024. ⟨hal-04785900⟩

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Rapport

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Marie Gosme, Tom De Swaef, Christian Dupraz, Marc Jaeger, Karen Lammoglia, et al.. DigitAF Deliverable 2.5: Plan for improvement of existing tools/models for tree and crop productivity. INRAE. 2024, pp.19. ⟨hal-04711263⟩

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Jean-Claude Gregoire, Martin Godefroid, Hervé Jactel, Raphaëlle Mouttet, Cécile Robin, et al.. Avis de L'Anses relatif à « la catégorisation de Trichoferus campestris ». Saisine n°2023-SA-0028, Anses. 2024, 28 p. ⟨anses-04855184⟩

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Eric Lombaert, Aurélien Salle, Thomas Le Bourgeois, Thierry Candresse, Philippe Castagnone, et al.. Avis de l’Anses relatif à l’« Evaluation du risque lié à Scirtothrips ginkgoe pour la France métropolitaine et l’Union européenne ». Saisine n°2024-SA-0111, Anses. 2024, 26 p. ⟨anses-04855283⟩

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François Verheggen, Nicolas Desneux, Pierre-François Duyck, Martin Godefroid, Philippe Ryckewaert, et al.. Demande d’évaluation du risque simplifiée (ERS) lié à l’introduction de Bactrocera dorsalis pour la France métropolitaine. Saisine n°2023-SA-0018, Anses. 2024, 144 p. ⟨anses-04562842⟩

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Thèse

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Clément Aubert. Conservation des crocodiliens : intérêt de l’approche de la conservation communautaire et apport des drones comme nouvel outil d’inventaire et de suivi de populations. Sciences de l'environnement. Université de Montpellier (UM), FRA, 2024. Français. ⟨NNT : ⟩. ⟨tel-04599948⟩

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Paul-Emile Augusseau. Modélisation des fluctuations du trait de côte mer-mangrove sous l’influence de(s) processus hydrosédimentaires en Guyane Française. Approche de la dynamique du paysage de mangrove pour des bilans de vulnérabilité côtière et de séquestration du carbone. Sciences de l'environnement. Université de Guyane, 2024. Français. ⟨NNT : ⟩. ⟨tel-04871299⟩

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Yuchen BAI. Simulation et modèle d'apprentissage automatique pour l'évaluation et la réduction des biais dans les estimateurs de densité foliaire des forêts tropicales. Mathématiques [math]. Université Grenoble - Alpes, 2024. Français. ⟨NNT : ⟩. ⟨tel-04867740⟩

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Juliette Picard. The spatio-temporal dynamics of Marantaceae forests in central Africa. Environmental Sciences. Université de Montpellier, 2024. English. ⟨NNT : ⟩. ⟨tel-04870145⟩

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Simon Rodrigue Tega II. Mathematical modelling and analysis of spatio-temporal models dedicated to tree-grass dynamics in humid savannas. Mathematics [math]. Université de Yaoundé 1 (Cameroun), 2024. English. ⟨NNT : ⟩. ⟨tel-04769721⟩

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Donatien Zébazé. Banque de graines du sol et végétation du sous-bois des forêts du Sud-est du Cameroun. Biodiversité et Ecologie. Université de Liège (Belgique), 2024. Français. ⟨NNT : ⟩. ⟨tel-04826595⟩

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Pré-publication, Document de travail

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Pierre-Alexandre Bliman, Manon de la Tousche, Yves Dumont. Feasibility and optimization results for elimination by mass-trapping in a metapopulation model. 2024. ⟨hal-04688245⟩

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Louise Brousseau, Sylvain Santoni, Audrey Weber, Guillaume Odonne. Natural and human-mediated drivers of microevolution in Neotropical palms: a historical genomics approach. 2024. ⟨hal-04633302⟩

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Louis Devresse, François de Coligny, Freya Way, Xavier Morin. Evolutionary rescue in a mixed beech-fir forest: insights from a quantitative-genetics approach in a process-based model. 2024. ⟨hal-04575070v2⟩

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Yves Dumont, Michel Duprez, Yannick Privat. Sterile Insect Technique in a Patch System: Influence of Migration Rates on Optimal Single-Patch Releases Strategies. 2024. ⟨hal-04693417⟩

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Cedric Gaucherel, Stolian Fayolle, Raphael Savelli, Olivier Philippine, Franck Pommereau, et al.. Diagnosis of planktonic trophic network dynamics with sharp qualitative changes. 2024. ⟨hal-04395166⟩

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Camille Girard-Tercieux, Ghislain Vieilledent, Adam T Clark, James S. Clark, Benoit Courbaud, et al.. Beyond variance: simple random distributions are not a good proxy for intraspecific variability in systems with environmental structure. 2024. ⟨hal-04398209⟩

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Dominique Lamonica, Lison Charvy, Dave Kuo, Clémentine Fritsch, Michael Coeurdassier, et al.. A brief review on models for birds exposed to chemicals. 2024. ⟨hal-04438562v2⟩

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Tanguy Lefort, Antoine Affouard, Benjamin Charlier, Jean-Christophe Lombardo, Mathias Chouet, et al.. Cooperative learning of Pl@ntNet's Artificial Intelligence algorithm: how does it work and how can we improve it?. 2024. ⟨hal-04603038v2⟩

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Maxime Lenormand, Jean-Baptiste Féret, Guillaume Papuga, Samuel Alleaume, Sandra Luque. Coupling in situ and remote sensing data to assess $α$- and $β$-diversity over biogeographic gradients. 2024. ⟨hal-04729405⟩

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Moses Libalah Bakonck, Adeline Fayolle, Nicolas Barbier, Nicolas Picard, Stephane Momo Takoudjou, et al.. Allometric options for predicting tropical tree height and crown area from stem diameter. 2024. ⟨hal-03996608⟩

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Testé Marc, Engel Julien, Mabobet Kevin, Mestre Mickael, Louise Brousseau. Landscape-scale spatial variations of pre-Columbian anthropogenic disturbances at three ring ditch sites in French Guiana. 2024. ⟨hal-04633316⟩

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Isabelle Maréchaux, Fabian Jörg Fischer, Sylvain Schmitt, Jérôme Chave. TROLL 4.0: representing water and carbon fluxes, leaf phenology and intraspecific trait variation in a mixed-species individual-based forest dynamics model – Part 1: Model description. 2024. ⟨hal-04769295⟩

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Christina Mathias, Julien Chetty, Aude Ripoche, Antoine Versini, Karim Barkaoui, et al.. A long-term multi-criteria analysis of sugarcane intercropping compared to conventional cropping systems. 2024. ⟨hal-04590580⟩

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Eduardo Moreno-Chamarro, Thomas Arsouze, Mario Acosta, Pierre-Antoine Bretonnière, Miguel Castrillo, et al.. The very-high resolution configuration of the EC-Earth global model for HighResMIP. 2024. ⟨hal-04701037⟩

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Daniela Nemetschek, Claire Fortunel, Eric Marcon, Johanna Auer, Vincyane Badouard, et al.. Love thy neighbour? Tropical tree growth and its response to climate anomalies is mediated by neighbourhood hierarchy and dissimilarity in carbon and water related traits.. 2024. ⟨hal-04816765⟩

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Ronaldo Oliveira-Filho, Mariana Antunes, Joelson Musiello-Fernandes, Rodrigo Guéron, Helen Audrey Pichler, et al.. Decapod Community Composition is Seasonally Driven by Different Environmental Factors in an Estuarine-Coastal Gradient (Eastern Brazil). 2024. ⟨hal-04711528⟩

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Sylvain Schmitt, Fabian J Fischer, James G C Ball, Nicolas Barbier, Marion Boisseaux, et al.. TROLL 4.0: representing water and carbon fluxes, leaf phenology, and intraspecific trait variation in a mixed-species individual-based forest dynamics model – Part 2: Model evaluation for two Amazonian sites. 2024. ⟨hal-04769801⟩

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Xianhui Shen, Antoine Wystrach, Uriel Gélin, Tristan Charles-Dominique, Kyle Tomlinson. A comparative study of navigation behaviours in ants. 2024. ⟨hal-04796615⟩

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