Publications HAL de la structure ;553450;1043280;1061099;553451;1043278;1061100;553452;1043279;1061098;1153147;1153146;1153148

2025

Journal articles

titre
Penalized likelihood optimization for censored missing value imputation in proteomics
auteur
Lucas Etourneau, Laura Fancello, Samuel Wieczorek, Nelle Varoquaux, Thomas Burger
article
Biostatistics, 2025, 26 (1), ⟨10.1093/biostatistics/kxaf006⟩
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https://hal.science/hal-05002295/file/2023.11.09.566355v2.full.pdf BibTex
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MNX1 prevents somatostatin expression in human beta cells by repressing PERCC1
auteur
Farah Kobaisi, Alexis Fouque, Philippe Ravassard, Olivier Albagli-Curiel, Raphael Scharfmann
article
Diabetologia, 2025, ⟨10.1007/s00125-025-06620-2⟩
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titre
Efficient Fine-Tuning of Endothelial Gene Expression by a Single Tyrosine (Y 685 ) to Phenylalanine Point Mutation in the VE-Cadherin Gene
auteur
Olivia Garnier, Florian Jeanneret, Aude Durand, Arnold Fertin, Sarah Berndt, Gilles Carpentier, Christophe Battail, Donald Martin, Isabelle Vilgrain
article
Arteriosclerosis, Thrombosis, and Vascular Biology, 2025, 45 (10), pp.1852-1871. ⟨10.1161/ATVBAHA.125.323129⟩
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Leveraging knowledge for explainable AI in personalized cancer treatment: challenges and future directions
auteur
Emilia Daghir-Wojtkowiak, Javier Alfaro, Michele Mastromattei, Aleksander Palkowski, Mark Stares, Ana Roca-Umbert, Andraz Krajnc, Riccardo Leoni, Anne Boland, Aria Nourbaksh, Ashwin Kallor, Camille Ducki, Davide Venditti, Carla Montesano, Chiara Cipriani, Daniel Faria, Delphine Pflieger, Elisa Zago, Etienne Bardet, Filipa Serrano, Florian Jeanneret, Damien Alouges, Liangwei Yin, Elodine Coquelet, Apolline Bacquet, Francesco Bonchi, Francesco Maiorino, Francesco Torino, Georges Bedran, Jean-Alexandre Long, Laura Balbi, Laurent Guyon, Liana Bevilacqua, Manuel Fiorelli, Marie-Catherine Wagner, Mario Reyes, Mario Roselli, Marta Contreiras Silva, Michal Waleron, Nikolas Dovrolis, Odile Filhol-Cochet, In Hwa Um, Georg Wolflein, Patrícia Eugénio, Pauline Bazelle, Pavlos Golnas, Peter Thorpe, Pierluigi Bove, Piyush Borole, Roberta Bernardini, Rohit Kumar, Rosella Cicconi, Saskia Kaltenbrunner, Saverio Gravina, Simona Brezar, Stefan Symeonides, Steven Mcginn, Susana Nunes, Ted Hupp, Yuri Gordienko, Dimitrios Varvaras, Sergii Stirenko, Luciano Xumerle, Stefania Mariani, Assilah Bouzit, Stéphane Gazut, Heiko Poth, Kyriakos Souliotis, Hector Katifelis, Elena Verzoni, Giuseppe Procopio, Sarah Schoch, Francisco Lupiáñez-Villanueva, Sandra Türk, Katarzyna Barud, Dimitri Koroliouk, Juan Caubet, Yamir Moreno, Jean-Luc Descotes, Christina Golna, Valentina Guadalupi, Paolo Garagnani, Maria Gazouli, Jean-François Deleuze, Frans Folkvord, Nikolaus Forgó, David J Harrison, Håkan Axelson, Armando Stellato, Maurizio Mattei, Ajitha Rajan, Alexander Laird, Christophe Battail, Catia Pesquita, Fabio Massimo Zanzotto
article
Frontiers in Digital Health, 2025, 7, ⟨10.3389/fdgth.2025.1637195⟩
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https://hal.science/hal-05371689/file/FrontiersDigitalHealth_2025_consortiumKATY.pdf BibTex
titre
Deubiquitinating enzyme UCH-L1 regulates neuronal Ca2+ signalling
auteur
Marie Perrier, Desirée Loreth, Johannes Brand, Laurence Aubry, Timothy Harrison, Xavier Jacq, Edward Tate, Gian-Marvin Kipka, Malte Gersch, Catherine Meyer-Schwesinger, Marie-Odile Fauvarque, Alexandre Bouron
article
ACS Chemical Neuroscience, 2025, 16 (20), ⟨10.1021/acschemneuro.5c00510⟩
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https://hal.science/hal-05282201/file/file%20for%20HAL.pdf BibTex
titre
The deubiquitinase USP36 funtions through catalytic-dependent and catalytic-independent mechanisms in Drosophila
auteur
Carmen Coirry, Julie Manessier, Charlène Clot, Magda Mortier, Marie-Odile Fauvarque, Emmanuel Taillebourg
article
Genetics, 2025, 231, ⟨10.1093/genetics/iyaf131⟩
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https://hal.science/hal-05266935/file/iyaf131.pdf BibTex
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Functional study of Phaeodactylum tricornutum Seipin highlights specificities of lipid droplets biogenesis in diatoms
auteur
Damien Le Moigne, Marta Carletti, Chems Amari, Rachel Bonnarde, Fabien Richard, Catherine Albrieux, Mégane Mahieu, Matteo Arrighi, Grégory Si-Larbi, Pierre‐henri Jouneau, Valérie Gros, Mathilde Louwagie, Sylvaine Roy, Yangmin Gong, Yufang Pan, Hanhua Hu, Olivier Bastien, Juliette Jouhet, Alberto Amato, Eric Maréchal, Juliette Salvaing
article
New Phytologist, 2025, 247 (5), pp.2245-2269. ⟨10.1111/nph.70350⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-05147856/file/nph70350_uncorrected.pdf BibTex
titre
The inflammasome sensor NLRP3 interacts with REV7 to maintain genome integrity through homologous recombination
auteur
Delphine Burlet, Md Muntaz Khan, Sabine Hacot, Hannes Buthmann, Léa Bardoulet, Anne-Laure Huber, Julie Gorry, Bastian Föhr, Bernard Lopez, Yohann Couté, Alex Faesen, Matthias Geyer, Agnès Tissier, Virginie Petrilli
article
Nucleic Acids Research, 2025, ⟨10.1101/2024.11.28.625806⟩
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https://hal.science/hal-04970670/file/gkaf554.pdf BibTex
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Methylglyoxal-Induced Glycation of Plasma Albumin: From Biomarker Discovery to Clinical Use for Prediction of New-Onset Diabetes in Individuals with Prediabetes
auteur
Arsênio Rodrigues Oliveira, Chloé Chevalier, Matthieu Wargny, Victoria Pakulska, Cédric Caradeuc, Chloé Cloteau, Marine Letertre, Nicolas Giraud, Gildas Bertho, Maxime Carpentier, Georges Nouadje, Yohann Couté, Cedric Le May, Bertrand Cariou, Samy Hadjadj, Mikaël Croyal
article
Clinical Chemistry, 2025, 71 (6), pp.688-699. ⟨10.1093/clinchem/hvaf035⟩
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Peptide recognition and mechanism of the radical S -Adenosyl- l -methionine multiple cyclophane synthase ChlB
auteur
Jérémie Ruel, Thi Quynh Ngoc Nguyen, Yohei Morishita, Anthony Usclat, Lydie Martin, Patricia Amara, Sylvie Kieffer-Jaquinod, Maria Cristina Stefanoiu, Eugenio de la Mora, Brandon Morinaka, Yvain Nicolet
article
Journal of the American Chemical Society, 2025, 147 (20), pp.16850-16863. ⟨10.1021/jacs.4c16004⟩
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https://hal.science/hal-05065181/file/Rual%20et%20al.%20JACS.pdf BibTex
titre
Proteomics-based characterization of ribosome heterogeneity in adult mouse organs
auteur
Marie R Brunchault, Anne-Marie Hesse, Julia Schaeffer, Albrecht Fröhlich, Ana Saintpierre, Charlotte Decourt, Florence Combes, Homaira Nawabi, Yohann Couté, Stephane Belin
article
Cellular and Molecular Life Sciences, 2025, 82 (1), pp.175. ⟨10.1007/s00018-025-05708-7⟩
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https://hal.science/hal-05106054/file/s00018-025-05708-7%20%282%29.pdf BibTex
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Mind Your Spectra: Points to be Aware of When Validating the Identification of Isobaric Histone Peptidoforms
auteur
Hassan Hijazi, Julie Manessier, Sabine Brugière, Tina Ravnsborg, Marie Courçon, Baptiste Brulé, Karine Merienne, Ole Jensen, Anne-Marie Hesse, Christophe Bruley, Delphine Pflieger
article
Journal of Proteome Research, 2025, 24 (5), pp.2408-2418. ⟨10.1021/acs.jproteome.4c01056⟩
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https://hal.science/hal-05238110/file/Hijazi-etal_jpr_revision.pdf BibTex
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Pacmanvirus isolated from the Lost City hydrothermal field extends the concept of transpoviron beyond the family Mimiviridae
auteur
Sébastien Santini, Audrey Lartigue, Jean-Marie Alempic, Yohann Couté, Lucid Belmudes, William J Brazelton, Susan Q Lang, Jean-Michel Claverie, Matthieu Legendre, Chantal Abergel
article
The International Society of Microbiologial Ecology Journal, 2025, 19 (1), ⟨10.1093/ismejo/wraf002/7950992⟩
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https://amu.hal.science/hal-04886539/file/wraf002.pdf BibTex
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Photoreceptor-induced LHL4 protects the photosystem II monomer in Chlamydomonas reinhardtii
auteur
Marie Dannay, Chloé Bertin, Eva Cavallari, Pascal Albanese, Dimitri Tolleter, Cécile Giustini, Mathilde Menneteau, Sabine Brugière, Yohann Couté, Giovanni Finazzi, Emilie Demarsy, Roman Ulm, Guillaume Allorent
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2025, 122 (7), pp.e2418687122. ⟨10.1101/2024.02.23.581703⟩
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Phototropin connects blue light perception to starch metabolism in green algae
auteur
Yizhong Yuan, Anthony Iannetta, Minjae Kim, Patric Sadecki, Marius Arend, Angeliki Tsichla, M. Águila Ruiz-Sola, Georgios Kepesidis, Denis Falconet, Emmanuel Thevenon, Marianne Tardif, Sabine Brugière, Yohann Couté, Jean Philippe Kleman, Irina Sizova, Marion Schilling, Juliette Jouhet, Peter Hegemann, Yonghua Li‐beisson, Zoran Nikoloski, Olivier Bastien, Leslie Hicks, Dimitris Petroutsos
article
Nature Communications, 2025, 16 (1), pp.2545. ⟨10.1038/s41467-025-57809-3⟩
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https://hal.science/hal-04463739/file/Yuan%20et%20al.%20Nature%20communications.pdf BibTex

Books

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Biomimetic Membrane Technology
auteur
Donald Martin, Isabelle Vilgrain
article
Springer Nature Switzerland, 2025, ⟨10.1007/978-3-031-90594-0⟩
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Preprints, Working Papers, ...

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Elucidating the interaction network of one of the largest icosahedral capsids in the virosphere
auteur
Hela Safi, Alain Schmitt, Alwena Tollec, Lucid Belmudes, Agathe Colmant, Olivier Poirot, Sebastien Santini, Matthieu Legendre, Yohann Couté, Hugo Bisio, Chantal Abergel
article
2025
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titre
Both L-lactyl and D-lactyl enantiomers modify histones in mouse testis
auteur
Julie Manessier, Hassan Hijazi, Sabine Brugière, Marie Courçon, Christophe Masselon, Alberto de la Iglesia, Julie Cocquet, Delphine Pflieger
article
2025
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https://hal.science/hal-05369553/file/2025.10.09.681385v1.full.pdf BibTex
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CARM1-mediated methylation controls interactions of ALIX with key partners important for cytokinesis
auteur
Solène Huard, Samyuktha Suresh, Jessica Vayr, Sonia Ruggiero, Rayan Dakroub, Vanessa Masson, Anđela Petrović, Rayane Dibsy, Julie Thomsen, Yara Hajj Younes, Clémence Vissotsky, Louise Amara, Lucid Belmudes, Christine Chatellard, Rémy Sadoul, Ahmed El Marjou, Yohann Couté, Damarys Loew, Raphaël Guérois, Nicolas Reynoird, Arnaud Echard, Thierry Dubois
article
2025
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titre
Rsc1 DNA-binding bromodomain drives RSC activity at A-rich promoters
auteur
Camille Sayou, Oriane Viravaux, Jordan Lyonnet, Jérémy Lucas, Raphaël Dupeyron, Emmanuel Thévenon, Julie Marais, Annie Adrait, Yohann Couté, François Parcy, Carlo Petosa, Jérôme Govin
article
2025
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Drug repurposing: halogenated salicylanilides inhibit USP8 catalytic activity and ACTH release by pituitary cells
auteur
Thierry Waltrich-Augusto, Magda Mortier, Caroline Barette, Emmanuelle Soleilhac, Laurence Aubry, Marie-Odile Fauvarque
article
2025
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