Publications HAL de 1104781;874790 du labo/EPI université de montpellier

2024

Journal articles

titre
Automatic patient-level recognition of four Plasmodium species on thin blood smear by a real-time detection transformer (RT-DETR) object detection algorithm: a proof-of-concept and evaluation
auteur
Emilie Guemas, Baptiste Routier, Théo Ghelfenstein-Ferreira, Camille Cordier, Sophie Hartuis, Bénédicte Marion, Sébastien Bertout, Emmanuelle Varlet-Marie, Damien Costa, Grégoire Pasquier
article
Microbiology Spectrum, 2024, 12 (2), pp.e0144023. ⟨10.1128/spectrum.01440-23⟩
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https://hal.science/hal-04607010/file/2-Automatic-patient-level-recognition-of-four-plasmodium-species-on-thin-blood-smear-by-a-real-time.pdf BibTex
titre
Multicenter evaluation of the Toxoplasma gondii Real-TM (Sacace) kit performance for the molecular diagnosis of toxoplasmosis
auteur
Juliette Guitard, Marie-Pierre Brenier-Pinchart, Emmanuelle Varlet-Marie, Frédéric Dalle, Celia Rouges, Nicolas Argy, Julie Bonhomme, Agathe Capitaine, Hélène Guégan, Rose-Anne Lavergne, Marie-Laure Dardé, Hervé Pelloux, Florence Robert-Gangneux, Hélène Yera, Yvon Sterkers
article
Journal of Clinical Microbiology, 2024, pp.e0142823. ⟨10.1128/jcm.01428-23⟩
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https://hal.science/hal-04516294/file/SacaceGuitardetalPBM_vHAL240313.pdf BibTex
titre
Which sub-compartments of fat mass and fat-free mass are related to blood viscosity factors?
auteur
Jean-Frédéric Brun, Emmanuelle Varlet-Marie, Justine Myzia, Laurent Vachoud, Bénédicte Marion, Céline Roques, E. Raynaud, Jacques Mercier
article
Clinical Hemorheology and Microcirculation, 2024, 86 (1-2), pp.1-8. ⟨10.3233/CH-238118⟩
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https://hal.science/hal-04225670/file/Brun%202024.pdf BibTex

2023

Journal articles

titre
Assessment of Droplet Digital PCR for the Detection and Absolute Quantification of Toxoplasma gondii
auteur
Cécile Nabet, Jean-Yves Brossas, Corentin Poignon, Amira Bouzidi, Luc Paris, Feriel Touafek, Emmanuelle Varlet-Marie, Yvon Sterkers, Karine Passebosc-Faure, Marie-Laure Dardé, Renaud Piarroux, Jérôme Alexandre Denis
article
Journal of Molecular Diagnostics, 2023, 25, pp.467 - 476. ⟨10.1016/j.jmoldx.2023.03.006⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-04173642/file/Nabet%20C.%20ddPCR.pdf BibTex

2022

Journal articles

titre
Beyond the Calorie Paradigm: Taking into Account in Practice the Balance of Fat and Carbohydrate Oxidation during Exercise?
auteur
Jean-Frédéric Brun, Justine Myzia, Emmanuelle Varlet-Marie, E. Raynaud, Jacques Mercier
article
Nutrients, 2022, 14 (8), pp.1605. ⟨10.3390/nu14081605⟩
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https://hal.science/hal-03639864/file/2022%20Brun%20JF%20et%20al.%2C%20Beyond%20the.pdf BibTex
titre
Molecular Diagnosis of Toxoplasmosis : Multicenter Evaluation of the Toxoplasma RealCycler Universal PCR Assay on 168 Characterized Human Samples
auteur
Marie-Pierre Brenier-Pinchart, Denis Filisetti, Sophie Cassaing, Emmanuelle Varlet-Marie, Florence Robert-Gangneux, Laurence Delhaes, Juliette Guitard, Hélène Yéra, Patrick Bastien, Hervé Pelloux, Yvon Sterkers
article
Journal of Molecular Diagnostics, 2022, 24 (6), pp.687-696. ⟨10.1016/j.jmoldx.2022.03.009⟩
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https://hal.science/hal-03688137/file/Progenie-Brenier%20Pinchart%20et%20al%20-JMDi.pdf BibTex
titre
Metabolic Influences Modulating Erythrocyte Deformability and Eryptosis
auteur
Jean-Frédéric Brun, Emmanuelle Varlet-Marie, Justine Myzia, E. Raynaud, Etheresia Pretorius
article
Metabolites, 2022, 12 (1), pp.4. ⟨10.3390/metabo12010004⟩
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https://hal.science/hal-03500303/file/metabolites-12-00004-v3.pdf BibTex

2021

Journal articles

titre
Multicenter Comparative Assessment of the TIB MolBiol Toxoplasma gondii Detection Kit and Four Laboratory-Developed PCR Assays for Molecular Diagnosis of Toxoplasmosis
auteur
Marie-Pierre Brenier-Pinchart, Florence Robert-Gangneux, Isabelle Accoceberry, Simon Pichard, Cécile Garnaud, Hélène Fricker-Hidalgo, Maude Lévêque, Gautier Hoarau, Hervé Pelloux, Patrick Bastien, Yvon Sterkers, Emmanuelle Varlet-Marie
article
Journal of Molecular Diagnostics, 2021, 23 (8), pp.1000-1006. ⟨10.1016/j.jmoldx.2021.05.010⟩
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https://hal.science/hal-03282456/file/Tir%C3%A9ApartHAL_BrenierPinchart.pdf BibTex
titre
Coupling Complete Blood Count and Steroidomics to Track Low Doses Administration of Recombinant Growth Hormone: An Anti-Doping Perspective
auteur
Luca Narduzzi, Corinne Buisson, Marie-Line Morvan, Alexandre Marchand, Michel Audran, Yves Le Bouc, Emmanuelle Varlet-Marie, Magnus Ericsson, Bruno Le Bizec, Gaud Dervilly, Gaud Dervilly
article
Frontiers in Molecular Biosciences, 2021, 8, pp.683675. ⟨10.3389/fmolb.2021.683675⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-03280281/file/fmolb-08-683675.pdf BibTex
titre
Impact of pre-analytic step duration on molecular diagnosis of toxoplasmosis for five types of biological samples
auteur
Marie-Pierre Brenier-Pinchart, Emmanuelle Varlet-Marie, Florence Robert-Gangneux, Denis Filisetti, Juliette Guitard, Yvon Sterkers, Hélène Yera, Hervé Pelloux, Patrick Bastien
article
PLoS ONE, 2021, 16 (2), pp.e0246802. ⟨10.1371/journal.pone.0246802⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-03147137/file/journal.pone.0246802.pdf BibTex
titre
Limitations of PCR detection of filarial DNA in human stools from subjects non-infected with soil-transmitted helminths
auteur
Maxime Doret, Hugues Nana-Djeunga, Narcisse Nzune-Toche, Sébastien Pion, Cédric Chesnais, Michel Boussinesq, Joseph Kamgno, Emmanuelle Varlet-Marie, Sabrina Locatelli
article
Parasite, 2021, 28, pp.47. ⟨10.1051/parasite/2021046⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-03653045/file/parasite200212.pdf BibTex

2020

Journal articles

titre
Rapid diagnostic tests failing to detect infections by Plasmodium falciparum encoding pfhrp2 and pfhrp3 genes in a non-endemic setting
auteur
Grégoire Pasquier, Vincent Azoury, Milène Sasso, Laëtitia Laroche, Emmanuelle Varlet-Marie, Sandrine Houzé, Laurence Lachaud, Patrick Bastien, Yvon Sterkers, Maude Leveque
article
Malaria Journal, 2020, 19 (1), pp.179. ⟨10.1186/s12936-020-03251-3⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-03566775/file/s12936-020-03251-3.pdf BibTex

2019

Journal articles

titre
Combined administration of microdoses of growth hormone and erythropoietin: Effects on performance and evaluation of GH detection capability using anti‐doping methods
auteur
Alexandre Marchand, Jean‐antoine Martin, David Collot, Olivier Hoang, Ingrid Roulland, Florian Semence, Pierre‐edouard Sottas, Michel Audran, Emmanuelle Varlet-Marie
article
Drug Testing and Analysis, 2019, 11 (11-12), pp.1698-1713. ⟨10.1002/dta.2674⟩
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BibTex
titre
Inhibition of polymerase chain reaction: Pathogen-specific controls are better than human gene amplification
auteur
Guillaume Roux, Christophe Ravel, Emmanuelle Varlet-Marie, Rachel Jendrowiak, Patrick Bastien, Yvon Sterkers
article
PLoS ONE, 2019, 14 (9), pp.e0219276. ⟨10.1371/journal.pone.0219276⟩
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https://hal.science/hal-02399049/file/journal.pone.0219276.pdf BibTex
titre
Fetal growth retardation and hemorheological predictors of oxygen delivery in hypertensive vs normotensive pregnant women
auteur
Jean-Frédéric Brun, Emmanuelle Varlet-Marie, Pierre Boulot, Bénédicte Marion, Céline Roques, Jacques Mercier, E. Raynaud
article
Clinical Hemorheology and Microcirculation, 2019, pp.1-10. ⟨10.3233/CH-199002⟩
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BibTex
titre
Shear-dependency of the predicted ideal hematocrit
auteur
Emmanuelle Varlet-Marie, Laurent Vachoud, Bénédicte Marion, Céline Roques, Thibault Fidani, Jacques Mercier, Jean-Frédéric Brun
article
Clinical Hemorheology and Microcirculation, 2019, pp.1-7. ⟨10.3233/CH-199001⟩
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https://hal.science/hal-02112125/file/proceedings%20krakow%20shear%20dependency.pdf BibTex
titre
Leg electrical resistance predicts venous blood viscosity and hematocrit
auteur
Emmanuelle Varlet-Marie, Laurent Vachoud, Bénédicte Marion, Céline Roques, Thibault Fidani, Constance Chevalier, Jacques Mercier, E. Raynaud, Jean-Frédéric Brun
article
Clinical Hemorheology and Microcirculation, 2019, 71 (4), pp.397-402. ⟨10.3233/CH-199003⟩
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https://hal.science/hal-02112117/file/proceedingskrakowlegresistance.pdf BibTex

2018

Journal articles

titre
Evaluation of five automated and one manual methods for Toxoplasma and human DNA extraction from artificially spiked amniotic fluid
auteur
Hélène Yera, Louise Ménégaut, Marie-Pierre Brenier-Pinchart, Feriel Touafek, Patrick Bastien, Frédéric Dalle, Sophie Cassaing, Laurence Delhaes, Denis Filisetti, Jean Menotti, Hervé Pelloux, Florence Robert-Gangneux, Yvon Sterkers, Emmanuelle Varlet-Marie
article
Clinical Microbiology and Infection, 2018, 24 (10), pp.1100.e7-1100.e11. ⟨10.1016/j.cmi.2018.01.014⟩
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BibTex
titre
Blood rheology as a mirror of endocrine and metabolic homeostasis in health and disease1
auteur
Jean-Frédéric Brun, Emmanuelle Varlet-Marie, Marlène Richou, Jacques Mercier, E. Raynaud
article
Clinical Hemorheology and Microcirculation, 2018, 69 (1-2), pp.239 - 265. ⟨10.3233/CH-189124⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-01837097/file/2018%20Brun%20et%20al.%2C%20Blood%20Rheology%20as.pdf BibTex
titre
Seeking the optimal hematocrit: May hemorheological modelling provide a solution ?
auteur
Jean-Frédéric Brun, Emmanuelle Varlet-Marie, Marlène Richou, E. Raynaud
article
Clinical Hemorheology and Microcirculation, 2018, pp.1 - 9. ⟨10.3233/CH-189201⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-01784252/file/2018%20Brun%20et%20al.%2C%20Seeking%20the%20optimal.pdf BibTex
titre
A new LAMP-based assay for the molecular diagnosis of toxoplasmosis: comparison with a proficient PCR assay
auteur
Emmanuelle Varlet-Marie, Yvon Sterkers, Marina Perrotte, Patrick Bastien
article
International Journal for Parasitology, 2018, 48 (6), pp.457--462. ⟨10.1016/j.ijpara.2017.11.005⟩
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https://hal.science/hal-02337223/file/Varlet%20etal_LAMP_2018HAL.doc.pdf BibTex
titre
Evolution of Toxoplasma-PCR methods and practices: a French national survey and proposal for technical guidelines
auteur
Guillaume Roux, Emmanuelle Varlet-Marie, Patrick Bastien, Yvon Sterkers
article
International Journal for Parasitology, 2018, 48 (9-10), pp.701-707. ⟨10.1016/j.ijpara.2018.03.011⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-02318790/file/Roux%20et%20al_HAL2020.pdf BibTex
titre
Purified egg protein supplementation has beneficial effects on body composition, metabolism and eating behavior and results in a more sustained weight loss thanlow fat diet.
auteur
Jean-Frédéric Brun, Emmanuelle Varlet-Marie, Thibault Fidani, Jacques Mercier, E. Raynaud
article
Integrative Obesity and Diabetes, 2018, Integrative Obesity and Diabetes, 4 (4), pp.1-11. ⟨10.15761/IOD.1000215⟩
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2017

Journal articles

titre
Liquid chromatography – high resolution mass spectrometry-based metabolomic approach for the detection of Continuous Erythropoiesis Receptor Activator effects in horse doping control
auteur
Céline Joré, Benoît Loup, Patrice Garcia, Anne-Christelle Paris, Marie-Agnes Popot, Michel Audran, Yves Bonnaire, Emmanuelle Varlet-Marie, Ludovic Bailly-Chouriberry
article
Journal of Chromatography A, 2017, 1521, pp.90 - 99. ⟨10.1016/j.chroma.2017.09.029⟩
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BibTex
titre
Actual vs optimal fetal hematocrit measured with punctures of cord blood in utero: Relationship with umbilical artery resistance
auteur
Jean-Frédéric Brun, Pierre Boulot, Emmanuelle Varlet-Marie
article
Clinical Hemorheology and Microcirculation, 2017, 64 (4), pp.789 - 797. ⟨10.3233/CH-168016⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-01803683/file/2016%20Brun%20et%20al.%2C%20Actual%20versus%20optimal.pdf BibTex
titre
Exercise-induced changes in hematocrit and hematocrit/viscosity ratio in male rugby players
auteur
Emmanuelle Varlet-Marie, Jean-Frédéric Brun, E. Raynaud, Christine Fedou
article
Clinical Hemorheology and Microcirculation, 2017, 64 (4), pp.817 - 826. ⟨10.3233/CH-168042⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-01804150/file/2016%20Varlet%20-Marie%20et%20al.%2C%20Exercices%20induced%20changes.pdf BibTex
titre
One-year follow-up of blood viscosity factors and hematocrit/viscosity ratio in elite soccer players
auteur
Jean-Frédéric Brun, Emmanuelle Varlet-Marie, Christine Fedou, E. Raynaud
article
Clinical Hemorheology and Microcirculation, 2017, 64 (4), pp.799 - 808. ⟨10.3233/CH-168014⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-01803686/file/2016%20Brun%20et%20al.%2C%20One%20Year.pdf BibTex
titre
Hematocrit and hematocrit viscosity ratio during exercise in athletes: Even closer to predicted optimal values?
auteur
Jean-Frédéric Brun, Emmanuelle Varlet-Marie, E. Raynaud
article
Clinical Hemorheology and Microcirculation, 2017, 64 (4), pp.777 - 787. ⟨10.3233/CH-168012⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-01803689/file/2016%20Brun%20et%20al.%2C%20hematocrit%20and%20hematocrit.pdf BibTex
titre
« Optimal » vs actual hematocrit in obesity and overweight
auteur
Jean-Frédéric Brun, Emmanuelle Varlet-Marie, Christine Fedou, E. Raynaud
article
Clinical Hemorheology and Microcirculation, 2017, 64 (4), pp.593 - 601. ⟨10.3233/CH-168013⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-01803688/file/2016%20Brun%20et%20al.%2C%20Optimal%20versus%20actual.pdf BibTex
titre
Segmental bioelectrical impedance analysis (SBIA) and blood rheology: Reducing the gap between in vivo and in vitro?
auteur
Emmanuelle Varlet-Marie, Céline Joré, Jean-Frédéric Brun
article
Clinical Hemorheology and Microcirculation, 2017, 64 (4), pp.603 - 611. ⟨10.3233/CH-168041⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.umontpellier.fr/hal-01804152/file/2016%20Varlet-Marie%20et%20al.%2C%20Segmental%20bioelectrical.pdf BibTex
titre
Rise in RBC aggregability and concomitant decrease in blood pressure 10 days after injection of the long acting erythropoietin analogue methoxy polyethylene glycol-epoetin-β (MIRCERA®)
auteur
Céline Joré, Jean-Frédéric Brun, Emmanuelle Varlet-Marie
article
Clinical Hemorheology and Microcirculation, 2017, 64 (4), pp.809 - 816. ⟨10.3233/CH-168015⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-01818441/file/2016%20Jor%C3%A9%20et%20al.%2C%20Rise%20in%20RBC.pdf BibTex
titre
Evaluation of Toxoplasma ELITe MGB Real-Time PCR Assay for Diagnosis of Toxoplasmosis
auteur
Florence Robert-Gangneux, Marie-Pierre Brenier-Pinchart, Hélène Yera, Sorya Belaz, Emmanuelle Varlet-Marie, Patrick Bastien, Yvon Sterkers
article
Journal of Clinical Microbiology, 2017, 55 (5), pp.1369-1376. ⟨10.1128/JCM.02379-16⟩
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https://univ-rennes.hal.science/hal-01526432/file/Evaluation%20of%20the%20Toxoplasma.pdf BibTex

2016

Journal articles

titre
Hemorheologic effects of low intensity endurance training in type 2 diabetic patients: A pilot study
auteur
Jean-Frédéric Brun, Emmanuelle Varlet-Marie, E. Raynaud, Christine Fedou, Marion Pollatz
article
Clinical Hemorheology and Microcirculation, 2016, 61 (4), pp.579 - 589. ⟨10.3233/CH-141916⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-01803680/file/2016%20Brun%20et%20al.%2C%20Hemorheologic.pdf BibTex

2015

Journal articles

titre
Are metabolically healthy obese patients also hemorheologically healthy?
auteur
Jean-Frédéric Brun, Emmanuelle Varlet-Marie, Christine Fedou, E. Raynaud
article
Clinical Hemorheology and Microcirculation, 2015, 61 (1), pp.39 - 46. ⟨10.3233/CH-141868⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-01756270/file/2015%20Brun%20et%20al.%2C%20Are%20metabolically%20healthy%20obese.pdf BibTex
titre
Are overall adiposity and abdominal adiposity separate or redundant determinants of blood viscosity?
auteur
Emmanuelle Varlet-Marie, E. Raynaud, Jean-Frédéric Brun
article
Clinical Hemorheology and Microcirculation, 2015, 61 (1), pp.31 - 38. ⟨10.3233/CH-141861⟩
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BibTex
titre
Molecular diagnosis of toxoplasmosis: value of the buffy coat for the detection of circulating Toxoplasma gondii.
auteur
Marie-Pierre Brenier-Pinchart, Elodie Capderou, Rose-Laurence Bertini, Sébastien Bailly, Hélène Fricker-Hidalgo, Emmanuelle Varlet-Marie, Jean-Benjamin Murat, Yvon Sterkers, Fériel Touafek, Patrick Bastien, Hervé Pelloux
article
Diagnostic Microbiology and Infectious Disease, 2015, 82 (4), pp.289-91. ⟨10.1016/j.diagmicrobio.2015.04.004⟩
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https://unilim.hal.science/hal-01262441/file/MPBrenier-PinchartBuffyCoat2015HAL.pdf BibTex
titre
Molecular diagnosis of toxoplasmosis in immunocompromised patients: a three-year multicenter retrospective study
auteur
Florence Robert-Gangneux, Yvon Sterkers, Hélène Yera, Isabelle Accoceberry, Jean Menotti, Sophie Cassaing, Marie-Pierre Brenier-Pinchart, Christophe Hennequin, Laurence Delhaes, Julie Bonhomme, Isabelle Villena, Emeline Scherer, Frédéric Dalle, Feriel Touafek, Denis Filisetti, Emmanuelle Varlet-Marie, Hervé Pelloux, Patrick Bastien
article
Journal of Clinical Microbiology, 2015, 53 (5), pp.1677-1684. ⟨10.1128/jcm.03282-14⟩
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2014

Journal articles

titre
Multicentric Comparative Assessment of the Bio-Evolution Toxoplasma gondii Detection Kit with Eight Laboratory-Developed PCR Assays for Molecular Diagnosis of Congenital Toxoplasmosis
auteur
Denis Filisetti, Yvon Sterkers, Marie-Pierre Brenier-Pinchart, Sophie Cassaing, Frédéric Dalle, Laurence Delhaes, Hervé Pelloux, Feriel Touafek, Emmanuelle Varlet-Marie, Hélène Yera, Ermano Candolfi, Patrick Bastien
article
Journal of Clinical Microbiology, 2014, 53 (1), pp.29-34. ⟨10.1128/jcm.01913-14⟩
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BibTex
titre
Freezing and storage at −20 °C provides adequate preservation of Toxoplasma gondii DNA for retrospective molecular analysis
auteur
Laurence Delhaes, Denis Filisetti, Marie-Pierre Brenier-Pinchart, Hervé Pelloux, Hélène Yera, Frédéric Dalle, Yvon Sterkers, Emmanuelle Varlet-Marie, Feriel Touafek, Sophie Cassaing, Patrick Bastien
article
Diagnostic Microbiology and Infectious Disease, 2014, 80 (3), pp.197-199. ⟨10.1016/j.diagmicrobio.2014.08.007⟩
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