2024
Journal articles
- titre
- Why incorporate plant architecture into trait-based ecology?
- auteur
- Marilyne Laurans, François Munoz, Tristan Charles-Dominique, Patrick Heuret, Claire Fortunel, Sandrine Isnard, Sylvie-Annabel Sabatier, Yves Caraglio, Cyrille Violle
- article
- Trends in Ecology & Evolution, 2024, 39 (6), pp.524-536. ⟨10.1016/j.tree.2023.11.011⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Mapping global orchid assemblages with deep learning provides novel conservation insights
- auteur
- Joaquim Estopinan, Maximilien Servajean, Pierre Bonnet, Alexis Joly, François Munoz
- article
- Ecological Informatics, 2024, 81, pp.102627. ⟨10.1016/j.ecoinf.2024.102627⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Parasite infection in a cell population: role of the partitioning kernel
- auteur
- Aline Marguet, Charline Smadi
- article
- Journal of Mathematical Biology, 2024, 89 (14), pp.1-28. ⟨10.1007/s00285-024-02110-y⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Improving the genetic stability of bacterial growth control for long‐term bioproduction
- auteur
- Thibault Clavier, Corinne Pinel, Hidde de Jong, Johannes Geiselmann
- article
- Biotechnology and Bioengineering, 2024, 121 (9), pp.2808-2819. ⟨10.1002/bit.28756⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Can plants build their niche through modulation of soil microbial activities linked with nitrogen cycling? A test with Arabidopsis thaliana
- auteur
- Maria Stefania Przybylska, Cyrille Violle, Denis Vile, J F Scheepens, François Munoz, Álvaro Tenllado, Mariona Vinyeta, Xavier Le Roux, François Vasseur
- article
- New Phytologist, 2024, 243 (2), pp.620-635. ⟨10.1111/nph.19870⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A general method for the estimation of moments of substitution number in molecular evolution
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh
- article
- Physica Scripta, 2024, 99 (6), pp.065035. ⟨10.1088/1402-4896/ad48cc⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Assessing mutualistic metacommunity capacity by integrating spatial and interaction networks
- auteur
- Marc Ohlmann, François Munoz, François Massol, Wilfried Thuiller
- article
- Theoretical Population Biology, 2024, 156, pp.22-39. ⟨10.1016/j.tpb.2024.01.001⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A set of ecosystem service indicators for European grasslands based on botanical surveys
- auteur
- Simon Taugourdeau, Frédérique Louault, Alice Michelot-Antalik, Samir Messad, François Munoz, Denis Bastianelli, Pascal Carrère, Sylvain Plantureux
- article
- Grassland Research, 2024, 3 (1), pp.43-56. ⟨10.1002/glr2.12069⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- SPARTA: Interpretable functional classification of microbiomes and detection of hidden cumulative effects
- auteur
- Baptiste Ruiz, Arnaud Belcour, Samuel Blanquart, Sylvie Buffet-Bataillon, Isabelle Luron Le Huërou-Luron, Anne Siegel, Yann Le Cunff
- article
- PLoS Computational Biology, 2024, 20 (11), pp.e1012577. ⟨10.1371/journal.pcbi.1012577⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Intransitive stability collapses under the influence of dominant competitors
- auteur
- Laure Gallien, Maude Charlie Cavaliere, Marie Charlotte Grange, François Munoz, Tamara Münkemüller
- article
- The American Naturalist, 2024, 204 (1), pp.E1-E10. ⟨10.1086/730297⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Empirical evidence for metabolic drift in plant and algal lipid biosynthesis pathways
- auteur
- Maëlle Zonnequin, Arnaud Belcour, Ludovic Delage, Anne Siegel, Samuel Blanquart, Catherine Leblanc, Gabriel V Markov
- article
- Frontiers in Plant Science, 2024, 15, pp.1339132. ⟨10.3389/fpls.2024.1339132⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Refocusing the microbial rare biosphere concept through a functional lens
- auteur
- Elena Litchman, Sébastien Villéger, Zinger Lucie, Jean-Christophe Auguet, Wilfried Thuiller, François Munoz, Nathan J. B. Kraft, Laurent Philippot, Cyrille Violle
- article
- Trends in Ecology & Evolution, 2024, 39 (10), pp.923-936. ⟨10.1016/j.tree.2024.06.005⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Spread of parasites affecting death and division rates in a cell population
- auteur
- Aline Marguet, Charline Smadi
- article
- Stochastic Processes and their Applications, 2024, 168, pp.104262. ⟨10.1016/j.spa.2023.104262⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Navigating the integration of biotic interactions in biogeography
- auteur
- Wilfried Thuiller, Irene Calderón-Sanou, Loïc Chalmandrier, Pierre Gaüzère, Louise M.J. O'Connor, Marc Ohlmann, Giovanni Poggiato, Tamara Münkemüller
- article
- Journal of Biogeography, 2024, 51 (4), pp.550-559. ⟨10.1111/jbi.14734⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Conference papers
- titre
- Optimization of microalgae biosynthesis via controlled algal-bacterial symbiosis
- auteur
- Rand Asswad, Walid Djema, Olivier Bernard, Jean-Luc Gouzé, Eugenio Cinquemani
- article
- CDC 2024 - 63rd IEEE Conference on Decision and Control, IEEE CSS, Dec 2024, Milan, Italy. pp.1-6, ⟨10.1109/CDC56724.2024.10886300⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Toujours plus haut, Toujours plus loin ou Thingsat : un véhicule de recherche pour l’expérimentation in-vivo ouverte de l’Internet des Objets par Satellite
- auteur
- Didier Donsez, Alphand Olivier, Florent Dobler, Léo Cordier, Tan Phu Vuong, Nhu Huan Nguyen, Vincent Grennerat, Sequies Thierry, Mathieu Barthelemy, Monin Jean-Louis, Moraux Estelle, Erik Kerstel
- article
- [CyberSkills] Workshop : Distribution sécurisée du Temps et Systèmes spatiaux, Nov 2024, Grenoble, France
- typdoc
- Conference papers
- Accès au bibtex
-
- titre
- The role of observation scale, trait correlations and competitive regime in community assembly patterns
- auteur
- Matthias Rohr, Wilfried Thuiller, Loïc Chalmandrier, Tamara Münkemüller
- article
- SFE² 2024, Oct 2024, Lyon, France
- typdoc
- Conference papers
- Accès au bibtex
-
- titre
- Intransitive competition: an important mechanism?
- auteur
- Laure Gallien, Maude Charlie Cavaliere, Marie Charlotte Grange, François Munoz, Tamara Münkemüller
- article
- SFE2 International congress in ecology and evolution, Oct 2024, Lyon, France
- typdoc
- Conference papers
- Accès au bibtex
-
- titre
- Development and Optimization of SPRI-based Electronic Nose for Highly Selective Detection of Volatile Organic Compounds
- auteur
- Vanessa Escobar, Arnaud Buhot, Natale Noel Scaramozzino, Yanxia Hou
- article
- EUROSENSORS XXXVI, Sep 2024, Debrecen, Hungary
- typdoc
- Conference papers
- Accès au bibtex
-
- titre
- Kalman-based approaches for online estimation of bioreactor dynamics from fluorescent reporter measurements
- auteur
- Rand Asswad, Eugenio Cinquemani, Jean-Luc Gouzé
- article
- ECC 2024 - European Control Conference, Jun 2024, Stockholm, Sweden. pp.1-6, ⟨10.23919/ECC64448.2024.10591076⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Inference of tree-structured auto-regressive models of gene expression parameters from generation-snapshot data
- auteur
- Emrys Reginato, Aline Marguet, Eugenio Cinquemani
- article
- ECC 2024 - 22nd European Control Conference, Jun 2024, Stockholm, Sweden. pp.1-8
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- The role of observation scale, trait correlations and competitive regime in community assembly patterns
- auteur
- Matthias Rohr, Wilfried Thuiller, Loïc Chalmandrier, Tamara Münkemüller
- article
- World Biodiversity Forum 2024, Jun 2024, Davos (Suisse), Switzerland
- typdoc
- Conference papers
- Accès au bibtex
-
- titre
- Microbial Risks Associated with Hydrogen Underground Storage in Europe
- auteur
- Nicole Dopffel, Biwen Annie An-Stepec, Petra Bombach, Kateřina Černá, Jakub Říha, Khine Kyaw, Nicola Paltrinieri, Are Oust, Delphine Ropers, Sétareh Rad, Sylvain Stephant, Joachim Tremosa
- article
- EAGE 2024 - 85th Annual Conference & Exhibition, Jun 2024, Oslo, Norway. pp.1-5, ⟨10.3997/2214-4609.202410805⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Novel High-Affinity Peptides Selected by Phage Display for Selective Detection of Aromatic VOCs
- auteur
- Vanessa Escobar, Sophie Brenet, Charlotte Hurot, Marielle El Kazzy, Arnaud Buhot, Natale Noel Scaramozzino, Yanxia Hou
- article
- 2024 IEEE International Symposium on Olfaction and Electronic Nose (ISOEN), May 2024, Grapevine, Texas, USA, United States
- typdoc
- Conference papers
- Accès au bibtex
-
- titre
- Microbial risks associated with hydrogen underground storage in Europe
- auteur
- Nicole Dopffel, Katerina Černa, Sylvain Stephant, Petra Bombach, Kenneth Wunch, Biwen Annie An-Stepec, Alsu Valiakhmetova, Tzvetanka Boiadjieva-Scherzer, Joachim Tremosa, Sétareh Rad, Delphine Ropers
- article
- SMRI 2024 -Conference on Solution Mining Research Institute Spring, Solution Mining Research Institute, Apr 2024, Krakow, Poland. pp.1-12
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Patents
- titre
- DNA G-QUADRUPLEX-SPECIFIC ANTIBODIES AND USES
- auteur
- Éric Defrancq, Natale Scaramozzino
- article
- France, Patent n° : WO/2025/153793 (FR2400468 / FR3158314). 2024
- typdoc
- Patents
- Accès au bibtex
-
Theses
- titre
- Genetic control of bacterial growth : optimization of process conditions for maximizing the yield of biotechnological products in E. coli
- auteur
- Thibault Clavier
- article
- Sciences du Vivant [q-bio]. Université Grenoble Alpes, 2024. Français. ⟨NNT : ⟩
- typdoc
- Theses
- Accès au bibtex
-
Preprints, Working Papers, ...
- titre
- When lowering temperature, the in vivo circadian clock in cyanobacteria follows and surpasses the in vitro protein clock trough the Hopf bifurcation
- auteur
- Irina Mihalcescu, Hotaka Kaji, Hina Maruyama, Jerome Giraud, Mathilde Van Melle-Gateau, Bahram Houchmandzadeh, Hiroshi Ito
- article
- 2024
- typdoc
- Preprints, Working Papers, ...
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Design proposition for continuous bioreactors optimization against the mutation risk
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh
- article
- 2024
- typdoc
- Preprints, Working Papers, ...
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2023
Journal articles
- titre
- The ecological causes of functional distinctiveness in communities
- auteur
- François Munoz, Christopher A Klausmeier, Pierre Gaüzère, Gaurav Kandlikar, Elena Litchman, Nicolas Mouquet, Annette Ostling, Wilfried Thuiller, Adam C Algar, Arnaud Auber, Marc W Cadotte, Léo Delalandre, Pierre Denelle, Brian J Enquist, Claire Fortunel, Matthias Grenié, Nicolas Loiseau, Lucie Mahaut, Anthony Maire, David Mouillot, Catalina Pimiento, Cyrille Violle, Nathan J B Kraft
- article
- Ecology Letters, 2023, 26 (8), pp.1452-1465. ⟨10.1111/ele.14265⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Resource allocation accounts for the large variability of rate-yield phenotypes across bacterial strains
- auteur
- Valentina Baldazzi, Delphine Ropers, Jean-Luc Gouzé, Tomas Gedeon, Hidde de Jong
- article
- eLife, 2023, 12, pp.1-29. ⟨10.7554/eLife.79815⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Links to rare climates do not translate into distinct traits for island endemics
- auteur
- Vanessa Cutts, Dagmar Hanz, Martha Paola Barajas-Barbosa, Franziska Schrodt, Manuel Steinbauer, Carl Beierkuhnlein, Pierre Denelle, José María Fernández-Palacios, Pierre Gaüzère, Matthias Grenié, Severin Irl, Nathan Kraft, Holger Kreft, Brian Maitner, François Munoz, Wilfried Thuiller, Cyrille Violle, Patrick Weigelt, Richard Field, Adam Algar
- article
- Ecology Letters, 2023, 26 (4), pp.504-515. ⟨10.1111/ele.14169⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A novel procedure for CFU plating and counting
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh, Patrice Ballet
- article
- Journal of Microbiological Methods, 2023, 206, pp.106693. ⟨10.1016/j.mimet.2023.106693⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Object-based characterization of vegetation heterogeneity with sentinel images proves efficient in a highly human-influenced National Park of Côte d’Ivoire
- auteur
- Stéphanie Diane Konan Houphlet, Pauline Dusseux, Adjo Estelle Geneviève Adiko, Arthur Brice Konan-Waidhet, François Munoz, Sylvain Bigot, Constant Yves Adou Yao
- article
- Environmental Monitoring and Assessment, 2023, 195 (1), pp.200. ⟨10.1007/s10661-022-10792-4⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- The functional trait distinctiveness of plant species is scale dependent
- auteur
- Pierre Gaüzère, Benjamin Blonder, Pierre Denelle, Bertrand Fournier, Matthias Grenié, Léo Delalandre, Tamara Münkemüller, François Munoz, Cyrille Violle, Wilfried Thuiller
- article
- Ecography, 2023, 2023 (1), pp.e06504. ⟨10.1111/ecog.06504⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Revisiting extinction debt through the lens of multitrophic networks and meta‐ecosystems
- auteur
- Grégoire Blanchard, François Munoz
- article
- Oikos, 2023, 2023 (3), pp.e09435. ⟨10.1111/oik.09435⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- Optimal protein production by a synthetic microbial consortium: Coexistence, distribution of labor, and syntrophy
- auteur
- Carlos Martinez, Eugenio Cinquemani, Hidde de Jong, Jean-Luc Gouzé
- article
- Journal of Mathematical Biology, 2023, 87 (1), pp.1-37. ⟨10.1007/s00285-023-01935-3⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Recent Advances in Electrochemical Biosensors for Food Control
- auteur
- Francesco Rizzotto, Majd Khalife, Yanxia Hou, Carole Chaix, Florence Lagarde, Natale Scaramozzino, Jasmina Vidic
- article
- Micromachines, 2023, 14 (7), pp. 1412. ⟨10.3390/mi14071412⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Dissecting fine root diameter distribution at the community level captures root morphological diversity
- auteur
- Amandine Erktan, Catherine Roumet, François Munoz
- article
- Oikos, 2023, 2023 (1), ⟨10.1111/oik.08907⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Recent Advances on Peptide-Based Biosensors and Electronic Noses for Foodborne Pathogen Detection
- auteur
- Vanessa Escobar, Natale Scaramozzino, Jasmina Vidic, Arnaud Buhot, Raphaël Mathey, Carole Chaix, Yanxia Hou
- article
- Biosensors, 2023, 13, ⟨10.3390/bios13020258⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Conference papers
- titre
- Resource allocation strategies behind rate-yield phenotypes in E.coli
- auteur
- Valentina Baldazzi, Delphine Ropers, Jean-Luc Gouzé, Tomas Gedeon, Hidde de Jong
- article
- 2023 - Workshop on Advanced School on Quantitative Principles in Microbial Physiology: from Single Cells to Cell Communities, ICTP, Oct 2023, Trieste, Italy. pp.1
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Exploration of Phage Display peptides as novel sensing materials for highly sensitive and selective biomimetic optoelectronic nose
- auteur
- Vanessa Escobar, Charlotte Hurot, Sophie Brenet, Marielle El Kazzy, Natale Scaramozzino, Raphaël Mathey, Arnaud Buhot, Yanxia Hou
- article
- 9th International Conference on Sensors Engineering and Electronics Instrumentation Advances (SEIA'), Sep 2023, Funchal (Madeira Island), Portugal
- typdoc
- Conference papers
- Accès au bibtex
-
- titre
- Projections climatiques CMIP6 à l’échelle du sud-ouest de la Côte d’Ivoire : évolution des contraintes thermo-pluviométriques pour les principaux agrosystèmes associant cacao, hévéa, palmier à huile et manioc
- auteur
- Sylvain Bigot, Dominique Dumas, Yao Télesphore Brou, Noufé Djibril Dabissi, Pauline Dibi'Anoh, François Munoz, A. Diedhou, Christian Cilas
- article
- Climat, eau et société : changements et défis, Association Internationale de Climatologie, Jul 2023, Bucarest, Romania. pp.189-195
- typdoc
- Conference papers
- Accès au bibtex
-
- titre
- Lactation-induced changes in bone cellular and sub-cellular networks: indication for altered bone mineral transport
- auteur
- Tengteng Tang, Asier Munoz, Jacqueline Huo, Aurélien Gourrier, Alessandra Carriero, Kathryn Grandfield
- article
- International Union of Microbeam Analysis Societies Joint with the Annual Microscopical Society of Canada and FIB SEM Meetings, Jun 2023, Hamilton, Canada
- typdoc
- Conference papers
- Accès au bibtex
-
Book sections
- titre
- Models of growing cells
- auteur
- Ohad Golan, Hollie Hindley, Hidde de Jong, Markus Köbis, Elena Pascual Garcia, Andrea Weiße
- article
- Economic Principles in Cell Biology, Zenodo, pp.117-129, 2023, ⟨10.5281/zenodo.8156979⟩
- typdoc
- Book sections
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Optimal cell behavior in time
- auteur
- Dafni Giannari, Hidde de Jong, Diego A Oyarzún, Steffen Waldherr, Agustín G. Yabo
- article
- Economic Principles in Cell Biology, , pp.153-172, 2023, ⟨10.5281/zenodo.8157066⟩
- typdoc
- Book sections
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Special issue
- titre
- Special Issue of the 19th International Conference on Computational Methods in Systems Biology
- auteur
- Eugenio Cinquemani, Loïc Paulevé
- article
- 24 (1), 2023, BMC Bioinformatics Supplements
- typdoc
- Special issue
- Accès au bibtex
-
Theses
- titre
- Development, characterization and control of E.coli communities on an automated experimental platform
- auteur
- Maaike Fonsine Sangster
- article
- Cellular Biology. Université Grenoble Alpes [2020-..], 2023. English. ⟨NNT : 2023GRALV041⟩
- typdoc
- Theses
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Eco-evolutionary biodiversity dynamics : understanding and predicting the influence of environmental heterogeneity at multiple temporal and spatial scales
- auteur
- Elizabeth Barthelemy
- article
- Biodiversité. Université Grenoble Alpes [2020-..], 2023. Français. ⟨NNT : 2023GRALV016⟩
- typdoc
- Theses
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2022
Journal articles
- titre
- Maturation models of fluorescent proteins are necessary for unbiased estimates of promoter activity
- auteur
- Antrea Pavlou, Eugenio Cinquemani, Johannes Geiselmann, Hidde de Jong
- article
- Biophysical Journal, 2022, 121 (21), pp.4179-4188. ⟨10.1016/j.bpj.2022.09.021⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Effects of Habitat and Competition on Niche Partitioning and Community Structure in Neotropical Ants
- auteur
- Alex Salas-López, Cyrille Violle, François Munoz, Florian Menzel, Jérôme Orivel
- article
- Frontiers in Ecology and Evolution, 2022, 10, pp.863080. ⟨10.3389/fevo.2022.863080⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Very High Resolution Species Distribution Modeling Based on Remote Sensing Imagery: How to Capture Fine-Grained and Large-Scale Vegetation Ecology With Convolutional Neural Networks?
- auteur
- Benjamin Deneu, Alexis Joly, Pierre Bonnet, Maximilien Servajean, François Munoz
- article
- Frontiers in Plant Science, 2022, 13, ⟨10.3389/fpls.2022.839279⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Deep Species Distribution Modeling From Sentinel-2 Image Time-Series: A Global Scale Analysis on the Orchid Family
- auteur
- Joaquim Estopinan, Maximilien Servajean, Pierre Bonnet, François Munoz, Alexis Joly
- article
- Frontiers in Plant Science, 2022, 13, pp.839327. ⟨10.3389/fpls.2022.839327⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Functionally distinct tree species support long-term productivity in extreme environments
- auteur
- Léo Delalandre, Pierre Gaüzère, Wilfried Thuiller, Marc Cadotte, Nicolas Mouquet, David Mouillot, François Munoz, Pierre Denelle, Nicolas Loiseau, Xavier Morin, Cyrille Violle
- article
- Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, 2022, 289 (1967), pp.20211694. ⟨10.1098/rspb.2021.1694⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Plant community impact on productivity: Trait diversity or key(stone) species effects?
- auteur
- Philipp Brun, Cyrille Violle, David Mouillot, Nicolas Mouquet, Brian J. Enquist, Francois Munoz, Tamara Munkemuller, Annette Ostling, Niklaus E. Zimmermann, Wilfried Thuiller
- article
- Ecology Letters, 2022, 25 (4), pp.913-925. ⟨10.1111/ele.13968⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Dynamical analysis and optimization of a generalized resource allocation model of microbial growth
- auteur
- Agustín G. Yabo, Jean-Baptiste Caillau, Jean-Luc Gouzé, Hidde de Jong, Francis Mairet
- article
- SIAM Journal on Applied Dynamical Systems, 2022, 21 (1), pp.137-165. ⟨10.1137/21M141097X⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Patents
- titre
- A genetically engineered bacterium and genetically stable method for the production of metabolites, peptides, and/or recombinant proteins
- auteur
- Hidde de Jong, Johannes Geiselmann, Thibault Clavier, Célia Boyat
- article
- France, N° de brevet: FR3141471A1. 2022, pp.32
- typdoc
- Patents
- Accès au bibtex
-
- titre
- Methods for counting the number of living microorganisms contained in a specimen sample and apparatuses for implementing such methods
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh, Patrice Ballet
- article
- France, Patent n° : WO2022/207514. 2022
- typdoc
- Patents
- Accès au bibtex
-
Theses
- titre
- Quantification of bacterial resource allocation in changing environments on the single-cell level
- auteur
- Antrea Pavlou
- article
- Virology. Université Grenoble Alpes [2020-..], 2022. English. ⟨NNT : 2022GRALV046⟩
- typdoc
- Theses
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Selection and production of specific DNA G-quadruplex antibody fragments
- auteur
- Nasab Reda
- article
- Sciences du Vivant [q-bio]. Université Grenoble Alpes, 2022. Français. ⟨NNT : ⟩
- typdoc
- Theses
- Accès au bibtex
-
2021
Journal articles
- titre
- Multiomics Study of Bacterial Growth Arrest in a Synthetic Biology Application
- auteur
- Delphine Ropers, Yohann Couté, Laëtitia Faure, Sabrina Ferré, Delphine Labourdette, Arieta Shabani, Lidwine Trouilh, Perrine Vasseur, Gwénaëlle Corre, Myriam Ferro, Marie-Ange Teste, Johannes Geiselmann, Hidde de Jong
- article
- ACS Synthetic Biology, 2021, 10 (11), pp.2910-2926. ⟨10.1021/acssynbio.1c00115⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- Supersymmetries in non-equilibrium Langevin dynamics
- auteur
- Bastien Marguet, Elisabeth Agoritsas, Léonie Canet, Vivien Lecomte
- article
- Physical Review E , 2021, 104 (4), pp.044120. ⟨10.1103/PhysRevE.104.044120⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- The dimensionality and structure of species trait spaces
- auteur
- David Mouillot, Nicolas Loiseau, Matthias Grenié, Adam Algar, Michele Allegra, Marc Cadotte, Nicolas Casajus, Pierre Denelle, Maya Guéguen, Anthony Maire, Brian Maitner, Brian Mcgill, Matthew Mclean, Nicolas Mouquet, François Munoz, Wilfried Thuiller, Sébastien Villéger, Cyrille Violle, Arnaud Auber
- article
- Ecology Letters, 2021, 24 (9), pp.1988-2009. ⟨10.1111/ele.13778⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- An Overview of Artificial Olfaction Systems with a Focus on Surface Plasmon Resonance for the Analysis of Volatile Organic Compounds
- auteur
- Marielle El Kazzy, Jonathan Weerakkody, Charlotte Hurot, Raphaël Mathey, Arnaud Buhot, Natale Scaramozzino, Yanxia Hou
- article
- Biosensors, 2021, 11 (8), pp.244. ⟨10.3390/bios11080244⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Drivers of tree community assembly during tropical forest post-fire succession in anthropogenic savannas
- auteur
- Grégoire Blanchard, Thomas Ibanez, François Munoz, David Bruy, Christelle Hély, Jérôme Munzinger, Philippe Birnbaum
- article
- Perspectives in Plant Ecology, Evolution and Systematics, 2021, 52, pp.125630. ⟨10.1016/j.ppees.2021.125630⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Unveiling ecological assembly rules from commonalities in trait distributions
- auteur
- Nicolas Gross, Yoann Le Bagousse-Pinguet, Pierre Liancourt, Hugo Saiz, Cyrille Violle, François Munoz
- article
- Ecology Letters, 2021, 24 (8), pp.1668-1680. ⟨10.1111/ele.13789⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Imprints of Past Habitat Area Reduction on Extant Taxonomic, Functional, and Phylogenetic Composition
- auteur
- Elizabeth Barthelemy, Claire Fortunel, Maxime Jaunatre, François Munoz
- article
- Frontiers in Ecology and Evolution, 2021, 9, ⟨10.3389/fevo.2021.634413⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Convolutional neural networks improve species distribution modelling by capturing the spatial structure of the environment
- auteur
- Benjamin Deneu, Maximilien Servajean, Pierre Bonnet, Christophe Botella, François Munoz, Alexis Joly
- article
- PLoS Computational Biology, 2021, 17 (4), pp.e1008856. ⟨10.1371/journal.pcbi.1008856⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Functional biogeography of weeds reveals how anthropogenic management blurs trait–climate relationships
- auteur
- Bérenger Bourgeois, François Munoz, Sabrina Gaba, Pierre Denelle, Guillaume Fried, Jonathan Storkey, Cyrille Violle
- article
- Journal of Vegetation Science, 2021, 32 (2), pp.1-12. ⟨10.1111/jvs.12999⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Do ecological specialization and functional traits explain the abundance–frequency relationship? Arable weeds as a case study
- auteur
- Guillaume Fried, Laura Armengot, Jonathan Storkey, Bérenger Bourgeois, Sabrina Gaba, Cyrille Violle, François Munoz
- article
- Journal of Biogeography, 2021, 48 (1), pp.37-50. ⟨10.1111/jbi.13980⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Canopy and understory tree guilds respond differently to the environment in an Indian rainforest
- auteur
- Sylvain Schmitt, Valérie Raevel, Maxime Réjou-Méchain, Narayanan Ayyappan, Natesan Balachandran, N. Barathan, Gopalakrishnan Rajashekar, François Munoz
- article
- Journal of Vegetation Science, 2021, 32 (5), ⟨10.1111/jvs.13075⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Designing sampling protocols for plant-pollinator interactions - timing, meteorology, flowering variations and failed captures matter
- auteur
- Marie Charlotte Grange, François Munoz, Marco Moretti, Sylvain Varona-Y-Varona, Julien Renaud, Marie-Pascale Colace, Maya Gueguen, Laure Gallien
- article
- Botany Letters, 2021, 168 (3), pp.324-332. ⟨10.1080/23818107.2021.1964596⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Rebound in functional distinctiveness following warming and reduced fishing in the North Sea
- auteur
- Juliette Murgier, Matthew Mclean, Anthony Maire, David Mouillot, Nicolas Loiseau, Francois Munoz, Cyrille Violle, Arnaud Auber
- article
- Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, 2021, 288 (1942), pp.20201600. ⟨10.1098/rspb.2020.1600⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Optimal proteome allocation and the temperature dependence of microbial growth laws
- auteur
- Francis Mairet, Jean-Luc Gouzé, Hidde de Jong
- article
- npj Systems Biology and Applications, 2021, 7 (14), ⟨10.1038/s41540-021-00172-y⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
Preprints, Working Papers, ...
- titre
- From Newton to Hamilton, bypassing Lagrange and Legendre.
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh
- article
- 2021
- typdoc
- Preprints, Working Papers, ...
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-
2020
Journal articles
- titre
- Weeds: Against the Rules?
- auteur
- Lucie Mahaut, Pierre-Olivier Cheptou, Guillaume Fried, François Munoz, Jonathan Storkey, François Vasseur, Cyrille Violle, François Bretagnolle
- article
- Trends in Plant Science, 2020, 25 (11), pp.1107-1116. ⟨10.1016/j.tplants.2020.05.013⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- The Hamilton-Jacobi Equation : an intuitive approach.
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh
- article
- American Journal of Physics, 2020, 88 (5), pp.353-359
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Bio-Inspired Strategies for Improving the Selectivity and Sensitivity of Artificial Noses: A Review
- auteur
- Charlotte Hurot, Natale Scaramozzino, Arnaud Buhot, Yanxia Hou
- article
- Sensors, 2020, 20 (6), pp.1803. ⟨10.3390/s20061803⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Large deviation of long time average for a stochastic process : an alternative method.
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh
- article
- Journal of Physics A: Mathematical and Theoretical, 2020, 53 (9), pp.095004
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Coupling Polar Adhesion with Traction, Spring, and Torque Forces Allows High-Speed Helical Migration of the Protozoan Parasite Toxoplasma
- auteur
- Georgios Pavlou, Bastien Touquet, Luis Vigetti, Patricia Renesto, Alexandre Bougdour, Delphine Débarre, Martial Balland, Isabelle Tardieux
- article
- ACS Nano, 2020, 14 (6), pp.7121-7139. ⟨10.1021/acsnano.0c01893⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
Other publications
- titre
- Growth trajectories, better than organ-level functional traits, reveal intraspecific response to environmental variation
- auteur
- François Munoz
- article
- 2020, pp.100041. ⟨10.24072/pci.ecology.100041⟩
- typdoc
- Other publications
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-
Theses
- titre
- Design and in vivo implementation of synthetic RNA switches in E.coli
- auteur
- Gabriel Joël Espel
- article
- Biologie structurale [q-bio.BM]. Université Grenoble Alpes [2020-..], 2020. Français. ⟨NNT : 2020GRALV051⟩
- typdoc
- Theses
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-
Preprints, Working Papers, ...
- titre
- Rawls's “original position” is not sufficient to specify the rules of cooperation.
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh
- article
- 2020
- typdoc
- Preprints, Working Papers, ...
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-
2019
Journal articles
- titre
- RhoTermPredict: an algorithm for predicting Rho-dependent transcription terminators based on Escherichia coli, Bacillus subtilis and Salmonella enterica databases
- auteur
- Marco Di Salvo, Simone Puccio, Clelia Peano, Stephan Lacour, Pietro Alifano
- article
- BMC Bioinformatics, 2019, 20 (1), pp.1-11. ⟨10.1186/s12859-019-2704-x⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- Acetate metabolism and the inhibition of bacterial growth by acetate
- auteur
- Stéphane Pinhal, Delphine Ropers, Johannes Geiselmann, Hidde de Jong
- article
- Journal of Bacteriology, 2019, 201 (13), pp.147 - 166. ⟨10.1128/JB.00147-19⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- APERO: a genome-wide approach for identifying bacterial small RNAs from RNA-Seq data
- auteur
- Simon Leonard, Sam Meyer, Stéphan Lacour, William Nasser, Florence Hommais, Sylvie Reverchon
- article
- Nucleic Acids Research, 2019, 47 (15), pp.1-12. ⟨10.1093/nar/gkz485⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Functional biogeography of dietary strategies in birds
- auteur
- Jean-Yves Barnagaud, Nathan Mazet, Francois Munoz, Matthias Grenié, Pierre Denelle, Mar Sobral, W. Daniel Kissling, Cyrille Violle
- article
- Global Ecology and Biogeography, 2019, 28 (7), pp.1004-1017. ⟨10.1111/geb.12910⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
2018
Journal articles
- titre
- An ensemble of mathematical models showing diauxic growth behaviour
- auteur
- Andreas Kremling, Johannes Geiselmann, Delphine Ropers, Hidde de Jong
- article
- BMC Systems Biology, 2018, 12 (1), pp.1-16. ⟨10.1186/s12918-018-0604-8⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Nanobob: a CubeSat mission concept for quantum communication experiments in an uplink configuration
- auteur
- Erik Kerstel, Arnaud Gardelein, Mathieu Barthelemy, Yves Gilot, Etienne Lecoarer, Juana Rodrigo, Thierry Sequies, Vincent Borne, Guillaume Bourdarot, Jean-Yves Burlet, Alexis Christidis, Jesus Segura, Benoit Boulanger, Véronique Boutou, Mylene Bouzat, Mathieu Chabanol, Laurent Fesquet, Hassen Fourati, Michel Moulin, Jean-Michel Niot, Rodrigo Possamai Bastos, Bogdan Robu, Etienne Rolland, Sylvain Toru, Matthias Fink, Siddarth Koduru Joshi, Rupert Ursin
- article
- European physical journal quantum technology, 2018, 5 (6), pp.1-30. ⟨10.1140/epjqt/s40507-018-0070-7⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Giant fluctuations in logistic growth
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh
- article
- Physical Review E : Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics [2001-2015], 2018, 98, pp.042118
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Nanobob: a cubesat mission concept for quantum communication experiments in an uplink configuration
- auteur
- Erik Kerstel, Guillaume Bourdarot, Etienne Lecoarer, Mathieu Barthelemy, Arnaud Gardelein, Sebastien Tanzilli, Matthias Fink, Siddarth Koduru Joshi, Rupert Ursin
- article
- European physical journal quantum technology, 2018, pp.68. ⟨10.1117/12.2535988⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Q3Sat: quantum communications uplink to a 3U CubeSat—feasibility & design
- auteur
- Sebastian Philipp Neumann, Siddarth Koduru Joshi, Matthias Fink, Thomas Scheidl, Roland Blach, Carsten Scharlemann, Sameh Abouagaga, Daanish Bambery, Erik Kerstel, Mathieu Barthelemy, Rupert Ursin
- article
- European physical journal quantum technology, 2018, 5 (4), ⟨10.1140/epjqt/s40507-018-0068-1⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- Toxoplasma Parasite Twisting Motion Mechanically Induces Host Cell Membrane Fission to Complete Invasion within a Protective Vacuole
- auteur
- Georgios Pavlou, Mateusz Biesaga, Bastien Touquet, Vanessa Lagal, Martial Balland, Alexandre Dufour, Mohamed-Ali Hakimi, Isabelle Tardieux
- article
- Cell Host and Microbe, 2018, 24 (1), pp.81-96.e5. ⟨10.1016/j.chom.2018.06.003⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Non-spherical oscillations drive the ultrasound-mediated release from targeted microbubbles
- auteur
- Guillaume Lajoinie, Ying Luan, Erik Gelderblom, Benjamin Dollet, Frits Mastik, Heleen Dewitte, Ine Lentacker, Nico de Jong, Michel Versluis
- article
- Communications Physics, 2018, 1, pp.22. ⟨10.1038/s42005-018-0020-9⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- AMICal Sat and ATISE: two space missions for auroral monitoring
- auteur
- Mathieu Barthélemy, Vladimir Kalegaev, Anne Vialatte, Etienne Le Coarer, Erik Kerstel, Alexander Basaev, Guillaume Bourdarot, Melanie Prugniaux, Thierry Sequies, Etienne Rolland, Emmanuelle Aubert, Vincent Grennerat, Hacheme Ayasso, Arnau Busom Vidal, Fabien Apper, Mikhail Stepanov, Benedicte Escudier, Laurence Croizé, Frédéric Romand, Sébastien Payan, Mikhail Panasyuk
- article
- Journal of Space Weather and Space Climate, 2018, 8, A44 (12p.). ⟨10.1051/swsc/2018035⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Book sections
- titre
- Selection and Use of Intracellular Antibodies
- auteur
- Sandrine Moutel, Clément Nizak, Franck Perez
- article
- Methods in molecular biology, pp.491-503, 2018
- typdoc
- Book sections
- Accès au bibtex
-
2017
Journal articles
- titre
- Characterization of foreign materials in paraffin-embedded pathological specimens using in situ multi-elemental imaging with laser spectroscopy
- auteur
- Benoit Busser, Samuel Moncayo, Florian Trichard, Vincent Bonneterre, Nicole Pinel, Frederic Pelascini, Philippe Dugourd, Jean-Luc Coll, Michel d'Incan, Julie Charles, Vincent Motto-Ros, Lucie Sancey
- article
- Modern Pathology, 2017, 31 (3), pp.378 - 384. ⟨10.1038/modpathol.2017.152⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- De l’optique dans les nanosatellites
- auteur
- Mathieu Barthelemy, Erik Kerstel, Etienne Lecoarer, Nathalie Martino, Thierry Sequies, Equipe Csug
- article
- Photoniques, 2017
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- Fisher Waves: an individual based stochastic model
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh, Marcel Vallade
- article
- Physical Review E , 2017, 96, pp.012414. ⟨10.1103/PhysRevE.96.012414⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Neutral Aggregation in Finite Length Genotype space
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh
- article
- Physical Review E , 2017, 95, pp.012402. ⟨10.1103/physreve.95.012402⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Resource reallocation in bacteria by reengineering the gene expression machinery
- auteur
- Hidde de Jong, Johannes Geiselmann, Delphine Ropers
- article
- Trends in Microbiology, 2017, 25 (6), pp.480-493. ⟨10.1016/j.tim.2016.12.009⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- Synthesis of new hydrophilic rhodamine based enzymatic substrates compatible with droplet-based microfluidic assays
- auteur
- Johan Fenneteau, Dany Chauvin, Andrew D. Griffiths, Clément Nizak, Janine Cossy
- article
- Chemical Communications, 2017, 53 (39), pp.5437-5440. ⟨10.1039/c7cc01506b⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
2016
Journal articles
- titre
- Nonlinear modification of the laser noise power spectrum induced by frequency-shifted optical feedback
- auteur
- Eric Lacot, Bahram Houchmandzadeh, Vadim Girardeau, Olivier Hugon, Olivier Jacquin
- article
- Physical Review A : Atomic, molecular, and optical physics [1990-2015], 2016, ⟨10.1103/PhysRevA.94.033843⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- The impact of cardiac ischemia/reperfusion on the mitochondria-cytoskeleton interactions.
- auteur
- Rafaela Bagur, Stéphane Tanguy, Sarah Foriel, Alexei Grichine, Caroline Sanchez, Karin Pernet-Gallay, Tuuli Kaambre, Andrey V Kuznetsov, Yves Usson, François Boucher, Rita Guzun
- article
- BBA - Biochimica et Biophysica Acta, 2016, 1862 (6), pp.1159-1171. ⟨10.1016/j.bbadis.2016.03.009⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- A simple, general result for the variance of substitution number in molecular evolution.
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh, Marcel Vallade
- article
- Molecular Biology and Evolution, 2016, 33 (7), pp.1858. ⟨10.1093/molbev/msw063⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Hierarchy and extremes in selections from pools of randomized proteins
- auteur
- Sébastien Boyer, Dipanwita Biswas, Ananda Kumar Soshee, Natale Scaramozzino, Clément Nizak, Olivier Rivoire
- article
- Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2016, 113 (13), pp.3482-3487. ⟨10.1073/pnas.1517813113⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- Dynamical allocation of cellular resources as an optimal control problem: Novel insights into microbial growth strategies
- auteur
- Nils Giordano, Francis Mairet, Jean-Luc Gouzé, Johannes Geiselmann, Hidde de Jong
- article
- PLoS Computational Biology, 2016, 12 (3), pp.e1004802. ⟨10.1371/journal.pcbi.1004802⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Conserved Units of Co-Expression in Bacterial Genomes: An Evolutionary Insight into Transcriptional Regulation
- auteur
- Ivan Junier, Olivier Rivoire
- article
- PLoS ONE, 2016, 11 (5), pp.e0155740. ⟨10.1371/journal.pone.0155740⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Informations in Models of Evolutionary Dynamics
- auteur
- Olivier Rivoire
- article
- Journal of Statistical Physics, 2016, ⟨10.1007/s10955-015-1381-z⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- Hierarchy and extremes in selections from pools of randomized proteins
- auteur
- Sébastien Boyer, Dipanwita Biswas, Anandakumar Soshee, Natate Scaramozzino, Clément Nizak, Olivier Rivoire
- article
- Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2016, ⟨10.1073/pnas.1517813113⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
2015
Journal articles
- titre
- Green autofluorescence, a double edged monitoring tool for bacterial growth and activity in micro-plates
- auteur
- Irina Mihalcescu, Mathilde Van-Melle Gateau, Bernard Chelli, Corinne Pinel, Jean-Luc Ravanat
- article
- Physical Biology, 2015, 12 (6), ⟨10.1088/1478-3975/12/6/066016⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A synthetic growth switch based on controlled expression of RNA polymerase
- auteur
- Jérôme Izard, Cindy Gomez-Balderas, Delphine Ropers, Stephan Lacour, Xiaohu Song, Yifan Yang, Ariel B. Lindner, Johannes Geiselmann, Hidde de Jong
- article
- Molecular Systems Biology, 2015, 11 (11), pp.840
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- Neutron fluctuations: The importance of being delayed
- auteur
- C. Tamain, B. Arab-Chapelet, M. Rivenet, S. Grandjean, F. Abraham, B. Houchmandzadeh, E. Dumonteil, A. Mazzolo, A. Zoia
- article
- Physical Review E : Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics [2001-2015], 2015, 92 (5), pp.246-256. ⟨10.1103/PhysRevE.92.052114⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- General formulation of Luria-Delbrück distribution of the number of mutants
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh
- article
- Physical Review E : Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics [2001-2015], 2015, 92, pp.012719
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Exact results for a noise-induced bistable system
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh, Marcel Vallade
- article
- Physical Review E : Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics [2001-2015], 2015, 91, pp.022115
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Fluctuation driven fixation of cooperative behavior
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh
- article
- BioSystems, 2015, 127, pp.60. ⟨10.1016/j.biosystems.2014.11.006⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Inference of quantitative models of bacterial promoters from time-series reporter gene data
- auteur
- Diana Stefan, Corinne Pinel, Stephane Pinhal, Eugenio Cinquemani, Johannes Geiselmann, Hidde de Jong
- article
- PLoS Computational Biology, 2015, 11 (1), pp.e1004028. ⟨10.1371/journal.pcbi.1004028⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- Robust reconstruction of gene expression profiles from reporter gene data using linear inversion
- auteur
- Valentin Zulkower, Michel Page, Delphine Ropers, Johannes Geiselmann, Hidde de Jong
- article
- Bioinformatics, 2015, 31 (12), pp.i71-i79. ⟨10.1093/bioinformatics/btv246⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- Evolution of sparsity and modularity in a model of protein allostery
- auteur
- Mathieu Hemery, Olivier Rivoire
- article
- Physical Review E : Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics [2001-2015], 2015, ⟨10.1103/PhysRevE.91.042704⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Breaking evolutionary constraint with a tradeoff ratchet
- auteur
- Marjon G. J. de Vos, Alexandre Dawid, Vanda Sunderlikova, Sander J Tans
- article
- Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2015, 112 (48), pp.14906-11. ⟨10.1073/pnas.1510282112⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- Understanding carbon catabolite repression in Escherichia coli using quantitative models
- auteur
- Andreas Kremling, Johannes Geiselmann, Delphine Ropers, Hidde de Jong
- article
- Trends in Microbiology, 2015, 23 (2), pp.99-109. ⟨10.1016/j.tim.2014.11.002⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
Conference papers
- titre
- Fluorescent reporter genes and the analysis of bacterial regulatory networks
- auteur
- Hidde de Jong, Johannes Geiselmann
- article
- Hybrid Systems Biology: Proceedings of the Second International Workshop, HSB 2013, and Third International Workshop, HSB 2014, 2015, Vienna, Austria. pp.1-24, ⟨10.1007/978-3-319-27656-4_2⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au bibtex
-
Book sections
- titre
- La cellule procaryote en biotechnologies
- auteur
- Sandrine Bourgoin-Voillard, Claire Durmort, Johannes Geiselmann, Audrey Le Gouellec, Delphine Ropers, Michel Sève
- article
- Introduction aux biotechnologies en santé, Tome 1, Tec & Doc Lavoisier, pp.318, 2015, Les biotechnologies en santé, 2743020857
- typdoc
- Book sections
- Accès au bibtex
-
Patents
- titre
- Method for producing metabolites, peptides and recombinant proteins
- auteur
- Johannes Geiselmann, Hidde de Jong, Delphine Ropers, Jérôme Izard
- article
- France, Patent n° : EP2848695. 2015
- typdoc
- Patents
- Accès au bibtex
-
- titre
- Method for producing metabolites, peptides and recombinant proteins
- auteur
- Johannes Geiselmann, Hidde de Jong, Delphine Ropers, Jérôme Izard
- article
- France, Patent n° : EP2848695 (A1). 2015
- typdoc
- Patents
- Accès au bibtex
-
2014
Journal articles
- titre
- An evolutionarily significant unicellular strategy in response to starvation stress in Dictyostelium social amoebae
- auteur
- Darja Dubravcic, Minus van Baalen, Clément Nizak
- article
- F1000Research, 2014, 3, pp.133. ⟨10.12688/f1000research.4218.1⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- A model for the generation and transmission of variations in evolution.
- auteur
- Olivier Rivoire, Stanislas Leibler
- article
- Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2014, 111 (19), pp.E1940-9. ⟨10.1073/pnas.1323901111⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- The remarkable discreteness of being
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh
- article
- Journal of Biosciences, 2014, 39 (2), pp.1-10. ⟨10.1007/s12038-013-9350-7⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Recombinant antibody mediated delivery of organelle-specific DNA pH sensors along endocytic pathways
- auteur
- Souvik Modi, S. Haider, Clément Nizak, Yamuna Krishnan
- article
- Nanoscale, 2014, 6 (2), pp.1144-52. ⟨10.1039/c3nr03769j⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- General in vitro method to analyze the interactions of synthetic polymers with human antibody repertoires
- auteur
- Anandakumar Soshee, Stefan Zürcher, N. Spencer, A. Halperin, Clément Nizak
- article
- Biomacromolecules, 2014, 15 (1), pp.113-21. ⟨10.1021/bm401360y⟩
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- Journal articles
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-
- titre
- An alternative to the breeder's and Lande's equations.
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh
- article
- G3, 2014, 4(1) (1), pp.97-108. ⟨10.1534/g3.113.008433⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Selection of Arginine-Rich Anti-Gold Antibodies Engineered for Plasmonic Colloid Self-Assembly
- auteur
- Purvi Jain, Anandakumar Soshee, S.Shankara Narayanan, Jadab Sharma, Christian Girard, Erik Dujardin, Clément Nizak
- article
- Journal of Physical Chemistry C, 2014, 118 (26), 10.1021/jp502118n. ⟨10.1021/jp502118n⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
2013
Journal articles
- titre
- Procedure to construct a multi-scale coarse-grained model of DNA-coated colloids from experimental data
- auteur
- Bianca M. Mladek, Julia Fornleitner, Francisco J. Martinez-Veracoechea, Alexandre Dawid, Daan Frenkel
- article
- Soft Matter, 2013, 9, pp.7342. ⟨10.1039/C3SM50701G⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Two DNA nanomachines map pH changes along intersecting endocytic pathways inside the same cell.
- auteur
- Souvik Modi, Clément Nizak, Sunaina Surana, Saheli Halder, Yamuna Krishnan
- article
- Nature Nanotechnology, 2013, 8 (6), pp.459-67. ⟨10.1038/nnano.2013.92⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Exact results for fixation probability of bithermal evolutionary graphs.
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh, Marcel Vallade
- article
- BioSystems, 2013, 112 (1), pp.49-54. ⟨10.1016/j.biosystems.2013.03.020⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Elements of Coevolution in Biological Sequences
- auteur
- Olivier Rivoire
- article
- Physical Review Letters, 2013, 110, pp.178102. ⟨10.1103/PHYSREVLETT.110.178102⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
2012
Journal articles
- titre
- Selection for altruism through random drift in variable size populations.
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh, Marcel Vallade
- article
- BMC Evolutionary Biology, 2012, 12, pp.61. ⟨10.1186/1471-2148-12-61⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Selection and use of intracellular antibodies (intrabodies).
- auteur
- Sandrine Moutel, Clément Nizak, Franck Perez
- article
- Methods in Molecular Biology, 2012, 907, pp.667-79. ⟨10.1007/978-1-61779-974-7_37⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Quantitative Prediction of the Phase Diagram of DNA-Functionalized Nanosized Colloids
- auteur
- Bianca M. Mladek, Julia Fornleitner, Francisco J. Martinez-Veracoechea, Alexandre Dawid, Daan Frenkel
- article
- Physical Review Letters, 2012, 108 (26), pp.268301. ⟨10.1103/PhysRevLett.108.268301⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
2011
Journal articles
- titre
- Fluctuations importance and control in biological systems
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh, Irina Mihalcescu
- article
- Europhysics News, 2011, 42 (6), pp.36. ⟨10.1051/epn/2011606⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- The fixation probability of a beneficial mutation in a geographically structured population
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh, Marcel Vallade
- article
- New Journal of Physics, 2011, 13, pp.3020. ⟨10.1088/1367-2630/13/7/073020⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- The Value of Information for Populations in Varying Environments
- auteur
- Olivier Rivoire, Stanislas Leibler
- article
- Journal of Statistical Physics, 2011, 142, pp.1124-1166. ⟨10.1007/S10955-011-0166-2⟩
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- Journal articles
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-
- titre
- Buckling resistance of solid shell bubbles under ultrasound
- auteur
- Philippe Marmottant, Ayache Bouakaz, Nico de Jong, Catherine Quilliet
- article
- Journal of the Acoustical Society of America, 2011, 129 (3), pp.1231. ⟨10.1121/1.3543943⟩
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- Journal articles
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-
- titre
- Laser microstructuration of three-dimensional enzyme reactors in microfluidic channels
- auteur
- Monica Iosin, Teodora Scheul, Clément Nizak, Olivier Stephan, Simion Astilean, Patrice L. Baldeck
- article
- Microfluidics and Nanofluidics, 2011, 10 (3), pp.685-690. ⟨10.1007/s10404-010-0698-9⟩
- typdoc
- Journal articles
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2010
Journal articles
- titre
- Alternative to the diffusion equation in population genetics.
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh, Marcel Vallade
- article
- Physical Review E : Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics [2001-2015], 2010, 82 (5), pp.051913. ⟨10.1103/PhysRevE.82.051913⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Importance et contrôle des fluctuations dans les systèmes biologiques
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh, Irina Mihalcescu
- article
- Jahrbuch für Computerphilologie, 2010, 20, pp.17-21. ⟨10.1051/refdp/2010017⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- From Grazing Resistance to Pathogenesis: The Coincidental Evolution of Virulence Factors
- auteur
- Sandrine Adiba, Clément Nizak, Minus van Baalen, Erick Denamur, Frantz Depaulis
- article
- PLoS ONE, 2010, 5 (8), pp.e11882. ⟨10.1371/journal.pone.0011882⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Characterization of single chain antibody targets through yeast two hybrid.
- auteur
- Ole Vielemeyer, Clément Nizak, Ana Joaquina Jimenez, Arnaud Echard, Bruno Goud, Jacques Camonis, Jean-Christophe Rain, Franck Perez
- article
- BMC Biotechnology, 2010, 10 (1), pp.59. ⟨10.1186/1472-6750-10-59⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Lectures
- titre
- Mathématiques pour la Physique
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh
- article
- Licence. Mathématiques pour la Physique., France. 2010, pp.270
- typdoc
- Lectures
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Les processus stochastiques
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh
- article
- Doctoral. Les processus stochastiques, Grenoble, France. 2010
- typdoc
- Lectures
- Accès au texte intégral et bibtex
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