Publications HAL de Alejandro ESTANA du labo/EPI LAAS

2020

Journal articles

titre
Predicting secondary structure propensities in IDPs using simple statistics from three-residue fragments
auteur
Alejandro Estaña, Amélie Barozet, Assia Mouhand, Marc Vaisset, Christophe Zanon, Pierre Fauret, Nathalie Sibille, Pau Bernadó, Juan Cortés
article
Journal of Molecular Biology, Elsevier, 2020, ⟨10.1016/j.jmb.2020.07.026⟩
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https://hal.laas.fr/hal-02920302/file/MS_Estana_LS2P_2020_R1.pdf BibTex
titre
Flanking regions determine the structure of the poly-glutamine homo- repeat in huntingtin through mechanisms common among glutamine-rich human proteins
auteur
Annika Urbanek, Matija Popovic, Anna Morató, Alejandro Estaña, Carlos Elena-Real, Pablo Mier, Aurélie Fournet, Frédéric Allemand, Stéphane Delbecq, Miguel Andrade-Navarro, Juan Cortés, Nathalie Sibille, Pau Bernadó
article
Structure, Elsevier (Cell Press), 2020, 28 (7), pp.733-746.e5. ⟨10.1016/j.str.2020.04.008⟩
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https://hal.laas.fr/hal-02893075/file/Urbanek_etal_ms_rev_H16_HAL.pdf BibTex
titre
Evidence of the reduced abundance of proline cis conformation in protein poly-proline tracts
auteur
Annika Urbanek, Matija Popovic, Carlos Elena-Real, Anna Morató, Alejandro Estaña, Aurélie Fournet, Frédéric Allemand, Ana Gil, Carlos Cativiela, Juan Cortés, Ana Jiménez, Nathalie Sibille, Pau Bernadó
article
Journal of the American Chemical Society, American Chemical Society, 2020, 142 (17), pp.7976-7986. ⟨10.1021/jacs.0c02263⟩
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https://hal.laas.fr/hal-02545935/file/urbanek_etal_polypro_2020_ms_HAL.pdf BibTex

2019

Journal articles

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Investigating the Formation of Structural Elements in Proteins Using Local Sequence-Dependent Information and a Heuristic Search Algorithm
auteur
Alejandro Estaña, Malik Ghallab, Pau Bernadó, Juan Cortés
article
Molecules, MDPI, 2019, 24 (6), pp.1150. ⟨10.3390/molecules24061150⟩
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https://hal.laas.fr/hal-02080026/file/Estana_MDPI-Molecules_2019.pdf BibTex
titre
Realistic Ensemble Models of Intrinsically Disordered Proteins Using a Structure-Encoding Coil Database
auteur
Alejandro Estaña, Nathalie Sibille, Elise Delaforge, Marc Vaisset, Juan Cortés, Pau Bernadó
article
Structure, Elsevier (Cell Press), 2019, 27 (5), pp.381-391.e2. ⟨10.1016/j.str.2018.10.016⟩
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https://hal.laas.fr/hal-01954977/file/Estana_IDPs_Structure_2019.pdf BibTex

2018

Journal articles

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Hybrid parallelization of a multi-tree path search algorithm: Application to highly-flexible biomolecules
auteur
Alejandro Estaña, Kevin Molloy, Marc Vaisset, Nathalie Sibille, Thierry Simeon, Pau Bernadó, Juan Cortés
article
Parallel Computing, Elsevier, 2018, 77, pp.84-100. ⟨10.1016/j.parco.2018.06.005⟩
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https://hal.laas.fr/hal-01823694/file/Hybrid_MultiTRRT.pdf BibTex

2017

Journal articles

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Structural Characterization of Highly Flexible Proteins by Small-Angle Scattering.
auteur
Tiago Cordeiro, Fatima Herranz-Trillo, Annika Urbanek, Alejandro Estaña, Juan Cortés, Nathalie Sibille, Pau Bernadó
article
Advances in Experimental Medicine and Biology, Kluwer, 2017, pp.PP.107-129. ⟨10.1007/978-981-10-6038-0_7⟩
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https://hal.laas.fr/hal-01664316/file/Cordeiro_etal_SAS_IDPs_preprint.pdf BibTex
titre
Small-angle scattering studies of intrinsically disordered proteins and their complexes
auteur
Tiago Cordeiro, Fatima Herranz-Trillo, Annika Urbanek, Alejandro Estaña, Juan Cortés, Nathalie Sibille, Pau Bernadó
article
Current Opinion in Structural Biology, Elsevier, 2017, 42, pp.15 - 23. ⟨10.1016/j.sbi.2016.10.011⟩
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https://hal.laas.fr/hal-01391541/file/Cordeiro_etal_COSB-2017_ms_rev.pdf BibTex