Publications HAL de FURTLEHNER du labo/EPI TAO;TAU

2024

Preprints, Working Papers, ...

titre
Latent generative modeling of long genetic sequences with GANs
auteur
Antoine Szatkownik, Cyril Furtlehner, Guillaume Charpiat, Burak Yelmen, Flora Jay
article
2024
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BibTex
titre
Diffusion-based artificial genomes and their usefulness for local ancestry inference
auteur
Antoine Szatkownik, Léo Planche, Maïwen Demeulle, Titouan Chambe, María Ávila-Arcos, Emilia Huerta-Sanchez, Cyril Furtlehner, Cyril Furtlehner, Flora Jay, Burak Yelmen
article
2024
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BibTex

2023

Journal articles

titre
Deep convolutional and conditional neural networks for large-scale genomic data generation
auteur
Burak Yelmen, Aurélien Decelle, Leila Lea Boulos, Antoine Szatkownik, Cyril Furtlehner, Guillaume Charpiat, Flora Jay
article
PLoS Computational Biology, 2023, 19 (10), pp.e1011584. ⟨10.1101/2023.03.07.530442⟩
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https://hal.science/hal-04244818/file/Yelmen%20et%20al.%20-%202023%20-%20Deep%20convolutional%20and%20conditional%20neural%20networks.pdf BibTex
titre
Free Dynamics of Feature Learning Processes
auteur
Cyril Furtlehner
article
Journal of Statistical Physics, 2023, Journal of Statistical Physics, 190 (51), pp.42. ⟨10.1007/s10955-022-03064-5⟩
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https://inria.hal.science/hal-03878500/file/JstatPhys_editor.pdf BibTex

Conference papers

titre
Towards creating longer genetic sequences with GANs: Generation in principal component space
auteur
Antoine Szatkownik, Cyril Furtlehner, Guillaume Charpiat, Burak Yelmen, Flora Jay
article
MLCB 2023 - 18th Conference on Machine Learning in Computational Biology, Nov 2023, Seattle, United States
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https://hal.science/hal-04419057/file/Szatkownik_PCA_GAN_for_genomics_camera_ready-2.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
Inferring effective couplings with Restricted Boltzmann Machines
auteur
Aurélien Decelle, Cyril Furtlehner, Alfonso de Jesus Navas Gómez, Beatriz Seoane
article
2023
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https://arxiv.org/pdf/2309.02292 BibTex

2022

Journal articles

titre
Learning a Restricted Boltzmann Machine using biased Monte Carlo sampling
auteur
Nicolas Béreux, Aurélien Decelle, Cyril Furtlehner, Beatriz Seoane
article
SciPost Physics, In press, 14 (3), pp.032. ⟨10.21468/SciPostPhys.14.3.032⟩
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https://inria.hal.science/hal-03795598/file/art_tmc.pdf BibTex
titre
Short-term Forecasting of Urban Traffic using Spatio-Temporal Markov Field
auteur
Cyril Furtlehner, Jean-Marc Lasgouttes, Alessandro Attanasi, Marco Pezzulla, Guido Gentile
article
IEEE Transactions on Intelligent Transportation Systems, 2022, 23 (8), pp.10858-10867. ⟨10.1109/TITS.2021.3096798⟩
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https://inria.hal.science/hal-03285664/file/main.pdf BibTex

2021

Journal articles

titre
Creating artificial human genomes using generative neural networks
auteur
Burak Yelmen, Aurélien Decelle, Linda Ongaro, Davide Marnetto, Corentin Tallec, Francesco Montinaro, Cyril Furtlehner, Luca Pagani, Flora Jay
article
PLoS Genetics, 2021, 17 (2), pp.e1009303. ⟨10.1371/journal.pgen.1009303⟩
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https://hal.science/hal-03149930/file/manuscript_Yelmen2020_withFooter_Header_Figs.pdf BibTex
titre
Exact Training of Restricted Boltzmann Machines on Intrinsically Low Dimensional Data
auteur
A Decelle, Cyril Furtlehner
article
Physical Review Letters, 2021, pp.158303. ⟨10.1103/PhysRevLett.127.158303⟩
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https://inria.hal.science/hal-03432350/file/rbm-letter_final.pdf BibTex

Conference papers

titre
Equilibrium and non-Equilibrium regimes in the learning of Restricted Boltzmann Machines
auteur
Aurélien Decelle, Cyril Furtlehner, Beatriz Seoane
article
NeurIPS 2021, Dec 2021, Vancouver, United States
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https://arxiv.org/pdf/2105.13889 BibTex

2020

Journal articles

titre
Gaussian-Spherical Restricted Boltzmann Machines
auteur
Aurelien Decelle, Cyril Furtlehner
article
Journal of Physics A: Mathematical and Theoretical, 2020, 53 (18), pp.184002. ⟨10.1088/1751-8121/ab79f3⟩
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https://arxiv.org/pdf/1910.14544 BibTex
titre
Restricted Boltzmann Machine, recent advances and mean-field theory
auteur
Aurélien Decelle, Cyril Furtlehner
article
Chinese Physics B, 2020, 30 (4), pp.040202. ⟨10.1088/1674-1056/abd160⟩
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https://hal.science/hal-03143314/file/Decelle%2Bet%2Bal_2020_Chinese_Phys._B_10.1088_1674-1056_abd160.pdf BibTex

Conference papers

titre
Dynamic Time Lag Regression: Predicting What and When
auteur
Mandar Chandorkar, Cyril Furtlehner, Bala Poduval, Enrico Camporeale, Michèle Sebag
article
ICLR 2020 - 8th International Conference on Learning Representations, Apr 2020, Addis Abeba, Ethiopia
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https://inria.hal.science/hal-02422148/file/iclr-paper.pdf BibTex
titre
Robust Multi-Output Learning with Highly Incomplete Data via Restricted Boltzmann Machines
auteur
Giancarlo Fissore, Aurelien Decelle, Cyril Furtlehner, Yufei Han
article
European Starting AI Researchers' Symposium 2020, Aug 2020, Santiago Compostela, Spain
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https://arxiv.org/pdf/1912.09382 BibTex

Habilitation à diriger des recherches

titre
Statistical physics methods for machine learning and traffic forecasting
auteur
Cyril Furtlehner
article
Statistical Mechanics [cond-mat.stat-mech]. Université Paris Saclay, 2020
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https://inria.hal.science/tel-02917159/file/hdr.pdf BibTex

2019

Reports

titre
Spatio-temporal Probabilistic Short-term Forecasting on Urban Networks
auteur
Cyril Furtlehner, Jean-Marc Lasgouttes, Alessandro Attanasi, Lorenzo Meschini, Marco Pezzulla
article
[Research Report] RR-9236, Inria Saclay -Île de France; Inria de Paris; PTV-SISTeMA. 2019, pp.30
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https://inria.hal.science/hal-01964270/file/RR-9236-2.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
Creating Artificial Human Genomes Using Generative Models
auteur
Burak Yelmen, Aurelien Decelle, Linda Ongaro, Davide Marnetto, Francesco Montinaro, Cyril Furtlehner, Luca Pagani, Flora Jay
article
2019
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https://hal.science/hal-02413942/file/bioarxiv_769091v2.full.pdf BibTex

2018

Journal articles

titre
Thermodynamics of Restricted Boltzmann Machines and Related Learning Dynamics
auteur
Aurélien Decelle, Giancarlo Fissore, Cyril Furtlehner
article
Journal of Statistical Physics, 2018, 172 (6), pp.1576-1608. ⟨10.1007/s10955-018-2105-y⟩
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https://inria.hal.science/hal-01675310/file/RR-9139.pdf BibTex

2017

Journal articles

titre
Spectral Dynamics of Learning Restricted Boltzmann Machines
auteur
A Decelle, G Fissore, Cyril Furtlehner
article
EPL - Europhysics Letters, 2017, 119, pp.60001. ⟨10.1209/0295-5075/119/60001⟩
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https://inria.hal.science/hal-01652314/file/main.pdf BibTex

2016

Journal articles

titre
Latent binary MRF for online reconstruction of large scale systems
auteur
Victorin Martin, Jean-Marc Lasgouttes, Cyril Furtlehner
article
Annals of Mathematics and Artificial Intelligence, 2016, 77 (1), pp.123-154. ⟨10.1007/s10472-015-9470-x⟩
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https://inria.hal.science/hal-01186220/file/LatentIsing.pdf BibTex
titre
Cycle-based Cluster Variational Method for Direct and Inverse Inference
auteur
Cyril Furtlehner, Aurélien Decelle
article
Journal of Statistical Physics, 2016, 164 (3), pp.531-574. ⟨10.1007/s10955-016-1566-0⟩
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https://inria.hal.science/hal-01214155/file/gcbp_paper.pdf BibTex

2015

Poster communications

titre
Seeded Influencer Ranking
auteur
Marco Bressan, Philippe Caillou, Cyril Furtlehner, Michèle Sebag, Fabien Barzic
article
Big Data Business Convention, Nov 2015, Jouy-en-Josas, France
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https://hal.science/hal-03832447/file/TobiPrint.pdf BibTex

2014

Journal articles

titre
Data Stream Clustering with Affinity Propagation
auteur
Xiangliang Zhang, Cyril Furtlehner, Cecile Germain-Renaud, Michèle Sebag
article
IEEE Transactions on Knowledge and Data Engineering, 2014, 26 (7), pp.1
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https://inria.hal.science/hal-00862941/file/strap_final_revision.pdf BibTex
titre
Traffic data reconstruction based on Markov random field modeling
auteur
Kataoa Shun, Yasuda Muneki, Cyril Furtlehner, Kazuyuki Tanaka
article
Inverse Problems, 2014, 30 (2), pp.15. ⟨10.1088/0266-5611/30/2/025003⟩
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BibTex

Conference papers

titre
GMRF Estimation under Topological and Spectral Constraints
auteur
Victorin Martin, Cyril Furtlehner, Yufei Han, Jean-Marc Lasgouttes
article
7th European Conference on Machine Learning and Principles and Practice of Knowledge Discovery in Databases, Sep 2014, Nancy, France. pp.370-385, ⟨10.1007/978-3-662-44851-9_24⟩
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https://hal.science/hal-01065607/file/ECML14_IPS_final.pdf BibTex

2013

Journal articles

titre
Pairwise MRF Models Selection for Traffic Inference
auteur
Cyril Furtlehner
article
Interdisciplinary Information Sciences, 2013, Special Issue: The 4th Young Scientist Meeting on Statistical Physics and Information Processing in Sendai, 19 (1), pp.17-22. ⟨10.4036/iis.2013.17⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-00865089/file/iis2012-draft.pdf BibTex
titre
Approximate Inverse Ising models close to a Bethe Reference Point
auteur
Cyril Furtlehner
article
Journal of Statistical Mechanics: Theory and Experiment, 2013, Volume2013, pp.P09020. ⟨10.1088/1742-5468/2013/09/P09020⟩
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https://inria.hal.science/hal-00865085/file/jstatmech.pdf BibTex

Reports

titre
Using Latent Binary Variables for Online Reconstruction of Large Scale Systems
auteur
Victorin Martin, Jean-Marc Lasgouttes, Cyril Furtlehner
article
[Research Report] RR-8435, INRIA. 2013, pp.34
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-00922106/file/RR-8435.pdf BibTex

2012

Journal articles

titre
One-dimensional Particle Processes with Acceleration/Braking Asymmetry
auteur
Cyril Furtlehner, Jean-Marc Lasgouttes, Maxim Samsonov
article
Journal of Statistical Physics, 2012, 147 (6), pp.1113-1144. ⟨10.1007/s10955-012-0521-y⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-00743369/file/FDiag-revis.pdf BibTex

Conference papers

titre
Local stability of Belief Propagation algorithm with multiple fixed points
auteur
Victorin Martin, Jean-Marc Lasgouttes, Cyril Furtlehner
article
STAIRS'12 - Sixth "Starting Artificial Intelligence Research" Symposium, Aug 2012, Montpellier, France. pp.180-191
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-00719204/file/FreeSTAIRS.pdf BibTex

Book sections

titre
An Ising Model for Road Traffic Inference
auteur
Cyril Furtlehner
article
Xavier Leoncini and Marc Leonetti. From Hamiltonian Chaos to Complex Systems: a Nonlinear Physics Approach, Springer, 2012
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-00743351/file/cct-chap.pdf BibTex

Reports

titre
Pairwise MRF Calibration by Perturbation of the Bethe Reference Point
auteur
Cyril Furtlehner, Yufei Han, Jean-Marc Lasgouttes, Victorin Martin
article
[Research Report] RR-8059, INRIA. 2012, pp.35
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-00743334/file/RR-8059.pdf BibTex

2011

Conference papers

titre
The Fundamental Diagram on the Ring Geometry for Particle Processes with Acceleration/Braking Asymmetry
auteur
Cyril Furtlehner, Jean-Marc Lasgouttes, Maxim Samsonov
article
TGF'11 - Traffic and Granular Flow, Sep 2011, Moscou, Russia
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-00646988/file/tgf11.pdf BibTex
titre
About Hydrodynamic Limit of Some Exclusion Processes via Functional Integration
auteur
Guy Fayolle, Cyril Furtlehner
article
International Mathematical Conference "50 YEARS OF IITP", Institute for Information Transmission Problems (Russian Academy of Sciences), Jul 2011, Moscow, Russia
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-00662674/file/Fayolle-IPPI-50.pdf BibTex
titre
Propagation of information on undirected dependency graphs for road traffic inference
auteur
Cyril Furtlehner, Yufei Han, Jean-Marc Lasgouttes, Victorin Martin, Fabien Moutarde
article
CCT'11 - Chaos, Complexity and Transport, May 2011, Marseille, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/hal-00648681/file/cct11-proc.pdf BibTex
titre
A probabilistic framework for road traffic reconstruction and prediction based on incomplete data
auteur
Victorin Martin, Jean-Marc Lasgouttes, Cyril Furtlehner
article
Actes du GERI SMRT 2011, 2011, Marne-la-Vallée, France. pp.91-96
Accès au bibtex
BibTex

Reports

titre
The Role of Normalization in the Belief Propagation Algorithm
auteur
Victorin Martin, Jean-Marc Lasgouttes, Cyril Furtlehner
article
[Research Report] RR-7514, INRIA. 2011, pp.31
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/inria-00558444/file/RR-7514.pdf BibTex

2010

Journal articles

titre
Scaling Analysis of Affinity Propagation
auteur
Cyril Furtlehner, Michèle Sebag, Zhang Xiangliang
article
Physical Review E : Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics, 2010, 81 (6), pp.066102. ⟨10.1103/PhysRevE.81.066102⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/inria-00420407/file/pre_v2.pdf BibTex
titre
Learning Multiple Belief Propagation Fixed Points for Real Time Inference
auteur
Cyril Furtlehner, Jean-Marc Lasgouttes, Anne Auger
article
Physica A: Statistical Mechanics and its Applications, 2010, 389, pp.149-163. ⟨10.1016/j.physa.2009.08.030⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/inria-00371372/file/RRLBP08.pdf BibTex

Conference papers

titre
Spatial and Temporal Analysis of Traffic States on Large Scale Networks
auteur
Cyril Furtlehner, Yufei Han, Jean-Marc Lasgouttes, Victorin Martin, Fabrice Marchal, Fabien Moutarde
article
13th International IEEE Conference on Intelligent Transportation Systems ITSC'2010, Sep 2010, Madère, Portugal
Accès au texte intégral et bibtex
https://minesparis-psl.hal.science/hal-00527481/file/ITSC10_0464_FINAL.pdf BibTex
titre
Multi-Objective 3-SAT with Survey-Propagation
auteur
Cyril Furtlehner, Marc Schoenauer
article
NIPS 2010 Workshop on Discrete Optimization in Machine Learning: Structures, Algorithms and Applications (DISCML), Dec 2010, Whisler, Canada
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/inria-00533149/file/wnips2010.pdf BibTex
titre
Exactly Solvable Stochastic Processes for Traffic Modelling
auteur
Maxim Samsonov, Cyril Furtlehner, Jean-Marc Lasgouttes
article
25th International Symposium on Computer and Information Sciences - ISCIS 2010, Erol Gelenbe, Ricardo Lent, Georgia Sakellari, Sep 2010, Londres, United Kingdom. pp.75-78
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/inria-00533154/file/smodels_short.pdf BibTex

Reports

titre
Exactly Solvable Stochastic Processes for Traffic Modelling
auteur
Maxim Samsonov, Cyril Furtlehner, Jean-Marc Lasgouttes
article
[Research Report] RR-7278, INRIA. 2010, pp.26
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/inria-00492430/file/RR-7278.pdf BibTex
titre
Multi Objective 3-SAT Problems addressed with Message Passing Techniques
auteur
Cyril Furtlehner, Marc Schoenauer
article
[Research Report] RR-7424, INRIA. 2010, pp.21
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/inria-00528438/file/RR-7424.pdf BibTex

2009

Conference papers

titre
Toward Autonomic Grids: Analyzing the Job Flow with Affinity Streaming
auteur
Xiangliang Zhang, Cyril Furtlehner, Julien Perez, Cécile Germain, Michèle Sebag
article
15th ACM SIGKDD Conference on Knowledge Discovery and Data Mining (KDD), Jun 2009, Paris, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/inria-00393825/file/sub_sigkdd_v3.pdf BibTex

2008

Conference papers

titre
Distributed and Incremental Clustering Based on Weighted Affinity Propagation
auteur
Xiangliang Zhang, Cyril Furtlehner, Michèle Sebag
article
the fourth European Starting AI Researcher Symposium (STAIRS), Jul 2008, Patras, Greece
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/inria-00287378/file/STAIRS08_vfinal.pdf BibTex
titre
Frugal and Online Affinity Propagation
auteur
Xiangliang Zhang, Cyril Furtlehner, Michèle Sebag
article
Conférence francophone sur l'Apprentissage (CAP), May 2008, Ile de Porquerolles, France
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/inria-00287381/file/v5_for_final.pdf BibTex
titre
Data Streaming with Affinity Propagation
auteur
Xiangliang Zhang, Cyril Furtlehner, Michèle Sebag
article
European Conference on Machine Learning and Principles and Practice of Knowledge Discovery in Databases, Sep 2008, Antwerp, Belgium
Accès au texte intégral et bibtex
https://inria.hal.science/inria-00289679/file/ECML08_final3.pdf BibTex