2024
Journal articles
- titre
- A set of ecosystem service indicators for European grasslands based on botanical surveys
- auteur
- Simon Taugourdeau, Frédérique Louault, Alice Michelot-Antalik, Samir Messad, François Munoz, Denis Bastianelli, Pascal Carrère, Sylvain Plantureux
- article
- Grassland Research, 2024, pp.1-14. ⟨10.1002/glr2.12069⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Why incorporate plant architecture into trait-based ecology?
- auteur
- Marilyne Laurans, François Munoz, Tristan Charles-Dominique, Patrick Heuret, Claire Fortunel, Sandrine Isnard, Sylvie-Annabel Sabatier, Yves Caraglio, Cyrille Violle
- article
- Trends in Ecology & Evolution, 2024, ⟨10.1016/j.tree.2023.11.011⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
2023
Journal articles
- titre
- The ecological causes of functional distinctiveness in communities
- auteur
- François Munoz, Christopher A Klausmeier, Pierre Gaüzère, Gaurav Kandlikar, Elena Litchman, Nicolas Mouquet, Annette Ostling, Wilfried Thuiller, Adam C Algar, Arnaud Auber, Marc W Cadotte, Léo Delalandre, Pierre Denelle, Brian J Enquist, Claire Fortunel, Matthias Grenié, Nicolas Loiseau, Lucie Mahaut, Anthony Maire, David Mouillot, Catalina Pimiento, Cyrille Violle, Nathan J B Kraft
- article
- Ecology Letters, 2023, 26 (8), pp.1452-1465. ⟨10.1111/ele.14265⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Links to rare climates do not translate into distinct traits for island endemics
- auteur
- Vanessa Cutts, Dagmar Hanz, Martha Paola Barajas-Barbosa, Franziska Schrodt, Manuel Steinbauer, Carl Beierkuhnlein, Pierre Denelle, José María Fernández-Palacios, Pierre Gaüzère, Matthias Grenié, Severin Irl, Nathan Kraft, Holger Kreft, Brian Maitner, François Munoz, Wilfried Thuiller, Cyrille Violle, Patrick Weigelt, Richard Field, Adam Algar
- article
- Ecology Letters, 2023, 26 (4), pp.504-515. ⟨10.1111/ele.14169⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- A novel procedure for CFU plating and counting
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh, Patrice Ballet
- article
- Journal of Microbiological Methods, 2023, 206, pp.106693. ⟨10.1016/j.mimet.2023.106693⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Object-based characterization of vegetation heterogeneity with sentinel images proves efficient in a highly human-influenced National Park of Côte d’Ivoire
- auteur
- Stéphanie Diane Konan Houphlet, Pauline Dusseux, Adjo Estelle Geneviève Adiko, Arthur Brice Konan-Waidhet, François Munoz, Sylvain Bigot, Constant Yves Adou Yao
- article
- Environmental Monitoring and Assessment, 2023, 195 (1), pp.200. ⟨10.1007/s10661-022-10792-4⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- The functional trait distinctiveness of plant species is scale dependent
- auteur
- Pierre Gaüzère, Benjamin Blonder, Pierre Denelle, Bertrand Fournier, Matthias Grenié, Léo Delalandre, Tamara Münkemüller, Francois Munoz, Cyrille Violle, Wilfried Thuiller
- article
- Ecography, 2023, 2023 (1), pp.e06504. ⟨10.1111/ecog.06504⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Revisiting extinction debt through the lens of multitrophic networks and meta‐ecosystems
- auteur
- Grégoire Blanchard, François Munoz
- article
- Oikos, 2023, 2023 (3), pp.e09435. ⟨10.1111/oik.09435⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- Recent Advances in Electrochemical Biosensors for Food Control
- auteur
- Francesco Rizzotto, Majd Khalife, Yanxia Hou, Carole Chaix, Florence Lagarde, Natale Scaramozzino, Jasmina Vidic
- article
- Micromachines, 2023, 14 (7), pp. 1412. ⟨10.3390/mi14071412⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Dissecting fine root diameter distribution at the community level captures root morphological diversity
- auteur
- Amandine Erktan, Catherine Roumet, François Munoz
- article
- Oikos, 2023, 2023 (1), ⟨10.1111/oik.08907⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Recent Advances on Peptide-Based Biosensors and Electronic Noses for Foodborne Pathogen Detection
- auteur
- Vanessa Escobar, Natale Scaramozzino, Jasmina Vidic, Arnaud Buhot, Raphaël Mathey, Carole Chaix, Yanxia Hou
- article
- Biosensors, 2023, 13, ⟨10.3390/bios13020258⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
Conference papers
- titre
- Lactation-induced changes in bone cellular and sub-cellular networks: indication for altered bone mineral transport
- auteur
- Tengteng Tang, Asier Munoz, Jacqueline Huo, Aurélien Gourrier, Alessandra Carriero, Kathryn Grandfield
- article
- International Union of Microbeam Analysis Societies Joint with the Annual Microscopical Society of Canada and FIB SEM Meetings, Jun 2023, Hamilton, Canada
- typdoc
- Conference papers
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-
Preprints, Working Papers, ...
- titre
- A general method for the estimation of moments of substitution number in molecular evolution
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh
- article
- 2023
- typdoc
- Preprints, Working Papers, ...
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2022
Journal articles
- titre
- Maturation models of fluorescent proteins are necessary for unbiased estimates of promoter activity
- auteur
- Antrea Pavlou, Eugenio Cinquemani, Johannes Geiselmann, Hidde de Jong
- article
- Biophysical Journal, 2022, 121 (21), pp.4179-4188. ⟨10.1016/j.bpj.2022.09.021⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Effects of Habitat and Competition on Niche Partitioning and Community Structure in Neotropical Ants
- auteur
- Alex Salas-López, Cyrille Violle, François Munoz, Florian Menzel, Jérôme Orivel
- article
- Frontiers in Ecology and Evolution, 2022, 10, pp.863080. ⟨10.3389/fevo.2022.863080⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Very High Resolution Species Distribution Modeling Based on Remote Sensing Imagery: How to Capture Fine-Grained and Large-Scale Vegetation Ecology With Convolutional Neural Networks?
- auteur
- Benjamin Deneu, Alexis Joly, Pierre Bonnet, Maximilien Servajean, François Munoz
- article
- Frontiers in Plant Science, 2022, 13, ⟨10.3389/fpls.2022.839279⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Deep Species Distribution Modeling From Sentinel-2 Image Time-Series: A Global Scale Analysis on the Orchid Family
- auteur
- Joaquim Estopinan, Maximilien Servajean, Pierre Bonnet, François Munoz, Alexis Joly
- article
- Frontiers in Plant Science, 2022, 13, pp.839327. ⟨10.3389/fpls.2022.839327⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Plant community impact on productivity: Trait diversity or key(stone) species effects?
- auteur
- Philipp Brun, Cyrille Violle, David Mouillot, Nicolas Mouquet, Brian J. Enquist, Francois Munoz, Tamara Munkemuller, Annette Ostling, Niklaus E. Zimmermann, Wilfried Thuiller
- article
- Ecology Letters, 2022, 25 (4), pp.913-925. ⟨10.1111/ele.13968⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
Patents
- titre
- Methods for counting the number of living microorganisms contained in a specimen sample and apparatuses for implementing such methods
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh, Patrice Ballet
- article
- France, Patent n° : WO2022/207514. 2022
- typdoc
- Patents
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-
2021
Journal articles
- titre
- Multiomics Study of Bacterial Growth Arrest in a Synthetic Biology Application
- auteur
- Delphine Ropers, Yohann Couté, Laëtitia Faure, Sabrina Ferré, Delphine Labourdette, Arieta Shabani, Lidwine Trouilh, Perrine Vasseur, Gwénaëlle Corre, Myriam Ferro, Marie-Ange Teste, Johannes Geiselmann, Hidde de Jong
- article
- ACS Synthetic Biology, 2021, 10 (11), pp.2910-2926. ⟨10.1021/acssynbio.1c00115⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- The dimensionality and structure of species trait spaces
- auteur
- David Mouillot, Nicolas Loiseau, Matthias Grenié, Adam Algar, Michele Allegra, Marc Cadotte, Nicolas Casajus, Pierre Denelle, Maya Guéguen, Anthony Maire, Brian Maitner, Brian Mcgill, Matthew Mclean, Nicolas Mouquet, François Munoz, Wilfried Thuiller, Sébastien Villéger, Cyrille Violle, Arnaud Auber
- article
- Ecology Letters, 2021, 24 (9), pp.1988-2009. ⟨10.1111/ele.13778⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- An Overview of Artificial Olfaction Systems with a Focus on Surface Plasmon Resonance for the Analysis of Volatile Organic Compounds
- auteur
- Marielle El Kazzy, Jonathan Weerakkody, Charlotte Hurot, Raphaël Mathey, Arnaud Buhot, Natale Scaramozzino, Yanxia Hou
- article
- Biosensors, 2021, 11 (8), pp.244. ⟨10.3390/bios11080244⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Drivers of tree community assembly during tropical forest post-fire succession in anthropogenic savannas
- auteur
- Grégoire Blanchard, Thomas Ibanez, François Munoz, David Bruy, Christelle Hély, Jérôme Munzinger, Philippe Birnbaum
- article
- Perspectives in Plant Ecology, Evolution and Systematics, 2021, 52, pp.125630. ⟨10.1016/j.ppees.2021.125630⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Unveiling ecological assembly rules from commonalities in trait distributions
- auteur
- Nicolas Gross, Yoann Le Bagousse-Pinguet, Pierre Liancourt, Hugo Saiz, Cyrille Violle, François Munoz
- article
- Ecology Letters, 2021, 24 (8), pp.1668-1680. ⟨10.1111/ele.13789⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Imprints of Past Habitat Area Reduction on Extant Taxonomic, Functional, and Phylogenetic Composition
- auteur
- Elizabeth Barthelemy, Claire Fortunel, Maxime Jaunatre, François Munoz
- article
- Frontiers in Ecology and Evolution, 2021, 9, ⟨10.3389/fevo.2021.634413⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Convolutional neural networks improve species distribution modelling by capturing the spatial structure of the environment
- auteur
- Benjamin Deneu, Maximilien Servajean, Pierre Bonnet, Christophe Botella, François Munoz, Alexis Joly
- article
- PLoS Computational Biology, 2021, 17 (4), pp.e1008856. ⟨10.1371/journal.pcbi.1008856⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Functional biogeography of weeds reveals how anthropogenic management blurs trait–climate relationships
- auteur
- Bérenger Bourgeois, François Munoz, Sabrina Gaba, Pierre Denelle, Guillaume Fried, Jonathan Storkey, Cyrille Violle
- article
- Journal of Vegetation Science, 2021, 32 (2), pp.1-12. ⟨10.1111/jvs.12999⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- Do ecological specialization and functional traits explain the abundance–frequency relationship? Arable weeds as a case study
- auteur
- Guillaume Fried, Laura Armengot, Jonathan Storkey, Bérenger Bourgeois, Sabrina Gaba, Cyrille Violle, François Munoz
- article
- Journal of Biogeography, 2021, 48 (1), pp.37-50. ⟨10.1111/jbi.13980⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- Designing sampling protocols for plant-pollinator interactions - timing, meteorology, flowering variations and failed captures matter
- auteur
- Marie Charlotte Grange, François Munoz, Marco Moretti, Sylvain Varona-Y-Varona, Julien Renaud, Marie-Pascale Colace, Maya Gueguen, Laure Gallien
- article
- Botany Letters, 2021, 168 (3), pp.324-332. ⟨10.1080/23818107.2021.1964596⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Canopy and understory tree guilds respond differently to the environment in an Indian rainforest
- auteur
- Sylvain Schmitt, Valérie Raevel, Maxime Réjou-Méchain, Narayanan Ayyappan, Natesan Balachandran, N. Barathan, Gopalakrishnan Rajashekar, François Munoz
- article
- Journal of Vegetation Science, 2021, 32 (5), ⟨10.1111/jvs.13075⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- Rebound in functional distinctiveness following warming and reduced fishing in the North Sea
- auteur
- Juliette Murgier, Matthew Mclean, Anthony Maire, David Mouillot, Nicolas Loiseau, Francois Munoz, Cyrille Violle, Arnaud Auber
- article
- Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, 2021, 288 (1942), pp.20201600. ⟨10.1098/rspb.2020.1600⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Preprints, Working Papers, ...
- titre
- From Newton to Hamilton, bypassing Lagrange and Legendre.
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh
- article
- 2021
- typdoc
- Preprints, Working Papers, ...
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2020
Journal articles
- titre
- Weeds: Against the Rules?
- auteur
- Lucie Mahaut, Pierre-Olivier Cheptou, Guillaume Fried, François Munoz, Jonathan Storkey, François Vasseur, Cyrille Violle, François Bretagnolle
- article
- Trends in Plant Science, 2020, 25 (11), pp.1107-1116. ⟨10.1016/j.tplants.2020.05.013⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- The Hamilton-Jacobi Equation : an intuitive approach.
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh
- article
- American Journal of Physics, 2020, 88 (5), pp.353-359
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Bio-Inspired Strategies for Improving the Selectivity and Sensitivity of Artificial Noses: A Review
- auteur
- Charlotte Hurot, Natale Scaramozzino, Arnaud Buhot, Yanxia Hou
- article
- Sensors, 2020, 20 (6), pp.1803. ⟨10.3390/s20061803⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Large deviation of long time average for a stochastic process : an alternative method.
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh
- article
- Journal of Physics A: Mathematical and Theoretical, 2020, 53 (9), pp.095004
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Preprints, Working Papers, ...
- titre
- Rawls's “original position” is not sufficient to specify the rules of cooperation.
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh
- article
- 2020
- typdoc
- Preprints, Working Papers, ...
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2019
Journal articles
- titre
- RhoTermPredict: an algorithm for predicting Rho-dependent transcription terminators based on Escherichia coli, Bacillus subtilis and Salmonella enterica databases
- auteur
- Marco Di Salvo, Simone Puccio, Clelia Peano, Stephan Lacour, Pietro Alifano
- article
- BMC Bioinformatics, 2019, 20 (1), pp.1-11. ⟨10.1186/s12859-019-2704-x⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- Acetate metabolism and the inhibition of bacterial growth by acetate
- auteur
- Stéphane Pinhal, Delphine Ropers, Johannes Geiselmann, Hidde de Jong
- article
- Journal of Bacteriology, 2019, 201 (13), pp.147 - 166. ⟨10.1128/JB.00147-19⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Functional biogeography of dietary strategies in birds
- auteur
- Jean‐yves Barnagaud, Nathan Mazet, Francois Munoz, Matthias Grenié, Pierre Denelle, Mar Sobral, W. Daniel Kissling, Cyrille Violle
- article
- Global Ecology and Biogeography, 2019, 28 (7), pp.1004-1017. ⟨10.1111/geb.12910⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
2018
Journal articles
- titre
- Giant fluctuations in logistic growth
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh
- article
- Physical Review E : Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics, 2018, 98, pp.042118
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Book sections
- titre
- Selection and Use of Intracellular Antibodies
- auteur
- Sandrine Moutel, Clément Nizak, Franck Perez
- article
- Methods in molecular biology, pp.491-503, 2018
- typdoc
- Book sections
- Accès au bibtex
-
2017
Journal articles
- titre
- Fisher Waves: an individual based stochastic model
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh, Marcel Vallade
- article
- Physical Review E , 2017, 96, pp.012414. ⟨10.1103/PhysRevE.96.012414⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Neutral Aggregation in Finite Length Genotype space
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh
- article
- Physical Review E , 2017, 95, pp.012402
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Resource reallocation in bacteria by reengineering the gene expression machinery
- auteur
- Hidde de Jong, Johannes Geiselmann, Delphine Ropers
- article
- Trends in Microbiology, 2017, 25 (6), pp.480-493. ⟨10.1016/j.tim.2016.12.009⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- Synthesis of new hydrophilic rhodamine based enzymatic substrates compatible with droplet-based microfluidic assays
- auteur
- Johan Fenneteau, Dany Chauvin, Andrew D. Griffiths, Clément Nizak, Janine Cossy
- article
- Chemical Communications, 2017, 53 (39), pp.5437-5440. ⟨10.1039/c7cc01506b⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
2016
Journal articles
- titre
- Nonlinear modification of the laser noise power spectrum induced by frequency-shifted optical feedback
- auteur
- Eric Lacot, Bahram Houchmandzadeh, Vadim Girardeau, Olivier Hugon, Olivier Jacquin
- article
- Physical Review A : Atomic, molecular, and optical physics [1990-2015], 2016, ⟨10.1103/PhysRevA.94.033843⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Conserved Units of Co-Expression in Bacterial Genomes: An Evolutionary Insight into Transcriptional Regulation
- auteur
- Ivan Junier, Olivier Rivoire
- article
- PLoS ONE, 2016, 11 (5), ⟨10.1371/journal.pone.0155740⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- A simple, general result for the variance of substitution number in molecular evolution.
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh, Marcel Vallade
- article
- Molecular Biology and Evolution, 2016, 33 (7), pp.1858
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Hierarchy and extremes in selections from pools of randomized proteins
- auteur
- Sébastien Boyer, Dipanwita Biswas, Ananda Kumar Soshee, Natale Scaramozzino, Clément Nizak, Olivier Rivoire
- article
- Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2016, 113 (13), pp.3482-3487. ⟨10.1073/pnas.1517813113⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- Dynamical allocation of cellular resources as an optimal control problem: Novel insights into microbial growth strategies
- auteur
- Nils Giordano, Francis Mairet, Jean-Luc Gouzé, Johannes Geiselmann, Hidde de Jong
- article
- PLoS Computational Biology, 2016, 12 (3), pp.e1004802. ⟨10.1371/journal.pcbi.1004802⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Informations in Models of Evolutionary Dynamics
- auteur
- Olivier Rivoire
- article
- Journal of Statistical Physics, 2016, ⟨10.1007/s10955-015-1381-z⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- Hierarchy and extremes in selections from pools of randomized proteins
- auteur
- Sébastien Boyer, Dipanwita Biswas, Anandakumar Soshee, Natate Scaramozzino, Clément Nizak, Olivier Rivoire
- article
- Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2016, ⟨10.1073/pnas.1517813113⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
2015
Journal articles
- titre
- A synthetic growth switch based on controlled expression of RNA polymerase
- auteur
- Jérôme Izard, Cindy Gomez-Balderas, Delphine Ropers, Stephan Lacour, Xiaohu Song, Yifan Yang, Ariel B. Lindner, Johannes Geiselmann, Hidde de Jong
- article
- Molecular Systems Biology, 2015, 11 (11), pp.840
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- Neutron fluctuations: The importance of being delayed
- auteur
- C. Tamain, B. Arab-Chapelet, M. Rivenet, S. Grandjean, F. Abraham, B. Houchmandzadeh, E. Dumonteil, A. Mazzolo, A. Zoia
- article
- Physical Review E : Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics, 2015, 92 (5), pp.246-256. ⟨10.1103/PhysRevE.92.052114⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- General formulation of Luria-Delbrück distribution of the number of mutants
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh
- article
- Physical Review E : Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics, 2015, 92, pp.012719
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Exact results for a noise-induced bistable system
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh, Marcel Vallade
- article
- Physical Review E : Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics, 2015, 91, pp.022115
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Fluctuation driven fixation of cooperative behavior
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh
- article
- BioSystems, 2015, 127, pp.60. ⟨10.1016/j.biosystems.2014.11.006⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Inference of quantitative models of bacterial promoters from time-series reporter gene data
- auteur
- Diana Stefan, Corinne Pinel, Stephane Pinhal, Eugenio Cinquemani, Johannes Geiselmann, Hidde de Jong
- article
- PLoS Computational Biology, 2015, 11 (1), pp.e1004028. ⟨10.1371/journal.pcbi.1004028⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- Robust reconstruction of gene expression profiles from reporter gene data using linear inversion
- auteur
- Valentin Zulkower, Michel Page, Delphine Ropers, Johannes Geiselmann, Hidde de Jong
- article
- Bioinformatics, 2015, 31 (12), pp.i71-i79. ⟨10.1093/bioinformatics/btv246⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- Evolution of sparsity and modularity in a model of protein allostery
- auteur
- Mathieu Hemery, Olivier Rivoire
- article
- Physical Review E : Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics, 2015, ⟨10.1103/PhysRevE.91.042704⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- Breaking evolutionary constraint with a tradeoff ratchet
- auteur
- Marjon G. J. de Vos, Alexandre Dawid, Vanda Sunderlikova, Sander J Tans
- article
- Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2015, 112 (48), pp.14906-11. ⟨10.1073/pnas.1510282112⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- Understanding carbon catabolite repression in Escherichia coli using quantitative models
- auteur
- Andreas Kremling, Johannes Geiselmann, Delphine Ropers, Hidde de Jong
- article
- Trends in Microbiology, 2015, 23 (2), pp.99-109. ⟨10.1016/j.tim.2014.11.002⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
Conference papers
- titre
- Fluorescent reporter genes and the analysis of bacterial regulatory networks
- auteur
- Hidde de Jong, Johannes Geiselmann
- article
- Hybrid Systems Biology: Proceedings of the Second International Workshop, HSB 2013, and Third International Workshop, HSB 2014, 2015, Vienna, Austria. pp.1-24, ⟨10.1007/978-3-319-27656-4_2⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au bibtex
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Book sections
- titre
- La cellule procaryote en biotechnologies
- auteur
- Sandrine Bourgoin-Voillard, Claire Durmort, Johannes Geiselmann, Audrey Le Gouellec, Delphine Ropers, Michel Sève
- article
- Introduction aux biotechnologies en santé, Tome 1, Tec & Doc Lavoisier, pp.318, 2015, Les biotechnologies en santé, 2743020857
- typdoc
- Book sections
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-
Patents
- titre
- Method for producing metabolites, peptides and recombinant proteins
- auteur
- Johannes Geiselmann, Hidde de Jong, Delphine Ropers, Jérôme Izard
- article
- France, Patent n° : EP2848695. 2015
- typdoc
- Patents
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- titre
- Method for producing metabolites, peptides and recombinant proteins
- auteur
- Johannes Geiselmann, Hidde de Jong, Delphine Ropers, Jérôme Izard
- article
- France, Patent n° : EP2848695 (A1). 2015
- typdoc
- Patents
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2014
Journal articles
- titre
- An evolutionarily significant unicellular strategy in response to starvation stress in Dictyostelium social amoebae
- auteur
- Darja Dubravcic, Minus van Baalen, Clément Nizak
- article
- F1000Research, 2014, 3, pp.133. ⟨10.12688/f1000research.4218.1⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Selection of Arginine-Rich Anti-Gold Antibodies Engineered for Plasmonic Colloid Self-Assembly
- auteur
- Purvi Jain, Anandakumar Soshee, S.Shankara Narayanan, Jadab Sharma, Christian Girard, Erik Dujardin, Clément Nizak
- article
- Journal of Physical Chemistry C, 2014, 10.1021/jp502118n. ⟨10.1021/jp502118n⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- A model for the generation and transmission of variations in evolution.
- auteur
- Olivier Rivoire, Stanislas Leibler
- article
- Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2014, 111 (19), pp.E1940-9. ⟨10.1073/pnas.1323901111⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- The remarkable discreteness of being
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh
- article
- Journal of Biosciences, 2014, 39 (2), pp.1-10. ⟨10.1007/s12038-013-9350-7⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Recombinant antibody mediated delivery of organelle-specific DNA pH sensors along endocytic pathways
- auteur
- Souvik Modi, S. Haider, Clément Nizak, Yamuna Krishnan
- article
- Nanoscale, 2014, 6 (2), pp.1144-52. ⟨10.1039/c3nr03769j⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- General in vitro method to analyze the interactions of synthetic polymers with human antibody repertoires
- auteur
- Anandakumar Soshee, Stefan Zürcher, N. Spencer, A. Halperin, Clément Nizak
- article
- Biomacromolecules, 2014, 15 (1), pp.113-21. ⟨10.1021/bm401360y⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- An alternative to the breeder's and Lande's equations.
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh
- article
- G3, 2014, 4(1) (1), pp.97-108. ⟨10.1534/g3.113.008433⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
2013
Journal articles
- titre
- Procedure to construct a multi-scale coarse-grained model of DNA-coated colloids from experimental data
- auteur
- Bianca M. Mladek, Julia Fornleitner, Francisco J. Martinez-Veracoechea, Alexandre Dawid, Daan Frenkel
- article
- Soft Matter, 2013, 9, pp.7342. ⟨10.1039/C3SM50701G⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- Two DNA nanomachines map pH changes along intersecting endocytic pathways inside the same cell.
- auteur
- Souvik Modi, Clément Nizak, Sunaina Surana, Saheli Halder, Yamuna Krishnan
- article
- Nature Nanotechnology, 2013, 8 (6), pp.459-67. ⟨10.1038/nnano.2013.92⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Exact results for fixation probability of bithermal evolutionary graphs.
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh, Marcel Vallade
- article
- BioSystems, 2013, 112 (1), pp.49-54. ⟨10.1016/j.biosystems.2013.03.020⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Elements of Coevolution in Biological Sequences
- auteur
- Olivier Rivoire
- article
- Physical Review Letters, 2013, 110, pp.178102. ⟨10.1103/PHYSREVLETT.110.178102⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
2012
Journal articles
- titre
- Selection for altruism through random drift in variable size populations.
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh, Marcel Vallade
- article
- BMC Evolutionary Biology, 2012, 12, pp.61. ⟨10.1186/1471-2148-12-61⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Selection and use of intracellular antibodies (intrabodies).
- auteur
- Sandrine Moutel, Clément Nizak, Franck Perez
- article
- Methods in Molecular Biology, 2012, 907, pp.667-79. ⟨10.1007/978-1-61779-974-7_37⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- Quantitative Prediction of the Phase Diagram of DNA-Functionalized Nanosized Colloids
- auteur
- Bianca M. Mladek, Julia Fornleitner, Francisco J. Martinez-Veracoechea, Alexandre Dawid, Daan Frenkel
- article
- Physical Review Letters, 2012, 108 (26), pp.268301. ⟨10.1103/PhysRevLett.108.268301⟩
- typdoc
- Journal articles
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2011
Journal articles
- titre
- Fluctuations importance and control in biological systems
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh, Irina Mihalcescu
- article
- Europhysics News, 2011, 42 (6), pp.36. ⟨10.1051/epn/2011606⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- The fixation probability of a beneficial mutation in a geographically structured population
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh, Marcel Vallade
- article
- New Journal of Physics, 2011, 13, pp.3020. ⟨10.1088/1367-2630/13/7/073020⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- The Value of Information for Populations in Varying Environments
- auteur
- Olivier Rivoire, Stanislas Leibler
- article
- Journal of Statistical Physics, 2011, 142, pp.1124-1166. ⟨10.1007/S10955-011-0166-2⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Laser microstructuration of three-dimensional enzyme reactors in microfluidic channels
- auteur
- Monica Iosin, Teodora Scheul, Clément Nizak, Olivier Stephan, Simion Astilean, Patrice L. Baldeck
- article
- Microfluidics and Nanofluidics, 2011, 10 (3), pp.685-690. ⟨10.1007/s10404-010-0698-9⟩
- typdoc
- Journal articles
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2010
Journal articles
- titre
- Alternative to the diffusion equation in population genetics.
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh, Marcel Vallade
- article
- Physical Review E : Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics, 2010, 82 (5), pp.051913. ⟨10.1103/PhysRevE.82.051913⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Importance et contrôle des fluctuations dans les systèmes biologiques
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh, Irina Mihalcescu
- article
- Jahrbuch für Computerphilologie, 2010, 20, pp.17-21. ⟨10.1051/refdp/2010017⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- From Grazing Resistance to Pathogenesis: The Coincidental Evolution of Virulence Factors
- auteur
- Sandrine Adiba, Clément Nizak, Minus van Baalen, Erick Denamur, Frantz Depaulis
- article
- PLoS ONE, 2010, 5 (8), pp.e11882. ⟨10.1371/journal.pone.0011882⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Characterization of single chain antibody targets through yeast two hybrid.
- auteur
- Ole Vielemeyer, Clément Nizak, Ana Joaquina Jimenez, Arnaud Echard, Bruno Goud, Jacques Camonis, Jean-Christophe Rain, Franck Perez
- article
- BMC Biotechnology, 2010, 10 (1), pp.59. ⟨10.1186/1472-6750-10-59⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
Lectures
- titre
- Mathématiques pour la Physique
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh
- article
- Licence. Mathématiques pour la Physique., France. 2010, pp.270
- typdoc
- Lectures
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-
- titre
- Les processus stochastiques
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh
- article
- Doctoral. Les processus stochastiques, Grenoble, France. 2010
- typdoc
- Lectures
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-
2009
Journal articles
- titre
- A production system to generate reference genetic profiles from buccal swab cells on FTA® cards
- auteur
- N. Scaramozzino, P. Terrenoire, L. Baron
- article
- Forensic Science International: Genetics Supplement Series, 2009, 2 (1), pp.80-82. ⟨10.1016/j.fsigss.2009.08.027⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Theory of neutral clustering for growing populations.
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh, Marcel Vallade
- article
- Physical Review E : Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics, 2009, 80 (5), pp.051920. ⟨10.1103/PhysRevE.80.051920⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Direct selection of monoclonal phosphospecific antibodies without prior phosphoamino acid mapping
- auteur
- O. Vielemeyer, H. Yuan, S. Moutel, R. Saint-Fort, D. Tang, Clément Nizak, Bruno Goud, Y. Wang, Franck Perez
- article
- Journal of Biological Chemistry, 2009, pp.PMID: 19473967
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- A multi-Fc-species system for recombinant antibody production
- auteur
- S. Moutel, A. El Marjou, O. Vielemeyer, Clément Nizak, P. Benaroch, S. Dübel, Franck Perez
- article
- BMC Biotechnology, 2009, pp.PMID: 19245715
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
2008
Journal articles
- titre
- Neutral Clustering in a Simple Experimental Ecological Community
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh
- article
- Physical Review Letters, 2008, 101, pp.078103. ⟨10.1103/PhysRevLett.101.078103⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2007
Journal articles
- titre
- Real-Time PCR to Identify Variola Virus or Other Human Pathogenic Orthopox Viruses
- auteur
- Natale Scaramozzino, Audrey Ferrier-Rembert, Anne-Laure Favier, Corinne Rothlisberger, Stéphane Richard, Jean-Marc Crance, Hermann Meyer, Daniel Garin
- article
- Clinical Chemistry, 2007, 53 (4), pp.606-613. ⟨10.1373/clinchem.2006.068635⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- Exploitation of other social amoebae by Dictyostelium caveatum
- auteur
- Clément Nizak, Rj Fitzhenry, Rh Kessin
- article
- PLoS ONE, 2007, pp.PMID: 17299592
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
Conference papers
- titre
- Experimental and theoretical study of singlet oxygen production in microcathode sustained discharges
- auteur
- G. Bauville, B. Lacour, L. Magne, V. Puech, J. Santos Sousa, Jp. Bœuf, G J M Hagelaar, E. Munoz-Serrano, Leanne Pitchford, N. Sadeghi, M. Touzeau
- article
- 38th AIAA Plasma dynamics and Lasers Conference, 2007, miami, United States
- typdoc
- Conference papers
- Accès au bibtex
-
- titre
- Experimental and Theoretical Study of Singlet Delta Oxygen Production in Microcathode Sustained Discharges
- auteur
- G. Bauville, M. Touzeau, N. Sadeghi, Leanne C. Pitchford, E. Muñoz Serrano, Gerjan Hagelaar, Jean-Pierre Boeuf, J. Santos Sousa, V Puech, L. Magne, B. Lacour
- article
- 38th AIAA Plasmadynamics and Lasers Conference, Miami, FL, USA, 2007, Miami, United States
- typdoc
- Conference papers
- Accès au bibtex
-
2006
Journal articles
- titre
- Species abundance distribution and population dynamics in a two-community model of neutral ecology
- auteur
- Marcel Vallade, Bahram Houchmandzadeh
- article
- Physical Review E : Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics, 2006, 74², pp.051914. ⟨10.1103/PhysRevE.74.051914⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
Conference papers
- titre
- Gas temperature measurements in a microcathode sustained discharge in oxygen
- auteur
- V. Puech, Jean-François Lagrange, N. Sadeghi, M. Touzeau, G. Bauville, B. Lacour
- article
- 59th Annual Gaseous Electronics Conference, Oct 2006, Columbus, Ohio, United States. pp.BAPS.2006.GEC.SRP2.17
- typdoc
- Conference papers
- Accès au bibtex
-
2005
Journal articles
- titre
- DNA Probe Array for the Simultaneous Identification of Herpesviruses, Enteroviruses, and Flaviviruses
- auteur
- Jehanara Korimbocus, Noël Scaramozzino, Bruno Lacroix, Jean Marc Crance, Daniel Garin, Guy Vernet
- article
- Journal of Clinical Microbiology, 2005, 43 (8), pp.3779-3787. ⟨10.1128/JCM.43.8.3779-3787.2005⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- Filtering the noise of embryonic development
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh
- article
- Journal of Physics: Condensed Matter, 2005, 17, pp.S1245-S1258. ⟨10.1088/0953-8984/17/14/014⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- Precise domain specification in the developing Drosophila embryo
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh, Eric Wieschaus, Stanislas Leibler
- article
- Physical Review E : Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics, 2005, 72, pp.061920. ⟨10.1103/PhysRevE.72.061920⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2004
Journal articles
- titre
- Prophylaxie et traitement des orthopoxviroses par immunoglobulines spécifiques
- auteur
- J.-M Crance, A Ferrier-Rembert, N Scaramozzino, A.-L Favier, D Garin
- article
- Médecine et Maladies Infectieuses, 2004, 34, pp.S46-S47. ⟨10.1016/S0399-077X(04)90015-7⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- In vitro inhibition of Chikungunya and Semliki Forest viruses replication by antiviral compounds: synergistic effect of interferon-α and ribavirin combination
- auteur
- S Briolant, D Garin, N Scaramozzino, A Jouan, J.M Crance
- article
- Antiviral Research, 2004, 61 (2), pp.111-117. ⟨10.1016/j.antiviral.2003.09.005⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
2003
Journal articles
- titre
- Analytical solution of a neutral model of biodiversity.
- auteur
- M. Vallade, B. Houchmandzadeh
- article
- Physical Review E : Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics, 2003, 68 (6 Pt 1), pp.061902
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Characterisation of the substrate specificity of homogeneous vaccinia virus uracil-DNA glycosylase
- auteur
- N. Scaramozzino
- article
- Nucleic Acids Research, 2003, 31 (16), pp.4950-4957. ⟨10.1093/nar/gkg672⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- Interferon, ribavirin, 6-azauridine and glycyrrhizin: antiviral compounds active against pathogenic flaviviruses
- auteur
- Jean Marc Crance, Natale Scaramozzino, Alain Jouan, Daniel Garin
- article
- Antiviral Research, 2003, 58 (1), pp.73-79. ⟨10.1016/s0166-3542(02)00185-7⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
Theses
- titre
- Développement d'outils pour l'étude de la dynamique de l'appareil de Golgi en interphase et en mitose
- auteur
- Clément Nizak
- article
- Biophysique [physics.bio-ph]. Université Paris-Diderot - Paris VII, 2003. Français. ⟨NNT : ⟩
- typdoc
- Theses
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2002
Journal articles
- titre
- Clustering of diffusing organisms.
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh
- article
- Physical Review E : Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics, 2002, pp.052902
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- NS3 protease of Langat tick-borne flavivirus cleaves serine protease substrates
- auteur
- Natale Scaramozzino, Jean-Marc Crance, Christian Drouet, Jean-Philippe Roebuck, Emmanuel Drouet, Alain Jouan, Daniel Garin
- article
- Biochemical and Biophysical Research Communications, 2002, 294 (1), pp.16-22. ⟨10.1016/s0006-291x(02)00425-4⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- Establishment of developmental precision and proportions in the early Drosophila embryo.
- auteur
- Bahram Houchmandzadeh, Eric Wieschaus, Stanislas Leibler
- article
- Nature, 2002, pp.798-802
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
2001
Journal articles
- titre
- Comparison of Flavivirus Universal Primer Pairs and Development of a Rapid, Highly Sensitive Heminested Reverse Transcription-PCR Assay for Detection of Flaviviruses Targeted to a Conserved Region of the NS5 Gene Sequences
- auteur
- Natale Scaramozzino, Jean-Marc Crance, Alain Jouan, Dominique Debriel, Françoise Stoll, Daniel Garin
- article
- Journal of Clinical Microbiology, 2001, 39 (5), pp.1922-1927. ⟨10.1128/jcm.39.5.1922-1927.2001⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-