Publications HAL de Karin, John ; gwennou, coupier ; claude, verdier ; delphine, debarre; valerie, laurent ; irina, mihalcescu ; jocelyn, etienne ; pierre, recho ; mourad, ismail ; daria, tsvirkun ; richard, michel ; alexander, erlich du labo/EPI LIPhy

Journal articles

2024

titre
Submicrometre spatiotemporal characterization of the Toxoplasma adhesion strategy for gliding motility
auteur
Luis Vigetti, Bastien Touquet, Delphine Debarre, Thierry Rose, Lionel Bureau, Dima Abdallah, Galina Dubacheva, Isabelle Tardieux
article
Nature Microbiology, In press, ⟨10.1038/s41564-024-01818-3⟩
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https://hal.science/hal-04765218/file/Vigetti%20et%20al.2024_14_08_24.pdf BibTex
titre
Spatio-temporal instabilities of blood flow in a model capillary network
auteur
Mathieu Alonzo, Nathaniel Karst, Thomas Podgorski, John Geddes, Gwennou Coupier
article
Physical Review Fluids, 2024, 9 (10), pp.104401. ⟨10.1103/PhysRevFluids.9.104401⟩
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https://hal.science/hal-04749016/file/2410.04270v1.pdf BibTex
titre
Glycocalyx cleavage boosts erythrocytes aggregation
auteur
Mehdi Abbasi, Min Jin, Yazdan Rashidi, Lionel Bureau, Daria Tsvirkun, Chaouqi Misbah
article
Scientific Reports, 2024, 14 (1), pp.24340. ⟨10.1038/s41598-024-75012-0⟩
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BibTex
titre
Comment on “Dynamics and rheology of vesicles under confined Poiseuille flow” by Z. Gou, H. Zhang, A. Nait-Ouhra, M. Abbasi, A. Farutin and C. Misbah, Soft Matter, 2023, 19, 9101
auteur
Gwennou Coupier, Thomas Podgorski
article
Soft Matter, 2024, ⟨10.1039/d3sm01679j⟩
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https://hal.science/hal-04672328/file/CommentRheology.pdf BibTex
titre
Initiation of motility on a compliant substrate
auteur
Jocelyn Étienne, Pierre Recho
article
Journal of the Mechanics and Physics of Solids, 2024, 183, pp.105526. ⟨10.1016/j.jmps.2023.105526⟩
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https://arxiv.org/pdf/2303.09666 BibTex
titre
A rheological model for spheroids including extra-cellular matrix
auteur
Claude Verdier, Liviu Iulian Palade
article
EPL - Europhysics Letters, 2024, 145, pp.17001. ⟨10.1209/0295-5075/ad1d6f⟩
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https://hal.science/hal-04248180/file/Spheroids.pdf BibTex
titre
A biomechanical model for cell sensing and migration
auteur
Arnaud Chauvière, Ian Manifacier, Claude Verdier, Grégory Chagnon, Ibrahim Cheddadi, Nicolas Glade, Angélique Stéphanou
article
Computer Methods in Biomechanics and Biomedical Engineering, In press, pp.1-19. ⟨10.1080/10255842.2024.2427112⟩
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https://hal.science/hal-04727238/file/manuscript-accepted.pdf BibTex

2023

titre
Growth anisotropy of the extracellular matrix shapes a developing organ
auteur
Stefan Harmansa, Alexander Erlich, Christophe Eloy, Giuseppe Zurlo, Thomas Lecuit
article
Nature Communications, 2023, 14 (1), pp.1220. ⟨10.1038/s41467-023-36739-y⟩
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https://hal.science/hal-04245559/file/s41467-023-36739-y.pdf BibTex
titre
Modeling spheroids rheology
auteur
Claude Verdier, Liviu Iulian Palade
article
Computer Methods in Biomechanics and Biomedical Engineering, 2023, 26 (S1), pp.S77-S79
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https://hal.science/hal-04146232/file/Verdier2023.pdf BibTex
titre
Quantitative analysis of the fibrous microstructure of 3D collagen gels
auteur
Julia Romero Bhathal, Laurent Orgéas, Mehdi Bouzid, Lucie Bailly, Claude Verdier, Valérie M Laurent
article
Computer Methods in Biomechanics and Biomedical Engineering: Imaging & Visualization, 2023, 26 (S1), pp.S80-S82
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https://hal.science/hal-04072485/file/Romero-Bhathal2023.pdf BibTex
titre
Changes in endothelial cell microrheology in medium modified by cancer cells
auteur
Georgia M. Kefala, Daria Tsvirkun, Claude Verdier, Valérie M. Laurent
article
Computer Methods in Biomechanics and Biomedical Engineering, 2023, 48eme Congrès de la société de biomécanique, 26 (S1), pp.S43-S45. ⟨10.1080/10255842.2023.2246304⟩
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https://hal.science/hal-04061684/file/Kefala2023.pdf BibTex
titre
Coated microbubbles swim via shell buckling
auteur
Georges Chabouh, Marcel Mokbel, Benjamin van Elburg, Michel Versluis, Tim Segers, Sebastian Aland, Catherine Quilliet, Gwennou Coupier
article
Communications Engineering, 2023, 2 (1), pp.63. ⟨10.1038/s44172-023-00113-z⟩
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https://hal.science/hal-04200310/file/CoatedMBswim.pdf BibTex
titre
Mechanical feedback in regulating the size of growing multicellular spheroids
auteur
A. Erlich, Pierre Recho
article
Journal of the Mechanics and Physics of Solids, 2023, 178, pp.105342. ⟨10.1016/j.jmps.2023.105342⟩
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https://hal.science/hal-04295086/file/2011.00486.pdf BibTex
titre
Mechanical feedback in regulating the size of growing multicellular spheroids
auteur
Alexander Erlich, P. Recho
article
Journal of the Mechanics and Physics of Solids, 2023, 178 (4), pp.105342. ⟨10.1016/j.jmps.2023.105342⟩
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https://arxiv.org/pdf/2011.00486 BibTex
titre
Molecular motors enhance microtubule lattice plasticity
auteur
William Lecompte, Karin John
article
PRX Life, 2023, 1 (1), pp.013012. ⟨10.48550/arXiv.2209.09161⟩
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BibTex
titre
Impact of baculoviral transduction of fluorescent actin on cellular forces
auteur
Sara Bouizakarne, Jocelyn Etienne, Alice Nicolas
article
European Journal of Cell Biology, 2023, 102 (2), ⟨10.1016/j.ejcb.2023.151294⟩
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https://hal.science/hal-03971453/file/postprint.pdf BibTex
titre
Substrate stiffness impacts early biofilm formation by modulating Pseudomonas aeruginosa twitching motility
auteur
Sofia Gomez Ho, Lionel Bureau, Karin John, Delphine Débarre, Sigolène Lecuyer
article
eLife, 2023, ⟨10.1101/2022.02.18.480999⟩
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https://hal.science/hal-03798581/file/2023-elife-81112-v1.pdf BibTex
titre
Axial dispersion of Red Blood Cells in microchannels
auteur
Sylvain Losserand, Gwennou Coupier, Thomas Podgorski
article
Physical Review Fluids, 2023, 8 (4), pp.043102. ⟨10.1103/PhysRevFluids.8.043102⟩
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https://hal.science/hal-03880195/file/Axial_dispersion_of_RBCs_V2_accepted.pdf BibTex
titre
Influence of storage and buffer composition on the mechanical behavior of flowing red blood cells
auteur
Adlan Merlo, Sylvain Losserand, François Yaya, Philippe Connes, Magalie Faivre, Sylvie Lorthois, Christophe Minetti, Elie Nader, Thomas Podgorski, Céline Renoux, Gwennou Coupier, Emilie Franceschini
article
Biophysical Journal, 2023, 122 (2), pp.360-373. ⟨10.1016/j.bpj.2022.12.005⟩
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https://hal.science/hal-03934042/file/manuscript.pdf BibTex
titre
Competitive Specific Anchorage of Molecules onto Surfaces: Quantitative Control of Grafting Densities and Contamination by Free Anchors
auteur
Oksana Kirichuk, Sumitra Srimasorn, Xiaoli Zhang, Abigail R E Roberts, Liliane Coche-Guerente, Jessica C F Kwok, Lionel Bureau, Delphine Débarre, Ralf P Richter
article
Langmuir, 2023, 39 (50), pp.18410-18423. ⟨10.1021/acs.langmuir.3c02567⟩
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https://hal.science/hal-04329029/file/kirichuk-et-al-2023-competitive-specific-anchorage-of-molecules-onto-surfaces-quantitative-control-of-grafting.pdf BibTex
titre
Lift at low Reynolds number
auteur
Lionel Bureau, Gwennou Coupier, Thomas Salez
article
European Physical Journal E: Soft matter and biological physics, 2023, 46, pp.111. ⟨10.1140/epje/s10189-023-00369-5⟩
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https://hal.science/hal-03719127/file/review_lift.pdf BibTex

2022

titre
Embryo-scale epithelial buckling forms a propagating furrow that initiates gastrulation
auteur
Julien Fierling, Alphy John, Barthélémy Delorme, Alexandre Torzynski, Guy B Blanchard, Claire M Lye, Anna Popkova, Grégoire Malandain, Bénédicte Sanson, Jocelyn Etienne, Philippe Marmottant, Catherine Quilliet, Matteo Rauzi
article
Nature Communications, 2022, 13 (1), pp.3348. ⟨10.1038/s41467-022-30493-3⟩
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https://hal.science/hal-03737695/file/s41467-022-30493-3.pdf BibTex
titre
How dynamic prestress governs the shape of living systems, from the subcellular to tissue scale
auteur
Alexander Erlich, Jocelyn Étienne, Jonathan Fouchard, Tom Wyatt
article
Interface Focus, 2022, 12 (6), ⟨10.1098/rsfs.2022.0038⟩
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https://hal.science/hal-03852746/file/Review_Prestress_Revised_manuscript.pdf BibTex
titre
Biomechanics of transendothelial migration by cancer cells
auteur
Claude Verdier
article
Biocell, 2022, 46 (11), pp.2381-2386
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https://hal.science/hal-03516708/file/HAL-endo-CC.pdf BibTex
titre
A quartz crystal microbalance method to quantify the size of hyaluronan and other glycosaminoglycans on surfaces
auteur
Sumitra Srimasorn, Luke Souter, Dixy Green, Lynda Djerbal, Ashleigh Goodenough, James Duncan, Abigail Roberts, Xiaoli Zhang, Delphine Débarre, Paul Deangelis, Jessica C. F. Kwok, Ralf Richter
article
Scientific Reports, 2022, 12 (1), pp.10980. ⟨10.1038/s41598-022-14948-7⟩
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https://hal.science/hal-03798316/file/s41598-022-14948-7.pdf BibTex
titre
Cell motility as an energy minimization process
auteur
Pierre Recho, Haythem Chelly
article
Physical Review E , 2022, ⟨10.1103/PhysRevE.105.064401⟩
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https://hal.science/hal-03852475/file/zero_friction.pdf BibTex
titre
Efficient deformation mechanisms enable invasive cancer cells to migrate faster in 3D collagen networks
auteur
Laure Laforgue, Arnold Fertin, Yves Usson, Claude Verdier, Valérie M Laurent
article
Scientific Reports, 2022, 12 (1), pp.7867. ⟨10.1038/s41598-022-11581-2⟩
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https://hal.science/hal-03872016/file/2022-Laforgue.pdf BibTex
titre
Gigantic floating leaves occupy a large surface area at an economical material cost
auteur
Finn Box, Alexander Erlich, Jian Guan, Chris Thorogood
article
Science Advances , 2022, 8 (6), ⟨10.1126/sciadv.abg3790⟩
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BibTex
titre
Adhesion-regulated junction slippage controls cell intercalation dynamics in an Apposed-Cortex Adhesion Model
auteur
Alexander Nestor-Bergmann, Guy Blanchard, Nathan Hervieux, Alexander Fletcher, Jocelyn Etienne, Bénédicte Sanson
article
PLoS Computational Biology, 2022, 18 (1), pp.e1009812. ⟨10.1371/journal.pcbi.1009812⟩
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https://hal.science/hal-03553820/file/journal.pcbi.1009812.pdf BibTex
titre
Rheology and structure of a suspension of deformable particles in plane Poiseuille flow
auteur
Vassanti Audemar, Thomas Podgorski, Gwennou Coupier
article
Physics of Fluids, 2022, 34 (4), pp.042013. ⟨10.1063/5.0087378⟩
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https://hal.science/hal-03759060/file/ConfinedRheology.pdf BibTex
titre
Symmetry-breaking, motion and bistability of active drops through polarization-surface coupling
auteur
Fenna Stegemerten, Karin John, Uwe Thiele
article
Soft Matter, 2022, 18, pp.5823. ⟨10.1039/d2sm00648k⟩
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https://arxiv.org/pdf/2107.08961 BibTex
titre
Efficient deformation mechanisms enable invasive cancer cells to migrate faster in 3D collagen networks
auteur
Laure Laforgue, Arnold Fertin, Yves Usson, Claude Verdier, Valérie M Laurent
article
Scientific Reports, 2022, 12, pp.7867. ⟨10.1038/s41598-022-11581-2⟩
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https://hal.science/hal-03424556/file/3Dmigration.pdf BibTex
titre
Biomechanics of transendothelial migration by cancer cells
auteur
Claude Verdier
article
Biocell, 2022, 46 (11), pp.2381-2386. ⟨10.32604/biocell.2022.021368⟩
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https://hal.science/hal-03653127/file/BIOCELL-Viewpoint.pdf BibTex
titre
The intriguing role of collagen on the rheology of cancer cell spheroids
auteur
Daria Tsvirkun, Jean Revilloud, Arianna Giannetti, Claude Verdier
article
Journal of Biomechanics, 2022, 141, ⟨10.1016/j.jbiomech.2022.111229⟩
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https://hal.science/hal-03610947/file/Spheroids-HAL.pdf BibTex
titre
Buckling of lipidic ultrasound contrast agents under quasi-static load
auteur
Georges Chabouh, Benjamin van Elburg, Michel Versluis, Tim Segers, Catherine Quilliet, Gwennou Coupier
article
Philosophical Transactions of the Royal Society A: Mathematical, Physical and Engineering Sciences, 2022, 381 (2244), ⟨10.1098/rsta.2022.0025⟩
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https://hal.science/hal-04208210/file/2211.05863.pdf BibTex

2021

titre
Cell crawling on a compliant substrate: a biphasic relation with linear friction
auteur
Haythem Chelly, Amir Jahangiri, Matthieu Mireux, Jocelyn Étienne, Dag K Dysthe, Claude Verdier, Pierre Recho
article
International Journal of Non-Linear Mechanics, 2021, 139, pp.103897. ⟨10.1016/j.ijnonlinmec.2021.103897⟩
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https://hal.science/hal-03553189/file/substrate_rigidity.pdf BibTex
titre
Chondrocyte cell adhesion on chitosan supports using single-cell atomic force microscopy
auteur
Christian Enrique Garcia Garcia, Claude Verdier, Bernard Lardy, Frédéric Bossard, Armando Félix Soltero Martinez, Marguerite Rinaudo
article
International Journal of Polymer Analysis and Characterization, 2021, 27 (1), pp.71-85. ⟨10.1080/1023666X.2021.2008135⟩
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https://hal.science/hal-03424529/file/Manuscrit-CGG%20correction%20190521%20CEGG.docx.pdf BibTex
titre
Post-buckling dynamics of spherical shells
auteur
Marcel Mokbel, Adel Djellouli, Catherine Quilliet, Sebastian Aland, Gwennou Coupier
article
Proceedings of the Royal Society A: Mathematical, Physical and Engineering Sciences, 2021, 477 (2253), pp.20210378. ⟨10.1098/rspa.2021.0378⟩
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https://arxiv.org/pdf/2104.06647 BibTex
titre
Viscoelastic properties in cancer: from cells to spheroids
auteur
Yara Abidine, Arianna Giannetti, Jean Revilloud, Valérie M Laurent, Claude Verdier
article
Cells, 2021, 10, ⟨10.3390/cells10071704⟩
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https://hal.science/hal-03249960/file/Projet_Cell_spheroids.pdf BibTex
titre
Chemo-mechanical model of a cell as a stochastic active gel
auteur
Pierre Recho, A. Desimone, R. Mcmeeking, V. Deshpande
article
Journal of the Mechanics and Physics of Solids, 2021, 151, pp.104381. ⟨10.1016/j.jmps.2021.104381⟩
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https://hal.science/hal-03433689/file/Cell_thermo_model.pdf BibTex
titre
Self-repair protects microtubules from destruction by molecular motors
auteur
Sarah Triclin, Daisuke Inoue, Jérémie Gaillard, Zaw Min Htet, Morgan Desantis, Didier Portran, Emmanuel Derivery, Charlotte Aumeier, Laura Schaedel, Karin John, Christophe Leterrier, Samara Reck-Peterson, Laurent Blanchoin, Manuel Théry
article
Nature Materials, 2021, 20, pp.883-891. ⟨10.1038/s41563-020-00905-0⟩
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https://hal.science/hal-03122126/file/Triclin%20et%20al.pdf BibTex
titre
Delayed buckling of spherical shells due to viscoelastic knockdown of the critical load
auteur
Lucia Stein-Montalvo, Douglas P Holmes, Gwennou Coupier
article
Proceedings of the Royal Society A: Mathematical, Physical and Engineering Sciences, 2021, 477 (2253), pp.20210253. ⟨10.1098/rspa.2021.0253⟩
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https://hal.science/hal-03337846/file/2104.02554.pdf BibTex
titre
Extra-cellular matrix in multicellular aggregates acts as a pressure sensor controlling cell proliferation and motility
auteur
Monika Elzbieta Dolega, Sylvain Monnier, Benjamin Brunel, Jean-François Joanny, Pierre Recho, Giovanni Cappello
article
eLife, 2021, 10, ⟨10.7554/eLife.63258⟩
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https://hal.science/hal-03015345/file/elife-63258-v1.pdf BibTex
titre
Spherical oscillations of encapsulated microbubbles: Effect of shell compressibility and anisotropy
auteur
Georges Chabouh, Benjamin Dollet, Catherine Quilliet, Gwennou Coupier
article
Journal of the Acoustical Society of America, 2021, 149 (2), pp.1240-1257. ⟨10.1121/10.0003500⟩
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https://hal.science/hal-03151985/file/Manuscript.pdf BibTex
titre
Diffusion-redistanciation schemes for 2D and 3D constrained Willmore flow: application to the equilibrium shapes of vesicles
auteur
Thibaut Métivet, Arnaud Sengers, Mourad Ismail, Emmanuel Maitre
article
Journal of Computational Physics, 2021, 436, pp.110288. ⟨10.1016/j.jcp.2021.110288⟩
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https://hal.science/hal-02905870/file/diffredist.pdf BibTex

2020

titre
Mechanical behavior of multi-cellular spheroids under osmotic compression
auteur
M. Dolega, G. Zurlo, M. Le Goff, M. Greda, C. Verdier, J.-F. Joanny, G. Cappello, Pierre Recho
article
Journal of the Mechanics and Physics of Solids, 2020, pp.104205. ⟨10.1016/j.jmps.2020.104205⟩
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https://hal.science/hal-03009531/file/2011.01131.pdf BibTex
titre
Mechanical properties of 3D tumor spheroids measured by AFM
auteur
A Giannetti, J Revilloud, Claude Verdier
article
Computer Methods in Biomechanics and Biomedical Engineering, 2020, ⟨10.1080/10255842.2020.1816297⟩
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https://hal.science/hal-02945836/file/Verdier2020.pdf BibTex
titre
A minimal biomechanical model for random cell migration
auteur
Ian Manifacier, Arnaud Chauvière, Claude Verdier, Gregory Chagnon, Ibrahim Cheddadi, Nicolas Glade, Angélique Stéphanou
article
Computer Methods in Biomechanics & Biomedical Engineering, 2020, ⟨10.1080/10255842.2020.1813420⟩
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https://hal.science/hal-02985515/file/Manifacier2020.pdf BibTex
titre
A Method to Quantify Molecular Diffusion within Thin Solvated Polymer Films: A Case Study on Films of Natively Unfolded Nucleoporins
auteur
Rickard Frost, Delphine Débarre, Saikat Jana, Fouzia Bano, Jürgen Schünemann, Dirk Görlich, Ralf Richter
article
ACS Nano, 2020, 14 (8), pp.9938-9952. ⟨10.1021/acsnano.0c02895⟩
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https://cnrs.hal.science/hal-02990307/file/acsnano.0c02895.pdf BibTex
titre
Thin-Film Modelling of Resting and Moving Active Droplets
auteur
Sarah Trinschek, Fenna Stegemerten, Karin John, Uwe Thiele
article
Physical Review E : Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics, 2020, 101, pp.062802. ⟨10.1103/PhysRevE.101.062802⟩
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https://arxiv.org/pdf/1911.08258 BibTex
titre
Corrigendum to “Migration velocity of red blood cells in microchannels” [Microvasc. Res. 124 (2019) 30–36]
auteur
Thomas Podgorski, Sylvain Losserand, Gwennou Coupier
article
Microvascular Research, 2020, 129, pp.103989. ⟨10.1016/j.mvr.2020.103989⟩
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https://hal.science/hal-02995831/file/Corrigendum_Losserand_MVR.pdf BibTex
titre
Curling of epithelial monolayers reveals coupling between active bending and tissue tension
auteur
Jonathan Fouchard, Tom Wyatt, Amsha Proag, Ana Lisica, Nargess Khalilgharibi, Pierre Recho, Magali Suzanne, Alexandre Kabla, Guillaume Charras
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2020, 117 (17), pp.9377-9383. ⟨10.1073/pnas.1917838117⟩
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https://hal.science/hal-03009371/file/806455v1.full.pdf BibTex
titre
CLASP Mediates Microtubule Repair by Restricting Lattice Damage and Regulating Tubulin Incorporation
auteur
Amol Aher, Dipti Rai, Laura Schaedel, Jérémie Gaillard, Karin John, Qingyang Liu, Maarten Altelaar, Laurent Blanchoin, Manuel Thery, Anna Akhmanova
article
Current Biology - CB, 2020, 30 (11), pp.2175-2183. ⟨10.1016/j.cub.2020.03.070⟩
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https://hal.science/hal-02780387/file/Aher-2020-CLASP%20Mediates%20Micro.pdf BibTex
titre
A biomechanical model for the transendothelial migration of cancer cells
auteur
S M Amin Arefi, Daria Tsvirkun, Claude Verdier, James Feng
article
Physical Biology, 2020, 17, pp.036004. ⟨10.1088/1478-3975/ab725c⟩
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https://hal.science/hal-02459536/file/trans-endo.pdf BibTex
titre
The role of topology and mechanics in uniaxially growing cell networks
auteur
Alexander Erlich, Gareth Jones, Françoise Tisseur, Derek Moulton, Alain Goriely
article
Proceedings of the Royal Society A: Mathematical, Physical and Engineering Sciences, 2020, 476 (2233), pp.20190523. ⟨10.1098/rspa.2019.0523⟩
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https://arxiv.org/pdf/1904.11161 BibTex
titre
Tug-of-war between stretching and bending in living cell sheets
auteur
Pierre Recho, J. Fouchard, T. Wyatt, N. Khalilgharibi, G. Charras, A. Kabla
article
Physical Review E , 2020, 102 (1), pp.012401. ⟨10.1103/physreve.102.012401⟩
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https://hal.science/hal-03009376/file/2002.03966.pdf BibTex
titre
Coupling Polar Adhesion with Traction, Spring, and Torque Forces Allows High-Speed Helical Migration of the Protozoan Parasite Toxoplasma
auteur
Georgios Pavlou, Bastien Touquet, Luis Vigetti, Patricia Renesto, Alexandre Bougdour, Delphine Débarre, Martial Balland, Isabelle Tardieux
article
ACS Nano, 2020, 14 (6), pp.7121-7139. ⟨10.1021/acsnano.0c01893⟩
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https://cnrs.hal.science/hal-02990387/file/proof-%20Pavlou%20et%20al.%20ACS%20Nano%202020.pdf BibTex
titre
A minimal biomechanical model for random cell migration
auteur
Ian Manifacier, Arnaud Chauvière, Claude Verdier, G. Chagnon, Ibrahim Cheddadi, Nicolas Glade, Angélique Stéphanou
article
Computer Methods in Biomechanics and Biomedical Engineering, 2020, 45th Congress of the Société de Biomécanique, 23 (sup1), pp.S183-S185. ⟨10.1080/10255842.2020.1813420⟩
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https://hal.science/hal-03015234/file/Manifacier_CMBBE_20.pdf BibTex
titre
The effect of shear stress reduction on endothelial cells: a microfluidic study of the actin cytoskeleton
auteur
Mehdi Inglebert, Laura Locatelli, Daria Tsvirkun, Priti Sinha, Jeanette A Maier, Chaouqi Misbah, Lionel Bureau
article
Biomicrofluidics, 2020, ⟨10.1063/1.5143391⟩
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https://hal.science/hal-02530071/file/manuscript-r1.pdf BibTex

2019

titre
Lattice defects induce microtubule self-renewal
auteur
L. Schaedel, S. Triclin, Denis Chrétien, Ariane Abrieu, C. Aumeier, J. Gaillard, L. Blanchoin, M. Théry, Karin John
article
Nature Physics, 2019, 15 (8), pp.830-838. ⟨10.1038/s41567-019-0542-4⟩
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https://univ-rennes.hal.science/hal-02181481/file/Schaedel%20-%20Nature%20Physics.pdf BibTex
titre
Active gel segment behaving as an active particle
auteur
Pierre Recho, T. Putelat, L. Truskinovsky
article
Physical Review E , 2019, 100 (6), ⟨10.1103/physreve.100.062403⟩
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https://hal.science/hal-03009358/file/AP.pdf BibTex
titre
Simultaneous regulation of cytokinetic furrow and nucleus positions by cortical tension contributes to proper DNA segregation during late mitosis
auteur
Anne Pacquelet, Matthieu Jousseaume, Jocelyn Etienne, Grégoire Michaux
article
Current Biology - CB, 2019, 29 (22), pp.3766-3777.e4. ⟨10.1016/j.cub.2019.09.013⟩
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https://hal.science/hal-03000526/file/2019%20Pacquelet%20et%20al%20Curr%20Biol.pdf BibTex
titre
Simultaneous regulation of cytokinetic furrow and nucleus positions by cortical tension contributes to proper DNA segregation during late mitosis
auteur
Anne Pacquelet, Matthieu Jousseaume, Jocelyn Etienne, Grégoire Michaux
article
Current Biology - CB, 2019, 29 (22), pp.3766-3777.e4. ⟨10.1016/j.cub.2019.09.013⟩
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https://hal.science/hal-02351117/file/2019%20Pacquelet%20et%20al%20Curr%20Biol.pdf BibTex
titre
Cancer cell microrheology using AFM
auteur
Claude Verdier, Y. Abidine, V. M. Laurent, A. Duperray
article
Computer Methods in Biomechanics and Biomedical Engineering, 2019, ⟨10.1080/10255842.2020.1714905⟩
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https://hal.science/hal-02169502/file/SB2019-Verdier.pdf BibTex
titre
The physics of cell-size regulation across timescales
auteur
Clotilde Cadart, Larisa Venkova, Pierre Recho, Marco Cosentino Lagomarsino, Matthieu Piel
article
Nature Physics, 2019, 15 (10), pp.993-1004. ⟨10.1038/s41567-019-0629-y⟩
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https://hal.science/hal-02359349/file/combinepdf.pdf BibTex
titre
Crawling in a Fluid
auteur
Alexander Farutin, Jocelyn Etienne, Chaouqi Misbah, Pierre Recho
article
Physical Review Letters, 2019, 123 (11), ⟨10.1103/physrevlett.123.118101⟩
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https://hal.science/hal-03009353/file/1902.01730v1.pdf BibTex
titre
Let’s deflate that beach ball
auteur
Gwennou Coupier, Adel Djellouli, Catherine Quilliet
article
European Physical Journal E: Soft matter and biological physics, 2019, 42 (9), ⟨10.1140/epje/i2019-11900-2⟩
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https://hal.science/hal-02325204/file/LetsDeflateThatBeachBall.pdf BibTex
titre
Displacement fields using correlation methods as a tool to investigate cell migration in 3D collagen gels
auteur
Arnold Fertin, Laure Laforgue, Alain Duperray, Valérie M Laurent, Yves Usson, Claude Verdier
article
Journal of Microscopy, 2019, 275 (3), pp.172-182. ⟨10.1111/jmi.12825⟩
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https://hal.science/hal-02086505/file/3D-displacement.pdf BibTex
titre
Actomyosin controls planarity and folding of epithelia in response to compression
auteur
Tom Wyatt, Jonathan Fouchard, Ana Lisica, Nargess Khalilgharibi, Buzz Baum, Pierre Recho, Alexandre Kabla, Guillaume Charras
article
Nature Materials, 2019, ⟨10.1038/s41563-019-0461-x⟩
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https://hal.science/hal-02359375/file/422196v1.full.pdf BibTex
titre
Migration velocity of red blood cells in microchannels
auteur
Sylvain Losserand, Gwennou Coupier, Thomas Podgorski
article
Microvascular Research, 2019, 124, pp.30-36. ⟨10.1016/j.mvr.2019.02.003⟩
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https://hal.science/hal-02023922/file/Migration_velocity_of_red_blood_cells_in_microchannels-4.pdf BibTex
titre
An integrated assay to probe endothelial glycocalyx-blood cell interactions under flow in mechanically and biochemically well-defined environments
auteur
Heather Davies, Natalia Baranova, Nouha El Amri, Liliane Coche-Guérente, Claude Verdier, Lionel Bureau, Ralf Richter, Delphine Débarre
article
Matrix Biology, 2019, 78-79, pp.47-59. ⟨10.1016/j.matbio.2018.12.002⟩
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BibTex
titre
Paroxysmal Permeability Disorders: Development of a Microfluidic Device to Assess Endothelial Barrier Function
auteur
Maddalena Alessandra Wu, Daria Tsvirkun, Lionel Bureau, Isabelle Boccon-Gibod, Mehdi Inglebert, Alain Duperray, Laurence Bouillet, Chaouqi Misbah, Marco Cicardi
article
Frontiers in Medicine, 2019, 6, ⟨10.3389/fmed.2019.00089⟩
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BibTex
titre
Theory of mechanochemical patterning in biphasic biological tissues
auteur
Pierre Recho, Adrien Hallou, Edouard Hannezo
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2019, 116 (12), pp.5344-5349. ⟨10.1073/pnas.1813255116⟩
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https://hal.science/hal-02086274/file/484345v1.full.pdf BibTex
titre
On the quasi-static effective behaviour of poroelastic media containing elastic inclusions
auteur
Pascale Royer, Pierre Recho, Claude Verdier
article
Mechanics Research Communications, 2019, 96, pp.19-23. ⟨10.1016/j.mechrescom.2019.02.004⟩
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https://hal.science/hal-01930338/file/MRC_Royer_Recho_Verdier_2019.pdf BibTex
titre
Force-induced repolarization of an active crawler
auteur
Pierre Recho, Thibaut Putelat, Lev Truskinovsky
article
New Journal of Physics, 2019, 21, ⟨10.1088/1367-2630/ab05fd⟩
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https://hal.science/hal-02016539/file/main_text.pdf BibTex
titre
Third harmonic generation imaging and analysis of the effect of low gravity on the lacuno-canalicular network of mouse bone
auteur
Rachel Genthial, Maude Gerbaix, Delphine Farlay, Laurence Vico, Emmanuel Beaurepaire, Delphine Débarre, Aurélien Gourrier
article
PLoS ONE, 2019, 14 (1), pp.e0209079. ⟨10.5281/zenodo.1475906⟩
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https://hal.science/hal-01969156/file/2019%20PLOS1%20THG%20imaging%20of%20the%20effect%20of%20low%20gravity%20on%20mouse%20bone.pdf BibTex

2018

titre
High-order finite-element framework for the efficient simulation of multifluid flows
auteur
Thibaut Métivet, Vincent Chabannes, Mourad Ismail, Christophe Prud'Homme
article
Mathematics , 2018, 6 (10), ⟨10.3390/math6100203⟩
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https://hal.science/hal-01865602/file/multifluid.pdf BibTex
titre
Optimal cell transport in straight channels and networks
auteur
Alexander Farutin, Zaiyi Shen, Gaël Prado, Vassanti Audemar, Hamid Ez-Zahraouy, Abdelilah Benyoussef, Benoit Polack, Jens Harting, Petia M Vlahovska, Thomas Podgorski, Gwennou Coupier, Chaouqi Misbah
article
Physical Review Fluids, 2018, 3 (10), ⟨10.1103/physrevfluids.3.103603⟩
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https://hal.science/hal-01898243/file/OptimalTransport.pdf BibTex
titre
From pulsatile apicomedial contractility to effective epithelial mechanics
auteur
Guy B Blanchard, Jocelyn Etienne, Nicole Gorfinkiel
article
Current Opinion in Genetics and Development, 2018, 51, pp.78 - 87. ⟨10.1016/j.gde.2018.07.004⟩
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BibTex
titre
Equilibrium Contact Angle and Adsorption Layer Properties with Surfactants
auteur
Uwe Thiele, Jacco H Snoeijer, Sarah Trinschek, Karin John
article
Langmuir, 2018, 34 (24), pp.7210-7221. ⟨10.1021/acs.langmuir.8b00513⟩
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https://arxiv.org/pdf/1802.04042 BibTex
titre
Elastohydrodynamic lift at a soft wall
auteur
Heather S Davies, Delphine Débarre, Nouha El Amri, Claude Verdier, Ralf P Richter, Lionel Bureau
article
Physical Review Letters, 2018, 120, pp.198001. ⟨10.1103/PhysRevLett.120.198001⟩
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https://hal.science/hal-01652253/file/Lift-MS-SMrev1-HAL.pdf BibTex
titre
Inheritance of Cell-Cycle Duration in the Presence of Periodic Forcing
auteur
Noga Mosheiff, Bruno M. c. Martins, Sivan Pearl-Mizrahi, Alexander Grünberger, Stefan Helfrich, Irina Mihalcescu, Dietrich Kohlheyer, James C. w. Locke, Leon Glass, Nathalie Balaban
article
Physical Review X, 2018, 8 (2), ⟨10.1103/physrevx.8.021035⟩
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https://arxiv.org/pdf/1710.00349 BibTex
titre
Mechanosensitivity of cancer cells in contact with soft substrates using AFM
auteur
Yara Abidine, Andrei Constantinescu, Valérie M. Laurent, Vinoth Sundar Rajan, Richard Michel, Valentin Laplaud, Alain Duperray, Claude Verdier
article
Biophysical Journal, 2018, 114 (5), pp.1165-1175. ⟨10.1016/j.bpj.2018.01.005⟩
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https://hal.science/hal-01615377/file/article.pdf BibTex
titre
Mechanical stress as a regulator of cell motility
auteur
T. Putelat, Pierre Recho, L. Truskinovsky
article
Physical Review E , 2018, 97 (1), ⟨10.1103/physreve.97.012410⟩
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https://hal.science/hal-02012570/file/PRT_PRE17.pdf BibTex
titre
Modelling of surfactant-driven front instabilities in spreading bacterial colonies
auteur
Sarah Trinschek, Karin John, Uwe Thiele
article
Soft Matter, 2018, 14 (22), pp.4464-4476. ⟨10.1039/c8sm00422f⟩
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BibTex

2017

titre
Buckling Instability Causes Inertial Thrust for Spherical Swimmers at All Scales
auteur
Adel Djellouli, Philippe Marmottant, Henda Djeridi, Catherine Quilliet, Gwennou Coupier
article
Physical Review Letters, 2017, 119 (22), pp.224501. ⟨10.1103/PhysRevLett.119.224501⟩
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https://hal.science/hal-01653208/file/SwimmingByBuckling.pdf BibTex
titre
Continuous versus Arrested Spreading of Biofilms at Solid-Gas Interfaces: The Role of Surface Forces
auteur
Sarah Trinschek, Karin John, Sigolène Lecuyer, Uwe Thiele
article
Physical Review Letters, 2017, 119 (7), ⟨10.1103/physrevlett.119.078003⟩
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https://arxiv.org/pdf/1612.05450 BibTex
titre
Label-free imaging of bone multiscale porosity and interfaces using third-harmonic generation microscopy
auteur
Rachel Genthial, Emmanuel Beaurepaire, Marie-Claire Schanne-Klein, Françoise Peyrin, Delphine Farlay, Cécile Olivier, Yohann Bala, Georges Boivin, Jean-Claude Vial, Delphine Débarre, Aurélien Gourrier
article
Scientific Reports, 2017, 7 (1), 16 p. ⟨10.1038/s41598-017-03548-5⟩
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https://hal.science/hal-01540048/file/Scientific_Reports_7_3419.pdf BibTex
titre
Lamins and nesprin-1 mediate inside-out mechanical coupling in muscle cell precursors through FHOD1
auteur
Christine Schwartz, Martina Fischer, Kamel Mamchaoui, Anne Bigot, Thevy Lok, Claude Verdier, Alain Duperray, Richard Michel, Ian Holt, Thomas Voit, Suzanna Quijano-Roy, Gisèle Bonne, Catherine Coirault
article
Scientific Reports, 2017, 7 (1), pp.1253. ⟨10.1038/s41598-017-01324-z⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-01518113/file/lamins.pdf BibTex
titre
Unraveling the Receptor-Ligand Interactions between Bladder Cancer Cells and the Endothelium Using AFM.
auteur
Vinoth Sundar Rajan, Valérie M Laurent, Claude Verdier, Alain Duperray
article
Biophysical Journal, 2017, 112 (6), pp.1246-1257. ⟨10.1016/j.bpj.2017.01.033⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://inserm.hal.science/inserm-01498619/file/Manuscript_BiophysJ_V-Sundar_2017.pdf https://inserm.hal.science/inserm-01498619/file/Supporting_Information_V-Sundar_2017.pdf BibTex
titre
The spontaneous motion of a slug of miscible liquids in a capillary tube
auteur
Mathieu Sellier, Claude Verdier, Volker Nock
article
International Journal of Nanotechnology, 2017, 14, pp.530-539. ⟨10.1504/ijnt.2017.082475⟩
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https://hal.science/hal-01135024/file/capillary-tube.pdf BibTex
titre
Geometry can provide long-range mechanical guidance for embryogenesis
auteur
Mahamar M Dicko, Pierre Saramito, Guy B Blanchard, Claire M Lye, Bénédicte B Sanson, Jocelyn Étienne
article
PLoS Computational Biology, 2017, 13 (3), pp.e1005443. ⟨10.1371/journal.pcbi.1005443⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-01566789/file/Dicko%2BEtienne.2017.1.pdf BibTex
titre
Microvasculature on a chip: study of the Endothelial Surface Layer and the flow structure of Red Blood Cells
auteur
Daria Tsvirkun, Alexei Grichine, Alain Duperray, Chaouqi Misbah, Lionel Bureau
article
Scientific Reports, 2017, 7, pp.45036. ⟨10.1038/srep45036⟩
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https://inserm.hal.science/inserm-01498626/file/Tsvirkun_SciRep_2017.pdf BibTex

2016

titre
A variational approach to the growth dynamics of pre-stressed actin filament networks
auteur
Karin John, Thomas Stöter, Chaouqi Misbah
article
Journal of Physics: Condensed Matter, 2016, 28 (37), pp.375101. ⟨10.1088/0953-8984/28/37/375101⟩
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BibTex
titre
Effective viscosity of 2D suspensions - Confinement effects
auteur
Vincent Doyeux, Stephane Priem, Levan Jibuti, Alexander Farutin, Mourad Ismail, Philippe Peyla
article
Physical Review Fluids, 2016, 1 (4), pp.043301. ⟨10.1103/PhysRevFluids.1.043301⟩
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https://hal.science/hal-01290029/file/Suspensions2D.pdf BibTex
titre
Effective viscosity of two-dimensional suspensions: Confinement effects
auteur
Vincent Doyeux, Stephane Priem, Levan Jibuti, Alexander Farutin, Mourad Ismail, Philippe Peyla
article
Physical Review Fluids, 2016, 1 (4)
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BibTex
titre
Efficient second-harmonic imaging of collagen in histological slides using Bessel beam excitation
auteur
Nelly Vuillemin, Pierre Mahou, Delphine Débarre, Thierry Gacoin, Pierre-Louis Tharaux, Marie-Claire Schanne-Klein, Willy Supatto, Emmanuel Beaurepaire
article
Scientific Reports, 2016, 6 (29863 (2016)), ⟨10.1038/srep29863⟩
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https://polytechnique.hal.science/hal-01421632/file/srep29863.pdf BibTex
titre
Blood flow and microgravity
auteur
Lionel Bureau, Gwennou Coupier, Frank Dubois, Alain Duperray, Alexander Farutin, Christophe Minetti, Chaouqi Misbah, Thomas Podgorski, Daria Tsvirkun, Mikhail Vysokikh
article
Comptes Rendus Mécanique, 2016, 345 (1), pp.78 - 85. ⟨10.1016/j.crme.2016.10.011⟩
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BibTex
titre
The Conformation of Thermoresponsive Polymer Brushes Probed by Optical Reflectivity
auteur
Siddhartha Varma, Lionel Bureau, Delphine Débarre
article
Langmuir, 2016, 32 (13), pp.3152 - 3163. ⟨10.1021/acs.langmuir.6b00138⟩
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https://arxiv.org/pdf/1511.07391 BibTex
titre
Clusters of red blood cells in microcapillary flow: hydrodynamic versus macromolecule induced interaction
auteur
Viviana Claveria, Othmane Aouane, Marine Thiébaud, Manouk Abkarian, Gwennou Coupier, Chaouqi Misbah, Thomas John, Christian Wagner
article
Soft Matter, 2016, 12 (39), pp.8235-8245. ⟨10.1039/C6SM01165A⟩
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https://hal.science/hal-02003361/file/1608.03695v2.pdf BibTex
titre
Self-repair promotes microtubule rescue
auteur
Charlotte Aumeier, Laura Schaedel, Jérémie Gaillard, Karin John, Laurent Blanchoin, Manuel Théry
article
Nature Cell Biology, 2016, 18 (10), pp.1054 - 1064. ⟨10.1038/ncb3406⟩
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BibTex
titre
From a thin film model for passive suspensions towards the description of osmotic biofilm spreading
auteur
Sarah Trinschek, Karin John, Uwe Thiele
article
AIMS Materials Science, 2016, 3 (3), pp.1138-1159. ⟨10.3934/matersci.2016.3.1138⟩
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https://arxiv.org/pdf/1607.08425 BibTex
titre
Prediction of traction forces of motile cells
auteur
Clément Roux, Alain Duperray, Valérie Laurent, Richard Michel, Valentina Peschetola, Claude Verdier, Jocelyn Etienne
article
Interface Focus, 2016, Theme issue ‘Coupling geometric partial differential equations with physics for cell morphology, motility and pattern formation’ organized by Rudolf Leube, Anotida Madvamuse, Rudolf Merkel and Hans Othmer, 6 (5), ⟨10.1098/rsfs.2016.0042⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-01391213/file/JE-Interface16.pdf BibTex

2015

titre
Green autofluorescence, a double edged monitoring tool for bacterial growth and activity in micro-plates
auteur
Irina Mihalcescu, Mathilde Van-Melle Gateau, Bernard Chelli, Corinne Pinel, Jean-Luc Ravanat
article
Physical Biology, 2015, 12 (6), ⟨10.1088/1478-3975/12/6/066016⟩
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https://hal.science/hal-01628395/file/Autofluorescence_with_Supplementary%20Information.pdf BibTex
titre
Microtubules self-repair in response to mechanical stress.
auteur
Laura Schaedel, Karin John, Jérémie Gaillard, Maxence V Nachury, Laurent Blanchoin, Manuel Théry
article
Nature Materials, 2015, 14 (11), pp.1156-63. ⟨10.1038/nmat4396⟩
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BibTex
titre
Local mechanical properties of bladder cancer cells measured by AFM as a signature of metastatic potential
auteur
Yara Abidine, Valérie M. Laurent, Richard Michel, Alain Duperray, Claude Verdier
article
The European Physical Journal Plus, 2015, 130, pp.202. ⟨10.1140/epjp/i2015-15202-6⟩
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https://hal.science/hal-01184996/file/Cancer-AFM.pdf BibTex
titre
Hemodynamic simulations in the cerebral venous network: A study on the influence of different modeling assumptions
auteur
Vincent Chabannes, Mourad Ismail, Christophe Prud'Homme, Marcela Szopos
article
Journal of Coupled Systems and Multiscale Dynamics, 2015, 3 (1), pp.23-37. ⟨10.1166/jcsmd.2015.1062⟩
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https://hal.science/hal-01109767/file/CIPS_preprint.pdf BibTex
titre
Cells as liquid motors: Mechanosensitivity emerges from collective dynamics of actomyosin cortex
auteur
Jocelyn Etienne, Jonathan Fouchard, Démosthène Mitrossilis, Nathalie Bufi, Pauline Durand-Smet, Atef Asnacios
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2015, 112 (9), pp.2740-2745. ⟨10.1073/pnas.1417113112⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-01132702/file/own_version_with_SI.pdf BibTex
titre
Physical properties of polyacrylamide gels probed by AFM and rheology
auteur
Yara Abidine, Valérie M. Laurent, Richard Michel, Alain Duperray, Liviu Iulian Palade, Claude Verdier
article
EPL - Europhysics Letters, 2015, 109 (3), 38003-p1-6. ⟨10.1209/0295-5075/109/38003⟩
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https://hal.science/hal-00840468/file/Abidine2015%20%281%29.pdf BibTex
titre
Emergent material properties of developing epithelial tissues
auteur
Pedro F Machado, Julia Duque, Jocelyn Etienne, Alfonso Martinez-Arias, Guy B Blanchard, Nicole Gorfinkiel
article
BMC Biology, 2015, 13, pp.98. ⟨10.1186/s12915-015-0200-y⟩
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https://hal.univ-grenoble-alpes.fr/hal-01233927/file/s12915-015-0200-y.pdf BibTex

Book sections

2021

titre
Joint Motion Estimation and Source Identification using Convective Regularisation with an Application to the Analysis of Laser Nanoablations
auteur
Lukas Lang, Nilankur Dutta, Elena Scarpa, Bénédicte Sanson, Carola-Bibiane Schönlieb, Jocelyn Etienne
article
Kaltenbacher, Barbara, Schuster, Thomas, Wald, Anne. Time-dependent Problems in Imaging and Parameter Identification, , 2021, 978-3-030-57784-1. ⟨10.1007/978-3-030-57784-1_7⟩
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BibTex

2020

titre
Red Blood Cell Dynamics: The Contribution of Microgravity in the BIOMICS Project
auteur
Thomas Podgorski, Gwennou Coupier, Christophe Minetti
article
Preparation of Space Experiments, IntechOpen; IntechOpen, 2020, ⟨10.5772/intechopen.93471⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-02990854/file/Red%20blood%20cell%20dynamics-%20chapitre_V4.pdf BibTex

Books

2023

titre
Mécanique des tissus vivants
auteur
Cédric P. Laurent, Claude Verdier
article
ISTE éditions, pp.356, 2023, 978-1-78948-160-0
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2022

titre
Biological Flow in Large Vessels
auteur
Valerie Deplano, Claude Verdier, Jose-Maria Fullana
article
ISTE Science Publishing Ltd, London, 2022, 978-1-78945-065-1
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