2016
Journal articles
- titre
- Accurate prediction of the statistics of repetitions in random sequences: a case study in Archaea genomes
- auteur
- Mireille Regnier, Philippe Chassignet
- article
- Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, 2016, 4, ⟨10.3389/fbioe.2016.00035⟩
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-
- titre
- SV-Bay: structural variant detection in cancer genomes using a Bayesian approach with correction for GC-content and read map-pability.
- auteur
- Daria Iakovishina, Isabelle Janoueix-Lerosey, Emmanuel Barillot, Mireille Regnier, Valentina Boeva
- article
- Bioinformatics, 2016, 32, pp.984-992. ⟨10.1093/bioinformatics/btv751⟩
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-
Poster communications
- titre
- Computational methods for comparing and integrating multiple probing assays to predict RNA secondary structure
- auteur
- Afaf Saaidi, Delphine M Allouche, Yann Ponty, Bruno M Sargueil, Mireille M Regnier
- article
- Doctorial journey Interface, Ecole polytechnique, Palaiseau, Nov 2016, Palaiseau, France. 10
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-
2015
Books
- titre
- Proceedings of the SeqBio 2015 workshop: String algorithms for bioinformatics
- auteur
- Alain Denise, Olivier Lespinet, Mireille Régnier
- article
- Alain Denise; Olivier Lespinet; Mireille Régnier. 2015
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-
Preprints, Working Papers, ...
- titre
- SV-Bay: structural variant detection in cancer genomes using a Bayesian approach with correction for GC-content and read mappability
- auteur
- D Iakovishina, Isabelle Janoueix-Lerosey, Emmanuel Barillot, Mireille Regnier, Valentina Boeva
- article
- 2015
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-
- titre
- Accurate prediction of the statistics of repetitions in random sequences : a case study in Archae genomes
- auteur
- Mireille Regnier, Philippe Chassignet
- article
- 2015
- Accès au bibtex
-
2014
Journal articles
- titre
- Analysis of pattern overlaps and exact computation of P-values of pattern occurrences numbers: case of Hidden Markov Models
- auteur
- Mireille Régnier, Evgenia Furletova, Victor Yakovlev, Mikhail Roytberg
- article
- Algorithms for Molecular Biology, 2014, 9 (1), ⟨10.1186/s13015-014-0025-1⟩
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-
- titre
- TmiRUSite and TmiROSite scripts: searching for mRNA fragments with miRNA binding sites with encoded amino acid residues
- auteur
- Olga Berillo, Mireille Regnier, Anatoly Ivashchenko
- article
- Bioinformation, 2014, 10 (7), pp.472-473
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-
Conference papers
- titre
- Clump Combinatorics, Automata, and Word Asymptotics
- auteur
- Mireille Regnier, Billy Fang, Daria Iakovishina
- article
- ANALCO'14, Jan 2014, Portland, United States. ⟨10.1137/1.9781611973204.6⟩
- Accès au bibtex
-
2013
Journal articles
- titre
- Large deviation properties for patterns
- auteur
- Mireille Regnier, Jérémie Bourdon
- article
- Journal of Discrete Algorithms, 2013, ⟨10.1016/j.jda.2013.09.004⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Binding of intronic miRNAs to the mRNAs of host genes encoding intronic miRNAs and proteins that participate in tumourigenesis
- auteur
- Olga Berillo, Mireille Regnier, Anatoly Ivashchenko
- article
- Computers in Biology and Medicine, 2013, ⟨10.1016/j.compbiomed.2013.07.011⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Characteristics of binding sites of intergenic, intronic and exonic miRNAs with mRNAs of oncogenes coding intronic miRNAs
- auteur
- Olga Berillo, Assel Issabekova, Mireille Regnier, Anatoly Ivashchenko
- article
- African Journal of Biotechnology, 2013, 12 (10), pp.1016-1024. ⟨10.5897/AJB12.2054⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2012
Journal articles
- titre
- Interactions of intergenic microRNAs with mRNAs of genes involved in carcinogenesis
- auteur
- Assel Issabekova, Olga Berillo, Mireille Regnier, Anatoly Ivashchenko
- article
- Bioinformation, 2012, 8 (11), pp.513-518. ⟨10.6026/97320630008513⟩
- Accès au bibtex
-
Conference papers
- titre
- Large deviation properties for patterns
- auteur
- Jérémie Bourdon, Mireille Regnier
- article
- LSD&LAW 2012, Simon J. Puglisi and Golnaz Badkobeh, Feb 2012, Londres, United Kingdom
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Reports
- titre
- A Dynamical Model for the Transmembrane Potential Regulation by pH
- auteur
- Araks Martirosyan, Loïc Paulevé, Clair Poignard, Mireille Régnier, Jean-Marc Steyaert, Laurent Schwartz
- article
- [Research Report] LIX, Ecole polytechnique. 2012
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2011
Journal articles
- titre
- Counting RNA pseudoknotted structures
- auteur
- Cédric Saule, Mireille Regnier, Jean-Marc Steyaert, Alain Denise
- article
- Journal of Computational Biology, 2011, 18 (10), pp.1339-1351. ⟨10.1089/cmb.2010.0086⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Characteristics of Intronic and Intergenic Human miRNAs and Features of their Interaction with mRNA
- auteur
- Assel Issabekova, Olga Berillo, Vladimir Khailenko, Shara Atambayeva, Mireille Regnier, Anatoliy T. Ivashchenko
- article
- International Journal of Biotechnology and Bioengineering, 2011, 5 (11), pp.777-780
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2010
Conference papers
- titre
- Counting RNA pseudoknotted structures (extended abstract)
- auteur
- Cédric Saule, Mireille Regnier, Jean-Marc Steyaert, Alain Denise
- article
- 22nd International Conference on Formal Power Series and Algebraic Combinatorics (FPSAC 2010), 2010, San Francisco, United States. pp.1037-1048, ⟨10.46298/dmtcs.2834⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2009
Journal articles
- titre
- Using profiles based on hydropathy properties to define essential regions for splicing
- auteur
- Anatoly Ivashchenko, Galina Boldina, Aizhan Turmagambetova, Mireille Régnier
- article
- International Journal of Biological Sciences, 2009, 5, pp.13-19
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Book sections
- titre
- A Word Counting Graph
- auteur
- Mireille Regnier, Zara Kirakossian, Eugenia Furletova, Mikhail A. Roytberg
- article
- Joseph Chan, Jacqueline W. Daykin and M. Sohel Rahman. London Algorithmics 2008: Theory and Practice (Texts in Algorithmics), London College Publications, 31 p., 2009, 978-1904987970
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