Publications HAL de Robert Duran

2021

Journal articles

titre
Fungi in PAH-contaminated marine sediments: Cultivable diversity and tolerance capacity towards PAH
auteur
Joyce Álvarez-Barragán, Cristiana Cravo-Laureau, Lukas Wick, Robert Duran
article
Marine Pollution Bulletin, Elsevier, 2021, 164, pp.112082. ⟨10.1016/j.marpolbul.2021.112082⟩
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titre
Metagenomic exploration of multi-resistance genes linked to microbial attributes in active nonferrous metal(loid) tailings
auteur
Jian-Li Liu, Jun Yao, Xiaozhe Zhu, De-Liang Zhou, Robert Duran, Victor Mihucz, Safdar Bashir, Karen Hudson-Edwards
article
Environmental Pollution, Elsevier, 2021, 273, pp.115667. ⟨10.1016/j.envpol.2020.115667⟩
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titre
Assessment of acid mist on mortar biodeterioration simulating the wall of Jardim da Princesa, the National Museum of Rio de Janeiro, Brazil
auteur
Diogo S.B. Dias, Lizeth Y.A. Jaramillo, Douglas Guedes, Robert Duran, Anne Carbon, Luiz Bertolino, Ulrich Vasconcelos, Márcia T.S. Lutterbach, Eliana F.C. Sérvulo, Cristiana Cravo-Laureau
article
International Biodeterioration and Biodegradation, Elsevier, 2021, 157, pp.105155. ⟨10.1016/j.ibiod.2020.105155⟩
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titre
Effect of organic and conventional farming on soil bacterial diversity of pecan tree ( Carya illinoensis K. Kosh) orchard across two phenological stages
auteur
Luz Elena Palma‐cano, Hilda Piñon‐castillo, Socorro Tarango‐rivero, Anne Carbon, Joan Salas‐leiva, Laila Muñoz‐castellanos, Cristiana Cravo-Laureau, Robert Duran, Erasmo Orrantia‐borunda
article
Letters in Applied Microbiology, Wiley, In press, ⟨10.1111/lam.13452⟩
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titre
Novel arsenic hyper-resistant bacteria from an extreme environment, Crven Dol mine, Allchar, North Macedonia
auteur
Vladimir Bermanec, Tina Paradžik, Snježana Kazazić, Chantelle Venter, Jasna Hrenović, Dušica Vujaklija, Robert Duran, Ivan Boev, Blažo Boev
article
Journal of Hazardous Materials, Elsevier, 2021, 402, pp.123437. ⟨10.1016/j.jhazmat.2020.123437⟩
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titre
Changes in bacterial diversity of activated sludge exposed to titanium dioxide nanoparticles
auteur
Pabel Cervantes-Avilés, César Augusto Caretta, Elcia Margareth Souza Brito, Pierre Bertin, Germán Cuevas-Rodríguez, Robert Duran
article
Biodegradation, Springer Verlag, In press, ⟨10.1007/s10532-021-09939-w⟩
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2020

Journal articles

titre
Comprehensive genomic and proteomic profiling reveal Acinetobacter johnsonii JH7 responses to Sb(III) toxicity
auteur
Jihai Gu, Jun Yao, Robert Duran, Geoffrey Sunahara
article
Science of the Total Environment, Elsevier, 2020, 748, pp.141174. ⟨10.1016/j.scitotenv.2020.141174⟩
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titre
Alteration of mixture toxicity in nonferrous metal mine tailings treated by biochar
auteur
Jihai Gu, Jun Yao, Robert Duran, Geoffrey Sunahara, Xiaoqi Zhou
article
Journal of Environmental Management, Elsevier, 2020, 265, pp.110511. ⟨10.1016/j.jenvman.2020.110511⟩
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titre
Effects of typical flotation reagent on microbial toxicity and nickel bioavailability in soil
auteur
Hao Li, Jun Yao, Robert Duran, Beenish Roha, Nuray Karapınar, Gyozo Jordan, Tatiana Minkina, Jihai Gu, Chao Lu, Ning Min, Zixia Fan
article
Chemosphere, Elsevier, 2020, 240, pp.124913. ⟨10.1016/j.chemosphere.2019.124913⟩
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titre
Aerobic and oxygen-limited naphthalene-amended enrichments induced the dominance of Pseudomonas spp. from a groundwater bacterial biofilm
auteur
Tibor Benedek, Flóra Szentgyörgyi, Istvan Szabo, Milán Farkas, Robert Duran, Balázs Kriszt, András Táncsics
article
Applied Microbiology and Biotechnology, Springer Verlag, 2020, 104 (13), pp.6023-6043. ⟨10.1007/s00253-020-10668-y⟩
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Conference papers

titre
Microbial communities and hydrocarbon biodegradation in land sea continuum
auteur
Elise Châtillon, Robert Duran, François Rigal, Christine Cagnon, Catherine Lorgeoux, Pierre Faure, Marie Hubert-Roux, Isabelle Schmitz-Afonso, Carlos Afonso, Aurélie Cébron, Cristiana Cravo-Laureau
article
SETAC, May 2020, Virtual Conference, Dublin, Ireland
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2019

Journal articles

titre
Sb(III)-resistance mechanisms of a novel bacterium from non-ferrous metal tailings
auteur
Jihai Gu, Geoffrey Sunahara, Robert Duran, Jun Yao, Yongqiang Cui, Cengceng Tang, Hongquan Li, Victor Mihucz
article
Ecotoxicology and Environmental Safety, Elsevier, 2019, 186, pp.109773. ⟨10.1016/j.ecoenv.2019.109773⟩
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titre
Modelling phaeopigments concentrations in water from a shallow mesotrophic lagoon
auteur
Teodor Stoichev, Robert Duran, Alberto de Diego, Vitor Vasconcelos
article
Water environment research, Water Environment Federation, 2019, ⟨10.1002/wer.1255⟩
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titre
Bacterial community assemblages in sediments under high anthropogenic pressure at Ichkeul Lake/Bizerte Lagoon hydrological system, Tunisia
auteur
Fida Ben Salem, Olfa Ben Saïd, Cristiana Cravo-Laureau, Ezzeddine Mahmoudi, Noëlle Bru, Mathilde Monperrus, Robert Duran
article
Environmental Pollution, Elsevier, 2019, 252, pp.644-656. ⟨10.1016/j.envpol.2019.05.146⟩
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titre
Comparison of flow regimes on biocorrosion of steel pipe weldments: Community composition and diversity of biofilms
auteur
Vitor Silva Liduino, Cristiana Cravo-Laureau, Cyril Noel, Anne Carbon, Robert Duran, Marcia Teresa Lutterbach, Eliana Flávia Camporese Sérvulo
article
International Biodeterioration and Biodegradation, Elsevier, 2019, 143, pp.104717. ⟨10.1016/j.ibiod.2019.104717⟩
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titre
Nonferrous metal (loid) s mediate bacterial diversity in an abandoned mine tailing impoundment
auteur
Jianli Liu, Jun Yao, Geoffrey Sunahara, Fei Wang, Zifu Li, Robert Duran
article
Environmental Science and Pollution Research, Springer Verlag, 2019, 26 (24), pp.24806-24818. ⟨10.1007/s11356-019-05092-3⟩
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titre
Microbial activity and biodiversity responding to contamination of metal(loid) in heterogeneous nonferrous mining and smelting areas
auteur
Jian-Li Liu, Jun Yao, Chao Lu, Hao Li, Zi-Fu Li, Robert Duran, Geoffrey Sunahara, Victor Mihucz
article
Chemosphere, Elsevier, 2019, 226, pp.659-667. ⟨10.1016/j.chemosphere.2019.03.051⟩
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titre
Dynamics of microbial communities across the three domains of life over an annual cycle with emphasis on marine mucilage in the Southern Bay of Biscay resolved by microbial fingerprinting
auteur
Vanessa Rouaud, Nicolas Susperregui, Anne Fahy, Rémy Guyoneaud, Sabrina Bichon, Camilla Liénart, Yolanda del Amo, Nicolas Savoye, Philippe Gaudin, Robert Duran, Béatrice Lauga
article
Continental Shelf Research, Elsevier, 2019, 186, pp.127-137. ⟨10.1016/j.csr.2019.06.003⟩
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titre
Bacterial diversity in typical abandoned multi-contaminated nonferrous metal(loid) tailings during natural attenuation
auteur
Jian-Li Liu, Jun Yao, Fei Wang, Ning Min, Ji-Hai Gu, Zi-Fu Li, Geoffrey Sunahara, Robert Duran, Tatjana Solevic-Knudsen, Karen Hudson-Edwards, Lena Alakangas
article
Environmental Pollution, Elsevier, 2019, 247, pp.98-107. ⟨10.1016/j.envpol.2018.12.045⟩
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2018

Journal articles

titre
Microcalorimetry and enzyme activity to determine the effect of nickel and sodium butyl xanthate on soil microbial community
auteur
Hao Li, Jun Yao, Jihai Gu, Robert Duran, Beenish Roha, Gyozo Jordan, Jianli Liu, Ning Min, Chao Lu
article
Ecotoxicology and Environmental Safety, Elsevier, 2018, 163, pp.577 - 584. ⟨10.1016/j.ecoenv.2018.07.108⟩
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titre
China’s most typical nonferrous organic-metal facilities own specific microbial communities
auteur
Jian-Li Liu, Jun Yao, Fei Wang, Wen Ni, Xing-Yu Liu, Geoffrey Sunahara, Robert Duran, Gyozo Jordan, Karen Hudson-Edwards, Lena Alakangas, Tatjana Solevic-Knudsen, Xiao-Zhe Zhu, Yi-Yue Zhang, Zi-Fu Li
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2018, 8 (1), ⟨10.1038/s41598-018-30519-1⟩
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titre
Dynamics of particulate organic matter composition in coastal systems: Forcing of spatio-temporal variability at multi-systems scale
auteur
Camilla Liénart, Nicolas Savoye, Valérie David, Pierre Ramond, Paco Rodriguez Tress, Vincent Hanquiez, Vincent Marieu, Sébastien Aubin, Fabien Aubert, Sabrina Bichon, Christophe Boinet, Line Bourasseau, Yann Bozec, Martine Bréret, Elsa Breton, Jocelyne Caparros, Thierry Cariou, Pascal Claquin, Pascal Conan, Anne-Marie Corre, Laurence Costes, Muriel Crouvoisier, Yolanda del Amo, Hervé Derriennic, Francois Dindinaud, Robert Duran, Maïa Durozier, Jérémy Devesa, Sophie Ferreira, Eric Feunteun, Nicole Garcia, Sandrine Geslin, Emilie Grossteffan, Aurore Gueux, Julien Guillaudeau, Gael Guillou, Orianne Jolly, Nicolas Lachaussée, Michel Lafont, Véronique Lagadec, Jézabel Lamoureux, Béatrice Lauga, Benoit Lebreton, Eric Lecuyer, Jean-Paul Lehodey, Cédric Leroux, Stéphane l'Helguen, Éric Macé, Eric Maria, Laure Mousseau, Antoine Nowaczyk, Philippe Pineau, Franck Petit, Mireille Pujo-Pay, Patrick Raimbault, Peggy Rimmelin-Maury, Vanessa Rouaud, Pierre-Guy Sauriau, Emmanuelle Sultan, Nicolas Susperregui
article
Progress in Oceanography, Elsevier, 2018, 162, pp.271-289. ⟨10.1016/j.pocean.2018.02.026⟩
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titre
Effect of sulfonylurea tribenuron methyl herbicide on soil Actinobacteria growth and characterization of resistant strains
auteur
Kounouz Rachedi, Ferial Zermane, Radja Tir, Fatima Ayache, Robert Duran, Béatrice Lauga, Solange Karama, Maryse Simon, Abderrahmane Boulahrouf
article
Brazilian Journal of Microbiology, Sociedade Brasileira de Microbiologia, 2018, 49 (1), pp.79-86. ⟨10.1016/j.bjm.2017.05.004⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01701579/file/Rachedi%20K%20Braz%20J%20Microbiol%202018%20Effect%20of%20sulfonylurea%20tribenuron%20methyl%20herbicide%20on%20soil%20Actinobacteria%20growth%20and%20characterization%20of%20resistant%20strains.pdf BibTex

Book sections

titre
Rôle des micro-organismes dans la biodisponibilité des contaminants
auteur
Lise Fechner, Chantal Compere, Thierry Berthe, Fabienne Petit, Robert Duran
article
Marie-Hélène Tusseau-Vuillemin; Emmanuelle Uher; Catherine Gourlay-Francé. Biodisponibles - Une histoire entre le vivant et son exposome, ISTE, pp.163-202, 2018, 978-1-78405-354-3
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Poster communications

titre
Dynamics of microbial communities across the three domains of life in the Bay of Biscay with emphasis on marine mucilage
auteur
Vanessa Rouaud, Nicolas Susperregui, Remy Guyoneaud, Philippe Gaudin, Robert Duran, Beatrice Lauga
article
ISOBAY 16. 16.International Symposium on Oceanography of the Bay of Biscay, Jun 2018, Anglet, France. 167 p., 2018, Book of Abstracts. Isobay 16
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Reports

titre
Liga en Sud-Aquitaine. Causes et conséquences du développement de "neige marine" sur la côte Basque et le sud des Landes
auteur
Nicolas Susperregui, Philippe Gaudin, Béatrice Lauga, Robert Duran, Vanessa Rouaud, Mathilde Monperrus, Thierry Pigot, Denis Morichon, Gaëlle Deletraz, Yolanda Del Amo, Nicolas Savoye, Camilla Liénart, Florence Jude, Valerie David, Edith Parlanti, Jeremie Parot, Mahaut Sourzac, Marie-Ange Cordier, Jean d'Elbée
article
[Rapport de recherche] Fédération MIRA - Milieux et Ressources Aquatiques. 2018, 82 p
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2017

Journal articles

titre
Bacterial diversity in fumarole environments of the Paricutin volcano, Michoacan (Mexico)
auteur
Miguel Medrano-Santillana, Elcia Margaret Souza-Brito, Robert Duran, Felix Gutierrez-Corona, Georgina Elena Reyna-Lopez
article
Extremophiles, Springer Verlag, 2017, 21, pp.499-511. ⟨10.1007/s00792-017-0920-8⟩
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titre
Oxidative damage to Pseudomonas aeruginosa ATCC 27833 and Staphylococcus aureus ATCC 24213 induced by CuO-NPs
auteur
A.L. Ulloa-Ogaz, H.A. Piñón-Castillo, L.N. Muñoz-Castellanos, M.S. Athie-García, M.D.L. Ballinas-Casarrubias, J.G. Murillo-Ramirez, L.Á. Flores-Ongay, Robert Duran, E. Orrantia-Borunda
article
Environmental Science and Pollution Research, Springer Verlag, 2017, 24 (27), pp.22048-22060. ⟨10.1007/s11356-017-9718-6⟩
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titre
Isolation, purification and chemical characterization of a new angucyclinone compound produced by a new halotolerant Nocardiopsis sp. HR-4 strain
auteur
Rabia-Boukhalfa Yamina Hadj, Yannick Eveno, Solange Karama, Okba Selama, Béatrice Lauga, Robert Duran, Hocine Hacene, Véronique Eparvier
article
World Journal of Microbiology and Biotechnology, Springer Verlag, 2017, 33, pp.126. ⟨10.1007/s11274-017-2292-8⟩
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titre
Recovering hydromorphological functionality to improve natural purification capacity of a highly human-modified wetland
auteur
J.M. Bodoque, J. Ladera, J.L. Yela, J. Alonso-Azcárate, Daniel Brito, I. Antiguedad, Robert Duran, Eléonore Attard, Béatrice Lauga, J.M. Sánchez-Pérez
article
Ecological Engineering, Elsevier, 2017, 103, pp.332--343. ⟨10.1016/j.ecoleng.2016.02.013⟩
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titre
Biodiversity and ecosystem purification service in an alluvial wetland
auteur
Samuel Teissier, Eléonore Attard, Béatrice Lauga, Robert Duran, Frédéric Julien, Léonard Bernard-Jannin, Hashradah Ramburn, Magali Gérino, Jingmei Yao, Jose-Miguel Sanchez-Perez, Sabine Sauvage
article
Ecological Engineering, Elsevier, 2017, 103B, pp.359-371. ⟨10.1016/j.ecoleng.2016.02.019⟩
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Conference papers

titre
Assessment of oil weathering and impact in mangrove ecosystem: PRISME Experiment.
auteur
Ronan Jézéquel, Karine Duboscq, Léa Sylvi, Emma Michaud, Lise Millera Ferriz, Enora Roic, Robert Duran, Cristiana Cravo-Laureau, Valerie Michotey, Patricia Bonin, Franck Gilbert, Marc Tedetti, Cécile Militon, Philippe Cuny
article
International Oil Spill Conference Proceedings 2017, May 2017, Long Beach, United States. pp.634-656, ⟨10.7901/2169-3358-2017.1.634⟩
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Book sections

titre
Microbial Responses to Pollution—Ecotoxicology: Introducing the Different Biological Levels
auteur
Cristiana Cravo-Laureau, Beatrice Lauga, Christine Cagnon, Robert Duran
article
Cravo-Laureau, C., Cagnon, C., Duran, R., Lauga, B. Microbial Ecotoxicology, Springer, pp.45-62, 2017, ISBN 978-3-319-61795-4
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Books

titre
Microbial Ecotoxicology
auteur
Cristiana Cravo-Laureau, Christine Cagnon, Béatrice Lauga, Robert Duran
article
Cravo-Laureau, C., Cagnon, C., Duran, R., Lauga, B. Springer International Publishing, 2017, 978-3-319-61795-4. ⟨10.1007/978-3-319-61795-4⟩
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2016

Journal articles

titre
Response of Core Microbial Consortia to Chronic Hydrocarbon Contaminations in Coastal Sediment Habitats
auteur
Mathilde Jeanbille, Jérôme Gury, Robert Duran, Jacek Tronczynski, Hélène Agogué, Olfa Ben Saïd, Jean-François Ghiglione, Jean-Christophe Auguet
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2016, 7, pp.1637. ⟨10.3389/fmicb.2016.01637⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-01417951/file/fmicb-07-01637.pdf BibTex
titre
Metatranscriptomes of oil-contaminated marine coastal sediment affected by oil addition and/or by the bioturbating activity of the marine polychaete Hediste diversicolor: Who are the microbial players?
auteur
Cécile Militon, Alexandre Atkinson, Valerie Michotey, Celine Jeziorski, Cristiana Cravo-Laureau, Robert Duran, Patricia Bonin, Philippe Cuny
article
Marine Genomics, Elsevier, 2016, 29, pp.55-59. ⟨10.1016/j.margen.2016.06.006⟩
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titre
Chronic Polyaromatic Hydrocarbon (PAH) Contamination Is a Marginal Driver for Community Diversity and Prokaryotic Predicted Functioning in Coastal Sediments
auteur
Mathilde Jeanbille, Jérôme Gury, Robert Duran, Jacek Tronczynski, Jean-François Ghiglione, Hélène Agogué, Olfa Ben Saïd, Najwa Taïb, Didier Debroas, Cédric Garnier, Jean-Christophe Auguet
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2016, 7, pp.1303. ⟨10.3389/fmicb.2016.01303⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-01599382/file/fmicb-07-01303.pdf BibTex
titre
Chemical multi-contamination drives benthic prokaryotic diversity in the anthropized Toulon Bay
auteur
Benjamin Misson, Cédric Garnier, Béatrice Lauga, Duc Huy Dang, Jean-François Ghiglione, Jean-Ulrich Mullot, Robert Duran, Olivier Pringault
article
Science of the Total Environment, Elsevier, 2016, 556, pp.319 - 329. ⟨10.1016/j.scitotenv.2016.02.038⟩
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titre
Validation of an Adapted QuEChERS Method for the Simultaneous Analysis of Polycyclic Aromatic Hydrocarbons, Polychlorinated Biphenyls and Organochlorine Pesticides in Sediment by Gas Chromatography–Mass Spectrometry
auteur
Fida Ben Salem, Olfa Ben Saïd, Robert Duran, Mathilde Monperrus
article
Bulletin of Environmental Contamination and Toxicology, Springer Verlag, 2016, 96 (5), pp.678--684. ⟨10.1007/s00128-016-1770-2⟩
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BibTex
titre
Pesticides in Ichkeul Lake–Bizerta Lagoon Watershed in Tunisia: use, occurrence, and effects on bacteria and free-living marine nematodes
auteur
Fida Ben Salem, Olfa Ben Said, Patricia Aissa, Ezzeddine Mahmoudi, Mathilde Monperrus, Olivier Grünberger, Robert Duran
article
Environmental Science and Pollution Research, Springer Verlag, 2016, 23 (1), pp.36-48. ⟨10.1007/s11356-015-4991-8⟩
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Conference papers

titre
Fate and Impact of Oil in Mangrove Ecosystem PRISME Experiment
auteur
Ronan Jézéquel, Karine Duboscq, Lea Sylvi, Emma Michaud, Lise Millera Ferriz, Robert Duran, Cristiana Cravo-Laureau, Valerie Michotey, Patricia Bonin, Gilbert Franck, Marc Tedetti, Cécile Militon, Philippe Cuny
article
AMOP Technical Seminar, Environment and Climate Change Canada, Ottawa, ON, 2016., Jun 2016, Halifax, Canada
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2015

Journal articles

titre
Microbial ecology of hydrocarbon-polluted coastal sediments.
auteur
Robert Duran, Philippe Cuny, Patricia Bonin, Cristiana Cravo-Laureau
article
Environmental Science and Pollution Research, Springer Verlag, 2015, 22 (20), pp.15195 - 15199. ⟨10.1007/s11356-015-5373-y⟩
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titre
Environmental microbiology as a mosaic of explored ecosystems and issues
auteur
Denis Faure, Patricia Bonin, Robert Duran, Pierre Amato, Florence Arsene-Ploetze, Jean-Christophe Auguet, Bernard Legrand, Philippe N. Bertin, Yvan Bettarel, Aurélie Bigot-Clivot, Nicolas Blot, Manuel Blouin, Myriam Bormans, Marc Bouvy, O Bruneel, Aurélie Cébron, Urania Christaki, Ivan Couée, Cristiana Cravo-Laureau, Michael Danger, Julien de Lorgeril, Yves Desdevises, Yves Dessaux, D Destoumieux-Garzón, Élodie Duprat, Gaël Erauso, Feth El Zahar Haichar, Éric Fouilland, Andre-Jean Francez, Nathalie Fromin, Alain Geffard, Jean-François Ghiglione, Arnaud Huguet, Vincent Grossi, Katell Guizien, Ludwig Jardillier, Pascal Jouquet, Fabien Joux, Aurore Kaisermann, Oliver Kaltz, Jean-Christophe Lata, Antoine Lecerf, Corinne Leyval, Patricia Luis, Estelle Masseret, Audrey Niboyet, Philippe Normand, Frédéric Plewniak, Franck Poly, Soizic Prado, Achim Quaiser, Pascal Ratet, Agnès Richaume, Jean-Luc Rolland, Jean-Luc Rols, Jf Rontani, Francesca Rossi, Sophie Sablé, P Sivadon, Philippe Soudant, Christian Tamburini, Aline Tribollet, Claire Valiente Moro, France van Wambeke, Philippe Vandenkoornhuyse, Stéphane Vuilleumier, Philippe Vandenkoornhuyse
article
Environmental Science and Pollution Research, Springer Verlag, 2015, 22 (18), pp.13577-13598. ⟨10.1007/s11356-015-5164-5⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01247096/file/Faure-EC2CO-2015-EnvironSciPollutRes-Environmental-MANUSCRIT.pdf BibTex
titre
Environmental microbiology reveals the Earth secret life.
auteur
Denis Faure, Patricia Bonin, Robert Duran
article
Environmental Science and Pollution Research, Springer Verlag, 2015, 22 (18), pp.13573-6
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BibTex
titre
Use of dispersant in mudflat oil-contaminated sediment: behavior and effects of dispersed oil on micro- and macrobenthos.
auteur
Philippe Cuny, Franck Gilbert, Cécile Militon, Georges Stora, Patricia Bonin, Valerie Michotey, Sophie Guasco, Karine Duboscq, Christine Cagnon, Ronan Jézéquel, Cristiana Cravo-Laureau, Robert Duran
article
Environmental Science and Pollution Research, Springer Verlag, 2015, 22 (20), pp.15370-15376. ⟨10.1007/s11356-015-4800-4⟩
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titre
Effect of physical sediments reworking on hydrocarbon degradation and bacterial community structure in marine coastal sediments.
auteur
Robert Duran, Patricia Bonin, Ronan Jezequel, Karine Dubosc, Claire Gassie, Fanny Terrisse, Justine Abella, Christine Cagnon, Cécile Militon, Valerie Michotey, Franck Gilbert, Philippe Cuny, Cristiana Cravo-Laureau
article
Environmental Science and Pollution Research, Springer Verlag, 2015, 22 (20), pp.15248-15259. ⟨10.1007/s11356-015-4373-2⟩
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titre
Isolation and characterization of different bacterial strains for bioremediation of n-alkanes and polycyclic aromatic hydrocarbons
auteur
A. Guermouche M’rassi, F. Bensalah, J. Gury, Robert Duran
article
Environmental Science and Pollution Research, Springer Verlag, 2015, 22 (20), pp.15332-15346. ⟨10.1007/s11356-015-4343-8⟩
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BibTex
titre
Integron diversity in bacterial communities of freshwater sediments at different contamination levels
auteur
J. Abella, A. Fahy, Robert Duran, Christine Cagnon
article
FEMS Microbiology Ecology, Wiley-Blackwell, 2015, 91 (12), ⟨10.1093/femsec/fiv140⟩
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BibTex
titre
Bacteria-mediated reduction of As(V)-doped lepidocrocite in a flooded soil sample
auteur
Aline Dia, Béatrice Lauga, Mélanie Davranche, Anne Fahy, Robert Duran, Bernd Nowack, Patrice Petitjean, Odile Henin, Sébastien Martin, Rémi Marsac, Gérard Gruau
article
Chemical Geology, Elsevier, 2015, 406, pp.34-44. ⟨10.1016/j.chemgeo.2015.04.008⟩
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https://hal-insu.archives-ouvertes.fr/insu-01145497/file/Dia-ChemGeol-2015-HAL.pdf BibTex
titre
Dynamics of bacterial assemblages and removal of polycyclic aromatic hydrocarbons in oil-contaminated coastal marine sediments subjected to contrasted oxygen regimes
auteur
Cécile Militon, Ronan Jezequel, Franck Gilbert, Yannick Corsellis, Léa Sylvi, Cristiana Cravo-Laureau, Robert Duran, Philippe Cuny
article
Environmental Science and Pollution Research, Springer Verlag, 2015, 22 (20), pp.15260-15272. ⟨10.1007/s11356-015-4510-y⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01233392/file/militon_14472.pdf BibTex

Conference papers

titre
Marine mucilage in South Biscay Bay (France) : factors controlling the dynamics of marine microbial communities
auteur
Vanessa Rouaud, Nicolas Susperregui, Remy Guyoneaud, Philippe Gaudin, Robert Duran, Béatrice Lauga
article
2. EMBO Conference on Aquatic Microbial Ecology (SAME-14), Aug 2015, Uppsala, Sweden
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Book sections

titre
Biodiversity and microbial ecosystems functioning
auteur
Philippe Normand, Robert Duran, Xavier Le Roux, Cindy E. Morris, Jean-Christophe Poggiale
article
Environmental microbiology: fundamentals and applications, Springer Science + Business Media Dordrecht 2015, 2015, 978-94-017-9117-5. ⟨10.1007/978-94-017-9118-2_8⟩
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titre
Mudflat Benthic Spill Simulations
auteur
Cristiana Cravo-Laureau, Ronan Jézéquel, Franck Gilbert, Philippe Cuny, Robert Duran
article
McGenity, Terry J., Timmis, Kenneth N., Fernandez, Balbina Nogales. Hydrocarbon and Lipid Microbiology Protocols. Meso- and Microcosms, Springer Protocols Handbooks, pp.79-89, 2015, 978-3-662-45179-3. ⟨10.1007/8623_2015_52⟩
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2014

Journal articles

titre
Desulfatiferula berrensis sp. nov., a n-alkene-degrading sulfate-reducing bacterium isolated from estuarine sediments.
auteur
Florence Hakil, Oulfat Amin, Agnès Hirschler-Réa, Damien Mollex, Vincent Grossi, Robert Duran, Robert Matheron, Cristiana Cravo-Laureau
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2014, 64 (Pt 2), pp.540-4. ⟨10.1099/ijs.0.057174-0⟩
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titre
Microbial diversity in Los Azufres geothermal field (Michoacán, Mexico) and isolation of representative sulfate and sulfur reducers
auteur
E.M.S. Brito, N. Villegas-Negrete, I.A. Sotelo-González, C.A. Caretta, Marisol Goñi-Urriza, Claire Gassie, Florence Hakil, Yannick Colin, Robert Duran, F. Gutiérrez-Corona, H.A. Piñón-Castillo, G. Cuevas-Rodríguez, O. Malm, J.P.M. Torres, A. Fahy, G.E. Reyna-López, Rémy Guyoneaud
article
Extremophiles, Springer Verlag, 2014, 18 (2), pp.385-398. ⟨10.1007/s00792-013-0624-7⟩
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titre
Effect of CuO nanoparticles over isolated bacterial strains from agricultural soil
auteur
S.I. Concha-Guerrero, E.M.S. Brito, H.A. Piñón-Castillo, S.H. Tarango-Rivero, C.A. Caretta, A. Luna-Velasco, Robert Duran, E. Orrantia-Borunda
article
Journal of Nanomaterials, Hindawi Publishing Corporation, 2014, 2014, ID 148743, 13 p. ⟨10.1155/2014/148743⟩
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titre
Diversity and spatiotemporal dynamics of bacterial communities: Physicochemical and other drivers along an acid mine drainage
auteur
A. Volant, O. Bruneel, A. Desoeuvre, M. Héry, C. Casiot, Noëlle Bru, S. Delpoux, A. Fahy, F. Javerliat, O. Bouchez, Robert Duran, P.N. Bertin, F. Elbaz-Poulichet, B. Lauga
article
FEMS Microbiology Ecology, Wiley-Blackwell, 2014, 90 (1), pp.247-263. ⟨10.1111/1574-6941.12394⟩
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2013

Journal articles

titre
Changes in tolerance to herbicide toxicity throughout development stages of phototrophic biofilms
auteur
Armelle Paule, V. Roubeix, Béatrice Lauga, Robert Duran, François Delmas, Etienne Paul, Jean-Luc Rols
article
Aquatic Toxicology, Elsevier, 2013, vol. 144-145, pp. 310-321. ⟨10.1016/j.aquatox.2013.09.024⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00913088/file/paule_10241.pdf BibTex
titre
Removal of alachlor in anoxic soil slurries and related alteration of the active communities
auteur
Béatrice Lauga, N. Girardin, S. Karama, K. Le Menach, H. Budzinski, Robert Duran
article
Environmental Science and Pollution Research, Springer Verlag, 2013, 20 (2), pp.1089--1105. ⟨10.1007/s11356-012-0999-5⟩
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titre
Impact of a simulated oil spill on benthic phototrophs and nitrogen-fixing bacteria in mudflat mesocosms
auteur
P.-M. Chronopoulou, A. Fahy, F. Coulon, S. Païssé, Marisol Goñi-Urriza, L. Peperzak, L. Acuña Alvarez, B.A. Mckew, T. Lawson, K.N. Timmis, Robert Duran, G.J.C. Underwood, T.J. Mcgenity
article
Environmental Microbiology, Society for Applied Microbiology and Wiley-Blackwell, 2013, 15 (1), pp.242--252. ⟨10.1111/j.1462-2920.2012.02864.x⟩
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titre
Microbial community responses to bioremediation treatments for the mitigation of low-dose anthracene in marine coastal sediments of Bizerte lagoon (Tunisia)
auteur
Haithem Louati, O.B. Said, P. Got, A. Soltani, E. Mahmoudi, Cristiana Cravo-Laureau, Robert Duran, P. Aïssa, O. Pringault
article
Environmental Science and Pollution Research, Springer Verlag, 2013, 20 (1), pp.300--310. ⟨10.1007/s11356-012-0860-x⟩
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titre
Impact of oil on bacterial community structure in bioturbated sediments
auteur
Magali Stauffert, Cristiana Cravo-Laureau, Ronan Jezequel, Sandra Barantal, Philippe Cuny, Franck Gilbert, Christine Cagnon, Cécile Militon, David Amouroux, Fatima Mahdaoui, Brice Bouyssiere, Georges Stora, François-Xavier Merlin, Robert Duran
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2013, vol. 8, pp. 1-15. ⟨10.1371/journal.pone.0065347⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00867612/file/Gilbert_9564.pdf BibTex
titre
Dynamics of metabolically active bacterial communities involved in PAH and toxicity elimination from oil-contaminated sludge during anoxic/oxic oscillations
auteur
Isabelle Vitte, Robert Duran, Guillermina Hernandez Raquet, Julie Mounier, R. Jézéquel, V. Bellet, P. Balaguer, Pierre Caumette, Cristiana Cravo-Laureau
article
Applied Microbiology and Biotechnology, Springer Verlag, 2013, 97 (9), pp.4199--4211. ⟨10.1007/s00253-012-4219-5⟩
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Conference papers

titre
Dynamique des éléments traces métalliques à l’interface Eau/Sol/Microorganismes
auteur
Aline Dia, Mélanie Davranche, Béatrice Lauga, Mohamad Fakih, Bernd Nowack, Mathieu Pédrot, Guillaume Morin, Robert Duran, Remi Marsac, Maya Al-Sid-Cheikh, Charlotte Catrouillet, Hélène Guénet
article
Institut National Polytechnique de Toulouse / ENSIACET, Nov 2013, Toulouse, France
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2011

Journal articles

titre
A photosynthetic rotating annular bioreactor (Taylor-Couette type flow) for phototrophic biofilm cultures
auteur
Armelle Paule, Béatrice Lauga, Loïc Ten-Hage, Jérôme Morchain, Robert Duran, Etienne Paul, Jean-Luc Rols
article
Water Research, IWA Publishing, 2011, vol. 45 (18), pp. 6107-6118. ⟨10.1016/j.watres.2011.09.007⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00908977/file/rols_10244.pdf BibTex
titre
Effect of oxic/anoxic switches on bacterial communities and PAH biodegradation in an oil-contaminated sludge.
auteur
Isabelle Vitte, Robert Duran, Ronan Jézéquel, Pierre Caumette, Cristiana Cravo-Laureau
article
Environmental Science and Pollution Research, Springer Verlag, 2011, 18 (6), pp.1022-32. ⟨10.1007/s11356-010-0435-7⟩
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Book sections

titre
Impact of hydrocarbons on marine microbial communities
auteur
Christine Cagnon, Magalie Stauffert, Cristiana Cravo-Laureau, Marisol Goñi-Urriza, Sylvain Bordenave, S. Païssé, Pierre Caumette, Robert Duran
article
Ceccaldi HJ, Dekeyser, I., Girault, M., Stora, G. Global Change: Mankind-Marine Environment Interactions, Springer, pp.335-339, 2011, ISBN 978-90-481-8630-3
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titre
Biodiversité et fonctionnement des écosystèmes microbiens
auteur
Philippe Normand, Robert Duran, Xavier Le Roux, Cindy E. Morris, Jean-Christophe Poggiale
article
Ecologie Microbienne : Microbiologie des milieux naturels et anthropisés, Presses Universitaires de Pau et des Pays de l'Adour, 1004 p., 2011, 2-35311-022-3 9782353110223
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titre
Hydrocarbon degradation in coastal muddy areas and anoxic ecosystems (DHYVA project): Role of bacterial mechanisms and bioturbation effects on the biodisponibility of organic pollutants
auteur
Magalie Stauffert, Lionel Huang, Isabelle Vitte, Ronan Jézéquel, Cristiana Cravo-Laureau, Georges Stora, C. Pecheyran, Christine Cagnon, Franck Gilbert, Marisol Goñi-Urriza, François-Xavier Merlin, David Amouroux, Philippe Cuny, Robert Duran
article
Ceccaldi, H.-J., Dekeyser, I., Girault, M., Stora, G. Global Change: Mankind-Marine Environment Interactions, Springer, pp.393-395, 2011, ISBN 978-90-481-8630-3
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2010

Conference papers

titre
Bioréduction du fer : produits secondaires et mobilité des éléments associés ‘BIOREFE
auteur
Aline Dia, Mélanie Davranche, G. Morin, Béatrice Lauga, Georges Ona-Nguema, Mathieu Pédrot, Robert Duran, Bernd Nowack, Patrice Petitjean, Odile Hénin, Ange Le Boudec, S. Martin, Gérard Gruau
article
Colloque de restitution EC2CO, CNRS, Nov 2010, Toulouse, France
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titre
Rôle de la diversité microbienne dans la dégradation des hydrocarbures présents dans des boues industrielles et urbaines (DIVERDHY)
auteur
Cristiana Cravo-Laureau, Guillermina Hernandez Raquet, Isabelle Vitte, Virginie Bellet, Jean-Jacques Godon, Pierre Caumette, Patrick Balaguer, Robert Duran
article
Colloque de restitution du programme EC2CO (Écosphère Continentale et Côtière), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS). FRA., Nov 2010, Toulouse, France
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titre
Bioindicators for the assessment of side effects of pesticides on soil biological status: report of a collaborative study conducted for the french ministry of the environment
auteur
Fabrice Martin-Laurent, Robert Duran, Vivienne Gianinazzi-Pearson, Pascal Guilbaut, Beatrice Lauga, Corinne Leyval, Laurent Philippot, Facundo Rivera-Becerril, Xavier Salducci, Guy Soulas
article
6. European Conference on Pesticides and Related Organic Micropolluants in the Environment, Sep 2010, Matera, Italy
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https://hal.inrae.fr/hal-02757675/file/34695_20110831114801248_1.pdf BibTex

2008

Journal articles

titre
Diversity of ring-hydroxylating dioxygenases in pristine and oil contaminated microbial mats at genomic and transcriptomic levels
auteur
S. Bordenave, M. Goñi-Urriza, C. Vilette, S. Blanchard, Pierre Caumette, Robert Duran
article
Environmental Microbiology, Society for Applied Microbiology and Wiley-Blackwell, 2008, 10 (12), pp.3201-3211. ⟨10.1111/j.1462-2920.2008.01707.x⟩
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2007

Journal articles

titre
Seasonal and diel distributions of denitrifying and bacterial communities in a hypersaline microbial mat (Camargue, France)
auteur
Christelle Desnues, Valérie Michotey, Andrea Wieland, Cui Zhizang, Aude Fourçans, Robert Duran, Patricia Bonin
article
Water Research, IWA Publishing, 2007, 41, pp.3407-3419
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titre
Rhodobium pfennigii sp. nov., a phototrophic purple non-sulfur bacterium with unusual bacteriochlorophyll a antennae, isolated from a brackish microbial mat on Rangiroa atoll, French Polynesia
auteur
Pierre Caumette, R. Guyoneaud, Robert Duran, Cristiana Cravo-Laureau, R. Matheron
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2007, 57 (6), pp.1250-1255. ⟨10.1099/ijs.0.64775-0⟩
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titre
Bacterial community structure along the Adour estuary (French Atlantic coast): Influence of salinity gradient versus metal contamination
auteur
M.S. Goñi-Urriza, David Point, David Amouroux, Rémy Guyoneaud, O.F.X. Donard, Pierre Caumette, Robert Duran
article
Aquatic Microbial Ecology, Inter Research, 2007, 49 (1), pp.47-56. ⟨10.3354/ame01128⟩
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titre
Alkane biodegradation and dynamics of phylogenetic subgroups of sulfate-reducing bacteria in an anoxic coastal marine sediment artificially contaminated with oil
auteur
Gilles Miralles, Vincent Grossi, Monique Acquaviva, Robert Duran, Jean Claude Bertrand, Philippe Cuny
article
Chemosphere, Elsevier, 2007, 68, pp.1327-1334. ⟨10.1016/j.chemosphere.2007.01.033⟩
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titre
Effects of heavy fuel oil on the bacterial community structure of a pristine microbial mat
auteur
S. Bordenave, M.S. Goñi-Urriza, Pierre Caumette, Robert Duran
article
Applied and Environmental Microbiology, American Society for Microbiology, 2007, 73 (19), pp.6089-6097. ⟨10.1128/AEM.01352-07⟩
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2004

Journal articles

titre
Structure and functional analyses of bacterial communities changes in microbial mats following petroleum exposure
auteur
S. Bordenave, A. Fourçans, S. Blanchard, Marisol Goñi, Pierre Caumette, Robert Duran
article
Ophelia, Taylor & Francis, 2004, 58 (3), pp.195-203. ⟨10.1080/00785236.2004.10410227⟩
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Conference papers

titre
Mercury transformation by anaerobic bacterial communities selected from estuarine sediments
auteur
Marisol Goñi, M Dias, Mathilde Monperrus, J.C. Salvado, David Amouroux, Robert Duran, O.F.X. Donard, Pierre Caumette, Remy Guyoneaud
article
7th International Conference on mercury as a global pollutant, Jun 2004, Ljubjana, Slovenia. pp.1006-1009
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2003

Journal articles

titre
Monitoring bacterial communities adaptation to mercury contamination in estuarine sediments maintained in slurries
auteur
Robert Duran, V. Menuet, Mathilde Monperrus, Rémy Guyoneaud, M.S. Goni, Emmanuel Tessier, David Amouroux, O.F.X. Donard, Pierre Caumette
article
Journal de Physique IV Proceedings, EDP Sciences, 2003, 107 (I), pp.393-396
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titre
Mercury methylation rates in coastal sediments versus microbial diversity and specific activity
auteur
Mathilde Monperrus, Rémy Guyoneaud, Emmanuel Tessier, Robert Duran, M. Goni, David Amouroux, O.F.X. Donard, Pierre Caumette
article
Journal de Physique IV Proceedings, EDP Sciences, 2003, 107 (II), pp.883-886
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