2024

Journal articles

titre

Complete genome of the Medicago anthracnose fungus, Colletotrichum destructivum, reveals a mini-chromosome-like region within a core chromosome

auteur

Nicolas Lapalu, Adeline Simon, Antoine Lu, Peter-Louis Plaumann, Joëlle Amselem, Sandrine Pigné, Annie Auger, Christian Koch, Jean-Félix Dallery, Richard J O'Connell

article

Microbial Genomics, 2024, 10 (8)

identifiant

hal-04683720

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titre

Quantitative pathogenicity and host adaptation in a fungal plant pathogen revealed by whole-genome sequencing

auteur

Reda Amezrou, Aurélie Ducasse, Jérôme Compain, Nicolas Lapalu, Anais Pitarch, Laetitia Dupont, Johann Confais, Henriette Goyeau, Gert H. J. Kema, Daniel Croll, Joëlle Amselem, Andrea Sanchez-Vallet, Thierry C Marcel

article

Nature Communications, 2024, 15 (1), pp.1933. ⟨10.1038/s41467-024-46191-1⟩

identifiant

hal-04498577

DOI

DOI : 10.1038/s41467-024-46191-1

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Poster communications

titre

Establishment of pangenome graphs for the analysis and monitoring of fungal plant pathogen populations

auteur

Nicolas Lapalu, Antoine Loth, Fabrice Legeai, Ludovic Duvaux, Elisabeth Fournier, Pierre Gladieux, Alice Feurtey, Cécile Lorrain, Marc-Henri Lebrun, Anne Genissel, Thierry C Marcel

article

ISCLB 2024 (International Symposium on Cereal Leaf Blights), Jun 2024, Zurich (CH), Switzerland. ⟨10.15454/1.5572369328961167E12⟩

identifiant

hal-04623680

DOI

DOI : 10.15454/1.5572369328961167E12

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Preprints, Working Papers, ...

titre

Generation of diversity in the blue cheese moldPenicillium roquefortiand identification of pleiotropic QTL for key cheese-making phenotypes

auteur

Thibault Caron, Ewen Crequer, Mélanie Le Piver, Stéphanie Le Prieur, Sammy Brunel, Alodie Snirc, Gwennina Cueff, Daniel Roueyre, Michel Place, Christophe Chassard, Adeline Simon, Ricardo Rodriguez de la Vega, Monika Coton, Emmanuel Coton, Marie Foulongne-Oriol, Antoine Branca, Tatiana Giraud

article

2024

identifiant

hal-04728775

DOI

DOI : 10.1101/2024.02.22.581506

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titre

Improved gene annotation of the fungal wheat pathogen Zymoseptoria tritici based on combined Iso-Seq and RNA-Seq evidence

auteur

Nicolas Lapalu, Lucie Lamothe, Yohann Petit, Anne Genissel, Camille Delude, Alice Feurtey, Leen Abraham, Dan Smith, Robert King, Alison Renwick, Mélanie Appertet, Justine Sucher, Andrei Steindorff, Stephen Goodwin, Gert H.J. Kema, Igor Grigoriev, James Hane, Jason Rudd, Eva Stukenbrock, Daniel Croll, Gabriel Scalliet, Marc-Henri Lebrun

article

2024

identifiant

hal-04542681

DOI

DOI : 10.1101/2023.04.26.537486

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2023

Journal articles

titre

Complete genome of the Medicago anthracnose fungus, Colletotrichum destructivum , reveals a mini-chromosome-like region within a core chromosome

auteur

Nicolas Lapalu, Adeline Simon, Antoine Lu, Peter-Louis Plaumann, Joëlle Amselem, Sandrine Pigné, Annie Auger, Christian Koch, Jean-Félix Dallery, Richard O’connell

article

Microbial Genomics, 2023, 10 (8), ⟨10.1101/2023.12.16.571984⟩

identifiant

hal-04669685

DOI

DOI : 10.1101/2023.12.16.571984

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titre

Location and timing govern tripartite interactions of fungal phytopathogens and host in the stem canker species complex

auteur

Elise Gay, Noémie Jacques, Nicolas Lapalu, Corinne Cruaud, Valerie Laval, Marie-Hélène Balesdent, Thierry Rouxel

article

BMC Biology, 2023, 21 (1), pp.247. ⟨10.1186/s12915-023-01726-8⟩

identifiant

hal-04281614

DOI

DOI : 10.1186/s12915-023-01726-8

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titre

Complete Genome Sequences of Septoria linicola : A Resource for Studying a Damaging Flax Pathogen

auteur

Nicolas Lapalu, Adeline Simon, Boris Demenou, Delphine Paumier, Marie-Pierre Guillot, Lilian Gout, Frederic Suffert, Romain Valade

article

Molecular Plant-Microbe Interactions, 2023, 36 (1), pp.59-63. ⟨10.1094/MPMI-09-22-0185-A⟩

identifiant

hal-03920575

DOI

DOI : 10.1094/MPMI-09-22-0185-A

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titre

A secreted protease-like protein in Zymoseptoria tritici is responsible for avirulence on Stb9 resistance gene in wheat

auteur

Reda Amezrou, Colette Audéon, Jérôme Compain, Sandrine Gélisse, Aurélie Ducasse, Cyrille Saintenac, Nicolas Lapalu, Clémentine Louet, Simon Orford, Daniel Croll, Joëlle Amselem, Sabine Fillinger, Thierry Marcel

article

PLoS Pathogens, 2023, 19 (5), pp.e1011376. ⟨10.1371/journal.ppat.1011376⟩

identifiant

hal-04102220

DOI

DOI : 10.1371/journal.ppat.1011376

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titre

Quantitative and qualitative plant-pathogen interactions call upon similar pathogenicity genes with a spectrum of effects

auteur

Camilla Langlands-Perry, Anaïs Pitarch, Nicolas Lapalu, Murielle Cuenin, Christophe Bergez, Alicia Noly, Reda Amezrou, Sandrine Gélisse, Célia Barrachina, Hugues Parrinello, Frédéric Suffert, Romain Valade, Thierry Marcel

article

Frontiers in Plant Science, 2023, 14, pp.1128546. ⟨10.3389/fpls.2023.1128546⟩

identifiant

hal-04125786

DOI

DOI : 10.3389/fpls.2023.1128546

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titre

Nucleosome patterns in four plant pathogenic fungi with contrasted genome structures

auteur

Colin Clairet, Nicolas Lapalu, Adeline Simon, Jessica Soyer, Muriel Viaud, Enric Zehraoui, Berengère Dalmais, Isabelle Fudal, Nadia Ponts

article

Peer Community Journal, 2023, 3, pp.e13. ⟨10.24072/pcjournal.227⟩

identifiant

hal-04088414

DOI

DOI : 10.24072/pcjournal.227

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Conference papers

titre

Antagonistic pleiotropic effects reduce adaptation in a Major wheat pathogen

auteur

Reda Amezrou, Gwilherm Gazeau, Nicolas Lapalu, L. Meyer, Frédéric Suffert, Sabine Fillinger, Anne-Sophie Walker, Thierry C. Marcel

article

20th Reinhardsbrunn symposium on modern fungicides and andi-fungal compounds, DpG, Apr 2023, Friedrichroda, Germany

identifiant

hal-04286767

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titre

Antagonistic pleiotropic effects reduce adaptation in a major wheat pathogen

auteur

R. Amezrou, Gwilherm Gazeau, Nicolas Lapalu, L. Meyer, Frédéric Suffert, Sabine Fillinger, Anne-Sophie Walker, Thierry C. Marcel

article

20th International Reinhardsbrunn symposium on modern fungicides and antifungal compounds, Apr 2023, Frierichroda, Germany

identifiant

hal-04314029

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titre

Of the fungal wheat pathogen Zymoseptoria tritici using ISO-SEQ and RNA-SEQ DATA

auteur

Marc-Henri Lebrun, Nicolas Lapalu, Lucie Lamothe, Yohann Petit, Scalliet Gabriel

article

16TH EUROPEAN CONFERENCE ON FUNGAL GENETICS, Susanne Zeilinger-Migsich; Hubertus Haas, Mar 2023, Innsbruck, Austria. pp.625

identifiant

hal-04102741

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2022

Journal articles

titre

Botrytis cinerea strains infecting grapevine and tomato display contrasted repertoires of accessory chromosomes, transposons and small RNAs

auteur

Adeline Simon, Alex Mercier, Pierre P. Gladieux, Benoît Poinssot, Anne-Sophie Walker, Muriel Viaud

article

Peer Community Journal, 2022, 2, pp.e83. ⟨10.24072/pcjournal.211⟩

identifiant

hal-03910388

DOI

DOI : 10.24072/pcjournal.211

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Conference papers

titre

Botrytis cinerea strains infecting grapevine and tomato display contrasted repertoires of accessory chromosomes, transposons and small RNAs

auteur

Adeline Simon, Alex Mercier, Pierre P. Gladieux, Benoit Poinssot, Anne-Sophie Walker, Muriel Viaud

article

1st Joint Botrytis-Sclerotinia Symposium, Jul 2022, Avignon, France

identifiant

hal-04084480

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titre

Antagonistic pleiotropic effecs reduce adaptation in a major wheat pathogen

auteur

R. Amezrou, Gwilherm Gazeau, Nicolas Lapalu, Frédéric Suffert, Sabine Fillinger, Anne-Sophie Walker, Thierry C. Marcel

article

International symposium on cereal leaf blights, May 2022, Gammarth, Tunisia

identifiant

hal-04312259

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Poster communications

titre

Fungal small RNAs: are they involved into host specialization?

auteur

Antoine Porquier, Adeline Simon, Anne-Sophie Walker, Benoit Poinssot, Muriel Viaud

article

JJC2022 - 13ème Rencontres de phytopathologie & mycologie, Sep 2022, Aussois, France

identifiant

hal-04283879

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2021

Journal articles

titre

Genome-wide mapping of histone modifications during axenic growth in two species of Leptosphaeria maculans showing contrasting genomic organization

auteur

Jessica Soyer, Colin Clairet, Elise Gay, Nicolas Lapalu, Thierry Rouxel, Eva Stukenbrock, Isabelle Fudal

article

Chromosome Research, 2021, 29 (2), pp.219-236. ⟨10.1007/s10577-021-09658-1⟩

identifiant

hal-03266749

DOI

DOI : 10.1007/s10577-021-09658-1

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titre

Large-scale transcriptomics to dissect 2 years of the life of a fungal phytopathogen interacting with its host plant

auteur

Elise J Gay, Jessica L Soyer, Nicolas Lapalu, Juliette Linglin, Isabelle Fudal, Corinne da Silva, Patrick Wincker, Jean-Marc Aury, Corinne Cruaud, Anne Levrel, Jocelyne Lemoine, Régine Delourme, Thierry Rouxel, Marie-Hélène Balesdent

article

BMC Biology, 2021, 19 (1), pp.e041118. ⟨10.1186/s12915-021-00989-3⟩

identifiant

hal-03190704

DOI

DOI : 10.1186/s12915-021-00989-3

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titre

Population genomics reveals molecular determinants of specialization to tomato in the polyphagous fungal pathogen Botrytis cinerea in France

auteur

Alex Mercier, Adeline Simon, Nicolas Lapalu, Tatiana E Giraud, Marc Bardin, Anne-Sophie Walker, Muriel Viaud, Pierre Gladieux

article

Phytopathology, 2021, 111, pp.2355-2366. ⟨10.1094/PHYTO-07-20-0302-FI⟩

identifiant

hal-03197705

DOI

DOI : 10.1094/PHYTO-07-20-0302-FI

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titre

Identification of Copper-Containing Oxidoreductases in the Secretomes of Three Colletotrichum Species with a Focus on Copper Radical Oxidases for the Biocatalytic Production of Fatty Aldehydes

auteur

David Ribeaucourt, Safwan Saker, David Navarro, Bastien Bissaro, Elodie Drula, Lydie Oliveira Correia, Mireille Haon, Sacha Grisel, Nicolas Lapalu, Bernard Henrissat, Richard O'Connell, Fanny Lambert, Mickaël Lafond, Jean-Guy Berrin

article

Applied and Environmental Microbiology, 2021, 87 (24), pp.e01526-21. ⟨10.1128/AEM.01526-21⟩

identifiant

hal-03619439

DOI

DOI : 10.1128/AEM.01526-21

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Conference papers

titre

Identification of the determinants involved in the adaptation of Leptosphaeria maculans to different Brassica species

auteur

Julie Noah, Mathilde Gorse, Nicolas Lapalu, Thierry Rouxel, Marie-Hélène Balesdent, Jessica L Soyer

article

Fungal Genetics IDF Symposium, Nov 2021, Paris, France

identifiant

hal-04230215

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Preprints, Working Papers, ...

titre

Nucleosome patterns in four plant pathogenic fungi with contrasted genome structures

auteur

Colin Clairet, Nicolas Lapalu, Adeline Simon, Jessica Soyer, Muriel Viaud, Enric Zehraoui, Berengère Dalmais, Isabelle Fudal, Nadia Ponts

article

2021

identifiant

hal-03324321

DOI

DOI : 10.1101/2021.04.16.439968

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2020

Journal articles

titre

pH effect on strain-specific transcriptomes of the take-all fungus

auteur

Kévin Gazengel, Lionel Lebreton, Nicolas Lapalu, Joëlle Amselem, Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt, Denis Tagu, Stéphanie Daval

article

PLoS ONE, 2020, 15 (7), pp.e0236429. ⟨10.1371/journal.pone.0236429⟩

identifiant

hal-02979591

DOI

DOI : 10.1371/journal.pone.0236429

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titre

Comparative quantitative proteomics of osmotic signal transduction mutants in Botrytis cinerea explain mutant phenotypes and highlight interaction with cAMP and Ca2+ signalling pathways” [J Proteomics. 2020 Feb 10; 212: 103580]

auteur

Jaafar Kilani, Marlene Davanture, Adeline Simon, Michel Zivy, Sabine Fillinger

article

Journal of Proteomics, 2020, 222, ⟨10.1016/j.jprot.2020.103733⟩

identifiant

hal-02907972

DOI

DOI : 10.1016/j.jprot.2020.103733

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titre

Comparative quantitative proteomics of osmotic signal transduction mutants in Botrytis cinerea explain mutant phenotypes and highlight interaction with cAMP and Ca2+ signalling pathways

auteur

Jaafar Kilani, Marlène Davanture, Adeline Simon, Michel Zivy, Sabine Fillinger

article

Journal of Proteomics, 2020, 212 (103580), pp.103580. ⟨10.1016/j.jprot.2019.103580⟩

identifiant

hal-02390794

DOI

DOI : 10.1016/j.jprot.2019.103580

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Conference papers

titre

Cloning of AvrStb9, a gene of Zymoseptoria tritici conferring avirulence on wheat cultivars carrying the Stb9 resistance gene

auteur

Thierry Marcel, Colette Audéon, Jérôme Compain, Gélisse Sandrine, Aurélie Ducasse, Sophie Bouchet, Cyrille Saintenac, Nicolas Lapalu, Daniel Croll, Joëlle Amselem, Sabine Fillinger

article

ECFG15 - 15th European conference on fungal genetics, ECFG15, Feb 2020, Rome, Italy. pp.340-341

identifiant

hal-04273732

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Poster communications

titre

Could small interfering RNA be involved in host specialization in the grey mould fungus Botrytis cinerea?

auteur

Adeline Simon, Alex Mercier, Guillaume Morgant, Pierre Gladieux, Anne-Sophie Walker, Benoit Poinssot, Muriel Viaud

article

ECFG15 European conference on fungal genetics, Feb 2020, Rome, Italy. p.310

identifiant

hal-04275453

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2019

Journal articles

titre

Botcinic acid biosynthesis in Botrytis cinerea relies on a subtelomeric gene cluster surrounded by relics of transposons and is regulated by the Zn(2)Cys(6) transcription factor BcBoa13

auteur

Antoine Porquier, Javier Moraga, Guillaume Morgant, Berengere Dalmais, Adeline Simon, Hind Sghyer, Isidro G. Collado, Muriel Viaud

article

Current Genetics, 2019, 65 (4), pp.965 - 980. ⟨10.1007/s00294-019-00952-4⟩

identifiant

hal-02625547

DOI

DOI : 10.1007/s00294-019-00952-4

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titre

A Similar Secretome Disturbance as a Hallmark of Non-pathogenic Botrytis cinerea ATMT-Mutants?

auteur

Amélie de Vallée, Pascal Bally, Christophe Bruel, Lucie Chandat, Mathias Choquer, Cindy Dieryckx, Jean William Dupuy, Sophie Kaiser, Marie-Pascale Latorse, Elise Loisel, Géraldine Mey, Guillaume Morgant, Christine Rascle, Julia Schumacher, Adeline Simon, Eytham Souibgui, Muriel Viaud, François Villalba, Nathalie Poussereau

article

Frontiers in Microbiology, 2019, 10, pp.2829. ⟨10.3389/fmicb.2019.02829⟩

identifiant

hal-02401466

DOI

DOI : 10.3389/fmicb.2019.02829

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Poster communications

titre

Investigating the involvement of the chromatin state in the control of gene expression in Leptospharia maculans

auteur

Colin Clairet, Jessica L. Soyer, Elise Gay, Nicolas Lapalu, Adeline Simon, Francoise Blaise, Eva H Stukenbrock, Isabelle Fudal

article

Fungal Genetics Conference, Mar 2019, Asiomar, United States

identifiant

hal-04456403

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titre

Population structure and host specialization in Botrytis cinerea

auteur

Alex Mercier, Marguerite Cuel, Jean-Marc Pradier, Adeline Simon, Muriel Viaud, Anne-Sophie Walker, Pierre Gladieux

article

30. Fungal Genetics Conference, Mar 2019, Asilomar, United States. , 2019

identifiant

hal-02786283

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2018

Journal articles

titre

Subcellular Localization Screening of Colletotrichum higginsianum Effector Candidates Identifies Fungal Proteins Targeted to Plant Peroxisomes, Golgi Bodies, and Microtubules

auteur

Guillaume Robin, Jochen Kleemann, Ulla Neumann, Lisa Cabre, Jean-Felix Dallery, Nicolas Lapalu, Richard O'Connell

article

Frontiers in Plant Science, 2018, 9, ⟨10.3389/fpls.2018.00562⟩

identifiant

hal-02622767

DOI

DOI : 10.3389/fpls.2018.00562

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titre

De novo assembly and annotation of three Leptosphaeria genomes using Oxford Nanopore MinION sequencing

auteur

Fabien Dutreux, Corinne da Silva, Léo d'Agata, Arnaud Couloux, Elise Gay, Benjamin Istace, Nicolas Lapalu, Arnaud Lemainque, Juliette Linglin, Benjamin Noel, Patrick Wincker, Corinne Cruaud, Thierry Rouxel, Marie-Helene Balesdent, Jean-Marc Aury

article

Scientific Data , 2018, 5 (180235), 11 p. ⟨10.1038/sdata.2018.235⟩

identifiant

hal-02621276

DOI

DOI : 10.1038/sdata.2018.235

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titre

Biosynthesis of abscisic acid in fungi: identification of a sesquiterpene cyclase as the key enzyme in Botrytis cinerea

auteur

Inmaculada Izquierdo-Bueno, Victoria E. Gonzalez-Rodriguez, Adeline Simon, Berengere Dalmais, Jean-Marc Pradier, Pascal Le Pecheur, Alex Mercier, Anne-Sophie Walker, Carlos Garrido, Isidro Gonzalez Collado, Muriel Viaud

article

Environmental Microbiology, 2018, 20 (7), pp.2469 - 2482. ⟨10.1111/1462-2920.14258⟩

identifiant

hal-02623632

DOI

DOI : 10.1111/1462-2920.14258

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Conference papers

titre

Investigating the involvement of histone modifications in the control of effector gene expression in Leptospharia maculans, the fungus causing stem canker of oilseed rape

auteur

Jessica L Soyer, Isabelle Fudal, Colin Clairet, Nicolas Lapalu, Adeline Simon, Francoise Blaise, Eva H. Stukenbrock

article

21th Crucifer Genetics Conference, Jul 2018, saint-Malo, France

identifiant

hal-02786161

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titre

Population structure and host specialization in Botrytis cinerea

auteur

Alex Mercier, Adeline Simon, Clémentine Duplaix, Marguerite Cuel, Jean-Marc Pradier, Muriel Viaud, Pierre Gladieux, Anne-Sophie Walker

article

Journées Jean Chevauchon JJC2018 - 12èmes Rencontres de Phytopathologie & Mycologie,, Jan 2018, Aussois, France. p.19

identifiant

hal-02785894

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titre

Analyse de l'interaction entre les membres d'un complexe d'espèces pathogènes du colza (Leptosphaeria maculans et L.biglobosa) par une approche transcriptomique

auteur

Elise Gay, Marie-Helene Balesdent, Thierry Rouxel, Nicolas Lapalu, Juliette Linglin, Fabien Dutreux, Jean-Philippe Vernadet

article

Journées Jean Chevauchon JJC2018 - 12èmes Rencontres de Phytopathologie & Mycologie,, Jan 2018, Aussois, France. p.40

identifiant

hal-02790241

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titre

Investigating the involvement of the chromatin state in the control of effector gene expression in Leptosphaeria maculans

auteur

Colin Clairet, Jessica L. Soyer, Nicolas Lapalu, Adeline Simon, Francoise Blaise, Julie Gervais, Eva H. Stukenbrock, Isabelle Fudal

article

Journées Jean Chevauchon JJC2018 - 12èmes Rencontres de Phytopathologie & Mycologie,, Jan 2018, Aussois, France. p.14

identifiant

hal-02785896

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titre

Pathway-specific regulation of the botcinic acid biosynthetic gene cluster in the grey mould fungus Botrytis cinerea

auteur

Antoine Porquier, Berengere Dalmais, Guillaume Morgant, Javier Moraga, Adeline Simon, Hind Sghyer, Jean-Marc Pradier, Isidro Gonzalez Collado, Muriel Viaud

article

14th european conference on fungal genetics, 2018, Haifa, Israel

identifiant

hal-02786284

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Poster communications

titre

Insights into chromosome structure, transposable elements and secondary metabolite gene clusters from the complete genome sequence of Colletotrichum higginsianum

auteur

Jean-Félix Dallery, Nicolas Lapalu, M.R. Thon, Richard O'Connell

article

ECFG14 European conference on fungal genetics, Feb 2018, Haifa, Israel

identifiant

hal-04282959

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2017

Journal articles

titre

Gapless genome assembly of Colletotrichum higginsianum reveals chromosome structure and association of transposable elements with secondary metabolite gene clusters

auteur

Jean-Félix Dallery, Nicolas Lapalu, Antonios Zampounis, Sandrine Pigné, Isabelle Luyten, Joëlle Amselem, Alexander Wittenberg, Shiguo Zhou, Marisa de Queiroz, Guillaume Robin, Annie Auger, Matthieu Hainaut, Bernard Henrissat, Ki-Tae Kim, Yong-Hwan Lee, Olivier Lespinet, David Schwartz, Michael Thon, Richard O'Connell

article

BMC Genomics, 2017, 18 (1), pp.667. ⟨10.1186/s12864-017-4083-x⟩

identifiant

hal-04011133

DOI

DOI : 10.1186/s12864-017-4083-x

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titre

A small secreted protein in Zymoseptoria tritici is responsible for avirulence on wheat cultivars carrying the Stb6 resistance gene

auteur

Ziming Zhong, Thierry Marcel, Fanny E. Hartmann, Xin Ma, Clémence Plissonneau, Marcello Zala, Aurélie Ducasse, Johann Confais, Romain Compain, Nicolas Lapalu, Joëlle Amselem, Bruce A. Mcdonald, Daniel Croll, Javier Palma-Guerrero

article

New Phytologist, 2017, 214 (2), pp.619 - 631. ⟨10.1111/nph.14434⟩

identifiant

hal-01530838

DOI

DOI : 10.1111/nph.14434

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titre

Regulation of conidiation in Botrytis cinerea involves the light-responsive transcriptional regulators BcLTF3 and BcREG1

auteur

Beate Brandhoff, Adeline Simon, Anne Dornieden, Julia Schumacher

article

Current Genetics, 2017, 63 (5), pp.931 - 949. ⟨10.1007/s00294-017-0692-9⟩

identifiant

hal-02624458

DOI

DOI : 10.1007/s00294-017-0692-9

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titre

Gapless genome assembly of Colletotrichum higginsianum reveals chromosome structure and association of transposable elements with secondary metabolite gene clusters

auteur

Jean-Felix Dallery, Nicolas Lapalu, Antonios Zampounis, Sandrine Pigné, Isabelle Luyten, Joelle Amselem, Alexander H. J. Wittenberg, Shiguo Zhou, Marisa V. de Queiroz, Guillaume Robin, Annie Auger, Matthieu Hainaut, Bernard Henrissat, Ki-Tae Kim, Yong-Hwan Lee, Olivier Lespinet, David C. Schwartz, Michael R. Thon, Richard O'Connell

article

BMC Genomics, 2017, 18, ⟨10.1186/s12864-017-4083-x⟩

identifiant

hal-01608503

DOI

DOI : 10.1186/s12864-017-4083-x

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Conference papers

titre

Regulation of the biosynthesis of phytotoxic secondary metabolites in the grey mould fungus Botrytis cinerea

auteur

Antoine Porquier, Berengere Dalmais, Adeline Simon, Javier Moraga, Jean-Marc Pradier, Pascal Le Pecheur, Isidro Collado, Muriel Viaud

article

9. Congrès National de la Société Française de Microbiologie, Oct 2017, Paris, France

identifiant

hal-02785791

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titre

Light-induced gene expression in Botrytis cinerea involves GATA-transcription factors and the stress-activated MAP kinase module.

auteur

Julia Schumacher, Kim C. Cohrs, Adeline Simon, Jaafar Kilani, Muriel Viaud, Sabine Fillinger

article

29. Fungal genetics conference Asilomar 17, Mar 2017, Pacific Grove CA, United States. p.196

identifiant

hal-01530812

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titre

A first glimpse into the genetic architecture of pathogenicity of Zymoseptoria tritici on bread wheat

auteur

Thierry Marcel, Aurélie Ducasse, Jérome Compain, Nicolas Lapalu, Z Chang Zhong Chen, Fanny E. Hartmann, Johann Confais, Henriette Goyeau, J. Palma-Guerrero, G.H.J. Kema, Joëlle Amselem, Daniel Croll

article

29. Fungal genetics conference Asilomar 17, Mar 2017, Pacific Grove, CA, United States. p.246

identifiant

hal-01530825

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Book sections

titre

Mining plant genomic and genetic data using the GnpIS information system

auteur

Anne-Francoise Adam-Blondon, Michael Alaux, Sophie Durand, Thomas Letellier, Guillaume Merceron, Nacer Mohellibi, Cyril Pommier, Delphine Steinbach, Françoise Alfama-Depauw, Joëlle Amselem, Dorothée Charruaud, Nathalie Choisne, Raphaël-Gauthier Flores, Claire Guerche, Véronique Jamilloux, Erik Kimmel, Nicolas Lapalu, Mikaël Loaec, Célia Michotey, Hadi Quesneville

article

Aalt D.J van Dijk. Plant Genomics Databases. Methods and Protocols, 1533, Springer, 2017, Methods in Molecular Biology, 978-1-4939-6658-5. ⟨10.1007/978-1-4939-6658-5_5⟩

identifiant

hal-03206731

DOI

DOI : 10.1007/978-1-4939-6658-5_5

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Poster communications

titre

Investigating the involvement of the chromatin state in the control of effector gene expression in Leptospharia maculans

auteur

Colin Clairet, Nicolas Lapalu, Adeline Simon, Francoise Blaise, Julie Gervais, Jessica L. Soyer, Isabelle Fudal

article

40th New Phytologist Symposium, Sep 2017, Vienne, Austria. 2017

identifiant

hal-02786095

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titre

Population structure and host specialization in Botrytis cinerea

auteur

Anne-Sophie Walker, Alex Mercier, Marguerite Cuel, Jean-Marc Pradier, Adeline Simon, Muriel Viaud, Pierre Gladieux

article

10. French Society for Plant Pathology (SFP), May 2017, Dunkerque, Malo-les-Bains, France. , 236 p., 2017, Deepen Knowledge in Plant Pathology for Innovative Agro-Ecology : Book of Abstracts

identifiant

hal-01603401

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Population structure and host specialization in Botrytis cinerea

auteur

Anne-Sophie Walker, A. Mercier, M. Cuel, Jean Marc Pradier, Adeline Simon, Muriel Viaud, P. Gladieux

article

10th French society for plant pathology conference, May 2017, Dunkerque, France.

identifiant

hal-04289673

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2016

Journal articles

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The botrydial biosynthetic gene cluster of Botrytis cinerea displays a bipartite genomic structure and is positively regulated by the putative Zn(II)(2)Cys(6) transcription factor BcBot6

auteur

Antoine Porquier, Guillaume Morgant, Javier Moraga, Berengere Dalmais, Isabelle Luyten, Adeline Simon, Jean-Marc Pradier, Joëlle Amselem, Isidro Gonzalez Collado, Muriel Viaud

article

Fungal Genetics and Biology, 2016, 96 (Nov 2016), pp.33-46. ⟨10.1016/j.fgb.2016.10.003⟩

identifiant

hal-01532622

DOI

DOI : 10.1016/j.fgb.2016.10.003

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Light governs asexual differentiation in the grey mould fungusBotrytis cinereavia the putative transcription factor BcLTF2

auteur

Kim C. Cohrs, Adeline Simon, Muriel Viaud, Julia Schumacher

article

Environmental Microbiology, 2016, ⟨10.1111/1462-2920.13431⟩

identifiant

hal-01531675

DOI

DOI : 10.1111/1462-2920.13431

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titre

A novel Zn(2)Cys(6) transcription factor BcGaaR regulates D-galacturonic acid utilization in Botrytis cinerea

auteur

Lisha Zhang, Ronnie J. M. Lubbers, Adeline Simon, Joost H. M. Stassen, Pablo R. Vargas Ribera, Muriel Viaud, Jan A. L. van Kan

article

Molecular Microbiology, 2016, 100 (2), pp.247 - 262. ⟨10.1111/mmi.13314⟩

identifiant

hal-02641464

DOI

DOI : 10.1111/mmi.13314

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Conference papers

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A network of light-responsive transcription factors regulates asexual differentiation n Botrytis cinerea

auteur

Kim C. Cohrs, Beate Brandhoff, Adeline Simon, Muriel Viaud, Julia Schumacher

article

XVII International Botrytis Symposium, Oct 2016, Sana Cruz, Chile. p. 32

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hal-01532613

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Looking through the eyes of Botrytis:Molecular genetics of photoperception and its consequences

auteur

Kim C. Cohrs, Adeline Simon, Muriel Viaud, Julia Schumacher

article

XVII International Botrytis Symposium, Oct 2016, Santa Cruz, Chile. p.22

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hal-01532612

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The botrydial (BOT) and botcinic acid (BOA) biosynthetic gene clusters dispolay a bipartite genomic structure and are controlled by putatiave pathway-specific ZN(II)2CYS6 Transcription factors

auteur

Antoine Porquier, Guillaume Morgant, J. Moraga, Berengere Dalmais, Isabelle Luyten, Adeline Simon, Hind Sghyer, Jean-Marc Pradier, Pascal Le Pecheur, Joëlle Amselem, Isidro G Collado, Muriel Viaud

article

XVII International Botrytis Symposium, Oct 2016, Santa Cruz, Chile. p.49

identifiant

hal-01532615

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Poster communications

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Population structure and host specialization in Botrytis cinerea

auteur

Anne-Sophie Walker, Alex Mercier, Marguerite Cuel, Jean-Marc Pradier, Adeline Simon, Muriel Viaud, Pierre Gladieux

article

17. International Botrytis Symposium, Oct 2016, Santa-Cruz, Chile. , 178 p., 2016, Abstract book : XVII International Botrytis Symposium

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hal-01532611

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