2016
Conference papers
- titre
- Modeling soil temperature to predict emergence
- auteur
- Etienne Claverie, Jérémie J. Lecoeur, Veronique Letort, Paul-Henry P.-H. Cournède
- article
- 2016 IEEE International Conference on Functional-Structural Plant Growth Modeling, Simulation, Visualization and Applications (FSPMA), Nov 2016, Qingdao, China. ⟨10.1109/FSPMA.2016.7818285⟩
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-
2015
Journal articles
- titre
- A Regularized Particle Filter EM Algorithm Based on Gaussian Randomization with an Application to Plant Growth Modeling
- auteur
- Yuting Chen, Samis Trevezas, Paul-Henry Cournède
- article
- Methodology and Computing in Applied Probability, 2015, 17 (4), pp.847-870. ⟨10.1007/s11009-015-9440-0⟩
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-
- titre
- A nonlinear mixed effects model of plant growth and estimation via stochastic variants of the EM algorithm.
- auteur
- Charlotte Baey, Samis Trevezas, Paul-Henry Cournède
- article
- Communications in Statistics - Theory and Methods, 2015, pp.00. ⟨10.1080/03610926.2014.930909⟩
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-
- titre
- Modeling spatial competition for light in plant populations with the porous medium equation
- auteur
- Robert Beyer, Octave Etard, Paul-Henry P.-H. Cournède, Pascal Laurent-Gengoux
- article
- Journal of Mathematical Biology, 2015, 70 (3), pp.533-547. ⟨10.1007/s00285-014-0763-1⟩
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-
- titre
- Interaction of Vaccination and Reduction of Antibiotic Use Drives Unexpected Increase of Pneumococcal Meningitis
- auteur
- Matthieu Domenech de Cellès, Margarita Pons-Salort, Emmanuelle Varon, Marie-Anne Vibet, Caroline Ligier, Véronique Letort, Lulla Opatowski, Didier Guillemot
- article
- Scientific Reports, 2015, 5, pp.11293. ⟨10.1038/srep11293⟩
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-
Conference papers
- titre
- Autonomous learning of parameters in differential equations
- auteur
- Adel Mezine, Artémis Llamosi, Véronique Letort, Michèle Sebag, Florence d'Alché-Buc
- article
- 32nd International Conference on Machine Learning (ICML) - AutoML workshop, Jul 2015, Lille, France
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-
- titre
- A Comparison of a Generic MCMC-Based Algorithm for Bayesian Estimation in C++, R and Julia. Application to Plant Growth Modeling
- auteur
- Gautier Viaud, Yuting Chen, Benoît Bayol, Paul-Henry Cournède
- article
- 2015 Spring Simulation Multi-Conference The Society for Modeling & Simulation International, Apr 2015, Alexandria, United States
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-
- titre
- WIP - Promoting good modeling practice with a domain-specific language and statistical algorithms designed for parallel computing
- auteur
- Benoît Bayol, Yuting Chen, Charlotte Baey, Gautier Viaud, Paul-Henry P.-H. Cournède
- article
- DEVS '15: Proceedings of the Symposium on Theory of Modeling & Simulation: DEVS Integrative M&S Symposium, Apr 2015, San Diego, United States
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-
2014
Journal articles
- titre
- A comprehensive methodology of global sensitivity analysis for complex mechanistic models with an application to plant growth
- auteur
- Qiongli Wu, Paul-Henry Cournède
- article
- Ecological Complexity, 2014, 20, pp.219-232. ⟨10.1016/j.ecocom.2013.12.005⟩
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-
- titre
- Parameter estimation via stochastic variants of the ECM algorithm with applications to plant growth modeling
- auteur
- Samis Trevezas, Sonia Malefaki, Paul-Henry P.-H. Cournède
- article
- Computational Statistics and Data Analysis, 2014, 78, pp.82-99. ⟨10.1016/j.csda.2014.04.004⟩
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-
- titre
- A Symbolic Method to Analyse Patterns in Plant Structure
- auteur
- Cedric Loi, Paul-Henry P.-H. Cournède, Jean Françon
- article
- Combinatorics, Probability and Computing, 2014, 23 (5), pp.842-860. ⟨10.1017/S0963548314000108⟩
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-
- titre
- Modeling tree crown dynamics with 3D partial differential equations
- auteur
- Robert Beyer, Véronique Letort, Paul-Henry Cournède
- article
- Frontiers in Plant Science, 2014, 5, pp.329. ⟨10.3389/fpls.2014.00329⟩
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-
- titre
- Insights into Persistence Mechanisms of a Zoonotic Virus in Bat Colonies Using a Multispecies Metapopulation Model
- auteur
- Margarita Pons-Salort, Jordi Serra-Cobo, Flora Jay, Marc Ló Pez-Roig, Rachel Lavenir, Didier Guillemot, Véronique Letort, Hervé Bourhy, Lulla Opatowski
- article
- PLoS ONE, 2014, 9 (4), pp.e95610. ⟨10.1371/journal.pone.0095610⟩
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-
- titre
- Sunlab: a Functional-Structural Model for Genotypic and Phenotypic Characterization of the Sunflower Crop
- auteur
- Fenni Kang, Paul-Henry Cournede, Jeremie Lecoeur, Véronique Letort
- article
- Ecological Modelling, 2014, 290, pp.21-33. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2014.02.006⟩
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-
- titre
- Model-Based Analysis-Synthesis for Realistic Tree Reconstruction and Growth Simulation
- auteur
- Corina Iovan, Paul-Henry Cournède, Thomas Guyard, Benoît Bayol, Dider Boldo, Matthieu Cord
- article
- IEEE Transactions on Geoscience and Remote Sensing, 2014, 52 (2), pp.1438-1450. ⟨10.1109/TGRS.2013.2251467⟩
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-
- titre
- Data assimilation to reduce uncertainty of crop model prediction with convolution particle filtering
- auteur
- Yuting Chen, Paul-Henry Cournède
- article
- Ecological Modelling, 2014, in press. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2014.01.030⟩
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-
- titre
- Application of a probabilistic model for analysing the abortion of seeds and pods in winter oilseed rape (Brassica napus)
- auteur
- Xiu Juan Wang, Amélie Mathieu, Paul-Henry P.-H. Cournède, B G Zhang, Philippe de Reffye
- article
- Annals of Applied Biology, 2014, 165 (3), pp.414- 428. ⟨10.1111/aab.12152⟩
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-
- titre
- Parametrization of five classical plant growth models applied to sugar beet and comparison of their predictive capacities on root yield and total biomass
- auteur
- Charlotte Baey, Anne Didier, Sébastien Lemaire, Fabienne Maupas, Paul-Henry Cournède
- article
- Ecological Modelling, 2014, 290, pp.11-20. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2013.11.003⟩
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-
Conference papers
- titre
- Experimental Design in Dynamical System Identification: A Bandit-Based Active Learning Approach
- auteur
- Artémis Llamosi, Adel Mezine, Florence d'Alché-Buc, Véronique Letort, Michèle Sebag
- article
- Machine Learning and Knowledge Discovery in Databases - Part II, Sep 2014, Nancy, France. pp.306 - 321, ⟨10.1007/978-3-662-44851-9_20⟩
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-
- titre
- Numerical Study and Ex Vivo Assessment of HIFU Treatment Time Reduction through Optimization of Focal Point Trajectory
- auteur
- A Grisey, S Yon, T Pechoux, Pauline Godillon-Lafitte, Véronique Letort
- article
- The 14th International Symposium on Therapeutic Ultrasound (ISTU), Apr 2014, Las Vegas, United States. ⟨10.1063/1.4977659⟩
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-
Proceedings
- titre
- MMCS, Mathematical Modelling of Complex Systems
- auteur
- Frédéric Abergel, Marc Aiguier, Damien Challet, Paul-Henry P.-H. Cournède, Gilles Fay, Pauline Godillon-Lafitte
- article
- 47, 2014, ESAIM: Proceedings and Surveys
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-
2013
Journal articles
- titre
- Automated Cell Tracking and Analysis in Phase-Contrast Videos (iTrack4U): Development of Java Software Based on Combined Mean-Shift Processes
- auteur
- Fabrice Cordelières, Valérie Petit, Mayuko Kumasaka, Olivier Debeir, Veronique Letort, Stuart Gallagher, Lionel Larue
- article
- PLoS ONE, 2013, 8 (11), pp.81266 - 81266. ⟨10.1371/journal.pone.0081266⟩
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-
- titre
- Development and Evaluation of Plant Growth Models: Methodology and Implementation in the PYGMALION platform
- auteur
- Paul-Henry Cournède, Yuting Chen, Qiongli Wu, Charlotte Baey, Benoît Bayol
- article
- Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2013, 8 (4), pp.112-130. ⟨10.1051/mmnp/20138407⟩
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-
- titre
- A sequential Monte Carlo approach for MLE in a plant growth model
- auteur
- Samis Trevezas, Paul-Henry Cournède
- article
- Journal of Agricultural, Biological, and Environmental Statistics, 2013, pp.online first. ⟨10.1007/s13253-013-0134-1⟩
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-
- titre
- Modelling the interindividual variability of organogenesis in sugar beet populations using a hierarchical segmented model
- auteur
- Charlotte Baey, Anne Didier, Lemaire Sébastien, Fabienne Maupas, Paul-Henry Cournède
- article
- Ecological Modelling, 2013, 263, pp.56-63. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2013.04.013⟩
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-
Conference papers
- titre
- A multi-task learning approach for compartmental model parameter estimation in DCE-CT sequences
- auteur
- Blandine Romain, Veronique Letort, Olivier Lucidarme, Laurence Rouet, Florence d'Alché-Buc
- article
- 16th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI 2013), Sep 2013, Nagoya, Japan. pp.271-278, ⟨10.1007/978-3-642-40763-5_34⟩
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-
- titre
- Towards an EDSL to enhance good modelling practice for non-linear stochastic discrete dynamical models Application to plant growth models
- auteur
- Benoit Bayol, Yuting Chen, Paul-Henry Cournède
- article
- SIMULTECH 2013, Jul 2013, Iceland. pp.132-138, ⟨10.5220/0004481101320138⟩
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-
- titre
- Optimal Control of Crop Irrigation based on the Hamilton-Jacobi-Bellman Equation
- auteur
- Jacques Ramanathan, Yuting Chen, Paul-Henry Cournède
- article
- SIAM Conference on Control and its Applications, Jul 2013, San Diego, United States. pp.21-28, ⟨10.1137/1.9781611973273.4⟩
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-
- titre
- Iterative convolution particle filtering for nonlinear parameter estimation and data assimilation with application to crop yield prediction
- auteur
- Yuting Chen, Samis Trevezas, Paul-Henry Cournède
- article
- Society for Industrial and Applied Mathematics (SIAM): Control & its Applications 2013, Jul 2013, San Diego, United States. pp.CHEN, ⟨10.1137/1.9781611973273.10⟩
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-
- titre
- Sensitivity Analysis for Plant Models with Correlated Parameters: Application to the Characterization of Sun flower Genotypes
- auteur
- Qiongli Wu, Benoît Bayol, Fenni Kang, Jérémie Lecoeur, Paul-Henry Cournède
- article
- 7th International Conference on Sensitivity Analysis of Model Output, Jul 2013, Nice, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Some sequential Monte Carlo techniques for Data Assimilation in a plant growth model
- auteur
- Yuting Chen, Samis Trevezas, Aman Gupta, Paul-Henry Cournède
- article
- Applied Stochastic Models and Data Analysis International Conference (ASMDA) 2013, Jun 2013, Spain. in press
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-
- titre
- A nonlinear mixed effects model to explain inter-individual variability in plant populations
- auteur
- Charlotte Baey, Samis Trevezas, Paul-Henry Cournède
- article
- Applied Stochastic Models and Data Analysis International Conference (ASMDA) 2013, Jun 2013, Barcelona, Spain
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-
- titre
- Assessment of Interactions in Complex Mechanistic Models using Global Sensitivity Analysis
- auteur
- Qiongli Wu, Paul-Henry Cournède
- article
- International Conference "Interactions in Complex Systems", Jun 2013, Orléans, France
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-
- titre
- Global sensitivity analysis of the NEMA model for its parameterization and biological diagnosis.
- auteur
- Qiongli Wu, Jessica Bertheloot, Paul-Henry Cournède
- article
- 7th International Conference on Functional-Structural Plant Models (FSPM 2013), Jun 2013, Saariselkä, Finland
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Modelling Competition in Crop Populations via Reaction-Diffusion Foliage Dynamics. With an Outlook on Tree Modelling
- auteur
- Robert Beyer, Paul-Henry Cournède
- article
- 7th International Conference on Functional-Structural Plant Models (FSPM 2013), Jun 2013, Saariselkä, Finland. pp.201-203
- Accès au bibtex
-
- titre
- A comprehensive global sensitivity analysis for biological model diagnosis and parameterization: application to the NEMA model
- auteur
- Qiongli Wu, Jessica Bertheloot, Paul-Henry Cournède
- article
- Seventh International Workshop on Functional-Structural Plant Models, Jun 2013, Saariselkä, Finland
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-
Other publications
- titre
- Simulation techniques for parameter estimation via a stochastic ECM algorithm with applications to plant growth modeling
- auteur
- Samis Trevezas, Sonia Malefaki, Paul-Henry Cournède
- article
- 2013
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2012
Journal articles
- titre
- Exploring individual HPV coinfections is essential to predict HPV-vaccination impact on genotype distribution: A model-based approach.
- auteur
- Margarita Pons-Salort, Véronique Letort, Michel Favre, Isabelle Heard, Benoit Dervaux, Lulla Opatowski, Didier Guillemot
- article
- Vaccine, 2012, 31 (8), pp.1238-1245. ⟨10.1016/j.vaccine.2012.11.098⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Oscillations in Functional Structural Plant Growth Models
- auteur
- Amélie Mathieu, Veronique Letort, Paul-Henry Cournède, Baogui Zhang, Patrick Heuret, Philippe de Reffye
- article
- Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2012, 7 (6), pp.47-66. ⟨10.1051/mmnp/20127603⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A Functional and Structural Mongolian Scots Pine (Pinus sylvestris var. mongolica) Model Integrating Architecture, Biomass and Effects of Precipitation
- auteur
- Feng Wang, Veronique Letort, Qi Lu, Xuefeng Bai, Yan Guo, P. de Reffye, Baoguo Li
- article
- PLoS ONE, 2012, 7 (8), pp.e43531. ⟨10.1371/journal.pone.0043531⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Characterization of the effects of inter-tree competition on source-sink balance in Chinese pine trees with the GreenLab model
- auteur
- Hong Guo, Xiangdong Lei, Paul-Henry Cournède, Veronique Letort
- article
- Trees - Structure and Function, 2012, 26, pp.1057-1067. ⟨10.1007/s00468-012-0683-x⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- An optimal control methodology for plant growth--Case study of a water supply problem of sunflower
- auteur
- Lin Wu, François-Xavier Le Dimet, Philippe de Reffye, Bao-Gang Hu, Paul-Henry Cournède, Meng-Zhen Kang
- article
- Mathematics and Computers in Simulation, 2012, 82 (5), pp.909-923. ⟨10.1016/j.matcom.2011.12.007⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Simulation of the topological development of young eucalyptus using a stochastic model and sampling measurement strategy
- auteur
- Jun Diao, Philippe de Reffye, Xiangdong Lei, Hong Guo, Veronique Letort
- article
- Computers and Electronics in Agriculture, 2012, 80, pp.105-114. ⟨10.1016/j.compag.2011.10.019⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- An efficient computational method for global sensitivity analysis and its application to tree growth modelling
- auteur
- Qiongli Wu, Paul-Henry Cournède, Amélie Mathieu
- article
- Reliability Engineering and System Safety, 2012, 107, pp.35-43. ⟨10.1016/j.ress.2011.07.001⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Parallel Graph Grammars with Instantiation Rules Allow Efficient Structural Factorization of Virtual Vegetation
- auteur
- Katarina Smolenova, Winfried Kurth, Paul-Henry Cournède
- article
- Electronic Communications of the EASST, 2012, pp.114-128. ⟨10.14279/tuj.eceasst.61.830.825⟩
- Accès au bibtex
-
Conference papers
- titre
- Evaluation of the Predictive Capacity of Five Plant Growth Models for Sugar Beet
- auteur
- Charlotte Baey, Anne Didier, Li Song, Sébastien Lemaire, Fabienne Maupas, Paul-Henry Cournède
- article
- Plant Growth Modeling, Simulation, Visualization and Applications - PMA12, Nov 2012, Shanghai, China. pp.30-37
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Interspecific Variability of Biomass Production of Young Coffea: No Influence of Branch Pruning. Experimental Evidence and Theoretical Analysis
- auteur
- Veronique Letort, Sylvie Sabatier, Sélastique Akaffou, Serge Hamon, Perla Hamon, P. de Reffye
- article
- 2012 IEEE 4th International Symposium on Plant Growth Modeling, Simulation, Visualization and Applications, Oct 2012, Shanghai, China. pp.224-227, ⟨10.1109/pma.2012.6524838⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- SUNLAB: a Functional-Structral Model for Genotypic and Phenotypic Characterization of the Sunflower Crop
- auteur
- Fenni Kang, Veronique Letort, Hugo Magaldi, Paul-Henry Cournède, Jérémie Lecoeur
- article
- 2012 IEEE 4th International Symposium on Plant Growth Modeling, Simulation, Visualization and Applications, Oct 2012, Shanghai, China. pp.148-151
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Assessment of Parameter Uncertainty in Plant Growth Model Identification
- auteur
- Yuting Chen, Paul-Henry Cournède
- article
- 2012 IEEE 4th International Symposium on Plant Growth Modeling, Simulation, Visualization and Applications, Oct 2012, China. CHEN, page 43
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Source-sink relationships vary with age in Chinese pine (Pinus tabulaeformis Carr.): analysis using the GreenLab model
- auteur
- Hong Guo, Veronique Letort, Yuanchang Lu, Jun Diao, Philippe de Reffye
- article
- 2012 IEEE 4th International Symposium on Plant Growth Modeling, Simulation, Visualization and Applications, Oct 2012, Shanghai, China. pp.148-151, ⟨10.1109/pma.2012.6524826⟩
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-
- titre
- Registration of free-breathing abdominal 3D contrast-enhanced CT
- auteur
- Blandine Romain, Veronique Letort, Olivier Lucidarme, Florence d'Alché-Buc, Laurence Rouet
- article
- 4th International Workshop on Abdominal Imaging. Computational and Clinical Applications, Held in Conjunction with MICCAI 2012, Oct 2012, Nice, France. pp.274-282, ⟨10.1007/978-3-642-33612-6_29⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Filtrage par noyaux de convolution itératif
- auteur
- Yuting Chen, Benoît Bayol, Cédric Loi, Samis Trevezas, Paul-Henry Cournède
- article
- Les 44 Journées de Statistique, May 2012, Bruxelles, Belgique. pp.CHEN
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Optimisation of reconstruction for the registration of CT liver perfusion sequences
- auteur
- Blandine Romain, Veronique Letort, Olivier Lucidarme, Florence d'Alché-Buc, Laurence Rouet
- article
- SPIE Medical Imaging 2012, Feb 2012, San Diego, United States. ⟨10.1117/12.910929⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2011
Journal articles
- titre
- 基于GreenLab原理构建油松成年树的结构-功能模型 (A functional-structural model for adults of Pinus tabulaeformis based on GreenLab)
- auteur
- Hong Guo, Xiangdong Lei, Veronique Letort, Yuanchang Lu
- article
- Chinese Journal of Plant Ecology, 2011, 35 (4), pp.422-430. ⟨10.3724/SP.J.1258.2011.00422⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Analysing the effects of local environment on the source-sink balance of Cecropia sciadophylla: a methodological approach based on model inversion
- auteur
- Veronique Letort, Patrick Heuret, Paul Camilo Zalamea, P. de Reffye, Eric A. Nicolini
- article
- Annals of Forest Science, 2011, 69, pp.167-180. ⟨10.1007/s13595-011-0131-x⟩
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-
- titre
- Exact MLE and asymptotic properties for nonparametric semi-Markov models
- auteur
- Samis Trevezas, Nikolaos Limnios
- article
- Journal of Nonparametric Statistics, 2011, 23 (3), pp.719-739. ⟨10.1080/10485252.2011.555543⟩
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-
- titre
- Growth and development simulation based on functional-structural model GreenLab for poplar (Salicaceae)
- auteur
- Yang Gang, Cao Weiqun, Liu Dongxiang, Meng Zhen Kang, Veronique Letort, Xing Meijun, Huang Xinyuan
- article
- African Journal of Agricultural Research, 2011, 6 (13), pp.3071-3077
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- NEMA, a functional-structural model of nitrogen economy within wheat culms after flowering. II. Evaluation and sensitivity analysis
- auteur
- Jessica Bertheloot, Qiongli Wu, Paul-Henry Cournède, Bruno Andrieu
- article
- Annals of Botany, 2011, 108 (6), pp.1097-1109. ⟨10.1093/aob/mcr125⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Characterization of the interactions between architecture and source-sink relationships in winter oilseed rape (Brassica napus) using the GreenLab model
- auteur
- Alexandra Jullien, Amélie Mathieu, Jean-Michel Allirand, Amélie Pinet, Philippe de Reffye, Paul-Henry Cournède, Bertrand Ney
- article
- Annals of Botany, 2011, 107 (5), pp.765-779. ⟨10.1093/aob/mcq205⟩
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-
- titre
- Simulation of fruit-set and trophic competition and optimization of yield advantages in six Capsicum cultivars using functional-structural plant modelling
- auteur
- Yuntao Ma, A. M. Wubs, E. Heuvelink, Amélie Mathieu, J. Y. Zhu, Bao-Gang Hu, Paul-Henry Cournède, Philippe de Reffye
- article
- Annals of Botany, 2011, 107 (5), pp.793-803. ⟨10.1093/aob/mcq223⟩
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-
- titre
- Some Parameter Estimation Issues in Functional-Structural Plant Modelling
- auteur
- Paul-Henry Cournède, Veronique Letort, Amélie Mathieu, Meng Zhen Kang, Sébastien Lemaire, Samis Trevezas, François Houllier, Philippe de Reffye
- article
- Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2011, 6 (2), pp.133-159. ⟨10.1051/mmnp/20116205⟩
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-
- titre
- NEMA, a functional-structural model of nitrogen economy within wheat culms after flowering. I.Model description
- auteur
- Jessica Bertheloot, Paul-Henry Cournède, Bruno Andrieu
- article
- Annals of Botany, 2011, 108 (6), pp.1085-1096. ⟨10.1093/aob/mcr119⟩
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-
- titre
- Variability and regulation of the number of ovules, seeds and pods according to assimilate availability in winter oilseed rape (Brassica napus L.).
- auteur
- Xiujuan X. Wang, Amélie A. Mathieu, Paul-Henry P.-H. Cournède, Jean Michel J. M. Allirand, Alexandra A. Jullien, Philippe Verchère de Reffye de Reffye, Bao Gui B. G. Zhang
- article
- Field Crops Research, 2011, 122 (1), pp.60-69. ⟨10.1016/j.fcr.2011.02.008⟩
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-
Conference papers
- titre
- A methodology to study Complex Biophysical Systems with Global Sensitivity Analysis
- auteur
- Qiongli Wu, Paul-Henry Cournède
- article
- ESREL2011, Antoine Grall, Sep 2011, Troyes, France
- Accès au bibtex
-
- titre
- Bayesian Estimation in Functional-Structural Plant Models with Stochastic Organogenesis
- auteur
- Cédric Loi, Paul-Henry Cournède, Samis Trevezas
- article
- 14th Applied Stochastic Models and Data Analysis International Conference (ASMDA 2011), Jun 2011, Rome, Italy
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Using a hierarchical segmented model to assess the dynamics of leaf appearance in plant populations.
- auteur
- Charlotte Baey, Paul-Henry Cournède
- article
- 14th Applied Stochastic Models and Data Analysis International Conference (ASMDA 2011), Jun 2011, Rome, Italy
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Effects of pod position and its appearance time on pod and seed abortion in winter oilseed rape (Brassica napus L.)
- auteur
- Xiujuan X. Wang, Amélie A. Mathieu, Paul-Henry P.-H. Cournède, Jean Michel J. M. Allirand, Alexandra A. Jullien, Philippe Verchère de Reffye de Reffye, Bao Gui B. G. Zhang
- article
- 13. International Rapeseed Congress, Jun 2011, Pargue, Czech Republic. pp.154-157
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-
Book sections
- titre
- Parameterization of plant growth models to characterize genotype by environment interactions: a methodology adapted to breeding programs
- auteur
- Fenni Kang, Thomas Galinier, Paul-Henry Cournède, Jérémie Lecoeur
- article
- Halford, N. and Semenov, M. Aspects of Applied Biology 107: Systems Approaches to Crop Improvement, The Association of Applied Biologists, pp.27-35, 2011
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-
Preprints, Working Papers, ...
- titre
- Irrigation Optimization by Modeling of Plant-Soil Interaction
- auteur
- Zhongping Li, Paul-Henry Cournède, Jean-Claude Mailhol
- article
- 2011
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-
2010
Journal articles
- titre
- Optimization of source-sink dynamics in plant growth for ideotype breeding: a case study on maize
- auteur
- Rui Qi, Yuntao Ma, Baogang Hu, Philippe de Reffye, Paul-Henry Cournède
- article
- Computers and Electronics in Agriculture, 2010, 71 (1), pp.96-105. ⟨10.1016/j.compag.2009.12.008⟩
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-
- titre
- Cultivons notre jardin
- auteur
- Philippe de Reffye
- article
- Interstices, 2010
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-
- titre
- Comparison of three approaches to model grapevine organogenesis in conditions of fluctuating temperature, solar radiation and soil water content
- auteur
- Benoît Pallas, Cedric Loi, Angélique Christophe, Paul-Henry Cournède, Jérémy Lecoeur
- article
- Annals of Botany, 2010, 107 (5), pp.Non connues. ⟨10.1093/aob/mcq173⟩
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-
- titre
- A stochastic model of tree architecture and biomass partitioning: application to Mongolian Scots pines
- auteur
- Feng Wang, Mengzhen Kang, Qi Lu, Véronique Letort, Hui Han, Yan Guo, P. de Reffye, Baoguo Li
- article
- Annals of Botany, 2010, pp.1-20. ⟨10.1093/aob/mcq218⟩
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-
- titre
- Quantitative analysis of melanocyte migration in vitro based on automated cell tracking under phase contrast microscopy considering the combined influence of cell division and cell-matrix interactions.
- auteur
- Véronique Letort, Sylvain Fouliard, Gaëlle Letort, Ivan Adanja, Mayuko Kumasaka, Stuart Gallagher, Olivier Debeir, Lionel Larue, Françoise Xavier
- article
- Mathematical Modelling of Natural Phenomena, 2010, 5 (1), pp.4-33. ⟨10.1051/mmnp/20105101⟩
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-
Conference papers
- titre
- Sensitivity analysis of GreenLab model for maize
- auteur
- Qiongli Wu, Paul-Henry Cournède
- article
- 3rd international symposium on Plant Growth and Applications (PMA09), Nov 2010, Beijing, China
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-
- titre
- Assessment of Non-Linearity in Functional-Structural Plant Models
- auteur
- Qiongli Wu, Jessica Bertheloot, Amélie Mathieu, Bruno Andrieu, Paul-Henry Cournède
- article
- FSPM 2010 - 6th International Workshop on Functional-Structural Plant Models, Sep 2010, Davis, California, United States
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-
- titre
- Calibration of a probabilistic model of oilseed rape fertility to analyze the inter-variety variability in number of seeds
- auteur
- X. Wang, Amélie Mathieu, Paul-Henry P.-H. Cournède, Jean Michel Allirand, Alexandra Jullien, Philippe Verchère de Reffye, B.G. Zhang
- article
- 6. International Workshop, Sep 2010, Davis, United States
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-
- titre
- A functional-structural model of nitrogen economy within wheat culms after flowering
- auteur
- Jessica Bertheloot, Paul-Henry P.-H. Cournède, Q. Wu, Bruno Andrieu
- article
- 12. ESA Congress, Aug 2010, Montpellier, France
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-
- titre
- The use of Sensitivity Analysis for the design of Functional Structural Plant Models
- auteur
- Qiongli Wu, Paul-Henry Cournède
- article
- Sixth international conference on sensitivity analysis of model output, Jul 2010, Milan, Italy. pp.7768-7769
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-
- titre
- A stochastic, functional-structural model for cotton plants
- auteur
- Dong Li, Veronique Letort, Meng Zhen Kang, Feng Wang, Yan Guo, Baoguo Li, P. de Reffye, Zhigang Zhan
- article
- Functional-Structural Plant Models, Jul 2010, Davis, United States. pp.20-22
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-
- titre
- A symbolic method to compute the probability distribution of the number of pattern occurences in random texts generated by stochastic 0L-systems
- auteur
- Cedric Loi, Paul-Henry Cournède, Jean Françon
- article
- 21st International Meeting on Probabilistic, Combinatorial, and Asymptotic Methods in the Analysis of Algorithms (AofA'10), 2010, Vienna, Austria. pp.473-488, ⟨10.46298/dmtcs.2774⟩
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-
Book sections
- titre
- Nitrogen acquisition and utilization by crops: review of different approaches and proposition of a mechanistic modeling
- auteur
- Jessica Bertheloot, Paul-Henry Cournède, Bruno Andrieu
- article
- Third International Symposium on Plant Growth Modeling, Simulation, Visualization and Applications: proceedings, 9-13 November 2009, Beijing, China, IEEE Computer Society, 454 p., 2010, Plant Growth Modeling, Simulation, Visualization and Applications, 978-0-7695-3988-1
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-
Preprints, Working Papers, ...
- titre
- A symbolic method to analyse patterns in plant structure whose organogenesis is driven by a multitype branching process
- auteur
- Cedric Loi, Paul-Henry Cournède, Jean Françon
- article
- 2010
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-
2009
Journal articles
- titre
- A dynamic model of plant growth with interactions between development and functional mechanisms to study plant structural plasticity related to trophic competition.
- auteur
- A. Mathieu, Paul-Henry Cournède, Véronique Letort, Daniel Barthélémy, P. de Reffye
- article
- Annals of Botany, 2009, 103 (8), pp.1173-1186. ⟨10.1093/aob/mcp054⟩
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-
- titre
- 基于GreenLab的油松结构-功能模型 (A FUNCTIONAL-STRUCTURAL MODEL GREENLAB FOR PINUS TABULAEFORMIS)
- auteur
- Hong Guo, Xiangdong Lei, Veronique Letort, Yuanchang Lu, Philippe de Reffye
- article
- Chinese Journal of Plant Ecology, 2009, 33 (5), pp.950-957. ⟨10.3773/j.issn.1005-264x.2009.05.014⟩
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-
- titre
- Une histoire de la modélisation des plantes
- auteur
- Philippe de Reffye, Marc Jaeger, Paul-Henry Cournède
- article
- Interstices, 2009
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-
- titre
- Using a mathematical model to evaluate the trophic and non-trophic determinants of axis development in grapevine (Vitis vinifera L.)
- auteur
- Benoit Pallas, Angélique Christophe, Paul-Henry Cournède, Jérémie Lecoeur
- article
- Functional Plant Biology, 2009, 36, pp.156-170
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-
- titre
- Using a mathematical model to evaluate the trophic and non-trophic determinants of axis development in grapevine
- auteur
- Benoit Pallas, Angélique Christophe, Paul-Henry Cournède, Jérémie Lecoeur
- article
- Functional Plant Biology, 2009, 36 (2), pp.156-170. ⟨10.1071/fp08178⟩
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-
- titre
- Application of the GreenLab model to simulate and optimize wood production and tree stability: a theoretical study
- auteur
- Rui Qi, Véronique Letort, M. Z. Kang, Paul-Henry Cournède, Philippe de Reffye, Thierry Fourcaud
- article
- Silva Fennica, 2009, 43 (3), pp.465-487
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-
Conference papers
- titre
- Modeling branching effects on source-sink relationships of the cotton plant
- auteur
- Dong Li, Véronique Letort, Yan Guo, P. de Reffye, Zhigang Zhan
- article
- 2009 Plant Growth Modeling And Applications, Nov 2009, Beijing, China. pp.293-300
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-
- titre
- Impact of topology on plant functioning : a theoretical analysis based on the GreenLab model equations
- auteur
- Véronique Letort, Paul-Henry Cournède, Philippe de Reffye
- article
- 2009 Plant Growth Modeling And Applications, Nov 2009, Beijing, China. pp.341-348
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-
- titre
- Calibration of topological development in the procedure of parametric identification: application to the stochastic GreenLab model for Pinus Sylvestris var. Mongolica
- auteur
- Feng Wang, Meng Zhen Kang, Hui Han, Qi Lu, Véronique Letort, Yan Guo, P. de Reffye, Baoguo Li
- article
- 2009 Plant Growth Modeling And Applications, Nov 2009, Beijing, China. pp.26-33
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Plants as Combinatorial Structures and Applications
- auteur
- Cedric Loi, Paul-Henry Cournède, Jean Françon
- article
- Third International Symposium on Plant Growth Modeling, Simulation, Visualization and Applications (PMA09), Nov 2009, Pékin, China. pp.319-326, ⟨10.1109/pma.2009.27⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Towards a continuous approach of functional-structural plant growth
- auteur
- Zhongping Li, Vincent Le Chevalier, Paul-Henry Cournède
- article
- Third International Symposium on Plant Growth Modeling, Simulation, Visualization and Applications (PMA09), Nov 2009, Beijing, China. pp.334-340, ⟨10.1109/PMA.2009.69⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Applying GreenLab Model to Adult Chinese Pine Trees with Topology Simplification
- auteur
- Hong Guo, Véronique Letort, Xiangdong Lei, Yuanchang Lu, P. de Reffye
- article
- Plant Growth Modeling, Simulation, Visualization and Applications - PMA09, Nov 2009, Beijing, China. pp.58-64
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-
- titre
- Preliminary Functional-Structural Modeling on Poplar (Salicaceae)
- auteur
- Dongxiang Liu, Meng Zhen Kang, Véronique Letort, Meijun Xing, Yang Gang, Xinyuan Huang, Weiqun Cao
- article
- Third International Symposium on Plant Growth Modeling, Simulation, Visualization and Applications (PMA09), Nov 2009, Beijing, China. pp.49-52, ⟨10.1109/pma.2009.47⟩
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-
- titre
- Analysis of Cecropia sciadophylla Morphogenesis Based on a Sink-Source Dynamic Model
- auteur
- Véronique Letort, Patrick Heuret, Paul Camilo Zalamea, Eric A. Nicolini, P. de Reffye
- article
- 2009 Plant Growth Modeling And Applications, Nov 2009, Beijing, China. pp.10-17
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-
- titre
- Stochastic models in floral biology and its application to the study of oilseed rape (Brassica napus L.) fertility
- auteur
- Wang Xiujuan, Amélie Mathieu, Paul-Henry Cournède, Jean-Michel Allirand, Alexandra Jullien, Philippe de Reffye, Bao Gui Zhang
- article
- Third International Symposium on Plant Growth Modeling, Simulation, Visualization and Applications (PMA09), Nov 2009, Beijing, China
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Comparison between empirical or functional sinks of organs - Application on Tomato plant
- auteur
- Baogui Zhang, Meng Zhen Kang, Véronique Letort, Xiujuan Wang, P. de Reffye
- article
- 2009 Plant Growth Modeling And Applications, Nov 2009, Beijing, China. pp.191-197
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-
- titre
- A stochastic growth model of grapevine with full interaction between environment, trophic competition and plant development.
- auteur
- Benoit Pallas, Cedric Loi, Angélique Christophe, Paul-Henry Cournède, Jérémie Lecoeur
- article
- Third International Symposium on Plant Growth Modeling, Simulation, Visualization and Applications (PMA09), Nov 2009, Pékin, China. pp.95-102
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-
- titre
- Stochastic models in floral biology and application to the study of oilseed rape fertility
- auteur
- Xiujuan Wang, Amélie Mathieu, Paul-Henry P.-H. Cournède, Jean Michel Allirand, Philippe Verchère de Reffye, Alexandra Jullien, Bao Gui Zhang
- article
- Third International Symposium on Plant Growth Modeling, Simulation, Visualization and Applications (PMA09), Ville service., Nov 2009, Beijing, China. 454 p., ⟨10.1109/PMA.2009.12⟩
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-
- titre
- Modelling of branch and flower expansion in GreenLab model to account for the whole crop cycle of Winter Oilseed Rape (Brassica Napus L.)
- auteur
- Alexandra Jullien, Amélie Mathieu, Jean Michel Allirand, Amélie Pinet, Philippe Verchère de Reffye, Bertrand Ney, Paul-Henry P.-H. Cournède
- article
- Third International Symposium on Plant Growth Modeling, Simulation, Visualization and Applications (PMA09), Ville service., Nov 2009, Beijing, China. 454 p
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-
- titre
- A Forest Growth Simulator Based on Functional-Structural Modelling of Individual Trees
- auteur
- Paul-Henry Cournède, Thomas Guyard, Benoit Bayol, Sébastien Griffon, François de Coligny, Philippe Borianne, Marc Jaeger, Philippe de Reffye
- article
- Third International Symposium on Plant Growth Modeling, Simulation, Visualization and Applications (PMA09), IEEE, Nov 2009, Beijing, China. pp.34-41, ⟨10.1109/PMA.2009.55⟩
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-
- titre
- Analysis of the density effects on the source-sink dynamics in Sugar-Beet growth
- auteur
- Sébastien Lemaire, Fabienne Maupas, Paul-Henry Cournède, Jean-Michel Allirand, Bertrand Ney, P. de Reffye
- article
- Third International Symposium on Plant Growth Modeling, Simulation, Visualization and Applications (PMA09), Nov 2009, Beijing, China. 454 p
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-
- titre
- Modeling Inter-Individual Variability in Sugar Beet Populations
- auteur
- P. de Reffye, Sébastien Lemaire, Nitish Srivastava, Fabienne Maupas, Paul-Henry Cournède
- article
- Third International Symposium on Plant Growth Modeling, Simulation, Visualization and Applications (PMA09), Nov 2009, Beijing, China
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-
- titre
- Simulation of morphological plasticity of Acacia tortilis in response to herbivore attacks
- auteur
- Amélie Mathieu, Véronique Letort, Renaud Gosset, Jacques Gignoux, Paul-Henry Cournède
- article
- Third International Symposium on Plant Growth Modeling, Simulation, Visualization and Applications (PMA09), Saisissez le nom du laboratoire, du service ou du département., Ville service., 2009, Beijing, China. 454 p
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-
Book sections
- titre
- A Functional-Structural Plant Model: Theories and its Applications in Agronomy
- auteur
- Meng Zhen Kang, Paul-Henry Cournède, Amélie Mathieu, Veronique Letort, Rui Qi
- article
- Cao, W. and White, J. and Wang, E. Crop Modeling and Decision Support, Springer, pp.148-160, 2009, 978-3-642-01131-3. ⟨10.1007/978-3-642-01132-0_16⟩
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-
Habilitation à diriger des recherches
- titre
- Dynamic System of Plant Growth
- auteur
- Paul-Henry Cournède
- article
- Mathematics [math]. Université Montpellier II - Sciences et Techniques du Languedoc, 2009
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-
2008
Journal articles
- titre
- AMAPsim: A Structural Whole-plant Simulator Based on Botanical Knowledge and Designed to Host External Functional Models
- auteur
- Jean-François Barczi, Hervé Rey, Yves Caraglio, Philippe de Reffye, Daniel Barthélémy, Thierry Fourcaud, Qiao Xue Dong
- article
- Annals of Botany, 2008, 101 (8), pp.1125-1138. ⟨10.1093/aob/mcm194⟩
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-
- titre
- Does the structure function model GREENLAB deal with crop phenotypic plasticity induced by plant spacing? A case study on tomato
- auteur
- Qiao Xue Dong, G. Louarn, Yiming Wang, Jean-François Barczi, Philippe de Reffye
- article
- Annals of Botany, 2008, 101 (8), pp.1195-1206. ⟨10.1093/aob/mcm317⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Rhythms and alternating patterns in plants as emergent properties of a model of interaction between development and functioning
- auteur
- Amélie Mathieu, Daniel Barthélémy, Paul-Henry Cournède, Philippe de Reffye
- article
- Annals of Botany, 2008, 101 (8), pp.1233-1242. ⟨10.1093/aob/mcm171⟩
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-
- titre
- Analytical study of a stochastic plant growth model: application to the GreenLab model
- auteur
- M. Z. Kang, Paul-Henry Cournède, Philippe de Reffye, Daniel Auclair, Bao-Gang Hu
- article
- Mathematics and Computers in Simulation, 2008, 78 (1), pp.57-78. ⟨10.1016/j.matcom.2007.06.003⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Computing competition for light in the GREENLAB model of plant growth: a contribution to the study of the effects of density on resource acquisition and architectural development.
- auteur
- Paul-Henry Cournède, Amélie Mathieu, François Houllier, Daniel Barthélémy, Philippe de Reffye
- article
- Annals of Botany, 2008, 101 (8), pp.1207-1219. ⟨10.1093/aob/mcm272⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- The derivation of sink functions of wheat organs using the GREENLAB Model
- auteur
- M. Z. Kang, Jochem B. Evers, Philippe de Reffye, Jan Vos
- article
- Annals of Botany, 2008, 101 (8), pp.1099-1108. ⟨10.1093/aob/mcm212⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- A model-based analysis of the dynamics of carbon balance at the whole-plant level in Arabidopsis thaliana
- auteur
- Angélique Christophe, Veronique Letort, Irène Hummel, Paul-Henry Cournède, P. de Reffye, Jérémie Lecoeur
- article
- Functional Plant Biology, 2008, 35, pp.1147-1162. ⟨10.1071/FP08099⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Quantitative genetics and functional-structural plant growth models : Simulation of quantitative trait loci detection for model parameters and application to potential yield optimization
- auteur
- Véronique Letort, Paul Mahe, Paul-Henry Cournède, Philippe de Reffye, Brigitte Courtois
- article
- Annals of Botany, 2008, 101 (8), pp.1243-1254. ⟨10.1093/aob/mcm197⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Structural Identifiability of Generalized Constraint Neural Network Models for Nonlinear Regression
- auteur
- Shuang-Hong Yang, Bao-Gang Hu, Paul-Henry Cournède
- article
- Neurocomputing, 2008, 72 (1-3), pp.392-400. ⟨10.1016/j.neucom.2007.12.013⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Parameter optimization and field validation of the functional-structural model GREENLAB for Maize at different population densities
- auteur
- Yuntao Ma, Wen Meiping, Yan Guo, Baoguo Li, Paul-Henry Cournède, Philippe de Reffye
- article
- Annals of Botany, 2008, 101 (8), pp.1185-1194. ⟨10.1093/aob/mcm233⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Parametric identification of a functional-structural tree growth model and application to beech trees (Fagus sylvatica)
- auteur
- Veronique Letort, Paul-Henry Cournède, Amélie Mathieu, Philippe de Reffye, Thiéry Constant
- article
- Functional Plant Biology, 2008, 35, pp.951-963. ⟨10.1071/fp08065⟩
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-
Conference papers
- titre
- A Functional-Structural Plant Model-Theory and Applications in Agronomy
- auteur
- Meng Zhen Kang, Paul-Henry Cournède, Amélie Mathieu, Véronique Letort, Rui Qi, Zhi Gang Zhan
- article
- International Symposium on Crop Modeling and Decision Support: ISCMDS 2008, Apr 2008, Nanjing, China
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-
- titre
- A morphogenetic crop model for sugar-beet (Beta vulgaris L.)
- auteur
- Sébastien Lemaire, Fabienne Maupas, Paul-Henry Cournède, Philippe de Reffye
- article
- ISCMDS, Apr 2008, Nanjing, China
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-
- titre
- Analyse et modélisation de l'architecture des Plantes
- auteur
- Daniel Auclair, Jean-François Barczi, Daniel Barthélémy, Frédéric Blaise, Yves Caraglio, Paul-Henry P.-H. Cournède, Thierry Fourcaud, Patrick Heuret, Marc Jaeger, Philippe Verchère de Reffye
- article
- Plantes et peuplements virtuels, Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UAR Département Adjoint Ecologie des Forêts, Prairies et Milieux Aquatiques (0940)., Mar 2008, Lyon, France
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-
- titre
- Generating Functions of Stochastic L-Systems and Application to Models of Plant Development
- auteur
- Cedric Loi, Paul Henry Cournède
- article
- Fifth Colloquium on Mathematics and Computer Science, 2008, Kiel, Germany. pp.325-338, ⟨10.46298/dmtcs.3574⟩
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-
Book sections
- titre
- Plant growth models
- auteur
- Philippe de Reffye, E. Heuvalick, Daniel Barthélémy, Paul-Henry P.-H. Cournède
- article
- Encyclopedia of Ecology, Elsevier, 2008, 978-0-08-045400-9. ⟨10.1016/B978-008045405-4.00217-2⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Modélisation et simulation de l'architecture et de la production végétales
- auteur
- Philippe de Reffye, Daniel Barthélémy, Paul-Henry P.-H. Cournède, Marc Jaeger
- article
- Aux origines des plantes : des plantes anciennes à la botanique du XXIe siècle, Fayard, 2008, 978-2-213-62836-3
- Accès au bibtex
-
- titre
- Modélisation et simulation de l'architecture et de la production végétales
- auteur
- Philippe de Reffye, Daniel Barthélémy, Paul-Henry Cournède, Marc Jaeger
- article
- Francis Hallé. Aux origines des plantes : des plantes anciennes à la botanique du XXIe siècle, Fayard, pp.184-227, 2008
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-
- titre
- Plant growth models
- auteur
- Philippe de Reffye, E. Heuvelink, Daniel Barthélémy, Paul-Henry Cournède
- article
- Jorgensen, S. E., Fath, B. D. Encyclopedia of Ecology, Elsevier, pp.2824-2838, 2008
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-
Reports
- titre
- A Markovian framework to formalize stochastic L-systems and application to models of plant development
- auteur
- Cédric Loi, Paul-Henry Cournède
- article
- [Research Report] RR-6830, INRIA. 2008, pp.24
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Computing the moments of probability distributions for branching processes
- auteur
- Cédric Loi, Paul-Henry Cournède
- article
- [Research Report] RR-6728, INRIA. 2008, pp.23
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-
Theses
- titre
- Adaptation of the GreenLab growth model to plants with complex architectures and multi-scale analysis of source-sink relationships for parametric identification.
- auteur
- Veronique Letort
- article
- Vegetal Biology. Ecole Centrale Paris, 2008. English. ⟨NNT : ⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2007
Journal articles
- titre
- Simulation and Visualisation of Functional Landscapes: Effects of the Water Resource Competition between Plants
- auteur
- Vincent Le Chevalier, Marc Jaeger, Xing Mei, Paul-Henry Cournède
- article
- Journal of Computer Science and Technology, 2007, 22 (6), pp.835-845. ⟨10.1007/s11390-007-9105-8⟩
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-
- titre
- GREENLAB-tomato: a 3D architectural model of tomato development
- auteur
- Qiao Xue Dong, L. L. Yang, Y. M. Wang, Jean-François Barczi, Philippe de Reffye
- article
- New Zealand Journal of Agricultural Research, 2007, 50 (5), pp.1229-1233. ⟨10.1080/00288230709510406⟩
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-
Conference papers
- titre
- Is it possible to simulate rapeseed organ mass in relation to N nutrition ? Calibration of the functional-structural model GREENLAB for the oilseed rape Brassica napus L. during the vegetative phase for two nitrogen nutrition levels
- auteur
- Alexandra Jullien, Jean Michel Allirand, Paul-Henry P.-H. Cournède, A. Matthieu, P. de Reffye, Bertrand Ney
- article
- 12. International Rapeseed Congress, Mar 2007, Wuhan, China
- Accès au bibtex
-
2006
Journal articles
- titre
- A dynamical model of plant growth with full retroaction between organogenesis and photosynthesis
- auteur
- Amélie Rostand-Mathieu, Paul-Henry Cournède, Philippe de Reffye
- article
- Revue Africaine de Recherche en Informatique et Mathématiques Appliquées, 2006, 7ème Colloque Africain sur la Recherche en Informatique (CARI'04), Volume 4, 2006, pp.101-107. ⟨10.46298/arima.1844⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Parameter Stability of the Functional Structural Plant Model GREENLAB as Affected by Variation within Populations, among Seasons and among Growth Stages
- auteur
- Yuntao Ma, Baoguo Li, Zhigang Zhan, Yan Guo, Delphine Luquet, Philippe de Reffye, Michael Dingkuhn
- article
- Annals of Botany, 2006, Annals of Botany, 99 (1), pp.61-73. ⟨10.1093/aob/mcl245⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Building Virtual Chrysanthemum Based on Sink-Source Relationships: Preliminary Results
- auteur
- M. Z. Kang, E. Heuvelink, Philippe de Reffye
- article
- Acta Horticulturae, 2006, Acta Horticulturae, 718, pp.129-136
- Accès au bibtex
-
- titre
- Parameter Optimization and Field Validation of the Functional-Structural Model GREENLAB for Maize
- auteur
- Y. Guo, Y.T. Ma, Z.G. Zhan, B.G. Li, M. Dingkuhn, D. Luquet, Philippe de Reffye
- article
- Annals of Botany, 2006, Annals of Botany, 97, pp.217-230. ⟨10.1093/aob/mcj033⟩
- Accès au bibtex
-
- titre
- Structural Factorization of Plants to Compute their Functional and Architectural Growth
- auteur
- Paul-Henry Cournède, M.Z. Kang, A. Mathieu, Jean-François Barczi, H.P. Yan, B.G. Hu, Philippe de Reffye
- article
- SIMULATION: Transactions of The Society for Modeling and Simulation International, 2006, Simulation,Transactions of the society for modelling and simulation international, 82 (7), pp.427-438. ⟨10.1177/0037549706069341⟩
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- titre
- Positivity statements for a Mixed-Element-Volume scheme on fixed and moving grids
- auteur
- Bruno Koobus, Paul-Henry Cournède, Alain Dervieux
- article
- Revue Européenne de Mécanique Numérique/European Journal of Computational Mechanics, 2006, 15 (7-8), pp.767-798. ⟨10.3166/remn.15.767-798⟩
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Conference papers
- titre
- Adaptation of the GreenLab model for analyzing sink-source relationships in Chinese Pine saplings
- auteur
- Hong Guo, Veronique Letort, Lingxia Hong, Thierry Fourcaud, Paul-Henry Cournède, Yuanchang Lu, Philippe de Reffye
- article
- PMA06, Plant growth modeling, Simulation, Visualization and Applications, Nov 2006, Beijing, China. pp.236-243
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- titre
- Generation of rhythms in plant development controlled by their functioning: theoretical and numerical study
- auteur
- Amélie Mathieu, Paul-Henry Cournède, Daniel Barthélémy, Philippe de Reffye
- article
- 2. International Symposium on Plant Growth Modeling, Simulation, Visualization and Applications, Nov 2006, Beijing, China
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- titre
- Rhythms and alternating patterns in plants as emergent properties of a model of interaction between development and functioning
- auteur
- Amélie Mathieu, Paul-Henry Cournède, Daniel Barthélémy, Philippe de Reffye
- article
- Second International Symposium on Plant Growth Modeling, Simulation, Visualization and Applications, PMA06, Nov 2006, Beijin, China. ⟨10.1093/aob/mcm171⟩
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- titre
- Effect of topological and phenological changes on biomass partitioning in Arabidopsis thaliana inflorescence: a preliminary model-based study
- auteur
- Veronique Letort, Paul-Henry Cournède, Jérémie Lecoeur, Irène Hummel, Philippe de Reffye, Angélique Christophe
- article
- PMA06, Plant Growth Modeling, Simulation, Visualization and applications, Nov 2006, Beijing, China. pp.65-69
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- titre
- Optimizing plant growth model parameters for genetic selection based on QTL mapping
- auteur
- Veronique Letort, Paul Mahe, Paul-Henry Cournède, P. de Reffye, Brigitte Courtois
- article
- Plant Growth Modeling, Simulation, Visualization and applications, Nov 2006, Beijing, China. pp.16-21
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- titre
- GreenScilab:A toolbox simulating plant growth in the Scilab environment
- auteur
- M.Z. Kang, R. Qi, Philippe de Reffye, B.G. Hu
- article
- 8th Middle Eastern Simulation Multiconference, Aug 2006, Alexandria / Egypt, Egypt. pp.174-178
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- titre
- A Mathematical Approach Estimating Source and Sink Functioning of Competing Organs
- auteur
- M.Z. Kang, Philippe de Reffye
- article
- Proceedings of the Frontis Workshop on Functional -structural Plant Modelling in Crop Production, Wageningen University and Research Centre, Mar 2006, Wageningen / Netherlands, Netherlands. pp.65-75
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2005
Journal articles
- titre
- A Water Supply Optimization Problem for Plant Growth Based on GreenLab Model
- auteur
- Lin Wu, Philippe de Reffye, Bao-Gang Hu, François-Xavier Le Dimet, Paul-Henry Cournède
- article
- Revue Africaine de Recherche en Informatique et Mathématiques Appliquées, 2005, Volume 3, Special Issue CARI'04, november 2005, pp.197-207. ⟨10.46298/arima.1836⟩
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- titre
- GreenLab: A Dynamical Model of Plant Growth for Environmental Applications
- auteur
- Paul-Henry Cournède, Philippe de Reffye
- article
- ERCIM News, 2005, Special : Environmental Modelling, 61, pp.39-40
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2004
Journal articles
- titre
- Fast Construction of Geometrical Structure of Plant with Substructures Algorithm
- auteur
- M. Z. Kang, Philippe de Reffye, B.G. Hu, X. Zhao
- article
- International Journal of Image and Graphics, 2004, 9 (1), pp.79-86
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- titre
- A dynamic, architectural plant model simulating resource-dependent growth
- auteur
- Hongping Yan, Meng Zhen Kang, Philippe de Reffye, Michael Dingkuhn
- article
- Annals of Botany, 2004, Annals of Botany, 93, pp.591-602
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Conference papers
- titre
- Theoretical Study and Numerical Simulation of a Stochastic Model for Plant Growth
- auteur
- M.Z. Kang, Paul-Henry Cournède, J. Le Roux, Philippe de Reffye, B.G. Hu
- article
- 7th African Conference on Research in Computer Science, Nov 2004, Hammamet, Tunisia
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- titre
- A Water Supply Optimization Problem for Plant Growth Based on GreenLab Model
- auteur
- L. Wu, François-Xavier Le Dimet, B.G. Hu, Paul-Henry Cournède, Philippe de Reffye
- article
- 7éme Colloque Africain sur la Recherche en Informatique (CARI'04), Nov 2004, Mammamet, Tunisia
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- titre
- The Influence of Photosynthesis on the Number of Metamers per Growth Unit in GreenLab Model
- auteur
- Amelie Mathieu, Paul-Henry Cournède, Philippe de Reffye
- article
- 4TH International Workshop on Functional-Structural Plant Models, Jun 2004, Montpellier, France
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