Publications HAL de lapaque ; Doré ; Mondot ; Van de Guchte ; Juste ; Larraufie ; Béra-Maillet; Hanouchi du labo/EPI Micalis

2023

Journal articles

titre
Evolution of T cell receptor beta loci in salmonids
auteur
Pierre Boudinot, Samuel Novas, Luc Jouneau, Stanislas Mondot, Marie-Paule Lefranc, Unni Grimholt, Susana Magadán
article
Frontiers in Immunology, 2023, 14, ⟨10.3389/fimmu.2023.1238321⟩
DOI
DOI : 10.3389/fimmu.2023.1238321
Accès au bibtex
BibTex
titre
Adlercreutzia equolifaciens Is an Anti-Inflammatory Commensal Bacterium with Decreased Abundance in Gut Microbiota of Patients with Metabolic Liver Disease
auteur
Florian Plaza Oñate, Célia Chamignon, Sebastian Burz, Nicolas Lapaque, Magali Monnoye, Catherine Philippe, Maxime Bredel, Laurent Chêne, William Farin, Jean-Michel Paillarse, Jérome Boursier, Vlad Ratziu, Pierre-Yves Mousset, Joël Doré, Philippe Gérard, Hervé Blottière
article
International Journal of Molecular Sciences, 2023, 24 (15), pp.12232. ⟨10.3390/ijms241512232⟩
DOI
DOI : 10.3390/ijms241512232
Accès au bibtex
BibTex
titre
Transinteractome analysis reveals distinct niche requirements for isotype‐based plasma cell subsets in the bone marrow
auteur
Amélie Bonaud, Pierre Larraufie, Mélanie Khamyath, Ugo Szachnowski, Shaun M Flint, Nadège geraldine Brunel‐meunier, François Delhommeau, Annie Munier, Tapio Lönnberg, Claire Toffano‐nioche, Daniel Gautheret, Karl Balabanian, Marion Espéli
article
European Journal of Immunology, 2023, ⟨10.1002/eji.202250334⟩
DOI
DOI : 10.1002/eji.202250334
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-04145276/file/Eur%20J%20Immunol%20-%202023%20-%20Bonaud%20-%20Transinteractome%20analysis%20reveals%20distinct%20niche%20requirements%20for%20isotype%E2%80%90based%20plasma%20cell.pdf BibTex
titre
Regulation of enteroendocrine cell respiration by the microbial metabolite hydrogen sulfide
auteur
Pierre Larraufie, Kenza Haroun, Carla Fleury, Mireille Andriamihaja, François Blachier
article
Frontiers in Endocrinology, 2023, 14, ⟨10.3389/fendo.2023.1123364⟩
DOI
DOI : 10.3389/fendo.2023.1123364
Accès au texte intégral et bibtex
https://agroparistech.hal.science/hal-04120706/file/Larraufie_regulation%20of%20EEC%20respiration%20by%20microbial%20metabolite%20H2S_Frontiers%20endo_final.pdf BibTex
titre
Single-Donor and Pooling Strategies for Fecal Microbiota Transfer Product Preparation in Ulcerative Colitis: A Systematic Review and Meta-analysis
auteur
Benoît Levast, Mathieu Fontaine, Stéphane Nancey, Pierre Dechelotte, Joël Doré, Philippe Lehert
article
Clinical and translational gastroenterology, 2023, 14 (5), pp.e00568. ⟨10.14309/ctg.0000000000000568⟩
DOI
DOI : 10.14309/ctg.0000000000000568
Accès au bibtex
BibTex
titre
Improving care for patients with Clostridioides difficile infection: A clinical practice and healthcare systems perspective
auteur
Lucy Hocking, Mark Wilcox, Nicola Petrosillo, Paul Griffin, Theodore Steiner, Gail Attara, Joel Doré, Mark Cabling, Stephanie Stockwell, Robert J Romanelli, Sonja Marjanovic
article
Frontiers in Medicine, 2023, 9, pp.1033417. ⟨10.3389/fmed.2022.1033417⟩
DOI
DOI : 10.3389/fmed.2022.1033417
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inrae.fr/hal-04297380/file/2023_Hocking_Front_Med.pdf BibTex
titre
Association of gut‐specific non‐inflammatory T lymphocytes with chronic anorexia nervosa and constitutional thinness
auteur
Tristan Gabriel, Catherine Massoubre, Mouna Hanachi, Joel Doré, Claude Lambert, Natacha Germain, Bogdan Galusca, Stephane Paul
article
European Eating Disorders Review, 2023, 31 (1), pp.76-86. ⟨10.1002/erv.2934⟩
DOI
DOI : 10.1002/erv.2934
Accès au bibtex
BibTex
titre
Impact of Oral Administration of Lactiplantibacillus plantarum Strain CNCM I−4459 on Obesity Induced by High-Fat Diet in Mice
auteur
Elsa Jacouton, Stanislas Mondot, Philippe Langella, Luis Bermúdez-Humarán
article
Bioengineering, 2023, 10 (10), pp. 1151. ⟨10.3390/bioengineering10101151⟩
DOI
DOI : 10.3390/bioengineering10101151
Accès au bibtex
BibTex
titre
From In Vitro to In Vivo: A Rational Flowchart for the Selection and Characterization of Candidate Probiotic Strains in Intestinal Disorders
auteur
Flore Maillard, Maëva Meynier, Stanislas Mondot, Frederic Pepke, Chloé Galbert, Edgar Torres Maravilla, Camille Kropp, Harry Sokol, Frédéric Antonio Carvalho, Elsa Jacouton, Sophie Holowacz, Philippe Langella, Florian Chain, Rebeca Martín
article
Microorganisms, 2023, 11 (4), pp 906. ⟨10.3390/microorganisms11040906⟩
DOI
DOI : 10.3390/microorganisms11040906
Accès au bibtex
BibTex
titre
Fecal microbiota transplantation compared with prednisolone in severe alcoholic hepatitis patients: a randomized trial
auteur
Apurva Pande, Shvetank Sharma, Vikas Khillan, Archana Rastogi, Vinod Arora, Saggere Muralikrishna Shasthry, Rajan Vijayaraghavan, Rakesh Jagdish, Manoj Kumar, Guresh Kumar, Stanislas Mondot, Joél Dore, Shiv Sarin
article
Hepatology international, 2023, 17 (1), pp.249-261. ⟨10.1007/s12072-022-10438-0⟩
DOI
DOI : 10.1007/s12072-022-10438-0
Accès au bibtex
BibTex

2022

Journal articles

titre
Synergistic effects of Lacticaseibacillus rhamnosus GG, glutamine, and curcumin on chronic unpredictable mild stress-induced depression in a mouse model
auteur
P. Faucher, A. Dries, P.Y. Mousset, M. Leboyer, J. Dore, D. Beracochea
article
Beneficial Microbes, 2022, 13 (3), pp.253-264. ⟨10.3920/BM2021.0188⟩
DOI
DOI : 10.3920/BM2021.0188
Accès au bibtex
BibTex
titre
Exposure to anti-seizure medications impact growth of gut bacterial species and subsequent host response
auteur
Zehra Esra Ilhan, Vincent Brochard, Nicolas Lapaque, Stéphane Auvin, Patricia Lepage
article
Neurobiology of Disease, 2022, 167, pp.105664. ⟨10.1016/j.nbd.2022.105664⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.nbd.2022.105664
Accès au bibtex
BibTex
titre
Long-Term Anxiety-like Behavior and Microbiota Changes Induced in Mice by Sublethal Doses of Acute Sarin Surrogate Exposure
auteur
Sabine François, Stanislas Mondot, Quentin Gerard, Rosalie Bel, Julie Knoertzer, Asma Berriche, Sophie Cavallero, Rachid Baati, Cyrille Orset, Gregory Dal Bo, Karine Thibault
article
Biomedicines, 2022, 10 (5), pp.1-21. ⟨10.3390/biomedicines10051167⟩
DOI
DOI : 10.3390/biomedicines10051167
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inrae.fr/hal-03812359/file/2022_Fran%C3%A7ois_MDPI%20biomedicines.pdf BibTex
titre
Underlying evidence for the health benefits of fermented foods in humans
auteur
F. Rul, C. Béra-Maillet, Marie-Christine Champomier-Vergès, Kamel-Eddine El Mecherfi, B. Foligné, Marie-Caroline Michalski, D. Milenkovic, I. Savary-Auzeloux
article
Food and Function, 2022, 13 (9), pp.4804-4824. ⟨10.1039/D1FO03989J⟩
DOI
DOI : 10.1039/D1FO03989J
Accès au bibtex
BibTex
titre
Modern Metaproteomics: A Unique Tool to Characterize the Active Microbiome in Health and Diseases, and Pave the Road towards New Biomarkers—Example of Crohn’s Disease and Ulcerative Colitis Flare-Ups
auteur
Céline Henry, Ariane Bassignani, Magali Berland, Olivier Langella, Harry Sokol, Catherine Juste
article
Cells, 2022, 11 (8), pp.1340. ⟨10.3390/cells11081340⟩
DOI
DOI : 10.3390/cells11081340
Accès au bibtex
BibTex
titre
Roseburia, a decreased bacterial taxon in the gut microbiota of patients suffering from anorexia nervosa
auteur
Stanislas Mondot, Laurine Lachkar, Joël Doré, Hervé Blottière, Mouna Hanachi
article
European Journal of Clinical Nutrition, 2022, 76 (10), pp.1486-1489. ⟨10.1038/s41430-022-01116-3⟩
DOI
DOI : 10.1038/s41430-022-01116-3
Accès au bibtex
BibTex
titre
Exposure to anti-seizure medications impact growth of gut bacterial species and subsequent host response
auteur
Zehra Esra Ilhan, Vincent Brochard, Nicolas Lapaque, Stéphane Auvin, Patricia Lepage
article
Neurobiology of Disease, 2022, 167, pp.105664. ⟨10.1016/j.nbd.2022.105664⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.nbd.2022.105664
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inrae.fr/hal-03954506/file/2022_Ilhan_Exposure.pdf BibTex
titre
Changes in Gut Microbiota of Patients with Atopic Dermatitis During Balneotherapy
auteur
Florence Thirion, Susie Guilly, Sébastien Fromentin, Florian Plaza Oñate, Anne-Sophie Alvarez, Emmanuelle Le Chatelier, Nicolas Pons, Florence Levenez, Benoît Quinquis, Stanislav Dusko Ehrlich, Joel Doré, Richard Martin, Sophie Seité
article
Clinical, Cosmetic and Investigational Dermatology, 2022, 15, pp.163-176. ⟨10.2147/CCID.S342104⟩
DOI
DOI : 10.2147/CCID.S342104
Accès au bibtex
BibTex
titre
Long-term diosmectite use does not alter the gut microbiota in adults with chronic diarrhea
auteur
Kévin da Silva, Susie Guilly, Florence Thirion, Emmanuelle Le Chatelier, Nicolas Pons, Hugo Roume, Benoît Quinquis, Stanislav Ehrlich, Nassima Bekkat, Hélène Mathiex-Fortunet, Harry Sokol, Joël Doré
article
BMC Microbiology, 2022, 22 (1), pp. 54. ⟨10.1186/s12866-022-02464-7⟩
DOI
DOI : 10.1186/s12866-022-02464-7
Accès au texte intégral et bibtex
https://inserm.hal.science/inserm-03690762/file/s12866-022-02464-7.pdf BibTex
titre
Increasing the diversity of dietary fibers in a daily-consumed bread modifies gut microbiota and metabolic profile in subjects at cardiometabolic risk
auteur
H. Ranaivo, F. Thirion, C. Béra-Maillet, S. Guilly, C. Simon, M. Sothier, L. van den Berghe, N. Feugier-Favier, S. Lambert-Porcheron, I. Dussous, L. Roger, H. Roume, N. Galleron, N. Pons, E. Le Chatelier, S. D. Ehrlich, M. Laville, J. Doré, J. A. Nazare
article
Gut microbes, 2022, 14 (1), pp. 2044722. ⟨10.1080/19490976.2022.2044722⟩
DOI
DOI : 10.1080/19490976.2022.2044722
Accès au texte intégral et bibtex
https://inserm.hal.science/inserm-03755432/file/GutMicrobes2022Ranaivo.pdf BibTex
titre
Akkermansia muciniphila upregulates genes involved in maintaining the intestinal barrier function via ADP-heptose-dependent activation of the ALPK1/TIFA pathway
auteur
Camille Martin-Gallausiaux, Diego Garcia-Weber, Amandine Lashermes, Pierre Larraufie, Ludovica Marinelli, Veronica Teixeira, Alice Rolland, Fabienne Béguet-Crespel, Vincent Brochard, Timothé Quatremare, Alexandre Jamet, Joël Doré, Scott D Gray-Owen, Hervé M Blottière, Cécile Arrieumerlou, Nicolas Lapaque
article
Gut microbes, 2022, 14 (1), pp.2110639. ⟨10.1080/19490976.2022.2110639⟩
DOI
DOI : 10.1080/19490976.2022.2110639
Accès au texte intégral et bibtex
https://agroparistech.hal.science/hal-03787581/file/Akkermansia%20muciniphila%20upregulates%20genes%20involved%20in%20maintaining%20the%20intestinal%20barrier%20function%20via%20AD.pdf BibTex
titre
A combined test for feature selection on sparse metaproteomics data—an alternative to missing value imputation
auteur
Sandra Plancade, Magali Berland, Mélisande Blein-Nicolas, Olivier Langella, Ariane Bassignani, Catherine Juste
article
PeerJ, 2022, 10, pp.e13525. ⟨10.7717/peerj.13525⟩
DOI
DOI : 10.7717/peerj.13525
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-04146583/file/PlancadeBerland2022_combinedtest_metaproteo.pdf BibTex

2021

Journal articles

titre
Glucose but Not Fructose Alters the Intestinal Paracellular Permeability in Association With Gut Inflammation and Dysbiosis in Mice
auteur
Magali Monnoye, Xufei Zhang, Mahendra Mariadassou, Fabienne Beguet-Crespel, Nicolas Lapaque, Christine Heberden, Véronique Douard
article
Frontiers in Immunology, 2021, 12, ⟨10.3389/fimmu.2021.742584⟩
DOI
DOI : 10.3389/fimmu.2021.742584
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inrae.fr/hal-03634400/file/Glucose%20but%20Not%20Fructose-2021-12.pdf BibTex
titre
The Metaproteomics Initiative: a coordinated approach for propelling the functional characterization of microbiomes
auteur
Tim van den Bossche, Magnus Ø. Arntzen, Dörte Becher, Dirk Benndorf, Vincent G H Eijsink, Céline Henry, Pratik D Jagtap, Nico Jehmlich, Catherine Juste, Benoit J Kunath, Bart Mesuere, Thilo Muth, Phillip B Pope, Jana Seifert, Alessandro Tanca, Sergio Uzzau, Paul Wilmes, Robert L Hettich, Jean Armengaud
article
Microbiome, 2021, 9 (1), pp.243. ⟨10.1186/s40168-021-01176-w⟩
DOI
DOI : 10.1186/s40168-021-01176-w
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inrae.fr/hal-04127775/file/2021_Den%20Bossche_Microbiome.pdf BibTex
titre
Parasites and diet as main drivers of the Malagasy gut microbiome richness and function
auteur
Stanislas Mondot, Philippe Poirier, Ahmed Abou-Bacar, Valentin Greigert, Julie Brunet, Céline Nourrisson, Milijaona Randrianarivelojosia, Jean-Louis Razafindrakoto, Eugene Morel, Rivo Rakotomalala, Marion Leclerc, Karine Le Roux, Céline Monot, Ermanno Candolfi, Patricia Lepage
article
Scientific Reports, 2021, 11 (1), pp.1-11. ⟨10.1038/s41598-021-96967-4⟩
DOI
DOI : 10.1038/s41598-021-96967-4
Accès au bibtex
BibTex
titre
Impact of Antibiotic Therapies on Resistance Genes Dynamic and Composition of the Animal Gut Microbiota
auteur
Tony Rochegüe, Marisa Haenni, Stanislas Mondot, Chloé Astruc, Géraldine Cazeau, Tristan Ferry, Jean-Yves Madec, Agnese Lupo
article
Animals, 2021, 11 (11), pp.3280. ⟨10.3390/ani11113280⟩
DOI
DOI : 10.3390/ani11113280
Accès au texte intégral et bibtex
https://anses.hal.science/anses-03971764/file/Rochegue_ReviewMicrobiote_Animals2021.pdf BibTex
titre
Profiling the T Cell Receptor Alpha/Delta Locus in Salmonids
auteur
Eva Stina Isabella Edholm, Christopher Graham Fenton, Stanislas Mondot, Ruth Hracky Paulssen, Marie Paule Lefranc, Pierre Boudinot, Susana Magadan
article
Frontiers in Immunology, 2021, 12, ⟨10.3389/fimmu.2021.753960⟩
DOI
DOI : 10.3389/fimmu.2021.753960
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-03434949/file/2021_Edholm_fimmu.pdf BibTex
titre
Gut microbiota diversity after autologous fecal microbiota transfer in acute myeloid leukemia patients
auteur
Florent Malard, Anne Vekhoff, Simona Lapusan, Francoise Isnard, Evelyne d'Incan-Corda, Jérôme Rey, Colombe Saillard, Xavier Thomas, Sophie Ducastelle-Lepretre, Etienne Paubelle, Marie-Virginie Larcher, Clément Rocher, Christian Recher, Suzanne Tavitian, Sarah Bertoli, Anne-Sophie Michallet, Lila Gilis, Pierre Peterlin, Patrice Chevallier, Stéphanie Nguyen, Emilie Plantamura, Lilia Boucinha, Cyrielle Gasc, Mauricette Michallet, Joel Dore, Ollivier Legrand, Mohamad Mohty
article
Nature Communications, 2021, 12 (1), pp.3084. ⟨10.1038/s41467-021-23376-6⟩
DOI
DOI : 10.1038/s41467-021-23376-6
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-03239769/file/s41467-021-23376-6.pdf BibTex
titre
Gut microbiota changes after metabolic surgery in adult diabetic patients with mild obesity: a randomised controlled trial
auteur
Eva Lau, Eugeni Belda, Paul Picq, Davide Carvalho, Manuel Ferreira-Magalhães, Maria Manuel Silva, Isaac Barroso, Flora Correia, Cidália Pina Vaz, Isabel Miranda, Adelino Barbosa, Karine Clément, Joel Doré, Paula Freitas, Edi Prifti
article
Diabetology & Metabolic Syndrome, 2021, 13 (1), pp.56. ⟨10.1186/s13098-021-00672-1⟩
DOI
DOI : 10.1186/s13098-021-00672-1
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-03235902/file/s13098-021-00672-1.pdf BibTex
titre
Perturbed Microbiota/Immune Homeostasis in Multiple Sclerosis
auteur
Delphine Sterlin, Martin Larsen, Jehane Fadlallah, Christophe Parizot, Marina Vignes, Gaëlle Autaa, Karim Dorgham, Catherine Juste, Patricia Lepage, Jennifer Aboab, Savine Vicart, Elisabeth Maillart, Olivier Gout, Catherine Lubetzki, Romain Deschamps, Caroline Papeix, Guy Gorochov
article
Neurology Neuroimmunology & Neuroinflammation, 2021, 8 (4), pp.e997. ⟨10.1212/nxi.0000000000000997⟩
DOI
DOI : 10.1212/nxi.0000000000000997
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-03231028/file/e997.full.pdf BibTex
titre
An Oral FMT Capsule as Efficient as an Enema for Microbiota Reconstruction Following Disruption by Antibiotics, as Assessed in an In Vitro Human Gut Model
auteur
Cécile Verdier, Sylvain Denis, Cyrielle Gasc, Lilia Boucinha, Ophélie Uriot, Dominique Delmas, Joël Dore, Corentin Le Camus, Carole Schwintner, Stéphanie Blanquet-Diot
article
Microorganisms, 2021, 9, pp.358. ⟨10.3390/microorganisms9020358⟩
DOI
DOI : 10.3390/microorganisms9020358
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inrae.fr/hal-03138820/file/VERDIER_microorganisms_2021.pdf BibTex
titre
Dynamic Properties of the Intestinal Ecosystem Call for Combination Therapies, Targeting Inflammation and Microbiota, in Ulcerative Colitis
auteur
Maarten van de Guchte, Stanislas Mondot, Joël Doré
article
Gastroenterology, 2021, 161, pp.1969 - 1981.e12. ⟨10.1053/j.gastro.2021.08.057⟩
DOI
DOI : 10.1053/j.gastro.2021.08.057
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inrae.fr/hal-03634959/file/1-s2.0-S001650852103482X-main.pdf BibTex
titre
Benefits of Iterative Searches of Large Databases to Interpret Large Human Gut Metaproteomic Data Sets
auteur
Ariane Bassignani, Sandra Plancade, Magali Berland, Melisande Blein-Nicolas, Alain Guillot, Didier Chevret, Chloé Moritz, Sylvie Huet, Salwa Rizkalla, Karine Clément, Joël Doré, Olivier Langella, Catherine Juste
article
Journal of Proteome Research, 2021, 20 (3), pp.1522-1534. ⟨10.1021/acs.jproteome.0c00669⟩
DOI
DOI : 10.1021/acs.jproteome.0c00669
Accès au bibtex
BibTex
titre
Diet and gut microbiome interactions of relevance for symptoms in irritable bowel syndrome
auteur
Julien Tap, Stine Störsrud, Boris Le Nevé, Aurélie Cotillard, Nicolas Pons, Joël Doré, Lena Öhman, Hans Törnblom, Muriel Derrien, Magnus Simrén
article
Microbiome, 2021, 9 (1), ⟨10.1186/s40168-021-01018-9⟩
DOI
DOI : 10.1186/s40168-021-01018-9
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inrae.fr/hal-03825700/file/Tap_et_al_2021_Microbiome.pdf BibTex
titre
High engraftment capacity of frozen ready-to-use human fecal microbiota transplants assessed in germ-free mice
auteur
Magali Berland, Julie Cadiou, Florence Levenez, Nathalie Galleron, Benoît Quinquis, Florence Thirion, Franck Gauthier, Emmanuelle Le Chatelier, Florian Plaza Oñate, Carole Schwintner, Sylvie Rabot, Patricia Lepage, Dusko Ehrlich, Joël Doré, Catherine Juste
article
Scientific Reports, 2021, 11 (1), ⟨10.1038/s41598-021-83638-7⟩
DOI
DOI : 10.1038/s41598-021-83638-7
Accès au bibtex
BibTex
titre
Glucose but Not Fructose Alters the Intestinal Paracellular Permeability in Association With Gut Inflammation and Dysbiosis in Mice
auteur
Xufei Zhang, Magali Monnoye, Mahendra Mariadassou, Fabienne Beguet-Crespel, Nicolas Lapaque, Christine Heberden, Véronique Douard
article
Frontiers in Immunology, 2021, 12, ⟨10.3389/fimmu.2021.742584⟩
DOI
DOI : 10.3389/fimmu.2021.742584
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-04084527/file/fimmu-12-742584.pdf BibTex
titre
Genomic analysis of a second rainbow trout line (Arlee) leads to an extended description of the IGH VDJ gene repertoire
auteur
Susana Magadan, Stanislas Mondot, Yniv Palti, Guangtu Gao, Marie Paule Lefranc, Pierre Boudinot
article
Developmental and Comparative Immunology, 2021, 118, pp.103998. ⟨10.1016/j.dci.2021.103998⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.dci.2021.103998
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-03230900/file/S0145305X21000069.pdf BibTex
titre
Associations between untargeted plasma metabolomic signatures and gut microbiota composition in the Milieu Intérieur population of healthy adults
auteur
Valentin Partula, Mélanie Deschasaux-Tanguy, Stanislas Mondot, Agnès Victor-Bala, Nadia Bouchemal, Lucie Lecuyer, Christine Bobin-Dubigeon, Marion Torres, Emmanuelle Kesse-Guyot, Bruno Charbit, Etienne Patin, Karen Assmann, Paule Latino-Martel, Chantal Julia, Pilar Galan, Serge Hercberg, Lluis Quintana-Murci, Matthew Albert, Darragh Duffy, Olivier Lantz, Philippe Savarin, Mohamed Nawfal Triba, Mathilde Touvier, Consortium The Milieu Interieur
article
British Journal of Nutrition, 2021, 126 (7), pp. 982-992. ⟨10.1017/S0007114520004870⟩
DOI
DOI : 10.1017/S0007114520004870
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-03073792/file/2020_Partula_British%20J%20Nutrition.pdf BibTex
titre
Impact on the Gut Microbiota of Intensive and Prolonged Antimicrobial Therapy in Patients With Bone and Joint Infection
auteur
Benoit Levast, Nicolas Benech, Cyrielle Gasc, Cecile Batailler, Eric Senneville, Sebastien Lustig, Cecile Pouderoux, David Boutoille, Lilia Boucinha, Frederic-Antoine Dauchy, Valerie Zeller, Marianne Maynard, Charles Cazanave, Thanh-Thuy Le Thi, Jerome Josse, Joel Dore, Frederic Laurent, Tristan Ferry
article
Frontiers in Medicine, 2021, 8 (586875), ⟨10.3389/fmed.2021.586875⟩
DOI
DOI : 10.3389/fmed.2021.586875
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-03222293/file/BPH_FM_2021_Levast.pdf BibTex
titre
Short Chain Fatty Acids – mechanisms and functional importance in the gut
auteur
Camille Martin-Gallausiaux, Ludovica Marinelli, Herve H. Blottiere, Pierre Larraufie, Nicolas Lapaque
article
Proceedings of the Nutrition Society, 2021, 80 (1), pp. 37-49. ⟨10.1017/S0029665120006916⟩
DOI
DOI : 10.1017/S0029665120006916
Accès au texte intégral et bibtex
https://agroparistech.hal.science/hal-02536149/file/Short%20Chain%20Fatty%20Acids%20%E2%80%93%20mechanistic%20and%20functional%20actions.pdf BibTex
titre
Hemicellulosic biomass conversion by Moroccan hot spring Bacillus paralicheniformis CCMM B940 evidenced by glycoside hydrolase activities and whole genome sequencing
auteur
Soufiane Maski, Serigne Inssa Ngom, Bahia Rached, Taha Chouati, Mohamed Benabdelkhalek, Elmostafa El Fahime, Mohamed Amar, Christel Béra-Maillet
article
3 Biotech, 2021, 11 (8), pp. 379. ⟨10.1007/s13205-021-02919-0⟩
DOI
DOI : 10.1007/s13205-021-02919-0
Accès au bibtex
BibTex
titre
Cholesterol-to-Coprostanol Conversion by the Gut Microbiota : What We Know, Suspect, and Ignore
auteur
Catherine Juste, Philippe Gerard
article
Microorganisms, 2021, 9 (9), pp.1881. ⟨10.3390/microorganisms9091881⟩
DOI
DOI : 10.3390/microorganisms9091881
Accès au bibtex
BibTex

2020

Journal articles

titre
Alternative stable states in the intestinal ecosystem: proof of concept in a rat model and a perspective of therapeutic implications
auteur
Maarten van de Guchte, Sebastian D Burz, Julie Cadiou, Jiangbo Wu, Stanislas Mondot, Hervé M. Blottière, Joël Doré
article
Microbiome, 2020, 8 (1), pp.153. ⟨10.1186/s40168-020-00933-7⟩
DOI
DOI : 10.1186/s40168-020-00933-7
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inrae.fr/hal-03634946/file/s40168-020-00933-7.pdf BibTex
titre
Extracellular vesicles produced by the probiotic Propionibacterium freudenreichii CIRM-BIA 129 mitigate inflammation by modulating the NF-κB pathway
auteur
Vinicius de Rezende Rodovalho, Brenda Silva Rosa da Luz, Houem Rabah, Fillipe Luiz Rosa Do Carmo, Edson L Folador, Aurélie Nicolas, Julien Jardin, Valérie Briard-Bion, Herve Blottiere, Nicolas Lapaque, Gwénaël Jan, Yves Le Loir, Vasco Ariston de Carvalho Azevedo, Eric Guédon
article
Frontiers in Microbiology, 2020, 11, ⟨10.3389/fmicb.2020.01544⟩
DOI
DOI : 10.3389/fmicb.2020.01544
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inrae.fr/hal-02885846/file/Author%27s%20Proof%20Correction%201.pdf BibTex
titre
Associations between consumption of dietary fibers and the risk of cardiovascular diseases, cancers, type 2 diabetes, and mortality in the prospective NutriNet-Santé cohort
auteur
Valentin Partula, Mélanie Deschasaux, Nathalie Druesne-Pecollo, Paule Latino-Martel, Elisa Desmetz, Eloi Chazelas, Emmanuelle Kesse-Guyot, Chantal Julia, Léopold Fezeu, Pilar Galan, Serge Hercberg, Stanislas S. Mondot, Olivier Lantz, Lluis Quintana-Murci, Matthew Albert, Darragh Duffy, Bernard Srour, Mathilde Touvier
article
The American Journal of Clinical Nutrition, 2020, ⟨10.1093/ajcn/nqaa063⟩
DOI
DOI : 10.1093/ajcn/nqaa063
Accès au texte intégral et bibtex
https://pasteur.hal.science/pasteur-02641647/file/AJCN-D-19-00922R2_Main%20document_accepted.pdf BibTex
titre
Late weaning is associated with increased microbial diversity and Faecalibacterium prausnitzii abundance in the fecal microbiota of piglets
auteur
Francesca Romana Massacci, El Mostafa Berri, Gaetan Lemonnier, Elodie Guettier, Fany Blanc, Deborah Jardet, Marie-Noëlle Rossignol, Marie-José Mercat, Joël Dore, Patricia Lepage, Claire Rogel Gaillard, Jordi Estellé
article
Animal Microbiome, 2020, 2 (1), 12 p. ⟨10.1186/s42523-020-0020-4⟩
DOI
DOI : 10.1186/s42523-020-0020-4
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inrae.fr/hal-02620309/file/2020_Massacci_Animal%20Microbiome_1.pdf BibTex
titre
Investigating host-microbiome interactions by droplet based microfluidics
auteur
Alexandra S Tauzin, Mariana Rangel Pereira, Liisa D van Vliet, Pierre-Yves Colin, Elisabeth Laville, Jeremy Esque, Sandrine Laguerre, Bernard Henrissat, Nicolas Terrapon, Vincent Lombard, Marion Leclerc, Joël Doré, Florian Hollfelder, Gabrielle Potocki-Veronese
article
Microbiome, 2020, 8 (1), ⟨10.1186/s40168-020-00911-z⟩
DOI
DOI : 10.1186/s40168-020-00911-z
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inrae.fr/hal-02961383/file/Tauzin_Microbiome_2020.pdf BibTex
titre
Human IgA binds a diverse array of commensal bacteria
auteur
Delphine Sterlin, Jehane Fadlallah, Olivia Adams, Claire Fieschi, Christophe Parizot, Karim Dorgham, Asok Rajkumar, Gaëlle Autaa, Hela El-Kafsi, Jean-Luc L Charuel, Catherine Juste, Friederike Jönsson, Thomas Candela, Hedda Wardemann, Alexandra Aubry, Carmen Capito, Hélène Brisson, Christophe Trésallet, Richard D Cummings, Martin Larsen, Hans Yssel, Stephan von Gunten, Guy Gorochov
article
Journal of Experimental Medicine, 2020, 217 (3), pp.e20181635. ⟨10.1084/jem.20181635⟩
DOI
DOI : 10.1084/jem.20181635
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-02433421/file/Sterlin%20et%20al.%20-%202020%20-%20Human%20IgA%20binds%20a%20diverse%20array%20of%20commensal%20bacte.pdf BibTex
titre
Gut Microbiota Profile of Obese Diabetic Women Submitted to Roux-en-Y Gastric Bypass and Its Association with Food Intake and Postoperative Diabetes Remission
auteur
Karina Al Assal, Edi Prifti, Eugeni Belda, Priscila Sala, Karine Clement, Maria-Carlota Dao, Joël Dore, Florence Levenez, Carla R Taddei, Danielle Cristina Fonseca, Ilanna Marques Rocha, Bianca Depieri Balmant, Andrew Maltez Thomas, Marco A Santo, Emmanuel Dias-Neto, João Carlos Setubal, Jean-Daniel Zucker, Giliane Belarmino, Raquel Susana Torrinhas, Dan L Waitzberg
article
Nutrients, 2020, 12 (2), pp.278. ⟨10.3390/nu12020278⟩
DOI
DOI : 10.3390/nu12020278
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-02552682/file/nutrients-12-00278-v2.pdf BibTex

2019

Journal articles

titre
A comprehensive assessment of demographic, environmental, and host genetic associations with gut microbiome diversity in healthy individuals
auteur
Petar Scepanovic, Flavia Hodel, Stanislas S. Mondot, Valentin Partula, Allyson Byrd, Christian Hammer, Cécile Alanio, Jacob Bergstedt, Etienne Patin, Mathilde Touvier, Olivier Lantz, Matthew Albert, Darragh Duffy, Lluis Quintana-Murci, Jacques Fellay
article
Microbiome, 2019, 7 (1), pp.130. ⟨10.1186/s40168-019-0747-x⟩
DOI
DOI : 10.1186/s40168-019-0747-x
Accès au texte intégral et bibtex
https://pasteur.hal.science/pasteur-02307232/file/document.pdf BibTex
titre
Altered host-gut microbes symbiosis in severely malnourished anorexia nervosa (AN) patients undergoing enteral nutrition: An explicative factor of functional intestinal disorders?
auteur
Mouna Hanachi, Chaysavanh Manichanh, Andreu Schoenenberger, Victoria Pascal, Florence Levenez, Nicole Cournède, Joel Dore, Jean-Claude Melchior
article
Clinical Nutrition, 2019, 38 (5), pp.2304-2310. ⟨10.1016/j.clnu.2018.10.004⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.clnu.2018.10.004
Accès au bibtex
BibTex
titre
A Guide for Ex Vivo Handling and storage of stool samples Intended for Fecal Microbiota transplantation
auteur
Sebastian D Burz, Anne-Laure Abraham, Fernanda Fonseca, Olivier David, Audrey Chapron, Fabienne F. Beguet-Crespel, Stéphanie Cenard, Karine Le Roux, Florence Levenez, Carole Schwintner, Herve H. Blottiere, Christel Béra-Maillet, Patricia Lepage, Joel Dore, Catherine Juste
article
Scientific Reports, 2019, 9 (1), pp.8897. ⟨10.1038/s41598-019-45173-4⟩
DOI
DOI : 10.1038/s41598-019-45173-4
Accès au texte intégral et bibtex
https://agroparistech.hal.science/hal-02466120/file/s41598-019-45173-4.pdf BibTex
titre
Fructose malabsorption induces cholecystokinin expression in the ileum and cecum by changing microbiota composition and metabolism
auteur
Xufei Zhang, Alexandra Grosfeld, Edek Williams, Daniel Vasiliauskas, Sharon Barretto, Lorraine Smith, Mahendra Mariadassou, Catherine Philippe, Fabienne Devime, Chloé Melchior, Guillaume Gourcerol, Nathalie Dourmap, Nicolas Lapaque, Pierre Larraufie, Hervé Blottiere, Christine Herberden, Philippe Gerard, Jens F. Rehfeld, Ronaldo Ferraris, J Christopher Fritton, Sandrine Ellero-Simatos, Véronique Douard
article
FASEB Journal, 2019, 33 (6), pp.7126-7142. ⟨10.1096/fj.201801526RR⟩
DOI
DOI : 10.1096/fj.201801526RR
Accès au bibtex
BibTex
titre
Associations between usual diet and gut microbiota composition: results from the Milieu Intérieur cross-sectional study
auteur
Valentin Partula, Stanislas S. Mondot, Marion J. Torres, Emmanuelle Kesse-Guyot, Mélanie Deschasaux, Karen Assmann, Paule Latino-Martel, Camille Buscail, Chantal Julia, Pilar Galan, Serge Hercberg, Vincent Rouilly, Stéphanie Thomas, Lluis Quintana-Murci, Matthew Albert, Darragh Duffy, Olivier Lantz, Mathilde Touvier, Consortium The Milieu Interieur
article
The American Journal of Clinical Nutrition, 2019, 109 (5), pp.1472-1483. ⟨10.1093/ajcn/nqz029⟩
DOI
DOI : 10.1093/ajcn/nqz029
Accès au bibtex
BibTex
titre
Intestinal translocation of enterococci requires a threshold level of enterococcal overgrowth in the lumen
auteur
Cristel Archambaud, Aurelie Derre-Bobillot, Nicolas Lapaque, Lionel Rigottier-Gois, Pascale P. Serror
article
Scientific Reports, 2019, 9 (1), ⟨10.1038/s41598-019-45441-3⟩
DOI
DOI : 10.1038/s41598-019-45441-3
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inrae.fr/hal-02618379/file/2019-Archambaud_Sci%20Rep_1.pdf BibTex
titre
Mucosal healing and bacterial composition in response to enteral nutrition versus steroid based induction therapy - a randomized prospective clinical trial in children with Crohn's disease
auteur
Bénédicte Pigneur, Patricia Lepage, Stanislas Mondot, Jacques Schmitz, Olivier Goulet, Joel Dore, Frank M. Ruemmele
article
Journal of Crohn's and Colitis, 2019, 13 (7), pp.846-855. ⟨10.1093/ecco-jcc/jjy207⟩
DOI
DOI : 10.1093/ecco-jcc/jjy207
Accès au bibtex
BibTex
titre
Akkermansia muciniphila abundance is lower in severe obesity, but its increased level after bariatric surgery is not associated with metabolic health improvement
auteur
Maria Carlota Dao, Eugeni Belda, Edi Prifti, Amandine Everard, Brandon D Kayser, Jean-Luc Bouillot, Jean-Marc Chevallier, Nicolas Pons, Emmanuelle Le Chatelier, Stanislav Dusko Ehrlich, Joël Dore, Judith Aron-Wisnewsky, Jean-Daniel Zucker, Patrice D. Cani, Karine Clement
article
AJP - Endocrinology and Metabolism, 2019, 317 (3), pp.E446-E459. ⟨10.1152/ajpendo.00140.2019⟩
DOI
DOI : 10.1152/ajpendo.00140.2019
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-02305445/file/Dao%20et%20al.%20-%202019%20-%20Akkermansia%20muciniphila%20abundance%20is%20lower%20in%20seve.pdf BibTex
titre
A mix of dietary fermentable fibers improves lipids handling by the liver of overfed minipigs
auteur
Ahmed Ben Mohamed, Didier Remond, Christophe Chambon, Thierry Sayd, Michel Hébraud, Frédéric Capel, Benoit Cohade, Noureddine Hafnaoui, Daniel Béchet, Cécile Coudy-Gandilhon, Carole Migné, Jérémie David, Dominique Dardevet, Joel Dore, Sergio Polakof, Isabelle Savary-Auzeloux
article
Journal of Nutritional Biochemistry, 2019, 65, pp.72-82. ⟨10.1016/j.jnutbio.2018.12.002⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.jnutbio.2018.12.002
Accès au bibtex
BibTex
titre
A Data Integration Multi-Omics Approach to Study Calorie Restriction-Induced Changes in Insulin Sensitivity
auteur
Maria Carlota Dao, Nataliya Sokolovska, Rémi Brazeilles, Séverine Affeldt, Véronique Pelloux, Edi Prifti, Julien Chilloux, Eric O. Verger, Brandon D Kayser, Judith Aron-Wisnewsky, Farid Ichou, Estelle Pujos-Guillot, Lesley Hoyles, Catherine Juste, Joël Doré, Marc-Emmanuel Dumas, Salwa W Rizkalla, Bridget A Holmes, Jean-Daniel Zucker, Karine Clément
article
Frontiers in Physiology, 2019, 9, pp.1958. ⟨10.3389/fphys.2018.01958⟩
DOI
DOI : 10.3389/fphys.2018.01958
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-02042331/file/fphys-09-01958.pdf BibTex
titre
Identification of the novel role of butyrate as AhR ligand in human intestinal epithelial cells
auteur
Ludovica Marinelli, Camille Martin-Gallausiaux, Jean-Marie Bourhis, Fabienne Beguet-Crespel, Herve Blottiere, Nicolas Lapaque
article
Scientific Reports, 2019, 9 (1), pp.643. ⟨10.1038/s41598-018-37019-2⟩
DOI
DOI : 10.1038/s41598-018-37019-2
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-01996381/file/s41598-018-37019-2.pdf BibTex
titre
Synergistic convergence of microbiota-specific systemic IgG and secretory IgA
auteur
Karim Dorgham, Hela El Kafsi, Sébastien Andre, Eric Oksenhendler, Jehane Fadlallah, Delphine Sterlin, Claire Fieschi, Christophe Parizot, Gaëlle Autaa, Pascale Ghillani-Dalbin, Catherine Juste, Patricia Lepage, Marion Malphettes, Lionel Galicier, David Boutboul, Karine Clement, Florian Marquet, Christophe Trésallet, Alexis Mathian, Makoto Miyara, Zahir Amoura, Hans Yssel, Martin Larsen, Guy Gorochov
article
Journal of Allergy and Clinical Immunology, 2019, 143 (4), pp.1575-1585.e4. ⟨10.1016/j.jaci.2018.09.036⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.jaci.2018.09.036
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-02171187/file/IgG-A_convergence_final_revu.pdf BibTex
titre
The T cell receptor (TRA) locus in the rabbit (Oryctolagus cuniculus): Genomic features and consequences for invariant T cells
auteur
Stanislas Mondot, Olivier Lantz, Marie-Paule Lefranc, Pierre Boudinot
article
European Journal of Immunology, 2019, ⟨10.1002/eji.201948228⟩
DOI
DOI : 10.1002/eji.201948228
Accès au bibtex
BibTex
titre
Porphyromonas, a potential predictive biomarker of Pseudomonas aeruginosa pulmonary infection in cystic fibrosis
auteur
Marlène Keravec, Jérôme Mounier, Charles-Antoine Guilloux, Marie-Sarah Fangous, Stanislas Mondot, Sophie Vallet, Stéphanie Gouriou, Rozenn Le Berre, Gilles Rault, Claude Férec, Georges Barbier, Patricia Lepage, Geneviève Hery-Arnaud
article
BMJ open respiratory research, 2019, 6 (1), pp.e000374. ⟨10.1136/bmjresp-2018-000374⟩
DOI
DOI : 10.1136/bmjresp-2018-000374
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inrae.fr/hal-02625944/file/2019_Keravec_Open%20Respiratory%20Res_1.pdf BibTex

2018

Journal articles

titre
Butyrate produced by commensal bacteria down-regulates indolamine 2, 3-dioxygenase 1 (IDO-1) expression via a dual mechanism in human intestinal epithelial cells
auteur
Camille Martin-Gallausiaux, Pierre Larraufie, Anne Jarry, Fabienne F. Beguet-Crespel, Ludovica Marinelli, Florence Ledue, Frank Reimann, Herve H. Blottiere, Nicolas Lapaque
article
Frontiers in Immunology, 2018, 9, ⟨10.3389/fimmu.2018.02838⟩
DOI
DOI : 10.3389/fimmu.2018.02838
Accès au texte intégral et bibtex
https://inserm.hal.science/inserm-01937996/file/Front%20Immunol%20in%20press.PDF BibTex
titre
Microbial ecology perturbation in human IgA deficiency
auteur
Jehane Fadlallah, Hela El Kafsi, Delphine Sterlin, Catherine Juste, Christophe Parizot, Karim Dorgham, Gaëlle Autaa, Doriane Gouas, Mathieu Almeida, Patricia Lepage, Nicolas Pons, Emmanuelle Le Chatelier, Florence Levenez, Sean Kennedy, Nathalie N. Galleron, Jean-Paul Pais de Barros, Marion Malphettes, Lionel Galicier, David Boutboul, Alexis Mathian, Makoto Miyara, Eric Oksenhendler, Zahir Amoura, Joel Dore, Claire Fieschi, S. Dusko Ehrlich, Martin Larsen, Guy Gorochov
article
Science Translational Medicine, 2018, 10 (439), pp.eaan1217. ⟨10.1126/scitranslmed.aan1217⟩
DOI
DOI : 10.1126/scitranslmed.aan1217
Accès au texte intégral et bibtex
https://u-bourgogne.hal.science/hal-01997107/file/Fadlallah%20et%20al.%20-%202018%20-%20Microbial%20ecology%20perturbation%20in%20human%20IgA%20defici.pdf BibTex
titre
Humans as holobionts: implications for prevention and therapy
auteur
Maarten van de Guchte, Herve Blottiere, Joel Dore
article
Microbiome, 2018, 6, pp.1-6. ⟨10.1186/s40168-018-0466-8⟩
DOI
DOI : 10.1186/s40168-018-0466-8
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inrae.fr/hal-02625522/file/2018_Van%20de%20Guchte_Microbiome_1.pdf BibTex
titre
SCFAs strongly stimulate PYY production in human enteroendocrine cells
auteur
Pierre Larraufie, Camille Martin-Gallausiaux, Nicolas Lapaque, Joel Dore, F. M. Gribble, F. Reimann, Herve Blottiere
article
Scientific Reports, 2018, 8, pp.1-9. ⟨10.1038/s41598-017-18259-0⟩
DOI
DOI : 10.1038/s41598-017-18259-0
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inrae.fr/hal-02628091/file/2018_Larraufie_Scientific%20Reports_1.pdf BibTex
titre
Butyrate produced by gut commensal bacteria activates TGF-beta1 expression through the transcription factor SP1 in human intestinal epithelial cells
auteur
Camille Martin-Gallausiaux, Fabienne Beguet-Crespel, Ludovica Marinelli, Alexandre Jamet, Florence Ledue, Herve Blottiere, Nicolas Lapaque
article
Scientific Reports, 2018, 8, pp.1-13. ⟨10.1038/s41598-018-28048-y⟩
DOI
DOI : 10.1038/s41598-018-28048-y
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inrae.fr/hal-02624971/file/2018_Martin-Gallausiaux_Scientific%20Reports_1.pdf BibTex
titre
High gastrointestinal microbial diversity and clinical outcome in graft-versus-host disease patients
auteur
Florent Malard, Cyrielle Gasc, Emilie Plantamura, Joel Dore
article
Bone Marrow Transplantation, 2018, 53 (12), pp.1493-1497. ⟨10.1038/s41409-018-0254-x⟩
DOI
DOI : 10.1038/s41409-018-0254-x
Accès au bibtex
BibTex
titre
High gastrointestinal microbial diversity and clinical outcome in graft-versus-host disease patients
auteur
Florent Malard, Cyrielle Gasc, Benoît Levast, Emilie Plantamura, Joel Dore
article
Hématologie, 2018, 24 (6), pp.376-383. ⟨10.1684/hma.2019.1402⟩
DOI
DOI : 10.1684/hma.2019.1402
Accès au bibtex
BibTex
titre
The gut microbiota drives the impact of bile acids and fat source in diet on mouse metabolism
auteur
Sarah Just, Stanislas Mondot, Josef Ecker, Katrin Wegner, Eva Rath, Laura Gau, Theresa Streidl, Genevieve Hery Arnaud, Sinah Schmidt, Till Robin Lesker, Valentin Bieth, Andreas Dunkel, Till Strowig, Thomas Hofmann, Dirk Haller, Gerhard Liebisch, Philippe Gérard, Sascha Rohn, Patricia Lepage, Thomas Clavel
article
Microbiome, 2018, 6, pp.1-18. ⟨10.1186/s40168-018-0510-8⟩
DOI
DOI : 10.1186/s40168-018-0510-8
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-01860016/file/2018_Just_Microbiome.pdf BibTex
titre
Identification of New Factors Modulating Adhesion Abilities of the Pioneer Commensal Bacterium Streptococcus salivarius
auteur
Benoit Couvigny, Saulius Kulakauskas, Nicolas Pons, Benoit Quinquis, Anne-Laure Abraham, Thierry Meylheuc, Christine Delorme, Pierre Renault, Romain Briandet, Nicolas Lapaque, Eric Guédon
article
Frontiers in Microbiology, 2018, 9 (article 273), ⟨10.3389/fmicb.2018.00273⟩
DOI
DOI : 10.3389/fmicb.2018.00273
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-01713777/file/fmicb-09-00273.pdf BibTex
titre
Enteric delivery of regenerating family member 3 alpha alters the intestinal microbiota and controls inflammation in mice with colitis
auteur
Marion Darnaud, Alexandre dos Santos, Patrick Gonzalez, Sandrine Augui, Claire Lacoste, Christophe Desterke, Gert de Hertogh, Emma Valentino, Emilie Braun, Jinzi Zheng, Raphaël Boisgard, Christel Neut, Laurent Dubuquoy, Franck Chiappini, Didier Samuel, Patricia Lepage, Francesca Guerrieri, Joel Dore, Christian Bréchot, Nicolas Moniaux, Jamila Faivre
article
Gastroenterology, 2018, 154 (4), pp.1009 -1037. ⟨10.1053/j.gastro.2017.11.003⟩
DOI
DOI : 10.1053/j.gastro.2017.11.003
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inrae.fr/hal-02626272/file/1-s2.0-S0016508517363497-main.pdf BibTex
titre
Nouveaux dispositifs médicaux et nouveau procédé de fabrication pour un transfert de microbiote fécal par voie rectale, sans risque, standardisé et prêt à l’emploi
auteur
Jean-François Dubuisson, Catherine Juste, Fernanda Fonseca, Patricia Lepage, Christel Béra Maillet, Fabienne Beguet-Crespel, Karine Le Roux, Sébastian Burz, Florence Levenez, Alice Leroux, Lilia Boucinha, Alicia Deprez, Carole Schwintner, Sebastien Dussurgey, Thibault Andrieu, Herve Affagard, Herve Blottiere, Pierre Bourlioux, Joel Dore
article
Journal de Pharmacie Clinique, 2018, 37 (2), pp.73-83
Accès au bibtex
BibTex

2017

Journal articles

titre
Three glycosylated serine-rich repeat proteins play a pivotal role in adhesion and colonization of the pioneer commensal bacterium, Streptococcus salivarius
auteur
Benoit Couvigny, Nicolas N. Lapaque, Lionel Rigottier-Gois, Alain Guillot, Sophie Chat, Thierry Meylheuc, Saulius Kulakauskas, Manfred Rohde, Michel-Yves Mistou, Pierre Renault, Joel Doré, Romain Briandet, Pascale Serror, Eric Guédon
article
Environmental Microbiology, 2017, 19 (9), pp.3579-3594. ⟨10.1111/1462-2920.13853⟩
DOI
DOI : 10.1111/1462-2920.13853
Accès au bibtex
BibTex
titre
Commensal gut bacteria modulate phosphorylation-dependent PPAR gamma transcriptional activity in human intestinal epithelial cells
auteur
Malgorzata Nepelska, Tomas T. de Wouters, Elsa Jacouton, Fabienne Beguet-Crespel, Nicolas Lapaque, Joel Dore, Velmurugesan Arulampalam, Herve Blottiere
article
Scientific Reports, 2017, 7, ⟨10.1038/srep43199⟩
DOI
DOI : 10.1038/srep43199
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.inrae.fr/hal-02628360/file/2017_Nepelska_Scientific%20Reports_1.pdf BibTex
titre
TLR ligands and butyrate increase Pyy expression through two distinct but inter-regulated pathways
auteur
Pierre Larraufie, Joel Dore, Nicolas Lapaque, Herve Blottiere
article
Cellular Microbiology, 2017, 19 (2), ⟨10.1111/cmi.12648⟩
DOI
DOI : 10.1111/cmi.12648
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-01530823/file/cmi.12648.pdf BibTex
titre
A fibrolytic potential in the human ileum mucosal microbiota revealed by functional metagenomic
auteur
Orlane Patrascu, Fabienne Beguet-Crespel, Ludovica Marinelli, Emmanuelle Le Chatelier, Anne-Laure Abraham, Marion Leclerc, Christophe C. Klopp, Nicolas Terrapon, Bernard Henrissat, Hervé Blottiere, Joël Dore, Christel Maillet
article
Scientific Reports, 2017, 7, ⟨10.1038/srep40248⟩
DOI
DOI : 10.1038/srep40248
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-01606551/file/Patrascu%20et%20al%20Sci%20Rep%202017_1.pdf BibTex
titre
The Enterococcus faecalis virulence factor ElrA interacts with the human Four-and-a-Half LIM Domains Protein 2
auteur
Alexandre Jamet, Rozenn Dervyn, Nicolas Lapaque, Francesca Bugli, Naima Bermudez, Hervé M. Blottiere, Jean-Claude Twizere, Maurizio Sanguinetti, Brunella Posteraro, Pascale Serror, Emmanuelle Maguin
article
Scientific Reports, 2017, 7 (1), ⟨10.1038/s41598-017-04875-3⟩
DOI
DOI : 10.1038/s41598-017-04875-3
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-01607001/file/Jamet_2017_Sci%20Rep_1.pdf BibTex
titre
Processing & rheological properties of wheat flour dough and bread containing high levels of soluble dietary fibres blends
auteur
S. Arufe, Hubert Chiron, Joel Dore, Isabelle Savary-Auzeloux, Luc Saulnier, Guy Della Valle
article
Food Research International, 2017, 97, pp.123-132. ⟨10.1016/j.foodres.2017.03.040⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.foodres.2017.03.040
Accès au bibtex
BibTex
titre
Unprecedented large inverted repeats at the replication terminus of circular bacterial chromosomes suggest a novel mode of chromosome rescue
auteur
Hela El Kafsi, Valentin Loux, Mahendra Mariadassou, Camille Blin, Hélène Chiapello, Anne-Laure Abraham, Emmanuelle Maguin, Maarten van de Guchte
article
Scientific Reports, 2017, 7, pp.1-11. ⟨10.1038/srep44331⟩
DOI
DOI : 10.1038/srep44331
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-01509688/file/srep44331.pdf BibTex
titre
Health relevance of the modification of low grade inflammation in ageing (inflammageing) and the role of nutrition
auteur
Philip C. Calder, Nabil Bosco, Raphaelle Bourdet-Sicard, Lucile Capuron, Nathalie Delzenne, Joel Dore, Claudio Franceschi, Markus J Lehtinen, Tobias Recker, Stefano Salvioli, Francesco Visioli
article
Ageing Research Reviews - ARR, 2017, 40, pp.95-119. ⟨10.1016/j.arr.2017.09.001⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.arr.2017.09.001
Accès au bibtex
BibTex
titre
Structure of protein emulsion in food impacts intestinal microbiota, caecal luminal content composition and distal intestine characteristics in rats
auteur
Martin Beaumont, Daphné Jaoui, Véronique Douard, Damien Mat, Fanny Koeth, Bénédicte Goustard, Camille Mayeur, Stanislas Mondot, Anais Hovaghimian, Steven Le Feunteun, Catherine C. Chaumontet, Anne-Marie Davila, Daniel D. Tomé, Isabelle Souchon, Camille Michon, Gilles Fromentin, Francois F. Blachier, Marion Leclerc
article
Molecular Nutrition and Food Research, 2017, 61 (10), pp.1700078. ⟨10.1002/mnfr.201700078⟩
DOI
DOI : 10.1002/mnfr.201700078
Accès au texte intégral et bibtex
https://agroparistech.hal.science/hal-01598952/file/2017_Beaumont_MolecularNutritionFoodResearch_1.pdf BibTex
titre
A fibrolytic potential in the human ileum mucosal microbiota revealed by functional metagenomic
auteur
Orlane Patrascu, Fabienne Béguet-Crespel, Ludovica Marinelli, Emmanuelle Le Chatelier, Anne-Laure Abraham, Marion Leclerc, Christophe Klopp, Nicolas Terrapon, Bernard Henrissat, Hervé Blottière, Joël Doré, Christel Béra-Maillet
article
Scientific Reports, 2017, 7 (1), pp. 40248. ⟨10.1038/srep40248⟩
DOI
DOI : 10.1038/srep40248
Accès au bibtex
BibTex
titre
Microbiome-based dDiagnostics: Ready for applications in laboratory medicine?
auteur
James Versalovic, Joel Dore, Francisco Guarner, Ruth Ann Luna, Yehuda Ringel
article
Clinical Chemistry, 2017, 63 (11), pp.1674-1679. ⟨10.1373/clinchem.2016.264473⟩
DOI
DOI : 10.1373/clinchem.2016.264473
Accès au bibtex
BibTex
titre
Three glycosylated serine-rich repeat proteins play a pivotal role in adhesion and colonization of the pioneer commensal bacterium, Streptococcus salivarius
auteur
Benoit Couvigny, Nicolas Lapaque, Lionel Rigottier-Gois, Alain Guillot, Sophie Chat, Thierry Meylheuc, Saulius Kulakauskas, Manfred Rohde, Michel-Yves Mistou, Pierre Renault, Joël Dore, Romain Briandet, Pascale Serror, Eric Guédon
article
Environmental Microbiology, 2017, 19 (9), pp.3579-3594. ⟨10.1111/1462-2920.13853⟩
DOI
DOI : 10.1111/1462-2920.13853
Accès au bibtex
BibTex
titre
The gut bacterium and pathobiont Bacteroides vulgatus activates NF-kappa B in a human gut epithelial cell line in a strain and growth phase dependent manner
auteur
Paraic O. Cuiv, Tomas de Wouters, Rabina Giri, Stanislas Mondot, Wendy J. Smith, Herve Blottiere, Jakob Begun, Mark Morrison
article
Anaerobe, 2017, 47, pp.209-217. ⟨10.1016/j.anaerobe.2017.06.002⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.anaerobe.2017.06.002
Accès au bibtex
BibTex
titre
Horizontal gene transfer and ecosystem function dynamics
auteur
Maarten van de Guchte
article
Trends in Microbiology, 2017, 25 (9), pp.699-700. ⟨10.1016/j.tim.2017.07.002⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.tim.2017.07.002
Accès au bibtex
BibTex