Publications HAL de patricia-bonin; isabelle-biegala; alain-dolla; fabrice-armougom; marc-bally; manon-bartoli; guillaume-blanc; laurence-casalot; philippe-cuny; gael-erauso; marcgarel; helene-gaussier; pascal-hingamp; agnes-hirschler-rea; magali-lescot; pierre-pol-liebgott; valerie-michotey; militon-cecile; benjamin-misson; bernard-ollivier; anne-postec; nathalie-pradel; marianne-quemeneur; celine-rommevaux; gwenola-simon; christiantamburini; youri-timsit; guillaume-pillot; marie-roumagnac; thomas-vannier; hana-zouch du labo/EPI 191652

2019

Article dans une revue

titre
The lichen symbiosis re-viewed through the genomes of Cladonia grayi and its algal partner Asterochloris glomerata
auteur
Daniele Armaleo, Olaf Müller, François Lutzoni, Ólafur Andrésson, Guillaume Blanc, Helge Bode, Frank Collart, Francesco Dal Grande, Fred Dietrich, Igor Grigoriev, Suzanne Joneson, Alan Kuo, Peter Larsen, John Logsdon, David López, Francis Martin, Susan May, Tami Mcdonald, Sabeeha Merchant, Vivian Miao, Emmanuelle Morin, Ryoko Oono, Matteo Pellegrini, Nimrod Rubinstein, Maria Virginia Sanchez-Puerta, Elizabeth Savelkoul, Imke Schmitt, Jason Slot, Darren Soanes, Péter Szövényi, Nicholas Talbot, Claire Veneault-Fourrey, Basil Xavier
article
BMC Genomics, BioMed Central, 2019, 20 (1), ⟨10.1186/s12864-019-5629-x⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02192633/file/Armaleo_et_al-2019-BMC_Genomics.pdf BibTex
titre
Community‐Level Responses to Iron Availability in Open Ocean Plankton Ecosystems
auteur
Luigi Caputi, Quentin Carradec, Damien Eveillard, Amos Kirilovsky, Eric Pelletier, Juan J Pierella Karlusich, Fabio Rocha Jimenez Vieira, Emilie Villar, Samuel Chaffron, Shruti Malviya, Eleonora Scalco, Silvia Acinas, Adriana Alberti, Jean-Marc Aury, Anne-Sophie Benoiston, Alexis Bertrand, Tristan Biard, Lucie Bittner, Martine Boccara, Jennifer Brum, Christophe Brunet, Greta Busseni, Anna Carratalà, Hervé Claustre, Luis Pedro Coelho, Sébastien Colin, Salvatore d'Aniello, Corinne da Silva, Marianna del Core, Hugo Doré, Stéphane Gasparini, Florian Kokoszka, Jean-Louis Jamet, Christophe Lejeusne, Cyrille Lepoivre, Magali Lescot, Gipsi Lima-Mendez, Fabien Lombard, Julius Lukeš, Nicolas Maillet, Mohammed-Amin Madoui, Elodie Martinez, Maria Grazia Mazzocchi, Mario Néou, Javier Paz-Yepes, Julie Poulain, Simon Ramondenc, Jean-Baptiste Romagnan, Simon Roux, Daniela Salvagio Manta, Remo Sanges, Mario Sprovieri, Shinichi Sunagawa, Vincent Taillandier, Atsuko Tanaka, Leila Tirichine, Camille Trottier, Julia Uitz, Alaguraj Veluchamy, Jana Veselá, Flora Vincent, Sheree Yau, Stefanie Kandels-Lewis, Sarah Searson, Céline Dimier, Marc Picheral, Peer Bork, Emmanuel Boss, Colomban de Vargas, Michael Follows, Nigel Grimsley, Lionel Guidi, Pascal Hingamp, Eric Karsenti, Paolo Sordino, Lars Stemmann, Matthew Sullivan, Alessandro Tagliabue, Adriana Zingone, Laurence Garczarek, Fabrizio d'Ortenzio, Pierre Testor, Fabrice Not, Maurizio Ribera D'alcalà, Maurizio Ribera d'Alcalà, Patrick Wincker, Chris Bowler, Daniele Iudicone, Gabriel Gorsky, Olivier Jaillon, Lee Karp-Boss, Uros Krzic, Hiroyuki Ogata, Stéphane Pesant, Jeroen Raes, Emmanuel Reynaud, Christian Sardet, Mike Sieracki, Sabrina Speich, Didier Velayoudon, Anne‐sophie Benoiston
article
Global Biogeochemical Cycles, American Geophysical Union, 2019, 5, ⟨10.1029/2018GB006022⟩
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https://hal-univ-tln.archives-ouvertes.fr/hal-02074931/file/Caputi%20et_al.%202019%2C%20Global%20Biogeochemical%20Cycles.pdf BibTex
titre
Shear Stress as a Major Driver of Marine Biofilm Communities in the NW Mediterranean Sea
auteur
Elisa Catão, Thomas Pollet, Benjamin Misson, Cédric Garnier, Jean-François Ghiglione, Raphaëlle Barry-Martinet, Marine Maintenay, Christine Bressy, Jean-François Briand
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2019, ⟨10.3389/fmicb.2019.01768⟩
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https://hal-univ-tln.archives-ouvertes.fr/hal-02269986/file/17.Shear%20stress%20as%20a%20major%20driver%20of%20marine%20biofilm%20communities..._Catao%20et%20al.%202019.pdf BibTex
titre
Dynamics of trace metals in a shallow coastal ecosystem : insights from the Gulf of Gabès (southern Mediterranean Sea)
auteur
Sandrine Chifflet, Marc Tedetti, Hana Zouch, Rania Fourati, Hatem Zaghden, Boubaker Elleuch, Marianne Quemeneur, Fatma Karray, Sami Sayadi
article
Aims Environmental Science, AIMS Press, 2019, 6 (4), pp.277-297. ⟨10.3934/environsci.2019.4.277⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02184270/file/Chifflet%20et%20al%202019%20-%20AIMS.pdf BibTex
titre
Impact of sterilization methods on dissolved trace metals concentrations in complex natural samples: optimization of UV irradiation
auteur
Sandrine Chifflet, Marianne Quemeneur, Aude Barani, Bernard Angeletti, Morgane Didry, Gérald Grégori, Nathalie Pradel
article
MethodsX, Elsevier, 2019, 6, pp.1133-1146. ⟨10.1016/j.mex.2019.04.020⟩
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https://hal-amu.archives-ouvertes.fr/hal-02128494/file/Chifflet_all_2019.pdf BibTex
titre
Changes in Bacterioplankton Communities Resulting From Direct and Indirect Interactions With Trace Metal Gradients in an Urbanized Marine Coastal Area
auteur
Clément Coclet, Cédric Garnier, Gaël Durrieu, Dario Omanović, Sébastien d'Onofrio, Christophe Le Poupon, Jean-Ulrich Mullot, Jean-Francois Briand, Benjamin Misson
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2019, 10, ⟨10.3389/fmicb.2019.00257⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02049263/file/fmicb-10-00257.pdf BibTex
titre
Evidence of high N2 fixation rates in the temperate northeast Atlantic
auteur
Debany Fonseca-Batista, Xuefeng Li, Virginie Riou, Valerie Michotey, Florian Deman, François Fripiat, Sophie Guasco, Natacha Brion, Nolwenn Lemaitre, Manon Tonnard, Morgane Gallinari, Hélène Planquette, Frederic Planchon, Géraldine Sarthou, Marc Elskens, Julie Laroche, Lei Chou, Frank Dehairs
article
Biogeosciences, European Geosciences Union, 2019, 16 (5), pp.999-1017. ⟨10.5194/bg-16-999-2019⟩
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https://hal-amu.archives-ouvertes.fr/hal-02066554/file/bg-16-999-2019.pdf BibTex
titre
Pressure-Retaining Sampler and High-Pressure Systems to Study Deep-Sea Microbes Under in situ Conditions
auteur
Marc Garel, Patricia Bonin, Severine Martini, Sophie Guasco, Marie Roumagnac, Nagib Bhairy, Fabrice Armougom, Christian Tamburini
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2019, 10, pp.453. ⟨10.3389/fmicb.2019.00453⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02094373/file/Garel_etal_2019.pdf BibTex
titre
Effects of catchment area and nutrient deposition regime on phytoplankton functionality in alpine lakes
auteur
Coralie Jacquemin, Céline Bertrand, Evelyne Franquet, Stéphane Mounier, Benjamin Misson, Benjamin Oursel, Laurent Cavalli
article
Science of the Total Environment, Elsevier, 2019, 674, pp.114-127. ⟨10.1016/j.scitotenv.2019.04.117⟩
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titre
Microbial abundance, activity and population genomic profiling with mOTUs2
auteur
Alessio Milanese, Daniel Mende, Lucas Paoli, Guillem Salazar, Hans-Joachim Ruscheweyh, Miguelangel Cuenca, Pascal Hingamp, Renato Alves, Paul Costea, Luis Pedro Coelho, Thomas Schmidt, Alexandre Almeida, Alex Mitchell, Robert Finn, Jaime Huerta-Cepas, Peer Bork, Georg Zeller, Shinichi Sunagawa
article
Nature Communications, Nature Publishing Group, 2019, 10 (1), ⟨10.1038/s41467-019-08844-4⟩
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titre
The bacterial MrpORP is a novel Mrp/NBP35 protein involved in iron-sulfur biogenesis
auteur
Romain Pardoux, Anouchka Fiévet, Cíntia Carreira, Céline Brochier-Armanet, Odile Valette, Zorah Dermoun, Beatrice Py, Alain Dolla, Sofia Pauleta, Corinne Aubert
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2019, 9 (1), pp.360-373. ⟨10.1038/s41598-018-37021-8⟩
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https://hal-amu.archives-ouvertes.fr/hal-02186929/file/pardoux_scirep.pdf BibTex
titre
Hydrostatic Pressure Helps to Cultivate an Original Anaerobic Bacterium From the Atlantis Massif Subseafloor (IODP Expedition 357): Petrocella atlantisensis gen. nov. sp. nov.
auteur
Marianne Quéméneur, Gaël Erauso, Eléonore Frouin, Emna Zeghal, Céline Vandecasteele, Bernard Ollivier, Christian Tamburini, Marc Garel, Bénédicte Ménez, Anne Postec
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2019, 10, pp.1497. ⟨10.3389/fmicb.2019.01497⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02297216/file/fmicb-10-01497.pdf BibTex
titre
Prokaryote Communities at Active Chimney and In-Situ Colonization Devices after a Magmatic Degassing Event (37°N MAR, EMSO-Azores Deep-Sea Observatory)
auteur
Céline Rommevaux, Pauline Henri, Jefferson Degboe, Valérie Chavagnac, Françoise Lesongeur, Anne Godfroy, Cédric Boulart, Christine Destrigneville, Alain Castillo
article
Geochemistry, Geophysics, Geosystems, AGU and the Geochemical Society, 2019, ⟨10.1029/2018GC008107⟩
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https://hal-amu.archives-ouvertes.fr/hal-02142449/file/Rommevaux_G3_2019.pdf BibTex
titre
Minimum Information about an Uncultivated Virus Genome (MIUViG)
auteur
Simon Roux, Evelien M. Adriaenssens, Bas E. Dutilh, Eugene V. Koonin, Andrew M. Kropinski, Mart Krupovic, Jens H. Kuhn, Rob Lavigne, J. Rodney Brister, Arvind Varsani, Clara Amid, Ramy K. Aziz, Seth R. Bordenstein, Peer Bork, Mya Breitbart, Guy R. Cochrane, Rebecca A. Daly, Christelle Desnues, Melissa B. Duhaime, Joanne B. Emerson, François Enault, Jed A. Fuhrman, Pascal Hingamp, Philip Hugenholtz, Bonnie L. Hurwitz, Natalia N. Ivanova, Jessica M. Labonté, Kyung-Bum Lee, Rex R. Malmstrom, Manuel Martinez-Garcia, Ilene Karsch Mizrachi, Hiroyuki Ogata, David Páez-Espino, Marie-Agnès Petit, Catherine Putonti, Thomas Rattei, Alejandro Reyes, Francisco Rodriguez-Valera, Karyna Rosario, Lynn Schriml, Frederik Schulz, Grieg F. Steward, Matthew B. Sullivan, Shinichi Sunagawa, Curtis A. Suttle, Ben Temperton, Susannah G. Tringe, Rebecca Vega Thurber, Nicole S. Webster, Katrine L. Whiteson, Steven W. Wilhelm, K. Eric Wommack, Tanja Woyke, Kelly C. Wrighton, Pelin Yilmaz, Takashi Yoshida, Mark J. Young, Natalya Yutin, Lisa Zeigler Allen, Nikos C. Kyrpides, Emiley A. Eloe-Fadrosh
article
Nature Biotechnology, Nature Publishing Group, 2019, 37, pp.29-37. ⟨10.1038/nbt.4306⟩
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https://hal-pasteur.archives-ouvertes.fr/pasteur-01977322/file/nbt.4306.pdf BibTex
titre
Dissecting the membrane lipid binding properties and lipase activity of Mycobacterium tuberculosis LipY domains
auteur
Pierre Santucci, Nabil Smichi, Sadia Diomandé, Isabelle Poncin, Vanessa Point, Hélène Gaussier, Jean‐françois Cavalier, Laurent Kremer, Stéphane Canaan
article
FEBS Journal, Wiley, 2019, ⟨10.1111/febs.14864⟩
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titre
Bacterial Bioluminescence: Light Emission in Photobacterium phosphoreum Is Not Under Quorum-Sensing Control
auteur
Lisa Tanet, Christian Tamburini, Chloé Baumas, Marc Garel, Gwenola Simon, Laurie Casalot
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2019, 10, ⟨10.3389/fmicb.2019.00365⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02055577/file/fmicb-10-00365.pdf BibTex

Chapitre d'ouvrage

titre
Cartographier les ressources pour gérer les priorités
auteur
Sébastien Hardy, Marie Sabrié, Thomas Mourier, Corinne Lavagne, V. Thivent, Isabelle Guérin, François Roubaud, Christophe Guilmoto, Mireille Razafindrakoto, Marc Pilon, Isabelle Léglise, Pierre Le Meur, Fatoumata Ouattara, Christian Seignobos, Pierre Chauveau, Eric Léonard, Dominique Guillaud, Alain Froment, Robin Robin, Michel Agier, Sophie Bava, Annabel Desgrées Du Loû, Flore Gubert, Eric Delaporte, Gonzague Jourdain, Alexandre Dumont, Serge Trèche, Jacques Berger, Pierre Traissac, Valérie Delaunay, Vincent Robert, Frédéric Darriet, Cheikh Sokhna, Michel Cot, Martine Peeters, Eric Leroy, Alice Desclaux, Marc Hougard, Didier Paugy, Michel Boussinesq, Philippe Solano, Dorothée Missé, Louis-Clément Gouagna, Jean Lemesre, Laure Banuls, Christophe E. Menkès, Morgan Mangeas, Benjamin Sultan, Thomas Condom, Marie Gosset, Serge Janicot, Jean Nocquet, Luc Le Pennec, Philippe Charvis, Yann Hello, Emmanuel Bonnet, Emilie Strady, David Point, Bernard Ollivier, Isabelle Biegala, Christian Feller, Christian Valentin, Eric Giraud, Eric Blanchart, Pierre Montoroi, Philippe Cecchi, Jean Albergel, Jean-Michel Vouillamoz, Vincent Simonneaux, Gil Boulet, Thierry Ruf, Geneviève Michon, Jean-Baptiste Boutrais, Laure Emperaire, Robin Duponnois, Philippe Boulanger, Eugénie Hébrard, Valerie Verdier, Boris Szurek, Bruno Le Ru, Paul-André Calatayud, Olivier Dangles, Frédérique Aberlenc, Sevastianos Roussos, Gauthier Dobigny, Marc Legendre, Daniel Gaertner, Pierre Chavance, Pascal Bach, Arnaud Bertrand, Jérôme Vialard, Jacques Merle, Bruno Voituriez, Bernard Bourlès, Pierrick Penven, Thierry Lebel, Gil Mahé, Luc Descroix, Pierre Chevallier, Stéphane Calmant, Bruno Turcq, Adrien Favreau, Jean-Louis Rajot, Raphaël Pelissier, Philippe Cury, Riccardo Rodolfo-Metalpa, Hervé De Tricornot, Frédéric Simard, Jean-François Etard, Bernard Taverne, Florence Fournet, Alexis Drogoul, Marc Souris, Monique Simier, Marie Bonnin, Alain Ghesquière, Serge Hamon, Yves Vigouroux, Sophie Gonzalez, Jean-François Molino, Geneviève Bourdy, Christian Moretti, Pierre Ottino Garanger, Francisco Valdez, Benoit Antheaume, Nicolas Gratiot
article
Science et développement durable : 75 ans de recherche au Sud, ⟨IRD⟩, 2019, 978-2-7099-2737-6
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Direction d'ouvrage, Proceedings, Dossier

titre
Science et développement durable : 75 ans de recherche au Sud
auteur
Marie-Lise Sabrié, Thomas Mourier, Corinne Lavagne, V. Thivent, Isabelle Guérin, François Roubaud, Christophe Guilmoto, Mireille Razafindrakoto, Marc Pilon, Isabelle Léglise, Pierre Le Meur, Fatoumata Ouattara, Christian Seignobos, Pierre Chauveau, Eric Léonard, Dominique Guillaud, Alain Froment, Robin Robin, Michel Agier, Sophie Bava, Annabel Desgrées Du Loû, Flore Gubert, Eric Delaporte, Gonzague Jourdain, Alexandre Dumont, Serge Trèche, Jacques Berger, Pierre Traissac, Valérie Delaunay, Vincent Robert, Frédéric Darriet, Cheikh Sokhna, Michel Cot, Martine Peeters, Eric Leroy, Alice Desclaux, Marc Hougard, Didier Paugy, Michel Boussinesq, Philippe Solano, Dorothée Missé, Louis-Clément Gouagna, Jean Lemesre, Laure Banuls, Christophe Menkès, Morgan Mangeas, Benjamin Sultan, Thomas Condom, Marie Gosset, Serge Janicot, Jean Nocquet, Luc Le Pennec, Sébastien Hardy, Philippe Charvis, Yann Hello, Emmanuel Bonnet, Emilie Strady, David Point, Bernard Ollivier, Isabelle Biegala, Christian Feller, Christian Valentin, Eric Giraud, Eric Blanchart, Pierre Montoroi, Philippe Cecchi, Jean Albergel, Jean-Michel Vouillamoz, Vincent Simonneaux, Gil Boulet, Thierry Ruf, Geneviève Michon, Jean-Baptiste Boutrais, Laure Emperaire, Robin Duponnois, Philippe Boulanger, Eugénie Hébrard, Valerie Verdier, Boris Szurek, Bruno Le Ru, Paul-André Calatayud, Olivier Dangles, Frédérique Aberlenc, Sevastianos Roussos, Gauthier Dobigny, Marc Legendre, Daniel Gaertner, Pierre Chavance, Pascal Bach, Arnaud Bertrand, Jérôme Vialard, Jacques Merle, Bruno Voituriez, Bernard Bourlès, Pierrick Penven, Thierry Lebel, Gil Mahé, Luc Descroix, Pierre Chevallier, Stéphane Calmant, Bruno Turcq, Adrien Favreau, Jean-Louis Rajot, Raphaël Pelissier, Philippe Cury, Riccardo Rodolfo-Metalpa, Hervé De Tricornot, Frédéric Simard, Jean-François Etard, Bernard Taverne, Florence Fournet, Alexis Drogoul, Marc Souris, Monique Simier, Marie Bonnin, Alain Ghesquière, Serge Hamon, Yves Vigouroux, Sophie Gonzalez, Jean-François Molino, Geneviève Bourdy, Christian Moretti, Pierre Ottino Garanger, Francisco Valdez, Benoît Antheaume, Nicolas Gratiot
article
IRD, 2019
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2018

Article dans une revue

titre
The nature of electron acceptor (MnIV/NO3) triggers differential expression of genes associated with stress and ammonium limitation responses in Shewanella algae C6G3
auteur
Axel Aigle, Patricia Bonin, Nicolas Fernandez -Nunez, Béatrice Loriod, Sophie Guasco, Aurélie Bergon, Fabrice Armougom, Chantal Iobbi-Nivol, Jean Imbert, Valerie Michotey
article
FEMS Microbiology Letters, Wiley-Blackwell, In press, ⟨10.1093/femsle/fny068⟩
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https://hal-amu.archives-ouvertes.fr/hal-01766209/file/Aigle%20et%20al%20Fems%202018.pdf BibTex
titre
Pleomorphochaeta naphthae sp. nov., a new anaerobic fermentative bacterium isolated from an oil field
auteur
Boussad Arroua, Régis Grimaud, Agnès Hirschler-Réa, Patrick Bouriat, Michel Magot, Laurent Urios, Anthony Ranchou-Peyruse
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2018, 68 (12), pp.3747-3753. ⟨10.1099/ijsem.0.003048⟩
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titre
Towards a congruent reclassification and nomenclature of the thermophilic species of the genus Pseudothermotoga within the order Thermotogales
auteur
Hassiba Belahbib, Zarath Summers, Marie-Laure Fardeau, Manon Joseph, Christian Tamburini, Alain Dolla, Bernard Ollivier, Fabrice Armougom
article
Systematic and Applied Microbiology, Elsevier, 2018, 41 (6), pp.555-563. ⟨10.1016/J.SYAPM.2018.04.007⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01975970/file/hassiba-1et%20al%202018.pdf BibTex
titre
Abundance and diversity of prokaryotes in ephemeral hypersaline lake Chott El Jerid using Illumina Miseq sequencing, DGGE and qPCR assays
auteur
Manel Ben Abdallah, Fatma Karray, Najwa Kallel, Fabrice Armougom, Najla Mhiri, Marianne Quemeneur, Jean-Luc Cayol, Gaël Erauso, Sami Sayadi
article
Extremophiles, Springer Verlag, 2018, 22 (5), pp.811-823. ⟨10.1007/s00792-018-1040-9⟩
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titre
Characterization of Desulfovibrio salinus sp. nov., a slightly halophilic sulfate-reducing bacterium isolated from a saline lake in Tunisia
auteur
Zouhaier Ben Ali Gam, Abdoulaye Thioye, Jean-Luc Cayol, Manon Joseph, Guy Fauque, Marc Labat
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2018, 68 (3), pp.715-720. ⟨10.1099/ijsem.0.002567⟩
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https://hal-amu.archives-ouvertes.fr/hal-01981629/file/715_ijsem002567.pdf BibTex
titre
Archaea: Microbial Candidates in Next-generation Probiotics Development
auteur
Jean-François Brugère, Wajdi Ben Hania, Marie-Edith Arnal, Céline Ribière, Nathalie Ballet, Pascal Vandeckerkove, Bernard Ollivier, Paul O’toole
article
Journal of Clinical Gastroenterology, Lippincott, Williams & Wilkins, 2018, 52, pp.S71-S73. ⟨10.1097/MCG.0000000000001043⟩
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BibTex
titre
A global ocean atlas of eukaryotic genes
auteur
Quentin Carradec, Eric Pelletier, Corinne da Silva, Adriana Alberti, Yoann Seeleuthner, Romain Blanc-Mathieu, Gipsi Lima-Mendez, Fabio Rocha, Leila Tirichine, Karine Labadie, Amos Kirilovsky, Alexis Bertrand, Stefan Engelen, Mohammed-Amin Madoui, Raphaël Méheust, Julie Poulain, Sarah Romac, Daniel Richter, Genki Yoshikawa, Céline Dimier, Stefanie Kandels-Lewis, Marc Picheral, Sarah Searson, Olivier Jaillon, Jean-Marc Aury, Eric Karsenti, Matthew Sullivan, Shinichi Sunagawa, Peer Bork, Fabrice Not, Pascal Hingamp, Jeroen Raes, Lionel Guidi, Hiroyuki Ogata, Colomban de Vargas, Daniele Iudicone, Chris Bowler, Patrick Wincker, Jean Weissenbach
article
Nature Communications, Nature Publishing Group, 2018, 9 (1), pp.373. ⟨10.1038/s41467-017-02342-1⟩
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https://hal-cea.archives-ouvertes.fr/cea-01874711/file/1471.pdf BibTex
titre
Trace metal contamination as a toxic and structuring factor impacting ultraphytoplankton communities in a multicontaminated Mediterranean coastal area
auteur
Clément Cloclet, Cédric Garnier, Floriane Delpy, Dominique Jamet, Gaël Durrieu, Christophe Le Poupon, Marie Mayer, Benjamin Misson
article
Progress in Oceanography, Elsevier, 2018, 163, pp.196 - 213. ⟨10.1016/j.pocean.2017.06.006⟩
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BibTex
titre
Obligate sugar oxidation in Mesotoga spp., phylum Thermotogae , in the presence of either elemental sulfur or hydrogenotrophic sulfate-reducers as electron acceptor
auteur
Khaled Fadhlaoui, Wagdi Ben Hania, Fabrice Armougom, Manon Joseph, Marie-Laure Fardeau, Gaël Erauso, Gael Brasseur, Corinne Aubert, Moktar Hamdi, Céline Brochier-Armanet, Alain Dolla, Bernard Ollivier
article
Environmental Microbiology, Wiley-Blackwell, 2018, 20 (1), pp.281-292. ⟨10.1111/1462-2920.13995⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01976008/file/Fadhlaoui_et_al-2018-Environmental_Microbiology-2018.pdf BibTex
titre
Diversity of rare and abundant prokaryotic phylotypes in the Prony hydrothermal field and comparison with other serpentinite-hosted ecosystems
auteur
Eléonore Frouin, Méline Bes, Bernard Ollivier, Marianne Quéméneur, Anne Postec, Didier Debroas, Fabrice Armougom, Gaël Erauso
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2018, 9, ⟨10.3389/fmicb.2018.00102⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01734508/file/fmicb-09-00102.pdf BibTex
titre
Magmatism, serpentinization and life: Insights through drilling the Atlantis Massif (IODP Expedition 357)
auteur
Gretchen Früh-Green, Beth Orcutt, Stéphane Rouméjon, Marvin Lilley, Yuki Morono, Carol Cotterill, Sophie Green, Javier Escartin, Barbara John, Andrew Mccaig, Mathilde Cannat, Bénédicte Ménez, Esther Schwarzenbach, Morgan Williams, Morgan Morgan, Susan Lang, Matthew Schrenk, William Brazelton, Norikatsu Akizawa, Chiara Boschi, Kristina Dunkel, Marianne Quemeneur, Scott Whattam, Lisa Mayhew, Michelle Harris, Gaye Bayrakci, Jan-Hinrich Behrmann, Emilio Herrero-Bervera, Kirsten Hesse, Hai-Quan Liu, Amila Sandaruwan Ratnayake, Katrina Twing, Dominique Weis, Rui Zhao, Laura Bilenker
article
Lithos, Elsevier, 2018, 323, pp.137-155
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BibTex
titre
A simple gas pressure manometer for measuring hydrogen production by hydrogenogenic cultures in serum bottles
auteur
Hana Gannoun, Lamia Ben Gaida, Rafika Saidi, Baligh Miladi, Moktar Hamdi, Hassib Bouallagui, Pierre-Pol Liebgott, Richard Auria
article
Process Biochemistry, Elsevier, 2018, 65, pp.157-163. ⟨10.1016/j.procbio.2017.10.011⟩
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https://hal-amu.archives-ouvertes.fr/hal-01629103/file/Gannoun%20et%20al.%202018%20Article%20HAL.pdf BibTex
titre
Functional characterization and FTIR-based 3D modeling of full length and truncated forms of Scorpio maurus venom phospholipase A 2
auteur
Najeh Krayem, Goetz Parsiegla, Hélène Gaussier, Hanen Louati, Raida Jallouli, Pascal Mansuelle, Frédéric Carrière, Youssef Gargouri
article
Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects, Elsevier, 2018, 1862 (5), pp.1247-1261. ⟨10.1016/j.bbagen.2018.02.004⟩
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https://hal-amu.archives-ouvertes.fr/hal-01739569/file/Krayem-BBA-2018-1862-1247-1261_PREPRINT.pdf BibTex
titre
The Physcomitrella patens chromosome-scale assembly reveals moss genome structure and evolution
auteur
Daniel Lang, Kristian Ullrich, Florent Murat, Jörg Fuchs, Jerry Jenkins, Fabian Haas, Carl Li, Guillaume Blanc, Heidrun Gundlach, Michiel van Bel, Rabea Meyberg, Cristina Vives, Jordi Morata, Aikaterini Symeonidi, Manuel Hiss, Wellington Muchero, Lee Kamisugi, Omar Saleh, Eva Decker, Nico van Gessel, Jane Grimwood, Richard Hayes, Sean Graham, Lee Gunter, Daniel Mcdaniel, Sebastian N.W. Hoernstein, Anders Larsson, Fay-Wei Li, Pierre-François Perroud, Jeremy Phillips, Priya Ranjan, Daniel Rokshar, Carl Rothfels, Lucas Schneider, Shengqiang Shu, Dennis Stevenson, Fritz Thümmler, Michael Tillich, Juan Villarreal Aguilar, Thomas Widiez, Gane Ka-Shu Wong, Ann Wymore, Yong Zhang, Andreas Zimmer, Ralph Quatrano, Klaus F.X. Mayer, David Goodstein, Josep Casacuberta, Klaas Vandepoele, Ralf Reski, Andrew Cuming, Gerald Tuskan, Florian Maumus, Jérôme Salse, Jeremy Schmutz, Stefan Rensing
article
Plant Journal, Wiley, 2018, 93 (3), pp.515 - 533. ⟨10.1111/tpj.13801⟩
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BibTex
titre
Degenerate PCR Primers to Reveal the Diversity of Giant Viruses in Coastal Waters
auteur
Yanze Li, Pascal Hingamp, Hiroyasu Watai, Hisashi Endo, Takashi Yoshida, Hiroyuki Ogata
article
Viruses, MDPI, 2018, 10 (9), pp.496. ⟨10.3390/v10090496⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01874850/file/viruses-10-00496-v2.pdf BibTex
titre
Bacterial diversity obtained by culturable approaches in the gut of Glossina pallidipes population from a non sleeping sickness focus in Tanzania: preliminary results
auteur
Imna Malele, Hamis Nyingilili, Eugen Lyaruu, Marc Tauzin, Bernard Ollivier, Jean-Luc Cayol, Marie-Laure Fardeau, Anne Geiger
article
BMC Microbiology, BioMed Central, 2018, 18 (S1), pp.811-823. ⟨10.1186/s12866-018-1288-3⟩
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titre
Taxon Richness of “Megaviridae” Exceeds those of Bacteria and Archaea in the Ocean
auteur
Tomoko Mihara, Hitoshi Koyano, Pascal Hingamp, Nigel Grimsley, Susumu Goto, Hiroyuki Ogata
article
Microbes and environments / JSME, Nakanishi Printing Co, 2018, 33 (2), pp.162-171. ⟨10.1264/jsme2.me17203⟩
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titre
Specific enrichment of hyperthermophilic electroactive Archaea from deep-sea hydrothermal vent on electrically conductive support
auteur
Guillaume Pillot, Eléonore Frouin, Emilie Pasero, Anne Godfroy, Yannick Combet-Blanc, Sylvain Davidson, Pierre-Pol Liebgott
article
Bioresource Technology, Elsevier, 2018, 259, pp.304-311. ⟨10.1016/j.biortech.2018.03.053⟩
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titre
Prokaryotic community successions and interactions in marine biofilms: the key role of Flavobacteriia
auteur
Thomas Pollet, Lyria Berdjeb, Cédric Garnier, Gaël Durrieu, Christophe Le Poupon, Benjamin Misson, Jean-François Briand
article
FEMS Microbiology Ecology, Wiley-Blackwell, 2018, ⟨10.1093/femsec/fiy083⟩
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https://hal-amu.archives-ouvertes.fr/hal-02024255/file/Pollet%20et%20al_preprint_HAL.pdf BibTex
titre
Biodegradation of Emiliania huxleyi aggregates by a natural Mediterranean prokaryotic community under increasing hydrostatic pressure
auteur
Virginie Riou, Julien Para, Marc Garel, Catherine Guigue, Badr Al Ali, Chiara Santinelli, Dominique Lefèvre, Jean-Pierre Gattuso, Madeleine Goutx, Stephanie Jacquet, Frédéric A.C. Le Moigne, Kazuyo Tachikawa, Christian Tamburini
article
Progress in Oceanography, Elsevier, 2018, 163, pp.271-281
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titre
Biohydrogen production from hyperthermophilic anaerobic digestion of fruit and vegetable wastes in seawater: Simplification of the culture medium of Thermotoga maritima
auteur
Rafika Saidi, Pierre-Pol Liebgott, Hana Gannoun, Lamia Ben Gaïda, Baligh Miladi, Moktar Hamdi, Hassib Bouallagui, Richard Auria
article
Waste Management, Elsevier, 2018, 71, pp.474 - 484. ⟨10.1016/j.wasman.2017.09.042⟩
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titre
Growth of an anaerobic sulfate-reducing bacterium sustained by oxygen respiratory energy conservation after O 2 -driven experimental evolution
auteur
Marine Schoeffler, Anne-Laure Gaudin, Fanny Ramel, Odile Valette, Yann Denis, Wagdi Ben Hania, Agnès Hirschler-Réa, Alain Dolla
article
Environmental Microbiology, Wiley-Blackwell, 2018, ⟨10.1111/1462-2920.14466⟩
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titre
Single-cell genomics of multiple uncultured stramenopiles reveals underestimated functional diversity across oceans
auteur
Yoann Seeleuthner, Samuel Mondy, Vincent Lombard, Quentin Carradec, Eric Pelletier, Marc Wessner, Jade Leconte, Jean-François Mangot, Julie Poulain, Karine Labadie, Ramiro Logares, Shinichi Sunagawa, Véronique de Berardinis, Marc Salanoubat, Céline Dimier, Stefanie Kandels-Lewis, Marc Picheral, Sarah Searson, Stéphane Pesant, Nicole Poulton, Ramunas Stepanauskas, Peer Bork, Chris Bowler, Pascal Hingamp, Matthew Sullivan, Daniele Iudicone, Ramon Massana, Jean-Marc Aury, Bernard Henrissat, Eric Karsenti, Olivier Jaillon, Mike Sieracki, Colomban de Vargas, Patrick Wincker, Silvia G. Acinas, Emmanuel Boss, Michael Follows, Gabriel Gorsky, Nigel Grimsley, Lee Karp-Boss, Uros Krzic, Fabrice Not, Jeroen Raes, Emmanuel G. Reynaud, Christian Sardet, Sabrina Speich, Lars Stemmann, Jean Weissenbach, Didier Velayoudon
article
Nature Communications, Nature Publishing Group, 2018, 9, pp.310. ⟨10.1038/s41467-017-02235-3⟩
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titre
Fate of petroleum hydrocarbons in bioturbated pristine sediments from Caleta Valdés (Patagonia Argentina): An ex situ bioassay
auteur
Julieta Sturla Lompré, Marina Nievas, Marcos Franco, Vincent Grossi, Agustina Ferrando, Cécile Militon, Franck Gilbert, Philippe Cuny, Georges Stora, Marcela Sepúlveda, José Luis Esteves, Marta Commendatore
article
Ecotoxicology and Environmental Safety, Elsevier, 2018, 162, pp.673-682. ⟨10.1016/j.ecoenv.2018.06.069⟩
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titre
The Ocean Gene Atlas: exploring the biogeography of plankton genes online
auteur
Emilie Villar, Thomas Vannier, Caroline Vernette, Magali Lescot, Miguelangel Cuenca, Aurélien Alexandre, Paul Bachelerie, Thomas Rosnet, Eric Pelletier, Shinichi Sunagawa, Pascal Hingamp
article
Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2018, pp.gky376. ⟨10.1093/nar/gky376⟩
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titre
Locality and diel cycling of viral production revealed by a 24 h time course cross-omics analysis in a coastal region of Japan
auteur
Takashi Yoshida, Yosuke Nishimura, Hiroyasu Watai, Nana Haruki, Daichi Morimoto, Hiroto Kaneko, Takashi Honda, Keigo Yamamoto, Pascal Hingamp, Yoshihiko Sako, Susumu Goto, Hiroyuki Ogata
article
The ISME journal, International Society for Microbial Ecology 2018, ⟨10.1038/s41396-018-0052-x⟩
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titre
Salinity shifts in marine sediment: Importance of number of fluctuation rather than their intensities on bacterial denitrifying community
auteur
Imen Zaghmouri, Valérie Michotey, Fabrice Armougom, Sophie Guasco, Patricia Bonin
article
Marine Pollution Bulletin, Elsevier, 2018, 130, pp.76 - 83. ⟨10.1016/j.marpolbul.2018.03.020⟩
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titre
Effect of acidic industrial efluent release on microbial diversity and trace metal dynamics during resuspension of coastal sediment
auteur
Hana Zouch, Léa Cabrol, Marc Tedetti, Sandrine Chifflet, Fatma Karray, Hatem Zaghden, Sami Sayadi, Marianne Quemeneur
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2018, 9, ⟨10.3389/fmicb.2018.03103⟩
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Communication dans un congrès

titre
Role of microorganisms in marine mercury cycling: current knowledge and future directions
auteur
Andrea Garcia Bravo, Claudia Cosio, Léa Cabrol, Benjamin Misson, Cynthia Gilmour, Marisol Goñi, Remy Guyoneaud, Marianne Quemeneur, Lars-Eric Heimbürger, Silvia G Acinas, Alexandre J. Poulain
article
MISTRALS Contamination & Pollution workshop, Nov 2018, Marseille, France
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Chapitre d'ouvrage

titre
Importance of Prokaryotes in the Functioning and Evolution of the Present and Past Geosphere and Biosphere
auteur
Bernard Ollivier, Nina Zeyen, Grégoire Galès, Keyron Hickman-Lewis, Frédéric Gaboyer, Karim Benzerara, Frances Westall
article
Prokaryotes and Evolution, Springer International Publishing, pp.57-129, 2018, 978-3-319-99782-7. ⟨10.1007/978-3-319-99784-1_3⟩
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2017

Article dans une revue

titre
Stacked search for time shifted high energy neutrinos from gamma ray bursts with the Antares neutrino telescope
auteur
S. Adrián-Martínez, A. Albert, M. Andre, M. Anghinolfi, G. Anton, M. Ardid, J. Aubert, B. Baret, J. Barrios-Marti, S. Basa, V. Bertin, S. Biagi, R. Bormuth, C. Bouwhuis, R. Bruijn, J. Brunner, J. Busto, A. Capone, L. Caramete, J. Carr, T. Chiarusi, M. Circella, R. Coniglione, H. Costantini, P. Coyle, A. Creusot, I. Dekeyser, A. Deschamps, G. de Bonis, C. Distefano, C. Donzaud, D. Dornic, D. Drouhin, A. Dumas, T. Eberl, D. Elsässer, A. Enzenhöfer, K. Fehn, I. Felis, P. Fermani, F. Folger, A. Fusco, S. Galatà, P. Gay, S. Geißelsöder, K. Geyer, V. Giordano, A. Gleixner, R. Gracia-Ruiz, K. Graf, S. Hallmann, H. van Haren, J. Heijboer, Y. Hello, J. Hernández-Rey, J. Hößl, J. Hofestädt, C. Hugon, C. James, M. de Jong, M. Kadler, O. Kalekin, U. Katz, D. Kießling, P. Kooijman, A. Kouchner, M. Kreter, I. Kreykenbohm, V. Kulikovskiy, R. Lahmann, Dominique Lefèvre, E. Leonora, S. Loucatos, M. Marcelin, A. Margiotta, A. Marinelli, J. Martínez-Mora, A. Mathieu, T. Michael, P. Migliozzi, A. Moussa, C. Müller, E. Nezri, E. Păvălaş, C. Pellegrino, C. Perrina, P. Piattelli, V. Popa, T. Pradier, C. Racca, G. Riccobene, R. Richter, K. Roensch, M. Saldaña, D. Samtleben, A. Sanchez-Losa, M. Sanguineti, P. Sapienza, J. Schmid, J. Schnabel, F. Schüssler, T. Seitz, C. Sieger, M. Spurio, J. Steijger, Th. Stolarczyk, M. Taiuti, Christian Tamburini, A. Trovato, M. Tselengidou, C. Tönnis, B. Vallage, C. Vallee, V. van Elewyck, E. Visser, D. Vivolo, S. Wagner, J. Wilms, J. Zornoza, J. Zúñiga
article
European Physical Journal C: Particles and Fields, Springer Verlag (Germany), 2017, C77 (1), pp.20. ⟨10.1140/epjc/s10052-016-4496-8⟩
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titre
Physiological and transcriptional approaches reveal connection between nitrogen and manganese cycles in Shewanella algae C6G3
auteur
Axel Aigle, Patricia Bonin, Chantal Iobbi-Nivol, Vincent Méjean, Valérie Michotey
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2017, Scientific Reports 7, 7, ⟨10.1038/srep44725⟩
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titre
Viral to metazoan marine plankton nucleotide sequences from the Tara Oceans expedition
auteur
Adriana Alberti, Julie Poulain, Stefan Engelen, Karine Labadie, Sarah Romac, Isabel Ferrera, Guillaume Albini, Jean-Marc Aury, Caroline Belser, Alexis Bertrand, Corinne Cruaud, Corinne da Silva, Carole Dossat, Frederick Gavory, Shahinaz Gas, Guy Guy, Maud Haquelle, E'Krame Jacoby, Olivier Jaillon, Arnaud Lemainque, Eric Pelletier, Gaëlle Samson, Mark Wessner, Pascal Bazire, Odette Beluche, Laurie Bertrand, Marielle Besnard-Gonnet, Isabelle Bordelais, Magali Boutard, Maria Dubois, Corinne Dumont, Evelyne Ettedgui, Patricia Fernandez, Espérance Garcia, Nathalie Aiach, Thomas Guerin, Chadia Hamon, Élodie Brun, Sandrine Lebled, Patricia Lenoble, Claudine Louesse, Eric Mahieu, Barbara Mairey, Nathalie Martins, Catherine Megret, Claire Milani, Jacqueline Muanga, Céline Orvain, Emilie Payen, Peggy Perroud, Emmanuel Petit, Dominique Robert, Murielle Ronsin, Benoit Vacherie, Silvia Acinas, Marta Royo-Llonch, Francisco Cornejo-Castillo, Ramiro Logares, Beatriz Fernández-Gómez, Chris Bowler, Guy Cochrane, Clara Amid, Petra Ten Hoopen, Colomban de Vargas, Nigel Grimsley, Elodie Desgranges, Stefanie Kandels-Lewis, Hiroyuki Ogata, Nicole Poulton, Michael Sieracki, Ramunas Stepanauskas, Matthew Sullivan, Jennifer Brum, Melissa Duhaime, Bonnie Poulos, Bonnie Hurwitz, Peer Bork, Emmanuel Boss, Michael Follows, Gabriel Gorsky, Pascal Hingamp, Daniele Iudicone, Lee Karp-Boss, Eric Karsenti, Fabrice Not, Stéphane Pesant, Jeroen Raes, Christian Sardet, Sabrina Speich, Lars Stemmann, Shinichi Sunagawa, Patrick Wincker
article
Scientific Data , Nature Publishing Group, 2017, 4, ⟨10.1038/sdata.2017.93⟩
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titre
Monitoring photo-oxidative and salinity-induced bacterial stress in the Canadian Arctic using specific lipid tracers
auteur
Remi Amiraux, Simon Belt, Frederic Vaultier, Virginie Galindo, Michel Gosselin, Patricia Bonin, Jean-Francois Rontani
article
Marine Chemistry, Elsevier, 2017, 194, pp.89 - 99. ⟨10.1016/j.marchem.2017.05.006⟩
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BibTex
titre
Characterization of the first cultured representative of a Bacteroidetes clade specialized on the scavenging of cyanobacteria
auteur
Wajdi Ben Hania, Manon Joseph, Boyke Bunk, Cathrin Sproer, Hans-Peter Klenk, Marie-Laure Fardeau, Stefan Spring
article
Environmental Microbiology, Wiley-Blackwell, 2017, 19 (3), pp.1134 - 1148. ⟨10.1111/1462-2920.13639⟩
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titre
Characterization of recombinant Trypanosoma brucei gambiense Translationally Controlled Tumor Protein (r Tbg TCTP) and its interaction with Glossina midgut bacteria
auteur
Géraldine Bossard, Manon Bartoli, Marie-Laure Fardeau, Philippe Holzmuller, Bernard Ollivier, Anne Geiger
article
Gut microbes, Taylor & Francis, 2017, 8 (5), pp.413 - 427. ⟨10.1080/19490976.2017.1331833⟩
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BibTex
titre
Rapid Characterization of Microcystin-Producing Cyanobacteria in Freshwater Lakes by TSA-FISH (Tyramid Signal Amplification-Fluorescent In Situ Hybridization)
auteur
Luc Brient, Nihel Ben Gamra, Marine Periot, Marie Roumagnac, Perrine Zeller, Myriam Bormans, Annick Mejean, Olivier Ploux, Isabelle C. Biegala
article
Frontiers in Environmental Science, Frontiers, 2017, 5, pp.43. ⟨10.3389/fenvs.2017.00043⟩
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https://hal-univ-rennes1.archives-ouvertes.fr/hal-01580363/file/Brient%20-%20Rapid%20Characterization.pdf BibTex
titre
Inhibitory effects of sodium azide on microbial growth in experimental resuspension of marine sediment
auteur
Léa Cabrol, Marianne Quemeneur, Benjamin Misson
article
Journal of Microbiological Methods, Elsevier, 2017, 133, pp.62 - 65. ⟨10.1016/j.mimet.2016.12.021⟩
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BibTex
titre
Regional and local environmental conditions do not shape the response to warming of a marine habitat-forming species
auteur
Carolina Crisci, J. -B. Ledoux, K. Mokhtar-Jamai, Marc Bally, N. Bensoussan, Didier Aurelle, E. Cebrian, R. Coma, Jean-Pierre Féral, Marie La Riviere, C. Linares, P. Lopez-Sendino, C. Marschal, M. Ribes, N. Teixido, Frederic Zuberer, J. Garrabou
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2017, 7 (1), pp.5069. ⟨10.1038/s41598-017-05220-4⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01591643/file/s41598-017-05220-4.pdf BibTex
titre
Dental pulp as a source of low-contaminated DNA
auteur
Michel Drancourt, Gerard Aboudharam, Olivier Croce, Fabrice Armougom, Catherine Robert, Didier Raoult
article
Microbial Pathogenesis, Elsevier, 2017, 105, pp.63-67. ⟨10.1016/j.micpath.2017.02.007⟩
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BibTex
titre
Genome Sequence of Piezophilic Bacterium Desulfovibrio profundus Strain 500-1, Isolated from a Deep Sediment Layer in the Japan Sea
auteur
Stéphanie Fouteau, Thomas Guerin, Ghislaine Magdelenat, Marie Roumagnac, Manon Bartoli, Bernard Ollivier, Alain Dolla, Valérie Barbe, Nathalie Pradel
article
Genome Announcements, American Society for Microbiology, 2017, 5 (44), ⟨10.1128/genomeA.01181-17⟩
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https://hal-amu.archives-ouvertes.fr/hal-01728313/file/Genome%20Announc.-2017-Fouteau-.pdf BibTex
titre
A Glimpse of Nucleo-Cytoplasmic Large DNA Virus Biodiversity through the Eukaryotic Genomics Window
auteur
Lucie Gallot-Lavallée, Guillaume Blanc
article
Viruses, MDPI, 2017, 9 (1), ⟨10.3390/v9010017⟩
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https://hal-amu.archives-ouvertes.fr/hal-01622035/file/viruses-09-00017.pdf BibTex
titre
Comparative Genomics of Chrysochromulina Ericina Virus and Other Microalga-Infecting Large DNA Viruses Highlights Their Intricate Evolutionary Relationship with the Established Mimiviridae Family
auteur
Lucie Gallot-Lavallée, Guillaume Blanc, Jean-Michel Claverie
article
Journal of Virology, American Society for Microbiology, 2017, 91 (14), pp.230 - 247. ⟨10.1128/JVI.00230-17⟩
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https://hal-amu.archives-ouvertes.fr/hal-01622036/file/J.%20Virol.-2017-Gallot-Lavall%C3%A9e-.pdf BibTex
titre
Desulfobulbus aggregans sp. nov., a Novel Sulfate Reducing Bacterium Isolated from Marine Sediment from the Gulf of Gabes
auteur
Hanen Kharrat, Fatma Karray, Manon Bartoli, Wajdi Ben Hania, Najla Mhiri, Marie-Laure Fardeau, Feten Bennour, Lotfi Kamoun, Didier Alazard, Sami Sayadi
article
Current Microbiology, Springer Verlag, 2017, 74 (4), pp.449 - 454. ⟨10.1007/s00284-017-1211-4⟩
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BibTex
titre
Environmental Viral Genomes Shed New Light on Virus-Host Interactions in the Ocean
auteur
Yosuke Nishimura, Hiroyasu Watai, Takashi Honda, Tomoko Mihara, Kimiho Omae, Simon Roux, Romain Blanc-Mathieu, Keigo Yamamoto, Pascal Hingamp, Yoshihiko Sako, Matthew Sullivan, Susumu Goto, Hiroyuki Ogata, Takashi Yoshida
article
MSphere, American Society for Microbiology., 2017, 2 (2), ⟨10.1128/mSphere.00359-16⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01771841/file/e00359-16.full.pdf BibTex
titre
Transfer of Pseudomonas pictorum Gray and Thornton 1928 to genus Stenotrophomonas as Stenotrophomonas pictorum comb. nov., and emended description of the genus Stenotrophomonas
auteur
Aboubakar Sidiki Ouattara, Jean Le Mer, Manon Joseph, Hervé Macarie
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2017, 67 (6), pp.1894 - 1900. ⟨10.1099/ijsem.0.001880⟩
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https://hal.ird.fr/ird-01563113/file/Stenotrophomonas%20pictorum%20-%20Ouattara%20et%20al.%202016%20full%20paper%20for%20HAL%20with%20SI.pdf BibTex
titre
Desulfonatronum parangueonense sp. nov., a sulfate-reducing bacterium isolated from sediment of an alkaline crater lake
auteur
M.F. Pérez Bernal, E.M.S. Brito, Manon Bartoli, J. Aubé, M.-L. Fardeau, G.C. Rodriguez, B. Ollivier, R. Guyoneaud, A. Hirschler-Réa
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2017, 67 (12), pp.4999-5005. ⟨10.1099/ijsem.0.002399⟩
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BibTex
titre
Mineralizing Filamentous Bacteria from the Prony Bay Hydrothermal Field Give New Insights into the Functioning of Serpentinization-Based Subseafloor Ecosystems
auteur
Céline Pisapia, Emmanuelle Gérard, Martine Gérard, Léna Lecourt, Susan Q. Lang, Bernard Pelletier, Claude E. Payri, Christophe Monnin, Linda Guentas, Anne Postec, Marianne Quéméneur, Gaël Erauso, Bénédicte Ménez
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2017, 8, pp.57. ⟨10.3389/fmicb.2017.00057⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-01484419/file/fmicb-08-00057.pdf BibTex
titre
Objection to the proposition of the new genus Abyssivirga
auteur
Anne Postec, Bernard Ollivier, Marie-Laure Fardeau
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2017, 67 (1), pp.174. ⟨10.1099/ijsem.0.001601⟩
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https://hal-amu.archives-ouvertes.fr/hal-01622044/file/174_ijsem001601.pdf BibTex
titre
Specificity Re-evaluation of Oligonucleotide Probes for the Detection of Marine Picoplankton by Tyramide Signal Amplification-Fluorescent In Situ Hybridization
auteur
Virginie Riou, Marine Periot, Isabelle C. Biegala
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2017, 8, pp.854 ⟨10.3389/fmicb.2017.00854⟩
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https://hal-amu.archives-ouvertes.fr/hal-01621990/file/fmicb-08-00854.pdf BibTex
titre
Desulfovibrio senegalensis sp. nov., a mesophilic sulfate reducer isolated from marine sediment
auteur
Abdoulaye Thioye, Zouhaier Ben Ali Gam, Malick Mbengue, Jean-Luc Cayol, Manon Joseph-Bartoli, Coumba Touré-Kane, Marc Labat
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2017, 67 (9), pp.3162 - 3166. ⟨10.1099/ijsem.0.001997⟩
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BibTex
titre
Characterization of the eosinophilic myositis caused by CAPN3 mutations on a mouse model
auteur
J. Warnez-Soulie, B. Giannesini, S. Henri, I. Richard, Bernard Malissen, M. Krahn, Manon Bartoli
article
Neuromuscular Disorders, Elsevier, 2017, 27 (2), pp.S143-S144. ⟨10.1016/j.nmd.2017.06.185⟩
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BibTex
titre
Microbial Diversity in Sulfate-Reducing Marine Sediment Enrichment Cultures Associated with Anaerobic Biotransformation of Coastal Stockpiled Phosphogypsum (Sfax, Tunisia)
auteur
Hana Zouch, Fatma Karray, Fabrice Armougom, Sandrine Chifflet, Agnès Hirschler-Réa, Hanen Kharrat, Lotfi Kamoun, Wajdi Ben Hania, Bernard Ollivier, Sami Sayadi, Marianne Quéméneur
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2017, 8, pp.1583 ⟨10.3389/fmicb.2017.01583⟩
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https://hal-amu.archives-ouvertes.fr/hal-01622007/file/fmicb-08-01583.pdf BibTex

2016

Article dans une revue

titre
Optical and X-ray early follow-up of ANTARES neutrino alerts
auteur
S. Adrián-Martínez, M. Ageron, A. Albert, I. Al Samarai, M. André, G. Anton, M. Ardid, J. -J. Aubert, B. Baret, J. Barrios-Marti, S. Basa, V. Bertin, S. Biagi, C. Bogazzi, R. Bormuth, M. Bou-Cabo, M. C. Bouwhuis, R. Bruijnk, J. Brunner, J. Busto, A. Capone, L. Caramete, J. Carr, T. Chiarusi, M. Circella, R. Coniglione, H. Costantini, P. Coyle, A. Creusot, I. Dekeyser, Anne Deschamps, G. de Bonis, C. Distefano, C. Donzaud, D. Dornic, D. Drouhin, Alexis Dumas, T. Eberl, D. Elsasser, A. Enzenhöfer, K. Fehn, I. Feis, P. Fermani, F. Folger, L. A. Fusco, S. Galatà, P. Gay, S. Geisselsoder, K. Geyer, V. Giordano, A. Gleixner, R. Gracia-Ruiz, K. Graf, H. Haren, A. J. Heijboer, Y. Hello, J. J. Hernandez-Rey, A. Herrero, J. Hossl, J. Hofestadt, C. Hugon, C. W. James, M. de Jong, M. Kadler, O. Kalekin, U. Katz, D. Kiessling, P. Kooijman, A. Kouchner, I. Kreykenbohm, V. Kulikovskiy, R. Lahmann, G. Lambard, D. Lattuada, Dominique Lefèvre, E. Leonora, S. Loucatos, S. Mangano, M. Marcelin, A. Margiotta, J. A. Martinez-Mora, S. Martini, A. Mathieu, T. Michael, P. Piattelli, P. Migliozzi, A. Moussa, C. Mueller, M. Neff, E. Nezri, G. E. Pavalas, C. Pellegrino, C. Perrina, V. Popa, T. Pradier, C. Racca, G. Riccobene, R. Richter, K. Roensch, A. Rostovtsev, M. Saldana, D. F. E. Samtleben, M. Sanguinetiz, P. Sapienza, J. Schmid, J. Schnabel, S. Schulte, F. Schüssler, T. Seitz, C. Sieger, M. Spurio, J. J. M. Steijger, Th. Stolarczyk, A. Sanchez-Losa, M. Taiuti, Christian Tamburini, A. Trovato, M. Tselengidou, C. Tonnis, D. Turpin, B. Vallage, Corentin Vallée, V. van Elewyck, M. Vecchi, E. Visser, D. Vivolo, S. Wagner, J. Wilms, J. D. Zornoza, J. Zúñiga, A. Klotz, M. Boer, A. Le van Suu, C. Akerlof, W. Zheng, P. Evans, N. Gehrels, J. Kennea, J. P. Osborne, D. M. Coward, Antares Collaboration
article
JOURNAL OF COSMOLOGY AND ASTROPARTICLE PHYSICS, 2016, ⟨10.1088/1475-7516/2016/02/062⟩
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titre
Deciphering the adaptation strategies of Desulfovibrio piezophilus to hydrostatic pressure through metabolic and transcriptional analyses.
auteur
Amira Amrani, Jacques van Helden, Aurélie Bergon, Aicha Aouane, Wajdi Ben Hania, Christian Tamburini, Béatrice Loriod, Jean Imbert, Bernard Ollivier, Nathalie Pradel, Alain Dolla
article
Environmental Microbiology Reports, Wiley, 2016, 8 (4), pp.520-6. ⟨10.1111/1758-2229.12427⟩
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titre
Genomic Insights into a new Citrobacter koseri strain revealed gene exchanges with the virulence-associated Yersinia pestis pPCP1 plasmid
auteur
Fabrice Armougom, Idir Bitam, Olivier Croce, Vicky Merhej, Lina Barassi, Ti-Thien Nguyen, Bernard La Scola, Didier Raoult
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2016, 7, pp.340. ⟨10.3389/fmicb.2016.00340⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01459560/file/fmicb-07-00340.pdf BibTex
titre
The impact of long-term hydrocarbon exposure on the structure, activity, and biogeochemical functioning of microbial mats
auteur
Johanne Aubé, Pavel Senin, Olivier Pringault, Patricia Bonin, Bruno Deflandre, Olivier Bouchez, Noëlle Bru, Edurne Biritxinaga-Etchart, Christophe Klopp, Rémy Guyoneaud, Marisol Goñi-Urriza
article
Marine Pollution Bulletin, Elsevier, 2016, 111 (1-2), pp.115-125. ⟨10.1016/j.marpolbul.2016.07.023⟩
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titre
Hydrogen production by the hyperthermophilic bacterium Thermotoga maritima Part II: modeling and experimental approaches for hydrogen production
auteur
Richard Auria, Celine Boileau, Sylvain Davidson, Laurence Casalot, Pierre Christen, Pierre-Pol Liebgott, Yannick Combet-Blanc
article
Biotechnology for Biofuels, BioMed Central, 2016, 9, ⟨10.1186/s13068-016-0681-0⟩
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titre
Prokaryotic diversity in a Tunisian hypersaline lake, Chott El Jerid
auteur
Manel Ben Abdallah, Fatma Karray, Najla Mhiri, Nan Mei, Marianne Quemeneur, Jean-Luc Cayol, Gaël Erauso, Jean-Luc Tholozan, Didier Alazard, Sami Sayadi
article
Extremophiles, Springer Verlag, 2016, 20 (2), pp.125-138. ⟨10.1007/s00792-015-0805-7⟩
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titre
Reclassification of Anaerobaculum mobile, Anaerobaculum thermoterrenum, Anaerobaculum hydrogeniformans as Acetomicrobium mobile comb. nov., Acetomicrobium thermoterrenum comb. nov and Acetomicrobium hydrogeniformans comb. nov., respectively, and emendation of the genus Acetomicrobium
auteur
Wajdi Ben Hania, Amel Bouanane-Darenfed, Jean-Luc Cayol, Bernard Ollivier, Marie-Laure Fardeau
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2016, 66, pp.1506-1509. ⟨10.1099/ijsem.0.000910⟩
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titre
Desulfotomaculum aquiferis sp nov and Desulfotomaculum profundi sp nov., isolated from a deep natural gas storage aquifer
auteur
Sabrina Berlendis, Magali Ranchou-Peyruse, Marie-Laure Fardeau, Jean-Francois Lascourreges, Manon Joseph, Bernard Ollivier, Thomas Auello, David Dequidt, Michel Magot, Anthony Ranchou-Peyruse
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2016, 66 (11), pp.4329-4338. ⟨10.1099/ijsem.0.001352⟩
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titre
Hydrogen production by the hyperthermophilic bacterium Thermotoga maritima part I: effects of sulfured nutriments, with thiosulfate as model, on hydrogen production and growth
auteur
Celine Boileau, Richard Auria, Sylvain Davidson, Laurence Casalot, Pierre Christen, Pierre-Pol Liebgott, Yannick Combet-Blanc
article
Biotechnology for Biofuels, BioMed Central, 2016, 9, ⟨10.1186/s13068-016-0678-8⟩
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titre
Novel serine keratinase from Caldicoprobacter algeriensis exhibiting outstanding hide dehairing abilities.
auteur
Khelifa Bouacem, Amel Bouanane-Darenfed, Nadia Zaraî Jaouadi, Manon Joseph, Hocine Hacene, Bernard Ollivier, Marie-Laure Fardeau, Samir Bejar, Bassem Jaouadi
article
International Journal of Biological Macromolecules, Elsevier, 2016, 86, pp.321-8. ⟨10.1016/j.ijbiomac.2016.01.074⟩
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titre
Molecular microbiology methods for environmental diagnosis
auteur
T. Bouchez, A. Blieux, S. Dequiedt, I. Domaizon, A. Dufresne, S. Ferreira, J. Godon, J. Hellal, C. Joulian, A. Quaiser, F. Martin-Laurent, A. Mauffret, J. Monier, P. Peyret, P. Schmitt-Koplin, O. Sibourg, E. D’oiron, A. Bispo, I. Deportes, C. Grand, Philippe Cuny, A. Maron, L. Ranjard
article
Environmental Chemistry Letters, Springer Verlag, 2016, 14 (4), pp.423-441. ⟨10.1007/s10311-016-0581-3⟩
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titre
Novel species and expanded distribution of ellipsoidal multicellular magnetotactic prokaryotes
auteur
Yi-Ran Chen, Wen-Yan Zhang, Ke Zhou, Hong-Miao Pan, Hai-Jian Du, Cong Xu, Jian-Hong Xu, Nathalie Pradel, Claire-Lise Santini, Jin-Hua Li, Hui Huang, Yong-Xin Pan, Tian Xiao, Long-Fei Wu
article
Environmental Microbiology Reports, Wiley, 2016, 8 (2), pp.218--226. ⟨10.1111/1758-2229.12371⟩
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titre
Oil removal and effects of spilled oil on active microbial communities in close to salt-saturation brines.
auteur
Yannick Corsellis, Marc M Krasovec, Lea Sylvi, Philippe Cuny, Cécile Militon
article
Extremophiles, Springer Verlag, 2016, pp.26955981. ⟨10.1007/s00792-016-0818-x⟩
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titre
Balneicella halophila gen. nov., sp nov., an anaerobic bacterium, isolated from a thermal spring and description of Balneicellaceae fam. nov.
auteur
Khaled Fadhlaoui, Wajdi Ben Hania, Anne Postec, Moktar Hamdi, Bernard Ollivier, Marie-Laure Fardeau
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2016, 66 (11), pp.4692-4696. ⟨10.1099/ijsem.0.001412⟩
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titre
Coupling of bacterial nitrification with denitrification and anammox supports N removal in intertidal sediments (Arcachon Bay, France)
auteur
Sheryl Fernandes, Cedric Javanaud, Valerie Michotey, Sophie Guasco, Pierre Anschutz, Patricia Bonin
article
Estuarine, Coastal and Shelf Science, Elsevier, 2016, 179, pp.39-50. ⟨10.1016/j.ecss.2015.10.009⟩
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titre
Denitrification activity in mangrove sediments varies with associated vegetation
auteur
Sheryl Oliveira Fernandes, Pinky Dutta, Maria-Judith Gonsalves, Patricia C. Bonin, P. A. Lokabharathi
article
Ecological Engineering, Elsevier, 2016, 95, pp.671-681. ⟨10.1016/j.ecoleng.2016.06.102⟩
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titre
Preservation of ancestral Cretaceous microflora recovered from a hypersaline oil reservoir
auteur
Gregoire Gales, Nicolas Tsesmetzis, Isabel Neria, Didier Alazard, Stéphanie Coulon, Bart P. Lomans, Dominique Morin, Bernard Ollivier, Jean Borgomano, Catherine Joulian
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2016, 6, ⟨10.1038/srep22960⟩
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titre
Thermanaeromonas burensis sp nov., a thermophilic anaerobe isolated from a subterranean clay environment
auteur
Zouhaier Ben Ali Gam, Sylvie Daumas, Laurie Casalot, Manon Bartoli-Joseph, Sophia Necib, Yannick Linard, Marc Labatt
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2016, 66, pp.445-449. ⟨10.1099/ijsem.0.000739⟩
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titre
Plankton networks driving carbon export in the oligotrophic ocean
auteur
Lionel Guidi, Samuel Chaffron, Lucie Bittner, Damien Eveillard, Abdelhalim Larhlimi, Simon Roux, Youssef Darzi, Stéphane Audic, L. Berline, Jennifer R. Brum, Luis Pedro Coelho, Julio Cesar Ignacio Espinoza, Shruti Malviya, Shinichi Sunagawa, Céline Dimier, Stefanie Kandels-Lewis, Marc Picheral, Julie Poulain, Sarah Searson, Lars Stemmann, Fabrice Not, Pascal Hingamp, Sabrina Speich, Mick Follows, Lee Karp-Boss, Emmanuel Boss, Hiroyuki Ogata, Stephane Pesant, Jean Weissenbach, Patrick Wincker, Silvia G. Acinas, Peer Bork, Daniele Iudicone, Matthew B. Sullivan, Jeroen Raes, Eric Karsenti, Chris Bowler, Gabriel Gorsky
article
Nature, Nature Publishing Group, 2016, 532, pp.465-470. ⟨10.1038/nature16942⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-01275276/file/Mordret_2015_The_symbiotic_life.pdf BibTex
titre
The chimeric nature of the genomes of marine magnetotactic coccoid-ovoid bacteria defines a novel group of Proteobacteria.
auteur
Boyang Ji, Sheng-Da Zhang, Wei-Jia Zhang, Zoe Rouy, François Alberto, Claire-Lise Santini, Sophie Mangenot, Séverine Gagnot, Nadège Philippe, Nathalie Pradel, Lichen Zhang, Sébastien Tempel, Ying Li, Claudine Médigue, Bernard Henrissat, Pedro M Coutinho, Valérie Barbe, Emmanuel Talla, Long-Fei Wu
article
Environmental Microbiology, Wiley-Blackwell, 2016, pp.doi: 10.1111/1462-2920.13637. ⟨10.1111/1462-2920.13637⟩
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titre
Localization of endobacteria in the gastrodermis of a Mediterranean gorgonian coral, Paramuricea clavata, using fluorescence in situ hybridization
auteur
Marie La Riviere, Marc Garel, Marc Bally
article
Marine Biology, Springer Verlag, 2016, 163, ⟨10.1007/s00227-016-2975-y⟩
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titre
Bacteria as part of bioluminescence emission at the deep ANTARES station (North-Western Mediterranean Sea) during a one-year survey
auteur
Severine Martini, Valerie Michotey, Laurie Casalot, Patricia Bonin, Sophie Guasco, Marc Garel, Christian Tamburini
article
Deep-Sea Research, 2016, 116, pp.33-40. ⟨10.1016/j.dsr.2016.07.014⟩
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titre
Mobilisporobacter senegalensis gen. nov., sp nov., an anaerobic bacterium isolated from tropical shea cake
auteur
Malick Mbengue, Abdoulaye Thioye, Marc Labat, Laurie Casalot, Manon Joseph, Abdoulaye Samb, Zouhaier Ben Ali Gam
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2016, 66, pp.1383-1388. ⟨10.1099/ijsem.0.000889⟩
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titre
Serpentinicella alkaliphila gen. nov., sp. nov., a novel alkaliphilic anaerobic bacterium isolated from the serpentinite-hosted Prony hydrothermal field, New Caledonia.
auteur
Nan Mei, Anne Postec, Gaël Erauso, Manon Joseph, Bernard Pelletier, Claude Payri, Bernard Ollivier, Marianne Quemeneur
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2016, 66 (11), pp.4464-4470. ⟨10.1099/ijsem.0.001375⟩
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titre
Metagenomic and PCR-Based Diversity Surveys of [FeFe]-Hydrogenases Combined with Isolation of Alkaliphilic Hydrogen-Producing Bacteria from the Serpentinite-Hosted Prony Hydrothermal Field, New Caledonia
auteur
Nan Mei, Anne Postec, Christophe Monnin, Bernard Pelletier, Claude Payri, Bénédicte Ménez, Eléonore Frouin, Bernard Ollivier, Gaël Erauso, Marianne Quéméneur
article
Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2016, 7, pp.1301. ⟨10.3389/fmicb.2016.01301⟩
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https://hal-insu.archives-ouvertes.fr/insu-01473338/file/fmicb-07-01301-mei.pdf BibTex
titre
Linking Virus Genomes with Host Taxonomy.
auteur
Tomoko Mihara, Yosuke Nishimura, Yugo Shimizu, Hiroki Nishiyama, Genki Yoshikawa, Hideya Uehara, Pascal Hingamp, Susumu Goto, Hiroyuki Ogata
article
AIDS Research and Human Retroviruses, Mary Ann Liebert, 2016, 8 (3), pp.66. ⟨10.3390/v8030066⟩
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titre
Metatranscriptomes of oil-contaminated marine coastal sediment affected by oil addition and/or by the bioturbating activity of the marine polychaete Hediste diversicolor: Who are the microbial players?
auteur
Cécile Militon, Alexandre Atkinson, Valerie Michotey, Celine Jeziorski, Cristiana Cravo-Laureau, Robert Duran, Patricia Bonin, Philippe Cuny
article
Marine Genomics, Elsevier, 2016, 29, pp.55-59. ⟨10.1016/j.margen.2016.06.006⟩
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BibTex
titre
Analysis of a population of magnetotactic bacteria of the Gulf of Gabes, Tunisia
auteur
Nathalie Pradel, Jean-Luc Cayol, Marie-Laure Fardeau, Fatma Karray, Sami Sayadi, Didier Alazard, Bernard Ollivier
article
Environmental Science and Pollution Research, Springer Verlag, 2016, 23 (5), pp.4046-4053. ⟨10.1007/s11356-015-4314-0⟩
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titre
Magnetotactic bacteria population in a pristine French Atlantic lagoon.
auteur
Nathalie Pradel, Maxime Fuduche, Bernard Ollivier
article
Environmental Science and Pollution Research, Springer Verlag, 2016, 23 (1), pp.691-7. ⟨10.1007/s11356-015-5322-9⟩
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titre
Bacterial community structure and functional arrA gene diversity associated with arsenic reduction and release in an industrially contaminated soil
auteur
Marianne Quéméneur, Françis Garrido, Patrick Billard, Dominique Breeze, Corinne Leyval, Michel Jauzein, Catherine Joulian
article
Geomicrobiology Journal, Taylor & Francis, 2016, 33 (10), pp.839-849. ⟨10.1080/01490451.2015.1118167⟩
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titre
Importance of N2-Fixation on the Productivity at the North-Western Azores Current/Front System, and the Abundance of Diazotrophic Unicellular Cyanobacteria.
auteur
Virginie Riou, D. Fonseca Batista, A. Roukaerts, Isabelle Biegala, S. R. Prakya, C. M. Loureiro, M. Santos, A. E. Muniz-Piniella, M. Schmiing, M. Elskens, N. Brion, M.A. Martins, F. Dehairs
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2016, 11 (3), pp.e0150827. ⟨10.1371/journal.pone.0150827⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01455155/file/PONE-D-15-34460_R2.pdf BibTex
titre
Importance of N2-Fixation on the Productivity at the North-Western Azores Current/Front System, and the Abundance of Diazotrophic Unicellular Cyanobacteria
auteur
Virginie Riou, Debany Fonseca-Batista, Arnout Roukaerts, Isabelle Biegala, Shree Ram Prakya, Clara Magalhães Loureiro, Mariana Santos, Angel Muniz-Piniella, Mara Schmiing, Marc Elskens, Natacha Brion, M. Ana Martins, Frank Dehairs
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2016, 11 (3), pp.015082. ⟨10.1371/journal.pone.0150827⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01829137/file/journal.pone.0150827.PDF BibTex
titre
Impact of an intense water column mixing (0-1500 m) on prokaryotic diversity and activities during an open-ocean convection event in the NW Mediterranean Sea
auteur
Tatiana Severin, Caroline Sauret, Mehdi Boutrif, Thomas Duhaut, Fayçal Kessouri, Louise Oriol, Jocelyne Caparros, Mireille Pujo-Pay, Xavier Durrieu de Madron, Marc Garel, Christian Tamburini, Pascal Conan, Jean-François Ghiglione
article
Environmental Microbiology, Wiley-Blackwell, 2016, 18 (12), pp.4378 - 4390. ⟨10.1111/1462-2920.13324⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-01480373/file/emi13324.pdf BibTex
titre
Neuron-Like Networks Between Ribosomal Proteins Within the Ribosome
auteur
Y. Timsit, Olivier Poirot
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2016, 6 (1), ⟨10.1038/srep26485⟩
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titre
Genomic and physiological analysis reveals versatile metabolic capacity of deep-sea Photobacterium phosphoreum ANT-2200.
auteur
Sheng-Da Zhang, Claire-Lise Santini, Wei-Jia Zhang, Valérie Barbe, Sophie Mangenot, Charlotte Guyomar, Marc Garel, Hai-Tao Chen, Xue-Gong Li, Qun-Jian Yin, Yuan Zhao, Jean Armengaud, Jean-Charles Gaillard, Severine Martini, Nathalie Pradel, Claude Vidaud, François Alberto, Claudine Médigue, Christian Tamburini, Long-Fei Wu
article
Extremophiles life under extreme conditions, 2016, 20 (3), pp.301-10. ⟨10.1007/s00792-016-0822-1⟩
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Communication dans un congrès

titre
Life in deep subsurface
auteur
Gregoire Gales, Gaël Erauso
article
I-DUST 2016 - INTER-DISCIPLINARY UNDERGROUND SCIENCE & TECHNOLOGY, 2016, Unknown, Unknown Region. ⟨10.1051/e3sconf/20161205001⟩
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titre
Microbiology of shallow subsurface aquifer and carbonate rocks studied by culture-dependent and culture-independent methods. Preliminary results on an underground laboratory, the LSBB, Rustrel, France
auteur
Gregoire Gales, Gaël Erauso, Jean-Luc Cayol, David Navarro, Daniel Boyer, Gilles Micolau
article
6. International Conference on Inter-Disciplinary Underground Science and Technology (-DUST) , Jun 2016, Avignon, France. pp.5, ⟨10.1051/e3sconf/20161205002⟩
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2015

Article dans une revue

titre
Draft-genome sequence of Shewanella algae strain C6G3
auteur
Axel Aigle, Valerie Michotey, Patricia Bonin
article
Standards in Genomic Sciences, 2015, 43 (10), pp.10.1186/s40793-015-0022-0. ⟨10.1186/s40793-015-0022-0⟩
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titre
Characterization of Alkaliphilus hydrothermalis sp. nov., a novel alkaliphilic anaerobic bacterium, isolated from a carbonaceous chimney of the Prony hydrothermal field, New Caledonia,
auteur
F. Ben Aissa, Anne Postec, Gaël Erauso, C. Payri, B. Pelletier, M. Hamdi, M-Laure Fardeau, B. Ollivier
article
Extremophiles, Springer Verlag, 2015, 19 (1), pp.183-188. ⟨10.1007/s00792-014-0697-y⟩
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titre
Draft genome sequence of Mesotoga strain PhosAC3, a mesophilic member of the bacterial order Thermotogales, isolated from a digestor treating phosphogypsum in Tunisia
auteur
Wajdi Ben Hania, Khaled Fadhlaoui, Céline Brochier-Armanet, Cecile Persillon, Anne Postec, Moktar Hamdi, Alain Dolla, Bernard Ollivier, Marie-Laure Fardeau, Jean Le Mer, Gaël Erauso
article
Standards in Genomic Sciences, 2015, 10, ⟨10.1186/1944-3277-10-12⟩
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titre
Search for muon-neutrino emission from GeV and TeV gamma-ray flaring blazars using five years of data of the ANTARES telescope
auteur
V. Bertin, S. Biagi, C. Bogazzi, R. Bormuth, M. Bou-Cabo, M. C. Bouwhuis, R. Bruijn, J. Brunner, J. Busto, A. Capone, L. Caramete, J. Carr, T. Chiarusi, M. Circella, R. Coniglione, H. Costantini, P. Coyle, A. Creusot, I. Dekeyser, A. Deschamps, G. de Bonis, C. Distefano, C. Donzaud, D. Dornic, D. Drouhin, A. Dumas, T. Eberl, D. Elsaesser, A. Enzenhoefer, K. Fehn, I. Felis, P. Fermani, F. Folger, L. A. Fusco, S. Galata, P. Gay, S. Geisselsoeder, K. Geyer, V. Giordano, A. Gleixner, R. Gracia-Ruiz, K. Graf, H. Haren, A. J. Heijboer, Y. Hello, J. J. Hernandez-Rey, A. Herrero, J. Hoessl, J. Hofestaedt, C. Hugon, C. W. James, M. Jong, M. Kadler, O. Kalekin, U. Katz, D. Kiessling, P. Kooijman, A. Kouchner, I. Kreykenbohm, V. Kulikovskiy, R. Lahmann, G. Lambard, D. Lattuada, Dominique Lefèvre, E. Leonora, S. Loucatos, S. Mangano, M. Marcelin, A. Margiotta, J. A. Martinez-Mora, S. Martini, A. Mathieu, T. Michael, P. Migliozzi, A. Moussa, C. Mueller, M. Neff, E. Nezri, G. E. Pavalas, C. Pellegrino, C. Perrina, P. Piattelli, V. Popa, T. Pradier, C. Racca, G. Riccobene, R. Richter, K. Roensch, A. Rostovtsev, M. Saldana, D. F. E. Samtleben, M. Sanguineti, P. Sapienza, J. Schmid, J. Schnabel, S. Schulte, F. Schuessler, T. Seitz, C. Sieger, M. Spurio, J. J. M. Steijger, Th. Stolarczyk, A. Sanchez-Losa, M. Taiuti, Christian Tamburini, A. Trovato, M. Tselengidou, C. Toennis, D. Turpin, B. Vallage, Corentin Vallée, V. van Elewyck, E. Visser, D. Vivolo, S. Wagner, J. Wilms, J. D. Zornoza, J. Zúñiga, Antares Collaboration, S. Adrián-Martínez, A. Albert, M. André, G. Anton, M. Ardid, J. J. Aubert, B. Baret, J. Barrios-Marti, S. Basa
article
JOURNAL OF COSMOLOGY AND ASTROPARTICLE PHYSICS, 2015, ⟨10.1088/1475-7516/2015/12/014⟩
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BibTex
titre
Acetoanaerobium pronyense sp. nov., an anaerobic alkaliphilic bacterium isolated from the Prony alkaline Hydrothermal Field in New Caledonia.
auteur
Meline Bes, Mériem Merrouch, Manon Joseph, Marianne Quemeneur, Claude Payri, Bernard Pelletier, Bernard Ollivier, Marie-Laure Fardeau, Gaël Erauso, Anne Postec
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2015, pp.10.1099/ijs.0.000307. ⟨10.1099/ijs.0.000307⟩
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BibTex
titre
Substrates specialization in lipid compounds and hydrocarbons of Marinobacter genus.
auteur
Patricia Bonin, Christophe Vieira, Régis Grimaud, Cécile Militon, Philippe Cuny, Oscar Lima, Sophie Guasco, Corina P D Brussaard, Valerie Michotey
article
Environmental Science and Pollution Research, Springer Verlag, 2015, 22, pp.15347-15359. ⟨10.1007/s11356-014-4009-y⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01201711/file/Fichier%20Hal_Bonin%26al2015ESPR-D-14-03278-revised.pdf BibTex
titre
Use of dispersant in mudflat oil-contaminated sediment: behavior and effects of dispersed oil on micro- and macrobenthos.
auteur
Philippe Cuny, Franck Gilbert, Cécile Militon, Georges Stora, Patricia Bonin, Valerie Michotey, Sophie Guasco, Karine Duboscq, Christine Cagnon, Ronan Jézéquel, Cristiana Cravo-Laureau, Robert Duran
article
Environmental Science and Pollution Research, Springer Verlag, 2015, 22 (20), pp.15370-15376. ⟨10.1007/s11356-015-4800-4⟩
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titre
Complete genome sequence of a new member of the Marseilleviridae recovered from the Brackish submarine spring in the Cassis Port-Miou Calanque, France
auteur
Gabriel Doutre, Bruno Arfib, Pierre Rochette, Jean-Michel Claverie, Patricia Bonin, Chantal Abergel
article
Genome Announcements, American Society for Microbiology, 2015, 3 (6), pp.e01148--15
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Microbial ecology of hydrocarbon-polluted coastal sediments.
auteur
Robert Duran, Philippe Cuny, Patricia Bonin, Cristiana Cravo-Laureau
article
Environmental Science and Pollution Research, Springer Verlag, 2015, 22 (20), pp.15195 - 15199. ⟨10.1007/s11356-015-5373-y⟩
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Effect of physical sediments reworking on hydrocarbon degradation and bacterial community structure in marine coastal sediments.
auteur
Robert Duran, Patricia Bonin, Ronan Jezequel, Karine Dubosc, Claire Gassie, Fanny Terrisse, Justine Abella, Christine Cagnon, Cécile Militon, Valerie Michotey, Franck Gilbert, Philippe Cuny, Cristiana Cravo-Laureau
article
Environmental Science and Pollution Research, Springer Verlag, 2015, 22 (20), pp.15248-15259. ⟨10.1007/s11356-015-4373-2⟩
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titre
Environmental microbiology as a mosaic of explored ecosystems and issues
auteur
Denis Faure, Patricia Bonin, Robert Duran, Pierre Amato, Florence Arsene-Ploetze, J.C. Auguet, Bernard Legrand, P.N. Bertin, Y. Bettarel, A Bigot-Clivot, N Blot, Manuel Blouin, Myriam Bormans, M Bouvy, O Bruneel, A Cébron, U Christaki, Ivan Couée, Cristiana Cravo-Laureau, M Danger, J de Lorgeril, Y Desdevises, Y Dessaux, D Destoumieux-Garzón, E Duprat, G Erauso, Z Haichar Fel, E Fouilland, Andre-Jean Francez, N Fromin, Alain Geffard, Jf Ghiglione, Vincent Grossi, K Guizien, C Hubas, A Huguet, L Jardillier, P Jouquet, F Joux, A Kaisermann, O Kaltz, Jc Lata, A Lecerf, C Leyval, P Luis, E Masseret, A Niboyet, P Normand, F Plewniak, F Poly, S Prado, Achim Quaiser, P Ratet, A Richaume, Jl Rolland, Jl Rols, Jf Rontani, F Rossi, Sophie Sablé, P Sivadon, P Soudant, C Tamburini, Aline Tribollet, C Valiente Moro, France van Wambeke, Philippe Vandenkoornhuyse, Stéphane Vuilleumier, Philippe Vandenkoornhuyse
article
Environmental Science and Pollution Research, Springer Verlag, 2015, 22 (18), pp.13577-13598. ⟨10.1007/s11356-015-5164-5⟩
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titre
Anaerobic nitrification-denitrification mediated by Mn-oxides in meso-tidal sediments: Implications for N-2 and N2O production
auteur
Sheryl Fernandes, Cedric Javanaud, Axel Aigle, Valerie Michotey, Sophie Guasco, Jonathan Deborde, Bruno Deflandre, Pierre Anschutz, Patricia Bonin
article
Journal of Marine Systems, Elsevier, 2015, 144, pp.1-8. ⟨10.1016/j.jmarsys.2014.11.011⟩
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titre
Oil spill effects on macrofaunal communities and bioturbation of pristine marine sediments (Caleta Valdés, Patagonia, Argentina): experimental evidence of low resistance capacities of benthic systems without history of pollution
auteur
Agustina Ferrando, Emilia Gonzalez, Marcos Franco, Marta Commendatore, Marina Nievas, Cécile Militon, Georges Stora, Franck Gilbert, José Luis Esteves, Philippe Cuny
article
Environmental Science and Pollution Research, Springer Verlag, 2015, vol. 22 (n° 20), pp. 15294-15306. ⟨10.1007/s11356-015-4167-6⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01223400/file/ferrando_14424.pdf BibTex
titre
Diversity of magnetotactic bacteria from a French pristine Mediterranean area.
auteur
Maxime Fuduche, Anne Postec, Sylvain Davidson, Jean-Paul Chauvin, Grégoire Galès, Agnes Hirschler, Bernard Ollivier, Long-Fei Wu, Nathalie Pradel
article
Current Microbiology, Springer Verlag, 2015, 70 (4), pp.499-505. ⟨10.1007/s00284-014-0745-y⟩
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titre
Aminobacterium thunnarium sp. nov., a mesophilic, amino acid-degrading bacterium isolated from an anaerobic sludge digester, pertaining to the phylum Synergistetes.
auteur
Olfa Hamdi, Wajdi Ben Hania, Anne Postec, Hassib Bouallagui, Moktar Hamdi, Patricia Bonin, Bernard Ollivier, Marie-Laure Fardeau
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2015, 65 (Pt 2), pp.609-14. ⟨10.1099/ijs.0.068965-0⟩
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titre
Evidence for host specificity among dominant bacterial symbionts in temperate gorgonian corals
auteur
Marie La Riviere, Joaquim Garrabou, Marc Bally
article
Coral Reefs, Springer Verlag, 2015, 34 (4), pp.1087. ⟨10.1007/s00338-015-1334-7⟩
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titre
H4K44 Acetylation Facilitates Chromatin Accessibility during Meiosis
auteur
Matthieu Legendre, Audrey Lartigue, Lionel Bertaux, Sandra Jeudy, Julia Bartoli, Magali Lescot, Jean-Marie Alempic, Claire Ramus, Christophe Bruley, Karine Labadie, Lyubov Shmakova, Elizaveta Rivkina, Yohann Coute, Chantal Abergel, Jean-Michel Claverie
article
Cell Reports , Elsevier Inc, 2015, 13 (9), pp.1772-1780. ⟨10.1016/j.celrep.2015.10.070⟩
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titre
Dynamics of bacterial assemblages and removal of polycyclic aromatic hydrocarbons in oil-contaminated coastal marine sediments subjected to contrasted oxygen regimes
auteur
Cécile Militon, Ronan Jezequel, Franck Gilbert, Yannick Corsellis, Léa Sylvi, Cristiana Cravo-Laureau, Robert Duran, Philippe Cuny
article
Environmental Science and Pollution Research, Springer Verlag, 2015, 22 (20), pp.15260-15272. ⟨10.1007/s11356-015-4510-y⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01233392/file/militon_14472.pdf BibTex
titre
Ecological significance of Synergistetes in the biological treatment of tuna cooking wastewater by an anaerobic sequencing batch reactor.
auteur
Cécile Militon, Olfa Hamdi, Valerie Michotey, Marie-Laure Fardeau, Bernard Ollivier, Hassib Bouallagui, Moktar Hamdi, Patricia Bonin
article
Environmental Science and Pollution Research, Springer Verlag, 2015, pp.2015 Jul 22. ⟨10.1007/s11356-015-4973-x⟩
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titre
Dynamic of bacterial communities attached to lightened phytodetritus
auteur
Morgan Petit, Patricia Bonin, Remi Amiraux, Valerie Michotey, Sophie Guasco, Joshua Armitano, Cécile Jourlin-Castelli, Frederic Vaultier, Vincent Méjean, Jean-Francois Rontani
article
Environmental Science and Pollution Research, Springer Verlag, 2015, 22 (18), pp.13681-92. ⟨10.1007/s11356-015-4209-0⟩
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titre
Microbial diversity in a submarine carbonate edifice from the serpentinizing hydrothermal system of the Prony Bay (New Caledonia) over a 6-year period
auteur
Anne Postec, Marianne Quéméneur, Méline Bes, Nan Mei, Fatma Ben Aissa-Fennira, Claude Payri, Bernard Pelletier, Christophe Monnin, Linda Guentas-Dombrowsky, Bernard Ollivier, Emmanuelle Gérard, Céline Pisapia, Martine Gérard, Bénédicte Ménez, Gaël Erauso
article
Frontiers in microbiology, Frontiers Research Foundation, 2015, 6, pp.857. ⟨10.3389/fmicb.2015.00857⟩
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https://hal.sorbonne-universite.fr/hal-01221183/file/fmicb-06-00857.pdf BibTex
titre
Endolithic microbial communities in carbonate precipitates from serpentinite-hosted hyperalkaline springs of the Voltri Massif (Ligurian Alps, Northern Italy).
auteur
Marianne Quemeneur, Alexandra Palvadeau, Anne Postec, Christophe Monnin, Valérie Chavagnac, Bernard Ollivier, Gaël Erauso
article
Environmental Science and Pollution Research, Springer Verlag, 2015, pp.10.1007/s11356-015-4113-7. ⟨10.1007/s11356-015-4113-7⟩
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titre
Growth of the Obligate Anaerobe Desulfovibrio vulgaris Hildenborough under Continuous Low Oxygen Concentration Sparging: Impact of the Membrane-Bound Oxygen Reductases
auteur
Fanny Ramel, Gael Brasseur, Laetitia Pieulle, Odile Valette, Agnès Hirschler-Réa, Marie Laure Fardeau, Alain Dolla
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2015, 10, pp.e0123455. ⟨10.1371/journal.pone.0123455⟩
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https://hal-amu.archives-ouvertes.fr/hal-01216176/file/fetchObject.pdf BibTex
titre
Crystallographic studies of [NiFe]-hydrogenase mutants: towards consensus structures for the elusive unready oxidized states.
auteur
Anne Volbeda, Lydie Martin, Elodie Barbier, Oscar Gutiérrez-Sanz, Antonio L de Lacey, Pierre-Pol Liebgott, Sébastien Dementin, Marc Rousset, Juan-Carlos Fontecilla-Camps
article
Journal of Biological Inorganic Chemistry, Springer Verlag, 2015, 20 (1), pp.11-22
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Chapitre d'ouvrage

titre
Antares Neutrino telescope and Deap Sea Observatory,
auteur
V. Bertin, J. Brunner, J. Carr, P. Coyle, C. Curtil, J. Destelle, A. Deschamps, S. Escoffier, K. Graf, C. Gojak, J. Hößl, R. Lahmann, Dominique Lefèvre, C. Lévèque, Christian Tamburini, P. Schuller, H. van Haren
article
Seafloor Observatories - A New Vision of the Earth from the Abyss, Springer Berlin Heidelberg, pp.369-414, 2015
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titre
Biogeochemical Cycles
auteur
Jean-Claude Bertrand, Patricia Bonin, Pierre Caumette, Jean-Pierre Gattuso, Gérald Grégori, Rémy Guyoneaud, Xavier Le Roux, Robert Matheron, Franck Poly
article
Environmental microbiology: fundamentals and applications, Springer Science+Business Media, 933 p., 2015, 978-94-017-9117-5
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2014

Article dans une revue

titre
Constraining the neutrino emission of gravitationally lensed Flat-Spectrum Radio Quasars with ANTARES data
auteur
S. Adrián-Martínez, A. Albert, M. Andre, G. Anton, M. Ardid, J. J. Aubert, B. Baret, J. Barrios-Marti, S. Basa, V. Bertin, S. Biagii, C. Bogazzi, R. Bormuth, M. Bou-Cabo, M. C. Bouwhuis, R. Bruijn, J. Brunner, J. Busto, A. Capone, L. Caramete, J. Carr, T. Chiarusi, M. Circella, R. Coniglione, L. Core, H. Costantini, P. Coyle, A. Creusot, G. de Rosa, I. Dekeyser, A. Deschamps, G. de Bonis, C. Distefano, C. Donzaud, D. Dornic, Q. Dorosti, D. Drouhin, A. Dumas, T. Eberl, D. Elsaesser, A. Enzenhoefer, S. Escoffier, K. Fehn, I. Fells, P. Fermani, F. Folger, L. A. Fusco, S. Galata, P. Gay, S. Geisselsoeder, K. Geyer, V. Giordano, A. Gleixner, J. P. Gomez-Gonzalez, K. Graf, G. Guillard, H. Haren, A. J. Heijboer, Y. Hello, J. J. Hernandez-Rey, B. Herold, A. Herrero, J. Hoessl, J. Hofestaedt, C. Hugon, C. W. James, M. Jong, M. Kadler, O. Kalekin, A. Kappes, U. Katz, D. Kiessling, P. Kooijman, A. Kouchner, I. Kreykenbohm, V. Kulikovskiy, R. Lahmann, E. Lambard, G. Lambard, Dominique Lefèvre, E. Leonora, H. Loehner, S. Loucatos, S. Mangano, M. Marcelin, A. Margiotta, J. A. Martinez-Mora, S. Martini, A. Mathieu, T. Michael, P. Migliozzi, C. Mueller, M. Neff, E. Nezri, D. Palioselitis, G. E. Pavalas, C. Perrina, V. Popa, T. Pradier, C. Racca, G. Riccobene, R. Richter, K. Roensch, A. Rostovtsev, M. Saldana, D. F. E. Samtleben, A. Sanchez-Losa, M. Sanguineti, J. Schmid, J. Schnabel, S. Schulte, F. Schuessler, T. Seitz, C. Sieger, A. Spies, M. Spurioi, J. J. M. Steijger, Th. Stolarczyk, M. Taiuti, Christian Tamburini, Y. Tayalati, A. Trovato, M. Tselengidou, C. Toennis, B. Vallage, Corentin Vallée, V. van Eewyck, E. Visser, D. Vivolo, S. Wagner, J. Wilms, E. Wolf, K. Yatkin, H. Yepes, J. D. Zornoza, J. Zúñiga, E. E. Falco, Antares Collaboration
article
JOURNAL OF COSMOLOGY AND ASTROPARTICLE PHYSICS, 2014, ⟨10.1088/1475-7516/2014/11/017⟩
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titre
A search for time dependent neutrino emission from microquasars with the ANTARES telescope
auteur
S. Adrián-Martínez, A. Albert, M. André, M. Anghinolfi, G. Anton, M. Ardid, T. Astraatmadja, J.-J. Aubert, B. Baret, J. Barrios, S. Basa, V. Bertin, S. Biagi, C. Bigongiari, C. Bogazzi, B. Bouhou, M. C. Bouwhuis, J. Brunner, J. Busto, A. Capone, L. Caramete, C. Cârloganu, J. Carr, S. Cecchini, P. Charvis, T. Chiarusi, M. Circella, R. Coniglione, L. Core, H. Costantini, P. Coyle, A. Creusot, G. de Rosa, I. Dekeyser, Anne Deschamps, G. de Bonis, C. Distefano, C. Donzaud, D. Dornic, Q. Dorosti, D. Drouhin, A. Dumas, T. Eberl, D. Elsässer, U. Emanuele, A. Enzenhöfer, J.-P. Ernenwein, S. Escoffier, K. Fehn, I. Felis, P. Fermani, F. Folger, L.A. Fusco, S. Galatà, Pascal Gay, S. Geißelsöder, K. Geyer, V. Giordano, A. Gleixner, J. P. Gómez-González, K. Graf, G. Guillard, H. van Haren, A. J. Heijboer, Y. Hello, J.J. Hernández-Rey, B. Herold, J. Hößl, J. Hofestädt, C. W. James, M. de Jong, M. Kadler, O. Kalekin, A. Kappes, U. Katz, P. Kooijman, A. Kouchner, I. Kreykenbohm, V. Kulikovskiy, R. Lahmann, E. Lambard, G. Lambard, G. Larosa, D. Lattuada, Dominique Lefèvre, E. Leonora, H. Loehner, S. Loucatos, S. Mangano, M. Marcelin, A. Margiotta, J. A. Martínez-Mora, S. Martini, A. Mathieu, T. Michael, P. Migliozzi, T. Montaruli, C. Müller, M. Neff, E. Nezri, D. Palioselitis, G. E. Păvălaş, C. Perrina, P. Piattelli, V. Popa, T. Pradier, C. Racca, G. Riccobene, R. Richter, C. Rivière, A. Robert, K. Roensch, A. Rostovtsev, M. Salda\na, D. F. E. Samtleben, A. Sánchez-Losa, M. Sanguineti, P. Sapienza, J. Schmid, J. Schnabel, S. Schulte, F. Schüssler, T. Seitz, C. Sieger, A. Spies, M. Spurio, J.J. M. Steijger, T. Stolarczyk, M. Taiuti, Christian Tamburini, Y. Tayalati, A. Trovato, B. Vallage, Corentin Vallée, V. van Elewyck, P. Vernin, Eelco Visser, D. Vivolo, S. Wagner, J. Wilms, E. de Wolf, K. Yatkin, H. Yepes, J. D. Zornoza, J. Zúñiga
article
Journal of High Energy Astrophysics, 2014, 3-4, pp.9-17. ⟨10.1016/j.jheap.2014.06.002⟩
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titre
Transcriptomics Reveal Several Gene Expression Patterns in the Piezophile Desulfovibrio hydrothermalis in Response to Hydrostatic Pressure
auteur
Amira Amrani, Aurélie Bergon, Hélène Holota, Christian Tamburini, Marc Garel, Bernard Ollivier, Jean Imbert, Alain Dolla, Nathalie Pradel
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2014, 9 (9), pp.e106831. ⟨10.1371/journal.pone.0106831⟩
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https://hal-amu.archives-ouvertes.fr/hal-01628348/file/journal.pone.0106831.PDF BibTex
titre
Vallitalea pronyensis sp. nov., isolated from a marine alkaline hydrothermal chimney
auteur
F. Ben Aissa, Anne Postec, G. Erauso, C. Payri, B. Pelletier, M. Hamdi, B. Ollivier, M.-L. Fardeau
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2014, 64 (Pt 4), pp.1160 - 1165. ⟨10.1099/ijs.0.055756-0⟩
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BibTex
titre
Bacterial diversity in relatively pristine and anthropogenically-influenced mangrove ecosystems (Goa, India).
auteur
Sheryl Fernandes, David L Kirchman, Valerie Michotey, Patricia Bonin, P A Lokabharathi
article
Brazilian Journal of Microbiology, Sociedade Brasileira de Microbiologia, 2014, 45 (4), pp.1161-71
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titre
Reconciliation of the carbon budget in the ocean’s twilight zone
auteur
Sarah L. C. Giering, Richard Sanders, Richard S. Lampitt, Thomas R. Anderson, Christian Tamburini, Mehdi Boutrif, Mikhail V. Zubkov, Chris M. Marsay, Stephanie A. Henson, Kevin Saw, Kathryn Cook, Daniel J. Mayor
article
Nature, Nature Publishing Group, 2014, 507 (7493), pp.480-483. ⟨10.1038/nature13123⟩
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titre
Mannitol metabolism in brown algae involves a new phosphatase family.
auteur
Agnès Groisillier, Zhanru Shao, Gurvan Michel, Sophie Goulitquer, Patricia Bonin, Stefan Krahulec, Bernd Nidetzky, Delin Duan, Catherine Boyen, Thierry Tonon
article
Journal of Experimental Botany, Oxford University Press (OUP), 2014, 65 (2), pp.559-70. ⟨10.1093/jxb/ert405⟩
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titre
Desulfatiferula berrensis sp. nov., a n-alkene-degrading sulfate-reducing bacterium isolated from estuarine sediments.
auteur
Florence Hakil, Oulfat Amin, Agnès Hirschler-Réa, Damien Mollex, Vincent Grossi, Robert Duran, Robert Matheron, Cristiana Cravo-Laureau
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2014, 64 (Pt 2), pp.540-4. ⟨10.1099/ijs.0.057174-0⟩
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BibTex
titre
Anaerobic oxidation of long-chain n-alkanes by the hyperthermophilic sulfate-reducing archaeon, Archaeoglobus fulgidus.
auteur
Nadia Khelifi, Oulfat Amin Ali, Philippe Roche, Vincent Grossi, Céline Brochier-Armanet, Odile Valette, Bernard Ollivier, Alain Dolla, Agnes Hirschler
article
ISME Journal, Nature Publishing Group, 2014, pp.18. ⟨10.1038/ismej.2014.58⟩
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titre
Relation between deep bioluminescence and oceanographic variables: A statistical analysis using time–frequency decompositions
auteur
S. Martini, David Nerini, Christian Tamburini
article
Progress in Oceanography, Elsevier, 2014, 127, pp.117-128. ⟨10.1016/j.pocean.2014.07.003⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01076992/file/Martini_etal_2014_draft.pdf BibTex
titre
Fermentative hydrogen production by a new alkaliphilic Clostridium sp (strain PROH2) isolated from a shallow submarine hydrothermal chimney in Prony Bay, New Caledonia
auteur
Nan Mei, Nesrine Zergane, Anne Postec, Gaël Erauso, Angelique Oilier, Claude Payri, Bernard Pelletier, Marie-Laure Fardeau, Bernard Ollivier, Marianne Quemeneur
article
International Journal of Hydrogen Energy, Elsevier, 2014, 39 (34), pp.19465-19473. ⟨10.1016/j.ijhydene.2014.09.111⟩
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BibTex
titre
Do furanic and phenolic compounds of lignocellulosic and algae biomass hydrolyzate inhibit anaerobic mixed cultures? A comprehensive review
auteur
F. Monlau, C. Sambusiti, A. Barakat, Marianne Quemeneur, E. Trably, J.-P. Steyer, H. Carrère
article
Biotechnology Advances, Elsevier, 2014, 32 (5), pp.934 - 951. ⟨10.1016/j.biotechadv.2014.04.007⟩
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BibTex
titre
Fluid chemistry of the low temperature hyperalkaline hydrothermal system of Prony Bay (New Caledonia)
auteur
C. Monnin, V. Chavagnac, C. Boulart, B. Menez, M. Gerard, E. Gerard, C. Pisapia, Marianne Quemeneur, Gaël Erauso, Anne Postec, L. Guentas-Dombrowski, C. Payri, B. Pelletier
article
Biogeosciences, European Geosciences Union, 2014, 11 (20), pp.5687-5706. ⟨10.5194/bg-11-5687-2014⟩
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BibTex
titre
Spatial distribution of microbial communities in the shallow submarine alkaline hydrothermal field of the Prony Bay, New Caledonia
auteur
Marianne Quéméneur, Méline Bes, Anne Postec, Nan Mei, Jérôme Hamelin, Christophe Monnin, Valérie Chavagnac, Claude Payri, Bernard Pelletier, Linda Guentas-Dombrowsky, Martine Gérard, Céline Pisapia, Emmanuelle Gérard, Bénédicte Ménez, Bernard Ollivier, Gaël Erauso
article
Environmental Microbiology Reports, Wiley, 2014, 6 (6), pp.665-674. ⟨10.1111/1758-2229.12184⟩
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Communication dans un congrès

titre
Production d’hydrogène dans les systèmes hydrothermaux hyperalcalins des ophiolites (Oman, Ligurie, Nouvelle Calédonie)
auteur
C. Monnin, V. Chavagnac, C. Boulart, G. Ceuleneer, Guilhem Hoareau, B. Ménez, E. Gérard, M. Gérard, M. Quéméneur, G. Erauso, Anne Postec, L. Guentas-Dombrowski, C. Payri, B. Pelletier
article
24ème Réunion des Sciences de la Terre : RST 2014, Pau, France, Oct 2014, 2014, Unknown, Unknown Region
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Chapitre d'ouvrage

titre
Members of the order Thermotogales: from microbiology to hydrogen production.
auteur
Martina Cappelletti, Davide Zannoni, Anne Postec, Bernard Ollivier
article
Davide Zannoni, Roberto De Philippis. Microbial BioEnergy: Hydrogen Production, Springer, pp.197-224, 2014, Advances in Photosynthesis and Respiration, 978-94-017-8553-2. ⟨10.1007/978-94-017-8554-9_9⟩
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BibTex
titre
Methods for Studying Microorganisms in the Environment
auteur
Fabien Joux, Jean Claude Bertrand, Rutger de Wit, Vincent Grossi, Laurent Intertaglia, Philippe Lebaron, Valérie Michotey, Philippe Normand, Pierre Peyret, Patrick Raimbault, Christian Tamburini, Laurent Urios
article
Environmental Microbiology: Fundamentals and Applications, Springer Netherlands, pp.757-829, 2014, 978-94-017-9117-5. ⟨10.1007/978-94-017-9118-2_17⟩
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titre
Petroleum: from formation to microbiology.
auteur
Bernard Ollivier, Jean Borgomano, Philippe Oger
article
Microbial life in the deep biosphere, De Gruyter, pp.161 -185, 2014
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Poster

titre
Dynamique de l’holobionte corallien et plasticité transcriptomique : variabilité interspécifique, interpopulationnelle et interindividuelle
auteur
Kelly Brener, Jérémie Vidal-Dupiol, Mehdi Adjeroud, Pascal Romans, Julien Loubet, Rémi Pillot, Didier Aurelle, Marine Pratlong, Anne Haguenauer, Pierre Pontaroti, Pascal Mirleau, Marc Bally, Eve Toulza, Guillaume Mitta
article
Journée de doctoriales Aragoyennes, Apr 2014, Banyuls sur Mer, France
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01134460/file/Brener-poster-doctoriales-Arago2014.pdf BibTex

2013

Article dans une revue

titre
Measurement of the atmospheric $\nu_\mu$ energy spectrum from 100 GeV to 200 TeV with the ANTARES telescope
auteur
S. Adrián-Martínez, A. Albert, I. Al Samarai, M. André, M. Anghinolfi, G. Anton, S. Anvar, M. Ardid, T. Astraatmadja, J-J. Aubert, B. Baret, J. Barrios-Martí, S. Basa, V. Bertin, S. Biagi, C. Bigongiari, C. Bogazzi, B. Bouhou, M. C. Bouwhuis, R. Bruijn, J. Brunner, J. Busto, A. Capone, L. Caramete, C. Carloganu, J. Carr, S. Cecchini, Z. Charif, Ph. Charvis, T. Chiarusi, M. Circella, F. Classen, L. Core, H. Costantini, P. Coyle, A. Creusot, C. Curtil, I. Dekeyser, Anne Deschamps, G. de Bonis, M. P. Decowski, C. Distefano, C. Donzaud, D. Dornic, Q. Dorosti, D. Drouhin, A. Dumas, T. Eberl, U. Emanuele, A. Enzenhöfer, J-P. Ernenwein, S. Escoffier, K. Fehn, P. Fermani, V. Flaminio, F. Folger, U. Fritsch, L. A. Fusco, S. Galatà, Pascal Gay, S. Geisselsöder, K. Geyer, G. Giacomelli, V. Giordano, A. Gleixner, J. P. Gómez-González, K. Graf, G. Guillard, H. van Haren, A. J. Heijboer, Y. Hello, J. J. Hernández-Rey, B. Herold, J. Hössl, C. W. James, M. de Jong, M. Kadler, O. Kalekin, A. Kappes, U. Katz, P. Kooijman, A. Kouchner, I. Kreykenbohm, V. Kulikovskiy, R. Lahmann, E. Lambard, G. Lambard, G. Larosa, D. Lattuada, Dominique Lefèvre, E. Leonora, D. Lo Presti, H. Loehner, S. Loucatos, F. Louis, S. Mangano, M. Marcelin, A. Margiotta, J. A. Martínez-Mora, S. Martini, T. Michael, T. Montaruli, M. Morganti, H. Motz, C. Mueller, M. Neff, E. Nezri, D. Palioselitis, G. E. Pavalas, C. Perrina, P. Piattelli, V. Popa, T. Pradier, C. Racca, R. Richter, C. Rivière, A. Robert, K. Roensch, A. Rostovtsev, D. F. E. Samtleben, M. Sanguineti, P. Sapienza, J. Schmid, J. Schnabel, S. Schulte, F. Schüssler, T. Seitz, R. Shanidze, C. Sieger, F. Simeone, A. Spies, M. Spurio, J. J. M. Steijger, Th. Stolarczyk, A. Sánchez-Losa, M. Taiuti, Christian Tamburini, Y. Tayalati, A. Trovato, B. Vallage, Corentin Vallée, V. van Elewyck, P. Vernin, Eelco Visser, S. Wagner, J. Wilms, E. de Wolf, K. Yatkin, H. Yepes, J.D. Zornoza, J. Zúñiga
article
European Physical Journal C: Particles and Fields, Springer Verlag (Germany), 2013, 73, pp.2606. ⟨10.1140/epjc/s10052-013-2606-4⟩
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https://arxiv.org/pdf/1308.1599 BibTex
titre
Genome Sequence of the Sulfate-Reducing Bacterium Desulfotomaculum hydrothermale Lam5(T).
auteur
Oulfat Amin, Marie-Laure Fardeau, Odile Valette, Agnès Hirschler-Réa, Valérie Barbe, Claudine Médigue, Benoit Vacherie, Bernard Ollivier, Philippe N Bertin, Alain Dolla
article
Genome Anouncements, 2013, 1 (1), epub ahead of print. ⟨10.1128/genomeA.00114-12⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00807485/file/e00114-12.pdf BibTex
titre
Mesotoga infera sp. nov., a mesophilic member of the order Thermotogales, isolated from an underground gas storage aquifer.
auteur
Wajdi Ben Hania, Anne Postec, Thomas Aüllo, Anthony Ranchou-Peyruse, Gaël Erauso, Céline Brochier-Armanet, Moktar Hamdi, Bernard Ollivier, Stéphanie Saint-Laurent, Michel Magot, Marie-Laure Fardeau
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2013, 63 (Pt 8), pp.3003-8. ⟨10.1099/ijs.0.047993-0⟩
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titre
Mesotoga infera sp. nov., a novel mesophilic member of the order Thermotogales, isolated from an underground gas storage in France
auteur
W Ben-Hamia, Anne Postec, T Aüllo, A Ranchou-Peyruse, Gaël Erauso, Céline Brochier-Armanet, M Hamdi, Bernard Ollivier, S Saint-Laurent, Michel Magot, Marie Laure Fardeau
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2013, pp.10.1099
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titre
Biochemical, Transcriptional and Translational Evidences of the Phenol-meta-Degradation Pathway by the Hyperthermophilic Sulfolobus solfataricus 98/2
auteur
Alexia Comte, Pierre Christen, Sylvain Davidson, Matthieu Pophillat, Jean Lorquin, Richard Auria, Gwenola Simon, Laurie Casalot
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2013, 8 (12), pp.e82397. ⟨10.1371/journal.pone.0082397⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00999455/file/journal.pone.0082397.pdf BibTex
titre
Denitrification activity is closely linked to the total ambient Fe concentration in mangrove sediments of Goa, India
auteur
S Fernandes, M Gonsalves, Valerie Michotey, Patricia Bonin, P Lokabharathi
article
Estuarine, Coastal and Shelf Science, Elsevier, 2013, 131, pp.64-74. ⟨10.1016/j.ecss.2013.08.008⟩
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titre
Desulfotomaculum peckii sp. nov., a moderately thermophilic member of the genus Desulfotomaculum, isolated from an upflow anaerobic filter treating abattoir wastewaters.
auteur
Linda Jabari, Hana Gannoun, Jean Luc Cayol, Moktar Hamdi, Bernard Ollivier, Guy Fauque, Marie Laure Fardeau
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2013, 63 (Pt 6), pp.2082-7. ⟨10.1099/ijs.0.043893-0⟩
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titre
Complete Genome Sequence of the Piezophilic, Mesophilic, Sulfate-Reducing Bacterium Desulfovibrio hydrothermalis AM13(T.).
auteur
Boyang Ji, Gregory Gimenez, Valérie Barbe, Benoît Vacherie, Zoé Rouy, Amira Amrani, Marie-Laure Fardeau, Philippe Bertin, Didier Alazard, Sabine Leroy, Emmanuel Talla, Bernard Ollivier, Alain Dolla, Nathalie Pradel
article
Genome Announc, 2013, 1 (1), epub ahead of print. ⟨10.1128/genomeA.00226-12⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00809071/file/e00226-12.pdf BibTex
titre
Insights into dynamics of mobile genetic elements in hyperthermophilic environments from five new thermococcus plasmids.
auteur
Mart Krupovic, Mathieu Gonnet, Wajdi Ben Hania, Patrick Forterre, Gaël Erauso
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2013, 8 (1), pp.e49044. ⟨10.1371/journal.pone.0049044⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00748527/file/journal.pone.0049044.pdf BibTex
titre
Transient Shifts in Bacterial Communities Associated with the Temperate Gorgonian Paramuricea clavata in the Northwestern Mediterranean Sea
auteur
Marie La Riviere, Marie Roumagnac, Joaquim Garrabou, Marc Bally
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2013, 8 (2), pp.e57385. ⟨10.1371/journal.pone.0057385⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00790768/file/journal.pone.0057385.PDF BibTex
titre
Vallitalea guaymasensis gen. nov., sp. nov., isolated from marine sediment.
auteur
Raja Lakhal, Nathalie Pradel, Anne Postec, Moktar Hamdi, Bernard Ollivier, Anne Godfroy, Marie-Laure Fardeau
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2013, 63 (Pt 8), pp.3019-23. ⟨10.1099/ijs.0.045708-0⟩
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titre
Characterization of Vallitalea guaymasensis gen. nov., sp. nov., a novel marine bacterium, isolated from sediments of Guaymas basin
auteur
R Lakhal, Nathalie Pradel, Anne Postec, M Hamdi, Bernard Ollivier, Anne Godfroy, Marie Laure Fardeau
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2013, pp.doi:10.1099/ijs.0.045708-0. ⟨10.1099⟩
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titre
Effects of Hydrostatic Pressure on Growth and Luminescence of a Moderately-Piezophilic Luminous Bacteria Photobacterium phosphoreum ANT-2200
auteur
Severine Martini, Badr Al Ali, Marc Garel, David Nerini, Vincent Grossi, Muriel Pacton, Laurence Casalot, Philippe Cuny, Christian Tamburini
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2013, 8 (6), pp.e66580. ⟨10.1371/journal.pone.0066580⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01988033/file/Martini_etal_2013_PLoSONE.pdf BibTex
titre
Desulfosporosinus burensis sp. nov., a spore-forming, mesophilic, sulfate-reducing bacterium isolated from a deep clay environment.
auteur
Bruno Mayeux, Marie Laure Fardeau, Manon Joseph, Laurie Casalot, Agnes Vinsot, Marc Labat
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2013, 63 (Pt 2), pp.593-8. ⟨10.1099/ijs.0.035238-0⟩
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titre
The First Genomic and Proteomic Characterization of a Deep-Sea Sulfate Reducer: Insights into the Piezophilic Lifestyle of Desulfovibrio piezophilus
auteur
Nathalie Pradel, Boyang Ji, G Gimenez, E Talla, P Lenoble, Marc Garel, Christian Tamburini, Patrick Fourquet, Régine Lebrun, Philippe Bertin, Yann Denis, Matthieu Pophillat, Valérie Barbe, Bernard Ollivier, Alain Dolla
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2013, 8 (1), pp.e55130. ⟨10.1371/journal.pone.0055130⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00787201/file/journal.pone.0055130.PDF BibTex
titre
Anaerobic bacterial degradation of pristenes and phytenes in marine sediments does not lead to pristane and phytane during early diagenesis
auteur
Jean-Francois Rontani, Patricia Bonin, Sophie Guasco, Frederic Vaultier, John K. Volkman
article
Organic Geochemistry, Elsevier, 2013, 58, pp.43-55
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titre
Impact of oil on bacterial community structure in bioturbated sediments
auteur
Magali Stauffert, Cristiana Cravo-Laureau, Ronan Jezequel, Sandra Barantal, Philippe Cuny, Franck Gilbert, Christine Cagnon, Cécile Militon, David Amouroux, Fatima Mahdaoui, Brice Bouyssiere, Georges Stora, François-Xavier Merlin, Robert Duran
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2013, vol. 8, pp. 1-15. ⟨10.1371/journal.pone.0065347⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00867612/file/Gilbert_9564.pdf BibTex
titre
Prokaryotic responses to hydrostatic pressure in the ocean - a review
auteur
Christian Tamburini, Mehdi Boutrif, Marc Garel, Rita Colwell, Jody Deming
article
Environmental Microbiology, Wiley-Blackwell, 2013, 15 (5), pp.1262-1274. ⟨10.1111/1462-2920.12084⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01988054/file/Tamburini_etal_EMI_draft.pdf BibTex
titre
Deep-Sea Bioluminescence Blooms after Dense Water Formation at the Ocean Surface
auteur
Christian Tamburini, Miquel Canals, Xavier Durrieu de Madron, Loïc Houpert, Dominique Lefèvre, Séverine Martini, Fabrizio d'Ortenzio, Anne Robert, Pierre Testor, Juan Antonio Aguilar, Imen Al Samarai, Arnaud Albert, Michel André, Marco Anghinolfi, Gisela Anton, Shebli Anvar, Miguel Ardid, Ana Carolina Assis Jesus, Tri L. Astraatmadja, Jean-Jacques Aubert, Bruny Baret, Stéphane Basa, Vincent Bertin, Simone Biagi, Armando Bigi, Ciro Bigongiari, Claudio Bogazzi, Manuel Bou-Cabo, Boutayeb Bouhou, Mieke C. Bouwhuis, Jurgen Brunner, José Busto, Francisco Camarena, Antonio Capone, Christina Cârloganu, Giada Carminati, John Carr, Stefano Cecchini, Ziad Charif, Philippe Charvis, Tommaso Chiarusi, Marco Circella, Rosa Coniglione, Heide Costantini, Paschal Coyle, Christian Curtil, Patrick Decowski, Ivan Dekeyser, Anne Deschamps, Corinne Donzaud, Damien Dornic, Hasankiadeh Q. Dorosti, Doriane Drouhin, Thomas Eberl, Umberto Emanuele, Jean-Pierre Ernenwein, Stéphanie Escoffier, Paolo Fermani, Marcelino Ferri, Vincenzo Flaminio, Florian Folger, Ulf Fritsch, Jean-Luc Fuda, Salvatore Galatà, Pascal Gay, Giorgio Giacomelli, Valentina Giordano, Juan-Pablo Gómez-González, Kay Graf, Goulven Guillard, Garadeb Halladjian, Gregory Hallewell, Hans van Haren, Joris Hartman, Aart J. Heijboer, Yann Hello, Juan Jose Hernández-Rey, Bjoern Herold, Jurgen Hößl, Ching-Cheng Hsu, Marteen de Jong, Matthias Kadler, Oleg Kalekin, Alexander Kappes, Uli Katz, Oksana Kavatsyuk, Paul Kooijman, Claudio Kopper, Antoine Kouchner, Ingo Kreykenbohm, Vladimir Kulikovskiy, Robert Lahmann, Patrick Lamare, Giuseppina Larosa, Dario Lattuada, Gordon Lim, Domenico Lo Presti, Herbert Loehner, Sotiris Loucatos, Salvatore Mangano, Michel Marcelin, Annarita Margiotta, Juan Antonio Martinez-Mora, Athina Meli, Teresa Montaruli, Luciano Moscoso, Holger Motz, Max Neff, Emma Nuel Nezri, Dimitris Palioselitis, Gabriela E. Păvălaş, Kevin Payet, Patrice Payre, Jelena Petrovic, Paolo Piattelli, Nicolas Picot-Clemente, Vlad Popa, Thierry Pradier, Eleonora Presani, Chantal Racca, Corey Reed, Giorgio Riccobene, Carsten Richardt, Roland Richter, Colas Rivière, Kathrin Roensch, Andrei Rostovtsev, Joaquin Ruiz-Rivas, Marius Rujoiu, Valerio G. Russo, Francisco Salesa, Augustin Sánchez-Losa, Piera Sapienza, Friederike Schöck, Jean-Pierre Schuller, Fabian Schussler, Rezo Shanidze, Francesco Simeone, Andreas Spies, Maurizio Spurio, Jos J. M. Steijger, Thierry Stolarczyk, Mauro G. F. Taiuti, Simona Toscano, Bertrand Vallage, Véronique van Elewyck, Giulia Vannoni, Manuela Vecchi, Pascal Vernin, Guus Wijnker, Jorn Wilms, Els de Wolf, Harold Yepes, Dmitry Zaborov, Juan de Dios Zornoza, Juan Zúñiga
article
PLoS ONE, Public Library of Science, 2013, 8 (7), pp.e67523. ⟨10.1371/JOURNAL.PONE.0067523⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01012135/file/journal.pone.0067523.PDF BibTex
titre
DNA Self-Assembly: From Chirality to Evolution
auteur
Y. Timsit
article
International Journal of Molecular Sciences, MDPI, 2013, 14 (4), pp.8252 - 8270. ⟨10.3390/ijms14048252⟩
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BibTex
titre
Trends in salinity and inorganic nitrogen compounds in the Berre lagoon (1994-2011) bacterial activities and nitrogen budgets
auteur
Imen Zaghmouri, Valerie Michotey, Sophie Guasco, Patrick Raimbault, Nicole Garcia, Guillaume Bernard, Patricia Bonin
article
Marine Pollution Bulletin, Elsevier, 2013, 67, pp.55-65. ⟨10.1016/j.marpolbul.2012.11.046⟩
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Autre publication

titre
Des Microoganismes très convoités
auteur
Bernard Ollivier
article
2013, pp.n°70
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Rapport

titre
Technical Design Report of the MEUST Infrastructure
auteur
M. Ageron, K. Bernardet, V. Bertin, S. Beurthey, M. Billault, J. Brunner, L. Caillat, A. Cosquer, P. Coyle, J.J. Destelle, D. Dornic, C. Gojak, Z. Hafidi, S. Henry, P. Keller, P. Lamare, Dominique Lefèvre, Y. Lenault, K. Mahiouz, J. Royon, M. Solazzo, Christian Tamburini, D. Tézier, S. Théraube, Corentin Vallée
article
2013
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titre
Evaluation and Selection of the MEUST Submarine Site
auteur
V. Bertin, M. Billault, P. Coyle, C. Curtil, S. Deguero, J.-J. Destelle, D. Dornic, F. Gallo, S. Henry, P. Keller, P. Lamare, Dominique Lefèvre, F. LÉon, S. Martini, Christian Tamburini, Corentin Vallée
article
2013, pp.1-15
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2012

Article dans une revue

titre
Defluviitoga tunisiensis gen. nov., sp. nov., a thermophilic bacterium isolated from a mesothermic and anaerobic whey digester.
auteur
Wajdi Ben Hania, Ramzi Ghodbane, Anne Postec, Moktar Hamdi, Bernard Ollivier, Marie Laure Fardeau
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2012, 62 (Pt 6), pp.1377-82. ⟨10.1099/ijs.0.033720-0⟩
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titre
Fusibacter tunisiensis sp. nov., isolated from an anaerobic reactor used to treat olive-mill wastewater.
auteur
Wajdi Ben Hania, Belkis Fraj, Anne Postec, Khaled Fadhlaoui, Moktar Hamdi, Bernard Ollivier, Marie Laure Fardeau
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2012, 62 (Pt 6), pp.1365-8. ⟨10.1099/ijs.0.034603-0⟩
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titre
Kinetics of aerobic phenol biodegradation by the acidophilic and hyperthermophilic archaeon Sulfolobus solfataricus 98/2
auteur
Pierre Christen, Armando Vega, Laurie Casalot, Gwenola Simon, Richard Auria
article
Biochemical Engineering Journal, Elsevier, 2012, 62, pp.56-61. ⟨10.1016/j.bej.2011.12.012⟩
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BibTex
titre
Analysis of Structure-Function Relationships in the Colibactin-Maturating Enzyme ClbP.
auteur
A Cougnoux, L Gibold, F Robin, D Dubois, Nathalie Pradel, A Darfeuille-Michaud, G Dalmasso, J Delmas, R Bonnet
article
Journal of Molecular Biology, Elsevier, 2012, in press. ⟨10.1016/j.jmb.2012.09.017⟩
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BibTex
titre
Methanomassiliicoccus luminyensis gen. nov., sp. nov., a methanogenic archaeon isolated from human faeces.
auteur
B Dribi, Marie Laure Fardeau, Bernard Ollivier, Didier Raoult, Michel Drancourt
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2012, 62 (Pt 8), pp.1902-7. ⟨10.1099/ijs.0.033712-0⟩
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BibTex
titre
Tungsten-enhanced growth of Methanosphaera stadtmanae
auteur
Bédis Dridi, Saber Khelaifia, Marie Laure Fardeau, Bernard Ollivier, Michel Drancourt
article
BMC Research Notes, BioMed Central, 2012, 5, pp.238. ⟨10.1186/1756-0500-5-238⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00746580/file/document%289%29.pdf BibTex
titre
Nitrogen-limited mangrove ecosystems conserve N through dissimilatory nitrate reduction to ammonium
auteur
Sheryl Fernandes, Patricia Bonin, Valerie Michotey, Nicole Garcia, P. A. Lokabharathi
article
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2012, 2, pp.419. ⟨10.1038/srep00419⟩
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BibTex
titre
Denitrification prevails over anammox in tropical mangrove sediments (Goa, India)
auteur
Sheryl Fernandes, Valerie Michotey, Sophie Guasco, Patricia Bonin, P. A. Loka Bharathi
article
Marine Environmental Research, Elsevier, 2012, 74, pp.9-19. ⟨10.1016/j.marenvres.2011.11.008⟩
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BibTex
titre
Isolation and characterization of Fonticella tunisiensis gen nov., sp. nov., a novel bacterium isolated from a Tunisian hot spring.
auteur
Belkis Fraj, Wajdi Ben Hania, Anne Postec, Moktar Hamdi, Bernard Ollivier, Marie Laure Fardeau
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2012, pp.10.1099/ijs.0.041947-0. ⟨10.1099/ijs.0.041947-0⟩
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BibTex
titre
Desulfosoma profundi sp nov., a thermophilic sulfate-reducing bacterium isolated from a deep terrestrial geothermal spring in France
auteur
Patrick Gregoire, Marie Laure Fardeau, Sophie Guasco, Joel Lagiere, Jean Cambar, Valerie Michotey, Patricia Bonin, Bernard Ollivier
article
Antonie van Leeuwenhoek, Springer Verlag, 2012, 101, pp.595-602. ⟨10.1007/s10482-011-9675-x⟩
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BibTex
titre
Understanding and tuning the catalytic bias of hydrogenase.
auteur
Abbas Abou Hamdan, Sébastien Dementin, Pierre-Pol Liebgott, Oscar Gutierrez-Sanz, Pierre Richaud, Antonio de Lacey, Marc Rousset, Patrick Bertrand, Laurent Cournac, Christophe Léger
article
Journal of the American Chemical Society, American Chemical Society, 2012, 134 (20), pp.8368-71. ⟨10.1021/ja301802r⟩
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BibTex
titre
Methanogenic octadecene degradation by syntrophic enrichment culture from brackish sediments
auteur
Agnes Hirschler, Cristiana Cravo-Laureau, Laurie Casalot, Robert Matheron
article
Current Microbiology, Springer Verlag, 2012, 65 (5), pp.561-7. ⟨10.1007/s00284-012-0195-3⟩
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BibTex
titre
Macellibacteroides fermentans gen. nov., sp. nov., a member of the family Porphyromonadaceae isolated from an upflow anaerobic filter treating abattoir wastewaters.
auteur
L Jabari, H Gannoun, Jean Luc Cayol, A Hedi, M Sakamoto, E Falsen, M Ohkuma, M Hamdi, Guy Fauque, Bernard Ollivier, Marie Laure Fardeau
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2012, 62 (Pt 10), pp.2522-7. ⟨10.1099/ijs.0.032508-0⟩
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BibTex
titre
Characterization of Defluviitalea saccharophila gen. nov., sp. nov., a thermophilic bacterium isolated from an upflow anaerobic filter treating abattoir wastewaters, and proposal of Defluviitaleaceae fam. nov.
auteur
Linda Jabari, Hana Gannoun, Jean Luc Cayol, Moktar Hamdi, Guy Fauque, Bernard Ollivier, Marie Laure Fardeau
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2012, 62 (Pt 3), pp.550-5. ⟨10.1099/ijs.0.030700-0⟩
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BibTex
titre
How to analyse bioluminescence time series from in situ observatories? Example from high frequency records and real time data at the ANTARES site
auteur
Severine Martini, David Nerini, Christian Tamburini
article
Luminescence, Wiley, 2012, 27 (2), pp.139-140
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BibTex
titre
Halanaerobacter jeridensis sp. nov., isolated from a hypersaline lake.
auteur
M Mezghani, Didier Alazard, F Karray, Jean Luc Cayol, Manon Joseph, Anne Postec, Marie Laure Fardeau, Jean-Luc Tholozan, S Sayadi
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2012, 62 (Pt 8), pp.1970-3. ⟨10.1099/ijs.0.036301-0⟩
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BibTex
titre
Spatio-temporal diversity of free-living and particle-attached prokaryotes in the tropical lagoon of Ahe atoll (Tuamotu Archipelago) and its surrounding oceanic waters
auteur
Valerie Michotey, Sophie Guasco, Dominique Boeuf, Nicola Morezzi, Brice Durieu, Loïc Charpy, Patricia Bonin
article
Marine Pollution Bulletin, Elsevier, 2012, 65 (10), pp.525-537. ⟨10.1016/j.marpolbul.2012.01.009⟩
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BibTex
titre
Magnetotactic Bacteria in Microcosms Originating from the French Mediterranean Coast Subjected to Oil Industry Activities
auteur
Anne Postec, Nicolas Tapia, Alain Bernadac, Manon Joseph, Sylvain Davidson, Long-Fei Wu, Bernard Ollivier, Nathalie Pradel
article
Microbial Ecology, Springer Verlag, 2012, 63, pp.1-11. ⟨10.1007/s00248-011-9910-z⟩
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BibTex
titre
Inhibition of fermentative hydrogen production by lignocellulose-derived compounds in mixed cultures
auteur
Marianne Quéméneur, Jérôme Hamelin, Abdellatif Barakat, Jean-Philippe Steyer, Hélène Carrère, Eric Trably
article
International Journal of Hydrogen Energy, Elsevier, 2012, 37 (4), pp.3150 - 3159. ⟨10.1016/j.ijhydene.2011.11.033⟩
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BibTex
titre
Effect of enzyme addition on fermentative hydrogen production from wheat straw
auteur
Marianne Quéméneur, Marine Bittel, Eric Trably, Claire Dumas, Laurent Fourage, Gilles Ravot, Jean-Philippe Steyer, Hélène Carrère
article
International Journal of Hydrogen Energy, Elsevier, 2012, 37 (14), pp.10639 - 10647. ⟨10.1016/j.ijhydene.2012.04.083⟩
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BibTex
titre
DNA-DNA Recognition: From Tight Contact to Fatal Attraction
auteur
Y. Timsit
article
InTech, Isa Instrument Society of America, 2012
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02008304/file/30530.pdf BibTex
titre
DNA-Directed Base Pair Opening
auteur
Y. Timsit
article
Molecules, MDPI, 2012, 17 (10), pp.11947-11964
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BibTex
titre
Mimicking floodplain reconnection and disconnection using 15N mesocosm incubations
auteur
N Welti, E Bondar-Kunze, M Mair, Patricia Bonin, W Wanek, G Pinay, T Hein
article
Biogeosciences Discussions, European Geosciences Union, 2012, 9, pp.4133-4176. ⟨10.5194/bgd-9-4133-2012⟩
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BibTex
titre
Mimicking floodplain reconnection and disconnection using 15N mesocosm incubations
auteur
N. Welti, E. Bondar-Kunze, M. Mair, Patricia Bonin, W. Wanek, Gilles Pinay, T. Hein
article
Biogeosciences, European Geosciences Union, 2012, 9 (11), pp.4263-4278. ⟨10.5194/bg-9-4263-2012⟩
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Communication dans un congrès

titre
Effects of pressure, temperature and salinity on metabolic activity of anaerobic strains
auteur
Vanessa Barsotti, Sébastien Dupraz, Catherine Joulian, Fabienne Battaglia-Brunet, Claire Sergeant, Bernard Ollivier, Françis Garrido
article
7th International Conference on High Pressure Bioscience and Biotechnology (HPBB2012), Oct 2012, Kyoto, Japan
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titre
Diversity of gorgonian-associated bacterial communities in Northwestern Mediterranean Sea
auteur
Marie La Riviere, Marie Roumagnac, Joaquim Garrabou, Marc Bally
article
The 14th International Symposium on Microbial Ecology (ISME), Aug 2012, Copenhague, Denmark
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titre
How to analyse bioluminescence time series from in situ observatories ? Example from high frequency records and real time data at the ANTARES site.
auteur
Severine Martini, Christian Tamburini, David Nerini
article
International symposium on bioluminescence and chemiluminescence (17th), May 2012, Guelph, Canada
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titre
Identification des liens entre communautés associées au cycle de l'azote par méthode d'enrichissement isotopique: Application aux zones d'interfaces aérobie/anaérobie des sédiments marins
auteur
Valerie Michotey
article
Identification des liens entre communautés associées au cycle de l'azote par méthode d'enrichissemen, Oct 2012, Clermont Ferrand, France
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Chapitre d'ouvrage

titre
Les conditions de vie extrêmes sur la planète et exobiologie
auteur
Jean Luc Cayol, Bernard Ollivier, Didier Alazard, Ricardo Amils, Anne Godfroy, Florence Piette, Daniel Prieur
article
Ecologie microbienne, Presses Universitaires de Pau et des Pays de l'Adour, pp.363-408, 2012
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Autre publication

titre
Les micro-rois du pétrole
auteur
Bernard Ollivier
article
2012
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titre
Bactéries de l'extrême.
auteur
Bernard Ollivier, Patrick Gregoire
article
2012, pp.63
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Brevet

titre
Culture et detection d'une Archaea méthanogène.
auteur
B Dridi, Marie Laure Fardeau, Bernard Ollivier, Didier Raoult, Michel Drancourt
article
France, N° de brevet: N° H52 888 cas 8 PCT/MD. MIO:12-093. 2012
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2011

Article dans une revue

titre
The chemical-in-mu well: a high-throughput technique for identifying solutes eliciting a chemotactic response in motile bacteria
auteur
Joshua Armitano, Claudine Baraquet, Valerie Michotey, Vincent Mejean, Cecile Jourlin-Castelli
article
Research in Microbiology, Elsevier, 2011, 162, pp.934-938. ⟨10.1016/j.resmic.2011.03.001⟩
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titre
Marine ecosystems’ responses to climatic and anthropogenic forcings in the Mediterranean
auteur
X. Durrieu de Madron, C. Guieu, R. Sempere, P. Conan, D. Cossa, F. D’ortenzio, C. Estournel, F. Gazeau, C. Rabouille, L. Stemmann, Sophie Bonnet, Frederic Diaz, P. Koubbi, O. Radakovitch, M. Babin, M. Baklouti, C. Bancon-Montigny, S. Belviso, N. Bensoussan, B. Bonsang, I. Bouloubassi, C. Brunet, F. Cadiou, F. Carlotti, M. Chami, S. Charmasson, B. Charrière, J. Dachs, D. Doxaran, C. Dutay, F. Elbaz-Poulichet, M. Eléaume, F. Eyrolles, C. Fernandez, S. Fowler, P. Francour, C. Gaertner, R. Galzin, S. Gasparini, F. Ghiglione, L. Gonzalez, C. Goyet, L. Guidi, K. Guizien, Lars-Eric Heimbürger, S. Jacquet, W.H. Jeffrey, F. Joux, P. Le Hir, K. Leblanc, Dominique Lefèvre, C. Lejeusne, R. Lemé, D. Loÿe-Pilot, M. Mallet, L. Mejanelle, F. Mélin, C. Mellon, B. Merigot, P. Merle, C. Migon, L. Miller, L. Mortier, B. Mostajir, L. Mousseau, T. Moutin, J. Para, T. Pérez, Anne Petrenko, C. Poggiale, L. Prieur, M. Pujo-Pay, Elvira Pulido-Villena, Patrick Raimbault, P. Rees, C. Ridame, F. Rontani, D. Ruiz Pino, M. Sicre, V. Taillandier, Christian Tamburini, T. Tanaka, I. Taupier-Letage, M. Tedetti, P. Testor, H. Thebault, B. Thouvenin, F. Touratier, J. Tronczynski, C. Ulses, France van Wambeke, V. Vantrepotte, S. Vaz, R. Verney
article
Progress in Oceanography, Elsevier, 2011, 91 (2), pp.97-166. ⟨10.1016/j.pocean.2011.02.003⟩
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titre
Caldilinea tarbellica sp nov., a filamentous, thermophilic, anaerobic bacterium isolated from a deep hot aquifer in the Aquitaine Basin
auteur
Patrick Gregoire, Malek Bohli, Jean Luc Cayol, Manon Joseph, Sophie Guasco, Karine Dubourg, Jean Cambar, Valerie Michotey, Patricia Bonin, Marie Laure Fardeau, Bernard Ollivier
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2011, 61, pp.1436-1441
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titre
Isolation and characterization of Thermanaerothrix daxensis gen. nov., sp nov., a thermophilic anaerobic bacterium pertaining to the phylum "Chloroflexi", isolated from a deep hot aquifer in the Aquitaine Basin
auteur
Patrick Gregoire, Marie Laure Fardeau, Manon Joseph, Sophie Guasco, Francette Hamaide, Sandra Biasutti, Valerie Michotey, Patricia Bonin, Bernard Ollivier
article
Systematic and Applied Microbiology, Elsevier, 2011, 34, pp.494-497. ⟨10.1016/j.syapm.2011.02.004⟩
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titre
Anaerobic ammonium oxidation mediated by Mn-oxides: from sediment to strain level
auteur
Cedric Javanaud, Valerie Michotey, Sophie Guasco, Nicole Garcia, Pierre Anschutz, Mathieu Canton, Patricia Bonin
article
Research in Microbiology, Elsevier, 2011, 162, pp.848-857. ⟨10.1016/j.resmic.2011.01.011⟩
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titre
Functional versus phylogenetic fingerprint analyses for monitoring hydrogen-producing bacterial populations in dark fermentation cultures
auteur
Marianne Quéméneur, Jérôme Hamelin, Eric Latrille, Jean-Philippe Steyer, Eric Trably
article
International Journal of Hydrogen Energy, Elsevier, 2011, 36 (6), pp.3870 - 3879. ⟨10.1016/j.ijhydene.2010.12.100⟩
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titre
Cytosine, the double helix and DNA self-assembly
auteur
Y. Timsit, Peter Varnai
article
Journal of Molecular Recognition, Wiley, 2011, 24 (2), pp.137-138
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titre
Local sensing of global DNA topology: from crossover geometry to type II topoisomerase processivity
auteur
Y. Timsit
article
Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2011, 39 (20), pp.8665-8676
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titre
Acoustic and optical variations during rapid downward motion episodes in the deep north-western Mediterranean Sea
auteur
H. van Haren, I. Taupier-Letage, J.A. Aguilar, A. Albert, G. Anton, S. Anvar, M. Ardid, A.C. Assis Jesus, T. Astraatmadja, J.-J. Aubert, R. Auer, B. Baret, S. Basa, M. Bazzotti, V. Bertin, S. Biagi, C. Bigongiari, M. Bou-Cabo, M.C. Bouwhuis, A. Brown, J. Brunner, J. Busto, F. Camarena, A. Capone, G. Carminati, J. Carr, D. Castel, E. Castorina, V. Cavasinni, S. Cecchini, Ph. Charvis, T. Chiarusi, M. Circella, R. Coniglione, H. Costantini, N. Cottini, P. Coyle, C. Curtil, G. de Bonis, M.P. Decowski, I. Dekeyser, Anne Deschamps, C. Distefano, C. Donzaud, D. Dornic, D. Drouhin, T. Eberl, U. Emanuele, J.-P. Ernenwein, S. Escoffier, F. Fehr, V. Flaminio, K. Fratini, U. Fritsch, J.-L. Fuda, G. Giacomelli, J.P. Gómez-González, K. Graf, G. Guillard, G. Halladjian, G. Hallewell, A.J. Heijboer, Y. Hello, J.J. Hernández-Rey, J. Hößl, M. de Jong, N. Kalantar-Nayestanaki, O. Kalekin, A. Kappes, U. Katz, P. Kooijman, C. Kopper, A. Kouchner, W. Kretschmer, R. Lahmann, P. Lamare, G. Lambard, G. Larosa, H. Laschinsky, Dominique Lefèvre, G. Lelaizant, G. Lim, D. Lo Presti, H. Loehner, S. Loucatos, F. Lucarelli, K. Lyons, S. Mangano, M. Marcelin, A. Margiotta, J.A. Martinez-Mora, G. Maurin, A. Mazure, M. Melissas, T. Montaruli, M. Morganti, L. Moscoso, H. Motz, C. Naumann, M. Neff, R. Ostasch, G. Palioselitis, G.E. Păvălaş, P. Payre, J. Petrovic, P. Piattelli, N. Picot-Clemente, C. Picq, R. Pillet, V. Popa, T. Pradier, E. Presani, C. Racca, A. Radu, C. Reed, G. Riccobene, C. Richardt, M. Rujoiu, G.V. Russo, F. Salesa, F. Schoeck, J.-P. Schuller, R. Shanidze, F. Simeone, M. Spurio, J.J.M. Steijger, Th. Stolarczyk, Christian Tamburini, L. Tasca, S. Toscano, B. Vallage, V. van Elewyck, M. Vecchi, P. Vernin, G. Wijnker, E. de Wolf, H. Yepes, D. Zaborov, J.D. Zornoza, J. Zúñiga, M. Anghinolfi
article
Deep Sea Research Part I: Oceanographic Research Papers, Elsevier, 2011, 58, pp.875-884. ⟨10.1016/j.dsr.2011.06.006⟩
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Communication dans un congrès

titre
Quantification des activités du cycle de l'azote dans des sédiments soumis à des apports d'eau douce: impact sur l'état d'eutrophisation de l'écosystème
auteur
Imen Zaghmouri, Patricia Bonin, Valerie Michotey
article
Lagun'R, Mar 2011, Aix en Provence, France. pp.178-182
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Chapitre d'ouvrage

titre
Hydrocarbon degradation in coastal muddy areas and anoxic ecosystems (DHYVA project): Role of bacterial mechanisms and bioturbation effects on the biodisponibility of organic pollutants
auteur
Magalie Stauffert, Lionel Huang, Isabelle Vitte, Ronan Jézéquel, Cristiana Cravo-Laureau, Georges Stora, C. Pecheyran, Christine Cagnon, Franck Gilbert, Marisol Goñi-Urriza, François-Xavier Merlin, David Amouroux, Philippe Cuny, Robert Duran
article
Ceccaldi, H.-J., Dekeyser, I., Girault, M., Stora, G. Global Change: Mankind-Marine Environment Interactions, Springer, pp.393-395, 2011, ISBN 978-90-481-8630-3
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2010

Article dans une revue

titre
Fatty acids as biomarkers to indicate main carbon sources of four major invertebrate families in a large River (the Allier, France)
auteur
Aurélie Descroix, Alexandre Bec, Gilles Bourdier, Denis Sargos, Jeremy Sauvanet, Benjamin Misson, Christian Desvilettes
article
Fundamental and Applied Limnology, E Schweizerbart Science Publishers, 2010, 177 (1), pp.39 - 55. ⟨10.1127/1863-9135/2010/0177-0039⟩
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titre
Effect of Oxygen and Redox Potential on Glucose Fermentation in Thermotoga maritima under Controlled Physicochemical Conditions
auteur
Raja Lakhal, Richard Auria, Sylvain Davidson, Bernard Ollivier, Alain Dolla, Moktar Hamdi, Yannick Combet-Blanc
article
International Journal of Microbiology, Hindawi Publishing Corporation, 2010, 2010, pp.1 - 10. ⟨10.1155/2010/896510⟩
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titre
Response of an archaeal community from anoxic coastal marine sediments to experimental petroleum contamination
auteur
Gilles Miralles, Monique Acquaviva, Jean Claude Bertrand, Philippe Cuny
article
Aquatic Microbial Ecology, Inter Research, 2010, 59, pp.25-31. ⟨10.3354/ame01379⟩
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titre
Development and application of a functional CE-SSCP fingerprinting method based on [Fe–Fe]-hydrogenase genes for monitoring hydrogen-producing Clostridium in mixed cultures
auteur
Marianne Quéméneur, Jérôme Hamelin, Eric Latrille, Jean-Philippe Steyer, Eric Trably
article
International Journal of Hydrogen Energy, Elsevier, 2010, 35 (24), pp.13158 - 13167. ⟨10.1016/j.ijhydene.2010.07.076⟩
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titre
Mesopelagic zone ecology and biogeochemistry - a synthesis
auteur
Carol Robinson, Deborah K. Steinberg, Thomas R. Anderson, Javier Aristegui, Craig A. Carlson, Jessica R. Frost, Jean-Francois Ghiglione, Santiago Hernandez-Leon, George A. Jackson, Rolf Koppelmann, Bernard Queguiner, Olivier Ragueneau, Fereidoun Rassoulzadegan, Bruce H. Robison, Christian Tamburini, Tsuneo Tanaka, Karen F. Wishner, Jing Zhang
article
Deep Sea Research Part II: Topical Studies in Oceanography, Elsevier, 2010, 57, pp.1504-1518. ⟨10.1016/j.dsr2.2010.02.018⟩
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titre
Differential stability of DNA crossovers in solution mediated by divalent cations
auteur
Péter Várnai, Y. Timsit
article
Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2010, 38 (12), pp.4163-4172
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2009

Article dans une revue

titre
Nitrogen fixation in the western equatorial Pacific: Rates, diazotrophic cyanobacterial size class distribution, and biogeochemical significance
auteur
Sophie Bonnet, Isabelle Biegala, Pierre Dutrieux, Lia Slemons, Douglas Capone
article
Global Biogeochemical Cycles, American Geophysical Union, 2009, 23 (3), pp.n/a - n/a. ⟨10.1029/2008GB003439⟩
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titre
Mass mortality in Northwestern Mediterranean rocky benthic communities: effects of the 2003 heat wave
auteur
J. Garrabou, R. Coma, N. Bensoussan, Marc Bally, P. Chevaldonne, M. Cigliano, D. Diaz, Jean Georges Harmelin, M. C. Gambi, D. K. Kersting, Jean-Baptiste Ledoux, C. Lejeusne, C. Linares, C. Marschal, T. Perez, M. Ribes, J. C. Romano, E. Serrano, N. Teixido, O. Torrents, M. Zabala, Frédéric Zuberer, C. Cerrano
article
Global Change Biology, Wiley, 2009, 15, pp.1090-1103. ⟨10.1111/j.1365-2486.2008.01823.x⟩
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titre
Hydroxytyrosol from tyrosol using hydroxyphenylacetic acid-induced bacterial cultures and evidence of the role of 4-HPA 3-hydroxylase
auteur
Pierre-Pol Liebgott, Agnès Amouric, Alexia Comte, Jean Tholozan, Jean Lorquin
article
Research in Microbiology, Elsevier, 2009, 160 (10), pp.757 - 766. ⟨10.1016/j.resmic.2009.09.015⟩
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titre
Effect of O 2 concentrations on Sulfolobus solfataricus P2
auteur
Gwenola Simon, Jasper Walther, Nathalie Zabeti, Yannick Combet-Blanc, Richard Auria, John van der Oost, Laurence Casalot
article
FEMS Microbiology Letters, Wiley-Blackwell, 2009, 299 (2), pp.255 - 260. ⟨10.1111/j.1574-6968.2009.01759.x⟩
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titre
The Role of Disordered Ribosomal Protein Extensions in the Early Steps of Eubacterial 50 S Ribosomal Subunit Assembly
auteur
Y. Timsit, Zahir Acosta, Frédéric Allemand, Claude Chiaruttini, Mathias Springer
article
International Journal of Molecular Sciences, MDPI, 2009, 10 (3), pp.817-834
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2008

Article dans une revue

titre
Metabolism of n-alkanes and n-alkenes by anaerobic bacteria: A summary
auteur
Vincent Grossi, Cristiana Cravo-Laureau, Rémy Guyoneaud, Anthony Ranchou-Peyruse, Agnès Hirschler-Réa
article
Organic Geochemistry, Elsevier, 2008, 39 (8), pp.1197 - 1203. ⟨10.1016/j.orggeochem.2008.02.010⟩
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2007

Article dans une revue

titre
Bioconversion of tyrosol into hydroxytyrosol and 3,4-dihydroxyphenylacetic acid under hypersaline conditions by the new Halomonas sp. strain HTB24
auteur
Pierre-Pol Liebgott, Marc Labat, Laurence Casalot, Agnès Amouric, Jean Lorquin
article
FEMS Microbiology Letters, Wiley-Blackwell, 2007, 276 (1), pp.26 - 33. ⟨10.1111/j.1574-6968.2007.00896.x⟩
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titre
The 1.3 A resolution structure of the RNA tridecamer r(GCGUUUGAAACGC): Metal ion binding correlates with base unstacking and groove contraction
auteur
Y. Timsit, S. Bombard
article
RNA, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2007, 13 (12), pp.2098-2107
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Chapitre d'ouvrage

titre
Impact of the deep biosphere on CO2 storage performance
auteur
Bénédicte Ménez, S Dupraz, Emmanuelle Gérard, François Guyot, Céline Rommevaux, Maximilien Libert, F Delorme, Christian Michel, Fabienne Battaglia-Brunet, Bruno Garcia, Denis Blanchet, Alain-Yves Huc, F. Haeseler, Phil M. Oger, Gilles Dromart, Bernard Ollivier, Michel Magot
article
Geotechnologien Science Reports, 9, pp.150-163, 2007, French-German Symposium on Geological storage of CO2
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2006

Article dans une revue

titre
Coexistence of two protein folding states in the crystal structure of ribosomal protein L20
auteur
Y. Timsit, Frédéric Allemand, Claude Chiaruttini, Mathias Springer
article
EMBO Reports, EMBO Press, 2006, 7 (10), pp.1013-1018
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2005

Article dans une revue

titre
Molecular, Biochemical, and Physiological Approaches for Understanding the Ecology of Denitrification
auteur
Christelle Goréguès, Valerie Michotey, Patricia Bonin
article
Microbial Ecology, Springer Verlag, 2005, 49 (2), pp.198-208
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Brevet

titre
Use of bacterium strains for the preparation of metallic biocatalysts, in particular for the preparation of palladium biocatalysts
auteur
Marc Rousset, Laurence Casalot, Pascale de Philip, A. Belaich, L. E. Macaskie, I. Mykheenko
article
France, Patent n° : 05 290 387.9. 2005
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2004

Article dans une revue

titre
Isolation of hydrocarbonoclastic denitrifying bacteria from berre microbial mats
auteur
Christelle Goréguès, Valerie Michotey, Patricia Bonin
article
Ophelia, Taylor & Francis, 2004, 58 (3), pp.263-270
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2003

Article dans une revue

titre
Quantitative assessment of picoeukaryotes in the natural environment by using taxon-specific oligonucleotide probes in association with tyramide signal amplification-fluorescence in situ hybridization and flow cytometry.
auteur
Isabelle Biegala, Fabrice Not, Daniel Vaulot, Nathalie Simon
article
Applied and Environmental Microbiology, American Society for Microbiology, 2003
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titre
Glucose Fermentation by Propionibacterium microaerophilum : Effect of pH on Metabolism and Bioenergetic
auteur
Marina Koussémon, Yannick Combet-Blanc, Bernard Ollivier
article
Current Microbiology, Springer Verlag, 2003, 46 (2), pp.141 - 145. ⟨10.1007/s00284-002-3839-x⟩
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2001

Article dans une revue

titre
Propionibacterium microaerophilum sp. nov., a microaerophilic bacterium isolated from olive mill wastewater
auteur
Yannick Combet-Blanc, Pierre Thomas, Bernard Ollivier, Marina Koussémon, Jean-Luc Cayol, Jean-Louis Garcia, Bharat Patel
article
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2001, 51 (4), pp.1373 - 1382. ⟨10.1099/00207713-51-4-1373⟩
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titre
Hydration and structural alterations of A-DNA. Implications for the accuracy of DNA replication.
auteur
C Mayer, Y. Timsit
article
Cellular and Molecular Biology, R. Wegmann, 2001, 47 (5), pp.815-22
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titre
Convergent Evolution of MutS and Topoisomerase II for Clamping DNA crossovers and stacked Holliday junctions
auteur
Y. Timsit
article
Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, Taylor & Francis: STM, Behavioural Science and Public Health Titles, 2001, 19 (2), pp.215-218. ⟨10.1080/07391102.2001.10506733⟩
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2000

Article dans une revue

titre
DNA Structure and Polymerase Fidelity: A New Role for A-DNA
auteur
Y. Timsit
article
Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, Taylor & Francis: STM, Behavioural Science and Public Health Titles, 2000, 17 (sup1), pp.169-176. ⟨10.1080/07391102.2000.10506617⟩
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1999

Article dans une revue

titre
DNA structure and polymerase fidelity 1 1Edited by T. Richmond
auteur
Y. Timsit
article
Journal of Molecular Biology, Elsevier, 1999, 293 (4), pp.835-853. ⟨10.1006/jmbi.1999.3199⟩
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BibTex
titre
Left-handed DNA Crossovers. Implications for DNA-DNA Recognition and Structural Alterations
auteur
Y. Timsit, Michal Shatzky-Schwartz, Zippora Shakked
article
Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, Taylor & Francis: STM, Behavioural Science and Public Health Titles, 1999, 16 (4), pp.775-785. ⟨10.1080/07391102.1999.10508292⟩
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1998

Article dans une revue

titre
Bacterial flora in the gut of Helix aspersa (Gastropoda Pulmonata): evidence for a permanent population with a dominant homolactic intestinal bacterium, Enterococcus casseliflavus
auteur
Maryvonne Charrier, Yannick Combet-Blanc, Bernard Ollivier
article
Canadian Journal of Microbiology, NRC Research Press, 1998, 44 (1), pp.20 - 27. ⟨10.1139/w97-120⟩
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titre
Hydration and recognition of methylated CpG steps in DNA
auteur
C. Mayer-Jung, D. Moras, Y. Timsit
article
EMBO Journal, EMBO Press, 1998, 17 (9), pp.2709-2718. ⟨10.1093/emboj/17.9.2709⟩
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titre
DNA crossovers and type II DNA topoisomerases: a thermodynamical study 1 1Edited by T. Richmond
auteur
Y Sikorav, Bertrand Duplantier, Gérard Jannink, Y. Timsit, Jean-Louis Sikorav
article
Journal of Molecular Biology, Elsevier, 1998, 284 (5), pp.1279-1287. ⟨10.1006/jmbi.1998.2280⟩
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titre
Symmetry and chirality in topoisomerase II-DNA crossover recognition 1 1Edited by T. Richmond
auteur
B Timsit, Bertrand Duplantier, J Jannink, Jean-Louis Sikorav, Y. Timsit, Gérard Jannink
article
Journal of Molecular Biology, Elsevier, 1998, 284 (5), pp.1289-1299. ⟨10.1006/jmbi.1998.2281⟩
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1997

Article dans une revue

titre
Effect of cytosine methylation on DNA-DNA recognition at CpG steps
auteur
Claudine Mayer-Jung, Dino Moras, Y. Timsit
article
Journal of Molecular Biology, Elsevier, 1997, 270 (3), pp.328-335. ⟨10.1006/jmbi.1997.1137⟩
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1996

Article dans une revue

titre
Cruciform structures and functions.
auteur
Y. Timsit, D. Moras
article
Quarterly Reviews of Biophysics, Cambridge University Press (CUP), 1996, 29 (4), pp.279-307
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1995

Article dans une revue

titre
Self-fitting and Self-modifying Properties of theB-DNA Molecule
auteur
Y. Timsit, Dino Moras
article
Journal of Molecular Biology, Elsevier, 1995, 251 (5), pp.629-647. ⟨10.1006/jmbi.1995.0461⟩
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1994

Article dans une revue

titre
DNA self-fitting: the double helix directs the geometry of its supramolecular assembly.
auteur
Y. Timsit, D. Moras
article
EMBO Journal, EMBO Press, 1994, 13 (12), pp.2737-46
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1992

Article dans une revue

titre
Crystallization of DNA.
auteur
Y. Timsit, D. Moras
article
Methods in Enzymology, Elsevier, 1992, 211, pp.409-29
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1991

Article dans une revue

titre
Groove-backbone interaction in B-DNA. Implication for DNA condensation and recombination.
auteur
Y. Timsit, D. Moras
article
Journal of Molecular Biology, Elsevier, 1991, 221 (3), pp.919-40
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titre
Base-pairing shift in the major groove of (CA)n tracts by B-DNA crystal structures
auteur
Y. Timsit, Eric Vilbois, Dino Moras
article
Nature, Nature Publishing Group, 1991, 354 (6349), pp.167-170. ⟨10.1038/354167a0⟩
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1989

Article dans une revue

titre
Unusual helical packing in crystals of DNA bearing a mutation hot spot
auteur
R Timsit, Eric Westhof, Robert Fuchs, Dino Moras, Y. Timsit
article
Nature, Nature Publishing Group, 1989, 341 (6241), pp.459-462. ⟨10.1038/341459a0⟩
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