Publications HAL de robin de la structure 37825;135757

2020

Books

titre
A next-generation of biomonitoring to detect global ecosystem change
auteur
David Bohan, Dominique Gravel, Alireza Tamaddoni-Nezhad, C. Vacher, Stephane S. Robin
article
2020, ⟨10.3389/978-2-88966-027-8⟩
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2019

Journal articles

titre
Nine Quick Tips for Analyzing Network Data
auteur
Vincent Miele, Stephane S. Robin, Catherine Matias, Stéphane Dray
article
PLoS Computational Biology, 2019, 15 (12), pp.e1007434. ⟨10.1371/journal.pcbi.1007434⟩
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https://hal.science/hal-02089501/file/simple_rules_v2.pdf BibTex
titre
Closed-form Bayesian inference of graphical model structures by averaging over trees
auteur
Loïc Schwaller, Stephane S. Robin, Michael Stumpf
article
Journal de la Société Française de Statistique, 2019, 160 (2), pp.1-23
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titre
Incomplete graphical model inference via latent tree aggregation
auteur
Geneviève Robin, Christophe Ambroise, Stephane S. Robin
article
Statistical Modelling, 2019, 19 (5), pp.545-568. ⟨10.1177/1471082X18786289⟩
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https://hal.science/hal-01686841/file/Robin2018_latent_tree.pdf BibTex
titre
A factor model approach for the joint segmentation with between-series correlation
auteur
Xavier Collilieux, Émilie Lebarbier, Stéphane Robin
article
Scandinavian Journal of Statistics, 2019, 46 (3), pp.86-705. ⟨10.1111/sjos.12368⟩
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titre
Variational inference for coupled hidden markov models applied to the joint detection of copy number variations
auteur
Xiaoqiang Wang, Emilie Lebarbier, Julie Aubert, Stephane Robin
article
The international journal of biostatistics, 2019, 15 (1), ⟨10.1515/ijb-2018-0023⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02626026/file/1706.06742.pdf BibTex
titre
A generalized statistical framework to assess mixing ability from incomplete mixing designs using binary or higher order variety mixtures and application to wheat
auteur
Emma Forst, Jerome Enjalbert, Vincent Allard, Christophe Ambroise, Inès Krissaane, Tristan Mary Huard, Stephane Robin, Isabelle Goldringer
article
Field Crops Research, 2019, 242, pp.107571. ⟨10.1016/j.fcr.2019.107571⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02618625/file/S0378429018311675.pdf BibTex

Conference papers

titre
Data-driven Modeling of Building Consumption Profile for Optimal Flexibility: Application to Energy Intensive Industry
auteur
Camille Pajot, Benoît Delinchant, Yves Maréchal, Frédéric Wurtz, Stephane Robin, Benjamin Vincent, Francois Debray, Nguyen Quang Hùng
article
Building Simulation Conference 2019, Sep 2019, Rome, Italy
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https://hal.science/hal-02364669/file/BS2019_256_8_211201_Pajot_2019-06-28_15-55_a.pdf BibTex
titre
Variational Inference for sparse network reconstruction from count data
auteur
Julien Chiquet, Mahendra Mariadassou, Stephane Robin
article
ICML 2019 International Conference on Machine Learning, Jun 2019, Long Beach, United States
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Book sections

titre
Applications in Genomics
auteur
Stephane S. Robin, Christophe Ambroise
article
FruhwirthSchnatter, S; Celeux, G; Robert, CP. HANDBOOK OF MIXTURE ANALYSIS, CRC PRESS-TAYLOR & FRANCIS GROUP, 2019, Chapman & Hall-CRC Handbooks of Modern Statistical Methods, 978-0-429-50824-0; 978-1-4987-6381-3
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Preprints, Working Papers, ...

titre
Bayesian inference for network Poisson models
auteur
Sophie Donnet, Stéphane Robin
article
2019
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https://arxiv.org/pdf/1907.09771 BibTex

2018

Journal articles

titre
Inference of Adaptive Shifts for Multivariate Correlated Traits
auteur
Paul Bastide, Céline Ané, Stephane Robin, Mahendra Mariadassou
article
Systematic Biology, 2018, 67, ⟨10.1093/sysbio/syy005⟩
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BibTex
titre
Goodness of fit of logistic regression models for random graphs
auteur
Pierre Latouche, Stephane Robin, Sarah Ouadah
article
Journal of Computational and Graphical Statistics, 2018, 27 (1), pp.98-109. ⟨10.1080/10618600.2017.1349663⟩
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BibTex
titre
A variable selection approach in the multivariate linear model: an application to LC-MS metabolomics data
auteur
Marie Perrot-Dockes, Celine Levy Leduc, Julien Chiquet, Laure Sansonnet, Margaux Brégère, Marie-Pierre Etienne, Stephane Robin, Grégory Genta-Jouve
article
Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology, 2018, 17 (5), pp.20170077. ⟨10.1515/sagmb-2017-0077⟩
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https://hal.science/hal-01896164/file/1704.00076.pdf BibTex
titre
Variational inference for probabilistic Poisson PCA
auteur
Julien Chiquet, Mahendra Mariadassou, Stephane Robin
article
Annals of Applied Statistics, 2018, 12 (4), pp.2674-2698. ⟨10.1214/18-AOAS1177⟩
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https://hal.science/hal-01941270/file/18-AOAS1177.pdf BibTex

2017

Journal articles

titre
SegCorr a statistical procedure for the detection of genomic regions of correlated expression
auteur
Eleni Ioanna Delatola, Emilie Lebarbier, Tristan Mary-Huard, François Radvanyi, Stéphane Robin, Jennifer Wong
article
BMC Bioinformatics, 2017, 18 (1), pp.333. ⟨10.1186/s12859-017-1742-5⟩
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https://inserm.hal.science/inserm-02059501/file/12859_2017_Article_1742.pdf BibTex
titre
A robust approach for estimating change-points in the mean of an AR(1) process
auteur
Souhil Chakar, Céline Levy Leduc, Stephane Robin, E. Lebarbier
article
Bernoulli, 2017, 23 (2), pp.1408-1447. ⟨10.3150/15-BEJ782⟩
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BibTex
titre
Exact Bayesian inference for off-line change-point detection in tree-structured graphical models
auteur
Loic Schwaller, Stephane Robin
article
Statistics and Computing, 2017, 27 (5), pp.1331-1345. ⟨10.1007/s11222-016-9689-3⟩
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https://hal.science/hal-01555266/file/ScR16-StatComp_%7B5A359203-F58A-4213-B15F-6E8ABBFE2DC3%7D.pdf BibTex
titre
Detection of adaptive shifts on phylogenies by using shifted stochastic processes on a tree
auteur
Paul Bastide, Mahendra Mariadassou, Stephane Robin
article
Journal of the Royal Statistical Society: Series B, 2017, ⟨10.1111/rssb.12206⟩
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Conference papers

titre
Exact and approximate inference in graphical models
auteur
Régis Sabbadin, Nathalie Peyrard, Marie-Josée Cros, Simon de Givry, Alain Franc, Stephane Robin, Thomas Schiex, Matthieu Vignes
article
10th International Conference on Scalable Uncertainty Management (SUM), Oct 2017, Granada, Spain
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https://hal.science/hal-02116334/file/Sabbadin_SUM_1.pdf BibTex

Book sections

titre
Convex estimation
auteur
Cécile Durot, Jade Giguelay, Sylvie Huet, François Koladjo, Stephane Robin
article
Capture-recapture methods for the social and medical sciences, CRC Press (Taylor \& Francis Group), pp.417, 2017, Interdisciplinary Statistics Series, 978-1-4987-4531-4
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Poster communications

titre
CHMM : an R package for coupled Hidden Markov Models
auteur
Julie Aubert, Xiaoqiang Wang, Emilie Lebarbier, Stephane Robin
article
R User Conference 2017, Jul 2017, Bruxelles, Belgium. 2017
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https://hal.science/hal-01661257/file/Poster_JAubert_1.pdf BibTex

Reports

titre
Variational inference for probabilistic Poisson PCA
auteur
Julien Chiquet, Mahendra Mariadassou, Stephane Robin
article
[University works] auto-saisine. 2017
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https://hal.science/hal-01608912/file/variational_%7BCE66C6D5-8A36-4981-BF8A-04F537890B08%7D.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
Shortened Bridge Sampler: Using deterministic approximations to accelerate SMC for posterior sampling
auteur
Sophie Donnet, Stéphane Robin
article
2017
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https://hal.science/hal-01566898/file/DoR17-StCo.pdf BibTex

2016

Journal articles

titre
Modeling overdispersion heterogeneity in differential expression analysis using mixtures
auteur
E. Bonafede, Franck Picard, S. Robin, C. Viroli
article
Biometrics, 2016, 72 (3), pp.804-814. ⟨10.1111/biom.12458⟩
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BibTex
titre
Structured regularization for conditional Gaussian graphical models
auteur
Julien Chiquet, Tristan Mary-Huard, Stephane Robin
article
Statistics and Computing, 2016, 27 (3), pp.1-16. ⟨10.1007/s11222-016-9654-1⟩
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https://hal.science/hal-01531660/file/1403.6168%20%281%29.pdf BibTex
titre
Modelling the influence of dimerisation sequence dissimilarities on the auxin signalling network
auteur
Jonathan Legrand, Jean-Benoist Leger, Stephane S. Robin, Teva Vernoux, Yann Guédon
article
BMC Systems Biology, 2016, 10 (22), pp.17. ⟨10.1186/s12918-016-0254-7⟩
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https://inria.hal.science/hal-01361020/file/LegrandLegerRobinVernouxGuedon2016.pdf BibTex
titre
Deciphering the pathobiome: intra- and interkingdom interactions involving the pathogen erysiphe alphitoides
auteur
Boris Jakuschkin, Virgil Fievet, Loïc Schwaller, Thomas Fort, Cécile Robin, Corinne Vacher
article
Microbial ecology, 2016, 72 (4), pp.870-880. ⟨10.1007/s00248-016-0777-x⟩
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BibTex
titre
Variational Bayes model averaging for graphon functions and motif frequencies inference in W-graph models
auteur
Pierre Latouche, Stephane S. Robin
article
Statistics and Computing, 2016, 26 (6), pp.1173 - 1185. ⟨10.1007/s11222-015-9607-0⟩
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https://hal.science/hal-01519750/file/LaR15-StatComp.pdf BibTex
titre
Comparing change-point location in independent series
auteur
Alice Cleynen, Stephane Robin
article
Statistics and Computing, 2016, 26 (1-2), pp.1-14. ⟨10.1007/s11222-014-9492-y⟩
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Conference papers

titre
Latent Block Model for metagenomic data
auteur
Julie Aubert, Sophie Schbath, Stephane Robin
article
17. Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques (JOBIM 2016), Jun 2016, Lyon, France
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BibTex
titre
Diagonal blockwise matrix segmentation in computational biology
auteur
Tristan Mary-Huard, Stephane Robin, Celine Levy Leduc, Maud Delattre, Vincent Brault, Eleni-Ioanna Delatola
article
IFCAM Workshop, 2016, Bangalore, India
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Poster communications

titre
Latent Block Model for metagenomic data
auteur
Julie Aubert, Sophie Schbath, Stephane Robin
article
15. European Conference on Computational Biology (ECCB 2016), Workshop "Recent Computational Advances in Metagenomics (RCAM)", Sep 2016, La Haye, Netherlands. , 2016, Proceedings of the 15th European Conference on Computational Biology (ECCB 2016), Workshop "Recent Computational Advances in Metagenomics (RCAM)"
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2015

Journal articles

titre
Les nouveaux défis de la biologie moléculaire
auteur
Celine Levy Leduc, Stephane Robin
article
Symbiose (Magazine d'Agroparistech Alumni), 2015, 12
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titre
Network impact on persistence in a finite population dynamic diffusion model: Application to an emergent seed exchange network
auteur
Pierre Barbillon, Mathieu Thomas, Isabelle Goldringer, Frédéric Hospital, Stéphane Robin
article
Journal of Theoretical Biology, 2015, 365, pp.365-376. ⟨10.1016/j.jtbi.2014.10.032⟩
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titre
Nonparametric species richness estimation under convexity constraint
auteur
Cécile Durot, Sylvie Huet, François Koladjo, Stéphane Robin
article
Environmetrics, 2015, 26 (7), pp.502-513. ⟨10.1002/env.2352⟩
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https://hal.science/hal-01250079/file/SpRichness.pdf BibTex
titre
Inference in finite state space non parametric hidden markov models and applications
auteur
E. Gassiat, Alice Cleynen, Stephane Robin
article
Statistics and Computing, 2015, 26 (1-2), ⟨10.1007/s11222-014-9523-8⟩
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BibTex
titre
Apprentissage de réseaux par agrégation bayésienne d’arbres couvrants
auteur
Stephane Robin, Loic Schwaller
article
Revue des Sciences et Technologies de l'Information - Série RIA : Revue d'Intelligence Artificielle, 2015, 2, pp.153-172. ⟨10.3166/RIA.29.153-172⟩
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Conference papers

titre
Deciphering the pathobiome: intra- and interkingdom interactions involving the pathogen Erysiphe alphitoides
auteur
Corinne Vacher, Virgil Fievet, Boris Jakuschkin, Sarah Ouadah, Cécile Robin, Stephane Robin, Loïc Schwaller
article
10. International symposium on phyllosphere microbiology, Jul 2015, Ascona, Switzerland
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BibTex
titre
Latent Block Model for ecological abundance data
auteur
Julie Aubert, Sophie Schbath, Christophe Mougel, Stephane Robin
article
30. European Meeting of Statisticians, Jul 2015, Amsterdam, Netherlands
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Books

titre
Le modèle linéaire et ses extensions - Modèle linéaire général, modèle linéaire généralisé, modèle mixte, plans d'expériences (Niveau C)
auteur
Tristan Mary-Huard, Liliane Bel, Marie Pierre Etienne, Stephane Robin
article
Edition Ellipses, 323 p., 2015
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Preprints, Working Papers, ...

titre
A degree-based goodness-of-fit test for heterogeneous random graph models
auteur
Sarah Ouadah, Stéphane Robin, Pierre Latouche
article
2015
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https://hal.science/hal-01187889/file/1507.08140v1.pdf BibTex
titre
Goodness of fit of logistic models for random graphs
auteur
Pierre Latouche, Stéphane Robin, Sarah Ouadah
article
2015
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https://hal.science/hal-01187890/file/1508.00286v1.pdf BibTex
titre
Exact and approximate inference in graphical models: variable elimination and beyond
auteur
Nathalie Dubois Peyrard, Simon de Givry, Alain Franc, Stephane Robin, Régis Sabbadin, Thomas Schiex, Matthieu Vignes
article
2015
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https://hal.science/hal-01197655/file/1506.08544v1_1.pdf BibTex

2014

Journal articles

titre
Modeling heterogeneity in random graphs through latent space models: a selective review
auteur
Catherine Matias, Stéphane Robin
article
ESAIM: Proceedings, 2014, MMCS, Mathematical Modelling of Complex Systems, 47, pp.55 - 74. ⟨10.1051/proc/201447004⟩
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https://hal.science/hal-00948421/file/Graphs_review_preprintV2.pdf BibTex
titre
Two-dimensional segmentation for analyzing Hi-C data
auteur
Celine Lévy-Leduc, Maud Delattre, T. Mary-Huard, S. Robin
article
Bioinformatics, 2014, 30 (17), pp.i386-i392. ⟨10.1093/bioinformatics/btu443⟩
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BibTex
titre
Hidden Markov Models with mixtures as emission distributions
auteur
Stevenn Volant, Caroline Bérard, Marie-Laure Martin-Magniette, Stéphane Robin
article
Statistics and Computing, 2014, 24 (4), pp.493-504. ⟨10.1007/s11222-013-9383-7⟩
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BibTex
titre
Comparing segmentation methods for genome annotation based on RNA-Seq data
auteur
Alice Cleynen, Sandrine Dudoit, Stephane Robin
article
Journal of Agricultural, Biological, and Environmental Statistics, 2014, 19 (1), pp.101-118. ⟨10.1007/s13253-013-0159-5⟩
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BibTex
titre
Segmentor3IsBack : an R package for the fast and exact segmentation of Seq-data
auteur
Alice Cleynen, Michel Koskas, Guillem Rigaill, Stephane Robin
article
Algorithms for Molecular Biology, 2014, 9, 11 p. ⟨10.1186/1748-7188-9-6⟩
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https://hal.science/hal-01197619/file/2014_Cleynen_Algorithms%20for%20Molecular%20Biology_1.pdf BibTex

Conference papers

titre
Two-dimensional segmentation for analyzing HiC data
auteur
Celine Levy Leduc, Maud Delattre, Tristan Mary-Huard, Stephane Robin
article
ECCB 2014: The 13th European Conference on Computational Biology, Sep 2014, Strasbourg, France. pp.386-392, ⟨10.1093/bioinformatics/btu443⟩
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https://hal.science/hal-01148580/file/2014_L%C3%A9vy%20Leduc_Bioinformatics_%7B1806FE76-9C65-45D2-A38B-2B708871909B%7D.pdf BibTex
titre
Detecting genomic alteration in genomic profiles: the infinite population case
auteur
Marie-Pierre Etienne, Laurent Decreusefond, Gabriel Lang, Stephane S. Robin
article
IWAP (International Workshop on Applied Probability) , Jun 2014, Antaly, Turkey
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BibTex

Reports

titre
Nonparametric species richness estimation under convexity constrain
auteur
Cécile Durot, Sylvie Huet, François Koladjo, Stephane Robin
article
[Technical Report] 2014-1, auto-saisine. 2014, 36 p
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BibTex

2013

Journal articles

titre
Genomic instability : a stronger prognostic marker than proliferation for early stage luminal breast carcinomas
auteur
Anne Vincent-Salomon, Vanessa Benhamo, Eleonore Gravier, Guillem Rigaill, Nadège Gruel, Stephane Robin, Yann de Rycke, Odette Mariani, Gaëlle Pierron, David Gentien, Fabien Reyal, Paul Cottu, Alain Fourquet, Roman Rouzier, Xavier Sastre-Garau, Olivier Delattre
article
PLoS ONE, 2013, 8 (10), ⟨10.1371/journal.pone.0076496⟩
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https://hal.science/hal-01219550/file/VBG13-PLoSOne_%7B35633296-186A-40E1-84B0-A5FB07D959CD%7D.pdf BibTex
titre
HOMER : a homogenization software - methods and applications
auteur
Olivier Mestre, Peter Domonkos, Franck Picard, Ingeborg Auer, Stephane Robin, Reinhard Boehm, Enric Aguilar, Jose Guijarro, Gregor Vertachnik, Matija Klancar, Brigitte Dubuisson, Petr Stepanek
article
IDOJARAS, 2013, 117 (1), pp.47 - 67
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BibTex
titre
Detection of significant genomic alterations via simultaneous minimal sojourns at a state by independent continuous-time markov chains
auteur
Stephane Robin, Valeri T. Stefanov
article
Methodology and Computing in Applied Probability, 2013, 17 (2), pp.479-487. ⟨10.1007/s11009-013-9374-3⟩
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BibTex
titre
Least-squares estimation of a convex discrete distribution
auteur
Cécile Durot, Sylvie Huet, François Koladjo, Stephane Robin
article
Computational Statistics and Data Analysis, 2013, 67, pp.282-298. ⟨10.1016/j.csda.2013.04.019⟩
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Conference papers

titre
Segmentor3isback : an r package for the fast and exact segmentation of seq-data
auteur
Alice Cleynen, Michel Koskas, Emilie Lebarbier, Guillem Rigaill, Stéphane Robin
article
The R User Conference, Jun 2013, Albacete, Spain
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BibTex
titre
A multivariate HMM with dependency structure for the detection of copy number variations
auteur
Xiaoqiang Wang, Julie J. Aubert, Stephane S. Robin
article
45e Journées de Statistique de la SfDS, May 2013, Toulouse, France
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BibTex
titre
Network impact on persistence in a finite population dynamic exchange model
auteur
Pierre Barbillon, Thomas Mathieu, Isabelle I. Goldringer, Frederic F. Hospital, Stephane S. Robin
article
Journées de statistiques de la SFDS, May 2013, Toulouse, France
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BibTex
titre
Estimation de la fonction graphon d'un W-graphe. Application au réseau de la blogosphere politique française
auteur
Pierre Latouche, Stéphane Robin
article
45èmes journées de Statistique, 2013, Toulouse, France. pp.JdS
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https://hal.science/hal-00830095/file/latouche_robin.pdf BibTex

Poster communications

titre
Multi-trait genomic selection via multivariate regression with structured regularization
auteur
Julien Chiquet, Tristan Mary, Stephane Robin
article
MLCB NIPS 2013, Oct 2013, South Lake Thao, United States. 2013
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https://hal.science/hal-01601860/file/MLCB13_submission12_1.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
Bayesian Model Averaging of Stochastic Block Models to Estimate the Graphon Function and Motif Frequencies in a W-graph Model
auteur
Pierre Latouche, Stéphane Robin
article
2013
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https://arxiv.org/pdf/1310.6150 BibTex

2012

Journal articles

titre
The influence of public programs on inter-firm R&D collaboration strategies: project-level evidence from EU FP5 and FP6
auteur
Mireille Matt, Stephane Robin, Sandrine Wolff
article
Journal of Technology Transfer, 2012, 37 (6), pp.885 - 916. ⟨10.1007/s10961-011-9232-9⟩
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BibTex
titre
Classification and estimation in the Stochastic Blockmodel based on the empirical degrees
auteur
Antoine Channarond, Jean-Jacques Daudin, Stephane Robin
article
Electronic Journal of Statistics , 2012, 6, pp.2574-2601. ⟨10.1214/12-EJS753⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-01190224/file/CDR12-ElectronJStatis_1.pdf BibTex
titre
Accuracy of variational estimates for random graph mixture models
auteur
Steven S. Gazal, Jean-Jacques J.-J. Daudin, Stephane S. Robin
article
Journal of Statistical Computation and Simulation, 2012, 82 (6), pp.849-862. ⟨10.1080/00949655.2011.560117⟩
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BibTex
titre
Exact posterior distributions and model selection criteria for multiple change-point detection problems
auteur
Guillem G. Rigaill, Stephane S. Robin
article
Statistics and Computing, 2012, 22 (4), pp.917-929. ⟨10.1007/s11222-011-9258-8⟩
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BibTex
titre
ExactDAS: an exact test procedure for the detection of differential alternative splicing in microarray experiments
auteur
Tristan Mary-Huard, Florence Jaffrezic, Stephane S. Robin
article
Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology, 2012, 11, online (5), Non paginé. ⟨10.1515/1544-6115.1814⟩
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BibTex
titre
Bayesian model averaging for estimating the number of classes: applications to the total number of species in metagenomics
auteur
Sébastien Li-Thiao-Te, Jean-Jacques Daudin, Stephane Robin
article
Journal of Applied Statistics, 2012, 39 (7), pp.1489-1504. ⟨10.1080/02664763.2012.658358⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-01019870/file/LDR12-JAS_1.pdf BibTex
titre
Classification and estimation in the Stochastic Blockmodel based on the empirical degrees
auteur
Antoine Channarond, Jean-Jacques Daudin, Stephane Robin
article
Electronic Journal of Statistics , 2012, 6, pp.1935 -2601. ⟨10.1214/12-EJS753⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-02374976/file/euclid.ejs.1357913089.pdf BibTex
titre
Variational Bayes approach for model aggregation in unsupervised classification with Markovian dependency
auteur
Stevenn Volant, Marie-Laure Magniette Martin-Magniette, Stephane S. Robin
article
Computational Statistics and Data Analysis, 2012, 56 (8), pp.2375-2387. ⟨10.1016/j.csda.2012.01.027⟩
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https://hal.science/hal-01000046/file/VMR12-CSDA_1.pdf BibTex

Conference papers

titre
ExactDAS: An exact test procedure for the detection of differential alternative splicing
auteur
Tristan Mary-Huard, Florence Jaffrezic, Stéphane Robin
article
4th International Conference on Bioinformatics and Computational Biology (BICoB), Mar 2012, Las Vegas, United States
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2011

Journal articles

titre
Unsupervised Classification for Tiling Arrays: ChIP-chip and Transcriptome
auteur
Caroline Berard, Marie-Laure Magniette, Veronique Brunaud, Sebastien Aubourg, Stephane Robin
article
Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology, 2011, 10 (1), pp.50. ⟨10.2202/1544-6115.1692⟩
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titre
Integrative epigenomic mapping defines four main chromatin states in Arabidopsis
auteur
François Roudier, Ikhlak I. Ahmed, Caroline C. Berard, Alexis A. Sarazin, Tristan Mary-Huard, Sandra S. Cortijo, Daniel D. Bouyer, Erwann E. Caillieux, Evelyne E. Duvernois-Berthet, Al-Shikhley A.-S. Liza, Laurene L. Giraut, Barbara B. Després, Stéphanie S. Drevensek, Frédy F. Barneche, Sandra S. Derozier, Veronique V. Brunaud, Sebastien S. Aubourg, Arp A. Schnittger, Chris C. Bowler, Marie-Laure M.-L. Magniette, Stephane S. Robin, Michel M. Caboche, Vincent V. Colot
article
EMBO Journal, 2011, 30 (10), pp.1928 - 1938. ⟨10.1038/emboj.2011.103⟩
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titre
Predicting invasion success of forest pathogenic fungi from species traits
auteur
Aurore A. Philibert, Marie Laure M. L. Desprez Loustau, Bénédicte Fabre, Pascal Frey, Fabien Halkett, Claude C. Husson, Brigitte Lung Lung-Escarmant, Benoit Marçais, Cécile C. Robin, Corinne C. Vacher, David D. Makowski
article
Journal of Applied Ecology, 2011, 48 (6), pp.1381 - 1390. ⟨10.1111/j.1365-2664.2011.02039.x⟩
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titre
Occurrence of structured motifs in random sequences: Arbitrary number of boxes
auteur
Valeri T. V. T. Stefanov, Stephane S. Robin, Sophie S. Schbath
article
Discrete Applied Mathematics, 2011, 159 (8), pp.826-831. ⟨10.1016/j.dam.2010.12.023⟩
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titre
Joint segmentation, calling, and normalization of multiple CGH profiles
auteur
Franck Picard, Mark Hoebeke, Guillem Rigaill, Baba Thiam, Stephane Robin
article
Biostatistics, 2011, 12 (3), pp.413-428. ⟨10.1093/biostatistics/kxq076⟩
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https://hal.science/hal-01019859/file/2011LebarbierBiostat_1.pdf BibTex
titre
Joint segmentation of multivariate Gaussian processes using mixed linear models
auteur
Franck F. Picard, E. Lebarbier, E. E. Budinska, Stephane S. Robin
article
Computational Statistics and Data Analysis, 2011, 55 (2), pp.1160 - 1170. ⟨10.1016/j.csda.2010.09.015⟩
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Conference papers

titre
NeMo: Fast Count and Statistical Significance of Network Motifs
auteur
Michel M. Koskas, Gilles G. Grasseau, Etienne E. Birmelé, Sophie S. Schbath, Stephane S. Robin
article
MARAMI 2011 : 2. Conférence sur les Modèles et l'Analyse des Réseaux : Approches Mathématiques et Informatique, Oct 2011, Grenoble, France. n.p
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titre
NeMo: Fast Count of Network Motifs
auteur
Michel M. Koskas, Gilles G. Grasseau, Etienne E. Birmelé, Sophie S. Schbath, Stephane S. Robin
article
Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques (JOBIM), Jun 2011, Paris, France. pp.53-60
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titre
Inférence dans le Stochastic Block Model pour de grands graphes
auteur
Antoine Channarond, Jean-Jacques Daudin, Stephane Robin
article
JDS 2011 : 43. Journées de Statistique, May 2011, Gammarth, Tunisie. 416 p
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https://hal.science/hal-01019782/file/50250_20120314093251344_1.pdf BibTex
titre
Uncovering latent structure in valued graphs: a variational approach
auteur
Mahendra Mariadassou, Stephane S. Robin, Corinne C. Vacher
article
Probability and Discrete Mathematics in Mathematical Biology, May 2011, Singapore, Singapore. 47 diapos
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https://hal.inrae.fr/hal-02802815/file/1105-Singapore_1.pdf BibTex

Book sections

titre
Introduction to statistical methods for complex systems
auteur
Stephane Robin
article
Handbook of Statistical Systems Biology, Wiley and Sons, 530 p., 2011, 978-0-470-71086-9
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2010

Journal articles

titre
A cross-validation based estimation of the proportion of true null hypotheses
auteur
Alain Célisse, Stephane Robin
article
Journal of Statistical Planning and Inference, 2010, 140 (11), pp.3132-3147. ⟨10.1016/j.jspi.2010.04.014⟩
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titre
Uncovering latent structure in valued graphs: a variational approach
auteur
Mahendra Mariadassou, Stephane Robin, Corinne Vacher
article
Annals of Applied Statistics, 2010, 4 (2), pp.715-742. ⟨10.1214/10-AOAS361⟩
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Conference papers

titre
Statistical methodology for the analysis of multi-sample ChIP-chip experiments
auteur
Tristan Mary-Huard, Marie-Laure Martin-Magniette, Caroline Berard, Stephane Robin
article
25. International Biometric Conference, Dec 2010, Florianopolis, Brazil. 1 p
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BibTex
titre
Inférence dans le Stochastic Block Model pour les grands graphes
auteur
Antoine Channarond, Jean-Jacques Daudin, Stephane Robin
article
JFGG'10 : Journée thématique Fouille de grands graphes, Oct 2010, Toulouse, France. 20 p
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https://hal.science/hal-01197533/file/49000_20120203112658276_1.pdf BibTex
titre
Properties of variational estimates of a mixture model for random graphs
auteur
Jean-Jacques Daudin, Alain Célisse, Steven Gazal, Stephane Robin
article
ECCS10 European Conference on Complex Systems, Sep 2010, Lisbonne, France
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https://hal.science/hal-01197575/file/51657_20120206120148426_1.pdf BibTex
titre
Mixture models of truncated data for estimating the number of species
auteur
Sébastien Li-Thiao-Te, Jean-Jacques Daudin, Stephane Robin
article
19. International Conference on Computational Statistics, Aug 2010, Paris, France
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BibTex
titre
Modèle linéaire mixte avec segmentation : application à la détection de changements dans les dates de vendanges
auteur
Franck Picard, Eva Budinska, Stephane Robin
article
42. Journées de Statistique, May 2010, Marseille, France
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https://hal.science/hal-01197573/file/51621_20120203104835517_1.pdf BibTex
titre
Approche bayésienne variationnelle pour l'agrégation de modèles en classification.
auteur
Stevenn Volant, Marie-Laure Martin-Magniette, Stéphane Robin
article
42èmes Journées de Statistique, 2010, Marseille, France, France
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https://inria.hal.science/inria-00494832/file/p197.pdf BibTex
titre
Modèle linéaire mixte avec segmentation : application à la détection de changements dans les dates de vendanges
auteur
Emilie Lebarbier, Franck Picard, Eva Budinska, Stéphane Robin
article
42èmes Journées de Statistique, 2010, Marseille, France, France
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https://inria.hal.science/inria-00494861/file/p242.pdf BibTex
titre
Accuracy of Variational Estimates for Random Graph Mixture Models
auteur
Steven Gazal, Jean-Jacques Daudin, Stéphane Robin
article
42èmes Journées de Statistique, 2010, Marseille, France, France
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https://inria.hal.science/inria-00494740/file/p80.pdf BibTex
titre
Modèles de mélange tronqués pour l'écologie microbienne. Estimation du nombre d'espèces manquantes.
auteur
Sebastien Li-Thiao-Te, Jean-Jacques Daudin, Stéphane Robin, Emilie Lebarbier
article
42èmes Journées de Statistique, 2010, Marseille, France, France
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https://inria.hal.science/inria-00494719/file/p61.pdf BibTex

Book sections

titre
Exact posterior distributions over the segmentation space and model selection for multiple change-point detection problems
auteur
Guillem Rigaill, Stephane Robin
article
Proceedings of COMPSTAT'2010: 19th International Conference on Computational StatisticsParis France, August 22-27, 2010 Keynote, Invited and Contributed Papers, Springer - Verlag, 2010, 978-3-7908-2603-6. ⟨10.1007/978-3-7908-2604-3_57⟩
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2009

Journal articles

titre
Terminal differentiation of goat mammary tissue during pregnancy requires the expression of genes involved in immune functions
auteur
F. Faucon, E. Rebours, C. Bevilacqua, J.-C. Helbling, J. Aubert, S. Makhzami, Sophie Dhorne-Pollet, S. Robin, P. Martin
article
Physiological Genomics, 2009, 40 (1), pp.61-82. ⟨10.1152/physiolgenomics.00032.2009⟩
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titre
Deciphering the connectivity structure of biological networks using MixNet
auteur
Franck Picard, Vincent Miele, Jean-Jacques J.-J. Daudin, Ludovic Cottret, Stephane S. Robin
article
BMC Bioinformatics, 2009, 10, pp.1-11. ⟨10.1186/1471-2105-10-S6-S17⟩
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titre
Kerfdr: a semi-parametric kernel-based approach to local false discovery rate estimation
auteur
Mickaël Guedj, Stephane Robin, Alain Célisse, Grégory Nuel
article
BMC Bioinformatics, 2009, 10, pp.1-12. ⟨10.1186/1471-2105-10-84⟩
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titre
Tailored Aggregation for Classification
auteur
Tristan Mary-Huard, Stephane Robin
article
IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence, 2009, 31 (11), pp.2098-2105. ⟨10.1109/TPAMI.2009.55⟩
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BibTex
titre
Transcriptional landscape estimation from tiling array data using a model of signal shift and drift
auteur
Pierre Nicolas, Aurelie Leduc, Stephane Robin, Simon Rasmussen, Hanne Jarmer, Philippe Bessieres
article
Bioinformatics, 2009, 25 (18), pp.2341-2347. ⟨10.1093/bioinformatics/btp395⟩
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BibTex
titre
Mélanges gaussiens bidimensionnels pour la comparaison de deux échantillons de chromatine immunoprécipitée
auteur
Caroline Berard, Marie-Laure Martin-Magniette, Alexandra To, François Roudier, Vincent Colot, Stephane Robin
article
La revue MODULAD, 2009, 40, pp.53-68
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https://hal.science/hal-01197565/file/51211_20120308084920041_1.pdf BibTex
titre
Simultaneous occurrences of runs in independent markov chains
auteur
Stephane Robin, V.T. Stefanov
article
Methodology and Computing in Applied Probability, 2009, 11 (2), pp.267-275. ⟨10.1007/s11009-008-9093-3⟩
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BibTex
titre
Kerfdr: a semi-parametric kernel-based approach to local false discovery rate estimation
auteur
M. Guedj, S. Robin, Alain Celisse, Gregory Nuel
article
BMC Bioinformatics, 2009, 10, pp.84
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BibTex
titre
Terminal differentiation of goat mammary tissue during pregnancy requires the expression of genes involved in immune functions
auteur
Felicie Faucon, Emmanuelle Rebours, Claudia Bevilacqua, Jean-Christophe Helbling, Julie Aubert, Samira Makhzami, Sophie Pollet, Stephane Robin, Patrice Martin
article
Physiological Genomics, 2009, 40 (1), pp.61-82
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Conference papers

titre
Statistical assessment of chromosomal aberrations at the cohort level: the CGHSeg package
auteur
Franck Picard, Baba Thiam, Stephane Robin
article
The 5. R useR Conference, Jul 2009, Rennes, France. 18 p
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https://hal.science/hal-01197546/file/50067_20120206025857711_1.pdf BibTex
titre
A statistical approach to detect chromosomal domains of gene expression
auteur
Tristan Mary-Huard, Stephane Robin
article
International Federation of Classification Societies 2009 Conference, Mar 2009, Dresde, Germany. 14 p
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https://hal.science/hal-01197555/file/50616_20120314104410121_1.pdf BibTex
titre
Segmentation de signal et détection d'aberrations chromosomiques
auteur
Stéphane Robin
article
41èmes Journées de Statistique, SFdS, Bordeaux, 2009, Bordeaux, France, France
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https://inria.hal.science/inria-00386788/file/p228.pdf BibTex
titre
Mélange de gaussiennes bidimensionnelles pour l'analyse de données de ChIP-chip IP/IP
auteur
Caroline Bérard, Marie-Laure Martin-Magniette, François Roudier, Stéphane Robin
article
41èmes Journées de Statistique, SFdS, Bordeaux, 2009, Bordeaux, France, France
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https://inria.hal.science/inria-00386657/file/p98.pdf BibTex
titre
Distribution de l'espace des segmentations
auteur
Guillem Rigaill, Stéphane Robin, Emilie Lebarbier
article
41èmes Journées de Statistique, SFdS, Bordeaux, 2009, Bordeaux, France, France
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https://inria.hal.science/inria-00386673/file/p113.pdf BibTex

Book sections

titre
How can pattern statistics be useful for DNA motif discovery ?
auteur
Sophie Schbath, Stephane Robin
article
Scan Statistics. Methods and Applications, 28, Birkhäuser Publishing, 2009, Statistics for Industry and Technology, 978-0-8176-4748-3
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2008

Journal articles

titre
ChIPmix: mixture model of regressions for two-color ChIP-chip analysis
auteur
Marie-Laure Magniette, Tristan Mary-Huard, Caroline Berard, Stephane Robin
article
Bioinformatics, 2008, 24 (16), pp.i181-i186. ⟨10.1093/bioinformatics/btn280⟩
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BibTex
titre
Individual signature in canary songs: contribution of multiple levels of song structure
auteur
Katia Lehongre, Thierry Aubin, Stephane Robin, Catherine del Negro
article
Ethology, 2008, 114 (5), pp.425-435. ⟨10.1111/j.1439-0310.2008.01486.x⟩
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BibTex
titre
Assessing the exceptionality of network motifs
auteur
Franck Picard, Jean-Jacques Daudin, Michel Koskas, Sophie Schbath, Stephane Robin
article
Journal of Computational Biology, 2008, 15 (1), pp.1-20. ⟨10.1089/cmb.2007.0137⟩
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titre
The MatP/matS site-specific system organizes the terminus region of the E. coli chromosome into a macrodomain
auteur
Romain Mercier, Marie Agnes Petit, Sophie Schbath, Stephane Robin, Meriem El Karoui, Frédéric Boccard, Olivier Espéli
article
Cell, 2008, 135 (3), pp.475-485. ⟨10.1016/j.cell.2008.08.031⟩
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https://hal.science/hal-01197588/file/Robin2008Cell_1.pdf BibTex
titre
Amplification biases: possible differences among deviating gene expressions.
auteur
Séverine A Degrelle, Christelle Hennequet-Antier, Hélène Chiapello, Karine Piot-Kaminski, François Piumi, Stéphane Robin, Jean-Paul Renard, Isabelle Hue
article
BMC Genomics, 2008, 9 (46), pp.46. ⟨10.1186/1471-2164-9-46⟩
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https://cea.hal.science/cea-00307623/file/BMCgenomics-28janv2008.pdf BibTex
titre
Nonparametric density estimation by exact leave-p-out cross-validation
auteur
Alain Célisse, Stephane Robin
article
Computational Statistics and Data Analysis, 2008, 52 (5), pp.2250-2368. ⟨10.1016/j.csda.2007.10.002⟩
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BibTex
titre
A mixture model for random graphs
auteur
Jean-Jacques Daudin, Franck Picard, Stephane Robin
article
Statistics and Computing, 2008, 18 (2), pp.173-183. ⟨10.1007/s11222-007-9046-7⟩
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BibTex
titre
Transcriptomic analysis of the dialogue between Pseudorabies virus and porcine epithelial cells during infection.
auteur
Laurence Flori, Claire Rogel Gaillard, Marielle Cochet, Gaetan Lemonnier, Karine Hugot, Patrick Chardon, Stéphane Robin, François Lefèvre
article
BMC Genomics, 2008, 9, pp.123. ⟨10.1186/1471-2164-9-123⟩
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https://cea.hal.science/cea-00307390/file/BMCgenomics-mars2008.pdf BibTex

Conference papers

titre
ChIPmix: Mixture model of regressions for two-color ChIP-chip analysis
auteur
Tristan Mary-Huard, Marie-Laure Martin-Magniette, Caroline Berard, Stephane Robin
article
ECCB'08: 7. European Conference on Computational Biology, Sep 2008, Calgari, Italy. 19 p
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https://hal.science/hal-01197548/file/50091_20120315104314165_1.pdf BibTex
titre
Segmentation simultanée de signaux: application aux données de microarray CGH
auteur
Baba Thiam, Stephane Robin
article
Congrès conjoint de la Société Statistique du Canada et de la Société Française de Statistique, May 2008, Ottawa, Canada. pp.219
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https://hal.science/hal-01197547/file/50078_20120314040230968_1.pdf BibTex
titre
Expression de gènes de l'immunité dans le tissu mammaire caprin gestant
auteur
Felicie Faucon, Emmanuelle Rebours, Jean-Christophe Helbling, Claudia Bevilacqua, J. Aubert, Marie-Laure Magniette, Stephane Robin, Patrice Martin
article
Journées Scientifiques, Département de Génétique Animale, Apr 2008, Lacanau, France
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2007

Journal articles

titre
Waiting times for clumps of patterns and for structured motifs in random sequences
auteur
V.T. Stefanov, Stephane Robin, Sophie Schbath
article
Discrete Applied Mathematics, 2007, 155 (6-7), pp.868-880. ⟨10.1016/j.dam.2005.07.016⟩
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BibTex
titre
Identification of DNA Motifs Implicated in Maintenance of Bacterial Core Genomes by Predictive Modeling
auteur
David Halpern, Helene Chiapello, Sophie Schbath, Stephane Robin, Christelle Hennequet-Antier, Alexandra Gruss, Meriem El Karoui
article
PLoS Genetics, 2007, 3 (9), pp.1614-1621;e153. ⟨10.1371/journal.pgen.0030153⟩
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https://hal.science/hal-01197542/file/49959_20120510094742452_1.pdf BibTex
titre
A semi-parametric approach for mixture models: Application to local false discovery rate estimation
auteur
Stephane Robin, Avner Bar-Hen, Jean-Jacques Daudin, Laurent Pierre
article
Computational Statistics and Data Analysis, 2007, 51 (12), pp.5483-5493. ⟨10.1016/j.csda.2007.02.028⟩
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BibTex
titre
Statistical tests to compare motif count exceptionalities
auteur
Stephane Robin, Sophie Schbath, Vincent Vandewalle
article
BMC Bioinformatics, 2007, 8, pp.84. ⟨10.1186/1471-2105-8-84⟩
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https://hal.science/hal-01197501/file/20354_20091023043114576_1.pdf BibTex
titre
Classification of variations of HSA21 gene expression in down syndrome lymphoblastoid cell lines : impact on disease phenotype
auteur
E. Aït Yahya-Graison, Julie Aubert, L. Dauphinot, Isabelle Rivals, Marguerite Prieur, G. Golfier, J. Rossier, L. Personnaz, N Créau, Stephane Robin, J. Delabar, M.C Potier
article
American Journal of Human Genetics, 2007, 81 (3), pp.475-491
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https://hal.science/hal-01208111/file/AAD07-AJHM_%7BC3CDA6E5-F1F6-46C7-A1B1-16B213249640%7D.pdf BibTex
titre
A segmentation/clustering model for the analysis of array CGH data
auteur
Franck Picard, Stephane Robin, Jean-Jacques Daudin
article
Biometrics, 2007, 63 (3), pp.758-766. ⟨10.1111/j.1541-0420.2006.00729.x⟩
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https://hal.science/hal-01197574/file/51622_20120509093051782_1.pdf BibTex
titre
A penalized criterion for variable selection in classification
auteur
Tristan Mary-Huard, Stephane Robin, Jean-Jacques Daudin
article
Journal of Multivariate Analysis, 2007, 98 (4), pp.695-705. ⟨10.1016/j.jmva.2006.06.003⟩
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BibTex
titre
Classification of human chromosome 21 gene-expression variations in down syndrome: Impact on disease phenotypes
auteur
E. Aït Yahya-Graison, Julie Aubert, Stephane Robin, L. Dauphinot, I. Rivals, M. Prieur, G. Golfier, G. Rossier, L. Personnaz, N. Créau, H. Bléhaut, J.M. Delabar, M.C. Potier
article
American Journal of Human Genetics, 2007, 81 (3), pp.475-491. ⟨10.1086/520000⟩
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Conference papers

titre
Différenciation fonctionnelle de l'épithélium sécrétoire mammaire caprin
auteur
Felicie Faucon, Emmanuelle Rebours, Jean-Christophe Helbling, Claudia Bevilacqua, Marie-Laure Magniette, Stephane Robin, Patrice Martin
article
14. Rencontres Recherches Ruminants, Dec 2007, Paris, France
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https://hal.science/hal-01197492/file/2007_Faucon_3R_1.pdf BibTex
titre
Assessing the exceptionality of network motifs
auteur
Franck Picard, Jean-Jacques Daudin, Michel Koskas, Sophie Schbath, Stephane Robin
article
JOBIM Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques, Jul 2007, Marseille, France
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BibTex
titre
Statistical tests to compare motif count exceptionalities
auteur
Stephane Robin, Sophie Schbath, Marine Vandewalle
article
JOBIM : Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques, Jul 2007, Marseille, France
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BibTex
titre
Joint segmentation of multivariate Gaussian processes using mixed linear models
auteur
Franck Picard, Eva Budinska, Stephane S. Robin
article
12. International Conference on Applied Stochastic Models and Data Analysis, Jun 2007, Chania, Greece
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https://hal.inrae.fr/hal-02751255/file/50355_20120316103651267_1.pdf BibTex
titre
A Combined Transcriptomic Approach to Analyse the Dialogue between Pseudorabies Virus and Porcine Cells
auteur
Laurence Flori, Claire Gaillard, Valentina Mariani, Gaëtan Lemonnier, M. Cochet, Karine Hugot, Patrick Chardon, Stephane Robin, Francois Lefèvre
article
International Symposium on Animal Genomics for Animal Health, 2007, Paris, France
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Book sections

titre
DNA microarrays in Plants
auteur
Patrick Doumas, Christophe Rothan, Yves Al-Ghazi, Stephane Robin
article
Functional Plant Genomics, Science Publishers, 2007, 978-1-57808-506-4
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Preprints, Working Papers, ...

titre
A leave-p-out based estimation of the proportion of null hypotheses
auteur
Alain Celisse, Stéphane Robin
article
2007
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https://hal.science/hal-00270908/file/pi0estimation.pdf BibTex

2006

Journal articles

titre
Network motifs : mean and variance for the count
auteur
Catherine Matias, Sophie S. Schbath, Etienne Birmelé, Jean-Jacques J.-J. Daudin, Stephane S. Robin
article
REVSTAT - Statistical Journal, 2006, 4 (1), pp.31-51
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https://hal.inrae.fr/hal-02655236/file/50482_20120425015224694_1.pdf BibTex
titre
Comparaisons multiples pour les microarrays
auteur
Avner Bar-Hen, Jean-Jacques Daudin, Stephane Robin
article
Journal de la Société Française de Statistique, 2006, 146 (1-2), pp.45-62
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Conference papers

titre
Compression pour la classification supervisée
auteur
Tristan Mary-Huard, Stephane S. Robin
article
Journées MAS: Modèles Spatiaux, Sep 2006, Lille, France. n.p
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Book sections

titre
False discovery rate
auteur
Stephane S. Robin
article
Encyclopedia of Biopharmaceutical Statistics, 3ème édition, CRC Press (Taylor \& Francis Group), 1504 p., 2006, 9781439822456
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2005

Journal articles

titre
VarMixt: efficient variance modelling for the differential analysis of replicated gene expression data
auteur
P. Delmar, S. Robin, Jj Daudin
article
Bioinformatics, 2005, 21 (4) (4), pp.502-508. ⟨10.1093/bioinformatics/bti023⟩
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titre
Mixture model on the variance for the differential analysis of gene expression data
auteur
P. Delmar, S. Robin, D. Tronik Le Roux, Jj Daudin
article
Journal of the Royal Statistical Society: Series C Applied Statistics, 2005, 54 (Part 1), pp.31-50 Part 1. ⟨10.1111/j.1467-9876.2005.00468.x⟩
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titre
Factors associated with time to neonatal diarrhoea in french beef calves
auteur
Tristan Lorino, Jean-Jacques Daudin, Stephane Robin, Moez Sanaa
article
Preventive Veterinary Medicine, 2005, 68 (2-4), pp.91-102. ⟨10.1016/j.prevetmed.2004.11.013⟩
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titre
A statistical approach for array CGH data analysis
auteur
Franck Picard, Stephane Robin, Marc Lavielle, Christian Vaisse, Jean-Jacques Daudin
article
BMC Bioinformatics, 2005, 6, ⟨10.1186/1471-2105-6-27⟩
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https://hal.science/hal-01222433/file/PRLV05-BMCBioinfo_%7B8B2F568E-BB62-44E3-B8C4-AB6FB0B60C40%7D.pdf BibTex
titre
Checking homogeneity of patterns distribution in heterogeneous sequences
auteur
Sabrina Ledent, Stephane Robin
article
Journal of Computational Biology, 2005, 12 (6), pp.672-685
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Books

titre
DNA, words and models: statistics of exceptional words
auteur
Stephane S. Robin, Francois F. Rodolphe, Sophie S. Schbath
article
Cambridge University Press, 138 p., 2005, 0-521-84729-X. ⟨10.2277/052184729X⟩
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2004

Journal articles

titre
A Game Theoretical Approach of Price Negotiation and Coordination in an Innovative Firm-Supplier Context: An Experimental Analysis
auteur
Alexis Garapin, Jeanne Duvallet, Stephane Robin, Daniel Llerena
article
International Negotiation, 2004, 9 (2), pp.245 - 269. ⟨10.1163/1571806042403045⟩
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titre
Determination of the regulated genes in microarray experiments using local FDR
auteur
Julie Aubert, Avner Bar-Hen, Jean-Jacques Daudin, Stephane Robin
article
BMC Bioinformatics, 2004, 5 (125), ⟨10.1186/1471-2105-5-125⟩
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https://hal.science/hal-01208107/file/ABD04-BMCbioinfo_%7B9DDFD831-D8B5-4DC8-A408-D63ACF00B36D%7D.pdf BibTex
titre
Comparison of semiparametric regression models for correlated survival data
auteur
Tristan Lorino, Moez Sanaa, Stephane Robin, Jean-Jacques Daudin
article
Communications in Statistics - Simulation and Computation, 2004, 33 (8), pp.1975-1991. ⟨10.1081/STA-120037453⟩
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Book sections

titre
Analyse du transcriptome végétal par les puces à ADN
auteur
Patrick Doumas, Christophe Rothan, Stephane S. Robin
article
La génomique en biologie végétale, INRA Editions, 2004, Science Update, 2-7380-1167-5
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titre
Techniques statistique pour l’analyse du transcriptome
auteur
Stephane Robin, Marie-Laure Magniette
article
Informatique pour l’analyse du transcriptome, Editions Lavoisier, 320 p., 2004
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BibTex
titre
Analyse du transcriptome végétal pas les puces à ADN
auteur
Stephane Robin, Patrick Doumas, Christophe Rothan
article
La génomique en biologie végétale, Quae éditions, 582 p., 2004, Science Update, 978-2-7380-1167-1
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2003

Journal articles

titre
A procedure for the clustering of cell wall mutants in the model plant arabidopsis based on fourier-transform infrared (FT-IR) spectroscopy
auteur
Stephane Robin, Mannaïg Lecomte, Hermanus Höfte, Gregory Mouille
article
Journal of Applied Statistics, 2003, 30 (6), pp.669-681. ⟨10.1080/0266476032000053745⟩
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titre
An iterative procedure for differential analysis of gene expression
auteur
Avner Bar-Hen, Stephane Robin
article
Comptes Rendus. Mathématique, 2003, 337 (5), pp.343-346. ⟨10.1016/S1631-073X(03)00365-0⟩
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Book sections

titre
Some statistical issues in microarray data analysis
auteur
Stephane Robin
article
Between Data Science And Applied Data Analysis, Springer-Verlag, 2003, Studies in Classification, Data Analysis, and Knowledge Organization, 978-3-642-18991-3
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Books

titre
ADN, mots et modèles
auteur
Stephane S. Robin, Francois F. Rodolphe, Sophie S. Schbath
article
Editions Belin, 144 p., 2003, 2-7011-3696-2
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2002

Journal articles

titre
Back to the local score in the logarithmic case : a direct and simple proof,
auteur
Jean-Noel Bacro, Jean-Jacques Daudin, Sabine Mercier, Stéphane Robin
article
Annals of the Institute of Statistical Mathematics, 2002, 54 (4), pp.748-757. ⟨10.1023/A:1022407200882⟩
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https://hal.science/hal-00937519/file/Bacro-Daudin-Mercier-2002.pdf BibTex
titre
A compound Poisson model for words occurrences in DNA sequences
auteur
Stephane Robin
article
Journal of the Royal Statistical Society: Series C Applied Statistics, 2002, 51 (4), pp.437-451. ⟨10.1111/1467-9876.00279⟩
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2001

Journal articles

titre
Predicting phenotypic distances using a linear model : the case of varietal distinctness
auteur
Gregory Nuel, Stephane Robin, Claire Baril
article
Journal of Applied Statistics, 2001, 28 (5), pp.607-621. ⟨10.1080/02664760120047942⟩
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titre
Extracting biological information from dna arrays : an unexpected link between arginine and methionine metabolism in bacillus subtilis
auteur
Agnieszka Sekowska, Stephane Robin, Jean-Jacques Daudin, Alain Hénaut, Antoine Danchin
article
Genome Biology, 2001, 2 (6), ⟨10.1186/gb-2001-2-6-research0019⟩
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https://hal.science/hal-01219561/file/art-2001-2-6-research0019-1.pdf BibTex
titre
Numerical comparison of several approximations of the word count distribution in random sequences
auteur
Stephane S. Robin, Sophie S. Schbath
article
Journal of Computational Biology, 2001, 8 (4), pp.349-359
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titre
Exact distribution of the distances between any occurrences of a set of words
auteur
Stephane Robin, Jean-Jacques Daudin
article
Annals of the Institute of Statistical Mathematics, 2001, 36 (4), pp.895-905. ⟨10.1023/A:1014633825822⟩
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1999

Journal articles

titre
A model for thermograms
auteur
Stephane Robin
article
Biometrics, 1999, 55 (1), pp.37-43. ⟨10.1111/j.0006-341X.1999.00037.x⟩
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titre
Exact distribution of word occurrences in a random sequence of letters
auteur
Stephane Robin, Jean-Jacques Daudin
article
Journal of Applied Probability, 1999, 36 (1), pp.179-193
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titre
Spike dry matter and nitrogen accumulation before anthesis in wheat as affected by nitrogen fertilizer: relationship to kernels per spike
auteur
Sabine Demotes-Mainard, Marie-Helene Jeuffroy, Stephane S. Robin
article
Field Crops Research, 1999, 64, pp.249-259
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