Publications HAL de la collection BERNOULLI_LAB

2025

Article dans une revue

titre
Automatic quality control of brain 3D FLAIR MRIs for a clinical data warehouse
auteur
Sophie Loizillon, Simona Bottani, Aurélien Maire, Sebastian Ströer, Lydia Chougar, Didier Dormont, Olivier Colliot, Ninon Burgos
article
Medical Image Analysis, 2025, 103, pp.103617. ⟨10.1016/j.media.2025.103617⟩
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https://inria.hal.science/hal-05059257/file/Loizillon_DA_QC_FLAIR_postprint.pdf BibTex

2024

Article dans une revue

titre
Automated MRI Quality Assessment of Brain T1-weighted MRI in Clinical Data Warehouses: A Transfer Learning Approach Relying on Artefact Simulation
auteur
Sophie Loizillon, Simona Bottani, Stéphane Mabille, Yannick Jacob, Aurélien Maire, Sebastian Ströer, Didier Dormont, Olivier Colliot, Ninon Burgos
article
Journal of Machine Learning for Biomedical Imaging, 2024, 2 (June 2024), pp.888-915. ⟨10.59275/j.melba.2024-7fgd⟩
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https://hal.science/hal-04623223/file/loizillon_article_t1_qc_final_version.pdf BibTex
titre
Automatic motion artefact detection in brain T1-weighted magnetic resonance images from a clinical data warehouse using synthetic data
auteur
Sophie Loizillon, Simona Bottani, Aurélien Maire, Sebastian Ströer, Didier Dormont, Olivier Colliot, Ninon Burgos
article
Medical Image Analysis, 2024, 93, pp.103073. ⟨10.1016/j.media.2023.103073⟩
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https://inria.hal.science/hal-03910451/file/MOTION_LOIZILLON_HAL.pdf BibTex
titre
Contrast-enhanced to non-contrast-enhanced image translation to exploit a clinical data warehouse of T1-weighted brain MRI
auteur
Simona Bottani, Elina Thibeau-Sutre, Aurélien Maire, Sebastian Ströer, Didier Dormont, Olivier Colliot, Ninon Burgos
article
BMC Medical Imaging, 2024, 24 (1), pp.67. ⟨10.1186/s12880-024-01242-3⟩
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https://hal.science/hal-03497645/file/s12880-024-01242-3.pdf BibTex

Communication dans un congrès

titre
Detecting Brain Anomalies in Clinical Routine with the β-VAE: Feasibility Study on Age-Related White Matter Hyperintensities
auteur
Sophie Loizillon, Yannick Jacob, Aurelien Maire, Didier Dormont, Olivier Colliot, Ninon Burgos
article
Medical Imaging with Deep Learning - MIDL 2024, Jul 2024, Paris, France
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https://hal.science/hal-04674025/file/_Loizillon__MIDL_2024___Unsupervised_WM_lesion_detection-1.pdf BibTex
titre
Leveraging noise and contrast simulation for the automatic quality control of routine clinical T1-weighted brain MRI
auteur
Sophie Loizillon, Stéphane Mabille, Simona Bottani, Yannick Jacob, Aurélien Maire, Sebastian Ströer, Didier Dormont, Olivier Colliot, Ninon Burgos
article
SPIE Medical Imaging 2024: Image Processing, Feb 2024, San Diego (CA), United States. ⟨10.1117/12.3005781⟩
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https://hal.science/hal-04674029/file/_Loizillon__SPIE_2024___T1_QC-2.pdf BibTex

2023

Article dans une revue

titre
Evaluation of MRI-based machine learning approaches for computer-aided diagnosis of dementia in a clinical data warehouse
auteur
Simona Bottani, Ninon Burgos, Aurélien Maire, Dario Saracino, Sebastian Stroër, Didier Dormont, Olivier Colliot
article
Medical Image Analysis, 2023, 89, pp.102903. ⟨10.1016/j.media.2023.102903⟩
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https://hal.science/hal-03656136/file/6-Paper_NO_track_changes.pdf BibTex

Communication dans un congrès

titre
Semi-supervised Domain Adaptation for Automatic Quality Control of FLAIR MRIs in a Clinical Data Warehouse
auteur
Sophie Loizillon, Olivier Colliot, Lydia Chougar, Sebastian Stroer, Yannick Jacob, Aurélien Maire, Didier Dormont, Ninon Burgos
article
DART 2023 - 5th MICCAI Workshop on Domain Adaptation and Representation Transfer, Oct 2023, Vancouver (BC), Canada. pp.84-93, ⟨10.1007/978-3-031-45857-6_9⟩
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https://hal.science/hal-04273997/file/hal_loizillon_dart_miccai.pdf BibTex
titre
Transfer learning from synthetic to routine clinical data for motion artefact detection in brain T1-weighted MRI
auteur
Sophie Loizillon, Simona Bottani, Aurélien Maire, Sebastian Stroer, Didier Dormont, Olivier Colliot, Ninon Burgos
article
SPIE Medical Imaging 2023: Image Processing, Feb 2023, San Diego, United States
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https://inria.hal.science/hal-03831746/file/SPIE_2023_Loizillon_HAL.pdf BibTex

2022

Article dans une revue

titre
Automatic quality control of brain T1-weighted magnetic resonance images for a clinical data warehouse
auteur
Simona Bottani, Ninon Burgos, Aurélien Maire, Adam Wild, Sébastian Ströer, Didier Dormont, Olivier Colliot
article
Medical Image Analysis, 2022, 75, ⟨10.1016/j.media.2021.102219⟩
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https://inria.hal.science/hal-03154792/file/QC_article_29_08_2021.pdf BibTex

Communication dans un congrès

titre
Homogenization of brain MRI from a clinical data warehouse using contrast-enhanced to non-contrast-enhanced image translation with U-Net derived models
auteur
Simona Bottani, Elina Thibeau-Sutre, Aurélien Maire, Sebastian Ströer, Didier Dormont, Olivier Colliot, Ninon Burgos
article
SPIE Medical Imaging 2022: Image Processing, Feb 2022, San Diego, United States. pp.576-582, ⟨10.1117/12.2608565⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-03478798/file/SPIE_2021_SimonaBottani_HAL.pdf BibTex