2025
Journal articles
-

- titre
- Iron-rich microband formation in marine sediments by hydrothermal iron cycling bacteria at Lucky Strike
- auteur
- Jérémie Aubineau, Ernest Chi Fru, Christine Destrigneville, Thierry Decrausaz, Fleurice Parat, Fabien Baron, Alexandra Nederbragt, Manuel Henry, Alain Castillo, Céline Rommevaux, Valérie Chavagnac
- article
- Communications Earth & Environment, 2025, ⟨10.1038/s43247-025-02223-2⟩
- identifiant
- hal-05053696
- DOI
- DOI : 10.1038/s43247-025-02223-2
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Influence of sediment on the chemical properties of water in coastal environment and their potential effect on heterotrophic prokaryotic growth
- auteur
- Clara Dignan, Benjamin Misson, Véronique Lenoble, Nicole Garcia, Benjamin Oursel, Virginie Sanial
- article
- Regional Studies in Marine Science, 2025, 85, pp.104145. ⟨10.1016/j.rsma.2025.104145⟩
- identifiant
- hal-05018426
- DOI
- DOI : 10.1016/j.rsma.2025.104145
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Representatives of the Synergistaceae family, taxonomic description and genome sequence of Caenicola nitritireducens gen nov., sp. nov., a novel fermenting and amino-acid degrading bacterium isolated from a municipal anaerobic digester sludge
- auteur
- Abdelaziz El Houari, Magali Ranchou-Peyruse, Elisabeth Carlier, Anthony Ranchou-Peyruse, Agnès Hirschler-Réa, Rhizlane Bennisse, Radia Bouterfas, James E Mcdonald, Remy Guyoneaud, Abdel-Illah Qatibi
- article
- Systematic and Applied Microbiology, 2025, 48 (3), pp.126607. ⟨10.1016/j.syapm.2025.126607⟩
- identifiant
- hal-05085980
- DOI
- DOI : 10.1016/j.syapm.2025.126607
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Assessing pollution in sediment and water before, during and after sediment dredging in a Mediterranean harbor
- auteur
- Chrystelle Montigny, Cyrine Chouba, Aurélien Domeau, Sophie Delpoux, Mylène Marie, Léa Causse, Rémi Freydier, Olivier Pringault
- article
- Journal of Environmental Management, 2025, 389, pp.126182. ⟨10.1016/j.jenvman.2025.126182⟩
- identifiant
- hal-05113522
- DOI
- DOI : 10.1016/j.jenvman.2025.126182
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- A trace metal cleaning protocol for laboratory equipment to enhance the repeatability of methanotroph cultures
- auteur
- Marie Noguer, Sandrine Chifflet, Sylvain Davidson, Florian Haitz, Bernard Angeletti, Jean Borgomano, Bernard Ollivier, Alain Dolla, Yannick Combet-Blanc
- article
- MethodsX, 2025, 14, ⟨10.1016/j.mex.2025.103392⟩
- identifiant
- hal-05106687
- DOI
- DOI : 10.1016/j.mex.2025.103392
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- The role of ribosomal protein networks in ribosome dynamics
- auteur
- Youri Timsit, Grégoire Sergeant-Perthuis, Daniel Bennequin
- article
- Nucleic Acids Research, 2025, 53, ⟨10.1093/nar/gkae1308⟩
- identifiant
- hal-04978839
- DOI
- DOI : 10.1093/nar/gkae1308
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- The Expanding Universe of Extensions and Tails: Ribosomal Proteins and Histones in RNA and DNA Complex Signaling and Dynamics
- auteur
- Youri Timsit
- article
- Genes, 2025, 16 (1), pp.45. ⟨10.3390/genes16010045⟩
- identifiant
- hal-04978833
- DOI
- DOI : 10.3390/genes16010045
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Global diversity and distribution of antibiotic resistance genes in human wastewater treatment systems
- auteur
- Congmin Zhu, Linwei Wu, Daliang Ning, Renmao Tian, Shuhong Gao, Bing Zhang, Jianshu Zhao, Ya Zhang, Naijia Xiao, Yajiao Wang, Mathew R Brown, Qichao Tu, Dany Acevedo, Miriam Agullo-Barcelo, Juliana Calabria de Araujo, Érika Ferreira de Abreu Mac Conell, Kevin Boehnke, Philip Bond, Charles B Bott, Patricia Bovio-Winkler, Rebecca K Brewster, Faizal Bux, Angela Cabezas, Léa Cabrol, Si Chen, Claudia Etchebehere, Amanda Ford, Janeth Sanabria Gómez, James S Griffin, April Z Gu, Moshe Habagil, Lauren Hale, Marc Harmon, Harald Horn, Zhiqiang Hu, David R Johnson, Deborah Garbani Marcantini, Alexander Keucken, Sheena Kumari, Cintia Dutra Leal, Zarraz Mp Lee, Yong Li, Zhenxin Li, Mengyan Li, Yu Liu, Leda C Mendonça-Hagler, Francisca Gleire Rodriguez de Menezes, Arthur J Meyers, Andrew Palmer, Prathap Parameswaran, Valeria Reginatto, Francis L de los Reyes, Simona Rossetti, Jatinder Sidhu, Kylie Smith, Oscarina Viana de Sousa, Kyle Stephens, Chenxiang Sun, Nicholas B Tooker, Joy D van Nostrand, Steve Wakelin, Bei Wang, Joseph E Weaver, Stephanie West, Sung-Geun Woo, Jer-Horng Wu, Liyou Wu, Chuanwu Xi, Tao Yan, Min Yang, Michelle Young, Chiqian Zhang, Qian Zhang, Wen Zhang, Wanlin Zheng, Hongde Zhou, Weiqin Zhuang, Feng Ju, George F Wells, Jianhua Guo, Zhili He, Per H Nielsen, Aijie Wang, Yu Zhang, Ting Chen, Qiang He, Craig S Criddle, Michael Wagner, James M Tiedje, Thomas P Curtis, Xianghua Wen, Yunfeng Yang, Lisa Alvarez-Cohen, David A Stahl, Pedro J J Alvarez, Bruce E Rittmann, Jizhong Zhou
- article
- Nature Communications, 2025, 16 (1), pp.4006. ⟨10.1038/s41467-025-59019-3⟩
- identifiant
- hal-05053288
- DOI
- DOI : 10.1038/s41467-025-59019-3
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Preprints, Working Papers, ...
- titre
- Deviation from Power-Law Distribution when Scaling the Distribution of Marine Plankton Folds from Genomes to Communities
- auteur
- Lucas Pavlovic, Caroline Vernette, Emanuele Pigani, Louis Joigneaux, Alexandre Labesse, Janaina Rigonato, Daniele Iudicone, Magali Lescot, Youri Timsit, Olivier Jaillon
- article
- 2025
- identifiant
- hal-05038679
- DOI
- DOI : 10.1101/2025.03.25.645231
- Accès au bibtex
-
2024
Journal articles
-

- titre
- Linking Zetaproteobacterial diversity and substratum type in iron-rich microbial mats from the Lucky Strike hydrothermal field (EMSO-Azores observatory)
- auteur
- Aina Astorch-Cardona, Giliane P Odin, Valérie Chavagnac, Alain Dolla, Hélène Gaussier, Céline Rommevaux
- article
- Applied and Environmental Microbiology, 2024, ⟨10.1128/aem.02041-23⟩
- identifiant
- hal-04383660
- DOI
- DOI : 10.1128/aem.02041-23
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Diversity and dynamics of bacteria from iron-rich microbial mats and colonizers in the Mediterranean Sea (EMSO-Western Ligurian Sea Observatory): Focus on Zetaproteobacteria
- auteur
- Aina Astorch-Cardona, Lionel Bertaux, Yann Denis, Alain Dolla, Céline Rommevaux
- article
- PLoS ONE, 2024, 19 (7), pp.e0305626. ⟨10.1371/journal.pone.0305626⟩
- identifiant
- hal-04649220
- DOI
- DOI : 10.1371/journal.pone.0305626
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- A novel method to sample individual marine snow particles for downstream molecular analyses
- auteur
- Chloé M.J. Baumas, Fatima‐ezzahra Ababou, Marc Garel, Mina Bizic, Danny Ionescu, Arthur Puzenat, Frederic A.C. Le Moigne, Hans-Peter Grossart, Christian Tamburini
- article
- Limnology and Oceanography: Methods, 2024, 22, pp.34-46. ⟨10.1002/lom3.10590⟩
- identifiant
- hal-04285160
- DOI
- DOI : 10.1002/lom3.10590
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Viral dynamics in a high-rate algal pond reveals a burst of Phycodnaviridae diversity correlated with episodic algal mortality
- auteur
- Emily E Chase, T. Pitot, Sonia Bouchard, S. Triplet, Cyrille Przybyla, Angélique Gobet, Christelle Desnues, Guillaume Blanc
- article
- mBio, In press, ⟨10.1128/mbio.02803-24⟩
- identifiant
- hal-04778092
- DOI
- DOI : 10.1128/mbio.02803-24
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Added Value of Water Column Spatiotemporal Monitoring to Assess Variability of Trace Metal Elements and Organotin Compounds in Mediterranean Harbours
- auteur
- Cyrine Chouba, Olivier Pringault, Aurélien Domeau, Sophie Delpoux, Léa Causse, Mylène Marie, Rémi Freydier, CHRYSTELLE MONTIGNY
- article
- Journal of Marine Science and Engineering, 2024, 12 (399), ⟨10.3390/jmse12030399⟩
- identifiant
- hal-04477440
- DOI
- DOI : 10.3390/jmse12030399
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Characterization of a Deglaciated Sediment Chronosequence in the High Arctic Using Near‐Surface Geoelectrical Monitoring Methods
- auteur
- Mihai O Cimpoiasu, Oliver Oliver Kuras, Harry Harrison, Paul B Wilkinson, Philip Meldrum, Jonathan E Chambers, Dane Liljestrand, Carlos Oroza, Steven K Schmidt, Pacifica Sommers, Trevor P Irons, James A Bradley
- article
- Permafrost and Periglacial Processes, 2024, 35 (2), pp.157-171. ⟨10.1002/ppp.2220⟩
- identifiant
- hal-04621012
- DOI
- DOI : 10.1002/ppp.2220
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Habitat specificity modulates the bacterial biogeographic patterns in the Southern Ocean.
- auteur
- Mélanie Delleuze, Guillaume Schwob, Julieta Orlando, Karin Gerard, Thomas Saucède, Paul Brickle, Elie Poulin, Léa Cabrol
- article
- FEMS Microbiology Ecology, 2024, 100 (11), pp.15. ⟨10.1093/femsec/fiae134⟩
- identifiant
- hal-04798553
- DOI
- DOI : 10.1093/femsec/fiae134
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Hypervariable DOM properties in coastal NW Mediterranean sea -evidences of strong human influences and potential consequences for the heterotrophic base of planktonic food webs
- auteur
- Clara Dignan, Véronique Lenoble, Nicole Garcia, Benjamin Oursel, Ana-Marija Cindrić, Benjamin Misson
- article
- Estuarine, Coastal and Shelf Science, 2024, 308, pp.108925. ⟨10.1016/j.ecss.2024.108925⟩
- identifiant
- hal-04678315
- DOI
- DOI : 10.1016/j.ecss.2024.108925
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Algal‐ and soil‐derived dissolved organic matter shapes bacteria‐phytoplankton interactions in a high‐altitude lake
- auteur
- Flavia Dory, Laurent Cavalli, Evelyne Franquet, France van Wambeke, Benjamin Misson, Stéphane Mounier, Christian Martino, Benjamin Oursel, Thierry Tatoni, Céline Bertrand
- article
- Freshwater Biology, 2024, 69 (4), pp.509-526. ⟨10.1111/fwb.14225⟩
- identifiant
- hal-04453583
- DOI
- DOI : 10.1111/fwb.14225
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- First release of the Pelagic Size Structure database: global datasets of marine size spectra obtained from plankton imaging devices
- auteur
- Mathilde Dugenne, Marco Corrales-Ugalde, Jessica Luo, Rainer Kiko, Todd O'Brien, Jean-Olivier Irisson, Fabien Lombard, Lars Stemmann, Charles Stock, Clarissa Anderson, Marcel Babin, Nagib Bhairy, Sophie Bonnet, Francois Carlotti, Astrid Cornils, E. Taylor Crockford, Patrick Daniel, Corinne Desnos, Laetitia Drago, Amanda Elineau, Alexis Fischer, Nina Grandrémy, Pierre-Luc Grondin, Lionel Guidi, Cécile Guieu, Helena Hauss, Kendra Hayashi, Jenny Huggett, Laetitia Jalabert, Lee Karp-Boss, Kasia Kenitz, Raphael Kudela, Magali Lescot, Claudie Marec, Andrew Mcdonnell, Zoe Mériguet, Barbara Niehoff, Margaux Noyon, Thelma Panaïotis, Emily Peacock, Marc Picheral, Emilie Riquier, Collin Roesler, Jean-Baptiste Romagnan, Heidi Sosik, Gretchen Spencer, Jan Taucher, Chloé Tilliette, Marion Vilain
- article
- Earth System Science Data, 2024, 16 (6), pp.2971-2999. ⟨10.5194/essd-16-2971-2024⟩
- identifiant
- hal-04648046
- DOI
- DOI : 10.5194/essd-16-2971-2024
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Exploring the influence of fertilization on bacterial community fluctuations in Ulva cultivation
- auteur
- Paul Estoup, Vincent Gernigon, Amandine Avouac, Guillaume Blanc, Angélique Gobet
- article
- Algal Research - Biomass, Biofuels and Bioproducts, 2024, 82, pp.103688. ⟨10.1016/j.algal.2024.103688⟩
- identifiant
- hal-04687427
- DOI
- DOI : 10.1016/j.algal.2024.103688
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Uncovering potential mangrove microbial bioindicators to assess urban and agricultural pressures on Martinique island in the eastern Caribbean Sea
- auteur
- Maud Fiard, Cécile Militon, Léa Sylvi, Jonathan Migeot, Emma Michaud, Ronan Jézéquel, Franck Gilbert, Isabelle Bihannic, Jeremy Devesa, Guillaume Dirberg, Philippe Cuny
- article
- Science of the Total Environment, 2024, 928, pp.172217. ⟨10.1016/j.scitotenv.2024.172217⟩
- identifiant
- hal-04542751
- DOI
- DOI : 10.1016/j.scitotenv.2024.172217
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Dissolved organic matter offsets the detrimental effects of climate change in the nitrogen‐fixing cyanobacterium Crocosphaera
- auteur
- Alba Filella, Jacqueline Umbricht, Angelina Klett, Angela Vogts, Thomas Vannier, Olivier Grosso, Maren Voss, Lasse Riemann, Mar Benavides
- article
- Limnology and Oceanography Letters, 2024, 9 (3), pp.296-306. ⟨10.1002/lol2.10380⟩
- identifiant
- hal-04909142
- DOI
- DOI : 10.1002/lol2.10380
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- What happens to biomass burning-emitted particles in the ocean? A laboratory experimental approach based on their tracers
- auteur
- Juan Miguel González-Sánchez, Christos Panagiotopoulos, Candice Antich, Laure Papillon, Nicole Garcia, France van Wambeke, Benjamin Misson
- article
- Science of the Total Environment, 2024, 907, pp.167770. ⟨10.1016/j.scitotenv.2023.167770⟩
- identifiant
- hal-04268856
- DOI
- DOI : 10.1016/j.scitotenv.2023.167770
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Biochemical and microbial characterization of a forest litter-based bio-fertilizer produced in batch culture by fermentation under different initial oxygen concentrations
- auteur
- Alejandra Gutierrez, Catherine Rébufa, Anne Marie Farnet da Silva, Sylvain Davidson, Lisa Foli, Yannick Combet-Blanc, Martine Martinez, Pierre Christen
- article
- World Journal of Microbiology and Biotechnology, 2024, 40 (11), 353 [11p.]. ⟨10.1007/s11274-024-04155-z⟩
- identifiant
- hal-04792006
- DOI
- DOI : 10.1007/s11274-024-04155-z
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Warming and polymetallic stress induce proteomic and physiological shifts in the neurotoxic Alexandrium pacificum as possible response to global changes
- auteur
- Natacha Jean, Amandin James, Thierry Balliau, Christian Martino, Jérôme Ghersy, Véronique Savar, Mohamed Laabir, Amandine M. N. Caruana
- article
- Marine Pollution Bulletin, 2024, 209, 117221 (19p.). ⟨10.1016/j.marpolbul.2024.117221⟩
- identifiant
- hal-04928778
- DOI
- DOI : 10.1016/j.marpolbul.2024.117221
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- The atmosphere: a transport medium or an active microbial ecosystem?
- auteur
- Rachael Lappan, Jordan Thakar, Laura Molares Moncayo, Alexi Besser, James A Bradley, Jacqueline Goordial, Elizabeth Trembath-Reichert, Chris Greening
- article
- The International Society of Microbiologial Ecology Journal, 2024, 18 (1), pp.wrae092. ⟨10.1093/ismejo/wrae092⟩
- identifiant
- hal-04663494
- DOI
- DOI : 10.1093/ismejo/wrae092
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Rising awareness to improve conservation of microorganisms in terrestrial ecosystems : advances and future directions in soil microbial diversity from Chile and the Antarctic Peninsula
- auteur
- Céline Lavergne, Léa Cabrol, Sara Cuadros-Orellana, Carolina Quinteros-Urquieta, Alexandra Stoll, Carolina Yáñez, Joseline Tapia, Julieta Orlando, Claudia Rojas
- article
- Frontiers in Environmental Science, 2024, 12, pp.1326158. ⟨10.3389/fenvs.2024.1326158⟩
- identifiant
- hal-04552890
- DOI
- DOI : 10.3389/fenvs.2024.1326158
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Predominant heterotrophic diazotrophic bacteria are involved in Sargassum proliferation in the great Atlantic Sargassum Belt
- auteur
- M Léger-Pigout, E Navarro, F Menard, S Ruitton, F Le Loc’h, S Guasco, J-M Munaron, D Thibault, T Changeux, S Connan, V Stiger-Pouvreau, T Thibaut, V Michotey
- article
- The International Society of Microbiologial Ecology Journal, 2024, ⟨10.1093/ismejo/wrad026⟩
- identifiant
- hal-04421726
- DOI
- DOI : 10.1093/ismejo/wrad026
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Indexing and real-time user-friendly queries in terabyte-sized complex genomic datasets with kmindex and ORA
- auteur
- Téo Lemane, Nolan Lezzoche, Julien Lecubin, Eric Pelletier, Magali Lescot, Rayan Chikhi, Pierre Peterlongo
- article
- Nature Computational Science, 2024, 4 (2), pp.104-109. ⟨10.1038/s43588-024-00596-6⟩
- identifiant
- hal-04489740
- DOI
- DOI : 10.1038/s43588-024-00596-6
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Indexer les données génomiques : un défi de taille à relever
- auteur
- Téo Lemane, Magali Lescot, Pierre Peterlongo
- article
- Interstices, 2024, pp.1-5
- identifiant
- hal-04757321
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Seasonal dynamics of Arctic soils: Capturing year-round processes in measurements and soil biogeochemical models
- auteur
- Zhou Lyu, Pacifica Sommers, Steven K Schmidt, Marta Magnani, Mihai Cimpoiasu, Oliver Kuras, Qianlai Zhuang, Youmi Oh, Maria de la Fuente, Margaret Cramm, James A Bradley
- article
- Earth-Science Reviews, 2024, 254, pp.104820. ⟨10.1016/j.earscirev.2024.104820⟩
- identifiant
- hal-04621009
- DOI
- DOI : 10.1016/j.earscirev.2024.104820
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Arctic plasmidome analysis reveals distinct relationships among associated antimicrobial resistance genes and virulence genes along anthropogenic gradients
- auteur
- Nicoletta Makowska‐zawierucha, Artur Trzebny, Krzysztof Zawierucha, Vineeth Manthapuri, James A Bradley, Amy Pruden
- article
- Global Change Biology, 2024, 30 (5), ⟨10.1111/gcb.17293⟩
- identifiant
- hal-04621011
- DOI
- DOI : 10.1111/gcb.17293
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- In situ oil contamination in young mangroves: biodegradation of petroleum hydrocarbons and effects on the microbial and benthic communities, an experimental study in French Guiana
- auteur
- Cécile Militon, Emma Michaud, Léa Sylvi, Lise Millera Ferriz, Enora Roic, Franck Gilbert, Ronan Jézéquel, Philippe Cuny
- article
- Marine Pollution Bulletin, 2024, 209, pp.117285. ⟨10.1016/j.marpolbul.2024.117285⟩
- identifiant
- hal-04817921
- DOI
- DOI : 10.1016/j.marpolbul.2024.117285
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- A New Inovirus from the Human Blood Encodes Proteins with Nuclear Subcellular Localization
- auteur
- Nikolay Popgeorgiev, Mart Krupovic, Julien Hiblot, Laura Fancello, Sonia Monteil-Bouchard, Christelle Desnues
- article
- Viruses, 2024, 16 (3), pp.475. ⟨10.3390/v16030475⟩
- identifiant
- pasteur-04518817
- DOI
- DOI : 10.3390/v16030475
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Unveiling the co-phylogeny signal between plunderfish Harpagifer spp. and their gut microbiomes across the Southern Ocean
- auteur
- Guillaume Schwob, Léa Cabrol, Thomas Saucède, Karin Gérard, Elie Poulin, Julieta Orlando
- article
- Microbiology Spectrum, 2024, 12 (4), pp.e03830-23. ⟨10.1128/spectrum.03830-23⟩
- identifiant
- hal-04552885
- DOI
- DOI : 10.1128/spectrum.03830-23
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Morphological and Molecular Characters Differentiate Common Morphotypes of Atlantic Holopelagic Sargassum
- auteur
- Amy Siuda, Aurélie Blanfuné, Skye Dibner, Marc Verlaque, Charles-François Boudouresque, Solène Connan, Deborah Goodwin, Valérie Stiger-Pouvreau, Frédérique Viard, Florence Rousseau, Valérie Michotey, Jeffrey Schell, Thomas Changeaux, Didier Aurelle, Thierry Thibaut
- article
- Journal of Phycology, 2024, 4 (2), pp.256-275. ⟨10.3390/phycology4020014⟩
- identifiant
- mnhn-04572926
- DOI
- DOI : 10.3390/phycology4020014
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Deciphering environmental forcings in the distribution of meiofauna and nematodes in mangroves of the Atlantic-Caribbean-East Pacific and Indo-West Pacific regions
- auteur
- Adriana Spedicato, Daniela Zeppilli, Gérard Thouzeau, Philippe Cuny, Cécile Militon, Léa Sylvi, Cédric Hubas, Guillaume Dirberg, Ronan Jézéquel, Guerric Barrière, Loïc Michel, Tânia Nara Bezerra, Emma Michaud
- article
- Science of the Total Environment, 2024, 930, pp.172612. ⟨10.1016/j.scitotenv.2024.172612⟩
- identifiant
- hal-04612129
- DOI
- DOI : 10.1016/j.scitotenv.2024.172612
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Protein Fold Usages in Ribosomes: Another Glance to the Past
- auteur
- Inzhu Tanoz, Youri Timsit
- article
- International Journal of Molecular Sciences, 2024, 25, ⟨10.3390/ijms25168806⟩
- identifiant
- hal-04733039
- DOI
- DOI : 10.3390/ijms25168806
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Principal role of fungi in soil carbon stabilization during early pedogenesis in the high Arctic
- auteur
- Juan Carlos Trejos-Espeleta, Juan Marin-Jaramillo, Steven Schmidt, Pacifica Sommers, James Bradley, William Orsi
- article
- Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2024, 121 (28), pp.e2402689121. ⟨10.1073/pnas.2402689121⟩
- identifiant
- hal-04663492
- DOI
- DOI : 10.1073/pnas.2402689121
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Microbiome alterations are associated with apolipoprotein E mutation in Octodon degus and humans with Alzheimer’s disease
- auteur
- Guido Zampieri, Léa Cabrol, Claudio Urra, Eduardo Castro-Nallar, Guillaume Schwob, David Cleary, Claudio Angione, Robert M.J. Deacon, Michael J Hurley, Patricia Cogram
- article
- iScience, 2024, 27 (8), pp.110348. ⟨10.1016/j.isci.2024.110348⟩
- identifiant
- hal-05053291
- DOI
- DOI : 10.1016/j.isci.2024.110348
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Reports
-

- titre
- Prospective Surfaces et Interfaces Continentales : 2024-2028
- auteur
- Sophie Ayrault, Gilles Pinay, Eric Ferrage, Nizar Abcha, Philippe Ackerer, Julien Ackerer, Cécile H. Albert, Elena Alekseenko, Anne Alexandre, Marie Alexis, Thierry Allard, Pierre Amato, Philippe Amiotte-Suchet, David Amouroux, Anne-Sylvie André-Mayer, Sandrine Anquetin, Eric Armynot Du Châtelet, Marie Arnaud, Nicolas Olivier Arnaud, Cécile Asanuma-Brice, Dominique Aubert, Mélanie Auffan, Julie Aufort, Cédric Bacour, Etienne Balan, Valérie Ballu, Agnès Baltzer, Pierre Barré, Maialen Barret, P. Bauda, Audrey Beaussart, Beatrice Bechet, Thierry Beguiristain, Benjamin Belfort, Frida Ben Rais Lasram, Lucilla Benedetti, Marc F. Benedetti, Anne-Claire Bennis, Catherine Bertrand, Éric Beucler, Patrick Billard, Gilles Billen, Elise Billoir, Françoise Binet, Anne-Kristel Bittebiere, Stéphane Blanc, Marc Blanchard, J Blanchet, Helene Blanchoud, Damien Blaudez, Julien Boé, Patricia Bonin, Myriam Bormans, Gudrun Bornette, Julien Bouchez, Camille Bouchez, Brice Boudevillain, Guillaume Bouger, Olivier Bour, François Bourrin, Philippe Bousquet, Anne Bousquet-Mélou, Isabelle Braud, Odile Bruneel, Yves Brunet, Elisa Bruni, Hélène Budzinski, Damien Calmels, Isabelle Calmet, Simon Damien Carrière, Corinne Casiot, Antoine Casquin, Charlotte Catrouillet, Florence Cayocca, Aurélie Cébron, François Chabaux, Aude Chambodut, Nicolas Champollion, Bruno Charrière, Mathieu Chassé, Ghassan Chebo, P. Choler, Pascal Claquin, Jean-Martial Cohard, Steeve Comeau, Yoann Copard, Marie-Christine Cormier-Salem, Samuel Coussy, Alain Crave, Julien Crétat, Philippe Cuny, Carole Dalin, Michael Danger, José Darrozes, Karin Dassas, Emilie Dassié, Olivier Dauteuil, Mélanie Davranche, Jean-Raynald de Dreuzy, Olivier de Viron, François de Vleeschouwer, Maxime Debret, Christophe Delacourt, Christine Delire, Julien Deloffre, Claire Delon, Nicolas Delpierre, Jérôme Demarty, Delphine Destoumieux-Garzon, Simon Devin, Laurent Dezileau, Aline Dia, Jean-Francois Doussin, David Doxaran, Laurent Drapeau, Agnès Ducharne, Jérôme F.L. Duval, Céline Duwig, Fabien Esculier, Agathe Euzen, O. Evrard, Pierre Faure-Catteloin, Cyrille Flamant, Cyril Fleurant, Marianne Font-Ertlen, Julien Fouché, Anthony Foucher, Matthieu Fournier, Clémentine Fritsch, François Fromard, Lucille Furgerot, Jérôme Gaillardet, Catherine Galy, Laure Gandois, Antoine Gardel, Josette Garnier, Simon Gascoin, Cécile Gautheron, Mathieu Gautier, Frédéric Gérard, Emmanuelle Geslin, Laure Giamberini, Martin Giard, Ludovic Gielly, Charline Giguet-Covex, Daniel Gilbert, Virginie Girard Girard, Sébastien Gogo, Claire Golléty, Dominique Gommery, Swanne Gontharet, Vincent Gordard, Aurélie Goutte, Regis. Grimaud, Bertrand Guenet, Laure Guerit, Elodie Guignon, Stephane Guillot, Éric Guilyardi, Damien Guinoiseau, Vincent Guinot, Remy Guyoneaud, Florence Habets, Sophia V. Hansson, Basile Hector, Marina Hery, A. Hofmann, Martine Hossaert-Mckey, Fabien Hubert, Gwenael Imfeld, Françoise Immel, M.-P. Isaure, Jérémy Jacob, Abderrahim Jardani, Emilie Jardé, Lionel Jarlan, Laurent Jeanneau, Stanislav Jelavić, Marc Jolivet, Dominique Joly, Anne Jost, Damien Jougnot, Jean Kempf, Philippe Kerhervé, B.K. Hassani, Sylvain Kuppel, Pierre Labadie, Jérôme Labanowski, Thierry Labasque, Jérôme Labille, Patrick Lachassagne, Yvan Lagadeuc, France Lagroix, Dimitri Lague, Laurent Lanceleur, Bruno Lanson, Martine Lanson, Goulven Gildas Laruelle, Béatrice Lauga, Anniet M. Laverman, Valérie Le Dantec, Séverine Le Faucheur, Annaig Leguen, Marie Le Jean, Pierre Le Pape, Romain Leclercq, Hélène Lecomte, Marine Legrand, Jean-François Léon, Nolwenn Lesparre, Laurence Lestel, C. Levard, Jean-Marc Limousin, Emily Lloret, Esméralda Longépée, Laurent Longuevergne, Fanny Louis, Wolfgang Ludwig, Fabienne Maignan, Grégoire Maillet, Odin Marc, Cyril Marchand, Guillaume Marchand, Virginie Marécal, Christelle Marlin, Yves Marrochi, Remi Marsac, Beatrice Marticorena, Jean-Michel Martinez, Jean Martins, Jérémy Masbou, Armand Masion, Nicolas Massei, Sylvie Massemin, Olivier Mathieu, Olivier Merlin, Édouard Metzger, Arnaud Mialon, Emma Michaud, Raymond Michels, Laurent Michot, Valerie Michotey, Cécile Militon, Laetitia Minguez, Florence Moatar, Florence Moatar, Gilles Molinie, Leslie Mondamert, Anne Mone, Mathilde Monperrus, Jean-Sébastien Moquet, Valérie Morel, Guillaume Morin, Samuel Morin, Dominique Mouazé, Jean-Marie Mouchel, Emilie Muller, Benjamin Musnier, Jean Nabucet, Sylvie Nazaret, Julien Némery, Nathalie Niquil, Priscia Oliva, Laurent Orgogozo, Catherine Ottle, Ludovic Oudin, Christophe Pagnout, Carmen Palacios, Gérémy Panthou, Guillaume Paris, Pierre-Yves Pascal, Sylvain Payraudeau, Thierry Pellarin, Manuel Pelletier, Jean Louis Perrin, Fabienne Petit, Sabine Petit, Christophe Peugeot, Jean-Philippe Pezy, Caroline Pierre, Marie-Claire Pierret, Anne-Catherine Pierson-Wickmann, Thierry Pigot, Raphaël Pik, Sébastien Pinel, Christophe Piscart, Valérie Plagnes, Sandrine Plaud-Guérin, Pascal Poupin, Hugues Preud'Homme, Sophie Prud'Homme, Anne Puissant, Cécile Quantin, Antoine Rabatel, Christophe Rabouille, Damien Raclot, Olivier Ragueneau, Mélanie Raimonet, Jean Louis Rajot, Guillaume Ramillien, Anthony Ranchou-Peyruse, Fayçal Rejiba, David Renault, Pierre Renault, Eléonore Resongles, Céline Reylé, Jean Riotte, Henri Robain, Tony Robinet, Philippe Roche, Fabrice Rodriguez, Jérôme Rose, Isabelle Ruin, Cornelia Rumpel, Christian Salles, Elodie Salmon, Geraldine Sarret, Géraldine Sarthou, Thomas Saucède, Sabine Sauvage, Nicolas Savoye, I. Schimmelpfennig, Dirk S Schmeller, François Schmitt, Johann Schnyder, Mathieu Sebilo, Loïc Ségalen, Antoine Séjourné, Alexei Sentchev, Lucía Seoane, Liudmila S Shirokova, Marie Silvestre, Anaëlle Simonneau, Yann Sivry, Delphine Six, Marisol Goñi, Jeroen E. Sonke, Aldo Sottolichio, Cyprien Soulaine, Tiphaine Tallec, Roman Teisserenc, Bernadette Tessier, Mickaël Tharaud, Julien Thevenot, Aubin Thibaut de Chanvalon, Thomas Thiebault, Éric Thiébaut, Vincent Thieu, Gérard Thouzeau, Vanessa Tocut, Christophe Tournassat, Danièle Valdés-Lao, E.D. van Hullebusch, Delphine Vantelon, D. Verfaillie, Nathalie Vigier, Cyrille Violle, Didier Voisin, N. Vuichard, Stéphane Vuilleumier, Xiaoni Wang-Faivre, Sylvain Weill, Gaël Le Roux, Bastien Wild, A. Zegeye, Pierpaolo Zuddas
- article
- INSU, CNRS; INEE, CNRS. 2024, 147 p
- identifiant
- insu-05045026
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Biological applications of the satellite Surface Water and Ocean Topography in the Mediterranean
- auteur
- Andrea M. Doglioli, Gérald Grégori, Francesco d'Ovidio, Anthony Bosse, Elvira Pulido-Villena, François Carlotti, Magali Lescot, Barani Aude, S. Barrillon, L. Berline, Maristella Berta, Pascale Bouruet-Aubertot, Chirurgien Laure, Caroline Comby, Veronique Cornet, Cédric Cotté, Alice Della Penna, Morgane Didry, Solange Duhamel, Jean-Luc Fuda, Sven Gastauer, Loic Guilloux, Dominique Lefèvre, Eva Le Merle, Adrien Martin, David Mccann, Milena Menna, Sandra Helias Nunige, Laurina Oms, M. Pacciaroni, Anne Petrenko, Robin Rolland, Louise Rousselet, Emily Waggoner
- article
- Ref. Rapport de campagne, Université Aix Marseille. 2024
- identifiant
- hal-04737346
- DOI
- DOI : 10.13155/100060
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2023
Journal articles
-

- titre
- Phage-Host Prediction Using a Computational Tool Coupled with 16S rRNA Gene Amplicon Sequencing
- auteur
- Harilanto Felana Andrianjakarivony, Yvan Bettarel, Fabrice Armougom, Christelle Desnues
- article
- Viruses, 2023, 15 (1), pp.76. ⟨10.3390/v15010076⟩
- identifiant
- hal-04032690
- DOI
- DOI : 10.3390/v15010076
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Decoding the DNA and RNA viromes of a tropical urban lagoon
- auteur
- Felana Harilanto Andrianjakarivony, Yvan Bettarel, Philippe Cecchi, Sonia Bouchard, Emily Chase, Christelle Desnues
- article
- Environmental Microbiology, 2023, 25 (11), pp.2368-2387. ⟨10.1111/1462-2920.16463⟩
- identifiant
- hal-04262842
- DOI
- DOI : 10.1111/1462-2920.16463
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Reconstructing the ocean's mesopelagic zone carbon budget: sensitivity and estimation of parameters associated with prokaryotic remineralization
- auteur
- Chloé Baumas, Robin Fuchs, Marc Garel, Jean-Christophe Poggiale, Laurent Memery, Frédéric A. C. Le Moigne, Christian Tamburini
- article
- Biogeosciences, 2023, 20 (19), pp.4165-4182. ⟨10.5194/BG-20-4165-2023⟩
- identifiant
- hal-04245254
- DOI
- DOI : 10.5194/BG-20-4165-2023
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Biological mechanisms underlying priming of vascular plant material in the presence of diatoms
- auteur
- Patricia Bonin, Aurélie Portas, Julie Hardy, Sophie Guasco, Ts Bianchi, Nd Ward, Jf Rontani
- article
- Aquatic Microbial Ecology, 2023, 89, pp.99-117. ⟨10.3354/ame01999⟩
- identifiant
- hal-04286759
- DOI
- DOI : 10.3354/ame01999
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Methanomethylophilus alvi gen. nov., sp. nov., a Novel Hydrogenotrophic Methyl-Reducing Methanogenic Archaea of the Order Methanomassiliicoccales Isolated from the Human Gut and Proposal of the Novel Family Methanomethylophilaceae fam. nov.
- auteur
- Guillaume Borrel, Khaled Fadhlaoui, Wajdi Ben Hania, Nadia Gaci, Gérard Péhau‐arnaudet, Prem Prashant Chaudhary, Pascal Vandekerckove, Nathalie Ballet, Monique Alric, Paul William O’toole, Marie-Laure Fardeau, Bernard Ollivier, Jean-François Brugère
- article
- Microorganisms, 2023, 11 (11), pp.2794. ⟨10.3390/microorganisms11112794⟩
- identifiant
- hal-04306127
- DOI
- DOI : 10.3390/microorganisms11112794
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Karenia selliformis bloom dynamics and growth rate estimation in the Sfax harbour (Tunisia), by using automated flow cytometry equipped with image in flow, during autumn 2019
- auteur
- Ismail Boudriga, Moufida Abdennadher, Yosra Khammeri, Mabrouka Mahfoudi, Marianne Quéméneur, Asma Hamza, Nader Bel Haj Hmida, Amel Bellaaj Zouari, Malika Bel Hassen
- article
- Harmful Algae, 2023, 121, pp.102366. ⟨10.1016/j.hal.2022.102366⟩
- identifiant
- hal-04114138
- DOI
- DOI : 10.1016/j.hal.2022.102366
- Accès au bibtex
-
- titre
- Bacterial diversity of an acid mine drainage beside the Xichú River (Mexico) accessed by culture-dependent and culture-independent approaches
- auteur
- Elcia Margareth Souza Brito, Remy Guyoneaud, César Augusto Caretta, Manon Joseph, Marisol Goñi-Urriza, Bernard Ollivier, Agnès Hirschler-Réa
- article
- Extremophiles, 2023, 27 (1), pp.5. ⟨10.1007/s00792-023-01291-6⟩
- identifiant
- hal-04015830
- DOI
- DOI : 10.1007/s00792-023-01291-6
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Singlet oxygen‐induced alteration of bacteria associated with phytodetritus: Effect of irradiance
- auteur
- Christopher Burot, Patricia Bonin, Gwénola Simon, Laurie Casalot, Jean‐françois Rontani
- article
- Journal of Phycology, 2023, 59 (5), pp.980-988. ⟨10.1111/jpy.13376⟩
- identifiant
- hal-04286500
- DOI
- DOI : 10.1111/jpy.13376
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Assessing the diversity of plankton-associated prokaryotes along a size-fraction gradient: A methodological evaluation
- auteur
- Léa Cabrol, Mélanie Delleuze, Arthur Szylit, Guillaume Schwob, Marianne Quemeneur, Benjamin Misson
- article
- Marine Pollution Bulletin, 2023, 197, pp.115688. ⟨10.1016/j.marpolbul.2023.115688⟩
- identifiant
- hal-04383437
- DOI
- DOI : 10.1016/j.marpolbul.2023.115688
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Redox gradient shapes the abundance and diversity of mercury-methylating microorganisms along the water column of the Black Sea
- auteur
- Léa Cabrol, Eric Capo, Daan M van Vliet, F a Bastiaan von Meijenfeldt, Stefan Bertilsson, Laura Villanueva, Irene Sánchez-Andrea, Erik Björn, Andrea G. Bravo, Lars-Eric Heimburger Boavida
- article
- mSystems, 2023, 8 (4), ⟨10.1128/msystems.00537-23⟩
- identifiant
- hal-04278382
- DOI
- DOI : 10.1128/msystems.00537-23
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Acetoclastic archaea adaptation under increasing temperature in lake sediments and wetland soils from Alaska
- auteur
- B M Dellagnezze, P Bovio-Winkler, C Lavergne, D A Menoni, F Mosquillo, Léa Cabrol, Maialen Barret, C Etchebehere
- article
- Polar Biology, 2023, 46, pp.259 - 275. ⟨10.1007/s00300-023-03120-0⟩
- identifiant
- hal-04453937
- DOI
- DOI : 10.1007/s00300-023-03120-0
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- An Effect-Based Method to Evaluate Spatio-Temporal Variations of Coastal Marine DOM Properties
- auteur
- Clara Dignan, Véronique Lenoble, Olivier Pringault, Benjamin Misson
- article
- Journal of Marine Science and Engineering, 2023, 11 (10), pp.1841. ⟨10.3390/jmse11101841⟩
- identifiant
- hal-04254404
- DOI
- DOI : 10.3390/jmse11101841
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Planktonic shift with dissolved organic matter properties: a functional perspective for sentinel lakes
- auteur
- Flavia Dory, Laurent Cavalli, Evelyne Franquet, Stéphane Mounier, Patrick Höhener, Benjamin Misson, Mathieu Martin, Quentin Arnault, Thierry Tatoni, Céline Bertrand
- article
- Journal of Ecology, 2023, 111 (1), pp.45-61. ⟨10.1111/1365-2745.14013⟩
- identifiant
- hal-03816119
- DOI
- DOI : 10.1111/1365-2745.14013
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Adaptation Strategies to High Hydrostatic Pressures in Pseudothermotoga species Revealed by Transcriptional Analyses
- auteur
- Romain Fenouil, Nathalie Pradel, Hassiba Belahbib, Marie Roumagnac, Manon Bartoli, Wajdi Ben Hania, Yann Denis, Marc Garel, C. Tamburini, Bernard Ollivier, Zarath Summers, Fabrice Armougom, Alain Dolla
- article
- Microorganisms, 2023, 11 (3), pp.773. ⟨10.3390/microorganisms11030773⟩
- identifiant
- hal-04037893
- DOI
- DOI : 10.3390/microorganisms11030773
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Thermospira aquatica gen. nov., sp. nov., a novel thermophilic spirochete isolated from a Tunisian hot spring, and description of the novel family Thermospiraceae
- auteur
- Zouhaier Ben Ali Gam, Abdoulaye Thioye, Jean-Luc Cayol, Anne Postec, Manon Bartoli-Joseph, Céline Vandecasteele, Gaël Erauso, Marc Labat
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2023, 73 (1), ⟨10.1099/ijsem.0.005690⟩
- identifiant
- hal-04417428
- DOI
- DOI : 10.1099/ijsem.0.005690
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Prokaryotic Diversity and Dynamics during Dinoflagellate Bloom Decays in Coastal Tunisian Waters
- auteur
- Rim Lajnef, Marianne Quéméneur, Moufida Abdennadher, Lamia Dammak Walha, Asma Hamza, Malika Belhassen, Amel Bellaaj Zouari
- article
- Diversity, 2023, 15 (2), pp.273. ⟨10.3390/d15020273⟩
- identifiant
- hal-04114131
- DOI
- DOI : 10.3390/d15020273
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Assessing the bioavailability of black carbon-derived dissolved organic matter for marine heterotrophic prokaryotes
- auteur
- Pauline Martinot, Catherine Guigue, Sandrine Chifflet, Philippe Cuny, Aude Barani, Morgane Didry, Clara Dignan, Léa Guyomarc'h, Nathalie Pradel, Olivier Pringault, France van Wambeke, Cam Tu Vu, Xavier Mari, Marc Tedetti
- article
- Science of the Total Environment, 2023, 901, pp.165802. ⟨10.1016/j.scitotenv.2023.165802⟩
- identifiant
- hal-04248922
- DOI
- DOI : 10.1016/j.scitotenv.2023.165802
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Effects of experimental sediment resuspension on protozooplankton grazing activity: implication for the planktonic food web structure
- auteur
- Kaouther Mejri Kousri, Marouan Meddeb, Boutheina Grami, Sondes Melliti Ben Garali, Oumayma Chkili, Inès Sahraoui, Catherine Gonzalez, Chrystelle Montigny, Olivier Pringault, Asma Sakka Hlaili
- article
- Aquatic Ecology, 2023, 57, pp.165-186. ⟨10.1007/s10452-022-09998-y⟩
- identifiant
- hal-03953579
- DOI
- DOI : 10.1007/s10452-022-09998-y
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Long-term organic carbon preservation enhanced by iron and manganese
- auteur
- Oliver Moore, Lisa Curti, Clare Woulds, James Bradley, Peyman Babakhani, Benjamin Mills, William Homoky, Ke-Qing Xiao, Andrew Bray, Ben Fisher, Majid Kazemian, Burkhard Kaulich, Andrew Dale, Caroline Peacock
- article
- Nature, 2023, 621 (7978), pp.312-317. ⟨10.1038/s41586-023-06325-9⟩
- identifiant
- hal-04450498
- DOI
- DOI : 10.1038/s41586-023-06325-9
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Prokaryotic Responses to Estuarine Coalescence Contribute to Planktonic Community Assembly in a Mediterranean Nutrient-Rich Estuary
- auteur
- Elisabeth Navarro, Chiara Santinelli, Simona Retelletti Brogi, Gaël Durrieu, Olivier Radakovitch, Cédric Garnier, Benjamin Misson
- article
- Journal of Marine Science and Engineering, 2023, 11 (5), pp.933. ⟨10.3390/jmse11050933⟩
- identifiant
- hal-04254398
- DOI
- DOI : 10.3390/jmse11050933
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Lithological controls on lake water biogeochemistry in Maritime Antarctica
- auteur
- Nazlı Olgun, Ufuk Tarı, Nurgül Balcı, Şafak Altunkaynak, Işıl Gürarslan, Sevil Deniz Yakan, Frederic Thalasso, María Soledad Astorga-España, Léa Cabrol, Céline Lavergne, Linn Hoffmann
- article
- Science of the Total Environment, 2023, 912, ⟨10.1016/j.scitotenv.2023.168562⟩
- identifiant
- hal-04453934
- DOI
- DOI : 10.1016/j.scitotenv.2023.168562
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Spark of life : role of electrotrophy in the emergence of life
- auteur
- Guillaume Pillot, Óscar Santiago, Sven Kerzenmacher, Pierre-Pol Liebgott
- article
- Life, 2023, 13 (2), pp.356. ⟨10.3390/life13020356⟩
- identifiant
- hal-04978640
- DOI
- DOI : 10.3390/life13020356
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Metabolic challenges and key players in serpentinite-hosted microbial ecosystems
- auteur
- Rabja Maria Popall, Anne Postec, Aurélien Lecoeuvre, Marianne Quéméneur, Gaël Erauso
- article
- Frontiers in Microbiology, 2023, 14, ⟨10.3389/fmicb.2023.1197823⟩
- identifiant
- hal-04172274
- DOI
- DOI : 10.3389/fmicb.2023.1197823
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Marinitoga aeolica sp. nov., a novel thermophilic anaerobic heterotroph isolated from a shallow hydrothermal field of Panarea Island in the Aeolian archipelago, Italy
- auteur
- Anne Postec, Grégoire Galès, Anne-Hélène Prime, Manon Bartoli, Roy E Price, Céline Vandecasteele, Gaël Erauso
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2023, 73 (11), pp.006186. ⟨10.1099/ijsem.0.006186⟩
- identifiant
- hal-04338849
- DOI
- DOI : 10.1099/ijsem.0.006186
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Aminithiophilus ramosus gen. nov., sp. nov., a sulphur-reducing bacterium isolated from a pyrite-forming enrichment culture, and taxonomic revision of the family Synergistaceae
- auteur
- Nathalie Pradel, Marie-Laure Fardeau, Boyke Bunk, Cathrin Spröer, Christian Boedeker, Jacqueline Wolf, Meina Neumann-Schaal, Michael Pester, Stefan Spring
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2023, 73 (2), ⟨10.1099/ijsem.0.005691⟩
- identifiant
- hal-04455059
- DOI
- DOI : 10.1099/ijsem.0.005691
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Microbial taxa related to natural hydrogen and methane emissions in serpentinite-hosted hyperalkaline springs of New Caledonia
- auteur
- Marianne Quéméneur, Nan Mei, Christophe Monnin, Anne Postec, Sophie Guasco, Julie Jeanpert, Pierre Maurizot, Bernard Pelletier, Gaël Erauso
- article
- Frontiers in Microbiology, 2023, 14, ⟨10.3389/fmicb.2023.1196516⟩
- identifiant
- hal-04153312
- DOI
- DOI : 10.3389/fmicb.2023.1196516
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Cellular Damage of Bacteria Attached to Senescent Phytoplankton Cells as a Result of the Transfer of Photochemically Produced Singlet Oxygen: A Review
- auteur
- Jean-François Rontani, Patricia Bonin
- article
- Microorganisms, 2023, 11 (6), pp.1565. ⟨10.3390/microorganisms11061565⟩
- identifiant
- hal-04286728
- DOI
- DOI : 10.3390/microorganisms11061565
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Biogeography of microbial communities in high‐latitude ecosystems: Contrasting drivers for methanogens, methanotrophs and global prokaryotes
- auteur
- Christophe V W Seppey, Léa Cabrol, Frederic Thalasso, Laure Gandois, Céline Lavergne, Karla Martinez‐cruz, Armando Sepulveda‐jauregui, Polette Aguilar‐muñoz, María Soledad Astorga‐españa, Rolando Chamy, Bruna Martins Dellagnezze, Claudia Etchebehere, Gilberto J Fochesatto, Oscar Gerardo‐nieto, Andrés Mansilla, Alison Murray, Maxime Sweetlove, Nikita Tananaev, Roman Teisserenc, Alexander T Tveit, Anton van de Putte, Mette M Svenning, Maialen Barret
- article
- Environmental Microbiology, 2023, 25, pp.3364 - 3386. ⟨10.1111/1462-2920.16526⟩
- identifiant
- hal-04453945
- DOI
- DOI : 10.1111/1462-2920.16526
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Contamination of planktonic food webs in the Mediterranean Sea: Setting the frame for the MERITE-HIPPOCAMPE oceanographic cruise (spring 2019)
- auteur
- Marc Tedetti, Jacek Tronczynski, François Carlotti, Marc Pagano, Sana Ben Ismail, Cherif Sammari, Malika Bel Hassen, Karine Desboeufs, Charlotte Poindron, Amel Bellaaj Zouari, Moufida Abdennadher, Sirine Amri, Daniela Bănaru, Lotfi Ben Abdallah, Nagib Bhairy, Ismail Boudriga, Aude Bourin, Christophe Brach-Papa, Nicolas Briant, Léa Cabrol, Cristele Chevalier, Sandrine Chifflet, Lassaad Chouba, Sylvain Coudray, Mohamed Nejib Daly Yahia, Thibault de Garidel-Thoron, Aurélie Dufour, Jean-Claude Dutay, Boris Espinasse, Pamela Fierro-González, Michel Fornier, Nicole Garcia, Stéphanie Jacquet, Catherine Guigue, Franck Giner, Loic Guilloux, Asma Hamza, Lars-Eric Heimbürger-Boavida, Joel Knoery, Rim Lajnef, Nouha Makhlouf Belkahia, Deny Malengros, Pauline Martinot, Anthony Bosse, Jean-Charles Mazur, Marouan Meddeb, Benjamin Misson, Olivier Pringault, Marianne Quemeneur, Olivier Radakovitch, Patrick Raimbault, Christophe Ravel, Javier Angel Tesán-Onrubia, Vincent Rossi, Bastien Thomas, Chaimaa Rwawi, Asma Sakka Hlaili, Melilotus Thyssen, Noureddine Zaaboub
- article
- Marine Pollution Bulletin, 2023, 189, pp.114765. ⟨10.1016/j.marpolbul.2023.114765⟩
- identifiant
- hal-04033259
- DOI
- DOI : 10.1016/j.marpolbul.2023.114765
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Reports
-

- titre
- Prospective océan-atmosphère 2023-2028
- auteur
- Jean-Francois Doussin, Thibault de Garidel-Thoron, Anne Brès, Nicolas Arnaud, P. Lherminier, S. Bony, Sébastien Payan, Cyrille Flamant, Xavier Capet, P. Chazette, Claire Delon, Fleur Couvreux, G. Durand, Evelyn Freney, Kathy S. Law, R. Morrow, E. Sanchez-Gomez, J. Riédi, N. Savoye Riédi, Fabrizio d'Ortenzio, Fabienne Lohou, Paola Formenti, G. Forêt, G. Uzu, Jean-François Léon, Samuel Morin, Philippe Bousquet, M. Cirtog, Virginie Marécal, J. Savarino, Gaelle Dufour, Thibaut Wagener, Stephane Sauvage, Eric Villenave, Joel Savarino, Christian Tamburini, Urania Christaki
- article
- Institut National des Sciences de l'Univers. 2023, 135p
- identifiant
- hal-04334125
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Preprints, Working Papers, ...
-

- titre
- “Quasigenus” amongPhycodnaviridae: A diversity of chlorophyte-infecting viruses in response to a dense algal culture in a high-rate algal pond
- auteur
- Emily E Chase, Thomas M Pitot, Sonia Monteil-Bouchard, Christelle Desnues, Guillaume Blanc
- article
- 2023
- identifiant
- hal-04281548
- DOI
- DOI : 10.1101/2022.12.26.521929
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Equatorial to Polar genomic variability of the microalgae Bathycoccus prasinos
- auteur
- Jade Leconte, Youri Timsit, Tom O Delmont, Magali Lescot, Gwenael Piganeau, Patrick Wincker, Olivier Jaillon
- article
- 2023
- identifiant
- hal-04308022
- DOI
- DOI : 10.1101/2021.07.13.452163
- Accès au bibtex
-
- titre
- kmindex and ORA: indexing and real-time user-friendly queries in terabyte-sized complex genomic datasets
- auteur
- Téo Lemane, Nolan Lezzoche, Julien Lecubin, Eric Pelletier, Magali Lescot, Rayan Chikhi, Pierre Peterlongo
- article
- 2023
- identifiant
- cea-04321497
- DOI
- DOI : 10.1101/2023.05.31.543043
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Singlet oxygen-induced alteration of bacteria associated with phytodetritus: effect of bacterial pigments
- auteur
- Gwénola Simon, Laurie Casalot, Corinne Valette, Christopher Burot, Jean-François Rontani, Patricia Bonin
- article
- 2023
- identifiant
- hal-04286634
- DOI
- DOI : 10.21203/rs.3.rs-3294986/v1
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2022
Journal articles
-

- titre
- The biotechnological potential of microbial communities from Antarctic soils and sediments: Application to low temperature biogenic methane production
- auteur
- P. Aguilar-Muñoz, C. Lavergne, R. Chamy, Léa Cabrol
- article
- Journal of Biotechnology, 2022, 351, pp.38-49. ⟨10.1016/j.jbiotec.2022.04.014⟩
- identifiant
- hal-03994455
- DOI
- DOI : 10.1016/j.jbiotec.2022.04.014
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Genome sequence and Carbohydrate Active Enzymes (CAZymes) repertoire of the thermophilic Caldicoprobacter algeriensis TH7C1T
- auteur
- Rihab Ameri, José Luis García, Amel Bouanane Derenfed, Nathalie Pradel, Sawssan Neifar, Sonia Mhiri, Monia Mezghanni, Nadia Zaraî Jaouadi, Jorge Barriuso, Samir Bejar
- article
- Microbial Cell Factories, 2022, 21 (1), pp.91. ⟨10.1186/s12934-022-01818-0⟩
- identifiant
- hal-03675034
- DOI
- DOI : 10.1186/s12934-022-01818-0
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Could Sterile Aedes albopictus Male Releases Interfere with Aedes aegypti Population in Reunion Island?
- auteur
- Harilanto Felana Andrianjakarivony, David Damiens, Lucie Marquereau, Benjamin Gaudillat, Nausicaa Habchi-Hanriot, Louis-Clément Gouagna
- article
- Insects, 2022, 13 (2), pp.146. ⟨10.3390/insects13020146⟩
- identifiant
- hal-03684652
- DOI
- DOI : 10.3390/insects13020146
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Biodiversity, climate change, and adaptation in the Mediterranean
- auteur
- Didier Aurelle, Séverine Thomas, Cécile H. Albert, Marc Bally, Alberte Bondeau, Charles-François Boudouresque, Abigail E. Cahill, François Carlotti, Anne Chenuil, Wolfgang Cramer, Hendrik Davi, Aurélien De Jode, Alexander Ereskovsky, Anne Marie Farnet da Silva, Catherine Fernandez, Thierry Gauquelin, Pascal Mirleau, Anne-Christine Monnet, Bernard Prévosto, Vincent Rossi, Stéphane Sartoretto, France van Wambeke, Bruno Fady
- article
- Ecosphere, 2022, 13 (4), pp.2-23. ⟨10.1002/ecs2.3915⟩
- identifiant
- hal-03670020
- DOI
- DOI : 10.1002/ecs2.3915
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- A combined microbial and biogeochemical dataset from high-latitude ecosystems with respect to methane cycle
- auteur
- Maialen Barret, Laure Gandois, Frederic Thalasso, Karla Martinez Cruz, Armando Sepulveda Jauregui, Céline Lavergne, Roman Teisserenc, Polette Aguilar, Oscar Gerardo Nieto, Claudia Etchebehere, Bruna Martins Dellagnezze, Patricia Bovio Winkler, Gilberto Fochesatto, Nikita Tananaev, Mette Svenning, Christophe Seppey, Alexander Tveit, Rolando Chamy, María Soledad Astorga España, Andrés Mansilla, Anton van de Putte, Maxime Sweetlove, Alison Murray, Léa Cabrol
- article
- Scientific Data , 2022, 9 (1), pp.674. ⟨10.1038/s41597-022-01759-8⟩
- identifiant
- hal-03993305
- DOI
- DOI : 10.1038/s41597-022-01759-8
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Transfer efficiency of organic carbon in marine sediments
- auteur
- James Bradley, Dominik Hülse, Douglas Larowe, Sandra Arndt
- article
- Nature Communications, 2022, 13 (1), pp.7297. ⟨10.1038/s41467-022-35112-9⟩
- identifiant
- hal-04450502
- DOI
- DOI : 10.1038/s41467-022-35112-9
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Surface Characteristics Together With Environmental Conditions Shape Marine Biofilm Dynamics in Coastal NW Mediterranean Locations
- auteur
- Jean-François Briand, Thomas Pollet, Benjamin Misson, Cédric Garnier, Marlene Lejars, Marine Maintenay, Raphaëlle Barry-Martinet, Aurélie Portas, Jean-François Ghiglione, Christine Bressy
- article
- Frontiers in Marine Science, 2022, 8, ⟨10.3389/fmars.2021.746383⟩
- identifiant
- hal-03608643
- DOI
- DOI : 10.3389/fmars.2021.746383
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Effective degradation of organophosphate ester flame retardants and plasticizers in coastal sediments under high urban pressure
- auteur
- Javier Castro-Jimenez, Philippe Cuny, Cécile Militon, Lea Sylvi, F Royer, L Papillon, Richard Sempere
- article
- Scientific Reports, 2022, ⟨10.1038/s41598-022-24685-6⟩
- identifiant
- hal-03869637
- DOI
- DOI : 10.1038/s41598-022-24685-6
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Integrated viral elements suggest the dual lifestyle of Tetraselmis spp. Polinton-like viruses
- auteur
- Emily Chase, Christelle Desnues, Guillaume Blanc
- article
- Virus Evolution, 2022, 8 (2), ⟨10.1093/ve/veac068⟩
- identifiant
- hal-03799220
- DOI
- DOI : 10.1093/ve/veac068
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Isotopic compositions of copper and zinc in plankton from the Mediterranean Sea (MERITE-HIPPOCAMPE campaign): Tracing trophic transfer and geogenic inputs
- auteur
- Sandrine Chifflet, Nicolas Briant, Rémi Freydier, Daniel Araùjo, Marianne Quéméneur, Hana Zouch, Amel Bellaaj-Zouari, François Carlotti, Marc Tedetti
- article
- Marine Pollution Bulletin, 2022, 185 (Part A), pp.114315. ⟨10.1016/j.marpolbul.2022.114315⟩
- identifiant
- hal-03865956
- DOI
- DOI : 10.1016/j.marpolbul.2022.114315
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Summer dynamics drive the microbial response to carbon and nutrient additions in a high‐altitude lake
- auteur
- Flavia Dory, Laurent Cavalli, Evelyne Franquet, Magalie Claeys-Bruno, Benjamin Misson, Thierry Tatoni, Céline Bertrand
- article
- Limnology and Oceanography, 2022, 67 (5), pp.1142-1156. ⟨10.1002/lno.12062⟩
- identifiant
- hal-03818173
- DOI
- DOI : 10.1002/lno.12062
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Seasonal composition and activity of the intertidal macrobenthic community of Caleta Valdés (Patagonia, Argentina) applying in situ and ex situ experimental protocols
- auteur
- Agustina Ferrando, Julieta Sturla Lompré, Emilia Gonzalez, Marcos Franco, Marta Commendatore, Marina Nievas, Cécile Militon, Georges Stora, José Luis Esteves, Philippe Cuny, Franck Gilbert
- article
- Regional Studies in Marine Science, 2022, 53, pp.102444. ⟨10.1016/j.rsma.2022.102444⟩
- identifiant
- hal-03700824
- DOI
- DOI : 10.1016/j.rsma.2022.102444
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Mangrove microbiota along the urban-to-rural gradient of the Cayenne estuary (French Guiana, South America): Drivers and potential bioindicators
- auteur
- Maud Fiard, Philippe Cuny, Léa Sylvi, Cédric Hubas, Ronan Jézéquel, Dominique Lamy, Romain Walcker, Amonda El Houssainy, Lars-Eric Heimbürger-Boavida, Tony Robinet, Isabelle Bihannic, Franck Gilbert, Emma Michaud, Guillaume Dirberg, Cécile Militon
- article
- Science of the Total Environment, 2022, 807, pp.150667. ⟨10.1016/j.scitotenv.2021.150667⟩
- identifiant
- hal-03576061
- DOI
- DOI : 10.1016/j.scitotenv.2021.150667
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Complete Genome Sequence of Tepidibacter sp. Strain 8C15b, Isolated from Bank Sediments of Haiphong Bay, Vietnam
- auteur
- Stéphanie Fouteau, Vuong Bui Van, Zoé Rouy, Mélanie Beraud, Corinne Cruaud, Jean-Luc Cayol, Sandrine Chifflet, Thuoc Chu Van, Thu Pham The, David Vallenet, Pedro Oliveira, Xavier Mari, Nathalie Pradel
- article
- Microbiology Resource Announcements, 2022, 11 (7), ⟨10.1128/mra.00132-22⟩
- identifiant
- hal-03778996
- DOI
- DOI : 10.1128/mra.00132-22
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Comparative Metagenomics Highlight a Widespread Pathway Involved in Catabolism of Phosphonates in Marine and Terrestrial Serpentinizing Ecosystems
- auteur
- Eléonore Frouin, Aurélien Lecoeuvre, Fabrice Armougom, Matthew Schrenk, Gaël Erauso
- article
- mSystems, 2022, 7 (4), ⟨10.1128/msystems.00328-22⟩
- identifiant
- hal-03993290
- DOI
- DOI : 10.1128/msystems.00328-22
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- A RUpture‐Based detection method for the Active mesopeLagIc Zone (RUBALIZ): A crucial step toward rigorous carbon budget assessments
- auteur
- Robin Fuchs, Chloé M J Baumas, Marc Garel, David Nerini, Frédéric a C Le Moigne, Christian Tamburini
- article
- Limnology and Oceanography: Methods, 2022, ⟨10.1002/lom3.10520⟩
- identifiant
- hal-03833918
- DOI
- DOI : 10.1002/lom3.10520
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Tracking spoilage bacteria in the tuna microbiome
- auteur
- Elsa Gadoin, Christelle Desnues, Thierry Bouvier, Emmanuelle Roque d'Orbcastel, Jean-Christophe Auguet, Sandrine Crochemore, Antoinette Adingra, Yvan Bettarel
- article
- FEMS Microbiology Ecology, 2022, 98 (10), pp.fiac110. ⟨10.1093/femsec/fiac110⟩
- identifiant
- hal-03860695
- DOI
- DOI : 10.1093/femsec/fiac110
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Diversity of Giant Viruses Infecting Vermamoeba vermiformis
- auteur
- Khalil Geballa-Koukoulas, Bernard La Scola, Guillaume Blanc, Julien Andreani
- article
- Frontiers in Microbiology, 2022, 13, ⟨10.3389/fmicb.2022.808499⟩
- identifiant
- hal-03665826
- DOI
- DOI : 10.3389/fmicb.2022.808499
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Temporal trends of two iconic Mediterranean gorgonians (Paramuricea clavata and Eunicella cavolini) in the climate change context
- auteur
- L. Iborra, M. Leduc, L. Fullgrabe, P. Cuny, S. Gobert
- article
- Journal of Sea Research (JSR), 2022, 186, pp.102241. ⟨10.1016/j.seares.2022.102241⟩
- identifiant
- hal-03706571
- DOI
- DOI : 10.1016/j.seares.2022.102241
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Metal stresses modify soluble proteomes and toxin profiles in two Mediterranean strains of the distributed dinoflagellate Alexandrium pacificum
- auteur
- Natacha Jean, Luce Perié, Estelle Dumont, Lucie Bertheau, Thierry Balliau, Amandine M. N. Caruana, Zouher Amzil, Mohamed Laabir, Estelle Masseret
- article
- Science of the Total Environment, 2022, 818, pp.151680. ⟨10.1016/j.scitotenv.2021.151680⟩
- identifiant
- hal-03708537
- DOI
- DOI : 10.1016/j.scitotenv.2021.151680
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Cd transfers during marine sediment resuspension over short and long-term period: Associated risk for coastal water quality
- auteur
- Nicolas Layglon, Véronique Lenoble, Longo Louis, Sébastien d'Onofrio, Stéphane Mounier, Jean-Ulrich Mullot, Davide Sartori, Dario Omanović, Cédric Garnier, Benjamin Misson
- article
- Marine Pollution Bulletin, 2022, 180, pp.113771. ⟨10.1016/j.marpolbul.2022.113771⟩
- identifiant
- hal-03678347
- DOI
- DOI : 10.1016/j.marpolbul.2022.113771
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Methanobacterium alkalithermotolerans sp. nov., a novel alkaliphilic and hydrogen-utilizing methanogen isolated from an alkaline geothermal spring (La Crouen, New Caledonia)
- auteur
- Nan Mei, Anne Postec, Manon Bartoli, Céline Vandecasteele, Laura Wils, Lisa Gil, Christophe Monnin, Bernard Pelletier, Gael Erauso, Marianne Quéméneur
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2022, 72 (10), ⟨10.1099/ijsem.0.005554⟩
- identifiant
- hal-04114150
- DOI
- DOI : 10.1099/ijsem.0.005554
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Living on an ever-changing coast: French Guiana populations facing coastal mobility
- auteur
- Marianne Palisse, Gérard Collomb, Dennis Lamaison, Valérie Morel, Philippe Cuny, Morgane Jolivet, Jean-Jacques Marquisar, Bettie Laplanche, Antoine Gardel
- article
- GeoJournal, 2022, ⟨10.1007/s10708-022-10694-5⟩
- identifiant
- hal-03861784
- DOI
- DOI : 10.1007/s10708-022-10694-5
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Dry-Wet Cycles Affect Nitrous Oxide Emissions Across Aquatic-Terrestrial Interfaces: A Mesocosms Study
- auteur
- Renata Pinto, Gabriele Weigelhofer, Matthias Pucher, Rebecca Clare Hood-Nowotny, Patricia Bonin, António Guerreiro Brito, Thomas Hein
- article
- Frontiers in Soil Science, 2022, 2, ⟨10.3389/fsoil.2022.849210⟩
- identifiant
- hal-03844523
- DOI
- DOI : 10.3389/fsoil.2022.849210
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Screening for Hyperthermophilic Electrotrophs for the Microbial Electrosynthesis of Organic Compounds
- auteur
- Rabja Maria Popall, Alenica Heussner, Sven Kerzenmacher, Pierre-Pol Liebgott, Guillaume Pillot
- article
- Microorganisms, 2022, 10 (11), pp.2249. ⟨10.3390/microorganisms10112249⟩
- identifiant
- hal-03993315
- DOI
- DOI : 10.3390/microorganisms10112249
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Genomic evidence for global ocean plankton biogeography shaped by large-scale current systems
- auteur
- Daniel Richter, Romain Watteaux, Thomas Vannier, Jade Leconte, Paul Frémont, Gabriel Reygondeau, Nicolas Maillet, Nicolas Henry, Gaëtan Benoit, Antonio Fernandez-Guerra, Samir Suweis, Romain Narci, Cédric Berney, Damien Eveillard, Frédérick Gavory, Lionel Guidi, Karine Labadie, Eric Mahieu, Julie Poulain, Sarah Romac, Simon Roux, Céline Dimier, Stefanie Kandels, Marc Picheral, Sarah Searson, Stéphane Pesant, Jean-Marc Aury, Jennifer Brum, Claire Lemaitre, Eric Pelletier, Peer Bork, Shinichi Sunagawa, Lee Karp-Boss, Chris Bowler, Matthew Sullivan, Eric Karsenti, Mahendra Mariadassou, Ian Probert, Pierre Peterlongo, Patrick Wincker, Colomban de Vargas, Maurizio Ribera d'Alcalà, Daniele Iudicone, Olivier Jaillon, Tom O. Delmont
- article
- eLife, 2022, 11, pp.e78129. ⟨10.7554/eLife.78129⟩
- identifiant
- hal-02399723
- DOI
- DOI : 10.7554/eLife.78129
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Monoculture and co-culture tests of the toxicity of four typical herbicides on growth, photosynthesis and oxidative stress responses of the marine diatoms Pseudo-nitzschia mannii and Chaetoceros decipiens
- auteur
- Inès Sahraoui, Sondes Melliti Ben Garali, Zoubaida Chakroun, Catherine Gonzalez, Asma Sakka Hlaili, Olivier Pringault
- article
- Ecotoxicology, 2022, 31, pp.700-716. ⟨10.1007/s10646-022-02535-5⟩
- identifiant
- hal-03619663
- DOI
- DOI : 10.1007/s10646-022-02535-5
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Methane and carbon dioxide cycles in lakes of the King George Island, maritime Antarctica
- auteur
- Frederic Thalasso, Armando Sepulveda-Jauregui, Léa Cabrol, Céline Lavergne, Nazlı Olgun, Karla Martinez-Cruz, Polette Aguilar-Muñoz, Natalia Calle, Andrés Mansilla, María Soledad Astorga-España
- article
- Science of the Total Environment, 2022, 848, ⟨10.1016/j.scitotenv.2022.157485⟩
- identifiant
- hal-04453947
- DOI
- DOI : 10.1016/j.scitotenv.2022.157485
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- The role of coupled DNRA-Anammox during nitrate removal in a highly saline lake
- auteur
- N. Valiente, F. Jirsa, T. Hein, W. Wanek, J. Prommer, P. Bonin, J.J. Gómez-Alday
- article
- Science of the Total Environment, 2022, 806, pp.150726. ⟨10.1016/j.scitotenv.2021.150726⟩
- identifiant
- hal-03427431
- DOI
- DOI : 10.1016/j.scitotenv.2021.150726
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- The Ocean Gene Atlas v2.0: online exploration of the biogeography and phylogeny of plankton genes
- auteur
- Caroline Vernette, Julien Lecubin, Pablo Sánchez, (team) Tara Oceans Coordinators, Shinichi Sunagawa, Tom O. Delmont, Silvia G Acinas, Eric Pelletier, Pascal Hingamp, Magali Lescot
- article
- Nucleic Acids Research, 2022, 11, ⟨10.1093/nar/gkac420⟩
- identifiant
- hal-03696136
- DOI
- DOI : 10.1093/nar/gkac420
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Conference papers
- titre
- Holobiont diversity in heterogeneous and anthropized marine environments
- auteur
- D. Aurelle, Christelle Desnues, Stephane Sartoretto, Emma Rozis, Sonia Bouchard, Dorian Guillemain, Laurine Moirand, Sandrine Chenesseau, Pierre Pontarotti, Alessandra Accornero, Jean-Christophe Poggiale, Lamya Chaoui, M. Hichem Kara, Nur Eda Topçu, Sarah Samadi, Marc Bally
- article
- Ecology and Evolution: New perspectives and societal challenges, SFE² GfÖ EEF Joint meeting, International Conference on Ecological Sciences, Nov 2022, Metz, France
- identifiant
- hal-03947518
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Status of water quality and impact of dredging activities in four ports of the gulf of Aigues Mortes (France)
- auteur
- Cyrine Chouba, Sophie Delpoux, Léa Causse, Mylène Marie, Rémi Freydier, Mylène Toubiana, Patrick Monfort, Olivier Pringault, Chrystelle Montigny
- article
- 9th International Symposium "Monitoring of Mediterranean coastal areas: problems and measurement techniques", Institute of BioEconomy (IBE) of the National Council Research (CNR); Italian Society of Silviculture and Forest Ecology (SISEF), Jun 2022, Livourne, Italy. pp.416-425, ⟨10.36253/979-12-215-0030-1.37⟩
- identifiant
- hal-04039957
- DOI
- DOI : 10.36253/979-12-215-0030-1.37
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Rising algal- and soil-derived dissolved organic matter modifies interactions between bacteria and phytoplankton in a high-altitude lake
- auteur
- Flavia Dory, Laurent Cavalli, Evelyne Franquet, France van Wambeke, Benjamin Misson, Stéphane Mounier, Martino Christian, Benjamin Oursel, Thierry Tatoni, Céline Bertrand
- article
- SIL2022: International Society of Limnology, International Society of Limnology, Aug 2022, Berlin, Germany
- identifiant
- hal-04555685
- Accès au bibtex
-
- titre
- Planktonic communities shift with dissolved organic matter properties: a functional perspective for sentinel lakes
- auteur
- Flavia Dory, Laurent Cavalli, Evelyne Franquet, Benjamin Misson, Patrick Höhener, Stéphane Mounier, Céline Bertrand
- article
- JASM 2022, May 2022, Grand Rapids, United States
- identifiant
- hal-04555731
- Accès au bibtex
-
Books
-

- titre
- Antarcticness: Inspirations and imaginaries
- auteur
- Ilan Kelman, James A Bradley
- article
- Ilan Kelman. UCL Press, pp.338, 2022, 978-1-80008-146-8. ⟨10.14324/111.9781800081444⟩
- identifiant
- hal-04450540
- DOI
- DOI : 10.14324/111.9781800081444
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Poster communications
-

- titre
- Screening of physico-chemical properties of complex organic substrates to produce biohydrogen by extremophile microorganisms (dark fermentation)
- auteur
- Halima Chebbi, Dhifalli Khouloud, Yahyaoui Rawnak, Jouini Faten, César Arturo Aceves-Lara, Fillaudeau Luc, Pierre-Pol Liebgott, Fersi Cheima, Jaouani Atef, Hana Gannoun, Lamia Ben Gaïda
- article
- The 20th International Days of Biotechnology - IDB 2022, Dec 2022, Hammamet, Tunisia
- identifiant
- hal-04987769
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Phytoplankton assemblage shifts with dissolved organic matter properties: a functional perspective for sentinel lakes
- auteur
- Flavia Dory, Laurent Cavalli, Evelyne Franquet, Stéphane Mounier, Patrick Höhener, Benjamin Misson, Mathieu Martin, Quentin Arnault, Thierry Tatoni, Céline Bertrand
- article
- 5ème JILO, Oct 2022, corte, France
- identifiant
- hal-04555636
- Accès au bibtex
-
Preprints, Working Papers, ...
- titre
- A ready-to-use logistic Verhulst model implemented in R shiny to estimate growth parameters of microorganisms
- auteur
- Marc Garel, Lloyd Izard, Marthe Vienne, David Nerini, Christian Tamburini, Séverine Martini
- article
- 2022
- identifiant
- hal-03864412
- DOI
- DOI : 10.1101/2022.07.29.501982
- Accès au bibtex
-
2021
Journal articles
-

- titre
- Deep ocean metagenomes provide insight into the metabolic architecture of bathypelagic microbial communities
- auteur
- Silvia Acinas, Pablo Sánchez, Guillem Salazar, Francisco Cornejo-Castillo, Marta Sebastián, Ramiro Logares, Marta Royo-Llonch, Lucas Paoli, Shinichi Sunagawa, Pascal Hingamp, Hiroyuki Ogata, Gipsi Lima-Mendez, Simon Roux, José González, Jesús Arrieta, Intikhab Alam, Allan Kamau, Chris Bowler, Jeroen Raes, Stéphane Pesant, Peer Bork, Susana Agustí, Takashi Gojobori, Dolors Vaqué, Matthew Sullivan, Carlos Pedrós-Alió, Ramon Massana, Carlos Duarte, Josep Gasol
- article
- Communications Biology, 2021, 4 (1), ⟨10.1038/s42003-021-02112-2⟩
- identifiant
- hal-03238997
- DOI
- DOI : 10.1038/s42003-021-02112-2
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- COVID-19 drug practices risk antimicrobial resistance evolution
- auteur
- Ebrahim Afshinnekoo, Chandrima Bhattacharya, Ana Burguete-García, Eduardo Castro-Nallar, Youping Deng, Christelle Desnues, Emmanuel Dias-Neto, Eran Elhaik, Gregorio Iraola, Soojin Jang, Paweł Łabaj, Christopher Mason, Niranjan Nagarajan, Michael Poulsen, Bharath Prithiviraj, Rania Siam, Tieliu Shi, Haruo Suzuki, Johannes Werner, Maria Mercedes Zambrano, Malay Bhattacharyya
- article
- The Lancet Microbe, 2021, ⟨10.1016/S2666-5247(21)00039-2⟩
- identifiant
- hal-03160391
- DOI
- DOI : 10.1016/S2666-5247(21)00039-2
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Use of Stress Signals of Their Attached Bacteria to Monitor Sympagic Algae Preservation in Canadian Arctic Sediments
- auteur
- Rémi Amiraux, Patricia Bonin, Christopher Burot, Jean-Francois Rontani
- article
- Microorganisms, 2021, 9 (12), pp.2626. ⟨10.3390/microorganisms9122626⟩
- identifiant
- hal-03525505
- DOI
- DOI : 10.3390/microorganisms9122626
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Bacterial diversity and lipid biomarkers in sea ice and sinking particulate organic material during the melt season in the Canadian Arctic
- auteur
- Rémi Amiraux, Jean-Francois Rontani, Fabrice Armougom, Eléonore Frouin, Marcel Babin, Lise Artigue, Patricia Bonin
- article
- Elementa: Science of the Anthropocene, 2021, 9 (1), ⟨10.1525/elementa.2019.040⟩
- identifiant
- hal-03424293
- DOI
- DOI : 10.1525/elementa.2019.040
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Mesopelagic microbial carbon production correlates with diversity across different marine particle fractions
- auteur
- Chloé Baumas, Frédéric Le Moigne, Marc Garel, Nagib Bhairy, Sophie Guasco, Virginie Riou, Fabrice Armougom, Hans-Peter Grossart, Christian Tamburini
- article
- The International Society of Microbiologial Ecology Journal, 2021, ⟨10.1038/s41396-020-00880-z⟩
- identifiant
- hal-03113293
- DOI
- DOI : 10.1038/s41396-020-00880-z
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Trace gas oxidizers are widespread and active members of soil microbial communities
- auteur
- Sean Bay, Xiyang Dong, James Bradley, Pok Man Leung, Rhys Grinter, Thanavit Jirapanjawat, Stefan Arndt, Perran Cook, Douglas Larowe, Philipp Nauer, Eleonora Chiri, Chris Greening
- article
- Nature Microbiology, 2021, 6 (2), pp.246-256. ⟨10.1038/s41564-020-00811-w⟩
- identifiant
- hal-04527857
- DOI
- DOI : 10.1038/s41564-020-00811-w
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Pacmanvirus S19, the Second Pacmanvirus Isolated from Sewage Waters in Oran, Algeria
- auteur
- Guillaume Blanc, Khalil Geballa-Koukoulas, Souhila Abdi, Bernard La Scola, Julien Andreani
- article
- Microbiology Resource Announcements, 2021, 10 (42), ⟨10.1128/MRA.00693-21⟩
- identifiant
- hal-03394563
- DOI
- DOI : 10.1128/MRA.00693-21
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Isolation and Characterization of Gardnerella Phage vB_Gva_AB1, a Bacteriophage Infecting a Clinical Strain of Gardnerella vaginalis
- auteur
- Alexia Bordigoni, Sonia Bouchard, Christelle Desnues
- article
- Microbiology Resource Announcements, 2021, 10 (12), ⟨10.1128/MRA.00053-21⟩
- identifiant
- hal-03203911
- DOI
- DOI : 10.1128/MRA.00053-21
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Development and validation of a multiplex qPCR assay for detection and relative quantification of HPV16 and HPV18 E6 and E7 oncogenes
- auteur
- Alexia Bordigoni, Anne Motte, Hervé Tissot-Dupont, Philippe Colson, Christelle Desnues
- article
- Scientific Reports, 2021, ⟨10.1038/s41598-021-83489-2⟩
- identifiant
- hal-03145129
- DOI
- DOI : 10.1038/s41598-021-83489-2
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Subsurface iron accumulation and rapid aluminum removal in the Mediterranean following African dust deposition
- auteur
- Matthieu Bressac, Thibaut Wagener, Nathalie Leblond, Antonio Tovar-Sánchez, Céline Ridame, Vincent Taillandier, Samuel Albani, Sophie Guasco, Aurélie Dufour, Stéphanie Jacquet, François Dulac, Karine Desboeufs, Cecile Guieu
- article
- Biogeosciences, 2021, 18 (24), pp.6435-6453. ⟨10.5194/bg-18-6435-2021⟩
- identifiant
- hal-03487082
- DOI
- DOI : 10.5194/bg-18-6435-2021
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- DOM Biological Lability in an Estuarine System in Two Contrasting Periods
- auteur
- Simona Retelletti Brogi, Raffaella Casotti, Benjamin Misson, Cecilia Balestra, Margherita Gonnelli, Stefano Vestri, Chiara Santinelli
- article
- Journal of Marine Science and Engineering, 2021, ⟨10.3390/jmse9020172⟩
- identifiant
- hal-03148207
- DOI
- DOI : 10.3390/jmse9020172
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Viability and stress state of bacteria associated with primary production or zooplankton-derived suspended particulate matter in summer along a transect in Baffin Bay (Arctic Ocean)
- auteur
- Christopher Burot, Rémi Amiraux, Patricia Bonin, Sophie Guasco, Marcel Babin, Fabien Joux, Dominique Marie, Laure Vilgrain, Hermann Heipieper, Jean-Francois Rontani
- article
- Science of the Total Environment, 2021, 770, pp.145252. ⟨10.1016/j.scitotenv.2021.145252⟩
- identifiant
- hal-03154542
- DOI
- DOI : 10.1016/j.scitotenv.2021.145252
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Metal resistance genes enrichment in marine biofilm communities selected by biocide-containing surfaces in temperate and tropical coastal environments
- auteur
- Elisa C.P. Catao, Nicolas Gallois, Fabienne Fay, Benjamin Misson, Jean-François Briand
- article
- Environmental Pollution, 2021, 268, pp.115835. ⟨10.1016/j.envpol.2020.115835⟩
- identifiant
- hal-03027551
- DOI
- DOI : 10.1016/j.envpol.2020.115835
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Hydrothermal plumes as hotspots for deep-ocean heterotrophic microbial biomass production
- auteur
- Cécile Cathalot, Erwan Roussel, Antoine Perhirin, Vanessa Creff, Jean-Pierre Donval, Vivien Guyader, Guillaume Roullet, Jonathan Gula, Christian Tamburini, Marc Garel, Anne Godfroy, Pierre-Marie Sarradin
- article
- Nature Communications, 2021, 12 (1), ⟨10.1038/s41467-021-26877-6⟩
- identifiant
- hal-03456814
- DOI
- DOI : 10.1038/s41467-021-26877-6
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- A high rate algal pond hosting a dynamic community of RNA viruses
- auteur
- Emily E Chase, Sonia Monteil-Bouchard, Angélique Gobet, Felana H Andrianjakarivony, Christelle Desnues, Guillaume Blanc
- article
- Viruses, 2021, 13 (11), pp.2163. ⟨10.3390/v13112163⟩
- identifiant
- hal-03394586
- DOI
- DOI : 10.3390/v13112163
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Trace Metal Contamination Impacts Predicted Functions More Than Structure of Marine Prokaryotic Biofilm Communities in an Anthropized Coastal Area
- auteur
- Clément Coclet, Cédric Garnier, Sébastien d'Onofrio, Gaël Durrieu, Emilie Pasero, Christophe Le Poupon, Dario Omanović, Jean-Ulrich Mullot, Benjamin Misson, Jean-François Briand
- article
- Frontiers in Microbiology, 2021, 12, pp.589948. ⟨10.3389/fmicb.2021.589948⟩
- identifiant
- hal-03148203
- DOI
- DOI : 10.3389/fmicb.2021.589948
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Ecosystem maturity modulates greenhouse gases fluxes from artificial lakes
- auteur
- Fanny Colas, Jean-Marc Baudoin, Patricia Bonin, Léa Cabrol, Martin Daufresne, Rémy Lassus, Julien Cucherousset
- article
- Science of the Total Environment, 2021, 760, pp.144046. ⟨10.1016/j.scitotenv.2020.144046⟩
- identifiant
- hal-03110280
- DOI
- DOI : 10.1016/j.scitotenv.2020.144046
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Revised phylogenetic position of Nephrocytium Nägeli (Sphaeropleales, Chlorophyceae), with the description of Nephrocytiaceae fam. nov. and Nephrocytium vieirae sp. nov.
- auteur
- Thaís Garcia da Silva, Lenka Štenclová, Naiara Carolina Pereira Archanjo, Inessa Lacativa Bagatini
- article
- Taxon, the journal of the International Association for Plant Taxonomy, 2021, 70 (5), pp.917-930. ⟨10.1002/tax.12560⟩
- identifiant
- hal-04444711
- DOI
- DOI : 10.1002/tax.12560
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- A global metagenomic map of urban microbiomes and antimicrobial resistance
- auteur
- David Danko, Daniela Bezdan, Evan Afshin, Sofia Ahsanuddin, Chandrima Bhattacharya, Daniel Butler, Kern Rei Chng, Daisy Donnellan, Jochen Hecht, Katelyn Jackson, Katerina Kuchin, Mikhail Karasikov, Abigail Lyons, Lauren Mak, Dmitry Meleshko, Harun Mustafa, Beth Mutai, Russell Neches, Amanda Ng, Olga Nikolayeva, Tatyana Nikolayeva, Eileen Png, Krista Ryon, Jorge Sanchez, Heba Shaaban, Maria Sierra, Dominique Thomas, Ben Young, Omar Abudayyeh, Josue Alicea, Malay Bhattacharyya, Ran Blekhman, Eduardo Castro-Nallar, Ana Cañas, Aspassia Chatziefthimiou, Robert Crawford, Francesca de Filippis, Youping Deng, Christelle Desnues, Emmanuel Dias-Neto, Marius Dybwad, Eran Elhaik, Danilo Ercolini, Alina Frolova, Dennis Gankin, Jonathan Gootenberg, Alexandra Graf, David Green, Iman Hajirasouliha, Jaden J.A. Hastings, Mark Hernandez, Gregorio Iraola, Soojin Jang, Andre Kahles, Frank Kelly, Kaymisha Knights, Nikos Kyrpides, Paweł Łabaj, Patrick K.H. Lee, Marcus H.Y. Leung, Per Ljungdahl, Gabriella Mason-Buck, Ken Mcgrath, Cem Meydan, Emmanuel Mongodin, Milton Ozorio Moraes, Niranjan Nagarajan, Marina Nieto-Caballero, Houtan Noushmehr, Manuela Oliveira, Stephan Ossowski, Olayinka Osuolale, Orhan Özcan, David Paez-Espino, Nicolás Rascovan, Hugues Richard, Gunnar Rätsch, Lynn Schriml, Torsten Semmler, Osman Sezerman, Leming Shi, Tieliu Shi, Rania Siam, Le Huu Song, Haruo Suzuki, Denise Syndercombe Court, Scott Tighe, Xinzhao Tong, Klas Udekwu, Juan Ugalde, Brandon Valentine, Dimitar Vassilev, Elena Vayndorf, Thirumalaisamy Velavan, Jun Wu, María Zambrano, Jifeng Zhu, Sibo Zhu, Christopher Mason, Gabriela Albuquerque, Alex Alexiev, Kalyn Ali, Lucia Alvarado-Arnez, Sarh Aly, Jennifer Amachee, Maria Amorim, Majelia Ampadu, Muhammad Al-Fath Amran, Nala An, Watson Andrew, Harilanto Andrianjakarivony, Michael Angelov, Verónica Antelo, Catharine Aquino, Álvaro Aranguren, Luiza Araujo, Hitler Francois Vasquez Arevalo, Jenny Arevalo, Carme Arnan, Lucia Elena Alvarado Arnez, Fernanda Arredondo, Matthew Arthur, Freddy Asenjo, Thomas Saw Aung, Juliette Auvinet, Nuria Aventin, Sadaf Ayaz, Silva Baburyan, Abd-Manaaf Bakere, Katrin Bakhl, Thais Bartelli, Erdenetsetseg Batdelger, François Baudon, Kevin Becher, Carla Bello, Médine Benchouaia, Hannah Benisty, Anne-Sophie Benoiston, Joseph Benson, Diego Benítez, Juliana Bernardes, Denis Bertrand, Silvia Beurmann, Tristan Bitard-Feildel, Lucie Bittner, Christina Black, Guillaume Blanc, Brittany Blyther, Toni Bode, Julia Boeri, Bazartseren Boldgiv, Kevin Bolzli, Alexia Bordigoni, Ciro Borrelli, Sonia Bouchard, Jean-Pierre Bouly, Alicia Boyd, Gabriela Branco, Alessandra Breschi, Björn Brindefalk, Christian Brion, Alan Briones, Paulina Buczansla, Catherine Burke, Aszia Burrell, Alina Butova, Irvind Buttar, Jalia Bynoe, Sven Bönigk, Kari Bøifot, Hiram Caballero, Xiao Wen Cai, Dayana Calderon, Angela Cantillo, Miguel Carbajo, Alessandra Carbone, Anais Cardenas, Katerine Carrillo, Laurie Casalot, Sofia Castro, Ana Castro, Astred Castro, Ana Valeria B. Castro, Simone Cawthorne, Jonathan Cedillo, Salama Chaker, Jasna Chalangal, Allison Chan, Anastasia Chasapi, Starr Chatziefthimiou, Sreya Ray Chaudhuri, Akash Keluth Chavan, Francisco Chavez, Gregory Chem, Xiaoqing Chen, Michelle Chen, Jenn-Wei Chen, Ariel Chernomoretz, Allaeddine Chettouh, Daisy Cheung, Diana Chicas, Shirley Chiu, Hira Choudhry, Carl Chrispin, Kianna Ciaramella, Erika Cifuentes, Jake Cohen, David Coil, Sylvie Collin, Colleen Conger, Romain Conte, Flavia Corsi, Cecilia Cossio, Ana Costa, Delisia Cuebas, Bruno D’alessandro, Katherine Dahlhausen, Aaron Darling, Pujita Das, Lucinda Davenport, Laurent David, Natalie Davidson, Gargi Dayama, Stéphane Delmas, Chris Deng, Chloé Dequeker, Alexandre Desert, Monika Devi, Felipe Dezem, Clara Dias, Timothy Ryan Donahoe, Sonia Dorado, Lashonda Dorsey, Valeriia Dotsenko, Steven Du, Alexandra Dutan, Naya Eady, Jonathan Eisen, Miar Elaskandrany, Lennard Epping, Juan Escalera-Antezana, Cassie Ettinger, Iqra Faiz, Luice Fan, Nadine Farhat, Emile Faure, Fazlina Fauzi, Charlie Feigin, Skye Felice, Laís Pereira Ferreira, Gabriel Figueroa, Aubin Fleiss, Denisse Flores, Jhovana Velasco Flores, Marcos A.S. Fonseca, Jonathan Foox, Juan Carlos Forero, Aaishah Francis, Kelly French, Pablo Fresia, Jacob Friedman, Jaime Fuentes, Josephine Galipon, Mathilde Garcia, Laura Garcia, Catalina García, Annie Geiger, Samuel Gerner, Sonia Ghose, Dao Phuong Giang, Matías Giménez, Donato Giovannelli, Dedan Githae, Spyridon Gkotzis, Liliana Godoy, Samantha Goldman, Gaston Gonnet, Juana Gonzalez, Andrea Gonzalez, Camila Gonzalez-Poblete, Andrew Gray, Tranette Gregory, Charlotte Greselle, Sophie Guasco, Juan Guerra, Nika Gurianova, Wolfgang Haehr, Sebastien Halary, Felix Hartkopf, Arya Hawkins-Zafarnia, Nur Hazlin Hazrin-Chong, Eric Helfrich, Eva Hell, Tamera Henry, Samuel Hernandez, Pilar Lopez Hernandez, David Hess-Homeier, Lauren Hittle, Nghiem Xuan Hoan, Aliaksei Holik, Chiaki Homma, Irene Hoxie, Michael Huber, Elizabeth Humphries, Stephanie Hyland, Andrea Hässig, Roland Häusler, Nathalie Hüsser, Robert Petit, Badamnyambuu Iderzorig, Mizuki Igarashi, Shaikh Iqbal, Shino Ishikawa, Sakura Ishizuka, Sharah Islam, Riham Islam, Kohei Ito, Sota Ito, Takayuki Ito, Tomislav Ivankovic, Tomoki Iwashiro, Sarah Jackson, Joann Jacobs, Marisano James, Marianne Jaubert, Marie-Laure Jerier, Esmeralda Jiminez, Ayantu Jinfessa, Ymke de Jong, Hyun Woo Joo, Guilllaume Jospin, Takema Kajita, Affifah Saadah Ahmad Kassim, Nao Kato, Amrit Kaur, Inderjit Kaur, Fernanda de Souza Gomes Kehdy, Vedbar Khadka, Shaira Khan, Mahshid Khavari, Michelle Ki, Gina Kim, Hyung Jun Kim, Sangwan Kim, Ryan King, Giuseppe Kolomonaco, Ellen Koag, Nadezhda Kobko-Litskevitch, Maryna Korshevniuk, Michael Kozhar, Jonas Krebs, Nanami Kubota, Andrii Kuklin, Sheelta Kumar, Rachel Kwong, Lawrence Kwong, Ingrid Lafontaine, Juliana Lago, Tsoi Ying Lai, Elodie Laine, Manolo Laiola, Olha Lakhneko, Isha Lamba, Gerardo de Lamotte, Romain Lannes, Eleonora de Lazzari, Madeline Leahy, Hyunjung Lee, Yunmi Lee, Lucy Lee, Vincent Lemaire, Emily Leong, Dagmara Lewandowska, Chenhao Li, Weijun Liang, Moses Lin, Priscilla Lisboa, Anna Litskevitch, Eric Minwei Liu, Tracy Liu, Mayra Arauco Livia, Yui Him Lo, Sonia Losim, Manon Loubens, Jennifer Lu, Olexandr Lykhenko, Simona Lysakova, Salah Mahmoud, Sara Abdul Majid, Natalka Makogon, Denisse Maldonado, Krizzy Mallari, Tathiane Malta, Maliha Mamun, Dimitri Manoir, German Marchandon, Natalia Marciniak, Sonia Marinovic, Brunna Marques, Nicole Mathews, Yuri Matsuzaki, Vincent Matthys, Madelyn May, Elias Mccomb, Annabelle Meagher, Adiell Melamed, Wayne Menary, Katterinne Mendez, Ambar Mendez, Irène Mauricette Mendy, Irene Meng, Ajay Menon, Mark Menor, Roy Meoded, Nancy Merino, Karishma Miah, Mathilde Mignotte, Tanja Miketic, Wilson Miranda, Athena Mitsios, Ryusei Miura, Kunihiko Miyake, Maria Moccia, Natasha Mohan, Mohammed Mohsin, Karobi Moitra, Mauricio Moldes, Laura Molina, Jennifer Molinet, Orgil-Erdene Molomjamts, Eftar Moniruzzaman, Sookwon Moon, Isabelle de Oliveira Moraes, Mario Moreno, Maritza Mosella, Josef Moser, Christopher Mozsary, Amanda Muehlbauer, Oasima Muner, Muntaha Munia, Naimah Munim, Maureen Muscat, Tatjana Mustac, Cristina Muñoz, Francesca Nadalin, Areeg Naeem, Dorottya Nagy-Szakal, Mayuko Nakagawa, Ashanti Narce, Masaki Nasu, Irene González Navarrete, Hiba Naveed, Bryan Nazario, Narasimha Rao Nedunuri, Thomas Neff, Aida Nesimi, Wan Chiew Ng, Synti Ng, Gloria Nguyen, Elsy Ngwa, Agier Nicolas, Pierre Nicolas, Abdollahi Nika, Hosna Noorzi, Avigdor Nosrati, Diana Nunes, Kathryn O’brien, Niamh O’hara, Gabriella Oken, Rantimi Olawoyin, Javier Quilez Oliete, Kiara Olmeda, Tolulope Oluwadare, Itunu Oluwadare, Nils Ordioni, Jenessa Orpilla, Jacqueline Orrego, Melissa Ortega, Princess Osma, Israel Osuolale, Oluwatosin Osuolale, Mitsuki Ota, Francesco Oteri, Yuya Oto, Rachid Ounit, Christos Ouzounis, Subhamitra Pakrashi, Rachel Paras, Coral Pardo-Este, Young-Ja Park, Paulina Pastuszek, Suraj Patel, Jananan Pathmanathan, Andrea Patrignani, Manuel Perez, Ante Peros, Sabrina Persaud, Anisia Peters, Adam Phillips, Lisbeth Pineda, Melissa Pizzi, Alma Plaku, Alketa Plaku, Brianna Pompa-Hogan, María Gabriela Portilla, Leonardo Posada, Max Priestman, Bharath Prithiviraj, Sambhawa Priya, Phanthira Pugdeethosal, Catherine Pugh, Benjamin Pulatov, Angelika Pupiec, Kyrylo Pyrshev, Tao Qing, Saher Rahiel, Savlatjon Rahmatulloev, Kannan Rajendran, Aneisa Ramcharan, Adan Ramirez-Rojas, Shahryar Rana, Prashanthi Ratnanandan, Timothy Read, Hubert Rehrauer, Renee Richer, Alexis Rivera, Michelle Rivera, Alessandro Robertiello, Courtney Robinson, Paula Rodríguez, Nayra Aguilar Rojas, Paul Roldán, Anyelic Rosario, Sandra Roth, Maria Ruiz, Stephen Eduard Boja Ruiz, Kaitlan Russell, Mariia Rybak, Thais Sabedot, Mahfuza Sabina, Ikuto Saito, Yoshitaka Saito, Gustavo Adolfo Malca Salas, Cecilia Salazar, Kaung Myat San, Khaliun Sanchir, Ryan Sankar, Paulo Thiago de Souza Santos, Zulena Saravi, Kai Sasaki, Yuma Sato, Masaki Sato, Seisuke Sato, Ryo Sato, Kaisei Sato, Nowshin Sayara, Steffen Schaaf, Oli Schacher, Anna-Lena Schinke, Ralph Schlapbach, Christian Schori, Jason Schriml, Felipe Segato, Felipe Sepulveda, Marianna Serpa, Paola de Sessions, Juan Severyn, Maheen Shakil, Sarah Shalaby, Aliyah Shari, Hyenah Shim, Hikaru Shirahata, Yuh Shiwa, Ophélie da Silva, Jordana Silva, Gwenola Simon, Shaleni Singh, Kasia Sluzek, Rebecca Smith, Eunice So, Núria Andreu Somavilla, Yuya Sonohara, Nuno Rufino de Sousa, Camila Souza, Jason Sperry, Nicolas Sprinsky, Stefan Stark, Antonietta La Storia, Kiyoshi Suganuma, Hamood Suliman, Jill Sullivan, Arif Asyraf Md Supie, Chisato Suzuki, Sora Takagi, Fumie Takahara, Naoya Takahashi, Kou Takahashi, Tomoki Takeda, Isabella Takenaka, Soma Tanaka, Anyi Tang, Yuk Man Tang, Emilio Tarcitano, Andrea Tassinari, Mahdi Taye, Alexis Terrero, Eunice Thambiraja, Antonin Thiébaut, Sade Thomas, Andrew Thomas, Yuto Togashi, Takumi Togashi, Anna Tomaselli, Masaru Tomita, Itsuki Tomita, Oliver Toth, Nora Toussaint, Jennifer Tran, Catalina Truong, Stefan Tsonev, Kazutoshi Tsuda, Takafumi Tsurumaki, Michelle Tuz, Yelyzaveta Tymoshenko, Carmen Urgiles, Mariko Usui, Sophie Vacant, Laura Vann, Fabienne Velter, Valeria Ventorino, Patricia Vera-Wolf, Riccardo Vicedomini, Michael Suarez-Villamil, Sierra Vincent, Renee Vivancos-Koopman, Andrew Wan, Cindy Wang, Tomoro Warashina, Ayuki Watanabe, Samuel Weekes, Johannes Werner, David Westfall, Lothar Wieler, Michelle Williams, Silver Wolf, Brian Wong, Yan Ling Wong, Tyler Wong, Rasheena Wright, Tina Wunderlin, Ryota Yamanaka, Jingcheng Yang, Hirokazu Yano, George Yeh, Olena Yemets, Tetiana Yeskova, Shusei Yoshikawa, Laraib Zafar, Yang Zhang, Shu Zhang, Amy Zhang, Yuanting Zheng, Stas Zubenko, Natasha Abdullah, Marcos Abraao, Adel Ait-Hamlat, Muhammad Afaq, Faisal Al-Quaddoomi, Ireen Alam
- article
- Cell, 2021, 184 (13), pp.3376-3393.e17. ⟨10.1016/j.cell.2021.05.002⟩
- identifiant
- hal-03357730
- DOI
- DOI : 10.1016/j.cell.2021.05.002
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Effects of nickel oxide nanoparticles on survival, reproduction, and oxidative stress biomarkers in the marine calanoid copepod Centropages ponticus under short-term exposure
- auteur
- Emna Djebbi, Delphine Bonnet, Olivier Pringault, Khawla Tlili, Mohamed Néjib Daly Yahia
- article
- Environmental Science and Pollution Research, 2021, ⟨10.1007/s11356-020-11781-1⟩
- identifiant
- hal-03159234
- DOI
- DOI : 10.1007/s11356-020-11781-1
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Phylogenomic fingerprinting of tempo and functions of horizontal gene transfer within ochrophytes
- auteur
- Richard G Dorrell, Adrien Villain, Benoît Perez-Lamarque, Guillemette Audren de Kerdrel, Giselle Mccallum, Andrew K Watson, Ouardia Ait-Mohamed, Adriana Alberti, Erwann Corre, Kyle R Frischkorn, Juan J Pierella Karlusich, Eric Pelletier, Hélène Morlon, Chris Bowler, Guillaume Blanc
- article
- Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2021, 118 (4), ⟨10.1073/pnas.2009974118/-/DCSupplemental⟩
- identifiant
- mnhn-03969507
- DOI
- DOI : 10.1073/pnas.2009974118/-/DCSupplemental
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Microbial consortia in an ice‐covered high‐altitude lake impacted by additions of dissolved organic carbon and nutrients
- auteur
- Flavia Dory, Laurent Cavalli, Evelyne Franquet, B. Misson, Thierry Tatoni, Céline Bertrand, Magalie Claeys-Bruno
- article
- Freshwater Biology, 2021, 66 (8), pp.1648-1662. ⟨10.1111/fwb.13781⟩
- identifiant
- hal-03375780
- DOI
- DOI : 10.1111/fwb.13781
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Organic additive release from plastic to seawater is lower under deep-sea conditions
- auteur
- Vincent Fauvelle, Marc Garel, Christian Tamburini, D. Nerini, Javier Castro-Jiménez, Natascha Schmidt, Andrea Paluselli, Armand Fahs, Laure Papillon, Andy M Booth, Richard Sempere
- article
- Nature Communications, 2021, 12 (1), ⟨10.1038/s41467-021-24738-w⟩
- identifiant
- hal-03293644
- DOI
- DOI : 10.1038/s41467-021-24738-w
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- OrpR is a σ 54 ‐dependent activator using an iron‐sulfur cluster for redox sensing in Desulfovibrio vulgaris Hildenborough
- auteur
- Anouchka Fiévet, Meriem Merrouch, Gaël Brasseur, Danaé Eve, Emanuele Biondi, Odile Valette, Sofia Pauleta, Alain Dolla, Zorah Dermoun, Bénédicte Burlat, Corinne Aubert
- article
- Molecular Microbiology, 2021, 116 (1), ⟨10.1111/mmi.14705⟩
- identifiant
- hal-03204123
- DOI
- DOI : 10.1111/mmi.14705
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Fishing for the Virome of Tropical Tuna
- auteur
- Elsa Gadoin, Christelle Desnues, Sonia Monteil-Bouchard, Thierry Bouvier, J.-C. Auguet, Emmanuelle Roque d’Orbcastel, Yvan Bettarel
- article
- Viruses, 2021, 13 (7), pp.1291. ⟨10.3390/v13071291⟩
- identifiant
- hal-03332237
- DOI
- DOI : 10.3390/v13071291
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Does the Composition of the Gut Bacteriome Change during the Growth of Tuna?
- auteur
- Elsa Gadoin, Lucile Durand, Aurélie Guillou, Sandrine Crochemore, Thierry Bouvier, Emmanuelle Roque d'Orbcastel, Laurent Dagorn, J.-C. Auguet, Antoinette Adingra, Christelle Desnues, Yvan Bettarel
- article
- Microorganisms, 2021, 9 (6), pp.1157. ⟨10.3390/microorganisms9061157⟩
- identifiant
- hal-03332247
- DOI
- DOI : 10.3390/microorganisms9061157
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Contrasting degradation rates of natural dissolved organic carbon by deep-sea prokaryotes under stratified water masses and deep-water convection conditions in the NW Mediterranean Sea
- auteur
- Marc Garel, Christos Panagiotopoulos, Mehdi Boutrif, Daniel Repeta, Richard Sempere, Chiara Santinelli, Bruno Charrière, David Nerini, Jean-Christophe Poggiale, Christian Tamburini
- article
- Marine Chemistry, 2021, 231, pp.103932. ⟨10.1016/j.marchem.2021.103932⟩
- identifiant
- hal-03159104
- DOI
- DOI : 10.1016/j.marchem.2021.103932
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Glutamate optimizes enzymatic activity under high hydrostatic pressure in Desulfovibrio species: effects on the ubiquitous thioredoxin system
- auteur
- Hélène Gaussier, M. Nouailler, Edouard Champaud, Edwige Garcin, Sebban -Kreuzer, Olivier Bornet, Marc Garel, Christian Tamburini, Laetitia Pieulle, Alain Dolla, Nathalie Pradel
- article
- Extremophiles, 2021, 25, pp.385-392. ⟨10.1007/s00792-021-01236-x⟩
- identifiant
- hal-03272295
- DOI
- DOI : 10.1007/s00792-021-01236-x
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- The Kaumoebavirus LCC10 Genome Reveals a Unique Gene Strand Bias among “Extended Asfarviridae”
- auteur
- Khalil Geballa-Koukoulas, Julien Andreani, Bernard La Scola, Guillaume Blanc
- article
- Viruses, 2021, 13 (2), pp.148. ⟨10.3390/v13020148⟩
- identifiant
- hal-03118634
- DOI
- DOI : 10.3390/v13020148
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Sediment reworking by the burrowing polychaete Hediste diversicolor modulated by environmental and biological factors across the temperate North Atlantic. A tribute to Gaston Desrosiers
- auteur
- Franck Gilbert, Erik Kristensen, Robert Aller, Gary Banta, Philippe Archambault, Rénald Belley, Luca Bellucci, Lois Calder, Philippe Cuny, Xavier de Montaudouin, Susanne Eriksson, Stefan Forster, Patrick Gillet, Jasmin Godbold, Ronnie Glud, Jonas Gunnarsson, Stefan Hulth, Stina Lindqvist, Anthony Maire, Emma Michaud, Karl Norling, Judith Renz, Martin Solan, Michael Townsend, Nils Volkenborn, Stephen Widdicombe, Georges Stora
- article
- Journal of Experimental Marine Biology and Ecology, 2021, 541, pp.151588. ⟨10.1016/j.jembe.2021.151588⟩
- identifiant
- hal-03233589
- DOI
- DOI : 10.1016/j.jembe.2021.151588
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Similar Methanogenic Shift but Divergent Syntrophic Partners in Anaerobic Digesters Exposed to Direct versus Successive Ammonium Additions
- auteur
- Julie Hardy, Patricia Bonin, Adele Lazuka, Estelle Gonidec, Sophie Guasco, Corinne Valette, Sébastien Lacroix, Léa Cabrol
- article
- Microbiology Spectrum, 2021, 9 (2), ⟨10.1128/Spectrum.00805-21⟩
- identifiant
- hal-03435672
- DOI
- DOI : 10.1128/Spectrum.00805-21
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- On the barium–oxygen consumption relationship in the Mediterranean Sea: implications for mesopelagic marine snow remineralization
- auteur
- Stéphanie Jacquet, Dominique Lefèvre, Christian Tamburini, Marc Garel, Frédéric A.C. Le Moigne, Nagib Bhairy, Sophie Guasco
- article
- Biogeosciences, 2021, 18 (6), pp.2205-2212. ⟨10.5194/bg-18-2205-2021⟩
- identifiant
- hal-03357294
- DOI
- DOI : 10.5194/bg-18-2205-2021
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Efficiency of benthic diatom-associated bacteria in the removal of benzo(a)pyrene and fluoranthene
- auteur
- Oumayma Kahla, Sondes Melliti Ben Garali, Fatma Karray, Manel Ben Abdallah, Najwa Kallel, Najla Mhiri, Hatem Zaghden, Badreddine Barhoumi, Olivier Pringault, Marianne Quemeneur, Marc Tedetti, Sami Sayadi, Asma Sakka Hlaili
- article
- Science of the Total Environment, 2021, 751, pp.141399. ⟨10.1016/j.scitotenv.2020.141399⟩
- identifiant
- hal-02925530
- DOI
- DOI : 10.1016/j.scitotenv.2020.141399
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Revised treatment of Reinsch’s Selenastrum taxa and Messastrum (Chlorophyta) with remarks on their original material and molecularly analysed reference strains
- auteur
- Wolf-Henning Kusber, Thaís Garcia da Silva, Christina Bock, Lothar Krienitz, Michael D Guiry
- article
- Notulae algarum, 2021, 218, pp.1
- identifiant
- hal-04444847
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Temperature differently affected methanogenic pathways and microbial communities in sub-Antarctic freshwater ecosystems
- auteur
- Céline Lavergne, Polette Aguilar-Muñoz, Natalia Calle, Frédéric Thalasso, Maria Soledad Astorga-España, Armando Sepulveda-Jauregui, Karla Martinez-Cruz, Laure Gandois, Andrés Mansilla, Rolando Chamy, Maialen Barret, Léa Cabrol
- article
- Environment International, 2021, 154, pp.106575. ⟨10.1016/j.envint.2021.106575⟩
- identifiant
- hal-03414370
- DOI
- DOI : 10.1016/j.envint.2021.106575
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Negligible microbial heterotrophic quantitative contribution onto trace metals remobilization during marine sediment resuspension - insights from a Mediterranean urbanized bay
- auteur
- Nicolas Layglon, B. Misson, Nicolas Gallois, Sébastien d'Onofrio, V Lenoble, Stéphane Mounier, Dario Omanović, Cédric Garnier
- article
- Marine Chemistry, In press, ⟨10.1016/j.marchem.2021.103981⟩
- identifiant
- hal-03229764
- DOI
- DOI : 10.1016/j.marchem.2021.103981
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- RadA, a MSCRAMM Adhesin of the Dominant Symbiote Ruminococcus gnavus E1, Binds Human Immunoglobulins and Intestinal Mucins
- auteur
- Marc Maresca, Radia Alatou, Ange Pujol, Cendrine Nicoletti, Josette Perrier, Thierry Giardina, Gwenola Simon, Vincent Méjean, Michel Fons
- article
- Biomolecules, 2021, 11 (11), pp.1613. ⟨10.3390/biom11111613⟩
- identifiant
- hal-03455626
- DOI
- DOI : 10.3390/biom11111613
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Capacity of the potentially toxic diatoms Pseudo-nitzschia mannii and Pseudo-nitzschia hasleana to tolerate polycyclic aromatic hydrocarbons
- auteur
- Sondes Melliti Ben Garali, Inès Sahraoui, Hiba Ben Othman, Abdessalem Kouki, Pablo de La Iglesia, Jorge Diogène, Céline Lafabrie, Karl Andree, Margarita Fernández-Tejedor, Kaouther Mejri, Marouan Meddeb, Olivier Pringault, Asma Sakka Hlaili
- article
- Ecotoxicology and Environmental Safety, 2021, 214, pp.112082. ⟨10.1016/j.ecoenv.2021.112082⟩
- identifiant
- hal-03184503
- DOI
- DOI : 10.1016/j.ecoenv.2021.112082
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- First Assessment of the Benthic Meiofauna Sensitivity to Low Human-Impacted Mangroves in French Guiana
- auteur
- Claire Michelet, Daniela Zeppilli, Cédric Hubas, Elisa Baldrighi, Philippe Cuny, Guillaume Dirberg, Cécile Militon, Romain Walcker, Dominique Lamy, Ronan Jézéquel, Justine Receveur, Gilbert Franck, Amonda El Houssainy, Aurélie Dufour, Lars-Eric Heimbürger-Boavida, Isabelle Bihannic, Lea Sylvi, Baptiste Vivier, Emma Michaud
- article
- Forests, 2021, 12 (3), pp.338. ⟨10.3390/f12030338⟩
- identifiant
- hal-03168449
- DOI
- DOI : 10.3390/f12030338
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Limited influence of marine sediment lyophilization on prokaryotic community structure assessed via amplicon sequencing: an example from environmentally contrasted sediment layers in Toulon harbor (France)
- auteur
- Benjamin Misson, Cédric Garnier, Alexandre J Poulain
- article
- PeerJ, 2021, 9, pp.e11075. ⟨10.7717/peerj.11075⟩
- identifiant
- hal-03191488
- DOI
- DOI : 10.7717/peerj.11075
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- The chemistry of hyperalkaline springs in serpentinizing environments: 1. the composition of free gases in New Caledonia compared to other springs worldwide
- auteur
- Christophe Monnin, Marianne Quemeneur, Roy Price, Julie Jeanpert, Pierre Maurizot, Cédric Boulart, Jean-Pierre Donval, Bernard Pelletier
- article
- Journal of Geophysical Research: Biogeosciences, In press, 9 (126), pp.e2021JG006243. ⟨10.1029/2021JG006243⟩
- identifiant
- hal-03242378
- DOI
- DOI : 10.1029/2021JG006243
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Virome Diversity among Mosquito Populations in a Sub-Urban Region of Marseille, France
- auteur
- Amira Nebbak, Sonia Monteil-Bouchard, Jean-Michel Berenger, Lionel Almeras, Philippe Parola, Christelle Desnues
- article
- Viruses, 2021, 13 (5), pp.768. ⟨10.3390/v13050768⟩
- identifiant
- hal-03304879
- DOI
- DOI : 10.3390/v13050768
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Forensic genetic identification of sharks involved in human attacks
- auteur
- Nicolas Oury, Sébastien Jaquemet, Gwenola Simon, Laurie Casalot, Géry Vangrevelynghe, Fanch Landron, Hélène Magalon
- article
- Forensic Science International: Genetics , 2021, pp.102558. ⟨10.1016/j.fsigen.2021.102558⟩
- identifiant
- hal-03273193
- DOI
- DOI : 10.1016/j.fsigen.2021.102558
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Integration of spatio-temporal variations of surface metabolomes and epibacterial communities highlights the importance of copper stress as a major factor shaping host-microbiota interactions within a Mediterranean seaweed holobiont
- auteur
- Benoît Paix, Nicolas Layglon, Christophe Le Poupon, Sébastien D’onofrio, Benjamin Misson, Cédric Garnier, Gérald Culioli, Jean-François Briand
- article
- Microbiome, 2021, 9 (1), ⟨10.1186/s40168-021-01124-8⟩
- identifiant
- hal-03426129
- DOI
- DOI : 10.1186/s40168-021-01124-8
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Synergistic effects of temperature and light affect the relationship between Taonia atomaria and its epibacterial community: a controlled conditions study
- auteur
- Benoit Paix, Philippe Potin, Gaëtan Schires, Christophe Le Poupon, B. Misson, Catherine Leblanc, Gérald Culioli, Jean‐françois Briand
- article
- Environmental Microbiology, 2021, 23 (11), pp.6777-6797. ⟨10.1111/1462-2920.15758⟩
- identifiant
- hal-03400714
- DOI
- DOI : 10.1111/1462-2920.15758
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Metal-containing PAS/GAF domains in bacterial sensors
- auteur
- Romain Pardoux, Alain Dolla, Corinne Aubert
- article
- Coordination Chemistry Reviews, 2021, 442, pp.214000. ⟨10.1016/j.ccr.2021.214000⟩
- identifiant
- hal-03249747
- DOI
- DOI : 10.1016/j.ccr.2021.214000
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Influence of Meteorological Conditions and Aerosol Properties on the COVID-19 Contamination of the Population in Coastal and Continental Areas in France: Study of Offshore and Onshore Winds
- auteur
- Jacques Piazzola, William Bruch, Christelle Desnues, Philippe Parent, Christophe Yohia, Elisa Canepa
- article
- Atmosphere, 2021, 12 (4), pp.523. ⟨10.3390/atmos12040523⟩
- identifiant
- hal-03210779
- DOI
- DOI : 10.3390/atmos12040523
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Evolution of Thermophilic Microbial Communities from a Deep-Sea Hydrothermal Chimney under Electrolithoautotrophic Conditions with Nitrate
- auteur
- Guillaume Pillot, Oulfat Amin Ali, Sylvain Davidson, Laetitia Shintu, Yannick Combet-Blanc, Anne Godfroy, Patricia Bonin, Pierre-Pol Liebgott
- article
- Microorganisms, 2021, 9 (12), pp.2475. ⟨10.3390/microorganisms9122475⟩
- identifiant
- hal-03563636
- DOI
- DOI : 10.3390/microorganisms9122475
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Identification of enriched hyperthermophilic microbial communities from a deep-sea hydrothermal vent chimney under electrolithoautotrophic culture conditions
- auteur
- Guillaume Pillot, Oulfat Amin Ali, Sylvain Davidson, Laetitia Shintu, Anne Godfroy, Yannick Combet-Blanc, Patricia Bonin, Pierre-Pol Liebgott
- article
- Scientific Reports, 2021, 11 (1), ⟨10.1038/s41598-021-94135-2⟩
- identifiant
- hal-03427430
- DOI
- DOI : 10.1038/s41598-021-94135-2
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Alkaliphilus serpentinus sp. nov. and Alkaliphilus pronyensis sp. nov., two novel anaerobic alkaliphilic species isolated from the serpentinite-hosted Prony Bay Hydrothermal Field (New Caledonia)
- auteur
- Anne Postec, Marianne Quemeneur, Aurélien Lecoeuvre, Nicolas Chabert, Manon Joseph, Gaël Erauso
- article
- Systematic and Applied Microbiology, 2021, 44 (2), pp.126175. ⟨10.1016/j.syapm.2020.126175⟩
- identifiant
- hal-03107003
- DOI
- DOI : 10.1016/j.syapm.2020.126175
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Phosphorus cycling in the upper waters of the Mediterranean Sea (PEACETIME cruise): relative contribution of external and internal sources
- auteur
- Elvira Pulido-Villena, Karine Desboeufs, Kahina Djaoudi, France van Wambeke, Stéphanie Barrillon, Andrea M. Doglioli, Anne Petrenko, Vincent Taillandier, Franck Fu, Tiphanie Gaillard, Sophie Guasco, Sandra Helias Nunige, Sylvain Triquet, Cécile Guieu
- article
- Biogeosciences, 2021, 18 (21), pp.5871 - 5889. ⟨10.5194/bg-18-5871-2021⟩
- identifiant
- hal-03418751
- DOI
- DOI : 10.5194/bg-18-5871-2021
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Procaryotic Diversity and Hydrogenotrophic Methanogenesis in an Alkaline Spring (La Crouen, New Caledonia)
- auteur
- Marianne Quéméneur, Nan Mei, Christophe Monnin, Anne Postec, Laura Wils, Manon Bartoli, Sophie Guasco, Bernard Pelletier, Gael Erauso
- article
- Microorganisms, 2021, 9 (7), pp.1360. ⟨10.3390/microorganisms9071360⟩
- identifiant
- hal-03279565
- DOI
- DOI : 10.3390/microorganisms9071360
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Alkalicella caledoniensis gen. nov., sp. nov., a novel alkaliphilic anaerobic bacterium isolated from ‘La Crouen’ alkaline thermal spring, New Caledonia
- auteur
- Marianne Quéméneur, Gaël Erauso, Manon Bartoli, Céline Vandecasteele, Laura Wils, Lisa Gil, Christophe Monnin, Bernard Pelletier, Anne Postec
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2021, 71 (5), pp.004810. ⟨10.1099/ijsem.0.004810⟩
- identifiant
- hal-03231234
- DOI
- DOI : 10.1099/ijsem.0.004810
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Benthic oxygen dynamics and implication for the maintenance of chronic hypoxia and ecosystem degradation in the Berre lagoon (France)
- auteur
- Sylvain Rigaud, Bruno Deflandre, Christian Grenz, Florian Cesbron, Lara Pozzato, Baptiste Voltz, Antoine Grémare, Alicia Romero-Ramirez, Pascal Mirleau, Samuel Meulé, Vincent Faure, Nicolas Mayot, Valerie Michotey, Patricia Bonin, Ludovic Pascal, Marie-Ange Cordier, Bastien Lamarque, Márcio Tenório, Olivier Radakovitch
- article
- Estuarine, Coastal and Shelf Science, 2021, 258, pp.107437. ⟨10.1016/j.ecss.2021.107437⟩
- identifiant
- hal-03249104
- DOI
- DOI : 10.1016/j.ecss.2021.107437
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Rapid Spread of the Invasive Brown Alga Rugulopteryx okamurae in a National Park in Provence (France, Mediterranean Sea)
- auteur
- Sandrine Ruitton, A. Blanfuné, Charles F. Boudouresque, Dorian Guillemain, Valerie Michotey, Sylvain Roblet, Delphine Thibault, Thierry Thibaut, Marc Verlaque
- article
- Water, 2021, 13 (16), pp.2306. ⟨10.3390/w13162306⟩
- identifiant
- hal-03342953
- DOI
- DOI : 10.3390/w13162306
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Elutriate preparation affects embryo development test with Paracentrotus lividus: An in-depth study on the differences between two protocols and three different sediment/water mixing times
- auteur
- Davide Sartori, Simona Macchia, Nicolas Layglon, Sébastien d'Onofrio, Benjamin Misson, Maria Elena Piccione, Rosa Maria Bertolotto, Alice Scuderi, Fabiano Pilato, Silvia Giuliani, David Pellegrini, Andrea Gaion
- article
- Ecotoxicology and Environmental Safety, 2021, ⟨10.1016/j.ecoenv.2021.112010⟩
- identifiant
- hal-03148212
- DOI
- DOI : 10.1016/j.ecoenv.2021.112010
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Increasing Hydrostatic Pressure Impacts the Prokaryotic Diversity during Emiliania huxleyi Aggregates Degradation
- auteur
- Christian Tamburini, Marc Garel, Aude Barani, Dominique Boeuf, Patricia Bonin, Nagib Bhairy, Sophie Guasco, Stéphanie Jacquet, Frédéric A.C. Le Moigne, Christos Panagiotopoulos, Virginie Riou, Sandrine Veloso, Chiara Santinelli, Fabrice Armougom
- article
- Water, 2021, 13 (19), pp.2616. ⟨10.3390/w13192616⟩
- identifiant
- hal-03356668
- DOI
- DOI : 10.3390/w13192616
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Towards the Idea of Molecular Brains
- auteur
- Y. Timsit, Grégoire Sergeant-Perthuis
- article
- International Journal of Molecular Sciences, 2021, 22 (21), pp.11868. ⟨10.3390/ijms222111868⟩
- identifiant
- hal-03430257
- DOI
- DOI : 10.3390/ijms222111868
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Bioluminescence and Photoreception in Unicellular Organisms: Light-Signalling in a Bio-Communication Perspective
- auteur
- Youri Timsit, Magali Lescot, Martha Valiadi, Fabrice Not
- article
- International Journal of Molecular Sciences, 2021, 22 (21), pp.11311. ⟨10.3390/ijms222111311⟩
- identifiant
- hal-03402318
- DOI
- DOI : 10.3390/ijms222111311
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Evolution of ribosomal protein network architectures
- auteur
- Y. Timsit, Grégoire Sergeant-Perthuis, Daniel Bennequin
- article
- Scientific Reports, 2021, 11 (1), ⟨10.1038/s41598-020-80194-4⟩
- identifiant
- hal-03120751
- DOI
- DOI : 10.1038/s41598-020-80194-4
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Spatial patterns of ectoenzymatic kinetics in relation to biogeochemical properties in the Mediterranean Sea and the concentration of the fluorogenic substrate used
- auteur
- France van Wambeke, Elvira Pulido-Villena, Philippe Catala, Julie Dinasquet, Kahina Djaoudi, Anja Engel, Marc Garel, Sophie Guasco, Barbara Marie, Sandra Nunige, Vincent Taillandier, Birthe Zäncker, Christian Tamburini
- article
- Biogeosciences, 2021, 18 (7), pp.2301-2323. ⟨10.5194/bg-18-2301-2021⟩
- identifiant
- hal-03195714
- DOI
- DOI : 10.5194/bg-18-2301-2021
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- The Ocean Barcode Atlas: a web service to explore the biodiversity and biogeography of marine organisms.
- auteur
- Caroline Vernette, Nicolas Henry, Julien Lecubin, Colomban de Vargas, Pascal Hingamp, Magali Lescot
- article
- Molecular Ecology Resources, 2021, ⟨10.1111/1755-0998.13322⟩
- identifiant
- hal-03115219
- DOI
- DOI : 10.1111/1755-0998.13322
- Accès au bibtex
-
Conference papers
-

- titre
- NEW INSIGHTS INTO MICROBIAL WAX ESTER BIOSYNTHESIS, NATURAL OCCURRENCE AND ADAPTIVE ROLE
- auteur
- Vincent Grossi, Ingrid Antheaume, Daniel Ariztegui, Guillaume Borrel, Cristiana Cravo-Laureau, Philippe Cuny, Mylène Hugoni, Cécile Militon, David Sala, Lea Sylvi, Camille Thomas
- article
- 30th International Meeting on Organic Geochemistry (IMOG), Sep 2021, Montpellier (on line due to pandemic situation), France
- identifiant
- hal-03761878
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- The REINFORCE Project: Inviting Citizen Scientists to analyse KM3NeT data
- auteur
- Rémy Le Breton, Vincent Bertin, Paschal Coyle, Gwenhaël de Wasseige, Hervé Glotin, Carlo Guidi, Feifei Huang, Séverine Martini, Antoine Kouchner, Christian Tamburini, Veronique van Elewyck
- article
- 37th International Cosmic Ray Conference, Jul 2021, Berlin, Germany. pp.1392, ⟨10.22323/1.395.1392⟩
- identifiant
- hal-03373316
- DOI
- DOI : 10.22323/1.395.1392
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Book sections
- titre
- Serpentinicella
- auteur
- Marianne Quemeneur, Nan Mei, Anne Postec, Gaël Erauso
- article
- Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria, 1, Wiley, 2021, ⟨10.1002/9781118960608.gbm01817⟩
- identifiant
- hal-03420813
- DOI
- DOI : 10.1002/9781118960608.gbm01817
- Accès au bibtex
-
Other publications
-

- titre
- The Hungry Snail, the Fragile Coral, and the Friendly Microbe
- auteur
- Yvan Bettarel, Elyse Boudin, Sébastien Halary, Jean-Christophe Auguet, Jean Péronnin, Thierry Bouvier, Emma Rochelle-Newall, van Ngoc Bui, Christelle Desnues
- article
- 2021, pp.573856. ⟨10.3389/frym.2021.573856⟩
- identifiant
- hal-03415940
- DOI
- DOI : 10.3389/frym.2021.573856
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Theses
-

- titre
- Hyperbaric methods, procedures and techniques for the study of deep-sea microorganisms under in situ conditions
- auteur
- Marc Garel
- article
- Ocean, Atmosphere. Aix-Marseille Université, 2021. English. ⟨NNT : ⟩
- identifiant
- tel-03513824
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Preprints, Working Papers, ...
-

- titre
- Subsurface iron accumulation and rapid aluminium removal in the Mediterranean following African dust deposition
- auteur
- Matthieu Bressac, Thibaut Wagener, Nathalie Leblond, Antonio Tovar-Sánchez, Céline Ridame, Samuel Albani, Sophie Guasco, Aurélie Dufour, Stéphanie Jacquet, François Dulac, Karine Desboeufs, Cecile Guieu
- article
- 2021
- identifiant
- hal-03201012
- DOI
- DOI : 10.5194/bg-2021-87
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Thriving of hyperthermophilic microbial communities from a deep-sea sulfidic hydrothermal chimney under electrolithoautotrophic conditions with nitrate as electron acceptor
- auteur
- G. Pillot, S. Davidson, L. Shintu, L. Tanet, Y. Combet-Blanc, A. Godfroy, Patricia Bonin, Pierre-Pol Liebgott
- article
- 2021
- identifiant
- hal-03427429
- DOI
- DOI : 10.1101/2021.03.26.437165
- Accès au bibtex
-
2020
Journal articles
-

- titre
- Iron corrosion induced by the hyperthermophilic sulfate-reducing archaeon Archaeoglobus fulgidus at 70°C
- auteur
- Oulfat Amin Ali, Emmanuel Aragon, Armand Fahs, Sylvain Davidson, Bernard Ollivier, Agnès Hirschler-Réa
- article
- International Biodeterioration and Biodegradation, 2020, 154, pp.105056. ⟨10.1016/j.ibiod.2020.105056⟩
- identifiant
- hal-03181343
- DOI
- DOI : 10.1016/j.ibiod.2020.105056
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Stress factors resulting from the Arctic vernal sea-ice melt
- auteur
- Rémi Amiraux, Christopher Burot, Patricia Bonin, Guillaume Massé, Sophie Guasco, Marcel Babin, Frederic Vaultier, Jean-Francois Rontani
- article
- Elementa: Science of the Anthropocene, 2020, 8 (1), ⟨10.1525/elementa.076⟩
- identifiant
- hal-03458308
- DOI
- DOI : 10.1525/elementa.076
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Meta-omics Provides Insights into the Impact of Hydrocarbon Contamination on Microbial Mat Functioning
- auteur
- Johanne Aubé, Pavel Senin, Patricia Bonin, Olivier Pringault, Céline Jeziorski, Olivier Bouchez, Christophe Klopp, Remy Guyoneaud, Marisol Goñi
- article
- Microbial ecology, 2020, 80 (2), pp.286-295. ⟨10.1007/s00248-020-01493-x⟩
- identifiant
- hal-03065790
- DOI
- DOI : 10.1007/s00248-020-01493-x
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Two new bacteria isolated from vagina of a patient with vaginosis: Atopobium massiliense sp. nov. and Butyricimonas vaginalis sp. nov.
- auteur
- A. Bordigoni, C.I. Lo, E. Kuete Yimagou, B. Nicaise, K. Diop, D. Raoult, C. Desnues, F. Fenollar
- article
- New Microbes and New Infections, 2020, 38, pp.100771. ⟨10.1016/j.nmni.2020.100771⟩
- identifiant
- hal-02999173
- DOI
- DOI : 10.1016/j.nmni.2020.100771
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Megasphaera vaginalis sp. nov. and Anaerococcus vaginimassiliensis sp. nov., new bacteria isolated from vagina of French woman with bacterial vaginosis
- auteur
- A. Bordigoni, C.I. Lo, E.K. Yimagou, K. Diop, B. Nicaise, D. Raoult, Christelle Desnues, F. Fenollar
- article
- New Microbes and New Infections, 2020, 37, pp.100706. ⟨10.1016/j.nmni.2020.100706⟩
- identifiant
- hal-02962477
- DOI
- DOI : 10.1016/j.nmni.2020.100706
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Widespread energy limitation to life in global subseafloor sediments
- auteur
- J. Bradley, S. Arndt, J. Amend, E. Burwicz, A. Dale, M. Egger, D. Larowe
- article
- Science Advances , 2020, 6 (32), ⟨10.1126/sciadv.aba0697⟩
- identifiant
- hal-04450513
- DOI
- DOI : 10.1126/sciadv.aba0697
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Anaerobic oxidation of methane and associated microbiome in anoxic water of Northwestern Siberian lakes
- auteur
- Léa Cabrol, Frédéric Thalasso, Laure Gandois, Armando Sepulveda-Jauregui, Karla Martinez-Cruz, Roman Teisserenc, Nikita Tananaev, Alexander Tveit, Mette Svenning, Maialen Barret
- article
- Science of the Total Environment, 2020, 736, pp.139588. ⟨10.1016/j.scitotenv.2020.139588⟩
- identifiant
- hal-03151740
- DOI
- DOI : 10.1016/j.scitotenv.2020.139588
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Intraspecific variability in membrane proteome, cell growth, and morphometry of the invasive marine neurotoxic dinoflagellate Alexandrium pacificum grown in metal-contaminated conditions
- auteur
- Cherif Chetouhi, Estelle Masseret, Cecilia Teodora Satta, Thierry Balliau, Mohamed Laabir, N. Jean
- article
- Science of the Total Environment, 2020, 715, pp.136834. ⟨10.1016/j.scitotenv.2020.136834⟩
- identifiant
- hal-02959936
- DOI
- DOI : 10.1016/j.scitotenv.2020.136834
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Impacts of copper and lead exposure on prokaryotic communities from contaminated contrasted coastal seawaters: the influence of previous metal exposure
- auteur
- Clément Coclet, Cédric Garnier, Gaël Durrieu, Sébastien d'Onofrio, Nicolas Layglon, Jean-François Briand, Benjamin Misson
- article
- FEMS Microbiology Ecology, 2020, 96 (6), ⟨10.1093/femsec/fiaa048⟩
- identifiant
- hal-03027561
- DOI
- DOI : 10.1093/femsec/fiaa048
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Long-read only assembly of Drechmeria coniospora genomes reveals widespread chromosome plasticity and illustrates the limitations of current nanopore methods
- auteur
- Damien Courtine, Jan Provaznik, Jérôme Reboul, Guillaume Blanc, Vladimir Benes, Jonathan J Ewbank
- article
- GigaScience, 2020, 9 (9), pp.1 - 11. ⟨10.1093/gigascience/giaa099⟩
- identifiant
- hal-02964511
- DOI
- DOI : 10.1093/gigascience/giaa099
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Oil spill response in mangroves: why a specific ecosystem-based management is required? The case of French Guiana – a mini-review
- auteur
- Philippe Cuny, Ronan Jezequel, Emma Michaud, Léa Sylvi, Franck Gilbert, Maud Fiard, C. Chevalier, Valérie Morel, Cécile Militon
- article
- Vie et Milieu / Life & Environment, 2020, 70 (3-4), pp.69-76
- identifiant
- hal-03425384
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Towards the development of ecosystem-based indicators of mangroves functioning state in the context of the EU water framework directive
- auteur
- Guillaume Dirberg, Geneviève Barnaud, Olivier Brivois, Pierre Caessteker, Marie-Christine Cormier-Salem, Philippe Cuny, Maud Fiard, François Fromard, Franck Gilbert, Sandrine Grouard, Daniel Guiral, Cédric Hubas, Daniel Imbert, Dominique Lamy, Tarik Meziane, Emma Michaud, Claire Michelet, Cécile Militon, Alain Pibot, Christophe Proisy, Tony Robinet, Thomas Stieglitz, Léa Sylvi, F Taureau, Hélène Udo, Romain Walcker, Daniela Zeppilli, Olivier Monnier
- article
- Vie et Milieu / Life & Environment, 2020, 70 (3-4), pp.303-310
- identifiant
- hal-03495716
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Oyster hemolymph is a complex and dynamic ecosystem hosting bacteria, protists and viruses
- auteur
- Samuel Dupont, A. Lokmer, E. Corre, J.-C. Auguet, Bruno Petton, E. Toulza, C. Montagnani, G. Tanguy, D. Pecqueur, C. Salmeron, Laure Guillou, Christelle Desnues, B. La Scola, J. Bou Khalil, J. de Lorgeril, G. Mitta, Y. Gueguen, Jean-Michel Escoubas
- article
- Animal Microbiome, 2020, 2 (1), pp.12. ⟨10.1186/s42523-020-00032-w⟩
- identifiant
- hal-02563300
- DOI
- DOI : 10.1186/s42523-020-00032-w
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Archaea, specific genetic traits, and development of improved bacterial live biotherapeutic products: another face of next-generation probiotics
- auteur
- Khaled Fadhlaoui, Marie-Edith Arnal, Matthieu Martineau, Paméla Camponova, Bernard Ollivier, Paul O'Toole, Jean-François Brugère
- article
- Applied Microbiology and Biotechnology, 2020, 104 (11), pp.4705-4716. ⟨10.1007/s00253-020-10599-8⟩
- identifiant
- hal-02996543
- DOI
- DOI : 10.1007/s00253-020-10599-8
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Correlations between microbial population dynamics, bamA gene abundance and performance of anaerobic sequencing batch reactor (ASBR) treating increasing concentrations of phenol
- auteur
- Oscar Franchi, Léa Cabrol, Rolando Chamy, Francisca Rosenkranz
- article
- Journal of Biotechnology, 2020, 310, pp.40-48. ⟨10.1016/j.jbiotec.2020.01.010⟩
- identifiant
- hal-03147119
- DOI
- DOI : 10.1016/j.jbiotec.2020.01.010
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Comparative Genomics Unveils Regionalized Evolution of the Faustovirus Genomes
- auteur
- Khalil Geballa-Koukoulas, Hadjer Boudjemaa, Julien Andreani, Bernard Scola, Guillaume Blanc
- article
- Viruses, 2020, 12 (5), pp.577. ⟨10.3390/v12050577⟩
- identifiant
- hal-02639526
- DOI
- DOI : 10.3390/v12050577
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Long-term monitoring emphasizes impacts of the dredging on dissolved Cu and Pb contamination along with ultraplankton distribution and structure in Toulon Bay (NW Mediterranean Sea, France)
- auteur
- N. Layglon, Benjamin Misson, Gaël Durieu, Clément Coclet, Sébastien d'Onofrio, Duc Huy Dang, David François, Jean-Ulrich Mullot, Stéphane Mounier, Véronique Lenoble, Dario Omanović, Cédric Garnier
- article
- Marine Pollution Bulletin, 2020, 156, pp.111196. ⟨10.1016/j.marpolbul.2020.111196⟩
- identifiant
- hal-02571468
- DOI
- DOI : 10.1016/j.marpolbul.2020.111196
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Have decades of abiotic studies in sediments been misinterpreted?
- auteur
- N. Layglon, Benjamin Misson, Stéphane Mounier, Véronique Lenoble, Dario Omanović, Cédric Garnier
- article
- Science of the Total Environment, 2020, 707, pp.135949. ⟨10.1016/j.scitotenv.2019.135949⟩
- identifiant
- hal-02409414
- DOI
- DOI : 10.1016/j.scitotenv.2019.135949
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- In situ observations and modelling revealed environmental factors favouring occurrence of Vibrio in microbiome of the pelagic Sargassum responsible for strandings
- auteur
- Valerie Michotey, Aurelie Blanfuné, Cristele Chevalier, Marc Garel, Frédéric Diaz, Léo Berline, Louis Le Grand, Fabrice Armougom, Sophie Guasco, Sandrine Ruitton, T. Changeux, Bruno Belloni, Jean Blanchot, Frédéric Ménard, Thierry Thibaut
- article
- Science of the Total Environment, 2020, 748, pp.141216. ⟨10.1016/j.scitotenv.2020.141216⟩
- identifiant
- hal-02933822
- DOI
- DOI : 10.1016/j.scitotenv.2020.141216
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- A Multi-Omics Analysis Suggests Links Between the Differentiated Surface Metabolome and Epiphytic Microbiota Along the Thallus of a Mediterranean Seaweed Holobiont
- auteur
- Benoît Paix, Nathan Carriot, Raphaëlle Barry-Martinet, Stephane Greff, Benjamin Misson, Jean-François Briand, Gérald Culioli
- article
- Frontiers in Microbiology, 2020, 11, pp.494. ⟨10.3389/fmicb.2020.00494⟩
- identifiant
- hal-02519482
- DOI
- DOI : 10.3389/fmicb.2020.00494
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Desulfobotulus mexicanus sp. nov., a novel sulfate-reducing bacterium isolated from the sediment of an alkaline crater lake in Mexico
- auteur
- Maria Fernanda Pérez-Bernal, Elcia Margareth Souza Brito, Manon Bartoli, Johanne Aubé, Bernard Ollivier, Remy Guyoneaud, Agnès Hirschler-Réa
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2020, 70 (5), pp.3219-3225. ⟨10.1099/ijsem.0.004159⟩
- identifiant
- hal-02860502
- DOI
- DOI : 10.1099/ijsem.0.004159
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- CHLSOC: the Chilean Soil Organic Carbon database, a multi-institutional collaborative effort
- auteur
- Marco Pfeiffer, José Padarian, Rodrigo Osorio, Nelson Bustamante, Guillermo Federico Olmedo, Mario Guevara, Felipe Aburto, Francisco Albornoz, Monica Antilén, Elías Araya, Eduardo Arellano, Maialen Barret, Juan Barrera, Pascal Boeckx, Margarita Briceño, Sally Bunning, Léa Cabrol, Manuel Casanova, Pablo Cornejo, Fabio Corradini, Gustavo Curaqueo, Sebastian Doetterl, Paola Duran, Mauricio Escudey, Angelina Espinoza, Samuel Francke, Juan Pablo Fuentes, Marcel Fuentes, Gonzalo Gajardo, Rafael García, Audrey Gallaud, Mauricio Galleguillos, Andrés Gomez, Marcela Hidalgo, Jorge Ivelic-Sáez, Lwando Mashalaba, Francisco Matus, Francisco Meza, Maria de La Luz Mora, Jorge Mora, Cristina Muñoz, Pablo Norambuena, Carolina Olivera, Carlos Ovalle, Marcelo Panichini, Aníbal Pauchard, Jorge Pérez-Quezada, Sergio Radic, José Ramirez, Nicolás Riveras, Germán Ruiz, Osvaldo Salazar, Iván Salgado, Oscar Seguel, Maria Sepúlveda, Carlos Sierra, Yasna Tapia, Francisco Tapia, Balfredo Toledo, José Miguel Torrico, Susana Valle, Ronald Vargas, Michael Wolff, Erick Zagal
- article
- Earth System Science Data, 2020, 12 (1), pp.457-468. ⟨10.5194/essd-12-457-2020⟩
- identifiant
- hal-03147125
- DOI
- DOI : 10.5194/essd-12-457-2020
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Production of Current by Syntrophy Between Exoelectrogenic and Fermentative Hyperthermophilic Microorganisms in Heterotrophic Biofilm from a Deep-Sea Hydrothermal Chimney
- auteur
- Guillaume Pillot, Sylvain Davidson, Richard Auria, Yannick Combet-Blanc, Anne Godfroy, Pierre-Pol Liebgott
- article
- Microbial ecology, 2020, 79 (1), pp.38-49. ⟨10.1007/s00248-019-01381-z⟩
- identifiant
- hal-02962527
- DOI
- DOI : 10.1007/s00248-019-01381-z
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Dissolved organic matter controls of arsenic bioavailability to bacteria
- auteur
- Martin Pothier, Véronique Lenoble, Cédric Garnier, Benjamin Misson, Charlotte Rentmeister, Alexandre Poulain
- article
- Science of the Total Environment, 2020, 716, pp.137118. ⟨10.1016/j.scitotenv.2020.137118⟩
- identifiant
- hal-03027565
- DOI
- DOI : 10.1016/j.scitotenv.2020.137118
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Anaerohalosphaera lusitana gen. nov., sp. nov., and Limihaloglobus sulfuriphilus gen. nov., sp. nov., isolated from solar saltern sediments, and proposal of Anaerohalosphaeraceae fam. nov. within the order Sedimentisphaerales
- auteur
- Nathalie Pradel, Marie-Laure Fardeau, Brian Tindall, Stefan Spring
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, In press, ⟨10.1099/ijsem.0.003919⟩
- identifiant
- hal-02462868
- DOI
- DOI : 10.1099/ijsem.0.003919
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Prokaryotic Diversity and Distribution Along Physical and Nutrient Gradients in the Tunisian Coastal Waters (South Mediterranean Sea)
- auteur
- Marianne Quemeneur, Malika Bel Hassen, Fabrice Armougom, Yosra Khammeri, Rim Lajnef, Amel Bellaaj-Zouari
- article
- Frontiers in Microbiology, 2020, 11, ⟨10.3389/fmicb.2020.593540⟩
- identifiant
- hal-03033038
- DOI
- DOI : 10.3389/fmicb.2020.593540
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Impact of cigarette butts on microbial diversity and dissolved trace metals in coastal marine sediment
- auteur
- Marianne Quemeneur, Sandrine Chifflet, Fourat Akrout, Amel Bellaaj-Zouari, Malika Belhassen
- article
- Estuarine, Coastal and Shelf Science, 2020, 240, pp.106785. ⟨10.1016/j.ecss.2020.106785⟩
- identifiant
- hal-02881380
- DOI
- DOI : 10.1016/j.ecss.2020.106785
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Responses to the Hydrostatic Pressure of Surface and Subsurface Strains of Pseudothermotoga elfii Revealing the Piezophilic Nature of the Strain Originating From an Oil-Producing Well
- auteur
- Marie Roumagnac, Nathalie Pradel, Manon Bartoli, Marc Garel, Aaron Jones, Fabrice Armougom, Romain Fenouil, Christian Tamburini, Bernard Ollivier, Zarath Summers, Alain Dolla
- article
- Frontiers in Microbiology, 2020, 11, ⟨10.3389/fmicb.2020.588771⟩
- identifiant
- hal-03152104
- DOI
- DOI : 10.3389/fmicb.2020.588771
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Characterization of the Gut Microbiota of the Antarctic Heart Urchin (Spatangoida) Abatus agassizii
- auteur
- Guillaume Schwob, Léa Cabrol, Elie Poulin, Julieta Orlando
- article
- Frontiers in Microbiology, 2020, 11, ⟨10.3389/fmicb.2020.00308⟩
- identifiant
- hal-03147115
- DOI
- DOI : 10.3389/fmicb.2020.00308
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Glacial ecosystems are essential to understanding biodiversity responses to glacier retreat
- auteur
- Marek Stibal, James Bradley, Arwyn Edwards, Scott Hotaling, Krzysztof Zawierucha, Jørgen Rosvold, Stefanie Lutz, Karen Cameron, Jill Mikucki, Tyler Kohler, Marie Šabacká, Alexandre Anesio
- article
- Nature Ecology & Evolution, 2020, 4 (5), pp.686-687. ⟨10.1038/s41559-020-1163-0⟩
- identifiant
- hal-04450517
- DOI
- DOI : 10.1038/s41559-020-1163-0
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- A novel Thermotoga strain TFO isolated from a Californian petroleum reservoir phylogenetically related to Thermotoga petrophila and T. naphthophila, two thermophilic anaerobic isolates from a Japanese reservoir: Taxonomic and genomic considerations
- auteur
- Zara M Summers, Hassiba Belahbib, Nathalie Pradel, Manon Bartoli, Pooja Mishra, Christian Tamburini, Alain Dolla, Bernard Ollivier, Fabrice Armougom
- article
- Systematic and Applied Microbiology, 2020, 43 (6), pp.126132. ⟨10.1016/j.syapm.2020.126132⟩
- identifiant
- hal-03007670
- DOI
- DOI : 10.1016/j.syapm.2020.126132
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Tara Oceans: towards global ocean ecosystems biology
- auteur
- Shinichi Sunagawa, Silvia Acinas, Peer Bork, Chris Bowler, Silvia Acinas, Marcel Babin, Peer Bork, Emmanuel Boss, Chris Bowler, Guy Cochrane, Colomban de Vargas, Michael Follows, Gabriel Gorsky, Nigel Grimsley, Lionel Guidi, Pascal Hingamp, Daniele Iudicone, Olivier Jaillon, Stefanie Kandels, Lee Karp-Boss, Eric Karsenti, Magali Lescot, Fabrice Not, Hiroyuki Ogata, Stéphane Pesant, Nicole Poulton, Jeroen Raes, Christian Sardet, Mike Sieracki, Sabrina Speich, Lars Stemmann, Matthew Sullivan, Shinichi Sunagawa, Patrick Wincker, Damien Eveillard, Gabriel Gorsky, Lionel Guidi, Daniele Iudicone, Eric Karsenti, Fabien Lombard, Hiroyuki Ogata, Stephane Pesant, Matthew Sullivan, Patrick Wincker, Colomban de Vargas
- article
- Nature Reviews Microbiology, 2020, 18 (8), pp.428-445. ⟨10.1038/s41579-020-0364-5⟩
- identifiant
- hal-04394809
- DOI
- DOI : 10.1038/s41579-020-0364-5
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Reviews and syntheses: Bacterial bioluminescence – ecology and impact in the biological carbon pump
- auteur
- Lisa Tanet, Severine Martini, Laurie Casalot, Christian Tamburini
- article
- Biogeosciences, 2020, 17 (14), pp.3757-3778. ⟨10.5194/bg-17-3757-2020⟩
- identifiant
- hal-02901948
- DOI
- DOI : 10.5194/bg-17-3757-2020
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Sub-oxycline methane oxidation can fully uptake CH4 produced in sediments: case study of a lake in Siberia
- auteur
- Frédéric Thalasso, Armando Sepulveda-Jauregui, Laure Gandois, Karla Martinez-Cruz, Oscar Gerardo-Nieto, María Astorga-España, Roman Teisserenc, Céline Lavergne, Nikita Tananaev, Maialen Barret, Léa Cabrol
- article
- Scientific Reports, 2020, 10 (1), ⟨10.1038/s41598-020-60394-8⟩
- identifiant
- hal-03147113
- DOI
- DOI : 10.1038/s41598-020-60394-8
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Impact of the microbial inoculum source on pre-treatment efficiency for fermentative H2 production from glycerol
- auteur
- Javiera Toledo-Alarcón, Léa Cabrol, David Jeison, Eric Trably, Jean-Philippe Steyer, Estela Tapia-Venegas
- article
- International Journal of Hydrogen Energy, 2020, 45 (3), pp.1597-1607. ⟨10.1016/j.ijhydene.2019.11.113⟩
- identifiant
- hal-02531470
- DOI
- DOI : 10.1016/j.ijhydene.2019.11.113
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Oxygen and light determine the pathways of nitrate reduction in a highly saline lake
- auteur
- Nicolás Valiente, Franz Jirsa, Thomas Hein, Wolfgang Wanek, Patricia Bonin, Juan José Gómez-Alday
- article
- Biogeosciences, 2020, ⟨10.5194/bg-2020-20⟩
- identifiant
- hal-03022672
- DOI
- DOI : 10.5194/bg-2020-20
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Diversity and evolution of bacterial bioluminescence genes in the global ocean
- auteur
- Thomas Vannier, Pascal Hingamp, Floriane Turrel, Lisa Tanet, Magali Lescot, Y. Timsit
- article
- NAR Genomics and Bioinformatics, 2020, 2 (2), ⟨10.1093/nargab/lqaa018⟩
- identifiant
- hal-02514159
- DOI
- DOI : 10.1093/nargab/lqaa018
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Widespread microbial mercury methylation genes in the global ocean
- auteur
- Emilie Villar, Léa Cabrol, Lars-Eric Heimbürger-Boavida
- article
- Environmental Microbiology Reports, 2020, 12 (3), pp.277-287. ⟨10.1111/1758-2229.12829⟩
- identifiant
- hal-02935272
- DOI
- DOI : 10.1111/1758-2229.12829
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Conference papers
- titre
- Oil Spill response in mangroves: why a specific Ecosystem-based Management is required?
- auteur
- Philippe Cuny, Ronan Jézéquel, Emma Michaud, Lea Sylvi, Cécile Militon
- article
- International Workshop on Ecosystem-based Management, Feb 2020, Marseille, France
- identifiant
- hal-03096700
- Accès au bibtex
-
Book sections
-

- titre
- Drivers of change
- auteur
- Semia Cherif, Enrique Doblas-Miranda, Piero Lionello, Carlos Borrego, Filippo Giorgi, Gil Rilov, Ana Iglesias, Sihem Jebari, Ezzeddine Mahmoudi, Marco Moriondo, Olivier Pringault, S Somot, Athanassios Tsikliras, Montserrat Vilà, George Zittis
- article
- [Cramer W; Guiot J; Marini K (eds.)]. Climate and Environmental Change in the Mediterranean Basin – Current Situation and Risks for the Future. First Mediterranean Assessment Report, pp.59-180, 2020, 978-2-9577416-0-1. ⟨10.5281/zenodo.7100601⟩
- identifiant
- hal-03210029
- DOI
- DOI : 10.5281/zenodo.7100601
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Un risque littoral avéré non représenté : la pollution par les hydrocarbures pétroliers
- auteur
- Cristele Chevalier, Philippe Cuny, Valérie Morel
- article
- Atlas critique de la Guyane, , pp.302-303, 2020, 978-2-271-13213-0
- identifiant
- hal-02968133
- Accès au bibtex
-
Preprints, Working Papers, ...
- titre
- On the barium-oxygen consumption relationship in the Mediterranean Sea: implications for mesopelagic marine snow remineralisation
- auteur
- Stéphanie Jacquet, Dominique Lefèvre, Christian Tamburini, Marc Garel, Frédéric A.C. Le Moigne, Nagib Bhairy, Marie Roumagnac, Sophie Guasco
- article
- 2020
- identifiant
- hal-02960676
- DOI
- DOI : 10.5194/bg-2020-241
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Electrotrophy as potential primary metabolism for colonization of conductive surfaces in deep-sea hydrothermal chimneys
- auteur
- Guillaume Pillot, Sylvain Davidson, Laetitia Shintu, Oulfat Amin, Anne Godfroy, Yannick Combet-Blanc, Patricia Bonin, Pierre-Pol Liebgott
- article
- 2020
- identifiant
- hal-03022667
- DOI
- DOI : 10.1101/2020.11.11.377697
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2019
Journal articles
-

- titre
- The lichen symbiosis re-viewed through the genomes of Cladonia grayi and its algal partner Asterochloris glomerata
- auteur
- Daniele Armaleo, Olaf Müller, François Lutzoni, Guillaume Blanc, Helge B Bode, Frank R Collart, Francesco Dal Grande, Fred Dietrich, Igor V Grigoriev, Suzanne Joneson, Alan Kuo, Peter Gorm Larsen, John M Logsdon, David López, Francis Martin, Susan P May, Tami R Mcdonald, Sabeeha S Merchant, Vivian Miao, Emmanuelle Morin, Ryoko Oono, Matteo Pellegrini, Nimrod Rubinstein, Maria Virginia Sanchez-Puerta, Elizabeth Savelkoul, Imke Schmitt, Jason C Slot, Darren Soanes, Péter Szövényi, Nicholas J Talbot, Claire Veneault-Fourrey, Basil B Xavier
- article
- BMC Genomics, 2019, 20 (1), pp.605. ⟨10.1186/s12864-019-5629-x⟩
- identifiant
- hal-02192633
- DOI
- DOI : 10.1186/s12864-019-5629-x
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Towards Integrating Evolution, Metabolism, and Climate Change Studies of Marine Ecosystems
- auteur
- Federico Baltar, Barbara Bayer, Nina Bednarsek, Stacy Deppeler, Ruben Escribano, Carolina Gonzalez, Roberta Hansman, Rajani Kanta Mishra, Mary Ann Moran, Daniel Repeta, Carol Robinson, Eva Sintes, Christian Tamburini, Luis Valentin, Gerhard Herndl
- article
- Trends in Ecology & Evolution, 2019, 34 (11), pp.1022-1033. ⟨10.1016/J.TREE.2019.07.003⟩
- identifiant
- hal-02989907
- DOI
- DOI : 10.1016/J.TREE.2019.07.003
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Seasonal changes of chemical contamination in coastal waters during sediment resuspension
- auteur
- Chrystelle Bancon-Montigny, Catherine Gonzalez, Sophie Delpoux, Murielle Avezac, Sylvie Spinelli, Takoua Mhadhbi, Kaouther Mejri, Asma Sakka Hlaili, Olivier Pringault
- article
- Chemosphere, 2019, 235, pp.651-661. ⟨10.1016/j.chemosphere.2019.06.213⟩
- identifiant
- hal-02192471
- DOI
- DOI : 10.1016/j.chemosphere.2019.06.213
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Enhancement of biotic degradation of terrestrial particulate organic matter in an estuarine salinity gradient: Interactive effects of organic matter pools and changes of bacterial communities.
- auteur
- Patricia Bonin, Anne-Hélène Prime, Mairie-Aimée Galeron, Sophie Guasco, Jean-Francois Rontani
- article
- Aquatic Microbial Ecology, 2019, 83 (2), pp.147 - 159. ⟨10.3354/ame01908⟩
- identifiant
- hal-03019979
- DOI
- DOI : 10.3354/ame01908
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Community‐Level Responses to Iron Availability in Open Ocean Plankton Ecosystems
- auteur
- Luigi Caputi, Quentin Carradec, Damien Eveillard, Amos Kirilovsky, Eric Pelletier, Juan Pierella Karlusich, Fabio Rocha Jimenez Vieira, Emilie Villar, Samuel Chaffron, Shruti Malviya, Eleonora Scalco, Silvia G Acinas, Adriana A. Alberti, Jean Marc Aury, Anne-Sophie Benoiston, Alexis Bertrand, Tristan Biard, Lucie Bittner, Martine Boccara, Jennifer R. Brum, Christophe Brunet, Greta Busseni, Anna Carratalà, Hervé Claustre, Luis Pedro Coelho, Sébastien Colin, Salvatore d'Aniello, Corinne da Silva, Marianna del Core, Hugo Doré, Stéphane Gasparini, Florian Kokoszka, Jean-Louis Jamet, Christophe Lejeusne, Cyrille Lepoivre, Magali Lescot, Gipsi Lima-Mendez, Fabien Lombard, Julius Lukeš, Nicolas Maillet, Mohammed-Amin Madoui, Elodie Martinez, Maria Grazia Mazzocchi, Mario B Néou, Javier Paz-Yepes, Julie Poulain, Simon Ramondenc, Jean-Baptiste Romagnan, Simon Roux, Daniela Salvagio Manta, Remo Sanges, Sabrina Speich, Mario Sprovieri, Shinichi Sunagawa, Vincent Taillandier, Atsuko Tanaka, Leila Tirichine, Camille Trottier, Julia Uitz, Alaguraj Veluchamy, Jana Veselá, Flora Vincent, Sheree Yau, Stefanie Kandels-Lewis, Sarah Searson, Céline Dimier, Marc Picheral, Peer Bork, Emmanuel Boss, Colomban de Vargas, Michael Follows, Nigel Grimsley, Lionel Guidi, Pascal Hingamp, Eric Karsenti, Paolo Sordino, Lars Stemmann, Matthew B. Sullivan, Alessandro Tagliabue, Adriana Zingone, Laurence Garczarek, Fabrizio d'Ortenzio, Pierre Testor, Fabrice Not, Maurizio Ribera d'Alcalà, Patrick Wincker, Gabriel Gorsky, Olivier Jaillon, Lee Karp-Boss, Uros Krzic, Hiroyuki Ogata, Stéphane Pesant, Jeroen Raes, Emmanuel G Reynaud, Christian Sardet, Mike Sieracki, Didier Velayoudon, Jean Weissenbach, Chris Bowler, Daniele Iudicone
- article
- Global Biogeochemical Cycles, 2019, 33 (3), pp.391-419. ⟨10.1029/2018GB006022⟩
- identifiant
- hal-02999805
- DOI
- DOI : 10.1029/2018GB006022
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Shear Stress as a Major Driver of Marine Biofilm Communities in the NW Mediterranean Sea
- auteur
- Elisa C P Catão, Thomas Pollet, Benjamin Misson, Cédric Garnier, Jean-François Ghiglione, Raphaëlle Barry-Martinet, Marine Maintenay, Christine Bressy, Jean-François Briand
- article
- Frontiers in Microbiology, 2019, ⟨10.3389/fmicb.2019.01768⟩
- identifiant
- hal-02269986
- DOI
- DOI : 10.3389/fmicb.2019.01768
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Halanaerobaculum
- auteur
- Jean Luc Cayol
- article
- Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria (BMSAB), 2019, 1, ⟨10.1002/9781118960608.gbm01725⟩
- identifiant
- hal-02883868
- DOI
- DOI : 10.1002/9781118960608.gbm01725
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- In silico prediction of the secretome from the invasive neurotoxic marine dinoflagellate Alexandrium catenella
- auteur
- Cherif Chetouhi, Mohammed Laabir, Estelle Masseret, Natacha Jean
- article
- Environmental Microbiology Reports, 2019, 11 (4), pp.571--580. ⟨10.1111/1758-2229.12764⟩
- identifiant
- hal-02403261
- DOI
- DOI : 10.1111/1758-2229.12764
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Impact of sterilization methods on dissolved trace metals concentrations in complex natural samples: optimization of UV irradiation
- auteur
- Sandrine Chifflet, Marianne Quemeneur, Aude Barani, Bernard Angeletti, Morgane Didry, Gérald Grégori, Nathalie Pradel
- article
- MethodsX, 2019, 6, pp.1133-1146. ⟨10.1016/j.mex.2019.04.020⟩
- identifiant
- hal-02128494
- DOI
- DOI : 10.1016/j.mex.2019.04.020
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Dynamics of trace metals in a shallow coastal ecosystem : insights from the Gulf of Gabès (southern Mediterranean Sea)
- auteur
- Sandrine Chifflet, Marc Tedetti, Hana Zouch, Rania Fourati, Hatem Zaghden, Boubaker Elleuch, Marianne Quemeneur, Fatma Karray, Sami Sayadi
- article
- Aims Environmental Science, 2019, 6 (4), pp.277-297. ⟨10.3934/environsci.2019.4.277⟩
- identifiant
- hal-02184270
- DOI
- DOI : 10.3934/environsci.2019.4.277
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Changes in Bacterioplankton Communities Resulting From Direct and Indirect Interactions With Trace Metal Gradients in an Urbanized Marine Coastal Area
- auteur
- Clément Coclet, Cédric Garnier, Gaël Durrieu, Dario Omanović, Sébastien d'Onofrio, Christophe Le Poupon, Jean-Ulrich Mullot, Jean-François Briand, Benjamin Misson
- article
- Frontiers in Microbiology, 2019, 10, ⟨10.3389/fmicb.2019.00257⟩
- identifiant
- hal-02049263
- DOI
- DOI : 10.3389/fmicb.2019.00257
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Seasonal and plant-part isotopic and biochemical variation in Posidonia oceanica
- auteur
- Pierre Cresson, Charles-François Boudouresque, Sandrine Ruitton, Laurie Casalot, Marc Verlaque, Mireille Harmelin-Vivien
- article
- Mediterranean Marine Science, 2019, 20 (2), pp.357. ⟨10.12681/mms.18660⟩
- identifiant
- hal-02458445
- DOI
- DOI : 10.12681/mms.18660
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Global phylogeography and ancient evolution of the widespread human gut virus crAssphage
- auteur
- Robert Edwards, Alejandro Vega, Holly Norman, Maria Ohaeri, Kyle Levi, Elizabeth Dinsdale, Ondrej Cinek, Ramy Aziz, Katelyn Mcnair, Jeremy Barr, Kyle Bibby, Stan Brouns, Adrian Cazares, Patrick de Jonge, Christelle Desnues, Samuel Díaz Muñoz, Peter Fineran, Alexander Kurilshikov, Rob Lavigne, Karla Mazankova, David Mccarthy, Franklin Nobrega, Alejandro Reyes Muñoz, German Tapia, Nicole Trefault, Alexander Tyakht, Pablo Vinuesa, Jeroen Wagemans, Alexandra Zhernakova, Frank Aarestrup, Gunduz Ahmadov, Abeer Alassaf, Josefa Anton, Abigail Asangba, Emma Billings, Adrian Cantu, Jane Carlton, Daniel Cazares, Gyu-Sung Cho, Tess Condeff, Pilar Cortés, Mike Cranfield, Daniel Cuevas, Rodrigo de La Iglesia, Przemyslaw Decewicz, Michael Doane, Nathaniel Dominy, Lukasz Dziewit, Bashir Mukhtar Elwasila, A. Murat Eren, Charles M. A. P. Franz, Jingyuan Fu, Cristina Garcia-Aljaro, Elodie Ghedin, Kristen Gulino, John Haggerty, Steven Head, Rene S Hendriksen, Colin Hill, Heikki Hyöty, Elena Ilina, Mitchell Irwin, Thomas Jeffries, Juan Jofre, Randall Junge, Scott Kelley, Mohammadali Khan Mirzaei, Martin Kowalewski, Deepak Kumaresan, Steven Leigh, David Lipson, Eugenia Lisitsyna, Montserrat Llagostera, Julia Maritz, Linsey Marr, Angela Mccann, Shahar Molshanski-Mor, Sílvia Monteiro, Benjamin Moreira-Grez, Megan Morris, Lawrence Mugisha, Maite Muniesa, Horst H. Neve, Nam-Phuong Nguyen, Olivia Nigro, Anders Nilsson, Taylor O’connell, Rasha Odeh, Andrew Oliver, Maria Piuri, Aaron Prussin Ii, Udi Qimron, Zhe-Xue Quan, Petra Rainetova, Adán Ramírez-Rojas, Raul Raya, Kim Reasor, Gillian Rice, Alessandro Rossi, Ricardo Santos, John Shimashita, Elyse Stachler, Lars Stene, Ronan Strain, Rebecca Stumpf, Pedro Torres, Alan Twaddle, Maryann Ugochi Ibekwe, Nicolás Villagra, Stephen Wandro, Bryan White, Andy White, Katrine White, Cisca Wijmenga, Maria Zambrano, Henrike Zschach, Bas E Dutilh
- article
- Nature Microbiology, 2019, 4, pp.1727-1736. ⟨10.1038/s41564-019-0494-6⟩
- identifiant
- hal-02195894
- DOI
- DOI : 10.1038/s41564-019-0494-6
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Methanocalculus
- auteur
- Marie-Laure Fardeau, Jean-Luc Cayol, Bernard Ollivier
- article
- Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria (BMSAB), 2019, ⟨10.1002/9781118960608.gbm00512.pub2⟩
- identifiant
- hal-02883889
- DOI
- DOI : 10.1002/9781118960608.gbm00512.pub2
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Fonticella
- auteur
- Marie Laure Fardeau, Anne Postec, Bernard Ollivier
- article
- Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria (BMSAB), 2019, 1, ⟨10.1002/9781118960608.gbm01633⟩
- identifiant
- hal-02884215
- DOI
- DOI : 10.1002/9781118960608.gbm01633
- Accès au bibtex
-
- titre
- Anaerosalibacter
- auteur
- Marie Laure Fardeau, Jean-Luc Cayol, Bernard Ollivier
- article
- Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria (BMSAB), 2019, 1, ⟨10.1002/9781118960608.gbm01397⟩
- identifiant
- hal-02884004
- DOI
- DOI : 10.1002/9781118960608.gbm01397
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Genus Paludifilum
- auteur
- Marie-Laure Fardeau, Jean-Luc Cayol, Bernard Ollivier
- article
- Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria (BMSAB), 2019, ⟨10.1002/9781118960608.gbm01628⟩
- identifiant
- hal-02883924
- DOI
- DOI : 10.1002/9781118960608.gbm01628
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Metabolomic and proteomic changes induced by growth inhibitory concentrations of copper in the biofilm-forming marine bacterium Pseudoalteromonas lipolytica
- auteur
- Laurie Favre, Annick Ortalo-Magné, Lionel Kerloch, Carole Pichereaux, Benjamin Misson, Jean-François Briand, Cédric Garnier, Gérald Culioli
- article
- Metallomics, 2019, 11 (11), pp.1887-1899. ⟨10.1039/C9MT00184K⟩
- identifiant
- hal-02435001
- DOI
- DOI : 10.1039/C9MT00184K
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Evidence of high N2 fixation rates in the temperate northeast Atlantic
- auteur
- Debany Fonseca-Batista, Xuefeng Li, Virginie Riou, Valerie Michotey, Florian Deman, François Fripiat, Sophie Guasco, Natacha Brion, Nolwenn Lemaitre, Manon Tonnard, Morgane Gallinari, Hélène Planquette, Frédéric Planchon, Géraldine Sarthou, Marc Elskens, Julie Laroche, Lei Chou, Frank Dehairs
- article
- Biogeosciences, 2019, 16 (5), pp.999-1017. ⟨10.5194/bg-16-999-2019⟩
- identifiant
- hal-02066554
- DOI
- DOI : 10.5194/bg-16-999-2019
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- A Novel Highly Efficient Device for Growing Micro-Aerophilic Microorganisms
- auteur
- Maxime Fuduche, Sylvain Davidson, Celine Boileau, Long-Fei Wu, Yannick Combet-Blanc
- article
- Frontiers in Microbiology, 2019, 10, ⟨10.3389/fmicb.2019.00534⟩
- identifiant
- hal-02237351
- DOI
- DOI : 10.3389/fmicb.2019.00534
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Crassaminicella
- auteur
- Gregoire Gales, Anne Postec, Jean Luc Cayol
- article
- Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria (BMSAB), 2019, 1, ⟨10.1002/9781118960608.gbm01636⟩
- identifiant
- hal-02884038
- DOI
- DOI : 10.1002/9781118960608.gbm01636
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Pressure-Retaining Sampler and High-Pressure Systems to Study Deep-Sea Microbes Under in situ Conditions
- auteur
- Marc Garel, Patricia Bonin, Severine Martini, Sophie Guasco, Marie Roumagnac, Nagib Bhairy, Fabrice Armougom, Christian Tamburini
- article
- Frontiers in Microbiology, 2019, 10, pp.453. ⟨10.3389/fmicb.2019.00453⟩
- identifiant
- hal-02094373
- DOI
- DOI : 10.3389/fmicb.2019.00453
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Effects of catchment area and nutrient deposition regime on phytoplankton functionality in alpine lakes
- auteur
- Coralie Jacquemin, Céline Bertrand, Evelyne Franquet, Stéphane Mounier, Benjamin Misson, Benjamin Oursel, Laurent Cavalli
- article
- Science of the Total Environment, 2019, 674, pp.114-127. ⟨10.1016/j.scitotenv.2019.04.117⟩
- identifiant
- hal-02176058
- DOI
- DOI : 10.1016/j.scitotenv.2019.04.117
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Microbial and chemical investigation of 2000 m deep Triassic rock (Meuse/Haute Marne, France)
- auteur
- Vanessa Leblanc, Jennifer Hellal, Marie Laure Fardeau, Saber Khelaifia, Claire Sergeant, Françis Garrido, Bernard Ollivier, Catherine Joulian
- article
- Geosciences, 2019, 9 (1), pp.3. ⟨10.3390/geosciences9010003⟩
- identifiant
- in2p3-02362139
- DOI
- DOI : 10.3390/geosciences9010003
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Consequences of a contaminant mixture of bisphenol A (BPA) and di-(2-ethylhexyl) phthalate (DEHP), two plastic-derived chemicals, on the diversity of coastal phytoplankton
- auteur
- Charaf M’ Rabet, Ons Kéfi-Daly Yahia, Douglas Couet, Sonia Khadija Maïté Gueroun, Olivier Pringault
- article
- Marine Pollution Bulletin, 2019, 138 (1), pp.385-396. ⟨10.1016/j.marpolbul.2018.11.035⟩
- identifiant
- ird-02048491
- DOI
- DOI : 10.1016/j.marpolbul.2018.11.035
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Microbial abundance, activity and population genomic profiling with mOTUs2
- auteur
- Alessio Milanese, Daniel Mende, Lucas Paoli, Guillem Salazar, Hans-Joachim Ruscheweyh, Miguelangel Cuenca, Pascal Hingamp, Renato Alves, Paul Costea, Luis Pedro Coelho, Thomas Schmidt, Alexandre Almeida, Alex Mitchell, Robert Finn, Jaime Huerta-Cepas, Peer Bork, Georg Zeller, Shinichi Sunagawa
- article
- Nature Communications, 2019, 10 (1), ⟨10.1038/s41467-019-08844-4⟩
- identifiant
- hal-02281129
- DOI
- DOI : 10.1038/s41467-019-08844-4
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Metagenomic Analysis of Microdissected Valvular Tissue for Etiologic Diagnosis of Blood Culture Negative Endocarditis
- auteur
- Matthieu Million, Maxime Gaudin, Clea Melenotte, Lionel Chasson, Sophie Edouard, Constance Verdonk, Elsa Prudent, Bernard Amphoux, Stéphane Meresse, Richard Dorent, Hubert Lepidi, Bernard La Scola, Jean-Pierre Gorvel, Christelle Desnues, Didier Raoult
- article
- Clinical Infectious Diseases, 2019, 70 (11), ⟨10.1093/cid/ciz655⟩
- identifiant
- hal-02195898
- DOI
- DOI : 10.1093/cid/ciz655
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- From In Situ to satellite observations of pelagic Sargassum distribution and aggregation in the Tropical North Atlantic Ocean
- auteur
- Anouck Ody, Thierry Thibaut, L. Berline, T. Changeux, Jean-Michel André, Cristele Chevalier, Aurelie Blanfuné, Jean Blanchot, Sandrine Ruitton, Valérie Stiger-Pouvreau, Solène Connan, Jacques Grelet, D. Aurelle, Mathilde Guéné, Hubert Bataille, Celine Bachelier, Dorian Guillemain, Natascha Schmidt, Vincent Fauvelle, Sophie Guasco, Frédéric Ménard
- article
- PLoS ONE, 2019, 14 (9), pp.e0222584. ⟨10.1371/journal.pone.0222584⟩
- identifiant
- hal-02291680
- DOI
- DOI : 10.1371/journal.pone.0222584
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- The bacterial MrpORP is a novel Mrp/NBP35 protein involved in iron-sulfur biogenesis
- auteur
- Romain Pardoux, Anouchka Fiévet, Cíntia Carreira, Céline Brochier-Armanet, Odile Valette, Zorah Dermoun, Beatrice Py, Alain Dolla, Sofia Pauleta, Corinne Aubert
- article
- Scientific Reports, 2019, 9 (1), pp.360-373. ⟨10.1038/s41598-018-37021-8⟩
- identifiant
- hal-02186929
- DOI
- DOI : 10.1038/s41598-018-37021-8
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Direct and indirect impact of the bacterial strain Pseudomonas aeruginosa on the dissolution of synthetic Fe(III)- and Fe(II)-bearing basaltic glasses
- auteur
- Anne Perez, Stéphanie Rossano, Nicolas Trcera, Aurélie Verney-Carron, Céline Rommevaux, Chloé Fourdrin, Ana Carolina Agnello, David Huguenot, François Guyot
- article
- Chemical Geology, 2019, 523, pp.9-18. ⟨10.1016/j.chemgeo.2019.05.033⟩
- identifiant
- hal-02359923
- DOI
- DOI : 10.1016/j.chemgeo.2019.05.033
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Hydrostatic Pressure Helps to Cultivate an Original Anaerobic Bacterium From the Atlantis Massif Subseafloor (IODP Expedition 357): Petrocella atlantisensis gen. nov. sp. nov.
- auteur
- Marianne Quéméneur, Gaël Erauso, Eléonore E Frouin, Emna Zeghal, Céline Vandecasteele, Bernard Ollivier, Christian Tamburini, Marc Garel, Bénédicte Ménez, Anne Postec
- article
- Frontiers in Microbiology, 2019, 10, pp.1497. ⟨10.3389/fmicb.2019.01497⟩
- identifiant
- hal-02297216
- DOI
- DOI : 10.3389/fmicb.2019.01497
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Discovery and Further Studies on Giant Viruses at the IHU Mediterranee Infection That Modified the Perception of the Virosphere
- auteur
- Clara Rolland, Julien Andreani, Amina Louazani, Sarah Aherfi, Rania Francis, Rodrigo Rodrigues, Ludmila Silva, Dehia Sahmi, Said Mougari, Nisrine Chelkha, Meriem Bekliz, Lorena Silva, Felipe Assis, Fabio Dornas, Jacques Khalil, Isabelle Pagnier, Christelle Desnues, Anthony Levasseur, Philippe Colson, Jonatas Abrahao, Bernard Scola
- article
- Viruses, 2019, 11 (4), pp.312. ⟨10.3390/v11040312⟩
- identifiant
- hal-02094406
- DOI
- DOI : 10.3390/v11040312
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Prokaryote Communities at Active Chimney and In-Situ Colonization Devices after a Magmatic Degassing Event (37°N MAR, EMSO-Azores Deep-Sea Observatory)
- auteur
- Céline Rommevaux, Pauline A Henri, Jefferson Degboe, Valérie Chavagnac, Françoise A Lesongeur, Anne A Godfroy, Cédric Boulart, Christine Destrigneville, Alain Castillo
- article
- Geochemistry, Geophysics, Geosystems, 2019, ⟨10.1029/2018GC008107⟩
- identifiant
- hal-02142449
- DOI
- DOI : 10.1029/2018GC008107
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Minimum Information about an Uncultivated Virus Genome (MIUViG)
- auteur
- Simon Roux, Evelien M. Adriaenssens, Bas E. Dutilh, Eugene V. Koonin, Andrew M. Kropinski, Mart Krupovic, Jens H. Kuhn, Rob Lavigne, J. Rodney Brister, Arvind Varsani, Clara Amid, Ramy K. Aziz, Seth R. Bordenstein, Peer Bork, Mya Breitbart, Guy R. Cochrane, Rebecca A. Daly, Christelle Desnues, Melissa B. Duhaime, Joanne B. Emerson, François Enault, Jed A. Fuhrman, Pascal Hingamp, Philip Hugenholtz, Bonnie L. Hurwitz, Natalia N. Ivanova, Jessica M. Labonté, Kyung-Bum Lee, Rex R. Malmstrom, Manuel Martinez-Garcia, Ilene Karsch Mizrachi, Hiroyuki Ogata, David Páez-Espino, Marie-Agnès Petit, Catherine Putonti, Thomas Rattei, Alejandro Reyes, Francisco Rodriguez-Valera, Karyna Rosario, Lynn Schriml, Frederik Schulz, Grieg F. Steward, Matthew B. Sullivan, Shinichi Sunagawa, Curtis A. Suttle, Ben Temperton, Susannah G. Tringe, Rebecca Vega Thurber, Nicole S. Webster, Katrine L. Whiteson, Steven W. Wilhelm, K. Eric Wommack, Tanja Woyke, Kelly C. Wrighton, Pelin Yilmaz, Takashi Yoshida, Mark J. Young, Natalya Yutin, Lisa Zeigler Allen, Nikos C. Kyrpides, Emiley A. Eloe-Fadrosh
- article
- Nature Biotechnology, 2019, 37 (1), pp.29-37. ⟨10.1038/nbt.4306⟩
- identifiant
- pasteur-01977322
- DOI
- DOI : 10.1038/nbt.4306
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Dissecting the membrane lipid binding properties and lipase activity of Mycobacterium tuberculosis LipY domains
- auteur
- Pierre Santucci, Nabil Smichi, Sadia Diomandé, Isabelle Poncin, Vanessa Point, Hélène Gaussier, Jean-François Cavalier, Laurent Kremer, Stéphane Canaan
- article
- FEBS Journal, 2019, ⟨10.1111/febs.14864⟩
- identifiant
- hal-02137694
- DOI
- DOI : 10.1111/febs.14864
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Growth of an anaerobic sulfate-reducing bacterium sustained by oxygen respiratory energy conservation after O 2 -driven experimental evolution
- auteur
- Marine Schoeffler, Anne-Laure Gaudin, Fanny Ramel, Odile Valette, Yann Denis, Wagdi Ben Hania, Agnès Hirschler-Réa, Alain Dolla
- article
- Environmental Microbiology, 2019, ⟨10.1111/1462-2920.14466⟩
- identifiant
- hal-01976026
- DOI
- DOI : 10.1111/1462-2920.14466
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Bacterial Bioluminescence: Light Emission in Photobacterium phosphoreum Is Not Under Quorum-Sensing Control
- auteur
- Lisa Tanet, Christian Tamburini, Chloé Baumas, Marc Garel, Gwenola Simon, Laurie Casalot
- article
- Frontiers in Microbiology, 2019, 10, ⟨10.3389/fmicb.2019.00365⟩
- identifiant
- hal-02055577
- DOI
- DOI : 10.3389/fmicb.2019.00365
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Nervous-Like Circuits in the Ribosome Facts, Hypotheses and Perspectives
- auteur
- Y. Timsit, Daniel Bennequin
- article
- International Journal of Molecular Sciences, 2019, ⟨10.3390/ijms20122911⟩
- identifiant
- hal-02390099
- DOI
- DOI : 10.3390/ijms20122911
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Global diversity and biogeography of bacterial communities in wastewater treatment plants
- auteur
- Linwei Wu, Daliang Ning, Bing Zhang, Yong Li, Ping Zhang, Xiaoyu Shan, Qiuting Zhang, Mathew Robert Brown, Zhenxin Li, Joy van Nostrand, Fangqiong Ling, Naijia Xiao, Ya Zhang, Julia Vierheilig, George Wells, Yunfeng Yang, Ye Deng, Qichao Tu, Aijie Wang, Tong Zhang, Zhili He, Jurg Keller, Per Nielsen, Pedro Alvarez, Craig Criddle, Michael Wagner, James Tiedje, Qiang He, Thomas Curtis, David Stahl, Lisa Alvarez-Cohen, Bruce Rittmann, Xianghua Wen, Jizhong Zhou, Léa Cabrol
- article
- Nature Microbiology, 2019, 4 (7), pp.1183-1195. ⟨10.1038/s41564-019-0426-5⟩
- identifiant
- hal-03147128
- DOI
- DOI : 10.1038/s41564-019-0426-5
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Modicisalibacter
- auteur
- Ben-Ali-Gam Zouhair, Laurie Casalot, Marc Labat
- article
- Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria (BMSAB), 2019, 1, ⟨10.1002/9781118960608.gbm01717⟩
- identifiant
- hal-02884023
- DOI
- DOI : 10.1002/9781118960608.gbm01717
- Accès au bibtex
-
Conference papers
- titre
- Ecological gradients as an evolutionary opportunity for Mediterranean biodiversity
- auteur
- Bruno Fady, Marc Bally, Alberte Bondeau, Francois Carlotti, Anne Chenuil, Wolfgang Cramer, Jean-Pierre Féral, Thierry Gauquelin, Anne-Christine Monnet, Séverine Thomas, France van Wambeke, D. Aurelle
- article
- OTMED Final Conference - What kind of environmental transition for the mediterranean region?, Oct 2019, Marseille, France
- identifiant
- hal-03024537
- Accès au bibtex
-
Book sections
- titre
- The Human Virome
- auteur
- Alexia Bordigoni, Sebastien Halary, Christelle Desnues
- article
- Reference Module in Life Sciences, Elsevier, 2019, ⟨10.1016/B978-0-12-809633-8.20960-6⟩
- identifiant
- hal-02902342
- DOI
- DOI : 10.1016/B978-0-12-809633-8.20960-6
- Accès au bibtex
-
Poster communications
-

- titre
- Physiological and proteomic responses of a mediterranean strain of the marine toxic invasive dinoflagellate Alexandrium catenella exposed to a polymetallic stress
- auteur
- Cherif Chetouhi, Estelle Masseret, Amandine Caruana, M Zouher Amzil, Thierry Balliau, Mohamed Laabir, Natacha Jean
- article
- Société d'écotoxicologie fondamentale et appliquée (SEFA), Jul 2019, lyon, France. ⟨10.13140/RG.2.2.19179.80164⟩
- identifiant
- hal-03467305
- DOI
- DOI : 10.13140/RG.2.2.19179.80164
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Theses
-

- titre
- Impacts of multiple contamination of trace metal elements on the microbial communities in a highly anthropized coastal environnement : the Toulon bay
- auteur
- Clément Coclet
- article
- Ecotoxicologie. Université de Toulon, 2019. Français. ⟨NNT : 2019TOUL0010⟩
- identifiant
- tel-02494822
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2018
Journal articles
-

- titre
- The nature of electron acceptor (MnIV/NO3) triggers differential expression of genes associated with stress and ammonium limitation responses in Shewanella algae C6G3
- auteur
- Axel Aigle, Patricia Bonin, Nicolas Fernandez -Nunez, Béatrice B. Loriod, Sophie Guasco, Aurélie Bergon, Fabrice Armougom, Chantal Iobbi-Nivol, Jean Imbert, Valerie Michotey
- article
- FEMS Microbiology Letters, In press, ⟨10.1093/femsle/fny068⟩
- identifiant
- hal-01766209
- DOI
- DOI : 10.1093/femsle/fny068
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Pleomorphochaeta naphthae sp. nov., a new anaerobic fermentative bacterium isolated from an oil field
- auteur
- Boussad Arroua, Régis Grimaud, Agnès Hirschler-Réa, Patrick Bouriat, Michel Magot, Laurent Urios, Anthony Ranchou-Peyruse
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2018, 68 (12), pp.3747-3753. ⟨10.1099/ijsem.0.003048⟩
- identifiant
- hal-02024167
- DOI
- DOI : 10.1099/ijsem.0.003048
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Towards a congruent reclassification and nomenclature of the thermophilic species of the genus Pseudothermotoga within the order Thermotogales
- auteur
- Hassiba Belahbib, Zarath Summers, Marie-Laure Fardeau, Manon Joseph, Christian Tamburini, Alain Dolla, Bernard Ollivier, Fabrice Armougom
- article
- Systematic and Applied Microbiology, 2018, 41 (6), pp.555-563. ⟨10.1016/J.SYAPM.2018.04.007⟩
- identifiant
- hal-01975970
- DOI
- DOI : 10.1016/J.SYAPM.2018.04.007
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Abundance and diversity of prokaryotes in ephemeral hypersaline lake Chott El Jerid using Illumina Miseq sequencing, DGGE and qPCR assays
- auteur
- Manel Ben Abdallah, Fatma Karray, Najwa Kallel, Fabrice Armougom, Najla Mhiri, Marianne Quemeneur, Jean-Luc Cayol, Gaël Erauso, Sami Sayadi
- article
- Extremophiles, 2018, 22 (5), pp.811-823. ⟨10.1007/s00792-018-1040-9⟩
- identifiant
- hal-01981823
- DOI
- DOI : 10.1007/s00792-018-1040-9
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Characterization of Desulfovibrio salinus sp. nov., a slightly halophilic sulfate-reducing bacterium isolated from a saline lake in Tunisia
- auteur
- Zouhaier Ben Ali Gam, Abdoulaye Thioye, Jean-Luc Cayol, Manon Bartoli, Guy Fauque, Marc Labat
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2018, 68 (3), pp.715-720. ⟨10.1099/ijsem.0.002567⟩
- identifiant
- hal-01981629
- DOI
- DOI : 10.1099/ijsem.0.002567
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Intensive exploitation of blue shark Prionace glauca and shortfin mako Isurus oxyrinchus : Analysis of the fisheries in the North-eastern Atlantic Ocean from 2001 to 2016
- auteur
- Sebastián Biton-Porsmoguer
- article
- Revista de Biologia Marina y Oceanografia, 2018, 53 (1), pp.27-38. ⟨10.4067/S0718-19572018000100027⟩
- identifiant
- hal-02024171
- DOI
- DOI : 10.4067/S0718-19572018000100027
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Archaea: Microbial Candidates in Next-generation Probiotics Development
- auteur
- Jean-François Brugère, Wajdi Ben Hania, Marie-Edith Arnal, Céline Ribière, Nathalie Ballet, Pascal Vandeckerkove, Bernard Ollivier, Paul O’toole
- article
- Journal of Clinical Gastroenterology, 2018, 52, pp.S71-S73. ⟨10.1097/MCG.0000000000001043⟩
- identifiant
- hal-01981676
- DOI
- DOI : 10.1097/MCG.0000000000001043
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- A global ocean atlas of eukaryotic genes
- auteur
- Quentin Carradec, Eric Pelletier, Corinne da Silva, Adriana A. Alberti, Yoann Seeleuthner, Romain Blanc-Mathieu, Gipsi Lima-Mendez, Fabio Rocha, Leila Tirichine, Karine Labadie, Amos Kirilovsky, Alexis Bertrand, Stefan Engelen, Mohammed-Amin Madoui, Raphaël Méheust, Julie Poulain, Sarah Romac, Daniel Richter, Genki Yoshikawa, Céline Dimier, Stefanie Kandels-Lewis, Marc Picheral, Sarah Searson, Olivier Jaillon, Jean-Marc Aury, Eric Karsenti, Matthew Sullivan, Shinichi Sunagawa, Peer Bork, Fabrice Not, Pascal Hingamp, Jeroen J. Raes, Lionel Guidi, Hiroyuki Ogata, Colomban de Vargas, Daniele Iudicone, Chris Bowler, Patrick Wincker, Jean Weissenbach
- article
- Nature Communications, 2018, 9 (1), pp.373. ⟨10.1038/s41467-017-02342-1⟩
- identifiant
- cea-01874711
- DOI
- DOI : 10.1038/s41467-017-02342-1
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Trace metal contamination as a toxic and structuring factor impacting ultraphytoplankton communities in a multicontaminated Mediterranean coastal area
- auteur
- Clément Coclet, Cédric Garnier, Floriane Delpy, Dominique Jamet, Gaël Durrieu, Christophe Le Poupon, Marie Mayer, Benjamin Misson
- article
- Progress in Oceanography, 2018, 163, pp.196 - 213. ⟨10.1016/j.pocean.2017.06.006⟩
- identifiant
- hal-01791337
- DOI
- DOI : 10.1016/j.pocean.2017.06.006
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Obligate sugar oxidation in Mesotoga spp., phylum Thermotogae , in the presence of either elemental sulfur or hydrogenotrophic sulfate-reducers as electron acceptor
- auteur
- Khaled Fadhlaoui, Wagdi Ben Hania, Fabrice Armougom, Manon Joseph, Marie-Laure Fardeau, Gaël Erauso, Gael Brasseur, Corinne Aubert, Moktar Hamdi, Céline Brochier-Armanet, Alain Dolla, Bernard Ollivier
- article
- Environmental Microbiology, 2018, 20 (1), pp.281-292. ⟨10.1111/1462-2920.13995⟩
- identifiant
- hal-01976008
- DOI
- DOI : 10.1111/1462-2920.13995
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Sporosalibacterium
- auteur
- Marie Laure Fardeau, Jean-Luc Cayol, Bernard Ollivier
- article
- Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria (BMSAB), 2018, ⟨10.1002/9781118960608.gbm01447⟩
- identifiant
- hal-02883987
- DOI
- DOI : 10.1002/9781118960608.gbm01447
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Diversity of rare and abundant prokaryotic phylotypes in the Prony hydrothermal field and comparison with other serpentinite-hosted ecosystems
- auteur
- Eléonore E Frouin, Méline Bes, Bernard Ollivier, Marianne Quéméneur, Anne Postec, Didier Debroas, Fabrice Armougom, Gaël Erauso
- article
- Frontiers in Microbiology, 2018, 9, ⟨10.3389/fmicb.2018.00102⟩
- identifiant
- hal-01734508
- DOI
- DOI : 10.3389/fmicb.2018.00102
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Magmatism, serpentinization and life: Insights through drilling the Atlantis Massif (IODP Expedition 357)
- auteur
- Gretchen Früh-Green, Beth Orcutt, Stéphane Rouméjon, Marvin Lilley, Yuki Morono, Carol Cotterill, Sophie Green, Javier Escartin, Barbara John, Andrew Mccaig, Mathilde Cannat, Bénédicte Ménez, Esther Schwarzenbach, Morgan Williams, Morgan Morgan, Susan Lang, Matthew Schrenk, William Brazelton, Norikatsu Akizawa, Chiara Boschi, Kristina G Dunkel, Marianne Quemeneur, Scott Whattam, Lisa Mayhew, Michelle Harris, Gaye Bayrakci, Jan-Hinrich Behrmann, Emilio Herrero-Bervera, Kirsten Hesse, Hai-Quan Liu, Amila Sandaruwan Ratnayake, Katrina Twing, Dominique Weis, Rui Zhao, Laura Bilenker
- article
- Lithos, 2018, 323, pp.137-155. ⟨10.1016/j.lithos.2018.09.012⟩
- identifiant
- hal-02024193
- DOI
- DOI : 10.1016/j.lithos.2018.09.012
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- A simple gas pressure manometer for measuring hydrogen production by hydrogenogenic cultures in serum bottles
- auteur
- Hana Gannoun, Lamia Ben Gaida, Rafika Saidi, Baligh Miladi, Moktar Hamdi, Hassib Bouallagui, Pierre-Pol Liebgott, Richard Auria
- article
- Process Biochemistry, 2018, 65, pp.157-163. ⟨10.1016/j.procbio.2017.10.011⟩
- identifiant
- hal-01629103
- DOI
- DOI : 10.1016/j.procbio.2017.10.011
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Antioxidant, Anti-inflammatory and Neuroprotective Activities of a Plant Extract Derived from Traditional Chinese Medicine SuHeXiang Wan (AT000)
- auteur
- Samy Iskandar, Senankpon Martial Gnansounou, Maxime Robin, Jean Lorquin, Carole Di Giorgio, Philippe Piccerelle
- article
- Chemistry of advanced Materials, 2018, 3 (2), pp.36-59
- identifiant
- hal-02080549
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Functional characterization and FTIR-based 3D modeling of full length and truncated forms of Scorpio maurus venom phospholipase A 2
- auteur
- Najeh Krayem, Goetz Parsiegla, Hélène Gaussier, Hanen Louati, Raida Jallouli, Pascal Mansuelle, Frédéric Carrière, Youssef Gargouri
- article
- Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects, 2018, 1862 (5), pp.1247-1261. ⟨10.1016/j.bbagen.2018.02.004⟩
- identifiant
- hal-01739569
- DOI
- DOI : 10.1016/j.bbagen.2018.02.004
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- The Physcomitrella patens chromosome-scale assembly reveals moss genome structure and evolution
- auteur
- Daniel Lang, Kristian Ullrich, Florent Murat, Jörg Fuchs, Jerry Jenkins, Fabian Haas, Carl Li, Guillaume Blanc, Heidrun H. Gundlach, Michiel van Bel, Rabea Meyberg, Cristina Vives, Jordi Morata, Aikaterini Symeonidi, Manuel Hiss, Wellington Muchero, Lee Kamisugi, Omar A. Saleh, Eva Decker, Nico van Gessel, Jane Grimwood, Richard Hayes, Sean Graham, Lee Gunter, Daniel Mcdaniel, Sebastian N.W. Hoernstein, Anders Larsson, Fay-Wei Li, Pierre-François Perroud, Jeremy Phillips, Priya Ranjan, Daniel Rokshar, Carl Rothfels, Lucas Schneider, Shengqiang Shu, Dennis Stevenson, Fritz Thümmler, Michael Tillich, Juan Villarreal Aguilar, Thomas Widiez, Gane Ka-Shu Wong, Ann Wymore, Yong Zhang, Andreas Zimmer, Ralph Quatrano, Klaus F.X. Mayer, David Goodstein, Josep Casacuberta, Klaas Vandepoele, Ralf Reski, Andrew Cuming, Gerald Tuskan, Florian Maumus, Jérôme Salse, Jeremy Schmutz, Stefan Rensing
- article
- The Plant Journal, 2018, 93 (3), pp.515 - 533. ⟨10.1111/tpj.13801⟩
- identifiant
- hal-01760352
- DOI
- DOI : 10.1111/tpj.13801
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Degenerate PCR Primers to Reveal the Diversity of Giant Viruses in Coastal Waters
- auteur
- Yanze Li, Pascal Hingamp, Hiroyasu Watai, Hisashi Endo, Takashi Yoshida, Hiroyuki Ogata
- article
- Viruses, 2018, 10 (9), pp.496. ⟨10.3390/v10090496⟩
- identifiant
- hal-01874850
- DOI
- DOI : 10.3390/v10090496
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Bacterial diversity obtained by culturable approaches in the gut of Glossina pallidipes population from a non sleeping sickness focus in Tanzania: preliminary results
- auteur
- Imna Malele, Hamis Nyingilili, Eugen Lyaruu, Marc Tauzin, Bernard Ollivier, Jean-Luc Cayol, Marie-Laure Fardeau, Anne Geiger
- article
- BMC Microbiology, 2018, 18 (S1), pp.811-823. ⟨10.1186/s12866-018-1288-3⟩
- identifiant
- hal-02053582
- DOI
- DOI : 10.1186/s12866-018-1288-3
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- IR spectroscopy analysis of pancreatic lipase-related protein 2 interaction with phospholipids: 2. Discriminative recognition of various micellar systems and characterization of PLRP2-DPPC-bile salt complexes
- auteur
- Eduardo Mateos-Diaz, Priscila Sutto-Ortiz, Moulay Sahaka, Deborah Byrne, Hélène Gaussier, Frédéric Carrière
- article
- Chemistry and Physics of Lipids, 2018, 211, pp.66-76. ⟨10.1016/j.chemphyslip.2017.11.012⟩
- identifiant
- hal-02325977
- DOI
- DOI : 10.1016/j.chemphyslip.2017.11.012
- Accès au bibtex
-
- titre
- IR spectroscopy analysis of pancreatic lipase-related protein 2 interaction with phospholipids: 1. Discriminative recognition of mixed micelles versus liposomes
- auteur
- Eduardo Mateos-Diaz, Jean-Claude Bakala N’goma, Deborah Byrne, Sylvie Robert, Frédéric Carrière, Hélène Gaussier
- article
- Chemistry and Physics of Lipids, 2018, 211, pp.52-65. ⟨10.1016/j.chemphyslip.2017.02.005⟩
- identifiant
- hal-02325970
- DOI
- DOI : 10.1016/j.chemphyslip.2017.02.005
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Taxon Richness of “Megaviridae” Exceeds those of Bacteria and Archaea in the Ocean
- auteur
- Tomoko Mihara, Hitoshi Koyano, Pascal Hingamp, Nigel Grimsley, Susumu Goto, Hiroyuki Ogata
- article
- Microbes and environments / JSME, 2018, 33 (2), pp.162-171. ⟨10.1264/jsme2.me17203⟩
- identifiant
- hal-01978927
- DOI
- DOI : 10.1264/jsme2.me17203
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Exploring the microbiome of the “star” freshwater diatom Asterionella formosa in a laboratory context
- auteur
- Kojadinovic-Sirinelli Mila, Villain Adrien, Puppo Carine, Fon Sing Sophie, Prioretti Laura, Hubert Pierre, Gérald Grégori, Zhang Yizhi, Sassi Jean-François, Jean-Michel Claverie, Guillaume Blanc, Brigitte Gontero
- article
- Environmental Microbiology, 2018, 20 (10), pp.3601-3615. ⟨10.1111/1462-2920.14337⟩
- identifiant
- hal-01863990
- DOI
- DOI : 10.1111/1462-2920.14337
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Specific enrichment of hyperthermophilic electroactive Archaea from deep-sea hydrothermal vent on electrically conductive support
- auteur
- Guillaume Pillot, Eléonore E Frouin, Emilie Pasero, Anne Godfroy, Yannick Combet-Blanc, Sylvain Davidson, Pierre-Pol Liebgott
- article
- Bioresource Technology, 2018, 259, pp.304-311. ⟨10.1016/j.biortech.2018.03.053⟩
- identifiant
- hal-02049432
- DOI
- DOI : 10.1016/j.biortech.2018.03.053
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Prokaryotic community successions and interactions in marine biofilms: the key role of Flavobacteriia
- auteur
- Thomas Pollet, Lyria Berdjeb, Cédric Garnier, Gaël Durrieu, Christophe Le Poupon, Benjamin Misson, Jean-François Briand
- article
- FEMS Microbiology Ecology, 2018, 94 (6), ⟨10.1093/femsec/fiy083⟩
- identifiant
- hal-02024255
- DOI
- DOI : 10.1093/femsec/fiy083
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Biodegradation of Emiliania huxleyi aggregates by a natural Mediterranean prokaryotic community under increasing hydrostatic pressure
- auteur
- Virginie Riou, Julien Para, Marc Garel, Catherine Guigue, Badr Al Ali, Chiara Santinelli, Dominique Lefèvre, Jean-Pierre Gattuso, Madeleine Goutx, Stephanie Jacquet, Frédéric A.C. Le Moigne, K. Tachikawa, Christian Tamburini
- article
- Progress in Oceanography, 2018, 163, pp.271-281. ⟨10.1016/j.pocean.2017.01.005⟩
- identifiant
- hal-01975994
- DOI
- DOI : 10.1016/j.pocean.2017.01.005
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Biotic and abiotic degradation of the sea ice diatom biomarker IP25 and selected algal sterols in near-surface Arctic sediments
- auteur
- Jean-Francois Rontani, Simon Belt, Remi Amiraux
- article
- Organic Geochemistry, 2018, 118, pp.73-88. ⟨10.1016/j.orggeochem.2018.01.003⟩
- identifiant
- hal-02024258
- DOI
- DOI : 10.1016/j.orggeochem.2018.01.003
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Biohydrogen production from hyperthermophilic anaerobic digestion of fruit and vegetable wastes in seawater: Simplification of the culture medium of Thermotoga maritima
- auteur
- Rafika Saidi, Pierre-Pol Liebgott, Hana Gannoun, Lamia Ben Gaïda, Baligh Miladi, Moktar Hamdi, Hassib Bouallagui, Richard Auria
- article
- Waste Management, 2018, 71, pp.474 - 484. ⟨10.1016/j.wasman.2017.09.042⟩
- identifiant
- hal-01728309
- DOI
- DOI : 10.1016/j.wasman.2017.09.042
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Enhancement of fermentative hydrogen production by Thermotoga maritima through hyperthermophilic anaerobic co-digestion of fruit-vegetable and fish wastes
- auteur
- Rafika Saidi, Pierre-Pol Liebgott, Moktar Hamdi, Richard Auria, Hassib Bouallagui
- article
- International Journal of Hydrogen Energy, 2018, 43 (52), pp.23168-23177. ⟨10.1016/j.ijhydene.2018.10.208⟩
- identifiant
- hal-01976197
- DOI
- DOI : 10.1016/j.ijhydene.2018.10.208
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Corrosion at the carbon steel-clay borehole water interface under anoxic alkaline and fluctuating temperature conditions
- auteur
- Michel Schlegel, Sophia Necib, Sylvie Daumas, Marc Labat, Cecile Blanc, Eddy Foy, Yannick Linard
- article
- Corrosion Science, 2018, 136, pp.70-90. ⟨10.1016/j.corsci.2018.02.052⟩
- identifiant
- cea-01736952
- DOI
- DOI : 10.1016/j.corsci.2018.02.052
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Single-cell genomics of multiple uncultured stramenopiles reveals underestimated functional diversity across oceans
- auteur
- Yoann Seeleuthner, Samuel Mondy, Vincent Lombard, Quentin Carradec, Eric Pelletier, Marc Wessner, Jade Leconte, Jean-François Mangot, Julie Poulain, Karine Labadie, Ramiro Logares, Shinichi Sunagawa, Véronique de Berardinis, Marcel Salanoubat, Céline Dimier, Stefanie Kandels-Lewis, Marc Picheral, Sarah Searson, Stéphane Pesant, Nicole Poulton, Ramunas Stepanauskas, Peer Bork, Chris Bowler, Pascal Hingamp, Matthew B. Sullivan, Daniele Iudicone, Ramon Massana, Jean-Marc Aury, Bernard Henrissat, Eric Karsenti, Olivier Jaillon, Mike Sieracki, Colomban de Vargas, Patrick Wincker, Silvia G. Acinas, Emmanuel Boss, Michael Follows, Gabriel Gorsky, Nigel Grimsley, Lee Karp-Boss, Uros Krzic, Fabrice Not, Jeroen Raes, Emmanuel G. Reynaud, Christian Sardet, Sabrina Speich, Lars Stemmann, Jean Weissenbach, Didier Velayoudon
- article
- Nature Communications, 2018, 9, pp.310. ⟨10.1038/s41467-017-02235-3⟩
- identifiant
- hal-01771839
- DOI
- DOI : 10.1038/s41467-017-02235-3
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Fate of petroleum hydrocarbons in bioturbated pristine sediments from Caleta Valdés (Patagonia Argentina): An ex situ bioassay
- auteur
- Julieta Sturla Lompré, Marina Nievas, Marcos Franco, Vincent Grossi, Agustina Ferrando, Cécile Militon, Franck Gilbert, Philippe Cuny, Georges Stora, Marcela Sepúlveda, José Luis Esteves, Marta Commendatore
- article
- Ecotoxicology and Environmental Safety, 2018, 162, pp.673-682. ⟨10.1016/j.ecoenv.2018.06.069⟩
- identifiant
- hal-02095651
- DOI
- DOI : 10.1016/j.ecoenv.2018.06.069
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- The Ocean Gene Atlas: exploring the biogeography of plankton genes online
- auteur
- Emilie Villar, Thomas Vannier, Caroline Vernette, Magali Lescot, Miguelangel Cuenca, Aurélien Alexandre, Paul Bachelerie, Thomas Rosnet, Eric Pelletier, Shinichi Sunagawa, Pascal Hingamp
- article
- Nucleic Acids Research, 2018, 46 (W1), pp.gky376. ⟨10.1093/nar/gky376⟩
- identifiant
- hal-01803597
- DOI
- DOI : 10.1093/nar/gky376
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Locality and diel cycling of viral production revealed by a 24 h time course cross-omics analysis in a coastal region of Japan
- auteur
- Takashi Yoshida, Yosuke Nishimura, Hiroyasu Watai, Nana Haruki, Daichi Morimoto, Hiroto Kaneko, Takashi Honda, Keigo Yamamoto, Pascal Hingamp, Yoshihiko Sako, Susumu Goto, Hiroyuki Ogata
- article
- The International Society of Microbiologial Ecology Journal, 2018, ⟨10.1038/s41396-018-0052-x⟩
- identifiant
- hal-01771838
- DOI
- DOI : 10.1038/s41396-018-0052-x
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Salinity shifts in marine sediment: Importance of number of fluctuation rather than their intensities on bacterial denitrifying community
- auteur
- Imen Zaghmouri, Valerie Michotey, Fabrice Armougom, Sophie Guasco, Patricia Bonin
- article
- Marine Pollution Bulletin, 2018, 130, pp.76 - 83. ⟨10.1016/j.marpolbul.2018.03.020⟩
- identifiant
- hal-01735881
- DOI
- DOI : 10.1016/j.marpolbul.2018.03.020
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Effect of acidic industrial efluent release on microbial diversity and trace metal dynamics during resuspension of coastal sediment
- auteur
- Hana Zouch, Léa Cabrol, Marc Tedetti, Sandrine Chifflet, Fatma Karray, Hatem Zaghden, Sami Sayadi, Marianne Quemeneur
- article
- Frontiers in Microbiology, 2018, 9, ⟨10.3389/fmicb.2018.03103⟩
- identifiant
- hal-01976501
- DOI
- DOI : 10.3389/fmicb.2018.03103
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Conference papers
- titre
- Role of microorganisms in marine mercury cycling: current knowledge and future directions
- auteur
- Andrea Garcia Bravo, Claudia Cosio, Léa Cabrol, Benjamin Misson, Cynthia Gilmour, Marisol Goñi, Remy Guyoneaud, Marianne Quemeneur, Lars-Eric Heimbürger-Boavida, Silvia G Acinas, Alexandre J. Poulain
- article
- MISTRALS Contamination & Pollution workshop, Nov 2018, Marseille, France
- identifiant
- hal-02173548
- Accès au bibtex
-
- titre
- Climate change and the evolutionary challenge of Mediterranean biodiversity
- auteur
- Bruno Fady, Marc Bally, Alberte Bondeau, Francois Carlotti, Anne Chenuil, Wolfgang Cramer, Jean-Pierre Féral, Thierry Gauquelin, Anne-Christine Monnet, Séverine Thomas, France van Wambeke, D. Aurelle
- article
- ESEB 2018 Evolution conference Montpellier, Aug 2018, Montpellier, France. ⟨10.13140/RG.2.2.35257.62565⟩
- identifiant
- hal-02962496
- DOI
- DOI : 10.13140/RG.2.2.35257.62565
- Accès au bibtex
-
Book sections
- titre
- Prokaryote/eukaryote dichotomy and bacteria/archaea/eukarya domains : two inseparable concepts
- auteur
- Jean-Claude Bertrand, Pierre Caumette, P. Normand, Bernard Ollivier, T. Sime-Ngando
- article
- Bertrand, J.C. (ed.); Normand, P. (ed.); Ollivier, Bernard (ed.); Sime-Ngando, T. (ed.). Prokaryotes and evolution, Springer, p. 1-21, 2018, 978-3-319-99782-7. ⟨10.1007/978-3-319-99784-1_1⟩
- identifiant
- hal-02328632
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-319-99784-1_1
- Accès au bibtex
-
- titre
- Evolutionary success of prokaryotes
- auteur
- J.C. Bertrand, P. Bonin, Bernard Ollivier, K. Alain, A. Godfroy, Nathalie Pradel, P. Normand
- article
- Bertrand, J.C. (ed.); Normand, P. (ed.); Ollivier, Bernard (ed.); Sime-Ngando, T. (ed.). Prokaryotes and evolution, Springer, pp.131-240, 2018, 978-3-319-99782-7. ⟨10.1007/978-3-319-99784-1_4⟩
- identifiant
- hal-02328653
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-319-99784-1_4
- Accès au bibtex
-
- titre
- Importance of Prokaryotes in the Functioning and Evolution of the Present and Past Geosphere and Biosphere
- auteur
- Bernard Ollivier, Nina Zeyen, Grégoire Galès, Keyron Hickman-Lewis, Frédéric Gaboyer, Karim Benzerara, Frances Westall
- article
- Prokaryotes and Evolution, Springer International Publishing, pp.57-129, 2018, 978-3-319-99782-7. ⟨10.1007/978-3-319-99784-1_3⟩
- identifiant
- hal-02067819
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-319-99784-1_3
- Accès au bibtex
-
- titre
- The evolution of living beings started with prokaryotes and in interaction with prokaryotes
- auteur
- T. Sime-Ngando, J.C. Bertrand, Didier Bogusz, J.F. Brugère, Claudine Franche, Marie-Laure Fardeau, Emilie Froussart, Anne Geiger, Maria Soledad Goñi Urriza, Bernard Ollivier, P. O'Toole
- article
- Bertrand, J.C. (ed.); Normand, P. (ed.); Ollivier, Bernard (ed.); Sime-Ngando (ed.). Prokaryotes and evolution, Springer, p. 241-338, 2018, 978-3-319-99782-7. ⟨10.1007/978-3-319-99784-1_5⟩
- identifiant
- hal-02337509
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-319-99784-1_5
- Accès au bibtex
-
Books
- titre
- Prokaryotes and evolution
- auteur
- J.C. Bertrand, P. Normand, Bernard Ollivier, T. Sime Ngando
- article
- Springer, 396 p., 2018, 978-3-319-99782-7. ⟨10.1007/978-3-319-99784-1⟩
- identifiant
- hal-02328683
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-319-99784-1
- Accès au bibtex
-
Poster communications
-

- titre
- Climate change and the evolutionary challenge of Mediterranean biodiversity
- auteur
- Bruno Fady, Alberte Bondeau, Marc Bally, Wolfgang Cramer, Thierry Gauquelin, Jean-Pierre Féral, Anne-Christine Monnet, Séverine Thomas, France van Wambeke, Anne Chenuil, Didier Aurelle
- article
- 2. Joint Congress on Evolutionary Biology (EVOLUTION 2018), Aug 2018, Montpellier, France. 2018
- identifiant
- hal-02737804
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2017
Journal articles
-

- titre
- Stacked search for time shifted high energy neutrinos from gamma ray bursts with the Antares neutrino telescope
- auteur
- S. Adrián-Martínez, A. Albert, M. Andre, M. Anghinolfi, G. Anton, M. Ardid, J. Aubert, B. Baret, J. Barrios-Marti, S. Basa, V. Bertin, S. Biagi, R. Bormuth, C. Bouwhuis, R. Bruijn, J. Brunner, J. Busto, A. Capone, L. Caramete, J. Carr, T. Chiarusi, M. Circella, R. Coniglione, H. Costantini, P. Coyle, A. Creusot, I. Dekeyser, Anne Deschamps, G. de Bonis, C. Distefano, C. Donzaud, D. Dornic, D. Drouhin, A. Dumas, T. Eberl, D. Elsässer, A. Enzenhöfer, K. Fehn, I. Felis, P. Fermani, F. Folger, A. Fusco, S. Galatà, P. Gay, S. Geisselsöder, K. Geyer, V. Giordano, A. Gleixner, R. Gracia-Ruiz, K. Graf, S. Hallmann, H. van Haren, J. Heijboer, Y. Hello, J. Hernández-Rey, J. Hössl, J. Hofestädt, C. Hugon, C. James, M. de Jong, M. Kadler, O. Kalekin, U. Katz, D. Kiessling, P. Kooijman, A. Kouchner, M. Kreter, I. Kreykenbohm, V. Kulikovskiy, R. Lahmann, Dominique Lefèvre, E. Leonora, S. Loucatos, M. Marcelin, A. Margiotta, A. Marinelli, J. Martínez-Mora, A. Mathieu, T. Michael, P. Migliozzi, A. Moussa, C. Müller, E. Nezri, E. Păvălaş, C. Pellegrino, C. Perrina, P. Piattelli, V. Popa, T. Pradier, C. Racca, G. Riccobene, R. Richter, K. Roensch, M. Saldaña, D. Samtleben, A. Sanchez-Losa, M. Sanguineti, P. Sapienza, J. Schmid, J. Schnabel, F. Schüssler, T. Seitz, C. Sieger, M. Spurio, J. Steijger, Th. Stolarczyk, M. Taiuti, Christian Tamburini, A. Trovato, M. Tselengidou, C. Tönnis, B. Vallage, C. Vallee, V. van Elewyck, E. Visser, D. Vivolo, S. Wagner, J. Wilms, J. Zornoza, J. Zúñiga
- article
- European Physical Journal C: Particles and Fields, 2017, C77 (1), pp.20. ⟨10.1140/epjc/s10052-016-4496-8⟩
- identifiant
- hal-01621701
- DOI
- DOI : 10.1140/epjc/s10052-016-4496-8
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Physiological and transcriptional approaches reveal connection between nitrogen and manganese cycles in Shewanella algae C6G3
- auteur
- Axel Aigle, Patricia Bonin, Chantal Iobbi-Nivol, Vincent Méjean, Valerie Michotey
- article
- Scientific Reports, 2017, Scientific Reports 7, 7, ⟨10.1038/srep44725⟩
- identifiant
- hal-01493279
- DOI
- DOI : 10.1038/srep44725
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Viral to metazoan marine plankton nucleotide sequences from the Tara Oceans expedition
- auteur
- Adriana A. Alberti, Julie Poulain, Stefan Engelen, Karine Labadie, Sarah Romac, Isabel Ferrera, Guillaume Albini, Jean-Marc Aury, Caroline Belser, Alexis Bertrand, Corinne Cruaud, Corinne da Silva, Carole Dossat, Frédérick F. Gavory, Shahinaz Gas, Guy Guy, Maud Haquelle, E'Krame Jacoby, Olivier Jaillon, Arnaud Lemainque, Eric Pelletier, Gaëlle Samson, Mark Wessner, Pascal Bazire, Odette Beluche, Laurie Bertrand, Marielle Besnard-Gonnet, Isabelle Bordelais, Magali Boutard, Maria Dubois, Corinne Dumont, Evelyne Ettedgui, Patricia Fernandez, Espérance Garcia, Nathalie Aiach, Thomas Guerin, Chadia Hamon, Élodie Brun, Sandrine Lebled, Patricia Lenoble, Claudine Louesse, Eric Mahieu, Barbara Mairey, Nathalie Martins, Catherine Megret, Claire Milani, Jacqueline Muanga, Céline Orvain, Emilie Payen, Peggy Perroud, Emmanuel Petit, Dominique Robert, Murielle Ronsin, Benoit Vacherie, Silvia G. Acinas, Marta Royo-Llonch, Francisco Cornejo-Castillo, Ramiro Logares, Beatriz Fernández-Gómez, Chris Bowler, Guy Cochrane, Clara Amid, Petra Ten Hoopen, Colomban de Vargas, Nigel Grimsley, Elodie Desgranges, Stefanie Kandels-Lewis, Hiroyuki Ogata, Nicole Poulton, Michael E. Sieracki, Ramunas Stepanauskas, Matthew Sullivan, Jennifer Brum, Melissa Duhaime, Bonnie Poulos, Bonnie Hurwitz, Peer Bork, Emmanuel Boss, Michael Follows, Gabriel Gorsky, Pascal Hingamp, Daniele Iudicone, Lee Karp-Boss, Eric Karsenti, Fabrice Not, Stéphane Pesant, Jeroen Raes, Christian Sardet, Sabrina Speich, Lars Stemmann, Shinichi Sunagawa, Patrick Wincker
- article
- Scientific Data , 2017, 4, ⟨10.1038/sdata.2017.93⟩
- identifiant
- hal-01771844
- DOI
- DOI : 10.1038/sdata.2017.93
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Monitoring photo-oxidative and salinity-induced bacterial stress in the Canadian Arctic using specific lipid tracers
- auteur
- Remi Amiraux, Simon Belt, Frederic Vaultier, Virginie Galindo, Michel Gosselin, Patricia Bonin, Jean-Francois Rontani
- article
- Marine Chemistry, 2017, 194, pp.89-99. ⟨10.1016/j.marchem.2017.05.006⟩
- identifiant
- hal-02325940
- DOI
- DOI : 10.1016/j.marchem.2017.05.006
- Accès au bibtex
-
- titre
- Virgibacillus ainsalahensis sp. nov., a Moderately Halophilic Bacterium Isolated from Sediment of a Saline Lake in South of Algeria
- auteur
- Meriam Amziane, Amel Darenfed-Bouanane, Ahmed Abderrahmani, Okba Selama, Lydia Jouadi, Jean-Luc Cayol, Farida Nateche, Marie-Laure Fardeau
- article
- Current Microbiology, 2017, 74 (2), pp.219 - 223. ⟨10.1007/s00284-016-1171-0⟩
- identifiant
- hal-01621699
- DOI
- DOI : 10.1007/s00284-016-1171-0
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Characterization of the first cultured representative of a Bacteroidetes clade specialized on the scavenging of cyanobacteria
- auteur
- Wajdi Ben Hania, Manon Bartoli, Boyke Bunk, Cathrin Sproer, Hans-Peter Klenk, Marie-Laure Fardeau, Stefan Spring
- article
- Environmental Microbiology, 2017, 19 (3), pp.1134 - 1148. ⟨10.1111/1462-2920.13639⟩
- identifiant
- hal-01621708
- DOI
- DOI : 10.1111/1462-2920.13639
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- When riverine dissolved organic matter (DOM) meets labile DOM in coastal waters: changes in bacterial community activity and composition
- auteur
- Marine Blanchet, Olivier Pringault, Christos Panagiotopoulos, Dominique Lefèvre, Bruno Charrìère, Jean-François Ghiglione, Camila Fernandez, Fran L. Aparicio, Cèlia Marrasé, Philippe Catala, Louise Oriol, Jocelyne Caparros, Fabien Joux
- article
- Aquatic Sciences - Research Across Boundaries, 2017, 79 (1), pp.27-43. ⟨10.1007/s00027-016-0477-0⟩
- identifiant
- hal-01285402
- DOI
- DOI : 10.1007/s00027-016-0477-0
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Characterization of recombinant Trypanosoma brucei gambiense Translationally Controlled Tumor Protein (r Tbg TCTP) and its interaction with Glossina midgut bacteria
- auteur
- Géraldine Bossard, Manon Bartoli, Marie-Laure Fardeau, Philippe P. Holzmuller, Bernard Ollivier, Anne Geiger
- article
- Gut microbes, 2017, 8 (5), pp.413 - 427. ⟨10.1080/19490976.2017.1331833⟩
- identifiant
- hal-01621726
- DOI
- DOI : 10.1080/19490976.2017.1331833
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Impact of heavy metal contamination on oxidative stress of Eisenia andrei and bacterial community structure in Tunisian mine soil
- auteur
- Iteb Boughattas, Sabrine Hattab, Hamadi Boussetta, Mohamed Banni, Elisabeth Navarro
- article
- Environmental Science and Pollution Research, 2017, 24 (22), pp.18083-18095. ⟨10.1007/s11356-017-9449-8⟩
- identifiant
- ird-02497519
- DOI
- DOI : 10.1007/s11356-017-9449-8
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Carbonate-rich dendrolitic cones: insights into a modern analog for incipient microbialite formation, Little Hot Creek, Long Valley Caldera, California
- auteur
- James Bradley, Leslie Daille, Christopher Trivedi, Caitlin Bojanowski, Blake Stamps, Bradley Stevenson, Heather Nunn, Hope Johnson, Sean Loyd, William Berelson, Frank Corsetti, John Spear
- article
- npj Biofilms and Microbiomes, 2017, 3 (1), pp.32. ⟨10.1038/s41522-017-0041-2⟩
- identifiant
- hal-04450524
- DOI
- DOI : 10.1038/s41522-017-0041-2
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Rapid Characterization of Microcystin-Producing Cyanobacteria in Freshwater Lakes by TSA-FISH (Tyramid Signal Amplification-Fluorescent In Situ Hybridization)
- auteur
- Luc Brient, Nihel Ben Gamra, Marine Periot, Marie Roumagnac, Perrine Zeller, Myriam Bormans, Annick Mejean, Olivier Ploux, Isabelle C. Biegala
- article
- Frontiers in Environmental Science, 2017, 5, pp.43. ⟨10.3389/fenvs.2017.00043⟩
- identifiant
- hal-01580363
- DOI
- DOI : 10.3389/fenvs.2017.00043
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Inhibitory effects of sodium azide on microbial growth in experimental resuspension of marine sediment
- auteur
- Léa Cabrol, Marianne Quemeneur, Benjamin Misson
- article
- Journal of Microbiological Methods, 2017, 133, pp.62 - 65. ⟨10.1016/j.mimet.2016.12.021⟩
- identifiant
- ird-01647866
- DOI
- DOI : 10.1016/j.mimet.2016.12.021
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Microbial ecology of fermentative hydrogen producing bioprocesses: useful insights for driving the ecosystem function
- auteur
- Léa Cabrol, Antonella Marone, Estela Tapia Venegas, Jean-Philippe Steyer, Gonzalo Ruiz-Filippi, Eric Trably
- article
- FEMS Microbiology Reviews, 2017, 41 (2), pp.158-181. ⟨10.1093/femsre/fuw043⟩
- identifiant
- hal-01595278
- DOI
- DOI : 10.1093/femsre/fuw043
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Regional and local environmental conditions do not shape the response to warming of a marine habitat-forming species
- auteur
- Carolina Crisci, J. -B. Ledoux, K. Mokhtar-Jamai, Marc Bally, N. Bensoussan, Didier Aurelle, E. Cebrian, R. Coma, Jean-Pierre Féral, Marie La Riviere, C. Linares, P. Lopez-Sendino, Christian Marschal, M. Ribes, N. Teixido, Frederic Zuberer, J. Garrabou
- article
- Scientific Reports, 2017, 7 (1), pp.5069. ⟨10.1038/s41598-017-05220-4⟩
- identifiant
- hal-01591643
- DOI
- DOI : 10.1038/s41598-017-05220-4
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Deep sediment resuspension and thick nepheloid layer generation by open-ocean convection
- auteur
- Xavier Durrieu de Madron, S. Ramondenc, L. Berline, Loïc Houpert, Anthony Bosse, S. Martini, L. Guidi, Pascal Conan, C. Curtil, N. Delsaut, S. Kunesch, J.F. Ghiglione, Patrick Marsaleix, M. Pujo-Pay, T. Séverin, Pierre Testor, Christian Tamburini
- article
- J.Geophys.Res.Oceans, 2017, 122 (3), pp.2291-2318. ⟨10.1002/2016jc012062⟩
- identifiant
- in2p3-01489691
- DOI
- DOI : 10.1002/2016jc012062
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Defluviitalea
- auteur
- Marie Laure Fardeau, Anne Postec, Bernard Ollivier
- article
- Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria (BMSAB), 2017, ⟨10.1002/9781118960608.gbm01386⟩
- identifiant
- hal-02884209
- DOI
- DOI : 10.1002/9781118960608.gbm01386
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Defluviitaleaceae
- auteur
- Marie-Laure Fardeau, Anne Postec, Bernard Ollivier
- article
- Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria (BMSAB), 2017, ⟨10.1002/9781118960608.fbm00280⟩
- identifiant
- hal-02884206
- DOI
- DOI : 10.1002/9781118960608.fbm00280
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Genome Sequence of Piezophilic Bacterium Desulfovibrio profundus Strain 500-1, Isolated from a Deep Sediment Layer in the Japan Sea
- auteur
- Stéphanie Fouteau, Thomas Guerin, Ghislaine Magdelenat, Marie Roumagnac, Manon Bartoli, Bernard Ollivier, Alain Dolla, Valérie Barbe, Nathalie Pradel
- article
- Genome Announcements, 2017, 5 (44), ⟨10.1128/genomeA.01181-17⟩
- identifiant
- hal-01728313
- DOI
- DOI : 10.1128/genomeA.01181-17
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Comparative Genomics of Chrysochromulina Ericina Virus and Other Microalga-Infecting Large DNA Viruses Highlights Their Intricate Evolutionary Relationship with the Established Mimiviridae Family
- auteur
- Lucie Gallot-Lavallée, Guillaume Blanc, Jean-Michel Claverie
- article
- Journal of Virology, 2017, 91 (14), pp.230 - 247. ⟨10.1128/JVI.00230-17⟩
- identifiant
- hal-01622036
- DOI
- DOI : 10.1128/JVI.00230-17
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- A Glimpse of Nucleo-Cytoplasmic Large DNA Virus Biodiversity through the Eukaryotic Genomics Window
- auteur
- Lucie Gallot-Lavallée, Guillaume Blanc
- article
- Viruses, 2017, 9 (1), ⟨10.3390/v9010017⟩
- identifiant
- hal-01622035
- DOI
- DOI : 10.3390/v9010017
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Desulfobulbus aggregans sp. nov., a Novel Sulfate Reducing Bacterium Isolated from Marine Sediment from the Gulf of Gabes
- auteur
- Hanen Kharrat, Fatma Karray, Manon Bartoli, Wajdi Ben Hania, Najla Mhiri, Marie-Laure Fardeau, Feten Bennour, Lotfi Kamoun, Didier Alazard, Sami Sayadi
- article
- Current Microbiology, 2017, 74 (4), pp.449 - 454. ⟨10.1007/s00284-017-1211-4⟩
- identifiant
- hal-01621962
- DOI
- DOI : 10.1007/s00284-017-1211-4
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Environmental Viral Genomes Shed New Light on Virus-Host Interactions in the Ocean
- auteur
- Yosuke Nishimura, Hiroyasu Watai, Takashi Honda, Tomoko Mihara, Kimiho Omae, Simon Roux, Romain Blanc-Mathieu, Keigo Yamamoto, Pascal Hingamp, Yoshihiko Sako, Matthew Sullivan, Susumu Goto, Hiroyuki Ogata, Takashi Yoshida
- article
- MSphere, 2017, 2 (2), ⟨10.1128/mSphere.00359-16⟩
- identifiant
- hal-01771841
- DOI
- DOI : 10.1128/mSphere.00359-16
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Transfer of Pseudomonas pictorum Gray and Thornton 1928 to genus Stenotrophomonas as Stenotrophomonas pictorum comb. nov., and emended description of the genus Stenotrophomonas
- auteur
- Aboubakar Sidiki Ouattara, Jean Le Mer, Manon Joseph, Hervé Macarie
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2017, 67 (6), pp.1894 - 1900. ⟨10.1099/ijsem.0.001880⟩
- identifiant
- ird-01563113
- DOI
- DOI : 10.1099/ijsem.0.001880
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Desulfonatronum parangueonense sp. nov., a sulfate-reducing bacterium isolated from sediment of an alkaline crater lake
- auteur
- M.F. Pérez Bernal, Elcia Margareth Souza Brito, Manon Bartoli, Johanne Aubé, Marie-Laure Fardeau, G.C. Rodriguez, B. Ollivier, Remy Guyoneaud, Agnès Hirschler-Réa
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2017, 67 (12), pp.4999-5005. ⟨10.1099/ijsem.0.002399⟩
- identifiant
- hal-01679475
- DOI
- DOI : 10.1099/ijsem.0.002399
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Mineralizing Filamentous Bacteria from the Prony Bay Hydrothermal Field Give New Insights into the Functioning of Serpentinization-Based Subseafloor Ecosystems
- auteur
- Céline E Pisapia, Emmanuelle E Gérard, Martine Gérard, Léna Lecourt, Susan Q. Lang, Bernard E Pelletier, Claude Payri, Christophe Monnin, Linda Guentas, Anne Postec, Marianne Q Quéméneur, Gaël Erauso, Bénédicte Ménez
- article
- Frontiers in Microbiology, 2017, 8, pp.57. ⟨10.3389/fmicb.2017.00057⟩
- identifiant
- hal-01484419
- DOI
- DOI : 10.3389/fmicb.2017.00057
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Objection to the proposition of the new genus Abyssivirga
- auteur
- Anne Postec, Bernard Ollivier, Marie-Laure Fardeau
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2017, 67 (1), pp.174. ⟨10.1099/ijsem.0.001601⟩
- identifiant
- hal-01622044
- DOI
- DOI : 10.1099/ijsem.0.001601
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Desulfovibrio senegalensis sp. nov., a mesophilic sulfate reducer isolated from marine sediment
- auteur
- Abdoulaye Thioye, Zouhaier Ben Ali Gam, Malick Mbengue, Jean-Luc Cayol, Manon Bartoli, Coumba Touré-Kane, Marc Labat
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2017, 67 (9), pp.3162 - 3166. ⟨10.1099/ijsem.0.001997⟩
- identifiant
- hal-01728316
- DOI
- DOI : 10.1099/ijsem.0.001997
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Complete mitochondrial genome sequence of the freshwater diatom Asterionella formosa
- auteur
- Adrien Villain, Mila Kojadinovic, Carine Puppo, Laura Prioretti, Pierre Hubert, Gérald Grégori, Alain Roulet, Céline Roques, Jean-Michel Claverie, Brigitte Gontero, Guillaume Blanc, Yizhi Zhang
- article
- Mitochondrial DNA Part B Resources, 2017, 2 (1), pp.97 - 98. ⟨10.1080/23802359.2017.1285210⟩
- identifiant
- hal-01760365
- DOI
- DOI : 10.1080/23802359.2017.1285210
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Microbial Diversity in Sulfate-Reducing Marine Sediment Enrichment Cultures Associated with Anaerobic Biotransformation of Coastal Stockpiled Phosphogypsum (Sfax, Tunisia)
- auteur
- Hana Zouch, Fatma Karray, Fabrice Armougom, Sandrine Chifflet, Agnès Hirschler-Réa, Hanen Kharrat, Lotfi Kamoun, Wajdi Ben Hania, Bernard Ollivier, Sami Sayadi, Marianne Quéméneur
- article
- Frontiers in Microbiology, 2017, 8, pp.1583 ⟨10.3389/fmicb.2017.01583⟩
- identifiant
- hal-01622007
- DOI
- DOI : 10.3389/fmicb.2017.01583
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Book sections
- titre
- Protocols for Subtidal and Deep-Sea Benthic Oil Spill Simulations
- auteur
- Philippe Cuny, Vincent Grossi, Cécile Militon, Christian Tamburini, Georges Stora, Franck Gilbert
- article
- McGenity, Terry J., Timmis, Kenneth N., Nogales Fernández, Balbina. Hydrocarbon and Lipid Microbiology Protocols. Meso- and Microcosms, , pp.91-102, 2017, 978-3-662-53108-2. ⟨10.1007/8623_2014_39⟩
- identifiant
- hal-02968434
- DOI
- DOI : 10.1007/8623_2014_39
- Accès au bibtex
-
Proceedings
- titre
- Assessment of oil weathering and impact in mangrove ecosystem: PRISME Experiment.
- auteur
- Ronan Jézéquel, Karine Duboscq, Léa Sylvi, Emma Michaud, Lise Millera Ferriz, Enora Roic, Robert Duran, Cristiana Cravo-Laureau, Valerie Michotey, Patricia Bonin, Franck Gilbert, Marc Tedetti, Cécile Militon, Philippe Cuny
- article
- International Oil Spill Conference Proceedings 2017, 2017 (1), pp.634-656, 2017, ⟨10.7901/2169-3358-2017.1.634⟩
- identifiant
- hal-02967246
- DOI
- DOI : 10.7901/2169-3358-2017.1.634
- Accès au bibtex
-
2016
Journal articles
- titre
- Optical and X-ray early follow-up of ANTARES neutrino alerts
- auteur
- S. Adrián-Martínez, M. Ageron, A. Albert, Imen Al Samarai, M. André, G. Anton, M. Ardid, J. -J. Aubert, B. Baret, J. Barrios-Marti, S. Basa, V. Bertin, S. Biagi, C. Bogazzi, R. Bormuth, M. Bou-Cabo, M. C. Bouwhuis, R. Bruijnk, J. Brunner, J. Busto, A. Capone, L. Caramete, J. Carr, T. Chiarusi, M. Circella, R. Coniglione, H. Costantini, P. Coyle, A. Creusot, I. Dekeyser, Anne Deschamps, G. de Bonis, C. Distefano, C. Donzaud, D. Dornic, D. Drouhin, Alexis Dumas, T. Eberl, D. Elsasser, A. Enzenhöfer, K. Fehn, I. Feis, P. Fermani, F. Folger, L. A. Fusco, S. Galatà, P. Gay, S. Geisselsoder, K. Geyer, V. Giordano, A. Gleixner, R. Gracia-Ruiz, K. Graf, H. Van Haren, A. J. Heijboer, Y. Hello, J. J. Hernandez-Rey, A. Herrero, J. Hossl, J. Hofestadt, C. Hugon, C. W. James, M. de Jong, M. Kadler, O. Kalekin, U. Katz, D. Kiessling, P. Kooijman, A. Kouchner, I. Kreykenbohm, V. Kulikovskiy, R. Lahmann, G. Lambard, D. Lattuada, Dominique Lefèvre, E. Leonora, S. Loucatos, S. Mangano, M. Marcelin, A. Margiotta, J. A. Martinez-Mora, S. Martini, A. Mathieu, T. Michael, P. Piattelli, P. Migliozzi, A. Moussa, C. Mueller, M. Neff, E. Nezri, G. E. Pavalas, C. Pellegrino, C. Perrina, V. Popa, T. Pradier, C. Racca, G. Riccobene, R. Richter, K. Roensch, A. Rostovtsev, M. Saldana, D. F. E. Samtleben, M. Sanguinetiz, P. Sapienza, J. Schmid, J. Schnabel, S. Schulte, F. Schüssler, T. Seitz, C. Sieger, M. Spurio, J. J. M. Steijger, Th. Stolarczyk, A. Sanchez-Losa, M. Taiuti, Christian Tamburini, A. Trovato, M. Tselengidou, C. Tonnis, D. Turpin, B. Vallage, Corentin Vallée, V. van Elewyck, M. Vecchi, E. Visser, D. Vivolo, S. Wagner, J. Wilms, J. D. Zornoza, J. Zúñiga, A. Klotz, M. Boer, A. Le van Suu, C. Akerlof, W. Zheng, P. Evans, N. Gehrels, J. Kennea, J. P. Osborne, D. M. Coward, Antares Collaboration
- article
- Journal of Cosmology and Astroparticle Physics, 2016, 02 (2), pp.062. ⟨10.1088/1475-7516/2016/02/062⟩
- identifiant
- hal-01441181
- DOI
- DOI : 10.1088/1475-7516/2016/02/062
- Accès au bibtex
-
- titre
- Deciphering the adaptation strategies of Desulfovibrio piezophilus to hydrostatic pressure through metabolic and transcriptional analyses.
- auteur
- Amira Amrani, Jacques van Helden, Aurélie Bergon, Aicha Aouane, Wajdi Ben Hania, Christian Tamburini, Béatrice Loriod, Jean Imbert, Bernard Ollivier, Nathalie Pradel, Alain Dolla
- article
- Environmental Microbiology Reports, 2016, 8 (4), pp.520-6. ⟨10.1111/1758-2229.12427⟩
- identifiant
- hal-01410149
- DOI
- DOI : 10.1111/1758-2229.12427
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Genomic Insights into a new Citrobacter koseri strain revealed gene exchanges with the virulence-associated Yersinia pestis pPCP1 plasmid
- auteur
- Fabrice Armougom, Idir Bitam, Olivier Croce, Vicky Merhej, Lina Barassi, Ti-Thien Nguyen, Bernard La Scola, Didier Raoult
- article
- Frontiers in Microbiology, 2016, 7, pp.340. ⟨10.3389/fmicb.2016.00340⟩
- identifiant
- hal-01459560
- DOI
- DOI : 10.3389/fmicb.2016.00340
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- The impact of long-term hydrocarbon exposure on the structure, activity, and biogeochemical functioning of microbial mats
- auteur
- Johanne Aubé, Pavel Senin, Olivier Pringault, Patricia Bonin, Bruno Deflandre, Olivier Bouchez, Noëlle Bru, Edurne Biritxinaga-Etchart, Christophe Klopp, Remy Guyoneaud, Marisol Goñi
- article
- Marine Pollution Bulletin, 2016, 111 (1-2), pp.115-125. ⟨10.1016/j.marpolbul.2016.07.023⟩
- identifiant
- ird-02048573
- DOI
- DOI : 10.1016/j.marpolbul.2016.07.023
- Accès au bibtex
-
- titre
- Hydrogen production by the hyperthermophilic bacterium Thermotoga maritima Part II: modeling and experimental approaches for hydrogen production
- auteur
- Richard Auria, Céline Boileau, Sylvain Davidson, Laurence Casalot, Pierre Christen, Pierre-Pol Liebgott, Yannick Combet-Blanc
- article
- Biotechnology for Biofuels, 2016, 9 (1), pp.268. ⟨10.1186/s13068-016-0681-0⟩
- identifiant
- hal-03479043
- DOI
- DOI : 10.1186/s13068-016-0681-0
- Accès au bibtex
-
- titre
- Prokaryotic diversity in a Tunisian hypersaline lake, Chott El Jerid
- auteur
- Manel Ben Abdallah, Fatma Karray, Najla Mhiri, Nan Mei, Marianne Quemeneur, Jean-Luc Cayol, Gaël Erauso, Jean-Luc Tholozan, Didier Alazard, Sami Sayadi
- article
- Extremophiles, 2016, 20 (2), pp.125-138. ⟨10.1007/s00792-015-0805-7⟩
- identifiant
- hal-01437952
- DOI
- DOI : 10.1007/s00792-015-0805-7
- Accès au bibtex
-
- titre
- Reclassification of Anaerobaculum mobile, Anaerobaculum thermoterrenum, Anaerobaculum hydrogeniformans as Acetomicrobium mobile comb. nov., Acetomicrobium thermoterrenum comb. nov and Acetomicrobium hydrogeniformans comb. nov., respectively, and emendation of the genus Acetomicrobium
- auteur
- Wajdi Ben Hania, Amel Bouanane-Darenfed, Jean-Luc Cayol, Bernard Ollivier, Marie-Laure Fardeau
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2016, 66, pp.1506-1509. ⟨10.1099/ijsem.0.000910⟩
- identifiant
- hal-01438759
- DOI
- DOI : 10.1099/ijsem.0.000910
- Accès au bibtex
-
- titre
- Desulfotomaculum aquiferis sp nov and Desulfotomaculum profundi sp nov., isolated from a deep natural gas storage aquifer
- auteur
- Sabrina Berlendis, Magali Ranchou-Peyruse, Marie-Laure Fardeau, Jean-Francois Lascourreges, Manon Joseph, Bernard Ollivier, Thomas Auello, David Dequidt, Michel Magot, Anthony Ranchou-Peyruse
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2016, 66 (11), pp.4329-4338. ⟨10.1099/ijsem.0.001352⟩
- identifiant
- hal-01443240
- DOI
- DOI : 10.1099/ijsem.0.001352
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Hydrogen production by the hyperthermophilic bacterium Thermotoga maritima part I: effects of sulfured nutriments, with thiosulfate as model, on hydrogen production and growth
- auteur
- Celine Boileau, Richard Auria, Sylvain Davidson, Laurence Casalot, Pierre Christen, Pierre-Pol Liebgott, Yannick Combet-Blanc
- article
- Biotechnology for Biofuels, 2016, 9, ⟨10.1186/s13068-016-0678-8⟩
- identifiant
- hal-01443237
- DOI
- DOI : 10.1186/s13068-016-0678-8
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Region Growing for Segmenting Green Microalgae Images
- auteur
- Vinicius Borges, Maria Cristina Ferreira de Oliveira, Thaís Garcia da Silva, Armando Augusto Henriques Vieira, Bernd Hamann
- article
- IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2016
- identifiant
- hal-04444861
- Accès au bibtex
-
- titre
- Novel serine keratinase from Caldicoprobacter algeriensis exhibiting outstanding hide dehairing abilities.
- auteur
- Khelifa Bouacem, Amel Bouanane-Darenfed, Nadia Zaraî Jaouadi, Manon Bartoli, Hocine Hacene, Bernard Ollivier, Marie-Laure Fardeau, Samir Bejar, Bassem Jaouadi
- article
- International Journal of Biological Macromolecules, 2016, 86, pp.321-8. ⟨10.1016/j.ijbiomac.2016.01.074⟩
- identifiant
- hal-01439233
- DOI
- DOI : 10.1016/j.ijbiomac.2016.01.074
- Accès au bibtex
-
- titre
- Molecular microbiology methods for environmental diagnosis
- auteur
- Théodore Bouchez, A. L. Blieux, Samuel S. Dequiedt, Isabelle Domaizon, Alexis Dufresne, Stephanie Ferreira, Jean-Jacques Godon, Jennifer Hellal, Catherine Joulian, Achim Quaiser, Fabrice Martin-Laurent, A. Mauffret, Jean-Michel Monier, P. Peyret, P. Schmitt-Koplin, Olivier Sibourg, E. d'Oiron, Antonio Bispo, I. Deportes, C. Grand, Philippe Cuny, Pierre-Alain Maron, Lionel Ranjard
- article
- Environmental Chemistry Letters, 2016, 14 (4), pp.423--441. ⟨10.1007/s10311-016-0581-3⟩
- identifiant
- hal-01413017
- DOI
- DOI : 10.1007/s10311-016-0581-3
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Microbial dynamics in a High Arctic glacier forefield: a combined field, laboratory, and modelling approach
- auteur
- James Bradley, Sandra Arndt, Marie Šabacká, Liane Benning, Gary Barker, Joshua Blacker, Marian Yallop, Katherine Wright, Christopher Bellas, Jonathan Telling, Martyn Tranter, Alexandre Anesio
- article
- Biogeosciences, 2016, 13 (19), pp.5677-5696. ⟨10.5194/bg-13-5677-2016⟩
- identifiant
- hal-04450527
- DOI
- DOI : 10.5194/bg-13-5677-2016
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Novel species and expanded distribution of ellipsoidal multicellular magnetotactic prokaryotes
- auteur
- Yi-Ran Chen, Wen-Yan Zhang, Ke Zhou, Hong-Miao Pan, Hai-Jian Du, Cong Xu, Jian-Hong Xu, Nathalie Pradel, Claire-Lise Santini, Jin-Hua Li, Hui Huang, Yong-Xin Pan, Tian Xiao, Long-Fei Wu
- article
- Environmental Microbiology Reports, 2016, 8 (2), pp.218--226. ⟨10.1111/1758-2229.12371⟩
- identifiant
- hal-01440767
- DOI
- DOI : 10.1111/1758-2229.12371
- Accès au bibtex
-
- titre
- Oil removal and effects of spilled oil on active microbial communities in close to salt-saturation brines.
- auteur
- Yannick Corsellis, Marc M Krasovec, Lea Sylvi, Philippe Cuny, Cécile Militon
- article
- Extremophiles, 2016, pp.26955981. ⟨10.1007/s00792-016-0818-x⟩
- identifiant
- hal-01435956
- DOI
- DOI : 10.1007/s00792-016-0818-x
- Accès au bibtex
-
- titre
- Balneicella halophila gen. nov., sp nov., an anaerobic bacterium, isolated from a thermal spring and description of Balneicellaceae fam. nov.
- auteur
- Khaled Fadhlaoui, Wajdi Ben Hania, Anne Postec, Moktar Hamdi, Bernard Ollivier, Marie-Laure Fardeau
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2016, 66 (11), pp.4692-4696. ⟨10.1099/ijsem.0.001412⟩
- identifiant
- hal-01443241
- DOI
- DOI : 10.1099/ijsem.0.001412
- Accès au bibtex
-
- titre
- Denitrification activity in mangrove sediments varies with associated vegetation
- auteur
- Sheryl Oliveira Fernandes, Pinky Dutta, Maria-Judith Gonsalves, Patricia Bonin, P. A. Lokabharathi
- article
- Ecological Engineering, 2016, 95, pp.671-681. ⟨10.1016/j.ecoleng.2016.06.102⟩
- identifiant
- hal-01443226
- DOI
- DOI : 10.1016/j.ecoleng.2016.06.102
- Accès au bibtex
-
- titre
- Coupling of bacterial nitrification with denitrification and anammox supports N removal in intertidal sediments (Arcachon Bay, France)
- auteur
- Sheryl Fernandes, Cedric Javanaud, Valerie Michotey, Sophie Guasco, Pierre Anschutz, Patricia Bonin
- article
- Estuarine, Coastal and Shelf Science, 2016, 179, pp.39-50. ⟨10.1016/j.ecss.2015.10.009⟩
- identifiant
- hal-01408734
- DOI
- DOI : 10.1016/j.ecss.2015.10.009
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Preservation of ancestral Cretaceous microflora recovered from a hypersaline oil reservoir
- auteur
- Gregoire Gales, Nicolas Tsesmetzis, Isabel Neria, Didier Alazard, Stéphanie Coulon, Bart P. Lomans, Dominique Morin, Bernard Ollivier, Jean Borgomano, Catherine Joulian
- article
- Scientific Reports, 2016, 6, ⟨10.1038/srep22960⟩
- identifiant
- hal-01443597
- DOI
- DOI : 10.1038/srep22960
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Thermanaeromonas burensis sp nov., a thermophilic anaerobe isolated from a subterranean clay environment
- auteur
- Zouhaier Ben Ali Gam, Sylvie Daumas, Laurie Casalot, Manon Bartoli, Sophia Necib, Yannick Linard, Marc Labat
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2016, 66, pp.445-449. ⟨10.1099/ijsem.0.000739⟩
- identifiant
- hal-01409620
- DOI
- DOI : 10.1099/ijsem.0.000739
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Plankton networks driving carbon export in the oligotrophic ocean
- auteur
- Lionel Guidi, Samuel Chaffron, Lucie Bittner, Damien Eveillard, Abdelhalim Larhlimi, Simon Roux, Youssef Darzi, Stéphane Audic, L. Berline, Jennifer R. Brum, Luis Pedro Coelho, Julio Cesar Ignacio Espinoza, Shruti Malviya, Shinichi Sunagawa, Céline Dimier, Stefanie Kandels-Lewis, Marc Picheral, Julie Poulain, Sarah Searson, Lars Stemmann, Fabrice Not, Pascal Hingamp, Sabrina Speich, Mick Follows, Lee Karp-Boss, Emmanuel Boss, Hiroyuki Ogata, Stephane Pesant, Jean Weissenbach, Patrick Wincker, Silvia G. Acinas, Peer Bork, Daniele Iudicone, Matthew B. Sullivan, Jeroen Raes, Eric Karsenti, Chris Bowler, Gabriel Gorsky
- article
- Nature, 2016, 532, pp.465-470. ⟨10.1038/nature16942⟩
- identifiant
- hal-01275276
- DOI
- DOI : 10.1038/nature16942
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Bacterial ecology of abattoir wastewater treated by an anaerobic digestor
- auteur
- Linda Jabari, Hana Gannoun, Eltaief Khelifi, Jean-Luc Cayol, Jean-Jacques Godon, Moktar Hamdi, Marie-Laure Fardeau
- article
- Brazilian Journal of Microbiology, 2016, 47 (1), pp.73-84. ⟨10.1016/j.bjm.2015.11.029⟩
- identifiant
- hal-02633155
- DOI
- DOI : 10.1016/j.bjm.2015.11.029
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- The chimeric nature of the genomes of marine magnetotactic coccoid-ovoid bacteria defines a novel group of Proteobacteria.
- auteur
- Boyang Ji, Sheng-Da Zhang, Wei-Jia Zhang, Zoe Rouy, François Alberto, Claire-Lise Santini, Sophie Mangenot, Séverine Gagnot, Nadège Philippe, Nathalie Pradel, Lichen Zhang, Sébastien Tempel, Ying Li, Claudine Médigue, Bernard Henrissat, Pedro M Coutinho, Valérie Barbe, Emmanuel Talla, Long-Fei Wu
- article
- Environmental Microbiology, 2016, pp.doi: 10.1111/1462-2920.13637. ⟨10.1111/1462-2920.13637⟩
- identifiant
- hal-01410134
- DOI
- DOI : 10.1111/1462-2920.13637
- Accès au bibtex
-
- titre
- Localization of endobacteria in the gastrodermis of a Mediterranean gorgonian coral, Paramuricea clavata, using fluorescence in situ hybridization
- auteur
- Marie La Rivière, Marc Garel, Marc Bally
- article
- Marine Biology, 2016, 163, ⟨10.1007/s00227-016-2975-y⟩
- identifiant
- hal-01365605
- DOI
- DOI : 10.1007/s00227-016-2975-y
- Accès au bibtex
-
- titre
- Bacteria as part of bioluminescence emission at the deep ANTARES station (North-Western Mediterranean Sea) during a one-year survey
- auteur
- Severine Martini, Valerie Michotey, Laurie Casalot, Patricia Bonin, Sophie Guasco, Marc Garel, Christian Tamburini
- article
- Deep Sea Research, 2016, 116, pp.33-40. ⟨10.1016/j.dsr.2016.07.014⟩
- identifiant
- hal-01408722
- DOI
- DOI : 10.1016/j.dsr.2016.07.014
- Accès au bibtex
-
- titre
- Mobilisporobacter senegalensis gen. nov., sp nov., an anaerobic bacterium isolated from tropical shea cake
- auteur
- Malick Mbengue, Abdoulaye Thioye, Marc Labat, Laurie Casalot, Manon Bartoli, Abdoulaye Samb, Zouhaier Ben Ali Gam
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2016, 66, pp.1383-1388. ⟨10.1099/ijsem.0.000889⟩
- identifiant
- hal-01409621
- DOI
- DOI : 10.1099/ijsem.0.000889
- Accès au bibtex
-
- titre
- Serpentinicella alkaliphila gen. nov., sp. nov., a novel alkaliphilic anaerobic bacterium isolated from the serpentinite-hosted Prony hydrothermal field, New Caledonia.
- auteur
- Nan Mei, Anne Postec, Gaël Erauso, Manon Bartoli, Bernard Pelletier, Claude Payri, Bernard Ollivier, Marianne Quemeneur
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2016, 66 (11), pp.4464-4470. ⟨10.1099/ijsem.0.001375⟩
- identifiant
- hal-01436930
- DOI
- DOI : 10.1099/ijsem.0.001375
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Metagenomic and PCR-Based Diversity Surveys of [FeFe]-Hydrogenases Combined with Isolation of Alkaliphilic Hydrogen-Producing Bacteria from the Serpentinite-Hosted Prony Hydrothermal Field, New Caledonia
- auteur
- Nan Mei, Anne R Postec, Christophe Monnin, Bernard R Pelletier, Claude Payri, Bénédicte R Ménez, Eléonore E Frouin, Bernard Ollivier, Gaël Erauso, Marianne Quéméneur
- article
- Frontiers in Microbiology, 2016, 7, pp.1301. ⟨10.3389/fmicb.2016.01301⟩
- identifiant
- insu-01473338
- DOI
- DOI : 10.3389/fmicb.2016.01301
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Metatranscriptomes of oil-contaminated marine coastal sediment affected by oil addition and/or by the bioturbating activity of the marine polychaete Hediste diversicolor: Who are the microbial players?
- auteur
- Cécile Militon, Alexandre Atkinson, Valerie Michotey, Celine Jeziorski, Cristiana Cravo-Laureau, Robert Duran, Patricia Bonin, Philippe Cuny
- article
- Marine Genomics, 2016, 29, pp.55-59. ⟨10.1016/j.margen.2016.06.006⟩
- identifiant
- hal-01408732
- DOI
- DOI : 10.1016/j.margen.2016.06.006
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Neuron-Like Networks Between Ribosomal Proteins Within the Ribosome
- auteur
- Olivier Poirot, Y. Timsit
- article
- Scientific Reports, 2016, 6 (1), ⟨10.1038/srep26485⟩
- identifiant
- hal-01816591
- DOI
- DOI : 10.1038/srep26485
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Analysis of a population of magnetotactic bacteria of the Gulf of Gabes, Tunisia
- auteur
- Nathalie Pradel, Jean-Luc Cayol, Marie-Laure Fardeau, Fatma Karray, Sami Sayadi, Didier Alazard, Bernard Ollivier
- article
- Environmental Science and Pollution Research, 2016, 23 (5), pp.4046-4053. ⟨10.1007/s11356-015-4314-0⟩
- identifiant
- hal-01443600
- DOI
- DOI : 10.1007/s11356-015-4314-0
- Accès au bibtex
-
- titre
- Magnetotactic bacteria population in a pristine French Atlantic lagoon.
- auteur
- Nathalie Pradel, Maxime Fuduche, Bernard Ollivier
- article
- Environmental Science and Pollution Research, 2016, 23 (1), pp.691-7. ⟨10.1007/s11356-015-5322-9⟩
- identifiant
- hal-01435958
- DOI
- DOI : 10.1007/s11356-015-5322-9
- Accès au bibtex
-
- titre
- Bacterial community structure and functional arrA gene diversity associated with arsenic reduction and release in an industrially contaminated soil
- auteur
- Marianne Quéméneur, Françis Garrido, Patrick Billard, Dominique Breeze, Corinne Leyval, Michel Jauzein, Catherine Joulian
- article
- Geomicrobiology Journal, 2016, 33 (10), pp.839-849. ⟨10.1080/01490451.2015.1118167⟩
- identifiant
- insu-01292649
- DOI
- DOI : 10.1080/01490451.2015.1118167
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Impact of an intense water column mixing (0-1500 m) on prokaryotic diversity and activities during an open-ocean convection event in the NW Mediterranean Sea
- auteur
- Tatiana Severin, Caroline Sauret, Mehdi Boutrif, Thomas Duhaut, Fayçal Kessouri, Louise Oriol, Jocelyne Caparros, Mireille Pujo-Pay, Xavier Durrieu de Madron, Marc Garel, Christian Tamburini, Pascal Conan, Jean-François Ghiglione
- article
- Environmental Microbiology, 2016, 18 (12), pp.4378 - 4390. ⟨10.1111/1462-2920.13324⟩
- identifiant
- hal-01480373
- DOI
- DOI : 10.1111/1462-2920.13324
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Genomic and physiological analysis reveals versatile metabolic capacity of deep-sea Photobacterium phosphoreum ANT-2200.
- auteur
- Sheng-Da Zhang, Claire-Lise Santini, Wei-Jia Zhang, Valérie Barbe, Sophie Mangenot, Charlotte Guyomar, Marc Garel, Hai-Tao Chen, Xue-Gong Li, Qun-Jian Yin, Yuan Zhao, J. Armengaud, Jean-Charles Gaillard, Severine Martini, Nathalie Pradel, Claude Vidaud, François Alberto, Claudine Médigue, Christian Tamburini, Long-Fei Wu
- article
- Extremophiles life under extreme conditions, 2016, 20 (3), pp.301-10. ⟨10.1007/s00792-016-0822-1⟩
- identifiant
- hal-01410136
- DOI
- DOI : 10.1007/s00792-016-0822-1
- Accès au bibtex
-
Conference papers
-

- titre
- Microbiology of shallow subsurface aquifer and carbonate rocks studied by culture-dependent and culture-independent methods. Preliminary results on an underground laboratory, the LSBB, Rustrel, France
- auteur
- Gregoire Gales, Gaël Erauso, Jean-Luc Cayol, David Navarro, Daniel Boyer, Gilles Micolau
- article
- 6. International Conference on Inter-Disciplinary Underground Science and Technology (-DUST), Jun 2016, Avignon, France. pp.5, ⟨10.1051/e3sconf/20161205002⟩
- identifiant
- hal-01594526
- DOI
- DOI : 10.1051/e3sconf/20161205002
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Life in deep subsurface
- auteur
- Gregoire Gales, Gaël Erauso
- article
- I-DUST 2016 - INTER-DISCIPLINARY UNDERGROUND SCIENCE & TECHNOLOGY, 2016, Unknown, Unknown Region. ⟨10.1051/e3sconf/20161205001⟩
- identifiant
- hal-01758948
- DOI
- DOI : 10.1051/e3sconf/20161205001
- Accès au bibtex
-
- titre
- Fate and Impact of Oil in Mangrove Ecosystem PRISME Experiment
- auteur
- Ronan Jézéquel, Karine Duboscq, Lea Sylvi, Emma Michaud, Lise Millera Ferriz, Robert Duran, Cristiana Cravo-Laureau, Valerie Michotey, Patricia Bonin, Gilbert Franck, Marc Tedetti, Cécile Militon, Philippe Cuny
- article
- AMOP Technical Seminar, Environment and Climate Change Canada, Ottawa, ON, 2016., Jun 2016, Halifax, Canada
- identifiant
- hal-02968524
- Accès au bibtex
-
2015
Journal articles
-

- titre
- Draft-genome sequence of Shewanella algae strain C6G3
- auteur
- Axel Aigle, Valerie Michotey, Patricia Bonin
- article
- Standards in Genomic Sciences, 2015, 43 (10), pp.10.1186/s40793-015-0022-0. ⟨10.1186/s40793-015-0022-0⟩
- identifiant
- hal-01194459
- DOI
- DOI : 10.1186/s40793-015-0022-0
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Aminomonas
- auteur
- Sandra Baena, Jean-Louis Garcia, Jean-Luc Cayol, Bernard Ollivier
- article
- Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria (BMSAB), 2015, 1, ⟨10.1002/9781118960608.gbm01251⟩
- identifiant
- hal-02981993
- DOI
- DOI : 10.1002/9781118960608.gbm01251
- Accès au bibtex
-
- titre
- Aminobacterium
- auteur
- Sandra Baena, Jean-Louis Garcia, Jean-Luc Cayol, Bernard Ollivier
- article
- Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria (BMSAB), 2015, 1, ⟨10.1002/9781118960608.gbm01253⟩
- identifiant
- hal-02983507
- DOI
- DOI : 10.1002/9781118960608.gbm01253
- Accès au bibtex
-
- titre
- Characterization of Alkaliphilus hydrothermalis sp. nov., a novel alkaliphilic anaerobic bacterium, isolated from a carbonaceous chimney of the Prony hydrothermal field, New Caledonia,
- auteur
- F. Ben Aissa, Anne Postec, Gaël Erauso, C. Payri, B. Pelletier, M. Hamdi, M-Laure Fardeau, B. Ollivier
- article
- Extremophiles, 2015, 19 (1), pp.183-188. ⟨10.1007/s00792-014-0697-y⟩
- identifiant
- hal-01362364
- DOI
- DOI : 10.1007/s00792-014-0697-y
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Draft genome sequence of Mesotoga strain PhosAC3, a mesophilic member of the bacterial order Thermotogales, isolated from a digestor treating phosphogypsum in Tunisia
- auteur
- Wajdi Ben Hania, Khaled Fadhlaoui, Céline Brochier-Armanet, Cecile Persillon, Anne Postec, Moktar Hamdi, Alain Dolla, Bernard Ollivier, Marie-Laure Fardeau, Jean Le Mer, Gaël Erauso
- article
- Standards in Genomic Sciences, 2015, 10, ⟨10.1186/1944-3277-10-12⟩
- identifiant
- hal-01452069
- DOI
- DOI : 10.1186/1944-3277-10-12
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Acetoanaerobium pronyense sp. nov., an anaerobic alkaliphilic bacterium isolated from the Prony alkaline Hydrothermal Field in New Caledonia.
- auteur
- Meline Bes, Mériem Merrouch, Manon Bartoli, Marianne Quemeneur, Claude Payri, Bernard Pelletier, Bernard Ollivier, Marie-Laure Fardeau, Gaël Erauso, Anne Postec
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2015, pp.10.1099/ijs.0.000307. ⟨10.1099/ijs.0.000307⟩
- identifiant
- hal-01177195
- DOI
- DOI : 10.1099/ijs.0.000307
- Accès au bibtex
-
- titre
- Mahella
- auteur
- M Bonillas-Salinas, Bernard Ollivier, Bkc Patel, Jean-Luc Cayol
- article
- Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria (BMSAB), 2015, 1, ⟨10.1002/9781118960608.gbm00758⟩
- identifiant
- hal-02981979
- DOI
- DOI : 10.1002/9781118960608.gbm00758
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Substrates specialization in lipid compounds and hydrocarbons of Marinobacter genus.
- auteur
- Patricia Bonin, Christophe Vieira, Régis Grimaud, Cécile Militon, Philippe Cuny, Oscar Lima, Sophie Guasco, Corina P D Brussaard, Valerie Michotey
- article
- Environmental Science and Pollution Research, 2015, 22 (20), pp.15347-15359. ⟨10.1007/s11356-014-4009-y⟩
- identifiant
- hal-01201711
- DOI
- DOI : 10.1007/s11356-014-4009-y
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- SHIMMER (1.0): a novel mathematical model for microbial and biogeochemical dynamics in glacier forefield ecosystems
- auteur
- J. Bradley, A. Anesio, J. Singarayer, M. Heath, S. Arndt
- article
- Geoscientific Model Development, 2015, 8 (10), pp.3441-3470. ⟨10.5194/gmd-8-3441-2015⟩
- identifiant
- hal-04450531
- DOI
- DOI : 10.5194/gmd-8-3441-2015
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Halothermothrix
- auteur
- Jean-Luc Cayol, Bernard Ollivier, Jean-Louis Garcia
- article
- Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria (BMSAB), 2015, 1, ⟨10.1002/9781118960608.gbm00735⟩
- identifiant
- hal-02981799
- DOI
- DOI : 10.1002/9781118960608.gbm00735
- Accès au bibtex
-
- titre
- Thermohalobacter
- auteur
- Jean-Luc Cayol, Jean-Louis Garcia, Bernard Ollivier
- article
- Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria (BMSAB), 2015, 1, ⟨10.1002/9781118960608.gbm00624⟩
- identifiant
- hal-02981675
- DOI
- DOI : 10.1002/9781118960608.gbm00624
- Accès au bibtex
-
- titre
- Use of dispersant in mudflat oil-contaminated sediment: behavior and effects of dispersed oil on micro- and macrobenthos.
- auteur
- Philippe Cuny, Franck Gilbert, Cécile Militon, Georges Stora, Patricia Bonin, Valerie Michotey, Sophie Guasco, Karine Duboscq, Christine Cagnon, Ronan Jézéquel, Cristiana Cravo-Laureau, Robert Duran
- article
- Environmental Science and Pollution Research, 2015, 22 (20), pp.15370-15376. ⟨10.1007/s11356-015-4800-4⟩
- identifiant
- hal-01201710
- DOI
- DOI : 10.1007/s11356-015-4800-4
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Complete genome sequence of a new member of the Marseilleviridae recovered from the Brackish submarine spring in the Cassis Port-Miou Calanque, France
- auteur
- Gabriel Doutre, Bruno Arfib, Pierre Rochette, Jean-Michel Claverie, Patricia Bonin, Chantal Abergel
- article
- Genome Announcements, 2015, 3 (6), pp.e01148--15. ⟨10.1128/genomeA.01148-15⟩
- identifiant
- hal-01457497
- DOI
- DOI : 10.1128/genomeA.01148-15
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Microbial ecology of hydrocarbon-polluted coastal sediments.
- auteur
- Robert Duran, Philippe Cuny, Patricia Bonin, Cristiana Cravo-Laureau
- article
- Environmental Science and Pollution Research, 2015, 22 (20), pp.15195 - 15199. ⟨10.1007/s11356-015-5373-y⟩
- identifiant
- hal-01208482
- DOI
- DOI : 10.1007/s11356-015-5373-y
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Effect of physical sediments reworking on hydrocarbon degradation and bacterial community structure in marine coastal sediments.
- auteur
- Robert Duran, Patricia Bonin, Ronan Jezequel, Karine Dubosc, Claire Gassie, Fanny Terrisse, Justine Abella, Christine Cagnon, Cécile Militon, Valerie Michotey, Franck Gilbert, Philippe Cuny, Cristiana Cravo-Laureau
- article
- Environmental Science and Pollution Research, 2015, 22 (20), pp.15248-15259. ⟨10.1007/s11356-015-4373-2⟩
- identifiant
- hal-01201709
- DOI
- DOI : 10.1007/s11356-015-4373-2
- Accès au bibtex
-
- titre
- Garciella
- auteur
- Miranda-Tello E., Marie Laure Fardeau, Bernard Ollivier, Didier Alazard
- article
- Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria (BMSAB), 2015, ⟨10.1002/9781118960608.gbm00630⟩
- identifiant
- hal-02884234
- DOI
- DOI : 10.1002/9781118960608.gbm00630
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Fusibacter fontis sp. nov., a sulfur-reducing, anaerobic bacterium isolated from a mesothermic Tunisian spring
- auteur
- Khaled Fadhlaoui, Wajdi Ben Hania, Anne Postec, Guy Fauque, Moktar Hamdi, Bernard Ollivier, Marie-Laure Fardeau
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2015, 65 (Pt_10), pp.3501-3506. ⟨10.1099/ijsem.0.000445⟩
- identifiant
- hal-04283782
- DOI
- DOI : 10.1099/ijsem.0.000445
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Characterization of Desulfovibrio biadhensis sp. nov., isolated from a thermal spring
- auteur
- Khaled Fadhlaoui, Wajdi Ben Hania, Anne Postec, Guy Fauque, Moktar Hamdi, Bernard Ollivier, Marie-Laure Fardeau
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2015, 65 (Pt_4), pp.1256-1261. ⟨10.1099/ijs.0.000088⟩
- identifiant
- hal-04283774
- DOI
- DOI : 10.1099/ijs.0.000088
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Crassaminicella profunda gen. nov., sp. nov., an anaerobic marine bacterium isolated from deep-sea sediments
- auteur
- Marie-Laure Fardeau, Raja Lakhal, Bernard Ollivier, Anne Godfroy, Anne R Postec, Jean-Luc Cayol, Grégoire Galès, Nathalie Pradel
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2015, 65 (9), pp.3097-3102. ⟨10.1099/ijsem.0.000386⟩
- identifiant
- hal-02463138
- DOI
- DOI : 10.1099/ijsem.0.000386
- Accès au bibtex
-
- titre
- Caldanaerobacter
- auteur
- Marie-Laure Fardeau, Bernard Ollivier, Jean-Luc Cayol
- article
- Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria (BMSAB), 2015, 1, ⟨10.1002/9781118960608.gbm00745⟩
- identifiant
- hal-02981646
- DOI
- DOI : 10.1002/9781118960608.gbm00745
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Environmental microbiology as a mosaic of explored ecosystems and issues
- auteur
- Denis Faure, Patricia Bonin, Robert Duran, Pierre Amato, Florence Arsene-Ploetze, Jean-Christophe Auguet, Bernard Legrand, Philippe N. Bertin, Yvan Bettarel, Aurélie Bigot-Clivot, Nicolas Blot, Manuel Blouin, Myriam Bormans, Marc Bouvy, Odile Bruneel, Aurélie Cébron, Urania Christaki, Ivan Couée, Cristiana Cravo-Laureau, Michael Danger, Julien de Lorgeril, Yves Desdevises, Yves Dessaux, Delphine Destoumieux-Garzon, Élodie Duprat, Gaël Erauso, Feth El Zahar Haichar, Éric Fouilland, Andre-Jean Francez, Nathalie Fromin, Alain Geffard, Jean-François Ghiglione, Arnaud Huguet, Vincent Grossi, Katell Guizien, Ludwig Jardillier, Pascal Jouquet, Fabien Joux, Aurore Kaisermann, Oliver Kaltz, Jean-Christophe Lata, Antoine Lecerf, Corinne Leyval, Patricia Luis, Estelle Masseret, Audrey Niboyet, Philippe Normand, Frédéric Plewniak, Franck Poly, Soizic Prado, Achim Quaiser, Pascal Ratet, Agnès Richaume, Jean-Luc Rolland, Jean-Luc Rols, Jf Rontani, Francesca Rossi, Sophie Sablé, P Sivadon, Philippe Soudant, Christian Tamburini, Aline Tribollet, Claire Valiente Moro, France van Wambeke, Philippe Vandenkoornhuyse, Stéphane Vuilleumier, Philippe Vandenkoornhuyse
- article
- Environmental Science and Pollution Research, 2015, 22 (18), pp.13577-13598. ⟨10.1007/s11356-015-5164-5⟩
- identifiant
- hal-01247096
- DOI
- DOI : 10.1007/s11356-015-5164-5
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Anaerobic nitrification-denitrification mediated by Mn-oxides in meso-tidal sediments: Implications for N-2 and N2O production
- auteur
- Sheryl Fernandes, Cedric Javanaud, Axel Aigle, Valerie Michotey, Sophie Guasco, Jonathan Deborde, Bruno Deflandre, Pierre Anschutz, Patricia Bonin
- article
- Journal of Marine Systems, 2015, 144, pp.1-8. ⟨10.1016/j.jmarsys.2014.11.011⟩
- identifiant
- hal-01157960
- DOI
- DOI : 10.1016/j.jmarsys.2014.11.011
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Oil spill effects on macrofaunal communities and bioturbation of pristine marine sediments (Caleta Valdés, Patagonia, Argentina): experimental evidence of low resistance capacities of benthic systems without history of pollution
- auteur
- Agustina Ferrando, Emilia Gonzalez, Marcos Franco, Marta Commendatore, Marina Nievas, Cécile Militon, Georges Stora, Franck Gilbert, José Luis Esteves, Philippe Cuny
- article
- Environmental Science and Pollution Research, 2015, vol. 22 (n° 20), pp. 15294-15306. ⟨10.1007/s11356-015-4167-6⟩
- identifiant
- hal-01223400
- DOI
- DOI : 10.1007/s11356-015-4167-6
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Diversity of magnetotactic bacteria from a French pristine Mediterranean area.
- auteur
- Maxime Fuduche, Anne Postec, Sylvain Davidson, Jean-Paul Chauvin, Grégoire Galès, Agnès Hirschler-Réa, Bernard Ollivier, Long-Fei Wu, Nathalie Pradel
- article
- Current Microbiology, 2015, 70 (4), pp.499-505. ⟨10.1007/s00284-014-0745-y⟩
- identifiant
- hal-01146287
- DOI
- DOI : 10.1007/s00284-014-0745-y
- Accès au bibtex
-
- titre
- Sporanaerobacter
- auteur
- Hernandez-Eugenio G, Marie Laure Fardeau, Jean-Louis Garcia, Bernard Ollivier
- article
- Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria (BMSAB), 2015, ⟨10.1002/9781118960608.gbm00720⟩
- identifiant
- hal-02884237
- DOI
- DOI : 10.1002/9781118960608.gbm00720
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Functional response of an adapted subtidal macrobenthic community to an oil spill: macrobenthic structure and bioturbation activity over time throughout an 18-month field experiment
- auteur
- Franck Gilbert, Georges Stora, Philippe Cuny
- article
- Environmental Science and Pollution Research, 2015, 22 (20), pp.15285-15293. ⟨10.1007/s11356-014-3906-4⟩
- identifiant
- hal-03518977
- DOI
- DOI : 10.1007/s11356-014-3906-4
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Sporobacter
- auteur
- Isabelle Grech-Mora, Marie Laure Fardeau, Jean-Louis Garcia, Bernard Ollivier
- article
- Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria (BMSAB), 2015, ⟨10.1002/9781118960608.gbm00679⟩
- identifiant
- hal-02884228
- DOI
- DOI : 10.1002/9781118960608.gbm00679
- Accès au bibtex
-
- titre
- Aminobacterium thunnarium sp. nov., a mesophilic, amino acid-degrading bacterium isolated from an anaerobic sludge digester, pertaining to the phylum Synergistetes.
- auteur
- Olfa Hamdi, Wajdi Ben Hania, Anne Postec, Hassib Bouallagui, Moktar Hamdi, Patricia Bonin, Bernard Ollivier, Marie-Laure Fardeau
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2015, 65 (Pt 2), pp.609-14. ⟨10.1099/ijs.0.068965-0⟩
- identifiant
- hal-01177834
- DOI
- DOI : 10.1099/ijs.0.068965-0
- Accès au bibtex
-
- titre
- Thermodesulfobacterium
- auteur
- Claude Hatchikian, Bernard Ollivier
- article
- Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria (BMSAB), 2015, ⟨10.1002/9781118960608.gbm01267⟩
- identifiant
- hal-02884181
- DOI
- DOI : 10.1002/9781118960608.gbm01267
- Accès au bibtex
-
- titre
- Thermodesulfobacteria class. nov.
- auteur
- Claude Hatchikian, Bernard Ollivier
- article
- Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria (BMSAB), 2015, ⟨10.1002/9781118960608.cbm00049⟩
- identifiant
- hal-02884197
- DOI
- DOI : 10.1002/9781118960608.cbm00049
- Accès au bibtex
-
- titre
- Thermodesulfobacteriaceae fam. nov.
- auteur
- Claude Hatchikian, Bernard Ollivier
- article
- Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria (BMSAB), 2015, ⟨10.1002/9781118960608.fbm00251⟩
- identifiant
- hal-02884187
- DOI
- DOI : 10.1002/9781118960608.fbm00251
- Accès au bibtex
-
- titre
- Thermodesulfobacteriales ord. nov.
- auteur
- Claude Hatchikian, Bernard Ollivier
- article
- Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria (BMSAB), 2015, ⟨10.1002/9781118960608.obm00113⟩
- identifiant
- hal-02884200
- DOI
- DOI : 10.1002/9781118960608.obm00113
- Accès au bibtex
-
- titre
- Evidence for host specificity among dominant bacterial symbionts in temperate gorgonian corals
- auteur
- Marie La Rivière, Joaquim Garrabou, Marc Bally
- article
- Coral Reefs, 2015, 34 (4), pp.1087-1098. ⟨10.1007/s00338-015-1334-7⟩
- identifiant
- mnhn-04056907
- DOI
- DOI : 10.1007/s00338-015-1334-7
- Accès au bibtex
-
- titre
- H4K44 Acetylation Facilitates Chromatin Accessibility during Meiosis
- auteur
- Matthieu Legendre, Audrey Lartigue, Lionel Bertaux, Sandra Jeudy, Julia Bartoli, Magali Lescot, Jean-Marie Alempic, Claire Ramus, Christophe Bruley, Karine Labadie, Lyubov Shmakova, Elizaveta Rivkina, Yohann Coute, Chantal Abergel, Jean-Michel Claverie
- article
- Cell Reports, 2015, 13 (9), pp.1772-1780. ⟨10.1016/j.celrep.2015.10.070⟩
- identifiant
- hal-02193350
- DOI
- DOI : 10.1016/j.celrep.2015.10.070
- Accès au bibtex
-
- titre
- Ecological significance of Synergistetes in the biological treatment of tuna cooking wastewater by an anaerobic sequencing batch reactor.
- auteur
- Cécile Militon, Olfa Hamdi, Valerie Michotey, Marie-Laure Fardeau, Bernard Ollivier, Hassib Bouallagui, Moktar Hamdi, Patricia Bonin
- article
- Environmental Science and Pollution Research, 2015, pp.2015 Jul 22. ⟨10.1007/s11356-015-4973-x⟩
- identifiant
- hal-01201712
- DOI
- DOI : 10.1007/s11356-015-4973-x
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Dynamics of bacterial assemblages and removal of polycyclic aromatic hydrocarbons in oil-contaminated coastal marine sediments subjected to contrasted oxygen regimes
- auteur
- Cécile Militon, Ronan Jezequel, Franck Gilbert, Yannick Corsellis, Léa Sylvi, Cristiana Cravo-Laureau, Robert Duran, Philippe Cuny
- article
- Environmental Science and Pollution Research, 2015, 22 (20), pp.15260-15272. ⟨10.1007/s11356-015-4510-y⟩
- identifiant
- hal-01233392
- DOI
- DOI : 10.1007/s11356-015-4510-y
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Dynamic of bacterial communities attached to lightened phytodetritus
- auteur
- Morgan Petit, Patricia Bonin, Remi Amiraux, Valerie Michotey, Sophie Guasco, Joshua Armitano, Cécile Jourlin-Castelli, Frederic Vaultier, Vincent Méjean, Jean-Francois Rontani
- article
- Environmental Science and Pollution Research, 2015, 22 (18), pp.13681-92. ⟨10.1007/s11356-015-4209-0⟩
- identifiant
- hal-01201708
- DOI
- DOI : 10.1007/s11356-015-4209-0
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Microbial diversity in a submarine carbonate edifice from the serpentinizing hydrothermal system of the Prony Bay (New Caledonia) over a 6-year period
- auteur
- Anne Postec, Marianne Quéméneur, Méline Bes, Nan Mei, Fatma Ben Aissa-Fennira, Claude Payri, Bernard Pelletier, Christophe Monnin, Linda Guentas-Dombrowsky, Bernard Ollivier, Emmanuelle Gérard, Céline Pisapia, Martine Gérard, Bénédicte Ménez, Gaël Erauso
- article
- Frontiers in Microbiology, 2015, 6, pp.857. ⟨10.3389/fmicb.2015.00857⟩
- identifiant
- hal-01221183
- DOI
- DOI : 10.3389/fmicb.2015.00857
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Endolithic microbial communities in carbonate precipitates from serpentinite-hosted hyperalkaline springs of the Voltri Massif (Ligurian Alps, Northern Italy).
- auteur
- Marianne Quemeneur, Alexandra Palvadeau, Anne Postec, Christophe Monnin, Valérie Chavagnac, Bernard Ollivier, Gaël Erauso
- article
- Environmental Science and Pollution Research, 2015, pp.10.1007/s11356-015-4113-7. ⟨10.1007/s11356-015-4113-7⟩
- identifiant
- hal-01177194
- DOI
- DOI : 10.1007/s11356-015-4113-7
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Growth of the Obligate Anaerobe Desulfovibrio vulgaris Hildenborough under Continuous Low Oxygen Concentration Sparging: Impact of the Membrane-Bound Oxygen Reductases
- auteur
- Fanny Ramel, Gael Brasseur, Laetitia Pieulle, Odile Valette, Agnès Hirschler-Réa, Marie Laure Fardeau, Alain Dolla
- article
- PLoS ONE, 2015, 10, pp.e0123455. ⟨10.1371/journal.pone.0123455⟩
- identifiant
- hal-01216176
- DOI
- DOI : 10.1371/journal.pone.0123455
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Crystallographic studies of [NiFe]-hydrogenase mutants: towards consensus structures for the elusive unready oxidized states.
- auteur
- Anne Volbeda, Lydie Martin, Elodie Barbier, Oscar Gutiérrez-Sanz, Antonio L de Lacey, Pierre-Pol Liebgott, Sébastien Dementin, Marc Rousset, Juan-Carlos Fontecilla-Camps
- article
- Journal of Biological Inorganic Chemistry, 2015, 20 (1), pp.11-22. ⟨10.1007/s00775-014-1203-9⟩
- identifiant
- hal-01166131
- DOI
- DOI : 10.1007/s00775-014-1203-9
- Accès au bibtex
-
Book sections
- titre
- Contributions of Descriptive and Functional Genomics to Microbial Ecology
- auteur
- Philippe Bertin, Valerie Michotey, Philippe Normand
- article
- Jean-Claude Bertrand; Pierre Caumette; Philippe Lebaron; Robert Matheron; Philippe Normand; Télesphore Sime-Ngando. Environmental Microbiology: Fundamentals and Applications, Springer Netherlands, pp.831-846, 2015, ⟨10.1007/978-94-017-9118-2_18⟩
- identifiant
- hal-02457946
- DOI
- DOI : 10.1007/978-94-017-9118-2_18
- Accès au bibtex
-
- titre
- Antares Neutrino telescope and Deap Sea Observatory,
- auteur
- V. Bertin, J. Brunner, J. Carr, P. Coyle, C. Curtil, J. Destelle, A. Deschamps, S. Escoffier, K. Graf, C. Gojak, J. Hössl, R. Lahmann, Dominique Lefèvre, C. Lévèque, Christian Tamburini, P. Schuller, H. van Haren
- article
- Seafloor Observatories - A New Vision of the Earth from the Abyss, 12, Springer Berlin Heidelberg, pp.369-414, 2015
- identifiant
- hal-02149668
- Accès au bibtex
-
- titre
- Biogeochemical Cycles
- auteur
- Jean-Claude Bertrand, Patricia Bonin, Pierre Caumette, Jean-Pierre Gattuso, Gérald Grégori, Remy Guyoneaud, Xavier Le Roux, Robert Matheron, Franck Poly
- article
- Jean-Claude Bertrand; Pierre Caumette; Philippe Lebaron; Robert Matheron; Philippe Normand; Télesphore Sime-Ngando. Environmental Microbiology: Fundamentals and Applications, Springer Netherlands, pp.511-617, 2015, 978-94-017-9118-2. ⟨10.1007/978-94-017-9118-2_14⟩
- identifiant
- hal-02457918
- DOI
- DOI : 10.1007/978-94-017-9118-2_14
- Accès au bibtex
-
- titre
- Mudflat Benthic Spill Simulations
- auteur
- Cristiana Cravo-Laureau, Ronan Jézéquel, Franck Gilbert, Philippe Cuny, Robert Duran
- article
- McGenity, Terry J., Timmis, Kenneth N., Fernandez, Balbina Nogales. Hydrocarbon and Lipid Microbiology Protocols. Meso- and Microcosms, Springer Protocols Handbooks, pp.79-89, 2015, 978-3-662-45179-3. ⟨10.1007/8623_2015_52⟩
- identifiant
- hal-02968493
- DOI
- DOI : 10.1007/8623_2015_52
- Accès au bibtex
-
Reports
- titre
- Atelier de Réflexion Prospective MERMED : adaptation aux changements globaux en mer Méditerranée
- auteur
- F. Boulier, V. Chagué, T. Changeux, D. Lacroix, Christian Chaboud, Philippe Charvis, Philippe Cury, Florence Galletti, François Le Loc'h, Christophe Leboulanger, Bernard Moizo, Olivier Pringault
- article
- [Rapport de recherche] Agropolis International. 2015, 12 p
- identifiant
- hal-02566399
- Accès au bibtex
-
- titre
- ARP MERMED Forward-thinking Workshop : adapting to global changes in the Mediterranean Sea
- auteur
- F. Boulier (coord.), V. Chagué (coord.), T. Changeux, D. Lacroix (coord.), Christian Chaboud (collab.), Philippe Charvis (collab.), Philippe Cury (collab.), Florence Galletti (collab.), François Le Loc’h, Christophe Leboulanger, Bernard Moizo (collab.), Olivier Pringault
- article
- [Research Report] Agropolis International. 2015, 12 p
- identifiant
- hal-02566419
- Accès au bibtex
-
2014
Journal articles
- titre
- Constraining the neutrino emission of gravitationally lensed Flat-Spectrum Radio Quasars with ANTARES data
- auteur
- S. Adrián-Martínez, A. Albert, M. Andre, G. Anton, M. Ardid, J. J. Aubert, B. Baret, J. Barrios-Marti, S. Basa, V. Bertin, S. Biagii, C. Bogazzi, R. Bormuth, M. Bou-Cabo, M. C. Bouwhuis, R. Bruijn, J. Brunner, J. Busto, A. Capone, L. Caramete, J. Carr, T. Chiarusi, M. Circella, R. Coniglione, L. Core, H. Costantini, P. Coyle, A. Creusot, G. de Rosa, I. Dekeyser, A. Deschamps, G. de Bonis, C. Distefano, C. Donzaud, D. Dornic, Q. Dorosti, D. Drouhin, A. Dumas, T. Eberl, D. Elsaesser, A. Enzenhoefer, S. Escoffier, K. Fehn, I. Fells, P. Fermani, F. Folger, L. A. Fusco, S. Galata, P. Gay, S. Geisselsoeder, K. Geyer, V. Giordano, A. Gleixner, J. P. Gomez-Gonzalez, K. Graf, G. Guillard, H. Van Haren, A. J. Heijboer, Y. Hello, J. J. Hernandez-Rey, B. Herold, A. Herrero, J. Hoessl, J. Hofestaedt, C. Hugon, C. W. James, M. De Jong, M. Kadler, O. Kalekin, A. Kappes, U. Katz, D. Kiessling, P. Kooijman, A. Kouchner, I. Kreykenbohm, V. Kulikovskiy, R. Lahmann, E. Lambard, G. Lambard, Dominique Lefèvre, E. Leonora, H. Loehner, S. Loucatos, S. Mangano, M. Marcelin, A. Margiotta, J. A. Martinez-Mora, S. Martini, A. Mathieu, T. Michael, P. Migliozzi, C. Mueller, M. Neff, E. Nezri, D. Palioselitis, G. E. Pavalas, C. Perrina, V. Popa, T. Pradier, C. Racca, G. Riccobene, R. Richter, K. Roensch, A. Rostovtsev, M. Saldana, D. F. E. Samtleben, A. Sanchez-Losa, M. Sanguineti, J. Schmid, J. Schnabel, S. Schulte, F. Schuessler, T. Seitz, C. Sieger, A. Spies, M. Spurioi, J. J. M. Steijger, Th. Stolarczyk, M. Taiuti, Christian Tamburini, Y. Tayalati, A. Trovato, M. Tselengidou, C. Toennis, B. Vallage, Corentin Vallée, V. van Elewyck, E. Visser, D. Vivolo, S. Wagner, J. Wilms, E. Wolf, K. Yatkin, H. Yepes, J. D. Zornoza, J. Zúñiga, E. E. Falco, Antares Collaboration
- article
- JOURNAL OF COSMOLOGY AND ASTROPARTICLE PHYSICS, 2014, 11, ⟨10.1088/1475-7516/2014/11/017⟩
- identifiant
- hal-01441852
- DOI
- DOI : 10.1088/1475-7516/2014/11/017
- Accès au bibtex
-
- titre
- A search for time dependent neutrino emission from microquasars with the ANTARES telescope
- auteur
- S. Adrián-Martínez, A. Albert, M. André, M. Anghinolfi, G. Anton, M. Ardid, T. Astraatmadja, J.-J. Aubert, B. Baret, J. Barrios, S. Basa, V. Bertin, S. Biagi, C. Bigongiari, C. Bogazzi, B. Bouhou, M. C. Bouwhuis, J. Brunner, J. Busto, A. Capone, L. Caramete, C. Cârloganu, J. Carr, S. Cecchini, P. Charvis, T. Chiarusi, M. Circella, R. Coniglione, L. Core, H. Costantini, P. Coyle, A. Creusot, G. de Rosa, I. Dekeyser, Anne Deschamps, G. de Bonis, C. Distefano, C. Donzaud, D. Dornic, Q. Dorosti, D. Drouhin, A. Dumas, T. Eberl, D. Elsässer, U. Emanuele, A. Enzenhöfer, J.-P. Ernenwein, S. Escoffier, K. Fehn, I. Felis, P. Fermani, F. Folger, L.A. Fusco, S. Galatà, Pascal Gay, S. Geisselsöder, K. Geyer, V. Giordano, A. Gleixner, J. P. Gómez-González, K. Graf, G. Guillard, H. van Haren, A. J. Heijboer, Y. Hello, J.J. Hernández-Rey, B. Herold, J. Hössl, J. Hofestädt, C. W. James, M. de Jong, M. Kadler, O. Kalekin, A. Kappes, U. Katz, P. Kooijman, A. Kouchner, I. Kreykenbohm, V. Kulikovskiy, R. Lahmann, E. Lambard, G. Lambard, G. Larosa, D. Lattuada, Dominique Lefèvre, E. Leonora, H. Loehner, S. Loucatos, S. Mangano, M. Marcelin, A. Margiotta, J. A. Martínez-Mora, S. Martini, A. Mathieu, T. Michael, P. Migliozzi, T. Montaruli, C. Müller, M. Neff, E. Nezri, D. Palioselitis, G. E. Păvălaş, C. Perrina, P. Piattelli, V. Popa, Thierry Pradier, C. Racca, G. Riccobene, R. Richter, C. Rivière, A. Robert, K. Roensch, A. Rostovtsev, M. Salda\na, D. F. E. Samtleben, A. Sánchez-Losa, M. Sanguineti, P. Sapienza, J. Schmid, J. Schnabel, S. Schulte, F. Schüssler, T. Seitz, C. Sieger, A. Spies, M. Spurio, J.J. M. Steijger, T. Stolarczyk, M. Taiuti, Christian Tamburini, Y. Tayalati, A. Trovato, B. Vallage, Corentin Vallée, V. van Elewyck, P. Vernin, Eelco Visser, D. Vivolo, S. Wagner, J. Wilms, E. de Wolf, K. Yatkin, H. Yepes, J. D. Zornoza, J. Zúñiga
- article
- Journal of High Energy Astrophysics, 2014, 3-4, pp.9-17. ⟨10.1016/j.jheap.2014.06.002⟩
- identifiant
- in2p3-01071564
- DOI
- DOI : 10.1016/j.jheap.2014.06.002
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Transcriptomics Reveal Several Gene Expression Patterns in the Piezophile Desulfovibrio hydrothermalis in Response to Hydrostatic Pressure
- auteur
- Amira Amrani, Aurélie Bergon, Hélène Holota, Christian Tamburini, Marc Garel, Bernard Ollivier, Jean Imbert, Alain Dolla, Nathalie Pradel
- article
- PLoS ONE, 2014, 9 (9), pp.e106831. ⟨10.1371/journal.pone.0106831⟩
- identifiant
- hal-01628348
- DOI
- DOI : 10.1371/journal.pone.0106831
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Vallitalea pronyensis sp. nov., isolated from a marine alkaline hydrothermal chimney
- auteur
- F. Ben Aissa, Anne Postec, Gaël Erauso, C. Payri, B. Pelletier, M. Hamdi, B. Ollivier, M.-L. Fardeau
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2014, 64 (Pt 4), pp.1160 - 1165. ⟨10.1099/ijs.0.055756-0⟩
- identifiant
- hal-01390088
- DOI
- DOI : 10.1099/ijs.0.055756-0
- Accès au bibtex
-
- titre
- Microbial community dynamics in the forefield of glaciers
- auteur
- James Bradley, Joy Singarayer, Alexandre Anesio
- article
- Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, 2014, 281 (1795), pp.20140882. ⟨10.1098/rspb.2014.0882⟩
- identifiant
- hal-04450532
- DOI
- DOI : 10.1098/rspb.2014.0882
- Accès au bibtex
-
- titre
- Bacterial diversity in relatively pristine and anthropogenically-influenced mangrove ecosystems (Goa, India).
- auteur
- Sheryl Fernandes, David L Kirchman, Valerie Michotey, Patricia Bonin, P A Lokabharathi
- article
- Brazilian Journal of Microbiology, 2014, 45 (4), pp.1161-71. ⟨10.1590/S1517-83822014000400006⟩
- identifiant
- hal-01166877
- DOI
- DOI : 10.1590/S1517-83822014000400006
- Accès au bibtex
-
- titre
- Reconciliation of the carbon budget in the ocean’s twilight zone
- auteur
- Sarah L. C. Giering, Richard Sanders, Richard S. Lampitt, Thomas R. Anderson, Christian Tamburini, Mehdi Boutrif, Mikhail V. Zubkov, Chris M. Marsay, Stephanie A. Henson, Kevin Saw, Kathryn Cook, Daniel J. Mayor
- article
- Nature, 2014, 507 (7493), pp.480-483. ⟨10.1038/nature13123⟩
- identifiant
- hal-01077017
- DOI
- DOI : 10.1038/nature13123
- Accès au bibtex
-
- titre
- Mannitol metabolism in brown algae involves a new phosphatase family.
- auteur
- Agnès Groisillier, Zhanru Shao, Gurvan Michel, Sophie Goulitquer, Patricia Bonin, Stefan Krahulec, Bernd Nidetzky, Delin Duan, Catherine Boyen, Thierry Tonon
- article
- Journal of Experimental Botany, 2014, 65 (2), pp.559-70. ⟨10.1093/jxb/ert405⟩
- identifiant
- hal-01002445
- DOI
- DOI : 10.1093/jxb/ert405
- Accès au bibtex
-
- titre
- Desulfatiferula berrensis sp. nov., a n-alkene-degrading sulfate-reducing bacterium isolated from estuarine sediments.
- auteur
- Florence Hakil, Oulfat Amin, Agnès Hirschler-Réa, Damien Mollex, Vincent Grossi, Robert Duran, Robert Matheron, Cristiana Cravo-Laureau
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2014, 64 (Pt 2), pp.540-4. ⟨10.1099/ijs.0.057174-0⟩
- identifiant
- hal-00976570
- DOI
- DOI : 10.1099/ijs.0.057174-0
- Accès au bibtex
-
- titre
- Comparative genomic analysis provides insights into the evolution and niche adaptation of marine Magnetospira sp. QH-2 strain
- auteur
- Boyang Ji, Sheng-Da Zhang, Pascal Arnoux, Zoe Rouy, François Alberto, Nadège Philippe, Dorothée Murat, Wei-Jia Zhang, Jean-Baptiste Rioux, Nicolas Ginet, Monique Sabaty, Sophie Mangenot, Nathalie Pradel, Jiesheng Tian, Jing Yang, Lichen Zhang, Wenyan Zhang, Hongmiao Pan, Bernard Henrissat, Pedro M Coutinho, Ying Li, Tian Xiao, Claudine Médigue, Valérie Barbe, David Pignol, Emmanuel Talla, Long-Fei Wu
- article
- Environmental Microbiology, 2014, 16 (2), pp.525-544. ⟨10.1111/1462-2920.12180⟩
- identifiant
- hal-02463127
- DOI
- DOI : 10.1111/1462-2920.12180
- Accès au bibtex
-
- titre
- Anaerobic oxidation of long-chain n-alkanes by the hyperthermophilic sulfate-reducing archaeon, Archaeoglobus fulgidus.
- auteur
- Nadia Khelifi, Oulfat Amin Ali, Philippe Roche, Vincent Grossi, Céline Brochier-Armanet, Odile Valette, Bernard Ollivier, Alain Dolla, Agnès Hirschler-Réa
- article
- The International Society of Microbiologial Ecology Journal, 2014, pp.18. ⟨10.1038/ismej.2014.58⟩
- identifiant
- hal-01165315
- DOI
- DOI : 10.1038/ismej.2014.58
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Effects of soot deposition on particle dynamics and microbial processes in marine surface waters
- auteur
- Xavier Mari, Jérôme Lefèvre, Jean-Pascal Torréton, Yvan Bettarel, Olivier Pringault, Emma J. Rochelle-Newall, Patrick Marchesiello, Christophe E. Menkès, Martine Rodier, Christophe Migon, Chiaki Motegi, Markus G Weinbauer, Louis Legendre
- article
- Global Biogeochemical Cycles, 2014, 28 (7), pp.662-678. ⟨10.1002/2014GB004878⟩
- identifiant
- hal-01139299
- DOI
- DOI : 10.1002/2014GB004878
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Relation between deep bioluminescence and oceanographic variables: A statistical analysis using time–frequency decompositions
- auteur
- S. Martini, David Nerini, Christian Tamburini
- article
- Progress in Oceanography, 2014, 127, pp.117-128. ⟨10.1016/j.pocean.2014.07.003⟩
- identifiant
- hal-01076992
- DOI
- DOI : 10.1016/j.pocean.2014.07.003
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Fermentative hydrogen production by a new alkaliphilic Clostridium sp (strain PROH2) isolated from a shallow submarine hydrothermal chimney in Prony Bay, New Caledonia
- auteur
- Nan Mei, Nesrine Zergane, Anne Postec, Gaël Erauso, Angelique Oilier, Claude Payri, Bernard Pelletier, Marie-Laure Fardeau, Bernard Ollivier, Marianne Quemeneur
- article
- International Journal of Hydrogen Energy, 2014, 39 (34), pp.19465-19473. ⟨10.1016/j.ijhydene.2014.09.111⟩
- identifiant
- hal-01178221
- DOI
- DOI : 10.1016/j.ijhydene.2014.09.111
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Do furanic and phenolic compounds of lignocellulosic and algae biomass hydrolyzate inhibit anaerobic mixed cultures? A comprehensive review
- auteur
- F. Monlau, C. Sambusiti, Abdellatif Barakat, Marianne Quemeneur, Eric Trably, Jean-Philippe Steyer, Hélène Carrère
- article
- Biotechnology Advances, 2014, 32 (5), pp.934 - 951. ⟨10.1016/j.biotechadv.2014.04.007⟩
- identifiant
- hal-01809612
- DOI
- DOI : 10.1016/j.biotechadv.2014.04.007
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Fluid chemistry of the low temperature hyperalkaline hydrothermal system of Prony Bay (New Caledonia)
- auteur
- C. Monnin, V. Chavagnac, C. Boulart, B. Menez, M. Gerard, E. Gerard, C. Pisapia, Marianne Quemeneur, Gaël Erauso, Anne Postec, L. Guentas-Dombrowski, C. Payri, B. Pelletier
- article
- Biogeosciences, 2014, 11 (20), pp.5687-5706. ⟨10.5194/bg-11-5687-2014⟩
- identifiant
- hal-01178210
- DOI
- DOI : 10.5194/bg-11-5687-2014
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Spatial distribution of microbial communities in the shallow submarine alkaline hydrothermal field of the Prony Bay, New Caledonia
- auteur
- Marianne Quéméneur, Méline Bes, Anne Postec, Nan Mei, Jérôme Hamelin, Christophe Monnin, Valérie Chavagnac, Claude Payri, Bernard Pelletier, Linda Guentas-Dombrowsky, Martine Gérard, Céline Pisapia, Emmanuelle Gérard, Bénédicte Ménez, Bernard Ollivier, Gaël Erauso
- article
- Environmental Microbiology Reports, 2014, 6 (2014), pp.665-674. ⟨10.1111/1758-2229.12184⟩
- identifiant
- hal-01190159
- DOI
- DOI : 10.1111/1758-2229.12184
- Accès au bibtex
-
Conference papers
- titre
- Production d’hydrogène dans les systèmes hydrothermaux hyperalcalins des ophiolites (Oman, Ligurie, Nouvelle Calédonie)
- auteur
- C. Monnin, V. Chavagnac, C. Boulart, G. Ceuleneer, Guilhem Hoareau, B. Ménez, E. Gérard, M. Gérard, M. Quéméneur, Gaël Erauso, Anne Postec, L. Guentas-Dombrowski, C. Payri, B. Pelletier
- article
- 24ème Réunion des Sciences de la Terre : RST 2014, Pau, France, Oct 2014, 2014, Unknown, Unknown Region
- identifiant
- hal-01815920
- Accès au bibtex
-
Book sections
- titre
- Members of the order Thermotogales: from microbiology to hydrogen production.
- auteur
- Martina Cappelletti, Davide Zannoni, Anne Postec, Bernard Ollivier
- article
- Davide Zannoni, Roberto De Philippis. Microbial BioEnergy: Hydrogen Production, Springer, pp.197-224, 2014, Advances in Photosynthesis and Respiration, 978-94-017-8553-2. ⟨10.1007/978-94-017-8554-9_9⟩
- identifiant
- hal-01027589
- DOI
- DOI : 10.1007/978-94-017-8554-9_9
- Accès au bibtex
-
- titre
- Methods for Studying Microorganisms in the Environment
- auteur
- Fabien Joux, Jean Claude Bertrand, Rutger de Wit, Vincent Grossi, Laurent Intertaglia, Philippe Lebaron, Valerie Michotey, Philippe Normand, Pierre P. Peyret, Patrick Raimbault, Christian Tamburini, Laurent Urios
- article
- Environmental Microbiology: Fundamentals and Applications, Springer Netherlands, pp.757-829, 2014, 978-94-017-9117-5. ⟨10.1007/978-94-017-9118-2_17⟩
- identifiant
- hal-01235538
- DOI
- DOI : 10.1007/978-94-017-9118-2_17
- Accès au bibtex
-
- titre
- Petroleum: from formation to microbiology.
- auteur
- Bernard Ollivier, Jean Borgomano, Philippe Oger
- article
- Microbial life in the deep biosphere, De Gruyter, pp.161 -185, 2014
- identifiant
- hal-00989881
- Accès au bibtex
-
Poster communications
-

- titre
- Dynamique de l’holobionte corallien et plasticité transcriptomique : variabilité interspécifique, interpopulationnelle et interindividuelle
- auteur
- Kelly Brener, Jeremie Vidal-Dupiol, Mehdi Adjeroud, Pascal Romans, Julien Loubet, Rémi Pillot, D. Aurelle, Marine Pratlong, Anne Haguenauer, Pierre Pontaroti, Pascal Mirleau, Marc Bally, Eve Toulza, Guillaume Mitta
- article
- Journée de doctoriales Aragoyennes, Apr 2014, Banyuls sur Mer, France
- identifiant
- hal-01134460
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Reports
- titre
- Atelier de réflexion prospective MERMED : adaptation aux changements globaux en mer Méditerranée : rapport final
- auteur
- B. Hubert, M. Broin, F. Boulier, V. Chagué, T. Changeux, D. Lacroix, Christian Chaboud, Philippe Charvis, Philippe Cury, Florence Galletti, François Guilhaumon, François Le Loc'h, Christophe Leboulanger, Bernard Moizo, Bernard Ollivier, Olivier Pringault
- article
- [Rapport de recherche] Agropolis International. 2014, 156 p
- identifiant
- hal-02860473
- Accès au bibtex
-
2013
Journal articles
- titre
- Measurement of the atmospheric $\nu_\mu$ energy spectrum from 100 GeV to 200 TeV with the ANTARES telescope
- auteur
- S. Adrián-Martínez, A. Albert, Imen Al Samarai, M. André, M. Anghinolfi, G. Anton, S. Anvar, M. Ardid, T. Astraatmadja, J-J. Aubert, B. Baret, J. Barrios-Martí, S. Basa, V. Bertin, S. Biagi, C. Bigongiari, C. Bogazzi, B. Bouhou, M. C. Bouwhuis, R. Bruijn, J. Brunner, J. Busto, A. Capone, L. Caramete, C. Carloganu, J. Carr, S. Cecchini, Z. Charif, Ph. Charvis, T. Chiarusi, M. Circella, F. Classen, L. Core, H. Costantini, P. Coyle, A. Creusot, C. Curtil, I. Dekeyser, Anne Deschamps, G. de Bonis, M. P. Decowski, C. Distefano, C. Donzaud, D. Dornic, Q. Dorosti, D. Drouhin, A. Dumas, T. Eberl, U. Emanuele, A. Enzenhöfer, J.-P. Ernenwein, S. Escoffier, K. Fehn, P. Fermani, V. Flaminio, F. Folger, U. Fritsch, L. A. Fusco, S. Galatà, Pascal Gay, S. Geisselsöder, K. Geyer, G. Giacomelli, V. Giordano, A. Gleixner, J. P. Gómez-González, K. Graf, G. Guillard, H. van Haren, A. J. Heijboer, Y. Hello, J. J. Hernández-Rey, B. Herold, J. Hössl, C. W. James, M. de Jong, M. Kadler, O. Kalekin, A. Kappes, U. Katz, P. Kooijman, A. Kouchner, I. Kreykenbohm, V. Kulikovskiy, R. Lahmann, E. Lambard, G. Lambard, G. Larosa, D. Lattuada, Dominique Lefèvre, E. Leonora, D. Lo Presti, H. Loehner, S. Loucatos, F. Louis, S. Mangano, M. Marcelin, A. Margiotta, J. A. Martínez-Mora, S. Martini, T. Michael, T. Montaruli, M. Morganti, H. Motz, C. Mueller, M. Neff, E. Nezri, D. Palioselitis, G. E. Pavalas, C. Perrina, P. Piattelli, V. Popa, T. Pradier, C. Racca, R. Richter, C. Rivière, A. Robert, K. Roensch, A. Rostovtsev, D. F. E. Samtleben, M. Sanguineti, P. Sapienza, J. Schmid, J. Schnabel, S. Schulte, F. Schüssler, T. Seitz, R. Shanidze, C. Sieger, F. Simeone, A. Spies, M. Spurio, J. J. M. Steijger, Th. Stolarczyk, A. Sánchez-Losa, M. Taiuti, Christian Tamburini, Y. Tayalati, A. Trovato, B. Vallage, Corentin Vallée, V. van Elewyck, P. Vernin, Eelco Visser, S. Wagner, J. Wilms, E. de Wolf, K. Yatkin, H. Yepes, J.D. Zornoza, J. Zúñiga
- article
- European Physical Journal C: Particles and Fields, 2013, 73, pp.2606. ⟨10.1140/epjc/s10052-013-2606-4⟩
- identifiant
- in2p3-00861705
- DOI
- DOI : 10.1140/epjc/s10052-013-2606-4
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Genome Sequence of the Sulfate-Reducing Bacterium Desulfotomaculum hydrothermale Lam5(T).
- auteur
- Oulfat Amin, Marie-Laure Fardeau, Odile Valette, Agnès Hirschler-Réa, Valérie Barbe, Claudine Médigue, Benoit Vacherie, Bernard Ollivier, Philippe N Bertin, Alain Dolla
- article
- Genome Announcements, 2013, 1 (1), epub ahead of print. ⟨10.1128/genomeA.00114-12⟩
- identifiant
- hal-00807485
- DOI
- DOI : 10.1128/genomeA.00114-12
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Virgibacillus natechei sp. nov., A Moderately Halophilic Bacterium Isolated from Sediment of a Saline Lake in Southwest of Algeria.
- auteur
- Meriam Amziane, Farida Metiaz, Amel Darenfed-Bouanane, Zahia Djenane, Okba Selama, Ahmed Abderrahmani, Jean Luc Cayol, Marie Laure Fardeau
- article
- Current Microbiology, 2013, pp.1-60. ⟨10.1007/s00284-012-0300-7⟩
- identifiant
- hal-00776311
- DOI
- DOI : 10.1007/s00284-012-0300-7
- Accès au bibtex
-
- titre
- Mesotoga infera sp. nov., a mesophilic member of the order Thermotogales, isolated from an underground gas storage aquifer.
- auteur
- Wajdi Ben Hania, Anne Postec, Thomas Aüllo, Anthony Ranchou-Peyruse, Gaël Erauso, Céline Brochier-Armanet, Moktar Hamdi, Bernard Ollivier, Stéphanie Saint-Laurent, Michel Magot, Marie-Laure Fardeau
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2013, 63 (Pt 8), pp.3003-8. ⟨10.1099/ijs.0.047993-0⟩
- identifiant
- hal-00972251
- DOI
- DOI : 10.1099/ijs.0.047993-0
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Biochemical, Transcriptional and Translational Evidences of the Phenol-meta-Degradation Pathway by the Hyperthermophilic Sulfolobus solfataricus 98/2
- auteur
- Alexia Comte, Pierre Christen, Sylvain Davidson, Matthieu Pophillat, Jean Lorquin, Richard Auria, Gwenola Simon, Laurie Casalot
- article
- PLoS ONE, 2013, 8 (12), pp.e82397. ⟨10.1371/journal.pone.0082397⟩
- identifiant
- hal-00999455
- DOI
- DOI : 10.1371/journal.pone.0082397
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Evidence for surfactant production by the haloarchaeon Haloferax sp. MSNC14 in hydrocarbon-containing media
- auteur
- Ikram Djeridi, Cécile Militon, Vincent Grossi, Philippe Cuny
- article
- Extremophiles, 2013, 17 (4), pp.669-675. ⟨10.1007/s00792-013-0550-8⟩
- identifiant
- hal-02966876
- DOI
- DOI : 10.1007/s00792-013-0550-8
- Accès au bibtex
-
- titre
- Denitrification activity is closely linked to the total ambient Fe concentration in mangrove sediments of Goa, India
- auteur
- S Fernandes, M Gonsalves, Valerie Michotey, Patricia Bonin, P Lokabharathi
- article
- Estuarine, Coastal and Shelf Science, 2013, 131, pp.64-74. ⟨10.1016/j.ecss.2013.08.008⟩
- identifiant
- hal-00872344
- DOI
- DOI : 10.1016/j.ecss.2013.08.008
- Accès au bibtex
-
- titre
- Desulfotomaculum peckii sp. nov., a moderately thermophilic member of the genus Desulfotomaculum, isolated from an upflow anaerobic filter treating abattoir wastewaters.
- auteur
- Linda Jabari, Hana Gannoun, Jean Luc Cayol, Moktar Hamdi, Bernard Ollivier, Guy Fauque, Marie Laure Fardeau
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2013, 63 (Pt 6), pp.2082-7. ⟨10.1099/ijs.0.043893-0⟩
- identifiant
- hal-00746774
- DOI
- DOI : 10.1099/ijs.0.043893-0
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Complete Genome Sequence of the Piezophilic, Mesophilic, Sulfate-Reducing Bacterium Desulfovibrio hydrothermalis AM13(T.).
- auteur
- Boyang Ji, Gregory Gimenez, Valérie Barbe, Benoit Vacherie, Zoé Rouy, Amira Amrani, Marie-Laure Fardeau, Philippe Bertin, Didier Alazard, Sabine Leroy, Emmanuel Talla, Bernard Ollivier, Alain Dolla, Nathalie Pradel
- article
- Genome Announcements, 2013, 1 (1), epub ahead of print. ⟨10.1128/genomeA.00226-12⟩
- identifiant
- hal-00809071
- DOI
- DOI : 10.1128/genomeA.00226-12
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Insights into dynamics of mobile genetic elements in hyperthermophilic environments from five new thermococcus plasmids.
- auteur
- Mart Krupovic, Mathieu Gonnet, Wajdi Ben Hania, Patrick Forterre, Gaël Erauso
- article
- PLoS ONE, 2013, 8 (1), pp.e49044. ⟨10.1371/journal.pone.0049044⟩
- identifiant
- hal-00748527
- DOI
- DOI : 10.1371/journal.pone.0049044
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Transient Shifts in Bacterial Communities Associated with the Temperate Gorgonian Paramuricea clavata in the Northwestern Mediterranean Sea
- auteur
- Marie La Rivière, Marie Roumagnac, Joaquim Garrabou, M. Bally
- article
- PLoS ONE, 2013, 8 (2), pp.e57385. ⟨10.1371/journal.pone.0057385⟩
- identifiant
- hal-00790768
- DOI
- DOI : 10.1371/journal.pone.0057385
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Impact of contaminated-sediment resuspension on phytoplankton in the Biguglia lagoon (Corsica, Mediterranean Sea)
- auteur
- Céline Lafabrie, M. Garrido, Christophe Leboulanger, Philippe Cecchi, Gérald Grégori, Vanina Pasqualini, O. Pringault
- article
- Estuarine, Coastal and Shelf Science, 2013, 130, pp.70-80
- identifiant
- hal-00872706
- Accès au bibtex
-
- titre
- Vallitalea guaymasensis gen. nov., sp. nov., isolated from marine sediment.
- auteur
- Raja Lakhal, Nathalie Pradel, Anne Postec, Moktar Hamdi, Bernard Ollivier, Anne Godfroy, Marie-Laure Fardeau
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2013, 63 (Pt 8), pp.3019-23. ⟨10.1099/ijs.0.045708-0⟩
- identifiant
- hal-01025550
- DOI
- DOI : 10.1099/ijs.0.045708-0
- Accès au bibtex
-
- titre
- Characterization of Vallitalea guaymasensis gen. nov., sp. nov., a novel marine bacterium, isolated from sediments of Guaymas basin
- auteur
- R Lakhal, Nathalie Pradel, Anne Postec, M Hamdi, Bernard Ollivier, Anne Godfroy, Marie Laure Fardeau
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2013, pp.doi:10.1099/ijs.0.045708-0
- identifiant
- hal-00787559
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Effects of Hydrostatic Pressure on Growth and Luminescence of a Moderately-Piezophilic Luminous Bacteria Photobacterium phosphoreum ANT-2200
- auteur
- Severine Martini, Badr Al Ali, Marc Garel, David Nerini, Vincent Grossi, Muriel Pacton, Laurence Casalot, Philippe Cuny, Christian Tamburini
- article
- PLoS ONE, 2013, 8 (6), pp.e66580. ⟨10.1371/journal.pone.0066580⟩
- identifiant
- hal-01988033
- DOI
- DOI : 10.1371/journal.pone.0066580
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Desulfosporosinus burensis sp. nov., a spore-forming, mesophilic, sulfate-reducing bacterium isolated from a deep clay environment.
- auteur
- Bruno Mayeux, Marie Laure Fardeau, Manon Bartoli, Laurie Casalot, Agnes Vinsot, Marc Labat
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2013, 63 (Pt 2), pp.593-8. ⟨10.1099/ijs.0.035238-0⟩
- identifiant
- hal-00808229
- DOI
- DOI : 10.1099/ijs.0.035238-0
- Accès au bibtex
-
- titre
- Isolation of Thermovenabulum gondwanense from a French hot spring and emended description of the species
- auteur
- Nathalie Pradel, Manon Bartoli, Alain Bernadac, Gregory Gimenez, Bernard Ollivier, Marie-Laure Fardeau
- article
- Antonie van Leeuwenhoek, 2013, 104 (2), pp.271-279. ⟨10.1007/s10482-013-9947-8⟩
- identifiant
- hal-02463100
- DOI
- DOI : 10.1007/s10482-013-9947-8
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- The First Genomic and Proteomic Characterization of a Deep-Sea Sulfate Reducer: Insights into the Piezophilic Lifestyle of Desulfovibrio piezophilus
- auteur
- Nathalie Pradel, Boyang Ji, G Gimenez, E Talla, P Lenoble, Marc Garel, Christian Tamburini, Patrick Fourquet, Régine Lebrun, Philippe Bertin, Yann Denis, Matthieu Pophillat, Valérie Barbe, Bernard Ollivier, Alain Dolla
- article
- PLoS ONE, 2013, 8 (1), pp.e55130. ⟨10.1371/journal.pone.0055130⟩
- identifiant
- hal-00787201
- DOI
- DOI : 10.1371/journal.pone.0055130
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Anaerobic bacterial degradation of pristenes and phytenes in marine sediments does not lead to pristane and phytane during early diagenesis
- auteur
- Jean-Francois Rontani, Patricia Bonin, Sophie Guasco, Frederic Vaultier, John K. Volkman
- article
- Organic Geochemistry, 2013, 58, pp.43-55
- identifiant
- hal-00807479
- Accès au bibtex
-
- titre
- Genome of Phaeocystis globosa virus PgV-16T highlights the common ancestry of the largest known DNA viruses infecting eukaryotes
- auteur
- S. Santini, J. Bartoli, O. Poirot, Magali Lescot, C. Abergel, Valérie Barbe, K. Wommack, A. Noordeloos, C. Brussaard, J.-M. Claverie
- article
- Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2013, 110 (26), pp.10800-10805. ⟨10.1073/pnas.1303251110⟩
- identifiant
- hal-02978222
- DOI
- DOI : 10.1073/pnas.1303251110
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Long-term monitoring programme of the hydrological variability in the Mediterranean Sea: a first overview of the HYDROCHANGES network
- auteur
- K. Schroeder, C. Millot, L. Bengara, S. Ben Ismail, M. Bensi, M. Borghini, G. Budillon, V. Cardin, L. Coppola, C. Curtil, A. Drago, B. El Moumni, J. Font, Jean-Luc Fuda, J. García-Lafuente, G. Gasparini, H. Kontoyiannis, Dominique Lefevre, P. Puig, Patrick Raimbault, G. Rougier, J. Salat, C. Sammari, J. Sánchez Garrido, A. Sanchez-Roman, S. Sparnocchia, Christian Tamburini, I. Taupier-Letage, A. Theocharis, M. Vargas-Yáñez, A. Vetrano
- article
- Ocean Science, 2013, 9 (2), pp.301-324. ⟨10.5194/os-9-301-2013⟩
- identifiant
- hal-03191372
- DOI
- DOI : 10.5194/os-9-301-2013
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Impact of oil on bacterial community structure in bioturbated sediments
- auteur
- Magali Stauffert, Cristiana Cravo-Laureau, Ronan Jezequel, Sandra Barantal, Philippe Cuny, Franck Gilbert, Christine Cagnon, Cécile Militon, David Amouroux, Fatima Mahdaoui, Brice Bouyssière, Georges Stora, François-Xavier Merlin, Robert Duran
- article
- PLoS ONE, 2013, vol. 8, pp. 1-15. ⟨10.1371/journal.pone.0065347⟩
- identifiant
- hal-00867612
- DOI
- DOI : 10.1371/journal.pone.0065347
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Prokaryotic responses to hydrostatic pressure in the ocean - a review
- auteur
- Christian Tamburini, Mehdi Boutrif, Marc Garel, Rita Colwell, Jody W. Deming
- article
- Environmental Microbiology, 2013, 15 (5), pp.1262-1274. ⟨10.1111/1462-2920.12084⟩
- identifiant
- hal-01988054
- DOI
- DOI : 10.1111/1462-2920.12084
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Deep-Sea Bioluminescence Blooms after Dense Water Formation at the Ocean Surface
- auteur
- Christian Tamburini, Miquel Canals, Xavier Durrieu de Madron, Loïc Houpert, Dominique Lefèvre, Séverine Martini, Fabrizio d'Ortenzio, Anne Robert, Pierre Testor, Juan Antonio Aguilar, Imen Al Samarai, Arnaud Albert, Michel André, Marco Anghinolfi, Gisela Anton, Shebli Anvar, Miguel Ardid, Ana Carolina Assis Jesus, Tri L. Astraatmadja, Jean-Jacques Aubert, Bruny Baret, Stéphane Basa, Vincent Bertin, Simone Biagi, Armando Bigi, Ciro Bigongiari, Claudio Bogazzi, Manuel Bou-Cabo, Boutayeb Bouhou, Mieke C. Bouwhuis, Jurgen Brunner, José Busto, Francisco Camarena, Antonio Capone, Christina Cârloganu, Giada Carminati, John Carr, Stefano Cecchini, Ziad Charif, Philippe Charvis, Tommaso Chiarusi, Marco Circella, Rosa Coniglione, Heide Costantini, Paschal Coyle, Christian Curtil, Patrick Decowski, Ivan Dekeyser, Anne Deschamps, Corinne Donzaud, Damien Dornic, Hasankiadeh Q. Dorosti, Doriane Drouhin, Thomas Eberl, Umberto Emanuele, Jean-Pierre Ernenwein, Stéphanie Escoffier, Paolo Fermani, Marcelino Ferri, Vincenzo Flaminio, Florian Folger, Ulf Fritsch, Jean-Luc Fuda, Salvatore Galatà, Pascal Gay, Giorgio Giacomelli, Valentina Giordano, Juan-Pablo Gómez-González, Kay Graf, Goulven Guillard, Garadeb Halladjian, Gregory Hallewell, Hans van Haren, Joris Hartman, Aart J. Heijboer, Yann Hello, Juan Jose Hernández-Rey, Bjoern Herold, Jurgen Hössl, Ching-Cheng Hsu, Marteen de Jong, Matthias Kadler, Oleg Kalekin, Alexander Kappes, Uli Katz, Oksana Kavatsyuk, Paul Kooijman, Claudio Kopper, Antoine Kouchner, Ingo Kreykenbohm, Vladimir Kulikovskiy, Robert Lahmann, Patrick Lamare, Giuseppina Larosa, Dario Lattuada, Gordon Lim, Domenico Lo Presti, Herbert Loehner, Sotiris Loucatos, Salvatore Mangano, Michel Marcelin, Annarita Margiotta, Juan Antonio Martinez-Mora, Athina Meli, Teresa Montaruli, Luciano Moscoso, Holger Motz, Max Neff, Emma Nuel Nezri, Dimitris Palioselitis, Gabriela E. Păvălaş, Kevin Payet, Patrice Payre, Jelena Petrovic, Paolo Piattelli, Nicolas Picot-Clemente, Vlad Popa, Thierry Pradier, Eleonora Presani, Chantal Racca, Corey Reed, Giorgio Riccobene, Carsten Richardt, Roland Richter, Colas Rivière, Kathrin Roensch, Andrei Rostovtsev, Joaquin Ruiz-Rivas, Marius Rujoiu, Valerio G. Russo, Francisco Salesa, Augustin Sánchez-Losa, Piera Sapienza, Friederike Schöck, Jean-Pierre Schuller, Fabian Schussler, Rezo Shanidze, Francesco Simeone, Andreas Spies, Maurizio Spurio, Jos J. M. Steijger, Thierry Stolarczyk, Mauro G. F. Taiuti, Simona Toscano, Bertrand Vallage, Véronique van Elewyck, Giulia Vannoni, Manuela Vecchi, Pascal Vernin, Guus Wijnker, Jorn Wilms, Els de Wolf, Harold Yepes, Dmitry Zaborov, Juan de Dios Zornoza, Juan Zúñiga
- article
- PLoS ONE, 2013, 8 (7), pp.e67523. ⟨10.1371/JOURNAL.PONE.0067523⟩
- identifiant
- hal-01012135
- DOI
- DOI : 10.1371/JOURNAL.PONE.0067523
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- DNA Self-Assembly: From Chirality to Evolution
- auteur
- Y. Timsit
- article
- International Journal of Molecular Sciences, 2013, 14 (4), pp.8252-8270. ⟨10.3390/ijms14048252⟩
- identifiant
- hal-01816598
- DOI
- DOI : 10.3390/ijms14048252
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Trends in salinity and inorganic nitrogen compounds in the Berre lagoon (1994-2011) bacterial activities and nitrogen budgets
- auteur
- Imen Zaghmouri, Valerie Michotey, Sophie Guasco, Patrick Raimbault, Nicole Garcia, Guillaume Bernard, Patricia Bonin
- article
- Marine Pollution Bulletin, 2013, 67, pp.55-65. ⟨10.1016/j.marpolbul.2012.11.046⟩
- identifiant
- hal-00796981
- DOI
- DOI : 10.1016/j.marpolbul.2012.11.046
- Accès au bibtex
-
Other publications
- titre
- Des Microoganismes très convoités
- auteur
- Bernard Ollivier
- article
- 2013, pp.n°70
- identifiant
- hal-00857880
- Accès au bibtex
-
Poster communications
- titre
- Distribution spatiale des communautés microbiennes du système hydrothermal alcalin de la baie de Prony, Nouvelle Calédonie
- auteur
- Marianne Quemeneur, Méline Bes, Anne Postec, Nan Mei, Jérôme Hamelin, Claude Payri, Bernard Pelletier, Bernard Ollivier, Gaël Erauso
- article
- VI. Colloque de l'Association Francophone d'Ecologie Microbienne (AFEM) "Microbiologie Environnementale : du Gène à l’Ecosystème", Oct 2013, Parent, France. 2013
- identifiant
- hal-02748380
- Accès au bibtex
-
Reports
- titre
- Technical Design Report of the MEUST Infrastructure
- auteur
- M. Ageron, K. Bernardet, V. Bertin, S. Beurthey, M. Billault, J. Brunner, L. Caillat, A. Cosquer, P. Coyle, J.J. Destelle, D. Dornic, C. Gojak, Z. Hafidi, S. Henry, P. Keller, P. Lamare, Dominique Lefèvre, Y. Lenault, K. Mahiouz, J. Royon, M. Solazzo, Christian Tamburini, D. Tézier, S. Théraube, Corentin Vallée
- article
- 2013
- identifiant
- in2p3-01071800
- Accès au bibtex
-
- titre
- Evaluation and Selection of the MEUST Submarine Site
- auteur
- V. Bertin, M. Billault, P. Coyle, C. Curtil, S. Deguero, J.-J. Destelle, D. Dornic, F. Gallo, S. Henry, P. Keller, P. Lamare, Dominique Lefèvre, F. Léon, S. Martini, Christian Tamburini, Corentin Vallée
- article
- 2013, pp.1-15
- identifiant
- in2p3-01071770
- Accès au bibtex
-
2012
Journal articles
-

- titre
- Melghirimyces thermohalophilus sp. nov., a novel thermoactinomycete isolated from an Algerian salt lake
- auteur
- A Addou, P Schumann, Cathrin Sproer, Amel Bouanane-Darenfed, S Amarouche, Hocine Hacene, Jean Luc Cayol, Marie Laure Fardeau
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2012, 63, pp.1717-1722. ⟨10.1099/ijs.0.043760-0⟩
- identifiant
- hal-00805363
- DOI
- DOI : 10.1099/ijs.0.043760-0
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Melghirimyces algeriensis gen. nov., sp. nov., a member of the family Thermoactinomycetaceae, isolated from a salt lake.
- auteur
- Ammara Nariman Addou, Peter Schumann, Cathrin Sproer, Hocine Hacene, Jean Luc Cayol, Marie Laure Fardeau
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2012, 62 (7), pp.1491-1498. ⟨10.1099/ijs.0.028985-0⟩
- identifiant
- hal-00745961
- DOI
- DOI : 10.1099/ijs.0.028985-0
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Fusibacter tunisiensis sp. nov., isolated from an anaerobic reactor used to treat olive-mill wastewater.
- auteur
- Wajdi Ben Hania, Belkis Fraj, Anne Postec, Khaled Fadhlaoui, Moktar Hamdi, Bernard Ollivier, Marie Laure Fardeau
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2012, 62 (Pt 6), pp.1365-8. ⟨10.1099/ijs.0.034603-0⟩
- identifiant
- hal-00739974
- DOI
- DOI : 10.1099/ijs.0.034603-0
- Accès au bibtex
-
- titre
- Defluviitoga tunisiensis gen. nov., sp. nov., a thermophilic bacterium isolated from a mesothermic and anaerobic whey digester.
- auteur
- Wajdi Ben Hania, Ramzi Ghodbane, Anne Postec, Moktar Hamdi, Bernard Ollivier, Marie Laure Fardeau
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2012, 62 (Pt 6), pp.1377-82. ⟨10.1099/ijs.0.033720-0⟩
- identifiant
- hal-00739989
- DOI
- DOI : 10.1099/ijs.0.033720-0
- Accès au bibtex
-
- titre
- Kinetics of aerobic phenol biodegradation by the acidophilic and hyperthermophilic archaeon Sulfolobus solfataricus 98/2
- auteur
- Pierre Christen, Armando Vega, Laurie Casalot, Gwenola Simon, Richard Auria
- article
- Biochemical Engineering Journal, 2012, 62, pp.56-61. ⟨10.1016/j.bej.2011.12.012⟩
- identifiant
- hal-00709293
- DOI
- DOI : 10.1016/j.bej.2011.12.012
- Accès au bibtex
-
- titre
- Analysis of Structure-Function Relationships in the Colibactin-Maturating Enzyme ClbP.
- auteur
- A Cougnoux, L Gibold, F Robin, D Dubois, Nathalie Pradel, A Darfeuille-Michaud, G Dalmasso, J Delmas, R Bonnet
- article
- Journal of Molecular Biology, 2012, 424 (3-4), in press. ⟨10.1016/j.jmb.2012.09.017⟩
- identifiant
- hal-00748966
- DOI
- DOI : 10.1016/j.jmb.2012.09.017
- Accès au bibtex
-
- titre
- Methanomassiliicoccus luminyensis gen. nov., sp. nov., a methanogenic archaeon isolated from human faeces.
- auteur
- B Dribi, Marie Laure Fardeau, Bernard Ollivier, Didier Raoult, Michel Drancourt
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2012, 62 (Pt 8), pp.1902-7. ⟨10.1099/ijs.0.033712-0⟩
- identifiant
- hal-00746616
- DOI
- DOI : 10.1099/ijs.0.033712-0
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Tungsten-enhanced growth of Methanosphaera stadtmanae
- auteur
- Bédis Dridi, Saber Khelaifia, Marie Laure Fardeau, Bernard Ollivier, Michel Drancourt
- article
- BMC Research Notes, 2012, 5, pp.238. ⟨10.1186/1756-0500-5-238⟩
- identifiant
- hal-00746580
- DOI
- DOI : 10.1186/1756-0500-5-238
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Nitrogen-limited mangrove ecosystems conserve N through dissimilatory nitrate reduction to ammonium
- auteur
- Sheryl Fernandes, Patricia Bonin, Valerie Michotey, Nicole Garcia, P. A. Lokabharathi
- article
- Scientific Reports, 2012, 2, pp.419. ⟨10.1038/srep00419⟩
- identifiant
- hal-00714213
- DOI
- DOI : 10.1038/srep00419
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Denitrification prevails over anammox in tropical mangrove sediments (Goa, India)
- auteur
- Sheryl Fernandes, Valerie Michotey, Sophie Guasco, Patricia Bonin, P. A. Loka Bharathi
- article
- Marine Environmental Research, 2012, 74, pp.9-19. ⟨10.1016/j.marenvres.2011.11.008⟩
- identifiant
- hal-00700304
- DOI
- DOI : 10.1016/j.marenvres.2011.11.008
- Accès au bibtex
-
- titre
- Isolation and characterization of Fonticella tunisiensis gen nov., sp. nov., a novel bacterium isolated from a Tunisian hot spring.
- auteur
- Belkis Fraj, Wajdi Ben Hania, Anne Postec, Moktar Hamdi, Bernard Ollivier, Marie Laure Fardeau
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2012, pp.10.1099/ijs.0.041947-0. ⟨10.1099/ijs.0.041947-0⟩
- identifiant
- hal-00739961
- DOI
- DOI : 10.1099/ijs.0.041947-0
- Accès au bibtex
-
- titre
- Desulfosoma profundi sp nov., a thermophilic sulfate-reducing bacterium isolated from a deep terrestrial geothermal spring in France
- auteur
- Patrick Gregoire, Marie Laure Fardeau, Sophie Guasco, Joel Lagiere, Jean Cambar, Valerie Michotey, Patricia Bonin, Bernard Ollivier
- article
- Antonie van Leeuwenhoek, 2012, 101, pp.595-602. ⟨10.1007/s10482-011-9675-x⟩
- identifiant
- hal-00690553
- DOI
- DOI : 10.1007/s10482-011-9675-x
- Accès au bibtex
-
- titre
- Understanding and tuning the catalytic bias of hydrogenase.
- auteur
- Abbas Abou Hamdan, Sébastien Dementin, Pierre-Pol Liebgott, Oscar Gutierrez-Sanz, Pierre Richaud, Antonio de Lacey, Marc Rousset, Patrick Bertrand, Laurent Cournac, Christophe Léger
- article
- Journal of the American Chemical Society, 2012, 134 (20), pp.8368-71. ⟨10.1021/ja301802r⟩
- identifiant
- hal-00748324
- DOI
- DOI : 10.1021/ja301802r
- Accès au bibtex
-
- titre
- Methanogenic octadecene degradation by syntrophic enrichment culture from brackish sediments
- auteur
- Agnès Hirschler-Réa, Cristiana Cravo-Laureau, Laurie Casalot, Robert Matheron
- article
- Current Microbiology, 2012, 65 (5), pp.561-7. ⟨10.1007/s00284-012-0195-3⟩
- identifiant
- hal-00740729
- DOI
- DOI : 10.1007/s00284-012-0195-3
- Accès au bibtex
-
- titre
- Benthic pelagic coupling in a shallow oligotrophic ecosystem: Importance of microphytobenthos and physical forcing
- auteur
- Sébastien Hochard, Christel Pinazo, Emma Rochelle-Newall, O. Pringault
- article
- Ecological Modelling, 2012, 247, pp.307- 318. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2012.07.038⟩
- identifiant
- hal-00743516
- DOI
- DOI : 10.1016/j.ecolmodel.2012.07.038
- Accès au bibtex
-
- titre
- Macellibacteroides fermentans gen. nov., sp. nov., a member of the family Porphyromonadaceae isolated from an upflow anaerobic filter treating abattoir wastewaters.
- auteur
- L Jabari, H Gannoun, Jean Luc Cayol, A Hedi, M Sakamoto, E Falsen, M Ohkuma, M Hamdi, Guy Fauque, Bernard Ollivier, Marie Laure Fardeau
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2012, 62 (Pt 10), pp.2522-7. ⟨10.1099/ijs.0.032508-0⟩
- identifiant
- hal-00746627
- DOI
- DOI : 10.1099/ijs.0.032508-0
- Accès au bibtex
-
- titre
- Characterization of Defluviitalea saccharophila gen. nov., sp. nov., a thermophilic bacterium isolated from an upflow anaerobic filter treating abattoir wastewaters, and proposal of Defluviitaleaceae fam. nov.
- auteur
- Linda Jabari, Hana Gannoun, Jean Luc Cayol, Moktar Hamdi, Guy Fauque, Bernard Ollivier, Marie Laure Fardeau
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2012, 62 (Pt 3), pp.550-5. ⟨10.1099/ijs.0.030700-0⟩
- identifiant
- hal-00745978
- DOI
- DOI : 10.1099/ijs.0.030700-0
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Protein expression from zooplankton communities in a metal contaminated NW mediterranean coastal ecosystem
- auteur
- Natacha Jean, Estelle Dumont, Gaël Durrieu, Thierry Balliau, Jean-Louis Jamet, Sébastien Personnic, Cédric Garnier
- article
- Marine Environmental Research, 2012, 80, pp.12-26. ⟨10.1016/j.marenvres.2012.06.004⟩
- identifiant
- hal-01096852
- DOI
- DOI : 10.1016/j.marenvres.2012.06.004
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- How to analyse bioluminescence time series from in situ observatories? Example from high frequency records and real time data at the ANTARES site
- auteur
- Severine Martini, David Nerini, Christian Tamburini
- article
- Luminescence, 2012, 27 (2), pp.139-140
- identifiant
- hal-00741759
- Accès au bibtex
-
- titre
- Halanaerobacter jeridensis sp. nov., isolated from a hypersaline lake.
- auteur
- M Mezghani, Didier Alazard, F Karray, Jean Luc Cayol, Manon Bartoli, Anne Postec, Marie Laure Fardeau, Jean-Luc Tholozan, S Sayadi
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2012, 62 (Pt 8), pp.1970-3. ⟨10.1099/ijs.0.036301-0⟩
- identifiant
- hal-00740042
- DOI
- DOI : 10.1099/ijs.0.036301-0
- Accès au bibtex
-
- titre
- Spatio-temporal diversity of free-living and particle-attached prokaryotes in the tropical lagoon of Ahe atoll (Tuamotu Archipelago) and its surrounding oceanic waters
- auteur
- Valerie Michotey, Sophie Guasco, Dominique Boeuf, Nicola Morezzi, Brice Durieu, Loïc Charpy, Patricia Bonin
- article
- Marine Pollution Bulletin, 2012, 65 (10), pp.525-537. ⟨10.1016/j.marpolbul.2012.01.009⟩
- identifiant
- hal-00739805
- DOI
- DOI : 10.1016/j.marpolbul.2012.01.009
- Accès au bibtex
-
- titre
- Magnetotactic Bacteria in Microcosms Originating from the French Mediterranean Coast Subjected to Oil Industry Activities
- auteur
- Anne Postec, Nicolas Tapia, Alain Bernadac, Manon Bartoli, Sylvain Davidson, Long-Fei Wu, Bernard Ollivier, Nathalie Pradel
- article
- Microbial ecology, 2012, 63, pp.1-11. ⟨10.1007/s00248-011-9910-z⟩
- identifiant
- hal-00687453
- DOI
- DOI : 10.1007/s00248-011-9910-z
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Effect of enzyme addition on fermentative hydrogen production from wheat straw
- auteur
- Marianne Quéméneur, Marine Bittel, Eric Trably, Claire Dumas, Laurent Fourage, Gilles Ravot, Jean-Philippe Steyer, Hélène Carrère
- article
- International Journal of Hydrogen Energy, 2012, 37 (14), pp.10639 - 10647. ⟨10.1016/j.ijhydene.2012.04.083⟩
- identifiant
- hal-01809613
- DOI
- DOI : 10.1016/j.ijhydene.2012.04.083
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Inhibition of fermentative hydrogen production by lignocellulose-derived compounds in mixed cultures
- auteur
- Marianne Quéméneur, Jérôme Hamelin, Abdellatif Barakat, Jean-Philippe Steyer, Hélène Carrère, Eric Trably
- article
- International Journal of Hydrogen Energy, 2012, 37 (4), pp.3150 - 3159. ⟨10.1016/j.ijhydene.2011.11.033⟩
- identifiant
- hal-01809614
- DOI
- DOI : 10.1016/j.ijhydene.2011.11.033
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Anaerosalibacter bizertensis gen. nov., sp. nov., a new halotolerant bacterium isolated from sludge.
- auteur
- Raja Rezgui, Abderrazek Maaroufi, Marie-Laure Fardeau, Zouhaier Ben Ali Gam, Jean-Luc Cayol, Saïd Ben Hamed, Marc Labat
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2012, 62 (10), pp.469-474. ⟨10.1099/ijs.0.036566-0⟩
- identifiant
- pasteur-00658466
- DOI
- DOI : 10.1099/ijs.0.036566-0
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- DNA-Directed Base Pair Opening
- auteur
- Y. Timsit
- article
- Molecules, 2012, 17 (10), pp.11947-11964. ⟨10.3390/molecules171011947⟩
- identifiant
- hal-02008045
- DOI
- DOI : 10.3390/molecules171011947
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- DNA-DNA Recognition: From Tight Contact to Fatal Attraction
- auteur
- Y. Timsit
- article
- InTech, 2012
- identifiant
- hal-02008304
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Mimicking floodplain reconnection and disconnection using 15N mesocosm incubations
- auteur
- N. Welti, E. Bondar-Kunze, M. Mair, Patricia Bonin, W. Wanek, Gilles Pinay, T. Hein
- article
- Biogeosciences, 2012, 9 (11), pp.4263-4278. ⟨10.5194/bg-9-4263-2012⟩
- identifiant
- hal-01097829
- DOI
- DOI : 10.5194/bg-9-4263-2012
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Conference papers
- titre
- Effects of pressure, temperature and salinity on metabolic activity of anaerobic strains
- auteur
- Vanessa Barsotti, Sébastien Dupraz, Catherine Joulian, Fabienne Battaglia-Brunet, Claire Sergeant, Bernard Ollivier, Françis Garrido
- article
- 7th International Conference on High Pressure Bioscience and Biotechnology (HPBB2012), Oct 2012, Kyoto, Japan
- identifiant
- hal-00732361
- Accès au bibtex
-
- titre
- Diversity of gorgonian-associated bacterial communities in Northwestern Mediterranean Sea
- auteur
- Marie La Riviere, Marie Roumagnac, Joaquim Garrabou, M. Bally
- article
- The 14th International Symposium on Microbial Ecology (ISME), Aug 2012, Copenhague, Denmark
- identifiant
- hal-00748858
- Accès au bibtex
-
- titre
- How to analyse bioluminescence time series from in situ observatories ? Example from high frequency records and real time data at the ANTARES site.
- auteur
- Severine Martini, Christian Tamburini, David Nerini
- article
- International symposium on bioluminescence and chemiluminescence (17th), May 2012, Guelph, Canada
- identifiant
- hal-00756806
- Accès au bibtex
-
- titre
- Identification des liens entre communautés associées au cycle de l'azote par méthode d'enrichissement isotopique: Application aux zones d'interfaces aérobie/anaérobie des sédiments marins
- auteur
- Valerie Michotey
- article
- Identification des liens entre communautés associées au cycle de l'azote par méthode d'enrichissemen, Oct 2012, Clermont Ferrand, France
- identifiant
- hal-00796797
- Accès au bibtex
-
Book sections
- titre
- Les conditions de vie extrêmes sur la planète et exobiologie
- auteur
- Jean Luc Cayol, Bernard Ollivier, Didier Alazard, Ricardo Amils, Anne Godfroy, Florence Piette, Daniel Prieur
- article
- Ecologie microbienne, Presses Universitaires de Pau et des Pays de l'Adour, pp.363-408, 2012
- identifiant
- hal-00747615
- Accès au bibtex
-
Other publications
- titre
- Bactéries de l'extrême.
- auteur
- Bernard Ollivier, Patrick Gregoire
- article
- 2012, pp.63
- identifiant
- hal-00746752
- Accès au bibtex
-
- titre
- Les micro-rois du pétrole
- auteur
- Bernard Ollivier
- article
- 2012
- identifiant
- hal-00746757
- Accès au bibtex
-
Patents
- titre
- Culture et detection d'une Archaea méthanogène.
- auteur
- B Dridi, Marie Laure Fardeau, Bernard Ollivier, Didier Raoult, Michel Drancourt
- article
- France, N° de brevet: N° H52 888 cas 8 PCT/MD. MIO:12-093. 2012
- identifiant
- hal-00746746
- Accès au bibtex
-
2011
Journal articles
- titre
- The chemical-in-mu well: a high-throughput technique for identifying solutes eliciting a chemotactic response in motile bacteria
- auteur
- Joshua Armitano, Claudine Baraquet, Valerie Michotey, Vincent Mejean, Cecile Jourlin-Castelli
- article
- Research in Microbiology, 2011, 162, pp.934-938. ⟨10.1016/j.resmic.2011.03.001⟩
- identifiant
- hal-00725012
- DOI
- DOI : 10.1016/j.resmic.2011.03.001
- Accès au bibtex
-
- titre
- Phenol biodegradation by the thermoacidophilic archaeon Sulfolobus solfataricus 98/2 in a fed-batch bioreactor
- auteur
- Pierre Christen, Sylvain Davidson, Yannick Combet-Blanc, Richard Auria
- article
- Biodegradation, 2011, 22 (3), pp.475 - 484. ⟨10.1007/s10532-010-9420-6⟩
- identifiant
- hal-01888843
- DOI
- DOI : 10.1007/s10532-010-9420-6
- Accès au bibtex
-
- titre
- Caldilinea tarbellica sp nov., a filamentous, thermophilic, anaerobic bacterium isolated from a deep hot aquifer in the Aquitaine Basin
- auteur
- Patrick Gregoire, Malek Bohli, Jean Luc Cayol, Manon Bartoli, Sophie Guasco, Karine Dubourg, Jean Cambar, Valerie Michotey, Patricia Bonin, Marie Laure Fardeau, Bernard Ollivier
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2011, 61 (Part6), pp.1436-1441. ⟨10.1099/ijs.0.025676-0⟩
- identifiant
- hal-00752944
- DOI
- DOI : 10.1099/ijs.0.025676-0
- Accès au bibtex
-
- titre
- Isolation and characterization of Thermanaerothrix daxensis gen. nov., sp nov., a thermophilic anaerobic bacterium pertaining to the phylum "Chloroflexi", isolated from a deep hot aquifer in the Aquitaine Basin
- auteur
- Patrick Gregoire, Marie Laure Fardeau, Manon Bartoli, Sophie Guasco, Francette Hamaide, Sandra Biasutti, Valerie Michotey, Patricia Bonin, Bernard Ollivier
- article
- Systematic and Applied Microbiology, 2011, 34, pp.494-497. ⟨10.1016/j.syapm.2011.02.004⟩
- identifiant
- hal-00690513
- DOI
- DOI : 10.1016/j.syapm.2011.02.004
- Accès au bibtex
-
- titre
- Anaerobic ammonium oxidation mediated by Mn-oxides: from sediment to strain level
- auteur
- Cedric Javanaud, Valerie Michotey, Sophie Guasco, Nicole Garcia, Pierre Anschutz, Mathieu Canton, Patricia Bonin
- article
- Research in Microbiology, 2011, 162, pp.848-857. ⟨10.1016/j.resmic.2011.01.011⟩
- identifiant
- hal-00725010
- DOI
- DOI : 10.1016/j.resmic.2011.01.011
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Functional versus phylogenetic fingerprint analyses for monitoring hydrogen-producing bacterial populations in dark fermentation cultures
- auteur
- Marianne Quéméneur, Jérôme Hamelin, Eric Latrille, Jean-Philippe Steyer, Eric Trably
- article
- International Journal of Hydrogen Energy, 2011, 36 (6), pp.3870 - 3879. ⟨10.1016/j.ijhydene.2010.12.100⟩
- identifiant
- hal-01809618
- DOI
- DOI : 10.1016/j.ijhydene.2010.12.100
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Local sensing of global DNA topology: from crossover geometry to type II topoisomerase processivity
- auteur
- Y. Timsit
- article
- Nucleic Acids Research, 2011, 39 (20), pp.8665-8676
- identifiant
- hal-02008064
- Accès au bibtex
-
- titre
- Cytosine, the double helix and DNA self-assembly
- auteur
- Y. Timsit, Peter Varnai
- article
- Journal of Molecular Recognition, 2011, 24 (2), pp.137-138
- identifiant
- hal-02008070
- Accès au bibtex
-
- titre
- New Cultural Approaches for Microaerophilic Hyperthermophiles
- auteur
- Rafael Uzarraga, Richard Auria, David Davidson, David Navarro, Yannick Combet-Blanc
- article
- Current Microbiology, 2011, 62 (2), pp.346 - 350. ⟨10.1007/s00284-010-9712-4⟩
- identifiant
- hal-01888771
- DOI
- DOI : 10.1007/s00284-010-9712-4
- Accès au bibtex
-
- titre
- Acoustic and optical variations during rapid downward motion episodes in the deep north-western Mediterranean Sea
- auteur
- H. van Haren, I. Taupier-Letage, J.A. Aguilar, A. Albert, G. Anton, S. Anvar, M. Ardid, A.C. Assis Jesus, T. Astraatmadja, J.-J. Aubert, R. Auer, B. Baret, S. Basa, M. Bazzotti, V. Bertin, S. Biagi, C. Bigongiari, M. Bou-Cabo, M.C. Bouwhuis, A. Brown, J. Brunner, J. Busto, F. Camarena, A. Capone, G. Carminati, J. Carr, D. Castel, E. Castorina, V. Cavasinni, S. Cecchini, Ph. Charvis, T. Chiarusi, M. Circella, R. Coniglione, H. Costantini, N. Cottini, P. Coyle, C. Curtil, G. de Bonis, M.P. Decowski, I. Dekeyser, Anne Deschamps, C. Distefano, C. Donzaud, D. Dornic, D. Drouhin, T. Eberl, U. Emanuele, J.-P. Ernenwein, S. Escoffier, F. Fehr, V. Flaminio, K. Fratini, U. Fritsch, J.-L. Fuda, G. Giacomelli, J.P. Gómez-González, K. Graf, G. Guillard, G. Halladjian, G. Hallewell, A.J. Heijboer, Y. Hello, J.J. Hernández-Rey, J. Hössl, M. de Jong, N. Kalantar-Nayestanaki, O. Kalekin, A. Kappes, U. Katz, P. Kooijman, C. Kopper, A. Kouchner, W. Kretschmer, R. Lahmann, P. Lamare, G. Lambard, G. Larosa, H. Laschinsky, Dominique Lefèvre, G. Lelaizant, G. Lim, D. Lo Presti, H. Loehner, S. Loucatos, F. Lucarelli, K. Lyons, S. Mangano, M. Marcelin, A. Margiotta, J.A. Martinez-Mora, G. Maurin, A. Mazure, M. Melissas, T. Montaruli, M. Morganti, L. Moscoso, H. Motz, C. Naumann, M. Neff, R. Ostasch, G. Palioselitis, G.E. Păvălaş, P. Payre, J. Petrovic, P. Piattelli, N. Picot-Clemente, C. Picq, R. Pillet, V. Popa, T. Pradier, E. Presani, C. Racca, A. Radu, C. Reed, G. Riccobene, C. Richardt, M. Rujoiu, G.V. Russo, F. Salesa, F. Schoeck, J.-P. Schuller, R. Shanidze, F. Simeone, M. Spurio, J.J.M. Steijger, Th. Stolarczyk, Christian Tamburini, L. Tasca, S. Toscano, B. Vallage, V. van Elewyck, M. Vecchi, P. Vernin, G. Wijnker, E. de Wolf, H. Yepes, D. Zaborov, J.D. Zornoza, J. Zúñiga, M. Anghinolfi
- article
- Deep Sea Research Part I: Oceanographic Research Papers, 2011, 58, pp.875-884. ⟨10.1016/j.dsr.2011.06.006⟩
- identifiant
- in2p3-00605777
- DOI
- DOI : 10.1016/j.dsr.2011.06.006
- Accès au bibtex
-
Conference papers
- titre
- Quantification des activités du cycle de l'azote dans des sédiments soumis à des apports d'eau douce: impact sur l'état d'eutrophisation de l'écosystème
- auteur
- Imen Zaghmouri, Patricia Bonin, Valerie Michotey
- article
- Lagun'R, Mar 2011, Aix en Provence, France. pp.178-182
- identifiant
- hal-00808460
- Accès au bibtex
-
Book sections
- titre
- Apports de la génomique descriptive et fonctionnelle en écologie microbienne. Chapitre 18
- auteur
- Philippe Bertin, Valerie Michotey, Philippe Normand
- article
- Ecologie Microbienne : Microbiologie des milieux naturels et anthropisés, Presses Universitaires de Pau et des Pays de l'Adour, 1004 p., 2011, 2-35311-022-3 9782353110223
- identifiant
- hal-02809856
- Accès au bibtex
-
- titre
- Les cycles géochimiques. Chapitre 14
- auteur
- Jean-Claude Bertrand, Patricia Bonin, Pierre Caumette, Jean-Pierre Gattuso, Gérald Grégori, Remy Guyoneaud, Xavier Le Roux, Robert Matheron, Franck Poly
- article
- Ecologie Microbienne : Microbiologie des milieux naturels et anthropisés, Presses Universitaires de Pau et des Pays de l'Adour, 1004 p., 2011, 2-35311-022-3 9782353110223
- identifiant
- hal-02811238
- Accès au bibtex
-
- titre
- Méthodes d'études des micro-organismes dans l'environnement. Chapitre 17
- auteur
- Fabien Joux, Jean-Claude Bertrand, Rutger de Wit, Vincent Grossi, Laurent Intertaglia, Philippe Lebaron, Valerie Michotey, Philippe Normand, Pierre Peyret, Patrick Raimbault, Christian Tamburini, Laurent Urios
- article
- Ecologie Microbienne : Microbiologie des milieux naturels et anthropisés, Presses Universitaires de Pau et des Pays de l'Adour, 1004 p., 2011, 2-35311-022-3 9782353110223
- identifiant
- hal-02810643
- Accès au bibtex
-
- titre
- Hydrocarbon degradation in coastal muddy areas and anoxic ecosystems (DHYVA project): Role of bacterial mechanisms and bioturbation effects on the biodisponibility of organic pollutants
- auteur
- Magalie Stauffert, Lionel Huang, Isabelle Vitte, Ronan Jézéquel, Cristiana Cravo-Laureau, Georges Stora, Christophe Pécheyran, Christine Cagnon, Franck Gilbert, Marisol Goñi, François-Xavier Merlin, David Amouroux, Philippe Cuny, Robert Duran
- article
- Ceccaldi, H.-J., Dekeyser, I., Girault, M., Stora, G. Global Change: Mankind-Marine Environment Interactions, Springer, pp.393-395, 2011, ISBN 978-90-481-8630-3
- identifiant
- hal-01652257
- Accès au bibtex
-
2010
Journal articles
- titre
- Fatty acids as biomarkers to indicate main carbon sources of four major invertebrate families in a large River (the Allier, France)
- auteur
- Aurélie Descroix, Alexandre Bec, Gilles Bourdier, Denis Sargos, Jeremy Sauvanet, Benjamin Misson, Christian Desvilettes
- article
- Fundamental and Applied Limnology, 2010, 177 (1), pp.39 - 55. ⟨10.1127/1863-9135/2010/0177-0039⟩
- identifiant
- hal-01826050
- DOI
- DOI : 10.1127/1863-9135/2010/0177-0039
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Effect of Oxygen and Redox Potential on Glucose Fermentation in Thermotoga maritima under Controlled Physicochemical Conditions
- auteur
- Raja Lakhal, Richard Auria, Sylvain Davidson, Bernard Ollivier, Alain Dolla, Moktar Hamdi, Yannick Combet-Blanc
- article
- International Journal of Microbiology, 2010, 2010, pp.1 - 10 / 896510. ⟨10.1155/2010/896510⟩
- identifiant
- hal-01888723
- DOI
- DOI : 10.1155/2010/896510
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Response of an archaeal community from anoxic coastal marine sediments to experimental petroleum contamination
- auteur
- Gilles Miralles, Monique Acquaviva, Jean Claude Bertrand, Philippe Cuny
- article
- Aquatic Microbial Ecology, 2010, 59, pp.25-31. ⟨10.3354/ame01379⟩
- identifiant
- hal-00692399
- DOI
- DOI : 10.3354/ame01379
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- Development and application of a functional CE-SSCP fingerprinting method based on [Fe–Fe]-hydrogenase genes for monitoring hydrogen-producing Clostridium in mixed cultures
- auteur
- Marianne Quéméneur, Jérôme Hamelin, Eric Latrille, Jean-Philippe Steyer, Eric Trably
- article
- International Journal of Hydrogen Energy, 2010, 35 (24), pp.13158 - 13167. ⟨10.1016/j.ijhydene.2010.07.076⟩
- identifiant
- hal-01809619
- DOI
- DOI : 10.1016/j.ijhydene.2010.07.076
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Mesopelagic zone ecology and biogeochemistry - a synthesis
- auteur
- Carol Robinson, Deborah K. Steinberg, Thomas R. Anderson, Javier Aristegui, Craig A. Carlson, Jessica R. Frost, Jean-Francois Ghiglione, Santiago Hernandez-Leon, George A. Jackson, Rolf Koppelmann, Bernard Queguiner, Olivier Ragueneau, Fereidoun Rassoulzadegan, Bruce H. Robison, Christian Tamburini, Tsuneo Tanaka, Karen F. Wishner, Jing Zhang
- article
- Deep Sea Research Part II: Topical Studies in Oceanography, 2010, 57, pp.1504-1518. ⟨10.1016/j.dsr2.2010.02.018⟩
- identifiant
- hal-00695891
- DOI
- DOI : 10.1016/j.dsr2.2010.02.018
- Accès au bibtex
-
- titre
- Differential stability of DNA crossovers in solution mediated by divalent cations
- auteur
- Péter Várnai, Y. Timsit
- article
- Nucleic Acids Research, 2010, 38 (12), pp.4163-4172
- identifiant
- hal-02008075
- Accès au bibtex
-
2009
Journal articles
- titre
- Desulfovibrio marrakechensis sp nov., a 1,4-tyrosol-oxidizing, sulfate-reducing bacterium isolated from olive mill wastewater
- auteur
- Fatima Chamkh, Cathrin Sproeer, Paulo Costa Lemos, Stephane Besson, Abdel-Ghani El Asli, Rhizlane Bennisse, Marc Labat, Maria Reis, Abdel-Illah Qatibi
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2009, 59, pp.936-942. ⟨10.1099/ijs.0.003822-0⟩
- identifiant
- hal-00688552
- DOI
- DOI : 10.1099/ijs.0.003822-0
- Accès au bibtex
-
- titre
- Mass mortality in Northwestern Mediterranean rocky benthic communities: effects of the 2003 heat wave
- auteur
- J. Garrabou, R. Coma, N. Bensoussan, M. Bally, P. Chevaldonne, M. Cigliano, D. Diaz, Jean Georges Harmelin, M. C. Gambi, D. K. Kersting, Jean-Baptiste Ledoux, C. Lejeusne, C. Linares, C. Marschal, T. Perez, M. Ribes, J. C. Romano, E. Serrano, N. Teixido, O. Torrents, M. Zabala, Frederic Zuberer, C. Cerrano
- article
- Global Change Biology, 2009, 15, pp.1090-1103. ⟨10.1111/j.1365-2486.2008.01823.x⟩
- identifiant
- hal-00687683
- DOI
- DOI : 10.1111/j.1365-2486.2008.01823.x
- Accès au bibtex
-
- titre
- Hydroxytyrosol from tyrosol using hydroxyphenylacetic acid-induced bacterial cultures and evidence of the role of 4-HPA 3-hydroxylase
- auteur
- Pierre-Pol Liebgott, Agnès Amouric, Alexia Comte, Jean Tholozan, Jean Lorquin
- article
- Research in Microbiology, 2009, 160 (10), pp.757 - 766. ⟨10.1016/j.resmic.2009.09.015⟩
- identifiant
- hal-01825484
- DOI
- DOI : 10.1016/j.resmic.2009.09.015
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Effect of O 2 concentrations on Sulfolobus solfataricus P2
- auteur
- Gwenola Simon, Jasper Walther, Nathalie Zabeti, Yannick Combet-Blanc, Richard Auria, John van Der Oost, Laurence Casalot
- article
- FEMS Microbiology Letters, 2009, 299 (2), pp.255 - 260. ⟨10.1111/j.1574-6968.2009.01759.x⟩
- identifiant
- hal-01888710
- DOI
- DOI : 10.1111/j.1574-6968.2009.01759.x
- Accès au texte intégral et bibtex
-
-

- titre
- The Role of Disordered Ribosomal Protein Extensions in the Early Steps of Eubacterial 50 S Ribosomal Subunit Assembly
- auteur
- Y. Timsit, Zahir Acosta, Frédéric Allemand, Claude Chiaruttini, Mathias Springer
- article
- International Journal of Molecular Sciences, 2009, 10 (3), pp.817-834. ⟨10.3390/ijms10030817⟩
- identifiant
- hal-02008085
- DOI
- DOI : 10.3390/ijms10030817
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Conference papers
- titre
- SI-OC Interactions during degradation of the diatom Skeletonema marinoï
- auteur
- Brivaëla Moriceau, Madeleine Goutx, Cindy Lee, A. Robert Armstrong, Catherine Guigue, Christian Tamburini, Marie Duflos, Olivier Ragueneau
- article
- ASLO, 2009, Nice, France
- identifiant
- hal-02534466
- Accès au bibtex
-
Poster communications
- titre
- Particle flux : control and processes affecting POM degradation
- auteur
- Madeleine Goutx, Brivaëla Moriceau, Catherine Guigue, Marc Garel, Christian Tamburini, Cindy Lee
- article
- ASLO Meeting, 2009, Nice, France
- identifiant
- hal-02534473
- Accès au bibtex
-
2008
Journal articles
- titre
- A Single Banana Streak Virus Integration Event in the Banana Genome as the Origin of Infectious Endogenous Pararetrovirus
- auteur
- Philippe Gayral, Juan-Carlos Noa-Carrazana, Magali Lescot, Fabrice Lheureux, Benham Lockhart, Takashi Matsumoto, Pietro Piffanelli, Marie-Line Iskra-Caruana
- article
- Journal of Virology, 2008, 82 (13), pp.6697-6710. ⟨10.1128/JVI.00212-08⟩
- identifiant
- hal-02978140
- DOI
- DOI : 10.1128/JVI.00212-08
- Accès au bibtex
-
- titre
- Metabolism of n-alkanes and n-alkenes by anaerobic bacteria: A summary
- auteur
- Vincent Grossi, Cristiana Cravo-Laureau, Remy Guyoneaud, Anthony Ranchou-Peyruse, Agnès Hirschler-Réa
- article
- Organic Geochemistry, 2008, 39 (8), pp.1197 - 1203. ⟨10.1016/j.orggeochem.2008.02.010⟩
- identifiant
- hal-01840098
- DOI
- DOI : 10.1016/j.orggeochem.2008.02.010
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Insights into the Musa genome: Syntenic relationships to rice and between Musa species
- auteur
- Magali Lescot, Pietro Piffanelli, Ana Ciampi, Manuel Ruiz, Guillaume Blanc, Jim Leebens-Mack, Felipe da Silva, Candice Mr Santos, Angélique d'Hont, Olivier Garsmeur, Alberto Vilarinhos, Hiroyuki Kanamori, Takashi Matsumoto, Catherine Ronning, Foo Cheung, Brian Haas, Ryan Althoff, Tammy Arbogast, Erin Hine, Georgios Pappas, Takuji Sasaki, Manoel Souza, Robert Ng Miller, Jean-Christophe Glaszmann, Christopher Town
- article
- BMC Genomics, 2008, 9 (1), ⟨10.1186/1471-2164-9-58⟩
- identifiant
- hal-02978134
- DOI
- DOI : 10.1186/1471-2164-9-58
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- The Genome of Borrelia recurrentis, the Agent of Deadly Louse-Borne Relapsing Fever, Is a Degraded Subset of Tick-Borne Borrelia duttonii
- auteur
- Magali Lescot, Stephane Audic, Catherine Robert, Thi Tien Nguyen, Guillaume Blanc, Sally Cutler, Patrick Wincker, Arnaud Couloux, Jean-Michel Claverie, Didier Raoult, Michel Drancourt
- article
- PLoS Genetics, 2008, 4 (9), pp.e1000185. ⟨10.1371/journal.pgen.1000185⟩
- identifiant
- hal-02978141
- DOI
- DOI : 10.1371/journal.pgen.1000185
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Phytoplankton-bacterioplankton coupling in a subtropical South Pacific coral reef lagoon
- auteur
- Emma Rochelle-Newall, Jean-Philippe Torréton, Xavier Mari, O. Pringault
- article
- Aquatic Microbial Ecology, 2008, 50, pp.221-229. ⟨10.3354/ame01158⟩
- identifiant
- hal-02080104
- DOI
- DOI : 10.3354/ame01158
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2007
Journal articles
- titre
- Exiguobacterium profundum sp. nov., a moderately thermophilic, lactic acid-producing bacterium isolated from a deep-sea hydrothermal vent
- auteur
- S. Crapart, M.-L. Fardeau, J.-L. Cayol, P. Thomas, C. Sery, B. Ollivier, Yannick Combet-Blanc
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2007, 57 (2), pp.287 - 292. ⟨10.1099/ijs.0.64639-0⟩
- identifiant
- hal-01888699
- DOI
- DOI : 10.1099/ijs.0.64639-0
- Accès au bibtex
-
- titre
- Natural material role in production, activation and stabilization of alkaline protease produced from a new isolated Geobacillus caldoxylosilyticus IRDO.
- auteur
- Mona Esawy, Wafaa A. Helmy, Samia A. Ahmed, Yannick Combet-Blanc
- article
- Journal of applied sciences research, 2007, 3 (10), pp.1062 - 8
- identifiant
- hal-01888682
- Accès au bibtex
-
- titre
- The 1.3 A resolution structure of the RNA tridecamer r(GCGUUUGAAACGC): Metal ion binding correlates with base unstacking and groove contraction
- auteur
- Y. Timsit, Sophie Bombard
- article
- RNA, 2007, 13 (12), pp.2098-2107
- identifiant
- hal-02008106
- Accès au bibtex
-
Book sections
- titre
- Impact of the deep biosphere on CO2 storage performance
- auteur
- Bénédicte Ménez, Sébastien Dupraz, Emmanuelle Gérard, François Guyot, Céline Rommevaux, Maximilien Libert, Fabian Delorme, Christian Michel, Fabienne Battaglia-Brunet, Bruno Garcia, Denis Blanchet, Alain-Yves Huc, F. Haeseler, Phil M. Oger, Gilles Dromart, Bernard Ollivier, Michel Magot
- article
- Geotechnologien Science Reports, 9, pp.150-163, 2007, French-German Symposium on Geological storage of CO2
- identifiant
- hal-02122968
- Accès au bibtex
-
2006
Journal articles
- titre
- Immobilization of Bacillus licheniformis 5A1 milk-clotting enzyme and characterization of its enzyme properties
- auteur
- Mona Esawy, Yannick Combet-Blanc
- article
- World Journal of Microbiology and Biotechnology, 2006, 22 (3), pp.197 - 200. ⟨10.1007/s11274-005-9018-z⟩
- identifiant
- hal-01888562
- DOI
- DOI : 10.1007/s11274-005-9018-z
- Accès au bibtex
-
- titre
- Coexistence of two protein folding states in the crystal structure of ribosomal protein L20
- auteur
- Y. Timsit, Frédéric Allemand, Claude Chiaruttini, Mathias Springer
- article
- EMBO Reports, 2006, 7 (10), pp.1013-1018. ⟨10.1038/sj.embor.7400803⟩
- identifiant
- hal-02008118
- DOI
- DOI : 10.1038/sj.embor.7400803
- Accès au bibtex
-
Poster communications
- titre
- Si-C interactions during degradation of the diatom Skeletonema costatum
- auteur
- Brivaëla Moriceau, Madeleine Goutx, Catherine Guigue, Cindy Lee, Marie Duflos, A. Robert Armstrong, Christian Tamburini, Bruno Charrìère
- article
- AGU conference, 2006, San Francisco, United States
- identifiant
- hal-02534536
- Accès au bibtex
-
2005
Journal articles
- titre
- Molecular, Biochemical, and Physiological Approaches for Understanding the Ecology of Denitrification
- auteur
- Christelle Goréguès, Valerie Michotey, Patricia Bonin
- article
- Microbial ecology, 2005, 49 (2), pp.198-208
- identifiant
- hal-02007308
- Accès au bibtex
-
- titre
- GoArrays: highly dynamic and efficient microarray probe design
- auteur
- S. Rimour, D. Hill, Cécile Militon, P. Peyret
- article
- Bioinformatics, 2005, 21 (7), pp.1094-1103. ⟨10.1093/bioinformatics/bti112⟩
- identifiant
- hal-02064225
- DOI
- DOI : 10.1093/bioinformatics/bti112
- Accès au bibtex
-
Patents
- titre
- Use of bacterium strains for the preparation of metallic biocatalysts, in particular for the preparation of palladium biocatalysts
- auteur
- Marc Rousset, Laurence Casalot, Pascale de Philip, A. Belaich, L. E. Macaskie, I. Mykheenko
- article
- France, Patent n° : 05 290 387.9. 2005
- identifiant
- hal-00335328
- Accès au bibtex
-
2004
Journal articles
- titre
- Molecular hydrogen from water radiolysis as an energy source for bacterial growth in a basin containing irradiating waste
- auteur
- Grégoire Galès, Marie-Françoise Libert, Régine Sellier, Laurent Cournac, Virginie Chapon, Thierry Heulin
- article
- FEMS Microbiology Letters, 2004, ⟨10.1016/j.femsle.2004.09.025⟩
- identifiant
- hal-01560913
- DOI
- DOI : 10.1016/j.femsle.2004.09.025
- Accès au bibtex
-
- titre
- Isolation of hydrocarbonoclastic denitrifying bacteria from berre microbial mats
- auteur
- Christelle Goréguès, Valerie Michotey, Patricia Bonin
- article
- Ophelia, 2004, 58 (3), pp.263-270
- identifiant
- hal-02008690
- Accès au bibtex
-
- titre
- Annotation of a 95-kb Populus deltoides genomic sequence reveals a disease resistance gene cluster and novel class I and class II transposable elements
- auteur
- Magali Lescot, S. Rombauts, J. Zhang, S. Aubourg, C. Mathé, S. Jansson, P. Rouzé, W. Boerjan
- article
- TAG Theoretical and Applied Genetics, 2004, 109 (1), pp.10-22. ⟨10.1007/s00122-004-1621-0⟩
- identifiant
- hal-02978143
- DOI
- DOI : 10.1007/s00122-004-1621-0
- Accès au bibtex
-
2003
Journal articles
- titre
- Glucose Fermentation by Propionibacterium microaerophilum : Effect of pH on Metabolism and Bioenergetic
- auteur
- Marina Koussémon, Yannick Combet-Blanc, Bernard Ollivier
- article
- Current Microbiology, 2003, 46 (2), pp.141 - 145. ⟨10.1007/s00284-002-3839-x⟩
- identifiant
- hal-01888555
- DOI
- DOI : 10.1007/s00284-002-3839-x
- Accès au bibtex
-
2002
Journal articles
- titre
- One-year seasonal survey of the chlorophyll photodegradation process in the northwestern Mediterranean Sea
- auteur
- Philippe Cuny, Jc Marty, J Chiaverini, I Vescovali, D Raphel, Jf Rontani
- article
- Deep Sea Research Part II: Topical Studies in Oceanography, 2002, 49 (11), pp.1987-2005. ⟨10.1016/S0967-0645(02)00023-1⟩
- identifiant
- hal-03483013
- DOI
- DOI : 10.1016/S0967-0645(02)00023-1
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- Inducibility by pathogen attack and developmental regulation of the rice Ltp1 gene
- auteur
- Emmanuel Guiderdoni, Maria José Cordero, Florence Vignols, José Manuel Garcia-Garrido, Magali Lescot, Didier Tharreau, Donaldo Meynard, Nicole Ferrière, Jean-Loup Notteghem, Michel Delseny
- article
- Plant Molecular Biology, 2002, 49 (6), pp.679-695. ⟨10.1023/a:1015595100145⟩
- identifiant
- hal-02978251
- DOI
- DOI : 10.1023/a:1015595100145
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Characterization of three spiral-shaped purple nonsulfur bacteria isolated from coastal lagoon sediments, saline sulfur springs, and microbial mats: Emended description of the genus Roseospira and description of Roseospira marina sp. nov., Roseospira navarrensis sp. nov., and Roseospira thiosulfatophila sp. nov.
- auteur
- Remy Guyoneaud, S. Mouné, C. Eatock, V. Bothorel, Agnès Hirschler-Réa, J. Willison, Robert Duran, W. Liesack, R. Herbert, R. Matheron, Pierre Caumette
- article
- Archives of Microbiology, 2002, 178 (5), pp.315-324. ⟨10.1007/s00203-002-0454-y⟩
- identifiant
- hal-01841799
- DOI
- DOI : 10.1007/s00203-002-0454-y
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- PlantCARE, a database of plant cis-acting regulatory elements and a portal to tools for in silico analysis of promoter sequences
- auteur
- Magali Lescot, Patrice Dehais, G. Thijs, K. Marchal, Y. Moreau, Y. van de Peer, P. Rouzé, S. Rombauts
- article
- Nucleic Acids Research, 2002, 30 (1), pp.325-327. ⟨10.1093/nar/30.1.325⟩
- identifiant
- hal-02978179
- DOI
- DOI : 10.1093/nar/30.1.325
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Aerobic and anaerobic metabolism of squalene by a denitrifying bacterium isolated from marine sediment
- auteur
- Abdelkrim Mouzdahir, Jean-Francois Rontani, Valerie Michotey, Patricia Bonin
- article
- Archives of Microbiology, 2002, 178 (4), pp.279-287. ⟨10.1007/s00203-002-0457-8⟩
- identifiant
- hal-04546347
- DOI
- DOI : 10.1007/s00203-002-0457-8
- Accès au bibtex
-
- titre
- Effect of auxin, cytokinin, and sucrose on cell cycle gene expression in Arabidopsis thaliana cell suspension cultures
- auteur
- Caroline Richard, Magali Lescot, Dirk Inzé, Lieven de Veylder
- article
- Plant Cell, Tissue and Organ Culture, 2002, 69 (2), pp.167-176. ⟨10.1023/a:1015241709145⟩
- identifiant
- hal-02964689
- DOI
- DOI : 10.1023/a:1015241709145
- Accès au bibtex
-
-

- titre
- A Gibbs Sampling Method to Detect Overrepresented Motifs in the Upstream Regions of Coexpressed Genes
- auteur
- Gert Thijs, Kathleen Marchal, Magali Lescot, Stephane Rombauts, Bart de Moor, Pierre Rouzé, Yves Moreau
- article
- Journal of Computational Biology, 2002, 9 (2), pp.447-464. ⟨10.1089/10665270252935566⟩
- identifiant
- hal-02978260
- DOI
- DOI : 10.1089/10665270252935566
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2001
Journal articles
- titre
- Propionibacterium microaerophilum sp. nov., a microaerophilic bacterium isolated from olive mill wastewater
- auteur
- Yannick Combet-Blanc, Pierre Thomas, Bernard Ollivier, Marina Koussémon, Jean-Luc Cayol, Jean-Louis Garcia, Bharat Patel
- article
- International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2001, 51 (4), pp.1373 - 1382. ⟨10.1099/00207713-51-4-1373⟩
- identifiant
- hal-01888543
- DOI
- DOI : 10.1099/00207713-51-4-1373
- Accès au bibtex
-
- titre
- Hydration and structural alterations of A-DNA. Implications for the accuracy of DNA replication.
- auteur
- C Mayer, Y. Timsit
- article
- Cellular and Molecular Biology, 2001, 47 (5), pp.815-22
- identifiant
- hal-02008139
- Accès au bibtex
-
- titre
- A higher-order background model improves the detection of promoter regulatory elements by Gibbs sampling
- auteur
- G. Thijs, Magali Lescot, K. Marchal, S. Rombauts, B. de Moor, P. Rouze, Y. Moreau
- article
- Bioinformatics, 2001, 17 (12), pp.1113-1122. ⟨10.1093/bioinformatics/17.12.1113⟩
- identifiant
- hal-02978262
- DOI
- DOI : 10.1093/bioinformatics/17.12.1113
- Accès au bibtex
-
- titre
- Convergent Evolution of MutS and Topoisomerase II for Clamping DNA crossovers and stacked Holliday junctions
- auteur
- Y. Timsit
- article
- Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, 2001, 19 (2), pp.215-218. ⟨10.1080/07391102.2001.10506733⟩
- identifiant
- hal-02008143
- DOI
- DOI : 10.1080/07391102.2001.10506733
- Accès au bibtex
-
2000
Journal articles
- titre
- DNA Structure and Polymerase Fidelity: A New Role for A-DNA
- auteur
- Y. Timsit
- article
- Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, 2000, 17 (sup1), pp.169-176. ⟨10.1080/07391102.2000.10506617⟩
- identifiant
- hal-02008153
- DOI
- DOI : 10.1080/07391102.2000.10506617
- Accès au bibtex
-
1999
Journal articles
- titre
- Effect of organic complex compounds on Bacillus thermoamylovorans growth and glucose fermentation
- auteur
- Yannick Combet-Blanc, M C Dieng, Pierre Yves Kergoat
- article
- Applied and Environmental Microbiology, 1999, 65 (10), pp.4582-5
- identifiant
- hal-01888535
- Accès au bibtex
-
- titre
- DNA structure and polymerase fidelity 1 1Edited by T. Richmond
- auteur
- Y. Timsit
- article
- Journal of Molecular Biology, 1999, 293 (4), pp.835-853. ⟨10.1006/jmbi.1999.3199⟩
- identifiant
- hal-02008161
- DOI
- DOI : 10.1006/jmbi.1999.3199
- Accès au bibtex
-
- titre
- Left-handed DNA Crossovers. Implications for DNA-DNA Recognition and Structural Alterations
- auteur
- Y. Timsit, Michal Shatzky-Schwartz, Zippora Shakked
- article
- Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, 1999, 16 (4), pp.775-785. ⟨10.1080/07391102.1999.10508292⟩
- identifiant
- hal-02008182
- DOI
- DOI : 10.1080/07391102.1999.10508292
- Accès au bibtex
-
1998
Journal articles
- titre
- Bacterial flora in the gut of Helix aspersa (Gastropoda Pulmonata): evidence for a permanent population with a dominant homolactic intestinal bacterium, Enterococcus casseliflavus
- auteur
- Maryvonne Charrier, Yannick Combet-Blanc, Bernard Ollivier
- article
- Canadian Journal of Microbiology, 1998, 44 (1), pp.20 - 27. ⟨10.1139/w97-120⟩
- identifiant
- hal-01888519
- DOI
- DOI : 10.1139/w97-120
- Accès au bibtex
-
- titre
- Hydration and recognition of methylated CpG steps in DNA
- auteur
- C. Mayer-Jung, D. Moras, Y. Timsit
- article
- EMBO Journal, 1998, 17 (9), pp.2709-2718. ⟨10.1093/emboj/17.9.2709⟩
- identifiant
- hal-02008233
- DOI
- DOI : 10.1093/emboj/17.9.2709
- Accès au bibtex
-
- titre
- DNA crossovers and type II DNA topoisomerases: a thermodynamical study 1 1Edited by T. Richmond
- auteur
- Y Sikorav, Bertrand Duplantier, Gérard Jannink, Y. Timsit, Jean-Louis Sikorav
- article
- Journal of Molecular Biology, 1998, 284 (5), pp.1279-1287. ⟨10.1006/jmbi.1998.2280⟩
- identifiant
- hal-02008229
- DOI
- DOI : 10.1006/jmbi.1998.2280
- Accès au bibtex
-
- titre
- Symmetry and chirality in topoisomerase II-DNA crossover recognition 1 1Edited by T. Richmond
- auteur
- B Timsit, Bertrand Duplantier, J Jannink, Jean-Louis Sikorav, Y. Timsit, Gérard Jannink
- article
- Journal of Molecular Biology, 1998, 284 (5), pp.1289-1299. ⟨10.1006/jmbi.1998.2281⟩
- identifiant
- hal-02008222
- DOI
- DOI : 10.1006/jmbi.1998.2281
- Accès au bibtex
-
1997
Journal articles
- titre
- Effect of cytosine methylation on DNA-DNA recognition at CpG steps
- auteur
- Claudine Mayer-Jung, Dino Moras, Y. Timsit
- article
- Journal of Molecular Biology, 1997, 270 (3), pp.328-335. ⟨10.1006/jmbi.1997.1137⟩
- identifiant
- hal-02008237
- DOI
- DOI : 10.1006/jmbi.1997.1137
- Accès au bibtex
-
1995
Journal articles
- titre
- Effect of pH on Bacillus thermoamylovorans Growth and Glucose Fermentation.
- auteur
- Yannick Combet-Blanc, K Kalamba, P Kergoat
- article
- Applied and Environmental Microbiology, 1995, 61 (2), pp.656-9
- identifiant
- hal-01888503
- Accès au bibtex
-
- titre
- Self-fitting and Self-modifying Properties of theB-DNA Molecule
- auteur
- Y. Timsit, Dino Moras
- article
- Journal of Molecular Biology, 1995, 251 (5), pp.629-647. ⟨10.1006/jmbi.1995.0461⟩
- identifiant
- hal-02008250
- DOI
- DOI : 10.1006/jmbi.1995.0461
- Accès au bibtex
-
Book sections
- titre
- DNA self-fitting
- auteur
- Y. Timsit
- article
- Proceeding of the eleventh conversation, state university of New York, Albany, eds R. Sarma and M. Sarma, Adenine press., 1995
- identifiant
- hal-02398491
- Accès au bibtex
-
1994
Journal articles
- titre
- PHI-AAU2, A TEMPERATE BACTERIOPHAGE SPECIFIC FOR ARTHROBACTER-AUREUS, WHOSE INTEGRATIVE FUNCTIONS WORK IN OTHER CORYNEBACTERIA
- auteur
- Lemarrec, C, Valerie Michotey, Blanco, C, Annie Trautwetter
- article
- MICROBIOLOGY-UK, 1994, 140 (11), pp.3071-3077
- identifiant
- hal-04983205
- Accès au bibtex
-
- titre
- NOVEL PHOSPHOTRANSFERASE SYSTEM GENES REVEALED BY BACTERIAL GENOME ANALYSIS - UNIQUE, PUTATIVE FRUCTOSE-SPECIFIC AND GLUCOSIDE-SPECIFIC SYSTEMS
- auteur
- Jonathan Reizer, Valerie Michotey, A Reizer, Mh Saier
- article
- Protein Science, 1994, 3 (3), pp.440-450
- identifiant
- hal-04983218
- Accès au bibtex
-
- titre
- DNA self-fitting: the double helix directs the geometry of its supramolecular assembly.
- auteur
- Y. Timsit, D. Moras
- article
- EMBO Journal, 1994, 13 (12), pp.2737-46
- identifiant
- hal-02008254
- Accès au bibtex
-
1992
Journal articles
- titre
- Crystallization of DNA.
- auteur
- Y. Timsit, D. Moras
- article
- Methods in Enzymology, 1992, 211, pp.409-29
- identifiant
- hal-02008256
- Accès au bibtex
-
1991
Journal articles
- titre
- Base-pairing shift in the major groove of (CA)n tracts by B-DNA crystal structures
- auteur
- Y. Timsit, Eric Vilbois, Dino Moras
- article
- Nature, 1991, 354 (6349), pp.167-170. ⟨10.1038/354167a0⟩
- identifiant
- hal-02008260
- DOI
- DOI : 10.1038/354167a0
- Accès au bibtex
-
- titre
- Groove-backbone interaction in B-DNA. Implication for DNA condensation and recombination.
- auteur
- Y. Timsit, D. Moras
- article
- Journal of Molecular Biology, 1991, 221 (3), pp.919-40
- identifiant
- hal-02008263
- Accès au bibtex
-
1989
Journal articles
- titre
- Unusual helical packing in crystals of DNA bearing a mutation hot spot
- auteur
- R Timsit, Eric Westhof, Robert P Fuchs, Dino Moras, Y. Timsit
- article
- Nature, 1989, 341 (6241), pp.459-462. ⟨10.1038/341459a0⟩
- identifiant
- hal-02008266
- DOI
- DOI : 10.1038/341459a0
- Accès au bibtex
-