Publications HAL

2026

titre
Des capteurs plasmo-photoniques pour la sécurité sanitaire des produits agricoles
auteur
Laurent Markey, Omkar Bhalerao, Stephan Suckow, Damien Bernier, Fabian Dortu, Evangelia Chatzianagnostou, Dimosthenis Spasopoulos, Christia Eleftheriou, Athanasios Manolis, Dimitris Tsiokos, Marios Sergides, Panayiota Demosthenous, Jean-Claude Weeber, Aymeric Leray, Alessandro Giusti
article
Photoniques, 2026, 135, pp.37-41. ⟨10.1051/photon/202513537⟩
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https://hal.science/hal-05474286/file/Des%20Capteurs%20%20Plasmo-photoniques%20pour%20la%20s%C3%A9curit%C3%A9%20sanitaire%20des%20produits%20agricoles%20PHOTNIQUES%20135%20_%2037-41.pdf BibTex

2025

titre
The nuclear dynamic of CDC48 is affected during the immune response in plants
auteur
Damien Inès, Aymeric Leray, Pascale Winckler, Pierre-Emmanuel Courty, David Wendehenne, Claire Rosnoblet
article
Plant Signaling and Behavior, 2025, 20 (1), pp.2488104. ⟨10.1080/15592324.2025.2488104⟩
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https://institut-agro-dijon.hal.science/hal-05023684/file/KPSB_20_2488104.pdf BibTex

2024

titre
Self-Induced Light Emission in Solid-State Memristors Replicates Neuronal Biophotons
auteur
Konstantin Malchow, Till Zellweger, Bojun Cheng, Aymeric Leray, Juerg Leuthold, Alexandre Bouhelier
article
ACS Nano, 2024, 18 (35), pp.24004-24011. ⟨10.1021/acsnano.4c02924⟩
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https://hal.science/hal-04736066/file/blinking_dynamics_in_memristive_junctions_2-14.pdf BibTex
titre
Controlling heat capacity in a thermal concentrator using metamaterials: Numerical and experimental studies
auteur
Thiwanka Arepolage, Christophe Verdy, Thibaut Sylvestre, Aymeric Leray, Sébastien Euphrasie
article
International Journal of Heat and Mass Transfer, 2024, 220, pp.124909 (7). ⟨10.1016/j.ijheatmasstransfer.2023.124909⟩
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https://hal.science/hal-04528353/file/059947dc-b678-47b1-be14-0cac4abebb8b-author.pdf BibTex
titre
Compact Implementation of a 1-Bit Adder by Coherent 2-Beam Excitation of a Single Plasmonic Cavity
auteur
Florian Dell’ova, Yoann Brûlé, Nicolas Gros, Justin Bizouard, Diana Shakirova, Aurélie Bertaux, Aymeric Leray, Ouassila Labbani Narsis, Christophe Nicolle, Gérard Colas des Francs, Alexandre Bouhelier, Erik Dujardin
article
ACS photonics, 2024, 11 (2), pp.752-761. ⟨10.1021/acsphotonics.3c01624⟩
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https://hal.science/hal-04736128/file/2024_ACSPhot_FDellOva_AcceptedManuscript_HAL.pdf BibTex
titre
Nano antenna-assisted quantum dots emission into high-index planar waveguide
auteur
X Yu, Jean Claude Weeber, Laurent Markey, Juan-Miguel Arocas, Alexandre Bouhelier, Aymeric Leray, Gérard Colas des Francs
article
Nanotechnology, 2024, 35 (26), pp.265201. ⟨10.1088/1361-6528/ad3742⟩
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https://hal.science/hal-04539940/file/2402.13557-1.pdf BibTex

2023

titre
Compact implementation of a 1-bit adder by coherent 2-beam excitation of a single plasmonic cavity
auteur
Florian Dell'Ova, Yoann Brûlé, Nicolas Gros, Justin Bizouard, Diana Shakirova, Aymeric Leray, Ouassila Labbani Narsis, Christophe Nicolle, Gérard Colas Des Francs, Alexandre Bouhelier, Erik Dujardin
article
2023
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https://hal.science/hal-04287298/file/2023_ACSPhot_FDellOva_Manuscript.pdf BibTex
titre
Combined SPT and FCS methods reveal a mechanism of RNAP II oversampling in cell nuclei
auteur
Marie Fournier, Pierre Leclerc, Aymeric Leray, Dorian Champelovier, Florence Agbazahou, Fatima Dahmani, Gabriel Bidaux, Alessandro Furlan, Laurent Héliot
article
Scientific Reports, 2023, 13 (1), pp.14633. ⟨10.1038/s41598-023-38668-8⟩
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https://hal.science/hal-04294629/file/s41598-023-38668-8.pdf BibTex

2022

titre
Vectorial probing of electric and magnetic transitions in variable optical environments and vice-versa
auteur
Reinaldo Chacon, Aymeric Leray, Jeongmo Kim, Khalid Lahlil, Alexandre Bouhelier, Jong-Wook Kim, Thierry Gacoin, Gérard Colas Des Francs
article
Nanotechnology, 2022, 33 (38), pp.385705. ⟨10.1088/1361-6528/ac7884⟩
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https://hal.science/hal-03795446/file/ChaconEuRodMD-EDNanotechR1.pdf BibTex
titre
Improvement of hetero-interface engineering by partial substitution of Zn in Cu2ZnSnS4-based solar cells
auteur
Charif Tamin, Denis Chaumont, Olivier Heintz, Aymeric Leray, Mohamed Adnane
article
EPJ Photovoltaics, 2022, Recent Advances in Spectroscopy and Microscopy of Thin-films Materials, Interfaces, and Solar Cells 2021, 13, pp.24. ⟨10.1051/epjpv/2022022⟩
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https://hal.science/hal-03820288/file/pv220012.pdf BibTex

2021

titre
Simple phasor-based deep neural network for fluorescence lifetime imaging microscopy
auteur
Laurent Héliot, Aymeric Leray
article
Scientific Reports, 2021, 11 (1), pp.23858. ⟨10.1038/s41598-021-03060-x⟩
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https://hal.science/hal-03795436/file/Leray2021_ScientificReports.pdf BibTex
titre
Measuring 3D orientation of nanocrystals via polarized luminescence of rare-earth dopants
auteur
Jeongmo Kim, Reinaldo Chacón, Zijun Wang, Eric Larquet, Khalid Lahlil, Aymeric Leray, Gérard Colas-Des-Francs, Jongwook Kim, Thierry Gacoin
article
Nature Communications, 2021, 12 (1), ⟨10.1038/s41467-021-22158-4⟩
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https://hal.science/hal-03334798/file/s41467-021-22158-4.pdf BibTex
titre
Characteristic ERK1/2 signaling dynamics distinguishes necroptosis from apoptosis
auteur
François Sipieter, Benjamin Cappe, Aymeric Leray, Elke de Schutter, Jolien Bridelance, Paco Hulpiau, Guy Van Camp, Wim Declercq, Laurent Héliot, Pierre Vincent, Peter Vandenabeele, Franck B Riquet
article
iScience, 2021, 24 (9), pp.103074. ⟨10.1016/j.isci.2021.103074⟩
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https://hal.science/hal-03427877/file/1-s2.0-S2589004221010427-main-2.pdf BibTex
titre
New insight into the aptamer conformation and aptamer/protein interaction by surface-enhanced Raman scattering and multivariate statistical analysis
auteur
Wafa Safar, Andra-Sorina Tatar, Aymeric Leray, Monica Potara, Qiqian Liu, Mathieu Edely, Nadia Djaker, Jolanda Spadavecchia, Weiling Fu, Sarra Gam Derouich, Nordin Felidj, Simion Astilean, Eric Finot, Marc Lamy de La Chapelle
article
Nanoscale, 2021, 13 (29), pp.12443-12453. ⟨10.1039/D1NR02180J⟩
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https://hal.science/hal-03369964/file/Safar_Nanoscale_13_2021.pdf BibTex

2020

titre
Investigation of absorber and heterojunction in the pure sulphide kesterite
auteur
Charif Tamin, Denis Chaumont, Olivier Heintz, Remi Chassagnon, Aymeric Leray, Nicolas Geoffroy, Maxime Guerineau, Mohamed Adnane
article
Boletín de la Sociedad Española de Cerámica y Vidrio, 2020, 60 (6), pp.380. ⟨10.1016/j.bsecv.2020.05.004⟩
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https://hal.science/hal-03032110/file/Tamin2020.pdf BibTex
titre
Colloidal quantum dots decorated micro-ring resonators for efficient integrated waveguides excitation
auteur
Jean-Claude Weeber, Gérard Colas des Francs, Alexandre Bouhelier, Aymeric Leray, Kirill Vasilev, Xiao Yu, Kamal Hammani, Juan-Miguel Arocas, Grégory Gadret, Laurent Markey, Benoit Dubertret
article
Nanophotonics, 2020, 9, pp.1411 - 1423. ⟨10.1515/nanoph-2019-0516⟩
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https://hal.science/hal-03025710/file/Nanophotonics.pdf BibTex
titre
Reduced reticulum–mitochondria Ca2+ transfer is an early and reversible trigger of mitochondrial dysfunctions in diabetic cardiomyopathy
auteur
Maya Dia, Ludovic Gomez, Helene Thibault, Nolwenn Tessier, Christelle Leon, Christophe Chouabe, Sylvie Ducreux, Noelle Gallo-Bona, Emily Tubbs, Nadia Bendridi, Stéphanie Chanon, Aymeric Leray, Lucid Belmudes, Yohann Couté, Mazen Kurdi, Michel Ovize, Jennifer Rieusset, Melanie Paillard
article
Basic Research in Cardiology, 2020, 115 (6), pp.74. ⟨10.1007/s00395-020-00835-7⟩
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https://hal.science/hal-03122630/file/Dia2020_BRIC.pdf BibTex
titre
Measuring the Magnetic Dipole Transition of Single Nanorods by Spectroscopy and Fourier Microscopy
auteur
Reinaldo Chacon, Aymeric Leray, Jeongmo Kim, Khalid Lahlil, Sanro Mathew, Alexandre Bouhelier, Jong-Wook Kim, Thierry Gacoin, Gérard Colas Des Francs
article
Physical Review Applied, 2020, 14, pp.054010. ⟨10.1103/PhysRevApplied.14.054010⟩
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https://hal.science/hal-02991087/file/ChaconPRAppv6.pdf BibTex

2019

titre
HEXIM1 Diffusion in the Nucleus Is Regulated by Its Interactions with Both 7SK and P-TEFb
auteur
Alessandro Furlan, Mariano Gonzalez-Pisfil, Aymeric Leray, Dorian Champelovier, Mélanie Henry, Corentin Le Nézet, Oliver Bensaude, Marc Lefranc, Thorsten Wohland, Bernard Vandenbunder, Gabriel Bidaux, Laurent Héliot
article
Biophysical Journal, 2019, 117 (9), pp.1615-1625. ⟨10.1016/j.bpj.2019.09.019⟩
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https://hal.science/hal-03060372/file/HEXIM1%20Diffusion%20in%20the%20Nucleus%20Is%20Regulated%20by%20Its%20Interactions%20with%20Both%207SK%20and%20P-TEFb.pdf BibTex
titre
Conformational Changes and Charge Transfer in Biomolecules Resolved Using Dynamic Enhanced Raman Correlation Spectroscopy
auteur
Aymeric Leray, Jean-Emmanuel Cleḿent, Alexandre Bouhelier, Eric Finot
article
Journal of Physical Chemistry B, 2019, 123 (9), pp.1931-1938. ⟨10.1021/acs.jpcb.8b10803⟩
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https://hal.science/hal-02322742/file/manuscript.pdf BibTex
titre
A readily usable two‐photon fluorescence lifetime microendoscope
auteur
Charles‐henri Hage, Pierre Leclerc, Marc Fabert, Sylvia Bardet, Julien Brevier, Guillaume Ducourthial, Tigran Mansuryan, Aymeric Leray, Alexandre Kudlinski, Frédéric Louradour
article
Journal of Biophotonics, 2019, 12 (5), ⟨10.1002/jbio.201800276⟩
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BibTex
titre
A readily usable two‐photon fluorescence lifetime microendoscope
auteur
Charles‐henri Hage, Pierre Leclerc, Fabert Marc, Sylvia M. Bardet, Julien Brevier, Guillaume Ducourthial, Tigran Mansuryan, Aymeric Leray, Alexandre Kudlinski, Frédéric Louradour
article
Journal of Biophotonics, 2019, 12 (5), pp.e201800276. ⟨10.1002/jbio.201800276⟩
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BibTex

2017

titre
Spectral pointillism of enhanced Raman scattering for accessing structural and conformational information on single protein
auteur
Jean-Emmanuel Clément, Aymeric Leray, Alexandre Bouhelier, Eric Finot
article
Physical Chemistry Chemical Physics, 2017, 19 (1), pp.458-466. ⟨10.1039/C6CP06667D⟩
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BibTex

2016

titre
Myofibril Changes in the Copepod Pseudodiaptomus marinus Exposed to Haline and Thermal Stresses
auteur
Ali Ibrahim, Anissa Souissi, Aymeric Leray, Laurent Héliot, Bernard Vandenbunder, Sami Souissi
article
PLoS ONE, 2016, 11 (11), pp.e0164770. ⟨10.1371/journal.pone.0164770⟩
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https://hal.science/hal-05462401/file/78b075c6e0a551155cf7d07c376096fc.pdf BibTex
titre
Sorting of Single Biomolecules based on Fourier Polar Representation of Surface Enhanced Raman Spectra
auteur
Aymeric Leray, Thibault Brulé, Mickael Buret, Gérard Colas des Francs, Alexandre Bouhelier, Alain Dereux, Eric Finot
article
Scientific Reports, 2016, 6 (1), pp.20383. ⟨10.1038/srep20383⟩
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https://hal.science/hal-05462346/file/srep20383.pdf BibTex
titre
Statistical performance analysis of a fast super-resolution technique using noisy translations
auteur
Pierre Chainais, Aymeric Leray
article
IEEE Transactions on Image Processing, 2016, 25 (4), pp.1699 - 1712. ⟨10.1109/TIP.2016.2526901⟩
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https://hal.science/hal-01104759/file/Chainais_Leray_TIP2016_preprint.pdf BibTex

2015

titre
Unraveling the time cross correlations of an emitter switching between two states with the same fluorescence intensity
auteur
F Eloi, H Frederich, A Leray, S Buil, Xavier Quélin, B Ji, Emerson Giovanelli, N Lequeux, B Dubertret, J.-P Hermier
article
Optics Express, 2015, ⟨10.1364/OE.23.029921⟩
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https://uvsq.hal.science/hal-01337661/file/article_submission_4.pdf BibTex

2014

titre
Sorting of Enhanced Reference Raman Spectra of a Single Amino Acid Molecule
auteur
Thibault Brulé Brulé, Hélène Yockell-Lelièvre, Alexandre Bouhelier, Jérémie Margueritat, Laurent Markey, Aymeric Leray, Alain Dereux, Eric Finot
article
Journal of Physical Chemistry C, 2014, 118 (31), pp.17975-17982. ⟨10.1021/jp504395c⟩
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BibTex
titre
Quantitative control of the error bounds of a fast super-resolution technique for microscopy and astronomy
auteur
Pierre Chainais, Pierre Pfennig, Aymeric Leray
article
Int. Conf. on Acoustics, Speech and Signal Processing (ICASSP), May 2014, Florence, Italy. pp.2853 - 2857, ⟨10.1109/ICASSP.2014.6854121⟩
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https://hal.science/hal-01081402/file/chainais_pfennig_icassp2014_FINAL.pdf BibTex
titre
5èmes Journées Scientifiques et Techniques du Réseau des Microscopistes INRA. « Imagerie cellulaire en science du vivant : Cryo-microscopies, Dynamiques in vivo et Interactions moléculaires »
auteur
Christine Arnould, Laure L. Avoscan, Véronique Aubert, Aline Bonnotte, Stéphanie Busset, Sandrine Giordana-Pignon, Fréderic Herbst, Rémi Chassagnon, Aymeric Leray, Jeannine Lherminier, Elodie Noirot, Jean-Marie Perrier-Cornet, Pascale Winckler
article
5. Journées Scientifiques et Techniques du Réseau des Microscopistes INRA, Nov 2014, Dijon, France. 28 p., 2014
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BibTex
titre
Single-molecule controlled emission in planar plasmonic cavities
auteur
S Derom, A Bouhelier, Ashish Kumar, A Leray, J-C Weeber, S Buil, Xavier Quélin, Jean-Pierre Hermier, G Colas Des Francs
article
Physical Review B: Condensed Matter and Materials Physics (1998-2015), 2014, 89 (3), pp.035401. ⟨10.1103/PhysRevB.89.035401⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://uvsq.hal.science/hal-01337603/file/PRB_89_035401_2014.pdf BibTex

2013

titre
Measuring the scattering coefficient of turbid media from two-photon microscopy
auteur
David Sevrain, Matthieu Dubreuil, Aymeric Leray, Christophe Odin, Yann Le Grand
article
Optics Express, 2013, 21 (21), pp.25221. ⟨10.1364/OE.21.025221⟩
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https://hal.univ-brest.fr/hal-00907898/file/Measuring_the_scattering_coefficient_of_turbid_media_from_two-photon_microscopy.pdf BibTex
titre
From FRET Imaging to Practical Methodology for Kinase Activity Sensing in Living Cells
auteur
Francois Sipieter, Pauline Vandame, Corentin Spriet, Aymeric Leray, Pierre Vincent, Dave Trinel, Jean-Francois Bodart, Franck B. Riquet, Laurent Heliot
article
Morris, MC. FLUORESCENCE-BASED BIOSENSORS: FROM CONCEPTS TO APPLICATIONS, 113, ELSEVIER ACADEMIC PRESS INC, pp.145-216, 2013, Progress in Molecular Biology and Translational Science, 978-0-12-386932-6. ⟨10.1016/B978-0-12-386932-6.00005-3⟩
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BibTex
titre
827Spatio-temporal quantification of FRET in living cells by fast time-domain FLIM: a comparative study of non-fitting methods.
auteur
Aymeric Leray, Sergi Padilla-Parra, Julien Roul, Laurent Héliot, Marc Tramier
article
PLoS ONE, 2013, 8 (7), pp.e69335. ⟨10.1371/journal.pone.0069335⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://univ-rennes.hal.science/hal-00877143/file/journal.pone.0069335.pdf BibTex
titre
The elongation complex components BRD4 and MLLT3/AF9 are transcriptional coactivators of nuclear retinoid receptors.
auteur
Sébastien Flajollet, Christophe Rachez, Maheul Ploton, Céline Schulz, Rozenn Gallais, Raphaël Métivier, Michal Pawlak, Aymeric Leray, Al Amine Issulahi, Laurent Héliot, Bart Staels, Gilles Salbert, Philippe Lefebvre
article
PLoS ONE, 2013, 8 (6), pp.e64880. ⟨10.1371/journal.pone.0064880⟩
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https://univ-rennes.hal.science/hal-00877102/file/journal.pone.0064880.pdf BibTex

2012

titre
Generalization of the polar representation in time domain fluorescence lifetime imaging microscopy for biological applications: practical implementation.
auteur
A. Leray, C. Spriet, D. Trinel, Yves Usson, L. Héliot
article
Journal of Microscopy, 2012, 248 (1), pp.66-76. ⟨10.1111/j.1365-2818.2012.03651.x⟩
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titre
Mesure des paramètres de diffusion de milieux turbides par microscopie a deux photons.
auteur
D. Sevrain, A. Leray, Christophe Odin, Yann Le Grand
article
OptDiag 2012 Diagnostic et Imagerie Optique en Médecine et Biologie, May 2012, Paris, France. pp.227-234
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titre
Mesure des paramètres de diffusion de milieux turbides par microscopie a deux photons
auteur
David Sevrain, Aymeric Leray, Christophe Odin, Yann Le Grand
article
Publications Mission ressources et compétences technologiques CNRS. Biophotonique Générale : Optique et Imageries pour le Diagnostic dans les sciences du Vivant et en Médecine, pp.227-234, 2012, 978-2-918701-11-8
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2011

titre
Upgrading time domain FLIM using an adaptive Monte Carlo data inflation algorithm.
auteur
Dave Trinel, Aymeric Leray, Corentin Spriet, Yves Usson, Laurent Héliot
article
Cytometry Part A, 2011, 79 (7), pp.528-37. ⟨10.1002/cyto.a.21054⟩
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titre
Quantitative comparison of polar approach versus fitting method in time domain FLIM image analysis.
auteur
A. Leray, C. Spriet, D. Trinel, R. Blossey, Yves Usson, L. Héliot
article
Cytometry Part A, 2011, 79 (2), pp.149-58. ⟨10.1002/cyto.a.20996⟩
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2009

titre
Measurement of femtosecond laser-induced damage and ablation thresholds in dielectrics
auteur
Nicolas Sanner, Olivier Utéza, Benoît Bussiere, G. Coustillier, A. Leray, Tatiana Itina, Marc Sentis
article
Applied physics. A, Materials science & processing, 2009, 94 (4), pp.889. ⟨10.1007/s00339-009-5077-6⟩
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2008

titre
Out-of-focus fluorescence collection in two-photon microscopy of scattering media
auteur
Aymeric Leray, Christophe Odin, Yann Le Grand
article
Optics Communications, 2008, 281 (24), pp.6139-6144. ⟨10.1016/J.OPTCOM.2008.09.032⟩
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titre
Non-descanned versus descanned epifluorescence collection in two-photon microscopy: Experiments and Monte Carlo simulations
auteur
Yann Le Grand, Aymeric Leray, Thomas Guilbert, Christophe Odin
article
Optics Communications, 2008, 281 (21), pp.5480-5486. ⟨10.1016/J.OPTCOM.2008.07.027⟩
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2007

titre
Excitation hors foyer et profondeur d'imagerie en microscopie biphotonique
auteur
A. Leray, Christophe Odin, Yann Le Grand, E. Huguet, François Amblard
article
OPTDIAG'07, May 2007, Paris, France
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titre
Spatially distributed two-photon excitation fluorescence in scattering media: Experiments and time-resolved Monte Carlo simulations
auteur
A. Leray, Christophe Odin, E. Huguet, François Amblard, Yann Le Grand
article
Optics Communications, 2007, 272 (1), pp.269-278. ⟨10.1016/J.OPTCOM.2006.11.007⟩
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2004

titre
Organization and Orientation of Amphiphilic Push−Pull Chromophores Deposited in Langmuir−Blodgett Monolayers Studied by Second Harmonic Generation and Atomic Force Microscopy
auteur
A. Leray, L. Leroy, Y. Le Grand, C. Odin, A. Renault, V. Vie, D. Rouède, T. Mallegol, O. Mongin, M. H. V. Werts, M. Blanchard-Desce
article
Langmuir, 2004, 20, pp.8165-8171. ⟨10.1021/la0491706⟩
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