Publications HAL

2023

Journal articles

titre
Functional redundancy in response to runoff input upholds microbial community in hydrocarbon-contaminated land-sea continuum
auteur
Elise Châtillon, Aurélie Cébron, François Rigal, Christine Cagnon, Catherine Lorgeoux, Pierre Faure, Robert Duran, Cristiana Cravo-Laureau
article
Environmental Pollution, 2023, 335, pp.122330. ⟨10.1016/j.envpol.2023.122330⟩
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https://univ-pau.hal.science/hal-04189595/file/Chatillon%20et%20al_2023_HAL.pdf BibTex
titre
Keystone microbial taxa organize micropollutant-related modules shaping the microbial community structure in estuarine sediments
auteur
Sandrine Veloso, David Amouroux, Christine Cagnon, Mathilde Monperrus, Jonathan Deborde, Cristiana Cravo-Laureau, Robert Duran
article
Journal of Hazardous Materials, 2023, 448, pp.130858. ⟨10.1016/j.jhazmat.2023.130858⟩
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https://univ-pau.hal.science/hal-03977926/file/MS-Veloso_et_al%20clean%2009012023%20%281%29.pdf BibTex
titre
The microbiome of a brownfield highly polluted with mercury and arsenic
auteur
Alexander Prosenkov, Christine Cagnon, José Luis R Gallego, Ana Isabel Pelaez
article
Environmental Pollution, 2023, 323, pp.121395. ⟨10.1016/j.envpol.2023.121305⟩
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https://univ-pau.hal.science/hal-04036911/file/1-s2.0-S026974912300307X-main.pdf BibTex
titre
New insights into microbial community coalescence in the land-sea continuum
auteur
Elise Châtillon, Robert Duran, François Rigal, Christine Cagnon, Aurélie Cébron, Cristiana Cravo-Laureau
article
Microbiological Research, 2023, 267, pp.127259. ⟨10.1016/j.micres.2022.127259⟩
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titre
Vertical organization of microbial communities in Salineta hypersaline wetland, Spain
auteur
Zeina Bourhane, Christine Cagnon, Carmen Castañeda, Rafael Rodríguez-Ochoa, Jorge Álvaro-Fuentes, Cristiana Cravo-Laureau, Robert Duran
article
Frontiers in Microbiology, 2023, 14, pp.869907. ⟨10.3389/fmicb.2023.869907⟩
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https://univ-pau.hal.science/hal-03996581/file/fmicb-14-869907.pdf BibTex
titre
Cold sediment microbial community shifts in response to crude oil water-accommodated fraction with or without dispersant: a microcosm study
auteur
Tamer Hafez, Maren Ortiz-Zarragoitia, Christine Cagnon, Cristiana Cravo-Laureau, Robert Duran
article
Environmental Science and Pollution Research, 2023, 30 (15), pp.44640-44656. ⟨10.1007/s11356-023-25264-6⟩
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titre
Environmental integrons: the dark side of the integron world
auteur
Eva Sandoval-Quintana, Béatrice Lauga, Christine Cagnon
article
Trends in Microbiology, 2023, 31 (5), pp.432-434. ⟨10.1016/j.tim.2022.01.009⟩
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titre
CRISPR‐Cas9 enrichment, a new strategy in microbial metagenomics to investigate complex genomic regions: The case of an environmental integron
auteur
Eva Sandoval-Quintana, Christina Stangl, Lionel Huang, Ivo Renkens, Robert Duran, Gijs van Haaften, Glen Monroe, Béatrice Lauga, Christine Cagnon
article
Molecular Ecology Resources, 2023, 23 (6), pp.1288-1298. ⟨10.1111/1755-0998.13798⟩
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https://univ-pau.hal.science/hal-04096642/file/hal%E2%80%9304096642Sandoval%20et%20al.pdf BibTex

2022

Journal articles

titre
Legacy and dispersant influence microbial community dynamics in cold seawater contaminated by crude oil water accommodated fractions
auteur
Tamer Hafez, Maren Ortiz-Zarragoitia, Christine Cagnon, Cristiana Cravo-Laureau, Robert Duran
article
Environmental Research, 2022, 212, pp.113467. ⟨10.1016/j.envres.2022.113467⟩
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https://univ-pau.hal.science/hal-04532118/file/1-s2.0-S0013935122007940-am.pdf BibTex
titre
Microbial diversity alteration reveals biomarkers of contamination in soilriver-lake continuum
auteur
Zeina Bourhane, Anders Lanzén, Christine Cagnon, Olfa Ben Said, Ezzeddine Mahmoudi, Frederic Coulon, Emmanuel Atai, Angel Borja, Cristiana Cravo-Laureau, Robert Duran
article
Journal of Hazardous Materials, 2022, 421, pp.126789. ⟨10.1016/j.jhazmat.2021.126789⟩
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https://univ-pau.hal.science/hal-04532085/file/1-s2.0-S0304389421017568-am.pdf BibTex

2021

Journal articles

titre
New insights in bacterial and eukaryotic diversity of microbial mats inhabiting exploited and abandoned salterns at the Ré Island (France)
auteur
Camille Mazière, Hélène Agogué, Cristiana Cravo-Laureau, Christine Cagnon, Isabelle Lanneluc, Sophie Sablé, Ingrid Fruitier-Arnaudin, Christine Dupuy, Robert Duran
article
Microbiological Research, 2021, 252, ⟨10.1016/j.micres.2021.126854⟩
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https://hal.science/hal-03327781/file/Mazie%CC%80re%20et%20al%20090821%20HAL.pdf BibTex

2020

Conference papers

titre
Microbial communities and hydrocarbon biodegradation in land sea continuum
auteur
Elise Châtillon, Robert Duran, François Rigal, Christine Cagnon, Catherine Lorgeoux, Pierre Faure, Marie Hubert-Roux, Isabelle Schmitz-Afonso, Carlos Afonso, Aurélie Cébron, Cristiana Cravo-Laureau
article
SETAC, May 2020, Virtual Conference, Dublin, Ireland
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2017

Journal articles

titre
Variation of oxygenation conditions on a hydrocarbonoclastic microbial community reveals Alcanivorax and Cycloclasticus ecotypes
auteur
Fanny Terrisse, Cristiana Cravo-Laureau, Cyril Noel, Christine Cagnon, Alex J. Dumbrell, T.J. Mcgenity, Robert Duran
article
Frontiers in Microbiology, 2017, 8, pp.1549. ⟨10.3389/fmicb.2017.01549⟩
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https://hal.science/hal-01631803/file/Terrisse%20et%20al%202017.pdf BibTex

Book sections

titre
Microbial Responses to Pollution—Ecotoxicology: Introducing the Different Biological Levels
auteur
Cristiana Cravo-Laureau, Béatrice Lauga, Christine Cagnon, Robert Duran
article
Cravo-Laureau, C., Cagnon, C., Duran, R., Lauga, B. Microbial Ecotoxicology, Springer, pp.45-62, 2017, ISBN 978-3-319-61795-4. ⟨10.1007/978-3-319-61795-4_4⟩
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2015

Journal articles

titre
Use of dispersant in mudflat oil-contaminated sediment: behavior and effects of dispersed oil on micro- and macrobenthos.
auteur
Philippe Cuny, Franck Gilbert, Cécile Militon, Georges Stora, Patricia Bonin, Valerie Michotey, Sophie Guasco, Karine Duboscq, Christine Cagnon, Ronan Jézéquel, Cristiana Cravo-Laureau, Robert Duran
article
Environmental Science and Pollution Research, 2015, 22 (20), pp.15370-15376. ⟨10.1007/s11356-015-4800-4⟩
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titre
Effect of physical sediments reworking on hydrocarbon degradation and bacterial community structure in marine coastal sediments.
auteur
Robert Duran, Patricia Bonin, Ronan Jezequel, Karine Dubosc, Claire Gassie, Fanny Terrisse, Justine Abella, Christine Cagnon, Cécile Militon, Valerie Michotey, Franck Gilbert, Philippe Cuny, Cristiana Cravo-Laureau
article
Environmental Science and Pollution Research, 2015, 22 (20), pp.15248-15259. ⟨10.1007/s11356-015-4373-2⟩
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titre
Integron diversity in marine environments
auteur
Justine Abella, A. Bielen, L. Huang, T.O. Delmont, Dušica Vujaklija, Robert Duran, Christine Cagnon
article
Environmental Science and Pollution Research, 2015, 22 (20), pp.15360-15369. ⟨10.1007/s11356-015-5085-3⟩
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titre
Integron diversity in bacterial communities of freshwater sediments at different contamination levels
auteur
Justine Abella, Anne Fahy, Robert Duran, Christine Cagnon
article
FEMS Microbiology Ecology, 2015, 91 (12), ⟨10.1093/femsec/fiv140⟩
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titre
Exploring Actinobacteria assemblages in coastal marine sediments under contrasted Human influences in the West Istria Sea, Croatia
auteur
Robert Duran, A. Bielen, T. Paradžik, C. Gassie, E. Pustijanac, Christine Cagnon, B. Hamer, D. Vujaklija
article
Environmental Science and Pollution Research, 2015, 22 (20), pp.15215-15229. ⟨10.1007/s11356-015-4240-1⟩
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2014

Journal articles

titre
Characterization of new bacterial catabolic genes and mobile genetic elements by high throughput genetic screening of a soil metagenomic library
auteur
Samuel Jacquiod, Sandrine Demanèche, Laure Franqueville, Luka Ausec, Zhuofei Xu, Tom O Delmont, Vincent Dunon, Christine Cagnon, Ines Mandic-Mulec, Timothy M Vogel, Pascal Simonet
article
Journal of Biotechnology, 2014, epub ahead of print. ⟨10.1016/j.jbiotec.2014.03.036⟩
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2013

Journal articles

titre
Impact of oil on bacterial community structure in bioturbated sediments
auteur
Magali Stauffert, Cristiana Cravo-Laureau, Ronan Jezequel, Sandra Barantal, Philippe Cuny, Franck Gilbert, Christine Cagnon, Cécile Militon, David Amouroux, Fatima Mahdaoui, Brice Bouyssière, Georges Stora, François-Xavier Merlin, Robert Duran
article
PLoS ONE, 2013, vol. 8, pp. 1-15. ⟨10.1371/journal.pone.0065347⟩
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https://hal.science/hal-00867612/file/Gilbert_9564.pdf BibTex

2012

Journal articles

titre
Genome sequence of the marine bacterium Marinobacter hydrocarbonoclasticus SP17, which forms biofilms on hydrophobic organic compounds
auteur
R. Grimaud, J.-F. Ghiglione, Christine Cagnon, Béatrice Lauga, P.-J. Vaysse, A. Rodriguez-Blanco, S. Mangenot, S. Cruveiller, Valérie Barbe, Robert Duran, L.-F. Wu, E. Talla, Patricia Bonin, Valerie Michotey
article
Journal of Bacteriology, 2012, 194 (13), pp.3539-3540. ⟨10.1128/JB.00500-12⟩
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https://hal.science/hal-01643936/file/Grimaud_JBacteriol2012.pdf BibTex

2011

Journal articles

titre
Temporal genetic variation in european eel anguilla anguilla (linnaeus, 1758): A fine scale investigation in the adour estuary
auteur
Christine Cagnon, Béatrice Lauga, S. Karama, C. Mouches
article
Marine Biology Research, 2011, 7 (5), pp.515-519. ⟨10.1080/17451000.2010.535832⟩
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Book sections

titre
Impact of hydrocarbons on marine microbial communities
auteur
Christine Cagnon, Magalie Stauffert, Cristiana Cravo-Laureau, Marisol Goñi, Sylvain Bordenave, S. Païssé, Pierre Caumette, Robert Duran
article
Ceccaldi HJ, Dekeyser, I., Girault, M., Stora, G. Global Change: Mankind-Marine Environment Interactions, Springer, pp.335-339, 2011, ISBN 978-90-481-8630-3
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titre
Hydrocarbon degradation in coastal muddy areas and anoxic ecosystems (DHYVA project): Role of bacterial mechanisms and bioturbation effects on the biodisponibility of organic pollutants
auteur
Magalie Stauffert, Lionel Huang, Isabelle Vitte, Ronan Jézéquel, Cristiana Cravo-Laureau, Georges Stora, Christophe Pécheyran, Christine Cagnon, Franck Gilbert, Marisol Goñi, François-Xavier Merlin, David Amouroux, Philippe Cuny, Robert Duran
article
Ceccaldi, H.-J., Dekeyser, I., Girault, M., Stora, G. Global Change: Mankind-Marine Environment Interactions, Springer, pp.393-395, 2011, ISBN 978-90-481-8630-3
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titre
Integron First Gene Cassettes: A Target to Find Adaptive Genes in Metagenomes
auteur
L. Huang, Christine Cagnon
article
Handbook of Molecular Microbial Ecology I: Metagenomics and Complementary Approaches, John Wiley and Sons, pp.217-223, 2011, 9780470644799. ⟨10.1002/9781118010518.ch26⟩
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2009

Journal articles

titre
First gene cassettes of integrons as targets in finding adaptive genes in metagenomes
auteur
L. Huang, Christine Cagnon, Pierre Caumette, Robert Duran
article
Applied and Environmental Microbiology, 2009, 75 (11), pp.3823-3825. ⟨10.1128/AEM.02394-08⟩
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2007

Journal articles

titre
Research Note: Quantification of increase in hepatic CYP1A1 mRNA by real-time RT-PCR after exposure of the European eel (Anguilla anguilla) to a diesel oil water soluble fraction
auteur
Emmanuel Aubry, Christine Cagnon, Y. Lalanne, C. Mouchès
article
Environmental Bioindicators, 2007, 2 (1), pp.47-51. ⟨10.1080/15555270701263002⟩
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titre
Assessment of young yellow European eel Anguilla anguilla L. exposure to a CYP1A1 inducer by the quantification of increase in hepatic CYP1A1 mRNA using real-time RT-PCR
auteur
Emmanuel Aubry, Christine Cagnon, Y. Lalanne, C. Mouchès
article
Journal of Fish Biology, 2007, 71 (SUPPL. C), pp.470-477. ⟨10.1111/j.1095-8649.2007.01658.x⟩
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2005

Journal articles

titre
Phylogeography of the white-throated dipper Cinclus cinclus in Europe
auteur
Béatrice Lauga, Christine Cagnon, Frank d'Amico, S. Karama, C. Mouchès
article
Journal für Ornithologie = Journal of Ornithology, 2005, 146 (3), pp.257-262. ⟨10.1007/s10336-005-0087-4⟩
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2004

Journal articles

titre
Phylogeographic differentiation of storm petrels [Hydrobates pelagicus] based on cytochrome b mitochondrial DNA variation
auteur
Christine Cagnon, Béatrice Lauga, G. Hémery, C. Mouchès
article
Marine Biology, 2004, 145 (6), pp.1257-1264. ⟨10.1007/s00227-004-1407-6⟩
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2001

1998

Journal articles

titre
Phenolic pattern of bean (Phaseolus vulgaris L.) as an indicator of chronic ozone stress
auteur
J.P. Biolley, Béatrice Lauga, Christine Cagnon, Robert Duran, J.C. Salvado, P. Goulas
article
Water, Air, and Soil Pollution, 1998, 106 (3-4), pp.355-368
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1997

Journal articles

titre
Site-directed mutagenesis of active site contact residues in a hydrolytic abzyme: Evidence for an essential histidine involved in transition state stabilization
auteur
H. Miyashita, T. Hara, R. Tanimura, S. Fukuyama, Christine Cagnon, A. Kohara, I. Fujii
article
Journal of Molecular Biology, 1997, 267 (5), pp.1247-1257. ⟨10.1006/jmbi.1997.0938⟩
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titre
CM-gag, a transposable-like element reiterated in the genome of Culex pipiens mosquitoes, contains only a gag gene
auteur
N. Bensaadi-Merchermek, Christine Cagnon, I. Desmons, J.C. Salvado, S. Karama, Frank d'Amico, C. Mouchès
article
Genetica, 1997, 100 (1-3), pp.141-148
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BibTex
titre
Proline-dependent oligomerization with arm exchange
auteur
M. Bergdoll, M.-H. Remy, Christine Cagnon, J.-M. Masson, P. Dumas
article
Structure, 1997, 5 (3), pp.391-401. ⟨10.1016/S0969-2126(97)00196-2⟩
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1995

Journal articles

titre
Characterization of the unlinked 16S rDNA and 23S-5S rRNA operon of Wolbachia pipientis, a prokaryotic parasite of insect gonads
auteur
N. Bensaadi-Merchermek, J.-C. Salvado, Christine Cagnon, S. Karama, C. Mouchès
article
Gene, 1995, 165 (1), pp.81-86. ⟨10.1016/0378-1119(95)00539-I⟩
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1994

Journal articles

titre
Crystal structure and site-directed mutagenesis of a bleomycin resistance protein and their significance for drug sequestering
auteur
P. Dumas, M. Bergdoll, Christine Cagnon, J.-M. Masson
article
EMBO Journal, 1994, 13 (11), pp.2483-2492
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1991

Journal articles

titre
A new family of sugar-inducible expression vectors for Escherichia coli
auteur
Christine Cagnon, V. Valverde, J.-M. Masson
article
Protein Engineering, Design and Selection, 1991, 4 (7), pp.843-847. ⟨10.1093/protein/4.7.843⟩
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1989

Journal articles

titre
Crystallization and preliminary X-ray data of a phleomycin-binding protein from Streptoalloteichus hindustanus
auteur
J.-M. Rondeau, Christine Cagnon, D. Moras, J.-M. Masson
article
Journal of Molecular Biology, 1989, 207 (3), pp.645-646. ⟨10.1016/0022-2836(89)90476-2⟩
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