Publications HAL de la collection LGDP

2025

titre
Physiologic, Genetic and Epigenetic Determinants of Water Deficit Tolerance in Fruit Trees
auteur
Marie Bonnin, Khadidiatou Diop, Gabriel Cavelier, Mathieu Crastes, Renel Groenewald, Hong Thu Nguyen, Raphaël Morillon, Frédéric Pontvianne
article
Plants, 2025, 14 (12), pp.1769. ⟨10.3390/plants14121769⟩
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https://hal.science/hal-05110097/file/plants-14-01769.pdf BibTex
titre
Role of methylation and siRNA on differential allelic expression in a hybrid of distantly related citrus species
auteur
Khadidiatou Diop, Anais Gibert, Christel Llauro, Yann Froelicher, Barbara Hufnagel, Nathalie Picault, Frederic Pontvianne
article
2025
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https://hal.science/hal-05190445/file/VF_article_DIOP2025.pdf BibTex

2024

titre
ANCHOR, a technical approach to visualize single-locus in planta
auteur
Aurore Sureau, Ange Dussutour, Mathieu Ingouff, Frederic Pontvianne
article
Plant Epigenetics (EPIPLANT/SEB 2024), Jul 2024, Clermont-Ferrand, France
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titre
Visualization of chromatin dynamic in planta
auteur
Aurore Sureau, Ange Dussutour, Mathieu Ingouff, Frederic Pontvianne
article
European Workshop on Plant Chromatin, May 2024, Barcelona (ES), Spain
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titre
The overlooked manipulation of nucleolar functions by plant pathogen effectors
auteur
Sarah Ranty-Roby, Frédéric Pontvianne, Michaël Quentin, Bruno Favery
article
Frontiers in Plant Science, 2024, 15, ⟨10.3389/fpls.2024.1445097⟩
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https://univ-perp.hal.science/hal-04727909/file/fpls-15-1445097.pdf BibTex
titre
Gene dose, dosage and positioning control at the allelic level in plant cells
auteur
Frederic Pontvianne
article
30 years of the IGMM, IGMM, Mar 2024, Montpellier, France
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2023

titre
Glutathione-mediated thermomorphogenesis and heat stress responses in Arabidopsis thaliana
auteur
Avilien Dard, Alizée Weiss, Laetitia Bariat, Juline Auverlot, Valentine Fontaine, Nathalie Picault, Frédéric Pontvianne, Christophe Riondet, Jean-Philippe Reichheld
article
Journal of Experimental Botany, 2023, ⟨10.1093/jxb/erad042⟩
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https://hal.science/hal-04068398/file/erad042.pdf BibTex
titre
Nicotianamine synthase activity affects nucleolar iron accumulation and impacts rDNA silencing and RNA methylation in Arabidopsis
auteur
Charlotte Montacié, Christophe Riondet, Lili Wei, Tommy Darrière, Alizée Weiss, Frédéric Pontvianne, Marie-Line Escande, Anne de Bures, Edouard Jobet, A. Barbarossa, Marie-Christine Carpentier, Mark G.M. Aarts, Aurore Attina, Christophe Hirtz, Alexandre David, V. Marchand, Yuri Motorin, Catherine Curie, Stéphane Mari, Jean‐philippe Reichheld, J. Sáez-Vásquez
article
Journal of Experimental Botany, 2023, 74 (15), pp.4384-4400. ⟨10.1093/jxb/erad180⟩
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https://hal.univ-lorraine.fr/hal-04097969/file/MontacieC.-et%20al-InPress-J.ExpBot-2023.pdf BibTex
titre
Extrachromosomal circular DNA and structural variants highlight genome instability in Arabidopsis epigenetic mutants
auteur
P. Zhang, Assane Mbodj, A. Soundiramourtty, C. Llauro, Alain Ghesquière, M. Ingouff, R.K. Slotkin, F. Pontvianne, M. Catoni, Marie Mirouze
article
Nature Communications, 2023, 14, pp.5236. ⟨10.1038/s41467-023-41023-0⟩
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https://hal.science/hal-04192599/file/s41467-023-41023-0.pdf BibTex
titre
Extrachromosomal circular DNA and structural variants highlight genome instability in Arabidopsis epigenetic mutants
auteur
Panpan Zhang, Assane Mbodj, Abirami Soundiramourtty, Christel Llauro, Alain Ghesquière, Mathieu Ingouff, R. Keith Slotkin, Frédéric Pontvianne, Marco Catoni, Marie Mirouze
article
Nature Communications, 2023, 14 (1), pp.5236. ⟨10.1038/s41467-023-41023-0⟩
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https://hal.science/hal-04766500/file/Zhang_et_al_2023_NatComm.pdf BibTex

2022

titre
The plant-specific DDR factor SOG1 increases chromatin mobility in response to DNA damage.
auteur
Anis Meschichi, Lihua Zhao, Svenja Reeck, Charles I. White, Olivier da Ines, Adrien Sicard, Frédéric Pontvianne, Stefanie Rosa
article
EMBO Reports, In press, ⟨10.15252/embr.202254736⟩
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https://hal.science/hal-03814507/file/EMBO%20Reports%20-%202022%20-%20Meschichi%20-%20The%20plant%25E2%2580%2590specific%20DDR%20factor%20SOG1%20increases%20chromatin%20mobility%20in%20response%20to%20DNA%20damage.pdf BibTex
titre
ANCHOR: a technical approach to monitor single-locus localization in planta
auteur
Ange Dussutour, Mathieu Ingouff, Frederic Pontvianne
article
Epiplant, Jul 2022, Banyuls-sur-mer, France, France
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2021

titre
Gene dosage compensation of rRNA transcript levels in Arabidopsis thaliana lines with reduced ribosomal gene copy number
auteur
Francesca B Lopez, Antoine Fort, Luca Tadini, Aline V. Probst, Marcus Mchale, James Friel, Peter Ryder, Frédéric Pontvianne, Paolo Pesaresi, Ronan Sulpice, Peter Mckeown, Galina Brychkova, Charles Spillane
article
The Plant cell, In press, ⟨10.1093/plcell/koab020⟩
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https://univ-perp.hal.science/hal-03133170/file/koab020.pdf BibTex
titre
ANCHOR: A Technical Approach to Monitor Single-Copy Locus Localization in Planta
auteur
Anis Meschichi, Mathieu Ingouff, Claire Picart, Marie Mirouze, Sophie Desset, Franck Gallardo, Kerstin Bystricky, Nathalie Picault, Stefanie Rosa, Frédéric Pontvianne
article
Frontiers in Plant Science, 2021, 12, pp.677849. ⟨10.3389/fpls.2021.677849⟩
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https://univ-perp.hal.science/hal-03313521/file/ANCHOR_Meschichi_2021.pdf BibTex

2020

titre
Chromatin domains in space and their functional implications
auteur
Frederic Pontvianne, Chang Liu
article
Current Opinion in Plant Biology, 2020, 2020, pp.1 - 10. ⟨10.1016/j.pbi.2019.11.005⟩
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https://univ-perp.hal.science/hal-02428536/file/COPB_final.pdf BibTex
titre
Three-dimensional nuclear organization in Arabidopsis thaliana
auteur
Frederic Pontvianne, Stefan Grob
article
Journal of Plant Research, 2020, 133 (4), pp.479-488. ⟨10.1007/s10265-020-01185-0⟩
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https://univ-perp.hal.science/hal-02925853/file/reviewaccepted.pdf BibTex
titre
Nucleolus-associated chromatin domains are maintained under heat stress, despite nucleolar reorganization in Arabidopsis thaliana
auteur
Ariadna Picart-Picolo, Claire Picart, Nathalie Picault, Frederic Pontvianne
article
Journal of Plant Research, 2020, 133 (4), pp.463-470. ⟨10.1007/s10265-020-01201-3⟩
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https://univ-perp.hal.science/hal-02925841/file/Picart_Picolo2020JplantRes.pdf BibTex
titre
Large tandem duplications affect gene expression, 3D organization, and plant–pathogen response
auteur
Ariadna Picart-Picolo, Stefan Grob, Nathalie Picault, Michal Franek, Christel Llauro, Thierry Halter, Tom R Maier, Edouard Jobet, Julie Descombin, Panpan Zhang, Vijayapalani Paramasivan, Thomas J Baum, Lionel Navarro, Martina Dvořáčková, Marie Mirouze, Frédéric Pontvianne
article
Genome Research, In press, ⟨10.1101/gr.261586.120⟩
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https://univ-perp.hal.science/hal-02962580/file/Genome%20Res.-2020-Picart-Picolo-gr.261586.120.pdf BibTex
titre
Tidying-up the plant nuclear space: domains, functions, and dynamics
auteur
Ana Paula Santos, Valérie Gaudin, Iva Mozgová, Frederic Pontvianne, Daniel Schubert, Ahmet L Tek, Martina Dvořáčková, Chang Liu, Paul Fransz, Stefanie Rosa, Sara Farrona
article
Journal of Experimental Botany, 2020, 71 (17), pp.5160-5178. ⟨10.1093/jxb/eraa282⟩
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https://univ-perp.hal.science/hal-02925840/file/santos2020JexpBot.pdf BibTex

2019

titre
Ribosomal RNA genes distribution and expression organize nucleolus- associated chromatin domains
auteur
Frederic Pontvianne
article
European Workshop on Plant Chromatin, EWPC, Jun 2019, Koln, Germany
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BibTex
titre
Ribosomal RNA genes shape chromatin domains associating with the nucleolus
auteur
Ariadna Picart-Picolo, Nathalie Picault, Frederic Pontvianne
article
Nucleus, 2019, 10 (1), pp.67-72. ⟨10.1080/19491034.2019.1591106⟩
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https://hal.science/hal-02115403/file/kncl-10-01-1591106.pdf BibTex
titre
Ribosomal RNA genes distribution and expression organize nucleolus- associated chromatin domains
auteur
Frederic Pontvianne
article
Epiplant, GDR Epiplant, Feb 2019, Strasbourg, France
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2018

titre
An Effector from the Cyst Nematode Heterodera schachtii Derepresses Host rRNA Genes by Altering Histone Acetylation
auteur
Paramasivan Vijayapalani, Tarek T. Hewezi, Frederic Pontvianne, Thomas Baum
article
The Plant cell, 2018, 30 (11), pp.2795-2812. ⟨10.1105/tpc.18.00570⟩
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https://hal.science/hal-02115392/file/TPC_201800570DR1.pdf BibTex
titre
A Method to Identify Nucleolus-Associated Chromatin Domains (NADs)
auteur
Marie-Christine Carpentier, Ariadna Picart-Picolo, Frederic Pontvianne
article
Methods in Molecular Biology, 1675, pp.99-109, 2018, Plant Chromatin Dynamics, ⟨10.1007/978-1-4939-7318-7_7⟩
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2017

titre
Hybrid incompatibility caused by an epiallele
auteur
Todd Blevins, Jing Wang, David Pflieger, Frédéric Pontvianne, Craig S. Pikaard
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2017, 114 (14), pp.3702-3707. ⟨10.1073/pnas.1700368114⟩
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https://hal.science/hal-02289585/file/islandora_79647.pdf BibTex
titre
Nucleolar Proteome Analysis and Proteasomal Activity Assays Reveal a Link between Nucleolus and 26S Proteasome in A. thaliana
auteur
Charlotte Montacié, Nathalie Durut, Alison Opsomer, Denise Palm, Pascale Comella, Claire Picart, Marie-Christine Carpentier, Frederic Pontvianne, Christine Carapito, Enrico Schleiff, Julio Sáez-Vasquez
article
Frontiers in Plant Science, 2017, 8, ⟨10.3389/fpls.2017.01815⟩
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BibTex
titre
Plant nucleolar DNA: Green light shed on the role of Nucleolin in genome organization
auteur
Claire Picart, Frederic Pontvianne
article
Nucleus, 2017, 8 (1), pp.11-16. ⟨10.1080/19491034.2016.1236167⟩
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2016

titre
Identification of Nucleolus-Associated Chromatin Domains Reveals a Role for the Nucleolus in 3D Organization of the A. thaliana Genome
auteur
Frederic Pontvianne, Marie-Christine Carpentier, Nathalie Durut, Veronika Pavlištová, Karin Jaške, Šárka Schořová, Hugues Parrinello, Marine Rohmer, Craig Pikaard, Miloslava Fojtová, Jiří Fajkus, Julio Sáez-Vasquez
article
Cell Reports, 2016, 16 (6), pp.1574-1587. ⟨10.1016/j.celrep.2016.07.016⟩
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https://hal.science/hal-02115369/file/PIIS2211124716309020.pdf BibTex
titre
Selective nucleolus organizer inactivation in Arabidopsis is a chromosome position-effect phenomenon
auteur
Gireesha Mohannath, Frederic Pontvianne, Craig Pikaard
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2016, 113 (47), pp.13426-13431. ⟨10.1073/pnas.1608140113⟩
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BibTex
titre
Chromosome-specific NOR inactivation explains selective rRNA gene silencing and dosage control in Arabidopsis
auteur
C Chandrasekhara, G Mohannath, Todd Blevins, F Pontvianne, C S Pikaard
article
Genes and Development, 2016, 30 (2), pp.177-190. ⟨10.1101/gad.273755.115⟩
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https://hal.science/hal-02185936/file/islandora_79675.pdf BibTex
titre
Rôle du nucléole dans l'organisation nucléaire chez Arabidopsis thaliana
auteur
Frédéric Pontvianne
article
Sciences du Vivant [q-bio]. Université de Perpignan Via Domitia (UPVD), 2016
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https://univ-perp.hal.science/tel-02186748/file/HDR_Pontvianne.pdf BibTex
titre
Fluorescence-Activated Nucleolus Sorting in Arabidopsis
auteur
Frederic Pontvianne, Myriam Boyer-Clavel, Julio Sáez-Vasquez
article
The Nucleolus : Methods and Protocols, 1455, pp.203-211, 2016, Methods in Molecular Biology, 978-1-4939-3790-5. ⟨10.1007/978-1-4939-3792-9_15⟩
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BibTex

2015

titre
Subunit compositions of Arabidopsis RNA polymerases I and III reveal Pol I- and Pol III-specific forms of the AC40 subunit and alternative forms of the C53 subunit
auteur
Thomas S Ream, Jeremy R Haag, Frederic Pontvianne, Carrie D Nicora, Angela D Norbeck, Ljiljana Paša-Tolić, Craig S Pikaard
article
Nucleic Acids Research, 2015, 43 (8), pp.4163-4178. ⟨10.1093/nar/gkv247⟩
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https://hal.science/hal-04892937/file/ream%20pontvianne.pdf BibTex
titre
A Two-Step Process for Epigenetic Inheritance in Arabidopsis
auteur
Todd Blevins, Frédéric Pontvianne, Ross Cocklin, Ram Podicheti, Chinmayi Chandrasekhara, Satwica Yerneni, Chris Braun, Brandon Lee, Doug Rusch, Keithanne Mockaitis, Haixu Tang, Craig S Pikaard
article
Molecular Cell, 2015, 54, pp.30 - 42. ⟨10.1016/j.molcel.2014.02.019⟩
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https://hal.science/hal-04892953/file/blevins%20pontvianne.pdf BibTex

2014

titre
A Duplicated NUCLEOLIN Gene with Antagonistic Activity Is Required for Chromatin Organization of Silent 45S rDNA in Arabidopsis
auteur
Nathalie Durut, Mohamed Abou-Ellail, Frederic Pontvianne, Sadhan Das, Hisae Kojima, Seiko Ukai, Anne de Bures, Pascale Comella, Sabine Nidelet, Stéphanie Rialle, Rémy Merret, Manuel Echeverria, Philippe Bouvet, Kenzo Nakamura, Julio Sáez-Vasquez
article
The Plant cell, 2014, 26 (3), pp.1330-1344. ⟨10.1105/tpc.114.123893⟩
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https://hal.science/hal-02116071/file/1330.pdf BibTex

2013

titre
CBC-ARS2 stimulates 3'-end maturation of multiple RNA families and favors cap-proximal processing
auteur
Marie Hallais, Frédéric Pontvianne, Peter Refsing Andersen, Marcello Clerici, Daniela Lener, Nour El Houda Benbahouche, Thierry Gostan, Franck Vandermoere, Marie-Cécile Robert, Stephen Cusack, Céline Verheggen, Torben Heick Jensen, Edouard Bertrand
article
Nature Structural and Molecular Biology, 2013, 20 (12), pp.1358--66. ⟨10.1038/nsmb.2720⟩
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https://hal.science/hal-02191615/file/Hallais_et_al._2013.pdf BibTex
titre
Subnuclear partitioning of rRNA genes between the nucleolus and nucleoplasm reflects alternative epiallelic states
auteur
Frederic Pontvianne, Todd Blevins, Chinmayi Chandrasekhara, Iva Mozgová, Christiane Hassel, Olga M F Pontes, Sarah Tucker, Petr Mokroš, Veronika Muchová, Jiří Fajkus, Craig S Pikaard
article
Genes and Development, 2013, 27, pp.1545 - 1550. ⟨10.1101/gad.221648.113⟩
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https://hal.science/hal-04892962/file/pontvianne%202013.pdf BibTex

2012

titre
Histone methyltransferases regulating rRNA gene dose and dosage control in Arabidopsis
auteur
Frédéric Pontvianne, Todd Blevins, Chinmayi Chandrasekhara, Wei Feng, Hume Stroud, Steven E Jacobsen, Scott D Michaels, Craig S Pikaard
article
Genes and Development, 2012, 26, pp.945 - 957. ⟨10.1101/gad.182865.111⟩
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https://hal.science/hal-04892972/file/pontvianne%202012.pdf BibTex

2010

titre
Nucleolin is required for DNA methylation state and the expression of rRNA gene variants in Arabidopsis thaliana.
auteur
Frédéric Pontvianne, Mohamed Abou-Ellail, Julien Douet, Pascale Comella, Isabel Matia, Chinmayi Chandrasekhara, Anne Debures, Todd Blevins, Richard Cooke, Francisco J Medina, Sylvette Tourmente, Craig S Pikaard, Julio Sáez-Vásquez
article
PLoS Genetics, 2010, 6 (11), pp.e1001225. ⟨10.1371/journal.pgen.1001225⟩
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BibTex
titre
Identification of protein factors and U3 snoRNAs from a Brassica oleracea RNP complex involved in the processing of pre-rRNA.
auteur
Hala Samaha, Valérie Delorme, Frederic Pontvianne, Richard Cooke, Francois Delalande, Alain van Dorsselaer, Manuel Echeverria, Julio Sáez-Vásquez
article
The Plant Journal, 2010, 61 (3), pp.383-98. ⟨10.1111/j.1365-313X.2009.04061.x⟩
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BibTex
titre
Arabidopsis Histone Lysine Methyltransferases
auteur
Frédéric Pontvianne, Todd Blevins, Craig S Pikaard
article
Advances in Botanical Research, 2010, pp.1 - 22. ⟨10.1016/s0065-2296(10)53001-5⟩
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https://hal.science/hal-04892981/file/pontvianne%20revue%202010.pdf BibTex

2008

titre
Characterization of a ribonuclease III-like protein required for cleavage of the pre-rRNA in the 3′ETS in Arabidopsis
auteur
P. Comella, F. Pontvianne, S. Lahmy, F. Vignols, N. Barbezier, A. Debures, E. Jobet, E. Brugidou, M. Echeverria, J. Saez-Vasquez
article
Nucleic Acids Research, 2008, 36 (4), pp.1163-1175. ⟨10.1093/nar/gkm1130⟩
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2007

titre
Characterization of AtNUC-L1 reveals a central role of nucleolin in nucleolus organization and silencing of AtNUC-L2 gene in Arabidopsis.
auteur
Frederic Pontvianne, Isabel Matía, Julien Douet, Sylvette Tourmente, Francisco J Medina, Manuel Echeverria, Julio Sáez-Vásquez
article
Molecular Biology of the Cell, 2007, 18 (2), pp.369-79. ⟨10.1091/mbc.E06-08-0751⟩
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